View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF8889_high_1 (Length: 1114)
Name: NF8889_high_1
Description: NF8889
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF8889_high_1 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 771; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 771; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 77 - 1099
Target Start/End: Original strand, 4840618 - 4841639
Alignment:
| Q |
77 |
aaattaaagctaaagataaaaattataatatccaaatatttgcgactccacatttcaacaggt---actatggacactcatcaataaaatggaaaatttg |
173 |
Q |
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| T |
4840618 |
aaattaaagctaaagataaaaattacaatatccaaatattttagactccacat----aaagtttaaactatggacactctttaatacaatggaaaagttg |
4840713 |
T |
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| Q |
174 |
gaaaaaatctacgcataaacttactgatgtaataaaaccaggccatacgccaacatgcattgatgcacaacactgttatgaaggccaacaatattgttat |
273 |
Q |
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| T |
4840714 |
gaaaaaatctacgcataaacttactgatgtaataaaaccaggccatacgccaacgtggattgatgcacaacactgttatgaaggctaacaatattgttat |
4840813 |
T |
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| Q |
274 |
gtaagatgctgtgaaactccaataaaatgttatcttatccacggaagattccttttctccattgtcattggattgtgatgatggtgaagactcgtcacgt |
373 |
Q |
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| T |
4840814 |
gtaagatgctgtgaaactccaataaaaagttatcatgtccaccatggtttccttttctccgtcgtcattggattgtgatgatgctgaagactcgacatgt |
4840913 |
T |
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| Q |
374 |
tcacacttccgattgaggagtggtccacaaagactgggattacctctgtagttttcctcatcaaaagttgcaaattgtcctgtactaggtggtgttccag |
473 |
Q |
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| T |
4840914 |
tcacactttcgattgaggaatggtccacaaagaccaggattacctatgtagttttcctcaacaaagcctccaaattgtcctgtactaggtggtgttccag |
4841013 |
T |
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| Q |
474 |
aaaggttgttgtatgacacattgaatgttgataaaaagttcaactggattagttcataaggtatcttaccactcaagttattgtatgataagtcaagact |
573 |
Q |
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| T |
4841014 |
agaggttgttgtatgacacattgaagatttctaaaaagttcaactgggttagttcatttggtatcttaccactcaagttattgtatgataagtcaagact |
4841113 |
T |
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| Q |
574 |
ctctatttgggtaagatttgaaaaagtaattggaataggaccagacaagtgattatgtgatagattcaaggctttaatttgttgtaggtctccaacgtga |
673 |
Q |
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| T |
4841114 |
ctctatttgggtaagatttgaaaaagtgattggaatgggacctgacaagtgattatgtgatagattcaaggctctaatttgttgtaggtctccaatttgg |
4841213 |
T |
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| Q |
674 |
gaagggatgacacctgttagcttattgcatgataaatccaatccagtcataatctctagaactttacccttgtaaaagtattcattgtgctttgttctaa |
773 |
Q |
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| T |
4841214 |
gaagggataacacctgttaaattattgcatgataaatccaatccagtcataatctctagaactttacccttgtaaaagtattcattgtgctttgttctaa |
4841313 |
T |
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| Q |
774 |
actccacttcaaattgtagatatttcaacgaatttccaatccatggatgtcgaatcaacaaactagcattgaaggaaatagctgtaggagctttgtacat |
873 |
Q |
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| T |
4841314 |
actccacttcaaattgtagatttttcaacgaatttccaatccatggatgtcgaatcaacaaactagcattgaaggaaatagctgttggagctttgtacat |
4841413 |
T |
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| Q |
874 |
tgagaattcaaaaatagaaccgtcatcatcatcattatgaacatgttgtctcattccaaatgacatattttggaagcaagatggtattgaagcattgagc |
973 |
Q |
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| T |
4841414 |
tgagaattcaaaaatagaaccgtcatcatcatcattatgaacatgttgtctcattccaaatgacatattttggaagcaagatggtattgaagcattgagc |
4841513 |
T |
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| Q |
974 |
atgtttcgtgataagtccattatggtgatattttttagatgacacaattgaattggaatttctccttcaaaattgttccctcctaatagaagaaccctta |
1073 |
Q |
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| T |
4841514 |
atgttccgtgataagtccattatggtgatattttttagatgacacaattgaattggaatttctccttcaaaattgttccctcctaatagaagaaccctta |
4841613 |
T |
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| Q |
1074 |
actctgagagcttatccatccaattg |
1099 |
Q |
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| T |
4841614 |
actctgagagcttatccatccaattg |
4841639 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 676; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 77 - 1095
Target Start/End: Complemental strand, 5174904 - 5173884
Alignment:
| Q |
77 |
