View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8873_low_13 (Length: 314)

Name: NF8873_low_13
Description: NF8873
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8873_low_13
NF8873_low_13
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (40-294)||(24619222-24619476)
chr5 (40-294)||(24715453-24715707)
chr5 (40-294)||(24748481-24748735)
chr5 (42-291)||(23079018-23079267)
chr5 (42-291)||(25849265-25849514)
chr5 (42-291)||(14885920-14886169)
chr5 (42-294)||(22503866-22504118)
chr5 (44-294)||(21679709-21679959)
chr5 (40-289)||(20343474-20343723)
chr5 (42-291)||(24797326-24797575)
chr5 (40-291)||(22234847-22235098)
chr5 (42-291)||(37542310-37542559)
chr5 (40-291)||(21562900-21563151)
chr5 (40-289)||(21871978-21872226)
chr5 (40-289)||(21876258-21876506)
chr5 (40-294)||(20822640-20822894)
chr5 (40-294)||(17268261-17268515)
chr5 (42-294)||(28893871-28894123)
chr5 (42-294)||(28915342-28915594)
chr5 (42-294)||(28922697-28922949)
chr5 (42-294)||(28930610-28930862)
chr5 (71-294)||(26737685-26737908)
chr5 (44-291)||(18777004-18777251)
chr5 (48-279)||(22463153-22463384)
chr5 (44-291)||(27519614-27519861)
chr5 (44-291)||(34567702-34567949)
chr5 (44-291)||(40709988-40710235)
chr5 (77-291)||(27684364-27684578)
chr5 (44-291)||(16357710-16357957)
chr5 (74-289)||(20467059-20467274)
chr5 (44-291)||(22135876-22136123)
chr5 (44-291)||(27611562-27611809)
chr5 (44-291)||(27667421-27667668)
chr5 (44-291)||(41772050-41772297)
chr5 (77-291)||(14998703-14998917)
chr5 (77-291)||(19771168-19771382)
chr5 (77-291)||(22331851-22332065)
chr5 (77-291)||(37290460-37290674)
chr5 (44-294)||(25427638-25427888)
chr5 (77-291)||(29475037-29475251)
chr5 (77-294)||(23472433-23472649)
chr5 (40-291)||(23441418-23441669)
chr5 (40-208)||(20777186-20777354)
chr5 (83-291)||(21338267-21338475)
chr5 (71-291)||(21408346-21408566)
chr5 (44-291)||(23574937-23575184)
chr5 (164-273)||(21497150-21497259)
chr5 (144-256)||(820-933)
chr5 (44-234)||(20800662-20800852)
chr5 (74-291)||(21936149-21936366)
chr5 (74-291)||(24582400-24582617)
chr5 (74-291)||(27012274-27012491)
chr5 (230-291)||(21830878-21830939)
chr5 (155-291)||(21882157-21882293)
chr5 (74-184)||(23504541-23504651)
chr5 (204-294)||(20774946-20775036)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (42-291)||(249920-250169)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (40-294)||(23197064-23197317)
chr1 (42-291)||(24098422-24098671)
chr1 (40-291)||(19855596-19855847)
chr1 (40-294)||(20938880-20939134)
chr1 (40-294)||(21744369-21744623)
chr1 (40-283)||(20834717-20834960)
chr1 (42-291)||(31538816-31539065)
chr1 (42-290)||(20295704-20295952)
chr1 (42-291)||(21952200-21952449)
chr1 (42-291)||(37678371-37678620)
chr1 (40-291)||(19661953-19662205)
chr1 (44-294)||(430937-431187)
chr1 (40-291)||(20060769-20061020)
chr1 (40-279)||(20855577-20855816)
chr1 (45-291)||(51332315-51332561)
chr1 (44-291)||(21234552-21234799)
chr1 (44-291)||(33389850-33390097)
chr1 (44-291)||(41352483-41352730)
chr1 (44-291)||(16349417-16349664)
chr1 (44-291)||(19107659-19107906)
chr1 (77-291)||(21831594-21831808)
chr1 (44-291)||(17043836-17044083)
chr1 (44-294)||(22361065-22361315)
chr1 (77-294)||(22110310-22110527)
chr1 (77-294)||(22114159-22114376)
chr1 (42-147)||(52987206-52987311)
chr1 (44-291)||(21025464-21025711)
chr1 (77-291)||(21838241-21838456)
chr1 (44-294)||(21750228-21750478)
chr1 (77-270)||(24793471-24793664)
chr1 (103-289)||(19759753-19759939)
chr1 (138-291)||(16373821-16373974)
chr1 (74-291)||(20830243-20830460)
chr1 (74-183)||(41216708-41216817)
chr1 (40-291)||(22134374-22134625)
chr1 (197-291)||(16077630-16077724)
chr1 (74-183)||(20915000-20915109)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (42-291)||(32069-32318)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (42-293)||(6895-7146)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (40-291)||(23521-23772)
scaffold0104 (101-291)||(20701-20891)
[»] chr4 (45 HSPs)
chr4 (42-291)||(33224199-33224448)
chr4 (40-294)||(15357865-15358119)
chr4 (40-294)||(15002109-15002363)
chr4 (42-291)||(29452284-29452533)
chr4 (42-291)||(3263541-3263790)
chr4 (47-291)||(11205983-11206227)
chr4 (41-294)||(15247197-15247450)
chr4 (40-294)||(15071632-15071886)
chr4 (40-294)||(16148984-16149238)
chr4 (40-294)||(16153130-16153384)
chr4 (42-294)||(44660613-44660865)
chr4 (44-291)||(8707196-8707442)
chr4 (40-294)||(27901659-27901913)
chr4 (40-289)||(51605537-51605786)
chr4 (104-294)||(15320409-15320599)
chr4 (44-291)||(18614313-18614560)
chr4 (44-291)||(23957023-23957270)
chr4 (44-291)||(8387688-8387935)
chr4 (44-291)||(16353934-16354181)
chr4 (44-291)||(29037893-29038140)
chr4 (44-291)||(8052112-8052359)
chr4 (44-291)||(12524952-12525199)
chr4 (44-291)||(18225935-18226182)
chr4 (44-291)||(18298481-18298728)
chr4 (40-294)||(1648022-1648276)
chr4 (44-264)||(14681870-14682090)
chr4 (44-291)||(12477876-12478123)
chr4 (44-291)||(19777282-19777529)
chr4 (77-291)||(27712612-27712826)
chr4 (44-291)||(14160746-14160993)
chr4 (56-291)||(15146386-15146621)
chr4 (44-291)||(40474316-40474563)
chr4 (77-291)||(14302500-14302714)
chr4 (77-294)||(14695386-14695603)
chr4 (77-294)||(14849888-14850105)
chr4 (118-291)||(15413849-15414022)
chr4 (158-294)||(20892255-20892391)
chr4 (74-291)||(9292111-9292328)
chr4 (74-291)||(15291937-15292154)
chr4 (74-291)||(14998592-14998808)
chr4 (77-209)||(18548841-18548973)
chr4 (113-171)||(12415973-12416031)
chr4 (74-174)||(12341644-12341744)
chr4 (113-156)||(15423058-15423101)
chr4 (44-123)||(56566280-56566359)
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (40-294)||(5296096-5296350)
chr6 (40-294)||(21472738-21472992)
chr6 (42-294)||(10467741-10467993)
chr6 (42-294)||(24365549-24365801)
chr6 (40-282)||(14378807-14379049)
chr6 (40-282)||(14380357-14380599)
chr6 (40-294)||(18795827-18796081)
chr6 (62-291)||(19454560-19454789)
chr6 (40-294)||(21563022-21563276)
chr6 (40-294)||(21568881-21569135)
chr6 (43-291)||(19436142-19436390)
chr6 (44-291)||(19880438-19880685)
chr6 (44-291)||(34644480-34644727)
chr6 (44-291)||(27188576-27188823)
chr6 (44-291)||(27260417-27260664)
chr6 (40-294)||(15460473-15460727)
chr6 (44-289)||(28281707-28281952)
chr6 (44-291)||(19488166-19488413)
chr6 (44-294)||(23079606-23079856)
chr6 (44-288)||(22435012-22435256)
chr6 (44-288)||(22443410-22443654)
chr6 (44-291)||(28262091-28262338)
chr6 (44-291)||(28340840-28341087)
chr6 (151-283)||(8761934-8762066)
chr6 (44-291)||(19865827-19866074)
chr6 (44-291)||(25113692-25113939)
chr6 (44-291)||(27564715-27564962)
chr6 (44-291)||(29590814-29591061)
chr6 (44-294)||(22761349-22761599)
chr6 (44-294)||(18406838-18407088)
chr6 (77-291)||(2873730-2873944)
chr6 (84-294)||(20636235-20636445)
chr6 (71-291)||(18449650-18449870)
chr6 (74-290)||(18966219-18966432)
chr6 (44-291)||(1541978-1542225)
chr6 (74-289)||(15897236-15897450)
chr6 (74-278)||(18196657-18196861)
chr6 (44-264)||(24312062-24312282)
chr6 (44-294)||(16962339-16962589)
chr6 (74-291)||(16381297-16381514)
chr6 (44-291)||(25608755-25609002)
chr6 (74-291)||(5838143-5838360)
chr6 (40-291)||(16648859-16649110)
chr6 (189-291)||(16625756-16625858)
chr6 (74-183)||(14624281-14624390)
chr6 (194-294)||(16926684-16926784)
chr6 (74-183)||(16099257-16099366)
chr6 (74-291)||(23997388-23997605)
chr6 (74-174)||(1647738-1647838)
chr6 (44-168)||(16621974-16622098)
chr6 (74-291)||(16234168-16234385)
chr6 (74-291)||(18836832-18837049)
chr6 (74-213)||(18574407-18574546)
chr6 (74-291)||(14129609-14129826)
chr6 (74-291)||(21928345-21928562)
chr6 (74-183)||(35275010-35275119)
chr6 (74-183)||(23026640-23026749)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (45-293)||(13022621-13022869)
chr7 (40-291)||(16949204-16949455)
chr7 (40-294)||(19148474-19148728)
chr7 (40-294)||(20747873-20748127)
chr7 (44-294)||(19613938-19614188)
chr7 (44-294)||(15101339-15101589)
chr7 (42-291)||(140-390)
chr7 (44-294)||(12457903-12458153)
chr7 (40-294)||(13666800-13667054)
chr7 (40-294)||(16071027-16071281)
chr7 (40-294)||(14262976-14263230)
chr7 (42-291)||(11304997-11305246)
chr7 (42-291)||(13967402-13967651)
chr7 (42-291)||(49153567-49153816)
chr7 (40-294)||(11387160-11387414)
chr7 (40-294)||(14285108-14285362)
chr7 (40-294)||(15341694-15341948)
chr7 (42-291)||(26117324-26117588)
chr7 (40-294)||(23504602-23504856)
chr7 (40-291)||(12205532-12205783)
chr7 (40-289)||(18052685-18052934)
chr7 (47-291)||(14212939-14213183)
chr7 (44-291)||(11235971-11236218)
chr7 (44-291)||(14333661-14333908)
chr7 (44-291)||(14955819-14956066)
chr7 (44-291)||(15159815-15160062)
chr7 (44-291)||(8199893-8200140)
chr7 (44-291)||(8708870-8709117)
chr7 (44-291)||(23202371-23202618)
chr7 (44-291)||(23508498-23508745)
chr7 (77-291)||(44790142-44790356)
chr7 (74-291)||(15204884-15205101)
chr7 (44-291)||(16076-16323)
chr7 (44-291)||(320795-321042)
chr7 (44-291)||(18179007-18179254)
chr7 (44-294)||(11770999-11771249)
chr7 (77-291)||(13687329-13687543)
chr7 (78-291)||(18550550-18550763)
chr7 (44-291)||(12688765-12689013)
chr7 (44-291)||(9597322-9597569)
chr7 (77-291)||(10872260-10872474)
chr7 (44-291)||(11551860-11552107)
chr7 (55-291)||(15147654-15147890)
chr7 (71-294)||(14040957-14041180)
chr7 (71-294)||(14350987-14351210)
chr7 (74-291)||(7825165-7825382)
chr7 (74-291)||(27106562-27106779)
chr7 (74-291)||(27171546-27171763)
chr7 (77-264)||(39937-40124)
chr7 (208-291)||(15625819-15625902)
chr7 (40-176)||(23642823-23642959)
chr7 (74-172)||(15625909-15626007)
chr7 (74-291)||(14937612-14937829)
chr7 (74-291)||(15365205-15365422)
chr7 (40-94)||(14139142-14139196)
chr7 (74-176)||(17925031-17925133)
chr7 (74-186)||(4441298-4441410)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (40-291)||(44090-44341)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (40-294)||(2103-2357)
scaffold0222 (40-280)||(8378-8618)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (45-283)||(31415664-31415902)
chr8 (40-294)||(21841756-21842010)
chr8 (40-294)||(23656266-23656520)
chr8 (42-291)||(6605000-6605249)
chr8 (42-291)||(29302616-29302865)
chr8 (47-294)||(16270419-16270666)
chr8 (40-294)||(20009109-20009362)
chr8 (40-294)||(20984735-20984989)
chr8 (42-245)||(27355924-27356127)
chr8 (42-291)||(14566484-14566733)
chr8 (40-283)||(20974844-20975087)
chr8 (40-291)||(20389441-20389692)
chr8 (40-294)||(22372270-22372524)
chr8 (40-283)||(21324457-21324700)
chr8 (40-294)||(22052202-22052456)
chr8 (86-294)||(12306097-12306305)
chr8 (44-289)||(31570034-31570279)
chr8 (44-294)||(21393057-21393307)
chr8 (44-294)||(21787551-21787801)
chr8 (44-291)||(30312336-30312583)
chr8 (44-291)||(32601486-32601733)
chr8 (74-291)||(20395354-20395571)
chr8 (44-291)||(17673215-17673462)
chr8 (44-291)||(19483256-19483503)
chr8 (44-291)||(21165730-21165977)
chr8 (44-294)||(21920928-21921178)
chr8 (40-168)||(19860900-19861028)
chr8 (44-291)||(18857919-18858166)
chr8 (44-291)||(20017455-20017702)
chr8 (44-291)||(21043787-21044034)
chr8 (44-291)||(22041201-22041448)
chr8 (45-291)||(19979309-19979555)
chr8 (77-287)||(22247658-22247868)
chr8 (162-294)||(19852750-19852882)
chr8 (162-294)||(19858786-19858918)
chr8 (44-264)||(22132233-22132453)
chr8 (44-291)||(19114032-19114279)
chr8 (44-294)||(21252283-21252533)
chr8 (77-291)||(22119399-22119613)
chr8 (77-291)||(22128183-22128397)
chr8 (47-291)||(15534725-15534969)
chr8 (74-289)||(23886368-23886583)
chr8 (40-291)||(16876283-16876534)
chr8 (71-288)||(22623262-22623472)
chr8 (197-291)||(6680453-6680547)
chr8 (44-291)||(23651383-23651630)
chr8 (77-294)||(22376678-22376896)
chr8 (77-294)||(22382853-22383071)
chr8 (74-291)||(22435645-22435862)
chr8 (197-294)||(1267577-1267674)
chr8 (40-264)||(19869062-19869286)
chr8 (44-171)||(16407309-16407436)
chr8 (74-258)||(21195724-21195908)
chr8 (74-186)||(23901634-23901746)
chr8 (68-183)||(21849553-21849668)
chr8 (74-176)||(23156262-23156364)
chr8 (74-183)||(20651555-20651664)
chr8 (243-291)||(803064-803112)
chr8 (74-174)||(22316650-22316750)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (40-294)||(5080-5334)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (42-291)||(55650-55899)
scaffold0076 (44-294)||(32429-32679)
scaffold0076 (74-291)||(41565-41782)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (40-291)||(13507-13758)
scaffold0124 (74-183)||(6590-6699)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (40-291)||(300-551)
scaffold0120 (44-296)||(7322-7574)
scaffold0120 (77-294)||(13362-13579)
scaffold0120 (74-183)||(23591-23700)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (40-294)||(1173-1427)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (40-294)||(41002-41256)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (42-291)||(16337487-16337736)
chr3 (40-291)||(12179243-12179494)
chr3 (44-294)||(13971097-13971347)
chr3 (40-294)||(16827176-16827430)
chr3 (42-291)||(47124849-47125098)
chr3 (42-294)||(11960144-11960396)
chr3 (42-294)||(16328635-16328887)
chr3 (40-293)||(13319475-13319728)
chr3 (44-294)||(14087575-14087825)
chr3 (42-291)||(28755223-28755472)
chr3 (40-294)||(18133319-18133573)
chr3 (40-294)||(17187276-17187530)
chr3 (42-291)||(31694161-31694410)
chr3 (44-291)||(12359504-12359751)
chr3 (42-291)||(31939808-31940057)
chr3 (95-296)||(14574823-14575024)
chr3 (40-294)||(16379901-16380155)
chr3 (40-282)||(16835483-16835725)
chr3 (40-294)||(13942926-13943180)
chr3 (40-294)||(14579926-14580180)
chr3 (44-294)||(16491169-16491419)
chr3 (40-288)||(15228557-15228805)
chr3 (40-288)||(15234425-15234673)
chr3 (40-289)||(41178429-41178678)
chr3 (42-294)||(10419020-10419272)
chr3 (44-289)||(44778154-44778399)
chr3 (44-291)||(53384006-53384253)
chr3 (44-291)||(5423918-5424165)
chr3 (44-291)||(16636668-16636915)
chr3 (44-291)||(43163992-43164239)
chr3 (44-294)||(17490742-17490992)
chr3 (44-252)||(14875487-14875695)
chr3 (44-291)||(6601631-6601878)
chr3 (44-291)||(13253585-13253832)
chr3 (44-291)||(16805935-16806182)
chr3 (44-291)||(20061042-20061289)
chr3 (44-291)||(10907105-10907352)
chr3 (44-291)||(15588380-15588627)
chr3 (164-291)||(17493535-17493662)
chr3 (44-291)||(48426342-48426589)
chr3 (77-294)||(15260522-15260739)
chr3 (44-291)||(10006495-10006742)
chr3 (44-291)||(15340164-15340411)
chr3 (77-264)||(15347266-15347453)
chr3 (44-291)||(15723922-15724169)
chr3 (77-291)||(15401538-15401752)
chr3 (54-291)||(16693059-16693296)
chr3 (71-291)||(15014771-15014991)
chr3 (44-291)||(14125582-14125829)
chr3 (41-135)||(10384732-10384826)
chr3 (54-291)||(12499143-12499380)
chr3 (44-232)||(3686897-3687085)
chr3 (44-291)||(16411270-16411517)
chr3 (74-291)||(13966362-13966579)
chr3 (74-291)||(8273417-8273634)
chr3 (74-291)||(16741721-16741938)
chr3 (74-291)||(30138711-30138928)
chr3 (74-291)||(30148262-30148479)
chr3 (77-291)||(15062613-15062827)
chr3 (44-168)||(5109599-5109723)
chr3 (40-183)||(55514702-55514845)
chr3 (78-291)||(6151875-6152088)
chr3 (74-291)||(25767223-25767440)
chr3 (74-291)||(15611008-15611225)
chr3 (74-183)||(17194107-17194216)
chr3 (71-183)||(12793154-12793266)
chr3 (77-291)||(16258049-16258263)
chr3 (76-291)||(18750849-18751064)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (40-296)||(108932-109188)
scaffold0031 (44-172)||(55743-55871)
scaffold0031 (189-291)||(62928-63030)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (40-291)||(12656-12907)
scaffold0034 (40-291)||(3701-3952)
scaffold0034 (40-294)||(68674-68928)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (40-294)||(47782-48036)
scaffold0053 (40-292)||(56595-56847)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (40-294)||(4053-4307)
scaffold0035 (72-291)||(42887-43106)
scaffold0035 (40-209)||(11944-12113)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (40-294)||(23277680-23277934)
chr2 (42-291)||(20829166-20829415)
chr2 (40-283)||(19651335-19651578)
chr2 (42-291)||(31831565-31831814)
chr2 (40-294)||(23294839-23295093)
chr2 (42-291)||(1064658-1064907)
chr2 (44-291)||(24949497-24949744)
chr2 (40-294)||(23111640-23111894)
chr2 (40-294)||(23099303-23099557)
chr2 (40-230)||(25264022-25264212)
chr2 (40-289)||(12575262-12575511)
chr2 (40-289)||(27788650-27788898)
chr2 (40-294)||(27209457-27209711)
chr2 (44-291)||(45533252-45533499)
chr2 (44-294)||(23107019-23107269)
chr2 (44-291)||(16926267-16926514)
chr2 (44-291)||(16999907-17000154)
chr2 (44-291)||(22324145-22324392)
chr2 (44-291)||(27218923-27219170)
chr2 (77-291)||(16923796-16924010)
chr2 (77-291)||(16983059-16983273)
chr2 (77-291)||(21144363-21144577)
chr2 (77-291)||(41607707-41607921)
chr2 (77-291)||(44384891-44385105)
chr2 (44-289)||(24263279-24263524)
chr2 (44-291)||(10869757-10870004)
chr2 (44-291)||(24676396-24676643)
chr2 (44-291)||(27372176-27372423)
chr2 (77-291)||(24710941-24711155)
chr2 (44-291)||(30011473-30011718)
chr2 (101-291)||(17064624-17064814)
chr2 (77-291)||(24876071-24876285)
chr2 (71-291)||(30210234-30210453)
chr2 (44-291)||(21324555-21324802)
chr2 (40-291)||(12639518-12639769)
chr2 (44-264)||(24706771-24706991)
chr2 (74-183)||(22279120-22279229)
chr2 (68-168)||(23072893-23072993)
chr2 (197-294)||(23067295-23067391)
chr2 (74-183)||(24830507-24830616)
chr2 (40-183)||(22760854-22760997)
chr2 (74-176)||(25129631-25129733)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (40-294)||(1602-1856)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (40-294)||(2233-2487)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (40-294)||(5734-5988)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (40-294)||(32715-32969)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (45-294)||(49267-49516)
scaffold0028 (77-291)||(16243-16457)
scaffold0028 (77-291)||(9781-9995)
scaffold0028 (44-291)||(44458-44705)
scaffold0028 (74-168)||(105355-105449)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (42-291)||(41083-41332)
scaffold0010 (40-294)||(46147-46401)
scaffold0010 (77-294)||(3218-3435)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (40-294)||(282-536)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (44-294)||(6054-6304)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (40-294)||(20153-20407)
scaffold0090 (40-294)||(24315-24569)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (40-294)||(50623-50877)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (42-283)||(1584-1825)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (42-283)||(12277-12518)
scaffold0180 (44-294)||(31505-31755)
scaffold0180 (40-172)||(34499-34631)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (42-283)||(28248-28489)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (46-294)||(27828-28076)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (75-291)||(308-524)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (40-296)||(721-977)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (40-264)||(34804-35028)
scaffold0139 (155-264)||(28551-28660)
scaffold0139 (229-294)||(95-160)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (42-294)||(15463-15715)
scaffold0089 (189-291)||(10744-10846)
[»] scaffold0367 (2 HSPs)
scaffold0367 (44-283)||(5990-6229)
scaffold0367 (84-171)||(1-88)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (44-291)||(113866-114113)
scaffold0029 (78-291)||(108597-108810)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (40-294)||(11097-11351)
scaffold0309 (44-135)||(16103-16194)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (40-294)||(15416-15670)
scaffold0266 (74-283)||(8643-8852)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (40-294)||(27929-28182)
scaffold0067 (40-291)||(59962-60213)
scaffold0067 (40-291)||(50928-51179)
scaffold0067 (40-291)||(66350-66601)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (42-267)||(293-518)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (66-291)||(2895-3120)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (40-293)||(45822-46075)
scaffold0114 (40-293)||(21192-21445)
scaffold0114 (44-294)||(19093-19343)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (42-291)||(100312-100561)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (40-283)||(324019-324262)
scaffold0004 (44-291)||(202220-202467)
scaffold0004 (74-289)||(118535-118750)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (40-294)||(10805-11059)
scaffold0298 (40-294)||(14575-14829)
scaffold0298 (40-291)||(21290-21541)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (44-291)||(6437-6684)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (40-294)||(18653-18907)
scaffold0244 (74-291)||(25559-25776)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (40-294)||(436-689)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (40-268)||(10205-10433)
scaffold0235 (40-268)||(20419-20647)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (40-283)||(42232-42475)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (40-291)||(149877-150127)
scaffold0011 (40-291)||(194452-194703)
scaffold0011 (77-294)||(25318-25535)
scaffold0011 (74-288)||(181234-181448)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (40-294)||(48408-48662)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (40-294)||(80580-80834)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (83-294)||(29361-29572)
scaffold0026 (40-240)||(50168-50368)
scaffold0026 (44-294)||(30249-30499)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (40-288)||(3020-3268)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (40-264)||(10637-10861)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (40-268)||(13047-13275)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (40-288)||(30033-30281)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (40-294)||(3480-3734)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (42-291)||(20427-20676)
scaffold0058 (71-247)||(57970-58146)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (40-294)||(5837-6093)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (56-289)||(35422-35655)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (40-294)||(628-882)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (44-291)||(177014-177261)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (40-294)||(6517-6771)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (40-291)||(1190-1441)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (110-264)||(2148-2302)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (40-294)||(261612-261866)
scaffold0005 (56-291)||(277594-277829)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (40-291)||(9556-9807)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (116-291)||(24700-24875)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (40-294)||(11534-11788)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (40-282)||(5084-5326)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (42-243)||(1-202)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (40-291)||(39508-39758)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (44-294)||(13963-14213)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (40-291)||(23827-24071)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (40-294)||(6097-6332)
scaffold0149 (40-294)||(10528-10763)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (44-294)||(7676-7926)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (44-294)||(7353-7603)
scaffold0358 (218-294)||(3535-3611)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (77-291)||(29356-29570)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (44-264)||(4105-4325)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (44-294)||(70-320)
scaffold0319 (44-294)||(2573-2823)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (78-291)||(22971-23184)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (83-291)||(10276-10484)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (158-294)||(89311-89447)
scaffold0001 (158-294)||(89989-90125)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (44-294)||(102537-102787)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (74-294)||(13772-13992)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (142-294)||(14150-14301)
scaffold0261 (142-294)||(22329-22480)
scaffold0261 (51-108)||(14098-14155)
scaffold0261 (51-108)||(22277-22334)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (44-291)||(8673-8920)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (74-289)||(6673-6888)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (44-291)||(8704-8951)
scaffold0080 (44-207)||(49481-49644)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (44-294)||(2740-2990)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (77-291)||(8246-8460)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (44-294)||(38700-38950)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (74-291)||(16759-16976)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (56-291)||(3501-3736)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (44-279)||(32325-32560)
scaffold0109 (77-291)||(9903-10117)
[»] scaffold0077 (4 HSPs)
scaffold0077 (40-187)||(20325-20472)
scaffold0077 (74-291)||(16346-16563)
scaffold0077 (74-183)||(27048-27157)
scaffold0077 (74-183)||(25664-25773)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (77-291)||(3190-3404)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (44-294)||(7083-7333)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (44-294)||(16958-17208)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (74-291)||(16184-16401)
scaffold0040 (78-294)||(112274-112490)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (46-294)||(50736-50984)
scaffold0081 (44-291)||(19909-20156)
scaffold0081 (44-291)||(35333-35580)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (74-289)||(115687-115902)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (44-291)||(60060-60307)
scaffold0023 (44-291)||(28120-28367)
scaffold0023 (44-126)||(3257-3339)
scaffold0023 (190-291)||(3354-3455)
scaffold0023 (227-294)||(131410-131477)
scaffold0023 (74-183)||(54723-54832)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (44-289)||(13833-14078)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (77-294)||(5175-5392)
scaffold0270 (77-294)||(12305-12522)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (44-293)||(7839-8088)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (74-291)||(4419-4636)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (47-291)||(1725-1969)
scaffold0044 (47-291)||(15465-15709)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (44-291)||(7321-7568)
[»] scaffold0509 (2 HSPs)
scaffold0509 (40-171)||(1627-1758)
scaffold0509 (40-171)||(8055-8186)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (44-291)||(38572-38819)
scaffold0042 (44-291)||(66712-66959)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (77-294)||(15266-15484)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (77-294)||(18000-18217)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (44-264)||(57351-57571)
scaffold0017 (44-264)||(18819-19039)
scaffold0017 (106-291)||(196292-196477)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (71-291)||(85298-85518)
scaffold0007 (104-183)||(92832-92911)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (116-291)||(2215-2390)
scaffold0647 (44-264)||(8411-8631)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (151-294)||(4311-4454)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (44-294)||(7405-7655)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (44-294)||(25697-25946)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (50-294)||(218178-218419)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (83-294)||(2197-2408)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (143-294)||(96468-96619)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (74-255)||(340-521)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (44-291)||(79246-79493)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (95-291)||(39686-39882)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (77-264)||(23858-24045)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (77-264)||(12777-12964)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (44-294)||(39861-40111)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (137-289)||(9861-10013)
scaffold0083 (50-108)||(9792-9850)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (87-181)||(3-97)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (74-291)||(2657-2874)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (125-294)||(66-235)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (74-291)||(24701-24918)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (74-291)||(14215-14432)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (231-294)||(1-64)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (74-172)||(478-576)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (44-209)||(2970-3135)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (71-296)||(6476-6701)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (74-291)||(8572-8789)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (74-291)||(25133-25350)
scaffold0008 (74-183)||(133271-133380)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (191-291)||(26281-26381)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (74-291)||(769-986)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (189-291)||(24774-24876)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (44-294)||(6525-6775)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (74-183)||(11492-11601)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (44-294)||(819-1069)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (212-294)||(12037-12119)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (74-176)||(15480-15582)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (74-183)||(10709-10818)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (212-293)||(5336-5417)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (74-183)||(72604-72713)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (74-291)||(2734-2951)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (74-183)||(19462-19571)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (104-258)||(7702-7856)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (74-129)||(34683-34738)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (74-183)||(3959-4068)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (74-183)||(13596-13705)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (44-112)||(1528-1596)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (44-112)||(8445-8513)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 24619222 - 24619476
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||    
T  24619222 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtctaaaatat 24619321  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24619322 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatg 24619421  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24619422 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 24619476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 24715453 - 24715707
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||    
T  24715453 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtctaaaatat 24715552  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24715553 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatg 24715652  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24715653 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 24715707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 24748481 - 24748735
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||    
T  24748481 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtctaaaatat 24748580  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24748581 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatg 24748680  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24748681 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 24748735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 23079018 - 23079267
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23079018 tggagttggctgcggtggggtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 23079117  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  23079118 atttgatcagaaggaattaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtg 23079217  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  23079218 gttgctaatgcgttgagcaggaaaacattacatatgtctgctttgatggt 23079267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25849514 - 25849265
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25849514 tggagttggctgcagtggtttttgttttaaaaatttggaggcatgatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 25849415  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  25849414 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 25849315  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  25849314 gttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggt 25849265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 14885920 - 14886169
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14885920 tggagttagctgcagtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 14886019  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14886020 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 14886119  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14886120 gttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggt 14886169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22504118 - 22503866
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22504118 tggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 22504019  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  22504018 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcaaagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 22503919  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||    
T  22503918 gttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctgctttaatggtaaa 22503866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 21679709 - 21679959
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21679709 gagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcagtacttgtatggttccagattcgaagtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttat 21679808  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21679809 ttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagt 21679908  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  21679909 tgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaa 21679959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 40 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20343723 - 20343474
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20343723 tttggaattggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtat 20343624  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20343623 ttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcataggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatg 20343524  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  20343523 tggttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatg 20343474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 24797326 - 24797575
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  24797326 tggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgaccataaaagtttgaagtattt 24797425  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  24797426 atttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 24797525  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||| |||||||    
T  24797526 gtagctgatgctttgagtaggaagactttgcacatgtctgctttgatggt 24797575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 22234847 - 22235098
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||    
T  22234847 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttagaggcattatttgtatggtttcagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatat 22234946  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  22234947 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggactatgaatttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatg 22235046  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  22235047 tggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctttgatggt 22235098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 37542310 - 37542559
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37542310 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 37542409  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  37542410 gtttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttattgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 37542509  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||    
T  37542510 gttgctgacgctttaagtaggaaaactttgcacgtgtctgctttgatggt 37542559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 21562900 - 21563151
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||    
T  21562900 tttggagttggctgctgtggtttttggtttgaaaatttggaggcattatttgtacgactccagatttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatat 21562999  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||| | || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21563000 ttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaactgttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaggtaaagctaatg 21563099  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  21563100 ttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtatgctatgatggt 21563151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 289
Target Start/End: Original strand, 21871978 - 21872226
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21871978 tttggagttggctgcggtggtttttcttttgaaaatttggagacattattagtacggtttcagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 21872077  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  21872078 ctgtttgatcaaaag-aattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatg 21872176  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  21872177 tggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatg 21872226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 289
Target Start/End: Original strand, 21876258 - 21876506
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21876258 tttggagttggctgcggtggtttttcttttgaaaatttggagacattattagtacggtttcagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 21876357  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  21876358 ctgtttgatcaaaag-aattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatg 21876456  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  21876457 tggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatg 21876506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20822894 - 20822640
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  20822894 tttggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatat 20822795  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || ||||| || || |||||||||||||||||||| | |||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20822794 ttgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 20822695  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||||||    
T  20822694 tagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaa 20822640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 17268261 - 17268515
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  17268261 tttggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatat 17268360  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  17268361 ttgtttgatcagacggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaatattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatg 17268460  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||| ||||    
T  17268461 tagtcgctgatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaa 17268515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 294
Target Start/End: Original strand, 28893871 - 28894123
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| |    
T  28893871 tggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatct 28893970  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
     ||||| || || |||||||||||||||||||| | |||| | ||| | || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  28893971 gtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtg 28894070  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||||||    
T  28894071 gttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaa 28894123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 294
Target Start/End: Original strand, 28915342 - 28915594
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| |    
T  28915342 tggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatct 28915441  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
     ||||| || || |||||||||||||||||||| | |||| | ||| | || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  28915442 gtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtg 28915541  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||||||    
T  28915542 gttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaa 28915594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 294
Target Start/End: Original strand, 28922697 - 28922949
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| |    
T  28922697 tggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatct 28922796  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
     ||||| || || |||||||||||||||||||| | |||| | ||| | || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  28922797 gtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtg 28922896  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||||||    
T  28922897 gttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaa 28922949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 294
Target Start/End: Original strand, 28930610 - 28930862
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| |    
T  28930610 tggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatct 28930709  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
     ||||| || || |||||||||||||||||||| | |||| | ||| | || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  28930710 gtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtg 28930809  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||||||    
T  28930810 gttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaa 28930862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 71 - 294
Target Start/End: Original strand, 26737685 - 26737908
Alignment:
Q  71 aaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggc 170  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26737685 aaaatatggagacactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccataagagtttaaaatacttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggc 26737784  T
Q  171 agagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgtt 270  Q
    || |||  ||| | ||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26737785 agggaaggtggcttgagttgttgaaagactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgtt 26737884  T
Q  271 acacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
     || ||||| ||||||||||||||    
T  26737885 gcatatgtccgctatgatggtaaa 26737908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18777251 - 18777004
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |    
T  18777251 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgt 18777152  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  18777151 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgattttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgt 18777052  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||| |||||||    
T  18777051 tgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggt 18777004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22463384 - 22463153
Alignment:
Q  48 tggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttga 147  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| | |||||    
T  22463384 tggctgcggtggtgtttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaagtatctgtttga 22463285  T
Q  148 tcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgca 247  Q
     || || |||||||||||||||||||| | |||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  22463284 ccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgca 22463185  T
Q  248 gatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtc 279  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22463184 gatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtc 22463153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27519861 - 27519614
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  27519861 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 27519762  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27519761 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 27519662  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  27519661 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 27519614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34567949 - 34567702
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  34567949 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 34567850  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  34567849 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 34567750  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  34567749 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 34567702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 40710235 - 40709988
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  40710235 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 40710136  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  40710135 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 40710036  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  40710035 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 40709988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 27684364 - 27684578
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  27684364 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 27684463  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  27684464 gatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 27684563  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  27684564 gtccgctatgatggt 27684578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16357957 - 16357710
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  16357957 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 16357858  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16357857 tcgatcagaaggagttgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 16357758  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  16357757 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 16357710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 289
Target Start/End: Original strand, 20467059 - 20467274
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||      
T  20467059 atttggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttgagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgagacaac 20467158  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    |||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||  ||||    
T  20467159 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtcggaaaactctaca 20467258  T
Q  274 catgtctgctatgatg 289  Q
     ||||| |||||||||    
T  20467259 tatgtccgctatgatg 20467274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22136123 - 22135876
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  22136123 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 22136024  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22136023 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 22135924  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  22135923 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 22135876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27611809 - 27611562
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  27611809 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 27611710  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27611709 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 27611610  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  27611609 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 27611562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 27667421 - 27667668
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||  ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  27667421 gagttggtggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 27667520  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27667521 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 27667620  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  27667621 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 27667668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41772297 - 41772050
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  41772297 gagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 41772198  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  41772197 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 41772098  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  41772097 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 41772050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 14998703 - 14998917
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||    
T  14998703 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagaattgaatatgagacagcgaa 14998802  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  14998803 gatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 14998902  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  14998903 gtccgctatgatggt 14998917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19771382 - 19771168
