View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8889_low_1 (Length: 1211)

Name: NF8889_low_1
Description: NF8889
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8889_low_1
NF8889_low_1
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (326-1187)||(5214090-5214951)
chr4 (320-1187)||(5160288-5161153)
chr4 (326-1187)||(5182533-5183389)
chr4 (326-1187)||(5195933-5196794)
chr4 (326-1195)||(4841466-4842332)
chr4 (326-1047)||(4855963-4856684)
chr4 (326-1195)||(5173196-5174053)
chr4 (326-816)||(7142800-7143293)
chr4 (1-180)||(5183541-5183720)
chr4 (1-183)||(5196937-5197119)
chr4 (1-180)||(5174199-5174378)
chr4 (1-197)||(5161241-5161437)
chr4 (1-180)||(4855650-4855829)
chr4 (1-173)||(5215092-5215264)
chr4 (1-180)||(4841144-4841323)
chr4 (1052-1194)||(7142463-7142605)
chr4 (1075-1187)||(4856686-4856798)
chr4 (848-1022)||(7142614-7142791)
chr4 (480-584)||(5203432-5203535)
chr4 (1-176)||(7143408-7143583)
chr4 (361-402)||(5203556-5203597)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 326 - 1187
Target Start/End: Complemental strand, 5214951 - 5214090
Alignment:
Q  326 attccaaatgacaaattttggaagcaagatggtattgaagcactgagcatgttctgcgataggtccatcatgttgatctttgttaaccgacacaattgaa 425  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  5214951 attccaaatgacatatttcggaagcaagatggtattgaagcattgagcatgttccgtgataggtccattatgtctatcttttttaaccgacacaattgaa 5214852  T
Q  426 ttggaatatctccttccaaattgttccctccaagtaaaagagcacgtaactctaaaagattgtccatccatttgggaattttacctgaaaatttgttctc 525  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5214851 ttggaatatctccttccaatttgttccctcctagtaaaagaacacgtaactctgatagcttatccatccagtggggaattttacctgaaaatttgttctc 5214752  T
Q  526 cctcaagtctaggaggttcagttgtgaacttcttgatagtgcaaatggtattgatccagaaaaatcattcttttgcaaatacaagaaccttagatatgtc 625  Q
    |||||| ||||| || |  |||||||| | |   || ||| || ||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  5214751 cctcaaatctagaagttgtagttgtgagccttcagagagttcagatggtatcgagccagagagattattcttttgcaaatacaagaacctaagaactgtc 5214652  T
Q  626 aaactacttaaatctgggattgatccaattaacttgttctgagaaagatcaataatttcaagctttgacatgttggaaatctcaatagggatctgacctt 725  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5214651 aaaccacttaactttgggattgatccaattaacttgttttgagaaagatccagaattttaagacttgacatgttggaaatctcaatagggatctcacctt 5214552  T
Q  726 ctaatagattttcagccataagaaggacttccatgttagaaaacgtcccaattgaactaggaattgtgcctgagaatgaattattggatatagatagcat 825  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  5214551 ctaatatattttgagacataagaaggacccagatgtaagaaaatgtcccaattgagctaggaattgttcctgagaatgaattattggatatggatagaaa 5214452  T
Q  826 tgctaatcctgtattatttcccaatacatctacaagtgttccactaaagttgttattattgagaaataacccaaacatattctttgaattacaaaatttg 925  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || |||| | |||||| |||||||     
T  5214451 tactaatcctgtattatttcccaatacatcttcaagtgttccactaaagttgttattattgagaaataaaaattccacattcatggaattataaaattta 5214352  T
Q  926 ggaatattaccacttagaaagttgtttgagagggtcaagtatcgtaaattatcacaatctgtggccagttgcttaggtaactcacccgagaaatgattat 1025  Q
    ||||| || |||  |||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5214351 ggaatgttcccatgtagaaagttgttggagagcttcaagtattgtaaattatcacaacctgtggccagttgtttaggtaactcacctgagaaatgattat 5214252  T
Q  1026 aagcgaagcccaagtacttaagtttattcatcttaccaattgatgaaggtatatttcctttaaagctattccatgaaaggttcaaagagattacactagg 1125  Q
     || || | ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  |||| | || | ||||||||    
T  5214251 gagagaggtccaaggactcaagttttttcatcttaccaattgatgaaggtatatttccttcaaagttatttgatgaaaaattcatataggtaacactagg 5214152  T
Q  1126 aaggaatataccaatatcttctgggagcaaaccactaaaattgttgtttgatagatccaaat 1187  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||    
T  5214151 aaggaatataccaatatcttttggaagaaaaccacttaaactgttgattgatatatccaaat 5214090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 320 - 1187
