View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8889_low_15 (Length: 733)

Name: NF8889_low_15
Description: NF8889
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8889_low_15
NF8889_low_15
[»] chr4 (80 HSPs)
chr4 (13-733)||(22801637-22802375)
chr4 (13-733)||(36920398-36921136)
chr4 (349-727)||(18535715-18536092)
chr4 (13-411)||(14788657-14789071)
chr4 (281-733)||(22781321-22781755)
chr4 (281-733)||(22045299-22045733)
chr4 (257-733)||(16932732-16933193)
chr4 (257-733)||(11007152-11007613)
chr4 (281-733)||(9175054-9175491)
chr4 (400-733)||(14788298-14788633)
chr4 (375-733)||(16454413-16454773)
chr4 (375-733)||(47563863-47564224)
chr4 (1-405)||(10113540-10113946)
chr4 (13-261)||(22134006-22134255)
chr4 (375-733)||(36379334-36379694)
chr4 (375-729)||(12401626-12401982)
chr4 (13-261)||(16933537-16933786)
chr4 (13-261)||(22782126-22782375)
chr4 (375-733)||(5099927-5100285)
chr4 (34-409)||(3577934-3578311)
chr4 (13-356)||(18536784-18537142)
chr4 (13-412)||(47563450-47563865)
chr4 (381-733)||(24879626-24879979)
chr4 (13-261)||(11007957-11008206)
chr4 (13-261)||(22046104-22046353)
chr4 (17-262)||(12395248-12395493)
chr4 (17-262)||(12400210-12400455)
chr4 (375-665)||(36770559-36770849)
chr4 (97-261)||(12402485-12402649)
chr4 (13-412)||(16453998-16454415)
chr4 (13-261)||(9175861-9176113)
chr4 (394-665)||(47565735-47566005)
chr4 (375-713)||(22133185-22133506)
chr4 (281-412)||(22133504-22133635)
chr4 (13-181)||(36378979-36379148)
chr4 (281-412)||(5099798-5099929)
chr4 (527-729)||(12396684-12396888)
chr4 (376-733)||(10113952-10114308)
chr4 (282-412)||(36379206-36379336)
chr4 (13-261)||(5136665-5136914)
chr4 (13-261)||(5872388-5872637)
chr4 (296-411)||(12399706-12399821)
chr4 (83-261)||(52094708-52094886)
chr4 (13-261)||(12743274-12743523)
chr4 (296-412)||(12401980-12402096)
chr4 (13-261)||(7123281-7123530)
chr4 (13-261)||(8393992-8394240)
chr4 (269-408)||(34571440-34571579)
chr4 (347-412)||(36770496-36770561)
chr4 (269-409)||(12740573-12740713)
chr4 (269-409)||(12748779-12748919)
chr4 (40-261)||(26558309-26558531)
chr4 (296-733)||(26558917-26559351)
chr4 (347-412)||(8394685-8394750)
chr4 (13-261)||(5207009-5207258)
chr4 (347-408)||(7123975-7124036)
chr4 (629-713)||(36379781-36379865)
chr4 (347-406)||(5137359-5137418)
chr4 (381-475)||(12399607-12399701)
chr4 (350-412)||(47565621-47565683)
chr4 (123-200)||(4588636-4588713)
chr4 (514-731)||(12740219-12740436)
chr4 (514-731)||(12748425-12748642)
chr4 (541-731)||(34571088-34571278)
chr4 (93-259)||(9224981-9225147)
chr4 (640-713)||(22045128-22045202)
chr4 (39-111)||(5350500-5350573)
chr4 (300-407)||(5206506-5206612)
chr4 (93-196)||(16624582-16624685)
chr4 (640-713)||(11006980-11007054)
chr4 (640-713)||(22781149-22781223)
chr4 (517-615)||(54882051-54882148)
chr4 (636-697)||(5137679-5137740)
chr4 (517-578)||(35371562-35371622)
chr4 (154-257)||(5350578-5350681)
chr4 (640-706)||(5100382-5100448)
chr4 (640-713)||(9174883-9174957)
chr4 (640-713)||(16932558-16932632)
chr4 (375-409)||(47565681-47565715)
chr4 (126-199)||(42191445-42191518)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (83-733)||(15533500-15534169)
chr6 (281-733)||(26066981-26067413)
chr6 (281-733)||(33310150-33310584)
chr6 (375-733)||(3395366-3395726)
chr6 (13-412)||(3631166-3631581)
chr6 (13-394)||(26944165-26944562)
chr6 (13-261)||(26931952-26932201)
chr6 (13-261)||(33309530-33309779)
chr6 (13-253)||(17012704-17012944)
chr6 (13-261)||(25462854-25463103)
chr6 (13-261)||(26067784-26068033)
chr6 (400-733)||(3630789-3631143)
chr6 (16-247)||(12936652-12936884)
chr6 (13-261)||(5408415-5408664)
chr6 (13-261)||(5412740-5412989)
chr6 (13-261)||(12157892-12158141)
chr6 (291-412)||(3395247-3395368)
chr6 (13-261)||(16553249-16553498)
chr6 (13-261)||(16629805-16630054)
chr6 (46-212)||(3395070-3395237)
chr6 (13-261)||(34165457-34165706)
chr6 (16-247)||(12910976-12911193)
chr6 (14-261)||(30443935-30444183)
chr6 (260-409)||(5407917-5408066)
chr6 (260-409)||(5412242-5412391)
chr6 (83-261)||(16651580-16651759)
chr6 (296-409)||(30444564-30444677)
chr6 (269-409)||(11137321-11137461)
chr6 (512-616)||(26944594-26944698)
chr6 (300-409)||(16568184-16568293)
chr6 (541-665)||(28038602-28038726)
chr6 (428-507)||(17012957-17013036)
chr6 (347-409)||(16553943-16554005)
chr6 (347-409)||(16630499-16630561)
chr6 (347-409)||(16652205-16652267)
chr6 (517-677)||(10456160-10456318)
chr6 (347-406)||(34166151-34166210)
chr6 (13-81)||(11137212-11137280)
chr6 (96-196)||(33331026-33331126)
chr6 (646-733)||(30729529-30729616)
chr6 (93-259)||(14738149-14738315)
chr6 (483-596)||(24543487-24543597)
chr6 (695-733)||(26944708-26944746)
chr6 (640-711)||(3630621-3630692)
chr6 (640-713)||(26066810-26066884)
chr6 (640-713)||(33310681-33310755)
chr6 (342-407)||(10456494-10456559)
chr6 (668-731)||(16568486-16568550)
chr6 (376-596)||(30444679-30444896)
chr6 (186-261)||(16567733-16567808)
chr6 (123-188)||(18232275-18232340)
chr6 (636-697)||(34166471-34166532)
[»] chr1 (70 HSPs)
chr1 (13-733)||(31736395-31737114)
chr1 (281-733)||(51751298-51751733)
chr1 (13-412)||(6996225-6996640)
chr1 (376-733)||(16430002-16430361)
chr1 (13-412)||(50078017-50078432)
chr1 (375-733)||(31423901-31424259)
chr1 (257-733)||(27337713-27338175)
chr1 (257-733)||(47178596-47179058)
chr1 (281-733)||(16227429-16227863)
chr1 (281-730)||(20301392-20301824)
chr1 (375-733)||(14098790-14099150)
chr1 (13-261)||(51750678-51750927)
chr1 (375-733)||(25249517-25249877)
chr1 (13-409)||(16429589-16430000)
chr1 (13-412)||(29003194-29003609)
chr1 (375-733)||(28202226-28202586)
chr1 (40-261)||(28841090-28841312)
chr1 (13-261)||(28203088-28203337)
chr1 (13-348)||(25250568-25250919)
chr1 (13-412)||(28997478-28997893)
chr1 (375-733)||(50077659-50078019)
chr1 (13-261)||(16226809-16227058)
chr1 (13-261)||(51758175-51758424)
chr1 (14-261)||(20300773-20301021)
chr1 (13-261)||(27338522-27338771)
chr1 (13-261)||(47178003-47178252)
chr1 (13-412)||(31424257-31424660)
chr1 (13-261)||(3805527-3805776)
chr1 (385-733)||(13126271-13126616)
chr1 (13-250)||(8348465-8348703)
chr1 (375-610)||(6996638-6996872)
chr1 (13-261)||(13127124-13127373)
chr1 (257-412)||(28202584-28202742)
chr1 (13-261)||(31657777-31658026)
chr1 (269-405)||(13126631-13126767)
chr1 (13-261)||(50168696-50168944)
chr1 (40-261)||(28222767-28222989)
chr1 (281-395)||(28841650-28841764)
chr1 (423-733)||(28841760-28842053)
chr1 (13-200)||(3157236-3157424)
chr1 (277-407)||(50168193-50168323)
chr1 (269-408)||(28222266-28222402)
chr1 (483-733)||(13548168-13548417)
chr1 (483-731)||(776506-776754)
chr1 (269-405)||(776260-776396)
chr1 (602-733)||(25127086-25127220)
chr1 (269-408)||(31658328-31658467)
chr1 (83-188)||(16456362-16456467)
chr1 (498-705)||(50167863-50168070)
chr1 (629-713)||(8954000-8954083)
chr1 (547-731)||(28221539-28221723)
chr1 (93-259)||(41397583-41397749)
chr1 (371-412)||(14099148-14099189)
chr1 (663-733)||(6996871-6996941)
chr1 (640-713)||(20301924-20301998)
chr1 (346-412)||(25249875-25249941)
chr1 (277-330)||(8348039-8348092)
chr1 (517-613)||(31928880-31928975)
chr1 (547-694)||(28221948-28222094)
chr1 (375-438)||(28997417-28997480)
chr1 (375-438)||(29003133-29003196)
chr1 (93-196)||(47099395-47099498)
chr1 (640-713)||(16227963-16228037)
chr1 (631-713)||(16430450-16430531)
chr1 (93-185)||(19359415-19359507)
chr1 (520-595)||(19753438-19753513)
chr1 (640-704)||(28997326-28997390)
chr1 (640-704)||(29003042-29003106)
chr1 (640-713)||(51751830-51751904)
chr1 (376-409)||(13548523-13548556)
[»] chr7 (75 HSPs)
chr7 (13-733)||(7470900-7471619)
chr7 (97-733)||(20298050-20298684)
chr7 (281-704)||(38395254-38395679)
chr7 (13-412)||(28486215-28486630)
chr7 (281-733)||(1047872-1048307)
chr7 (257-733)||(7093044-7093506)
chr7 (13-412)||(24749237-24749652)
chr7 (281-583)||(7350370-7350669)
chr7 (281-733)||(22136073-22136508)
chr7 (281-733)||(40551100-40551535)
chr7 (13-261)||(38394636-38394885)
chr7 (328-733)||(43556-43944)
chr7 (375-733)||(44725982-44726343)
chr7 (281-583)||(31157003-31157303)
chr7 (13-261)||(36100-36349)
chr7 (13-261)||(1048678-1048927)
chr7 (13-412)||(21678709-21679124)
chr7 (16-261)||(44725228-44725474)
chr7 (13-261)||(7351040-7351289)
chr7 (13-261)||(7093850-7094099)
chr7 (13-261)||(22135453-22135702)
chr7 (13-261)||(40550480-40550729)
chr7 (382-733)||(24815896-24816245)
chr7 (383-731)||(21679130-21679480)
chr7 (375-733)||(9679721-9680079)
chr7 (13-253)||(13289896-13290137)
chr7 (376-665)||(44011447-44011736)
chr7 (13-261)||(31159091-31159326)
chr7 (375-733)||(28486628-28486969)
chr7 (375-675)||(24749650-24749950)
chr7 (13-252)||(24816768-24817001)
chr7 (257-409)||(24816253-24816405)
chr7 (22-261)||(26213379-26213618)
chr7 (13-261)||(18391517-18391766)
chr7 (13-261)||(47675483-47675732)
chr7 (281-412)||(44725853-44725984)
chr7 (16-260)||(6047137-6047382)
chr7 (13-261)||(6593879-6594128)
chr7 (281-412)||(4293940-4294071)
chr7 (40-261)||(48490005-48490227)
chr7 (281-412)||(9679592-9679723)
chr7 (1-189)||(4295402-4295592)
chr7 (269-409)||(48490592-48490732)
chr7 (16-261)||(6570563-6570809)
chr7 (296-407)||(6047763-6047874)
chr7 (269-409)||(47674978-47675118)
chr7 (349-409)||(44011738-44011798)
chr7 (347-409)||(6593372-6593434)
chr7 (347-409)||(18391010-18391072)
chr7 (347-406)||(1560808-1560867)
chr7 (93-196)||(24261900-24262003)
chr7 (123-261)||(3890780-3890918)
chr7 (644-733)||(31156869-31156958)
chr7 (645-733)||(7350236-7350324)
chr7 (93-261)||(16884269-16884437)
chr7 (483-615)||(26214221-26214352)
chr7 (483-731)||(48490838-48491086)
chr7 (97-259)||(12405681-12405843)
chr7 (296-409)||(26214004-26214115)
chr7 (547-731)||(47674625-47674809)
chr7 (93-196)||(18413065-18413168)
chr7 (640-713)||(44041-44115)
chr7 (640-713)||(1047701-1047775)
chr7 (640-704)||(9680176-9680240)
chr7 (375-438)||(4293879-4293942)
chr7 (93-196)||(5817762-5817865)
chr7 (640-713)||(7350065-7350139)
chr7 (123-196)||(21988327-21988400)
chr7 (95-196)||(49091084-49091185)
chr7 (281-333)||(36720-36772)
chr7 (193-261)||(4294106-4294174)
chr7 (640-713)||(22136605-22136679)
chr7 (640-713)||(40551632-40551706)
chr7 (551-612)||(6068019-6068080)
chr7 (636-697)||(6593053-6593114)
[»] chr5 (76 HSPs)
chr5 (13-412)||(20043626-20044028)
chr5 (13-412)||(27911073-27911488)
chr5 (13-412)||(658659-659074)
chr5 (13-412)||(25806102-25806486)
chr5 (281-733)||(34478003-34478437)
chr5 (281-733)||(31543994-31544429)
chr5 (365-733)||(18510279-18510649)
chr5 (375-733)||(20044026-20044385)
chr5 (269-583)||(15355566-15355882)
chr5 (281-733)||(6746332-6746767)
chr5 (281-583)||(23666307-23666608)
chr5 (375-733)||(27911486-27911846)
chr5 (13-261)||(6745709-6745958)
chr5 (13-261)||(10750339-10750588)
chr5 (375-733)||(659072-659433)
chr5 (13-261)||(31543374-31543623)
chr5 (13-261)||(15356238-15356487)
chr5 (13-261)||(23665687-23665936)
chr5 (13-261)||(34478808-34479057)
chr5 (13-261)||(18467325-18467574)
chr5 (375-733)||(20504731-20505092)
chr5 (105-412)||(18510637-18510959)
chr5 (13-261)||(29720948-29721197)
chr5 (13-261)||(9788567-9788816)
chr5 (489-731)||(31466778-31467021)
chr5 (281-412)||(18467948-18468079)
chr5 (13-257)||(26171340-26171585)
chr5 (557-733)||(41586872-41587051)
chr5 (281-399)||(10750959-10751077)
chr5 (281-411)||(31467117-31467247)
chr5 (13-261)||(534332-534581)
chr5 (257-412)||(20505090-20505248)
chr5 (13-261)||(40380689-40380938)
chr5 (395-583)||(10756269-10756455)
chr5 (83-261)||(16407979-16408157)
chr5 (269-697)||(16408522-16408947)
chr5 (13-261)||(16545010-16545262)
chr5 (375-733)||(18468077-18468418)
chr5 (13-261)||(13694487-13694735)
chr5 (13-261)||(42427777-42428026)
chr5 (300-409)||(29721593-29721700)
chr5 (300-408)||(42427276-42427384)
chr5 (151-258)||(13294851-13294958)
chr5 (300-409)||(534953-535062)
chr5 (347-409)||(16545707-16545769)
chr5 (347-409)||(26174045-26174107)
chr5 (347-409)||(40381383-40381445)
chr5 (375-475)||(25806484-25806584)
chr5 (93-196)||(33790722-33790825)
chr5 (271-409)||(13487214-13487352)
chr5 (547-724)||(42426925-42427102)
chr5 (541-731)||(13487515-13487705)
chr5 (93-196)||(27449229-27449332)
chr5 (631-733)||(15355436-15355537)
chr5 (631-733)||(23666637-23666738)
chr5 (644-733)||(10756500-10756589)
chr5 (640-713)||(18510108-18510181)
chr5 (483-570)||(13295074-13295160)
chr5 (97-196)||(37557205-37557304)
chr5 (93-196)||(43598139-43598242)
chr5 (93-196)||(43603631-43603734)
chr5 (93-196)||(43609123-43609226)
chr5 (640-713)||(15355265-15355339)
chr5 (640-713)||(23666835-23666909)
chr5 (547-726)||(26174277-26174456)
chr5 (129-261)||(31397605-31397737)
chr5 (640-713)||(10756686-10756760)
chr5 (547-697)||(29721872-29722021)
chr5 (640-713)||(31544526-31544600)
chr5 (640-713)||(34477831-34477905)
chr5 (547-731)||(535232-535416)
chr5 (192-253)||(20505603-20505664)
chr5 (640-713)||(27911943-27912016)
chr5 (547-613)||(16545939-16546005)
chr5 (40-81)||(18510959-18511000)
chr5 (123-196)||(34842023-34842096)
[»] scaffold1674 (2 HSPs)
scaffold1674 (16-577)||(511-1087)
scaffold1674 (602-714)||(390-505)
[»] chr3 (106 HSPs)
chr3 (13-412)||(3315302-3315717)
chr3 (13-412)||(53916897-53917312)
chr3 (281-733)||(43227320-43227755)
chr3 (257-581)||(5898625-5898951)
chr3 (281-581)||(6064513-6064811)
chr3 (281-733)||(11169341-11169776)
chr3 (281-583)||(457147-457447)
chr3 (281-733)||(4309095-4309525)
chr3 (13-261)||(43226697-43226946)
chr3 (375-733)||(53916539-53916899)
chr3 (400-733)||(28138106-28138441)
chr3 (381-733)||(890771-891126)
chr3 (13-412)||(28101231-28101646)
chr3 (375-733)||(3315715-3316075)
chr3 (13-261)||(456527-456776)
chr3 (13-261)||(10957712-10957961)
chr3 (375-675)||(23634796-23635099)
chr3 (13-412)||(42990919-42991334)
chr3 (375-733)||(28100873-28101233)
chr3 (375-733)||(43422336-43422695)
chr3 (13-261)||(5192270-5192519)
chr3 (375-731)||(18097699-18098057)
chr3 (13-261)||(6065182-6065431)
chr3 (13-261)||(11168721-11168970)
chr3 (13-261)||(5898029-5898278)
chr3 (13-261)||(18098560-18098808)
chr3 (13-261)||(23634066-23634314)
chr3 (13-412)||(43422693-43423106)
chr3 (281-475)||(10957147-10957341)
chr3 (53-261)||(4309899-4310108)
chr3 (15-406)||(1619735-1620110)
chr3 (83-261)||(7769246-7769424)
chr3 (16-261)||(27421261-27421507)
chr3 (14-261)||(23199484-23199732)
chr3 (13-261)||(37407262-37407511)
chr3 (13-261)||(10209774-10210023)
chr3 (1-261)||(5259668-5259930)
chr3 (281-412)||(18098055-18098186)
chr3 (376-570)||(25634865-25635058)
chr3 (13-261)||(6717086-6717335)
chr3 (13-261)||(10056818-10057067)
chr3 (13-261)||(10061262-10061511)
chr3 (13-261)||(10063484-10063733)
chr3 (13-261)||(10065706-10065955)
chr3 (14-261)||(29811443-29811691)
chr3 (13-261)||(4600065-4600314)
chr3 (13-261)||(9635469-9635718)
chr3 (13-261)||(10059040-10059289)
chr3 (40-218)||(25634523-25634703)
chr3 (257-409)||(25634714-25634863)
chr3 (560-733)||(35918763-35918939)
chr3 (13-261)||(22834354-22834602)
chr3 (257-412)||(23634643-23634798)
chr3 (281-411)||(891131-891261)
chr3 (375-713)||(42991332-42991653)
chr3 (13-261)||(7762844-7763093)
chr3 (269-409)||(23198979-23199119)
chr3 (291-409)||(7763479-7763597)
chr3 (13-177)||(53597846-53598011)
chr3 (269-407)||(32892276-32892414)
chr3 (296-409)||(27421891-27422004)
chr3 (269-409)||(5259163-5259303)
chr3 (269-409)||(29812057-29812197)
chr3 (599-733)||(10956932-10957069)
chr3 (123-261)||(15822031-15822169)
chr3 (14-261)||(15830587-15830834)
chr3 (101-261)||(32891752-32891912)
chr3 (347-409)||(10210465-10210527)
chr3 (269-405)||(6717700-6717834)
chr3 (296-409)||(7769765-7769878)
chr3 (520-596)||(1619530-1619605)
chr3 (13-196)||(23409742-23409926)
chr3 (347-406)||(10057512-10057571)
chr3 (347-406)||(10059734-10059793)
chr3 (347-406)||(10061956-10062015)
chr3 (347-406)||(10064178-10064237)
chr3 (347-406)||(10066400-10066459)
chr3 (347-409)||(4599558-4599620)
chr3 (296-407)||(15824698-15824809)
chr3 (483-726)||(9634989-9635233)
chr3 (542-706)||(15824370-15824534)
chr3 (644-733)||(457492-457581)
chr3 (644-733)||(6064377-6064466)
chr3 (640-713)||(3306247-3306320)
chr3 (13-261)||(8516436-8516685)
chr3 (483-731)||(29812303-29812550)
chr3 (96-261)||(32479682-32479847)
chr3 (629-713)||(10956761-10956845)
chr3 (636-728)||(37407844-37407937)
chr3 (355-407)||(27900224-27900276)
chr3 (546-665)||(27422164-27422283)
chr3 (344-407)||(31116505-31116568)
chr3 (640-713)||(457678-457752)
chr3 (640-713)||(6064205-6064279)
chr3 (640-713)||(11169873-11169947)
chr3 (636-697)||(10210785-10210846)
chr3 (547-615)||(23198741-23198809)
chr3 (355-407)||(27882632-27882684)
chr3 (640-704)||(53916378-53916442)
chr3 (547-613)||(43403032-43403098)
chr3 (640-689)||(5899186-5899235)
chr3 (636-697)||(10057832-10057893)
chr3 (636-697)||(10060054-10060115)
chr3 (636-697)||(10062276-10062337)
chr3 (636-697)||(10064498-10064559)
chr3 (636-697)||(10066720-10066781)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (13-411)||(50659-51073)
scaffold0005 (400-733)||(51097-51432)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (375-733)||(34948-35309)
scaffold0011 (13-261)||(34191-34440)
scaffold0011 (257-412)||(34792-34950)
[»] scaffold1899 (2 HSPs)
scaffold1899 (281-583)||(885-1186)
scaffold1899 (13-261)||(265-514)
[»] chr8 (43 HSPs)
chr8 (375-733)||(21481605-21481945)
chr8 (13-412)||(21481192-21481607)
chr8 (281-583)||(18812024-18812324)
chr8 (281-583)||(43080918-43081218)
chr8 (257-583)||(27828274-27828602)
chr8 (13-261)||(15069263-15069512)
chr8 (12-412)||(41383348-41383763)
chr8 (382-733)||(41383768-41384121)
chr8 (1-261)||(27827668-27827930)
chr8 (13-261)||(18811404-18811653)
chr8 (13-261)||(43080298-43080547)
chr8 (375-733)||(15071868-15072226)
chr8 (13-261)||(31577683-31577931)
chr8 (13-261)||(34255852-34256101)
chr8 (93-261)||(17848303-17848471)
chr8 (13-261)||(4732231-4732480)
chr8 (13-261)||(5591459-5591707)
chr8 (419-733)||(31574432-31574746)
chr8 (269-409)||(34255346-34255486)
chr8 (277-409)||(31577192-31577324)
chr8 (269-409)||(41365853-41365993)
chr8 (298-409)||(17848859-17848970)
chr8 (269-409)||(4732817-4732957)
chr8 (257-366)||(15069859-15069971)
chr8 (483-731)||(41365502-41365752)
chr8 (362-412)||(15071820-15071870)
chr8 (93-196)||(10684841-10684944)
chr8 (93-196)||(35744797-35744900)
chr8 (483-733)||(17849103-17849351)
chr8 (644-714)||(43081263-43081333)
chr8 (483-726)||(34254997-34255240)
chr8 (599-692)||(27828599-27828695)
chr8 (93-196)||(18853740-18853843)
chr8 (640-713)||(18812396-18812470)
chr8 (640-713)||(27828819-27828893)
chr8 (640-713)||(43081449-43081523)
chr8 (636-697)||(4733216-4733277)
chr8 (123-259)||(6813037-6813173)
chr8 (599-642)||(18812321-18812364)
chr8 (123-185)||(26300756-26300818)
chr8 (700-733)||(40220518-40220551)
chr8 (640-713)||(41384218-41384291)
chr8 (700-733)||(42436108-42436141)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (281-733)||(35216553-35216988)
chr2 (375-733)||(31733747-31734104)
chr2 (281-733)||(36559728-36560162)
chr2 (381-733)||(21519223-21519577)
chr2 (375-733)||(6263020-6263379)
chr2 (13-412)||(6263377-6263792)
chr2 (257-733)||(19502919-19503381)
chr2 (13-261)||(36560530-36560779)
chr2 (14-261)||(35217359-35217607)
chr2 (13-261)||(19503725-19503974)
chr2 (14-253)||(21520091-21520331)
chr2 (17-253)||(22405327-22405564)
chr2 (257-412)||(21519581-21519739)
chr2 (281-412)||(31734102-31734233)
chr2 (485-643)||(22404976-22405134)
chr2 (314-412)||(22402266-22402364)
chr2 (13-188)||(34574620-34574796)
chr2 (269-407)||(14634841-14634979)
chr2 (296-412)||(28569310-28569426)
chr2 (509-731)||(14634485-14634708)
chr2 (129-261)||(42019235-42019367)
chr2 (585-730)||(13829021-13829167)
chr2 (83-241)||(28569834-28569992)
chr2 (297-407)||(41304109-41304219)
chr2 (519-665)||(28569023-28569167)
chr2 (375-475)||(22402362-22402462)
chr2 (90-196)||(23079041-23079147)
chr2 (547-695)||(42018425-42018572)
chr2 (97-196)||(19348684-19348783)
chr2 (93-196)||(25403057-25403160)
chr2 (296-407)||(42018734-42018845)
chr2 (629-711)||(31733579-31733660)
chr2 (515-665)||(6396475-6396624)
chr2 (640-713)||(19502748-19502822)
chr2 (640-713)||(35216382-35216456)
chr2 (641-713)||(36559557-36559630)
chr2 (645-733)||(41303825-41303914)
chr2 (93-196)||(10446017-10446120)
chr2 (517-578)||(41303969-41304029)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (13-412)||(80507-80922)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (281-733)||(23387-23819)
scaffold0140 (13-261)||(22767-23016)
scaffold0140 (640-713)||(23916-23990)
[»] scaffold0133 (3 HSPs)
scaffold0133 (503-727)||(3966-4190)
scaffold0133 (13-253)||(26288-26528)
scaffold0133 (428-507)||(26196-26275)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (16-261)||(72906-73152)
scaffold0025 (342-733)||(70111-70485)
scaffold0025 (269-347)||(72466-72547)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (13-261)||(115176-115425)
scaffold0016 (269-402)||(115787-115920)
[»] scaffold1908 (3 HSPs)
scaffold1908 (269-409)||(553-690)
scaffold1908 (223-261)||(150-188)
scaffold1908 (636-697)||(948-1009)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (13-81)||(12445-12513)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (93-196)||(14886-14989)
[»] scaffold0219 (2 HSPs)
scaffold0219 (13-259)||(26764-27011)
scaffold0219 (350-407)||(23202-23259)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (93-261)||(149532-149700)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (97-196)||(458-557)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (640-713)||(2367-2441)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (640-713)||(189176-189250)
scaffold0006 (123-196)||(1914-1987)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (93-196)||(18521-18624)
[»] scaffold1991 (1 HSPs)
scaffold1991 (123-196)||(1028-1101)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (123-196)||(30090-30163)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (123-196)||(42681-42754)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 80)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 13 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 22802375 - 22801637
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||  |||| | || ||| |||| ||||||||||    
T  22802375 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcgggaataaagatttgagagaagcaacaaaggaaacaaccgcgacatcaatgtggtcaa 22802276  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | || ||||    
T  22802275 agttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggtcgtcgtgga 22802176  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacatt------------gaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| || |||||||||            ||||||||   |||| | ||||||||   |||||| |||| |    
T  22802175 gctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgattttgagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctaatggtgtggtgttgtttggaggat 22802076  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  22802075 gaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagtggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagtctggagaggcggaggc 22801976  T
Q  397 aagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttag 496  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||       | ||||||| | ||    
T  22801975 aacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagaatacgctcagcgtgag 22801876  T
Q  497 ttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattc 596  Q
     ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801875 gtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattc 22801777  T
Q  597 cagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttc 693  Q
    | || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||| |    
T  22801776 cggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggaaaccttcaaggaagcgggagatgtcc 22801677  T
Q  694 cgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
     | |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  22801676 tgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 22801637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 13 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 36921136 - 36920398
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||| || |  |||||||||||||||||||    
T  36921136 gagatggtggacaaggccaggagtgccactgtcttgtacctcggggataaagttttgagagaagcagcaaaggatccaatcgcggcatcgatgtggtcaa 36921037  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  36921036 agtttgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaagtcttaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggccatcatgga 36920937  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg------------atgcaaatgctttgatggtgtgttg---tttcgaggtt 296  Q
    |  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||            ||||   |||| |||||||||| ||   ||| |||| |    
T  36920936 gctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttagggatgcgggtgctctgatggtgtggtgatgtttggaggat 36920837  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  36920836 gaagaatgtgatgtgtctcaccttgagattgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagtctggagaggcggaggc 36920737  T
Q  397 aagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttag 496  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||     | | | ||||| | ||    
T  36920736 aacaatattcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgttcagcgtgag 36920637  T
Q  497 ttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattc 596  Q
     || | |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36920636 gtgcatttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgcaatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattc 36920538  T
Q  597 cagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttc 693  Q
    | || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| |    
T  36920537 cggaggttgaagaatgtatagcacagcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcaggagatgtcc 36920438  T
Q  694 cgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
     ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  36920437 tgtgttgaagagattatggtgaatgcttgtggaactacct 36920398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 349 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 18536092 - 18535715
Alignment:
Q  349 gtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaa 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| | ||||| |    
T  18536092 gtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatattcatgatctacct-ttgaggtggagttttaaggttgaagacata 18535994  T
Q  449 gtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgcta 548  Q
    |||  |||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||| || ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18535993 gtgcgatgtacgcattttctagttgagaggtaaaaagctcagcttgaggtggagtttaacacaccaggaatggtacgactatggaggaccttgggtgcta 18535894  T
Q  549 tgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaa 648  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |   |||||  || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18535893 tgctctagtggtgagcaatggatttcttcataaagacgaacaacattctggaggttaaagaatgtatatcacgacttgcgggattaccttaaaaagccaa 18535794  T
Q  649 gggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaa 727  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18535793 gggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagtgggagatgtcccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaa 18535715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14789071 - 14788657
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcacg-gaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||  | || |||||||||||||||||||    
T  14789071 gagatggtggacaaggccatgagtgccattgtcttgctcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaagatactaccgcggcatcgatgtggtcaa 14788972  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  14788971 agatcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatgga 14788872  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacatt------------gaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||            ||||||||   |||| ||||||||||   ||||||||||| |    
T  14788871 gctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttcgaggat 14788772  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14788771 gaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 14788672  T
Q  397 aagaatactcatgat 411  Q
    |||||||||||||||    
T  14788671 aagaatactcatgat 14788657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 22781755 - 22781321
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22781755 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 22781656  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||         
T  22781655 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtaga 22781556  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  22781555 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat- 22781459  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
                      ||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||| ||||   || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22781458 ------------------gaagttggagaatgtatagcacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaag 22781377  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  22781376 gaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 22781321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 22045733 - 22045299
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggt-cgtctggagagacgttaaacactcaacatcag 379  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22045733 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtatctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggttcgtctggagacacgttaaacactcaacatcag 22045634  T
Q  380 cctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggt 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||       
T  22045633 cctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagatag 22045534  T
Q  480 tggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcat 579  Q
     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22045533 agtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacggctatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat 22045435  T
Q  580 gaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa-gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaagg 678  Q
                       ||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  22045434 -------------------gaagttgaagaatatatagcacggcttgcgagattactctaaaaattccaagggtgattgaatgcaaggtgatcttcaagg 22045354  T
Q  679 aaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    || |||||||||||| | | |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  22045353 aagcgggagatgttctgcggtgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 22045299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 257 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 16933193 - 16932732
Alignment:
Q  257 tgaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 353  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||   |||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933193 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 16933094  T
Q  354 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||     
T  16933093 gagagacgttaaacactcaacattagcttggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggctgaagacatagtggg 16932994  T
Q  454 atgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctc 553  Q
    |||||| |||||||||||||||     | | ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  16932993 atgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgactat-gaaaaccttgggtgctatgctc 16932895  T
Q  554 tagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagg 650  Q
    || |||||||||||||||||||||||                   ||||||| ||||||| || |||  |||||| |||||| ||||   || |||||||    
T  16932894 ta-tggtgagcaagggatttcttcat-------------------gaagttggagaatgtgtagcacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagg 16932815  T
Q  651 gtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  16932814 gtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 16932732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 257 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 11007613 - 11007152
Alignment:
Q  257 tgaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 353  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||   ||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  11007613 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttgaaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtcta 11007514  T
Q  354 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggc 453  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||     
T  11007513 gagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggg 11007414  T
Q  454 atgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctc 553  Q
    |||||| ||||| |||||||||     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  11007413 atgtacgcattttctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaaaaccttgggtgctatgctc 11007315  T
Q  554 tagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagg 650  Q
    || |||||||||||||||||||||||                   ||||||| ||||||| || |||  |||||| |||||| ||||   || | |||||    
T  11007314 ta-tggtgagcaagggatttcttcat-------------------gaagttggagaatgtgtagcacggcttgcgagattactctaaaagaatgtcaagg 11007235  T
Q  651 gtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  11007234 gtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaaccaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacct 11007152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 9175491 - 9175054
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9175491 gtgttgcttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 9175392  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||         
T  9175391 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctattgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtaga 9175292  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||| | | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  9175291 gtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtactatgctcta-tggtgagcaagggatttattcat- 9175194  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaa--gggtgattggaggcaaggagatcttca 675  Q
                      ||||||||||||||||||  ||  ||||| |||||| |||||   || |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9175193 ------------------gaagttgaagaatgtatacaacggcttgcaggattatcctaaaagaaggccaagggggtgattggatgcaaggtgatcttca 9175112  T
Q  676 aggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  9175111 aggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 9175054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 400 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 14788633 - 14788298
Alignment:
Q  400 aatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttg 499  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     | | ||||||| | || ||    
T  14788633 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtg 14788534  T
Q  500 gagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccag 599  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  14788533 gagttgaacacaccggtaatggtacggctatggaggacgttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcacgaagacggaaggcgttccgg 14788435  T
Q  600 aagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt 696  Q
    | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  14788434 aggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgt 14788335  T
Q  697 gttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  14788334 gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 14788298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 16454413 - 16454773
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| ||||||||| ||  | || |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  16454413 atcagactggagaggtggaagcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggtgtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcatttgctagttga 16454512  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  16454513 ggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggagtaccttgggtgctatacgcta-tggtgagcaagggatttc 16454611  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16454612 ttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatc 16454711  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  16454712 ttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 16454773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 47563863 - 47564224
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  47563863 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctaccggttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 47563962  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47563963 ggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccgataatggtacgactatggacgaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaatggatttc 47564062  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||     
T  47564063 ttcatgaagacggaaggcattatggaggttgaagaatgtatagcacgaattgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggaaatt 47564162  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  47564163 ttcaaggaagcgggaaatgtattgtgttgaagaggttatggtgaatgcttgtgaaactacct 47564224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 10113540 - 10113946
Alignment:
Q  1 agtggagaag-cagagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggca 98  Q
    |||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||  | | ||||||  | ||   |    
T  10113540 agtggagaagaccgagatggtggaataggtcaggagtgccgttgtcttgtgcctcaggaataaagttttcagagatgtcacgaaggaaccttccgcaata 10113639  T
Q  99 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaa 198  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10113640 tcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgactaagtctttggctcacaggcaattcctaaatcaacaactctactcattcaagacggtggagtcaa 10113739  T
Q  199 aggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgaggatgcaaatgctttgatggtgtgttgtttcgaggttga 298  Q
    ||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||  |||  |||    
T  10113740 aggccatcatggagcgactaacagagttcaacaaaatccttgatgatttggaaaacattgaggatgcatgtgctttggtggcgtgttgttgggagaatga 10113839  T
Q  299 agaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaa 398  Q
    ||||||| ||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10113840 agaaggtaatgtttccaaccttgtgaatgatgcctagtagagcggtgatcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggtggtgggaa 10113939  T
Q  399 gaatact 405  Q
    |||||||    
T  10113940 gaatact 10113946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22134255 - 22134006
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  22134255 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaa 22134156  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22134155 agttggaatctttttatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 22134056  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22134055 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 22134006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 36379334 - 36379694
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  36379334 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcattatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtac-catttgctagttga 36379432  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | |||||| || || ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  36379433 ggtagagtacgctcagtttgaggtggagttaaacacaccgggaatggtacgactatggaggaccttggatgctatgctctagtggtgagcaatgaatttc 36379532  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||| ||||    
T  36379533 ttcatgaaaacggaaggcattccagagattgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattgaatgcaaggtgatc 36379632  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  36379633 ttcaaggaagcgggagatgtcttgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 36379694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 375 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 12401982 - 12401626
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  12401982 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacttgttgaggtggagtttcaaggttgaagacataatgggatgtacgcatttgctagttga 12401883  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12401882 ggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaactcaccggtaatggtacagctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 12401784  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||| ||||    
T  12401783 ttcatgaagacagaaggaattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgtaaggtgatc 12401684  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaact 729  Q
    ||||||||| |  ||||||| | ||| |||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  12401683 ttcaaggaagcatgagatgtcctgtggtgaagatgttatggtgaatgcttgtggaact 12401626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16933786 - 16933537
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  16933786 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaa 16933687  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  16933686 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatgga 16933587  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16933586 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 16933537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22782375 - 22782126
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  22782375 gagatggtggacaaggccaggagtgccgttgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaa 22782276  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22782275 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 22782176  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22782175 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 22782126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 5099927 - 5100285
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| ||||||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  5099927 atcagtctggagaggtggaggcaaaaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttga 5100026  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||| | || ||||||| |||||   || ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5100027 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacc--ggtaatagtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 5100123  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaa---agccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5100124 ttcatgaagacagaagacattccggaggttgaagaatgtataacacagcttgcgggattaccctaaaaaatagccaagagtgattggatgcaaggagatc 5100223  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||||||| | | |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
T  5100224 ttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgttgaactacct 5100285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 3578311 - 3577934
Alignment:
Q  34 agtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatga 132  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||  | |||||| || ||| ||||||||||||||||||| || | ||| || ||||    
T  3578311 agtgccattgtcttgtgcctcagagataaagttttgagagatgtagtgaaggaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtctttatatatga 3578212  T
Q  133 caaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacag 232  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |     
T  3578211 caaagtctttggatcatcgccaacttttaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagacaaagtccatcatggagcaacttacagagttcaaaaa 3578112  T
Q  233 aatccttgatgacttggagaacattgaggatgcaaatgctttgatggtgtgttgttt-cgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgc 331  Q
     || | |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||||||  |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3578111 tattcctgattatttggagaacattgaggatgcaggtgctttggtggggtcttgtttgggagaatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggaataatgc 3578012  T
Q  332 ctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    ||      |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3578011 cttacaacgcggtgatcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcatggagaggcggtagtaagaatactcatg 3577934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18537142 - 18536784
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  18537142 gagatagtggacaaggccaagagtgccattgtcttgtgcctcgggaataaagttttaagagatgtagcgaaggaaccaatcgcggcatcgatgtggtcaa 18537043  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18537042 agttcgtatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatggaagagtcgaaggccatcatgga 18536943  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaaca---------------ttgaggatgcaaatgctttgatggtgtgttgtttcgaggtt 296  Q
    | ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| || |               |||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |    
T  18536942 gcaacttgcggagttcaacagaat-cttgatgacttggaaaatattatctctgagggttttgaggatgcaagtgttttggtggtgtgttgtttggaggat 18536844  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggag 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  18536843 gaagaaggtgatgtttctcaccttgtgagtgatgcctggtaaagcgttggtcgtctggag 18536784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Original strand, 47563450 - 47563865
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  | || ||| |||||||||||  ||    
T  47563450 gagatgatggacaaggccaagagtgacattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggatacaaccgcgacatcgatgtgggaaa 47563549  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | | |||||||||||||||    
T  47563550 agttggaatctttgtatatgacaaagtcgttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaatttaaaggccatcatgga 47563649  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattga------------ggatgcaaatgctttgatggt---gtgttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||            |||||||  |||| |||||||   ||||||||| |||| |    
T  47563650 gctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagagcattgaggtgtgtcttggggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggat 47563749  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  47563750 gaagaatgtgatgtgtctcaccttgggattgatacatagtagagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagtctagagatgcggtggt 47563849  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  47563850 aagaatactcatgatc 47563865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 381 - 733
Target Start/End: Original strand, 24879626 - 24879979
Alignment:
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||         
T  24879626 ctggagaggtggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttaaggtaga 24879725  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | |||||||   || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24879726 gtacgctcagcgagaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 24879824  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||  || ||| ||    
T  24879825 aagacggaatgcattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccgtaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtaatattc-ag 24879923  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||    
T  24879924 gaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatgatgaatgcttgtggaactacct 24879979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11008206 - 11007957
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||||||  ||    
T  11008206 gagatggtggacaaggccaggagtgccgttgtcttgtgcctcggagataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggaaa 11008107  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    || | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  11008106 agatggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgaatctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 11008007  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11008006 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 11007957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22046353 - 22046104
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcacgg-aaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | || | ||  |||||||||||||| |||    
T  22046353 gagatggtggacaaggccaggtgtgccattgtcttgtgcctcgaggataaagttttgagagaagtagcaaagtaagcaacctcggcatcgatgtgggcaa 22046254  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    | || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22046253 atttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 22046154  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22046153 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 22046104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12395493 - 12395248
Alignment:
Q  17 tggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagtt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| || || | | ||||||||||| |||||||    
T  12395493 tggtggacaaggccagaagtgccattgtcttgtgcctcggggataaaattttgagagaagtagcaaaggagccaaccgtgacatcgatgtgggcaaagtt 12395394  T
Q  116 cgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaa 215  Q
     |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| ||    
T  12395393 ggaatctttgtat-tgaaaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggaatcgaaggccatcatggagcaa 12395295  T
Q  216 cttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagga 262  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12395294 cttacggagttcaacaaaatccgtgatgacttggagaatattgagga 12395248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12400455 - 12400210
Alignment:
Q  17 tggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagtt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| || || | | ||||||||||| |||||||    