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19771382 tggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgaa 19771283  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| ||||| || | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  19771282 gatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcatat 19771183  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| || ||||||||    
T  19771182 gtccgccatgatggt 19771168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 22331851 - 22332065
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  22331851 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 22331950  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  22331951 gatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 22332050  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  22332051 gtccgctatgatggt 22332065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 37290460 - 37290674
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  37290460 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactgaatatgaggcagcgca 37290559  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  37290560 gatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 37290659  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  37290660 gtccgctatgatggt 37290674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25427888 - 25427638
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || || || ||||| | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  25427888 gagttggctgttgtggtttttgtattgaagatatggagactttacttttatggttccagatttgaggtatttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 25427789  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| | ||  || | || |||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  25427788 tcgatcagaaggaattgaacatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccgtgtaaagctaatgttgt 25427689  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  25427688 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaa 25427638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 29475037 - 29475251
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  29475037 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaattatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 29475136  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||  | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  29475137 gatgacttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 29475236  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  29475237 gtccgctatgatggt 29475251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23472649 - 23472433
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||  || ||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  23472649 tggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagcgatcataaagtct-gaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 23472551  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
      ||| | ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||    
T  23472550 ggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttaaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatat 23472451  T
Q  277 gtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  23472450 gtccgctatgatggtaaa 23472433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23441669 - 23441418
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||    
T  23441669 tttggagttggcggctgtggcctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaagtgtttagtgatcacaagagcttaaagtat 23441570  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || || |||||||| ||| |||| ||||||||| |||  ||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||    
T  23441569 ttgttcgatcagaaagaactgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaaactaatg 23441470  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  23441469 ttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 23441418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20777354 - 20777186
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  20777354 tttggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatat 20777255  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgatttt 208  Q
    || ||||| || || |||||||||||||||||||| | |||| | ||| | || |||||||||||||||    
T  20777254 ttgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgatttt 20777186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 291
Target Start/End: Original strand, 21338267 - 21338475
Alignment:
Q  83 cattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggt 182  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||| |||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||     
T  21338267 cattacttgtattgttcgagatttgaagtgttcagcgaacacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaatgtggc 21338366  T
Q  183 tagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgc 282  Q
    | ||  || |||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| | | | || ||||| ||    
T  21338367 ttgaattgctgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagcaggaagatgctgcatatgtcagc 21338466  T
Q  283 tatgatggt 291  Q
    |||||||||    
T  21338467 tatgatggt 21338475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21408566 - 21408346
Alignment:
Q  71 aaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggc 170  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||| || |||||||    
T  21408566 aaaatttggaggcattatctgtatggttctaaatttgacgtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatttatttgaccagaaataattaaatatgaggc 21408467  T
Q  171 agagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgtt 270  Q
    ||   |  ||| | ||  || | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||    
T  21408466 agcataggtggcttgaattgctaaaggattatgaattcggattgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatactttaagtaggaaaacatt 21408367  T
Q  271 acacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  21408366 acatatgtctgctatgatggt 21408346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23575184 - 23574937
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  23575184 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgt 23575085  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    |  ||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||| | ||  |  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23575084 tcaatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggctcgaattaatgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 23574985  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| |||||  | || || ||||| |||||||||||    
T  23574984 tgcagatgccttgagtaggaaggcattgcatatgtccgctatgatggt 23574937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21497259 - 21497150
Alignment:
Q  164 atgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcagga 263  Q
    |||||||| |||| |||| | ||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21497259 atgaggcaaagaagatggcttgagttgttggaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcagga 21497160  T
Q  264 aaacgttaca 273  Q
    | ||||||||    
T  21497159 agacgttaca 21497150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 256
Target Start/End: Original strand, 820 - 933
Alignment:
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  820 ttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggt 919  T
Q  244 tgc-agatgctttg 256  Q
    ||| ||||||||||    
T  920 tgcaagatgctttg 933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20800852 - 20800662
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  20800852 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 20800753  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagc 234  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||  |||  ||| | ||  | ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  20800752 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactttgatttgaattatcatccaggtaaagc 20800662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 21936149 - 21936366
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  21936149 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 21936248  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    | | |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  21936249 ggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 21936348  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  21936349 tatgtctgctttgatggt 21936366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24582617 - 24582400
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  24582617 atttggaggaactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 24582518  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  24582517 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 24582418  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  24582417 tatgtctgctttgatggt 24582400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27012491 - 27012274
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| |  || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  27012491 atttggaggcactatctgtatggttctaagttcgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 27012392  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    | | |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  27012391 ggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 27012292  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  27012291 tatgtctgctttgatggt 27012274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 291
Target Start/End: Original strand, 21830878 - 21830939
Alignment:
Q  230 aaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  21830878 aaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtttgctatgatggt 21830939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21882293 - 21882157
Alignment:
Q  155 gaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctt 254  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||| ||||  || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||  ||||| |    
T  21882293 gaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgttgatgcct 21882194  T
Q  255 tgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||| ||||| || ||  | ||||| |||||||||||    
T  21882193 tgagtaggaagacattgaatatgtccgctatgatggt 21882157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23504651 - 23504541
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||  ||||||| || ||||| |||| ||| |    
T  23504651 atttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccataagagtttgaagtacttgttaaatcagaaagagttgaatatgaagcaaa 23504552  T
Q  174 gaaaatggtta 184  Q
    ||| |||||||    
T  23504551 gaagatggtta 23504541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20775036 - 20774946
Alignment:
Q  204 attttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||| || ||||| | |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||||||    
T  20775036 attttggcttgaactaccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaa 20774946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 250169 - 249920
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  250169 tggagttggctgcggtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggtttcagatttgaagtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 250070  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  250069 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtg 249970  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  249969 gttgctgatgcgttgagcaggaaaacattacatatgtctgctttgatggt 249920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 23197064 - 23197317
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  23197064 tttggagttggctgcagtggt-tttgttttgaaaatttgaaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagtctgaaatat 23197162  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23197163 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 23197262  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23197263 tggttgctgatgcgttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 23197317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 24098422 - 24098671
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24098422 tggagttagttgcggtggtgtttgttttaaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatattt 24098521  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24098522 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagatcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtg 24098621  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||| |||||||    
T  24098622 gttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggt 24098671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19855847 - 19855596
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||||    
T  19855847 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatat 19855748  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19855747 ttatttgatcagaaggaattaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatg 19855648  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||| |||||||    
T  19855647 tggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggt 19855596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 20938880 - 20939134
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||| ||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||  | ||||||    
T  20938880 tttggggttggctggggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttctagatttgaggtattcagtgattacaaaagtctaaaatat 20938979  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  20938980 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaagccaatg 20939079  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||    
T  20939080 tggttgcagatgccttgagtaggaaaatgttgcatatgtctgctttgatggtaaa 20939134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 21744369 - 21744623
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21744369 tttggagttggctacggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtaaggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 21744468  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     |  ||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  21744469 ctgattgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgagtaaagctaatg 21744568  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21744569 tggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 21744623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Original strand, 20834717 - 20834960
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  20834717 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtttgaaatat 20834816  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20834817 ctgtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagttgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatg 20834916  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgct 283  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||    
T  20834917 tggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgct 20834960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 31538816 - 31539065
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31538816 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 31538915  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  31538916 atttgaccaaaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 31539015  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  31539016 gttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacgtgtcagctttgatggt 31539065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20295952 - 20295704
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    |||| |||||||  ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  20295952 tggaattggctgtggtggtttttgttttggaaatttggagacattatttgtacggttccagatctgaggtgttcaatgatcataaaagtttgaagtattt 20295853  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||     
T  20295852 atttgaccagaaggttctgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaggccaatgta 20295753  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatgg 290  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  20295752 gttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatgg 20295704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21952449 - 21952200
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21952449 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactatttgtacggttcaagatttgaggtgttctgtgatcataaaagtttgaaatattt 21952350  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21952349 gtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 21952250  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||| |||||||    
T  21952249 gttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggt 21952200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 37678620 - 37678371
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37678620 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 37678521  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| || || ||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  37678520 atttgaccaaaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggtttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 37678421  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  37678420 gttgttgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggt 37678371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 19661953 - 19662205
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttg-ttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaata 138  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||  | |||||    
T  19661953 tttggagttggctgcggtggtttttggttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagattcgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaata 19662052  T
Q  139 tttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaat 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  19662053 tttatttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaat 19662152  T
Q  239 gtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||| |||||||    
T  19662153 gtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcatatgtctgctttgatggt 19662205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 430937 - 431187
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  430937 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtacggttcgagatttgaagtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 431036  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  || ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  431037 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 431136  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  431137 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaa 431187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 20060769 - 20061020
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20060769 tttggagttggccgcggtggtttttgtattaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatat 20060868  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     | ||||| || || |||||||||||||||||||| | |||  | ||  | || ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  20060869 ctgtttgaccaaaacgaattgaacatgaggcagaggagatgacttgaattattaaaggattatgattttggcttgaactaccattcgggtaaagctaatg 20060968  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  20060969 tagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 20061020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 279
Target Start/End: Original strand, 20855577 - 20855816
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||    
T  20855577 tttggagctggctgcggtggtgtttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaagtat 20855676  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     | ||||| || || |||||||||||||||||||| | |||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  20855677 ctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaatgattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatg 20855776  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtc 279  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  20855777 tagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtc 20855816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Original strand, 51332315 - 51332561
Alignment:
Q  45 agttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatt 144  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||    
T  51332315 agttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtt 51332414  T
Q  145 tgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggtt 244  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  51332415 cgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtt 51332514  T
Q  245 gcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||| ||||  ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  51332515 gcagatgccttgattaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 51332561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 21234552 - 21234799
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| | |||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||  |    
T  21234552 gagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaagatttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatattagt 21234651  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||| | | |||| ||||| || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  21234652 tcgatcaaaaggaattgaatatgagacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 21234751  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  21234752 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtccgctttgatggt 21234799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 33389850 - 33390097
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  33389850 gagttggcggcagtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 33389949  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||| || | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33389950 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatgactagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgt 33390049  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  33390050 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 33390097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 41352483 - 41352730
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |    
T  41352483 gagttggcggcagtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgt 41352582  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  41352583 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaagattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgt 41352682  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  41352683 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 41352730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 16349417 - 16349664
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  16349417 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 16349516  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16349517 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 16349616  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  16349617 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 16349664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19107906 - 19107659
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  19107906 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgt 19107807  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||| |  ||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  19107806 tcgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 19107707  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||  | ||||| |||||||||||    
T  19107706 tgcagatgccttgagtaggaagacattgtatatgtccgctatgatggt 19107659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21831808 - 21831594
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  21831808 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 21831709  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  21831708 gatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 21831609  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  21831608 gtccgctatgatggt 21831594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 17043836 - 17044083
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||  |||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |    
T  17043836 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagatattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgt 17043935  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  17043936 tggatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgt 17044035  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  17044036 tgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 17044083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 22361065 - 22361315
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  22361065 gagttggctgttgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgagatgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 22361164  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||  | ||  || ||||||| ||||||||||  || |  |||||| |||||||||| ||||| ||    
T  22361165 tcgatcagaagtaattgaatatgaggcagcgtagatgacttgaattgctgaaggactatgattttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgt 22361264  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  22361265 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatatctgctatgatggtaaa 22361315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22110527 - 22110310
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||    
T  22110527 tggagacattatttgtacggttttagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatttgagacagcgaa 22110428  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
      ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||    
T  22110427 ggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatat 22110328  T
Q  277 gtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||  |||||||||||||    
T  22110327 gtcctctatgatggtaaa 22110310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22114376 - 22114159
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||    
T  22114376 tggagacattatttgtacggttgtagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatttgagacagcgaa 22114277  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
      ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||    
T  22114276 ggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatat 22114177  T
Q  277 gtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||  |||||||||||||    
T  22114176 gtcctctatgatggtaaa 22114159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 52987311 - 52987206
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  52987311 tggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 52987212  T
Q  142 atttga 147  Q
    ||||||    
T  52987211 atttga 52987206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21025711 - 21025464
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||||||  || | ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  21025711 gagttggcggctgtggtcgttatattaaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgt 21025612  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||  |||  ||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||    
T  21025611 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgaatttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatggtgt 21025512  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  21025511 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 21025464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21838456 - 21838241
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaa-agcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaga 175  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  21838456 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcagcaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcga 21838357  T
Q  176 aaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacaca 275  Q
    | |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || |    
T  21838356 agatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 21838257  T
Q  276 tgtctgctatgatggt 291  Q
    |||| || ||||||||    
T  21838256 tgtccgccatgatggt 21838241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21750478 - 21750228
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||   |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | |    
T  21750478 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggaaaaattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgaacataagagtttgaagtatctgt 21750379  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||| | |  ||| | ||  || ||||| | ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21750378 tcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaagaactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 21750279  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||||||    
T  21750278 tgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaa 21750228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 270
Target Start/End: Original strand, 24793471 - 24793664
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||| ||  |||    
T  24793471 tggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaacgaattgaacatgagacaacgaa 24793570  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgtt 270  Q
      ||| ||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24793571 ggtggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaaaacgtt 24793664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 289
Target Start/End: Original strand, 19759753 - 19759939
Alignment:
Q  103 atttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattat 202  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | |  ||| | ||  ||||||| ||||||    
T  19759753 atttgaagtgtttagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgatcagaatgaattgaatatgagacaacggaggtggcttgaattgttgaaagattat 19759852  T
Q  203 gattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  19759853 gattttgggttgaattatcatccaggaaaagctaatgttgttgcagatgcgttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatg 19759939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16373974 - 16373821
Alignment:
Q  138 atttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaa 237  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  16373974 atttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaa 16373875  T
Q  238 tgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| || || || |||||||||||||||||    
T  16373874 tgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggt 16373821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 20830243 - 20830460
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  20830243 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 20830342  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  20830343 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 20830442  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  20830443 tatgtctgctttgatggt 20830460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Original strand, 41216708 - 41216817
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  41216708 atttggaggcattatctatatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccataaaagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 41216807  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  41216808 gaagatggtt 41216817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 22134374 - 22134625
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| ||  || || ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||     
T  22134374 tttggaattggcagctgttgtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgatgtgttcagtgaccacaagagtttgaagtac 22134473  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||| ||||    | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||    
T  22134474 ttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaaggtggtcagagtaccttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatg 22134573  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    | ||||| ||||||||||| || || || || || ||||||||| |||||||    
T  22134574 ttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggt 22134625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 291
Target Start/End: Original strand, 16077630 - 16077724
Alignment:
Q  197 gattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  16077630 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccttgaggaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 16077724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20915109 - 20915000
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || || || || || ||| | ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  20915109 atttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttaaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaa 20915010  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  20915009 gaagatggtt 20915000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 32069 - 32318
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32069 tggagttggctgttgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttaaaatattt 32168  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  32169 atttgatcagaaggaattgaacatgaggtagagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtg 32268  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  32269 gttgctgatgcgttgagcagcaaaacattacatatgtctgctttgatggt 32318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 42 - 293
Target Start/End: Original strand, 6895 - 7146
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6895 tggagttggctgcggtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagcttgaaatattt 6994  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6995 gtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtg 7094  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaa 293  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||| | |||||||    
T  7095 gttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctgctttaatggtaa 7146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23772 - 23521
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23772 tttggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 23673  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23672 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatg 23573  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||    
T  23572 tggttgatgatgcgttgagcaggaagacattacatatgtctgctttgatggt 23521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 101 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20891 - 20701
Alignment:
Q  101 agatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  20891 agatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttcgagctgttgaaagatt 20792  T
Q  201 atgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||    
T  20791 atgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacattacatatgtctgctttgatggt 20701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 45)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33224448 - 33224199
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33224448 tggagttggctgctgtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattacttgtacggtttcagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttaaaatattt 33224349  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33224348 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtg 33224249  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||    
T  33224248 gttgctgatgcgttgagcaggaagacattacatatgtctgctttgatggt 33224199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 15357865 - 15358119
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||||    
T  15357865 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatat 15357964  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15357965 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggtgagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagccaatg 15358064  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15358065 tggttgcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 15358119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 15002109 - 15002363
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15002109 tttggagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 15002208  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15002209 ttatttgattagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 15002308  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15002309 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaa 15002363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 29452284 - 29452533
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29452284 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 29452383  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  29452384 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 29452483  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  29452484 gttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggt 29452533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 3263541 - 3263790
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3263541 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 3263640  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  3263641 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 3263740  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  3263741 gttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggt 3263790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 47 - 291
Target Start/End: Original strand, 11205983 - 11206227
Alignment:
Q  47 ttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttg 146  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11205983 ttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattctttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttg 11206082  T
Q  147 atcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgc 246  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  11206083 accagaaggaactgaacatgaggtagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgc 11206182  T
Q  247 agatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  11206183 tgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggt 11206227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15247450 - 15247197
Alignment:
Q  41 ttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatt 140  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  15247450 ttggagttagctgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggtattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatatt 15247351  T
Q  141 tatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgt 240  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  15247350 tatttgatccgaaggaattgaatatggggcagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgactttggtttgaattaccattcgggtaaagctaatgt 15247251  T
Q  241 ggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15247250 ggttgcagatgttttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 15247197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15071886 - 15071632
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  15071886 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggctctagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatat 15071787  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||  | |||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  15071786 ttttttgaccaaaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatg 15071687  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15071686 tagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 15071632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16149238 - 16148984
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |  || || ||||||    
T  16149238 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacatgagtttaaaatat 16149139  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16149138 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggtagaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 16149039  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || || || ||||| ||  ||||||||||    
T  16149038 tggttgcagatacgttgagcaggaagacattgcatatgtccgccttgatggtaaa 16148984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16153384 - 16153130
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |  || || ||||||    
T  16153384 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacatgagtttaaaatat 16153285  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16153284 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggtagaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 16153185  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || || || ||||| ||  ||||||||||    
T  16153184 tggttgcagatacgttgagcaggaagacattgcatatgtccgccttgatggtaaa 16153130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 294
Target Start/End: Original strand, 44660613 - 44660865
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  44660613 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttgaaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 44660712  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||     
T  44660713 atttgaccagaaggaactgaacatgagacagaggaggtggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgtt 44660812  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||| | ||||||||    
T  44660813 gttgctgatgctttgagcaagaaaactttgcatatgtctgctttaatggtaaa 44660865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8707442 - 8707196
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || || |||||||||||||    
T  8707442 gagttggctgctgtggtttttgcgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttatcgatcacaagagtttgaaatatttat 8707343  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||  ||| | ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  8707342 ttgatcaaaaggaattgaatatgag-cagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 8707244  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  8707243 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggt 8707196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27901913 - 27901659
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  27901913 tttggaattggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatat 27901814  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     | ||||| || || |||||||||||||||||||| | |||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27901813 atgtttgaacaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 27901714  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  27901713 tagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccatgatggtaaa 27901659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 289
Target Start/End: Original strand, 51605537 - 51605786
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  51605537 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatat 51605636  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  51605637 ttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatg 51605736  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  51605737 tagtcgcggatgcgttgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatg 51605786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15320599 - 15320409
Alignment:
Q  104 tttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatg 203  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||  ||| | ||  |||||||||||||||    
T  15320599 tttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagagaaggtggcttgaattgttgaaggattatg 15320500  T
Q  204 attttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||||  |||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15320499 attttggtatgaattatcacccaggtaaagctaatgtgattgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatggtaaa 15320409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 18614313 - 18614560
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |    
T  18614313 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcataagagtttgaagtatttgt 18614412  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  18614413 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggatagaactgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 18614512  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| ||||| ||||||| ||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  18614513 tgctgatgccttgagcatgaagacattgcatatgtccgctttgatggt 18614560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23957270 - 23957023
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  23957270 gagttggcggcagtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 23957171  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23957170 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgt 23957071  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  23957070 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 23957023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8387935 - 8387688
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  8387935 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 8387836  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  8387835 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 8387736  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  8387735 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 8387688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 16353934 - 16354181
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |    
T  16353934 gagttggcggctgtggtctttgttttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagattcgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgt 16354033  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||| | ||  | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16354034 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 16354133  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  16354134 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 16354181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 29037893 - 29038140
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  29037893 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 29037992  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  29037993 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 29038092  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  29038093 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 29038140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 8052112 - 8052359
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  8052112 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 8052211  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  8052212 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 8052311  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  8052312 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 8052359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12525199 - 12524952
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||| | ||||| |    
T  12525199 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaagagtttgcagtatttgt 12525100  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  12525099 tcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 12525000  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||  |||||||||||    
T  12524999 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatggt 12524952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 18225935 - 18226182
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |    
T  18225935 gagttggcggctgtggtctttgtatttaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaaatatttgt 18226034  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||| |||||||| || ||||||||| | | |||| ||||  ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  18226035 tcgatcaaaaggaattaaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactatggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 18226134  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  18226135 tgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtcagctttgatggt 18226182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18298728 - 18298481
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||  ||||| |    
T  18298728 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgt 18298629  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  18298628 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 18298529  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  18298528 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 18298481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 1648022 - 1648276
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||    
T  1648022 tttggagttggctgcagtggtttttgtcttgaagatttggaggcactacttgtatggttcacgatttgaagtatttagtgaccacaaaagtttgaaatat 1648121  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||   ||| || ||||    
T  1648122 ttatttgatcagaaggagctgaacatgaggtagaggagatggttagagctgttgaaagactatgactttggtttgaattaccaccctaataaggctaatg 1648221  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  1648222 ttgtggcggatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccatgatggtaaa 1648276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14682090 - 14681870
