View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8888_low_54 (Length: 376)

Name: NF8888_low_54
Description: NF8888
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8888_low_54
NF8888_low_54
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (19-368)||(19038199-19038548)
chr5 (19-368)||(28238769-28239118)
chr5 (19-370)||(28879268-28879619)
chr5 (21-368)||(30707719-30708066)
chr5 (19-368)||(8577575-8577924)
chr5 (69-368)||(8739-9038)
chr5 (19-365)||(7760012-7760351)
chr5 (19-365)||(38407887-38408226)
chr5 (19-365)||(5199442-5199781)
chr5 (19-365)||(511646-511985)
chr5 (19-365)||(42538468-42538814)
chr5 (27-341)||(8699470-8699784)
chr5 (19-365)||(38970716-38971062)
chr5 (19-365)||(42937692-42938019)
chr5 (19-341)||(15939344-15939666)
chr5 (19-89)||(40623041-40623111)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (19-368)||(17423138-17423487)
chr2 (19-368)||(30493997-30494346)
chr2 (19-368)||(43981193-43981542)
chr2 (19-368)||(15833928-15834277)
chr2 (19-368)||(5354643-5354992)
chr2 (19-368)||(43536740-43537089)
chr2 (19-368)||(28471200-28471549)
chr2 (19-368)||(45431177-45431526)
chr2 (19-368)||(39950166-39950515)
chr2 (19-365)||(29398641-29398987)
chr2 (31-368)||(7189485-7189822)
chr2 (19-365)||(10825954-10826293)
chr2 (23-365)||(36653536-36653878)
chr2 (207-368)||(22680191-22680351)
chr2 (19-347)||(7416475-7416803)
chr2 (115-344)||(40538235-40538464)
chr2 (19-122)||(20067493-20067596)
chr2 (42-77)||(22529914-22529949)
chr2 (19-89)||(40538476-40538546)
chr2 (291-365)||(45292545-45292619)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (19-368)||(46401377-46401726)
chr3 (19-368)||(42901192-42901541)
chr3 (19-368)||(46698347-46698696)
chr3 (19-368)||(49141550-49141899)
chr3 (19-368)||(50477809-50478158)
chr3 (19-368)||(54388797-54389146)
chr3 (19-368)||(34048097-34048446)
chr3 (19-368)||(2272088-2272437)
chr3 (19-368)||(36130157-36130506)
chr3 (19-368)||(4005443-4005791)
chr3 (19-365)||(47071219-47071558)
chr3 (19-324)||(599583-599888)
chr3 (19-330)||(17562375-17562686)
chr3 (19-285)||(9473034-9473300)
chr3 (19-365)||(20353216-20353562)
chr3 (19-365)||(41614944-41615282)
chr3 (19-341)||(49266401-49266723)
chr3 (19-365)||(16646183-16646516)
chr3 (19-365)||(42759337-42759676)
chr3 (19-365)||(44232393-44232732)
chr3 (19-365)||(48565551-48565890)
chr3 (19-344)||(48891213-48891538)
chr3 (112-344)||(50758795-50759027)
chr3 (19-209)||(52388630-52388820)
chr3 (242-368)||(52388827-52388953)
chr3 (240-365)||(51807851-51807976)
chr3 (19-131)||(2648608-2648720)
chr3 (19-344)||(42804993-42805318)
chr3 (19-255)||(50214199-50214428)
chr3 (19-344)||(30253126-30253451)
chr3 (296-368)||(3495550-3495622)
chr3 (19-182)||(6927989-6928146)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (19-364)||(27638424-27638769)
chr6 (19-368)||(6203821-6204170)
chr6 (19-368)||(11690788-11691137)
chr6 (19-368)||(30826654-30827003)
chr6 (19-368)||(22303902-22304251)
chr6 (19-368)||(31770746-31771088)
chr6 (97-368)||(26440113-26440384)
chr6 (21-356)||(26172594-26172936)
chr6 (19-365)||(2406918-2407257)
chr6 (19-344)||(24085850-24086177)
chr6 (19-182)||(2406059-2406222)
chr6 (19-365)||(32642567-32642912)
chr6 (19-365)||(18005475-18005821)
chr6 (19-329)||(3384140-3384449)
chr6 (46-142)||(21603282-21603378)
chr6 (19-77)||(32641897-32641955)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (19-368)||(1055198-1055547)
chr8 (19-368)||(23019323-23019672)
chr8 (19-368)||(26662119-26662468)
chr8 (19-368)||(15033801-15034150)
chr8 (19-368)||(22532-22881)
chr8 (19-368)||(42482542-42482891)
chr8 (19-368)||(486769-487118)
chr8 (19-365)||(34367646-34367992)
chr8 (19-365)||(39603963-39604308)
chr8 (19-368)||(43214075-43214405)
chr8 (19-356)||(34819646-34819983)
chr8 (19-365)||(41243120-41243447)
chr8 (19-341)||(20858712-20859034)
chr8 (19-365)||(39831787-39832125)
chr8 (19-365)||(5301343-5301689)
chr8 (19-353)||(40075736-40076063)
chr8 (19-341)||(45132438-45132760)
chr8 (19-332)||(35554303-35554609)
chr8 (19-365)||(21176349-21176695)
chr8 (19-341)||(5679558-5679882)
chr8 (19-344)||(51778-52103)
chr8 (21-182)||(30761310-30761485)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (19-368)||(41883212-41883561)
chr7 (19-368)||(48406030-48406379)
chr7 (19-368)||(9368438-9368787)
chr7 (19-368)||(17460298-17460647)
chr7 (19-368)||(17592567-17592916)
chr7 (19-368)||(35607427-35607776)
chr7 (19-367)||(42504970-42505318)
chr7 (19-368)||(15071319-15071655)
chr7 (19-368)||(17837632-17837974)
chr7 (19-368)||(10521503-10521851)
chr7 (19-365)||(5538587-5538933)
chr7 (19-368)||(13322706-13323055)
chr7 (19-365)||(16680134-16680480)
chr7 (19-365)||(17654370-17654716)
chr7 (19-365)||(27450723-27451069)
chr7 (19-324)||(34741444-34741742)
chr7 (149-365)||(11630427-11630643)
chr7 (19-341)||(47670239-47670561)
chr7 (19-298)||(37342992-37343271)
chr7 (19-178)||(47522013-47522172)
chr7 (161-365)||(11632680-11632884)
chr7 (112-344)||(9491989-9492221)
chr7 (19-89)||(11630317-11630387)
chr7 (227-344)||(36980256-36980373)
chr7 (19-131)||(16488281-16488394)
chr7 (112-182)||(41734630-41734700)
chr7 (19-55)||(41734713-41734749)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (19-368)||(6178840-6179189)
chr4 (19-368)||(41796075-41796424)
chr4 (19-368)||(49168183-49168532)
chr4 (19-368)||(31424412-31424761)
chr4 (19-368)||(1306170-1306521)
chr4 (19-368)||(49093093-49093443)
chr4 (19-368)||(21018628-21018977)
chr4 (19-368)||(40355453-40355802)
chr4 (97-368)||(30723877-30724148)
chr4 (19-365)||(44677020-44677366)
chr4 (19-365)||(50277829-50278175)
chr4 (19-365)||(37016633-37016967)
chr4 (19-356)||(8109835-8110172)
chr4 (19-365)||(10730030-10730376)
chr4 (19-365)||(10943799-10944145)
chr4 (71-365)||(51685810-51686104)
chr4 (19-356)||(50904047-50904377)
chr4 (19-344)||(71633-71958)
chr4 (19-362)||(50020734-50021065)
chr4 (19-344)||(13624569-13624894)
chr4 (223-365)||(50196076-50196218)
chr4 (115-341)||(41931108-41931334)
chr4 (31-341)||(14317308-14317618)
chr4 (154-341)||(46438767-46438954)
chr4 (19-287)||(30706657-30706925)
chr4 (19-89)||(30723777-30723847)
chr4 (19-142)||(50196224-50196351)
chr4 (19-126)||(55278820-55278927)
chr4 (22-104)||(46438956-46439038)
chr4 (216-297)||(21535449-21535530)
chr4 (28-119)||(12891833-12891924)
chr4 (46-365)||(40886693-40887012)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (19-368)||(3729379-3729729)
chr1 (19-368)||(13637036-13637385)
chr1 (19-368)||(26878388-26878730)
chr1 (19-368)||(19158692-19159041)
chr1 (19-368)||(95132-95474)
chr1 (19-368)||(31780697-31781039)
chr1 (19-368)||(22526674-22527016)
chr1 (19-354)||(52804554-52804888)
chr1 (21-365)||(19522316-19522653)
chr1 (30-365)||(47505016-47505350)
chr1 (19-365)||(11196537-11196883)
chr1 (19-365)||(47660547-47660893)
chr1 (19-365)||(45828251-45828596)
chr1 (247-365)||(50341407-50341525)
chr1 (19-344)||(49855053-49855377)
chr1 (19-142)||(50617929-50618052)
chr1 (19-206)||(21143770-21143950)
chr1 (256-337)||(21143682-21143763)
chr1 (19-299)||(38120195-38120475)
chr1 (242-344)||(35256520-35256622)
chr1 (274-365)||(23273541-23273632)
chr1 (19-176)||(16269827-16269984)
chr1 (38-117)||(23273427-23273506)
chr1 (19-59)||(35256442-35256482)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (19-365)||(12025-12371)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (39-142)||(56476-56579)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (36-104)||(22343-22411)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 19038199 - 19038548
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038199 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 19038298  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038299 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 19038398  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038399 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 19038498  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19038499 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 19038548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 28238769 - 28239118
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28238769 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccccaggacatagccatccgccacccgccatg 28238868  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28238869 tatcctctcctgcctgctcacctcgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 28238968  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28238969 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgggcgccgcacataatccat 28239068  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28239069 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 28239118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28879619 - 28879268
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28879619 tcatttgcaggcctcggaagatctcctgaaagaggtggaaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 28879520  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28879519 tatcctctcctgcctgctcatcccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacacctgcacaatggaagacggtgggaggtccctaac 28879420  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  28879419 atcaatcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacatgatccag 28879320  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctcct 370  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28879319 cctgaataccagaaaatctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctcct 28879268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 30708066 - 30707719
Alignment:
Q  21 atttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||     
T  30708066 atttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatgta 30707967  T
Q  121 tcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  30707966 tcctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcaacgaacacctgcataatggaagacggtgggaggtccctaacag 30707867  T
Q  221 cagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatcc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  30707866 cagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccacacataatccaccc 30707767  T
Q  321 agaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30707766 ataataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 30707719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 8577575 - 8577924
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||    
T  8577575 tcatttgcaggcctcagaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatctgccgtccgccatg 8577674  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||   |||||  ||   |||    
T  8577675 tctcctctcctgcctgctgaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaagggaatgggatctctacaac 8577774  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  8577775 atccgtgggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccac 8577874  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8577875 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 8577924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 69 - 368
Target Start/End: Original strand, 8739 - 9038
Alignment:
Q  69 gtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtg 168  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  8739 gtgagacaccctagtgtaccataggacatagtcatccgtcatccgtcatgtctcctctcctgcctgctcaccccgatcgtctgccttaagcgtgtgagtg 8838  T
Q  169 ccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaa 268  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8839 cggaagtcgacgaacacctgcacaatgggaggcggcgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatctgtactgcctcaaaa 8938  T
Q  269 ccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8939 ccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccagccaaaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 9038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7760351 - 7760012
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||       |||    
T  7760351 tcatttgcaggcctcagaagatctcctggaagaggtgacaagatttgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgcc-------atg 7760259  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| || ||||||| |||||   |||    
T  7760258 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaagcggtggcaggtctacaac 7760159  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7760158 atccgttagatgtctggggatggtctggacgtattcgcactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccat 7760059  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    | |||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  7760058 caagaataccagaaaacctgttcaaagtcttggatctccctgtgctc 7760012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 38407887 - 38408226
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||       |||    
T  38407887 tcatttgctggcctaggaagatctcctggaagaggtggcaagatctaagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgcc-------atg 38407979  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| || ||   |||    
T  38407980 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtgaggcggtggcagctctacaac 38408079  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  38408080 atccgttagatgtatggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 38408179  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  38408180 ccagaataccagaaaacctcctcaaaatcatggatctccctgtgctc 38408226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5199781 - 5199442
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||       |||    
T  5199781 tcatttgctggcctcggaagatctcctagaagagatggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atg 5199689  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| |||||||||||||||||| |   || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   || ||||||   ||||||||  || ||   |||    
T  5199688 tctgctctcctgcctgctcacctcaatcggccgccttaaacgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctacacaatttgaggcggtgacagctctacaac 5199589  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||     
T  5199588 atccgtcggatgtctagggaccctctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacatcgcacataattcag 5199489  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || ||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  5199488 cctgaataccagaaaacctcttcaaaatcctggatctccctgtgctc 5199442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 511646 - 511985
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||| |||       |||    
T  511646 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccatctgcc-------atg 511738  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | | ||||  ||||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||   ||| |||||   ||||||||| || ||   |||    
T  511739 tattctcttgtgcctgctcaccccaatcggccgccttaaacgtgtgagtgcggaagtcgatgaatgcctgtacaatctgaggcggtggcagctctacaac 511838  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| |||| |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  511839 atccgtcgaatgtctagggacgctctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 511938  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    |  |||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||    
T  511939 catgaataccagaaaacctcctcaaaatcctagatctccctgtgctc 511985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 42538814 - 42538468
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| |  |||||||||||| ||  |   |||     
T  42538814 tcatttgctggtctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgaaacactttagtgtaccataacacatagccatccaccatctatcata 42538715  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||   ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||   ||| ||||| || ||   |||    
T  42538714 tctgctcttgtgcctgctcaccccaatcggtcgctgtaagcgtgtgagtgcggaagtcgacaaatgcctgcacaatctgaggtggtggcagctctacaac 42538615  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||||| |||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||     
T  42538614 atccgtcggatgtctagggacgctctggacatattcgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctatgaacaccgcacataatccag 42538515  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || |||||||||||||||||||| || || ||||||||  |||||||    
T  42538514 cctgaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatctccatgtgctc 42538468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 341
Target Start/End: Original strand, 8699470 - 8699784
Alignment:
Q  27 aggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctct 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    | ||||||  | |||||| |||| | |   |||||||||| ||||    
T  8699470 aggcctcggaatatctcctggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacataggcatctgtcaaacgccatgtctgctct 8699569  T
Q  127 cctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcg 226  Q
    ||||| ||||||||||   || || ||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || ||| |  || ||   |||||| | ||    
T  8699570 cctgcatgctcaccccaatcggcctcctcaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagccggcgacagctctacaacatccgacg 8699669  T
Q  227 gatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 326  Q
    ||||||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||    
T  8699670 gatgtctaggggcggtctagacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgatcaccgcacataatccagcctgaata 8699769  T
Q  327 ccagaaaacctcctc 341  Q
    |||||| ||||||||    
T  8699770 ccagaatacctcctc 8699784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38971062 - 38970716
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||  |   |||||||    
T  38971062 tcatttgctggcctaggaagatctcctggaagaggtggaaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccacaacacatagccctccctcatacgccatg 38970963  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||   ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||  |||||||||  || ||   |||    
T  38970962 tctgctctgctgtctgctcaccccaatcggtcgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcttgcacaatctaaggcggtgtcagctctacaac 38970863  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||  ||| ||||||  |||||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || | || | ||| ||||||||     
T  38970862 attcgtcagatgtccagggatcttctgtacgtatctgtactgcctcaacaccctctcaggcaagtgacggtacaccttatgaacactgcaaataatccag 38970763  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || |||||||| || | |||||| ||  | |||||||| ||||||||    
T  38970762 cctgaataccataatatctcctcaaaaccctggatctccctgtgctc 38970716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 42937692 - 42938019
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtacc-acaggacatagccatccgccgcccgccat 117  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||       ||    