Target Start/End: Complemental strand, 5161153 - 5160288
Alignment:
Q  320 tgtcctattccaaatgacaaattttggaagcaagatggtattgaagcactgagcatgttctgcgataggtccatcatgttgatctttgttaaccgacaca 419  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5161153 tgtcctataccaaatgtcaaattttggaagcaagatggtattgaagcattgaacatgttccgcgataggtccatcatgttgatcttttttaatcgacaca 5161054  T
Q  420 attgaattggaatatctccttccaaattgttccctccaagtaaaagagcacgtaactctaaaagattgtccatccatttgggaattttacctgaaaattt 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| |||| |||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5161053 attgaattggaatatctccttccaagttattccatcctagtaaaagaacacgcaactctgagagattatcaatccaattgggaattttacctgaaaattt 5160954  T
Q  520 gttctccctcaagtctaggaggttcagttgtgaacttcttgatagtgcaaatggtattgatccagaaaaatcattcttttgcaaatacaagaaccttaga 619  Q
    |||||||||||| || || || |  |||| ||| |||   || ||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5160953 gttctccctcaaatccagaagttgtagttttgagctttcagacagttcaattggtatagatccagagagatcattcttttgcaaatacaagaactttaga 5160854  T
Q  620 tatgtcaaactacttaaatctgggattgatccaattaacttgttctga-gaaagatcaataatttcaagctttgacatgttggaaatctcaatagggatc 718  Q
     | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||  |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  5160853 gaagtcaaactacttaaaggtgggattgatccatttaacttgttttgaagaaagatccaacatttcaagactgaacatgttggaaaactcaatagggatc 5160754  T
Q  719 tgaccttctaatagattttcagccataagaaggacttccatgttagaaaacgtcccaattgaactaggaattgtgcctgagaatgaattattggatatag 818  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5160753 tcaccttctaatagattttcagacatgataaggacttccatgttagaaaacgtcccaattgaactaggaattgtgcctgagaatgaattattggatatgg 5160654  T
Q  819 atagcattgctaatcctgtattatttcccaatacatctacaagtgttccactaaagttgttattattgagaaataacccaaacatattctttgaattaca 918  Q
    |||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |    |  ||  | |||||||    
T  5160653 atagaaatgctaattctgtattgtttcccaatacatcttcaagtgttccactaaagttgttattattaagaaataa---atttttcatccctaaattaca 5160557  T
Q  919 aaatttgggaatattaccacttagaaagttgtttgagagggtcaagtatcgtaaattatcacaatctgtggccagttgcttaggtaactcacccgagaaa 1018  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5160556 aaatttgggaatattaccacttagaaagttgtcggagacggacaagtatagtaaactatcagaatctgtggccagttgttttggtaactcacccgagaaa 5160457  T
Q  1019 tgattataagcgaagcccaagtacttaagtttattcatcttaccaattgatgaaggtatatttcctttaaagctattccatgaaaggttcaaagagatta 1118  Q
    ||||||| || || | |||||  |  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     |      
T  5160456 tgattatgagagaggtccaagagcaaaagtttttttatcttaccaattgatgaaggtatatttccttcaaagctattccatgaaaagttcaactgtgtag 5160357  T
Q  1119 cactaggaaggaatataccaatatcttctgggagcaaaccactaaaattgttgtttgatagatccaaat 1187  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5160356 cacttggaaggaataaatcaaaatcttttgttagcaacccacttaaattgttgtttgatatatccaaat 5160288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 326 - 1187
Target Start/End: Complemental strand, 5183389 - 5182533
Alignment:
Q  326 attccaaatgacaaattttggaagcaagatggtattgaagcactgagcatgttctgcgataggtccatcatgttgatctttgtta-accgacacaattga 424  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  5183389 attccaaatgacatattttgaaagcaagatggtattgaagcattgagcatgttccgtgataagtccattatgttgatcttttttagaaggacacaattga 5183290  T
Q  425 attggaatatctccttccaaattgttccctccaagtaaaagagcacgtaactctaaaagattgtccatccatttgggaattttacctgaaaatttgttct 524  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||  | | ||||||| | || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5183289 attggaatatctccttcaaaattgttccctcctaatagaaggacccttaactctgagagcttatccatccaattgggaattttacctgaaaatttgttgt 5183190  T
Q  525 ccctcaagtctaggaggttcagttgtgaacttcttgatagtgcaaatggtattgatccagaaaaatcattcttttgcaaatacaagaaccttagatatgt 624  Q
    |||| || ||||| || |  |||||||| | |   || ||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5183189 cccttaaatctagaagttgtagttgtgagccttcagagagttcagatggtattgatccagagagatcattctattgcaaatacaagaaccttagagatgt 5183090  T
