View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8890_low_12 (Length: 640)

Name: NF8890_low_12
Description: NF8890
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8890_low_12
NF8890_low_12
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (6-616)||(19456992-19457602)
chr2 (6-598)||(21703735-21704327)
chr2 (19-598)||(27392069-27392647)
chr2 (10-598)||(27435022-27435609)
chr2 (10-587)||(20837004-20837581)
chr2 (10-587)||(12654628-12655205)
chr2 (10-587)||(28881300-28881877)
chr2 (10-587)||(23129144-23129721)
chr2 (10-587)||(11635767-11636344)
chr2 (10-587)||(11641956-11642533)
chr2 (10-587)||(21677760-21678337)
chr2 (10-587)||(22926606-22927183)
chr2 (10-587)||(32048884-32049461)
chr2 (25-587)||(12717198-12717760)
chr2 (10-587)||(31875367-31875944)
chr2 (10-587)||(34860766-34861343)
chr2 (10-587)||(37686487-37687064)
chr2 (10-587)||(37701752-37702329)
chr2 (10-587)||(37924579-37925156)
chr2 (10-509)||(261343-261841)
chr2 (10-509)||(12585965-12586464)
chr2 (10-509)||(34278613-34279112)
chr2 (10-587)||(16829916-16830493)
chr2 (10-587)||(16890988-16891565)
chr2 (10-587)||(19417077-19417654)
chr2 (10-509)||(27816138-27816637)
chr2 (10-509)||(37374325-37374824)
chr2 (10-509)||(39052406-39052905)
chr2 (10-509)||(40232663-40233162)
chr2 (10-512)||(13937122-13937624)
chr2 (10-509)||(27776371-27776870)
chr2 (10-509)||(9350572-9351071)
chr2 (10-509)||(27802856-27803355)
chr2 (10-509)||(39889226-39889725)
chr2 (10-400)||(34285627-34286017)
chr2 (10-400)||(34290687-34291077)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (6-598)||(15226967-15227559)
chr4 (12-598)||(1899354-1899940)
chr4 (6-616)||(15285510-15286120)
chr4 (19-623)||(14236123-14236727)
chr4 (19-598)||(15391931-15392511)
chr4 (10-587)||(14664123-14664700)
chr4 (10-587)||(17013105-17013682)
chr4 (10-587)||(24592900-24593477)
chr4 (10-509)||(34189546-34190045)
chr4 (10-587)||(30752847-30753424)
chr4 (10-494)||(24111863-24112347)
chr4 (10-584)||(27163906-27164480)
chr4 (10-587)||(40106227-40106804)
chr4 (10-512)||(14763893-14764395)
chr4 (10-587)||(14097646-14098223)
chr4 (10-587)||(21968806-21969383)
chr4 (10-512)||(19372441-19372943)
chr4 (25-587)||(33677948-33678510)
chr4 (10-509)||(5005053-5005552)
chr4 (10-509)||(36345101-36345600)
chr4 (10-509)||(39849806-39850305)
chr4 (10-512)||(6569033-6569535)
chr4 (10-605)||(54832477-54833072)
chr4 (10-587)||(31127107-31127684)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (6-598)||(16450466-16451058)
chr7 (6-598)||(16040406-16040998)
chr7 (10-603)||(16518891-16519483)
chr7 (10-598)||(16503855-16504442)
chr7 (10-587)||(2153664-2154241)
chr7 (10-587)||(10917340-10917917)
chr7 (10-587)||(5127083-5127660)
chr7 (10-587)||(11425251-11425828)
chr7 (10-587)||(16736935-16737512)
chr7 (10-587)||(16751989-16752566)
chr7 (10-587)||(17522623-17523200)
chr7 (10-587)||(17530015-17530592)
chr7 (28-509)||(5120629-5121110)
chr7 (10-587)||(26670389-26670966)
chr7 (10-587)||(11440651-11441228)
chr7 (10-587)||(45386434-45387011)
chr7 (10-587)||(3444385-3444962)
chr7 (10-509)||(26538348-26538847)
chr7 (10-587)||(4145598-4146175)
chr7 (10-587)||(24593016-24593593)
chr7 (10-509)||(26434426-26434925)
chr7 (10-512)||(22142826-22143328)
chr7 (19-587)||(9617742-9618310)
chr7 (10-587)||(26275569-26276146)
chr7 (10-587)||(26320344-26320921)
chr7 (10-509)||(26486219-26486718)
chr7 (10-512)||(5147815-5148317)
chr7 (10-509)||(31124080-31124579)
chr7 (10-509)||(31564874-31565373)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (6-598)||(19490-20083)
scaffold0124 (10-587)||(29543-30120)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (14-598)||(25198120-25198704)
chr5 (10-598)||(23891294-23891882)
chr5 (10-598)||(24951198-24951786)
chr5 (10-587)||(24688643-24689220)
chr5 (10-587)||(30933735-30934312)
chr5 (10-587)||(23718475-23719049)
chr5 (10-587)||(11548453-11549030)
chr5 (10-587)||(22999600-23000177)
chr5 (10-587)||(33776586-33777163)
chr5 (10-587)||(9549029-9549606)
chr5 (10-587)||(2510150-2510727)
chr5 (10-509)||(33291705-33292204)
chr5 (10-587)||(6873401-6873978)
chr5 (10-587)||(8665961-8666538)
chr5 (10-509)||(41673886-41674385)
chr5 (10-509)||(15659246-15659745)
chr5 (10-509)||(28648403-28648902)
chr5 (10-587)||(15759343-15759920)
chr5 (10-587)||(18375898-18376475)
chr5 (10-587)||(24680536-24681113)
chr5 (10-587)||(24723063-24723640)
chr5 (10-587)||(30151117-30151694)
chr5 (10-587)||(31826905-31827482)
chr5 (19-587)||(26479491-26480059)
chr5 (10-512)||(32599955-32600457)
chr5 (10-587)||(5637009-5637586)
chr5 (10-587)||(12131254-12131831)
chr5 (19-587)||(30167568-30168136)
chr5 (10-509)||(3788703-3789202)
chr5 (10-509)||(31430605-31431104)
chr5 (10-512)||(34615695-34616197)
chr5 (10-587)||(9316550-9317127)
chr5 (10-587)||(33515455-33516032)
chr5 (10-509)||(18501234-18501733)
chr5 (10-587)||(29967552-29968129)
chr5 (10-587)||(30028514-30029091)
chr5 (10-509)||(13325330-13325829)
chr5 (10-509)||(40474038-40474537)
chr5 (10-509)||(37671978-37672477)
chr5 (10-509)||(37771485-37771984)
chr5 (10-509)||(43077426-43077925)
chr5 (10-258)||(23752936-23753183)
chr5 (10-512)||(37359141-37359643)
chr5 (10-494)||(37754160-37754644)
chr5 (10-476)||(28960284-28960750)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (6-598)||(18529432-18530029)
chr3 (6-598)||(16627128-16627720)
chr3 (181-604)||(15334768-15335191)
chr3 (10-598)||(15893336-15893924)
chr3 (10-587)||(8301894-8302468)
chr3 (10-587)||(8295026-8295603)
chr3 (10-587)||(18050313-18050890)
chr3 (10-587)||(4797283-4797860)
chr3 (10-587)||(15741712-15742286)
chr3 (10-587)||(35879817-35880394)
chr3 (10-587)||(18329725-18330302)
chr3 (10-587)||(29149385-29149962)
chr3 (10-587)||(6191367-6191944)
chr3 (10-587)||(4720682-4721259)
chr3 (139-587)||(14447676-14448124)
chr3 (10-509)||(4892342-4892841)
chr3 (10-509)||(22388205-22388704)
chr3 (10-587)||(51781062-51781639)
chr3 (10-587)||(51796149-51796726)
chr3 (10-587)||(5609952-5610529)
chr3 (10-587)||(28338354-28338930)
chr3 (10-587)||(36997719-36998296)
chr3 (10-509)||(32438286-32438785)
chr3 (10-512)||(18277682-18278184)
chr3 (10-512)||(28116587-28117089)
chr3 (10-587)||(7995613-7996190)
chr3 (10-587)||(10642121-10642698)
chr3 (10-587)||(31965103-31965680)
chr3 (10-587)||(50134701-50135278)
chr3 (10-509)||(7072341-7072840)
chr3 (10-512)||(18292983-18293485)
chr3 (10-512)||(18308284-18308786)
chr3 (10-587)||(4415967-4416544)
chr3 (10-509)||(8210870-8211369)
chr3 (10-587)||(5012763-5013340)
chr3 (10-587)||(17985586-17986163)
chr3 (10-587)||(24327210-24327787)
chr3 (10-509)||(11110991-11111490)
chr3 (10-509)||(48465044-48465543)
chr3 (10-515)||(10395259-10395764)
chr3 (10-509)||(20577492-20577991)
chr3 (10-509)||(29665615-29666114)
chr3 (10-512)||(18241853-18242355)
chr3 (10-587)||(18224242-18224819)
chr3 (10-509)||(21673822-21674321)
chr3 (10-509)||(28020407-28020906)
chr3 (10-509)||(47022582-47023081)
chr3 (10-512)||(22871504-22872006)
chr3 (10-512)||(22886563-22887065)
chr3 (10-509)||(4347314-4347813)
chr3 (10-509)||(5466114-5466613)
chr3 (10-509)||(6543104-6543603)
chr3 (10-509)||(5596996-5597495)
chr3 (552-598)||(15727987-15728033)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (6-595)||(16208610-16209198)
chr1 (6-598)||(20460186-20460778)
chr1 (10-587)||(41793897-41794474)
chr1 (10-598)||(28584059-28584647)
chr1 (10-587)||(51637307-51637884)
chr1 (10-587)||(10961759-10962336)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (19-598)||(20646-21225)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (6-616)||(20159759-20160375)
chr6 (6-616)||(22172456-22173072)
chr6 (10-587)||(24862804-24863381)
chr6 (10-587)||(22935409-22935987)
chr6 (10-587)||(23857854-23858432)
chr6 (10-587)||(13299483-13300060)
chr6 (10-587)||(15424849-15425426)
chr6 (19-587)||(24305159-24305727)
chr6 (10-583)||(26999163-26999737)
chr6 (10-587)||(26988091-26988665)
chr6 (10-587)||(16748941-16749518)
chr6 (10-587)||(26917468-26918044)
chr6 (7-449)||(27273112-27273555)
chr6 (10-587)||(16944559-16945136)
chr6 (10-587)||(29572100-29572677)
chr6 (10-587)||(30558548-30559125)
chr6 (10-509)||(16673292-16673791)
chr6 (10-509)||(27360542-27361041)
chr6 (10-509)||(27450885-27451384)
chr6 (10-509)||(29548643-29549142)
chr6 (10-509)||(27043554-27044054)
chr6 (7-479)||(27630238-27630710)
chr6 (10-509)||(34463893-34464392)
chr6 (10-512)||(28206604-28207106)
chr6 (10-509)||(17024427-17024926)
chr6 (10-512)||(4546316-4546818)
chr6 (10-509)||(4524454-4524953)
chr6 (10-509)||(4756926-4757425)
chr6 (10-509)||(4772162-4772661)
chr6 (10-509)||(27006877-27007376)
chr6 (10-509)||(29500571-29501070)
chr6 (10-512)||(27484279-27484781)
chr6 (10-509)||(26778159-26778658)
chr6 (10-512)||(4724675-4725177)
chr6 (10-512)||(26116951-26117453)
chr6 (99-509)||(3695267-3695677)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (19-598)||(22081429-22082008)
chr8 (10-598)||(16282531-16283116)
chr8 (10-587)||(16276644-16277221)
chr8 (10-587)||(14556717-14557294)
chr8 (10-587)||(2137807-2138384)
chr8 (10-587)||(19687188-19687765)
chr8 (10-587)||(27609453-27610030)
chr8 (10-587)||(18709676-18710253)
chr8 (10-509)||(19673606-19674105)
chr8 (10-587)||(31490298-31490875)
chr8 (10-526)||(31353675-31354191)
chr8 (19-587)||(19208917-19209485)
chr8 (19-587)||(28362512-28363080)
chr8 (10-587)||(33257813-33258390)
chr8 (10-605)||(19285537-19286132)
chr8 (10-509)||(19279034-19279534)
chr8 (10-509)||(19518691-19519190)
chr8 (10-512)||(29828478-29828980)
chr8 (10-509)||(3330067-3330566)
chr8 (10-605)||(12093281-12093876)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (10-598)||(28842-29430)
scaffold0089 (10-587)||(40658-41235)
scaffold0089 (10-587)||(47574-48151)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (10-587)||(719-1296)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (152-598)||(120912-121358)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (10-587)||(26382-26959)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (10-587)||(48744-49347)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (10-587)||(15519-16096)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (10-598)||(7828-8416)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (106-449)||(40889-41232)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (10-512)||(7102-7604)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (10-509)||(7400-7899)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (444-593)||(1-150)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (10-161)||(26791-26942)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 459; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 616
Target Start/End: Original strand, 19456992 - 19457602
Alignment:
Q  6 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19456992 ttctaggcgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagttttcaggaatgtc 19457091  T
Q  106 tgagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggaga 205  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19457092 taagtcatctcctcttcatcaagagcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgcgcatactcgcggaagctttcatctttcttttgggaga 19457191  T
Q  206 gggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatcttt 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  19457192 gggatctgagaaattccctgtttggtttcaacctggtattaaacccatagtggtttttgaaagcagcagccaattcatcaaaagtgtgaacgtcatcttt 19457291  T
Q  306 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19457292 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccatcaagctatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 19457391  T
Q  406 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagc 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||    
T  19457392 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaattctgggaccttgaacttcttggggatgtccacctttggtaccaagc 19457491  T
Q  506 agaggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttccacagttcc 605  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  19457492 aaagatcatgagtcttaacagtatcactacttccccggttagctttgatttcacgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttccatggttcc 19457591  T
Q  606 agtcatgggag 616  Q
    ||| |||||||    
T  19457592 agttatgggag 19457602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 598
Target Start/End: Original strand, 21703735 - 21704327
Alignment:
Q  6 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21703735 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatctc 21703834  T
Q  106 tgagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggaga 205  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  21703835 tgagtcatctcttcttcatcaagagcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcatctttcttttgggaaa 21703934  T
Q  206 gggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatcttt 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21703935 gggatctgagaaattccctgtttggttttaatctggtattaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatgaacgtcatcttt 21704034  T
Q  306 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 405  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21704035 gctcaagctagtataccattctgcagcgtcttccattaagctatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 21704134  T
Q  406 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagc 505  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  21704135 acatacttgatgatatggttatggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaactctgggaccttgaacttcttggggacgtccacctttggtaccaagc 21704234  T
Q  506 agaggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    |||||||||||||||| ||||  || |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21704235 agaggtcatgagtcttaacagagtccccgttccctcggttagctttgatttcacgacggagttctttagcaagttcttccatcctttcttcca 21704327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 27392647 - 27392069
Alignment:
Q  19 cccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcatctcct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27392647 cccatggtgaccatctcagagaagtcacttggagcaacgatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcatctcct 27392548  T
Q  119 cttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaaa 218  Q
    |||| | ||||   ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| | ||    
T  27392547 cttcattaagagtaggagtaacacgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcatctttcttctggaaaagggacctgaggaa 27392448  T
Q  219 ttccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggtg 318  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||  ||||||||||||     
T  27392447 t-ccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttgaaagcagcagccaattcatcaaaagtgtgaatgtcgtctcggctcaagctggta 27392349  T
Q  319 taccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataa 418  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  27392348 taccattctccagcatcttccattagactatcttgaaagtagtggatcatgagtgaatcattgtctgagtagttagccatcttccggacatatttgatga 27392249  T
Q  419 tgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgagt 518  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  27392248 tgtgattctgtggacaagttagcccattgtatcggtcgaaatccggaaccttgaacttcttagggatatccaccttcggtaccaagcagagatcatgagt 27392149  T
Q  519 cttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    ||| |||| ||||||| | |  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27392148 cttaacagtatcactacttccccgattagctttgatttcccgacggagttccttagcaagttcctccatcctttcttcca 27392069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 598
Target Start/End: Original strand, 27435022 - 27435609
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  27435022 agacgagttcccatggtgaccatttccgagaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 27435121  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  27435122 tcatttcttcttcatcaagggcgggagtaatgcgggcagctgcccc-ctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 27435220  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  27435221 tctgaggaattccctgttcggcttcaatctggtgttaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatgaatgtcatttttgctc 27435320  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  27435321 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaagctatcttggaagcagtgaatcatgagtgaatcattgtctttgtaattacccatctttcggacat 27435420  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27435421 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaagtccgggatcttgaacttcttagggacatccacctttggtaccaagcagag 27435520  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27435521 atcctgagttttgaaagagtctgcattccctcgattagctttgatttcatgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 27435609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 20837581 - 20837004
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  20837581 agacgagttcccatggtgaccatctccgagaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 20837482  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  20837481 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacagaagctttcctccttcttctgggagagaga 20837382  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||| | |||||||    
T  20837381 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcttttttgctc 20837282  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  20837281 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcttggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattacccatctttcggacat 20837182  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  20837181 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatctgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 20837082  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20837081 atcttgagttttgaaagagtctgcattccctcgattggctttgatctcatgacagagttctttagcaagttcctccat 20837004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 12655205 - 12654628
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  12655205 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 12655106  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  12655105 tcatttcttcttcatcaagagcgacagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttttgggagagaga 12655006  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  ||||| || ||||| |||||||| || |||||| | || |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  12655005 tctgaggaattccctgttcggcttcaatctggtattaaacccgtagtggctcttgaaagcaacggctaattcatcaaaggtatgaatgtcatttttgctc 12654906  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  12654905 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcttggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattacccatctttcggacat 12654806  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  12654805 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatctgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 12654706  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12654705 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 12654628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 28881877 - 28881300
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  28881877 agacgagttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 28881778  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  28881777 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcaccgaagctttcctccttcttctgggagagaga 28881678  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  28881677 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 28881578  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  28881577 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcttggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacat 28881478  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  28881477 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatctgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 28881378  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||| | ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28881377 atcttgagttttgaaagagtccgcatttcctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 28881300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 23129144 - 23129721
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  23129144 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcgatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 23129243  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  23129244 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 23129343  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  23129344 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 23129443  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||  |    
T  23129444 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcctggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggatgt 23129543  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  23129544 acttgatgatgtggttctggggacaggtcagcccgttgtattggtcgaaatctgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 23129643  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23129644 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatctcatgacggagttctctagcaagttcctccat 23129721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 11635767 - 11636344
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  11635767 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 11635866  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  11635867 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 11635966  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || |||||||| |||||||| | |||||  ||||||    
T  11635967 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaattcatcaaaggtatggatgtcattcttgctc 11636066  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  11636067 aaactagtataccactctgcagcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 11636166  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  11636167 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 11636266  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    |||  |||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11636267 gtctcgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 11636344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 11641956 - 11642533
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  11641956 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 11642055  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  11642056 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 11642155  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || |||||||| |||||||| | |||||  ||||||    
T  11642156 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaattcatcaaaggtatggatgtcattcttgctc 11642255  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  11642256 aaactagtataccactctgcagcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 11642355  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  11642356 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 11642455  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    |||  |||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11642456 gtctcgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 11642533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 21677760 - 21678337
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  21677760 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 21677859  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  21677860 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 21677959  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  21677960 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 21678059  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || |||||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  21678060 aaactagtataccactctgcggcatcttccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 21678159  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  21678160 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttagggacatccacttttgacactaagcaaag 21678259  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||| | |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678260 gtcttgagttttgacagagtctgcatttcctcggttggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 21678337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 22926606 - 22927183
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  22926606 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 22926705  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  22926706 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 22926805  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  22926806 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 22926905  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  22926906 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 22927005  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  22927006 atttgatgatgtgattttgaggacaagtcagcccgttataccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 22927105  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22927106 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 22927183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 32049461 - 32048884
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  32049461 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 32049362  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  32049361 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 32049262  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  32049261 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 32049162  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  32049161 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcttgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 32049062  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  32049061 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttagggacatccacttttgacactaagcaaag 32048962  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32048961 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 32048884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 587
Target Start/End: Original strand, 12717198 - 12717760
Alignment:
Q  25 gtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcatctcctcttcgt 124  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  12717198 gtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacgtaatctttcttcaacgtctttaagaacgtctgggtcatttcttcttcat 12717297  T
Q  125 caagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaaattccct 224  Q
    | | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || ||||| ||| | || |||||    
T  12717298 ctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagatagggacctgaggaactccct 12717397  T
Q  225 gtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggtgtaccat 324  Q
     || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||  |||||||| || || |||||     
T  12717398 attcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagctgctaattcatcaaaggtatggatgtcattcttgctcaaactagtataccac 12717497  T
Q  325 tctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataatgtggt 424  Q
    || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  12717498 tcagcggcatcctccatcaaactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgtatttgatgatgtggt 12717597  T
Q  425 tctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgagtcttgac 524  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| || || ||||| ||||     
T  12717598 tttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccggaattttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaagatcttgagttttgaa 12717697  T
Q  525 aggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    |   ||   ||||| ||| || || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717698 aaagtccgcattccctcgattggccttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 12717760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 31875944 - 31875367
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  31875944 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 31875845  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  31875844 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 31875745  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  31875744 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 31875645  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  31875644 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 31875545  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  31875544 atttgatgatgtgattttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttagggacatccacttttgacactaagcaaag 31875445  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||  |||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31875444 gtcttgagttttgacagagtctgtattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 31875367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 34861343 - 34860766
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  34861343 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 34861244  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  34861243 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 34861144  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  34861143 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 34861044  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  34861043 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 34860944  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  34860943 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 34860844  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34860843 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 34860766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 37686487 - 37687064
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  37686487 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatcttttttcaacgtctttaagaacgtctggg 37686586  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  37686587 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 37686686  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  37686687 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 37686786  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  37686787 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 37686886  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  37686887 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 37686986  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37686987 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 37687064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 37701752 - 37702329
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  37701752 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatcttttttcaacgtctttaagaacgtctggg 37701851  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  37701852 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 37701951  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  37701952 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 37702051  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  37702052 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 37702151  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  37702152 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 37702251  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37702252 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 37702329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 37925156 - 37924579
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||| ||||| |    
T  37925156 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtttttaagaacgtctggg 37925057  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  37925056 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 37924957  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  37924956 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 37924857  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  37924856 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 37924757  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  37924756 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 37924657  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37924656 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 37924579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 261343 - 261841
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  261343 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 261442  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  261443 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcttcctttttctgagataggga 261542  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  261543 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 261642  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| ||||| || |||||||    
T  261643 agactagtataccactccgcagcgtcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccat-ttccggacat 261741  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  261742 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 261841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12586464 - 12585965
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||||||||| |    
T  12586464 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtttttaagaatgtctggg 12586365  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  12586364 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagataggga 12586265  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| || || || || |||||||| || | |||||| || ||||| || || |||||||||    
T  12586264 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtaatgactcttgaaagcagcggctagttcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 12586165  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  12586164 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 12586065  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || ||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  12586064 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccattatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 12585965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 34279112 - 34278613
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  34279112 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 34279013  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  34279012 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 34278913  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || |  ||||| || || || || ||||||||||||    
T  34278912 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcggcggctagctcatcaaaagtgtggacatcatctttgctc 34278813  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  34278812 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 34278713  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  34278712 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 34278613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 16829916 - 16830493
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  16829916 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 16830015  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  16830016 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 16830115  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| ||||| || | |||||  || |||    
T  16830116 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtgtggatgtcattcttactc 16830215  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  16830216 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 16830315  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  16830316 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 16830415  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16830416 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 16830493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 16891565 - 16890988
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  16891565 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 16891466  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  16891465 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 16891366  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| ||||| || | |||||  || |||    
T  16891365 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtgtggatgtcattcttactc 16891266  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  16891265 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 16891166  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  16891165 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 16891066  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16891065 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 16890988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 19417077 - 19417654
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||| ||||| |    
T  19417077 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtttttaagaacgtctggg 19417176  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  19417177 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 19417276  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  19417277 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 19417376  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  19417377 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 19417476  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  19417477 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 19417576  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19417577 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 19417654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27816637 - 27816138
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  27816637 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 27816538  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || || ||    
T  27816537 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagatagaga 27816438  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  27816437 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 27816338  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  27816337 agactagtataccactccgcagcgtcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 27816238  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  27816237 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactctgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 27816138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 37374824 - 37374325