T  42937692 tcatttgctagcctgggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtacccatagcacatagccatccgcc-------at 42937784  T
Q  118 gtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaa 217  Q
    ||||            |||||||||   ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||||||| || ||   ||    
T  42937785 gtct------------gctcaccccaatcggtcgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatatgaggcggtggaagctctacaa 42937872  T
Q  218 catcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatcca 317  Q
    |||| ||| |||| || ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| |||||    
T  42937873 catccgtcagatgcctagggacagtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccccctcgggcaagtgac-gaacaccctacgaacaccgcacatgatcca 42937971  T
Q  318 tccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
     || ||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  42937972 gcctgaaaaccagaaaacctcctaaaaatcttggatctccctgtgctc 42938019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15939666 - 15939344
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||| |  |||||||| |||  |   |||| ||    
T  15939666 tcatttgctggcctcgaaagatatcctggaagaggtggcaaaatctaagggtgagacaacttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgccttg 15939567  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||   ||  | |||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||    
T  15939566 tctgctctactgcctgctcatcccaatcggtctccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacaaaagcctgcacaatatgaggcggtggcagctcaacaac 15939467  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | |||  |||| |||||| ||||| || || |||||||| |||    
T  15939466 atcaatcggatgtctagggaccgtctggacatatccgtactgcctcaaaatcctcttgagcagatgacagtacactctacgaacaccacacataattcat 15939367  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctc 341  Q
    || |||||| |||||| ||||||    
T  15939366 cctgaatactagaaaagctcctc 15939344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 40623041 - 40623111
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtacca 89  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||| ||||||    
T  40623041 tcatttgctggcctcggaagatctcttggaagaggtggcaaaatctgaggatgaggcaccttagtgtacca 40623111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17423487 - 17423138
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423487 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 17423388  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423387 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 17423288  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423287 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 17423188  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17423187 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 17423138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 30493997 - 30494346
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30493997 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 30494096  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30494097 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 30494196  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30494197 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 30494296  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30494297 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 30494346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 43981542 - 43981193
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43981542 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgcctcccgccatg 43981443  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43981442 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 43981343  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43981342 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 43981243  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43981242 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 43981193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15834277 - 15833928
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15834277 tcatttgcaggcctcagaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 15834178  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15834177 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 15834078  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15834077 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcggacaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 15833978  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15833977 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 15833928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 5354992 - 5354643
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5354992 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 5354893  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5354892 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 5354793  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5354792 atcagtcggatgtctggggatggtctacacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 5354693  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5354692 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctatgctcctc 5354643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 43536740 - 43537089
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43536740 tcatttgcaggcctcggaagatctactggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatctgccacccgccatg 43536839  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43536840 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 43536939  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43536940 atcagtcagatgtctggggatagtctgcatgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 43537039  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43537040 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 43537089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28471549 - 28471200
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28471549 tcatttgcaggtctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccgcccgccatg 28471450  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28471449 tatcctctcctacctgctcaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacacctgcacaatggaagacggtgggagatccctaac 28471350  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  28471349 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatctgtactacctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccac 28471250  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28471249 ccagaataccaaaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 28471200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 45431526 - 45431177
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  45431526 tcatttgcaggcctcggaagatctcctagaaaaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatg 45431427  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45431426 tatcctttcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagttgacgaacacctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 45431327  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  45431326 atcagtaggatgtctggggatggtctgcacgtatccatactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccacacataatccag 45431227  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45431226 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 45431177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 39950515 - 39950166
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39950515 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgccatccgccatg 39950416  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||   |||    
T  39950415 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgtacaatgtaaggcggtgggaggtctgcaac 39950316  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  39950315 atcagtcggatgtctgcggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacagacaccgcacataatccag 39950216  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  39950215 ccagaataccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctcctc 39950166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 29398641 - 29398987
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||  ||||||||    
T  29398641 tcatttgcaggcctaggaagatttcctggaagagatgacaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagtcatccgccatccgccatg 29398740  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | |||   |||    
T  29398741 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtggcaagtctacaac 29398840  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  29398841 atccgtcggatgtctggggatggtcaggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtaacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 29398940  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  29398941 ccagaataccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctc 29398987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7189822 - 7189485
Alignment:
Q  31 ctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctg 130  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||    
T  7189822 ctcggaagatctcctgaaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcatatagccatccgtcatcagccatgtctgctctcctg 7189723  T
Q  131 cctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatg 230  Q
    ||||||||||||   || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  7189722 cctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtacggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcagtgggaggtctacaacatcagtcggatg 7189623  T
Q  231 tctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccag 330  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  7189622 tctggggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccagtcagaataccag 7189523  T
Q  331 aaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  7189522 aaaacctcttcaaagtcctggatctccatgtgctcctc 7189485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 10825954 - 10826293
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||       ||||    
T  10825954 tcatttgcaggcctcggaatatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgc-------catg 10826046  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| || | |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||   |||    
T  10826047 tctgctattctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcatgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtggcaggtctacaac 10826146  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  10826147 atccgtcggatgtctgcggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 10826246  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  10826247 ccagaataccagaaaacctcatcaaagtcttggatctccctgtgctc 10826293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 365
Target Start/End: Original strand, 36653536 - 36653878
Alignment:
Q  23 ttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctc 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||| |  ||||||||||||| |  || ||||||||     
T  36653536 ttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggcgagacacccgagtataccataacacatagccatccgtcatccaccatgtctg 36653635  T
Q  123 ctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatca 222  Q
    |||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||    ||||||||  || ||   ||||||     
T  36653636 ctctcctgtctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgccttcacaaactgaggcggtgacagctctacaacatcg 36653735  T
Q  223 gtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccag 322  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || |    
T  36653736 gtcggatgtctggggacggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcggacaagtgacggtacaccctatgaacaccgcacataatccaacctg 36653835  T
Q  323 aataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  36653836 aataccaaaaaacctcctcaaaatcatggatctccctgtgctc 36653878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 207 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22680351 - 22680191
Alignment:
Q  207 gaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22680351 gaggtccctaacatcagtcggatgtctggg-atggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccg 22680253  T
Q  307 cacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22680252 cacataatccaaccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 22680191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7416803 - 7416475
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |  | ||||||||  | ||||||||||| |||    ||||||    
T  7416803 tcatttggaggcctcggaatatctcctggaagaagtggcaaaatctgagagtgagacgcaatggcgtaccatcgtacatagccatctgccatatgccatg 7416704  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||||||||||||| |||||||| |   || | ||||||||||||||||||| |||||||| |||  | ||||||||   || |||||  || ||   |||    
T  7416703 tctcctctcctgcatgctcaccgcaatcggctgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgaagaaagtatgcacaatctcagtcggtgacagctctacaac 7416604  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| | ||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |   ||||||||||||     
T  7416603 atccgacggatgtctagggacggtctggacatatccgtactgcctcaaaaccctatcgggcaagtgacggtgcaccttacgatcattgcacataatccag 7416504  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtc 347  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7416503 cctgaataccagaatacctcctggaagtc 7416475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40538464 - 40538235
Alignment:
Q  115 catgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccc 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||   || ||||||   || |||||  || ||      
T  40538464 catgtctcctctcctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgtggaagtcgacaaaagcctacacaatctcagccggtgacagctcta 40538365  T
Q  215 taacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataat 314  Q
     ||| ||   | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |  ||||||||||    
T  40538364 caacctccaacagatgtctagggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggaaagtgacggtgcaccctacgatcatcgcacataat 40538265  T
Q  315 ccatccagaataccagaaaacctcctcgaa 344  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||    
T  40538264 ccagcctgaataccaaaatacctcctcgaa 40538235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 20067493 - 20067596
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||| ||  |||||||     
T  20067493 tcattagctggcctcggaagatctcctagaagaagtggcaaaatcagagggtgagacaccctaatgtaccatattacatagccatcctccatccgccatt 20067592  T
Q  119 tctc 122  Q
    ||||    
T  20067593 tctc 20067596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 77
Target Start/End: Original strand, 22529914 - 22529949
Alignment:
Q  42 tcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacac 77  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22529914 tcctggaataggtggcaaaatctgagggtgagacac 22529949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 40538546 - 40538476
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtacca 89  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||    
T  40538546 tcatttggaggcctcagaatatctcttggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaatggcgtacca 40538476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 45292619 - 45292545
Alignment:
Q  291 caccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||    
T  45292619 caccctacgaacactgcacataatccagcctgaatactagaaaacctcctcaaaatcccggatctccctgtgctc 45292545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 46401726 - 46401377
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401726 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 46401627  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401626 tctcctctcctgcctgctcaccccggacgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 46401527  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401526 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 46401427  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46401426 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 46401377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 42901192 - 42901541
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42901192 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 42901291  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42901292 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 42901391  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42901392 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 42901491  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42901492 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 42901541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 46698347 - 46698696
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46698347 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 46698446  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46698447 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgtcttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 46698546  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698547 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 46698646  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46698647 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 46698696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 49141550 - 49141899
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49141550 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 49141649  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49141650 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaaatcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 49141749  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141750 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 49141849  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49141850 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 49141899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 50477809 - 50478158
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50477809 tcatttgcaggcctcggaagatctactggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 50477908  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50477909 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcaacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 50478008  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50478009 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 50478108  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50478109 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 50478158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 54389146 - 54388797