T  12400455 tggtggacaaggccagaagtgccattgtcttgtgcctcggggataaaattttgagagaagtagcaaaggagccaaccgtgacatcgatgtgggcaaagtt 12400356  T
Q  116 cgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaa 215  Q
     |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| ||    
T  12400355 ggaatctttgtat-tgaaaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggaatcgaaggccatcatggagcaa 12400257  T
Q  216 cttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagga 262  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12400256 cttacggagttcaacaaaatccgtgatgacttggagaatattgagga 12400210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 375 - 665
Target Start/End: Original strand, 36770559 - 36770849
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||| | || || ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  36770559 atcagtctggagaggcagaggcaacaatactcatgatctatttgttgagttggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtgcgcatttgctagttga 36770658  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | ||||| ||||| || |||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  36770659 ggtagagtaagcttagcttgaggtggagttgaacagaccgataatggtacggctatggagaaccttgggtgctatgctctagttgtgagcaagggaattc 36770758  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaag 665  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  36770759 ttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtataacatggcttgtgggattaccctaaaagaccaaggttgattggatgcaag 36770849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12402649 - 12402485
Alignment:
Q  97 catcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtc 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12402649 catcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtc 12402550  T
Q  197 aaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12402549 gaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccgtgatgacttggagaatattgagg 12402485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Original strand, 16453998 - 16454415
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcacggaac-cgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||| | |||||||||||||  | |||| |||| |||||||||||||  | |  | || ||| |||||||||||||||    
T  16453998 gagatggtggacaaggccaggattgccaatgtcttgtgcctcatgaataaagtttcgagagaagtagcaaagtatacaaccgcgacatcgatgtggtcaa 16454097  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    | || ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||| ||| ||    
T  16454098 attttgaatatttgtatacgacaaagactttggctcatcgacaagtcctaaagcaacaactttactaattcaagatggtaaagtcaaaggccaccataga 16454197  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg------------atgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggtt 296  Q
    |  | ||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||            ||||   |||| ||||||||||   |||||| |||| |    
T  16454198 gctaattgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggat 16454297  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaac--atcagcctggagaggcggtg 394  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16454298 gaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctgttagagcggtggttgtctagagagacgttagacactcaacagatcagcctggagaggcggtg 16454397  T
Q  395 gtaagaatactcatgatc 412  Q
    | ||||||||||||||||    
T  16454398 gcaagaatactcatgatc 16454415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9176113 - 9175861
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaag---gtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggt 108  Q
    |||||||||||||||   | ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| | ||  || |||||||||||     
T  9176113 gagatggtggacaagaaggccaggagtgccgttgtcttgtgcctcggagataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccacgacatcgatgtggg 9176014  T
Q  109 caaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcat 208  Q
     |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  9176013 aaaagtgggaatctttgtatatgacaaagtctttggctgatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggaagactcaaaggccatcat 9175914  T
Q  209 ggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9175913 ggagcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 9175861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 394 - 665
Target Start/End: Original strand, 47565735 - 47566005
Alignment:
Q  394 ggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctt 493  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||    
T  47565735 ggtaacaatactcatgatctacctattgaggtggagtttcaaggtggaagacataatgggatgtacatatttgctagttgagaggtagaaagcttagttt 47565834  T
Q  494 tagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggca 593  Q
     || || |||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47565835 gaggtgaagttgaactcaccgggaatggtatgactatggagaaccttgagtgatatgctcta-ttgtgagcaagggaattcttcatgaagacggaaggca 47565933  T
Q  594 ttccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaag 665  Q
    |||  || ||||||| ||||||| ||   |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||    
T  47565934 ttctggaggttgaaggatgtatagcatggcttgtgggattaccctaaaagaccaatggtgattggatgcaag 47566005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 375 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 22133506 - 22133185
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22133506 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 22133407  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22133406 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 22133308  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    ||||||| ||                   ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||   || |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22133307 ttcatgagga-------------------tgaagaatgtatagcacggcttgcgggattatcctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatc 22133227  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  22133226 ttcaaggaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 22133185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 281 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22133635 - 22133504
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133635 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 22133536  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133535 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 22133504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Original strand, 36378979 - 36379148
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||| |||||    
T  36378979 gagatggtggacaaggtcaggagtgtcattgtcttgtgcctcgggaataaagatttgagagaagtagcgaaggaaccaaccgtggcatcgatgtagtcaa 36379078  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcatt 181  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36379079 agttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcatt 36379148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 281 - 412
Target Start/End: Original strand, 5099798 - 5099929
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  5099798 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacattaaacactcaacattagc 5099897  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5099898 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 5099929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 527 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 12396888 - 12396684
Alignment:
Q  527 ctatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttg 626  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| |||||    
T  12396888 ctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacagaaggaattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttg 12396790  T
Q  627 cgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgt 723  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |  ||||||| | ||| |||||| ||||||||| || |||||    
T  12396789 cgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgtaaggtgatcttcaaggaagcatgagatgtcctgtggtgaagatgttatggtgaatgcttgt 12396690  T
Q  724 ggaact 729  Q
    ||||||    
T  12396689 ggaact 12396684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 376 - 733
Target Start/End: Original strand, 10113952 - 10114308
Alignment:
Q  376 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgag 475  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||||  ||||| || | ||||||||  |||| | ||||  ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  10113952 tcagtctgaagaggcgggagtaagaatacttgtgatcaacct-ttgaggtggtgttttagggtgaaagacaaagtgtgatgtacgcattttctagttgag 10114050  T
Q  476 aggttggaa--gctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggattt 573  Q
      ||||  |  ||||||||| || ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||| |||||||| ||| ||    
T  10114051 --gttgacaacgctcagcttgaggtggagttaaacacaccgggaatggtacgactatggaga-ccttgggtgttattctttagttgtgagcaatggaatt 10114147  T
Q  574 cttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatctt 673  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| ||  |||||||||||||  ||   |||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10114148 cttcatgaagacataagacattccggagtttgaagaatgtatggcatggcttgtgggattgccctaaaataccaagggtgattggatggaaggagatctt 10114247  T
Q  674 caaggaaacgggagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10114248 caaggaagcgggagacgttccgtggttgaagaggttatggtatatacttgtggaactacct 10114308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 282 - 412
Target Start/End: Original strand, 36379206 - 36379336
Alignment:
Q  282 tgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcc 381  Q
    |||||||| |||| ||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36379206 tgttgtttggaggatgaagaagacgatttttctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcc 36379305  T
Q  382 tggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36379306 tggagaggcggtggtaataatactcatgatc 36379336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 5136665 - 5136914
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  5136665 gagatggtggacaaggcgaggagtgccattgtcttgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtcta 5136764  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  5136765 agttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 5136864  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||    
T  5136865 gcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgagg 5136914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 5872388 - 5872637
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || || || | |||||| || ||| | |||||||||||||    
T  5872388 gagatggtggacaaggctatgagtgccattgtcttgtgcctcggtgacaaagttttgagggaggtcgcgaaggaaccaaccgcgccgtcgatgtggtcaa 5872487  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || |  ||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  5872488 agttggagtcgttgcatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaaatctactcattcaagatggtggagtcaaagaccatgatgga 5872587  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || | | | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5872588 gcaattaatggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgagg 5872637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 296 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 12399821 - 12399706
Alignment:
Q  296 tgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtgg 395  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12399821 tgaagaaggtgatgcgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaggcggtgg 12399722  T
Q  396 taagaatactcatgat 411  Q
    ||||||||||||||||    
T  12399721 taagaatactcatgat 12399706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 52094886 - 52094708
Alignment:
Q  83 ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattc 182  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52094886 ggaacctaccgcggcatcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattc 52094787  T
Q  183 aagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    ||||||| ||| |||||| || | |||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52094786 aagatggtggattcaaagaccgtgatggagcaattgacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgagg 52094708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12743523 - 12743274
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| || || |||||||| || || |  | |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  12743523 gagatggtggacaaggctagaagtgccattgtcgtgtgcctcggtgacaaagttttgagggatgtcgtgaaggaacctaccgcggcgtcgatgtggtcaa 12743424  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    ||||  |||  ||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  12743423 agttgaaatcattgtatatgaccaagtctttggcttataggcaattccttaagaaacaactatactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 12743324  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || | ||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12743323 gcaattaacggagttcaacaaaatctttgatgatttggagaacattgagg 12743274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 296 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12402096 - 12401980
Alignment:
Q  296 tgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtgg 395  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12402096 tgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaagcggtgg 12401997  T
Q  396 taagaatactcatgatc 412  Q
    |||||||||||||||||    
T  12401996 taagaatactcatgatc 12401980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 7123281 - 7123530
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| |  ||||||||||| ||||| |    
T  7123281 gagatggtggacaaggcgaggagcgccattgtcttgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaacgcggcatcgatatggtcta 7123380  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  7123381 agttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 7123480  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||    
T  7123481 gcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgagg 7123530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 8393992 - 8394240
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||  ||||||| || || || | |||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  8393992 gagatggtggacaaggcgaggagcgccattgtcttgtgcctcggggataaa-ttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtcta 8394090  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  8394091 agttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattcctcaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 8394190  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||    
T  8394191 gcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgagg 8394240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 269 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 34571579 - 34571440
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||| ||| |||||||  | |||||||||||| | |||||||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  34571579 tgctttggtggtgagttgttgggaggatgatgaaggtggggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctagagagacgttaaaca 34571480  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcat 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  34571479 ctcaacatcagcctggagaggtggtgtgaagaatactcat 34571440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 347 - 412
Target Start/End: Original strand, 36770496 - 36770561
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36770496 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaggcggtggtaagaatactcatgatc 36770561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12740713 - 12740573
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    |||||||  |||| ||||||  |||| ||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||| ||  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12740713 tgctttggcggtgagttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtgatcgtctggagagacgttaaaca 12740614  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  12740613 ctcaacatcatcctggataggcggtgagaagaatactcatg 12740573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12748919 - 12748779
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    |||||||  |||| ||||||  |||| ||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||| ||  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12748919 tgctttggcggtgagttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtgatcgtctggagagacgttaaaca 12748820  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  12748819 ctcaacatcatcctggataggcggtgagaagaatactcatg 12748779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 261
Target Start/End: Original strand, 26558309 - 26558531
Alignment:
Q  40 attgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagt 138  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| || || || |||  |||||| || ||||||| ||| ||||||||||| || |  ||||| ||||| |  |    
T  26558309 attgtcttgtgcctcgaggataaagttttaagggatgtcgcaaaggaaccaaccgcggcatggatatggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccatat 26558408  T
Q  139 ctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatcct 238  Q
    | |||||| ||  |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||  ||||||||| | ||||    
T  26558409 ccttggcttatatgcaatttcgaaagcatcaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcactgagcaactcacatagttcaacaaattcct 26558508  T
Q  239 tgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    ||| || ||||| || |||||||    
T  26558509 tgaagatttggaaaatattgagg 26558531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 296 - 733
Target Start/End: Original strand, 26558917 - 26559351
Alignment:
Q  296 tgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtgg 395  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||  | |||||| |||||| || | |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |  ||    
T  26558917 tgaagaaggtgatgtctctcacctttggactgatgccttatagagcggcggtcgtttgtacagacattaaacactcaacatcagcctgaagagttgacgg 26559016  T
Q  396 taagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagcttta 495  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||| |||  || || ||||| ||| || ||||||| ||||||      | ||||||| | | |    
T  26559017 taagaatactcatgatcaacct-ttgaggtggagtttcaaagtgaaagtcatagtgg-atgcacgcatttgcaagttgatgtagagaaagctcatcgtaa 26559114  T
Q  496 gttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcatt 595  Q
    | |||||||||  ||||   ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| || |||||   | || || | |||||  | |||||||    
T  26559115 ggtggagttgatgacaccataaatggtacaactatggag-accttgggtgctaggctctagttgttagcaacataatttttgaagaagataggaggcatt 26559213  T
Q  596 ccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccg 695  Q
       ||  |||||| ||||||  ||  ||||| | |||||  ||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |    
T  26559214 tatgagtttgaagtatgtatggcatgacttgtgtgatta-tctaaaagatcaagggtgattggatgcaaggagatcttcacggaagcgggagacgttctg 26559312  T
Q  696 t-gttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    | |||||||||| | ||||| |||||| || ||||||||    
T  26559313 tggttgaagaggatttggtgtatacttatgaaactacct 26559351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 347 - 412
Target Start/End: Original strand, 8394685 - 8394750
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8394685 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatgatc 8394750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5207258 - 5207009
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||| |  |  ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || |  | |||||  || ||  |||||   ||| |||    
T  5207258 gagatggtggacaaaggaatgagtgctattgtattgtgcctcggggataaagtgttgagggatgttgtgaaggaacgtaccgcaacatcggcatgggcaa 5207159  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| | |  || |||| || | |||||    
T  5207158 agttggagtctttgtatatgacaaagtctttggctcatagacaaatcctaaatcaacaaatctactcatttaagatagtgaggttaaagaccgtaatgga 5207059  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||| |||| |||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||    
T  5207058 gcaactaacgacgttcaacaaaatcctttatgatttagagaacattgagg 5207009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 347 - 408
Target Start/End: Original strand, 7123975 - 7124036
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcat 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7123975 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcat 7124036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 629 - 713
Target Start/End: Original strand, 36379781 - 36379865
Alignment:
Q  629 ggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36379781 ggattaccctaaaaatccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgttctgtattgaagaggttatggt 36379865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 406
Target Start/End: Original strand, 5137359 - 5137418
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactc 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5137359 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactc 5137418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 381 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 12399701 - 12399607
Alignment:
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgag 475  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12399701 ctggagaggcggagggaacaatactcatgatctacatgttaaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgag 12399607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 350 - 412
Target Start/End: Original strand, 47565621 - 47565683
Alignment:
Q  350 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  47565621 tctggagagacgttaaacactcaacatcaacctgaagaggcagtggtaagaatactcatgatc 47565683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 200
Target Start/End: Original strand, 4588636 - 4588713
Alignment:
Q  123 ttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaag 200  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4588636 ttgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaattctactcattcaagatggtggagtcaaag 4588713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 514 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 12740436 - 12740219
Alignment:
Q  514 ggaaatggtacgactatggagaacctagggtgct-atgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatg 612  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||| | |||||||||| || |||| | || |||||||||| |||||||| |||||| |   ||||||||||    
T  12740436 ggaaatggtacaactatggagg-ccttgggtgtttatgctctagttgtaagcacgtgaattcttcatgaggacggaagacattccggggtttgaagaatg 12740338  T
Q  613 tataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt-gttgaagaggttatg 711  Q
    |||       |||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | | ||    
T  12740337 tatggtgtggcttgtgtgattacc-taaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagatggtttg 12740239  T
Q  712 gtggatacttgtggaactac 731  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  12740238 gtgtatacttgtggagctac 12740219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 514 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 12748642 - 12748425
Alignment:
Q  514 ggaaatggtacgactatggagaacctagggtgct-atgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatg 612  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||| | |||||||||| || |||| | || |||||||||| |||||||| |||||| |   ||||||||||    
T  12748642 ggaaatggtacaactatggagg-ccttgggtgtttatgctctagttgtaagcacgtgaattcttcatgaggacggaagacattccggggtttgaagaatg 12748544  T
Q  613 tataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt-gttgaagaggttatg 711  Q
    |||       |||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | | ||    
T  12748543 tatggtgtggcttgtgtgattacc-taaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagatggtttg 12748445  T
Q  712 gtggatacttgtggaactac 731  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  12748444 gtgtatacttgtggagctac 12748425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 541 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 34571278 - 34571088
Alignment:
Q  541 gggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa 640  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||| |||||       |||| | ||||||| |||    
T  34571278 gggtgctatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagactgtatggtctggcttgtgtgattacc-taa 34571180  T
Q  641 aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtggaactac 731  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||| | ||||| | |||| |||| ||||    
T  34571179 aagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacattccgtggttgaagagggtttggtgtagacttatggagctac 34571088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Original strand, 9224981 - 9225147
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  9224981 gcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtgg 9225080  T
Q  193 agtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattga 259  Q
    |||| ||  | |||  |||| |||||||| |||| ||||  || |||||||| ||||  ||||||||    
T  9225081 agtctaaatcaatctcggagcaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattga 9225147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 22045202 - 22045128
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  22045202 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 22045128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 111
Target Start/End: Original strand, 5350500 - 5350573
Alignment:
Q  39 tattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagt-agcacggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || | |||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  5350500 tattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagatgtcaggatggaacctactgcgacatcgatgtgatcaa 5350573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 300 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5206612 - 5206506
Alignment:
Q  300 gaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 399  Q
    |||||||| | ||||||||| || |||||| ||| || || ||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||| |||| || |||||| |||    
T  5206612 gaaggtgacgtttctcacctaggtaatgattccttgtagatcggtggtagtctg-atagacagtaaacactcaacatcagcttggaaagacggtgggaag 5206514  T
Q  400 aatactca 407  Q
    ||||||||    
T  5206513 aatactca 5206506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 16624582 - 16624685
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |  ||||||||||| || || ||||||||| || || || | || ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  16624582 gcggcatcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatcgttggctcataggaaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtgg 16624681  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  16624682 agtc 16624685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 11007054 - 11006980
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  11007054 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggt 11006980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 22781223 - 22781149
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  22781223 aaaagccaagggtgattgagtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 22781149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 517 - 615
Target Start/End: Original strand, 54882051 - 54882148
Alignment:
Q  517 aatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtat 615  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||  |||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  54882051 aatggtacgactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagagtacgggaggcattcccggggttgaagaatgtat 54882148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 636 - 697
Target Start/End: Original strand, 5137679 - 5137740
Alignment:
Q  636 cctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtg 697  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  5137679 cctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggaggcgggagacgttccgtg 5137740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 517 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 35371622 - 35371562
Alignment:
Q  517 aatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttca 578  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  35371622 aatggtacgactatgga-aaccatgggttctatgctctagttgtgagcaagggagttcttca 35371562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Original strand, 5350578 - 5350681
Alignment:
Q  154 aattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaa 253  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||  ||||||   ||||||||| | |  ||||||| | ||||||    
T  5350578 aattcttaaaacaacaactctactcatttaagaaggtggagtcaaatgccgtcatggaccaacttatagagttcaacaaattttttgatgattgggagaa 5350677  T
Q  254 catt 257  Q
    ||||    
T  5350678 catt 5350681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 640 - 706
Target Start/End: Original strand, 5100382 - 5100448
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagagg 706  Q
    ||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  5100382 aaaagccaagggtgattaggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtctcgtattgaagagg 5100448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 9174957 - 9174883
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | |||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  9174957 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagctggagatatctcgtattgaagaggttatggt 9174883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 16932632 - 16932558
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| |  | | ||||||||||||||||    
T  16932632 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcatattgaagaggttatggt 16932558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 409
Target Start/End: Original strand, 47565681 - 47565715
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47565681 atcagcctggagaggcggtggtaagaatattcatg 47565715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 42191518 - 42191445
Alignment:
Q  126 tacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaa 199  Q
    |||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| | |||||||||    
T  42191518 tacatgaccaagtcgttggttcatagtcaattcctaaaacaaaaactctactcatttaggatagtggagtcaaa 42191445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 83 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 15534169 - 15533500
Alignment:
Q  83 ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattc 182  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  15534169 ggaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaagtcctaaagcaacaactttactcattc 15534070  T
Q  183 aagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg------------atgcaaatg 270  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||||||  ||||  | ||||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||            ||||   ||    
T  15534069 aagatggtagagtcaaaaaccatcatggagctacttgtggagttcgacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgcgggtg 15533970  T
Q  271 ctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaac 367  Q
    || ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15533969 ctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccatgagagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttatac 15533870  T
Q  368 actcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgc 467  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||| |    
T  15533869 actcaacatcagcctagagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttaaggtagagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacattttc 15533770  T
Q  468 tagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaag 567  Q
    ||||||||     | | ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||| |    
T  15533769 tagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgagtgttatgctctagtggtgagcacg 15533670  T
Q  568 ggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtga-ttggaggca 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||    
T  15533669 ggatttcttcatgaagacggaaggcattccaaaggttgaagaatgtatagcacaacttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgatttggatgca 15533570  T
Q  664 aggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||| || |||||| || |||||||||||||||    
T  15533569 aggagaccttcaaggaagcgggagatgtcttgtgttgaagatgtcatggtgaatgcttgtggaactacct 15533500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 26067413 - 26066981
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26067413 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctactggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 26067314  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||| |||||||||||||||         
T  26067313 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttcaaggttgaagac--agtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 26067216  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  26067215 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat- 26067119  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
                      ||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||   || |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26067118 ------------------gaagttggagaatgtgtagcacagcttgcgggattactctaaaagaatgccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaag 26067037  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| | |||||||||| | |||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||    
T  26067036 gaagcaggagatgttctgcgttgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacct 26066981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Original strand, 33310150 - 33310584
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33310150 gtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagtggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 33310249  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||         
T  33310250 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 33310349  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  33310350 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctaggctcta-tggtgagcaagggatttcttcat- 33310446  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
                      ||||||| ||||||| || |||  |||||| |||||| ||||   || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33310447 ------------------gaagttggagaatgtgtagcacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaag 33310528  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| | |||||||||| | |||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||    
T  33310529 gaagcaggagatgttctgcgttgaagatggtatggtgaatgcttgtgggactacct 33310584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 3395366 - 3395726
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3395366 atcagtctggagaggcggagacaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgtagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 3395465  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | |  |||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3395466 gctagagtaccctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggttagcaagggatttc 3395564  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||  ||| | |||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||| ||| |    
T  3395565 ttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatttatatcacgtctttctggattaccctaaaaaaaggtcaagggtgattggatgcaagaagacc 3395664  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  3395665 ttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgtttgtggaactacct 3395726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 3631581 - 3631166
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||| | || || |||||||||||| |||    
T  3631581 gagatggtggacaaggccaggagtgtcattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagaaaagtagcgaaggaatccaccgcagcatcgatgtggccaa 3631482  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  3631481 agttggaagctttgtatatgacaaagtctttgactcatcaacaattcctaaagcaataactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggccatcatgga 3631382  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaaca------------ttgaggatgcaaatgctttgatggt---gtgttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||    ||||||| | |||| ||| ||| ||||||||||            |||||||||   ||||| |||||||   ||||||||| |||| |    
T  3631381 gctacttgtagagttcaataaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtggatgctctgatggtgtggtgttgtttggaggat 3631282  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3631281 gaagaaggtgatgtgtctcaccttgggggtgatgcctagtggagcggtggttgtctggagagacgttaaacactcaacatcaacctggagaggcggtggt 3631182  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||| ||||||||    
T  3631181 aagaatagtcatgatc 3631166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 394
Target Start/End: Original strand, 26944165 - 26944562
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||| | |||||| || ||| |||||||||||||||    
T  26944165 gagatggtggacaaggcccggagtaccattgtcttgtgcctcggaaataaagttttgagagatatagcgaaggaaccaaccgcgccatcgatgtggtcaa 26944264  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  26944265 agttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggcttatcgacaattcctaaagcgacaactttaataattcaagatggtagagtcaaaggccatcataga 26944364  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacat---------------tgaggatgcaaatgctttgatggtgtgttgtttcgaggtt 296  Q
    |||  ||  | |||||||||||||||||||| |||||||  | ||               ||||||| |||||| |||  |||||||||||||  ||| |    
T  26944365 gaactttgtggagttcaacagaatccttgataacttggattatattgtctctgagggttatgaggatacaaatgttttcgtggtgtgttgtttaaaggat 26944464  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtg 394  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26944465 gaagaaggtgatgtttttcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcggtg 26944562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26932201 - 26931952
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||| ||||| |||    
T  26932201 gagatggtggacaaggccaggagtgccgttgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgttgtgggcaa 26932102  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    ||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26932101 agttgaaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaagatggaagagtcaaaggccatcatgga 26932002  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26932001 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 26931952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 33309530 - 33309779
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || || |||||||| ||| |||    
T  33309530 gagatggtggacaaggccaggagtgtcgttgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcagcatcgatatgggcaa 33309629  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  33309630 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 33309729  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33309730 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 33309779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 17012704 - 17012944
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| | || | |||||||| |||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17012704 gagatggtggacaaggccatgattgctattgtcttgtgcctcgagaattaagttttgagggaagtagcaaaggaaccaactgcgacatcgatgtggtcaa 17012803  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17012804 agttcgaatatttgtatatgataaagtctttggctcatcggcaattccaaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatgga 17012903  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaa 253  Q
    ||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17012904 gaaacttgcggagttcaa-aaaatccttgatgacttggagaa 17012944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25463103 - 25462854
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |  ||||||||||||| || ||    
T  25463103 gagatggtagacaaggccaagagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagatgtagcgaaagaaccaaacgcggcatcgatgtagttaa 25463004  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    ||||  | | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25463003 agttatagtctttgtatatgacaaagtcttaggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatgga 25462904  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25462903 gcaacttacggagttcaacaaaatctttgatgacttggagaatattgagg 25462854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26068033 - 26067784
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  26068033 gagatggtggacaaggccaggagtgtcgttgtcttgtgcctcggggataaagttttgatagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaa 26067934  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||    
T  26067933 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcagcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcattga 26067834  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26067833 gcaacttacggagttcaaaaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 26067784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 400 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 3631143 - 3630789
Alignment:
Q  400 aatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttg 499  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||     | | ||||| ||| || ||    
T  3631143 aatactcatgatctacctgttgaggtggactttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacttgaggtg 3631044  T
Q  500 gagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccag 599  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3631043 gagttgaacacaccggtaatggtatgactttggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagacattccgg 3630945  T
Q  600 aagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa----------------------aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
    | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||                      || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3630944 aggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaggccgcgggattaccctaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaag 3630845  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  3630844 gaagcgggatatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 3630789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12936884 - 12936652
Alignment:
Q  16 atggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagt 114  Q
    |||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  12936884 atggtggataaggtcatgagtgtcattgtcttgtgccttagggataaagttttgagagatgtagcgaaagaaccaaccgcgccatcgatgtggtcaaagt 12936785  T
Q  115 tcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaa 214  Q
    | || | |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  12936784 tggagtctttgtatatgacaaaatctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactctactcatttaagatggtggagttaaaggccatcatggagca 12936685  T
Q  215 acttacgaagttcaacagaatccttgatgactt 247  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  12936684 acttacggagtttaacaaaatccttgatgactt 12936652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5408664 - 5408415
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||  || ||| |||||||||||||||    
T  5408664 gagatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaactaaccgcgacatcgatgtggtcaa 5408565  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  5408564 agttggagtcgttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 5408465  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5408464 gcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagatcattgagg 5408415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5412989 - 5412740
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||  || ||| |||||||||||||||    
T  5412989 gagatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaactaaccgcgacatcgatgtggtcaa 5412890  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  5412889 agttggagtcgttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 5412790  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5412789 gcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagatcattgagg 5412740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 12157892 - 12158141
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  |||||||| ||||||||||| || |||||| | || || || | |||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  12157892 gagatggtggacaaggctaggagtgacattgtcttatgcctcggggaaaaagttttgggggatgtcgctaaggaaccaaacgcgacatcgatgtggtcaa 12157991  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  12157992 agttggagtcattgtatatgacaaagtctttggctcattggcaattcctaaagcaagcactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccaccatgga 12158091  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    |||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12158092 gaaacttacagagttcaacaagatccttgatgatttggagaacattgagg 12158141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 291 - 412
Target Start/End: Original strand, 3395247 - 3395368
Alignment:
Q  291 gaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggc 390  Q
    |||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3395247 gaggatgaagaatgtgatgtgtctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggc 3395346  T
Q  391 ggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3395347 ggtggtaagaatactcatgatc 3395368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 16553249 - 16553498
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||| ||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  16553249 gagatcgtggacaaggcgaggagcgccattgtcttgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtcta 16553348  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  16553349 agttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 16553448  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16553449 gcaattggcggagttcaacaagatccttgatgacttggagaacattgagg 16553498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 16629805 - 16630054
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||| ||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  16629805 gagatcgtggacaaggcgaggagcgccattgtcttgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtcta 16629904  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  16629905 agttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 16630004  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16630005 gcaattggcggagttcaacaagatccttgatgacttggagaacattgagg 16630054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 212
Target Start/End: Original strand, 3395070 - 3395237
Alignment:
Q  46 ttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttgg 144  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| || || |||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3395070 ttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtggcaaaggaaccaaccgccgcatcgatgtgtgcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttgg 3395169  T
Q  145 ctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggag 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  3395170 ctcattggcaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcacggag 3395237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 34165457 - 34165706
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || || || |||||| ||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  34165457 gagatggtggacaaggcgaggagcgccattgtcctgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaactgcggcatcgatatggtcta 34165556  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  34165557 agttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 34165656  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||    
T  34165657 gcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgagg 34165706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12911193 - 12910976
Alignment:
Q  16 atggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagt 114  Q
    |||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  12911193 atggtggataaggtcatgagtgtcattgtcttgtgcctcagggataaagttttgagagatgtagcgaaagaaccaaccgcgccatcgatgtggtcaaagt 12911094  T
Q  115 tcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaa 214  Q
    |               ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  12911093 t---------------gacaaagtctttggctcattgggaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagttaaaggccatcatggagca 12911009  T
Q  215 acttacgaagttcaacagaatccttgatgactt 247  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  12911008 acttacggagtttaacaaaatccttgatgactt 12910976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 30443935 - 30444183
Alignment:
Q  14 agatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||  ||||||| ||  ||||||||||  |||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  30443935 agatggtggacaaggccagaagtgtttttgtcttatggttcggggacaaaattttgagagatatagcgaaggaaccaaccacggcatcgatgtggtcaaa 30444034  T
Q  113 gttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggag 212  Q
    ||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| | | |  |||||||||||    
T  30444035 gttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcatagacaatttctaaagccacaactctactcatttaagatgatggatttatacaccatcatggag 30444134  T
Q  213 aaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||    
T  30444135 caacttacgaagttcaacaaaatcctttataatttggagaacattgagg 30444183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 260 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 5408066 - 5407917
Alignment:
Q  260 ggatgcaaatgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagaga 359  Q
    |||||||  ||||||| ||||| ||||||  ||||  || |||||||| | |||||||||||| | |||||||| || ||| |||| |||||||||||||    