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  37374824 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 37374725  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  37374724 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 37374625  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |  ||||| || || || || || |||||||||    
T  37374624 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagctcatcaaaagtgtggacatcgtctttgctc 37374525  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  37374524 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 37374425  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   ||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  37374424 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcaaactctgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 37374325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 39052406 - 39052905
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  39052406 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 39052505  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  39052506 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagataggga 39052605  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  39052606 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 39052705  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  39052706 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 39052805  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  39052806 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 39052905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40233162 - 40232663
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  40233162 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 40233063  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  40233062 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagataggga 40232963  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||  |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  40232962 cctaagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 40232863  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| || ||||    
T  40232862 agactagtataccactccgcagcgtcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccgtacat 40232763  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  40232762 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 40232663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Original strand, 13937122 - 13937624
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | |||||| || |    
T  13937122 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtttggg 13937221  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  13937222 tcatttcttcttcatctaaagcaggggtgatgcgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 13937321  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  13937322 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 13937421  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  13937422 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 13937521  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  13937522 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 13937621  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  13937622 gtc 13937624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27776870 - 27776371
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  27776870 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 27776771  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || || ||    
T  27776770 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggctgctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagatagaga 27776671  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  27776670 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 27776571  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  27776570 agactagtataccactccgcagcgtcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 27776471  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  27776470 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactctgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 27776371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 9350572 - 9351071
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||||||||| |    
T  9350572 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtttttaagaatgtctggg 9350671  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  9350672 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagataggga 9350771  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  9350772 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 9350871  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| |  || ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  9350872 agactagtataccactccgcagcatcttccatcaggctgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 9350971  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  9350972 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 9351071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27803355 - 27802856
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  27803355 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 27803256  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || | |||    
T  27803255 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataagga 27803156  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||  |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || | |||||| || ||||| || || || ||||||    
T  27803155 cctaagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagttcatcaaaagtatggacatcgtccttgctc 27803056  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  27803055 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 27802956  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  27802955 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 27802856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 39889725 - 39889226
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  39889725 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 39889626  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | ||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  39889625 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtaatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 39889526  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  || |  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  39889525 cctgaggaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggctagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 39889426  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||| ||   |||||| |||||||| |||||||    
T  39889425 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattatccttgtagttgcccatcttccggacat 39889326  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  39889325 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatatttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgataccaagcagag 39889226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34286017 - 34285627
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  34286017 agacgggttcccatggtgaccatttccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 34285918  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| || || |||||    
T  34285917 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaagctttcctccttcttctgagataggga 34285818  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| ||||| ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| || || |  ||||| || || || || ||||||||||||    
T  34285817 cctgagaaactccctatttggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggcggctagctcatcaaaagtgtggacatcatctttgctc 34285718  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatct 400  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||    
T  34285717 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatct 34285627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34291077 - 34290687
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  34291077 agacgggttcccatggtgaccatttccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 34290978  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| || || |||||    
T  34290977 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaagctttcctccttcttctgagataggga 34290878  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| ||||| ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| || || |  ||||| || || || || ||||||||||||    
T  34290877 cctgagaaactccctatttggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggcggctagctcatcaaaagtgtggacatcatctttgctc 34290778  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatct 400  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||    
T  34290777 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatct 34290687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 15227559 - 15226967
Alignment:
Q  6 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227559 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 15227460  T
Q  106 tgagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggaga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15227459 tgagtcatctcctcttcgtcaagagtgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctttgtgcgtactcgcggaagctttcatctttcttttgggaga 15227360  T
Q  206 gggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatcttt 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15227359 gggatctgagaaattccctgtttggtttcaacctggtattaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtataaacgtcatcttt 15227260  T
Q  306 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 405  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227259 gctcaagctagtataccattctgcagcgtcttccattaagctatcttggaagcaatgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 15227160  T
Q  406 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagc 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  15227159 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaactctgggaccttgaacttcttggggacgtccacctttggtaccaagc 15227060  T
Q  506 agaggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |  |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15227059 agagatcatgagtcttaacagggtccccgttccctcggttagctttgatttcacgatggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 15226967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 1899940 - 1899354
Alignment:
Q  12 acgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1899940 acgagtccccatggtgaccatctcaaagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtc 1899841  T
Q  112 atctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatc 211  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  1899840 atctcctcttcatcaagagcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatatttgtgcatactcgcggaagctttcatctttcttttgggagagagata 1899741  T
Q  212 tgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaa 311  Q
    || |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1899740 tgagaaattccctgtttggtttcaatctggtattaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatgaacgtcatctttgctcaa 1899641  T
Q  312 gctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatac 411  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1899640 gctagtataccattctgcagcgtcttccattaagctatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatac 1899541  T
Q  412 ttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggt 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  1899540 ttgataatgtggttctggggacaagttagcccattgtatcggtcaaactctgggatcttgaacttcttagggacgtccacctttggtaccaagcagagat 1899441  T
Q  512 catgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    |||||||||| ||||  || |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1899440 catgagtcttaacagagtccccgttccctcggttagctttgatttcacgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 1899354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 616
Target Start/End: Original strand, 15285510 - 15286120
Alignment:
Q  6 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15285510 ttctaggcgagtccccatggtgaccatcttagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagttttcatgaatgtc 15285609  T
Q  106 tgagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggaga 205  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15285610 tgagtagtctcctcttcgtcaagagcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgcgcatactcgcagaagctttcatctttcttttgggaga 15285709  T
Q  206 gggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatcttt 305  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  15285710 gggatctgagaaattccctgcttggtttcaacctggtattaaacccataatggtttttgaaagcagcagccaattcatcaaaagtgtgaacgtcatcttt 15285809  T
Q  306 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15285810 gctcaagctggtgtaccattctgcagcatcttccattaagctatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtaattacccatctttcgg 15285909  T
Q  406 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagc 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||    
T  15285910 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaactctgggaccttgaacttcttggggatgtccacctttggtaccaagc 15286009  T
Q  506 agaggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttccacagttcc 605  Q
    | || ||||||||||| | || ||||||| | |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  15286010 aaagatcatgagtcttaatagtatcactacttcccctgttagctttgatttcacgacggagttctttagcaagttcctctatcctttcttccatggttcc 15286109  T
Q  606 agtcatgggag 616  Q
    ||| |||||||    
T  15286110 agttatgggag 15286120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 623
Target Start/End: Original strand, 14236123 - 14236727
Alignment:
Q  19 cccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcatctcct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14236123 cccatggtgaccatctcagagaagttactcggagcagtaatgatcattctttcgacataatccttcttcaaagttttcaggaatgtctgagtcatctcct 14236222  T
Q  119 cttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaaa 218  Q
    |||| |||||| | || || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||  ||||    
T  14236223 cttcatcaagagcaggggtaatacgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcgcggaagctttcatctttcttctggaaaagggatctaagaaa 14236322  T
Q  219 ttccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggtg 318  Q
    |||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||| |||||||||||||     
T  14236323 ttccctatttggcttcaacctggtcttaaacccataatggcttttgaaagcagcagccaattcgtcaaaagtatgaatgtcgtctctgctcaagctggta 14236422  T
Q  319 taccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataa 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14236423 taccattctgcagcgtcttccattaagctatcctggaagcagtgaatcatgagtgaatcattgtctgagtagttagccatcttccggacatacttgataa 14236522  T
Q  419 tgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgagt 518  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14236523 tgtggttttgaggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatccgggactttgaactttttagggacgtccacctttggtaccaagcagagatcatgagt 14236622  T
Q  519 cttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttccacagttccagtcatgggagcc 618  Q
    ||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  14236623 cttaacaggatcaccgtttcctcggttagctttgatttcacgacggagttctttagcaagttcctccatcctctcctccacagttccagttatgggagcc 14236722  T
Q  619 ttccc 623  Q
    |||||    
T  14236723 ttccc 14236727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 19 - 598
Target Start/End: Original strand, 15391931 - 15392511
Alignment:
Q  19 cccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcatctcct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15391931 cccatggtgaccatctcagagaagtcacttggagcagcgatgatcattctttcgacataatccttttttagagtcttcaggaatgtctgagttatctcct 15392030  T
Q  119 cttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctcc-atctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaa 217  Q
    |||| | ||||   ||||| |  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||  | |    
T  15392031 cttcattaagagtaggagtaacacgggcagccgcccccctcccatctctgtgcatactcgcgaaagctttcatctttcttctggcaaagggacctaagga 15392130  T
Q  218 attccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggt 317  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||  ||| ||||||||    
T  15392131 attccctatttggtttcagtctggtgttgaacccatagtggcttttgaaagcagcagccaattcatcaaaagtgtgaatgtcgtctcggcttaagctggt 15392230  T
Q  318 gtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatacttgata 417  Q
     ||||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||||     
T  15392231 ataccattatgcagcatcttccattagactatcctgaaagcagtggatcatgagtgaatcattgtctgcgtaattagccatcttccggacatatttgatg 15392330  T
Q  418 atgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgag 517  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  15392331 atgtgattctgtggacaagttagcccattgtatcggtcgaaatccagaaccttgaacttcttagggacatccaccttcggtaccaagcagagatcatgag 15392430  T
Q  518 tcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    |||| |||| ||| ||| | |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15392431 tcttaacagtatcgctacttccccgattagctttgatttcccgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 15392511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 14664700 - 14664123
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  14664700 agacgagttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 14664601  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  14664600 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttttgggagagaga 14664501  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | || |||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  14664500 tctgaggaactccctgttcggcttcaatctggtgttaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 14664401  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  14664400 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaagctatcttggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 14664301  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  14664300 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatctgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 14664201  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14664200 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatttcatgacggagttctttagcaagttcctccat 14664123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 17013682 - 17013105
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  17013682 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 17013583  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  17013582 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 17013483  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  17013482 tctgaggaattccctgttcggcttcaatctggtgttaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 17013383  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  17013382 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcttgaaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 17013283  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  17013282 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatctgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 17013183  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || || || |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17013182 atcttgggttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 17013105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 24592900 - 24593477
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  24592900 agacgggttcccatggtgaccatctccgagaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 24592999  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  24593000 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatacgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 24593099  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  24593100 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 24593199  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  24593200 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcctggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 24593299  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24593300 atttgatgatgtggttttggggacaagttagcccgttgtaccggtcgaaatctgggattttgaacttcttagggacatccacttttgacaccaagcagag 24593399  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24593400 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttaatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 24593477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 34189546 - 34190045
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  34189546 agacgtgttcccatggtaaccatctctgagaaattgtttggggctgcgataatcatcctttcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 34189645  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| |||||||| || | | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  34189646 tcatttcctcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 34189745  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |  ||||| || || || || ||||||||||||    
T  34189746 cctgagaaactccctatttggcttcagtcttgtattgaacccataatggcttttgaaagcggctgctagctcatcaaaagtgtggacatcatctttgctc 34189845  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  34189846 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 34189945  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  34189946 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 34190045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 30753424 - 30752847
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||||||||| |    
T  30753424 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtttttaagaatgtctggg 30753325  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  30753324 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttttgagataggga 30753225  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||  ||||||    
T  30753224 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcattcttgctc 30753125  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  30753124 aaactagtataccactcagcggcatcctccatcaaactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 30753025  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  30753024 atttgatgatgtggttttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccggaattttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 30752925  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| |   ||   ||||| ||| || || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30752924 atcttgagttttgaaaaagtccgcattccctcgattggccttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 30752847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24112347 - 24111863
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  24112347 agacgtgttcccatggtaaccatctctgagaaattgtttggggctgcgataatcatcctttcaacataatccctcttgagagtcttcagaaatgtctgag 24112248  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| |||||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  24112247 tcatttcctcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 24112148  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |  || |  ||||| || || || || ||||||||||||    
T  24112147 cctgagaaactccctatttggcttcagtcttgtattgaacccataatggcttttgaaagcggttgctagctcatcaaaagtgtggacatcatctttgctc 24112048  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  24112047 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 24111948  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctt 494  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||    
T  24111947 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctacctt 24111863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 584
Target Start/End: Original strand, 27163906 - 27164480
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  27163906 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 27164005  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| || || |||||    
T  27164006 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaagctttcctccttcttctgagataggga 27164105  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  27164106 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 27164205  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  27164206 aaactagtataccactctgcggcgtcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 27164305  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  27164306 atttgatgatgtgattttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttagggacatccacttttgtcactaagcaaag 27164405  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctc 584  Q
    ||| ||||| |||||||  ||  |||||| ||| || || | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27164406 gtcttgagttttgacagagtctgtattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctc 27164480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 40106227 - 40106804
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  40106227 agacgggtccccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 40106326  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  40106327 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 40106426  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  40106427 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 40106526  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  40106527 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 40106626  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  40106627 atttgatgatgtgattttgaggacaagtcagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 40106726  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40106727 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 40106804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Original strand, 14763893 - 14764395
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  14763893 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgtttggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 14763992  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  14763993 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 14764092  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |  ||||| || || || || || |||||||||    
T  14764093 cctgagaaactccctattcggcttcagtcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagctcatcaaaagtgtggacatcgtctttgctc 14764192  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||  | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  14764193 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaaataatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 14764292  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  14764293 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 14764392  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  14764393 gtc 14764395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 14098223 - 14097646
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  14098223 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 14098124  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || || ||||| || ||||| || || |||||    
T  14098123 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacgaaaactttcctccttcttctgagataggga 14098024  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  14098023 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 14097924  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  14097923 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 14097824  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  14097823 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttagggacatccacttttgacactaagcaaag 14097724  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14097723 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 14097646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 21969383 - 21968806
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  21969383 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 21969284  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  21969283 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 21969184  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  21969183 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 21969084  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  21969083 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcttgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 21968984  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  21968983 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttagggacatccacttttgacactaagcaaag 21968884  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21968883 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 21968806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19372943 - 19372441
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  19372943 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 19372844  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  19372843 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcttcctttttctgagataggga 19372744  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  19372743 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 19372644  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  19372643 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 19372544  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  19372543 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 19372444  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  19372443 gtc 19372441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 587
Target Start/End: Original strand, 33677948 - 33678510
Alignment:
Q  25 gtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcatctcctcttcgt 124  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||||||||| ||||| || ||||| |    
T  33677948 gtgaccatctctgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtttttaagaatgtctgggtcatttcttcttcat 33678047  T
Q  125 caagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaaattccct 224  Q
    | | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || ||||| ||| |||| |||||    
T  33678048 ctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagatagggacctgagaaactccct 33678147  T
Q  225 gtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggtgtaccat 324  Q
     || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || | |||||| |||||||| | |||||  ||||| || || || |||||     
T  33678148 attcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagttcatcaaaggtatggatgtcattcttgcttaaactagtataccac 33678247  T
Q  325 tctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataatgtggt 424  Q
    || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  33678248 tcagcggcatcctccatcaaactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgtatttgatgatgtggt 33678347  T
Q  425 tctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgagtcttgac 524  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| || || ||||| ||||     
T  33678348 tttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccggaattttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaagatcttgagttttgaa 33678447  T
Q  525 aggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    |   ||   ||||| ||| || || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33678448 aaagtccgcattccctcgattggccttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 33678510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 5005552 - 5005053
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  5005552 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 5005453  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| ||||| || || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||| || || || |||||    
T  5005452 tcatttcctcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcttttttctgagataggga 5005353  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || | |||||| || ||||| || || |||||||||    
T  5005352 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagttcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 5005253  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||  | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  5005252 agactagtataccactctgcagcatcctccatcagactgtcttggaaataatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 5005153  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  5005152 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttctttggaacatctaccttcgatactaagcagag 5005053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 36345101 - 36345600
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  36345101 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 36345200  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  36345201 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 36345300  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |  ||||| || |||||||| || |||||||||    
T  36345301 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagctcatcaaaagtatgaacatcgtctttgctc 36345400  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  36345401 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 36345500  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || |  |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || | ||||||||||||    
T  36345501 atttgacaatatgattttaaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctactttcgatactaagcagag 36345600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 39850305 - 39849806
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  39850305 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 39850206  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  39850205 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccatctttgcgcatattcccggaaactttcctccttcttctgagataggga 39850106  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| |||||||||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  39850105 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 39850006  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  39850005 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttgaaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 39849906  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  39849905 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 39849806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 6569535 - 6569033
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  6569535 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 6569436  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  6569435 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgctcctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 6569336  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||| || || || || |||||||| || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  6569335 cctgagaaactccctattcggcttcagtcgagtgttaaacccgtaatgactcttgaaagcagcggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 6569236  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  6569235 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 6569136  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  6569135 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 6569036  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  6569035 gtc 6569033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 54833072 - 54832477
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  54833072 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 54832973  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  54832972 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 54832873  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || | |||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  54832872 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagttcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 54832773  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||||| ||| || |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  54832772 agactagtataccattttgcggcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 54832673  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  54832672 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 54832573  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttccacagttcc 605  Q
     || ||||| || | ||  || | ||| |  | ||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  54832572 atcctgagttttaatagagtctccatttcccctgttggccttaatttcccgtcggagctctttggcaagttcttccattctctcttccatagttcc 54832477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 31127107 - 31127684
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||  || || | ||| ||||| |    
T  31127107 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacgtaatctttcttcaacgtttttaagaacgtctggg 31127206  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  31127207 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 31127306  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| ||||| || | |||||  || |||    
T  31127307 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtgtggatgtcattcttactc 31127406  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  31127407 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 31127506  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  31127507 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 31127606  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127607 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 31127684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 445; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 598
Target Start/End: Original strand, 16450466 - 16451058
Alignment:
Q  6 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16450466 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 16450565  T
Q  106 tgagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggaga 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16450566 tgagtcatctcctcttcatcaagagcgggagtgatgcgggcagctacccctctccatctctgtgcatactcgtggaagctttcatctttcttttgggaga 16450665  T
Q  206 gggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatcttt 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||      
T  16450666 gggatctgagaaattccctgtttggtttcaacctggtattaaacccatagtggcttttgaaagcagcagccaattcatcaaaagtgtgaatgtcgtctcg 16450765  T