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54389146 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 54389047  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  54389046 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaaa 54388947  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54388946 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacgccctacggacgccgcacataatccat 54388847  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54388846 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 54388797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 34048446 - 34048097
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34048446 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 34048347  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34048346 tatcctctcctgcctgctcaccccaagctaccgccttaagcgtgtgagtgcgaaaatcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 34048247  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34048246 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctatggacgccgcacataatccat 34048147  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34048146 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctatgtgctcctc 34048097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 2272088 - 2272437
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2272088 tcatttgcaggcctcaaaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgccatccgccatg 2272187  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||   |||    
T  2272188 tctgctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatggaaagcggtgggaggtctgcaac 2272287  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  2272288 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccag 2272387  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2272388 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 2272437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 36130506 - 36130157
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| |||  ||||||||    
T  36130506 tcatttgcaggcctcggaagatctccagggagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcatatagccatcagccatccgccatg 36130407  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | | ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||| ||   |||    
T  36130406 tatgctctcctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaagggagtgggagctctacaac 36130307  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  36130306 atccgtgggatgtctggggatggtctgcacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcgggaaagtgacggtacaccctacggacaccacacataatccag 36130207  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36130206 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 36130157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 4005443 - 4005791
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| |||  ||||||||    
T  4005443 tcatttgcaggcctcggaagatctctagggagaggtggcaaagtatgagggtgagacaccctagtgtaccatagcatatagccatcagccatccgccatg 4005542  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||   || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||| ||   |||    
T  4005543 tctgctctcctgcctactcaccccaatcg-ccgctttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaagggagtgggagctctacaac 4005641  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  4005642 atccgtgggatgtctagggatggtctgcatgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccag 4005741  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4005742 ccagaataccagaaaacatcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 4005791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 47071219 - 47071558
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||       |||    
T  47071219 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggtaaaggtggcaagatccaagagtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgcc-------atg 47071311  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| |||||||||||||||||| |   |  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  47071312 tctgctctcctgcctgctcacctcaatcagccgccttaagcatgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctacacaatgtaaggcggtgggaggtctacaac 47071411  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  47071412 atccgtcggatgtctggggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaatcctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacgccgcatataatccag 47071511  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  47071512 tcagaataccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctc 47071558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 599888 - 599583
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||| ||   ||||||||| |||  ||||||||    
T  599888 tcatttgcaggcctcggaagatctccaggaagaggtggcgaaatctgagggtgagacatcctagtgtaccatagctaatagccatcagccatccgccatg 599789  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
     || ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| || ||   |||    
T  599788 actgctctcctgcctgctcaccccaatcgtccaccttaagcgtgtgagtgcagaagtcgacgaacacctgcacaatgtaaggcaatggcagctctacaac 599689  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  599688 atccgtgagatgtctgaggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccacacataatccag 599589  T
Q  319 ccagaa 324  Q
    ||||||    
T  599588 ccagaa 599583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 330
Target Start/End: Original strand, 17562375 - 17562686
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||   |||||||    
T  17562375 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagagatggcgagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatctgccatacgccatg 17562474  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||  ||| || ||  || ||   |||    
T  17562475 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagactgcacaatctaagacgatgacagctctacaac 17562574  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| | | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  17562575 atccgacagatgtctagggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 17562674  T
Q  319 ccagaataccag 330  Q
    || |||||||||    
T  17562675 cctgaataccag 17562686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9473300 - 9473034
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  9473300 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgccatccgtcatg 9473201  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| || |    |||    
T  9473200 tctcctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtctgagtgcggaagtcgacgaacgcctggacaatgtgagacggtggcagctgtacaac 9473101  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtga 285  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9473100 atcgatcggatgtctggggacggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtga 9473034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20353562 - 20353216
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| || || |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  | ||||||    
T  20353562 tcatttgttggcctcagaagatctcgtgaaagaggtggaaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatcagccatg 20353463  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |   ||||||||| || ||   |||    
T  20353462 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgtggaagtcgacgaatgcctgcacagtctgaggcggtggtagctctacaac 20353363  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  20353362 atccgtcggatgtctagggatcgtctggacgtatccgtactgcctcaaacccctctcaggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 20353263  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || ||||||||||||| |||||| || || |||||||| || |||||    
T  20353262 cctgaataccagaaaatctcctcaaaatcctggatctccctatgctc 20353216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 41615282 - 41614944
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||       |||    
T  41615282 tcatttgctggcctcggaagatctcctgtaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atg 41615190  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||  || ||   |||    
T  41615189 tctgctctcctgcctgctcaccccat-cggccgccctaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtgacagctctacaac 41615091  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| | | ||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  41615090 atccgccagatgtctagggaccctctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacgatacaccctacgaacaccgcacataatccag 41614991  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  41614990 cctgaataccataaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 41614944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 49266401 - 49266723
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| || |||| |||  ||||||||    
T  49266401 tcatttgctgacctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacacagtcatctgccatccgccatg 49266500  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| || ||||||||||||||||    || || ||||||||||||||||||  |||||||||||   |||||||||   ||||||||  || ||   |||    
T  49266501 tctgctttcctgcctgctcaccctaatcggccaccttaagcgtgtgagtgcgaaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtgacagctctacaac 49266600  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||| ||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || |||||||||||     
T  49266601 atccgtcagatgtttggggacggtctggacgtctccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaaatgacggtagaccctacgaccacctcacataatccag 49266700  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctc 341  Q
    ||  |||||||||||||||||||    
T  49266701 cctaaataccagaaaacctcctc 49266723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16646516 - 16646183
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||||||||  ||||||||    
T  16646516 tcatttgcaagtctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatcaaagggtgagacaccctagtttaccatagcacatagtcatccgccatccgccatg 16646417  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | |            |||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| |||||   |||    
T  16646416 tgt------------gctcaccccaatcgtctgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcataatgtaaggcggtggcaggtctacaac 16646329  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||   || ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  16646328 atacttcagatgtcttgggatggtctggatgtatccgtactgcctcaaaaccctatcgggaaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataat-cag 16646230  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  16646229 ccagaataccagaataccttctcaaagtcctggatctccctgtgctc 16646183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 42759676 - 42759337
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||       |||    
T  42759676 tcatttgctggcctcggaagatctcttagaagaggtggcaaaatttgagggtgagacaccttagtgtaccataaaacatagccatccgcc-------atg 42759584  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||  || |||||||||||   || || |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||   ||||||||| || ||   |||    
T  42759583 tctgctcttgtgtctgctcaccccaatcgaccaccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcatgcacaatctgaggcggtggcagctctacaac 42759484  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||  ||||||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  42759483 attcgtcggatgtctagggacgctctggatgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacgctacaccctacgaacaccgcacataattcag 42759384  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || ||||||||||||  |||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  42759383 cctgaataccagaaaggctcctcaaaatcttggatctccctgtgctc 42759337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44232732 - 44232393
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| | |||| |||       |||    
T  44232732 tcatttgctggcctcggaagatctcctgaaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacattgtcatcagcc-------atg 44232640  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | | ||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||   ||||||||| || ||   |||    
T  44232639 tatgctctcttgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagccgacgaatatctgcataatctgaggcggtggcagctctacaac 44232540  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| | || || |||||||||||     
T  44232539 atctgtcagatgtctggggacggtctggacgtatccgcactgcctcaaaaccctctcgaaaaagtgacagtacaccctatgaacaccacacataatccag 44232440  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || |||||||||||||||||||  || || ||||||||  |||||||    
T  44232439 cctgaataccagaaaacctccttaaaatcctggatctccatgtgctc 44232393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 48565890 - 48565551
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |  |||||||||||||||       |||    
T  48565890 tcatttgctggcctcggaagatcttctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacacctcagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atg 48565798  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||    
T  48565797 tctgctcttgtgcctgctcaccccattcgaccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctctacaac 48565698  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| |||||||||||   || | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||||||| |     
T  48565697 atcggtcggatgtctaaagacgctctggacgtatctgtactgcctcaaaacccgctcgggtaagtgacagtacaccctacgaacaccacacataatctag 48565598  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || ||| |||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||    
T  48565597 cctgaacaccagaaaacctcctcaaaatcctggatctcccagtgctc 48565551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 48891538 - 48891213
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    | ||||||  | ||||||||||| |||   |||||||    
T  48891538 tcatttggaggcctcgtaatatctcctggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatctgccatacgccatg 48891439  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
     || ||||| ||| ||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||   || || ||  || ||   |||    
T  48891438 cctgctctcatgcatgctcactccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagtctgcacaatctcagccgatgacagctctacaac 48891339  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||||||     
T  48891338 atccgacggatgtctagggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccttacgaacactgcatataatccag 48891239  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaa 344  Q
    || ||||||||||| |||||||||||    
T  48891238 cctgaataccagaatacctcctcgaa 48891213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 112 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 50759027 - 50758795
Alignment:
Q  112 cgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggt 211  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || |||||  || |    
T  50759027 cgccatgtctgctctcctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagccggtgacagct 50758928  T
Q  212 ccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacat 311  Q
    |   |||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||    
T  50758927 ctacaacatccggcggatgtctagggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcggtcaagtgacggtacaccctacaatcaccgcacat 50758828  T
Q  312 aatccatccagaataccagaaaacctcctcgaa 344  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  50758827 aatccagcctgaataccagaatacctcctcgaa 50758795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 52388630 - 52388820
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| |||  ||||||||    
T  52388630 tcatttgcaggcctcggaagatctccattgagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtctaccatagcatatagccatcagccatccgccatg 52388729  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggag 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||    
T  52388730 tctactctcctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaagggagtgggag 52388820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 242 - 368
Target Start/End: Original strand, 52388827 - 52388953
Alignment:
Q  242 tctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctc 341  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52388827 tctgcacgtatctatactacctcaaaaccctctcggacaagtgacggtacaccctacggacaccgcacattatccagccagaataccagaaaacctcctc 52388926  T
Q  342 gaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  52388927 gaagtcctggatctctctgtgctcctc 52388953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 240 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 51807976 - 51807851
Alignment:
Q  240 ggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcc 339  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  51807976 ggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaataccagaaaacctcc 51807877  T
Q  340 tcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || || ||||||||||| ||||||||    
T  51807876 tcaaaatcttggatctccctgtgctc 51807851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Original strand, 2648608 - 2648720
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  2648608 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatg 2648707  T
Q  119 tctcctctcctgc 131  Q
    | |||||||||||    
T  2648708 tatcctctcctgc 2648720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 42804993 - 42805318
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  | | ||||||  | ||||||||||| |||   | |||||    
T  42804993 tcatttggaggcctcagaatatctcctggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaatggtgtaccatcgtacatagccatctgccatacaccatg 42805092  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||   || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||   |||||||||   || ||||   || ||   |||    
T  42805093 tctcctctcatgcatgctcaccccaatcgcccgccttaagcgtacgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctgagccggtaacagctctacaac 42805192  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| | ||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || |  | ||||||||||||||     
T  42805193 atccgacggatgtctagggacggtccgaacgtatctgtactgcctcaaaatcctctcgggctagtgacggtgcaccgtatgatcaccgcacataatccag 42805292  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaa 344  Q
    || ||||||||||| |||||||||||    
T  42805293 cctgaataccagaatacctcctcgaa 42805318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Original strand, 50214199 - 50214428
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||       ||||||||    
T  50214199 tcatttgctggcctcggaatatctcctggaagaggtggcaagatttgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccat-------ccgccatg 50214291  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||| |  |||||||||||   ||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||  ||||||||  || |    ||     