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  14682090 gagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 14681991  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||| |  ||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14681990 tcgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggatgtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 14681891  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaa 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  14681890 tgcagatgccttgagtaggaa 14681870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12478123 - 12477876
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||  ||||| |    
T  12478123 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgt 12478024  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  12478023 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 12477924  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  12477923 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 12477876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 19777282 - 19777529
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||  ||||| |    
T  19777282 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgt 19777381  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  19777382 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 19777481  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  19777482 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 19777529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27712826 - 27712612
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27712826 tggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgaa 27712727  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| ||||| || | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  27712726 gatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcatat 27712627  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| || ||||||||    
T  27712626 gtccgccatgatggt 27712612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14160993 - 14160746
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  14160993 gagttggccgcagtagtctttgtattgaagatatggagacattacttatatggttcgaggtttgaagtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 14160894  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14160893 tcgaccagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgagttactgaaggattttgattttggcttgaattatcatccgggtaaagcgaatgtcgt 14160794  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
     || ||||| || || || || || || || ||||| |||||||||||    
T  14160793 agctgatgccttaagtagaaagaccttgcatatgtccgctatgatggt 14160746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 291
Target Start/End: Original strand, 15146386 - 15146621
Alignment:
Q  56 gtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaagg 155  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| || |||||||| |    
T  15146386 gtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacgagagcttgaaatatttgttcgatcagaaag 15146485  T
Q  156 aattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcttt 255  Q
    ||||||| ||||||||| |||   || | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |     
T  15146486 aattgaatatgaggcagcgaaggcggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgcctc 15146585  T
Q  256 gagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  15146586 gagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggt 15146621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 40474563 - 40474316
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  40474563 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 40474464  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  |  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40474463 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagacttactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggt 40474364  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| || || ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  40474363 tgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 40474316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 14302500 - 14302714
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  14302500 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 14302599  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  || || ||    
T  14302600 gatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagatattgcatat 14302699  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  14302700 gtccgctatgatggt 14302714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14695603 - 14695386
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||| ||  |||    
T  14695603 tggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattggatatgagacaacgaa 14695504  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
      ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| | ||| || ||    
T  14695503 ggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagaagttgcatat 14695404  T
Q  277 gtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  14695403 gtccgctatgatgttaaa 14695386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 14849888 - 14850105
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||    
T  14849888 tggagacattatttgtacgattctagatttgaagtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgagacagcgaa 14849987  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
      ||| | ||  |  |||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||    
T  14849988 ggtggcttgaatttgtgaaagactatgattttgggtttaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgctttaagtaggaagacgttgcatat 14850087  T
Q  277 gtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||| ||| ||||||||||    
T  14850088 gtccgctgtgatggtaaa 14850105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 118 - 291
Target Start/End: Original strand, 15413849 - 15414022
Alignment:
Q  118 tgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaat 217  Q
    |||||| ||||| ||||||||  |||||||| | || |||||||| ||||||||  |||  ||| | ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  15413849 tgatcacaaaagtttgaaatacctatttgataaaaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaat 15413948  T
Q  218 tatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  15413949 tatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatggt 15414022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20892391 - 20892255
Alignment:
Q  158 ttgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttga 257  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  20892391 ttgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattga 20892292  T
Q  258 gcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||||||| || || ||||||||| | ||||||||    
T  20892291 gcaggaaaacattgcatatgtctgctttaatggtaaa 20892255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9292328 - 9292111
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  9292328 atttggaggcactatttgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 9292229  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||| | |||||||  ||||| ||||||||| || |  || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  9292228 gaagatggttggaatatcttaaggactttgattttcacttgagttatcatcctgggagggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgca 9292129  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  9292128 tatgtctgctttgatggt 9292111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 15291937 - 15292154
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  15291937 atttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaa 15292036  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  15292037 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 15292136  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  15292137 tatgtctgctttgatggt 15292154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14998808 - 14998592
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || || || ||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  14998808 atttggaggcactatttgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgacca-aagagtttaaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 14998710  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  14998709 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgca 14998610  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  14998609 tatgtctgctttgatggt 14998592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 209
Target Start/End: Original strand, 18548841 - 18548973
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| | |    
T  18548841 tggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaaagagttgaatatgagacagcgga 18548940  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttg 209  Q
     |||||| ||| | || ||||| ||||||||||    
T  18548941 gatggttggagttcttaaaggactatgattttg 18548973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 171
Target Start/End: Original strand, 12415973 - 12416031
Alignment:
Q  113 ttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggca 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  12415973 ttcagtgatcataacagcttgaaatatctatttgatcagaaggaaatcaaaatgaggca 12416031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 174
Target Start/End: Original strand, 12341644 - 12341744
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |  ||||| |||||||| || || || || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12341644 atttggaggcattatttgtatcattctaagtttgaagtgttcagcgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 12341743  T
Q  174 g 174  Q
    |    
T  12341744 g 12341744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 156
Target Start/End: Original strand, 15423058 - 15423101
Alignment:
Q  113 ttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaagga 156  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15423058 ttcagtgatcataagagcttgaaatatctattcgatcagaagga 15423101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 123
Target Start/End: Original strand, 56566280 - 56566359
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatca 123  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  56566280 gagttagctgctgtggtctttgtattgaagatatggagaaattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatca 56566359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 5296096 - 5296350
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  5296096 tttggagttggctacggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagtctgaaatat 5296195  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5296196 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcaaagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 5296295  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5296296 tggttgttgatgcgttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 5296350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21472992 - 21472738
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  21472992 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggctctagatttgaggtgtttagtgatcataagagattgaaatat 21472893  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21472892 ttatttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 21472793  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21472792 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 21472738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 42 - 294
Target Start/End: Original strand, 10467741 - 10467993
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10467741 tggagttggctgcggtggtatttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttctagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatattt 10467840  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  10467841 gtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 10467940  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||| ||||    
T  10467941 gttgctgatgctttgagcagaaaaacattgcatatgtctgctttgatgataaa 10467993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24365801 - 24365549
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24365801 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 24365702  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||     
T  24365701 gtttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgtt 24365602  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||    
T  24365601 gttgctgatgctttgagcaggaaaaccttgcacatgtctgctttaatggtaaa 24365549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Original strand, 14378807 - 14379049
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||    
T  14378807 tttggagttggctgcggtagtttttgtattgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataagagtctaaaatat 14378906  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14378907 ttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 14379006  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgc 282  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| | || ||||||||    
T  14379007 tggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgcatatgtctgc 14379049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Original strand, 14380357 - 14380599
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||    
T  14380357 tttggagttggctgcggtagtttttgtattgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataagagtctaaaatat 14380456  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14380457 ttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 14380556  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgc 282  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| | || ||||||||    
T  14380557 tggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgcatatgtctgc 14380599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18796081 - 18795827
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  18796081 tttggagttggctgcggtagtttttgttttgaagatttggaggcactacttgtatggttccaggtttgaagtgtttagtgatcacaagagcttgaaatat 18795982  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18795981 tcatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagccaatg 18795882  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  18795881 tagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggctttaatggtaaa 18795827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 62 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19454789 - 19454560
Alignment:
Q  62 tttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattga 161  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19454789 tttgttttgaagatttggaggcatgatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcaaaaggaattga 19454690  T
Q  162 acatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcag 261  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19454689 acatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcag 19454590  T
Q  262 gaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| || || || ||||||||| |||||||    
T  19454589 gaagacattgcatatgtctgctttgatggt 19454560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 21563022 - 21563276
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  21563022 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcacaaaagtttgaaatat 21563121  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || || |  ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21563122 ttgtttgatcaaaaggaattgaatatgagacaaaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 21563221  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21563222 tagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaa 21563276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 21568881 - 21569135
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  21568881 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcaaaaaagtttgaaatat 21568980  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || || |  ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21568981 ttgtttgatcaaaaggaattgaatatgagacaaaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 21569080  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21569081 tagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaa 21569135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 43 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19436390 - 19436142
Alignment:
Q  43 ggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattta 142  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19436390 ggagttcgatgcggtggtgtttgttttgaaaacttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcggtgatcataaaagcttgaaatattta 19436291  T
Q  143 tttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtgg 242  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  19436290 tttgatcagaaggagttgaatatgaggtagaggatatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtgg 19436191  T
Q  243 ttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||  |||| |||||| |||| || || || ||||||||| |||||||    
T  19436190 ttgctaatgcgttgagccggaagacattgcatatgtctgctttgatggt 19436142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19880685 - 19880438
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19880685 gagttggctgcggtggtttttgtcttaaagatttggaggcactacttgtatggttccaggttcgaagtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttat 19880586  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  19880585 ttgaccagaaggagttgaacatgagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaacgtagt 19880486  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||    
T  19880485 tgcagatgctttgagtagaaagacgttgcacatgtcggccatgatggt 19880438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 34644480 - 34644727
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34644480 gagttggctgcggtggtctttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccaggttcgaagtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttat 34644579  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  34644580 ttgaccagaaggagttgaacatgagacagaggagatggctagagttattgaaggattatgagtttgggttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagt 34644679  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||    
T  34644680 tgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 34644727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27188823 - 27188576
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |    
T  27188823 gagttggcggctgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgt 27188724  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27188723 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgt 27188624  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  27188623 tgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggt 27188576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 27260417 - 27260664
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |    
T  27260417 gagttggcggctgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgt 27260516  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27260517 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgt 27260616  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  27260617 tgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggt 27260664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15460727 - 15460473
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  15460727 tttggagttggctgcggtggtatttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatat 15460628  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     | ||||| || || |||||||||||||||||||| | |||| ||||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15460627 ctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggctagaattattaaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatg 15460528  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||||||    
T  15460527 tagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaa 15460473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 289
Target Start/End: Original strand, 28281707 - 28281952
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |    
T  28281707 gagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccaggtttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgt 28281806  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  28281807 ttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagcaaatgtagt 28281906  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  28281907 cgcggatgcattgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatg 28281952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 19488166 - 19488413
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| |    
T  19488166 gagttggctgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggccccatatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttct 19488265  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||| | || |||||||| ||||||||  |||  ||| | |   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  19488266 ttgataaaaaagaattgaatatgaggcaccgaaggtggcttggattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgt 19488365  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||    
T  19488366 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgaatatgtctgctatgatggt 19488413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23079856 - 23079606
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  23079856 gagttggctgctgtggtttttgtattgaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatttgt 23079757  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    || |||| ||||||||||| ||||  ||| |||  ||| |  |  |||||||||||||||||||| | || || |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23079756 tttatcataaggaattgaatatgaaacagcgaaggtggctcaaattgttgaaggattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgt 23079657  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23079656 tgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 23079606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22435256 - 22435012
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |    
T  22435256 gagttggctgttgtggtttttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatctgt 22435157  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||| |||  ||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22435156 ttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgt 22435057  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgat 288  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  22435056 tgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgat 22435012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22443654 - 22443410
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | |    
T  22443654 gagttggctgttgtggtttttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatctgt 22443555  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||| |||  ||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22443554 ttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgt 22443455  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgat 288  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  22443454 tgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgat 22443410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 28262091 - 28262338
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  28262091 gagttggcagctgtagtctttgtgttaaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 28262190  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || | ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  28262191 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgt 28262290  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  28262291 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgccatgatggt 28262338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 28340840 - 28341087
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  28340840 gagttggcagctgtagtctttgtgttaaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 28340939  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || | ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  28340940 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgt 28341039  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  28341040 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgccatgatggt 28341087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 151 - 283
Target Start/End: Original strand, 8761934 - 8762066
Alignment:
Q  151 gaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagat 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8761934 gaaggatttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagat 8762033  T
Q  251 gctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgct 283  Q
    || ||||| ||||||||| | || |||||||||    
T  8762034 gccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgct 8762066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19866074 - 19865827
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||| | |||||||| |    
T  19866074 gagttggcggctatggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttcaggtgtttagtgatcacaagagcctaaaatatttgt 19865975  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||| | ||  | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  19865974 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 19865875  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19865874 tgctgatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctatgatggt 19865827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25113939 - 25113692
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  25113939 gagttagcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 25113840  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  25113839 tcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtagatggctagagttgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 25113740  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  25113739 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 25113692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 27564715 - 27564962
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| |    
T  27564715 gagttggcagttgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttaaagtatttgt 27564814  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||  || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27564815 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 27564914  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  27564915 tgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 27564962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 29590814 - 29591061
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  29590814 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 29590913  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  29590914 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 29591013  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  29591014 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 29591061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 22761349 - 22761599
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  22761349 gagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgagatatttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 22761448  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| | ||  |||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22761449 ttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtatatggcttgaattgttgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgt 22761548  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  22761549 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatggtaaa 22761599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 18406838 - 18407088
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  18406838 gagttggctgctgtggtctttgtattaaaaatatggagacgttacttgtatggttcgagatttgatgtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 18406937  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||| | ||  || | || |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  18406938 tcgatcagaaggaatggaacatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaacgttgt 18407037  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    || ||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  18407038 tgtagacgctttgagcaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaa 18407088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 2873730 - 2873944
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  2873730 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 2873829  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  2873830 gatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 2873929  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  2873930 gtccgctatgatggt 2873944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 294
Target Start/End: Original strand, 20636235 - 20636445
Alignment:
Q  84 attatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggtt 183  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| |    
T  20636235 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggct 20636334  T
Q  184 agagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgct 283  Q
     ||  || ||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||    
T  20636335 tgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttacatatgttcgct 20636434  T
Q  284 atgatggtaaa 294  Q
    |||||||||||    
T  20636435 atgatggtaaa 20636445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18449870 - 18449650
Alignment:
Q  71 aaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggc 170  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| || ||||||     
T  18449870 aaaatttggaggagttatctgtatggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtttgaaatatttatttgacgagaaagaattaaatatgaggt 18449771  T
Q  171 agagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgtt 270  Q
    || |||  ||| | ||  || | ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||    
T  18449770 agtgaaggtggcttgaattgctaaaggattataatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcatatgctttaagtaggaaaacatt 18449671  T
Q  271 acacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  18449670 acatatgtctgctatgatggt 18449650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 290
Target Start/End: Original strand, 18966219 - 18966432
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  18966219 atttggagacattatctgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagc 18966318  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    |||  ||| | ||  | ||||| |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||| ||    |||| ||||||||| || ||||||||  ||||    
T  18966319 gaaggtggcttgaattattgaaagattatgatttttggttgaattatcatctaggtaaagctaa---cgttgtagatgctttaagtaggaaaactctaca 18966415  T
Q  274 catgtctgctatgatgg 290  Q
     ||||||||||||||||    
T  18966416 tatgtctgctatgatgg 18966432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 1541978 - 1542225
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  1541978 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 1542077  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| | ||  |||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  1542078 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgttaaaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgt 1542177  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| |||||  |||| || || || ||||| |||||||||||    
T  1542178 tgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 1542225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15897450 - 15897236
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||      
T  15897450 atttggagacattacttgtatggttctagatt-gaagtgttcagtgatcataagagtctgaagtatttgtttgatcagaatgaattgaatatgagacaac 15897352  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    |||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||    
T  15897351 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctaca 15897252  T
Q  274 catgtctgctatgatg 289  Q
     ||||| || ||||||    
T  15897251 tatgtccgcgatgatg 15897236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 278
Target Start/End: Original strand, 18196657 - 18196861
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  18196657 atttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagc 18196756  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    |||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||  |||||| || || ||||| || |||||    
T  18196757 gaaggtggctcgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttatagatgccttaagtaggaagactttaca 18196856  T
Q  274 catgt 278  Q
     ||||    
T  18196857 tatgt 18196861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Original strand, 24312062 - 24312282
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  24312062 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 24312161  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  24312162 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 24312261  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaa 264  Q
    | ||||| | ||||| |||||    
T  24312262 ttcagattccttgagtaggaa 24312282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 16962339 - 16962589
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| |||| ||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |  ||||| ||| | |    
T  16962339 gagttagctgatgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaagtgtttagtgatcacaagactttgaagtatctgt 16962438  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| | ||  || | ||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16962439 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgctaaaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgt 16962538  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    || |||||| ||||| |||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  16962539 tggagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaaa 16962589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 16381297 - 16381514
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16381297 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 16381396  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  16381397 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 16381496  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  16381497 tatgtctgctttgatggt 16381514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 25608755 - 25609002
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||  |||| ||| | |    
T  25608755 gagttagctgatgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaagagtctgaagtatctgt 25608854  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||| ||||||||||||| ||||| |||  ||  ||| | ||  || | || |||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  25608855 tcgattagaaggaattgaatatgagacagcaaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgt 25608954  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||    
T  25608955 tgcagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggt 25609002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 5838143 - 5838360
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  5838143 atttggagacactacttgtatggttcgaggtttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaagaattgaatatgagacaga 5838242  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    |||  ||| ||||   | | ||||| |||||||| |  ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||    
T  5838243 gaaggtggctagaatcgctaaaggactatgatttcgaattgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgca 5838342  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||| |||||||||||    
T  5838343 tatgtccgctatgatggt 5838360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 16648859 - 16649110
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| ||  || || ||||||||||| ||| |  | ||||| | |||||||||||||||||| || || || ||||| |||    
T  16648859 tttggaattggcggctgttgtgtatgcattgaagatttggaggcactatctacatggttctaaatttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtat 16648958  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||    
T  16648959 ttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatg 16649058  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    | ||||| ||||||||||| || || || || || ||||||||| |||||||    
T  16649059 ttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggt 16649110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 291
Target Start/End: Original strand, 16625756 - 16625858
Alignment:
Q  189 tgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgat 288  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || |||||    
T  16625756 tgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgat 16625855  T
Q  289 ggt 291  Q
    |||    
T  16625856 ggt 16625858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Original strand, 14624281 - 14624390
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  14624281 atttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 14624380  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    | | ||||||    
T  14624381 ggagatggtt 14624390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Original strand, 16926684 - 16926784
Alignment:
Q  194 aaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaa 293  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||    
T  16926684 aaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaa 16926783  T
Q  294 a 294  Q
    |    
T  16926784 a 16926784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16099366 - 16099257
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16099366 atttggaggcattatctgtatgattctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 16099267  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  16099266 gaagatggtt 16099257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23997605 - 23997388
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  23997605 atttgaaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 23997506  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    | | |||||| ||     | | ||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  23997505 ggagatggttggaatatcttacggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 23997406  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  23997405 tatgtctgctttgatggt 23997388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 174
Target Start/End: Original strand, 1647738 - 1647838
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  1647738 atttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 1647837  T
Q  174 g 174  Q
    |    
T  1647838 g 1647838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 168
Target Start/End: Original strand, 16621974 - 16622098
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  16621974 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 16622073  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgag 168  Q
    | ||||||||||||||||| |||||    
T  16622074 tcgatcagaaggaattgaatatgag 16622098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16234385 - 16234168
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||| | ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  16234385 atttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaa 16234286  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||||||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||  ||||||||| | || || || || ||    
T  16234285 gaagatggttagaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgtggatgctttgtgtagaaagactttgca 16234186  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  16234185 tatgtctgctttgatggt 16234168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 18836832 - 18837049
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| | |||||| || | || ||||| |||||||| |    
T  18836832 atttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatgaggaagagttgaatatgaggcaaa 18836931  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  18836932 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 18837031  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  18837032 tatgtctgctttgatggt 18837049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18574546 - 18574407
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||| |  ||| ||||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18574546 atttggaggcattatctgtatgattctaagtttaaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 18574447  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggctt 213  Q
    | | |||||| ||    || ||||||| ||||||||||||    
T  18574446 ggagatggttggaatattttaaggattttgattttggctt 18574407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14129826 - 14129609
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |  ||| | ||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  14129826 atttggaggcattatatgtttggttctaagttttaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaa 14129727  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| |||    | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||  ||||||||| | || || || || ||    
T  14129726 gaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgttgatgctttgtgtagaaagactttgca 14129627  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  14129626 tatgtctgctttgatggt 14129609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21928562 - 21928345
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||||    
T  21928562 atttggaagcattatatgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaatgagttcaatatgaggcaga 21928463  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    |||  ||||| |||    | |||||||  ||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || || || ||    
T  21928462 gaaggtggttggagtatcttaaggatttcgattttcagttgagttatcatcccgggaaggcaaatgttgttgccgacgctttgagtagaaagactttgca 21928363  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  21928362 tatgtctgctttgatggt 21928345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Original strand, 35275010 - 35275119
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |    
T  35275010 atttggagtcattatctgtatggttctaagtttgatgtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcaaa 35275109  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  35275110 gaacatggtt 35275119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Original strand, 23026640 - 23026749
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |  ||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||| ||| |    
T  23026640 atttggaggcattatctgtatggttataagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaagcaaa 23026739  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  23026740 gaagatggtt 23026749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 45 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13022869 - 13022621
Alignment:
Q  45 agttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatt 144  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13022869 agttggcttcggtggtgtttgtttttaaaatttggaggcattatttgtacgtttccagatttgatgtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttgtt 13022770  T
Q  145 tgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggtt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  13022769 tgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggtt 13022670  T
Q  245 gcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaa 293  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  13022669 gctgatgcgttgagcaggaaaacattacatatgtctgctttgatggtaa 13022621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 16949204 - 16949455
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16949204 tttggagttggctacggtggtgtttgttttaaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 16949303  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  16949304 ttattttatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaaaccaatg 16949403  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||| |||||||    
T  16949404 tggttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctctgatggt 16949455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19148728 - 19148474
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19148728 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 19148629  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || |||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19148628 ttgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatg 19148529  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19148528 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 19148474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20748127 - 20747873
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20748127 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 20748028  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || |||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20748027 ttgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatg 20747928  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20747927 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 20747873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19614188 - 19613938
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19614188 gagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttat 19614089  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  19614088 ttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagt 19613989  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  19613988 tgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaa 19613938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 15101339 - 15101589
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  15101339 gagttagctgcggtgatttttgttttataaatttggaggcattatttgtacgattccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctgaaatatttat 15101438  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15101439 ttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggt 15101538  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15101539 tgcagatgctctgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 15101589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 140 - 390
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  140 tggagttggctgcggtattgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttcctgattcgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 239  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  240 atttgattagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtt 339  T
Q  242 gttgc-agatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| | |||| ||| ||||||| || || || ||||||||| |||||||    
T  340 gttgctaaatgcgttgcgcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggt 390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12458153 - 12457903
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12458153 gagttggctgcggtggtatttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttaaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgt 12458054  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  12458053 ttgatcagaaggaattgaaaatgaggcaaaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtagt 12457954  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||| ||||    
T  12457953 tgctgatgctttgagcagaaaaacattgcatatgtctgctttgatgataaa 12457903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13667054 - 13666800
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||    
T  13667054 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatat 13666955  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||| |    
T  13666954 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatcctagtaaagccaacg 13666855  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  13666854 tggttgcaaatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctttgatggtaaa 13666800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 16071027 - 16071281
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16071027 tttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 16071126  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     |||||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||    
T  16071127 ctatttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagctaatg 16071226  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  16071227 tggttgtagatgctttgagcaggaagacattgcacatgtctgctatgatggtaaa 16071281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 14262976 - 14263230
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  14262976 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgtaatat 14263075  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     | |||||| | || || ||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14263076 ctgtttgataaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatg 14263175  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14263176 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtctactataatggtaaa 14263230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 11304997 - 11305246
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11304997 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 11305096  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  11305097 atttgaccagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggctaatgtg 11305196  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  11305197 gttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggt 11305246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 13967402 - 13967651
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13967402 tggaattggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgagatgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 13967501  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  13967502 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttattgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaggccaatgtt 13967601  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| |||||||| | | ||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  13967602 gttgctgatgctttaacccggaaaactttgcacatgtctgctttgatggt 13967651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 49153816 - 49153567
