View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8890_low_34 (Length: 431)

Name: NF8890_low_34
Description: NF8890
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8890_low_34
NF8890_low_34
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (1-421)||(28853879-28854299)
chr8 (1-421)||(22059161-22059581)
chr8 (1-421)||(22145158-22145577)
chr8 (1-421)||(17614848-17615266)
chr8 (1-421)||(24707579-24707998)
chr8 (1-390)||(10829226-10829613)
chr8 (92-421)||(17795325-17795658)
chr8 (92-421)||(363880-364214)
chr8 (92-421)||(44431953-44432287)
chr8 (92-158)||(44523052-44523118)
chr8 (311-421)||(7301157-7301267)
chr8 (311-421)||(45135003-45135113)
chr8 (282-421)||(6608320-6608460)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-421)||(45307218-45307639)
chr1 (1-421)||(36181504-36181924)
chr1 (1-421)||(20631245-20631665)
chr1 (1-421)||(14432125-14432544)
chr1 (1-421)||(22900024-22900442)
chr1 (1-421)||(24087348-24087764)
chr1 (1-421)||(37358401-37358817)
chr1 (92-421)||(296448-296781)
chr1 (92-421)||(294127-294462)
chr1 (333-421)||(2333075-2333163)
chr1 (311-421)||(20579376-20579486)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (1-421)||(4993414-4993835)
chr7 (1-421)||(13395235-13395655)
chr7 (1-421)||(48785242-48785662)
chr7 (1-372)||(123963-124329)
chr7 (1-421)||(35366155-35366573)
chr7 (1-421)||(13733307-13733723)
chr7 (1-265)||(21064934-21065200)
chr7 (333-421)||(38828160-38828248)
chr7 (379-421)||(124322-124364)
chr7 (327-421)||(21065254-21065349)
chr7 (311-421)||(8776276-8776386)
chr7 (311-421)||(16006331-16006441)
chr7 (76-158)||(14036392-14036474)
chr7 (76-158)||(14346422-14346504)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (1-421)||(28382753-28383173)
chr4 (1-421)||(287019-287439)
chr4 (12-421)||(47126607-47127016)
chr4 (1-372)||(31116824-31117190)
chr4 (1-372)||(55502519-55502885)
chr4 (1-421)||(10313644-10314063)
chr4 (1-421)||(15279857-15280273)
chr4 (1-421)||(16359433-16359852)
chr4 (92-421)||(33848835-33849168)
chr4 (92-421)||(56115462-56115796)
chr4 (92-308)||(43251189-43251410)
chr4 (282-421)||(16278157-16278298)
chr4 (311-421)||(41791585-41791695)
chr4 (379-421)||(31117183-31117225)
chr4 (379-421)||(55502878-55502920)
[»] chr3 (18 HSPs)
chr3 (1-421)||(14038106-14038526)
chr3 (1-421)||(2034754-2035174)
chr3 (1-421)||(2038261-2038681)
chr3 (1-421)||(2042002-2042422)
chr3 (1-421)||(14041574-14041994)
chr3 (1-421)||(39230654-39231073)
chr3 (1-421)||(18958825-18959243)
chr3 (10-421)||(54046644-54047052)
chr3 (1-421)||(15009929-15010346)
chr3 (2-421)||(603413-603836)
chr3 (92-421)||(10989429-10989762)
chr3 (1-164)||(16800000-16800163)
chr3 (311-421)||(54973299-54973409)
chr3 (311-421)||(54975909-54976019)
chr3 (311-421)||(54978519-54978629)
chr3 (282-421)||(10554349-10554489)
chr3 (282-421)||(55292471-55292611)
chr3 (1-89)||(606139-606226)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (1-421)||(16102272-16102692)
chr6 (1-421)||(12595886-12596306)
chr6 (1-421)||(16812707-16813125)
chr6 (1-421)||(16829727-16830145)
chr6 (1-418)||(29492687-29493102)
chr6 (1-164)||(15539464-15539627)
chr6 (1-137)||(2287679-2287814)
chr6 (1-99)||(17105985-17106082)
chr6 (311-421)||(8522845-8522955)
chr6 (1-99)||(23539221-23539318)
[»] scaffold0525 (2 HSPs)
scaffold0525 (1-421)||(10645-11065)
scaffold0525 (311-421)||(9084-9194)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (1-421)||(44620857-44621276)
chr2 (1-418)||(41684533-41684950)
chr2 (1-372)||(31755900-31756266)
chr2 (1-421)||(12627663-12628080)
chr2 (92-421)||(23339026-23339359)
chr2 (92-421)||(28348999-28349334)
chr2 (333-421)||(31503513-31503601)
chr2 (333-421)||(31506079-31506167)
chr2 (311-420)||(21239203-21239312)
chr2 (311-420)||(21241753-21241862)
chr2 (311-421)||(24504616-24504726)
chr2 (381-421)||(20591253-20591292)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (1-421)||(23693387-23693806)
chr5 (1-372)||(22880190-22880556)
chr5 (1-421)||(16255706-16256124)
chr5 (1-421)||(22589503-22589921)
chr5 (1-421)||(22593058-22593476)
chr5 (1-421)||(22596613-22597031)
chr5 (1-421)||(16259339-16259757)
chr5 (1-372)||(43121139-43121511)
chr5 (1-372)||(43124672-43125044)
chr5 (1-421)||(4397638-4398056)
chr5 (1-421)||(26360856-26361272)
chr5 (92-421)||(22758517-22758851)
chr5 (311-421)||(29325318-29325428)
chr5 (311-420)||(26495800-26495909)
chr5 (10-99)||(15796674-15796762)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-372)||(33129-33495)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (1-372)||(81317-81683)
scaffold0049 (379-421)||(81676-81718)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (1-421)||(133742-134158)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (2-421)||(8265-8688)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (92-421)||(162376-162710)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (92-421)||(2431-2765)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (92-421)||(137867-138201)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (333-421)||(1629-1716)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (92-308)||(22775-22995)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 28854299 - 28853879
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  28854299 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcaagctagtgcttgacagactgctttgtttaggatttcatgtgactctgtcgcacgagagattgtgagt 28854200  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  28854199 tgaactttgagatagcaatggaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgtgataagatcgtataa 28854100  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28854099 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtatactgttgtgttgctgttgattgatta 28854000  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  28853999 tgattgttaatgatcgctggtttatacttaattgcattcagttagaatgtacaatgtgttggttcaagttgtaagtggcgggttgtcgtttctaagtaac 28853900  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28853899 ggagtcataggttgttgatgt 28853879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 22059161 - 22059581