Q  625 caaactacttaaatctgggattgatccaattaacttgttctgagaaagatcaataatttcaagctttgacatgttggaaatctcaatagggatctgacct 724  Q
    ||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5183089 caaactactgaactttgggatcgatccatttaacttgttttgagaaagatccaacatttgaagaatggccatgttggaaatctcaatagggatctcacct 5182990  T
Q  725 tctaatagattttcagccataagaaggacttccatgttagaaaacgtcccaattgaactaggaattgtgcctgagaatgaattattggatatagatagca 824  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||| | |||||||||  ||| ||    
T  5182989 tctaatagatttccggacataagaaggacttgcatatcagaaaacatcccaattgaactaggaattttgcctgtgattgagtaattggatatgaataaca 5182890  T
Q  825 ttgctaatcctgtattatttcccaatacatctacaagtgttccactaaagttgttattattgagaaataacccaaacatattctttgaattacaaaattt 924  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||      ||||| |    
T  5182889 ttcctaatcctgtattgttttccaatacatcttcaagtgttccactaaagttgttattattaagaaataacccaaacatattcactg------aaaatct 5182796  T
Q  925 gggaatattaccacttagaaagttgtttgagagggtcaagtatcgtaaattatcacaatctgtggccagttgcttaggtaactcacccgagaaatgatta 1024  Q
     ||||| || |||  |||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  5182795 tggaatcttcccatgtagaaagttgttggagagcttcaagtattgtaaattatcacaacctgtggccagttgtttaggtaactcacctgagaaatgattc 5182696  T
Q  1025 taagcgaagcccaagtacttaagtttattcatcttaccaattgatgaaggtatatttcctttaaagctattccatgaaaggttcaaagagattacactag 1124  Q
    | || || | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||    
T  5182695 tgagagaggtccaagtactcaagttgtttcatcttaccaattgatgaaggtatatttccttcaaagctattccatgaaaagttcaaatacttaacactag 5182596  T
Q  1125 gaaggaatataccaatatcttctgggagcaaaccactaaaattgttgtttgatagatccaaat 1187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5182595 gaaggaatataccaatatcttttggaagcaaaccactcaaattgttgtttgatatatccaaat 5182533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 326 - 1187
Target Start/End: Complemental strand, 5196794 - 5195933
Alignment:
Q  326 attccaaatgacaaattttggaagcaagatggtattgaagcactgagcatgttctgcgataggtccatcatgttgatctttgttaaccgacacaattgaa 425  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  5196794 attccaaataacatatttcgaaagcaagatggtatggaagcattgagcatgtttcgtgataagtccattatgttgatcttttttaaccgacacaactgca 5196695  T
Q  426 ttggaatatctccttccaaattgttccctccaagtaaaagagcacgtaactctaaaagattgtccatccatttgggaattttacctgaaaatttgttctc 525  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||  | | ||| ||| | |  || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5196694 ttggaatttctccttcaaaattgttccctcctaataaaaggacccttaattctgagaacttatccatccagttgggaatttttcctgaaaatttgttctc 5196595  T
Q  526 cctcaagtctaggaggttcagttgtgaa--cttcttgatagtgcaaatggtattgatccagaaaaatcattcttttgcaaatacaagaaccttagatatg 623  Q
    |||||| ||||| || |  ||||| |||  |||| | | ||| || |||| ||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||   |    
T  5196594 cctcaaatctagaagttgtagttg-gaagccttcat-agagttcatatgggattgatccagagagaccattctcttgcaaatacaagaaccttagaagag 5196497  T
Q  624 tcaaactacttaaatctgggattgatccaattaacttgttctgagaaagatcaataatttcaagctttgacatgttggaaatctcaatagggatctgacc 723  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||    | ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  5196496 tcaaaccacttaaaggtgggattgatccatttaacttgttttgagaaagatctaaaatttgaagccgccatatgctggaaatctcaatagggatctcacc 5196397  T
Q  724 ttctaatagattttcagccataagaaggacttccatgttagaaaacgtcccaattgaactaggaattgtgcctgagaatgaattattggatatagatagc 823  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  5196396 ttctaattgatttttagacataagaagggcccacatgttagaaaacatcccaattgaactaggaattgtgcctgagaatgaattattggatatggacagc 5196297  T
Q  824 attgctaatcctgtattatttcccaatacatctacaagtgttccactaaagttgttattattgagaaataacccaaacatattctttgaattacaaaatt 923  Q
     || |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  5196296 gtttctaatcttgtattatttcctaatacatcttcaagtgttccactaaagttgttattattaagaaataacccaaacatattcactgaattacaaaatc 5196197  T