T  50214292 tctgctctcttagctgctcaccccaatcggtcgtcttaagcgtgtgagtgaggaagtcgacgaacgcctacacaatgtgaggcggtgacagctttacaat 50214391  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccg 255  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  50214392 atccgtcggatgtctggggacggtctggacgtatccg 50214428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 30253126 - 30253451
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||  ||| | ||||||| |||||||  ||||||||      ||||||  | ||||||||||| |||   |||||||    
T  30253126 tcatttggaggcctcggaatatctcccagaagaagtggcaaaatctgagcatgagacacaacgatgtaccatcgtacatagccatctgccatacgccatg 30253225  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | |  |||| ||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||   |||| |||  || ||   |||    
T  30253226 tttgttctcttgcatgctcaccccagtcagccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaaaacctgcacaatctcaggcagtgacagctctacaac 30253325  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| | ||||||||| |||| ||| || | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  | || |||||||||||     
T  30253326 atccgacggatgtctagggacggtttggatgtatctgtactgcctcaaaaccctctcgagcaagtgacggtataccctctgatcaccacacataatccag 30253425  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaa 344  Q
    || |||||||| || |||||||||||    
T  30253426 cctgaataccataatacctcctcgaa 30253451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 368
Target Start/End: Original strand, 3495550 - 3495622
Alignment:
Q  296 tacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3495550 tacggacaccgcacataatccacccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 3495622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6928146 - 6927989
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtacca-caggacatagccatccgccgcccgccat 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||||||  |  ||||||||||       |||||||    
T  6928146 tcatttgctggcctcggaagatctcctgaaagaggtggcaaaatttgagggtgacacaccttagtgtaccataaacacatagccat-------ccgccat 6928054  T
Q  118 gtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaa 182  Q
    |||| ||||   |||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6928053 gtctgctcttgcgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaa 6927989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27638769 - 27638424
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27638769 tcatttgcaggcctcggaagatctcttggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 27638670  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638669 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 27638570  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638569 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 27638470  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27638469 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgct 27638424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6204170 - 6203821
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6204170 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 6204071  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6204070 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 6203971  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6203970 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 6203871  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6203870 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 6203821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11691137 - 11690788
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11691137 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 11691038  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11691037 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 11690938  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690937 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 11690838  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11690837 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 11690788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 30826654 - 30827003
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30826654 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 30826753  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30826754 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 30826853  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826854 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 30826953  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30826954 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 30827003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22304251 - 22303902
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22304251 tcatttgcaggcctcagaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 22304152  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22304151 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 22304052  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304051 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 22303952  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22303951 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 22303902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31771088 - 31770746
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||       |||    
T  31771088 tcatttgctggcctcggaagatctcctgaaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgcc-------atg 31770996  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||  ||||||||| || ||   |||    
T  31770995 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctacacaatgtgaggcggtggcagctctacaac 31770896  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  31770895 atccgtcggatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcaggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 31770796  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  31770795 ccagaataccataaaacctcctcaaaatcatggatctctctgtgctcctc 31770746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 97 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26440384 - 26440113
Alignment:
Q  97 tagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatgg 196  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||   |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||     
T  26440384 tagccatccgccatccgccatgtctgctctcctgccggctcaccccaatcagtcgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcttgcacaatgt 26440285  T
Q  197 aaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccct 296  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26440284 aaggcagtgggaggtctacaacatcagtcagatgtctagggatggtctggacgtatccgtattgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccct 26440185  T
Q  297 acggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  26440184 acggacaccgcacataatccaaccagaataccagaaaacctcctcaaagtcatggatctccttgtgctcctc 26440113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26172936 - 26172594
Alignment:
Q  21 atttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtc 120  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||  |||| |||||    
T  26172936 atttgctggcgtcggaagatctcctcgaagaggtggcaaaatttgagg-tgagacaccctagtgtaccataacacatagacatccgccatccgcaatgtc 26172838  T
Q  121 tcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacat 220  Q
    | |||||||||||||| | |||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||||    
T  26172837 tgctctcctgcctgcttatcccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctctacaacat 26172738  T
Q  221 cagt--------cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacata 312  Q
    | ||        |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26172737 ccgttcatccgtcggatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaactctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacata 26172638  T
Q  313 atccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctc 356  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  26172637 atccagcctgaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatctc 26172594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2407257 - 2406918
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||       ||     
T  2407257 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatccgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatctgcc-------att 2407165  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||   |||  |||| || ||   |||    
T  2407164 tctgctctcctgcctgttcacctcgatcggccgccttaagcgtgtaagtgcggaagtcgacgaatgtctgcacaatttgaggtagtggcagctctacaac 2407065  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||     
T  2407064 atccgtcggatgtttagggacggtctagacgtatccgtattgccttaaaaccctctcgagcaagtgacagtagaccctacgtacaccgcatataatccag 2406965  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  2406964 cctgaataccagaaaacctactcaaagtcctggatctccctgtgctc 2406918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 24085850 - 24086177
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||  || | ||||||| |||||||||||||||||    | ||||||  | ||||||||||| |||   |||||||    
T  24085850 tcatttggaggcctccgaatatctcctacaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatctgccatacgccatg 24085949  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
     || ||||||||| ||||||||||   || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||   || |||||  || ||   |||    
T  24085950 cctgctctcctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagtgtgtgagtgcggaagtcgacgaaaacatgcacaatctcagtcggtgacagctctacaac 24086049  T
Q  219 atcagtcggatgtctg-gggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcggg-caagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatcc 316  Q
    ||| | || ||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  24086050 atccgacgaatgtctaagggacggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcggggcaagtgacggtacaccctacgatcaccgcacataatcc 24086149  T
Q  317 atccagaataccagaaaacctcctcgaa 344  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24086150 atcctgaataccagaatacctcctcgaa 24086177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 182
Target Start/End: Original strand, 2406059 - 2406222
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||| || ||| ||||    
T  2406059 tcatttgctggcctcggaagatctcttggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacacccttgtgtaccataacacatagccatccgtcgtccgtcatg 2406158  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaa 182  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2406159 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaa 2406222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 32642912 - 32642567
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||    | ||||||  | ||||||||||| | |   |||||||    
T  32642912 tcatttggaggcctcggaatatctcctggaagaagtggcaaaatttgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatctgtcatacgccatg 32642813  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| | ||||| | |||||||||     | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||   || |||||  |  ||   |||    
T  32642812 tctaccctcctacatgctcacccaatcag-ccgccttaagcgtgtgagtacggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagccggtgacaactctacaac 32642714  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||     
T  32642713 atccgacggatgtctagggacggtcaggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgatcaccgcacataattcag 32642614  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || ||||||||||| |||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  32642613 cctgaataccagaatacctcctcgaaagcctggaagtctctgtgctc 32642567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 18005475 - 18005821
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    | |||||   | ||||||||||| |||   | |||||    
T  18005475 tcatttggaggcctcggaaaatctcctggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccttcgtacatagccatctgccatacaccatg 18005574  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | |||||| |||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || |||||  |  ||   |||    
T  18005575 tttcctctgctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagtcggtgacatctctacaac 18005674  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    | |   | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   | || ||| |||||||     
T  18005675 agctaacagatgtctagggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgatggtgcaccctacaatcaccacacgtaatccag 18005774  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || |||||| |||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||    
T  18005775 cctgaatactagaatacctcctcgaaagcttggaagtccctgtgctc 18005821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3384449 - 3384140
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||| ||| || |  |||||||| |||  |    ||||||    
T  3384449 tcatttgctggcctcggaagatctc-tggaagagatggcaaaatctgagggtgagacatcttagtgtatcataacacatagccctccctcatatgccatg 3384351  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| |||| ||||||||||||  |   ||  | |||||||||||||| ||   ||||| |||||  ||||||||||   |||| |||  |  ||   |||    
T  3384350 tctgctctgctgcctgctcacttcaatcggtctccttaagcgtgtgaatgtgaaagtctacgaatgtctgcacaatctgaggcagtgtcatctctacaac 3384251  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| || |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||     
T  3384250 atccgtaggatgtctagggatcgtatggacgtatccgtactgcctcaacaccctctcaggcaagtgacggtgcaccctacgaacaccgcaaataatccag 3384151  T
Q  319 ccagaatacca 329  Q
    || ||||||||    
T  3384150 cctgaatacca 3384140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21603378 - 21603282
Alignment:
Q  46 ggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcacccc 142  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||||  ||  |  ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  21603378 ggaataggtggaaaaatctgagggtgagacaccgtagtgtaccatagtatatagccatcatccatcttccatgtcgcctctcctgctggctcacccc 21603282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Original strand, 32641897 - 32641955
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacac 77  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||    
T  32641897 tcatttggaggcctcggaatatctcctggaagaagtgacaaaatttgagggtgagacac 32641955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1055547 - 1055198
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1055547 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 1055448  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1055447 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 1055348  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055347 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 1055248  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1055247 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 1055198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 23019323 - 23019672
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23019323 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 23019422  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23019423 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 23019522  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019523 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 23019622  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23019623 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 23019672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26662468 - 26662119
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26662468 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 26662369  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26662368 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 26662269  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662268 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 26662169  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26662168 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 26662119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 15033801 - 15034150
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15033801 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccatccgccatg 15033900  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15033901 tatcctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggttcctaac 15034000  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15034001 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccac 15034100  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15034101 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 15034150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 22532 - 22881
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  22532 tcatttgcaggcctcggaatatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagtcatctgccacccgccatg 22631  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22632 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 22731  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22732 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggatgccacacataatccat 22831  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22832 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctagatctctctgtgctcctc 22881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 42482542 - 42482891
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  42482542 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggatatagccatccgccacccaccatg 42482641  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42482642 tatcctttcctgcctgctcaccccgagcgtccgcctcaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 42482741  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42482742 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaatcctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 42482841  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42482842 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctttctgtgctcctc 42482891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 486769 - 487118
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  486769 tcatttgcaggcctcgaaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 486868  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  486869 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgataaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 486968  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  486969 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacagacgccgcacataatccat 487068  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  487069 ccagaataccaggaaacctcctcgaagtcctgaatctctttgtgctcctc 487118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 34367646 - 34367992