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22059161 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagt 22059260  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22059261 tgaactttgagatagcaataaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggttagggcaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 22059360  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||     
T  22059361 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatc 22059460  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  22059461 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagattgtacaatgtgttagttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 22059559  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22059560 cggagtcataggttgttgatgt 22059581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 22145158 - 22145577
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  22145158 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcctgacagactgcgttgtt-aggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagt 22145256  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22145257 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggatagggtaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 22145356  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22145357 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatt 22145456  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  22145457 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 22145555  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22145556 cggagtcataggttgttgatgt 22145577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17615266 - 17614848
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| | |||| ||||  |||||| ||||||  ||||||||     
T  17615266 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgctttacagactgccgtgtttaag-tttcttgtggttttgtcacacgagtagttgtgagt 17615168  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17615167 tgaactttgggataacaatgaaagacgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggtcatggcaaattgaggttattaatgtgataaaattgtataa 17615068  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  17615067 gtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcattgaattgtataagatattgttatatcatgctgtcgtatactgttgtgttgccgttgattgatta 17614968  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |    
T  17614967 tgatggttaatgatcgctgatttatacttaactgcattcaattagaatgaacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagctgtc-attctaagtaac 17614869  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  17614868 ggagtcataggtggttgatgt 17614848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 24707579 - 24707998
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||| ||||  |||||||||||||  ||||||||     
T  24707579 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgatagactgccatgtttagg-tttcttgtggttttgtcgcacgagtagttgtgagt 24707677  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24707678 tgaactttgggataacaatgaaagatgtataggatataaatgatgatctgagaagcttgttatgacaaattgaggttattaatatgataaaattgtataa 24707777  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattg-att 299  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24707778 gtattacttggattatgtgaaaatgttagacatcgttgaattgcataagatactgttatatcacgctgttgtatactgttgtgttgctgttgattgaatt 24707877  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||  || ||||||     
T  24707878 atgattgttgatgaatgctggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaatgtgttggttcgggttgtaagttgtgagttgtc-attataagtaa 24707976  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24707977 cggagtcataggttgttgatgt 24707998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 390
Target Start/End: Original strand, 10829226 - 10829613
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||| |||||     
T  10829226 ctcgctgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgccttgtttagg-tttcttgtgactt-gtcgcacgagtggtcgtgagt 10829323  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||   |||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  10829324 tgaactttgggatagcgatgaaagatgtatatgatataaatgataatatgtgaaactggttatgaggaattgaggttattagtataataaaattgtataa 10829423  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||| ||||| | | ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10829424 gtattacttagatcatgtgcaaatgctagacatcgttgaattgcataagatattgttatatcacgttgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatta 10829523  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtt 390  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| | ||| | ||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10829524 tgattgttgatgattgctggtttatgcataactacaaacaattagaatatacaaggtgttggttcgagttgtaagttgcgagttgtcgtt 10829613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17795658 - 17795325
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttatt---aatgttat 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||||||||| || ||   |||||||||||||   ||| | ||    
T  17795658 gttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtgtgaagctgattgtgatgaattgaggttatttttaatatgat 17795559  T
Q  189 aaaattgtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgac-gtgtactgtt-gtgttg 286  Q
    | ||||| ||| | | ||||||| |||||||  |||| |||| |  |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| | || ||||||| ||||||    
T  17795558 ataattgcatacgcattacttggattatgtgggaatgttagatagtgttgaattgca-aagatattgttatatcacgctgtctgtatactgtttgtgttg 17795460  T