Q  306 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 405  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16450766 gctcaagctagtataccattctgcagcgtcttccattaatctatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtcggagtagttacccatctttcgg 16450865  T
Q  406 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagc 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  16450866 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaactctgggaccttgaacttcttagggacgtccacctttggtatcaagc 16450965  T
Q  506 agaggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16450966 agagatcatgagtcttaacagggtctccgttccctcggttagctttgatttcacgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 16451058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 16040998 - 16040406
Alignment:
Q  6 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16040998 ttctagacgagttcccatggtgaccatttcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 16040899  T
Q  106 tgagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggaga 205  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16040898 tgagtcatctcttcttcatcaagagcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctttgtgcatactcgcggaagctttcatctttcttttgggaaa 16040799  T
Q  206 gggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatcttt 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16040798 gggatctgagaaattccctgtttggtttcaacctggtattaaacccatagtggcttttgaatgcaacagctaattcatcaaaggtatgaacgtcatcttt 16040699  T
Q  306 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 405  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16040698 gctcaagctagtataccattctgcagtgtcttccattaggctatcttggaagcagtgaatcataagtgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 16040599  T
Q  406 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagc 505  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  16040598 acatacttgataatgtggttatggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaactctgggaccttgaacttcttggggacgtccacctttggtaccaagc 16040499  T
Q  506 agaggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    |||| ||||||||||| ||||  || |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16040498 agagatcatgagtcttaacagagtccccgttccctcggttagctttgatttcacgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 16040406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 603
Target Start/End: Original strand, 16518891 - 16519483
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |    
T  16518891 agacgagttcccatggtgaccatctccgagaagttattcggggcagcaataatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaggaatgtctggg 16518990  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  16518991 tcatttcttcttcatcaagggcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 16519090  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | ||| || ||||||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  16519091 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtattaaacccatagtggcttttgaaagcatg-gctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 16519189  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  16519190 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaagctatcttggaagcagtgaatcatgagtgaatcattgtctttgtaattacccatctttcggacat 16519289  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16519290 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggatcttgaacttcttagggacatccacctttggtaccaagcagag 16519389  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttccacagtt 603  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16519390 atcttgagttttgaaagagtctgcattccctcgattagctttgatttcatgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttccatagtt 16519483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 10 - 598
Target Start/End: Original strand, 16503855 - 16504442
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |    
T  16503855 agacgagttcccatggtgaccatctccgagaagttattcggggcagcaataatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaggaatgtctggg 16503954  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || | ||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  16503955 tcatttcttattcatcaagggcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcagggaagctttcctccttcttctgggagagaga 16504054  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | ||| || ||||||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  16504055 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtattaaacccatagtggcttttgaaagcatg-gctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 16504153  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  16504154 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaagctatcttggaagcagtgaatcatgagtgaatcattgtctttgtaattacccatctttcggacat 16504253  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16504254 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgagatcttgaacttcttagggacatccacctttggtaccaagcagag 16504353  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16504354 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattagctttgatttcatgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 16504442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 2154241 - 2153664
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  2154241 agacgagttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcgatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 2154142  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||    
T  2154141 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgagagagaga 2154042  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  2154041 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 2153942  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  2153941 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcctggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 2153842  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  2153841 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 2153742  T
Q  510 gtcatgagtcttgacag-gatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| || | || | ||||| ||| |  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2153741 atcttgagttttgaaagagttcgc-attccctcgatgggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 2153664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 10917340 - 10917917
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | | ||||||  |    
T  10917340 agacgagttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaaggatgtctagg 10917439  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  10917440 tcatttcttcttcatcaagagcggtagtaatacgggcagctgctcccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 10917539  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  10917540 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 10917639  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |  ||| || |||||||||||||| |    
T  10917640 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaagctatcctggaagcagtggatcataagggaatcattgtgtttgtaatttcccatctttcggacgt 10917739  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  10917740 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatctgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 10917839  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10917840 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatttcatgacagagttctttagcaagttcctccat 10917917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 5127660 - 5127083
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  || || | |||||| || |    
T  5127660 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtttttaagaatgtttggg 5127561  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  5127560 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgagcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 5127461  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||    
T  5127460 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcgaaggtatggatatcatttttgctc 5127361  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  5127360 aaactagtataccactctgcggcatcttccatcaaactatcctgaaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 5127261  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  5127260 atttgatgatgtggttctggggacaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggacatccacttttgacaccaagcagag 5127161  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5127160 gtcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 5127083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 11425251 - 11425828
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||| | ||||||||| |    
T  11425251 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagctatgatcattctctcaacataatccttctttaatgtctttaagaatgtctggg 11425350  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  11425351 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 11425450  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  11425451 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 11425550  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  11425551 aaactagtataccactctgcggcatcttccatcaaactatcctgaaagcagtggatcataagagaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 11425650  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||    
T  11425651 atttgatgatgtggttctggggacaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggacatccactattgacaccaagcagag 11425750  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||| | ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11425751 atcttgagttttgaaagagtccgcatttcctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 11425828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 16736935 - 16737512
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | |||||||||||    
T  16736935 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctgag 16737034  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  16737035 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 16737134  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  16737135 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 16737234  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || ||||| ||||| ||||| || |||||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  16737235 aaactggtataccactctgcggcatcttccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 16737334  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  16737335 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 16737434  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737435 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcggttggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 16737512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 16751989 - 16752566
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | |||||||||||    
T  16751989 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctgag 16752088  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  16752089 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 16752188  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  16752189 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 16752288  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || ||||| ||||| ||||| || |||||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  16752289 aaactggtataccactctgcggcatcttccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 16752388  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  16752389 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 16752488  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752489 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcggttggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 16752566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 17523200 - 17522623
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | |||||||||||    
T  17523200 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctgag 17523101  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  17523100 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 17523001  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  17523000 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 17522901  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || ||||| ||||| ||||| || |||||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  17522900 aaactggtataccactctgcggcatcttccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 17522801  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  17522800 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 17522701  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17522700 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcggttggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 17522623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 17530015 - 17530592
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | |||||||||||    
T  17530015 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctgag 17530114  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  17530115 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 17530214  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  17530215 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 17530314  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || ||||| ||||| ||||| || |||||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  17530315 aaactggtataccactctgcggcatcttccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 17530414  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  17530415 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 17530514  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17530515 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcggttggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 17530592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 5121110 - 5120629
Alignment:
Q  28 accatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcatctcctcttcgtcaa 127  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  5121110 accatctctgagaaattgtttggggctgcgataatcatcctttcaacataatccttcttgagagtcttcagaaatgtctgagtcatttcctcttcatcta 5121011  T
Q  128 gatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaaattccctgtt 227  Q
     | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||| |||| ||||| ||    
T  5121010 aagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagatagggacctgagaaactccctatt 5120911  T
Q  228 tggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggtgtaccattct 327  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |  ||||| || || || || ||||||||||| |  || || ||||| |||    
T  5120910 tggcttcagtcttgtattgaacccataatggcttttgaaagcggctgctagctcatcaaaagtgtggacatcatctttgcttagactagtataccactct 5120811  T
Q  328 gcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataatgtggttct 427  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||   |||||| | |||||| ||||||||||||| ||| || || |    
T  5120810 gcagcatcttccatcagactgtcttggaagcaatgaatcataagggaatcattatccttgtagttgctcatcttccggacatacttgacaatatgatttt 5120711  T
Q  428 ggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  5120710 gaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttgggaacatctaccttcgataccaagcagag 5120629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 26670389 - 26670966
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  26670389 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 26670488  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  26670489 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 26670588  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  ||||||    
T  26670589 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttgctc 26670688  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  26670689 aaactagtataccactcagcggcatcctccatcaaactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 26670788  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  26670789 atttgatgatgtggttttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccggaattttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 26670888  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26670889 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 26670966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 11441228 - 11440651
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||||||||| |    
T  11441228 agacgggttcccatagtgaccatctctgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtttttaagaatgtctggg 11441129  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  11441128 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 11441029  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||  ||||||    
T  11441028 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcattcttgctc 11440929  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  11440928 aaactagtataccactcagcggcatcctccatcaaactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 11440829  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  11440828 atttgatgatgtggttttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccggaattttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 11440729  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| |   ||   ||||| ||| || || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11440728 atcttgagttttgaaaaagtccgcattccctcgattggccttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 11440651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 45387011 - 45386434
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  45387011 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 45386912  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  45386911 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 45386812  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  45386811 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 45386712  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  45386711 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 45386612  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  45386611 atttgatgatgtgattttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttagggacatccacttttgacactaagcaaag 45386512  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45386511 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 45386434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 3444962 - 3444385
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  3444962 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacgtaatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 3444863  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  3444862 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 3444763  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || || |  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||  ||||||    
T  3444762 cctgaggaactccctattcggctttaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcattcttgctc 3444663  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  3444662 aaactagtataccactcagcagcatcctccatcaaactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 3444563  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  3444562 atttgatgatgtggttttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccggaattttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 3444463  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||| ||  ||   |||||  || || || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3444462 gtcttgagttttgaaagagtccgcattcccccgattggccttgatctcatgacggagttctttagcaagttcccccat 3444385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 26538348 - 26538847
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||||| ||||||||| |    
T  26538348 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtcttcaagaatgtctggg 26538447  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  26538448 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagataggga 26538547  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
      || |||| ||||| || || ||||  | |||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  26538548 catgagaaactccctattcggcttcaatcgggtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 26538647  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  26538648 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 26538747  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || ||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  26538748 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccattatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 26538847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 4145598 - 4146175
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  4145598 agacgggttcccatagtgaccatctctgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 4145697  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  4145698 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 4145797  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  4145798 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 4145897  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  4145898 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 4145997  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  4145998 atttgatgatgtgattttgaggacaaattagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 4146097  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4146098 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 4146175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 24593016 - 24593593
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  24593016 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 24593115  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  24593116 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 24593215  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  24593216 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 24593315  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  24593316 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 24593415  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  24593416 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 24593515  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24593516 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 24593593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26434925 - 26434426
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  26434925 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatcttttttcaaggtctttaagaacgtctggg 26434826  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  26434825 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgtgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 26434726  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || |||||||| || ||||  |  ||||| |||||||| || || || |||||||| || | |||||| || ||||| || || |||||||||    
T  26434725 cctgaggaactccctgttcggcttcaatcgagtgttaaacccataatgactcttgaaagcagcggctagttcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 26434626  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  26434625 agactagtataccactctgcagcatcctccatcagactgtcttggaagtaatgaatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 26434526  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  26434525 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaggcagag 26434426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22143328 - 22142826
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  22143328 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 22143229  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  22143228 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 22143129  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |  || || || ||||| || || |||||||||    
T  22143128 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagctcgtcaaaagtatggacatcgtctttgctc 22143029  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  22143028 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 22142929  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22142928 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 22142829  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  22142828 gtc 22142826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 9618310 - 9617742
Alignment:
Q  19 cccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcatctcct 118  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||| ||||| ||||| || |    
T  9618310 cccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtttttaagaacgtctgggtcatttctt 9618211  T
Q  119 cttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaaa 218  Q
    | || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||    
T  9618210 cctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagatagggacctgagaaa 9618111  T
Q  219 ttccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggtg 318  Q
     ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || ||||| || ||     
T  9618110 ctccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactcaaactagta 9618011  T
Q  319 taccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataa 418  Q
    ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| || ||||| |    
T  9618010 taccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgtatttgatga 9617911  T
Q  419 tgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgagt 518  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||    
T  9617910 tgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaaggtcttgagt 9617811  T
Q  519 cttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9617810 tttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 9617742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 26275569 - 26276146
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  26275569 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 26275668  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  26275669 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 26275768  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  26275769 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 26275868  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  26275869 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 26275968  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  26275969 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 26276068  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  |    ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26276069 gtcttgagttttgacagagtttgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 26276146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 26320344 - 26320921
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  26320344 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 26320443  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  26320444 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 26320543  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  26320544 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 26320643  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  26320644 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 26320743  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  26320744 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 26320843  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  |    ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26320844 gtcttgagttttgacagagtttgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 26320921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 26486219 - 26486718
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  26486219 agacgggttcccatggtaaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatcttttttcaaggtctttaagaacgtctggg 26486318  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  26486319 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 26486418  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  26486419 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 26486518  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    | ||| || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  26486519 aggctagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 26486618  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || | ||||||||||||    
T  26486619 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctactttcgatactaagcagag 26486718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Original strand, 5147815 - 5148317
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  5147815 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 5147914  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  5147915 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtaatacgggcagctgcccctctccacctttgtgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 5148014  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  5148015 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 5148114  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| | |||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  5148115 agactagtataccactccgcagcattttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 5148214  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  5148215 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 5148314  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  5148315 gtc 5148317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31124579 - 31124080
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  31124579 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatcttttttcaaggtctttaagaatgtctggg 31124480  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || || || || || || || |||||    
T  31124479 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactctcctcctttttctgagataggga 31124380  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  31124379 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 31124280  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  31124279 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 31124180  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || || ||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  31124179 atttgacaatatgattttgagggcaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgataccaagcagag 31124080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 31564874 - 31565373
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || || || |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  31564874 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcggcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 31564973  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || || || || || || |||||    
T  31564974 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccatctttgtgcatattcacggaaactctcctcctttttctgagataggga 31565073  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  ||||  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  31565074 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggccagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 31565173  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  31565174 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 31565273  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| | ||||||||||||||| || || | ||| ||||| | ||| ||||||||    
T  31565274 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactacgggactttgaacttttttggaatatctaccttcgataccaagcagag 31565373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 20083 - 19490
Alignment:
Q  6 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20083 ttctaggcgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 19984  T
Q  106 tgagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccc-tccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggag 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  19983 tgagtcatctcttcttcatcaagagcgggagtgatgcggacagctgccccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcatctttcttttgggaa 19884  T
Q  205 agggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctt 304  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19883 agggatctgaggaattccctgtttggtttcaacctggtattaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatgaacgtcatctt 19784  T
Q  305 tgctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcg 404  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19783 tgctcaagctagtataccattctgcagcgtcttccattaagctatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctttgtagttacccatctttcg 19684  T
Q  405 gacatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaag 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  19683 gacatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaactctgggactttgaacttcttggggacgtccacctttggtaccaag 19584  T
Q  505 cagaggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || |  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19583 cagagatcatgagtcttaacagagtccccgttccctcggttagctttgatttcatgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 19490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 30120 - 29543
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  30120 agacgagttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 30021  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  30020 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgagcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 29921  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | |||| |||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  29920 tctgaggaatttcctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 29821  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  29820 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcctgaaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 29721  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  29720 acttgatgatgtggttctggggacaagttagcccgttgtatcggtcgaagtccgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 29621  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| | || ||  ||   ||||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29620 atcttgagtttagaaagagtccgcattccctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 29543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 437; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 25198704 - 25198120
Alignment:
Q  14 gagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25198704 gagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcat 25198605  T
Q  114 ctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctg 213  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  25198604 ctcttcttcatcaagagcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgtggaagctttcatctttcttttgggagagagatcta 25198505  T
Q  214 tgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagc 313  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25198504 agaaattccctgtttggtttcaacctggtattaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatgaacgtcatctttgctcaagc 25198405  T
Q  314 tggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatactt 413  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25198404 tagtataccattctgcagcatcttccattaagctatcttggaagcagtgaatcatgagtgaatcattgtctttgtagttacccatctttcggacatactt 25198305  T
Q  414 gataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtca 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  25198304 gataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaactccgggaccttgaacttcttggggacgtccacctttggtaccaagcagagatca 25198205  T
Q  514 tgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    |||||||| | ||  || || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25198204 tgagtcttaaaagagtctctgttccctcggttagctttgatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 25198120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 23891882 - 23891294
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23891882 agacgagtccccatggtgaccatctcatagaagttatttggagcagcaatgatctttctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 23891783  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23891782 tcatctcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggtagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcatctttcttttgggagagaga 23891683  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23891682 tctgagaaattccctgtttggcttcaatctggtattaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatgaacgtcatctttgctc 23891583  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23891582 aagctagtataccattctgcagcatcttccattaagctatcttggaagcagtgaataatgagtgaatcattgtctttgtagttacccatctttcggacat 23891483  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23891482 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggattttgaacttcttggggacatccacctttggtaccaagcagag 23891383  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
     ||||||||| | | ||  || | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23891382 atcatgagtcctaaaagagtccccattccctcggttagctttgatttcatgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 23891294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 24951786 - 24951198
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |    
T  24951786 agacgagttcccatggtgaccatctccgagaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaggaatgtctggg 24951687  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  24951686 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttttgggagagaga 24951587  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | || |||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  24951586 tctgaggaactccctgttcggcttcaatctggtgttaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 24951487  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24951486 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaagctatcttggaagcagtgaatcatgagtgaatcattgtctttgtagttacccatctttcggacat 24951387  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  24951386 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggacatccaccttaggcaccaagcagag 24951287  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
     || |||||||||| ||  ||   ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24951286 atcctgagtcttgaaagagtccgcattccctcgattagctttgatttcatgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 24951198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 24688643 - 24689220
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |    