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  34367646 tcatttgcaggcctcagaagatctcctgaaagaggtggcaagatctgagggtgagataccctagtgtaccatagcacatagccatccgccatccgccatg 34367745  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  34367746 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcgaaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtgggaggtctacaac 34367845  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||     
T  34367846 atcagtcggatgtctgaggatggtctggacgtattcgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgaaggtacaccatacagacaccgcacataatccag 34367945  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  34367946 ccagaataccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctatgctc 34367992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 39604308 - 39603963
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||    
T  39604308 tcatttgcaggcctcagaagatttcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagtcatccgccatccgtcatg 39604209  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||   |||    
T  39604208 tctactctcctgcatgctcaccccaatcggccaccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtggcaggtctacaac 39604109  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39604108 atccgtcggatgtct-gggatggtctggacgtattcgtactgcctcaaaaccctcttgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccat 39604010  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  39604009 ccagaatacgagaaaaccacctcaaagtcctggatctccctgtgctc 39603963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 43214405 - 43214075
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||       |||    
T  43214405 tcatttgcaggcctcataatatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgcc-------atg 43214313  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    |||            |||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||   |||    
T  43214312 tct------------gctcaccccaatcgttcgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtcggaggtctgcaac 43214225  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  43214224 atcagtcggatgtctggggatggtctggacgtattcgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacatcctacggacaccgcacataatccag 43214125  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  43214124 ccagaataccagaaaacctcctcaaagtcctgcatctccctgtgctcctc 43214075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Original strand, 34819646 - 34819983
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||  ||||||||    
T  34819646 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggaaaaatctgagggtgaaacaccttagtgtaccataacacatagccatccgccatccgccatg 34819745  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| |||   ||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||   ||||||||| || ||   |||    
T  34819746 tctgctcctgtgcctgctcaccccaatcggctgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctacacaatctgaggcggtggcagctctacaac 34819845  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||     
T  34819846 atccgtcggatgtctagggacgctctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacatcctacgaataccgcacataatccag 34819945  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctc 356  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  34819946 cctgaataccagaaaacctcctcaaaatcttggatctc 34819983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 41243120 - 41243447
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||              
T  41243120 tcatttgcaggccttggaagatctcctggaagaggtgacaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatctgcca--------- 41243210  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
              ||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||   |||    
T  41243211 ----------tgcctgctcaccccaatcgtctgccttaagcgtgtcagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtggcaggtctacaac 41243300  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||     
T  41243301 atctgtcggatgtctggggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaacactctctggcaagtgacggtacaccctacgaacagcgcacataatccag 41243400  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  41243401 ccagaataccataaaatctcctcaaagtcatggatctccctgtgctc 41243447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20859034 - 20858712
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |  |||||    
T  20859034 tcatttgcttgcctcgaaagatctcctggaagaggtggaaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatcatccatg 20858935  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | | ||||||||||||||||| ||    | |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||   |||||||||  |||||||||  |  ||   |||    
T  20858934 tatgctctcctgcctgctcactccaataggccgccttaagggtgtgagtgtggaagttgacgaatgcctgcacaatctaaggcggtgacaactctacaac 20858835  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  20858834 atccgtcggatgtttggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 20858735  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctc 341  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  20858734 cctgaataccagaaaacctcctc 20858712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 39831787 - 39832125
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||  ||||||||       |||    
T  39831787 tcatttgctggcctcggaagatctcttggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacacc-tagtgtaccataacacataatcatccgcc-------atg 39831878  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||  || ||   |||    
T  39831879 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcgaccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtgacagctctacaac 39831978  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || | || ||||||||||||||     
T  39831979 atcggtcggatgtctggagacggtctggacgtatccgtactgccttaaaaccctctcgggtaagtgacggtacaccttaggaacaccgcacataatccag 39832078  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  39832079 cctgaataccacaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 39832125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 5301343 - 5301689
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||  ||  ||||    
T  5301343 tcatttgctggccttggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagtcatccgccatccatcatg 5301442  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||| || |   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   |||  ||||||| ||   |||    
T  5301443 tctgctctcctgcctgctcgcctcaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggtagtgggagctctacaac 5301542  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||     
T  5301543 atccgtcggatgtctagggacggtatggacgtatccgtactacctcaaaatccacttggacaagtgacggtagacccaacaaacaccgcacataatccag 5301642  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    |  |||||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||    
T  5301643 cttgaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatcttcctgtgctc 5301689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 353
Target Start/End: Original strand, 40075736 - 40076063
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||       |||    
T  40075736 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atg 40075828  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||   ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||| ||||  || ||   |||    
T  40075829 tctgctcttgtgcctgctcaccccaatcggttgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggtggtgtcagctctacaac 40075928  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||| ||||||| |||||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  40075929 atccgtctgatgtctagggattctctggatgtatctgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacgatacaccctacgaacaccgcacataatccag 40076028  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggat 353  Q
    || |||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  40076029 cctgaatactagaaaatctcctcaaaatcttggat 40076063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45132760 - 45132438
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   |||||||    
T  45132760 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgccatg 45132661  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    |||  ||| || ||||||||||||   || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||   ||||||||| || ||   |||    
T  45132660 tctgatctgctacctgctcaccccaatcggcctccttaagcatgtgagtgcggaagtcgacgaaagcttgcacaatctgaggcggtggcagctcaacaac 45132561  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  45132560 atccgtcggatgtctagggaccatctggacgtatccgtactacctcaaaaccctctcgggcagatgtcggtacactctacgaacaccgcacataatccat 45132461  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctc 341  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  45132460 cctgaataccaaaaaacctcctc 45132438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35554609 - 35554303
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||       |||    
T  35554609 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atg 35554517  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| || |  ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||  || ||   |      
T  35554516 tctgcttttgtgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaattcctgcacaatctgaggcggtgtcagctctacatt 35554417  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||     
T  35554416 atccgtcggatgtctagggaccctctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccacaaataatccag 35554317  T
Q  319 ccagaataccagaa 332  Q
    || | |||||||||    
T  35554316 cctggataccagaa 35554303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 21176349 - 21176695
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||  || |||||| || |||||| |||||  |   |||||||    
T  21176349 tcatttgctggcctcagaagatcttctggaagaggtgtcaaaatctgagggtgtgacaccgcagtgtaccatagcacatagtcatccctcatacgccatg 21176448  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||||||   ||||| | | || ||   |||    
T  21176449 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcgtgctccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaatgcctccacaatctgaggcgatcgcagctctacaac 21176548  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||     
T  21176549 atccgtcggatgtctagggatgctctggacgtatccttactgccgcaaaaccctctcaagaaagtgacggtacatcctacgaacaccgcacataatccag 21176648  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || |||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||    
T  21176649 cctgaataccagaaaacctcctcaaaaccctggatctccctgtgctc 21176695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5679882 - 5679558
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||  |   |||||||    
T  5679882 tcatttgctagcctcggaagatctactggaagaggtggcaaaatccgagggtgagacaccgtagtataccatagcacatagccatccctcatacgccatg 5679783  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   ||  | |||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||   ||||||| |  | ||   |||    
T  5679782 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcgggctccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaatggctgcacaatctgaggcggtcgccgctctacaac 5679683  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacgg--tacaccctacggacgccgcacataatcc 316  Q
    ||| ||  | ||||| |||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  || ||| |||||||||    
T  5679682 atccgttagttgtctagggacgctctggacgtatccgtactgccgcaaaaccctctcaggcaagtgacggtatacaccctacaaacaccgtacataatcc 5679583  T
Q  317 atccagaataccagaaaacctcctc 341  Q
    | || ||||||||||||||||||||    
T  5679582 agcctgaataccagaaaacctcctc 5679558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 52103 - 51778
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || | |||| || || ||||||||||||||    | ||||||  | ||||||||||| | |    ||||||    
T  52103 tcatttggaggcctcggaatatctcatgaaagaagtggaaaaatgtgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatctgtcatatgccatg 52004  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || |||||  || ||   |||    
T  52003 tctgctctcatgcatgctcaccccaatcgaccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaatcctgcacaatctgagtcggtgacagctctacaac 51904  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| | ||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |     
T  51903 atctgacggatgtctagggacggactggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgatcaccgcacataatctag 51804  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaa 344  Q
    |  ||||| ||||| ||| |||||||    
T  51803 catgaatatcagaataccccctcgaa 51778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Original strand, 30761310 - 30761485
Alignment:
Q  21 atttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccat--- 117  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||  |||||||       
T  30761310 atttgctggcctcggaagatctcttggaagaggtggaaaaatttgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagtcatccgccatccgccatctg 30761409  T
Q  118 -----------gtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaa 182  Q
               |||| ||||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30761410 ccatccaccatgtctgctctcctgcatgctcaccccaatcggccaccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaa 30761485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 41883561 - 41883212
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41883561 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 41883462  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41883461 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 41883362  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883361 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 41883262  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41883261 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 41883212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 48406379 - 48406030
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48406379 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 48406280  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48406279 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 48406180  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406179 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 48406080  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48406079 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 48406030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 9368438 - 9368787
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9368438 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccgtg 9368537  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368538 tatcctctcctgcctgcacaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 9368637  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368638 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 9368737  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9368738 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 9368787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 17460298 - 17460647
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17460298 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatatgagggtgaaacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 17460397  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17460398 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 17460497  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460498 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 17460597  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17460598 caagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 17460647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17592916 - 17592567
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17592916 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatatgagggtgaaacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 17592817  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17592816 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 17592717  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592716 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 17592617  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17592616 caagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 17592567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 35607427 - 35607776
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35607427 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacctgccatg 35607526  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35607527 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 35607626  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35607627 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccatactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 35607726  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35607727 ctagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 35607776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 19 - 367
Target Start/End: Original strand, 42504970 - 42505318
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  42504970 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggcagcaagatatgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatg 42505069  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42505070 tatcctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatgaaaggcggtgggaggtccctaac 42505169  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42505170 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctcttgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccat 42505269  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcct 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42505270 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcct 42505318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 15071319 - 15071655
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  15071319 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatg 15071418  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071419 tatcctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcatgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 15071518  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||          ||   || ||||    
T  15071519 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgatggtacaccct----------ca---aaaccat 15071605  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15071606 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctatgctcctc 15071655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17837974 - 17837632