Q  924 tgggaatattaccacttagaaagttgtttgagagggtcaagtatcgtaaattatcacaatctgtggccagttgcttaggtaactcacccgagaaatgatt 1023  Q
    | ||||| || |||  |||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5196196 ttggaatgttcccatgtagaaagttgttggagagcttcaagtattgtaaattatcacaacctgtggccagttgtttaggtaactcacctgagaaatgatt 5196097  T
Q  1024 ataagcgaagcccaagtacttaagtttattcatcttaccaattgatgaaggtatatttcctttaaagctattccatgaaaggttcaaagagattacacta 1123  Q
     | || |||| |||||   | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||| ||    
T  5196096 ttgagagaagtccaagagttgaagttgtttcatcttaccaattgatgaaggtatatttccttcaaagctattccatgaaaagttcaaataggtaacatta 5195997  T
Q  1124 ggaaggaatataccaatatcttctgggagcaaaccactaaaattgttgtttgatagatccaaat 1187  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5195996 ggaaggaatataccgatatcttttggaagcaaaccactcaaattgttgtttgatatatccaaat 5195933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 326 - 1195
Target Start/End: Original strand, 4841466 - 4842332
Alignment:
Q  326 attccaaatgacaaattttggaagcaagatggtattgaagcactgagcatgttctgcgataggtccatcatgttgatctttgttaaccgacacaattgaa 425  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||| |||| ||| |||   ||||||||||||    
T  4841466 attccaaatgacatattttggaagcaagatggtattgaagcattgagcatgttccgtgataagtccattatggtgatattttttagatgacacaattgaa 4841565  T
Q  426 ttggaatatctccttccaaattgttccctccaagtaaaagagcacgtaactctaaaagattgtccatccatttgggaattttacctgaaaatttgttctc 525  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | || |||| | | ||||||| | || || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4841566 ttggaatttctccttcaaaattgttccctcctaatagaagaacccttaactctgagagcttatccatccaattgggaattttacctgaaagtttgttctc 4841665  T
Q  526 cctcaagtctaggaggttcagttgtgaacttcttgatagtgcaaatggtattgatccagaaaaatcattcttttgcaaatacaagaaccttagatatgtc 625  Q
    |||||| ||||| || |  |||| ||| | |   || ||| || ||||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  4841666 cctcaaatctagaagttgtagttttgagccttcagagagttcagatggctttgatccagagagatcattctgttgcaaatacaagaaccttagatattta 4841765  T
Q  626 aaactacttaaatctgggattgatccaattaacttgttctgagaaagatcaataatttcaagctttgacatgttggaaatctcaatagggatctgacctt 725  Q
    |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4841766 aaactactcaactttgggattgctccaattaacttgttttgagaaagatccaaaatatgaagccatggcatgttggaaatctcaatagggatctgacctt 4841865  T
Q  726 ctaatagattttcagccataagaaggacttccatgttagaaaacgtcccaattgaactaggaattgtgcctgagaatgaattattggatatagatagcat 825  Q
    ||||| |||||| | |||||| |||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| |||||||     
T  4841866 ctaattgattttgacccataaaaaggaactgcatgtgagaaaacatcccaattgaactaggaattttgcctgtgattgagttattggatatggatagcaa 4841965  T
Q  826 tgctaatcctgtattatttccc------aatacatctacaagtgttccactaaagttgttattattgagaaataacccaaacatattctttgaattacaa 919  Q
    |  ||||| | |||||||||||      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||        ||||    
T  4841966 tattaatcttctattatttccctttcccaatacatcatcaagtgttccactaaagttgttattattgagaaataaaactaccatattc--------acaa 4842057  T
Q  920 aatttgggaatattaccacttagaaagttgtttgagagggtcaagtatcgtaaattatcacaatctgtggccagttgcttaggtaactcacccgagaaat 1019  Q
    | ||| |||||||| |||| |||| ||||||| |||||  |||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4842058 a-tttaggaatattcccacatagagagttgttggagagaatcaagtattgtaaattattgcaatctgcggccagttgtttaggtaactcacctgagaaat 4842156  T
Q  1020 gattataagcgaagcccaagtacttaagtttattcatcttaccaattgatgaaggtatatttcctttaaagctattccatgaaaggttcaaagagattac 1119  Q
    |||| | || || | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  |||| | || | ||    
T  4842157 gattctgagagaggtccaagtacttaagttttttcatcttacaaattgatgaaggtatatttccttcaaagttatttgatgaaaaattcatataggtaac 4842256  T