Q  287 ttgttgattgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgt 386  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17795459 ctgttgattgattatgattgttaatgatcgctggtttctacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgt 17795360  T
Q  387 cgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17795359 cgtttctaagtaacggagtcataggttgttgatgt 17795325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 364214 - 363880
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttatt---aatgttat 188  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||   |||||||||||||   ||| | ||    
T  364214 gttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctgattgtgatgaattgaggttatttttaatatgat 364115  T
Q  189 aaaattgtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgac-gtgtactgtt-gtgttg 286  Q
    | ||||| ||| | | ||||||| |||||||  |||| |||| |  |||| |||| | ||||||||||||||||| | || | || ||||||| ||||||    
T  364114 ataattgcatacgcattacttggattatgtgggaatgttagatagtgttgaattgca-aagatattgttatatcacgttgtctgtatactgtttgtgttg 364016  T
Q  287 ttgttgattgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt--aagtgacgagtt 384  Q
     |||||||||| ||||||||||  |||| | | ||||||  |||| ||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||  | ||||    
T  364015 ctgttgattgagtatgattgttgctgattgctagtttatgtttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttgcaagtt 363916  T
Q  385 gtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  363915 gtcg-ttctaagtaacggagtcataggttgttgatgt 363880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 44432287 - 44431953
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttatt---aatgttat 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||   |||||||||||||   ||| | ||    
T  44432287 gttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctgattgtgatgaattgaggttatttttaatatgat 44432188  T
Q  189 aaaattgtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgac-gtgtactg-ttgtgttg 286  Q
    | ||||| ||| | | ||||||| |||||||  |||| |||| |  |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| | || || || ||||||||    
T  44432187 ataattgcatacgcattacttggattatgtgggaatgttagatagtgttgaattgca-aagatattgttatatcacgctgtctgtatattgtttgtgttg 44432089  T
Q  287 ttgttgattgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt--aagtgacgagtt 384  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||  |||| | ||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||  | ||||    
T  44432088 ttgttgattgagtatgattgttgctgattgatggtttatgtttaactacattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttgcaagtt 44431989  T
Q  385 gtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  44431988 gtcg-ttctaaataacggagtcatatgttgttgatgt 44431953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 158
Target Start/End: Original strand, 44523052 - 44523118
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctg 158  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||  ||||||||||    
T  44523052 gttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgacgtgtgaagctg 44523118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Original strand, 7301157 - 7301267
Alignment:
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||  |||| ||||  |||||||| |  | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7301157 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattagattatacaagatgttagttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 7301255  T
Q  410 ggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||    
T  7301256 ggttgttgatgt 7301267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Original strand, 45135003 - 45135113
Alignment:
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||||||||  | | |||||  ||||||||| ||| ||||| |  | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45135003 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattgaattatacaagatgttggttcaagtggtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 45135101  T
Q  410 ggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||    
T  45135102 ggttgttgatgt 45135113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 421
Target Start/End: Original strand, 6608320 - 6608460
Alignment:
Q  282 tgttgttgttgattgattatgatt-gttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgac 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||| |||||| ||| | ||  ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |  |    
T  6608320 tgttgttgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 6608419  T
Q  380 gagttgtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6608420 aagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcatagattgttgatgt 6608460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 45307639 - 45307218
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggattt-catgtgactttgtcgcacgagaggttgtgag 99  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  45307639 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagattgctttgtttaggattttcatgtggctttgtcgcatgagaggttgtgag 45307540  T
Q  100 ctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtata 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45307539 ctgaactttgagatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgtgataaaattgtata 45307440  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  45307439 agtaatacttggtttatgtgataatgctagacatcgttggattgtataaaatattatcatatcatgctgacgtatactgttgtgttgctgttgattgatt 45307340  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  45307339 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcgtttccaagtaa 45307240  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45307239 cggagtcataggttgttgatgt 45307218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 36181924 - 36181504