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||       |||    
T  17837974 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgcc-------atg 17837882  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  17837881 tctgctctcctgcttgctcaccccaatcgtctgccttaagcgtgtaagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatggaaggcggtgggaggtctgcaac 17837782  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  17837781 atcagtcggatgtctggggatggtctggacgtatccatactgcctcaaaaccatctcgggcaagtgacggtacaccatacggacaccgcacataatccag 17837682  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17837681 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctatgctcctc 17837632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 10521851 - 10521503
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  ||||||||    
T  10521851 tcatttgcaggtctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatatgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccatccgccatg 10521752  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||  ||||||| |||||||   |||    
T  10521751 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcgaaagtcgacgaacgcctgtacaatgtcaggcggtcggaggtctgcaac 10521652  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  10521651 atcagtcggatgtctggggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaa-cctcttgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccag 10521553  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  10521552 ccagaataccagaaaacctcctcaaagtcatgcatctccatgtgctcctc 10521503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 5538587 - 5538933
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  5538587 tcatttgctggcctcgaaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgccatccgccatg 5538686  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||| || ||   |||    
T  5538687 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagtgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtgaggcgatggcagctctacaac 5538786  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||  |||||||||| ||| ||||||  | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||     
T  5538787 atccatcggatgtctagggttggtctagatgtatttgtactgcctcaaaacccactcgggcaagtgacggtacaccgtacgaacaccgcacataatccaa 5538886  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  5538887 ccagaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 5538933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13323055 - 13322706
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||  ||||||||    
T  13323055 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaatatctgagggtgagacaccatagtgtaccatagaacatcgccatccgccatccgccatg 13322956  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||  ||| ||||| || ||   |||    
T  13322955 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggcccccttaagcgtgtgagtgctaaagtcgatgaacgcctgcacaatgtgaggtggtggcagctctacaac 13322856  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||| |||||     
T  13322855 atctttcggatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccttacgaacaccacacattatccag 13322756  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| | ||||||    
T  13322755 ccagaataccataaaacctcctcaaaatcctggatctctctattctcctc 13322706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16680480 - 16680134
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |||||| |    
T  16680480 tcatttgctggcctcggaagatctcatggaacaggtggcaaaatctgagggtgacacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatccgccaag 16680381  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||    
T  16680380 tctgctctcctgcctgctcaccctaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctcgacaac 16680281  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  16680280 atccgtcggatgtctggggacaggctggacgtattcgtactgcctcaaaaccctattggacaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 16680181  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || |||||||| ||||||||||  || || |||||||| ||||||||    
T  16680180 cctgaataccataaaacctcctaaaaatcctggatctccctgtgctc 16680134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17654716 - 17654370
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |||||| |    
T  17654716 tcatttgctggcctcggaagatctcatggaacaggtggcaaaatctgagggtgacacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatccgccaag 17654617  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||    
T  17654616 tctgctctcctgcctgctcaccctaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctcgacaac 17654517  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  17654516 atccgtcggatgtctggggacaggctggacgtattcgtactgcctcaaaaccctattggacaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccag 17654417  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || |||||||| ||||||||||  || || |||||||| ||||||||    
T  17654416 cctgaataccataaaacctcctaaaaatcctggatctccctgtgctc 17654370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 27450723 - 27451069
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||  ||||||||    
T  27450723 tcatttgctggcctcggaagatctcttggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacacagccatccgccatccgccatg 27450822  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||| ||||  || ||   |||    
T  27450823 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggtggtgacagctctacaac 27450922  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||  |||||| ||||| || ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||     
T  27450923 atcgttcggatatctggagacggtttggacgtatccgtactacctcaaaaccctcttgggaaagtgacggtacaccctataaacaccgcacataatccag 27451022  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  27451023 cctgaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 27451069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34741742 - 34741444
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||       |||    
T  34741742 tcatttgctggtctcagaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgaggttgagacagcctagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atg 34741650  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| || ||   |||    
T  34741649 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggctgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtgaggcggtggcagctctacaac 34741550  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  34741549 atccgtcagatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcttcaaaaccctatcgggcaagtgacagtacattctacgaacaccgcacataatccag 34741450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Original strand, 11630427 - 11630643
Alignment:
Q  149 ccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcac 248  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||||| ||||||||||| |||| |||||  ||    
T  11630427 ccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcaacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctctacaacatccgtcggatgtctagggacggtcttgac 11630526  T
Q  249 gtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtct 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||     
T  11630527 gtatacgtactgcctcaaaaccctctcgggaaagtgatggtagaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaataccagaaaacctcctcaaaatcc 11630626  T
Q  349 tggatctctctgtgctc 365  Q
    |||||||| ||||||||    
T  11630627 tggatctccctgtgctc 11630643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 47670239 - 47670561
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||    ||||||||||  ||    |||||||    
T  47670239 tcatttggaggcctcgaaatatctcctggaagaagtggcaaattctgagggtgagacacaatggcgtaccatcatacatagccatatgctatacgccatg 47670338  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||||||||||||  ||||||||||   || ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||   |||||||||   || |||||  || ||   |||    
T  47670339 tctcctctcctggatgctcaccccaatcggccgacttaagcgcgtgagtgcggaagttgacgaaagcctgcacaatctcagccggtgacagctctacaac 47670438  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
     || | ||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||     
T  47670439 ctccgacggatgtctaggtacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctttcgggcaagtgacggtgcaccctacgatcaccgcacataatccag 47670538  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctc 341  Q
    || ||||||||||| ||||||||    
T  47670539 cctgaataccagaatacctcctc 47670561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37343271 - 37342992
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |    ||||||    
T  37343271 tcatttgctggcctcggaagatctcctgaaagaggtggaaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatatgccatg 37343172  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| |||| |||||||||||||||   || || |||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||   ||||||||  || ||   |||    
T  37343171 tctgctctgctgcctgctcaccccaatcggcctccttaagcgtgtgagtgcggaagtatacgaatgtctgcacaatctgaggcggtgtcagctctacaac 37343072  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctac 298  Q
    ||| | ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37343071 atccgccggatgtctagggtttgtctggacgtatccgtattgccttaacaccctctcaggcaagtgacggtacaccctac 37342992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 47522013 - 47522172
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||  ||||||||    
T  47522013 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaataggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagtcatccgccatccgccatg 47522112  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcga 178  Q
    ||| || |||||||||||||||||   || ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  47522113 tctgctttcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaaacgtgtaagtgcggaagtcga 47522172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 365
Target Start/End: Original strand, 11632680 - 11632884
Alignment:
Q  161 tgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactg 260  Q
    ||||||||| |||||| |||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||    
T  11632680 tgtgagtgcggaagtcaacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctctacaacatccgtcggatgtctagggacggtcttgacgtatacgtactg 11632779  T
Q  261 cctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctg 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  11632780 cctcaaaaccctctcgggaaagtgatggtagaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatctccctg 11632879  T
Q  361 tgctc 365  Q
    |||||    
T  11632880 tgctc 11632884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 344
Target Start/End: Original strand, 9491989 - 9492221
Alignment:
Q  112 cgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggt 211  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || |||||  || |    
T  9491989 cgccatgtctcctctcctacatgctcaccccaattggtcgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagccggtgacagct 9492088  T
Q  212 ccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacat 311  Q
    |   |||||| | ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | || |||||    
T  9492089 ctacaacatccgacggatgtctagggatggtctgggtgtatccgtactgccttaaaaccctctcgggaaagtgacggtacactctacgatcaccacacat 9492188  T
Q  312 aatccatccagaataccagaaaacctcctcgaa 344  Q
    |||| | || |||| | |||| |||| ||||||    
T  9492189 aatcaaacctgaatgctagaataccttctcgaa 9492221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 11630317 - 11630387
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtacca 89  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11630317 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtacca 11630387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 36980373 - 36980256
Alignment:
Q  227 gatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 326  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||    
T  36980373 gatgtctagggacagtctggacgtatccgtactgcctcaaaatcctctcgggaaagtgacggtacaccctacgatcaccacacataattcagcctgaata 36980274  T
Q  327 ccagaaaacctcctcgaa 344  Q
    |  ||| |||||||||||    
T  36980273 caggaatacctcctcgaa 36980256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16488394 - 16488281
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctga-gggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccat 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||     |||||||    
T  16488394 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcacaatctgaggggtgaaacaccttagtgtaccataacacatatccatcccttatccgccat 16488295  T
Q  118 gtctcctctcctgc 131  Q
    |||| |||||||||    
T  16488294 gtctgctctcctgc 16488281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 41734700 - 41734630
Alignment:
Q  112 cgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaa 182  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||   || || |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41734700 cgccatgtctgctctgctgcctgctcaccccaatcggcctccttaagcgtgtgagtgcggaagtctacgaa 41734630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 41734749 - 41734713
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtg 55  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  41734749 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtg 41734713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 6178840 - 6179189
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6178840 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 6178939  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6178940 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 6179039  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6179040 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 6179139  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6179140 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 6179189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 41796075 - 41796424
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  41796075 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaagacatagccatcccccgcccgccatg 41796174  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796175 tctcctctcctacctgctcaccccaggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 41796274  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796275 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtattgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacagtacaccctacggacgccgcacataatccat 41796374  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41796375 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 41796424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 49168532 - 49168183
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49168532 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatg 49168433  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49168432 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 49168333  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168332 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 49168233  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49168232 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 49168183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31424761 - 31424412
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31424761 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtgccacaggacatagccatccgccacccgccatg 31424662  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31424661 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccttaac 31424562  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424561 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 31424462  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31424461 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctgaatctctctgtgctcctc 31424412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 1306170 - 1306521
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgc--ca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  1306170 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgcgcca 1306269  T
Q  117 tgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtcccta 216  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1306270 tgtatcctctcctacctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtcccta 1306369  T
Q  217 acatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatcc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306370 acatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatcc 1306469  T
Q  317 atccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1306470 atccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 1306521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 49093443 - 49093093
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgcc-at 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  49093443 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgcccat 49093344  T
Q  118 gtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaa 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49093343 gtatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcatgtgagtgcggaagtcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaa 49093244  T
Q  218 catcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatcca 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49093243 catcagtcggatgtctagggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatcca 49093144  T
Q  318 tccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49093143 tccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 49093093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 21018628 - 21018977
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21018628 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatcttagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgccatccgccatg 21018727  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21018728 tctcctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacacctgcataatgaaaggcggtgggaggtccctaac 21018827  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  21018828 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccttctcgggaaagtgacggtacacgctacagacaccgcacataatccag 21018927  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21018928 ccagaataccagaaaacctcctctaagtcctggatctctctatgctcctc 21018977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 40355453 - 40355802
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  40355453 tcatttgcaggtctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggttagacaccctagtgtaccatatgacattgccattcgccacccgccatg 40355552  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40355553 tatcctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacacctgcacaatggaagacggtgggaggtccctaac 40355652  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||     