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49153816 tggagttagctgcggtagtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatattt 49153717  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |  |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  49153716 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 49153617  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  49153616 gttgcggacgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggt 49153567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 11387160 - 11387414
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  11387160 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcataaaagtttgaaatat 11387259  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||  | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11387260 ttgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagagaaggtggcttgaattattgaaggattatgattttggattgaattaccatccgggtaaagctaatg 11387359  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11387360 tagttgtagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaa 11387414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 14285108 - 14285362
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| || ||  |||| |||    
T  14285108 tttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgtagtattcagtgatcacaagagtctgaagtat 14285207  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  14285208 ttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagctaacg 14285307  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||    
T  14285308 tagttgctgatgcgttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaa 14285362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15341948 - 15341694
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||| |||    
T  15341948 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatctgtatggttccaaatttgaggtgttcagtgatcacaagagtctgaagtat 15341849  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||| |||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  15341848 ttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattattattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaatg 15341749  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  15341748 tagttgctgatgcattgagcaggaagacgctgcatatgtctgctatgatgataaa 15341694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 26117324 - 26117588
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccaga---------------tttgaggtgttcagtgatcataa 126  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||    
T  26117324 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagatttgaggtgttcagtgatcataa 26117423  T
Q  127 aagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccg 226  Q
    |||  |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26117424 aagtctgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatccg 26117523  T
Q  227 ggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  26117524 ggttaagccaatgttgtggctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggt 26117588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 23504602 - 23504856
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  23504602 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatat 23504701  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  23504702 ttgtttgatcagaaggaattaaacatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatg 23504801  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  23504802 tagtcgctgatgcattgagtaggaagacgctgcatatgtctgctatgatgataaa 23504856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 12205532 - 12205783
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  12205532 tttggagttggctgcggtggtttttgtgttaaaaatttggagaccttatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtac 12205631  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     |||||||||| || |||||||| ||||||||| | |  ||| | ||  |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  12205632 ctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatg 12205731  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||||||    
T  12205732 ttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatatcagctatgatggt 12205783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 289
Target Start/End: Original strand, 18052685 - 18052934
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  18052685 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatat 18052784  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  18052785 ttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatg 18052884  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
    | || || ||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  18052885 tagtcgcggatgctttgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatg 18052934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14213183 - 14212939
Alignment:
Q  47 ttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttg 146  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |    
T  14213183 ttggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattagttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttcg 14213084  T
Q  147 atcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgc 246  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||    
T  14213083 atcagaaggaattgaaaatgaggcaaagaagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgc 14212984  T
Q  247 agatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  14212983 agatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 14212939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 11235971 - 11236218
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  11235971 gagttggcggctgtcgtctttgtattgaagatatggaggcattacttgtatggttcgagatttaaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 11236070  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  11236071 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 11236170  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  11236171 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 11236218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14333908 - 14333661
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |    
T  14333908 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgt 14333809  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14333808 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 14333709  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  14333708 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 14333661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14956066 - 14955819
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  14956066 gagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatgggtcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 14955967  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||| |  ||| | ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14955966 tcgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 14955867  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  14955866 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 14955819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 15159815 - 15160062
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||    
T  15159815 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttat 15159914  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15159915 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 15160014  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  15160015 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 15160062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8200140 - 8199893
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  8200140 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 8200041  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  8200040 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 8199941  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  8199940 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 8199893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8709117 - 8708870
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  8709117 gagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 8709018  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  8709017 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 8708918  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  8708917 tgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggt 8708870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 23202371 - 23202618
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||||  |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||||||||| |    
T  23202371 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgagatttggggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttgt 23202470  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||| || |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||  ||    
T  23202471 tcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgt 23202570  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  23202571 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 23202618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 23508498 - 23508745
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||||  |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||||||||| |    
T  23508498 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgagatttggggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttgt 23508597  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||| || |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||  ||    
T  23508598 tcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgt 23508697  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  23508698 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 23508745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 44790142 - 44790356
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  44790142 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 44790241  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  44790242 gatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 44790341  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| || ||||||||    
T  44790342 gtccgccatgatggt 44790356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15205101 - 15204884
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||      
T  15205101 atttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgctcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacaac 15205002  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    |||  ||| | ||  || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  15205001 gaaggtggctcgaattgctgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttaca 15204902  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     |||||||||||||||||    
T  15204901 tatgtctgctatgatggt 15204884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 16076 - 16323
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |    
T  16076 gagttggcggctctagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaacagtttgaagtatttgt 16175  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||| ||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16176 ttgatcagaagaaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 16275  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  16276 tgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 320795 - 321042
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  320795 gagttggccgctgtagtctttgtattgaagatatgaagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 320894  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||  || | || |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  320895 ttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 320994  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| ||||| || || ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  320995 tgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggt 321042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18179254 - 18179007
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| | || || ||||| ||||| |    
T  18179254 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgattacaagagtttgaagtatttgt 18179155  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||| || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  18179154 tctatcagaaggaattgaacatgaggcagtgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 18179055  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  18179054 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 18179007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 11770999 - 11771249
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| |||    
T  11770999 gagttagctgcagtggtttttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatctat 11771098  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||| | ||  | ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  11771099 ttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggctcgaatttttgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgt 11771198  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||| || || ||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  11771199 tgcagatgccttaagtaggaagatgttgcatatgtccgctatgatggtaaa 11771249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13687543 - 13687329
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  |||    
T  13687543 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaa 13687444  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| || || || ||    
T  13687443 gatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcatatgccttgagtaggaagacattgcatat 13687344  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| || ||||||||    
T  13687343 gtccgccatgatggt 13687329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 291
Target Start/End: Original strand, 18550550 - 18550763
Alignment:
Q  78 ggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaa 177  Q
    |||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||     
T  18550550 ggagacattacttgtatgattcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaag 18550649  T
Q  178 atggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatg 277  Q
    |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||    
T  18550650 atggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatg 18550749  T
Q  278 tctgctatgatggt 291  Q
    || || ||||||||    
T  18550750 tccgccatgatggt 18550763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12689013 - 12688765
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |    
T  12689013 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtctgaagtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgt 12688914  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggatt-atgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtgg 242  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  12688913 tcaatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaggatttatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttg 12688814  T
Q  243 ttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  12688813 ttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 12688765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9597569 - 9597322
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || | ||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||  ||||| |    
T  9597569 gagttggcagctgtggtctttgtattgaagatattgagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaggtatttgt 9597470  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | | |||| |||| ||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  9597469 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaactactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 9597370  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  9597369 tgcagatgccttgagcatgaagacattgcatatgtccgctttgatggt 9597322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10872474 - 10872260
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  10872474 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 10872375  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  10872374 gatggctcgaattgttgaaagattatgactttgggttggattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 10872275  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| || ||||||||    
T  10872274 gtccgccatgatggt 10872260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 11551860 - 11552107
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||  ||||| ||||| ||||  ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  11551860 gagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggaaacattacttgtatggtttgagatttgaggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 11551959  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||  || ||||||||||| | ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  11551960 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattgctgaaggattataactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgt 11552059  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| |  || || || || ||||| |||||||||||    
T  11552060 tgcagatgccttgagtaaaaagacattgcatatgtccgctatgatggt 11552107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 291
Target Start/End: Original strand, 15147654 - 15147890
Alignment:
Q  55 tgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaag 154  Q
    |||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||||||||    
T  15147654 tgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaag 15147753  T
Q  155 gaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctt 254  Q
    |||||||| ||||||||| | |  ||| | ||  || |||| || | ||||||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  15147754 gaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaaagaatttgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcct 15147853  T
Q  255 tgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||| ||||| || || || |||||||||||||||||    
T  15147854 tgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggt 15147890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14041180 - 14040957
Alignment:
Q  71 aaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggc 170  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  14041180 aaaatatggagacattacttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagac 14041081  T
Q  171 agagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgtt 270  Q
    || |||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||||  || |  | |||| |||||||||| ||||| |||| |||||| || || ||||| || ||    
T  14041080 agcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacatt 14040981  T
Q  271 acacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
     || ||| | ||||||||||||||    
T  14040980 gcatatgcccgctatgatggtaaa 14040957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14351210 - 14350987
Alignment:
Q  71 aaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggc 170  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  14351210 aaaatatggagacattacttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagac 14351111  T
Q  171 agagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgtt 270  Q
    || |||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||||  || |  | |||| |||||||||| ||||| |||| |||||| || || ||||| || ||    
T  14351110 agcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacatt 14351011  T
Q  271 acacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
     || ||| | ||||||||||||||    
T  14351010 gcatatgcccgctatgatggtaaa 14350987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7825382 - 7825165
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  7825382 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 7825283  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  7825282 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 7825183  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  7825182 tatgtctgctttgatggt 7825165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 27106562 - 27106779
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  27106562 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 27106661  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  27106662 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 27106761  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  27106762 tatgtctgctttgatggt 27106779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27171763 - 27171546
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  27171763 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 27171664  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  27171663 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 27171564  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  27171563 tatgtctgctttgatggt 27171546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 264
Target Start/End: Original strand, 39937 - 40124
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |    
T  39937 tggagacattatttgtatgggtcaaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaaggagttgaatatgagacagcgga 40036  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaa 264  Q
     |||||| ||  | || ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| || || |||||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  40037 gatggttggaattcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccaggaaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaa 40124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15625902 - 15625819
Alignment:
Q  208 tggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  15625902 tggcttgaattatcatccaggtaaagataatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctgctatgatggt 15625819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23642959 - 23642823
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| || || |||||  ||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  23642959 tttggaattggctgcagttgtgtttgtgttgaagatttgacggcattatttgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgatcacacaagtttgaagtat 23642860  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    || |||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  23642859 ttgtttgactagaaggagttgaatatgagacagagaa 23642823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15626007 - 15625909
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcag 172  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  | || ||||| ||||||||||||||||| || | |||||||    
T  15626007 atttggagacattatttatatggttctagatttgaagtgttcagtgatcacaaaagtctaaagtatttgtttgatcagaaggaattaaatacgaggcag 15625909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14937829 - 14937612
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  14937829 atttggaggcattatctttatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaaaagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaa 14937730  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| |||    | |||||||  ||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||  ||||||||||| || || || || ||    
T  14937729 gaagatggttggagtatcttaaggatttcgattttcagttgagttatcatcctggaaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgca 14937630  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  14937629 aatgtctgctttgatggt 14937612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15365422 - 15365205
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  15365422 atttggaggcattatctttatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaaaagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaa 15365323  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| |||    | |||||||  ||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||  ||||||||||| || || || || ||    
T  15365322 gaagatggttggagtatcttaaggatttcgattttcagttgagttatcatcctggaaaggcgaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgca 15365223  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  15365222 aatgtctgctttgatggt 15365205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 14139196 - 14139142
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtac 94  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14139196 tttggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtac 14139142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17925133 - 17925031
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |  ||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  17925133 atttggaggcattatctgtttggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 17925034  T
Q  174 gaa 176  Q
    |||    
T  17925033 gaa 17925031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4441410 - 4441298
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||  |    
T  4441410 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggccaa 4441311  T
Q  174 gaaaatggttaga 186  Q
    ||| |||||||||    
T  4441310 gaagatggttaga 4441298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 44341 - 44090
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  44341 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaattat 44242  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44241 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatg 44142  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||| || || || ||||||||| |||||||    
T  44141 tggttgctaatgcgttgagtaggaagacattgcatatgtctgctttgatggt 44090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 2103 - 2357
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2103 tttggagttggctgcagtagtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 2202  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2203 ttatttgatcagaaggaattgaacatgagacagaggagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 2302  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  2303 tagttgcagatgccttgcgtaggaaaacgttgcatatgtctactatgatggtaaa 2357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8618 - 8378
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||    
T  8618 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatctggaggcactgtttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatat 8519  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  8518 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatg 8419  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtct 280  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||| ||||| || ||||||    
T  8418 tggttgcagatgtcttgaataggaagacgttgcatatgtct 8378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Original strand, 31415664 - 31415902
Alignment:
Q  45 agttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatt 144  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31415664 agttggctgcagtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtccagtgatcataaaagcttgaaatatttatt 31415763  T
Q  145 tgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggtt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  31415764 tgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccattctggtaaagccaatgtggtt 31415863  T
Q  245 gcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgct 283  Q
    || || || ||||||||||| || || || |||||||||    
T  31415864 gctgacgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgct 31415902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21842010 - 21841756
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21842010 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaaggttgaaatat 21841911  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||| |||| | ||| |||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21841910 ttatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcaaagaagatggcttgagatgttgaaggattatgatttctgtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 21841811  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21841810 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttaaacatgtctgctatgatggtaaa 21841756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23656520 - 23656266
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23656520 tttggagtttgctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtattcagtgatcacaaaagcttgaaatat 23656421  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23656420 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggtagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattactatccgggtaaagccaatg 23656321  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23656320 tggttgcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 23656266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6605249 - 6605000
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6605249 tggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 6605150  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  6605149 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 6605050  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  6605049 gttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggt 6605000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 29302616 - 29302865
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  29302616 tggaattggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagattcgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaaatattt 29302715  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  29302716 gtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaggctaatgtg 29302815  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||| |||||||    
T  29302816 gttgcagatgcgttaagcaggaaaacattgcatatgtctgctttgatggt 29302865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 47 - 294
Target Start/End: Original strand, 16270419 - 16270666
Alignment:
Q  47 ttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttg 146  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  16270419 ttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgaccataaaagtttgaaatatctgtttg 16270518  T
Q  147 atcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16270519 atcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 16270618  T
Q  247 agatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
     ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||    
T  16270619 tgatgcattgagcaggaaaacattgcacatgtctgctttaatggtaaa 16270666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 20009109 - 20009362
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20009109 tttggagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttcctgatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 20009208  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||    
T  20009209 ttatttgatcaaaaggaattaaacatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactgtgattttggtttgaattatcaccccggtaaa-ctaatg 20009307  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20009308 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 20009362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 20984735 - 20984989
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  20984735 tttggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatttggagacattatttgtacggttctagatttgaggtgcttagtgatcataaaagtttgaaatat 20984834  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     | ||||| || || |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20984835 ctgtttgaccaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatg 20984934  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20984935 ttgttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 20984989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27356127 - 27355924
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27356127 tggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatattt 27356028  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  27356027 atttgaccagaaggaactaaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 27355928  T
Q  242 gttg 245  Q
    ||||    
T  27355927 gttg 27355924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14566733 - 14566484
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14566733 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacgattccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 14566634  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14566633 atttgaacagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 14566534  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  14566533 gttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggt 14566484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Original strand, 20974844 - 20975087
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||  | ||||||    
T  20974844 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctaaaatat 20974943  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20974944 ttatttgataagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 20975043  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgct 283  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||    
T  20975044 tggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgct 20975087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20389692 - 20389441
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  20389692 tttggagttggctgttgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatat 20389593  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||  ||| |  |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20389592 ttatttgatcaaaaggaattaaatatgaggcagcgaaggtggcttcaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatg 20389493  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  20389492 ttgttgcagattctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggt 20389441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22372524 - 22372270
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  22372524 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaagtat 22372425  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     ||||||| || ||  ||||||| ||||||||||||| |||| | ||  | |||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  22372424 ctatttgaccaaaaataattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatg 22372325  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22372324 tagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 22372270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Original strand, 21324457 - 21324700
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  21324457 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtttgaaatat 21324556  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21324557 ttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 21324656  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgct 283  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||    
T  21324657 tggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcatgtgtctgct 21324700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22052456 - 22052202
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||| |  ||  |||| |||    
T  22052456 tttggagttggctgcagtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtatggtttcagatttgaagtattcagcgatcacaggagtctgaagtat 22052357  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  22052356 ttatttgaccagaaggaattgaacatgagacagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacg 22052257  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||    
T  22052256 tagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaa 22052202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 86 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12306305 - 12306097
Alignment:
Q  86 tatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttag 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  12306305 tatttgtacggttctagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagtttgaaatatctgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttat 12306206  T
Q  186 agctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctat 285  Q
    || |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||||||||| |    
T  12306205 agttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagctgtaaaacattgcatatgtctgcttt 12306106  T
Q  286 gatggtaaa 294  Q
     ||||||||    
T  12306105 aatggtaaa 12306097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 289
Target Start/End: Original strand, 31570034 - 31570279
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |    
T  31570034 gagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgt 31570133  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  31570134 ttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagt 31570233  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  31570234 cgcggatgcgttgagtaggaagacacttcatatgtctgctatgatg 31570279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 21393057 - 21393307
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  21393057 gagttggcggctgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 21393156  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  || |||| |||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21393157 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 21393256  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| | ||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  21393257 tgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaa 21393307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 21787551 - 21787801
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  21787551 gagttggcggctgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 21787650  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  || |||| |||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21787651 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 21787750  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| | ||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  21787751 tgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaa 21787801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 30312336 - 30312583
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  30312336 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaattatttgt 30312435  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||| || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  30312436 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 30312535  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  30312536 tgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 30312583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32601733 - 32601486
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||    
T  32601733 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttat 32601634  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  ||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||    
T  32601633 ttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaatcatcatccaggtaaagctaatgttgt 32601534  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  32601533 tgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 32601486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 20395354 - 20395571
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||     
T  20395354 atttggagacgttatttgtatggttctagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagc 20395453  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    |||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  20395454 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactttaca 20395553  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||| | |||||||||    
T  20395554 tatgtcagttatgatggt 20395571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 17673215 - 17673462
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  17673215 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 17673314  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17673315 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 17673414  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  17673415 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 17673462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 19483256 - 19483503
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |    
T  19483256 gagttggcggcagtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgt 19483355  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  19483356 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaagattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgt 19483455  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  19483456 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 19483503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 21165730 - 21165977
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |    
T  21165730 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaaatacttgt 21165829  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||| || || ||||| ||||||||| | | |||| ||||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  21165830 tcgatcaaaaagagttgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 21165929  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  21165930 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 21165977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 21920928 - 21921178
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||| |      
T  21920928 gagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagattttgaagtatctgc 21921027  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| | ||  || | ||  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21921028 tcgatcagaaggaattgaacatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaatattatgattttgagttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgt 21921127  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  21921128 tgcagatgctttgagtaggaagacttttcacatgtctgccatgatggtaaa 21921178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19861028 - 19860900
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  19861028 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtttgaaatat 19860929  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgag 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19860928 ttatttgatcaaaaggaattgaatatgag 19860900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18858166 - 18857919
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  18858166 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 18858067  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  18858066 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgt 18857967  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  18857966 tgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggt 18857919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 20017455 - 20017702
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  20017455 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 20017554  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  20017555 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 20017654  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  20017655 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 20017702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21044034 - 21043787
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||| ||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  21044034 gagttggctgatgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 21043935  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| | ||  || ||||||| ||||||||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  21043934 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctcgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgt 21043835  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||||| |||| ||||| || || || |||||||||||||||||    
T  21043834 tgcagatgctctgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21043787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22041448 - 22041201
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || || | ||| ||||| |    
T  22041448 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagttggaagtatttgt 22041349  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22041348 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagccaatgttgt 22041249  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  22041248 tgcggatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 22041201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19979555 - 19979309
Alignment:
Q  45 agttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatt 144  Q
    ||||||| | |||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19979555 agttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataaaagcttgaaatatatgtt 19979456  T
Q  145 tgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggtt 244  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||| | | |||| | ||  || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  19979455 cgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtacatggctggaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtt 19979356  T
Q  245 gcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||| ||||| |  || || || || ||||| |||||||||||    
T  19979355 gcagatgccttgagtataaagacattgcatatgtccgctatgatggt 19979309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 287
Target Start/End: Original strand, 22247658 - 22247868
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||    
T  22247658 tggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattaaatatgagacagcgaa 22247757  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
      ||| | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||    
T  22247758 ggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatat 22247857  T
Q  277 gtctgctatga 287  Q
    ||| |||||||    
T  22247858 gtccgctatga 22247868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 162 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19852882 - 19852750
Alignment:
Q  162 acatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcag 261  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19852882 acatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 19852783  T
Q  262 gaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19852782 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 19852750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 162 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19858918 - 19858786
Alignment:
Q  162 acatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcag 261  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19858918 acatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 19858819  T
Q  262 gaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19858818 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 19858786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Original strand, 22132233 - 22132453
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  22132233 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattaattgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 22132332  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||    
T  22132333 tcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtaaatggctagagttgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgatgt 22132432  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaa 264  Q
    |  |||||| |||||||||||    
T  22132433 tatagatgcgttgagcaggaa 22132453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19114279 - 19114032
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  19114279 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 19114180  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  19114179 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 19114080  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  19114079 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 19114032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21252533 - 21252283
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  21252533 gagttagctgctgtggtctttgtattgaagatatggagatattacttgtatggttcgagattcgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 21252434  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||   | || | | ||  || ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21252433 tcaatcagaaggaattgaatatgaggcagcatagatagcttgaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 21252334  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  21252333 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaa 21252283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 22119399 - 22119613
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  22119399 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 22119498  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||| || ||    
T  22119499 gatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatggcttgagtaggaagacgttgcatat 22119598  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  22119599 gtccgctatgatggt 22119613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 22128183 - 22128397
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  22128183 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 22128282  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||| || ||    
T  22128283 gatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatat 22128382  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  22128383 gtccgctatgatggt 22128397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15534969 - 15534725
Alignment:
Q  47 ttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttg 146  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||  ||||| || |    