T  24688643 agacgagttcccatggtgaccatctccgagaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcttttttcaaggtctttaggaatgtctggg 24688742  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  24688743 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgcgcgtattcacggaagctttcctccttcttttgggagagaga 24688842  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || || |  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||||| | |||||  ||||||    
T  24688843 tctgaggaattccctgttcggcttaaatctggtgttaaacccatagtggcttttgaaagcagtggctaattcatcaaaggtatggatgtcattcttgctc 24688942  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  24688943 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaagctatcttggaagcagtgaatcataagtgaatcattgtctttgtaattacccatctttcggacat 24689042  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24689043 acctgatgatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggacatccacctttggcaccaagcagag 24689142  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24689143 atcctgagttttgaaagagtccgcattccctcgattagctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 24689220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 30934312 - 30933735
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  30934312 agacgagttcccatggtgaccatctccgagaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 30934213  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  30934212 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatacgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 30934113  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | |||||||| || || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  30934112 tctgaggaattccctattcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 30934013  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  30934012 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcttggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 30933913  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  30933912 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatccgagattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 30933813  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30933812 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttaatttcatgacggagttctttagcaagttcctccat 30933735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 23718475 - 23719049
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  23718475 agacgagttcccatggtgaccatctc-gaaaagttattcggggcagcgatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 23718573  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||   ||||||| ||    
T  23718574 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagcagcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttct---gggagagaga 23718670  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  23718671 tctgaggaattccctgttcggcttcaaccgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 23718770  T
Q  310 aagctggtgtaccattctg-cagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggaca 408  Q
    || || || ||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||     
T  23718771 aaactagtataccactctgtcagcatcttccatcaaactatcttgaaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacg 23718870  T
Q  409 tacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcaga 508  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||    
T  23718871 tacttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtaccggtcgaaatctgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaaacaga 23718970  T
Q  509 ggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    | || ||||| |||| ||  ||   ||| | ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23718971 gatcttgagttttgaaagagtccgcatttcctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 23719049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 11549030 - 11548453
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  11549030 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagctatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 11548931  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  11548930 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 11548831  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||    
T  11548830 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatatcatttttgctc 11548731  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  11548730 aaactagtataccactctgcggcatcttccatcaaactatcctgaaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 11548631  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  11548630 atttgatgatgtggttttggggacaagttagcccgttgtaccggtcgaaatctgggattttgaatttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 11548531  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||| | ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11548530 atcttgagttttgaaagagtccgcatttcctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 11548453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 22999600 - 23000177
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||  ||||| | ||||||||| |    
T  22999600 agacgggttcccatggtgaccatcttcgaaaagttattcggggcagctatgatcattctctcaacataatccttcctcaaggtctttaagaatgtctggg 22999699  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  22999700 tcatttcttcttcatcaagagcaggagtaatgcgggcagcagcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 22999799  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  22999800 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaactcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 22999899  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  22999900 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcctgaaagcagtggatcataagtgaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 22999999  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  23000000 atttgatgatgtggttatggggacaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggacatccactttcgacaccaagcagag 23000099  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  23000100 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatctcatgatggagttctttagcaagttcctccat 23000177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 33777163 - 33776586
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  33777163 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcagggcagcgatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 33777064  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  33777063 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctttgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 33776964  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||  | ||||||||||| || ||||  | |||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||    
T  33776963 tctaaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcgaaggtatggatatcatttttgctc 33776864  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||| | ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  33776863 aaactagtataccactctgcggcatcttccatcaaactatcctgaaagcagaggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 33776764  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  33776763 atttgatgatgtggttctggggacaagttagcccgttgtaccggtcgaaatctgggattttgaatttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 33776664  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||| | ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33776663 atcttgagttttgaaagagtctgcatttcctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 33776586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 9549029 - 9549606
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  9549029 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 9549128  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| ||| |||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  9549129 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacggacagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 9549228  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||  ||||||    
T  9549229 cctgagaaactccctatttggcttcagtcgggtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcattcttgctc 9549328  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  9549329 aaactagtataccactctgcggcgtcttccatcaaactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 9549428  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  9549429 atttgatgatgtggttttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccgggattttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 9549528  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||| ||  ||   |||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9549529 gtcttgagttttgaaagagtccgcattcccccgattggctttaatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 9549606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 2510727 - 2510150
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  2510727 agacgggttcccatagtgaccatctctgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 2510628  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  2510627 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 2510528  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  2510527 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 2510428  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || |||||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |    
T  2510427 aaactagtataccactctgcggcatcttccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattacccatcttccggacgt 2510328  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  2510327 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 2510228  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510227 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcggttggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 2510150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 33292204 - 33291705
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  33292204 agacgtgttcccatggtaaccatctctgagaaattgtttggggctgcgataatcatcctttcaacataatccctcttgagagtcttcagaaatgtctgag 33292105  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  33292104 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcgtattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 33292005  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |  ||||| || || || || ||||||||||||    
T  33292004 cctgagaaactccctatttggcttcagtcttgtattgaacccataatggcttttgaaagcggctgctagctcatcaaaagtgtggacatcatctttgctc 33291905  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  33291904 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 33291805  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  33291804 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatatttgtcgaactccgggactttaaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 33291705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 6873978 - 6873401
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  6873978 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 6873879  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  6873878 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 6873779  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  6873778 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 6873679  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  6873678 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcaggctatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 6873579  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  6873578 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttagggacatccacttttgacactaagcaaag 6873479  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6873478 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcggttggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 6873401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 8665961 - 8666538
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  8665961 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 8666060  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  8666061 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 8666160  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  8666161 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 8666260  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || |||||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  8666261 aaactagtataccactctgcggcatcttccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 8666360  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  8666361 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 8666460  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8666461 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcggttggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 8666538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 41674385 - 41673886
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  41674385 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagctatgatcattctctcaacataatccctcttcaaggtctttaagaatgtctggg 41674286  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  41674285 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 41674186  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || | |||||| || || || || ||||||||||||    
T  41674185 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagttcatcaaaagtgtggacatcatctttgctc 41674086  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  41674085 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 41673986  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  41673985 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 41673886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 15659246 - 15659745
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  15659246 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 15659345  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  15659346 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 15659445  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |  ||||| || || || || ||||||||||||    
T  15659446 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagctcatcaaaagtgtggacatcatctttgctc 15659545  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  15659546 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtctttgtagttgcccatcttccggacat 15659645  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  15659646 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 15659745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28648902 - 28648403
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||||| ||||||||| |    
T  28648902 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtcttcaagaatgtctggg 28648803  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  28648802 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgtgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 28648703  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||| || || || || ||||||||||||    
T  28648702 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcagctagctcatcaaaagtgtggacatcatctttgctc 28648603  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   ||||||||||||||| ||||| |    
T  28648602 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttacccatcttccggacgt 28648503  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  28648502 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 28648403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 15759343 - 15759920
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  15759343 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 15759442  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| || || |||||    
T  15759443 tcatttcttcttcatctaaagcaggggtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaagctttcctccttcttctgagataggga 15759542  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| ||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  15759543 cctgagaaactccctatttggcttcagtcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 15759642  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  15759643 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 15759742  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  15759743 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 15759842  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15759843 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 15759920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 18375898 - 18376475
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  18375898 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 18375997  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| || || |||||    
T  18375998 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaagctttcctccttcttctgagataggga 18376097  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  18376098 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 18376197  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  18376198 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 18376297  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  18376298 atttgatgatgtgattttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttagggacatccacttttgacactaagcaaag 18376397  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18376398 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 18376475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 24681113 - 24680536
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  24681113 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacgtaatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 24681014  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  24681013 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 24680914  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||  ||||||    
T  24680913 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcattcttgctc 24680814  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  24680813 aaactagtataccactcagcggcatcctccatcaaactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 24680714  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  24680713 atttgatgatgtggttttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccggaattttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 24680614  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| |   ||   ||||| ||| || || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24680613 atcttgagttttgaaaaagtccgcattccctcgattggccttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 24680536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 24723640 - 24723063
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  24723640 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacgtaatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 24723541  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  24723540 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 24723441  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||  ||||||    
T  24723440 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcattcttgctc 24723341  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  24723340 aaactagtataccactcagcggcatcctccatcaaactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 24723241  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  24723240 atttgatgatgtggttttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccggaattttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 24723141  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| |   ||   ||||| ||| || || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24723140 atcttgagttttgaaaaagtccgcattccctcgattggccttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 24723063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 30151694 - 30151117
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  30151694 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 30151595  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  30151594 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 30151495  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  30151494 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 30151395  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  30151394 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 30151295  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  30151294 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 30151195  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30151194 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 30151117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 31826905 - 31827482
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  31826905 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcgacgtaatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 31827004  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  31827005 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 31827104  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || || |  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||  ||||||    
T  31827105 cctgaggaactccctattcggctttaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcattcttgctc 31827204  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  31827205 aaactagtataccactcagcggcatcctccatcaaactatcctgaaaacaatggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 31827304  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  31827305 atttgatgatgtggttttgagggcaagttagtccgttgtaccggtcgaaatccggaattttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 31827404  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||| ||  ||   |||||  || || || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31827405 gtcttgagttttgaaagagtccgcattcccccgattggccttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 31827482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 26480059 - 26479491
Alignment:
Q  19 cccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcatctcct 118  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| ||||| || |    
T  26480059 cccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctgggtcatttctt 26479960  T
Q  119 cttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaaa 218  Q
    | || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||    
T  26479959 cctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagatagggacctgagaaa 26479860  T
Q  219 ttccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggtg 318  Q
     ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || ||||| || ||     
T  26479859 ctccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactcaaactagta 26479760  T
Q  319 taccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataa 418  Q
    ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| || ||||| |    
T  26479759 taccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgtatttgatga 26479660  T
Q  419 tgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgagt 518  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||    
T  26479659 tgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaaggtcttgagt 26479560  T
Q  519 cttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26479559 tttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 26479491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Original strand, 32599955 - 32600457
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  32599955 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 32600054  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  32600055 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 32600154  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| | ||| || || ||||  |  ||||| |||||||||||||| || |||||||  || | |||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  32600155 cctgagaaacttcctattcggcttcaatcaagtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagtggctagttcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 32600254  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  32600255 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 32600354  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| ||||| | ||||||||||||    
T  32600355 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggagcatctaccttcgatactaagcagag 32600454  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  32600455 gtc 32600457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 5637586 - 5637009
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  5637586 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 5637487  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| || || |||||    
T  5637486 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaagctttcctccttcttctgagataggga 5637387  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  5637386 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 5637287  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  5637286 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 5637187  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  5637186 atttgatgatgtgattttgaggacaggttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 5637087  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637086 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggtctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 5637009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 12131831 - 12131254
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  12131831 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 12131732  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  12131731 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 12131632  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  12131631 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 12131532  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  12131531 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 12131432  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  12131431 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 12131332  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12131331 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 12131254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 30168136 - 30167568
Alignment:
Q  19 cccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcatctcct 118  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| ||||| || |    
T  30168136 cccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctgggtcatttctt 30168037  T
Q  119 cttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaaa 218  Q
    |||| || | | | || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||    
T  30168036 cttcatctaaagcaggggtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagatagggacctgagaaa 30167937  T
Q  219 ttccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggtg 318  Q
     ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || ||||| || ||     
T  30167936 ctccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactcaaactagta 30167837  T
Q  319 taccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataa 418  Q
    ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| || ||||| |    
T  30167836 taccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgtatttgatga 30167737  T
Q  419 tgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgagt 518  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||    
T  30167736 tgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaaggtcttgagt 30167637  T
Q  519 cttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30167636 tttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 30167568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3789202 - 3788703
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  3789202 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatcttttttcaaggtctttaagaacgtctggg 3789103  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  3789102 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 3789003  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  ||||  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  3789002 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggccagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 3788903  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  3788902 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 3788803  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  3788802 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgataccaagcagag 3788703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 31431104 - 31430605
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || || || |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||||| ||||||||| |    
T  31431104 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcggcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtcttcaagaatgtctggg 31431005  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  31431004 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 31430905  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  31430904 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatgaacatcatctttgctc 31430805  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  31430804 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 31430705  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  31430704 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccattatatttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgataccaagcagag 31430605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 34616197 - 34615695
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || || || |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  34616197 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcggcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 34616098  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  34616097 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 34615998  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  34615997 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 34615898  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| |  |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  34615897 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataaaggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 34615798  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    |||||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  34615797 acttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 34615698  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  34615697 gtc 34615695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 9317127 - 9316550
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  9317127 agacgggttcccatagtgaccatttccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 9317028  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  9317027 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 9316928  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  9316927 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 9316828  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  9316827 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 9316728  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  9316727 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 9316628  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9316627 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 9316550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 33516032 - 33515455
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  33516032 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 33515933  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  33515932 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 33515833  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| ||||| || | |||||  || |||    
T  33515832 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtgtggatgtcattcttactc 33515733  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  33515732 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 33515633  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  33515632 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 33515533  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33515532 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 33515455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 18501234 - 18501733
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||||||||| |    
T  18501234 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtttttaagaatgtctggg 18501333  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  18501334 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcatttttctgagataggga 18501433  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  18501434 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 18501533  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  18501534 agactagtataccactccgcagcgtcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 18501633  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  18501634 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 18501733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 29967552 - 29968129
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||| ||||| |    
T  29967552 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtttttaagaacgtctggg 29967651  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  29967652 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 29967751  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  29967752 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 29967851  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  29967852 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 29967951  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  29967952 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 29968051  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  |    | ||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29968052 gtcttgagttttgacagagtttgcactccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 29968129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 30029091 - 30028514
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||| ||||| |    
T  30029091 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtttttaagaacgtctggg 30028992  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  30028991 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 30028892  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  30028891 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 30028792  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  30028791 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 30028692  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  30028691 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 30028592  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  |    | ||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028591 gtcttgagttttgacagagtttgcactccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 30028514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 13325330 - 13325829
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || || || |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||||| ||||||||| |    
T  13325330 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcggcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtcttcaagaatgtctggg 13325429  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  13325430 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 13325529  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  || |  ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  13325530 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggctagctcatcaaaggtatggacatcatctttgctc 13325629  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  13325630 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 13325729  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  13325730 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatatttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgataccaagcagag 13325829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 40474038 - 40474537
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||  ||||||| ||||||||| |    
T  40474038 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgataatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtcttcaagaatgtctggg 40474137  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  40474138 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 40474237  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  40474238 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 40474337  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  40474338 agactagtataccactctgcagcatcctccatcagactgtcttggaagtaatgaatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 40474437  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  40474438 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 40474537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 37671978 - 37672477
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  37671978 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 37672077  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || || || || || || |||||    
T  37672078 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgtgcatattcacggaaactctcctcctttttctgagataggga 37672177  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  ||||  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  37672178 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggccagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 37672277  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  37672278 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 37672377  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  37672378 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgataccaagcagag 37672477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 37771485 - 37771984
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || || || |||||||| || || |||||||| ||  |||  ||||| | ||||||||| |    
T  37771485 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcggcgatgatcatcctctcaacataatctttcctcaaggtctttaagaatgtctggg 37771584  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || || || || || || |||||    