T  5408066 ggatgcaggtgctttggtggtgagttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagaga 5407967  T
Q  360 cgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5407966 cgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 5407917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 260 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 5412391 - 5412242
Alignment:
Q  260 ggatgcaaatgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagaga 359  Q
    |||||||  ||||||| ||||| ||||||  ||||  || |||||||| | |||||||||||| | |||||||| || ||| |||| |||||||||||||    
T  5412391 ggatgcaggtgctttggtggtgagttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagaga 5412292  T
Q  360 cgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5412291 cgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 5412242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 261
Target Start/End: Original strand, 16651580 - 16651759
Alignment:
Q  83 ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattc 182  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16651580 ggaaccaaccgcggcatcgatatggtctaagttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattc 16651679  T
Q  183 aagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggaga-acattgagg 261  Q
    ||||||| |||||||||| || | |||||| || |  || |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16651680 aagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaagatccttgatgacttggagacacattgagg 16651759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 296 - 409
Target Start/End: Original strand, 30444564 - 30444677
Alignment:
Q  296 tgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtgg 395  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30444564 tgaagaaggtgatgattcttgccttgggagtgatgctttgtagagcggtggtcgtctggagagacattaaacactcaacatcagcatggagaggcggtgg 30444663  T
Q  396 taagaatactcatg 409  Q
     ||||||| |||||    
T  30444664 gaagaatattcatg 30444677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 269 - 409
Target Start/End: Original strand, 11137321 - 11137461
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| ||||||||||||   | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  11137321 tgctttggtggtgtgttgttggtacgatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggaatgatgccttatagagcggtgatcgtctatagagacgttaaaca 11137420  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11137421 ctcaacatcattctggaaaggcggtgggaagaatactcatg 11137461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 512 - 616
Target Start/End: Original strand, 26944594 - 26944698
Alignment:
Q  512 ctggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaat 611  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  26944594 ctgggaatggtacgactgtggaggaccttgggggctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaatgcattccggaggttgaagaat 26944693  T
Q  612 gtata 616  Q
    |||||    
T  26944694 gtata 26944698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 300 - 409
Target Start/End: Original strand, 16568184 - 16568293
Alignment:
Q  300 gaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 399  Q
    |||||||| | |||||||||||| | |||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16568184 gaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgttcatctggaaagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaac 16568283  T
Q  400 aatactcatg 409  Q
    ||||||||||    
T  16568284 aatactcatg 16568293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 541 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 28038726 - 28038602
Alignment:
Q  541 gggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa 640  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  28038726 gggtgctatggtctagtggtgaggaaggggattcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcatgacttgtgggattaccctaa 28038627  T
Q  641 aaagccaagggtgattggaggcaag 665  Q
    |   |||||||||| |||| |||||    
T  28038626 acgaccaagggtgaatggatgcaag 28038602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 507
Target Start/End: Original strand, 17012957 - 17013036
Alignment:
Q  428 agtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaa 507  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  17012957 agtttcaaggtggaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgagaggtagaaagctcagctttaggtggagttgaa 17013036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 409
Target Start/End: Original strand, 16553943 - 16554005
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16553943 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatg 16554005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 409
Target Start/End: Original strand, 16630499 - 16630561
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16630499 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatg 16630561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 409
Target Start/End: Original strand, 16652205 - 16652267
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16652205 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatg 16652267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 517 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 10456318 - 10456160
Alignment:
Q  517 aatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtata 616  Q
    ||||||||||||||||||| | | || || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||     |||||||||||||||     
T  10456318 aatggtacgactatggaga-ctttggatgttatgctctagttgtgagcaagggaattcttcaagagaacggaagacattttgtgagttgaagaatgtatg 10456220  T
Q  617 acacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  10456219 gcacaacttgtgggatta-cctaaaagaccaagggtgattggatgtaaggagatattcaag 10456160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 406
Target Start/End: Original strand, 34166151 - 34166210
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactc 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34166151 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactc 34166210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 11137212 - 11137280
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagca 81  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11137212 gagatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcagggataaagttttgagagatgtagca 11137280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 196
Target Start/End: Original strand, 33331026 - 33331126
Alignment:
Q  96 gcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagt 195  Q
    |||||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||  || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33331026 gcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgatgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagt 33331125  T
Q  196 c 196  Q
    |    
T  33331126 c 33331126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 646 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 30729616 - 30729529
Alignment:
Q  646 caagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| || | ||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  30729616 caagggtgattggatgcaaggtaatcttcaaggaagcgggagacgtcctgtgttaaagatgttatggtgaatgcttgtgtaactacct 30729529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Original strand, 14738149 - 14738315
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||| | | ||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  14738149 gcggcatcgatgttggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgatgg 14738248  T
Q  193 agtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattga 259  Q
    |||| ||  | |||  |||| |||||||| |||| ||||  || |||||||| ||||  ||||||||    
T  14738249 agtctaaatcgatctcggagcaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattga 14738315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 483 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 24543597 - 24543487
Alignment:
Q  483 aagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaa 582  Q
    ||||||| ||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||  || |||||||||||| ||||||| ||     
T  24543597 aagctcaacttgaggtggagttgatgacactggaaatggtacaactatggag-accttgggttctaggctc--gttgtgagcaagggagttcttcaagag 24543501  T
Q  583 gacggaaggcattc 596  Q
    |||| |||||||||    
T  24543500 gacgaaaggcattc 24543487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 695 - 733
Target Start/End: Original strand, 26944708 - 26944746
Alignment:
Q  695 gtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26944708 gtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 26944746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 640 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 3630692 - 3630621
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatg 711  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||    
T  3630692 aaaagccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcacgtattgaagatgttatg 3630621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 26066884 - 26066810
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||    
T  26066884 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattaaagaggttatggt 26066810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 33310681 - 33310755
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  33310681 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggt 33310755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10456559 - 10456494
Alignment:
Q  342 ggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactca 407  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||  |||||||||||    
T  10456559 ggtgttcgtctggagagacattaaacactcaacatcatcctagagaagtggtgcgaagaatactca 10456494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 668 - 731
Target Start/End: Original strand, 16568486 - 16568550
Alignment:
Q  668 gatcttcaaggaaacgggagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtggaactac 731  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  16568486 gatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagagggtttggtgtatacttgtggagctac 16568550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 376 - 596
Target Start/End: Original strand, 30444679 - 30444896
Alignment:
Q  376 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgag 475  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||  || || ||||| || |||| |||||  | |||||    
T  30444679 tcagtctgaagaggcggaggtaagaatactcatgatcaatct-ttgaggtggagtttcaaggtgaaagtcatagtgg-atatacatatttggaacttgag 30444776  T
Q  476 aggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttct 575  Q
         | ||| ||||||| || |||||||||  || |||  | |||||||||||||||| || | ||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||    
T  30444777 gtagagaaaggtcagcttgaggtggagttgatgacgctgatagtggtacgactatggag-acattgggtgctagtctctagttgtgagcaagagaattct 30444875  T
Q  576 tcatgaagacggaaggcattc 596  Q
    ||| || ||| ||||||||||    
T  30444876 tcaagaggacagaaggcattc 30444896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 261
Target Start/End: Original strand, 16567733 - 16567808
Alignment:
Q  186 atggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    |||| |||||||||| || | |||||| || |  || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16567733 atggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgagg 16567808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18232340 - 18232275
Alignment:
Q  123 ttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatg 188  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || || || | || ||||||||||| ||||||||||||    
T  18232340 ttgtacatgacaaaatcgttggctcataggaaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatg 18232275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 636 - 697
Target Start/End: Original strand, 34166471 - 34166532
Alignment:
Q  636 cctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtg 697  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  34166471 cctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtg 34166532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 70)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 31737114 - 31736395
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  |||||  || |||||||||||||||||||    
T  31737114 gagatggtggacaaggccaagagtgccattgtcttgtgcctcgggtataaagtttcgagagaagcagcaaaggaacgaaccgcggcatcgatgtggtcaa 31737015  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  31737014 agttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatgga 31736915  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacatt------------gaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||            ||||||||   |||| ||||||||||   |||||| |||| |    
T  31736914 gctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggat 31736815  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31736814 gaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtgaagcggtggtcgtttggagagacgttaaacactcaacattagcctggagaggcggttgt 31736715  T
Q  397 aagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttag 496  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||     | | ||||||| | ||    
T  31736714 aagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgag 31736615  T
Q  497 ttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattc 596  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                     
T  31736614 gtggagttgaacacaccggtaatggtacggctatggagaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat----------------- 31736533  T
Q  597 cagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttc 693  Q
      || ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||   || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  31736532 --gaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattactctaaaagaaggccaagggtgataggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcc 31736435  T
Q  694 cgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
     | |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  31736434 tgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 31736395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Original strand, 51751298 - 51751733
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51751298 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 51751397  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||         
T  51751398 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 51751497  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  51751498 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat- 51751595  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
                      ||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||| ||||   || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  51751596 ------------------gaagttggagaatgtatagcacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaag 51751677  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
T  51751678 gaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtagaactacct 51751733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Original strand, 6996225 - 6996640
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||| || || ||| |||||||||||||||    
T  6996225 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtacctcggggataaagttttgagagaagtaacaaaggatccaaccgcgacatcgatgtggtcaa 6996324  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||    
T  6996325 agttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaagaccatcatgga 6996424  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattga------------ggatgcaaatgctttgatggt---gtgttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||            ||||||   |||| |||||||   ||||||||| |||| |    
T  6996425 gctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttggggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggat 6996524  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996525 gaagaaggtgatgtgtctcacatttggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 6996624  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  6996625 aagaatactcatgatc 6996640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 376 - 733
Target Start/End: Original strand, 16430002 - 16430361
Alignment:
Q  376 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgag 475  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||    
T  16430002 tcagtctggagaggcggatgtaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggtatgtacgctttt-ctagttgag 16430100  T
Q  476 aggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttct 575  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16430101 aggatggaagctcagcttaaggtggagttgaacacaccagtaatggtacggctatggaggaccttggatgttatgctctagtggtgagcaagggatttct 16430200  T
Q  576 tcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatct 672  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16430201 tcatgaagacggaaggcattccgaaggttggagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagatct 16430300  T
Q  673 tcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16430301 tcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaggttatggtgaatgcttgtggaactacct 16430361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 50078432 - 50078017
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  50078432 gagatggtggacaaggccaagagtgccattgtcttgtgcctcgggaataaagtttcgagagaagtagcgaaggaaacaactgcggcatcaatgtggtcaa 50078333  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  50078332 agtttgaatatttgtatatgacaaaatcttgggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagattatagagtcaaaggccatcatgga 50078233  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgag------------gatgcaaatgctttgatggt---gtgttgtttcgaggtt 296  Q
    | |||||||| ||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||            ||||||  |||| |||||||   ||||||||| |||| |    
T  50078232 gcaacttacggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttggagatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggat 50078133  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50078132 gaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgattcctattggagtggttgtcttctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 50078033  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  50078032 aagaatactcatgatc 50078017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 31424259 - 31423901
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| | | ||| | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  31424259 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcattatctacctgttgaggtagagtttcaaggttgaacacataatgggatgtacgcatttgctagttga 31424160  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31424159 gaggttggaagctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatagtacgactatgggggaccttgggtgctatgctcta--ggtgagcaagggatttc 31424062  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa--gccaagggtgattggaggcaaggagatct 672  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31424061 ttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtattgcacggcttgcgggattaccctaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatct 31423962  T
Q  673 tcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  31423961 tcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagagattatggtgaatgcttgtggaactacct 31423901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 257 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 27338175 - 27337713
Alignment:
Q  257 tgaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 353  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27338175 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgattcctagtggagcggtggtcgtctg 27338076  T
Q  354 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||     
T  27338075 gagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggg 27337976  T
Q  454 atgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctc 553  Q
    |||||| |||||||||||||||     | | |||||||   || ||||||||||||||| || |||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27337975 atgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgcgaggtggagttgaacacaccggtaatgtttcgactatggaggaccttgggtgctatgctc 27337876  T
Q  554 tagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagg 650  Q
    || |||||||||| ||||||||||||                   |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   || |||||||    
T  27337875 ta-tggtgagcaatggatttcttcat-------------------gaagttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaagaaggccaagg 27337796  T
Q  651 gtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | | |||||||| ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  27337795 gtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtaggactacct 27337713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 257 - 733
Target Start/End: Original strand, 47178596 - 47179058
Alignment:
Q  257 tgaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 353  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47178596 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 47178695  T
Q  354 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||     
T  47178696 gagagacgttaaacactcaacatcaacctagagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggg 47178795  T
Q  454 atgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctc 553  Q
    |||||| |||||||||||||||     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  47178796 atgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctc 47178895  T
Q  554 tagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagg 650  Q
    || |||||||||||||||||||||||                   ||||||| |||||||||| |||  |||||| ||| || ||||   || |||||||    
T  47178896 ta-tggtgagcaagggatttcttcat-------------------gaagttggagaatgtatagcacggcttgcgagataactctaaaagaatgccaagg 47178975  T
Q  651 gtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  47178976 gtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacct 47179058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Original strand, 16227429 - 16227863
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16227429 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacacttaacatcagc 16227528  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||| |||||| |||||||||||||||         
T  16227529 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagatatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 16227628  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  16227629 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat- 16227725  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
                      ||||||| ||||||| || |||  |||||| |||||| ||||   || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16227726 ------------------gaagttggagaatgtgtagcacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaag 16227807  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  16227808 gaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 16227863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 281 - 730
Target Start/End: Original strand, 20301392 - 20301824
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20301392 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 20301491  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||         
T  20301492 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgtcgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtaga 20301591  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || |||||||||||||||  | ||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||     
T  20301592 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccagtaatggtacggctatgaaggaccttgagtgctatgctcta-tcgtgagcaaaggatttcttcat- 20301689  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
                      |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  20301690 ------------------gaagttgaagaatgtatagcacggcttgcggaattaccctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatctttaag 20301771  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaacta 730  Q
    ||| |||||||||||  |  ||||||| ||||||||| || ||||||| ||||    
T  20301772 gaagcgggagatgttttgcattgaagatgttatggtgaatgcttgtgggacta 20301824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 14099150 - 14098790
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14099150 atcagtctgaagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttga 14099051  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14099050 ggcagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtatgtctatggaggaccttgggtgttatgctcta-tggtgagcaagggatttc 14098952  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14098951 ttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgtatagcatggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagacc 14098852  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  14098851 ttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 14098790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 51750678 - 51750927
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  51750678 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaa 51750777  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  51750778 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 51750877  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51750878 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 51750927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 25249877 - 25249517
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25249877 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgagttggagttttaaggtggaagacatagtgggatgtacacatttgctaattga 25249778  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | |  |||  ||| || ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25249777 ggtagagtacactctacttgaggtggagttgaacacaccggaaatcgtatgactatggaggaccttgggtgctatgatctagtggtgagcaagggatttc 25249678  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa--gccaagggtgattggaggcaaggagatct 672  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  25249677 ttcatgaagacagaaggcattctggaggttgaataatgtatagcatgacttgcgggattaccctaaaaaaggccaagggtgattggatgcaagatgatct 25249578  T
Q  673 tcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  25249577 tcaaagaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 25249517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 409
Target Start/End: Original strand, 16429589 - 16430000
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||| | || ||||| |||||||||| ||    
T  16429589 gagatagtgaacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcgggaacaatgttttgagagaaatagcgaaggaatctaccgcggcgtcgatgtggttaa 16429688  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    ||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16429689 agttcaagtgtttgtatatgacaaagtctttggctcatcagaaattcctaaagtaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatgga 16429788  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggaga------------acattgaggatgcaaatgctttgatggt---gtgttgtttcgaggtt 296  Q
    | |||||  | ||||||||| || ||||||||| |||||||            |  ||||||||||   |||| || ||||   ||||||||| |||| |    
T  16429789 gcaacttgtggagttcaacaaaacccttgatgatttggagattattgaggtgcatcttgaggatgc-ggtgctctggtggtgtggtgttgtttggaggat 16429887  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16429888 gaaaaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggaacggtggtcttctggagagaagttaaacactcaacatcagcttggagaggcggtggt 16429987  T
Q  397 aagaatactcatg 409  Q
    |||||||||||||    
T  16429988 aagaatactcatg 16430000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 29003609 - 29003194
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||  |||  | ||  || |||| ||||||||||    
T  29003609 gagatggtggacaaggtcaggagtgccattatcttgtgcctcaggaataaagtttcgagagaagtagcaaaggatacaaccacgacatcaatgtggtcaa 29003510  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||| |||||| |    
T  29003509 agttcaaatatttgtatatgacaaaatctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatgca 29003410  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg------------atgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggtt 296  Q
        |||| | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||            |||  | |||| ||||||||||   |||||| |||| |    
T  29003409 actgcttatggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgtgagtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggat 29003310  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29003309 gaagaaggtgatgtgtcacaccttggcagtgatgcctagtggagcggcggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 29003210  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    || |||||||||||||    
T  29003209 aaaaatactcatgatc 29003194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 28202586 - 28202226
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  28202586 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctattgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgttcgcatttgctagttga 28202487  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||||| || ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28202486 ggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacatcggtaatggcacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggttttc 28202388  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  |   |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  28202387 ttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatatcacggcgctcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaagaagacc 28202288  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||    
T  28202287 ttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaaaatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 28202226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 261
Target Start/End: Original strand, 28841090 - 28841312
Alignment:
Q  40 attgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  28841090 attgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagt 28841189  T
Q  139 ctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatcct 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  28841190 ctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatcct 28841289  T
Q  239 tgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  28841290 tgatgacttggagaatattgagg 28841312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28203337 - 28203088
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| |||    
T  28203337 gagatggtggataagtccaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaaccaaccgcggcatcgatgtgggcaa 28203238  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28203237 agttggaatctttgtataagacaaagtctttgactcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaagccatcatgga 28203138  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28203137 gcaactgacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 28203088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25250919 - 25250568
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||  |||| | || |||| ||||||||||| ||    
T  25250919 gagatggtgggcaaggccagaagtgccattgtcttgtgcctcaagaataaagttttgagagaagtagcaaaggaaacaaccgcggtatcgatgtggttaa 25250820  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25250819 agttcaaatatttgtatatggcaaagtctttggctcttcggtaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatgga 25250720  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaaca------------ttgaggatgcaaatgctttgatggt---gtgttgtttcgaggtt 296  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||            ||||||||||   |||| |||||||   ||||||||| |||| |    
T  25250719 gaaacttacggagttcaacaaaatcattgatgatttggacaacattaagctgcaccttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggagggt 25250620  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtc 348  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25250619 gaagaatgtgatgtgtctcaccttgagaatgatgcctagtggagcggtggtc 25250568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 28997893 - 28997478
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||  |||  | ||  || |||| ||||||||||    
T  28997893 gagatggtggacaaggtcaggagtgccattatcttgtgcctcaggaataaagtttcgagagaagtagcaaaggatacaaccacgacatcaatgtggtcaa 28997794  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||| |||||| |    
T  28997793 agttcaaatatttgtatatgacaaaatctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatgca 28997694  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg------------atgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggtt 296  Q
        |||| | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||            |||    |||| ||||||||||   |||||| |||| |    
T  28997693 actgcttatggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgttgatgtttgtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggat 28997594  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28997593 gaagaaggtgatgtgtcacaccttggcagtgatgcctagtggagcggcggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 28997494  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    || |||||||||||||    
T  28997493 aaaaatactcatgatc 28997478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 50078019 - 50077659
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| | ||||| | | | |||||  ||||||||||||||    
T  50078019 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagcttcaaggttgaagacataataggatgtatgcatttgctagttga 50077920  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | |  |||||| | || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50077919 ggtagagtacactcagcgtgaggtggagttgaacacaccgataatggtacgactatggagaaccttggatgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 50077821  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||| |  |    
T  50077820 ttcatgaagacggaaggcattttggaggttaaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaaggtcaagggtgattggatgcaaggtggcc 50077721  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  50077720 ttcaaggaagcgggagatgtcccgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 50077659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 16226809 - 16227058
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  16226809 gagatggtggacaaggccaggagtgccgttgtcttgtgcctcggggataaagttttaagagaagtaacaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaa 16226908  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  16226909 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatgga 16227008  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16227009 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 16227058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 51758175 - 51758424
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| | || ||| ||||||||||| |||    
T  51758175 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaaattttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaa 51758274  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    | || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  51758275 aattggaatctttgtatacgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 51758374  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51758375 gtaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 51758424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 20300773 - 20301021
Alignment:
Q  14 agatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||  || | ||||||||| ||| ||||    
T  20300773 agatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggagataaagttttgagagaagtagcaaaggaacaaaccgtggcatcgatatgggcaaa 20300872  T
Q  113 gttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggag 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  20300873 gttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgtcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggag 20300972  T
Q  213 aaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20300973 caacttacggagttcaacaaaatccttgaagacttggagaatattgagg 20301021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27338771 - 27338522
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcacggaaccgact-gcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  | |  || | ||||||||||||||| |||    
T  27338771 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgccttggggataaatttttgagagaagtagcaaaggaatgaatcgcggcatcgatgtgggcaa 27338672  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27338671 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttgactcattggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatgga 27338572  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  27338571 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggataatattgagg 27338522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 47178003 - 47178252
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||| | |  ||||||||||||||| |||    
T  47178003 gagatggtggacaaggccaggagtgccgttgtcttgtgcctcggggataaagttttaagagaagtagcaaaggaagcaatcgcggcatcgatgtgggcaa 47178102  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  47178103 agttggaatctttgtatatgacaaagtcattggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatgga 47178202  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  47178203 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 47178252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31424660 - 31424257
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||  || ||| ||||||| |||    
T  31424660 gagatggtggacaaggtcaggagtgccattgtcttgtgcctcggggatgaagttttgagagaagtagcaaaggaaccaaccacgacatagatgtgggcaa 31424561  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||            ||||||||||||  ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31424560 agttggaatctttgt------------ctttggctcatcaacaatttctaaagcaacatatttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatgga 31424473  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg------------atgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggtt 296  Q
       ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||            ||||   |||| ||||||||||   |||||| |||| |    
T  31424472 tctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgtgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtattgtttggaggat 31424373  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31424372 gaagaaggtgatgtgtctcatcttgggagtgattcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacacttaacatcagcctggagatgcggtggt 31424273  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  31424272 aagaatactcatgatc 31424257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3805776 - 3805527
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||| || ||| |||||||||||||||    
T  3805776 gagatggtggacaatgccagaagtgtcattgtcttgtgtctcggggataaagttttgagagatatagcgaaggaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaa 3805677  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
     ||| || |  ||||  ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3805676 cgttagagttgttgtttatgaccaaatctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactgtaatcattcaagatggcagagtcaaaggccatcatgga 3805577  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3805576 gcaacttacggagttcaacaaaattcttgatgacttggagaacattgagg 3805527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 385 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 13126616 - 13126271
Alignment:
Q  385 agaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaa 484  Q
    |||||||| ||||||||||||  | |||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||     | ||    
T  13126616 agaggcggaggtaagaatacttgtaatctacct-ttaaggtggagtttcaaggtggaagacatagtgggatgtacgcatttggaagttgaggtagagaaa 13126518  T
Q  485 gctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaaga 584  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  13126517 gctcagctagaggtggagttgaacacactgaaaatggtacgactatagaggaccttgtgt--tatgctctagttgtgagcaaggaaattcttcatgaaga 13126420  T
Q  585 cggaaggcattccagaagtt-gaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacg 683  Q
    |  |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||   |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| || |    
T  13126419 caaaaggcattcc-gaagtttgaagaaagtatagcatggcttgtgggattacgctaaaaaaccaagggtgattagatgcaaggagatcttcaagg-aagg 13126322  T
Q  684 ggagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13126321 ggagatgttccgtggttgaagaggttatggtgtagacttgtggaactacct 13126271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8348703 - 8348465
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | | |||| || | ||| |||||||||||||    
T  8348703 gagatggtagacaaggccatgagtgtcattgtcttatgcctcagggataaagttttgaaagaagtagcgaagaaaccaaccgtggcgtcgatgtggtcaa 8348604  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || | |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8348603 agttagagtctttgtatatgacaaagtctttgggacatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatgta 8348504  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttgga 250  Q
    | |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8348503 gcaacttacggagttcaacaaaatctttgatgacttgga 8348465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 375 - 610
Target Start/End: Original strand, 6996638 - 6996872
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| || ||||||||| || || | |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6996638 atcagtctagagaggcggaggcaacagtactcatgatctacattttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 6996737  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||| | || ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6996738 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcggtaatggtacggctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 6996836  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaa 610  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6996837 ttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaa 6996872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13127373 - 13127124
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| | | |||  || ||| |||||||||  ||||    
T  13127373 gagatggtggacaaagccaggagtgccattttcttgtgcctctgggataaaattttgagagatgtagcgaagtaactaaccgcgacatcgatgtcttcaa 13127274  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |    
T  13127273 agttggagtctttgtatatgacaaattctttggctcatcgacaattcttaaagaaacaactatactcattcaatatggcggagtcaaagatcatcatgta 13127174  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13127173 gcaacttatggagtttaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 13127124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 257 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 28202742 - 28202584
Alignment:
Q  257 tgaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 353  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||   |||||| |||| |||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  28202742 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaataagttgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgatcttctg 28202643  T
Q  354 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28202642 gagagacgttaaacactcgacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 28202584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 31657777 - 31658026
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || || |  | |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  31657777 gagatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcggtgacaaagttttgagggatgtcgtgaaggaaccaaccgcggcgtcgatgtggtcaa 31657876  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || |  ||||| ||||| || ||||||||| || || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |  ||    
T  31657877 agttggagtcattgtatatgaccaaatctttggcttataggaaattccttaagcaacaactttactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgacaga 31657976  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || | ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31657977 gcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgagg 31658026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 269 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 13126767 - 13126631
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13126767 tgctttggtggtgtgttgttgggaggatgaagaaggcgatgtttctcaccttgggagtgatgccttgtagagcggtggtcgtctggagagatgataaaca 13126668  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatact 405  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13126667 ctcaacatcaacttggagaggcggtggtaagaatact 13126631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 50168944 - 50168696
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| | || || |||||||| || || || | |||||| ||  || | ||||| |||||||    
T  50168944 gagatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcagtgacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccacgacgtcgatatggtcaa 50168845  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || | || ||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  50168844 agttggagtctt-gtatatgaccaagtttttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 50168746  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || | | | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50168745 gcaattaatggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgagg 50168696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28222989 - 28222767
Alignment:
Q  40 attgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagt 138  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || || || | |||||| || || |||||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| || |    
T  28222989 attgtcttgtgcctcggtgacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcagcatcgatgtggtcaaagttggtgtcattgtatatgaccaaat 28222890  T
Q  139 ctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatcct 238  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | |  ||| || | ||  ||||||||| ||||||    
T  28222889 ctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgacagagcaattgacagagttcaacaaaatcct 28222790  T
Q  239 tgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  28222789 tgatgatttggagaacattgagg 28222767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 395
Target Start/End: Original strand, 28841650 - 28841764
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28841650 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcgtagtggagcgatggtcgtctggcgagacgttaaacacccaacatcagc 28841749  T
Q  381 ctggagaggcggtgg 395  Q
    |||||||||||||||    
T  28841750 ctggagaggcggtgg 28841764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 423 - 733
Target Start/End: Original strand, 28841760 - 28842053
Alignment:
Q  423 ggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggt 522  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||    
T  28841760 ggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggt 28841859  T
Q  523 acgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaa 622  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |                   |||||||||||| | ||||     
T  28841860 acgactatgaaaaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaaggaatttcttcatgagg-------------------ttgaagaatgtaaagcacag 28841939  T
Q  623 cttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatac 719  Q
    ||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | | |||||||| ||||||||| |  |    
T  28841940 cttgcgggattacactaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttatggtgtacgc 28842039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 3157236 - 3157424
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| || || || | |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  3157236 gagatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcggtggcaaagttttgagggatgtcgcgaaggaacctaccgcggcgtcgatgtggtcaa 3157335  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaag 200  Q
    |||| || |  || || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3157336 agttggagtcattctatatgaccaagtctttggctcatagacaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcaaag 3157424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 277 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 50168323 - 50168193
Alignment:
Q  277 tggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacat 376  Q
    |||| |||||||  |||| | |||||||||| | |||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50168323 tggtttgttgttgggaggataaagaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacat 50168224  T
Q  377 cagcctggagaggcggtggtaagaatactca 407  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  50168223 cagcctggaaaggcggtaggaagaatactca 50168193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 28222402 - 28222266
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||   |||| | |||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  28222402 tgctttggtggtgtgttgttgggaggatgaag---gtgaggtttctcaccttggtactgatgccttgtagagtggtggtcgtttggagagacgttaaaca 28222306  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcat 408  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||    
T  28222305 ctcaacatcagcctagagaggcagtgtgaagaatactcat 28222266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 483 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 13548417 - 13548168
Alignment:
Q  483 aagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaa 582  Q
    ||||||| ||| || |||||||||  |||| || |||||||| |||||||||  ||| | |||||||| |||||| ||||||| | || ||||||||||     
T  13548417 aagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaactatggagg-ccttgagtgctatgttctagttgtgagcatgtgaattcttcatgag 13548319  T