aaattaaagctaaagataaaaattataatatccaaatatttgcgactccacatttcaacaggt---actatggacactcatcaataaaatggaaaatttg |
173 |
Q |
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| T |
5174904 |
aaattaaagctaaaggtaaaaattacaatatccaaatatttgagactccacat----aaagtttaaactatggacactcttcaatacaatggaaaagttg |
5174809 |
T |
|
| Q |
174 |
gaaaaaatctacgcataaacttactgatgtaataaaaccaggccatacgccaacatgcattgatgcacaacactgttatgaaggccaacaatattgttat |
273 |
Q |
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|
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| T |
5174808 |
gaaaaaatctacgcataaacttactgatataataaaaccaggccatacgccaacgtggattgatgcacaaaactgttatgagggccaacaatattgttat |
5174709 |
T |
|
| Q |
274 |
gtaagatgctgtgaaactccaataaaatgttatcttatccacggaagattccttttctccattgtcattggattgtgatgatggtgaagactcgtcacgt |
373 |
Q |
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| T |
5174708 |
gtaagatgctgtgaaactccaataaaaagttatcatgtccaccatggtttccttttctccgtcgtcattggattgtgatgatgctgaagactcgacatgt |
5174609 |
T |
|
| Q |
374 |
tcacacttccgattgaggagtggtccacaaagactgggattacctctgtagttttcctcatcaaaagttgcaaattgtcctgtactaggtggtgttccag |
473 |
Q |
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| T |
5174608 |
tcacactttcgattgacgaatggtccacaaagaccaggattacctatgtagttttcctcaacaaagcctccaaattgtcctgtactaggtggtgttccag |
5174509 |
T |
|
| Q |
474 |
aaaggttgttgtatgacacattgaatgttgataaaaagttcaactggattagttcataaggtatcttaccactcaagttattgtatgataagtcaagact |
573 |
Q |
| |
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| T |
5174508 |
aaaggttgttgtatgacacattgaaggttgacaaaaagtttagctgggttagttcattgggtatcttaccactcaagtcattgtatgataagtcaagact |
5174409 |
T |
|
| Q |
574 |
ctctatttgggtaagatttgaaaaagtaattggaataggaccagacaagtgattatgtgatagattcaaggctttaatttgttgtaggtctccaacgtga |
673 |
Q |
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| T |
5174408 |
ctctatttgggtaagatttgaaaaagtgattggaatgggaccagacaagtgattatgtgatagattcaaggctctaatttgttgtaggtctccaatttga |
5174309 |
T |
|
| Q |
674 |
gaagggatgacacctgttagcttattgcatgataaatccaatccagtcataatctctagaactttacccttgtaaaagtattcattgtgctttgttctaa |
773 |
Q |
| |
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| T |
5174308 |
gaagggatgacacctgttagcttattgcatgataaatccaatccagtcatattctctagaactatacccttgtaagagtattcattgtgctttgttctga |
5174209 |
T |
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| Q |
774 |
actccacttcaaattgtag---atatttcaacgaatttccaatccatggatgtcgaatcaacaaactagcattgaaggaaatagctgtaggagctttgta |
870 |
Q |
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| T |
5174208 |
actccacttcaaattgtagttcttctttcaacgaatttccaatccatggatgtcgaatcaacaaactagcattgaaggaaatatctgtaggagctccgta |
5174109 |
T |
|
| Q |
871 |
cattgagaattcaaaaatagaaccgtcatcatcatcattatgaacatgttgtctcattccaaatgacatattttggaagcaagatggtattgaagcattg |
970 |
Q |
| |
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| T |
5174108 |
cattgagaattcaaaaataggaccgtcatcatcatcattatgaacatattgtctcattccaaatgacatattttggaggcaagatggtattgaagcattg |
5174009 |
T |
|
| Q |
971 |
agcatgtttcgtgataagtccattatggtgatattttttagatgacacaattgaattggaatttctccttcaaaattgttccctcctaatagaagaaccc |
1070 |
Q |
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| T |
5174008 |
agcatgttccgtgatagatccattatgtcgatctttttgaaccaacaaaattgaattggaatttctccttcaaaattgttccctcctaataaaagaaccc |
5173909 |
T |
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| Q |
1071 |
ttaactctgagagcttatccatcca |
1095 |
Q |
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| T |
5173908 |
tcaactctgagagcttatccatcca |
5173884 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 64 - 1095
Target Start/End: Complemental strand, 5215810 - 5214782
Alignment:
| Q |
64 |
catcaaactgtc-gaaattaaagctaaagataaaaattataatatccaaatatttgcgactccacat-----ttcaacaggtactatggacactcatcaa |
157 |
Q |
| |
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| T |
5215810 |
catcaaactgtctgaaattaaaggtaaatataaaaattacaatatccaaatatttgagacttcacttgaagtttcaacaggaataacagacactcttcaa |
5215711 |
T |
|
| Q |
158 |
taaaatggaaaatttggaaaaaatctacgcataaacttactgatgtaataaaaccaggccatacgccaacatgcattgatgcacaacactgttatgaagg |
257 |
Q |
| |
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|
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| T |
5215710 |
tacaatggaaacgttggaaaaattttacgcataaacttactgatgtaataaaaccaggccatacgccaacgtggattgacgcacaacactgttatgaagg |
5215611 |
T |
|
| Q |
258 |
ccaacaatattgttatgtaagatgctgtgaaactccaataaaatgttatcttatccacggaagattccttttctccattgtcattggattgtgatgatgg |
357 |
Q |
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| T |