T  37771585 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgtgcatattcacggaaactctcctcctttttctgagataggga 37771684  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  37771685 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 37771784  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  37771785 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 37771884  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || |||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  37771885 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatatttgtcgaactccgggattttgaactttttaggaacatctaccttcgatactaagcagag 37771984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43077925 - 43077426
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  43077925 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 43077826  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  |||| ||||| || || || || || |||||    
T  43077825 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcatggaaactttcctcctttttctgagataggga 43077726  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  43077725 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 43077626  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  43077625 agactagtataccactccgcagcatcttccatcatactgtcttggaagtaatggatcatcagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 43077526  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  43077525 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggaccttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 43077426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 23752936 - 23753183
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttc-aggaatgtctga 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||  | |||||||||     
T  23752936 agacgagttcccatggtgaccatctctgaaaagttattcggggcagcgatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtcttttaagaatgtctgg 23753035  T
Q  109 gtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgt-ctttcttttgggagagg 207  Q
     |||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||   ||||||     
T  23753036 ttcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagcagcccccctccatctctgtgcgtattcccggaagctttcctcctttctt---ggagaga 23753132  T
Q  208 gatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtgg 258  Q
     |||||   ||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  23753133 aatctgaagaattccctgttcggtttcaaccgggtgttaaacccatagtgg 23753183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Original strand, 37359141 - 37359643
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  37359141 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 37359240  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | ||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  37359241 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtaatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 37359340  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  37359341 cctgagaaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 37359440  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| ||||| || ||||| |    
T  37359441 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccattttccggacgt 37359540  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  37359541 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 37359640  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  37359641 gtc 37359643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 37754644 - 37754160
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  37754644 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 37754545  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | ||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  37754544 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtaatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 37754445  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  || |  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  37754444 cctgagaaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggctagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 37754345  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||   || ||||| || | |||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  37754344 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtgatggatcataaggggatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 37754245  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctt 494  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  37754244 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttctttggaacatctacctt 37754160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 476
Target Start/End: Original strand, 28960284 - 28960750
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  28960284 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 28960383  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  28960384 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 28960483  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| |  || |  ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  28960484 cctgaggaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtgactcctgaaagcggtggctagctcatcaaaggtgtggacatcatctttgctc 28960583  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| ||| |||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  28960584 agactagtataccactctacagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 28960683  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaactt 476  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||| |||||||||||    
T  28960684 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccggaactttgaactt 28960750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 18530029 - 18529432
Alignment:
Q  6 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530029 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 18529930  T
Q  106 tgagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggaga 205  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18529929 tgagtcatctcttcttcatcaagagcgggagtgatgcgggcagctgcccctctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcatctttcttttgggaga 18529830  T
Q  206 gggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatcttt 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18529829 gggatctgagaaattccctgtttggtttcaacctggtattaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatgaacgtaatcttt 18529730  T
Q  306 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 405  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18529729 gctcaagctagtataccattccgcagcgtcttccattaagctatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 18529630  T
Q  406 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacc-tttggtactaag 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  18529629 acatacttgataatgtggttctggggacaagtccgcccattgtatcggtcgaactctgggaccttgaacttcttggggacatccaccttttggtaccaag 18529530  T
Q  505 cagaggtcatgagtctt-gacaggat---cactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    ||||| |||||||||||  | ||| |   | |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18529529 cagagatcatgagtcttaaatagggtttcccccgttccctcggttagctttgatttcacgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 18529432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 598
Target Start/End: Original strand, 16627128 - 16627720
Alignment:
Q  6 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16627128 ttctaggcgagtccccatggtgaccatctcaaagaagttatctagagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagttttcaggaatgtc 16627227  T
Q  106 tgagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggaga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16627228 tgagtcatctcctcttcgtcaagagcgggaatgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcatctttcttttgggaga 16627327  T
Q  206 gggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatcttt 305  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||      
T  16627328 gagatctgagaaattccctgtttggtttcaacctggtattaaaccaatagtggtttttgaaagcagcagccaattcatcaaaagtgtgaatgtcgtctcg 16627427  T
Q  306 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16627428 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaagctatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 16627527  T
Q  406 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagc 505  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||    
T  16627528 acatacttgataatgtggttctagggacaagtcagcccattgtatcggtcgaactctgggaccttgaacttcttggggatgtccacctttggtaccaagc 16627627  T
Q  506 agaggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |  |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16627628 agagatcatgagtcttaacagggtccccgttccctcagttagctttgatttcacgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 16627720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 181 - 604
Target Start/End: Original strand, 15334768 - 15335191
Alignment:
Q  181 aagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaatt 280  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15334768 aagctttcatctttcttttgggagagggatctgagaaattccctgtttggtttcaacctggtattaaacccatagtggcttttgaaagcagcagccaatt 15334867  T
Q  281 catctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcatt 380  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15334868 catcaaaagtatgaacgtcatctttgctcaagctagtataccattctgcagcgtcttccattaagctatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcatt 15334967  T
Q  381 gtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttctta 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||     
T  15334968 gtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaactctgggaccttgaacttcttg 15335067  T
Q  481 gggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagtt 580  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15335068 gggacgtccacctttggtaccaagcagagatcatgagtcttaacagggtccccgttccctcggttagctttgatttcacgacggagttctttagcaagtt 15335167  T
Q  581 cctccattctttcttccacagttc 604  Q
    ||||||| |||||||||| |||||    
T  15335168 cctccatcctttcttccatagttc 15335191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 598
Target Start/End: Original strand, 15893336 - 15893924
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |    
T  15893336 agacgagttcccatggtgaccatttccgagaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaggaacgtctggg 15893435  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  15893436 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 15893535  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  || || || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  15893536 tctgaggaattccctgttcggcttcaatctagtattaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 15893635  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15893636 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaagctatcttggaagtagtgaatcatgagtgaatcattgtctttgtagttacccatctttcggacat 15893735  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15893736 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaattcgggatcttgaacttcttagggacatccacctttggtaccaagcaaag 15893835  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
     |||||||| |||| ||  ||   ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15893836 atcatgagttttgaaagagtctgcattccctcgattagctttgatttcatgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 15893924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 8301894 - 8302468
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  8301894 agacgagttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 8301993  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||   ||||||| ||    
T  8301994 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttct---gggagagaga 8302090  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  8302091 tctgaggaattccctgttcggcttcaatctggtgttaaacccatagtggcttttgaaagcagtggccaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 8302190  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  8302191 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaagctatcttggaagcagtggatcataagtgaatcattgtctttgtaattacccatctttcggacat 8302290  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  8302291 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 8302390  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  8302391 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatttcatgatggagttctttagcaagttcctccat 8302468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 8295603 - 8295026
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  8295603 agacgagttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 8295504  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  8295503 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctcgttcttctgggagagaga 8295404  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  8295403 tctgaggaattccctgttcggcttcagtcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaaatcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 8295304  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||    
T  8295303 aaactagtataccactctgcggcatcttccatcaaactatcctggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcgaacat 8295204  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8295203 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacactaagcagag 8295104  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8295103 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 8295026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 18050890 - 18050313
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  18050890 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 18050791  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  18050790 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 18050691  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  18050690 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 18050591  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| | |||||    
T  18050590 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaagctatcttggaagcagtggatcataagtgaatcattgtctttgtaattgcccatcttccagacat 18050491  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  18050490 acttgatgatgtggttctggggacaaggcagcccattgtatcggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 18050391  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||  |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18050390 atcttgagatttgaaagagtctgcattccctcgattggctttgatttcatgacggagttctttagcaagttcctccat 18050313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 4797283 - 4797860
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  4797283 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagtaatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 4797382  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  4797383 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgagcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 4797482  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  4797483 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 4797582  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  4797583 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcctgaaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 4797682  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  4797683 acttgatgatgtggttctggggacaagttagcccgttgtatcggtcgaagtccgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 4797782  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4797783 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 4797860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 15741712 - 15742286
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  15741712 agacgagttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcgatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 15741811  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||   ||||||| ||    
T  15741812 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttct---gggagagaga 15741908  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||| ||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  15741909 tctgaggaattctctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 15742008  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  15742009 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcctggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacat 15742108  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15742109 acttgatgatgtgattctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatctgggattttgaacttcttagggacatccacttttgacaccaagcagag 15742208  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||| | ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742209 atcttgagttttgaaagagtccgcatttcctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 15742286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 35880394 - 35879817
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  35880394 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 35880295  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  35880294 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 35880195  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| | ||||| |||||||    
T  35880194 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcgtcaaaggtatggatgtcatttttgctc 35880095  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  35880094 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcctggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 35879995  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||  || ||||||||    
T  35879994 atttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtaccggtcgaaatctgggattttgaatttcttagggaaatccacctttgacaccaagcagag 35879895  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||| | ||| || |||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  35879894 atcttgagttttgaaagagtccgcatttcctcgattggctttgatctcatgacggagttctgcagcaagttcctccat 35879817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 18330302 - 18329725
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  18330302 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 18330203  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  18330202 tcatttcttcttcatccagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctttgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 18330103  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||    
T  18330102 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcgaaggtatggatatcatttttgctc 18330003  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  18330002 aaactagtataccactctgcggcatcttccatcaaactatcctgaaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 18329903  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  18329902 atttgatgatgtggttttggggacaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 18329803  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18329802 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 18329725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 29149385 - 29149962
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  29149385 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagctatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 29149484  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  29149485 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 29149584  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  29149585 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 29149684  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  29149685 aaactagtataccactctgcggcatcttccatcaaactatcctgaaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 29149784  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  29149785 atttaatgatgtggttttggggacaagttagcccgttgtaccggtcgaaatctgggattttgaacttcttagggacatccacttttgacaccaagcagag 29149884  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||| | ||| || ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29149885 atcttgagttttgaaagagtccgcatttcctcgattggctctgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 29149962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 6191944 - 6191367
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  6191944 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagctatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 6191845  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  6191844 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctttgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 6191745  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||    
T  6191744 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcgaaggtatggatatcatttttgctc 6191645  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  6191644 aaactagtataccactctgcggcatcttccatcaaactatcctgaaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 6191545  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  6191544 atttgatgatgtggttttggggacaagttagcccgttgtaccggtcgaaatctaggattttgaacttcttagggacatccacttttgacaccaagcagag 6191445  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6191444 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 6191367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 4721259 - 4720682
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  4721259 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcacctatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 4721160  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  4721159 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctttgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 4721060  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  |  ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||    
T  4721059 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagttgctcttgaaagcagcggctaattcatcgaaggtatggatatcatttttgctc 4720960  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  4720959 aaactagtataccactctgcggcatcttccatcaaactatcctgaaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 4720860  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  4720859 atttgatgatgtggttttgtggacaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggacatccacttttgacaccaagcagag 4720760  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4720759 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 4720682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 139 - 587
Target Start/End: Original strand, 14447676 - 14448124
Alignment:
Q  139 atgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcc 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||  |    
T  14447676 atgcgggcagctgccccccttcatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagagatctgaggaattccctgttcggcttcaatc 14447775  T
Q  239 tggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttc 338  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| || || ||||| |||||||| |||||    
T  14447776 gggtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctcaaactagtataccactctgcagcatcttc 14447875  T
Q  339 cattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataatgtggttctggggacaagtc 438  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  14447876 catcaaactatcctgaaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgtacttgatgatgtggttctggggacaagtt 14447975  T
Q  439 agcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgagtcttgacaggatcactattcc 538  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||| |||| ||  ||   |||||    
T  14447976 agcccgttgtatcggtcgaaatatgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagagatcttgagttttgaaagagtccgcattcc 14448075  T
Q  539 atcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14448076 ctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 14448124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4892841 - 4892342
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  4892841 agacgtgttcccatggtaaccatctctgagaaattgtttggggctgcgataatcatcctttcaacataatccctcttgagagtcttcagaaatgtctgag 4892742  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| |||||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  4892741 tcatttcctcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 4892642  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |  ||||| || || || || |||||||||||     
T  4892641 cctgagaaactccctatttggcttcagtcttgtattgaacccataatggcttttgaaagcggctgctagctcatcaaaagtgtggacatcatctttgctt 4892542  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||   |||||| | |||||| |||||||    
T  4892541 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagcaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgctcatcttccggacat 4892442  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    |||||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  4892441 acttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttgggaacatctaccttcgatactaagcagag 4892342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 22388205 - 22388704
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  22388205 agacgtgttcccatggtaaccatctctgagaaattgtttggggctgcgataatcatcctttcaacataatccttcttgagagtcttcagaaatgtctgag 22388304  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| |||||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  22388305 tcatttcctcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 22388404  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |  ||||| || || || || |||||||||||     
T  22388405 cctgagaaactccctatttggcttcagtcttgtattgaacccatactggcttttgaaagcggctgctagctcatcaaaagtgtggacatcatctttgctt 22388504  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||   |||||| | |||||| |||||||    
T  22388505 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagcaatgaatcataggggaatcattatccttgtagttgctcatcttccggacat 22388604  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    |||||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22388605 acttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttgggaacatctaccttcgatactaagcagag 22388704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 51781639 - 51781062
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||||||||| |    
T  51781639 agacgggttcccatagtgaccatctctgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtttttaagaatgtctggg 51781540  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  51781539 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 51781440  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||  ||||||    
T  51781439 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcattcttgctc 51781340  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  51781339 aaactagtataccactcagcggcatcctccatcaaactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 51781240  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  51781239 atttgatgatgtggttttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccggaattttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 51781140  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| |   ||   ||||| ||| || || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51781139 atcttgagttttgaaaaagtccgcattccctcgattggccttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 51781062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 51796726 - 51796149
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||||||||| |    
T  51796726 agacgggttcccatagtgaccatctctgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtttttaagaatgtctggg 51796627  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  51796626 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 51796527  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||  ||||||    
T  51796526 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcattcttgctc 51796427  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  51796426 aaactagtataccactcagcggcatcctccatcaaactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 51796327  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  51796326 atttgatgatgtggttttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccggaattttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 51796227  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| |   ||   ||||| ||| || || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51796226 atcttgagttttgaaaaagtccgcattccctcgattggccttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 51796149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 5609952 - 5610529
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  5609952 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 5610051  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  5610052 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 5610151  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  5610152 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 5610251  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  5610252 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 5610351  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  5610352 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 5610451  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5610452 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 5610529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 28338930 - 28338354
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  28338930 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 28338831  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  28338830 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttttgagataggga 28338731  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  28338730 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgtt-aacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 28338632  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  28338631 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 28338532  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  28338531 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 28338432  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28338431 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 28338354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 36997719 - 36998296
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  36997719 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 36997818  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  36997819 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 36997918  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||  ||||||    
T  36997919 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcattcttgctc 36998018  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||   || || |||||||||||||| |    
T  36998019 aaactagtataccactcagcggcatcctccatcaaactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttataattgcccatctttcggacgt 36998118  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  36998119 atttgatgatgtggttttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccggaattttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 36998218  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||| |   ||   ||||| ||| || || ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36998219 gtcttgagttttgaaaaagtccgcattccctcgattggccttgatctcatgacgcagttctttagcaagttcctccat 36998296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 32438785 - 32438286
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||    
T  32438785 agacgtgttcccatggtaaccatctctgagaaattgtttggtgctgcgataatcatcctttcaacataatctctcttgagagtcttcagaaatgtctgag 32438686  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  32438685 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagacaggga 32438586  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| ||||| ||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||| || || |  ||||| || || || || ||||||||||||    
T  32438585 cctgagaaactccctatttggcttcaatcttgtgttgaacccataatggcttttgaaagcggctgctagctcatcaaaagtgtggacatcatctttgctc 32438486  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| || ||||| | |||  |||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| ||||| || |||||||    
T  32438485 agactagtataccactctgcagcatcctccatcagactgccttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccattttccggacat 32438386  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  32438385 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 32438286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Original strand, 18277682 - 18278184
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  18277682 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 18277781  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  18277782 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 18277881  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |  ||||| || || || || || |||||||||    
T  18277882 cctgagaaactccctattcggcttcagtcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagctcatcaaaagtgtggacatcgtctttgctc 18277981  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  18277982 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttatagttgcccatcttccggacat 18278081  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || ||||| |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  18278082 atttgacaatatgattctgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 18278181  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  18278182 gtc 18278184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Original strand, 28116587 - 28117089
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  28116587 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 28116686  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || || |||||    
T  28116687 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgtgcatattcacggaaactttcctcttttttctgagataggga 28116786  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || | |||||| || ||||| || || |||||||||    
T  28116787 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagttcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 28116886  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||  | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  28116887 agactagtataccactctgcagcatcctccatcagactgtcttggaaataatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 28116986  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  28116987 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttctttggaacatctaccttcgatactaagcagag 28117086  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  28117087 gtc 28117089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 7996190 - 7995613
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  7996190 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 7996091  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  7996090 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 7995991  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  7995990 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 7995891  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  7995890 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 7995791  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  7995790 atttgatgatgtgattttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttagggacatccacttttgacactaagcaaag 7995691  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||  |||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7995690 gtcttgagttttgacagagtcggtattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 7995613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 10642698 - 10642121
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  10642698 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 10642599  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  10642598 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 10642499  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  10642498 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 10642399  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  10642398 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 10642299  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  10642298 atttgatgatgtgattttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttagggacatccacttttgacactaagcaaag 10642199  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||  |||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10642198 gtcttgagttttgacagagtcggtattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 10642121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 31965103 - 31965680
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  31965103 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 31965202  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  31965203 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 31965302  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  31965303 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 31965402  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  31965403 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 31965502  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  31965503 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 31965602  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31965603 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 31965680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 50134701 - 50135278
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  50134701 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 50134800  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  50134801 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 50134900  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  50134901 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 50135000  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  50135001 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 50135100  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  50135101 atttgatgatgtgattttgaggacaagtcagcccgttataccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 50135200  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || |  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50135201 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctgaatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 50135278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 7072840 - 7072341