Q  583 gacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaac 682  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||||||       |||| | ||||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |    
T  13548318 gacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacc-taaaagaccaagggtgatcggatgcaagatgatcttcaaggaagc 13548220  T
Q  683 gggagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  13548219 gggagacgttccatggttgaagaggttatggtgtaggcttgtggaactacct 13548168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 483 - 731
Target Start/End: Original strand, 776506 - 776754
Alignment:
Q  483 aagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgct-atgctctagtggtgagcaagggatttcttcatga 581  Q
    ||||||| ||| || |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||| | |||||||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  776506 aagctcaacttgaggtggagttgataacaccggaaatggtaccactatggagg-ccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 776604  T
Q  582 agacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa 681  Q
     ||||||||||||||| |   ||||||| |||||       |||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  776605 ggacggaaggcattccggggtttgaagactgtatggtgtggcttgtgtgattacc-taaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaag 776703  T
Q  682 cgggagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtggaactac 731  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| | ||||||||| ||||    
T  776704 cgggagacgttccgtggttgaagagattttggtgtagacttgtggagctac 776754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 269 - 405
Target Start/End: Original strand, 776260 - 776396
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||| ||| |||||||| | |||||||||||  | |||||||| || ||| |||| |||||| ||||||| |||||||    
T  776260 tgctttggtggtgagttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttgatattgatgccttgtagagtggtgttcgtcttgagagacattaaaca 776359  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatact 405  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  776360 ctcaacatcagcttggggaggcggtgggaagaatact 776396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 602 - 733
Target Start/End: Original strand, 25127086 - 25127220
Alignment:
Q  602 gttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgt 698  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||| |  |||    
T  25127086 gttgaagaatgtatagcacggcttgtgggattaccctaaaaaaaggccaagggtaattggatggaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctttgt 25127185  T
Q  699 tgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  25127186 tgaagatgttatggtgaatgattgtggaactacct 25127220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 269 - 408
Target Start/End: Original strand, 31658328 - 31658467
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| | ||| ||||||  |||| ||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  31658328 tgctttggttgtgagttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcatctggagagacgttaaaca 31658427  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcat 408  Q
    ||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||    
T  31658428 ctcaacatcattctggagatgcagtggaaagaatactcat 31658467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Original strand, 16456362 - 16456467
Alignment:
Q  83 ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattc 182  Q
    |||||| |||||||| | |||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16456362 ggaaccaactgcggcgttgatgtgatcaaagttggagtcattgtatatgaccaagactttggctcataggcaaatcctaaagcaacaactctactcattc 16456461  T
Q  183 aagatg 188  Q
    ||||||    
T  16456462 aagatg 16456467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 498 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 50168070 - 50167863
Alignment:
Q  498 tggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgct-atgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattc 596  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| | |||||||||| ||||||| | || |||||||||| |||| |||||||||    
T  50168070 tggagttgatgacaccggaaatggtacgactatggagg-ccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacgaaaggcattc 50167972  T
Q  597 cagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt 696  Q
    | |   ||||| ||||||| | |   |||| | ||||| |||||||  |||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  50167971 cggggtttgaaaaatgtatgatatggcttgtgtgatta-cctaaaagaccaagggttattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgggagacgttccgt 50167873  T
Q  697 -gttgaagag 705  Q
     |||||||||    
T  50167872 ggttgaagag 50167863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 629 - 713
Target Start/End: Original strand, 8954000 - 8954083
Alignment:
Q  629 ggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8954000 ggattaccctaaaa-gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgttctgtattgaagaggttatggt 8954083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 547 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 28221723 - 28221539
Alignment:
Q  547 tatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagcc 646  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||| | |   ||||| |||||||      ||||| | ||||||| |||||  ||    
T  28221723 tatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacagaaggcattacggggtttgaataatgtattgtgtgacttgtgtgattacc-taaaagacc 28221625  T
Q  647 aagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtggaactac 731  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  28221624 aagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttaaagagggtttggtgtatacttgtggagctac 28221539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41397749 - 41397583
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  41397749 gcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatgatgg 41397650  T
Q  193 agtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattga 259  Q
    |||| ||  | |||  |||| |||||||| |||| ||||  || |||||||| ||||  ||||||||    
T  41397649 agtctaaatcgatctcggagcaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattga 41397583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 14099189 - 14099148
Alignment:
Q  371 caacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14099189 caacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 14099148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 663 - 733
Target Start/End: Original strand, 6996871 - 6996941
Alignment:
Q  663 aaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||    
T  6996871 aaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtaaatgcttgtggaactacct 6996941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 20301924 - 20301998
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  20301924 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 20301998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 25249941 - 25249875
Alignment:
Q  346 gtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25249941 gtcgtttggagagacgttaaatactaaacatcattctggagaggtggtggtaagaatactaatgatc 25249875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8348092 - 8348039
Alignment:
Q  277 tggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatg 330  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8348092 tggtgtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggagtgatg 8348039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 517 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 31928975 - 31928880
Alignment:
Q  517 aatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgt 613  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| || |||| ||| |||| | |  ||||||||||||    
T  31928975 aatggtacgactatggaga-ccttgggtgatatgctctagttgtgagcaagagaattcttcaagaggacgaaagacatttcgggggttgaagaatgt 31928880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 547 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 28222094 - 28221948
Alignment:
Q  547 tatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagcc 646  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |||||||||| ||| |||| |||||| |   ||||| ||||||||     ||||| | ||||||| |||||  ||    
T  28222094 tatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacagaagccattccggggtttgaataatgtatagtgtgacttgtgtgattacc-taaaagacc 28221996  T
Q  647 aagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttcc 694  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| |||||    
T  28221995 aagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagtgggagacgttcc 28221948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 28997480 - 28997417
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggt 438  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28997480 atcagtctggagaggcggaggcaacaatacgcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggt 28997417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 29003196 - 29003133
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggt 438  Q
    ||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29003196 atcagtctggagaggcggaggcaacaatacgcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggt 29003133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 47099395 - 47099498
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |  || |||||||| || || ||||||||| ||||| || | || ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  47099395 gcggcatcgatgtgggctaagttggagtcattttacatgacgaaatcgttggctcataggcaactcgtgaaacaacaactctattcattcaagatggtgg 47099494  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  47099495 agtc 47099498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 16227963 - 16228037
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaagg-aaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  16227963 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaaacgggagatatctcgtattgaagaggttatggt 16228037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 631 - 713
Target Start/End: Original strand, 16430450 - 16430531
Alignment:
Q  631 attaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||   |||  ||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16430450 attaccctaaaa-gcctagggtgattgggaacaaatagatcttcaaggaagagggagatgttccgtattaaagaggttatggt 16430531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 185
Target Start/End: Original strand, 19359415 - 19359507
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaag 185  Q
    ||||||||||||||| | |||||  | |  ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | || ||||||||||| |||||||||    
T  19359415 gcggcatcgatgtgggctaagttgaagtcattgtacatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaag 19359507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 520 - 595
Target Start/End: Original strand, 19753438 - 19753513
Alignment:
Q  520 ggtacgactatggagaacctagggtgct-atgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcatt 595  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||    
T  19753438 ggtacgactatggagg-ccttgggtgcttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcatt 19753513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 640 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 28997390 - 28997326
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaaga 704  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  28997390 aaaagccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcctatgttgaaga 28997326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 640 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 29003106 - 29003042
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaaga 704  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  29003106 aaaagccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcctatgttgaaga 29003042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 51751830 - 51751904
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    ||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  51751830 aaaagccaatggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagtgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 51751904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13548556 - 13548523
Alignment:
Q  376 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13548556 tcagcctggagaggcggtgggaagaatactcatg 13548523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 75)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 7471619 - 7470900
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||  |||  | || |||||||||||||||||||    
T  7471619 gagatggtggacaaggccaggagggccattgtcttgtgcctcgggaataaagtttcgagagaagtaacaaaggatacaaccgcggcatcgatgtggtcaa 7471520  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||||    
T  7471519 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtaaaaggctatcatgga 7471420  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg------------atgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||            ||||   |||| ||||||||||   |||||| |||| |    
T  7471419 gctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttggggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggat 7471320  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7471319 gaagaaggtgatgtgtctcaccttgagagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 7471220  T
Q  397 aagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttag 496  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||     | | ||||||| | ||    
T  7471219 aagaatactcatgatctacctgttgtggtggagtttcaaggttgaagacaaagtgggatgtacgcatttgctagttgaggcagagtacgctcagcgtgag 7471120  T
Q  497 ttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattc 596  Q
     ||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||                     
T  7471119 gtggggttgaacacaccggtaatgatacgattatggaagaccttgggtgctatgctcta-tggggagcaagggatttcttcat----------------- 7471038  T
Q  597 cagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaa--aag-ccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttc 693  Q
      |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | | |||||||| |    
T  7471037 --gaagttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaagaagtccaagggtgattggatgcaaagtgatcttcaagggagcaggagatgtcc 7470940  T
Q  694 cgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
     |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  7470939 tgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 7470900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 97 - 733
Target Start/End: Original strand, 20298050 - 20298684
Alignment:
Q  97 catcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtc 196  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||    
T  20298050 catcgatgtgggcaaagtcggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtc 20298149  T
Q  197 aaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacatt------------gaggatgcaaatgctttgatggtgtg- 283  Q
    ||||||| ||||||||   |||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||            ||||||||   |||| ||||||||||     
T  20298150 aaaggccttcatggagctgcttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgtgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtgg 20298249  T
Q  284 --ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcc 381  Q
      |||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20298250 tgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggagtgatgcctagtggaacggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcc 20298349  T
Q  382 tggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttg 481  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||     |    
T  20298350 tggagaggcggtggtaacaatactcatgatctacctgttgatgtggagtttcaaggtggaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtagag 20298449  T
Q  482 gaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatga 581  Q
     | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  20298450 tacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggagaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat-- 20298546  T
Q  582 agacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaagg 678  Q
                     || ||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20298547 -----------------gaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctaaaagaaggccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaagg 20298629  T
Q  679 aaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    || |||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  20298630 aagcgggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 20298684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 281 - 704
Target Start/End: Original strand, 38395254 - 38395679
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  38395254 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctagagagaagttaaacactcaacatcagc 38395353  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||         
T  38395354 ctggagagacggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggggtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagg 38395453  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38395454 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagcgatttcttcatg 38395552  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   ||||||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  38395553 aagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgtgggattaccctaaaaaaaggccaagcatgattggatgcaaggagaccttcaag 38395652  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaaga 704  Q
    ||| ||||||||||   ||||||||||    
T  38395653 gaagcgggagatgtcatgtgttgaaga 38395679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Original strand, 28486215 - 28486630
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagca-cggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||| | || |||||||||||||||||||    
T  28486215 gagatggtggacaaggccaggagagccattgtcttgtgcctcggggataaaattttgagagaagcagcaacggaaacaaccgcggcatcgatgtggtcaa 28486314  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  28486315 agttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatgga 28486414  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattga------------ggatgcaaatgctttgatggt---gtgttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||            |||||||  |||| |||||||   ||||||||| |||  |    
T  28486415 gctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttggggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggagaat 28486514  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28486515 gaagaaggtgatgtgtctcaccttgagattgatgccttgtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 28486614  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  28486615 aagaatactcatgatc 28486630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 1048307 - 1047872
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1048307 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 1048208  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||         
T  1048207 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 1048108  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  1048107 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat- 1048010  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
                      ||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||| ||||   || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1048009 ------------------gaagttggagaatgtatagcacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaag 1047928  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  1047927 gaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 1047872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 257 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 7093506 - 7093044
Alignment:
Q  257 tgaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 353  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7093506 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 7093407  T
Q  354 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggc 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||      
T  7093406 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgag 7093307  T
Q  454 atgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctc 553  Q
    |||||| |||||||||||||||     | | ||||| | | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  7093306 atgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctc 7093207  T
Q  554 tagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaa---aagccaagg 650  Q
    || |||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||   | |||||||    
T  7093206 ta-tggtgagcaagggatttcttcat-------------------gaagttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattactctaaaaggaggccaagg 7093127  T
Q  651 gtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||| | | |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  7093126 gtgattggatgcaaggtgaccttcaaggaagtgggagatgtcctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 7093044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Original strand, 24749237 - 24749652
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcacg-gaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||   ||||||||||||| |||    
T  24749237 gagatggtggacaaggccaaaagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaagaaccaaccatggcatcgatgtgggcaa 24749336  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    ||||  ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24749337 agttgaaatctttgtatatgacaaagtctttggctgatcggcaattcctaaagcaataactctactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatgga 24749436  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg------------atgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||            |||    |||| ||||||||||   |||||| || | |    
T  24749437 gctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaagat 24749536  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24749537 gaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggttgtcatctggagagacattaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 24749636  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  24749637 aagaatactcatgatc 24749652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 281 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 7350669 - 7350370
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7350669 gtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 7350570  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||         
T  7350569 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 7350470  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7350469 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaac-cactggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 7350373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Original strand, 22136073 - 22136508
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtgg-tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcag 379  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136073 gtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcag 22136172  T
Q  380 cctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggt 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||        
T  22136173 cctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtag 22136272  T
Q  480 tggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcat 579  Q
     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22136273 agtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat 22136370  T
Q  580 gaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaa 676  Q
                       ||||||| ||||||| || |||  |||||| |||||| ||||   || |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22136371 -------------------gaagttggagaatgtgtagcacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaa 22136451  T
Q  677 ggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||| ||| |||||||| | |||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||    
T  22136452 ggaagcggaagatgttctgcgttgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacct 22136508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Original strand, 40551100 - 40551535
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtgg-tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcag 379  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40551100 gtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcag 40551199  T
Q  380 cctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggt 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||        
T  40551200 cctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtag 40551299  T
Q  480 tggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcat 579  Q
     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40551300 agtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat 40551397  T
Q  580 gaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaa 676  Q
                       ||||||| ||||||| || |||  |||||| |||||| ||||   || |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  40551398 -------------------gaagttggagaatgtgtagcacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaa 40551478  T
Q  677 ggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||| ||| |||||||| | |||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||    
T  40551479 ggaagcggaagatgttctgcgttgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacct 40551535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 38394636 - 38394885
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  38394636 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaa 38394735  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38394736 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatgga 38394835  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38394836 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 38394885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 328 - 733
Target Start/End: Original strand, 43556 - 43944
Alignment:
Q  328 atgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtga 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||      
T  43556 atgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctgcagaggcggtggtaagaataatcatgatctacctgttgaggttg 43655  T
Q  428 agtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgac 527  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  43656 agtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgagatggagttgaacacaccggtaatggtacgac 43755  T
Q  528 tatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgc 627  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                   || ||||||||||||||| |||  |||||    
T  43756 tatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat-------------------gaggttgaagaatgtatatcacggcttgc 43835  T
Q  628 gggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtg 724  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||    
T  43836 gggattaccctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtg 43935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 44725982 - 44726343
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  44725982 atcagtcttgagaggcggaggcaatgatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 44726081  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44726082 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgttatgctctagtggtgagcaagggatttc 44726181  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||||| |    
T  44726182 ttcatgaagatggaaggcattccggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggtcaagggtgattggatgcaaggagacc 44726281  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  44726282 ttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 44726343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 281 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 31157303 - 31157003
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31157303 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagatgttaaacactcaacatcagc 31157204  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||         
T  31157203 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttgaggtaga 31157104  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || |||| ||||||||||  | ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  31157103 gtacgctcagcgtgaggtggacttgaacacacctgtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaaggaatttcttcatg 31157006  T
Q  581 aag 583  Q
    |||    
T  31157005 aag 31157003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 36100 - 36349
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  36100 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagctaccgcggcatcgatgtgggcaa 36199  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  36200 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttagctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatgga 36299  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36300 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 36349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1048927 - 1048678
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||| ||| |||    
T  1048927 gagatggtggacaaggtcaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaa 1048828  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  1048827 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggcgcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 1048728  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1048727 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 1048678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Original strand, 21678709 - 21679124
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |  ||||| || ||| |||||||||||||||    
T  21678709 gagatggtggacaaggccaagagtgccattgtcttgtgcctcgggaataaagttttgagagaagtaacgaaagaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaa 21678808  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    ||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | | |||||| ||||||||    
T  21678809 agttcgaatctttgtattttacaaagtctttggctcatcggcagttcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaaataaaaggcaatcatgga 21678908  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaaca------------ttgaggatgcaaatgctttgatgg---tgtgttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||            ||||||||||   | || ||||||    ||||||||| |||| |    
T  21678909 gctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgcgggtactctgatggcgtagtgttgtttggaggat 21679008  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  21679009 gaagaaggtgatgtgtctcaccttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcatctggagagacgctaaacactcaacatcatccaggagacgcggtggt 21679108  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  21679109 aagaatactcatgatc 21679124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 44725228 - 44725474
Alignment:
Q  16 atggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagt 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||| ||| ||||||    
T  44725228 atggtggacaaggtcaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaaccaaccgcggcatcgatttgggcaaagt 44725327  T
Q  115 tcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaa 214  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  44725328 tggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagtaacaactctacttattcaggatggtggagtcaaaggccatcatagagca 44725427  T
Q  215 acttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44725428 acttatggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 44725474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7351289 - 7351040
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  7351289 gagatggtggacaaggccaggagtgccgttgtcttgtgcctcggggataaagttttgaaagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaa 7351190  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  7351189 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggtcatcatgga 7351090  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  7351089 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 7351040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7094099 - 7093850
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||| ||||||||||| |||    
T  7094099 gagatggtggacaaggtcaggagtgtcattgtcttatgccttggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaa 7094000  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  7093999 agttggagtctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 7093900  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7093899 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 7093850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 22135453 - 22135702
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| | | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || |||||||| || ||| |||    
T  22135453 gagatggtggacaaggcccggagtgccgttgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcaatatgggcaa 22135552  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22135553 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 22135652  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22135653 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 22135702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 40550480 - 40550729
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| | | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || |||||||| || ||| |||    
T  40550480 gagatggtggacaaggcccggagtgccgttgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcaatatgggcaa 40550579  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  40550580 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 40550679  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40550680 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 40550729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 382 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 24816245 - 24815896
Alignment:
Q  382 tggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttg 481  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||      |    
T  24816245 tggagaggcggaggtaacaatacccatgatctacat-ttgaggtggagtttcaaggtggaagacatagtgggatgtatgcatttgctagttgaagtagag 24816147  T
Q  482 gaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatga 581  Q
     | ||||||||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24816146 tacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccgagaatggtacgactacggtggacctcgggtgctatgctctagtggtgagcaagggatt-cttcatga 24816048  T
Q  582 agacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa 681  Q
    ||| |||||| ||| | || ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||     
T  24816047 agaaggaaggtatttcggaggttgaagaatgtatagcatagcttgcgggattaccctaaaaggccaaggttgattggatgaaaggagatcttcatggaag 24815948  T
Q  682 cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||| | | |||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  24815947 cgggagttatcccgtgttgaagacgttattgtgaatacttgtagaactacct 24815896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 383 - 731
Target Start/End: Original strand, 21679130 - 21679480
Alignment:
Q  383 ggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttgg 482  Q
    |||||||||| || |  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||||| | ||| || ||||||||| |||||||||     |     
T  21679130 ggagaggcggaggaaccaatactcatgatctacttgttaagatggagtttcaaggttgaagacataatgggatatacacattttctagttgaggtagagt 21679229  T
Q  483 aagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaa 582  Q
    |  |||||| | || |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21679230 acactcagcgtgaggtggagttgaacacaccagtaatggtacggctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaa 21679328  T
Q  583 gacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaagga 679  Q
    ||||||||  |||||  | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  21679329 gacggaagatattccgaaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaagga 21679428  T
Q  680 aacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactac 731  Q
    | ||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||    
T  21679429 agcggaagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtcgaactac 21679480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 9679721 - 9680079
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| ||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9679721 atcagtctggagaggtggaggcaacaatactcatgatcaacttgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 9679820  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||| | || |||||||||||||   || ||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  9679821 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacc--ggtaatggtactgctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagaaagagatttt 9679917  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  9679918 ttcatgaagacggaatgcatttcggaggttgaagaatgtataacactacttgcaggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcatggagacc 9680017  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||    
T  9680018 ttcaaggaagcgggagatgtcatgtgttgaacatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 9680079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13290137 - 13289896
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| || | | ||| |||||||||||    
T  13290137 gagatggtggacaaggccagaagtgtcattgtcttgtgcctcagggataaagttttgagagatgtagcaaaggaaccaaccgggacattgatgtggtcaa 13290038  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13290037 agttggagtcattgtatatgacaaagtctttggctcatcggtaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagttaaaggccatcatgga 13289938  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaa 253  Q
    | |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13289937 gcaacttatggagttcaacaaattccttgatgacttggagaa 13289896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 376 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 44011736 - 44011447
Alignment:
Q  376 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgag 475  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||  ||||||  ||||||||||| ||    
T  44011736 tcagtctggagaggcggaggtaacagtactcatgatctacctattgaagtggagtttcaaggtggaagatatagtgtgatgtacgtatttgctagttaag 44011637  T
Q  476 aggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttct 575  Q
    |||| | |||||| |||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  44011636 aggtagaaagctctgcttgaggtggagtcgaacacaccggaaatggtacgactatggagaaccttgggtgctatgctgtagttgtgagcaagggaattct 44011537  T
Q  576 tcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaag 665  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||    
T  44011536 tcatgaagatggaaggtattccggaggttgaagaatgtataacatggcttgtgggattaccataaaagatcaagggtgattggatgcaag 44011447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31159326 - 31159091
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  31159326 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgc-tcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaa 31159228  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
                 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  31159227 -------------gtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 31159141  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31159140 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 31159091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 28486628 - 28486969
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28486628 atcagtctggagaggcggaggcaaaaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 28486727  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28486728 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 28486826  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    |||||                   |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| ||||   || |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28486827 ttcat-------------------gaagttgaagaatgtatagcacggcttgcgagattactctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatc 28486907  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||||| |||||||    
T  28486908 ttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttttggtgaatgcttgtgggactacct 28486969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 375 - 675
Target Start/End: Original strand, 24749650 - 24749950
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||  ||||| |||||| |    
T  24749650 atcagtctggagaggcggatgcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcattttctagttaa 24749749  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | |  |||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24749750 ggtagagtacactcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgtctatggaggaccttggatgctatgctcta-tggtgagcaagagatttc 24749848  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccct-aaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatctt 673  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||| ||||||    
T  24749849 ttcataaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcatgacttgcgggattaccctaaaaaaggcaaaggtgattgtatgcaaggtgatctt 24749948  T
Q  674 ca 675  Q
    ||    
T  24749949 ca 24749950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24817001 - 24816768
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | | |||||| || ||| |||||||| ||||||    
T  24817001 gagatggtggacaaggccaggagtgtcattgtcttatgcctcggggataaagttt-gagagaagtaacgaaggaaccaaccgcgacatcgatgcggtcaa 24816903  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| ||||      |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  24816902 agttggaatttttg------acaaagtctttggctcatctacaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggattcaaaggtcatcatgga 24816809  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggaga 252  Q
    | |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24816808 gcaacttacggagttcaacaaaattcttgatgacttggaga 24816768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 257 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 24816405 - 24816253
Alignment:
Q  257 tgaggatgcaaatgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggag 356  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24816405 tgaggattcaaatgctttggtggtgtgttgtttggaggatgaagaatgtgatgtgtctcaccttgggagtgatgccttgtagagcggtggtcgtctggag 24816306  T
Q  357 agacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24816305 agacgttaaacactcaacatcagcctgaagagacggtggtaagaatactcatg 24816253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 261
Target Start/End: Original strand, 26213379 - 26213618
Alignment:
Q  22 gacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaat 120  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||||| ||||| | |||||| |  | || ||| ||||||||||| || || |    
T  26213379 gacaaggtcaggagtgccattgtcatgtgccacggggataaatttttgagagatgtagcgaaggaaccaatcgtggaatcaatgtggtcaaatttggagt 26213478  T
Q  121 atttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttac 220  Q
      ||||| | ||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26213479 cattgtataggaccaaatctttggctcatttgcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggcc-tcatggagaaacttac 26213577  T
Q  221 gaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
      ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26213578 agagttcaacaaaatctttgatgacttggagaatattgagg 26213618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18391766 - 18391517
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || | |||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  18391766 gagatggtggacaaggcgaggagcgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtcta 18391667  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  18391666 agttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 18391567  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||    
T  18391566 gcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgagg 18391517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 47675732 - 47675483
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || || |||  |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  47675732 gagatggtggacaaggctaggagtgccattgtattgtgcctcggtgacaaagttttgagggatgtcgcaaaggaacctaccgcggcgtcgatgtggtcaa 47675633  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  | |||||    
T  47675632 agtttgagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctaatcattcaagatggtggagtcaaagactgtgatgga 47675533  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || | ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47675532 gcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgagg 47675483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 281 - 412
Target Start/End: Original strand, 44725853 - 44725984
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| ||||  ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44725853 gtgttgtttggaggacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 44725952  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44725953 ctggagaagcggtggtaagaatactcatgatc 44725984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 260
Target Start/End: Original strand, 6047137 - 6047382
Alignment:
Q  16 atggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagt 114  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| || || | |||||| |  |||||||| ||| | ||||| |    
T  6047137 atggtggacaaggctagaagtgccattgtcttgtgtctcagggataatttttttagagatgttgcgaaggaaccaatcgcggcatcaatgcgatcaaatt 6047236  T
Q  115 tcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaa 214  Q
    | || |  ||||| ||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |    
T  6047237 tggagtcgttgtatatgaacaaatctttggctcatacgcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagtccatcattcagta 6047336  T
Q  215 acttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgag 260  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6047337 acttacggagttaaacaatatccttgatgacttggagaacattgag 6047382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6594128 - 6593879
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  6594128 gagatggtggacaaggcaaggagcgccattgtcttgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtcta 6594029  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  6594028 agttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 6593929  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||    
T  6593928 gcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgagg 6593879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 281 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 4294071 - 4293940
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4294071 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaacttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacattaaacactcaacatcagc 4293972  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  4293971 ctggagaggtggtgacaagaatactcatgatc 4293940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 261
Target Start/End: Original strand, 48490005 - 48490227
Alignment:
Q  40 attgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagt 138  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| || || || | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||| || ||||| |    
T  48490005 attgtcttgtgcctcggtgacaaagtattgagggatgtcgcgaaggaacctactgcggcgtcgatgtggtcaaagttggagtcattgtatattacaaaat 48490104  T
Q  139 ctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatcct 238  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||    
T  48490105 ctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcatttaacggagttcaacaaaatcct 48490204  T
Q  239 tgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  48490205 taatgatttggagaacattgagg 48490227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 281 - 412
Target Start/End: Original strand, 9679592 - 9679723
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  9679592 gtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttaggagtgatacctagtggagcggtggttgtctggagagacgttaaaaactcaacatcatc 9679691  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679692 ctgaagaggcggtggtaagaatactcatgatc 9679723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4295592 - 4295402
Alignment:
Q  1 agtggagaag-cagagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggca 98  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| | ||  |||    || ||||||    
T  4295592 agtggagaagaccgagatggtggacaaggccaggagtgtcattgtcttgtgcctcaggaataaagtttcgagagaagcaacaaaggataaaaccgcggca 4295493  T
Q  99 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatgg 189  Q
    |||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4295492 tcgatgtgggaaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatgg 4295402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 269 - 409
Target Start/End: Original strand, 48490592 - 48490732
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| ||||| ||||||   ||| ||| |||||||| | |||||||||| | | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48490592 tgctttggtggtgagttgttggcaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttagtattgatgccttgtggagtggtggtcgtctggagagacgttaaaca 48490691  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48490692 ctcaacatcagtctggagaggcggtgggaagaatactcatg 48490732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 6570563 - 6570809
Alignment:
Q  16 atggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagt 114  Q
    |||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| || || || | |||||| | || ||| ||||||||||||||||    
T  6570563 atggtggacaaggctaggagtgtcattgtcttgtgcctcggggataaaattttgagggatgtcgcgaaggaacctattgtggcgtcgatgtggtcaaagt 6570662  T