Q  1120 actaggaaggaatataccaatatcttctgggagcaaaccactaaaattgttgtttgatagatccaaatgttgtatg 1195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4842257 actaggaaggaatataccaatatcttctggaagcaaaccactaaaattgttgtttgatagatccaaatattgtatg 4842332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 326 - 1047
Target Start/End: Original strand, 4855963 - 4856684
Alignment:
Q  326 attccaaatgacaaattttggaagcaagatggtattgaagcactgagcatgttctgcgataggtccatcatgttgatctttgttaaccgacacaattgaa 425  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4855963 attccaaatgacatatttcggaagcaagatggtattgaagcattgagcatgttccgtgataggtccattatgtcgatcttttttaaccgacacaattgaa 4856062  T
Q  426 ttggaatatctccttccaaattgttccctccaagtaaaagagcacgtaactctaaaagattgtccatccatttgggaattttacctgaaaatttgttctc 525  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4856063 ttggaatatctccttccaagttgttccctcctagtaaaagaacacgtaactctgataggttatccatccagtggggaattttacctgaaaatttgttctc 4856162  T
Q  526 cctcaagtctaggaggttcagttgtgaacttcttgatagtgcaaatggtattgatccagaaaaatcattcttttgcaaatacaagaaccttagatatgtc 625  Q
    |||||| ||||| || |  |||||||| | | | || ||| || |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  4856163 cctcaaatctagaagttgtagttgtgagcctttagagagttcagatggtattgatccagggagattattcttttgcaaatacaagaacctaagaactgtc 4856262  T
Q  626 aaactacttaaatctgggattgatccaattaacttgttctgagaaagatcaataatttcaagctttgacatgttggaaatctcaatagggatctgacctt 725  Q
    |||| |||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| | |||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4856263 aaaccacttaactttgggattgctccaactaacttgttttgagaaagatccaaaatataaagactggacatgttggaaatctcaatagggatctcacctt 4856362  T
Q  726 ctaatagattttcagccataagaaggacttccatgttagaaaacgtcccaattgaactaggaattgtgcctgagaatgaattattggatatagatagcat 825  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||    
T  4856363 ctaattgattttcagacataacaagggaaaccatgttagaaaacttcccaattgaactaggaattttgcctgtgattgagttattggatatggatagcat 4856462  T
Q  826 tgctaatcctgtattatttcccaatacatctacaagtgttccactaaagttgttattattgagaaataacccaaacatattctttgaattacaaaatttg 925  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||  |||  | |||||||||||||     
T  4856463 tgttaatcttgtattatttcccaatacatcttcaagtgttccactaaagttgttattactgagcaataaccaaagcaagttcgctaaattacaaaattta 4856562  T
Q  926 ggaatattaccacttagaaagttgtttgagagggtcaagtatcgtaaattatcacaatctgtggccagttgcttaggtaactcacccgagaaatgattat 1025  Q
    |||||||| || |  ||||||||||| |||||  |||||||| |||| | ||   | |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| |    
T  4856563 ggaatattccctcggagaaagttgttggagagcttcaagtattgtaactcattcaactctgtggccaattgttcaggtaactcacctgagaaatgattct 4856662  T
Q  1026 aagcgaagcccaagtacttaag 1047  Q
     || || | |||||||||||||    
T  4856663 gagagaggtccaagtacttaag 4856684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 326 - 1195
Target Start/End: Complemental strand, 5174053 - 5173196
Alignment:
Q  326 attccaaatgacaaattttggaagcaagatggtattgaagcactgagcatgttctgcgataggtccatcatgttgatctttgttaaccgacacaattgaa 425  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||||| | |||| ||| |||||||    
T  5174053 attccaaatgacatattttggaggcaagatggtattgaagcattgagcatgttccgtgatagatccattatgtcgatctttttgaaccaacaaaattgaa 5173954  T
Q  426 ttggaatatctccttccaaattgttccctccaagtaaaagagcacgtaactctaaaagattgtccatccatttgggaattttacctgaaaatttgttctc 525  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |  |||||| | || || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5173953 ttggaatttctccttcaaaattgttccctcctaataaaagaaccctcaactctgagagcttatccatccagttgggaattttacctgaaagtttgttctc 5173854  T
Q  526 cctcaagtctaggaggttcagttgtgaacttcttgatagtgcaaatggtattgatccagaaaaatcattcttttgcaaatacaagaaccttagatatgtc 625  Q
    |||||| ||||| || |  |||| ||| | |   || ||| ||||||||||  ||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| || ||| ||  |    
T  5173853 cctcaaatctagaagttgtagttttgagccttcagagagttcaaatggtataaatccagagagatcattctgttgtaaatacaagaatctcagagat--c 5173756  T
Q  626 aaactacttaaatctgggattgatccaattaacttgttctgagaaagatcaataatttcaagctttgacatgttggaaatctcaatagggatctgacctt 725  Q