T  15534969 ttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaggtatttgttcg 15534870  T
Q  147 atcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgc 246  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| ||||| || |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||    
T  15534869 atcagaaagaattgaatatgagacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatgatccaggtaaagctaatgttgttgc 15534770  T
Q  247 agatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||||    
T  15534769 agatgctttgagcaggaagacattgcacatgtccgctttgatggt 15534725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23886583 - 23886368
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||   ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||      
T  23886583 atttggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttcggtgatcataaaagtcagaagtatttgtttgatctgaaggaattgaatatgagacaac 23886484  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    |||  ||| |  |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||    
T  23886483 gaaggtggctttaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatcctggtaaaactaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctaca 23886384  T
Q  274 catgtctgctatgatg 289  Q
    |||||| || ||||||    
T  23886383 catgtccgccatgatg 23886368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 16876283 - 16876534
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| ||  || || |||| |||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| || || || ||||| |||    
T  16876283 tttggaattggcggctgttgtgtatgcattgaagatttagaggcattatctgtatggttctaaatttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtat 16876382  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||    
T  16876383 ttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatg 16876482  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    | ||||| ||||||||||| || || || || || ||||||||| |||||||    
T  16876483 ttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggt 16876534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 288
Target Start/End: Original strand, 22623262 - 22623472
Alignment:
Q  71 aaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggc 170  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||  |||| ||||| || |||||||    
T  22623262 aaaatttggagacattatctgtatggttctagatttgaagtgttcagtgattataaaagtatgaagtatttatttgactagaaagaattaaatatgaggc 22623361  T
Q  171 agagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgtt 270  Q
           | || ||  | |||| |||||||||||||   | || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  22623362 -------aaggctaatgttgttaaaggattatgattacaggttaaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacatt 22623454  T
Q  271 acacatgtctgctatgat 288  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  22623455 acatatgtctgctatgat 22623472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6680547 - 6680453
Alignment:
Q  197 gattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  6680547 gattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggt 6680453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23651630 - 23651383
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || | |||||| || ||  |||| ||| | |    
T  23651630 gagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttactgatcacaagagtctgaagtatctgt 23651531  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||||| |||  ||| | ||  |  | || |||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23651530 tcgatctgaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaatttctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgt 23651431  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| || || ||||| || || || |||||||||||||||||    
T  23651430 tgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggt 23651383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 22376678 - 22376896
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagct-tgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaga 175  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||  | |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||    
T  22376678 tggagacattatttaaacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaaagtctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcga 22376777  T
Q  176 aaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacaca 275  Q
    |  ||| | ||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||| ||||| ||||||||||| || || || || | ||| || |    
T  22376778 aggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcata 22376877  T
Q  276 tgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  22376878 tgtccgctatgatggtaaa 22376896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 22382853 - 22383071
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagct-tgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaga 175  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||  | |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||    
T  22382853 tggagacattatttaaacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaaagtctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcga 22382952  T
Q  176 aaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacaca 275  Q
    |  ||| | ||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||| ||||| ||||||||||| || || || || | ||| || |    
T  22382953 aggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcata 22383052  T
Q  276 tgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  22383053 tgtccgctatgatggtaaa 22383071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22435862 - 22435645
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  22435862 atttggaggcattatatgtatagttctaactttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaggagttgaatatgaggcaaa 22435763  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | || |||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  22435762 gaagatggttggaatatcttaaagattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgcagatgctttgagtagaaaaactttgca 22435663  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  22435662 tatgtctgctttgatggt 22435645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1267674 - 1267577
Alignment:
Q  197 gattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  | || || |||||||||||| ||||    
T  1267674 gattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagtcaatgtggttgcagatgcgttgaggaggaagacactgcatatatctgctatgatgataaa 1267577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19869286 - 19869062
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||  |||| ||||||||| | ||  | ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||     
T  19869286 tttggagttagcatctgtagtgtttgttcttaaggtatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatac 19869187  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || |||||||| || || ||||| ||||| ||| | | |||||| ||| | || ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| || || |||||||    
T  19869186 ttgtttgatcaaaatgagttgaatatgagacagcggagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccagggaaggccaatg 19869087  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaa 264  Q
    | || || ||||| ||||| |||||    
T  19869086 tagtagctgatgccttgagtaggaa 19869062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 171
Target Start/End: Original strand, 16407309 - 16407436
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  16407309 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgt 16407408  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggca 171  Q
    | ||||| || |||||||| ||||||||    
T  16407409 tcgatcaaaaagaattgaatatgaggca 16407436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 258
Target Start/End: Original strand, 21195724 - 21195908
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||  | ||||| |||||||| |    
T  21195724 atttggaggcattatctgtatggttctaaatttgaagttttcagtgaccataagagtttgaagtacttatttgatcagaaaaagttgaatatgaggcaaa 21195823  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgag 258  Q
    ||| |||| | ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  21195824 gaagatgggtggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggcgaatgttgttgctgatgctttgag 21195908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23901746 - 23901634
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |    
T  23901746 atttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgagacaaa 23901647  T
Q  174 gaaaatggttaga 186  Q
    ||| |||||||||    
T  23901646 gaagatggttaga 23901634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 183
Target Start/End: Original strand, 21849553 - 21849668
Alignment:
Q  68 ttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 167  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || |||||    ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  21849553 ttaaagatttggaggcattatctttatggttcttagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagaattgaatatga 21849652  T
Q  168 ggcagagaaaatggtt 183  Q
    ||||||| | ||||||    
T  21849653 ggcagaggagatggtt 21849668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 176
Target Start/End: Original strand, 23156262 - 23156364
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  23156262 atttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaa 23156361  T
Q  174 gaa 176  Q
    |||    
T  23156362 gaa 23156364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Original strand, 20651555 - 20651664
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| |  ||||||||||||| ||| || || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  20651555 atttggaggcattacctgtatggttctaagtttgaggtgttcaatgaccacaagagtttgaagtaattgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 20651654  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  20651655 gaagatggtt 20651664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 291
Target Start/End: Original strand, 803064 - 803112
Alignment:
Q  243 ttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  803064 ttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggt 803112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22316750 - 22316650
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| || || |  ||||| ||||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  22316750 atttggaggcattatctgtatggctctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 22316651  T
Q  174 g 174  Q
    |    
T  22316650 g 22316650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5334 - 5080
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5334 tttggagttggctgctgtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 5235  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  5234 ttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatg 5135  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5134 tggttgcagatgctttgagcaagaagacgttgcacatttctgctatgatggtaaa 5080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 55650 - 55899
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  55650 tggagttggctgcagtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcataagagtatgaaatattt 55749  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  55750 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttcaattaccatcctggtaaagccaatgtg 55849  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||| |||||||    
T  55850 gttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggt 55899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 32429 - 32679
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32429 gagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttat 32528  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  32529 ttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagt 32628  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  32629 tgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaa 32679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41782 - 41565
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  41782 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 41683  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  41682 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 41583  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  41582 tatgtctgctttgatggt 41565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13758 - 13507
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||||    
T  13758 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatat 13659  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13658 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatg 13559  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13558 tggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctacgatggt 13507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Original strand, 6590 - 6699
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  6590 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 6689  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  6690 gaagatggtt 6699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 300 - 551
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||||    
T  300 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttatacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatat 399  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  400 ttatttgataagaaggaattgaacatgaggcagaggagatgcttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatg 499  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  500 tggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctatgatggt 551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7574 - 7322
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  7574 gagttggctgttgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcataagagcttgaagtatctgt 7475  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||   | |||| | ||  || ||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7474 ttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcatagatggcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 7375  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaatg 296  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||    
T  7374 tgcagacgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaatg 7322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13579 - 13362
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |    
T  13579 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgta 13480  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  || ||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || |     
T  13479 gatggcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtcaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcataa 13380  T
Q  277 gtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||| |||||||||||    
T  13379 gtctgccatgatggtaaa 13362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23700 - 23591
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| |  ||| ||||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  23700 atttgaaggcattatctgtatggttctaagttttaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaa 23601  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  23600 gaagatggtt 23591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1427 - 1173
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1427 tttggagttggctgcggtggtttttgtttcgaaaatttggagacattatttgtacggttccaggtttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 1328  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1327 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaaaatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 1228  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1227 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtctactatgatggtaaa 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41256 - 41002
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41256 tttggagttggctgcggtgatttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatat 41157  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||| || | ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  41156 ttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggttttgattatcatccgggtaaagctaatg 41057  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41056 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 41002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 16337487 - 16337736
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16337487 tggagttggttgttgtggtgtttgttttaaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatattt 16337586  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  16337587 gtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccgatgtg 16337686  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  16337687 gttgctgatgcattgagcaggaaaacattacatatgtctgctttgatggt 16337736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12179494 - 12179243
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||||||    
T  12179494 tttgtagttggctgcggtggtttttattttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctgaaatat 12179395  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  12179394 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccagccgggcaaagccaatg 12179295  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12179294 tggttgcagatgcgttgagcaggaaaacgttgcatatgtctgctatgatggt 12179243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 13971097 - 13971347
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13971097 gagttggctgcggtggtctttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttat 13971196  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  13971197 ttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgactttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagt 13971296  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  13971297 tgcagatgccttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaa 13971347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 16827176 - 16827430
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  16827176 tttggagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatat 16827275  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16827276 ttatttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgacttgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 16827375  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16827376 tgtttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 16827430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 47125098 - 47124849
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  47125098 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 47124999  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  47124998 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 47124899  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  47124898 gttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggt 47124849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 294
Target Start/End: Original strand, 11960144 - 11960396
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11960144 tggagttggctgcggtggtatttgttttaaaaatttggaggcattacttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataagagtttgaaatattt 11960243  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||    
T  11960244 gtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagattgttagaactactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctagtaaggccaatgtg 11960343  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  11960344 gttgctgatgcattgaggaggaaaacattgcatatgtctgctttgatggtaaa 11960396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 294
Target Start/End: Original strand, 16328635 - 16328887
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16328635 tggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgataataaaagtttgaaatattt 16328734  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  16328735 gtttgatcagaaggaattgaacatgaggcacaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 16328834  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  16328835 gttgctgatgcattgagcaggaaaacattacatatgtctgctttaatggtaaa 16328887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 293
Target Start/End: Original strand, 13319475 - 13319728
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  13319475 tttggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatatggaggcactatctgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagcttgaggtat 13319574  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13319575 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 13319674  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaa 293  Q
    |||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||    
T  13319675 tggttgcgaatgcgttgagcaggaagaccttacatatgtctgcactgatggtaa 13319728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14087825 - 14087575
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14087825 gagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttat 14087726  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14087725 ctgattagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttaaactatcatccgggtaaagccaatgtagt 14087626  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  14087625 tgcagatgctttgagtaggaagacattacacatgtcggccatgatggtaaa 14087575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28755472 - 28755223
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28755472 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 28755373  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  28755372 atttgaccagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggtttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 28755273  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28755272 gttgcggatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggt 28755223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 18133319 - 18133573
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||    
T  18133319 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggctttatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatat 18133418  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18133419 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaatggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcatgaattaccatccgggtaaagctaatg 18133518  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||||| || | || || ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  18133519 tggttgcatataccttaagtaggaaaacgttgcatatgtctgctttgatggtaaa 18133573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17187530 - 17187276
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17187530 tttggagttggcttcggtggtttttgttttgaagatttgtaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatat 17187431  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17187430 ttatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttagtttgaactatcacccgggtaaagccaatg 17187331  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| ||||||||||||||    
T  17187330 tggttgcagatgcgttgagcaggaaggcattgcatatgtcggctatgatggtaaa 17187276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 31694161 - 31694410
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||  | ||||||||    
T  31694161 tggagttggctgcggtggtttttattttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctaaaatattt 31694260  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  31694261 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaacatcctggtaaagccaatgta 31694360  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  31694361 gttgcagatgctttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgctttgatggt 31694410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 12359504 - 12359751
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| ||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  12359504 gagttagctgcggtggtttttactttgaaaatttggaggcattacttgtatggttccagatttgaagtatttagtaatcacaaaagtttgaaatatttat 12359603  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12359604 ttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggatagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggt 12359703  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||| | ||||| || || ||||| || ||||||||| |||||||    
T  12359704 tgcagattccttgagtagaaagacgttgcatatgtctgctttgatggt 12359751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31940057 - 31939808
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||  | ||||||||    
T  31940057 tggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcacaagagtctaaaatattt 31939958  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  31939957 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgta 31939858  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  31939857 gttgcagatgctttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgctttgatggt 31939808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 95 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14575024 - 14574823
Alignment:
Q  95 ggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttga 194  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||| |    
T  14575024 ggttccaggtttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttaa 14574925  T
Q  195 aggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14574924 aggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 14574825  T
Q  295 tg 296  Q
    ||    
T  14574824 tg 14574823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 16379901 - 16380155
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16379901 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatat 16380000  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| || |    
T  16380001 ttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagcaaagctaacg 16380100  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||| ||||    
T  16380101 tagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaa 16380155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Original strand, 16835483 - 16835725
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16835483 tttggagttagctgcagtggtttttgttttgaagatttagaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatat 16835582  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||    
T  16835583 ttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatg 16835682  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgc 282  Q
    | ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||    
T  16835683 tagttgcggatgcgttgagcagaaagactttgcacatgtctgc 16835725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13943180 - 13942926
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||     
T  13943180 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatac 13943081  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13943080 ttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatg 13942981  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | || || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||| ||||    
T  13942980 tagtcgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaa 13942926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 14579926 - 14580180
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||    
T  14579926 tttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatat 14580025  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14580026 ttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatg 14580125  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14580126 ttgttgcagatgccttgagtaggaagaatttacacatgtccgctatgatggtaaa 14580180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 16491169 - 16491419
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  16491169 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 16491268  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16491269 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgggttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 16491368  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    || |||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  16491369 tgaagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaa 16491419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15228805 - 15228557
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  15228805 tttggagttggctgcggtggtttttgtgttgaaaatttggagacattatttatatggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtac 15228706  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     |||||||||| || |||||||| ||||||||| | |  ||| | ||  |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  15228705 ctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatg 15228606  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgat 288  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||    
T  15228605 ttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgat 15228557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15234673 - 15234425
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  15234673 tttggagttggctgcggtggtttttgtgttgaaaatttggagacattatttatatggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtac 15234574  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     |||||||||| || |||||||| ||||||||| | |  ||| | ||  |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  15234573 ctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatg 15234474  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgat 288  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||    
T  15234473 ttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgat 15234425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 41178678 - 41178429
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  41178678 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatat 41178579  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  41178578 ttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatg 41178479  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  41178478 tagtcgcggatgcgttgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatg 41178429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 294
Target Start/End: Original strand, 10419020 - 10419272
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| |    
T  10419020 tggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatct 10419119  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  10419120 gtttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgta 10419219  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||||||    
T  10419220 gttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaa 10419272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 44778399 - 44778154
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |    
T  44778399 gagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgt 44778300  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  44778299 ttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagt 44778200  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  44778199 cgctgatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctgctatgatg 44778154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 53384006 - 53384253
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  53384006 gagttggcggctgtagtctttgtgttgaaaatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 53384105  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |    
T  53384106 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgttat 53384205  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  53384206 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 53384253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 5423918 - 5424165
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  5423918 gagttggcagctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 5424017  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  5424018 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 5424117  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  5424118 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 5424165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16636915 - 16636668
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  16636915 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 16636816  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16636815 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 16636716  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  16636715 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 16636668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 43164239 - 43163992
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  43164239 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 43164140  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  43164139 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 43164040  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  43164039 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 43163992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17490992 - 17490742
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  17490992 gagttggctgctgtagtctttgtattgaatatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 17490893  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | || | | ||  || | || |||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17490892 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagattgcttgaattgcttaatgattatgattttgagttgagctatcatcctggtaaagctaatgttgt 17490793  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  17490792 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaa 17490742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Original strand, 14875487 - 14875695
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |    
T  14875487 gagttggcagctgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgt 14875586  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| | | |||| ||||  || |||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14875587 tcgatcagaatgaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttgatttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 14875686  T
Q  244 tgcagatgc 252  Q
    |||||||||    
T  14875687 tgcagatgc 14875695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6601878 - 6601631
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||| || || ||||| ||||| |    
T  6601878 gagttggcggccgtagtctttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttaatgatcacaagagattgaagtatttgt 6601779  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6601778 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgt 6601679  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  6601678 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 6601631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13253832 - 13253585
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  13253832 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 13253733  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  13253732 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgt 13253633  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  13253632 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 13253585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 16805935 - 16806182
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |    
T  16805935 gagttggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgt 16806034  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  || |||| |||||||| ||||  |||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  16806035 tcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggatagaattgctgaaagattatgactttgctttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgt 16806134  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  16806135 tgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 16806182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 20061042 - 20061289
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  20061042 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 20061141  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  20061142 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 20061241  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  20061242 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 20061289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10907352 - 10907105
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||  ||||| |    
T  10907352 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtattttt 10907253  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  10907252 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 10907153  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  10907152 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 10907105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 15588380 - 15588627
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||  ||||| |    
T  15588380 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgt 15588479  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15588480 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 15588579  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  15588580 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 15588627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 17493662 - 17493535
Alignment:
Q  164 atgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcagga 263  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17493662 atgaggcagagaagatggttaaagctgttgaaggattatgattttggtttgagttaccatccgggtaaagccaacgtggttgcagatgccttgaggagga 17493563  T
Q  264 aaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||    
T  17493562 agacgttgcatatgtctgctatgatggt 17493535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 48426589 - 48426342
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  48426589 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 48426490  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  48426489 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 48426390  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  48426389 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 48426342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15260739 - 15260522
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  15260739 tggagacattacttgtatggttcgagatttaaagtgttcagcgaccacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 15260640  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
      ||| | ||  ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || || ||    
T  15260639 ggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatat 15260540  T
Q  277 gtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  15260539 gtccgctatgatggtaaa 15260522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10006742 - 10006495
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || |  ||||| |    
T  10006742 gagttggcagctgtagtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttaaggtatttgt 10006643  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  10006642 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 10006543  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  10006542 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 10006495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15340411 - 15340164
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||| | |    
T  15340411 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgt 15340312  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||    
T  15340311 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgctgt 15340212  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  15340211 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 15340164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 264
Target Start/End: Original strand, 15347266 - 15347453
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  15347266 tggagacattacttgtttggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 15347365  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaa 264  Q
     |||| | ||| || | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  15347366 gatggcttgagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 15347453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 15723922 - 15724169
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  15723922 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 15724021  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| || | | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15724022 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatagcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 15724121  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    || |||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  15724122 tgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 15724169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 15401538 - 15401752
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| || || ||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  15401538 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggagtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 15401637  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  15401638 gatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 15401737  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  15401738 gtccgctatgatggt 15401752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16693296 - 16693059
Alignment:
Q  54 ctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaa 153  Q
    ||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||    
T  16693296 ctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttattgatcataagagtttgaagtatctgtttgaccagaa 16693197  T
Q  154 ggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgct 253  Q
    ||||||||| ||||| ||| | | |||| ||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||     
T  16693196 ggaattgaatatgagacagcgtagatggatagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcg 16693097  T
Q  254 ttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||  |||||||    
T  16693096 ttgagcaggaagacattgcatatgtctgccttgatggt 16693059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 291
Target Start/End: Original strand, 15014771 - 15014991
Alignment:
Q  71 aaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggc 170  Q
    |||||||||||||||||| | || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  15014771 aaaatttggaggcattatctatatgtttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgactagaaagaattgaatatgaggc 15014870  T
Q  171 agagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgtt 270  Q
    || |||  ||| | ||  || | ||| ||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || ||||| ||| || ||||||| || |||||||| ||    
T  15014871 agcgaaggtggcttgaattgctaaagaattatgatttcaggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttacaaatgctttaagtaggaaaacatt 15014970  T
Q  271 acacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  15014971 acatatgtctgctatgatggt 15014991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 14125582 - 14125829
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||  |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||||| | |||||| || ||||| || ||||| |    
T  14125582 gagttggtggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttaatgatcacaagagcttaaagtatttgt 14125681  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||   | |||| ||||  || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14125682 tcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcttagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 14125781  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  14125782 tgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 14125829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 10384826 - 10384732
Alignment:
Q  41 ttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaa 135  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10384826 ttggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaa 10384732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12499380 - 12499143
Alignment:
Q  54 ctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaa 153  Q
    ||||||| |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  12499380 ctgtggtctttgatttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaa 12499281  T
Q  154 ggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgct 253  Q
    ||||||||| ||||| || ||||  ||| | ||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||      
T  12499280 ggaattgaatatgagtcaaagaaggtggctcgagttattgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaacgtcgttgcagatggc 12499181  T
Q  254 ttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  12499180 ttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 12499143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3687085 - 3686897
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  3687085 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 3686986  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaa 232  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3686985 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaa 3686897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 16411270 - 16411517
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  16411270 gagttggcagccgtagtctttgtattgaagatatggagacactacttgtatggttcgagatttgaggtctttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 16411369  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  || |||| ||||| || ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  16411370 tcgaacagaaggaattgaatattaggcagagaagatggctagaattgctgaaagattacgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgt 16411469  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| || || ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  16411470 tgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 16411517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 13966362 - 13966579
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  13966362 atttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 13966461  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  13966462 gaagatggttggaatatcttaaggattttgatttttagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 13966561  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  13966562 tatgtctgctttgatggt 13966579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 8273417 - 8273634
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  8273417 atttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 8273516  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  8273517 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 8273616  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  8273617 tatgtctgctttgatggt 8273634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 16741721 - 16741938
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16741721 atttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 16741820  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| |||    | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  16741821 gaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 16741920  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  16741921 tatgtctgctttgatggt 16741938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30138928 - 30138711
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  30138928 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 30138829  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  30138828 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 30138729  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  30138728 tatgtctgctttgatggt 30138711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30148479 - 30148262
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  30148479 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 30148380  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  30148379 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 30148280  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  30148279 tatgtctgctttgatggt 30148262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15062827 - 15062613
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||| |||    
T  15062827 tggagacattacttgtatggttcgaggttttaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgagacagcgaa 15062728  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
      ||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  | |||||| ||||| || | |||||| || || ||||| || || || ||    
T  15062727 ggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatcaagttaaagctaatgttgtggtagatgccttaagtaggaagacattgcatat 15062628  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  15062627 gtccgctatgatggt 15062613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 168
Target Start/End: Original strand, 5109599 - 5109723
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  5109599 gagttggcggctgtagtctttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattttt 5109698  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgag 168  Q
    | ||||||||||||||||| |||||    
T  5109699 tcgatcagaaggaattgaatatgag 5109723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 183
Target Start/End: Original strand, 55514702 - 55514845
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| ||| || || ||||||||||||||| |||| ||||| | |||| | ||||| |||||||| || || ||||| |||    
T  55514702 tttggaattggcggctgttgtgtatgtgttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaaatttaaagtgttaagtgatcacaagagtttgaagtat 55514801  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggtt 183  Q