Q  115 tcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaa 214  Q
    |  | |  ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || | |  ||| |    
T  6570663 tgcagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctcctcattcaagattgtggagtcaaagaccgtaacagagca 6570762  T
Q  215 acttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | | ||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6570763 attaacggagttcaataaaatacttgatgatttggagaacattgagg 6570809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 296 - 407
Target Start/End: Original strand, 6047763 - 6047874
Alignment:
Q  296 tgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtgg 395  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6047763 tgaagtaggtgatgtttctcgccttgtgaatgatgtcttgtagagtggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtgg 6047862  T
Q  396 taagaatactca 407  Q
     |||||||||||    
T  6047863 aaagaatactca 6047874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 269 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 47675118 - 47674978
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||| |  ||||| ||||| | |||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  47675118 tgctttggtggtgagttgttgggaggatgaagaaggtgaggtctctcaacttggtattgattccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaaca 47675019  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  47675018 ctcaacatcatcatggagaggcggtgggaagaatactcatg 47674978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 349 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 44011798 - 44011738
Alignment:
Q  349 gtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44011798 gtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 44011738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 6593434 - 6593372
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6593434 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatg 6593372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18391072 - 18391010
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18391072 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatg 18391010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1560867 - 1560808
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactc 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1560867 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactc 1560808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 24261900 - 24262003
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  24261900 gcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtgg 24261999  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  24262000 agtc 24262003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3890918 - 3890780
Alignment:
Q  123 ttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacga 222  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||| || |||| |       
T  3890918 ttgtatatgaccaagcctttgactcataggcaattcctaaaaccaaaactctattcattaaatatgggggagtcaaaggtcatcatgaagcaactaatag 3890819  T
Q  223 agttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  3890818 agttcaacaaaatccttaatgatatggagaacattgagg 3890780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 644 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 31156958 - 31156869
Alignment:
Q  644 gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  31156958 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacct 31156869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 645 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 7350324 - 7350236
Alignment:
Q  645 ccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  7350324 ccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacct 7350236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16884437 - 16884269
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  16884437 gcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcatttaagatggtgg 16884338  T
Q  193 agtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    |||| ||  | |||  |||| |||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||||  ||||||||||    
T  16884337 agtctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgagg 16884269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 483 - 615
Target Start/End: Original strand, 26214221 - 26214352
Alignment:
Q  483 aagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaa 582  Q
    ||||||||||| || ||||||||   ||||| | || | |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  26214221 aagctcagcttgaggtggagttggtgacactaggaacgatacgactatggaga-ccttgggtgctagactctagttgtgagcaagggaattcttcaagaa 26214319  T
Q  583 gacggaaggcattccagaagttgaagaatgtat 615  Q
    |||||||| ||||||  |  |||||||||||||    
T  26214320 gacggaagacattccgtagtttgaagaatgtat 26214352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 483 - 731
Target Start/End: Original strand, 48490838 - 48491086
Alignment:
Q  483 aagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgct-atgctctagtggtgagcaagggatttcttcatga 581  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||  |||| || |||||||| |||||||||  ||| ||||| | |||||||||| ||||||| |  | ||||||||||    
T  48490838 aagctcaacttgaggtggagtagatgacaccgggaatggtacaactatggagg-ccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtaaattcttcatga 48490936  T
Q  582 agacggaaggcattccagaagtt-gaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaa 680  Q
     ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |     |||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  48490937 ggacggaaggcattcc-gaggtttgaagaatgtatgatgtggcttgtgtgattacc-taaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaagaa 48491034  T
Q  681 acgggagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtggaactac 731  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| | || |||||| ||||    
T  48491035 gcgggagacgttccgtggttgaagagggtttggtgtagacctgtggagctac 48491086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12405843 - 12405681
Alignment:
Q  97 catcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtc 196  Q
    ||||||||||| | ||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12405843 catcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 12405744  T
Q  197 aaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattga 259  Q
     ||  | |||  |||| |||||||| |||| ||||  || |||||||| ||||  ||||||||    
T  12405743 taaatcaatctcggagcaacttacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattga 12405681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 409
Target Start/End: Original strand, 26214004 - 26214115
Alignment:
Q  296 tgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtgg 395  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| || |||||||||| || ||  |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||     
T  26214004 tgaagaaggtgatgtttctcacctcggtaatgattccttgtagagcggtggttgtatg--gagatgttaaacagttaacatcagcttggagaggcggtga 26214101  T
Q  396 taagaatactcatg 409  Q
     || ||||||||||    
T  26214102 gaataatactcatg 26214115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 547 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 47674809 - 47674625
Alignment:
Q  547 tatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagcc 646  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||       |||| | ||||||| |||||   |    
T  47674809 tatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaagacattccagggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacc-taaaagatc 47674711  T
Q  647 aagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtggaactac 731  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| | |||| |||| ||||    
T  47674710 aagggtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagagggtttggtgtagacttatggagctac 47674625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18413168 - 18413065
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||  | ||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | || ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  18413168 gcggcatcgatgtgagctaagttggagtcattgtacatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtgg 18413069  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  18413068 agtc 18413065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 44041 - 44115
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  44041 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 44115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 1047775 - 1047701
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  1047775 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 1047701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 640 - 704
Target Start/End: Original strand, 9680176 - 9680240
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaaga 704  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  9680176 aaaagccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaaga 9680240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4293942 - 4293879
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggt 438  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  4293942 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgagctggagtttcaaggt 4293879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 5817762 - 5817865
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |  ||||| |||||||| || ||| ||||| || || || | || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5817762 gcggcatcgatgtgggctaagttggagtcattgtatatgacaaaatcgttgactcataggaaactcttgaaacaacaactctactcattcaagatggtgg 5817861  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  5817862 agtc 5817865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 7350139 - 7350065
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    ||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  7350139 aaaagtcaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 7350065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21988400 - 21988327
Alignment:
Q  123 ttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtc 196  Q
    ||||||||||| || || |||| |||| ||||| || | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21988400 ttgtacatgacgaaatcgttggatcataggcaactcttgaaacaacaactctactcattcaagatggtggagtc 21988327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 49091185 - 49091084
Alignment:
Q  95 ggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggag 194  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |  ||||||||||| || || ||||||||| ||||| || | || |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  49091185 ggcatcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatcgttggctcataggcaactcttgaaacaacaattctattcattcaagatggtggag 49091086  T
Q  195 tc 196  Q
    ||    
T  49091085 tc 49091084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 333
Target Start/End: Original strand, 36720 - 36772
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcct 333  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  36720 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcct 36772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4294174 - 4294106
Alignment:
Q  193 agtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  4294174 agtcaaaggccttcatggagctacttatggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgagg 4294106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 22136605 - 22136679
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  22136605 aaaagccaagggtgattgggtataagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggt 22136679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 40551632 - 40551706
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  40551632 aaaagccaagggtgattgggtataagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggt 40551706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 551 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 6068080 - 6068019
Alignment:
Q  551 ctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatg 612  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  6068080 ctctagttgtgagcaagggaattcttcaattagacggaaggcattccggagtttgaagaatg 6068019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 636 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 6593114 - 6593053
Alignment:
Q  636 cctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtg 697  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  6593114 cctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtg 6593053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 76)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Original strand, 20043626 - 20044028
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||| ||| | |||||||||| |||||    
T  20043626 gagatggtggacaaggccaagagtgccattgttttgtgcctcggggataaagatttgagagatgtagcgaaggaaccaact-cagcatcgatgtagtcaa 20043724  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20043725 agttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatggcagagtcaaaggccatcatgga 20043824  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgaggatgcaaatgctttgatggt---gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgat 308  Q
    | |||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20043825 gcaacttgtggagttcaaaacaatccttgatgacttggagaacattgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgat 20043924  T
Q  309 gattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcat 408  Q
    |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20043925 gtgtctcaccttgggagtgattcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcttggagaggtggtggtaagaatactcat 20044024  T
Q  409 gatc 412  Q
    ||||    
T  20044025 gatc 20044028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Original strand, 27911073 - 27911488
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27911073 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggagataaagttttgagagaagtagcaaaggaatcaactgcggcatcgatgtggtcaa 27911172  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  27911173 agttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatgga 27911272  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaaca------------ttgaggatgcaaatgctttgatggt---gtgttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||            ||||||||||   |||| |||||||   ||||||||| |||| |    
T  27911273 gctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggat 27911372  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27911373 gaagaaggtgacgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcgacatcagcctggagaggcggtggt 27911472  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  27911473 aagaatactcatgatc 27911488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Original strand, 658659 - 659074
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||||||||||    
T  658659 gagatggtggacaaggtcaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaaccaaccgcgacatcgatgtggtcaa 658758  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  658759 agttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggccatcatgga 658858  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattga------------ggatgcaaatgctttgatggt---gtgttgtttcgaggtt 296  Q
       ||||    ||||||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||            ||||||   |||| |||||||   ||||||||| |||| |    
T  658859 cctacttgtagagttcaacaaaatcattggtgatttggagaatattgaggcgcgtcttggggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggat 658958  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  658959 gaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaccatcagcctagagaggcggtcgt 659058  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||| ||||||||    
T  659059 aagaataatcatgatc 659074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Original strand, 25806102 - 25806486
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  |||| | || || ||||||||||||||||    
T  25806102 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcgggtataaagtttcgagagaagcagcaatggaaacaaccgcagcatcgatgtggtcaa 25806201  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  25806202 agttcgaatatttgtatattacaaagtctttggctcattggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatgga 25806301  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgaggatgcaaatgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgat 311  Q
    |  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||                ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||      
T  25806302 gctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaag----------------tgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtg 25806385  T
Q  312 tctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgat 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25806386 tctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgat 25806485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 34478437 - 34478003
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34478437 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 34478338  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||         
T  34478337 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 34478238  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  34478237 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat- 34478141  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
                      ||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||   || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34478140 ------------------gaagttggagaatgtgtagcacgacttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaag 34478059  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| | |||||||||  | |||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  34478058 gaagcaggagatgttatgcgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacct 34478003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Original strand, 31543994 - 31544429
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31543994 gtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctatagagacgttaaacactcaacatcagc 31544093  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||         
T  31544094 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 31544193  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  31544194 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat- 31544291  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaa--aag-ccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
                      ||||||| ||||||| || |||  |||||| |||||| |||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  31544292 ------------------gaagttggagaatgtgtagcacgtcttgcgagattactctaaaagaagaccaatggtgattggatgcaaggagatcttcaag 31544373  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  31544374 gaagcaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacct 31544429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 365 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 18510649 - 18510279
Alignment:
Q  365 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatt 464  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||    
T  18510649 aacactcatgatcagtctggagaggcggaggcaaaaatactcataatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatt 18510550  T
Q  465 tgctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagc 564  Q
    |||||||||||     | |  |||||  | || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18510549 tgctagttgaggtagagtactctcagtgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagc 18510451  T
Q  565 aagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggagg 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  18510450 aagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttaaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggagg 18510351  T
Q  662 caaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  18510350 caaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 18510279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 20044026 - 20044385
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||  |  || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  20044026 atcagtctggagaggcgaagacaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagcgggatgtacacatttgctagttga 20044125  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    | |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20044126 gaggttggaagctcagcttgaggtggagttgaagacca--gtaatgttgcgactatggaggaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaagagatttc 20044223  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||| | |    
T  20044224 ttcatgaagacggaagacattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggtcaagggtgattggatgcaaggaaacc 20044323  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  20044324 ttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 20044385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 269 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 15355882 - 15355566
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaa 365  Q
    |||||||||||||||   |||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355882 tgctttgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaa 15355783  T
Q  366 acactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacattt 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||    
T  15355782 acactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattt 15355683  T
Q  466 gctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagca 565  Q
    ||||||||||     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15355682 gctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagca 15355585  T
Q  566 a-gggatttcttcatgaag 583  Q
    | |||||||||||||||||    
T  15355584 aggggatttcttcatgaag 15355566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Original strand, 6746332 - 6746767
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6746332 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttaggattgatgcctagtggagcggtgttcgtcttgagagacgttaaacactcaacatcagc 6746431  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||         
T  6746432 ctggagaggtggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 6746531  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||| | | || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  6746532 gtatgctcaccgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttca-- 6746628  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaa--aag-ccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
                      || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||     
T  6746629 -----------------ggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaagaagaccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaa 6746711  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| | |||||||| | | |||||||| ||| ||||| || ||||||| |||||||    
T  6746712 gaagcaggagatgtcctgcgttgaagatgttgtggtgaatgcttgtgggactacct 6746767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 281 - 583
Target Start/End: Original strand, 23666307 - 23666608
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtgg-tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcag 379  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23666307 gtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcag 23666406  T
Q  380 cctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggt 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||        
T  23666407 cctggagaggcggtggtaagaatactcaggatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtag 23666506  T
Q  480 tggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcat 579  Q
     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23666507 agtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat 23666604  T
Q  580 gaag 583  Q
    ||||    
T  23666605 gaag 23666608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 27911486 - 27911846
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| || ||||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |    
T  27911486 atcagtctagagaggcggagacaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttaa 27911585  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27911586 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 27911684  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  27911685 ttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagacc 27911784  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  27911785 ttcaaggaactgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 27911846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 6745709 - 6745958
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  || |||||||| |||||| |||    
T  6745709 gagatggtagacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaacgaaccgcggcatcaatgtgggcaa 6745808  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    ||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6745809 agttgtaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatgga 6745908  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6745909 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 6745958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 10750339 - 10750588
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  10750339 gagatggtggacaaggccaggagtgctgttgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtaggaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaa 10750438  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  10750439 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 10750538  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10750539 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 10750588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 659072 - 659433
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| | | ||||| ||||| |||||| ||||| |||||| |    
T  659072 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgagatggagtttcaagattgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttta 659171  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  659172 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctttgctcta-tgatgagcaagggatttc 659270  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa----gccaagggtgattggaggcaaggagat 670  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||     
T  659271 ttcatgaagacggaaggcatttcggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagac 659370  T
Q  671 cttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  659371 cttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgtttgtggaactacct 659433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 31543374 - 31543623
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||| ||||||||||| |||    
T  31543374 gagatggtggacaaggccaggagtgccgttgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaa 31543473  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31543474 agttagaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaagatggaagagtcaaaggccatcatgga 31543573  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31543574 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 31543623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15356487 - 15356238
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| | | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||| ||| |||    
T  15356487 gagatggtggacaaggcccggagtgccgttgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaa 15356388  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  15356387 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 15356288  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15356287 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 15356238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 23665687 - 23665936
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| | | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||| ||| |||    
T  23665687 gagatggtggacaaggcccggagtgccgttgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaa 23665786  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  23665787 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 23665886  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23665887 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 23665936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34479057 - 34478808
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||| ||||||||||| |||    
T  34479057 gagatggtggacaaggccaggagtgccgttgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaa 34478958  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  34478957 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 34478858  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  34478857 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggaaaatattgagg 34478808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 18467325 - 18467574
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||  || ||| ||||||| ||| |||    
T  18467325 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgtctcggagataaagttttgagagaagtagcaaaggaacgaaccgcgacatcgatatgggcaa 18467424  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18467425 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatgga 18467524  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18467525 gcaatttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 18467574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 20505092 - 20504731
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20505092 atcagtctcgagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 20504993  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | |  |||||| | || |||||| |||||||| || ||||||||| |||||||| |||| || || ||||||||| |||||||||||||||||     
T  20504992 gttagagtacactcagcgtgaggtggagtggaacacaccggtaatggtacggctatggaggaccttggatgttatgctcta-tggtgagcaagggatttg 20504894  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa----gccaagggtgattggaggcaaggagat 670  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||    |||||||| ||||||| |||||||||     
T  20504893 ttcatgaagacggaaggcattacggaggttgaagaatgtatagcacggcttacgggattacccttaaaaaaatgccaagggggattggatgcaaggagac 20504794  T
Q  671 cttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20504793 ctttaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaggttatggtgaatgcttgtggaactacct 20504731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 105 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18510959 - 18510637
Alignment:
Q  105 tggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggcca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| |    
T  18510959 tggtcaaagttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggcttatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggcta 18510860  T
Q  205 tcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacatt------------gaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgttt 289  Q
    ||||||||  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||            |||||||    |||| ||||||||||   ||||||    
T  18510859 tcatggagctacttgtgcagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgttt 18510760  T
Q  290 cgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagagg 389  Q
     || | |||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510759 ggacgatgaataagatgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcctggagagg 18510660  T
Q  390 cggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  18510659 cggtggtaagaacactcatgatc 18510637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 29720948 - 29721197
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| || |||||||||||||||||||    
T  29720948 gagatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtcaa 29721047  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  29721048 agttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 29721147  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29721148 gcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgagg 29721197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9788816 - 9788567
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| || ||||||||||| |||||||    
T  9788816 gagatgatggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtcaa 9788717  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  9788716 agttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 9788617  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9788616 gcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgagg 9788567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 489 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 31467021 - 31466778
Alignment:
Q  489 agctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacgga 588  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31467021 agcttgaggtggagttaaacacaccgataatggtacgactatggaggaccttggttgctatgctcta-tggtgagcaagagatttcttcatgaagacgga 31466923  T
Q  589 aggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa--gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacggga 686  Q
    || |||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||    
T  31466922 agacatttcagaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaagaaagtggga 31466823  T
Q  687 gatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactac 731  Q
    ||||| | ||||||||||  | |||||| || |||||||||||||    
T  31466822 gatgtcctgtgttgaagatttcatggtgaatgcttgtggaactac 31466778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 281 - 412
Target Start/End: Original strand, 18467948 - 18468079
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18467948 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaaactcaacatcagc 18468047  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18468048 ctggagaggcggtggtaagaatacccatgatc 18468079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 257
Target Start/End: Original strand, 26171340 - 26171585
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| || || || || | |||||| || | ||||||||| |||||||    
T  26171340 gagatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcgaggacaaagttttaagggatgtcgcgaaggaaccaaccgtggcatcgatatggtcaa 26171439  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  26171440 agttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 26171539  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacatt 257  Q
    | || |  || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26171540 gcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacatt 26171585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 557 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 41587051 - 41586872
Alignment:
Q  557 tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaag---ccaagggtg 653  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||  |||| |||||||| ||||||||   |||||||||    
T  41587051 tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtacagcacggcttgtgggattactctaaaaagaggccaagggtg 41586952  T
Q  654 attggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  41586951 attggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 41586872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 399
Target Start/End: Original strand, 10750959 - 10751077
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10750959 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 10751058  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaag 399  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10751059 ctggagaggcggtggtaag 10751077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 281 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31467247 - 31467117
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31467247 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcactttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtttggagagacgttaaacactcaacatcatc 31467148  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31467147 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgat 31467117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 534332 - 534581
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||  | | |||||| || ||||| | |||||||||||    
T  534332 gagatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcggtgacaaagttttgagggatgtcccgaaggaacctacggcggcgttgatgtggtcaa 534431  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || |  ||||| ||||| |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  534432 agttggagtcattgtatatgaccaagtctttggttgataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 534531  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || | ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  534532 gcaattaacggagttcaacaaaatacttgatgatttggagaacattgagg 534581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 257 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 20505248 - 20505090
Alignment:
Q  257 tgaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 353  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||     
T  20505248 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgaggttgatgcctagtggagtggtggtcgtcta 20505149  T
Q  354 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505148 gagagacgttaaacactcgacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 20505090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 40380689 - 40380938
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  40380689 gagatggtggacaaggcgaggagcgccattgtcttgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtcta 40380788  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  40380789 agttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 40380888  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  ||||| || |  ||||||||||||||||    
T  40380889 gcaattggcggagttcaacaagatcctcgacggtttggagaacattgagg 40380938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 395 - 583
Target Start/End: Original strand, 10756269 - 10756455
Alignment:
Q  395 gtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagcttt 494  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||     | | ||||||| |     
T  10756269 gtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtatgctcagcgtg 10756368  T
Q  495 agttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 583  Q
    || ||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10756369 aggtggagttgaactcaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 10756455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 261
Target Start/End: Original strand, 16407979 - 16408157
Alignment:
Q  83 ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattc 182  Q
    |||||| || |||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16407979 ggaaccaaccgcggaatcgatatgatcaaagttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattc 16408078  T
Q  183 aagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    ||||||| ||||| |||| || | |||||| || |  || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16408079 aagatggtggagtaaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgagg 16408157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 269 - 697
Target Start/End: Original strand, 16408522 - 16408947
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||  || |||||||| | |||||||||||| | |||| ||| || ||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  16408522 tgctttggtggtgagttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgattccttgtagagtgtggttcgtctggagagacgttaaaca 16408621  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgct 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||| |||  |||||||| || || ||||| | |||| ||||||      
T  16408622 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggtggaag-catagtgg-aagtactcatttgga 16408718  T
Q  469 agttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtg-ctatgctctagtggtgagcaag 567  Q
    |||||||     | ||||||| ||| || |||||||||  |||| || ||||||| |||||||||| || | |||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  16408719 agttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatggag-actttgggtgtttatgctctagttgtgagcatg 16408817  T
Q  568 ggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaag-ccaagggtgattggaggcaagg 666  Q
     || |||||||||| ||||||||| | ||| |   |||||||||||||       |||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  16408818 tgaattcttcatgaggacggaaggtactccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgatta-cctaaaaagaccaagggtgatcggatgcaagg 16408916  T
Q  667 agatcttcaaggaaacgggagatgttccgtg 697  Q
     ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  16408917 tgatcttcgaggaagcgggagacgttccgtg 16408947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 16545010 - 16545262
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  16545010 gagatggtggacaaggcgaggagcgccattgtcttgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtcta 16545109  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaa---gtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcat 208  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||   ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||    
T  16545110 agttggaatcgttgtatatgaccaacaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgat 16545209  T
Q  209 ggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    |||| || |  || |||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||    
T  16545210 ggagcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgagg 16545262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 18468077 - 18468418
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || || | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||    
T  18468077 atcagtctggagaggcggaggcaacaacaatcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagctga 18468176  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18468177 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggcacggctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaatggatttc 18468275  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    |||||                   || ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||   || ||||||||||||| || |||||| ||||    
T  18468276 ttcat-------------------gaggttgaagaatgtatagcacggcttgcaggattaccctaaaagaaggccaagggtgattagatgcaaggtgatc 18468356  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| || ||||||||  |  ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  18468357 ttcaaggaagcgagagatgttttgcattgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 18468418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13694735 - 13694487
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcacggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaa 112  Q
    |||||||| |||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   |  |  | |||||| || |||  || ||||||||||||    
T  13694735 gagatggtagacaaggcaatgagtgctattttcttgtgcctcggggataaagttttgaggatatcacgaaggaacctaccgcgatattgatgtggtcaaa 13694636  T
Q  113 gttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggag 212  Q
     || || |  ||||| ||||| || ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  13694635 tttggagtcgttgtatatgaccaaatctttggctcatatgcaattcctatatcaacaactctacttatttaagatggtggagtcaaatgtcatcatggag 13694536  T
Q  213 aaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
     |||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13694535 caactaacggagttcaacaaaatccttgatgagttggaaaacattgagg 13694487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 42428026 - 42427777
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| || || || |||||||| || || || | |||||| || || |    |||||||||||    
T  42428026 gagatggtggacaaggctagaagtgtcattgtcttgtgccttggtgacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaacctaccgcagaggtgatgtggtcaa 42427927  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    ||||  | |  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | | |||    
T  42427926 agttgtagtcattgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgacgga 42427827  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
      || | ||  ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  42427826 acaattaacagagttcaacaaaatccttgatgattttgagaacattgagg 42427777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 300 - 409
Target Start/End: Original strand, 29721593 - 29721700
Alignment:
Q  300 gaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 399  Q
    |||||||| | |||||||||||| | |||| ||| || ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29721593 gaaggtgagggttctcaccttggtattgattccttgtagagtggt--tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtgag 29721690  T
Q  400 aatactcatg 409  Q
    ||||||||||    
T  29721691 aatactcatg 29721700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 300 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 42427384 - 42427276
Alignment:
Q  300 gaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 399  Q
    |||||||| | |||||||||||| | |||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  42427384 gaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtggttgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcctggagaggcgatgggaag 42427285  T
Q  400 aatactcat 408  Q
    |||| ||||    
T  42427284 aatattcat 42427276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 258
Target Start/End: Original strand, 13294851 - 13294958
Alignment:
Q  151 ggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttgga 250  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  13294851 ggcaattcagaaagcaacaactctactcattcatgatggtggagtcaaagggcatcatggagcaacttactgagttcagtagaagccttgatgatttgga 13294950  T
Q  251 gaacattg 258  Q
    ||||||||    
T  13294951 gaacattg 13294958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 300 - 409
Target Start/End: Original strand, 534953 - 535062
Alignment:
Q  300 gaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 399  Q
    |||||||| | |||| ||||||| |||||||||| || ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||     
T  534953 gaaggtgaggtttcttaccttggtaatgatgccttgtagagtggtgatcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcctcgagaggcgctgggaat 535052  T
Q  400 aatactcatg 409  Q
    ||||||||||    
T  535053 aatactcatg 535062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 409
Target Start/End: Original strand, 16545707 - 16545769
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16545707 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatg 16545769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 409
Target Start/End: Original strand, 26174045 - 26174107
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26174045 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcgatggtgagaatactcatg 26174107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 409
Target Start/End: Original strand, 40381383 - 40381445
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40381383 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatg 40381445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 475
Target Start/End: Original strand, 25806484 - 25806584
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||    
T  25806484 atcagtctagagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggaagtacgcatttgctagttga 25806583  T
Q  475 g 475  Q
    |    
T  25806584 g 25806584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33790825 - 33790722
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33790825 gcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcatagacaactcttgaagcaacaactctactcattcaagatggtgg 33790726  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  33790725 agtc 33790722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 271 - 409
Target Start/End: Original strand, 13487214 - 13487352
Alignment:
Q  271 ctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacact 370  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||| | |||||||||||    |||||||| || ||| |||| |||| | |||||||||||||||||    
T  13487214 ctttgatggtgagttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttgcttttgatgccttgtagagtggtgttcgtatagagagacgttaaacact 13487313  T
Q  371 caacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
     || |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13487314 taatatcagcttgcagaagcggtgggaagaatactcatg 13487352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 547 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 42427102 - 42426925
Alignment:
Q  547 tatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagcc 646  Q
    ||||||||||  ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||  |   ||||||||| ||| |     |||| | ||||||| |||||  ||    
T  42427102 tatgctctagctgtgagcatgtgaattcttcatgatgacggaaggcattctggggtttgaagaatatatgatgtggcttgtgtgattacc-taaaagacc 42427004  T
Q  647 aagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtg 724  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| | |||||||    
T  42427003 aagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaaacgggagacgttccgtggttgaagagggtttggtgtagacttgtg 42426925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 731
Target Start/End: Original strand, 13487515 - 13487705
Alignment:
Q  541 gggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa 640  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||      ||||| | ||||| |||||    
T  13487515 gggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgatta-cctaa 13487613  T
Q  641 aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtggaactac 731  Q
    ||  |||||||||||||   |||||| |||||||||| ||  |||||| ||||| | |||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  13487614 aagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttccatggttgaagagggtttggtgtatacttgtggagctac 13487705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27449332 - 27449229