5215610 |
ccaatagtattgttatgtaagatgctgtgaaactccaataaaatgttatcatgtccaccatggtttccttttctccattgtcattggattgtgatgaagg |
5215511 |
T |
|
| Q |
358 |
tgaagactcgtcacgttcacacttccgattgaggagtggtccacaaagactgggattacctctgtagttttcctcatcaaaagttgcaaattgtcctgta |
457 |
Q |
| |
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| T |
5215510 |
tgaagactcgacacgttcacacttttgatagaggagtggtccacaaagaccgggattacctctgtaactgtcctcatcaaaacctccaaactgtcctgta |
5215411 |
T |
|
| Q |
458 |
ctaggtggtgttccagaaaggttgttgtatgacacattgaatgttgataaaaagttcaactggattagttcataaggtatcttaccactcaagttattgt |
557 |
Q |
| |
|
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| T |
5215410 |
ctaggtggtgttccagaaaagttgttgtatgatacattgaaggttgataaaaagttcaactgggttagttcatttggtatcttaccactcaagttattgt |
5215311 |
T |
|
| Q |
558 |
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657 |
Q |
| |
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|
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| T |
5215310 |
atgataagtcaaggctctctatttgggtaagatttgaaaaagtaattggaataggaccagacaagtgattatgtgataggttcaaggctctaacttgttg |
5215211 |
T |
|
| Q |
658 |
taggtctccaacgtgagaagggatgacacctgttagcttattgcatgataaatccaatccagtcataatctctagaactttacccttgtaaaagtattca |
757 |
Q |
| |
|
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| T |
5215210 |
aaggtgaccaatttgagaagggatgagacctgttaggttattccatgataaatccaatccagtcatattctctagaactttacccttgtaaaagtattca |
5215111 |
T |
|
| Q |
758 |
ttgtgctttgttctaaactccacttcaaattgtagatatt--tcaacgaatttccaatccatggatgtcgaatcaacaaactagcattgaaggaaatagc |
855 |
Q |
| |
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| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || | || || | |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
5215110 |
tagtgctttgttctgaactccacctcaaattgtagatcttcattaaacaa-----actccatggaggttgaatcgacaaactagcattgaaggaaatcgt |
5215016 |
T |
|
| Q |
856 |
tgtaggagctttgtacattgagaattcaaaaatagaaccgtcatcatcatcattatgaacatgttgtctcattccaaatgacatattttggaagcaagat |
955 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5215015 |
tggaagatatccggatattgagaattcaaaagtaggaccgtcatcatcatc------aacgtattgcctcattccaaatgacatatttcggaagcaagat |
5214922 |
T |
|
| Q |
956 |
ggtattgaagcattgagcatgtttcgtgataagtccattatggtgatattttttagatgacacaattgaattggaatttctccttcaaaattgttccctc |
1055 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5214921 |
ggtattgaagcattgagcatgttccgtgataggtccattatgtctatcttttttaaccgacacaattgaattggaatatctccttccaatttgttccctc |
5214822 |
T |
|
| Q |
1056 |
ctaatagaagaacccttaactctgagagcttatccatcca |
1095 |
Q |
| |
|
||| || |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5214821 |
ctagtaaaagaacacgtaactctgatagcttatccatcca |
5214782 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 64 - 1095
Target Start/End: Original strand, 4855106 - 4856132
Alignment:
| Q |
64 |
catcaaactgtc-gaaattaaagctaaagataaaaattataatatccaaatatttgcgactccacat-----ttcaacaggtactatggacactcatcaa |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| | || |
|
|
| T |
4855106 |
catcaaactgtctgaaattaaagttaaatataaaaattacaatacccaaatatttgagactccacataaagtttcaacaggtactacggacactctttaa |
4855205 |
T |
|
| Q |
158 |
taaaatggaaaatttggaaaaaatctacgcataaacttactgatgtaataaaaccaggccatacgccaacatgcattgatgcacaacactgttatgaagg |
257 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4855206 |
tacaatggaaaagttggaaaaaagatacctacaaacttactaatgtaataaaaccaggccaaacgccaacgtggattgatgca--acactgttatgaagg |
4855303 |
T |
|
| Q |
258 |
ccaacaatattgttatgtaagatgctgtgaaactccaataaaatgttatcttatccacggaagattccttttctccattgtcattggattgtgatgatgg |
357 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4855304 |
tcagtagtattgttatgtaagatggtgtgaaactccaataaaatgttatcatgtccacatttgtttcctcttcttcattgtcattggattgtgatgatgg |
4855403 |
T |
|
| Q |
358 |
tgaagactcgtcacgttcacacttccgattgaggagtggtccacaaagactgggattacctctgtagttttcctcatcaaaagttgcaaattgtcctgta |
457 |
Q |
| |
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|
| T |
4855404 |
tgaagacttggcaccttcacactttcggtcgaggagtggtccacaaagatcgggattacctctgtagctgtcctcaatgaaggttgcaaactgtcctgta |
4855503 |
T |
|
| Q |
458 |
ctaggtggtgttccagaaaggttgttgtatgacacattgaatgttgataaaaagttcaactggattagttcataaggtatcttaccactcaagttattgt |
557 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
4855504 |
ctaggtggtgttccagaaaggttgttgtatgacacattgaatatttctaaagaggtcaacttggttagttcataaggtatcttaccactcaagttattgt |
4855603 |
T |
|
| Q |
558 |
atgataagtcaagactctctatttgggtaagatttgaaaaagtaattggaataggaccagacaagtgattatgtgatagattcaaggctttaatttgttg |
657 |
Q |
| |