T  40355653 agcagtcggatgtctagggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacactacacataatccac 40355752  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40355753 ccagaataccataaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 40355802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 97 - 368
Target Start/End: Original strand, 30723877 - 30724148
Alignment:
Q  97 tagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatgg 196  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  30723877 tagccatccgccacccgccatgtatcctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaattg 30723976  T
Q  197 aaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccct 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30723977 aaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccct 30724076  T
Q  297 acggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30724077 acggacaccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 30724148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 44677020 - 44677366
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||    ||||||    
T  44677020 tcatttacaggcctcgaaaaatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacacagccatccgccatgtgccatg 44677119  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    |||  |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    |||    
T  44677120 tctgttctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtgggaggtttacaac 44677219  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  44677220 atcagtcagatgcctggggatggtctggatgtatccgtactgcctcaaaaccctcttgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccag 44677319  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  44677320 ccagaataccaaaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctc 44677366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 50278175 - 50277829
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||| |  |||||||||||||||  ||||||||    
T  50278175 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtgacaaaatatgagggtgagacaccctagtgtgccataacacatagccatccgccatccgccatg 50278076  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||||||| |  ||   |||    
T  50278075 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcggctgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatatgaggcggtggcaactctacaac 50277976  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||     
T  50277975 atccgtcggatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacaaacaccgcacataatccag 50277876  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  50277875 ccagaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatctctctgtgctc 50277829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 37016633 - 37016967
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  37016633 tcatttgcaggcctcggaagatctactgaaagaggtggcaagatcttagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgccatccgccatg 37016732  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    |||            |||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||   |||    
T  37016733 tct------------gctcaccccaatcgtccgccttaagtgtgtgagtgcggaagtcaacgaacgtctgcacaatgtaaggcgatgggaggtctacaac 37016820  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  37016821 atccgtcagatgtctggggatggtcttgacgtatccgtattgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccacacataatccaa 37016920  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||    
T  37016921 ccagaataccagaaaacctcctcaaagttctggatctccctatgctc 37016967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8110172 - 8109835
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |  |||||    
T  8110172 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagatgtggaaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatcaaccatg 8110073  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||   || | ||||||||||| |||||||  |||||||||||   |||||||||   || |||||| || ||   |||    
T  8110072 tctgctctcttgcctgctcaccccaatcggctgccttaagcgtatgagtgcgaaagtcgacgaatgcctgcacaatctgagacggtggcagctctacaac 8109973  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  8109972 attcgtcggatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccacacataatccag 8109873  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctc 356  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8109872 cctgaataccagaaaacctcctcaaaatcttggatctc 8109835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 10730030 - 10730376
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   || ||||    
T  10730030 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgtcatg 10730129  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||   || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||| | || ||   |||    
T  10730130 tctgctctcgtgcctgctcaccccaatcggcctccttcagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctgaggcggtagcagctcaacaac 10730229  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||     
T  10730230 atccgtcggatttctagggatggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcaggcaagtgacggtacactctacgaacaccgcacaaaatccag 10730329  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||    
T  10730330 cctaaataccagaaaacctcctcaaaaccttggatctccttgtgctc 10730376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 10943799 - 10944145
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   || ||||    
T  10943799 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgtcatg 10943898  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||   || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||| | || ||   |||    
T  10943899 tctgctctcgtgcctgctcaccccaatcggcctccttcagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctgaggcggtagcagctcaacaac 10943998  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||     
T  10943999 atccgtcggatttctagggatggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcaggcaagtgacggtacactctacgaacaccgcacaaaatccag 10944098  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||    
T  10944099 cctaaataccagaaaacctcctcaaaaccttggatctccttgtgctc 10944145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 71 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 51686104 - 51685810
Alignment:
Q  71 gagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgcc 170  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||||||| | |  |||||||||||  |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||     
T  51686104 gagacaccctagtgtaccataacacatagccatctgtcatccgccatgtctgttctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgca 51686005  T
Q  171 gaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaacc 270  Q
    ||||| ||||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  51686004 gaagttgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctctacaacatccgtcggatgtctagggacggtctggacgtatctgtactgcctcaaaacc 51685905  T
Q  271 ctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  51685904 ctctcgggcaagtgacggtagaccctacgaacaccgcatataatccagcctgaataccagaaaacctcctcaaaatcttagatctctctgtgctc 51685810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 50904377 - 50904047
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||||       |||    
T  50904377 tcatttgctggcctgggaagatcttctgaaagaggtgacaaaatctgagggtgagataccctagtgtaccatagcacatagccgtccgcc-------atg 50904285  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |   || || |||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||   ||||||||| || ||   |||    
T  50904284 tctgctctcctacctgctcacctcaatcggccaccttaagcgtgtgagtgcggaaatcgacgaacgcctgcacaatatgaggcggtggaagctctacaac 50904185  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||     
T  50904184 atccgtcggatgcctggggacggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcggacaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacatgatccaa 50904085  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctc 356  Q
    || ||| |||| ||| ||||||| || || ||||||||    
T  50904084 cctgaaaaccaaaaaccctcctcaaaatcctggatctc 50904047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 71958 - 71633
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| | ||| ||| |||||||||||||||||    | ||||||  | |||||||||||||||   |||||||    
T  71958 tcatttggaggcctcagaatatctcctagaagaagtgacaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatccgccatacgccatg 71859  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || || ||  || ||   |||    
T  71858 tctgctctcctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctgagccgatgacagctctacaac 71759  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||     
T  71758 atccgacagatgtctagggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcggccaagtgacggaacaccctacgatcaccgcacataatccag 71659  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaa 344  Q
    || |||||||| || |||||||||||    
T  71658 cctgaataccataatacctcctcgaa 71633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Original strand, 50020734 - 50021065
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||||  | ||||||    
T  50020734 tcatttgctggcctcggaagatctcttggaagaggtggcaaaatttgagggtgagacaccctagtgtaccataacatatagccatccgccatcagccatg 50020833  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    |||            |||||||||   || || |||| ||| |||||||||   ||| ||||||   |||||||||   || |||||| || ||   |||    
T  50020834 tct------------gctcaccccaatcggcctccttgagcatgtgagtgcgagagttgacgaatgcctgcacaatctgagtcggtggtagctctacaac 50020921  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  50020922 atccgtcggatgtctggggacggtatggacgtacccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccaa 50021021  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtg 362  Q
    || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  50021022 cctgaataccagaaaacctcctcaaaatcatgtatctccctgtg 50021065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 13624569 - 13624894
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||      ||||||    ||||||||||| |||   |||||||    
T  13624569 tcatttggaggcatcagaatatctcctggaagatgtggaaaaatctgagggtgagacacaacgatgtaccatcatacatagccatctgccatacgccatg 13624668  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || |||||  || ||   |||    
T  13624669 tctgctctcttgcatgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagccggtgacagatctacaac 13624768  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||     
T  13624769 atccgacggatgtctagggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctcttgggcaagtgacggtacgccctacgatcaccgcacataatccaa 13624868  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaa 344  Q
    || ||||||||||| || ||||||||    
T  13624869 cctgaataccagaatacttcctcgaa 13624894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 223 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 50196218 - 50196076
Alignment:
Q  223 gtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccag 322  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |    
T  50196218 gtcgaatgtctggggacggcctgaacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccaacctg 50196119  T
Q  323 aataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||    
T  50196118 aataccagaaaacctcctcaaaattctggatctccctgtgctc 50196076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 115 - 341
Target Start/End: Original strand, 41931108 - 41931334
Alignment:
Q  115 catgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccc 214  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||   || || |||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||||||| || ||      
T  41931108 catgtctgctctgctgcctgctcaccccaatcggcctccttaatcatgtgagtgcggaagtcgacgaaagtctgcacaatctgaggcggtggcagctcaa 41931207  T
Q  215 taacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataat 314  Q
     |||||||||||||||||| ||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  | ||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  41931208 caacatcagtcggatgtctagggactgtttggacgtatccgtgctgcctcaaaaccctcttgggtagataacggtacactctacgaacaccgcacataat 41931307  T
Q  315 ccatccagaataccagaaaacctcctc 341  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||    
T  41931308 ccatccttaataccagaaaacctcctc 41931334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14317618 - 14317308
Alignment:
Q  31 ctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctg 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   |||||||| | |||||| |    
T  14317618 ctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatatgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgccatgtttgctctcccg 14317519  T
Q  131 cctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatg 230  Q
    || |||||||||   |   | |||||||||||||||||| |||||| |  ||    ||||||||   |||  |||| || ||   |||||| ||||||||    
T  14317518 ccggctcaccccattcaggctccttaagcgtgtgagtgcggaagtcaagaaatgcttgcacaatctgaggtagtggcagctctacaacatccgtcggatg 14317419  T
Q  231 tctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccag 330  Q
     || ||||  || || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  14317418 actagggacagtttggacgtatctgtaccgcctcaaaaccctctcgggcaagtgatggtataccctacgaacaccgcacataatccagcctgaataccag 14317319  T
Q  331 aaaacctcctc 341  Q
    |||||||||||    
T  14317318 aaaacctcctc 14317308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 46438954 - 46438767
Alignment:
Q  154 ttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatc 253  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||||||  || ||   |||||| ||||||||||| ||||   |||| |||||||    
T  46438954 ttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgtctgcacaatctgaggcggtgtcagctctacaacatccgtcggatgtctagggaccctctggacgtatc 46438855  T
Q  254 cgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctc 341  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||| |||| | ||||||    
T  46438854 tgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtaacggtacaccctacgaacaccgcaaataatccagcctgaatactagaatatctcctc 46438767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30706925 - 30706657
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || |  ||| | |  |||  |   |||||||    
T  30706925 tcatttgttggcctccgaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtatcataacacacaacattccctcatacgccatg 30706826  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||   || || |||||| ||||||||||| |||||| |||||   |||||||||   ||||||||  || ||   |||    
T  30706825 tctgctctgctgccagctcaccccaatcggcctccttaaacgtgtgagtgcagaagtctacgaatgcctgcacaatctgaggcggtgtcagctctacaac 30706726  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacg 287  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30706725 atccgtcggatgtctagggatcgtctagacgtattcgtactgcctcaacaccctctcaggcaagtgacg 30706657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 30723777 - 30723847
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtacca 89  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30723777 tcatttacaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtacca 30723847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 50196351 - 50196224
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccct----agcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgc 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||| |  |||||||||||| ||  | ||    
T  50196351 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgagtgtaccataacacatagccatccaccatcagc 50196252  T
Q  115 catgtctcctctcctgcctgctcacccc 142  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  50196251 catgtctgctctcctacctgcacacccc 50196224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 126
Target Start/End: Original strand, 55278820 - 55278927
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||| ||  ||||||||    
T  55278820 tcattagctggcctcggaagatatcctggaagaagtggcaaaatcagagggtgagtcaccctagtgtaccatagtacatagccatcctccatccgccatg 55278919  T
Q  119 tctcctct 126  Q
    ||||||||    
T  55278920 tctcctct 55278927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 46439038 - 46438956
Alignment:
Q  22 tttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatc 104  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||    
T  46439038 tttgctggcctcggaagatctcatggaagaggtggcaaaatttgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccatc 46438956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 297
Target Start/End: Original strand, 21535449 - 21535530
Alignment:
Q  216 aacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacacccta 297  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21535449 aacatccgtcggatgtctagggacggtctcgacatatccgtacagccgcaaaactctctcaggcaagtgacgatacacccta 21535530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12891924 - 12891833
Alignment:
Q  28 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgt 119  Q
    ||||||| ||||||||| | || | ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||||| ||  |||||||||    
T  12891924 ggcctcgaaagatctcccgaaagaagtggcaaaatctgagggtgatacaccctagtgtaccaccgtatatagccatcctccatccgccatgt 12891833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 365
Target Start/End: Original strand, 40886693 - 40887012
Alignment:
Q  46 ggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccggg 145  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  | ||| |||||  ||  | |||||||| |||||| |||| |||||||||       
T  40886693 ggaataagtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacatataaccatcatccatctgccatgtcacctctcatgccggctcaccccaat 40886792  T
Q  146 cgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctg 245  Q
    ||  | |||||| ||||||||| | ||| || |||||   |||||||||   || || | | |  ||   ||||||  || ||||||| |||| | ||||    
T  40886793 cgggctccttaatcgtgtgagtacggaaatcaacgaaagcctgcacaatctgagtcgctcgcaactcaacaacatccatcagatgtctagggacgttctg 40886892  T
Q  246 cacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaag 345  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||| |||||  | |||||||| |||||  |    || |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| ||     
T  40886893 cacgtatccttactgccgcctaactctctcaagaaagtgacgatacacgttgtcaacaccgcacataatccagcctgaataccataaaatctcctcaaaa 40886992  T
Q  346 tcttggatctctctgtgctc 365  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  40886993 tcttggatctctctatgctc 40887012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 3729379 - 3729729
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3729379 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgtcacccgccatg 3729478  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaagg-cggtgggaggtccctaa 217  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3729479 tatcctctcctgcctactcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcaacgaacatctgcacaatggaagggcggggggaggtccctaa 3729578  T