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |  ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27449332 gcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacaaaatctttagctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtgg 27449233  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  27449232 agtc 27449229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 631 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 15355537 - 15355436
Alignment:
Q  631 attaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaacta 730  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| | ||||||| || ||||||| ||||    
T  15355537 attactctaaaa-gccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgctgaagacggtatggtgaatgcttgtgggacta 15355439  T
Q  731 cct 733  Q
    |||    
T  15355438 cct 15355436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 631 - 733
Target Start/End: Original strand, 23666637 - 23666738
Alignment:
Q  631 attaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaacta 730  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| | ||||||| || ||||||| ||||    
T  23666637 attactctaaaa-gccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgctgaagacggtatggtgaatgcttgtgggacta 23666735  T
Q  731 cct 733  Q
    |||    
T  23666736 cct 23666738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 644 - 733
Target Start/End: Original strand, 10756500 - 10756589
Alignment:
Q  644 gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||    
T  10756500 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgttatgcgttgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacct 10756589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 18510181 - 18510108
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    ||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  18510181 aaaagccaagggtgattgagcacaagtagatcttcaaggaaacgggagaggtcctgtgttgaagaggttatggt 18510108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 483 - 570
Target Start/End: Original strand, 13295074 - 13295160
Alignment:
Q  483 aagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaaggga 570  Q
    ||||||||||| || ||||| |||  ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13295074 aagctcagcttgaggtggagatgatgacaccaaaaatggtacgactatggaga-ccttgggtgctatgctctagttgtgagcaaggga 13295160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 196
Target Start/End: Original strand, 37557205 - 37557304
Alignment:
Q  97 catcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtc 196  Q
    ||||||||||| | ||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37557205 catcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtc 37557304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43598242 - 43598139
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |  ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  43598242 gcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttagctcatgggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtgg 43598143  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  43598142 agtc 43598139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43603734 - 43603631
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |  ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  43603734 gcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttagctcatgggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtgg 43603635  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  43603634 agtc 43603631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43609226 - 43609123
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |  ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  43609226 gcggcatcgatgtgggcgaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttagctcatgggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtgg 43609127  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  43609126 agtc 43609123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 15355339 - 15355265
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  15355339 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 15355265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 23666835 - 23666909
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  23666835 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 23666909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 547 - 726
Target Start/End: Original strand, 26174277 - 26174456
Alignment:
Q  547 tatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagcc 646  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||| ||||| |   |||||||||||||       |||| | ||||||| |||||  ||    
T  26174277 tatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacc-taaaagacc 26174375  T
Q  647 aagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtgga 726  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||| | | ||||| | |||||||||    
T  26174376 aagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaagcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgtagacttgtgga 26174456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 261
Target Start/End: Original strand, 31397605 - 31397737
Alignment:
Q  129 atgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttca 228  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||  | |||  |||| |||| ||| |||| |    
T  31397605 atgacaaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcatttaagatggtggagtctaaatcgatctcggagcaactaacggagttta 31397704  T
Q  229 acagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    |||  || |||||||| ||||  ||||||||||    
T  31397705 acaagattcttgatgatttggccaacattgagg 31397737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 10756686 - 10756760
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  10756686 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggt 10756760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 547 - 697
Target Start/End: Original strand, 29721872 - 29722021
Alignment:
Q  547 tatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagcc 646  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||| ||||| |   |||||||||||||       |||| | ||||||| |||||  ||    
T  29721872 tatgctctagttgtgagcatgcgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattacc-taaaacacc 29721970  T
Q  647 aagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtg 697  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  29721971 aagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggagacgggagacgttccgtg 29722021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 31544526 - 31544600
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  31544526 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggt 31544600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 34477905 - 34477831
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  34477905 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggt 34477831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 547 - 731
Target Start/End: Original strand, 535232 - 535416
Alignment:
Q  547 tatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagcc 646  Q
    |||||||||||  |||||| | || |||||||||  ||||||||||||||| |   |||||||||||||       |||| | ||||||| |||||  ||    
T  535232 tatgctctagttatgagcatgtgaattcttcatggggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacc-taaaagacc 535330  T
Q  647 aagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtggaactac 731  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||| |||||  |||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  535331 aagggtgattagatgcaatgtgatcttcgaggaagtgggagacgttccgtggttgaagagggtttggtgtatacttgtggagctac 535416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20505664 - 20505603
Alignment:
Q  192 gagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaa 253  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  20505664 gagtcaaaggacattatggagcaacttacggagtttaacaaaatccttaatgacttggagaa 20505603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 27911943 - 27912016
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| |  |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  27911943 aaaagccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggtagtgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 27912016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 547 - 613
Target Start/End: Original strand, 16545939 - 16546005
Alignment:
Q  547 tatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgt 613  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||| ||||| |   |||||||||||    
T  16545939 tatgctctagtggtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgt 16546005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 81
Target Start/End: Original strand, 18510959 - 18511000
Alignment:
Q  40 attgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagca 81  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  18510959 attgtcttgtgcctcggggataaagtttcgagataagtagca 18511000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 34842096 - 34842023
Alignment:
Q  123 ttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtc 196  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| | | |||||  | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34842096 ttgtacatgacaaaatctttagctcgtagacaatttttgaaataacaactctactcattcaagatggtggagtc 34842023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 1087 - 511
Alignment:
Q  16 atggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagt 114  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  |||| | || ||| |||||||||||||||| |    
T  1087 atggtcgacaaggccaggagtgccattgtcttttgcctcgggtataaagtttcgagagaagcagcaaaggaaacaaccgcgtcatcgatgtggtcaaatt 988  T
Q  115 tcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaa 214  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |      
T  987 ttgaatttttgtatatgacaaagtctttggcttatcggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggtgct 888  T
Q  215 acttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacatt------------gaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaa 299  Q
    ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||            ||||||||   |||| ||||||||||   |||||| |||| ||||    
T  887 acttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaa 788  T
Q  300 gaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 399  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  787 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 688  T
Q  400 aatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttg 499  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||     | | ||||| | | || ||    
T  687 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacgtgaggtg 588  T
Q  500 gagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttc 577  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  587 gagttgaacacaccggtaatggtacaactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 505 - 390
Alignment:
Q  602 gttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgt 698  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||| |||||| ||||||    ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||| |  |    
T  505 gttgaagaatgtatagcacggcttgcgagattactctaaaagaaggccaatggtgattggatgcaaggtggtcttcaaggaagcgggagatgttctgcat 406  T
Q  699 tgaagaggttatggtg 714  Q
    |||||| |||||||||    
T  405 tgaagatgttatggtg 390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 205; Significance: 1e-111; HSPs: 106)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Original strand, 3315302 - 3315717
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  3315302 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaaccaaccgcgacatcgatgtgtgcaa 3315401  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  3315402 agttggaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttattcattcaagatggtagagtcaaaggccatcacgga 3315501  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaaca------------ttgaggatgcaaatgctttgatggt---gtgttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| || |||||||            ||||||||||   |||| |||||||   ||||||||| |||| |    
T  3315502 gctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttagagaacattgaggtgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggat 3315601  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3315602 gaagaaggtgatgtatctcaccttgggaatgatgcttagtggagaggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 3315701  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  3315702 aagaatactcatgatc 3315717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 53917312 - 53916897
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| | ||  |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  53917312 gagatggtggacaaggccaggagtgtcattgtcttgtgcctcgggtataaattttcgagagaagcaacaaaggaaacaactgcggcatcgatgtggtcaa 53917213  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||    
T  53917212 agttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaagaccatcatgga 53917113  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaaca------------ttgaggatgcaaatgctttgatggt---gtgttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||            |||||||||| | |||| |||||||   |||||||||  ||| |    
T  53917112 gctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgagtgctctgatggtgtggtgttgtttgtaggat 53917013  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53917012 gaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactctacatcagcctggagaggcggtggt 53916913  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  53916912 aagaatactcatgatc 53916897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Original strand, 43227320 - 43227755
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43227320 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagggacgttaaacactcaacatcagc 43227419  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| | |||||  |||||||||||||||         
T  43227420 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagttggatgtatgcatttgctagttgaggtaga 43227519  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || | ||||||||||||| || ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  43227520 gtacgctcagcgtgaggtagagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat- 43227617  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
                      || ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  43227618 ------------------gaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaag 43227699  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  43227700 gaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 43227755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 257 - 581
Target Start/End: Original strand, 5898625 - 5898951
Alignment:
Q  257 tgaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 353  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5898625 tgaggatgcaagtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtagtcgtctg 5898724  T
Q  354 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggc 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||     
T  5898725 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggg 5898824  T
Q  454 atgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctc 553  Q
    |||||| |||||||||||||||     | |  |||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||    
T  5898825 atgtacgcatttgctagttgaggtagagtacactcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgtgtgctatgctc 5898924  T
Q  554 tagtggtgagcaagggatttcttcatga 581  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  5898925 ta-tggtgagcaagggatttcttcatga 5898951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 281 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 6064811 - 6064513
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6064811 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 6064712  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||         
T  6064711 ctggagaggcggtggtaagaatactc-tgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 6064613  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6064612 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tgatgagcaagggatttcttcatg 6064514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Original strand, 11169341 - 11169776
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11169341 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 11169440  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | |||||  |||| |||||| ||||| |||||||||         
T  11169441 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgcggtggagtttcaaggttgaagacatggtgggatgtacgcattttctagttgaggtaga 11169540  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | |  |||| | | || ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| || | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  11169541 gtacactcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacggctatgaaggagcttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat- 11169638  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
                      |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| ||||   || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11169639 ------------------gaagttgaagaatgtatagcacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaag 11169720  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  11169721 gaagcgggagatgttttgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 11169776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 281 - 583
Target Start/End: Original strand, 457147 - 457447
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  457147 gtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 457246  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||         
T  457247 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcatttgccagttgaggtaga 457346  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  457347 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 457444  T
Q  581 aag 583  Q
    |||    
T  457445 aag 457447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 4309525 - 4309095
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4309525 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcactttgggagtgatgcctagtggagtagtggtcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagc 4309426  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||         
T  4309425 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 4309326  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||| | | || ||||||||||||||| || |||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  4309325 gtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacaactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat- 4309228  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaa 680  Q
                      || ||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||  || |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  4309227 ------------------gaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggatta--ctcgaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaa 4309148  T
Q  681 acgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
     |||||||||||| |  ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  4309147 gcgggagatgttctgcattgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 4309095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 43226697 - 43226946
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||||||||| |||    
T  43226697 gagatggtggacaaggcgaggagtgccattgtcttgtgcctcggagataaagttttgagagaagtagcaaaggaacgaaccgcggcatcgatgtgggcaa 43226796  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43226797 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccatcatgga 43226896  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43226897 gcaacttacgaagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 43226946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 53916899 - 53916539
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||    
T  53916899 atcagtctggagaggcggaggcaaaaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggtggaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttga 53916800  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||| | || ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53916799 gttagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcggtaatggtacggctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 53916701  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||||||  |||    
T  53916700 ttcatgaagatggaagacattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattatcctaaaaaaaggccaacggtgattggatgcaaggtaatc 53916601  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  53916600 ttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaggttatggttaatgcttgtggaactacct 53916539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 400 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 28138441 - 28138106
Alignment:
Q  400 aatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttg 499  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||     | | ||||||||| || ||    
T  28138441 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtg 28138342  T
Q  500 gagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccag 599  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  28138341 gagttgaacacaccggtaatggtacgactatggatgaccttgggtgctatgctcta-tggcgagcaagggatttcttcatgaagacgaaaggcattccgg 28138243  T
Q  600 aagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt 696  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||||   ||    
T  28138242 aggttgaagaatgtatagcgcaacttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggaagcaaggagactttcaaggaagcggaagatgtcatgt 28138143  T
Q  697 gttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  28138142 gttgaagaggttatggtgaatgcttgtgaaactacct 28138106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 381 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 891126 - 890771
Alignment:
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||| |||||||||||| || |||||          
T  891126 ctggagaggcggagacaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacataatgggatgtacacattttctcgttgatgtaga 891027  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | |  |||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  891026 gcactctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggagtaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 890927  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  890926 aagacggaagacattccggaggttgaagaatgtatagcacagcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagagtgattggatgcaagaagaccttcaag 890827  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
     ||||||||||| | | ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  890826 aaaacgggagatatcctgtgttaaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 890771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 28101646 - 28101231
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcacg-gaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||   ||||| || ||| |||| ||||||||||    
T  28101646 gagatagtggacaaggccaggagttccattctcttgtgcctcgggaataaagtttcgatagaagtagcaaaagaaccaaccgcgacatcaatgtggtcaa 28101547  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  28101546 agttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggtaattcctaaagtaacaactctactcattcaagatggtaaagttaaaggccatcatgga 28101447  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacatt------------gaggatgcaaatgctttgatggt---gtgttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||| | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||            ||||||||   | || |||||||   ||||||||| |||| |    
T  28101446 gctacttatggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgcgggttctctgatggtgtggtgttgtttggaggat 28101347  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    ||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28101346 gaagaaggtgatatgtctcaccttgaaaatgatgcctagtggagcggtggtcatctagagggaagttaaacactcaacatcatcctggagaggcggtggt 28101247  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  28101246 aagaatactcatgatc 28101231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 3315715 - 3316075
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3315715 atcagtctggagaggcggaggcaagaatactcatgatcttcctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 3315814  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||||| || ||||||| || |||| || ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3315815 ggtagagtacgctcagcttgagctggagtttaaaacaccggtaatggtatgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 3315913  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| | ||||| ||| |    
T  3315914 ttcatgaagacggaagacattccggaggttgaagaatatatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaaggtcaagggtgattgaatgcaagaagacc 3316013  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||||||  ||||||||| |  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  3316014 ttcaaggaagtgggagatgtcctatgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 3316075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 456527 - 456776
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||| ||||||||||| |||    
T  456527 gagatggtggacaaggccaggagtgccgttgtcttgtgcctcggagataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcgacatcgatgtgggcaa 456626  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  456627 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatgga 456726  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  456727 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 456776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10957961 - 10957712
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||| ||| |||    
T  10957961 gagatggtagacaaggccaggagttccattgtcttgtgcctcgaggataaagttttgagagaagtagcaaaggaaccaaccgtggcatcgatttgggcaa 10957862  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  10957861 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 10957762  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10957761 gcaacttacgaagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 10957712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 375 - 675
Target Start/End: Original strand, 23634796 - 23635099
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| | ||||| ||||   ||||||||||| ||||||||    
T  23634796 atcagtctggagaggcggaggtaacaatactcatgatctacctgttgagggggagttttaaggttgaagacatagtgaggtgtacacattttctagttga 23634895  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23634896 gaggttggaagctcagcttgaggtggagttgaacacaccagtaatggtacggctatggaggaccttcggtgttatgctctactggtgagcaagggatttc 23634995  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  23634996 ttcatgaagacggaaggcattccgaaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatacaaggtgatc 23635095  T
Q  672 ttca 675  Q
    ||||    
T  23635096 ttca 23635099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Original strand, 42990919 - 42991334
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||  |||||  || ||| ||||||||||| |||    
T  42990919 gagatggtggacaaggccaggagtgtcattgtcttgtgcctcggagataaagttttgagaaaagtagcaaaggaacgaaccgcgacatcgatgtgggcaa 42991018  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| || ||||    
T  42991019 agttggaatctttatatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaatatggtaaagtcaaaggccttcttgga 42991118  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaaca------------ttgaggatgcaaatgctttgatggt---gtgttgtttcgaggtt 296  Q
    |   |||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||            ||||||||||   |||| |||||||   ||||||||| |||| |    
T  42991119 gctgcttgtggagttcaacaaaatcattgctgatttggagaacattaagttgcgacttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggat 42991218  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42991219 gaagaaggtgatgtgtctcaccttggaagtgatgcctaatggagcggtgatcatctagagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcagtggt 42991318  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  42991319 aagaatactcatgatc 42991334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 28101233 - 28100873
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| ||||||||||||  | || |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||  |||| |||||| ||||| |||||| |    
T  28101233 atcagtctggagaggcggatgcaataatattcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatggtgggatgtacgcattttctagttaa 28101134  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28101133 ggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgttatgctcta-tggtgagcaagggatttc 28101035  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||      
T  28101034 ttcatgaagacggaaggcatttcggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagact 28100935  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||||||  || |||||| |  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28100934 ttcaaggaagtggaagatgtcctatgttgaagaggttatggtgaatgcttgtggaactacct 28100873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 43422695 - 43422336
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  43422695 atcagtctggagatgcggaggtaacaatactcattatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgtatttgctaattga 43422596  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  43422595 ggtagagtacgctcaacttgaggtggagttgaacacactagtaatggtaagactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagaaagggattt- 43422498  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||| ||||    
T  43422497 ttcattaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaatgccaagggtgattggatgctaggtgatc 43422398  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  43422397 ttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 43422336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 5192270 - 5192519
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||| ||||||||||| |||    
T  5192270 gagatggtggacaaggccaagagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaactgcgacatcgatgtgggcaa 5192369  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||    
T  5192370 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcagcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcattga 5192469  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5192470 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 5192519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 375 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 18098057 - 18097699
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  18098057 atcagtctggagaggcggaggcaaaaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttgaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttga 18097958  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||| | || |||| || ||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18097957 ggtagagtacgctcagcatgaggtggaatttaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgccatgctcta-tggtgagcaagggatttc 18097859  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18097858 ttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggcgatc 18097759  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactac 731  Q
    ||||||| | |||||||||| | ||||||||||  |||||||| || |||||||||||||    
T  18097758 ttcaagggagcgggagatgtcctgtgttgaagatattatggtgaatgcttgtggaactac 18097699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6065431 - 6065182
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  6065431 gagatggtggacaagcccaggagtgccgttgtcttgtgcctcgaggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaa 6065332  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  6065331 agttggaatctttgtatacgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatcgtagagtcaaaggccatcatgga 6065232  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6065231 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 6065182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 11168721 - 11168970
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||| | || || |||||||||||| |||    
T  11168721 gagatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagataagtagcagaggaagcaaccgcagcatcgatgtgggcaa 11168820  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  11168821 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaactactctactcattctggatggtagagtcaaaggccatcatgga 11168920  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11168921 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 11168970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 5898029 - 5898278
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  || ||| ||||||| ||| |||    
T  5898029 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgatagaagtagcaaaggaacgaaccgcgacatcgatatgggcaa 5898128  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  5898129 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcttaaagcaacaactctactcatttaagatggtggagtcgaagaccatcatgga 5898228  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5898229 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 5898278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18098808 - 18098560
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| || |||||||| |||||| |||    
T  18098808 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgcgcctcggg-ataaagttttgagagaagtagcaaaggaaccaaccgcggcatcaatgtgggcaa 18098710  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    || | |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18098709 agatggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattcctaaagcaacaactctacttattcaggatggttgagtcaaaggccatcatgga 18098610  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18098609 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 18098560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 23634066 - 23634314
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||  |||||||| ||||||    
T  23634066 gagatggtggacaataccaggagtgccattgtcttgtgcctcagggataaagttttgagagaagtagcgaaggaaccaac-gcatcatcgatgaggtcaa 23634164  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23634165 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatttctaaagcaacaactctagtcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatgga 23634264  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23634265 gcaatttatagagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 23634314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 43423106 - 43422693
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||   | || ||| ||||||||||| |||    
T  43423106 gagatggtgggcaaggccagaagtgtcattgtcttatgccttgggaataaagttttgagagaagtagcaaaggttacaaccgcgacatcgatgtgggcaa 43423007  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||   ||| |   |||||||||||||||||||    
T  43423006 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcccaaatcaacaactttactcattg--gattgtaaagtcaaaggccatcatgga 43422909  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg------------atgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||    ||||||||| |||| ||| ||| ||| ||||||||||||            |||||  |||| ||||||||||   |||||| |||| |    
T  43422908 gctacttgtcgagttcaacaaaatcattggtgatttgaagaacattgaggtgcatcttgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggat 43422809  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    ||||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43422808 gaagaaggtgatctgtctcaccttgagagtgatgcctagtggaacggtggtcgtatggagagacgataaacactcaacatcagcctagagaggcggtggt 43422709  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  43422708 aagaatactcatgatc 43422693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 281 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 10957341 - 10957147
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10957341 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagtggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 10957242  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgag 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  10957241 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctaccagttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcattttctagttgag 10957147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 53 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4310108 - 4309899
Alignment:
Q  53 tcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcg 151  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  || |||||||| || ||| |||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4310108 tcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaacgaaccgcggcatcaatatgggcaaagttgaaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcg 4310009  T
Q  152 gcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggag 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4310008 gcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggag 4309909  T
Q  252 aacattgagg 261  Q
    || |||||||    
T  4309908 aatattgagg 4309899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1620110 - 1619735
Alignment:
Q  15 gatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaag 113  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1620110 gatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgatagatgtagcgaaggtacaaactgcggcatcgatgtggtcaaag 1620011  T
Q  114 ttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggaga 213  Q
    || || | |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||  |||||||||||     
T  1620010 ttggagtctttgcatatgacaaagtctttggctcattggtaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatgaagca-acaaaatccatcatggagc 1619912  T
Q  214 aacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgaggatgcaaatgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattc 313  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||        || |        | ||||| |||| ||||| |  |||| |||||||||||||| |||    
T  1619911 aacttacggagttcaacaaaatccttgatgttttg--------tggg--------ttctttggtggtctgttgctgggaggatgaagaaggtgatgtttc 1619828  T
Q  314 tcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactc 406  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||  || ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  1619827 tcaccttgtgaatgattccttgtaaagtggtagttttctagagagacgttaaacactcaacatcagcccagagaggcagttgtaagaatactc 1619735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 261
Target Start/End: Original strand, 7769246 - 7769424
Alignment:
Q  83 ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattc 182  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7769246 ggaaccaattgcgacatcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagaaacaactctactcattc 7769345  T
Q  183 aagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  7769346 aagatggtggagtcaaaggctatcatggagcaacttacggagttctaaaaaatccttgatgacgtggagaatattgagg 7769424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 27421261 - 27421507
Alignment:
Q  16 atggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagt 114  Q
    |||||||| |||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | | |||||| || ||| ||| ||||||||||||||    
T  27421261 atggtggaaaaggccaggagtgtcattgtcttgtgccttggggataaagttttgagagatgtaacgaaggaaccaaccgcgacattgatgtggtcaaagt 27421360  T
Q  115 tcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaa 214  Q
    | || |  ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |    
T  27421361 tggagtcgttgttattgacaaaatctttggctcatcggcaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggtcatcatggagca 27421460  T
Q  215 acttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27421461 acttacggagttcaacaagatccttgatgacttggagaatattgagg 27421507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23199732 - 23199484
Alignment:
Q  14 agatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaa 112  Q
    |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  23199732 agatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcggggacaaagttttgagggatgttgcgaaggaaccaaccgcgacatcgatatggtcaaa 23199633  T
Q  113 gttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggag 212  Q
    ||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  23199632 gttggaatcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctaatcattcaagatggtggagtcaaagaccatgatggag 23199533  T
Q  213 aaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
     || |  || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  23199532 caattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttagagaacattgagg 23199484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 37407262 - 37407511
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| || |||||||| ||||||||||    
T  37407262 gagatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcaatgtggtcaa 37407361  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||    
T  37407362 agttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagttaaagaccgtgatgga 37407461  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37407462 gcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggaaaacattgagg 37407511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 10209774 - 10210023
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || | |||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  10209774 gagatggtggacaaggcgaggagcgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtcta 10209873  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  10209874 agttggaatcattgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 10209973  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||    
T  10209974 gcaattggcggagttcaacaagatccttgacgatttggagaacattgagg 10210023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5259930 - 5259668
Alignment:
Q  1 agtggagaag-cagagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggca 98  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||  || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| || || || || | |||||| || ||||||    
T  5259930 agtggagaagaccgagatggtggacatggctaggagtgccattgtcttgtgcctcgaggaaaaagttttaagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggca 5259831  T
Q  99 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaa 198  Q
    || |||||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5259830 tctatgtggtcaaagttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaa 5259731  T
Q  199 aggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    || || | |||||| || |  |  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5259730 agaccttgatggagcaattggcagagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgagg 5259668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 281 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18098186 - 18098055
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18098186 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagattgatgtctagtggagcggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagc 18098087  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18098086 ctggagaggcggtagtaagaatactcatgatc 18098055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 376 - 570
Target Start/End: Original strand, 25634865 - 25635058
Alignment:
Q  376 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgag 475  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25634865 tcagtctggagagacggaggtaacaatactcatgatctacct-ttgacgtggagtttcaaggtggaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgag 25634963  T
Q  476 aggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaaggga 570  Q
    |||| | ||| |||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25634964 aggtagaaagttcagtttgaggtggagttgaacacagcggaaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctagtgggaagcaaggga 25635058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 6717086 - 6717335
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || | |||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  6717086 gagatggtggacaaggcgaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtcta 6717185  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | || ||    
T  6717186 agttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacatttccttaagcgacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgataga 6717285  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6717286 gcaattggcggagttcaacaagatccttgatgatttggagaacattgagg 6717335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 10056818 - 10057067
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || || || |||||| ||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  10056818 gagatggtggacaaggcgaggagcgccattgtcctgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaactgcggcatcgatatggtcta 10056917  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  10056918 agttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 10057017  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||    
T  10057018 gcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgagg 10057067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 10061262 - 10061511
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || || || |||||| ||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  10061262 gagatggtggacaaggcgaggagcgccattgtcctgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaactgcggcatcgatatggtcta 10061361  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  10061362 agttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 10061461  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||    
T  10061462 gcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgagg 10061511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 10063484 - 10063733
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || || || |||||| ||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  10063484 gagatggtggacaaggcgaggagcgccattgtcctgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaactgcggcatcgatatggtcta 10063583  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  10063584 agttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 10063683  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||    
T  10063684 gcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgagg 10063733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 10065706 - 10065955
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || || || |||||| ||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  10065706 gagatggtggacaaggcgaggagcgccattgtcctgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaactgcggcatcgatatggtcta 10065805  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  10065806 agttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 10065905  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||    
T  10065906 gcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgagg 10065955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 29811443 - 29811691
Alignment:
Q  14 agatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaa 112  Q
    |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || || || | |||||| || || || || |||||||||||    
T  29811443 agatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcggtgacaaagttttgagggatgtcgctaaggaacctaccgcagcgtccatgtggtcaaa 29811542  T
Q  113 gttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggag 212  Q
    ||| || |  ||||| || || | |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||    
T  29811543 gttggagtcattgtatataaccaggtctttggctcataagcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggag 29811642  T
Q  213 aaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
     || | ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29811643 caattaacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgagg 29811691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4600314 - 4600065
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  4600314 gagatggtggacaaggcgaggagcgccattgtcttgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgatatggtcta 4600215  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | || ||    
T  4600214 agttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgataga 4600115  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||    
T  4600114 gcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgagg 4600065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9635718 - 9635469
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| || |||||||| | ||||||||    
T  9635718 gagatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttatgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatctacgtggtcaa 9635619  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| || | |||||    
T  9635618 agttggagccgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaaatctactcattcaagatggtgcattcaaagaccgtgatgga 9635519  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9635518 gcaattggcgtagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgagg 9635469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 10059040 - 10059289
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  10059040 gagatggtggacaaggcgaggagtgccattgtcctgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaactgcggcatcgatatggtcta 10059139  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || | |||||    
T  10059140 agttggaatcgttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggatttaaagaccgtgatgga 10059239  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || |||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||    