     | ||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  55514802 atgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatggtt 55514845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 291
Target Start/End: Original strand, 6151875 - 6152088
Alignment:
Q  78 ggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaa 177  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||||| |     
T  6151875 ggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatataaggcagaggag 6151974  T
Q  178 atggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatg 277  Q
    |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |||    
T  6151975 atggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatg 6152074  T
Q  278 tctgctatgatggt 291  Q
    |||||| |||||||    
T  6152075 tctgctttgatggt 6152088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25767440 - 25767223
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |    
T  25767440 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagcttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgagacaaa 25767341  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | |||||||  ||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  25767340 gaagatggtttgaatatcttaaggatttcgattttcaattgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgca 25767241  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  25767240 tatgtctgctttgatggt 25767223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15611225 - 15611008
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||| ||| || || || | ||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  15611225 atttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcaatgaccacaagagttcgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 15611126  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    | | |||||| ||     | ||||| | |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  || ||    
T  15611125 ggagatggttggaatatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtaggaagattttgca 15611026  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  15611025 tatgtctgctttgatggt 15611008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17194216 - 17194107
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17194216 atttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaaatacttgcttgatcaaaaagagttgaatatgaggcaga 17194117  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  17194116 gaagatggtt 17194107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12793266 - 12793154
Alignment:
Q  71 aaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggc 170  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| | ||||||||||| || ||||| | |||||    
T  12793266 aaaatttggaggcactatctgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatacgaggc 12793167  T
Q  171 agagaaaatggtt 183  Q
    |||| | ||||||    
T  12793166 agaggagatggtt 12793154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16258263 - 16258049
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  16258263 tggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagga 16258164  T
Q  177 aatggttagagctgt-tgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacaca 275  Q
     |||||| ||  | | | ||||||| |||||||   |||| |||||||||  | || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |    
T  16258163 gatggtt-gaaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccagaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcata 16258065  T
Q  276 tgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||| |||||||    
T  16258064 tgtctgctttgatggt 16258049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18751064 - 18750849
Alignment:
Q  76 ttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaga 175  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |  ||||| ||||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  18751064 ttggaggcattatctatatggttctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaga 18750965  T
Q  176 aaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacaca 275  Q
    |  ||||| |||    | |||||||   |||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |    
T  18750964 aggtggttggagtatcttaaggatttcaattttcagttgagttatcatccagggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcata 18750865  T
Q  276 tgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||| |||||||    
T  18750864 tgtctgctttgatggt 18750849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 40 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 109188 - 108932
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  109188 tttgaagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatat 109089  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  109088 ttatttgattagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatg 108989  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaatg 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  108988 tggttgtagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaatg 108932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 172
Target Start/End: Original strand, 55743 - 55871
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  55743 gagttagctgccgtggtttttgtgttgaagatgtggagacattacttatatggttcgagttttgaggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatatttat 55842  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcag 172  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  55843 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcag 55871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 291
Target Start/End: Original strand, 62928 - 63030
Alignment:
Q  189 tgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgat 288  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  62928 tgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgat 63027  T
Q  289 ggt 291  Q
    |||    
T  63028 ggt 63030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 12656 - 12907
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12656 tttggagttggctgtggtggttttcgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 12755  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaagccaatg 12855  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||| || |||||||    
T  12856 tggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctcctttgatggt 12907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 3701 - 3952
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||||| |||||  | ||||||    
T  3701 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttgcagacttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatat 3800  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  3801 ttatttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccacccgggtaaagctaatg 3900  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||| |||||||    
T  3901 tggttgcagatgccttgagtagcaagacgttgcatatgtctgctttgatggt 3952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 68928 - 68674
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||    
T  68928 tttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcatgatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaattat 68829  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||| | |||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  68828 ttgtttgatcataaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 68729  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  68728 tagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccatgatggtaaa 68674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 47782 - 48036
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  47782 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttaaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 47881  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47882 ttatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 47981  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47982 tggtcgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 48036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 292
Target Start/End: Original strand, 56595 - 56847
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||  | || |||    
T  56595 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgttcaatgatcaaaagagtctaaagtat 56694  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  56695 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaacg 56794  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggta 292  Q
    | ||||| ||||| ||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  56795 tagttgctgatgcgttgagcaagaagacgctgcacatgtctgctatgatggta 56847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4307 - 4053
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||    
T  4307 tttggagttagctgcggtggtttttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccaaatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaactat 4208  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4207 ttatttgatcagaaagaaatgaacatgaggcagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatg 4108  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  4107 tggttgcagatgcgttgagcatgaaggcgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 4053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 291
Target Start/End: Original strand, 42887 - 43106
Alignment:
Q  72 aaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggca 171  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||| |||||||| ||    
T  42887 aaatttggaggcattatctgtgcggttctagatttgaagtgttcagtaatcataaaagtttgaagtatttattctaccagaaagaattaaacatgagaca 42986  T
Q  172 gagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgtta 271  Q
    | |||  ||| ||||  || | || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||    
T  42987 gcgaaggtggctagaattgctaaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgctttaagtaggaaaacatta 43086  T
Q  272 cacatgtctgctatgatggt 291  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  43087 catatgtctgttatgatggt 43106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 209
Target Start/End: Original strand, 11944 - 12113
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||  | ||  | ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  11944 tttggagttagcagctgtagtgtttgtacttaaggtatggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatat 12043  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttg 209  Q
    || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | | |||||| ||| | || ||||| ||||||||||    
T  12044 ttgtttgatcaaaaggagttgaatatgagacagcggagatggttggagttcttaaaggactatgattttg 12113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23277934 - 23277680
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||| |||| ||||| || ||||||    
T  23277934 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattacttgtacggatccagatttgaagtatttagttatcacaaaagtttaaaatat 23277835  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23277834 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 23277735  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23277734 tggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 23277680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20829415 - 20829166
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20829415 tggagttagctgcggtggtttttgtcttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 20829316  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||    
T  20829315 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtgaggccaatgtg 20829216  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20829215 gttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggt 20829166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Original strand, 19651335 - 19651578
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19651335 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 19651434  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||    
T  19651435 ttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcctaggaaagctaatg 19651534  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgct 283  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| | || |||||||||    
T  19651535 tggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgcatatgtctgct 19651578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31831814 - 31831565
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31831814 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 31831715  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  31831714 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 31831615  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31831614 gttgctgatgctttgagtaggaaaactttacacatgtctgctttgatggt 31831565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23295093 - 23294839
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||    
T  23295093 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatatggaggcaatatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctgaaatat 23294994  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  23294993 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatt 23294894  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  23294893 tggtggcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctttaatggtaaa 23294839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1064907 - 1064658
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1064907 tggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 1064808  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  1064807 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 1064708  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1064707 gttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggt 1064658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24949744 - 24949497
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||  | ||||||||||    
T  24949744 gagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttaaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttat 24949645  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24949644 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagccaatgtggt 24949545  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24949544 tgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggt 24949497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23111894 - 23111640
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||||||||||| |||||| || || || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  23111894 tttggagttggctgttgtggttttcgtgttgaaaattttgaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatat 23111795  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||| | ||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23111794 ttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagccaatg 23111695  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23111694 ttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 23111640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 23099303 - 23099557
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  23099303 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatctggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcacaaaagtttgaaatat 23099402  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||| || || |  ||| | ||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23099403 ttgtttgattaaaaggaattgaatatgagacaaaggaggtggcttgaattgatgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 23099502  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23099503 tagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaa 23099557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25264212 - 25264022
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  25264212 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtttgaaatat 25264113  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25264112 ttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagactatgattttggtttgaattaccatccgggta 25264022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12575511 - 12575262
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  12575511 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttatatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatat 12575412  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  12575411 ttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatg 12575312  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  12575311 tagtcgcggatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctgctatgatg 12575262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27788898 - 27788650
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  27788898 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatat 27788799  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  27788798 ttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatg 27788699  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| ||  | || |||||||||||||||    
T  27788698 tagtcgctgatgcattgagtaggaagacact-catatgtctgctatgatg 27788650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 27209457 - 27209711
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  27209457 tttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatat 27209556  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     | ||||| || || ||||||||||||||||| || | |||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27209557 ctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcaaaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 27209656  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | || |||||||| ||||| || || || || |||||||| ||  ||||||||||    
T  27209657 tagtcgcagatgcgttgagtagaaagacattgcacatgtccgccttgatggtaaa 27209711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 45533499 - 45533252
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  45533499 gagttagctgcagtggtttttgtacttaaaatttggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtttgaagtatttat 45533400  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||  |||| ||||| || ||||||||| |||  ||||| ||  || | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  45533399 ttgacaagaaagaattaaatatgaggcagcgaaggtggtttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgt 45533300  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  45533299 tgcagatgctttaagtaggaaaacattaaatatgtctgctatgatggt 45533252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 23107019 - 23107269
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||    
T  23107019 gagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctat 23107118  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | || | ||||  || |||| |||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  23107119 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatagatagaattgctgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgcgtaaagctaatgttgt 23107218  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  23107219 tacagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaa 23107269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16926514 - 16926267
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  16926514 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 16926415  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16926414 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 16926315  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  16926314 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 16926267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 17000154 - 16999907
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  17000154 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 17000055  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17000054 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 16999955  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  16999954 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 16999907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 22324145 - 22324392
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  22324145 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 22324244  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22324245 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgt 22324344  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  22324345 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 22324392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27219170 - 27218923
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||  ||||| |    
T  27219170 gagttggcggctgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgt 27219071  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27219070 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 27218971  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  27218970 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 27218923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16924010 - 16923796
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  16924010 tggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 16923911  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  16923910 gatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 16923811  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| || ||||||||    
T  16923810 gtccgccatgatggt 16923796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16983273 - 16983059
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  16983273 tggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 16983174  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  16983173 gatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 16983074  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| || ||||||||    
T  16983073 gtccgccatgatggt 16983059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 21144363 - 21144577
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| | |    
T  21144363 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgta 21144462  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| ||||  || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  21144463 gatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 21144562  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  21144563 gtccgctatgatggt 21144577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 41607707 - 41607921
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  41607707 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcgcaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 41607806  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  41607807 gatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 41607906  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  41607907 gtccgctatgatggt 41607921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 44384891 - 44385105
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  44384891 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 44384990  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
      ||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  44384991 ggtggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 44385090  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| || ||||||||    
T  44385091 gtccgccatgatggt 44385105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24263524 - 24263279
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  24263524 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 24263425  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  24263424 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgt 24263325  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||    
T  24263324 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 24263279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10870004 - 10869757
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  10870004 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 10869905  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  10869904 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtctgaattaccatccaggtaaagctaatgttgt 10869805  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  10869804 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 10869757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24676643 - 24676396
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||| | ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24676643 gagttggcggctgtgatctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaaaagcttgaaatatttgt 24676544  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | |||||||| || ||||| ||||||||| | | |||| | ||  | || ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  24676543 tcgatcagaaagagttgaatatgaggcagcgtagatggctcgaattatttaaaaattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 24676444  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  24676443 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 24676396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27372423 - 27372176
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  27372423 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 27372324  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27372323 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 27372224  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  27372223 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 27372176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24711155 - 24710941
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  24711155 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 24711056  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  24711055 gatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 24710956  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| || ||||||||    
T  24710955 gtccgccatgatggt 24710941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 30011473 - 30011718
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||  ||||| |||||||    
T  30011473 gagttagctgcagtggtttttgtacttaaaatttggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaattttgaagtatttat 30011572  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||| |||  ||| | ||  || | |||||||||||||| || || ||||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  30011573 ttgaccagaaagaattaaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttaaattaccatccgagtaaggctaatgttgt 30011672  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  30011673 tgcagatgttttaagtaggaaaacatt--acatgtctgctatgatggt 30011718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 101 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 17064814 - 17064624
Alignment:
Q  101 agatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggatt 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||  ||||||||||||    
T  17064814 agattggaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggatt 17064715  T
Q  201 atgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  17064714 atgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 17064624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 24876071 - 24876285
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| |  || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| | |    
T  24876071 tggagacattacttgtatggtttgagatttgaggtgtttagtgatcacaggagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgta 24876170  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| ||||  || |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  24876171 gatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 24876270  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  24876271 gtccgctatgatggt 24876285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 291
Target Start/End: Original strand, 30210234 - 30210453
Alignment:
Q  71 aaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggc 170  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || | |||||    
T  30210234 aaaatttggagacattatctgtatggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatacgaggc 30210333  T
Q  171 agagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgtt 270  Q
    |  |||  ||| | ||  || | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  || ||||| ||| |||||||||| || ||||||||  |    
T  30210334 atcgaaggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtatggctaatgttgttacagatgctttaagtaggaaaac-at 30210432  T
Q  271 acacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  30210433 acatatgtctgctatgatggt 30210453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 21324555 - 21324802
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  21324555 gagttagcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgt 21324654  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||  |||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||    
T  21324655 tcgaccagaaggaattgaatatgaggcagcgaagatggcttgaattgttaaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgttgt 21324754  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    || ||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  21324755 tgtagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggt 21324802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 12639518 - 12639769
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| ||  || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| |||    
T  12639518 tttggaattggcagctgttgtgtatgcattgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtat 12639617  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||    
T  12639618 ttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcaattgagttatcatcccggaaaggctaatg 12639717  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    | ||||||||||||||||| || || || || || ||||||||| |||||||    
T  12639718 ttgttgcagatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggt 12639769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Original strand, 24706771 - 24706991
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  24706771 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgt 24706870  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | |||||||  |||||||| ||||||||  |||  ||| | ||  | ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||| || |||||  |    
T  24706871 tcgatcagacagaattgaatatgaggcaacgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactttggtttgaattattatccaagtaaggctaatgtttt 24706970  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaa 264  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  24706971 tgcagatgccttgagcaggaa 24706991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22279229 - 22279120
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22279229 atttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatatatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 22279130  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  22279129 gaagatggtt 22279120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23072993 - 23072893
Alignment:
Q  68 ttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatga 167  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  23072993 ttaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatga 23072894  T
Q  168 g 168  Q
    |    
T  23072893 g 23072893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23067391 - 23067295
Alignment:
Q  197 gattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || || ||||||||||||||||||||    
T  23067391 gattatgattttgagttgact-atcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaa 23067295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Original strand, 24830507 - 24830616
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  24830507 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 24830606  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    | | ||||||    
T  24830607 ggagatggtt 24830616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 183
Target Start/End: Original strand, 22760854 - 22760997
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||| ||||| || ||||||| ||  || || ||||||||||||||| |||| ||||  |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||     
T  22760854 tttggaattggcggccgtggtgtatgcattgaagatttggaggcattatctgtatggttataagtttgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtac 22760953  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggtt 183  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||||||| || ||||||    
T  22760954 ttgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagaaaagatggtt 22760997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25129733 - 25129631
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  25129733 atttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgaccaaaaagagttgaatatgaggcaga 25129634  T
Q  174 gaa 176  Q
    |||    
T  25129633 gaa 25129631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 1602 - 1856
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  1602 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacagttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagcctgaaatat 1701  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1702 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagcaaatg 1801  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1802 tggttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcacatgtctactatgatggtaaa 1856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 2233 - 2487
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||    
T  2233 tttggagttagctgcggtagtttttgttttgaaattttggaggcattatttgtacggctccagatttgaagtgtttagtgatcccaaaagtttgaaatat 2332  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  2333 ttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtgaagctaatg 2432  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2433 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 2487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5988 - 5734
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5988 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccaaatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 5889  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || |||||| | || |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5888 ttgtttgataaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 5789  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5788 tggttgcagatgctttgagaaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 5734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32969 - 32715
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||||||    
T  32969 tttggagttggctgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggcattatctgtaccgttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctgaaatat 32870  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32869 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 32770  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32769 tggttgcggatactctgagcaggaaaacgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 32715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 294
Target Start/End: Original strand, 49267 - 49516
Alignment:
Q  45 agttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatt 144  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  49267 agttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagattcgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttatt 49366  T
Q  145 tgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggtt 244  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  49367 tgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcattcgggtaaagccaatgtagtt 49466  T
Q  245 gcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  49467 gcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaa 49516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16457 - 16243
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  16457 tggagacattacttgtatggttcgagatttaaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgta 16358  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| ||||  || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||| || || || ||    
T  16357 gatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagttggaagacattgcatat 16258  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    |||| ||||||||||    
T  16257 gtcttctatgatggt 16243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9995 - 9781
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| | |    
T  9995 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgattatgaggcagcgta 9896  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| ||||  || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || || ||||| || || || ||    
T  9895 gatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctagtgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatat 9796  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  9795 gtccgctatgatggt 9781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 44705 - 44458
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  44705 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 44606  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||   | |||| | ||  |||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  44605 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcatagatggcttgaattgttaaaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgt 44506  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| |||||  |||| || || || ||||| |||||||||||    
T  44505 tgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 44458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 168
Target Start/End: Original strand, 105355 - 105449
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgag 168  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| |||||    
T  105355 atttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttaatcagaaagagttgaatatgag 105449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 41083 - 41332
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  41083 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 41182  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  41183 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 41282  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  41283 gttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggt 41332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 46147 - 46401
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||    
T  46147 tttggagttggctgtggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatat 46246  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  46247 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatg 46346  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | |||||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  46347 tagttgcacatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctttgatggtaaa 46401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3435 - 3218
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||    
T  3435 tggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatgtgagacagcgaa 3336  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
      ||| | ||  |||||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||    
T  3335 ggtggcttgaattgttgaaatattatgattgtgggttgaattattatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatat 3236  T
Q  277 gtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||| ||  ||||||||||    
T  3235 gtccgcattgatggtaaa 3218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 536 - 282
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  536 tttggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatttggagatattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaattttgaaatat 437  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||     
T  436 ttatttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaata 337  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  336 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6304 - 6054
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6304 gagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggccttacttgtacggtttcagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaactatttat 6205  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  | ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6204 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgctaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggt 6105  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  6104 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtttgttatgatggtaaa 6054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20407 - 20153
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20407 tttgaagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcactacttgtatggttctagattcgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatat 20308  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20307 ttatttgatcagaagcagttaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatg 20208  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20207 tagttacagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtcggctatgatggtaaa 20153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24569 - 24315
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24569 tttgaagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcactacttgtatggttctagattcgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatat 24470  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24469 ttatttgatcagaagcagttaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatg 24370  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24369 tagttacagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtcggctatgatggtaaa 24315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 50623 - 50877
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  50623 tttggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtattcagtgatcataaaagtttgaaatat 50722  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     | |||||| | || || ||||| ||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  50723 ctgtttgataaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgaactgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatg 50822  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50823 tggttgtagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 50877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 283
Target Start/End: Original strand, 1584 - 1825
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1584 tggagttggccgctgtggtgtttgttttaaaaatttggagacattatttgtacggatccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatct 1683  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  1684 gtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttatagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 1783  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgct 283  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||    
T  1784 gttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctgct 1825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 283
Target Start/End: Original strand, 12277 - 12518
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12277 tggagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagttttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 12376  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12377 atttgattagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagaactgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtg 12476  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgct 283  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||| | || |||||||||    
T  12477 gttgcagatgccttgagtaggaagacgctgcatatgtctgct 12518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 31505 - 31755
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  31505 gagttggctgatgtggtttttgtgttgaaaatatggaaacattacttgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 31604  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31605 tagatcagaaggaattgaatatgagccagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgtggt 31704  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  31705 tgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaa 31755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 172
Target Start/End: Original strand, 34499 - 34631
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  34499 tttggagttggctgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatat 34598  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcag 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34599 ttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcag 34631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 42 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28489 - 28248
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28489 tggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaattattt 28390  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  28389 atttgaccagaaggaacttaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaggccaatgtg 28290  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgct 283  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||| || || |||||||||    
T  28289 gttgttgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctgct 28248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 46 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28076 - 27828
Alignment:
Q  46 gttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttattt 145  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28076 gttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcaatatttgtacggctccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctattt 27977  T
Q  146 gatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttg 245  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27976 gaccaaaaggaattgaacatgaggcaaagaatatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttg 27877  T
Q  246 cagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27876 cagatgctttgagcaggaagacgtttcacatgtctgctatgatggtaaa 27828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 75 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 524 - 308
Alignment:
Q  75 tttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagag 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  524 tttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagag 425  T
Q  175 aaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacac 274  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  424 gagatggttagagctgttgaaggattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggtagcagatgcgttgagcaggaagacgttgcat 325  T
Q  275 atgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||||||||||||    
T  324 atgtctgctatgatggt 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 296
Target Start/End: Original strand, 721 - 977
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||    
T  721 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttaaagtatttagtgatcataaaagtttgaaatat 820  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| |||||| ||||    
T  821 ttatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccattcggttaaagctaatg 920  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaatg 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  921 tggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacaagtctgctatgatggtaaatg 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 35028 - 34804
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||    
T  35028 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatat 34929  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  34928 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatg 34829  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  34828 tggttgcagatgcgttgagcaggaa 34804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 155 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28660 - 28551
Alignment:
Q  155 gaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctt 254  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28660 gaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgt 28561  T
Q  255 tgagcaggaa 264  Q
    ||||||||||    
T  28560 tgagcaggaa 28551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 95 - 160
Alignment:
Q  229 taaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  95 taaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacatgtttgctatgatggtaaa 160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 294
Target Start/End: Original strand, 15463 - 15715
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15463 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 15562  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  15563 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtt 15662  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||| | ||||||||    
T  15663 gttgctgatgctttgagcaggaagactttgcatatgtctgctttaatggtaaa 15715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10846 - 10744
Alignment:
Q  189 tgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgat 288  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||| |||| || || || ||||| ||||||||    
T  10846 tgttgaaggactgtgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatattttgagcgggaagacattgcatatgtcagctatgat 10747  T
Q  289 ggt 291  Q
    |||    
T  10746 ggt 10744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6229
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||  | ||||||||||    
T  5990 gagttggctgcggtgatttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttaaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttat 6089  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6090 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggt 6189  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgct 283  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  6190 tgcagatgccttgagtaggaaaatgttgcatatgtctgct 6229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 1