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  7072840 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 7072741  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  7072740 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 7072641  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || |  ||||| || || || || ||||||||||||    
T  7072640 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcggcggctagctcatcaaaagtgtggacatcatctttgctc 7072541  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  7072540 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 7072441  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || ||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  7072440 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccattatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 7072341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Original strand, 18292983 - 18293485
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  18292983 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 18293082  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  18293083 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 18293182  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||| || ||||| || |||||||| || |  ||||| || || || || || |||||||||    
T  18293183 cctgagaaactccctattcggcttcagtcgagtgttaaacccgtaatggctcttgaaagcagcggctagctcatcaaaagtgtggacatcgtctttgctc 18293282  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  18293283 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttatagttgcccatcttccggacat 18293382  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || ||||| |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  18293383 atttgacaatatgattctgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 18293482  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  18293483 gtc 18293485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Original strand, 18308284 - 18308786
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  18308284 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 18308383  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  18308384 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 18308483  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |  ||||| || || || || || |||||||||    
T  18308484 cctgagaaactccctattcggcttcagtcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagctcatcaaaagtgtggacatcgtctttgctc 18308583  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||    ||||| |||||||| |||||||    
T  18308584 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttatagttgcccatcttccggacat 18308683  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || ||||| |||||||||||||  || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  18308684 atttgacaatatgattctgaggacaagtcagcctgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 18308783  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  18308784 gtc 18308786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 4416544 - 4415967
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||||||||| |    
T  4416544 agacgggttcccatagtgaccatctctgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtttttaagaatgtctggg 4416445  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  4416444 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 4416345  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  4416344 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 4416245  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  4416244 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 4416145  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||    
T  4416144 atttgatgatgtgattttgaggacaagtcagcccgttataccggtcgaagtccggaatcttgaactttttagggacgtccacttttgacactaagcaaag 4416045  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4416044 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 4415967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8211369 - 8210870
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | |||||| || |    
T  8211369 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtttggg 8211270  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  8211269 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 8211170  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| || || || || |||||||| || | |||||| || ||||| || || |||||||||    
T  8211169 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtaatgactcttgaaagcagcggctagttcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 8211070  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  8211069 agactagtataccactctgcagcatcctccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtctttgtagttgcccatcttccggacat 8210970  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  8210969 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 8210870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 5013340 - 5012763
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  5013340 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 5013241  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  5013240 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 5013141  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  5013140 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 5013041  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  5013040 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 5012941  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  5012940 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtactggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 5012841  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5012840 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 5012763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 17985586 - 17986163
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  17985586 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacgtaatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 17985685  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  17985686 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 17985785  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |  || || ||||| ||||| || | |||||  || |||    
T  17985786 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggcttttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtgtggatgtcattcttactc 17985885  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||||||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  17985886 aaactagtataccattctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 17985985  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  17985986 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 17986085  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17986086 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 17986163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 24327787 - 24327210
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||| ||||| |    
T  24327787 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtttttaagaacgtctggg 24327688  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  24327687 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 24327588  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  24327587 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 24327488  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  24327487 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcttgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 24327388  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  24327387 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 24327288  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24327287 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 24327210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 11110991 - 11111490
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  11110991 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 11111090  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  11111091 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcttcctttttctgagataggga 11111190  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  11111191 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 11111290  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  11111291 agactagtataccactccgcagcgtcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 11111390  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  11111391 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 11111490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 48465543 - 48465044
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  48465543 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 48465444  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || |   | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  48465443 tcatttcttcttcatctaaggcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagataggga 48465344  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  48465343 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 48465244  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  48465243 agactagtataccactccgcagcgtcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 48465144  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  48465143 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 48465044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10395764 - 10395259
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  10395764 agacgggttcccatggtgaccatttccgaaaagttgttcggggcagctatgatcatcctctcaacataatcttttttcaaggtctttaagaaagtctggg 10395665  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  10395664 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 10395565  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  10395564 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 10395465  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| || ||||    
T  10395464 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccgaacat 10395365  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  10395364 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 10395265  T
Q  510 gtcatg 515  Q
     |||||    
T  10395264 atcatg 10395259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 20577492 - 20577991
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||||||||| |    
T  20577492 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtttttaagaatgtctggg 20577591  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  20577592 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagataggga 20577691  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  20577692 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 20577791  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  20577792 agactagtataccactccgcagcgtcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 20577891  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  20577892 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 20577991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 29665615 - 29666114
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  29665615 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 29665714  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  29665715 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagataggga 29665814  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  29665815 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 29665914  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  29665915 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 29666014  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  29666015 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 29666114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18242355 - 18241853
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  18242355 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatcttttttcaaggtctttaagaatgtctggg 18242256  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  18242255 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 18242156  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  ||||  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  18242155 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggccagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 18242056  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  18242055 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 18241956  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  18241955 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggaccttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 18241856  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  18241855 gtc 18241853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 18224819 - 18224242
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || || ||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  18224819 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggcgcagcgatgatcatcctctcaacgtaatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 18224720  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  18224719 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 18224620  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  18224619 cctgaggaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatccaaggtatggatgtcattcttactc 18224520  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  18224519 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 18224420  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  18224419 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 18224320  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18224319 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 18224242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 21674321 - 21673822
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||||||||| |    
T  21674321 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtttttaagaatgtctggg 21674222  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  21674221 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagataggga 21674122  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  21674121 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 21674022  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||| ||   |||||| |||||||| |||||||    
T  21674021 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattatccttgtagttgcccatcttccggacat 21673922  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  21673921 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 21673822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28020906 - 28020407
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  28020906 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatcttttttcaaggtctttaagaatgtctggg 28020807  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  28020806 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagataggga 28020707  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||||||||||||  | ||||  |  || |  || || |||||||| || ||||||||||||    
T  28020706 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccatagtggctcctgaaagtggtggctagctcgtcaaaggtatggacatcatctttgctc 28020607  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || ||||| |||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  28020606 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcgttgtccttgtagttgcccatcttccggacat 28020507  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  28020506 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagctcgttatatttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 28020407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 47023081 - 47022582
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||||||| || || |  ||||| | ||||||||| |    
T  47023081 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgataatcattctctcaacataatctttctttaaggtctttaagaatgtctggg 47022982  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  47022981 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 47022882  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| || || || || |||||||| || | |||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  47022881 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtaatgactcttgaaagcagcggctagttcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 47022782  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  47022781 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 47022682  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || |||  |||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  47022681 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatatttgtcgaactccgggaccttgaacttttttggaacatctaccttcgataccaagcagag 47022582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Original strand, 22871504 - 22872006
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  22871504 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 22871603  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  22871604 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 22871703  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  || |  ||||| |||||||| || || |||||||||    
T  22871704 cctgagaaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggctagctcatcaaaggtatggacatcgtctttgctc 22871803  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  22871804 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 22871903  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  22871904 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatctaccttcgataccaagcagag 22872003  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  22872004 gtc 22872006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Original strand, 22886563 - 22887065
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  22886563 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 22886662  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  22886663 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 22886762  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  || |  ||||| |||||||| || || |||||||||    
T  22886763 cctgagaaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggctagctcatcaaaggtatggacatcgtctttgctc 22886862  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  22886863 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 22886962  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  22886963 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatctaccttcgataccaagcagag 22887062  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  22887063 gtc 22887065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 4347314 - 4347813
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  4347314 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 4347413  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||| || || || |  || |||||    
T  4347414 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctcttcacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctaagataggga 4347513  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  || |  ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  4347514 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggctagctcatcaaaggtatggacatcatctttgctc 4347613  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||| | || ||||| | ||||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  4347614 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactatcttggaagtaatggatcataaacgaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 4347713  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  4347714 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttgggaacatctaccttcgatactaagcagag 4347813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 5466613 - 5466114
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  5466613 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 5466514  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  5466513 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 5466414  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |  | ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | |||||||  || |  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  5466413 cctgagggactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 5466314  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || | ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||    
T  5466313 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataaggggatcattgtctttgtagttgcccatcttccggacat 5466214  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  5466213 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgataccaagcagag 5466114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 6543104 - 6543603
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  6543104 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 6543203  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  6543204 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 6543303  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  6543304 cctgagaaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 6543403  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  6543404 agactagtataccactctgcagcatcctccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatctttcggacat 6543503  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  6543504 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatatttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgataccaagcagag 6543603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 5596996 - 5597495
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || || || |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||||||||| |    
T  5596996 agacgggttcccatagtgaccatctctgaaaagttgttcggggcggcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtttttaagaatgtctggg 5597095  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  5597096 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 5597195  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  5597196 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 5597295  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  ||  | ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  5597296 agactactataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 5597395  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || ||||||||||| || || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  5597396 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagtccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 5597495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 598
Target Start/End: Original strand, 15727987 - 15728033
Alignment:
Q  552 gatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15727987 gatttcacgacggagttctttagcaagttcctcaatcctttcttcca 15728033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 595
Target Start/End: Original strand, 16208610 - 16209198
Alignment:
Q  6 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16208610 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcaacataatccttttttagagtcttcaggaatgtc 16208709  T
Q  106 tgagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggaga 205  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16208710 tgagtcttctcttcttcgtcaagagcgggagtgatgcgggcagctgcccc-ctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcatctttcttttgggaga 16208808  T
Q  206 gggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatcttt 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  16208809 gggatctgagaaattccctgtttggtttcaatctggtattaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatgaacgtcattttt 16208908  T
Q  306 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 405  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  16208909 gctcaagctagtataccattctgcagcgtcttccattaagctatcttggaagcagtgaatcatgagtgaatcattgtctttatagttacccatctttcgg 16209008  T
Q  406 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagc 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16209009 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaactccgggaccttgaacttcttggggacatccacctttggtaccaagc 16209108  T
Q  506 agaggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttctt 595  Q
    |||| ||||||||||| | ||  |  |  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16209109 agagatcatgagtcttaatagagttcccgttccctcggttagctttgatttcatgacggagttctttagcaagttcctccatcctttctt 16209198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 20460778 - 20460186
Alignment:
Q  6 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  20460778 ttctaggcgagtccccatggtgaccatctcagagaaattatttggggcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcatagttttcaagaatgtc 20460679  T
Q  106 tgagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggaga 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20460678 tgagtcatctcgtcttcgtcaagagcgggagtgatgcgggaagctgcccccctccatcttagtgcatactcgcggaagctttcatctttcttttgggaga 20460579  T
Q  206 gggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatcttt 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | || || |||| ||| |||      
T  20460578 gggatctgagaaattccctgtttggcttcaacctggtattaaacctatagtggtttttgaaagcagcagccaattcaacaaaagtgtgaatgtcgtctcg 20460479  T
Q  306 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20460478 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaagctatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 20460379  T
Q  406 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagc 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||    
T  20460378 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggttgaactctgggaccttgaacttcttgggaatgtccacctttggtaccaagc 20460279  T
Q  506 agaggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20460278 agagatcatgagtcttaacagggtccccgttccctcggttagctttgatttcacgacggagttctttagcaagttcctccatcttttcttcca 20460186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 41793897 - 41794474
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  41793897 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 41793996  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | |   |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  41793997 tcatttcttcctcatctaaagtaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 41794096  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  41794097 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 41794196  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  41794197 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 41794296  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  41794297 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttagggacatccacttttgacactaagcaaag 41794396  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41794397 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 41794474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 28584647 - 28584059
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||| ||||| |    
T  28584647 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtttttaagaacgtctggg 28584548  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  28584547 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 28584448  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  28584447 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 28584348  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  28584347 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 28584248  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  28584247 atttgatgatgtgattttggggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 28584148  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28584147 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccatcatttcttcca 28584059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 51637884 - 51637307
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  51637884 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 51637785  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  51637784 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 51637685  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  51637684 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 51637585  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  51637584 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 51637485  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  51637484 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 51637385  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51637384 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 51637307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 10962336 - 10961759
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  10962336 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 10962237  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  10962236 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 10962137  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  10962136 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 10962037  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  10962036 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 10961937  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  10961936 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgatactaagcaaag 10961837  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10961836 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcccccat 10961759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 21225 - 20646
Alignment:
Q  19 cccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcatctcct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21225 cccatggtgaccatctcagagaagtcacttggagcagcgatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcatctcct 21126  T
Q  119 cttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaaa 218  Q
    |||| | ||||   ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| | ||    
T  21125 cttcattaagagtaggagtaacacgggcagctgcccccctccatatctgtgcatactcgcggaagctttcatctttcttctggaaaagggacctgaggaa 21026  T
Q  219 ttccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggtg 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||  ||||||||||||     
T  21025 ttccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttgaaagcagcagccaattcatcaaaagtgtgaatgtcgtctcggctcaagctggta 20926  T
Q  319 taccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataa 418  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  20925 taccattctgcagcatcttccattagactatcctgaaagcagtggatcatgagtgaatcattgtctgagtagttagccatcttccggacatatttgatga 20826  T
Q  419 tgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgagt 518  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  20825 tgtgattctgtggacaagttagcccattgtatcggtcgaaatccggaaccttgaacttcttagggatatccaccttcggtaccaagcagagatcatgagt 20726  T
Q  519 cttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    ||| |||| ||||||| | |  || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20725 cttaacagtatcactacttccccgattagctttgatttcccgacggagttccttagcaagttcctccatcctttcttcca 20646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 20160375 - 20159759
Alignment:
Q  6 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 105  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  20160375 ttctagacgggttcccatggtgaccatctcagagaagttactcggagcagcaatgatcattctctcgacataatccttttttaaagtctttaggaatgtc 20160276  T
Q  106 tgagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggaga 205  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  20160275 tgagtcatctcttcttcatcaagagcgggagtgatacgggcagctgcccctctccatctctgggcatattcacggaagctttcatctttcttttgggaaa 20160176  T
Q  206 gggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatcttt 305  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||  | |||||| ||    
T  20160175 gagatctgagaaattccctgtttggtttcagcctagtattaaacccatagtggtttttgaaagcagcagctaattcatcaaaagtatagatgtcatcctt 20160076  T
Q  306 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 405  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||| |||||| |||    
T  20160075 gctcaagctagtgtaccattctgcagcatcttccattaagctatcttggaagcaatgaatcatgagtgaatcattgtccaaatagttactcatcttgcgg 20159976  T
Q  406 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagc 505  Q
    || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||    
T  20159975 acgtacttgatgatatgattctgaggacaagtcagcccattgtatcggtcgaactccgggaccttgaacttcttagggatgtccacccttggtaccaagc 20159876  T
Q  506 agaggtcatgagt------cttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttccac 599  Q
    | || |||||| |       || ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  20159875 atagatcatgatttttaacattaacagggtcactgttccctcggttagctttgatttcacgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttccat 20159776  T
Q  600 agttccagtcatgggag 616  Q
     |||||||| |||||||    
T  20159775 ggttccagttatgggag 20159759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 616
Target Start/End: Original strand, 22172456 - 22173072
Alignment:
Q  6 ttctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtc 105  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  22172456 ttctagacgggttcccatggtgaccatctcagagaagttactcggagcagcaatgatcattctctcgacataatccttttttaaagtctttaggaatgtc 22172555  T
Q  106 tgagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggaga 205  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22172556 tgagtcatctcttcttcatcaagagcgggagtgatacgggcagctgcccctctccatctctgggcatattcacggaagctttcatctttcttttgggaaa 22172655  T
Q  206 gggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatcttt 305  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||  | |||||| ||    
T  22172656 gagatctgagaaattccctgtttggtttcagcctagtattaaacccatagtggtttttgaaagcagcagctaattcatcaaaagtatagatgtcatcctt 22172755  T
Q  306 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 405  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||| |||||| |||    
T  22172756 gctcaagctagtgtaccattctgcagcatcttccattaagctatcttggaagcaatgaatcatgagtgaatcattgtccaaatagttactcatcttgcgg 22172855  T
Q  406 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagc 505  Q
    || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||    
T  22172856 acgtacttgatgatatgattctgaggacaagtcagcccattgtatcggtcgaactccgggaccttgaacttcttagggatgtccacccttggtaccaagc 22172955  T
Q  506 agaggtcatgagt------cttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttccac 599  Q
    | || |||||| |       || ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22172956 atagatcatgatttttaacattaacagggtcactgttccctcggttagctttgatttcacgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttccat 22173055  T
Q  600 agttccagtcatgggag 616  Q
     |||||||| |||||||    
T  22173056 ggttccagttatgggag 22173072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 24863381 - 24862804
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  24863381 agacgagttctcatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 24863282  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  24863281 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgagagaggga 24863182  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | || |||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  24863181 tctgaggaactccctgttcggcttcaaacgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 24863082  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  24863081 aaactagtataccactctgcaacatcttccatcaaactatcttgaaagcagtggatcataagtgaatcattgtctttgtaattacccatctttcggacat 24862982  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  24862981 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggatatccacctttgacactaagcagag 24862882  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24862881 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattagctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 24862804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 22935409 - 22935987
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |    
T  22935409 agacgagttcccatggtgaccatctccgagaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaggaatgtctggg 22935508  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagc-tgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggg 208  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  22935509 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagcctgcccccctccatctctacgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagag 22935608  T
Q  209 atctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgct 308  Q
    ||||| | ||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||    
T  22935609 atctgaggaattccctgttcggcttcaatctggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgct 22935708  T
Q  309 caagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggaca 408  Q
    |||  | || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  22935709 caaattagtataccactctgcagcatcttccatcaagctatcttggaagcagtggatcataagtgaatcattgtctttgtaattacccatctttcggaca 22935808  T
Q  409 tacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcaga 508  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||    
T  22935809 tacttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggattttgaactttttagggacatccacctttgacaccaaacaga 22935908  T
Q  509 ggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    | || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22935909 gatcttgagttttgaaagagtctgcattccctcgattggctttgatttcatgacggagttctttagcaagttcctccat 22935987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 23857854 - 23858432
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |    
T  23857854 agacgagttcccatggtgaccatctccgagaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaggaatgtctggg 23857953  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagc-tgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggg 208  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  23857954 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagcctgcccccctccatctctacgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagag 23858053  T
Q  209 atctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgct 308  Q
    ||||| | ||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||    
T  23858054 atctgaggaattccctgttcggcttcaatctggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgct 23858153  T