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  36181924 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagt 36181825  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  36181824 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggatagggtaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 36181725  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  36181724 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatactgttgtgttgttgttgattgatt 36181625  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  36181624 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 36181526  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36181525 cggagtcataggttgttgatgt 36181504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20631665 - 20631245
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20631665 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagt 20631566  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20631565 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggatagggtaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 20631466  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20631465 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatt 20631366  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  20631365 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 20631267  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20631266 cggagtcataggttgttgatgt 20631245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 14432125 - 14432544
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  14432125 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcgttgtt-aggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagt 14432223  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  14432224 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggatagggtaaattgaggttattaacgtgataaaaattgtata 14432323  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14432324 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgccgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatt 14432423  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  14432424 gtgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgttcaatgtgttagttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 14432522  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14432523 cggagtcataggttgttgatgt 14432544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 22900024 - 22900442
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| ||||  |||||| ||||||  ||||||||     
T  22900024 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgctttacagactgccgtgtttagg-tttcttgtggttttgtcacacgagtagttgtgagt 22900122  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22900123 tgaactttgggataacaatgaaagacgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggtcatggcaaattgaggttattaatgtgataaaattgtataa 22900222  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  22900223 gtaatacttagattatgtgaaaatgctagacatcattgaattgtataagatattgttatatcatgctgtcgtatactgttgtgttgccgttgattgatta 22900322  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |    
T  22900323 tgattgttaatgatcgctgatttatacttaactgcattcaattagaatgaacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagctgtcg-ttccaagtaac 22900421  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  22900422 ggagtcataggtggttgatgt 22900442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24087764 - 24087348
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| |||||||||     
T  24087764 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgccttgtttagg-tttcttgtggctt-gtcgcacgagtggttgtgagt 24087667  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  24087666 tgaactttgggatagcgatgaaagatgtataggatataaatgatgatctgtgaagctggttatgaggaattgaggtgattaatataataaaattgtataa 24087567  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||| ||||| | | ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  || || |||||||||| |||||||| ||||    
T  24087566 gtattacttagatcatgtgcaaatgctagacatcgttgaattgcataagatattgttatatcacgctgttgtatattgttgtgttgctgttgattaatta 24087467  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||| ||  | | |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |    
T  24087466 tgattgttgatttttgctggtttatgcttaactacattcaattagaatatacaaggtgttgg-tcgagttgtaagttgcgagttgtcg-ttctaagtaac 24087369  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24087368 ggagtcataggttgttgatgt 24087348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 37358817 - 37358401
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||| |||| ||||  |||  |||||||||||||  |||||| |     
T  37358817 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgtcgtgtgtagg-tttctcgtggttttgtcgcacgagtagttgtgggt 37358719  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  37358718 tgaactttgggataacaatgaaagatgtataggatataaatgatgatatgagaagctggttatgacgaattgaggttattaatatgataaacttgtataa 37358619  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||| |||||| ||  || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||  || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37358618 gtattacttgattg-tgagaaaatgttagacatcgttgaattgcataagatactgttatatcacgatgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatta 37358520  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| || |||||| |    
T  37358519 tgattgttgatgaatgctggtttatacttaactgcattcagttagaatatacaatgtgttggttcg-gttgtaagttgtgagttgtcg-ttataagtaac 37358422  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37358421 ggagtcataggttgttgatgt 37358401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 296781 - 296448
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttatt---aatgttat 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||||||||| || ||   |||||||||||||   ||| | ||    
T  296781 gttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtgtgaagctgattgtgatgaattgaggttatttttaatatgat 296682  T
Q  189 aaaattgtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgac-gtgtactgtt-gtgttg 286  Q