T  10059240 gcaattggcggagttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgagg 10059289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 218
Target Start/End: Original strand, 25634523 - 25634703
Alignment:
Q  40 attgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcg--gcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |   ||  ||||||| |||||||||||| || | ||| || ||||||||    
T  25634523 attgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcgaaggaactaaaatcgtggcatcga-gtggtcaaagttagagtctttatatatgacaaa 25634621  T
Q  137 gtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaactt 218  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  25634622 gtctttgactcatcagcaattcctaaagccacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatggagcaactt 25634703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 257 - 409
Target Start/End: Original strand, 25634714 - 25634863
Alignment:
Q  257 tgaggatgcaaatgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggag 356  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||    
T  25634714 tgaggatgcaagtgttttggtggtgtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgcctagt---gcggtggtcgtctagag 25634810  T
Q  357 agacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25634811 agttgttaaatactcaacatcagcctagagaggcggtgctaagaatactcatg 25634863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 560 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 35918939 - 35918763
Alignment:
Q  560 tgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgatt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||   || |||||||||||||    
T  35918939 tgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattactctaaaagaaggccaagggtgatt 35918840  T
Q  657 ggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| | |  ||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||    
T  35918839 ggatgcaaggtgatcttcaaggaagtgggagatgtcctgcattgaagatgttatggtgaatgcgtgtgggactacct 35918763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22834602 - 22834354
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || | |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  22834602 gagatggtggacaggct-aggagtgccattgtcttgtgcctcggtgataaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcgtcgatgtggtcaa 22834504  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || |  ||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || | |  ||    
T  22834503 agttggagtcattgtatatgatcaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagttaaagaccgtgacaga 22834404  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || | ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22834403 gcaattgacggagttcaacaaaattcttgatgatttggagaacattgagg 22834354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 257 - 412
Target Start/End: Original strand, 23634643 - 23634798
Alignment:
Q  257 tgaggatgcaaatgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggag 356  Q
    ||||||||||  |||| || ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||  | || ||||||||||||||| |||    
T  23634643 tgaggatgcatgtgctctggtggtgtgttttttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgtatggtagagcggtggtcgtctagag 23634742  T
Q  357 agacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23634743 agacgttaaacactcaacatcagcatggagaagaggtggtaagaatactcatgatc 23634798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 281 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 891261 - 891131
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  891261 gtgttgtttggaagatgaagaaggtgatgtgtctcgcctttggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtttggagagacgttaaacactcgacatcatc 891162  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgat 411  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  891161 ttggagaggcggtggtaagaatactcatgat 891131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 375 - 713
Target Start/End: Original strand, 42991332 - 42991653
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||   ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  42991332 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctattgaggtggagtttcaaggttaaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 42991431  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42991432 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacaactatgaaggaccttaggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 42991530  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    ||||| |||                  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  42991531 ttcat-aag------------------gttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattactctaaaaaaaggccaagggtgattggatacaaggtgatc 42991611  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    ||||||||| ||||||||||   | |||||||| ||||||||    
T  42991612 ttcaaggaagcgggagatgtcatgcgttgaagatgttatggt 42991653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 7762844 - 7763093
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || || || | |||||  || |||| ||||||||||||||    
T  7762844 gagatggtggacaaggctaagagtgccattgtcttgtgcctcggtgacaaagttttaagggatgtcgcgaaggaactaaccgcggaatcgatgtggtcaa 7762943  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || |  || || ||||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| || | |||||    
T  7762944 agttggagtcattatatatgaccaagtctttggctcataagcaattctttaagcaacaactctattcatttaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 7763043  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || | ||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  7763044 gcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgattttgagaacattgagg 7763093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 269 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 23199119 - 23198979
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||  || |||||||| | |||||||||||| | |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23199119 tgctttggtggtgagttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaaca 23199020  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23199019 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatg 23198979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 291 - 409
Target Start/End: Original strand, 7763479 - 7763597
Alignment:
Q  291 gaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggc 390  Q
    |||| ||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7763479 gaggatgatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagccaggagaggc 7763578  T
Q  391 ggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  7763579 ggtggtaacaatactcatg 7763597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 53597846 - 53598011
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||  | |||| | || |||||||||||||||||||    
T  53597846 gagatggtggacaaggtcaggagtgccattgtcttgtgcttcgatgataaagttttgagagatgtagataaggaatcaaccgcggcatcgatgtggtcaa 53597945  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctact 177  Q
    | ||  | | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  53597946 aattgaagtctttgtatatgacaaagtctttacctcatcggcaatttctaaagcaagaactctact 53598011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 269 - 407
Target Start/End: Original strand, 32892276 - 32892414
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| |||| |||||||  || | |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32892276 tgctttggtggtttgttgttgagatgatgaagaaggtgaggtttctcaccttggtactgatgccttgtagagcggtgctcatctggagagacgttaaaca 32892375  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactca 407  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  32892376 ctcaacatcagtcaggagaagcggtgggaagaatactca 32892414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 409
Target Start/End: Original strand, 27421891 - 27422004
Alignment:
Q  296 tgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtgg 395  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||     
T  27421891 tgaagaaggtgttgtttctcaccttgtgaatgatgccttgtagagcggcggtcgtctggagagactttaaacactcaacatcagcatgaaaaggcggtga 27421990  T
Q  396 taagaatactcatg 409  Q
     |||||||||||||    
T  27421991 gaagaatactcatg 27422004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 269 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 5259303 - 5259163
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||  || |||||||| | |||| ||||||| | |||||||| || ||  |||| || ||||||||||| |||||||    
T  5259303 tgctttggtggtgagttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctgaccttggtattgatgccttgtagaatggtgttcatctggagagacattaaaca 5259204  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5259203 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 5259163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 409
Target Start/End: Original strand, 29812057 - 29812197
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| | |||||||| ||  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29812057 tgctttggtggtgagttgttgggaggctgaggaaggtgaggtctctcaccttggtattgatgccttgtacagtggtgttcgtctggagagacgttaaaca 29812156  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  29812157 ctcaacatcagtttggagaggcggtcggaagaatactcatg 29812197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 599 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 10957069 - 10956932
Alignment:
Q  599 gaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccg 695  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10957069 gaagttgaagaatgtatagcacggcttacgggattactctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctg 10956970  T
Q  696 tgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
     |||||||| ||| ||||| || ||||||| |||||||    
T  10956969 cgttgaagatgttgtggtgaatgcttgtgggactacct 10956932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15822169 - 15822031
Alignment:
Q  123 ttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacga 222  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||| || | |  ||| |||| ||||    
T  15822169 ttgtatatgactaagtctttagctcatatgtaattcctaaagcaacaactctactcgtttaaaatggtggagtcaaagaccttaacagagcaactaacga 15822070  T
Q  223 agttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15822069 agttcaacaaaatccttaatgatttggagaacattgagg 15822031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15830834 - 15830587
Alignment:
Q  14 agatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaa 112  Q
    ||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||| || || || || | |||||| ||  || |||||| |||||||||    
T  15830834 agatggtggacaaagctagaagtgtcattgtcttgtgcctcaaggataaagttttcag-gatgtcgcgaaggaacctaccacgacatcgaggtggtcaaa 15830736  T
Q  113 gttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggag 212  Q
    ||| || |  ||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||| || |    |||    
T  15830735 gttggagttattgtatatgactaagtctatggttcataggcaattcctaaagcaagaactttactcatttaagatggtggagtcaaagaccgtagcagag 15830636  T
Q  213 aaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
     |||  ||  ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  15830635 caaccaacagagttcaacaaaatccttgatgatttagagaacattgagg 15830587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 261
Target Start/End: Original strand, 32891752 - 32891912
Alignment:
Q  101 gatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaag 200  Q
    ||||||||||||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  32891752 gatgtggtcaaagttggagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcatttaaggtggtggagtcaaag 32891851  T
Q  201 gccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
     || | |   || || | |||  |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32891852 accgtgacaaagcaattaacggggttcaacaaaatccatgatgatttggagaacattgagg 32891912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 347 - 409
Target Start/End: Original strand, 10210465 - 10210527
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10210465 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatg 10210527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 269 - 405
Target Start/End: Original strand, 6717700 - 6717834
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||  |  |||||||| | |||||||||||| | |||| ||| || ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  6717700 tgctttgatggtgagttgttgggagggaggtgaaggtgagggttctcaccttggtattgattccttgtagagtggt--tcgtctggagagacgttaaaca 6717797  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatact 405  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6717798 ctcaacgtcagcctggagaggcagtggtgagaatact 6717834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 296 - 409
Target Start/End: Original strand, 7769765 - 7769878
Alignment:
Q  296 tgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtgg 395  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| | ||||    
T  7769765 tgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgccttgtagagcggtgtctatctggagagacgttaaacagtcaagatcatcctagagagtctgtgg 7769864  T
Q  396 taagaatactcatg 409  Q
     |||||||||||||    
T  7769865 gaagaatactcatg 7769878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 520 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 1619605 - 1619530
Alignment:
Q  520 ggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattc 596  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1619605 ggtacgactatggaga-ccttgggtgctatgctctagtggtgaccaagggaattcttcatgaagacagaaggcattc 1619530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23409926 - 23409742
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||| |  || ||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||| || || || | |||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  23409926 gagatggtggacaatgctaggagtgacattgtcttgtacctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaacctaccgcggcgtcgatatggtcaa 23409827  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtc 196  Q
    | || || |  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  23409826 attttgagtcattgtatatgaccaaatctttggctcataggcaactccttaagcaacaactctacttatttaagatggtggagtc 23409742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 406
Target Start/End: Original strand, 10057512 - 10057571
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactc 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10057512 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactc 10057571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 406
Target Start/End: Original strand, 10059734 - 10059793
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactc 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10059734 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactc 10059793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 406
Target Start/End: Original strand, 10061956 - 10062015
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactc 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10061956 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactc 10062015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 406
Target Start/End: Original strand, 10064178 - 10064237
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactc 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10064178 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactc 10064237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 406
Target Start/End: Original strand, 10066400 - 10066459
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactc 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10066400 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactc 10066459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 347 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 4599620 - 4599558
Alignment:
Q  347 tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4599620 tcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgataatactcatg 4599558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 296 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15824809 - 15824698
Alignment:
Q  296 tgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtgg 395  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| || ||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||    
T  15824809 tgaagaaggtgatatttctcacctttggagtgatgccttgtagagagatagtcgtctagagagacattaaacactcaacatcatcttggaggggcgatgg 15824710  T
Q  396 taagaatactca 407  Q
     |||||||||||    
T  15824709 gaagaatactca 15824698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 483 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 9635233 - 9634989
Alignment:
Q  483 aagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgct-atgctctagtggtgagcaagggatttcttcatga 581  Q
    ||||||| ||| || |||||||||  |||| || ||||||||||||||||||  ||| || || | |||||||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  9635233 aagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggagg-ccttggttgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 9635135  T
Q  582 agacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaa-gggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaa 680  Q
     || |||||||||||| |   ||||||||||||| |   | |||| | ||||| |||||||  |||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  9635134 ggatggaaggcattccggggtttgaagaatgtatgatgtagcttgtgtgatta-cctaaaagaccaaggggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaa 9635036  T
Q  681 acgggagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtgga 726  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| | |||||||||    
T  9635035 gcgggagacgttccgtggttgaagaggatttggtgtagacttgtgga 9634989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 542 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 15824534 - 15824370
Alignment:
Q  542 ggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaag-ttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa 640  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||| || ||||||| || |||||||| |||| | || | |||||||||||||| ||  ||||| | ||||| |||||    
T  15824534 ggtgttatgctctagttgcgagcaagtgaattcttcaagaggacggaagtcatt-ctgaggtttgaagaatgtatagcatgacttgtgtgatta-cctaa 15824437  T
Q  641 aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt-gttgaagagg 706  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15824436 aacaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagagg 15824370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 644 - 733
Target Start/End: Original strand, 457492 - 457581
Alignment:
Q  644 gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  457492 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagtaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacct 457581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 644 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 6064466 - 6064377
Alignment:
Q  644 gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  6064466 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacct 6064377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 3306247 - 3306320
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  3306247 aaaagccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 3306320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8516685 - 8516436
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||| |||||||  |  |||||||||||||| || ||||| ||||| || || || || || || | |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  8516685 gagatggtagacaaggcaaagagtgctattgtcttatgtctcggagataaggtcttaagggatgtcgcgagggaagctaccgcggcatcgatgtgggcaa 8516586  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || |  || || ||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||  | |||  |||    
T  8516585 agttagagtcattatatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcatttaagatggtggagtctaaatcgatctcgga 8516486  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||||  ||||||||||    
T  8516485 gcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgagg 8516436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 731
Target Start/End: Original strand, 29812303 - 29812550
Alignment:
Q  483 aagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaa 582  Q
    ||||||| ||| || |||||||||  |||| || |||||||| ||||||||   ||| | ||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||     
T  29812303 aagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaactatggatg-ccttgagtgctatgctctagttgtgagcttgtgaattcttcatgag 29812401  T
Q  583 gacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaac 682  Q
     |||||||||||||  |   |||||||||||||     | |||| | | ||||| |||||  ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| |    
T  29812402 aacggaaggcattctggggtttgaagaatgtatggtgtagcttgtgtggttacc-taaaagaccaagcgtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggaagc 29812500  T
Q  683 gggagatgttcc-gtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactac 731  Q
    |||||||||||| | |||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||    
T  29812501 gggagatgttccggggttgaagagggtttggtgtagacttgtggagctac 29812550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 32479847 - 32479682
Alignment:
Q  96 gcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagt 195  Q
    |||||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  32479847 gcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcatttaagatggtggagt 32479748  T
Q  196 caaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | ||  | |||  |||| |||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||||  ||||||||||    
T  32479747 ctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgagg 32479682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 629 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 10956845 - 10956761
Alignment:
Q  629 ggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  10956845 ggattactctaaaaa-ccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 10956761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 728
Target Start/End: Original strand, 37407844 - 37407937
Alignment:
Q  636 cctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtggaac 728  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | | ||||| | |||||||||||    
T  37407844 cctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgtagacttgtggaac 37407937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 407
Target Start/End: Original strand, 27900224 - 27900276
Alignment:
Q  355 agagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactca 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  27900224 agagacgttaaacacccaacatcagtctggagaggcggtgcaaagaatactca 27900276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 546 - 665
Target Start/End: Original strand, 27422164 - 27422283
Alignment:
Q  546 ctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagc 645  Q
    ||||||| |||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  ||||| | |||||||  ||||  |    
T  27422164 ctatgctttagttgtgagcaagagaattcttcaagaagacggaaggcattctagagtttaaagaatgtatagcatgacttgtgagattaccagaaaagac 27422263  T
Q  646 caagggtgattggaggcaag 665  Q
     |||||| |||||| |||||    
T  27422264 taagggtaattggaagcaag 27422283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 407
Target Start/End: Original strand, 31116505 - 31116568
Alignment:
Q  344 tggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||  |||||| |||||    
T  31116505 tggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcctagaaaggaggttctaagaagactca 31116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 457678 - 457752
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  457678 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggt 457752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 6064279 - 6064205
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  6064279 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcaggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 6064205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 11169873 - 11169947
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  11169873 aaaagccaagggtgattggctacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctggtattgaagaggttatggt 11169947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 636 - 697
Target Start/End: Original strand, 10210785 - 10210846
Alignment:
Q  636 cctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtg 697  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  10210785 cctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggaggcgggagacgttccgtg 10210846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 547 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 23198809 - 23198741
Alignment:
Q  547 tatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtat 615  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  23198809 tatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtat 23198741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27882684 - 27882632
Alignment:
Q  355 agagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactca 407  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  27882684 agagacgttaaacactcagcatcagtttggagaggcggtgcaaagaatactca 27882632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 640 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 53916442 - 53916378
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaaga 704  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  53916442 aaaagccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcaggagatgtcctgtgttgaaga 53916378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 547 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 43403098 - 43403032
Alignment:
Q  547 tatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgt 613  Q
    ||||||||||| | ||||| | || |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  43403098 tatgctctagtagcgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgggggttgaagaatgt 43403032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 689
Target Start/End: Original strand, 5899186 - 5899235
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagat 689  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5899186 aaaagccaagggtgattgggaacaagtagatcttcaaggaagcgggagat 5899235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 636 - 697
Target Start/End: Original strand, 10057832 - 10057893
Alignment:
Q  636 cctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtg 697  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  10057832 cctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtg 10057893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 636 - 697
Target Start/End: Original strand, 10060054 - 10060115
Alignment:
Q  636 cctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtg 697  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  10060054 cctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtg 10060115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 636 - 697
Target Start/End: Original strand, 10062276 - 10062337
Alignment:
Q  636 cctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtg 697  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  10062276 cctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtg 10062337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 636 - 697
Target Start/End: Original strand, 10064498 - 10064559
Alignment:
Q  636 cctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtg 697  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  10064498 cctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtg 10064559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 636 - 697
Target Start/End: Original strand, 10066720 - 10066781
Alignment:
Q  636 cctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtg 697  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  10066720 cctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaggcgggagacgttccgtg 10066781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 411
Target Start/End: Original strand, 50659 - 51073
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcacg-gaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||  | || |||||||||||||||||||    
T  50659 gagatggtggacaaggccatgagtgccattgtcttgctcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaagatactaccgcggcatcgatgtggtcaa 50758  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  50759 agatcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatgga 50858  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacatt------------gaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||            ||||||||   |||| ||||||||||   ||||||||||| |    
T  50859 gctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttcgaggat 50958  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50959 gaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 51058  T
Q  397 aagaatactcatgat 411  Q
    |||||||||||||||    
T  51059 aagaatactcatgat 51073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 400 - 733
Target Start/End: Original strand, 51097 - 51432
Alignment:
Q  400 aatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttg 499  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     | | ||||||| | || ||    
T  51097 aatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtg 51196  T
Q  500 gagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccag 599  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  51197 gagttgaacacaccggtaatggtacggctatggaggacgttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcacgaagacggaaggcgttccgg 51295  T
Q  600 aagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt 696  Q
    | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  51296 aggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgt 51395  T
Q  697 gttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  51396 gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 51432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 34948 - 35309
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  34948 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 35047  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||| | || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35048 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcggtaatggtacgactatggaggaccttgagtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 35147  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  35148 ttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctaaaaaagggccaagggtgattggatgcaaggagacc 35247  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35248 ttcaaggaaacgggagatgtcctgtgttgaagaggttatggtgaatgcttgtggaactacct 35309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 34191 - 34440
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||| | ||  |||||||||||||| |||    
T  34191 gagatggtggacaaggcaaggagtgacaatgtcttgtgcctcggagataaagttttaagagaagtagcaaaggaaacaacaacggcatcgatgtgggcaa 34290  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34291 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactccactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatgga 34390  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34391 gcaactcacggagttaaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 34440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 257 - 412
Target Start/End: Original strand, 34792 - 34950
Alignment:
Q  257 tgaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 353  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34792 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggcgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcacgttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 34891  T
Q  354 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34892 gaaagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 34950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 281 - 583
Target Start/End: Original strand, 885 - 1186
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  885 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 984  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||         
T  985 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctaattgaggtaga 1084  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1085 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 1183  T
Q  581 aag 583  Q
    |||    
T  1184 aag 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 265 - 514
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || | ||||||||||||| |||    
T  265 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgtggcatcgatgtgggcaa 364  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  365 agttggaatctttgtatatgacaaagcctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 464  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  465 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 8e-97; HSPs: 43)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 21481605 - 21481945
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  21481605 atcagtctggagaggcggaggtaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggtggaagacatagtgggatttacacatttgctagttga 21481704  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21481705 gaggttggaagctcaacttgaggtggatttgaacacatcggaaatggtacgactatggaagaccttgggagctatgctctagtggtgagcaatggatttc 21481804  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttc 674  Q
    ||||||||||||                  || |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21481805 ttcatgaagacg------------------gaggaatgtataacacggcttgctagattaccctaaaaagccaagggtgattggatgcaaggagatcttc 21481886  T
Q  675 aaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21481887 aaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaggttatggtggatacttgcggaactacct 21481945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Original strand, 21481192 - 21481607
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |  ||||| || ||| |||| ||||||||||    
T  21481192 gagatggtgggcaaggccaagagtgccattgttttgtgcctcggagataaatttttgagagaagtagcgaatgaaccaaccgcgacatcaatgtggtcaa 21481291  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  21481292 agttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcgccaattcctaaagaaacaattttactcattcaagatggtagagtcaaagaccatcatgga 21481391  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacat---------------tgaggatgcaaatgctttgatggtgtgttgtttcgaggtt 296  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||               ||||||||||  || |||| ||||| ||||| | |||| |    
T  21481392 gaaccttgcggagttcaacagaatccttgatgacttggagtatattgtctctgagggttatgaggatgcatgtgttttggtggtgcgttgtatggaggat 21481491  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21481492 gaagaaggtgatgtttctcaccttgggagtgttgcctgatagagcggtggtcgtcaagagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcgatggt 21481591  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  21481592 aagaatactcatgatc 21481607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 281 - 583
Target Start/End: Original strand, 18812024 - 18812324
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18812024 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 18812123  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||         
T  18812124 ctggaaaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 18812223  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18812224 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 18812321  T
Q  581 aag 583  Q
    |||    
T  18812322 aag 18812324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 281 - 583
Target Start/End: Original strand, 43080918 - 43081218
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43080918 gtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 43081017  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||         
T  43081018 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 43081117  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43081118 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 43081215  T
Q  581 aag 583  Q
    |||    
T  43081216 aag 43081218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 257 - 583
Target Start/End: Original strand, 27828274 - 27828602
Alignment:
Q  257 tgaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 353  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||   |||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828274 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 27828373  T
Q  354 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| |     
T  27828374 gagagacgttaaacactcaacatcaacctggagaggtggtagtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagttgg 27828473  T
Q  454 atgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctc 553  Q
    |||||| |||||||||||||||     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27828474 atgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaaccttgggtgctatgctc 27828573  T
Q  554 tagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 583  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27828574 ta-tggtgagtaagggatttcttcatgaag 27828602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 15069263 - 15069512
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcacg-gaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  15069263 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgttcctcggggataaagttttgaaagaagtagcaaatgaaccaactgcggcatcgatgtgggcaa 15069362  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15069363 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatgga 15069462  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15069463 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 15069512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 412
Target Start/End: Original strand, 41383348 - 41383763
Alignment:
Q  12 agagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtca 110  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| || | || | ||||||||||| | ||  |||| | || ||| ||||||||||||||    
T  41383348 agagatggtggacaaggccaggagtgtcattgtcttgtgcctcaggaaaaaagatttgagagaagcaacaaaggaaacaaccgcgacatcgatgtggtca 41383447  T
Q  111 aagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgg 210  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||   |||||||||| |||||||    
T  41383448 aagttcaaatatttgtatatgacaaagtctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttgagatggtaaagtcaaaggctatcatgg 41383547  T
Q  211 agaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg------------atgcaaatgctttgatggtgtg--ttgtttcgaggtt 296  Q
    ||  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||            |||  | |||| ||||||||||  |||||| |||| |    
T  41383548 agctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgtgactgctctgatggtgtggtttgtttggaggat 41383647  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    || ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41383648 gatgaaggtgatgtgtctcaccttgagagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 41383747  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  41383748 aagaatactcatgatc 41383763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 382 - 733
Target Start/End: Original strand, 41383768 - 41384121
Alignment:
Q  382 tggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttg 481  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||     |    
T  41383768 tggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtgcacatttgctagttgaggtagag 41383867  T
Q  482 gaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatga 581  Q
     | ||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41383868 tacgctcatcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacggctatggaggaccttggatgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 41383966  T
Q  582 agacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaagg 678  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||| || ||||||||    
T  41383967 agacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggttatttgatgcaaggtgaccttcaagg 41384066  T
Q  679 aaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    || |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  41384067 aagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 41384121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 27827668 - 27827930
Alignment:
Q  1 agtggagaag-cagagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggca 98  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||    
T  27827668 agtggagaagaccgagatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggca 27827767  T
Q  99 tcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaa 198  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  27827768 tcgatgtgggcaaagttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaa 27827867  T
Q  199 aggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27827868 aggccatcatggagcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 27827930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 18811404 - 18811653
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  18811404 gagatggtggacaaggcctggagtgtcattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaa 18811503  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    || | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18811504 agatggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 18811603  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18811604 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 18811653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 43080298 - 43080547
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  43080298 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggagataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaa 43080397  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  43080398 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatgga 43080497  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43080498 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 43080547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 15071868 - 15072226
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15071868 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctattgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 15071967  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15071968 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgacaatggaagaccttgagtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 15072066  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||  |  || |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15072067 ttcatgaagacggaaggcattccgg--gttgaagaatgtatagcacggcaagcaggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagacc 15072164  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
T  15072165 ttcaaggaagcaggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtagaactacct 15072226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31577931 - 31577683
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| | |||| |||||||||||||||    
T  31577931 gagatggtggacaaggccagaagtgtcattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaggtagcgaaggaaccaattgcgtcatcgatgtggtcaa 31577832  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || | | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31577831 agttggagtctgtgtatatgacaaagtctttggctcttcggcaattcctaaagcaacaactctact-attcaagatggtggagtcaatggccatcatgga 31577733  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31577732 gcaacttacggagttcaacaaaatccatgatgacttggagaatattgagg 31577683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34256101 - 34255852
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || || | |||||| || ||  |||||||||||||||    
T  34256101 gagatggtggacaaggctatgagtgccattgtcttgtgcctcggggacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcaacatcgatgtggtcaa 34256002  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  34256001 agttggagtcgttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 34255902  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || |  || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34255901 gcaattggcggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgagg 34255852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 261
Target Start/End: Original strand, 17848303 - 17848471
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  17848303 gcggaatcgatgtggtcaaagttggagtctttgtatatgacaatctctttggctcatcggaaattcctaaagcaacaactctactcattgaagatgttgg 17848402  T
Q  193 agtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17848403 agtcaaagttcatcatggagtaacttacgaagttcaatacaatccttgatgacttggagaatattgagg 17848471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 4732231 - 4732480
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||  |||||| |||||||||| || || |||||||| || || || | |||||| || | ||| |||||||||||||    
T  4732231 gagattgtggacaaggctaggagtgtcattgtcatgtgcctcggtgacaaagttttgagggatgtcgcgaaggaacctaccgtggcgtcgatgtggtcaa 4732330  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| ||    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||    
T  4732331 agttggagacattgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatgga 4732430  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || | ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4732431 gcaattaacggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgagg 4732480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 5591459 - 5591707
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || | |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  5591459 gagatggtggacaggct-aggagtgccattgtcttgtgcctcggtgataaagttttgagggatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcgtcgatgtggtcaa 5591557  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || |  ||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || | |  ||    
T  5591558 agttggagtcattgtatatgatcaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagttaaagaccgtgacaga 5591657  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || | ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5591658 gcaattgacggagttcaacaaaattcttgatgatttggagaacattgagg 5591707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 419 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 31574746 - 31574432
Alignment:
Q  419 ttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaa 518  Q
    |||||||| ||||||||||||  || ||  |||| |||||| |||||||||||||||     | ||||||| ||| || ||||||| |  |||  || ||    
T  31574746 ttgaggtggagtttcaaggtgaaagtcattgtgg-atgtacgcatttgctagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtttatgacatcgggaa 31574648  T
Q  519 tggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagtt-gaagaatgtataa 617  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31574647 tgatacgactatggaga-ccttgggtgctatgctctagttatgagaaagggaattcttcatgaagacagaaggcattcc-gaagtttgaagaatgtataa 31574550  T
Q  618 cacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt-gttgaaga-ggttatggtgg 715  Q
    ||   | || ||||||||| | |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||| |||||||| ||||||||||     
T  31574549 catggcatgtgggattacctttaaagaacaagggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcaggagacgtctcgtggttgaagagggttatggtgt 31574450  T
Q  716 atacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  31574449 atacttgcggaactacct 31574432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 269 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 34255486 - 34255346
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||  || |||||||| | |||||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34255486 tgctttggtggtgagttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtggagtggtgttcgtctggagagacgttaaaca 34255387  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34255386 ctcaacatcagcctggagaggtggtggtaagaatactcatg 34255346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 277 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 31577324 - 31577192
Alignment:
Q  277 tggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacat 376  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  31577324 tggtgtcttgttgggaggatgaagaatgtgatgtttctcaccttgtgaattatgccttgtagagcggtgttcttctggagagacgttaaacactcaacct 31577225  T
Q  377 cagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31577224 cagcctggagaggcggttgtaagaatactcatg 31577192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 269 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 41365993 - 41365853
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||| |  ||||||||||| | ||| |||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  41365993 tgctttggtggtgtgttgatgggaggatgaagaaggtgaagtctctcaccttggtattgaggccttgtagagtggtgattgtctggagagacgttaaaca 41365894  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41365893 ctcaacatcagcctggagaggcggtgggaagaatactcatg 41365853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 298 - 409
Target Start/End: Original strand, 17848859 - 17848970
Alignment:
Q  298 aagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggta 397  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |    
T  17848859 aagaaagtgatgtttctcaccttgggaattatgccttgtagagcggtggtcgtctggagagacattaaacattcaacatcaccctggagaggcggtcgaa 17848958  T
Q  398 agaatactcatg 409  Q
    |||||| |||||    
T  17848959 agaatagtcatg 17848970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 269 - 409
Target Start/End: Original strand, 4732817 - 4732957
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| ||| | ||||||  |||| ||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||| || ||| |||| |||| | |||||||||||||||    