     | ||  | || | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5173755 cagctg-tgaactttgggattgctccaattaacttgttttgagaaagatccaaaatataaagactggacatgttggaaatctcaatagggatctgacctt 5173657  T
Q  726 ctaatagattttcagccataagaaggacttccatgttagaaaacgtcccaattgaactaggaattgtgcctgagaatgaattattggatatagatagcat 825  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  || ||||||||||| ||||||||    
T  5173656 ctaattgatttttagacataagaaggacatacatgttagaaaacatcccaattgaactaggaattctgcctgtgatcgagttattggatatggatagcat 5173557  T
Q  826 tgctaatcctgtattatt------tcccaatacatctacaagtgttccactaaagttgttattattgagaaataacccaaacatattctttgaattacaa 919  Q
    |  || || |||||||||      ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |   |||| ||        || |    
T  5173556 tagtattcttgtattatttccctttcccaatacatcatcaagtgttccactaaagttgttattattcagtaataaaacttccatactc--------ac-a 5173466  T
Q  920 aatttgggaatattaccacttagaaagttgtttgagagggtcaagtatcgtaaattatcacaatctgtggccagttgcttaggtaactcacccgagaaat 1019  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| ||||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5173465 aatttaggaatattcccacgtagagagttgttggagagaatcaagtattgtaaattatcgcaatatgtggccagttgtttaggtaactcacctgagaaat 5173366  T
Q  1020 gattataagcgaagcccaagtacttaagtttattcatcttaccaattgatgaaggtatatttcctttaaagctattccatgaaaggttcaaagagattac 1119  Q
     ||||| || || | | ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | |     
T  5173365 tattatgagagaggtcaaagtactcaagatttttcatcttaccaattgatgaaggtatatttccttcaaagctattccatgaaaagttcaaataggtaat 5173266  T
Q  1120 actaggaaggaatataccaatatcttctgggagcaaaccactaaaattgttgtttgatagatccaaatgttgtatg 1195  Q
    ||| |||||||||      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5173265 acttggaaggaat------atatcttctggaagcaaaccactaaaattgttgtttgatagatccaaatattgtatg 5173196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 326 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 7143293 - 7142800
Alignment:
Q  326 attccaaatgacaaattttggaagcaagatggtattgaagcactgagcatgttctgcgataggtccatcatgttgatctttgttaaccgacacaattgaa 425  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7143293 attccaaatgacatattttggaagcaaggtggtattgaagcattgagcatgttttctgataggtctattttgtcgatcttttttaaccgacacaattgaa 7143194  T
Q  426 ttggaatatctccttccaaattgttccctccaagtaaaagagcacgtaactctaaaagattgtccatccatttgggaattttacctgaaaatttgttctc 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| | || || |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7143193 ttggaatatctccttccaaattgttccttcctaataaaagaacacgtaactctgatagcttatccatccagttgggaattttacttgaaagtttgttctc 7143094  T
Q  526 cctcaagtctaggaggttcagttgtgaacttcttgatagtgcaaatggtattgatccagaaaaatcattcttttgcaaatacaagaaccttagatatgtc 625  Q
    |||||| ||||  || |  |||||||| | |   || ||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  7143093 cctcaaatctaaaagttgtagttgtgagccttcagagagttcaaatggtatagatccagagagatcattcttttgcaaatacaagagccttagatttttc 7142994  T
Q  626 aaactacttaaatctgggattgatccaattaacttgttctgagaaagatcaataatttcaagctttgacatgttggaa---atctcaatagggatctgac 722  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |||   ||| |||| ||||||| ||    
T  7142993 aaactacttaaatctgggattgatccaattaacttgttttgagaaagatcaatatattcaagaatagacatgtttgaaaacatcccaattgggatctcac 7142894  T
Q  723 cttctaatagattttcagccataagaaggacttccatgttagaaaacgtcccaattgaactaggaattgtgcctgagaatgaattattggatat 816  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||  || ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7142893 cttctaaaagattttcaaccatacgaagggctagcaggtttgaaaacatcccaattgaactaggaattgttcctgagattgaattattggatat 7142800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5183720 - 5183541
Alignment:
Q  1 tggaataggaccagacaagtgattatgtgatagattcaaggctttaatttgttgtaggtctccaacgtgagaagggatgacacctgttagcttattgcat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5183720 tggaataggaccagacaagtaattatgtgatagattcaaggctttaatttgttgtaggtctccaatttgagaagggatgacacctgttagcttattgcat 5183621  T