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| T |
4855604 |
atgataagtcaaggctttctatttgggtaagatttgaaaaagtaattggaataggaccagacaagtgattatgtgataggttcaaggctctaactggttg |
4855703 |
T |
|
| Q |
658 |
taggtctccaacgtgagaagggatgacacctgttagcttattgcatgataaatccaatccagtcataatctctagaactttacccttgtaaaagtattca |
757 |
Q |
| |
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| T |
4855704 |
aaggtgaccaatttgagaagggatgacacctgttaggttattccatgataaatccaatccagtcatattctctagaactttacccttgtaaaagtattca |
4855803 |
T |
|
| Q |
758 |
ttgtgctttgttctaaactccacttcaaattgtagatatt--tcaacgaatttccaatccatggatgtcgaatcaacaaactagcattgaaggaaatagc |
855 |
Q |
| |
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| T |
4855804 |
tagtgctttgttctgaactccacttcaaattgtagatcttcattaaacaa-----actccatggaggttgaatcgacaaactagcattgaaggaaattgt |
4855898 |
T |
|
| Q |
856 |
tgtaggagctttgtacattgagaattcaaaaatagaaccgtcatcatcatcattatgaacatgttgtctcattccaaatgacatattttggaagcaagat |
955 |
Q |
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| T |
4855899 |
tggtagatatccggatattgagaattcaaaagtaggaccgtcatcatcatc------aacgtattgtctcattccaaatgacatatttcggaagcaagat |
4855992 |
T |
|
| Q |
956 |
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1055 |
Q |
| |
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| T |
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ggtattgaagcattgagcatgttccgtgataggtccattatgtcgatcttttttaaccgacacaattgaattggaatatctccttccaagttgttccctc |
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T |
|
| Q |
1056 |
ctaatagaagaacccttaactctgagagcttatccatcca |
1095 |
Q |
| |
|
||| || |||||| | ||||||||| || ||||||||||| |
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|
| T |
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ctagtaaaagaacacgtaactctgataggttatccatcca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 5197668 - 5196931
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Q |
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|
| T |
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gaacatcaaattgtctgaaattaaaggtaaatataaaaattacaatatgcaaatatttgagactccacataatgtttcaacaggaactatggccactctt |
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T |
|
| Q |
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caataaaatggaaaatttggaaaaaatctacgcataaacttactgatgtaataaaaccaggccatacgccaacatgcattgatgcacaacactgttatga |
254 |
Q |
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| T |
5197568 |
caatacaatggaaaagttggaaagaatctacgcataaacttactgatgtaataaaaccaggccatgcgccaacgtggattgatgcacaacactgttatga |
5197469 |
T |
|
| Q |
255 |
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354 |
Q |
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| T |
5197468 |
aggccaatagtattgttatgtaagatgctgtgaaactccaataaaatgttatcatgtccacaccagtttcctcttcttcattgtcattggattgggatga |
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T |
|
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355 |
tggtgaagactcgtcacgttcacacttccgattgaggagtggtccacaaagactgggattacctctgtagttttcctcatcaaaagttgcaaattgtcct |
454 |
Q |
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| T |
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T |
|
| Q |
455 |
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554 |
Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
555 |
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654 |
Q |
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| T |
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tgtatgataagtcaagactctctatttgggtaagatttgaaaaagtgattggaatgggacctgacaagtgattatgtgatagattcaaggctctaatttg |
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T |
|
| Q |
655 |
ttgtaggtctccaacgtgagaagggatgacacctgttagcttattgcatgataaatccaatccagtcataatctctagaactttacccttgtaaaagtat |
754 |
Q |
| |
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| T |
5197068 |
ttgtaggtctccaatttgagaagggatgacacctgttagcttattgcatgataaatccaatccagtcatattctctagaactttacccttgtaaaagtat |
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T |
|
| Q |
755 |
tcattgtgctttgttctaaactccacttcaaattgtag |
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Q |
| |
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|||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||| |
|
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 439; E-Value: 0
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Target Start/End: Complemental strand, 5184324 - 5183530
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Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