Alignment:
Q  84 attatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggca 171  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  88 attacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaagatttgaatatgaggca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 114113 - 113866
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  114113 gagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcattacttgcatggttccaggtttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatctgt 114014  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  114013 ttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaacgccaatgtagt 113914  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  113913 tgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 113866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 291
Target Start/End: Original strand, 108597 - 108810
Alignment:
Q  78 ggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaa 177  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  108597 ggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtag 108696  T
Q  178 atggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatg 277  Q
    ||| |||||| || | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || |||    
T  108697 atgattagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatg 108796  T
Q  278 tctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||||    
T  108797 tctgctatgatggt 108810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11351 - 11097
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11351 tttggagttggctgtggtggtttttgtgttgaaaatttggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 11252  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     | |||||||| || || ||||| ||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11251 ctgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaggatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 11152  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11151 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 11097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16194 - 16103
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaa 135  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  16194 gagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaa 16103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15670 - 15416
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  15670 tttggatttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatat 15571  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     | |||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  15570 ctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatctgggtaaagctaatg 15471  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  15470 tggttgcagatgctttgagcaggaagaggttgcatatgtctgctatgatggtaaa 15416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 283
Target Start/End: Original strand, 8643 - 8852
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| | ||| ||||||| || ||||| |||||||| |    
T  8643 atttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttaatcagaaagagttgaatatgaggcaca 8742  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  8743 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgca 8842  T
Q  274 catgtctgct 283  Q
     |||||||||    
T  8843 tatgtctgct 8852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28182 - 27929
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||||||    
T  28182 tttggattttgctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctgaaatat 28083  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  28082 ttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatg 27983  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||| |||||  | ||||||||||||||||||||    
T  27982 tggttgtagatgctctgagca-gaagacgttggatatgtctgctatgatggtaaa 27929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 59962 - 60213
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | || |||    
T  59962 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagcgatcacaagagtctaaagtat 60061  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||    
T  60062 ttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatg 60161  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||  |||||||    
T  60162 tggctgcggatgcgttgatcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggt 60213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 50928 - 51179
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | ||||||    
T  50928 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatatagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagcgatcacaagagtctaaaatat 51027  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||    
T  51028 ttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatg 51127  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||  |||||||    
T  51128 tggctgcggatgcgttgatcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggt 51179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 66350 - 66601
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | ||||||    
T  66350 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatatagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagcgatcacaagagtctaaaatat 66449  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||    
T  66450 ttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatg 66549  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||  |||||||    
T  66550 tggctgcggatgcgttgatcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggt 66601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 518 - 293
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  518 tggagttggttgtagtagtgtttgttttaaaaatttggagagattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatattt 419  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  418 gtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 319  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaac 267  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  318 gttgctgatgcattgagcaggaaaac 293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 66 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3120 - 2895
Alignment:
Q  66 ttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacat 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3120 ttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttaaaatatttatttgatcagaaataattgaacat 3021  T
Q  166 gaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaa 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||     
T  3020 gaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagccaatatggttgcagatgcgctgagcaggaag 2921  T
Q  266 acgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    | ||| || |||||||||||||||||    
T  2920 atgttgcatatgtctgctatgatggt 2895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 46075 - 45822
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46075 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtttggttctagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaacat 45976  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45975 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 45876  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaa 293  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||  |||| ||||||||  |||||||||    
T  45875 tggttgcggatgcgttaagcaggaagaccctacatatgtctgcgttgatggtaa 45822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21445 - 21192
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||  | || |||    
T  21445 tttggagttgactacggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgtggtgttcagcgatcacaagagtctaaagtat 21346  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||    
T  21345 ttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaatg 21246  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaa 293  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||    
T  21245 tggttgcggatgcgttgagcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtaa 21192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 19093 - 19343
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||| || |||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  19093 gagttggatgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtaaggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatatgt 19192  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| | ||  || ||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19193 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggactatgattttgtgttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 19292  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  19293 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaa 19343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Original strand, 100312 - 100561
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  100312 tggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcaatatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcattaaagcttgaaatattt 100411  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  100412 atttgatcagaaggagttgaatatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggactacaattttggtttgaattaccatcatggtaaagccaatgtg 100511  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||| |||||||    
T  100512 gttgcagatgcattgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggt 100561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 324262 - 324019
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||||    
T  324262 tttggagttggctgcggtggtttttattttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtctcaaatat 324163  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  324162 ttatttgatcagaaggagttaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatg 324063  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgct 283  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  324062 tggttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcacatgtctgct 324019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 202220 - 202467
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |  || |||||||||||||    
T  202220 gagttggctgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagattttaggtgtttagtgatcacaggagtttgaaatatttat 202319  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||| | ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  202320 ttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagcaaatgttgt 202419  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  202420 tgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatggt 202467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 118750 - 118535
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||      
T  118750 atttggagacattatttgtatggttctagattattagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaac 118651  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    |||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||  ||||    
T  118650 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctaca 118551  T
Q  274 catgtctgctatgatg 289  Q
     ||||| | |||||||    
T  118550 tatgtccgttatgatg 118535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 10805 - 11059
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||  || ||||||    
T  10805 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaattttgaggcattacttgtacggatccagatttgaagtatttagtgatcacaaaaatttaaaatat 10904  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||  ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10905 ttatttgattggaaagagttgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatg 11004  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11005 tggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctacgatggtaaa 11059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 14575 - 14829
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||  || ||||||    
T  14575 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaattttgaggcattacttgtacggatccagatttgaagtatttagtgatcacaaaaatttaaaatat 14674  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||  ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14675 ttatttgattggaaagagttgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatg 14774  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14775 tggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctaagatggtaaa 14829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21541 - 21290
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||||    
T  21541 tttggagttggctgcggttgtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatat 21442  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||||| |    
T  21441 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatttggggaaagccaacg 21342  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||  || ||||  |||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  21341 tggtgtcaaatgcgatgagcaagaggacgttgcatatgtctgctatgatggt 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 6437 - 6684
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  6437 gagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttctagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttat 6536  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  6537 ttgaacagaaggagttgaacatgagacagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagt 6636  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  6637 tgcggatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggt 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18907 - 18653
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18907 tttggaattggttgcagtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 18808  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  18807 ttattcgatctgaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggttttaattaccatccgggtaaagctaatg 18708  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | |||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  18707 tcgttgtagatgctttgagcaggaagacatttcacatctctgctatgatggtaaa 18653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 25559 - 25776
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  25559 atttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccacaatagtttgaagtaattgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 25658  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| |||    | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || || || ||||  ||||||||||| || || || || ||    
T  25659 gaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaacgttgttgttgatgctttgagtagaaagacattgca 25758  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  25759 tatgtctgctttgatggt 25776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 436 - 689
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||    
T  436 tttggagttggctgcagtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttatacggttccagatttgaagtatttagtgaccataaaagtttaaaatat 535  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  536 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggctagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccat-cgggtaaagcaaatg 634  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||||||||||  | || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  635 tggttgcagatgccataagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Original strand, 10205 - 10433
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  10205 tttggagttggttgcggtgatttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagagttgaagtatttcgtgatcataaaagtttgaaatat 10304  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10305 taatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatg 10404  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacg 268  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  10405 tggttacagatgccttgagtaggaaaacg 10433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Original strand, 20419 - 20647
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  20419 tttggagttggttgcggtgatttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagagttgaagtatttcgtgatcataaaagtttgaaatat 20518  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20519 taatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatg 20618  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacg 268  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  20619 tggttacagatgccttgagtaggaaaacg 20647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42475 - 42232
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||||    
T  42475 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgatgtttttagtgatcataagagtcttaaatat 42376  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  42375 ttatttgattagaaggagtttaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatg 42276  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgct 283  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||    
T  42275 tggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgct 42232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 150127 - 149877
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||  | ||||| |||||  | ||||||    
T  150127 tttggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattacttgtacggttcctgatttgaagtattttgggatcacaaaagtctaaaatat 150028  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  150027 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaag-caatg 149929  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||| |||||||    
T  149928 tggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgaatatgtctgctttgatggt 149877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 194452 - 194703
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||| ||||||| |||||  | ||||||    
T  194452 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagattttaagtattcggtgatcacaaaagtctaaaatat 194551  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  194552 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggaggtgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatg 194651  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||   ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||    
T  194652 tggttattgatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtctgctttgatggt 194703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 25318 - 25535
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||    
T  25318 tggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtttgaataatttatttgatcagaaagaattgaatatgagacaacgaa 25417  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
      ||| | ||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||  | || ||||| ||||| || ||    
T  25418 ggtggcttgaattgttgaaatattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccctaagtaggaagacgttgcatat 25517  T
Q  277 gtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  25518 gtccgctatgatggtaaa 25535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 181448 - 181234
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || |  ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||      
T  181448 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagattttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaat 181349  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| |||    | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| | ||| ||||||||||| || ||||| || ||    
T  181348 gaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttggtgctgatgctttgagtagaaaaactttgca 181249  T
Q  274 catgtctgctatgat 288  Q
     ||||||||| ||||    
T  181248 tatgtctgctttgat 181234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48662 - 48408
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||| ||||    
T  48662 tttggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgagatat 48563  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || |||||||| || |||||||| |||||  |||||| |||| | ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48562 ttgtttgatcaaaaagaattgaatatgagctagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 48463  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  48462 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 48408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 80580 - 80834
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||    
T  80580 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtatgaaatat 80679  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  80680 ttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 80779  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  80780 tggttgctgatgcgttgagcaggaagacactacatatgtctgctatgatggtaaa 80834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 83 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29572 - 29361
Alignment:
Q  83 cattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  29572 cattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcatacaagtttaaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggc 29473  T
Q  183 tagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgc 282  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29472 ttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgc 29373  T
Q  283 tatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||    
T  29372 tatgatggtaaa 29361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 50368 - 50168
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||||    
T  50368 tttggagttggctgcggcggtttttgtttttaaaagttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcatacaagtttaaaatat 50269  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     | |||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  50268 ctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 50169  T
Q  240 t 240  Q
    |    
T  50168 t 50168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30499 - 30249
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  30499 gagtttgctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 30400  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||| | ||  || | || |||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||| |||||  |    
T  30399 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgtttt 30300  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  30299 tgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggtaaa 30249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 288
Target Start/End: Original strand, 3020 - 3268
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  3020 tttggagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatat 3119  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||  |||||| | ||||    
T  3120 ttgtctgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatg 3219  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgat 288  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  3220 tagtcgcggatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgat 3268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 264
Target Start/End: Original strand, 10637 - 10861
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10637 tttgcagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtatggttctagattggaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 10736  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| | ||| | || || |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  10737 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagcggagatggcttgagttcttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcttggtaaagccaatg 10836  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaa 264  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||    
T  10837 tggttgcggatgcgttaagcaggaa 10861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Original strand, 13047 - 13275
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||  | ||||||    
T  13047 tttggagttggcttcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctaaaatat 13146  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||    
T  13147 ttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatg 13246  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacg 268  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13247 tggttgcagatgccttgagtaggaaaacg 13275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 288
Target Start/End: Original strand, 30033 - 30281
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  30033 tttggagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatat 30132  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||  |||||| | ||||    
T  30133 ttgtctgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatg 30232  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgat 288  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  30233 tagtcgcggatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgat 30281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3734 - 3480
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    ||| ||||    
T  3734 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaatatctgagatat 3635  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||| | ||| || | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  3634 ttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatg 3535  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3534 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctattatggtaaa 3480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20676 - 20427
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||  | || |||||    
T  20676 tggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcataagagtctaaagtattt 20577  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20576 atttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtg 20477  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  |||||||    
T  20476 gttgcggatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgcgttgatggt 20427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Original strand, 57970 - 58146
Alignment:
Q  71 aaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggc 170  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  57970 aaaatttggagacattatctgtatggttttagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggc 58069  T
Q  171 agagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgca 247  Q
    || |||  ||| | ||  || | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  58070 agcgaaggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgca 58146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 5837 - 6093
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| || ||| | || || |||||||||    
T  5837 tttggagttggctgcggtggtttttgtattgaaaatttggagacattatttgtacgactctagatttgaggtgtttagcgataacaagagtttgaaatat 5936  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||| | ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  5937 ttatttgaccaaaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatg 6036  T
Q  240 t--ggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6037 tacggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 6093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 35655 - 35422
Alignment:
Q  56 gtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaagg 155  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||||||| ||  ||||||| |    
T  35655 gtggtctttgtttagaaaatttggaagcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctaaaatattttttcaatcagaaag 35556  T
Q  156 aattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcttt 255  Q
    | |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  35555 atttgaacatgaagtagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgcgtt 35456  T
Q  256 gagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
    ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  35455 gagtaggaagatgttgcacatgtctgctatgatg 35422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 882 - 628
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||  | ||||||    
T  882 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaagcgttcagtgatcacaagagtctaaaatat 783  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| | |||  | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  782 ttatttgaccagaaggaatggaatatgagacagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccaccctggtaaagccaatg 683  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  682 tggttgcggatgcgttgagcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtaaa 628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 177014 - 177261
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  177014 gagttggctgttgtggtttttctgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttat 177113  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||  ||| | ||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||    
T  177114 ttgatcagaagaaattgaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttgttgaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgtcgt 177213  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  177214 tgcagaagctttaagcaggaagacgttacatatgtctgctatgatggt 177261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6771 - 6517
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | || |||    
T  6771 tttggagttggctacggtggtgtttgttttgaaaatctggagccattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaagtat 6672  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||| | || || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  6671 ttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgaggttttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacg 6572  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || |||| |||||||||||||||    
T  6571 tagttgctgatgcattgagcaggaagacacttcatatgtatgctatgatggtaaa 6517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1441 - 1190
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  1441 tttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatat 1342  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||  | ||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1341 ttgtttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatgacttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 1242  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    | ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| || ||||||||    
T  1241 tagttgcagatgcgttgagtagaaagacattgcacatgtcggccatgatggt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 110 - 264
Target Start/End: Original strand, 2148 - 2302
Alignment:
Q  110 gtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttg 209  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2148 gtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgatttta 2247  T
Q  210 gcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaa 264  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2248 gtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaa 2302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 261866 - 261612
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||  |||| ||     
T  261866 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctgaagtac 261767  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |||| | |||| | ||| |||| || |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  261766 ttatttgaccaaaaggaattgaacatgaggtagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagctaacg 261667  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||    
T  261666 tagttgctgatgcgttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaa 261612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 291
Target Start/End: Original strand, 277594 - 277829
Alignment:
Q  56 gtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaagg 155  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || |||| ||| |    
T  277594 gtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcggaaag 277693  T
Q  156 aattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcttt 255  Q
    ||||||| ||||||||| |||  ||| | ||  | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  277694 aattgaatatgaggcagcgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcctt 277793  T
Q  256 gagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  277794 gagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 277829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 9556 - 9807
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||     
T  9556 tttggagttggctgcggtggcttttgtgttaaaaatttggagacattatttctacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtctgaagtac 9655  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
     |||||||||| || |||||||| ||||||||| | |  ||| | ||  |||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  9656 ctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggattgtgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatg 9755  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||||||    
T  9756 ttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatttgtcagctatgatggt 9807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 116 - 291
Target Start/End: Original strand, 24700 - 24875
Alignment:
Q  116 agtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttga 215  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24700 agtgatcataaaagtttaaaatatttatttcatctgaaggaattgaacatgaggtagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttga 24799  T
Q  216 attatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||| |||| |||||||    
T  24800 attaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcagaaagacgttgcatatgtttgctttgatggt 24875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 11534 - 11788
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||  |||| |||    
T  11534 tttggagttgggtgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggtattatttgtatggttcgagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctgaagtat 11633  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |    
T  11634 ttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaacg 11733  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||    
T  11734 tagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaa 11788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Original strand, 5084 - 5326
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | || |||    
T  5084 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaagtat 5183  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| | |||  | ||| |||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  5184 ttatttgaccagaggtaattgaatatgaggcagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttggattaccatcttggtaaagccaatg 5283  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgc 282  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  5284 tagttgcggatgcgttgaggaggaagaccttacatatgtctgc 5326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 202 - 1
Alignment:
Q  42 tggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 141  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | || |||||    
T  202 tggagttggcggcagtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaagtattt 103  T
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||    
T  102 atttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaggccaatgtg 3  T
Q  242 gt 243  Q
    ||    
T  2 gt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 39508 - 39758
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||    
T  39508 tttggagttggctgttgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgagatat 39607  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||   ||| | ||  |||||||||| ||||| |||   || ||||||||||  |||||||| ||||    
T  39608 ttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgacggtggcttgaattgttgaaggactatga-tttatttttaattatcatcaaggtaaagctaatg 39706  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  39707 ttgttgcagatgctttgagcatgaagacgttgcatatgtctgctatgatggt 39758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 13963 - 14213
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  13963 gagttggctgatgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatgtgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgt 14062  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  || ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14063 tcgaacagaaggaattgaatatgaggcagggtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 14162  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||||||    
T  14163 tgcagatgctttgagtaggaagaccatgcatatgtctgctatgatggtaaa 14213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 23827 - 24071
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||    
T  23827 tttggagttggttgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatat 23926  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||| | ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23927 ttattagatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatg 24026  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    | ||||||       |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  24027 ttgttgca-------tgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggt 24071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 6097 - 6332
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  6097 tttggagttggctgtggtggtttttgttttgaaaatgtggaggcattattta-acggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatat 6195  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||                  ||| ||||||||| ||||    
T  6196 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgaagatggcttgagctgttgaaggattatg------------------atctgggtaaagctaatg 6277  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6278 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 6332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 10528 - 10763
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  10528 tttggagttggctgtggtggtttttgttttgaaaatgtggaggcattattta-acggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatat 10626  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatg 239  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||                  ||| ||||||||| ||||    
T  10627 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgaagatggcttgagctgttgaaggattatg------------------atctgggtaaagctaatg 10708  T
Q  240 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10709 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 10763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7926 - 7676
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| | | | |    
T  7926 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggggacattatttgtacggttcaagatttgagctgtttagtgatcataagagtttgaagtctctgt 7827  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  || |||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7826 tcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 7727  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  7726 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaa 7676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7603 - 7353
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || || || ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  7603 gagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattgcttgtacggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 7504  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| | | |||| | ||  || ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7503 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 7404  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  7403 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaa 7353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 294
Target Start/End: Original strand, 3535 - 3611
Alignment:
Q  218 tatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  3535 tatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaa 3611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 29356 - 29570
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  29356 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaggaattaaacatgaggtagcgaa 29455  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
      ||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  29456 ggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatat 29555  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  29556 gtccgctatgatggt 29570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Original strand, 4105 - 4325
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |    
T  4105 gagttggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaaatacttgt 4204  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    |  ||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4205 tcaatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtaaatggctagaattgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 4304  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaa 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  4305 tgcagatgccttgagtaggaa 4325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 320 - 70
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  320 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtactgtttgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 221  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | || | | ||  || ||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  220 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatagcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 121  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  120 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaa 70  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2823 - 2573
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  2823 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtactgtttgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 2724  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | || | | ||  || |||| |||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2723 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagattgcttgaattgctgaatgattttgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 2624  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  2623 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaa 2573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 291
Target Start/End: Original strand, 22971 - 23184
Alignment:
Q  78 ggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaa 177  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  22971 ggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaag 23070  T
Q  178 atggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatg 277  Q
     ||| | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||  ||||| |||    
T  23071 gtggcttgaattgttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaattttacatatg 23170  T
Q  278 tctgctatgatggt 291  Q
    ||| ||||||||||    
T  23171 tctcctatgatggt 23184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10484 - 10276
Alignment:
Q  83 cattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggt 182  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||     
T  10484 cattacttgtatggttcgagatttcaagtgttcagcgatcataaaagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagttggc 10385  T
Q  183 tagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgc 282  Q
    | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||    
T  10384 tcgaattgttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttacatatgtctgc 10285  T
Q  283 tatgatggt 291  Q
    |||||||||    
T  10284 tatgatggt 10276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 158 - 294
Target Start/End: Original strand, 89311 - 89447
Alignment:
Q  158 ttgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttga 257  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  89311 ttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttga 89410  T
Q  258 gcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  89411 gcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 89447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 158 - 294
Target Start/End: Original strand, 89989 - 90125
Alignment:
Q  158 ttgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttga 257  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  89989 ttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttga 90088  T
Q  258 gcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  90089 gcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 90125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 102787 - 102537
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  102787 gagttgggtgctgtggtttttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatttgt 102688  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  102687 ttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttggtttgaactatcatccaggtaaagctaattttgt 102588  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||| | || |||||||||||    
T  102587 tgcagatgcattgagtaggaagactttgcatatgcccgccatgatggtaaa 102537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13992 - 13772
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  13992 atttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcaacgatcataaaagtctgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagc 13893  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    |||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||    
T  13892 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgtcgcagatgccttaagcaggaaaactttgca 13793  T
Q  274 catgtctgctatgatggtaaa 294  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  13792 tatgtccgccatgatggtaaa 13772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 294
Target Start/End: Original strand, 14150 - 14301
Alignment:
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||    
T  14150 atttgaacagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcc-agtaaagacaatgtg 14248  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  14249 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctctgatggtaaa 14301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 294
Target Start/End: Original strand, 22329 - 22480
Alignment:
Q  142 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtg 241  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||    
T  22329 atttgaacagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcc-agtaaagacaatgtg 22427  T
Q  242 gttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  22428 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctctgatggtaaa 22480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 108
Target Start/End: Original strand, 14098 - 14155
Alignment:
Q  51 ctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttga 108  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098 ctgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttga 14155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 108
Target Start/End: Original strand, 22277 - 22334
Alignment:
Q  51 ctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttga 108  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22277 ctgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttga 22334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8920 - 8673
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  8920 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattttt 8821  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  8820 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 8721  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  8720 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 8673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 289
Target Start/End: Original strand, 6673 - 6888
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||      
T  6673 atttggagacattacttgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaag 6772  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    |||  ||| | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||    
T  6773 gaaggtggcttgaattgttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcattaagtaggaagactctaca 6872  T
Q  274 catgtctgctatgatg 289  Q
     ||||| |||||||||    
T  6873 tatgtccgctatgatg 6888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8951 - 8704
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| || || || ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  8951 gagttggcggccgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 8852  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  8851 tcgattagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 8752  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  8751 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 8704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 49644 - 49481
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  49644 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 49545  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattt 207  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  || |||| |||||||||||    
T  49544 tcgatcagatggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgattt 49481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2990 - 2740
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  2990 gagttggctgttgtggtctttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgattagtgatcataagagtttgaagtatttgt 2891  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || | |  ||| | ||  || ||||||| ||||||||||  ||||  |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  2890 ttgatcagaaggaattgaatatgaggtagcgtaggtggcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagttaatgttgt 2791  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2790 tgcggatgctttgagtaggaagactttacatatgtctgctatgatggtaaa 2740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8460 - 8246