    | ||||| ||| | | ||||||| |||||||  |||| |||| |  |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| | || ||||||| ||||||    
T  296681 ataattgcatacgcattacttggattatgtgggaatgttagatagtgttgaattgca-aagatattgttatatcacgctgtctgtatactgtttgtgttg 296583  T
Q  287 ttgttgattgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgt 386  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  296582 ttgtttattgattataattgttaatgatcgttggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgt 296483  T
Q  387 cgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  296482 cgtttctaagtaacggagtcataggttgttgatgt 296448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 294462 - 294127
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggtta---ttaatgttat 188  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||   |||||||||||   ||||| | ||    
T  294462 gttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaatgatgatctgtgatgctgattatgatgaattgaggttatttttaatatgat 294363  T
Q  189 aaaattgtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctg-acgtgtactg-ttgtgttg 286  Q
    | ||||||||| | | ||||||| |||| || ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||   || ||||| ||||||||    
T  294362 ataattgtatacgaattacttggattatatggaaatgttagacattgttgaattgcataagatattgttatatctcgctgtttgtatactgtttgtgttg 294263  T
Q  287 ttgttgattgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt--aagtgacgagtt 384  Q
     |||| ||||| ||||||||||  |||| | | |||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||  |||||||||||  ||||  | ||||    
T  294262 ctgttaattgaatatgattgttgctgattgctagtttatgcttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaagttcgagttgtagaagttgcaagtt 294163  T
Q  385 gtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  294162 gtcg-ttctaagtaacggagtcataggttgttgatgt 294127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 421
Target Start/End: Original strand, 2333075 - 2333163
Alignment:
Q  333 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaa-gtgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2333075 tgcattcaattagaatatacaaggtgtgagttcgagttgtaaagttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggttgttgatgt 2333163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20579486 - 20579376
Alignment:
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaa-gtgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||| ||||||| ||  | |||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20579486 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcgggttgtaaggttgcaagttgtcg-ttctaagtaacggagccata 20579388  T
Q  410 ggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||    
T  20579387 ggttgttgatgt 20579376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 4993835 - 4993414
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggattt-catgtgactttgtcgcacgagaggttgtgag 99  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4993835 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagattgctttgtttaggattttcatgtggctttgtcgcatgagaggttgtgag 4993736  T
Q  100 ctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtata 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4993735 ctgaactttgagatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgtgataaaattgtata 4993636  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4993635 agtaatacttggtttatgtgataatgctagacatcgttggattgtataaaatattatcatatcaagctgacgtatactgttatgttgctgttgattgatt 4993536  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  4993535 atgattgttaatgatcgatggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcgtttctaagtaa 4993436  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4993435 cggagtcataggttgttgatgt 4993414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 13395235 - 13395655
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  13395235 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagt 13395334  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13395335 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggatagggtaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 13395434  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13395435 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatt 13395534  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  13395535 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 13395633  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13395634 cggagtcataggttgttgatgt 13395655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 48785662 - 48785242
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  48785662 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagt 48785563  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  48785562 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggatagggtaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 48785463  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  48785462 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatt 48785363  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  48785362 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 48785264  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48785263 cggagtcataggttgttgatgt 48785242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 123963 - 124329
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123963 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcttggtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 124062  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  124063 tgaactttgggatagcaatgagagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggccaattgaggttattaatgtgataaaattgtacaa 124162  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||    
T  124163 gtaatacttggtttatgttataatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtatac-----tgttgttgttgattgatta 124257  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124258 tgattgttaatgatcgctggtttatatttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 124329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 35366573 - 35366155