105 |
tatccaaatatttgcgactccacat-----ttcaacaggtactatggacactcatcaataaaatggaaaatttggaaaaaatctacgcataaacttactg |
199 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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tatccaaatattttagactccacataaagtttcaacaggaactatggacactcatcaatataatggaaaagatggaaagaatctacgcataaacttactg |
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T |
|
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299 |
Q |
| |
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| T |
5184124 |
atgtaataaaaccaggccatacgccaacgtggattgatgcccaacacagttatgaaggccaatagtattgtaatataagatgttatgaaactccaataaa |
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T |
|
| Q |
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atgttatcttatccacggaagattccttttctccattgtcattggattgtgatgatggtgaagactcgtcacgttcacacttccgattgaggagtggtcc |
399 |
Q |
| |
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| T |
5184024 |
atgttatcatgtccaccatggtttgcttttctccattgtcattggattgtgatgaaggtgaagactcgacacgttcacacttttgatttaggagttgtcc |
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T |
|
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400 |
acaaagactgggattacctctgtagttttcctcatcaaaagttgcaaattgtcctgtactaggtggtgttccagaaaggttgttgtatgacacattgaat |
499 |
Q |
| |
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|
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| T |
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gcaaagaccgggattacctctgtagttgtactcatcaaagtttgcaaattgtcttgtgctaggtggtgttccagaaaggttgttgtatgacacattgaag |
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T |
|
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gttgataaaaagttcaactggattagttcataaggtatcttaccactcaagttattgtatgataagtcaagactctctatttgggtaagatttgaaaaag |
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Q |
| |
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| T |
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atttctaaagaggtcaacttggttagttcataaggaatcttaccactcaagttattgtatgataagtcaaggctctctatttgggtaagttttgaaaaag |
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T |
|
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taattggaataggaccagacaagtgattatgtgatagattcaaggctttaatttgttgtaggtctccaacgtgagaagggatgacacctgttagcttatt |
699 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
5183724 |
ttattggaataggaccagacaagtaattatgtgatagattcaaggctttaatttgttgtaggtctccaatttgagaagggatgacacctgttagcttatt |
5183625 |
T |
|
| Q |
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gcatgataaatccaatccagtcataatctctagaactttacccttgtaaaagtattcattgtgctttgttctaaactccacttcaaattgtagat |
794 |
Q |
| |
|
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|
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5183624 |
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5183530 |
T |
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Target: chr4; HSP #7
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Q |
| |
|
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|
|
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5161985 |
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T |
|
| Q |
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taaaatggaaaatttggaaaaaatctacgcataaacttactgatgtaataaaaccaggccatacgccaacatgcattgatgcacaacactgttatgaagg |
257 |
Q |
| |
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|
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| T |
5161885 |
tacaatggaaaagttggaaaaaaaaatcgtgcaaacttactaatgtaataaaaccaagccatacgccaacgagcattgatacacaacactgttacgaagg |
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T |
|
| Q |
258 |
ccaacaatattgttatgtaagatgctgt-gaaac-tccaataaaatgttatcttatccacggaagattccttttctccattgtcattggattgtgatgat |
355 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5161785 |
ccaacaatattgttatgtaagatgctgtagaaacctccaataaaatgttatcatgtccacatttgtttcctcttcttcattgtcattggattgtgatgat |
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T |
|
| Q |
356 |
ggtgaagactcgtcacgttcacacttccgattgaggagtggtccacaaagactgggattacctctgtagttttcctcatcaaaagttgcaaattgtcctg |
455 |
Q |
| |
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|
| T |
5161685 |
ggtgaagacttgacaccttcacactttcggtcgaggagtgatccacaaagaccgggattacctctgtagctgtcctcaacgaaggttgcaaactgtcctg |
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T |
|
| Q |
456 |
tactaggtggtgttccagaaaggttgttgtatgacacattgaatgttgataaaaagttcaactggattagttcataaggtatcttaccactcaagttatt |
555 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5161585 |