Q  309 caagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggaca 408  Q
    |||  | || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  23858154 caaattagtataccactctgcagcatcttccatcaagctatcttggaagcagtggatcataagtgaatcattgtctttgtaattacccatctttcggaca 23858253  T
Q  409 tacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcaga 508  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||    
T  23858254 tacttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggattttgaactttttagggacatccacctttgacaccaaacaga 23858353  T
Q  509 ggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    | || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23858354 gatcttgagttttgaaagagtctgcattccctcgattggctttgatttcatgacggagttctttagcaagttcctccat 23858432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 13299483 - 13300060
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  13299483 agacgagttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 13299582  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  13299583 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctctttcttctgggagagaga 13299682  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    | || | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  13299683 tttgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 13299782  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  13299783 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcttgaaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacat 13299882  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  13299883 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatatgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 13299982  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13299983 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatttcatgacggagttctttagcaagttcctccat 13300060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 15424849 - 15425426
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  15424849 agacgagttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcgatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 15424948  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  15424949 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 15425048  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  15425049 tctgaggaattccctgttcggcttcaatctggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 15425148  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  15425149 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaagctatcctggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 15425248  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  15425249 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatctgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 15425348  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || ||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15425349 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttaatttcatgacggatttctttagcaagttcctccat 15425426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 587
Target Start/End: Original strand, 24305159 - 24305727
Alignment:
Q  19 cccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcatctcct 118  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||| || |    
T  24305159 cccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctgggtcatttctt 24305258  T
Q  119 cttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaaa 218  Q
    |||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||| | |||||||| |||||| | ||    
T  24305259 cttcatcaagagcgggagtaatacgggcagctgctcccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcctctgggagagagatctgaggaa 24305358  T
Q  219 ttccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggtg 318  Q
    ||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || ||     
T  24305359 ttccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatgaatgtcatttttgctcaaactagta 24305458  T
Q  319 taccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataa 418  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  24305459 taccactctgcagcatcttccatcaaactatcctggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattacccatctttcggacgtacttgatga 24305558  T
Q  419 tgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgagt 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |||||    
T  24305559 tgtggttctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatctgggattttgaacttcttagggacatccacttttgacaccaagcagagatcttgagt 24305658  T
Q  519 cttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     |||| ||  ||   ||||| ||| || ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24305659 tttgaaagagtccgcattccctcgattggctttaatttcatgacggagttctttagcaagttcctccat 24305727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 26999737 - 26999163
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  26999737 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 26999638  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  26999637 tcatttcttcttcatcaagagtgggagtaatgcgagcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 26999538  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  26999537 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 26999438  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaact-atcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggaca 408  Q
    || || || ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||     
T  26999437 aaactagtataccactctgcaacatcttccatcaaactaatcctggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacg 26999338  T
Q  409 tacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcaga 508  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||    
T  26999337 tacttgatgatgtggttctggggacaagttagcccgttgtatcggtcgaagtccgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaaacaga 26999238  T
Q  509 ggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcct 583  Q
    | || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26999237 gatcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcct 26999163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 26988665 - 26988091
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  26988665 agacgagttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 26988566  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  26988565 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 26988466  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  26988465 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 26988366  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  26988365 aaactagtataccactctgcaacatcttccatcaaactatcctggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 26988266  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  26988265 acttgatgatgtggttctggg-aca-gttagccg-ttgtatcggtcgaagtccgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 26988169  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||| | ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26988168 atcttgagttttgaaagagtccgcatttcctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 26988091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 16749518 - 16748941
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  16749518 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagctatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 16749419  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||    
T  16749418 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgagagagaga 16749319  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||    
T  16749318 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcgaaggtatggatatcatttttgctc 16749219  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  16749218 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcctggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 16749119  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  16749118 atttgatgatgtggttttggggacaagttagcccgttgtaccggtcgaaatctgggattttgaatttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 16749019  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||| | ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16749018 atcttgagttttgaaagagtccgcatttcctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 16748941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 26918044 - 26917468
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  26918044 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagctatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 26917945  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||    
T  26917944 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctttgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgagagagaga 26917845  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||    
T  26917844 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcgaaggtatggatatcatttttgctc 26917745  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  26917744 aaactagtataccactctgcggcatcttccatcaaactatcctgaaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 26917645  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  26917644 atttgatgatgtggttctggggacaagttagcccgttgtaccggtcgaaatccgggattttgaactttttagggacatccacttttgacaccaagcagag 26917545  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||| | ||| || |||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26917544 atcttgagttttgaaagagtccgcatttcctcgattggctttgatctcatgac-gagttctttagcaagttcctccat 26917468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 449
Target Start/End: Original strand, 27273112 - 27273555
Alignment:
Q  7 tctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtct 106  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||| ||||| | ||| || || ||||  || |||| ||| || |    
T  27273112 tctagacgagtccccatagttaccatttcagaaaagttgctaggagcagcaataatcatcctttcaatatagtctttcttcaaggttttcaagaaagttt 27273211  T
Q  107 gagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagag 206  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  27273212 gagtcatttcctcttcctctagagcgggagtaatacgggcagcagctcccctccatctttgggcatattcacggaaactttcgtctttcttctgagagag 27273311  T
Q  207 ggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaa-ttcatctaaggtatgaacgtcatcttt 305  Q
    ||| ||| || ||||||| ||||| || |  ||||| |||||||| || || || || || |||||||  ||  || || || || || | |||||| ||    
T  27273312 ggacctgagagattccctatttggctttaatctggtattgaacccgtaatgactcttgaaggcagcagataacatcgtcaaaagtgtggatgtcatcctt 27273411  T
Q  306 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 405  Q
    |||||| |  || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||| || |||||||| |||    
T  27273412 gctcaaaccagtataccactctgcagcatcttccatcaagctatcttggaagcagtgtatcataagcgaatcattgtctttgtaatttcccatcttgcgg 27273511  T
Q  406 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgta 449  Q
    ||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||||    
T  27273512 acatacttgatgatatgattttgaggacaagtcagcccgttgta 27273555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 16944559 - 16945136
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||| ||||| |    
T  16944559 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtttttaagaacgtctggg 16944658  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| || || |||||    
T  16944659 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaagctttcctccttcttctgagataggga 16944758  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  16944759 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 16944858  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  16944859 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 16944958  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  16944959 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 16945058  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16945059 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 16945136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 29572677 - 29572100
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||  || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  29572677 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatttttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 29572578  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  29572577 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 29572478  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  29572477 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 29572378  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || |||||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  29572377 aaactagtgtaccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 29572278  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  29572277 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 29572178  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29572177 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 29572100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 30558548 - 30559125
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  30558548 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 30558647  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  30558648 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 30558747  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| ||||| || | |||||  || |||    
T  30558748 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtgtggatgtcattcttactc 30558847  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  30558848 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 30558947  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  30558948 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 30559047  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30559048 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 30559125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16673791 - 16673292
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  16673791 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 16673692  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || |   | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  16673691 tcatttcttcttcatctaaggcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagataggga 16673592  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  16673591 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 16673492  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  16673491 agactagtataccactccgcagcgtcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 16673392  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  16673391 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 16673292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 27360542 - 27361041
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || || || |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  27360542 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcggcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 27360641  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  27360642 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccatctttgtgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagataggga 27360741  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  ||||  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  27360742 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggccagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 27360841  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  27360842 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 27360941  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  27360942 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatatttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 27361041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 27450885 - 27451384
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || || || |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  27450885 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcggcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 27450984  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  27450985 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccatctttgtgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagataggga 27451084  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  ||||  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  27451085 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggccagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 27451184  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  27451185 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 27451284  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  27451285 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatatttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 27451384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 29549142 - 29548643
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  29549142 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 29549043  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| ||||||||| |||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  29549042 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagcttcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 29548943  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |  ||||| || || || || ||||||||||||    
T  29548942 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagctcatcaaaagtgtggacatcatctttgctc 29548843  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| || ||||    
T  29548842 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccgaacat 29548743  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || ||||| |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  29548742 atttgacaatatgattctgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgataccaagcagag 29548643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27044054 - 27043554
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  27044054 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagctatgatcatcctctcaacataatcttttttcaaggtctttaagaacgtctggg 27043955  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  27043954 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 27043855  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || | |||||| || || || || ||||||||||||    
T  27043854 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagttcatcaaaagtgtggacatcatctttgctc 27043755  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  27043754 agactagtataccactctgcagcatcctccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 27043655  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagg-gacatccacctttggtactaagcaga 508  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||| | |||||||||||    
T  27043654 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggtaacatctaccttcgatactaagcaga 27043555  T
Q  509 g 509  Q
    |    
T  27043554 g 27043554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 479
Target Start/End: Original strand, 27630238 - 27630710
Alignment:
Q  7 tctagacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtct 106  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||  | || |||||||| ||||| ||||| |  || || || ||||  || |||| ||| || |    
T  27630238 tctagacgagtccccatagttaccatttcagaaaagttgctaggggcagcaataatcatcctttcaatgtagtctttcttcaaggttttcaagaaagttt 27630337  T
Q  107 gagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagag 206  Q
    | |||||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| || | ||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  27630338 gggtcatctcctcttcttctagagcgggagtaatacgggcagcagctctcctccatctttgggcatattcacggaaactttcgtccttcttctgagagag 27630437  T
Q  207 ggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttg 306  Q
    ||| ||| || ||||||| ||||| || |  ||||| |||||||| || || || || || |||||||  || || || || ||||| | |||||| |||    
T  27630438 ggacctgagagattccctatttggctttaatctggtattgaacccgtaatgactcttgaaggcagcagataactcgtcaaaagtatggatgtcatccttg 27630537  T
Q  307 ctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgga 406  Q
    ||||| |  || ||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||  ||| || |||||||| ||||    
T  27630538 ctcaaaccagtataccactctgcagcatcttccatcagactatcctggaagcagtggatcataagtgagtcattgtctttgtaatttcccatcttgcgga 27630637  T
Q  407 catacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttctt 479  Q
    |||| ||||| || || || || |||||||||||||| |||||   |||||| |||||||  ||||| |||||    
T  27630638 catatttgatgatatgattttgaggacaagtcagcccgttgtacttgtcgaactccgggagcttgaatttctt 27630710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 34463893 - 34464392
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||||||||| |    
T  34463893 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtttttaagaatgtctggg 34463992  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  34463993 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagataggga 34464092  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  34464093 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 34464192  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  34464193 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 34464292  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  34464293 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 34464392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28207106 - 28206604
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  28207106 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcaatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 28207007  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  28207006 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 28206907  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  ||||  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  28206906 cctgagaaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggccagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 28206807  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| ||||| || ||||| |    
T  28206806 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccattttccggacgt 28206707  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  28206706 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgataccaagcagag 28206607  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  28206606 gtc 28206604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 17024926 - 17024427
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  17024926 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 17024827  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  17024826 tcatttcttcttcatctaaagcaggggtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 17024727  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  17024726 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 17024627  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  17024626 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 17024527  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  17024526 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttgggaacatctaccttcgatactaagcagag 17024427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Original strand, 4546316 - 4546818
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  4546316 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcaatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 4546415  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  4546416 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 4546515  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  ||||  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  4546516 cctgagaaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggccagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 4546615  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| ||||| || ||||| |    
T  4546616 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccattttccggacgt 4546715  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  4546716 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgataccaagcagag 4546815  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  4546816 gtc 4546818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4524953 - 4524454
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  4524953 agacgggttcccatagtgaccatctctgaaaagttgttcggggcggcgatgatcatcctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 4524854  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || || || || || || || |||||    
T  4524853 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactctcctcctttttctgagataggga 4524754  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  || |  ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  4524753 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggctagctcatcaaaggtatggacatcatctttgctc 4524654  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  4524653 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 4524554  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  4524553 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatatttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgataccaagcagag 4524454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4757425 - 4756926
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || || || |||||||| || || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  4757425 agacgggttcccatagtgaccatctctgaaaagttgttcggggcggcgatgatcatcctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 4757326  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  4757325 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 4757226  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| |  || |  ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  4757225 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtgactcctgaaagcggtggctagctcatcaaaggtatggacatcatctttgctc 4757126  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  4757125 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 4757026  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || | ||||||||||||    
T  4757025 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatatttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctactttcgatactaagcagag 4756926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 4772661 - 4772162
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  4772661 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 4772562  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  4772561 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 4772462  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  || |  ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  4772461 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggctagctcatcaaaggtatggacatcatctttgctc 4772362  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  4772361 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 4772262  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || | ||||||||||||    
T  4772261 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatatttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctactttcgatactaagcagag 4772162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27007376 - 27006877
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || || || |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  27007376 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcggcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 27007277  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || || || || || || || |||||    
T  27007276 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactctcctcctttttctgagataggga 27007177  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  || |  ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  27007176 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggctagctcatcaaaggtatggacatcatctttgctc 27007077  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  27007076 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 27006977  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  27006976 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatatttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 27006877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 29501070 - 29500571
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  29501070 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatcttttttcaaggtctttaagaatgtctggg 29500971  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  29500970 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcctttttctgagataggga 29500871  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| || ||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  29500870 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtaatggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 29500771  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||||   || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  29500770 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtgatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 29500671  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || | ||||||||||||    
T  29500670 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctactttcgatactaagcagag 29500571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 27484781 - 27484279
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || || || |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  27484781 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcggcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 27484682  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | ||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  27484681 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtcatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 27484582  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  27484581 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggccaactcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 27484482  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  27484481 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 27484382  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  27484381 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggaccttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 27484282  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  27484281 gtc 27484279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 26778159 - 26778658
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  26778159 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 26778258  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  26778259 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 26778358  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| |  || |  ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  26778359 cctgaggaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtgactcctgaaagcggtggctagctcatcaaaggtgtggacatcatctttgctc 26778458  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  26778459 agactagtataccactctgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 26778558  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  26778559 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatatttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgataccaagcagag 26778658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Original strand, 4724675 - 4725177
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  4724675 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 4724774  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  4724775 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 4724874  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  4724875 cctgagaaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 4724974  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| ||||| || ||||| |    
T  4724975 agactagtataccactctgcagcatcctccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccattttccggacgt 4725074  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  4725075 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 4725174  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  4725175 gtc 4725177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Original strand, 26116951 - 26117453
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  26116951 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 26117050  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | ||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  26117051 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtaatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 26117150  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  ||||  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  26117151 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggccagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 26117250  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| ||||| || ||||| |    
T  26117251 agactagtataccactctgcagcatcctccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccattttccggacgt 26117350  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  26117351 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 26117450  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  26117451 gtc 26117453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3695677 - 3695267
Alignment:
Q  99 gaatgtctgagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttt 198  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || | | | || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || ||     
T  3695677 gaatgtctgggtcatttcttcttcatctaaagcaggggtgatgcgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcccggaaactttcctcctttttc 3695578  T
Q  199 tgggagagggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgt 298  Q
    || || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| || ||||| || |||||||| || | |||||| || ||||| || |    
T  3695577 tgagatagggacctgagaaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtaatggctcttgaaagcagcggctagttcatcaaaagtatggacat 3695478  T
Q  299 catctttgctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccat 398  Q
    | ||||||||||  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||| ||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||    
T  3695477 cgtctttgctcagactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttgaaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccat 3695378  T
Q  399 ctttcggacatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggt 498  Q
    ||| |||||||| |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | |    
T  3695377 cttccggacatatttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgat 3695278  T
Q  499 actaagcagag 509  Q
    |||||||||||    
T  3695277 actaagcagag 3695267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 598
Target Start/End: Original strand, 22081429 - 22082008
Alignment:
Q  19 cccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcatctcct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22081429 cccatggtgaccatctcagagaagtcacttggagcagcgatgatcattctttcgacataatcctttttcaaagtcttcaggaatgtctgagtcatctcct 22081528  T
Q  119 cttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaaa 218  Q
    |||| | ||||   ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | | ||||| ||  | ||    
T  22081529 cttcattaagagtaggagtaacacgggcagccgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcatctttcttctagcaaagggacctaaggaa 22081628  T
Q  219 ttccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggtg 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||  ||| ||||||||     
T  22081629 ttccctgtttggtttcagtctggtgttgaacccatagtggcttttgaaagcagcagccaattcatcaaaagtgtgaatgtcgtctcggcttaagctggta 22081728  T
Q  319 taccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataa 418  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  22081729 taccattctgcagcatcttccattagactatcctgaaagcagtggatcatgagtgaatcattgtctaagtagttagccatcttccggacatatttgatga 22081828  T
Q  419 tgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgagt 518  Q
    || | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  22081829 tgggattctgtggacaagttagcccattgtatcggtcgaaatccggaaccttgaacttcttagggacatccaccttcggtaccaagcagagatcatgagt 22081928  T
Q  519 cttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    ||| |||| ||| ||| | |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22081929 cttaacagtatcgctacttccccgattagctttgatttcccgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 22082008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 16283116 - 16282531
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |    
T  16283116 agacgagttcccatggtgaccatctccgagaagttattcggggcagcgatgatcattctctcaacataatcctttt-caaagtctttaggaatgtctggg 16283018  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccc-tccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggg 208  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  16283017 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggaagctgccccccctccatctctgtgcatattcacggaagctttcctccttcttttgggagagag 16282918  T
Q  209 atctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgct 308  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||    ||||||    
T  16282917 atctgaggaattccctgtttggcttcaatctggtattaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggacgtt---tttgct 16282821  T
Q  309 caagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggaca 408  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16282820 caagctagtataccattctgcagcatcttccattaagctatcttggaagcagtgaatcatgagtgaatcattgtctttgtagttacccatctttcggaca 16282721  T
Q  409 tacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcaga 508  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16282720 tacttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgtaatccgggatcttgaacttcttaggaacatccacctttggtaccaagcaga 16282621  T
Q  509 ggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    | ||||||||||| | ||  || |  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16282620 gatcatgagtcttaaaagagtccccgttccctcggttagctttgatttcatgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 16282531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 16277221 - 16276644