Q  218 catcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatcca 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3729579 catcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatcca 3729678  T
Q  318 tccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3729679 tccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 3729729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 13637036 - 13637385
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  13637036 tcatttgcaggcctcagaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatg 13637135  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13637136 tatcctctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggagctccctaac 13637235  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13637236 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgatggtacaccctacggacgccgcacataatccat 13637335  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13637336 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 13637385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26878730 - 26878388
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||       |||    
T  26878730 tcatttgcaggcctcagaagatctactggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccccagtgtaccacaggacatagccattcgcc-------atg 26878638  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26878637 tatcctctcctgcttgctcaccccgagcttccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaac 26878538  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26878537 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgtctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 26878438  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26878437 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcatggatctctctgtgctcctc 26878388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19159041 - 19158692
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19159041 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccgtccgccatg 19158942  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||| ||   |||    
T  19158941 tctcctctcctgcctgctgaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaagggagtgggagctctacaac 19158842  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  19158841 atccgtgggatgtttggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggaaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccac 19158742  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19158741 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 19158692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 95132 - 95474
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||       ||||    
T  95132 tcatttgcaggcctcagaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtactataggacatagccatccgc-------catg 95224  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| |||||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  95225 tctactctcctgtctgctcaccccaatcatccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtgggaggtctacaac 95324  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  95325 atcagtcggatgtctggggatggtctggaaatatccgtactgcctcaaaaccctatcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccacacataatccag 95424  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  95425 ccagaataccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctcctc 95474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Original strand, 31780697 - 31781039
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||       ||||    
T  31780697 tcatttgcaggcctcggaagatctgctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgc-------catg 31780789  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  31780790 tctgctctcctgcctactcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgtctgcacaatgtaaggcggtgggaggtctacaac 31780889  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  31780890 atcagtcggatgtttggggatggtctggacgtatccgtactgcctcataaccctctcgggcaagtgatggtacaccctacagacaccgcacataatccaa 31780989  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  31780990 ccagaataccagaaaatcccctcaaagtcctggatctccctgtgctcctc 31781039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22527016 - 22526674
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||       |||    
T  22527016 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgcc-------atg 22526924  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    | | ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| || ||   |||    
T  22526923 tttgctctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagggcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtgaggcggtggcagctctacaac 22526824  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  22526823 atcggtcggatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccag 22526724  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 368  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  ||||||||||    
T  22526723 ccagagtactagaaaacctcctcaaagtcctagatctccatgtgctcctc 22526674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 52804888 - 52804554
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |  || |||||    
T  52804888 tcatttgctggcctcggaatatctactggaagagctggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgtcatcctccatg 52804789  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   |  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| || ||   |||    
T  52804788 tctgctctcctgcctgctcaccccaatcagccgccttaagtgtgtgagtgtggaagtcgacgaacgtctgcacaatgtgaggcagtggcagctctacaac 52804689  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  52804688 atccgtcggatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacacctcacataatccaa 52804589  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatc 354  Q
     || ||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  52804588 gcataataccagaaaaccttctc-aaatcttggatc 52804554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 365
Target Start/End: Original strand, 19522316 - 19522653
Alignment:
Q  21 atttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtc 120  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||       |||||    
T  19522316 atttgctggcctcgaaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atgtc 19522408  T
Q  121 tcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacat 220  Q
    | ||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||| || ||   |||||    
T  19522409 tgctctcctgcctgctcaccccaatcggctgccttaagcgtgtgagggcggaagttgacgaacgcctgcacaatgtgaggcggtggcagctctacaacat 19522508  T
Q  221 cagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatcc 320  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  19522509 ccgtcgaatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacgatacaccctacgaacaccgcacataatccagcc 19522608  T
Q  321 agaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    ||||||||||||||||||||| |  || || ||||||||||||||    
T  19522609 agaataccagaaaacctcctcaatatcctgtatctctctgtgctc 19522653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47505350 - 47505016
Alignment:
Q  30 cctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcct 129  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  47505350 cctcgaaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatctgccatccgccatgtctgctctcct 47505251  T
Q  130 gcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggat 229  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||   ||||||||   | ||   |||||| |||||||    
T  47505250 gcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagcgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtgatcgctctacaacatccgtcggat 47505151  T
Q  230 gtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatacca 329  Q
    |||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| || || |||||    
T  47505150 gtctggggacagtctggacgtatttgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccc-acgaacaccgcacataatccagcctgattacca 47505052  T
Q  330 gaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  47505051 gaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 47505016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11196883 - 11196537
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   || ||||    
T  11196883 tcatttgctggcctcggaagatctcctgaaagaggtggcaaaatacgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgacatg 11196784  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| |||| ||||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||  || ||   |||    
T  11196783 tctgctctgctgcctgctcaccctaatcggccgccttaagcatgtgagtgcggaaatcgacgaatgtctgcacaatctaaggcggtgtcagctctacaac 11196684  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||  ||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||     
T  11196683 attcgtcggatgtctagggatcatctggacgtatccgtactgcctcaacaccctctcagacaagtgacggtacaccctacgaataccgcacataatccag 11196584  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || ||||| ||| |||||||    
T  11196583 cctgaataccaaaaaacctcctcaaaatcctggatttctttgtgctc 11196537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47660893 - 47660547
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| ||||||||  ||||||||    
T  47660893 tcatttgctggcctcagaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagtcatccgccatccgccatg 47660794  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||| || | |||||||||   || || |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||| ||||  || ||   |||    
T  47660793 tctgctctcgtgtcggctcaccccaatcggccaccttaagcgtgtgagtgcagaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggtggtgtcagctctacaac 47660694  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||  ||| ||||||| ||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||     
T  47660693 attcgtccgatgtctagggaccctctggacgtatccgtacttcctcaaaaccctctcgggtaagtgacggtacaccctacaaacaccgcagataatccag 47660594  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||| ||||||||    
T  47660593 cctgaataccagaatatctcctcaaaaccctggatctccctgtgctc 47660547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 45828596 - 45828251
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| || || ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||||| ||   |||||||    
T  45828596 tcatttgctggcctcataagatctcatgaaagaggtggcaaaatctgagggtgaaacaccttagtgtaccataacacatagccatcctccattcgccatg 45828497  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   |||| |||| || ||   |||    
T  45828496 tctgctcttgtgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatg-ctgcacaatctgaggcagtggcagctctacaac 45828398  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| || |||||||| |||| | | || ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||     
T  45828397 atctgtaggatgtctagggacgctatgaacgtatttgtactacctcaaaaccctcttgggcaagtgacggtataccctatgaacaccgcacataatccag 45828298  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  45828297 cctgaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 45828251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 247 - 365
Target Start/End: Original strand, 50341407 - 50341525
Alignment:
Q  247 acgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |    
T  50341407 acgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaataccagaaaacctcctctaaat 50341506  T
Q  347 cttggatctctctgtgctc 365  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  50341507 cctggatctccctgtgctc 50341525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 49855053 - 49855377
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| | || | ||||||| |||||||||||||||||    | ||||||  | ||||||||||| |||   |||||||    
T  49855053 tcatttggaggccttggaatatctcccgaaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatctgccatacgccatg 49855152  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||   || |||||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||   || |||||  || ||   |||    
T  49855153 tctgctctcctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagtgtgtgagtgcgcaagtcgacgaaagtctgcacaatttgagccggtgacagctctacaac 49855252  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| | | ||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||     
T  49855253 atccgacagatgtctagggacggtctggacgtatctgtagtgcctcaaa-ccctctcgggcaagtcacggtacaccctacgatcaccgcacataatccaa 49855351  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaa 344  Q
    |  ||||||||||| ||| |||||||    
T  49855352 cttgaataccagaataccccctcgaa 49855377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 142
Target Start/End: Original strand, 50617929 - 50618052
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||| |||| |||  ||||||||    
T  50617929 tcatttgctggcctcggaagatctcctggaagaggttgcaagatctgagggtgagacaccctggtgtaccatagcacatagtcatctgccatccgccatg 50618028  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcacccc 142  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  50618029 tctgctctcctgcctgctcacccc 50618052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21143950 - 21143770
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||       |||| ||    
T  21143950 tcatttgctggcctcggaagaactcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacacccaagtgtaccatagcacatagccatc-------cgccttg 21143858  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgg 206  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||   || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  21143857 tctgctcttctgcttgctcaccccaatcggccaccttaagtgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtgaggcggtgg 21143770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21143763 - 21143682
Alignment:
Q  256 tactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21143763 tactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagccagaataccagaaaacct 21143682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 299
Target Start/End: Original strand, 38120195 - 38120475
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||| || |  ||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   |||||||    
T  38120195 tcatttgctggcatcggaagatctcctagaagaggtggaaaaatctgaggatgggttaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgccatg 38120294  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| |||| || ||||||||||||   || | |||| |||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||   |||| |||  || ||   |||    
T  38120295 tctgctctgctacctgctcaccccaatcggcggcctgaagcgtgtgagtgtggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcagtgtcagctctacaac 38120394  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacg 299  Q
    ||| ||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38120395 atccgtcagatgtttagggatcgtctggacgtatccgtactgcctcaacaccctctcaggcaagtgacggtacaccctacg 38120475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 242 - 344
Target Start/End: Original strand, 35256520 - 35256622
Alignment:
Q  242 tctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctc 341  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  35256520 tctgaacgtatccgtactgtctcaaaactctctcaggcaagtgacggtacaccctacgatcaccgcacataatccagcctgaataccagaatacctcctc 35256619  T
Q  342 gaa 344  Q
    |||    
T  35256620 gaa 35256622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 365
Target Start/End: Original strand, 23273541 - 23273632
Alignment:
Q  274 tcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  23273541 tcgggcaagtgacggtagaccctacgaacaccgcatataatccagccggaataccaaaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 23273632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Original strand, 16269827 - 16269984
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| | ||| |||||| |  ||||||| ||||  |  ||||||||    
T  16269827 tcatttgctggcctcacaagatctcctggaagaggtggcacaatctaagggtgagacatcgtagtgtaccataacacatagcgatccctcatccgccatg 16269926  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtc 176  Q
    ||| |||||||||| |||||||||    |  | |||||||||||||||||| ||||||    
T  16269927 tctgctctcctgccggctcaccccaattgggctccttaagcgtgtgagtgcggaagtc 16269984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 117
Target Start/End: Original strand, 23273427 - 23273506
Alignment:
Q  38 gatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccat 117  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |||||||    
T  23273427 gatctcctagaagagatggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatccgccat 23273506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Original strand, 35256442 - 35256482
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaa 59  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35256442 tcatttggaggcctcggaatatctcctggaataagtggcaa 35256482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12371 - 12025
Alignment:
Q  19 tcatttgcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatg 118  Q
    |||||||  |||||||||| || |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  | | ||||||    |||||||||||||||   |||||||    
T  12371 tcatttggtggcctcggaatatttcctggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaatggtgtaccatcctacatagccatccgccatacgccatg 12272  T
Q  119 tctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaac 218  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||   ||||||||  || ||   |||    
T  12271 tctgctctcctgcatgctcaccccaatcgacctccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagactacacaatctgaggcggtgacagctctacaac 12172  T
Q  219 atcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccat 318  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||     
T  12171 atccgacggatgtctagggatggtcaggacgtattcgtactgcctcaaaaccctctcgagcaaatgacggtacaccctacgatcaccgcacataatccag 12072  T
Q  319 ccagaataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctc 365  Q
    || ||||||||||| || ||||| ||  | |||||||| ||||||||    
T  12071 cctgaataccagaatacgtcctcaaaagcctggatctccctgtgctc 12025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 56579 - 56476
Alignment:
Q  39 atctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctca 138  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56579 atctcctggaagaggttgcaagatctgagggtgagacaccctggtgtaccatagcacatagtcatctgccatccgccatgtctgctctcctgcctgctca 56480  T
Q  139 cccc 142  Q
    ||||    
T  56479 cccc 56476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 104
Target Start/End: Original strand, 22343 - 22411
Alignment:
Q  36 aagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatc 104  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  22343 aagatctcctagaagaagtggcaaaatcagaggttgagacaccctagtgtaccatagtatatagccatc 22411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University