tactaggtggtgttccagaaaggttgttgtatgacacgttgaaggttgataaaaaggtcaactgggttagctcataaggtatcttaccactcaagttatt |
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T |
|
| Q |
556 |
gtatgataagtcaagactctctatttgggtaagatttgaaaaagtaattggaataggaccagacaagtgattatgtgatagattcaaggctttaatttgt |
655 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5161485 |
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T |
|
| Q |
656 |
tgtaggtctccaacgtgagaagggatgacacctgttagcttattgcatgataaatccaatccagtcataatctctagaactttacccttgtaaaagtatt |
755 |
Q |
| |
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|| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
5161385 |
tgcaggtgcccaatttgagaagggatagtacctgttagcttgttgcatgataaatccaatccagtcattttctctaggactttacctttgtaaaagtaat |
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T |
|
| Q |
756 |
cattgtgctttgttctaaactccacttcaaattgtag |
792 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |
|
|
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
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T |
|
| Q |
1012 |
atgacacaattgaattggaatttctccttcaaaattgttccctcctaatagaagaacccttaactctgagagcttatccatccaattg |
1099 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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5183302 |
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T |
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Target: chr4; HSP #9
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Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||| |||| || |||||| | ||| || ||||||| | |
|
|
| T |
7143740 |
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T |
|
| Q |
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caagttattgtatgataagtcaagactctctatttgggtaagatttgaaaaagtaattggaataggaccagacaagtgattatgtgatagattcaaggct |
646 |
Q |
| |
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||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
7143640 |
caagttactctatgataagtcaagactctctatttgggtaagattggaaaaagtgattggaataggacctgacaagtgattatgttatagattcaagact |
7143541 |
T |
|
| Q |
647 |
ttaatttgttgtaggtctccaacgtgagaagggatgacacctgttagcttattgcatgataaatccaatccagtcataatctctagaactttacccttgt |
746 |
Q |
| |
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| | ||| | |||||||| | |||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | | || |
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| T |
7143540 |
cgatggttttgcatgtctccaagttcagaaggtatgactctagttacgatattgcatgataaatccaatccagtcatcatctctaggattttagcgtcgt |
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T |
|
| Q |
747 |
aaaagtattcattgtgctttgttctaaact |
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Q |
| |
|
||||||| |||| || |||||||||||||| |
|
|
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Target: chr4; HSP #10
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Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
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T |
|
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Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
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| |
|
|||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| || ||| |||| |
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T |
|
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ttagatgacacaattgaattggaatttctccttcaaaattgttccctcctaatagaagaacccttaactctgagagcttatccatcca |
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Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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7143211 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
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| |
|
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
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ccaaatgtcaaattttggaagcaagatggtattgaagcattgaacatgttccgcgataggtccatcatgttgatcttttttaatcgacacaattgaattg |
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T |
|
| Q |
1029 |
gaatttctccttcaaaattgttccctcctaatagaagaacccttaactctgagagcttatccatccaattg |
1099 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || || |||| ||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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gaatatctccttccaagttattccatcctagtaaaagaacacgcaactctgagagattatcaatccaattg |
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| |
|
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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