Q  101 gataaatccaatcctgtcatgttctctaggattttacctttgtaaaagtaatcgtaatgctttgttctgaactgcacttc 180  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||| | | |||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  5183620 gataaatccaatccagtcatgatctttagaactatacccttgtaaaagtaatcatagtgctttgttctaaactgcacttc 5183541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5197119 - 5196937
Alignment:
Q  1 tggaataggaccagacaagtgattatgtgatagattcaaggctttaatttgttgtaggtctccaacgtgagaagggatgacacctgttagcttattgcat 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5197119 tggaatgggacctgacaagtgattatgtgatagattcaaggctctaatttgttgtaggtctccaatttgagaagggatgacacctgttagcttattgcat 5197020  T
Q  101 gataaatccaatcctgtcatgttctctaggattttacctttgtaaaagtaatcgtaatgctttgttctgaactgcacttccaa 183  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  5197019 gataaatccaatccagtcatattctctagaactttacccttgtaaaagtattcatagtgctttgttctgaactccacttccaa 5196937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5174378 - 5174199
Alignment:
Q  1 tggaataggaccagacaagtgattatgtgatagattcaaggctttaatttgttgtaggtctccaacgtgagaagggatgacacctgttagcttattgcat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5174378 tggaatgggaccagacaagtgattatgtgatagattcaaggctctaatttgttgtaggtctccaatttgagaagggatgacacctgttagcttattgcat 5174279  T
Q  101 gataaatccaatcctgtcatgttctctaggattttacctttgtaaaagtaatcgtaatgctttgttctgaactgcacttc 180  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | | |||| |||||| |||| || |  |||||||||||||||| ||||||    
T  5174278 gataaatccaatccagtcatattctctagaactatacccttgtaagagtattcattgtgctttgttctgaactccacttc 5174199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5161437 - 5161241
Alignment:
Q  1 tggaataggaccagacaagtgattatgtgatagattcaaggctttaatttgttgtaggtctccaacgtgagaagggatgacacctgttagcttattgcat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||  ||||  |||||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  5161437 tggaataggacccgacaagtgattatgtgataggttcaaggctaaaacttgttgcaggtgcccaatttgagaagggatagtacctgttagcttgttgcat 5161338  T
Q  101 gataaatccaatcctgtcatgttctctaggattttacctttgtaaaagtaatcgtaatgctttgttctgaactgcacttccaagtatagttcgccat 197  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5161337 gataaatccaatccagtcattttctctaggactttacctttgtaaaagtaatcattgtgctttgttctgaactccacttccaagtgtagttcgccat 5161241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 4855650 - 4855829
Alignment:
Q  1 tggaataggaccagacaagtgattatgtgatagattcaaggctttaatttgttgtaggtctccaacgtgagaagggatgacacctgttagcttattgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||| ||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4855650 tggaataggaccagacaagtgattatgtgataggttcaaggctctaactggttgaaggtgaccaatttgagaagggatgacacctgttaggttattccat 4855749  T
Q  101 gataaatccaatcctgtcatgttctctaggattttacctttgtaaaagtaatcgtaatgctttgttctgaactgcacttc 180  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||    
T  4855750 gataaatccaatccagtcatattctctagaactttacccttgtaaaagtattcatagtgctttgttctgaactccacttc 4855829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5215264 - 5215092
Alignment:
Q  1 tggaataggaccagacaagtgattatgtgatagattcaaggctttaatttgttgtaggtctccaacgtgagaagggatgacacctgttagcttattgcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  5215264 tggaataggaccagacaagtgattatgtgataggttcaaggctctaacttgttgaaggtgaccaatttgagaagggatgagacctgttaggttattccat 5215165  T
Q  101 gataaatccaatcctgtcatgttctctaggattttacctttgtaaaagtaatcgtaatgctttgttctgaact 173  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  5215164 gataaatccaatccagtcatattctctagaactttacccttgtaaaagtattcatagtgctttgttctgaact 5215092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 4841144 - 4841323
Alignment:
Q  1 tggaataggaccagacaagtgattatgtgatagattcaaggctttaatttgttgtaggtctccaacgtgagaagggatgacacctgttagcttattgcat 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  4841144 tggaatgggacctgacaagtgattatgtgatagattcaaggctctaatttgttgtaggtctccaatttgggaagggataacacctgttaaattattgcat 4841243  T
Q  101 gataaatccaatcctgtcatgttctctaggattttacctttgtaaaagtaatcgtaatgctttgttctgaactgcacttc 180  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| |||| ||||||    
T  4841244 gataaatccaatccagtcataatctctagaactttacccttgtaaaagtattcattgtgctttgttctaaactccacttc 4841323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1052 - 1194
Target Start/End: Complemental strand, 7142605 - 7142463
Alignment:
Q  1052 ttcatcttaccaattgatgaaggtatatttcctttaaagctattccatgaaaggttcaaagagattacactaggaaggaatataccaatatcttctggga 1151  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7142605 ttcatcataccaattgattaaggtatatttccttgaaagctattcaatgaaaagttcagatagtcaacactaggaaggaatataccaatatcttctggaa 7142506  T
Q  1152 gcaaaccactaaaattgttgtttgatagatccaaatgttgtat 1194  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7142505 gcaaaccacttaaattgttgtttgatatatccaaatgttgtat 7142463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1075 - 1187
Target Start/End: Original strand, 4856686 - 4856798
Alignment:
Q  1075 tatatttcctttaaagctattccatgaaaggttcaaagagattacactaggaaggaatataccaatatcttctgggagcaaaccactaaaattgttgttt 1174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4856686 tatatttccttcaaagctattccatgaaatgttcaaataggtaacactaggaaggaatataccaatatcttttggaagcaaaccactcaaattgttgttt 4856785  T
Q  1175 gatagatccaaat 1187  Q
    |||| ||||||||    
T  4856786 gatatatccaaat 4856798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 848 - 1022
Target Start/End: Complemental strand, 7142791 - 7142614
Alignment:
Q  848 aatacatctacaagtgttccactaaagttgttattattgagaaataa----cccaaacatattctttgaattacaaaatttgggaatattaccacttaga 943  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||| | ||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7142791 aatacatcttccagtgttccaccaaagttgttattattgagaaataaagttcccaaatacattatt-gaaatataaaatttaggaatattaccacttaga 7142693  T
Q  944 aagttgtttgagagggtcaagtatcgtaaattatcacaatctgtggccagttgcttaggtaactcacccgagaaatgat 1022  Q
    |||||||| |||||| |||||     |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7142692 aagttgttggagaggatcaaggtgtttaaactatcacaatctttggccaattgtttaggtaactcacccgagaaatgat 7142614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 480 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 5203535 - 5203432
Alignment:
Q  480 aaagattgtccatccatttgggaattttacctgaaaatttgttctccctcaagtctaggaggttcagttgtgaacttcttgatagtgcaaatggtattga 579  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||| ||    
T  5203535 aaagattatccatccagttgggaatgttacctgaaaatttgttct-cctcaagtctaaaagtttcagctgtgaacttccagacagttcaaatggtataga 5203437  T
Q  580 tccag 584  Q
    |||||    
T  5203436 tccag 5203432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7143583 - 7143408
Alignment:
Q  1 tggaataggaccagacaagtgattatgtgatagattcaaggctttaatttgttgtaggtctccaacgtgagaagggatgacacctgttagcttattgcat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  |   | ||| | ||||||||  | |||||| ||||| |  ||||   ||||||||    
T  7143583 tggaataggacctgacaagtgattatgttatagattcaagactcgatggttttgcatgtctccaagttcagaaggtatgactctagttacgatattgcat 7143484  T
Q  101 gataaatccaatcctgtcatgttctctaggattttacctttgtaaaagtaatcgtaatgctttgttctgaactgca 176  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| | | ||||||||| || || | ||||||||| |||||||    
T  7143483 gataaatccaatccagtcatcatctctaggattttagcgtcgtaaaagtactcatagttctttgttctaaactgca 7143408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 361 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 5203597 - 5203556
Alignment:
Q  361 tgaagcactgagcatgttctgcgataggtccatcatgttgat 402  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5203597 tgaagcattgagcatgttccgtgataggtccatcatgttgat 5203556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University