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  8460 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 8361  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| | ||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  8360 gatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 8261  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||    
T  8260 gtccgctatgatggt 8246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 38700 - 38950
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  38700 gagttggctgctgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgagcataacagtttgaagtatttgt 38799  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||| | ||  || | || |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  38800 tcgatcagaaggaattgaacatgagacatcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 38899  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  38900 tgcagacgctttgagtaggaagaccttggatatgtctgctatgatggtaaa 38950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 16759 - 16976
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||      
T  16759 atttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacaac 16858  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    |||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||    
T  16859 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttgaattatcaaccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctaca 16958  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||| |||||||||||    
T  16959 tatgtccgctatgatggt 16976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3736 - 3501
Alignment:
Q  56 gtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaagg 155  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |    
T  3736 gtggtttttgtgttgaagatttggagacattacttatatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaag 3637  T
Q  156 aattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcttt 255  Q
    ||||||| ||||||||| |||  ||| | ||  |||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |     
T  3636 aattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttacagatgcctc 3537  T
Q  256 gagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  3536 gagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggt 3501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 279
Target Start/End: Original strand, 32325 - 32560
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || || || ||||| ||||| |    
T  32325 gagttggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgagcacaagagtttgaagtatttgt 32424  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| | | |||| ||||| || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  32425 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 32524  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtc 279  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  32525 tgcagatgctttgagcagaaagacgttgcatatgtc 32560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10117 - 9903
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   |    
T  10117 tggagacattacttgtatggttcgaggattgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagctta 10018  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| ||||| || |||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||    
T  10017 gatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgagcaggaagacattgcatat 9918  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| ||| |||||||    
T  9917 gtccgctttgatggt 9903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 187
Target Start/End: Original strand, 20325 - 20472
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||    
T  20325 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcaaaaaagtctaaaatat 20424  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagag 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | ||||||||    
T  20425 ttatttgatcataaggaattgaacatgaagcagaggagacggttagag 20472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 16346 - 16563
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  16346 atttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaggcgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaa 16445  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  16446 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgca 16545  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  16546 tatgtctgctttgatggt 16563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Original strand, 27048 - 27157
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  27048 atttggaggcaatatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 27147  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  27148 gaagatggtt 27157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Original strand, 25664 - 25773
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  25664 atttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaa 25763  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  25764 gaagatggtt 25773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 291
Target Start/End: Original strand, 3190 - 3404
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   |    
T  3190 tggagacattacttgtatggttcgaggattgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagctta 3289  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
     |||| ||||| || |||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||    
T  3290 gatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgagcaggaagacattgcatat 3389  T
Q  277 gtctgctatgatggt 291  Q
    ||| ||| |||||||    
T  3390 gtccgctttgatggt 3404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 7083 - 7333
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||| | || ||||| ||| | |    
T  7083 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtaaggttcgagatttaaggtgtttagtgaccattagagtttgaagtatctgt 7182  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| || | | |||| | ||  || ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7183 tcgatcagaaggaattgaatatgaggaagcgtagatggcttgaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 7282  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || ||  |||||||||||||||||||    
T  7283 tgcagacgctttgagtaggaagaccttgcatttgtctgctatgatggtaaa 7333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17208 - 16958
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| ||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  17208 gagttagctgcagtggtcttcgtgttgaagatatggagacattacttgtatcgttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgt 17109  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17108 ttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 17009  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
     |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||||||    
T  17008 agcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaa 16958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16401 - 16184
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| || |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||     
T  16401 atttggagacactatttgtatgattcgagatttgaagtgttcagtgatcataagagtctgaagtatttgtttgatcagaagcaattgaatatgagacagc 16302  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    |||  ||| |  |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||    
T  16301 gaaggtggatcaaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgca 16202  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     |||||||||||||||||    
T  16201 tatgtctgctatgatggt 16184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 294
Target Start/End: Original strand, 112274 - 112490
Alignment:
Q  78 ggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaa 177  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  112274 ggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtatttagtgatcacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtaa 112373  T
Q  178 atggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatg 277  Q
     ||| | ||  || |||| || ||||||||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || || || |||    
T  112374 gtggcttgaattgctgaacgactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttaagtaggaagacattgcatatg 112473  T
Q  278 tctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||  | |||||||||||    
T  112474 tcgaccatgatggtaaa 112490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 50984 - 50736
Alignment:
Q  46 gttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttattt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || |||||  |||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||    
T  50984 gttggctgcggtggtctttgtattgaagatatggagaaattacttgtatgattcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttt 50885  T
Q  146 gatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttg 245  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||| | |  ||| | ||  || ||||||| || |||||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  50884 gattagaaggaattgcatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaaggactacgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttg 50785  T
Q  246 cagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  50784 cagatgctttgagtaggaagactttgcacatgtccgctatgatggtaaa 50736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20156 - 19909
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| | |||||| ||||| || || || ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |    
T  20156 gagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatattttt 20057  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| | | |||| ||||  || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  20056 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 19957  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    || |||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  19956 tgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 19909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 35580 - 35333
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| | |||||| ||||| || || || ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |    
T  35580 gagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatattttt 35481  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| | | |||| ||||  || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  35480 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 35381  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    || |||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  35380 tgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 35333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 289
Target Start/End: Original strand, 115687 - 115902
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |       
T  115687 atttggagacattatttgtatggttatagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttttttgatcagaaggaattaaatatgagaccac 115786  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    |||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||  ||||    
T  115787 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttggattgaattatcatccaggtaaggctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctaca 115886  T
Q  274 catgtctgctatgatg 289  Q
     ||||| |||||||||    
T  115887 tatgtccgctatgatg 115902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 60307 - 60060
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||  | || |||||||    
T  60307 gagttagctgcagtggtttttgtactcaaaatttggaggcattatctgtatggttctagatttgaagttttcagtggtcataaaagtataaagtatttat 60208  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||  ||  ||| ||||  || | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||| ||    
T  60207 ttgaccagaagaaattgaatatgaggcagcaaaggtggctagaattgctaaaggattatgatttcggattgaattaccatccgggtaagggtaatgttgt 60108  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||| |||| || |||||||||    
T  60107 tgcagatgctttaaataggaaaacattacatatgtttgatatgatggt 60060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 28120 - 28367
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||| | || || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |    
T  28120 gagttggcggctgtcgtctttatattgaagatatggagacactacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaaatacttgt 28219  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||| | | |||| ||||  || ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28220 tcgaccagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgactttggtttcaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 28319  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||| | |||||  |||| || || || ||||| |||||||||||    
T  28320 tgcagattccttgagttggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 28367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 3257 - 3339
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataa 126  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  3257 gagttggctgctgtgatttttgtgttgaaaatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcgatcataa 3339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 291
Target Start/End: Original strand, 3354 - 3455
Alignment:
Q  190 gttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
    |||||| ||||| |||||| | || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || || |||||| ||||||||    
T  3354 gttgaaagattacgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtcttctatgatg 3453  T
Q  290 gt 291  Q
    ||    
T  3454 gt 3455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 131477 - 131410
Alignment:
Q  227 ggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  131477 ggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatggtaaa 131410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Original strand, 54723 - 54832
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||||| ||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||     
T  54723 atttggagtcattatctttatggttctatttttgaggtgttcattgaccataagtgtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagc 54822  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  54823 gaagatggtt 54832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 289
Target Start/End: Original strand, 13833 - 14078
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||  | || |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |    
T  13833 gagttagctgcagtggtctttgtgcttaagatttggagacattatttgtatggctctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgt 13932  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| ||  |||  ||| | ||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| || || ||    
T  13933 ttgatcagaaggaattaaatttgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatggttttgggttgaattatcatcctagtaaagctaacgttgt 14032  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
    |||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  14033 tgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatg 14078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5392 - 5175
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  5392 tggagacattatttgtacaattctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 5293  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
      ||| | ||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||    
T  5292 ggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatat 5193  T
Q  277 gtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||  |||||||||||||    
T  5192 gtccactatgatggtaaa 5175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12522 - 12305
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  12522 tggagacattatttgtacaattctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 12423  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
      ||| | ||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||    
T  12422 ggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatat 12323  T
Q  277 gtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||  |||||||||||||    
T  12322 gtccactatgatggtaaa 12305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 293
Target Start/End: Original strand, 7839 - 8088
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||| || ||  |||||||||| |    
T  7839 gagttggctgctgtggtctttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttctagattcgaggtgtttaatgatcacaagagtctgaaatatttgt 7938  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||| | ||  || |||| || ||||||||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  7939 ttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgctgaaagactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgt 8038  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaa 293  Q
    ||||||||| || || |||||||| || || ||||| || ||||||||||    
T  8039 tgcagatgccttaagtaggaaaacattgcatatgtcggccatgatggtaa 8088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4636 - 4419
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  4636 atttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaattaattgtttgattagaaggaattgaatatgagacagc 4537  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
     || |||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||| ||| | || || ||||| || |||||    
T  4536 aaagatggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcaaacggttaaagctaatgttgttgcggataccttaagtaggaagactttaca 4437  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     |||||||||||||||||    
T  4436 tatgtctgctatgatggt 4419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1969 - 1725
Alignment:
Q  47 ttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttg 146  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  1969 ttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttgtttg 1870  T
Q  147 atcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgc 246  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  1869 atcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgt 1770  T
Q  247 agatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  1769 tgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 1725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15709 - 15465
Alignment:
Q  47 ttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttg 146  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  15709 ttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttgtttg 15610  T
Q  147 atcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgc 246  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  15609 atcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgt 15510  T
Q  247 agatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  15509 tgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 15465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7568 - 7321
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| | |||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  7568 gagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttttatggttctaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgt 7469  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | |||||||| || ||||| ||||||||||| |  ||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  7468 tcgatcagaaagatttgaatatgaggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 7369  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || |||||  ||||||||||    
T  7368 tgcagatgccttgagtagtaagacattgcatatgtcctctatgatggt 7321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1758 - 1627
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  1758 tttggagttggctacggtggtttttgtgttaaaaatttggagacattatttatacggttccagatttgaggtgtttagtgatcactaaagtttgaaatat 1659  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggca 171  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  1658 ttatttgatcaaaatgaattaaatatgaggca 1627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 8186 - 8055
Alignment:
Q  40 tttggagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 139  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  8186 tttggagttggctacggtggtttttgtgttaaaaatttggagacattatttatacggttccagatttgaggtgtttagtgatcactaaagtttgaaatat 8087  T
Q  140 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggca 171  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  8086 ttatttgatcaaaatgaattaaatatgaggca 8055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 38572 - 38819
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |    
T  38572 gagttggcggttgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacctgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcagaagagcttgaaatatttgt 38671  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| | | |||| | |   || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  38672 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctggtattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 38771  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||| | ||||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  38772 tgcagatgccttgtgtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 38819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 66959 - 66712
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| | |||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || || | ||| ||||| |    
T  66959 gagttggcagatgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagttcgaagtatttgt 66860  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||| || || ||| | | |||| ||||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  66859 tcgatcagaaggaattgaatattagacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgt 66760  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  66759 tgcagatgctttgagcaagaagacattgcatatgtccgctttgatggt 66712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 15266 - 15484
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagct-tgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaga 175  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||  | |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||    
T  15266 tggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaaagtctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcga 15365  T
Q  176 aaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacaca 275  Q
    |  ||| | ||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  15366 aggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccatgtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcata 15465  T
Q  276 tgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  15466 tgtccactatgatggtaaa 15484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 18000 - 18217
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||  |||||||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||    
T  18000 tggagacattatttgtaaggttctagattaaaagtgttcaaagatcataaaagtatgaagtatatgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaa 18099  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacat 276  Q
      ||| | ||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||    
T  18100 ggtggcttgaattgttgaaggattgtgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatat 18199  T
Q  277 gtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  18200 gtccgctatgatggtaaa 18217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 57571 - 57351
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || | ||| ||||| |    
T  57571 gagttggcggctgttgtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagttcgaagtatttgt 57472  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||  | | |||| ||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  57471 tcgaccagaaggaattaaatatgagacaacgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 57372  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaa 264  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  57371 tgtagatgctttgagcaggaa 57351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Original strand, 18819 - 19039
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| ||||||| || ||||| || ||||| || ||||| |    
T  18819 gagttggcggctgtggtctttgtattgaatatatggagacattacttgtatggttcaaggtttcaggtgtttagcgatcacaagagcttaaagtatttgt 18918  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||   | |||| ||||  || |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  18919 tcgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcatagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 19018  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaa 264  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  19019 tgcagatgccttgagcaggaa 19039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 291
Target Start/End: Original strand, 196292 - 196477
Alignment:
Q  106 tgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgat 205  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || || ||  | || || ||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| | ||  ||||||| ||||||||     
T  196292 tgaggtgtttagtgatcataagagtttaaagtacctgttcgaccagaaagaattgaatatgaggcagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgac 196391  T
Q  206 tttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || || || ||||| ||| |||||||    
T  196392 tttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcggacgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 196477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 291
Target Start/End: Original strand, 85298 - 85518
Alignment:
Q  71 aaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggc 170  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  85298 aaaatttggaggcattatctgtatggttctagatttgaattgttcagcgatcataaaagttttaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggc 85397  T
Q  171 agagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgtt 270  Q
    |  |||  ||| | ||  |    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||| || |||||||| ||    
T  85398 aacgaaggtggcttgaattaaaaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttattgcagatgctttaagtaggaaaacatt 85497  T
Q  271 acacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  85498 acatatgtctgctatgatggt 85518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 92911 - 92832
Alignment:
Q  104 tttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggtt 183  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  92911 tttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggtt 92832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 2390 - 2215
Alignment:
Q  116 agtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttga 215  Q
    |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||| | ||  ||||||| ||||||||||| ||  |||    
T  2390 agtgttcataaaagtctgaagtattcatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttcgggctga 2291  T
Q  216 attatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2290 attatcatccaggtaaagctaatgttcttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatggt 2215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Original strand, 8411 - 8631
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||| ||| ||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  8411 gagttgactgatgtagtctttgtattgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 8510  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| | ||  || ||| ||| ||||||||||  ||||  |||||| |||||||||| ||||| ||    
T  8511 tcgatcagaaggaattgaacatgagacagcgtagatggcttgaattgctgatggactatgattttgagttgagctatcattcgggtaaagctaatgttgt 8610  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaa 264  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  8611 tgcaaatgctttgagtaggaa 8631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 151 - 294
Target Start/End: Original strand, 4311 - 4454
Alignment:
Q  151 gaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagat 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4311 gaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggat 4410  T
Q  251 gctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    || ||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  4411 gcgttgagcaggaagaccttacatatgtctgcattgatggtaaa 4454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 7405 - 7655
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||   |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | |    
T  7405 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggaaaaattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgaacataagagtttgaagtatctgt 7504  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||| | |  ||| | ||  || ||||| | ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7505 tcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaagaactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 7604  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||||||    
T  7605 tgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaa 7655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 25697 - 25946
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| || || ||||||||||| |    
T  25697 gagttggctgttgtggtctttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttaatgatcacaagagtttgaaatatttgt 25796  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||| ||| ||||||||| || |||||| | |  ||| | ||  |  |||||||||| |||||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  25797 ttgattagagggaattgaatattaggcagcgtaggtggcttgaattactgaaggatta-gattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgt 25895  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||||||    
T  25896 tgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaa 25946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 294
Target Start/End: Original strand, 218178 - 218419
Alignment:
Q  50 gctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatc 149  Q
    ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||   |  |||| ||||| |||||||    
T  218178 gctgcagtggtttttgtgcttaaaatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcaatcata---gtctgaagtatttgtttgatc 218274  T
Q  150 agaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcaga 249  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  218275 agaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaactataatccaggtaaagctaattttgttgcaga 218374  T
Q  250 tgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||| || || ||||| ||||| || |||||  |||||||||||||    
T  218375 tgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatggtaaa 218419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2408 - 2197
Alignment:
Q  83 cattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggt 182  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| |||| ||||||||| | |  |||     
T  2408 cattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgctttatcagaaggaaatgaatatgaggcagcgtaggtggc 2309  T
Q  183 tagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgc 282  Q
    | ||  || |||| |||||||||||||  ||||  |||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  2308 ttgaattgctgaaagattatgattttgagttgagctatcatctaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggc 2209  T
Q  283 tatgatggtaaa 294  Q
     |||||||||||    
T  2208 catgatggtaaa 2197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 96619 - 96468
Alignment:
Q  143 tttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtgg 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  96619 tttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtag 96520  T
Q  243 ttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||| ||||    
T  96519 tcgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaa 96468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 521 - 340
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||| || |||||||||     
T  521 atttggaggcattatctgtattgttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgactagaaagaattaaatatgaggcagc 422  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcttt 255  Q
    |||  ||| | ||  ||   |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  421 gaaggtggctggaattgccaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttgttgcagatgcttt 340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 291
Target Start/End: Original strand, 79246 - 79493
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||| | |||||| ||||| || || || ||||| ||| | ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  79246 gagttggcggttgtggtctttgtattgaagatatggagacatcacttgtatggttcgaggttcgaggtgtttagtgatcacaagagattgaagtatttgt 79345  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||| | ||  | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  79346 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 79445  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||||||    
T  79446 tgcagatgccttgagtagaaagacattgcatatgtccgccatgatggt 79493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 39882 - 39686
Alignment:
Q  95 ggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttga 194  Q
    ||||| || ||||||||||| |  ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||  ||||||    
T  39882 ggttcaaggtttgaggtgtttaacgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttga 39783  T
Q  195 aggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggt 291  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| || || || || ||||| ||| |||||||    
T  39782 aagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgctttgagcagtaagacattgcatatgtccgctttgatggt 39686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 264
Target Start/End: Original strand, 23858 - 24045
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23858 tggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaacagaaggaattgaatatgaggcagagaa 23957  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaa 264  Q
      ||| |  |  ||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  23958 ggtggcttaaattgttgaaagattatgactttaggttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaa 24045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 264
Target Start/End: Original strand, 12777 - 12964
Alignment:
Q  77 tggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaa 176  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| | |    
T  12777 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttaaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgta 12876  T
Q  177 aatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaa 264  Q
     |||| || |  |  |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  12877 gatggctaaaaatactgaaagaatatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaa 12964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40111 - 39861
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||| |||| || || || || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||| |||    
T  40111 gagttggctactgtagtcttcgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcataagagtttgaagtatctat 40012  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||  | | | ||  || | || |||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||| ||||| ||    
T  40011 ttgatcagaaggaatggaatatgagacagcgaaggtagcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccggttaaagctaatgttgt 39912  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||  || ||||  |||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  39911 tgcagacactctgagtgggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaa 39861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 289
Target Start/End: Original strand, 9861 - 10013
Alignment:
Q  137 tatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagcca 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  9861 tatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtatagcca 9960  T
Q  237 atgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatg 289  Q
    |||| ||||||||||  || || ||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  9961 atgttgttgcagatgaattaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatg 10013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 108
Target Start/End: Original strand, 9792 - 9850
Alignment:
Q  50 gctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttga 108  Q
    ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9792 gctgcagtggtctttgtaattaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttga 9850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 97 - 3
Alignment:
Q  87 atttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatgg 181  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  97 atttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 2657 - 2874
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  2657 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 2756  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  2757 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 2856  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  2857 tatgtctgctttgatggt 2874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 294
Target Start/End: Original strand, 66 - 235
Alignment:
Q  125 aaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatc 224  Q
    ||||| |||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||| | || || |||||||||||||||||||| || ||||    
T  66 aaaagtttgagatatctgtttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaaataccatc 165  T
Q  225 cgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    | | |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||||||    
T  166 cagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaa 235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24918 - 24701
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  24918 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 24819  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  24818 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 24719  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  24718 tatgtctgctttgatggt 24701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14432 - 14215
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  14432 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 14333  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  14332 gaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 14233  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  14232 tatgtctgctttgatggt 14215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 294
Target Start/End: Original strand, 1 - 64
Alignment:
Q  231 aagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 64  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 576 - 478
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcag 172  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||    
T  576 atttggagacattacttatatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcag 478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3135 - 2970
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |    
T  3135 gagttggctgctgtggtttttatattgaaaatatggagacattacttgtatgattcgagatttgaggtgttcagtgatcacacgagtttgaaatatttgt 3036  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttg 209  Q
    | ||| ||||||| ||||| || ||||||  ||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||||    
T  3035 tcgataagaaggagttgaatataaggcagcaaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttg 2970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6701 - 6476
Alignment:
Q  71 aaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggc 170  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  6701 aaaatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggc 6602  T
Q  171 agagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgtt 270  Q
    |||||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||  | ||    
T  6601 agagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagtcttt 6502  T
Q  271 acacatgtctgctatgatggtaaatg 296  Q
     || ||||||||| ||||||| ||||    
T  6501 gcatatgtctgctttgatggttaatg 6476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8789 - 8572
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  8789 attttgaggcattatttgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccataagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaa 8690  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    ||| |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| |||||| ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  8689 gaatatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcacccgaggaaggctaatgttgttgccgatgctttgagtaggaagactttgca 8590  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  8589 tatgtctgctttgatggt 8572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25350 - 25133
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  25350 atttggaggcattatctttatggttcgaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 25251  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    | | |||||| ||     | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  25250 ggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaagtgaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgca 25151  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  25150 tatgtctgctttgatggt 25133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Original strand, 133271 - 133380
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| | ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  133271 atttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaa 133370  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  133371 gaagatggtt 133380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26381 - 26281
Alignment:
Q  191 ttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatgg 290  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||    
T  26381 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 26282  T
Q  291 t 291  Q
    |    
T  26281 t 26281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 986 - 769
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  986 atttggagtcattatctgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 887  T
Q  174 gaaaatggttagagctgt-tgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttac 272  Q
    ||| |||||| ||  | | | ||||| | |||||||   |||| ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || || || || |    
T  886 gaagatggtt-gaaatatcttaaggactttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgc 788  T
Q  273 acatgtctgctatgatggt 291  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  787 atatgtctgctttgatggt 769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24876 - 24774
Alignment:
Q  189 tgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgat 288  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||| ||||    
T  24876 tgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaagactctacatatgtccgctttgat 24777  T
Q  289 ggt 291  Q
    |||    
T  24776 ggt 24774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6775 - 6525
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||  |||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||  || ||||| ||| |||    
T  6775 gagttggctaatgtggtctttatattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgataatacgagtttgaagtatctat 6676  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||  ||| | ||  || | || |||||| | ||||  || |  |||||| |||||||||| ||||| ||    
T  6675 tcgatcagaaggaatggaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattataactttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgt 6576  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    ||||||||||||||| | ||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  6575 tgcagatgctttgagtatgaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaa 6525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Original strand, 11492 - 11601
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  11492 atttagaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgagcaaaagagtttgaagtatttatttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 11591  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    | | ||||||    
T  11592 ggagatggtt 11601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 294
Target Start/End: Original strand, 819 - 1069
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttat 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||  | || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||  | ||||||||||    
T  819 gagttggctgttgtggtctttgtacttaagatatggagaaattacttgtatggttcgagatttgaagtattcagcgatcacaagagtctaaaatatttat 918  T
Q  144 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggt 243  Q
    ||||||  |||||||| || ||||||||| | |  ||| | ||  ||||||| || ||||||||||  ||||  |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  919 ttgatccaaaggaattcaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaagactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatcttgt 1018  T
Q  244 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
     |||||||| ||||  ||||| || || || ||||| || |||||||||||    
T  1019 agcagatgccttgaataggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaa 1069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12119 - 12037
Alignment:
Q  212 ttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaa 294  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |  ||||||||||    
T  12119 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagaccttacatatgtctacgttgatggtaaa 12037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15582 - 15480
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||    
T  15582 atttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaaatatttatttgattagaaagagttgaatattaggcaga 15483  T
Q  174 gaa 176  Q
    |||    
T  15482 gaa 15480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 10818 - 10709
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  10818 atttggaggcataatttgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcata 10719  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  10718 gaagatggtt 10709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5417 - 5336
Alignment:
Q  212 ttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaa 293  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5417 ttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttacatatgtccgctatgatggtaa 5336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 72713 - 72604
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||| ||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  72713 atttggaggcattatctgtatggttctaagttttaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 72614  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  72613 gaagatggtt 72604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Original strand, 2734 - 2951
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  2734 atttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttaagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaa 2833  T
Q  174 gaaaatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttaca 273  Q
    |||  ||||| |||    | ||||||| |||||||   |||| ||||||||| |  || || |||||  |||  ||||||||||| || || || |||||    
T  2834 gaaggtggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgcgaaggctaatgtatttgttgatgctttgagtagaaagactttaca 2933  T
Q  274 catgtctgctatgatggt 291  Q
     ||||||||| |||||||    
T  2934 tatgtctgctttgatggt 2951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19571 - 19462
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| |    
T  19571 atttggagacattatctgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaacagttgaatatgaggcaaa 19472  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  19471 gaagatggtt 19462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 258
Target Start/End: Original strand, 7702 - 7856
Alignment:
Q  104 tttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaaatggttagagctgttgaaggattatg 203  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||| |||    | ||||||| ||    
T  7702 tttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaagcagagaagatggttggagtatcttaaggattttg 7801  T
Q  204 attttggcttgaattatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgag 258  Q
    |||||   |||| ||||||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  7802 attttcagttgagttatcatcccgagaaggctaatgttgttgctgatgctttgag 7856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 34738 - 34683
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaag 129  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34738 atttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcataaaag 34683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4068 - 3959
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||| | | || || || ||||| ||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| |    
T  4068 atttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcatttaccacaagagtttgaagtatttgttttatcaaaaagagttgaatatgaggcaaa 3969  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  3968 gaagatggtt 3959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Original strand, 13596 - 13705
Alignment:
Q  74 atttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaga 173  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||| |||  |    
T  13596 atttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgttttatcaaaaagagttgaatatggggccaa 13695  T
Q  174 gaaaatggtt 183  Q
    ||| ||||||    
T  13696 gaagatggtt 13705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 112
Target Start/End: Original strand, 1528 - 1596
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtg 112  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  1528 gagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtg 1596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 112
Target Start/End: Original strand, 8445 - 8513
Alignment:
Q  44 gagttggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtg 112  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  8445 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtg 8513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University