T  4732817 tgctttggtggcgagttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtttagagagacgttaaaca 4732916  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4732917 ctcatcatcagcctggagaggcggtgggaagaatactcatg 4732957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 257 - 366
Target Start/End: Original strand, 15069859 - 15069971
Alignment:
Q  257 tgaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 353  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15069859 tgaggatgcaggtgctttgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatggatctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcatctg 15069958  T
Q  354 gagagacgttaaa 366  Q
     ||||||||||||    
T  15069959 aagagacgttaaa 15069971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 483 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 41365752 - 41365502
Alignment:
Q  483 aagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg-- 580  Q
    ||||||| ||| || |||||||||  |||| || ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||      
T  41365752 aagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatggagg-ccttgggtgctatgctctagttgtgagcatgggaattcttcatgaa 41365654  T
Q  581 -aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaagga 679  Q
     |||||||||| |||||||||  |||||||||||||   |  ||| | | ||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  41365653 gaagacggaagacattccagagtttgaagaatgtatggtatgactagtgtgatta-cctaaaagaccaagagtgattggatgcacgatgatcttcaagga 41365555  T
Q  680 aacgggagatgttccgtg-ttgaagaggttatggtggatacttgtggaactac 731  Q
    | | |||||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||||||||| ||||    
T  41365554 agcaggagatgttccgtgtttgaagaaggtttggtgtatacttgtggagctac 41365502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 362 - 412
Target Start/End: Original strand, 15071820 - 15071870
Alignment:
Q  362 ttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071820 ttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 15071870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 10684841 - 10684944
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  10684841 gcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtgg 10684940  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  10684941 agtc 10684944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35744900 - 35744797
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35744900 gcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcatagacaactcttgaagcaacaactctactcattcaagatggtgg 35744801  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  35744800 agtc 35744797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 483 - 733
Target Start/End: Original strand, 17849103 - 17849351
Alignment:
Q  483 aagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaa 582  Q
    ||||||| ||| || |||||||||  ||| |||| |  ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||| || |||||||  ||    
T  17849103 aagctcaccttgaggtggagttgatgacattggacaaagtatgactatggaga-ccttgggtgctaggctctagttgttagcaagagaattcttcaaaaa 17849201  T
Q  583 gacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaac 682  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||  ||||| | |||||  ||||||  |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||      
T  17849202 gacggaaggcatttcggattttgaagaatgtatgacatgacttgtgtgatta-tctaaaagaccaaggatgattggatacaaggtgatcttcaaggaagt 17849300  T
Q  683 gggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    | ||||  ||    |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  17849301 gtgagactttagtggttgaagagggtttggtgtagacttgtggaactacct 17849351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 644 - 714
Target Start/End: Original strand, 43081263 - 43081333
Alignment:
Q  644 gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtg 714  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43081263 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtg 43081333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 483 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 34255240 - 34254997
Alignment:
Q  483 aagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgct-atgctctagtggtgagcaagggatttcttcatga 581  Q
    ||||||| ||| || |||||||||  |||| || ||||||||||||||||||  ||| ||||| | |||||||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  34255240 aagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggagg-ccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 34255142  T
Q  582 agacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa 681  Q
     ||||||||| ||||| |   |||||||||||||       |||| | ||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||     
T  34255141 ggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgatta-cctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaag 34255043  T
Q  682 cgggagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtgga 726  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | | ||||| | |||||||||    
T  34255042 cgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgtagacttgtgga 34254997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 599 - 692
Target Start/End: Original strand, 27828599 - 27828695
Alignment:
Q  599 gaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgtt 692  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| ||||||    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  27828599 gaagttgaagaatgtatagcacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgtt 27828695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 18853740 - 18853843
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| | || || || |  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | || ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  18853740 gcggcatcgatgtgggctaaattggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtgg 18853839  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  18853840 agtc 18853843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 18812396 - 18812470
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||    
T  18812396 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagagattatggt 18812470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 27828819 - 27828893
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27828819 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaagttaagcgggagatgtttcgtattgaagaggttatggt 27828893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 43081449 - 43081523
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  43081449 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggt 43081523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 636 - 697
Target Start/End: Original strand, 4733216 - 4733277
Alignment:
Q  636 cctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtg 697  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4733216 cctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtg 4733277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6813173 - 6813037
Alignment:
Q  123 ttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacga 222  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| || || || | || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  | |||| |||| || | || |    
T  6813173 ttgtacatgacgaaatcgttggctcataggaaactcttgaaacaacaactctactcattgaagatggtggagtctaaatcaatcacggagcaattgacaa 6813074  T
Q  223 agttcaacagaatccttgatgacttggagaacattga 259  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  6813073 aatttaacaaaattcttgatgacttggccaacattga 6813037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 642
Target Start/End: Original strand, 18812321 - 18812364
Alignment:
Q  599 gaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaa 642  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18812321 gaagttggagaatgtatagcacaacttgcgggattactctaaaa 18812364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26300818 - 26300756
Alignment:
Q  123 ttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaag 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||| || | || ||||||||||| |||||||||    
T  26300818 ttgtacatgacaaaatctttggctcatagacaactcttgaaacaacaactctattcattcaag 26300756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 700 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 40220551 - 40220518
Alignment:
Q  700 gaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40220551 gaagaggttatggtggagacttgtggaactacct 40220518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 41384218 - 41384291
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||| |||||| |||||||   |||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  41384218 aaaatccaaggatgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggatatgtctcgtattgaagaggttatggt 41384291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 700 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 42436141 - 42436108
Alignment:
Q  700 gaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42436141 gaagaggttatggtggagacttgtggaactacct 42436108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 180; Significance: 8e-97; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 35216988 - 35216553
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216988 gtgttgtttggaggaagaaaaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 35216889  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||         
T  35216888 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 35216789  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  35216788 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat- 35216691  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
                      |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||   || |||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  35216690 ------------------gaagttaaagaatgtatagcacgacttgcgagattattctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaat 35216609  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  35216608 gaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 35216553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 31734104 - 31733747
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  31734104 atcagtctggagaggcggaggtaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 31734005  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | |  |||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31734004 ggtagagtacactcagcttgaggtggagttgaacacatcggtaatggtacgactatggaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagtgatttc 31733906  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttc 674  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31733905 ttcatgaagacgaaagacattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgctagattaccctaaaaagccaaaggtgattggatgcaaggagatcttc 31733806  T
Q  675 aaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31733805 aaggaagcgggagatgtcctgtgttaaagattttatggtggatacttgtggaactacct 31733747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 36560162 - 36559728
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36560162 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcgccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 36560063  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||         
T  36560062 ttggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 36559963  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  36559962 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat- 36559866  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
                      ||||||| ||||||| || |||  |||||| |||||| ||||   || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  36559865 ------------------gaagttggagaatgtgtagcacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaag 36559784  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||||| | ||||||| || ||||||| |||||||    
T  36559783 gaagcggaagatgttctgcgttgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacct 36559728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 381 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 21519577 - 21519223
Alignment:
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggtt 480  Q
    |||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||         
T  21519577 ctggagagccggaggcaaaaatactcatgatctacttgttgaggtgaagcttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 21519478  T
Q  481 ggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 580  Q
    | | ||||||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21519477 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 21519379  T
Q  581 aagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaag 677  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||  |||||||||||| | ||||||   |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21519378 aagacggaaggcattccggaggttgaagaatatatagcacggcttgcgggattatcttaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaag 21519279  T
Q  678 gaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  21519278 gaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 21519223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 6263379 - 6263020
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6263379 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctgcctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 6263280  T
Q  475 gaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttc 574  Q
    |     | | ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6263279 ggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctag--gtgagcaagggatttc 6263182  T
Q  575 ttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa---gccaagggtgattggaggcaaggagatc 671  Q
    ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  6263181 ttcatgaagacagaagacattctggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagtgtgattggatgcaaggtgatc 6263082  T
Q  672 ttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||||| | | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  6263081 ttcaaggaagcgggagatatcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacct 6263020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 6263792 - 6263377
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | | | |||| | || |||||||||||||||||||    
T  6263792 gagatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcgggaataaagtttcgagagaagcaacgaaggaaacaaccgcggcatcgatgtggtcaa 6263693  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6263692 agttcagatatttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatgga 6263593  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacatt------------gaggatgcaaatgctttgatggtgt---gttgtttcgaggtt 296  Q
    | |||||| | ||||||||| ||   ||| ||| ||||||||||||            ||||||||   |||| |||||||||   ||||||| |||| |    
T  6263592 gcaacttatggagttcaacaaaacagttggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggcgttgtttggaggat 6263493  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||    
T  6263492 gaagaaggtgatgtccctcaccttgggattgatacctggtggagtggtggtcgtctggagaaacgttaaacactcaacatcaacctgaagagacgatggt 6263393  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  6263392 aagaatactcatgatc 6263377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 257 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 19503381 - 19502919
Alignment:
Q  257 tgaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 353  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19503381 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcagtggtcgtctg 19503282  T
Q  354 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggc 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||     
T  19503281 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggtggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggg 19503182  T
Q  454 atgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctc 553  Q
    ||| || |||||||||| ||||     | | ||||||| | || |||||||||| |||| || ||||||||| ||||  || |||| ||||||||||| |    
T  19503181 atgcacgcatttgctagctgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaatacaccggtaatggtacggctattaaggaccttgggtgctatgcgc 19503082  T
Q  554 tagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa---aaagccaagg 650  Q
    || |||||| ||||||||||||||||                   |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| ||||   || |||||||    
T  19503081 ta-tggtgaccaagggatttcttcat-------------------gaagttgaagaatgtatagcacggcttgcgagattactctaaaagaatgccaagg 19503002  T
Q  651 gtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  19503001 gtgattggatgcaagatgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 19502919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 36560779 - 36560530
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||| ||| |||    
T  36560779 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaa 36560680  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  36560679 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 36560580  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  36560579 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 36560530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 35217607 - 35217359
Alignment:
Q  14 agatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  35217607 agatggtggacaaggccaggagtgccgttgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaaa 35217508  T
Q  113 gttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggag 212  Q
    ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  35217507 gttggaatctttatatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggag 35217408  T
Q  213 aaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
     |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35217407 caacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 35217359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19503974 - 19503725
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| |||    
T  19503974 gagatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatgtgggcaa 19503875  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||    
T  19503874 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcaattcctaaagcaatgactctactcattcaggatgatagagtcaaaggccatcatgga 19503775  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19503774 gcaacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 19503725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21520331 - 21520091
Alignment:
Q  14 agatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||| ||||    
T  21520331 agatggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaatttttgagagaagtagcaaaggaaccaaccgcagcatcgatgtggccaaa 21520232  T
Q  113 gttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggag 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  21520231 gttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcatttaggatggtggagttaaatgccatcatggag 21520132  T
Q  213 aaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaa 253  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21520131 caacttacggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaa 21520091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22405564 - 22405327
Alignment:
Q  17 tggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagtt 115  Q
    ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  22405564 tggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcgaaggaaccaaccgcgacatcgatgtgggcaaagtt 22405465  T
Q  116 cgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaa 215  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22405464 ggaatctttgtatatgacaaagtctttggcttatcagcaattcctaaagcaacgattctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatggagcaa 22405365  T
Q  216 cttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaa 253  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22405364 cttacggagttcaacaaaatccttgatgacttagagaa 22405327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 257 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 21519739 - 21519581
Alignment:
Q  257 tgaggatgcaaatgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 353  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21519739 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgttcgtctg 21519640  T
Q  354 gagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21519639 gagagacgttaaacactcaacatcatcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 21519581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 281 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31734233 - 31734102
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 380  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31734233 gtgttgtttggaggataaagaaggtgatgtttctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcaac 31734134  T
Q  381 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  31734133 ctggagatgtggtgataagaatactcatgatc 31734102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 485 - 643
Target Start/End: Original strand, 22404976 - 22405134
Alignment:
Q  485 gctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaaga 584  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||| || ||||||| | |||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22404976 gctcagcttgaggtggaattgaacacaccggtaatggtatggctatggaggaccttgagtgttatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaaga 22405075  T
Q  585 cggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaa 643  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22405076 cgaaaggcattccggaggttgaagaatgtataacacggcttgcgggattaccctaaaaa 22405134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 314 - 412
Target Start/End: Original strand, 22402266 - 22402364
Alignment:
Q  314 tcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 412  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22402266 tcaccttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcttggagaggcggtggtaagaatattcatgatc 22402364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34574796 - 34574620
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||| ||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||  |||||| || |||||||||||||||||||    
T  34574796 gagatgatggacaagaccagaagcgccattgtcttgttcctcggggataaattttttagagatgtagcaaaggaaccaaccgcggcatcgatgtggtcaa 34574697  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatg 188  Q
    |||| || | |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  34574696 agttggagtctttgtatatgacaaagcctttggctcataggcaattccaaatgcaacaactctactcatttaagatg 34574620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 269 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14634979 - 14634841
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| | || |||||||  |||| |||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14634979 tgctttggtagtatgttgttgggaggatgaagagggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgatcgtctggagagacgttaaaca 14634880  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactca 407  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14634879 ctcaacatcagcctagagaggcggtgggaagaatactca 14634841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 296 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 28569426 - 28569310
Alignment:
Q  296 tgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtgg 395  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28569426 tgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgacttgtagagtggtggtcgtctagagagatgttaaacactcaacatcagtctggagaggcggtgg 28569327  T
Q  396 taagaatactcatgatc 412  Q
     || |||||||||||||    
T  28569326 gaaaaatactcatgatc 28569310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 509 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 14634708 - 14634485
Alignment:
Q  509 acactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaag 608  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||| || |||||||||||||||||   ||||||    
T  14634708 acaccggaaatggtacgactatggagggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgagaattcttcaagaggacggaaggcattccagggtttgaag 14634609  T
Q  609 aatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaag-ccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgt-gttgaagagg 706  Q
    ||| |||  |    |||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14634608 aatatatggcgttgcttatgtgatta-cctaaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagagg 14634510  T
Q  707 ttatggtggatacttgtggaactac 731  Q
     | ||||| | ||||||||| ||||    
T  14634509 gtttggtgcagacttgtggagctac 14634485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 42019367 - 42019235
Alignment:
Q  129 atgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttca 228  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| || |||||||    
T  42019367 atgaccaagtctttggcttataggcaattcctaaaacaccaactttatacatttaagatggtggagtcaaaggtcatcgtggagtaactaacaaagttca 42019268  T
Q  229 acagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42019267 acaaaatccatgatgacttggagaacattgagg 42019235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 585 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 13829167 - 13829021
Alignment:
Q  585 cggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgg 684  Q
    ||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||   |||| || ||||||||||||    |||||||||||||  |||| |||||||||||||| | |    
T  13829167 cggaaggcattctggagtttgaagaatgtatagcatggcttgtggcattaccctaaaagagtaagggtgattggatacaagaagatcttcaaggaagcag 13829068  T
Q  685 gagatgttccgt-gttgaagaggttatggtggatacttgtggaacta 730  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13829067 gagatgttccgtggttgaagaggttatggtgtatacttgtggaacta 13829021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28569992 - 28569834
Alignment:
Q  83 ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattc 182  Q
    |||||| || |||| |||||| || |||||||| || |  | ||| ||||| || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  28569992 ggaaccaaccgcggaatcgatatgatcaaagttggagtcgtggtatatgaccaaatctttagctcatcgacagatcctaaaacaaaaactttactcattc 28569893  T
Q  183 aagatggcggagtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttga 241  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28569892 aagatggtagagtcaaaggccatcatggatcaacttacggagttcaacaaaatccttga 28569834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 297 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 41304219 - 41304109
Alignment:
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||     
T  41304219 gaagaaggtgatgcctttcaccttgtgactgatgccttatagagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaaaatcagcttggagatgcggtggg 41304120  T
Q  397 aagaatactca 407  Q
    |||||||||||    
T  41304119 aagaatactca 41304109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 519 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 28569167 - 28569023
Alignment:
Q  519 tggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataac 618  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| || || |||||||||||| |   |||||||||||||  |    
T  28569167 tggtacgactatggaga-cctagggtgctattctctagttgtgagcaaggtaattcttcaagaggatggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggc 28569069  T
Q  619 acaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaag 665  Q
    |  ||||| |||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28569068 atgacttgtgggatta-tcgaaaaagccaagggtaattagaggcaag 28569023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 475
Target Start/End: Original strand, 22402362 - 22402462
Alignment:
Q  375 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttga 474  Q
    ||||| ||||||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  22402362 atcagtctggagaggtggaggcaataatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggaatgtacgcattttctagttga 22402461  T
Q  475 g 475  Q
    |    
T  22402462 g 22402462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 196
Target Start/End: Original strand, 23079041 - 23079147
Alignment:
Q  90 actgcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatgg 189  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | || ||||||||||| |||||||||||||    
T  23079041 actgcggcatcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatgg 23079140  T
Q  190 cggagtc 196  Q
     ||||||    
T  23079141 tggagtc 23079147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 547 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 42018572 - 42018425
Alignment:
Q  547 tatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagcc 646  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||    ||||| |||||||  ||    
T  42018572 tatgctctagttgtgagcaggggaattcttcaagaggatggaaggcattccaggagttgaagaatgtatgacatgactttttagatta-cctaaaagacc 42018474  T
Q  647 aagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccg 695  Q
    |||||| ||| || ||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  42018473 aagggtaattagatgcatgaagatcttcaagaaaacatgagatgttccg 42018425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19348783 - 19348684
Alignment:
Q  97 catcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtc 196  Q
    ||||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| | ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19348783 catcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcatagacaactcttgaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtc 19348684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25403160 - 25403057
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || | || ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25403160 gcggcatcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtgg 25403061  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  25403060 agtc 25403057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 42018845 - 42018734
Alignment:
Q  296 tgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtgg 395  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |  |    || || ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42018845 tgaagaaggtgatgtttctcaccttggaaatgatgccttataaatgaatgatcatcttgaaagacattaaacactcaacatcatcctggagaggcggtgg 42018746  T
Q  396 taagaatactca 407  Q
     |||||||||||    
T  42018745 gaagaatactca 42018734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 629 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 31733660 - 31733579
Alignment:
Q  629 ggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatg 711  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||   |||  |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31733660 ggattaccctaaaa-gccaagggtgattgggcacaaatagatcttcaaggaagcgggagatgttctgtattgaagaggttatg 31733579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 6396624 - 6396475
Alignment:
Q  515 gaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgta 614  Q
    ||||| ||| ||||||||||| | | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||||||  | |||||||||||||   |  ||||| |||||||    
T  6396624 gaaattgtatgactatggaga-ctttgggtgatatgatctagttgtgagtaagggaattcttcaacatgacggaaggcattttgggggttgacgaatgta 6396526  T
Q  615 taacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaag 665  Q
    |||||| ||||| ||||||| |  ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  6396525 taacacgacttgtgggattaactgaaaagaccaagggtaattggaggcaag 6396475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 19502822 - 19502748
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  19502822 aaaagccaagggtgattgggtataagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 19502748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 35216456 - 35216382
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  35216456 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggt 35216382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 641 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 36559630 - 36559557
Alignment:
Q  641 aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  36559630 aaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggt 36559557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 645 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 41303914 - 41303825
Alignment:
Q  645 ccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtg-ttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| | || |||||||  ||||||| || |||||| | ||||| || |||||||||||||||    
T  41303914 ccaagggtgattggaagcaatgagatcttcacgaaagcgggagacattccgtgattaaagagggtttggtgtattcttgtggaactacct 41303825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 10446017 - 10446120
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |  ||||||||||| || || ||||||||| || || || | || ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  10446017 gcggcgtcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatcgttggctcataggaaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtgg 10446116  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  10446117 agtc 10446120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 517 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 41304029 - 41303969
Alignment:
Q  517 aatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttca 578  Q
    |||||||| |||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  41304029 aatggtacaactatggagatctt-gggtgctaggctctagttgtgagcaagggaattcttca 41303969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 412
Target Start/End: Original strand, 80507 - 80922
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||| | || ||| |||||||||||||||    
T  80507 gagatggtggacaaggccatgagtgtcattgtcttgtgcctcgggaataaagtttagagagaagtagcaaaggaaacaaccgcgccatcgatgtggtcaa 80606  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  80607 agttcgaatatttgtatatgacaaagtctttggctcaacggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatgga 80706  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaaca------------ttgaggatgcaaatgctttgatggt---gtgttgtttcgaggtt 296  Q
    |  ||||  | ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||            ||||||||||   || | |||||||   ||||||||| |||| |    
T  80707 gctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgttctgatggtgtggtgttgtttggaggat 80806  T
Q  297 gaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggt 396  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  80807 gaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcgagggt 80906  T
Q  397 aagaatactcatgatc 412  Q
    ||||||||||||||||    
T  80907 aagaatactcatgatc 80922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 172; Significance: 5e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 281 - 733
Target Start/End: Original strand, 23387 - 23819
Alignment:
Q  281 gtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtgg-tcgtctggagagacgttaaacactcaacatcag 379  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23387 gtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcag 23486  T
Q  380 cctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggt 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||        
T  23487 cctggagaggcggtggtaagaatactcaggatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtag 23586  T
Q  480 tggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcat 579  Q
     | | ||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23587 agcacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat 23685  T
Q  580 gaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaagga 679  Q
    ||||                   ||| ||||||| || |||  ||||||  ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23686 gaag-------------------ttggagaatgtgtagcacggcttgcgaaattactctaaaa-gccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaagga 23765  T
Q  680 aacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
    | |||||||||||| | | |||||| | ||||||| || ||||||| |||||||    
T  23766 agcgggagatgttctgcgctgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacct 23819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 22767 - 23016
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| | | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||| ||| |||    
T  22767 gagatggtggacaaggcccggagtgccgttgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagcaaaggaagcaaccgcggcatcgatatgggcaa 22866  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22867 agttggaatctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatgga 22966  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22967 gcaacttacggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgagg 23016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 23916 - 23990
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  23916 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 23990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 165; Significance: 7e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 503 - 727
Target Start/End: Original strand, 3966 - 4190
Alignment:
Q  503 ttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctagggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaag 602  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  3966 ttgaacacaccagaaatggtacgactatggaggaccttgggtgatatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccaaagt 4065  T
Q  603 ttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaa 702  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  4066 ttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggatgtaaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaa 4165  T
Q  703 gaggttatggtggatacttgtggaa 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4166 gaggttatggtggatacttgtggaa 4190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26528 - 26288
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| | || | |||||||| |||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  26528 gagatggtggacaaggccatgattgctattgtcttgtgcctcgagaattaagttttgagggaagtagcaaaggaaccaactgcgacatcgatgtggtcaa 26429  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26428 agttcgaatatttgtatatgataaagtctttggctcatcggcaattccaaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatgga 26329  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaa 253  Q
    ||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26328 gaaacttgcggagttcaa-aaaatccttgatgacttggagaa 26288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 26275 - 26196
Alignment:
Q  428 agtttcaaggtggtagacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaa 507  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  26275 agtttcaaggtggaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgagaggtagaaagctcagctttaggtggagttgaa 26196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 73152 - 72906
Alignment:
Q  16 atggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaaagt 114  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  73152 atggtggacaaggccaggagtgccattgtcttgtgcctcggagataaagttttgagagaagtagcaaaggaacgaactgcggcatctatgtgggcaaagt 73053  T
Q  115 tcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatggagaa 214  Q
    | |||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  73052 tggaatctttgtatatgacaaaatctttgactcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagca 72953  T
Q  215 acttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  72952 acttacagagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgagg 72906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 342 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 70485 - 70111
Alignment:
Q  342 ggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtgaagtttcaaggtggt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  70485 ggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagttgcggtggtaataatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttga 70386  T
Q  442 agacaaagtggcatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagctttagttggagttgaacacactggaaatggtacgactatggagaacctag 541  Q
    ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||     | | ||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |    
T  70385 agacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcatcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgactatggaagaccttg 70286  T
Q  542 ggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccagaagttgaagaatgtataacacaacttgcgggattaccctaa- 640  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||                   || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||     
T  70285 ggtgctatgctcta-tggtgaggaagggatttcttcat-------------------gaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattactctaaa 70206  T
Q  641 --aaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacct 733  Q
      || |||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| | |  ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  70205 agaaggccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaggaagcgggagatgtcctgcattgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacct 70111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 72547 - 72466
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtg---ttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggt 347  Q
    |||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  72547 tgctttgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggatggatgcctagtggagcggtggt 72466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 261
Target Start/End: Original strand, 115176 - 115425
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagc-acggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || || || | |||||| || |||||||||| ||||||||    
T  115176 gagatggtggacaaggctaggagtgccattgtcttgtgcctcggtgacaaagttttgagcgatgtcgcgaaggaaccaaccgcggcatcgacgtggtcaa 115275  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    ||||  | |  ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||    
T  115276 agttgtagtcattgtatatgaccaagtctttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggattcaaagaccgtgatgga 115375  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    | || | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  115376 gcaattgacagagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgagg 115425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 269 - 402
Target Start/End: Original strand, 115787 - 115920
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||| ||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  115787 tgctttggtggtgagttgttgggaggatgatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtggtcgtctggagagacgttaaaca 115886  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaat 402  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  115887 ctcaacatcagcctggagaggcagtgggaagaat 115920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 269 - 409
Target Start/End: Original strand, 553 - 690
Alignment:
Q  269 tgctttgatggtgtgttgtttcgaggttgaagaaggtgatgattctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 368  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||   |||| |  ||||||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  553 tgctttgatggtgtgttgttgggaggatgaag---gtgaggtctctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgatcgtctggagagacattaaaca 649  T
Q  369 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatg 409  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  650 ctcaacatcagcttggagaggcggtgggaagaatactcatg 690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 261
Target Start/End: Original strand, 150 - 188
Alignment:
Q  223 agttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  150 agttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgagg 188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 636 - 697
Target Start/End: Original strand, 948 - 1009
Alignment:
Q  636 cctaaaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaacgggagatgttccgtg 697  Q
    |||||||  |||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  948 cctaaaagaccaagggtaattgaaaacaaggtgatcttcaaggaaacgggagacgttccgtg 1009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12513 - 12445
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagca 81  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12513 gagatggtggacaaggccaggagtgccgttgtcttgtgcctcggggataaagttttgagagaagtagca 12445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 14886 - 14989
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14886 gcggcatcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcattcaagatggtgg 14985  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  14986 agtc 14989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27011 - 26764
Alignment:
Q  13 gagatggtggacaaggtcagaagtgctattgtcttgtgcctcggggataatgttttgagagaagtagcac-ggaaccgactgcggcatcgatgtggtcaa 111  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||   | ||||| ||||| || || ||| ||  |||||  | || ||||||  |||||||||    
T  27011 gagatggtggacaaggcaagaaatgttattgtcttgtgccctagtgataaagttttaagggatgtaacagaggaacatattgtggcatcattgtggtcaa 26912  T
Q  112 agttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtcaaaggccatcatgga 211  Q
    |||| || |  |||||  ||||||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||| |||||||||||   || ||||    
T  26911 agttggagtcgttgtatgtgacaaattctttggctcatacacaattcctaaaactacatctctactcgtttaagatggtggagtcaaaggttgtcttgga 26812  T
Q  212 gaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattga 259  Q
    | |||| | | |||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26811 gcaactaatggagttcaaacaaattcttgatgatttggagaacattga 26764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 23259 - 23202
Alignment:
Q  350 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactca 407  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||   |||||||| ||||| |||||||||||    
T  23259 tctggagagacgttaaacacactacatcaatatggagaggtggtgggaagaatactca 23202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 261
Target Start/End: Original strand, 149532 - 149700
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    |||||||| |||||| ||||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  149532 gcggcatcaatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactctattcatttaagatggtgg 149631  T
Q  193 agtcaaaggccatcatggagaaacttacgaagttcaacagaatccttgatgacttggagaacattgagg 261  Q
    |||| ||  | |||  |||| |||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||||  ||||||||||    
T  149632 agtctaaatcgatctcggagcaactaacggagtttaacaagattcttgatgatttggccaacattgagg 149700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 196
Target Start/End: Original strand, 458 - 557
Alignment:
Q  97 catcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtc 196  Q
    ||||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  458 catcgatgtgggcaaagttggagtcattgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaagcaacaactttattcattcaagatggtggagtc 557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 2367 - 2441
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  2367 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 2441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 713
Target Start/End: Original strand, 189176 - 189250
Alignment:
Q  640 aaaagccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaaa-cgggagatgttccgtgttgaagaggttatggt 713  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  189176 aaaagccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggt 189250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1987 - 1914
Alignment:
Q  123 ttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtc 196  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||| || | || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  1987 ttgtacatgacgaaatcgttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaaaatggtggagtc 1914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 196
Target Start/End: Original strand, 18521 - 18624
Alignment:
Q  93 gcggcatcgatgtggtcaaagttcgaatatttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcgg 192  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |  ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |  | || |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  18521 gcggcatcgatgtgggctaagttggagtcattgtacatgacgaaatctttggctcataggcaacttttgaaacaacaactctatgcatccaagatggcgg 18620  T
Q  193 agtc 196  Q
    ||||    
T  18621 agtc 18624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1991 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1991
Description:

Target: scaffold1991; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 196
Target Start/End: Original strand, 1028 - 1101
Alignment:
Q  123 ttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtc 196  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || | || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  1028 ttgtatatgacgaaatctttggctcataggcaactcttgaaacaacaactctattcattcaagatggtggagtc 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 196
Target Start/End: Original strand, 30090 - 30163
Alignment:
Q  123 ttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtc 196  Q
    ||||||||||| || |  ||||||||| ||||| || | || |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30090 ttgtacatgacgaaattgttggctcattggcaactcttgaaacaacaactctactctttcaagatggtggagtc 30163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 42754 - 42681
Alignment:
Q  123 ttgtacatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggcggagtc 196  Q
    ||||||||||| || |  ||||||||| ||||| || | || |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42754 ttgtacatgacgaaattgttggctcattggcaactcttgaaacaacaactctactctttcaagatggtggagtc 42681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University