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  16277221 agacgagttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcgatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 16277122  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  16277121 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctctttcttctgggagagaga 16277022  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  16277021 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 16276922  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  16276921 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcttggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacat 16276822  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  16276821 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 16276722  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| |||  | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16276721 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgactggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 16276644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 14557294 - 14556717
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  14557294 agacgagttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 14557195  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  14557194 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatacgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctctttcttctgggagagaga 14557095  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  14557094 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatgaatgtcatttttgctc 14556995  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |    
T  14556994 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcttgaaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattacccatctttcggacgt 14556895  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  14556894 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttatatcggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 14556795  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14556794 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 14556717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 2137807 - 2138384
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  2137807 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 2137906  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  2137907 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctctttcttctgggagagaga 2138006  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  2138007 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 2138106  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |    
T  2138107 aaactagtataccactctgcaacatcttccatcaaactatcctggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattacccatctttcggacgt 2138206  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  2138207 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 2138306  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2138307 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 2138384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 19687765 - 19687188
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  19687765 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 19687666  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| | |||||| ||    
T  19687665 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcttccttcttctaggagagaga 19687566  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | |||||||| || |  ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||| | |||||||    
T  19687565 tctgaggaattccctattcgacttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcgtttttgctc 19687466  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  19687465 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaagctatcttggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattacccatctttcggacat 19687366  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||    
T  19687365 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaaggagag 19687266  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19687265 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattagctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 19687188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 27609453 - 27610030
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  || || | ||||||||| |    
T  27609453 agacgagttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtttttaagaatgtctggg 27609552  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  27609553 tcatttcttcttcatcaagagcaggagtaatacgggcagctgctcccctccatctctgtgcatattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 27609652  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||  | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  27609653 tctaaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 27609752  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  27609753 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcttggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 27609852  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||    
T  27609853 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatctgggattttgaactttttagggacatccacctttgacaccaagcaaag 27609952  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||| | ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27609953 atcttgagttttgaaagagtctgcatttcctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 27610030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 18710253 - 18709676
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  18710253 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 18710154  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || |||||    
T  18710153 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctctttcttctgagataggga 18710054  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||  ||||||    
T  18710053 cctgagaaactccctatttggcttcagtcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcattcttgctc 18709954  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  18709953 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcaaactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 18709854  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||| ||| ||||  |||||||| ||    
T  18709853 atttgatgatgtggttttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccgggattttgaaatttttaggaacatgcacttttgacactaagcaaag 18709754  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||| ||  ||   |||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709753 gtcttgagttttgaaagagtccgcattcccccgattggctttaatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 18709676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19674105 - 19673606
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |    
T  19674105 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcgatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaagaatgtctggg 19674006  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || |||||    
T  19674005 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctctttcttctgagataggga 19673906  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  ||| ||  ||||| |||||||||||||| || |||||||| || | |||||| || ||||| || || |||||||||    
T  19673905 cctgagaaactccctatttggcctcaaccgagtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctagttcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 19673806  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||  | || ||||| || ||||| |||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  19673805 agactagtataccactctgcagcatcctccatcagactgtcttggaaataatggatcataagggaatcgttgtccttgtagttgcccatcttccggacat 19673706  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  19673705 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggaccttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 19673606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 31490298 - 31490875
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  31490298 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 31490397  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  31490398 tcatttcttcttcatctaaagcaggggtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgggataggga 31490497  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  31490498 tctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 31490597  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  31490598 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 31490697  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  31490698 atttgatgatgtgattttgagggcaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttagggacatccacttttgacactaagcaaag 31490797  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31490798 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 31490875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 31354191 - 31353675
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  31354191 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 31354092  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  31354091 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccatctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 31353992  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  31353991 tctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 31353892  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  31353891 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcatgagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 31353792  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  31353791 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 31353692  T
Q  510 gtcatgagtcttgacag 526  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  31353691 gtcttgagttttgacag 31353675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 587
Target Start/End: Original strand, 19208917 - 19209485
Alignment:
Q  19 cccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcatctcct 118  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| ||||| || |    
T  19208917 cccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctgggtcatttctt 19209016  T
Q  119 cttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaaa 218  Q
    | || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||    
T  19209017 cctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagatagggacctgagaaa 19209116  T
Q  219 ttccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggtg 318  Q
     ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || ||||| || ||     
T  19209117 ctccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactcaaactagta 19209216  T
Q  319 taccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataa 418  Q
    ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| || ||||| |    
T  19209217 taccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgtatttgatga 19209316  T
Q  419 tgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgagt 518  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||    
T  19209317 tgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaaggtcttgagt 19209416  T
Q  519 cttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19209417 tttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 19209485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 587
Target Start/End: Original strand, 28362512 - 28363080
Alignment:
Q  19 cccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgagtcatctcct 118  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| ||||| || |    
T  28362512 cccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctgggtcatttctt 28362611  T
Q  119 cttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaaa 218  Q
    | || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||    
T  28362612 cctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagatagggacctgagaaa 28362711  T
Q  219 ttccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggtg 318  Q
     ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || ||||| || ||     
T  28362712 ctccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactcaaactagta 28362811  T
Q  319 taccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataa 418  Q
    ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| || ||||| |    
T  28362812 taccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgtatttgatga 28362911  T
Q  419 tgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgagt 518  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||    
T  28362912 tgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaaggtcttgagt 28363011  T
Q  519 cttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28363012 tttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 28363080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 33258390 - 33257813
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  || || | ||| ||||| |    
T  33258390 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtttttaagaacgtctggg 33258291  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  33258290 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 33258191  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  33258190 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 33258091  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  33258090 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 33257991  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  33257990 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 33257891  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   | ||| ||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33257890 gtcttgagttttgacagagtctgcactccctcgattggcctggatttcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 33257813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 19286132 - 19285537
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  19286132 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 19286033  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  19286032 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 19285933  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || | |||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  19285932 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagcggctagttcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 19285833  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||||| ||| || |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  19285832 agactagtataccattttgcggcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 19285733  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  19285732 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 19285633  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttccacagttcc 605  Q
     || ||||| || | ||  || | ||| |  | ||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  19285632 atcctgagttttaatagagtctccatttcccctgttggccttaatttcccgtcggagctctttggcaagttcttccattctctcttccatagttcc 19285537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 19279034 - 19279534
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  19279034 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgtttggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 19279133  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggaga-ggg 208  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || | |||    
T  19279134 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataaggg 19279233  T
Q  209 atctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgct 308  Q
    | ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || || ||||||||    
T  19279234 acctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgct 19279333  T
Q  309 caagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggaca 408  Q
    ||  || || ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||||    
T  19279334 cagactagtataccactccgcagcgtcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggaca 19279433  T
Q  409 tacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcaga 508  Q
    || |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  19279434 tatttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcaga 19279533  T
Q  509 g 509  Q
    |    
T  19279534 g 19279534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 19518691 - 19519190
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  19518691 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgtttggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 19518790  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || | |||    
T  19518791 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataagga 19518890  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || ||| |||  || |  ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  19518891 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaaccagtggctagctcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 19518990  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  19518991 agactagtataccactccgcagcgtcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 19519090  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  19519091 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatccactttcgatactaagcagag 19519190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 29828980 - 29828478
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  29828980 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 29828881  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | ||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  29828880 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtaatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 29828781  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  29828780 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 29828681  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| |    
T  29828680 agactagtataccactccgcagcgtcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacgt 29828581  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  29828580 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 29828481  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  29828480 gtc 29828478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Original strand, 3330067 - 3330566
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || || |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  3330067 agacgagttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcggcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 3330166  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || || || || || || || |||||    
T  3330167 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactctcctcctttttctgagataggga 3330266  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| | || ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| |||||||| || |||||||  || |  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  3330267 cctgaggaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcttgaaagcagtggctagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 3330366  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  3330367 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 3330466  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  3330467 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaactttttaggaacatctaccttcgatactaagcagag 3330566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 605
Target Start/End: Original strand, 12093281 - 12093876
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  12093281 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcaatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 12093380  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || || || || || || || |||||    
T  12093381 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactctcctcctttttctgagataggga 12093480  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  ||||  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  12093481 cctgagaaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggccagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 12093580  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| ||||| || ||||| |    
T  12093581 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccattttccggacgt 12093680  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| ||||||||    
T  12093681 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatccaccttcgataccaagcagag 12093780  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttccacagttcc 605  Q
    ||| || || ||||  |  || | ||| |  | ||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  12093781 gtcctgggttttgatggagtctccatttcccctgttggccttaatttcccgtcggagctctttggcaagttcttccattctctcttccatagttcc 12093876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 10 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 29430 - 28842
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |    
T  29430 agacgagttcccatggtgaccatctccgagaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaggaatgtctggg 29331  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  29330 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgcgcgtattcacggaagctttcctccttcttttgggagagaga 29231  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | ||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  29230 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtattaaacccatagtggcttttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 29131  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29130 aaactagtataccactctgtagcatcttccatcaagctatcttggaagcagtgaatcatgagtgaatcattgtctttgtagttacccatctttcggacat 29031  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29030 atttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggatcttgaacttcttagggacatccacctttggtaccaagcagag 28931  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
     || |||||||||| ||  ||   ||||| | | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28930 atcctgagtcttgaaagagtccgcattcccttgattagctttgatttcatgacggagttctttagcaagttcctccatcctttcttcca 28842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 40658 - 41235
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |    
T  40658 agacgagttcccatggtgaccatctccgagaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatcctttttcaaggtctttaggaatgtctggg 40757  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||    
T  40758 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgcgagagaga 40857  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  40858 tctgaggaattctctgttcggcttcaatctggtgttaaacccatagtggcttttgaaagcaacggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 40957  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  40958 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaagctatcttggaagcagtgaatcataagtgaatcattgtctttgtaattacccatctttcggacat 41057  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  41058 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggattttgaacttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 41157  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41158 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattagctttgatttcatgacggagttctttagcaagttcctccat 41235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 47574 - 48151
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  47574 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 47673  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  47674 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 47773  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||| | || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  47774 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcaacggctaattcatcgaaggtatggatgtcatttttgctc 47873  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  47874 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcctggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaatttcccatctttcggacgt 47973  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  47974 acttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtatcggtcgaaatctgggattttgaacttcttagggacatccacttttgacaccaagcagag 48073  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||| | ||| || ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48074 atcttgagttttgaaagagtccgcatttcctcgattggctttaatttcatgacggagttctttagcaagttcctccat 48151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 719 - 1296
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  719 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttattcggggcagcaatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 818  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  819 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgggcagctgcccctctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 918  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  919 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 1018  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  1019 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcctggaagcagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 1118  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  1119 atttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccgttgtaccggtcgaaatctgggattttgaacttcttagggacatccacttttgacaccaagcagag 1218  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1219 atcttgagttttgaaagagtccgcattccctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcttccat 1296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 152 - 598
Target Start/End: Original strand, 120912 - 121358
Alignment:
Q  152 cccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagagggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaaccc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||   || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  120912 cccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcatctttcttctgtaaaaggggcttgaggaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaaccc 121011  T
Q  252 atagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatct 351  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||  ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  121012 atagtggcttttgaaagcagcagccaattcatcaaaagtgtgaatgtcgtctaagctaaagctggtataccattctgcagcatcttccattagactatcc 121111  T
Q  352 tggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatc 451  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  121112 tgaaagcagtggatcatgagtgaatcattgtctgagtagttagccatcttccggacatatttgatgatgtgattctgtggacaagttagcccattgtatc 121211  T
Q  452 ggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagcttt 551  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||   |  || ||||||||    
T  121212 ggtcgaaatccggaaccttgaacttcttagggatatccaccttcggtaccaagcagagatcatgagtcttaacagtatcactacatccccgattagcttt 121311  T
Q  552 gatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
     ||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  121312 aatttaccgacggagttccttaacaagttcctccatcctttcttcca 121358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 26959 - 26382
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || | ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  26959 agacgagttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggaagcaatgatcattctctcaacataatccttcttcaaggtctttaagaatgtctggg 26860  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  26859 tcatttcttcttcatcaagagcgggagtaatgcgagcagctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaagctttcctccttcttctgggagagaga 26760  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  26759 tctgaggaattccctgttcggcttcaatcgggtgttaaacccatagtggctcttgaaagcagcggctaattcatcaaaggtatggatgtcatttttgctc 26660  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |    
T  26659 aaactagtataccactctgcagcatcttccatcaaactatcttgaaagcagtggatcataagtgaatcattgtctttgtaattgcccatctttcggacgt 26560  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  26559 atttgatgatgtggttctgaggacaagttagcccgttgtatcggtcgaaatctgggattttgaatttcttagggacatccacctttgacaccaagcagag 26460  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
     || ||||| |||| ||  ||   ||| | ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26459 atcttgagttttgaaagagtccgcatttcctcgattggctttgatctcatgacggagttctttagcaagttcctccat 26382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 48744 - 49347
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggag-cagcaatgatcattct-ttcgacataatccttttt---cagagtcttc-aggaatg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   ||  |||||  |||||||    
T  48744 agacgagttcccatggtgaccatctccgagaagttattcgggggcagcaatgatcattctcttcaacataatccttttttcccaaggtcttttaggaatg 48843  T
Q  104 tctgagtc-atctcctcttcgt-caagatcgggagtgat-gcgggcagc-tgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaa-gcttt--cgtctttct 196  Q
    |||| ||| || || ||||| | ||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||    
T  48844 tctgggtctatttcttcttcattcaagagcgggagtaatcgcgggcagcctgcccccctccatctctgtgcgtattcacggaaagcttttccgtccttct 48943  T
Q  197 ttt-gggagagggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaaccc-atagtggcttttaaaa-gcagcagccaattcatctaa-ggtat 292  Q
    ||| ||||||| |||||| | || |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  48944 ttttgggagagagatctgaggaactccctgttcggcttcaatctggtgttaaaccccatagtggcttttgaaacgcagcggctaattcatcaaaaggtat 49043  T
Q  293 gaacgtcatctttgctcaagctggtgtaccattct-gcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaa-tcatgagcgaatcattgtctgagtag 390  Q
    | | ||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||    
T  49044 ggatgtcatttttgctcaaactagtataccactctagcagcatcttccatcaagctatcttggaagcagtgaaatcatgagtgaatcattgtctttgtag 49143  T
Q  391 ttacccatctttcggac-atacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccggga-ctttgaacttcttaggg-acat 487  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  49144 ttacccatctttcggactatacttgatgatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggatttttgaacttcttagggtacat 49243  T
Q  488 ccacctt-tggtactaagcagaggt-catgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttc-gcgacggagttctttag-caagttcct 583  Q
    |||||||  || || |||||||| | | |||||||||| ||  ||   ||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  49244 ccaccttacggcaccaagcagagatccctgagtcttgaaagagtccgcattccctcgattagctttgatttctatgacggagttctttagtcaagttcct 49343  T
Q  584 ccat 587  Q
    ||||    
T  49344 ccat 49347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 587
Target Start/End: Original strand, 15519 - 16096
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  15519 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 15618  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| || || |||||    
T  15619 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaagctttcctccttcttctgagataggga 15718  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  15719 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 15818  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| ||||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  15819 aaactagtataccactctgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 15918  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  15919 atttgatgatgtgattttgagggcaagttagcccgttgtatcggtcgaagtccggaatcttgaactttttagggacatccacttttgacactaagcaaag 16018  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccat 587  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||| ||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16019 gtcttgagttttgacagagtctgcattccctcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccat 16096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 598
Target Start/End: Original strand, 7828 - 8416
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  7828 agacgggttcccatagtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaacgtctggg 7927  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || |||||    
T  7928 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctccttcttctgagataggga 8027  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |  || || ||||| |||||||| | |||||  || |||    
T  8028 cctgagaaactccctatttggcctcagtcgagtgttaaacccataatggctcttgaaagcggtggctaactcatcaaaggtatggatgtcattcttactc 8127  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    || || || ||||| | ||| || || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| |    
T  8128 aaactagtataccactttgcggcatcctccatcagactatcctgaaaacagtggatcataagggaatcattgtctttgtaattgcccatcttccggacgt 8227  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||    
T  8228 atttgatgatgtgattttgaggacaagttagcccgttgtaccggtcgaagtccggaatcttgaactttttaggaacatccacttttgacactaagcaaag 8327  T
Q  510 gtcatgagtcttgacaggatcactattccatcggttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttcttcca 598  Q
    ||| ||||| |||||||  ||   ||||||||| || || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8328 gtcttgagttttgacagagtctgcattccatcgattggcctggatctcgtgacggagttctttagcaagttcctccatcatttcttcca 8416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 106 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 41232 - 40889
Alignment:
Q  106 tgagtcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggaga 205  Q
    |||||||| |||||||| || ||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  41232 tgagtcatttcctcttcctctagagcgggagtaatacgggcagcagctcccctccatctttgggcatattcacggaaactttcgtctttcttctgagaga 41133  T
Q  206 gggatctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatcttt 305  Q
    |||| ||| || ||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| || || || || || |||||||  ||||| || || || || |  ||||| ||    
T  41132 gggacctgagagattccctatttggcttcaatctggtattgaacccgtaatgactcttgaaggcagcagataattcgtcaaaagtgtggatatcatcctt 41033  T
Q  306 gctcaagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcgg 405  Q
    |||||| |  || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||| || |||||||| |||    
T  41032 gctcaaaccagtataccactctgcggcatcttccatcaagctatcttggaagcagtgtatcataagcgaatcattgtctttgtaatttcccatcttgcgg 40933  T
Q  406 acatacttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgta 449  Q
    ||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||||    
T  40932 acatacttgatgatatgattttgaggacaagtcagcccgttgta 40889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 91; Significance: 9e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 7604 - 7102
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  7604 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcaatgatcattctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 7505  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  7504 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 7405  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  ||||  ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  7404 cctgagaaactccctattcggcttcaaacgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggccagctcatcaaaagtatggacatcatctttgctc 7305  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| || ||||| |||||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| ||||| || ||||| |    
T  7304 agactagtataccactccgcagcatcttccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccattttccggacgt 7205  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  7204 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgataccaagcagag 7105  T
Q  510 gtc 512  Q
    |||    
T  7104 gtc 7102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 7899 - 7400
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||| ||||| |    
T  7899 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaaggtctttaagaacgtctggg 7800  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctccatctctgtgcatactcgcggaagctttcgtctttcttttgggagaggga 209  Q
    |||| || ||||| || | | | |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||    
T  7799 tcatttcttcttcatctaaagcaggagtgatacgggcagctgcccctctccacctttgcgcatattcacggaaactttcctcctttttctgagataggga 7700  T
Q  210 tctgtgaaattccctgtttggtttcagcctggtgttgaacccatagtggcttttaaaagcagcagccaattcatctaaggtatgaacgtcatctttgctc 309  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||  |  ||||| ||||| ||||||||  | ||||| |  || | |||||| || ||||| || || |||||||||    
T  7699 cctgagaaactccctattcggcttcaatcgagtgttaaacccgtagtggctcctgaaagcggtggctagttcatcaaaagtatggacatcgtctttgctc 7600  T
Q  310 aagctggtgtaccattctgcagcgtcttccattaaactatcttggaagcagtgaatcatgagcgaatcattgtctgagtagttacccatctttcggacat 409  Q
    |  || || ||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||| | || ||||| || |||||||||||   |||||| |||||||| |||||||    
T  7599 agactagtataccactctgcagcatcctccatcagactgtcttggaagtaatggatcataagggaatcattgtccttgtagttgcccatcttccggacat 7500  T
Q  410 acttgataatgtggttctggggacaagtcagcccattgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagag 509  Q
    | |||| ||| || || || |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  7499 atttgacaatatgattttgaggacaagtcagcccgttatacttgtcgaactccgggactttgaacttttttggaacatctaccttcgatactaagcagag 7400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 444 - 593
Target Start/End: Original strand, 1 - 150
Alignment:
Q  444 attgtatcggtcgaaatccgggactttgaacttcttagggacatccacctttggtactaagcagaggtcatgagtcttgacaggatcactattccatcgg 543  Q
    ||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |  |||| ||||    
T  1 attgtatcggtcgaactctggaaccttgaacttcttggggatgtccacctttggtaccaagcagagatcatgagtcttaacagggtccccgttccctcgg 100  T
Q  544 ttagctttgatttcgcgacggagttctttagcaagttcctccattctttc 593  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  101 taagctttgatttcacgacggagttctttagcaagttcctccatcctttc 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 161
Target Start/End: Original strand, 26791 - 26942
Alignment:
Q  10 agacgagtccccatggtgaccatctcagagaagttatttggagcagcaatgatcattctttcgacataatcctttttcagagtcttcaggaatgtctgag 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||  ||||| | ||||||||| |    
T  26791 agacgggttcccatggtgaccatctccgaaaagttgttcggggcagcgatgatcatcctctcaacataatctttcttcaacgtctttaagaatgtctggg 26890  T
Q  110 tcatctcctcttcgtcaagatcgggagtgatgcgggcagctgcccccctcca 161  Q
    |||| || || || || | | | |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  26891 tcatttcttcctcatctaaagcaggagtgatacgggcagccgcccctctcca 26942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University