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  35366573 ctcgccgtggcgagt-gaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgccttgtgtaggatt-catgtggctttgtcgcacgagtggttgtgagt 35366476  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttatt-aatgttataaaattgtata 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||||||| || ||| | |||||||||||||    
T  35366475 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatattaatgatgatctgtgaagttggttatgatgaattgaggttgtttaatatgataaaattgtata 35366376  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
     ||| ||||||| |||  || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  || || |||||||||| |||||||||| |    
T  35366375 cgtattacttggattacatggaaatgttagacatcgttgaattgcataagatattgttatatcacgctgttgtatattgttgtgttgctgttgattgaat 35366276  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||     
T  35366275 atgattgttgatgattgctggtttatgcttaattgcattcaattagaatatacaaggtgttggttcgagttgtaagttttgagttgtcg-ttctaagtaa 35366177  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35366176 cggagtcataggttgttgatgt 35366155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 13733307 - 13733723
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||  |||  |||||||||||||  |||||| |     
T  13733307 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgccttgcgagctagtgcttgacagactgccgtgtgtagg-tttctcgtggttttgtcgcacgagtagttgtgggt 13733405  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  13733406 tgaactttgggataacaatgaaagatgtataggatataaatgatgatatgagaagctggttatgacgaattgaggttattaacatgataaacttgtataa 13733505  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||  || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13733506 gtattacttgatt-atgagaaaatgttagacatcgttgaattgcataagatactgttatatcacgttgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatta 13733604  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| || |||||| |    
T  13733605 tgattgttgatgaatgctggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaatgtgttggttcg-gttgtaagttgtgagttgtcg-ttataagtaac 13733702  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13733703 ggagtcataggttgttgatgt 13733723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 21064934 - 21065200
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |||| || |  ||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||     
T  21064934 ctcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgtgagttagtactagaaagactgccttgtgtaggatt-catgtggctttgtcgc-cgagtggttgtgagt 21065031  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggata-taaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttatt-----aatgttataaaatt 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| |||||   |||||||||||||      ||||||||||  |    
T  21065032 tgaactttgggataacaatgaaagttgtataggatattaattgataatctgtgaagctgattatgatgaattgaggttatttttaatatgttataaa--t 21065129  T
Q  195 gtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatg 265  Q
    ||||| | | ||||||| |||| || ||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21065130 gtatacgcattacttggattatatggaaatgttagacattgttgaattgcataagatattgttatatcatg 21065200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 38828248 - 38828160
Alignment:
Q  333 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt-aagtgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38828248 tgcattcaattagaatatacaaggtgtgggttcgagttgtaaagttgcaagttgtcg-ttctaagtaacggagtcataggttgttgatgt 38828160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 421
Target Start/End: Original strand, 124322 - 124364
Alignment:
Q  379 cgagttgtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  124322 cgagttgtcgtttctaagtaacagagtcataggttgttgatgt 124364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 421
Target Start/End: Original strand, 21065254 - 21065349
Alignment:
Q  327 cttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaa--gtgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  |||| |||| |||||| |||||||  ||  | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21065254 cttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgcgttgtaaaagttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggttgttgatgt 21065349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8776386 - 8776276
Alignment:
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||||||||  | | |||||  ||||||||| ||| ||||| |  | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8776386 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattgaattatacaagatgttggttcaagtggtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 8776288  T
Q  410 ggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||    
T  8776287 ggttgttgatgt 8776276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16006441 - 16006331
Alignment:
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |  | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16006441 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 16006343  T
Q  410 ggttgttgatgt 421  Q
     |||||||||||    
T  16006342 agttgttgatgt 16006331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14036474 - 14036392
Alignment:
Q  76 ctttgtcgcacgagaggttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctg 158  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||||| ||| |||| | | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14036474 ctttgtcgcacgagatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctg 14036392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14346504 - 14346422
Alignment:
Q  76 ctttgtcgcacgagaggttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctg 158  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||||| ||| |||| | | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14346504 ctttgtcgcacgagatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctg 14346422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 28383173 - 28382753
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28383173 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgtgagctagtgcttgacagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagt 28383074  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28383073 tgaactttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggttagggcaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 28382974  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||| ||||||||||||    
T  28382973 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatattgttgtgttgctgttgattgatt 28382874  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  28382873 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 28382775  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28382774 cggagtcataggttgttgatgt 28382753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 287439 - 287019
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  287439 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagt 287340  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  287339 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggatagggtaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 287240  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  287239 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatt 287140  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  287139 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 287041  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  287040 cggagtcataggttgttgatgt 287019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 12 - 421
Target Start/End: Original strand, 47126607 - 47127016
Alignment:
Q  12 gagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagctgaactttggg 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |    
T  47126607 gagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagttgaaccttgag 47126706  T
Q  112 atagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtataagtaatacttg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  47126707 atagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaatctggatagggtaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtataagtaatacttg 47126806  T
Q  211 gtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgattatgattgttaa 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47126807 gattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatactgttgtgttgctgttgattgattatgattgttaa 47126906  T
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcatag 410  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  47126907 tgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaacggagtcatag 47127005  T
Q  411 gttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||    
T  47127006 gttgttgatgt 47127016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 31116824 - 31117190
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31116824 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcttggtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 31116923  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31116924 tgaactttgggatagcaatgagagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgtgataaaattgtacaa 31117023  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||    
T  31117024 gtaatacttggtttatgttataatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtatac-----tgttgttgttgattgatta 31117118  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117119 tgattgttaatgatcgctggtttatatttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 31117190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 55502519 - 55502885
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55502519 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcttggtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 55502618  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  55502619 tgaactttgggatagcaatgagagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggccaattgaggttattaatgtgataaaattgtacaa 55502718  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||    
T  55502719 gtaatacttggtttatgttataatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtatac-----tgttgttgttgattgatta 55502813  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55502814 tgattgttaatgatcgctggtttatatttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 55502885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 10314063 - 10313644
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  10314063 ctcgctgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgctttgtttaggatctcatgtgactttgtcgcacgagtggttttgagt 10313964  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  10313963 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgatctgtgaagctggttatggaaaattgaggttattaatatgataaaattgtataa 10313864  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10313863 gtattacttggattatgtgaaaatgctagacatcgatgaattgtataagatattgttacatcatactgtcgtatactgttgtgttgctgttgattgatta 10313764  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||||| | |    
T  10313763 tgtttgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttctaattgtaagtggtgagttgtcg-ttctaagcaac 10313665  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  10313664 gaagtcataggttgttgatgt 10313644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 15279857 - 15280273
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||  |||  |||||||||||||  |||||| |     
T  15279857 ctcgtcgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgccgtgtgtagg-tttctcgtggttttgtcgcacgagtagttgtgggt 15279955  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  15279956 tgaactttgggataacaatgaaagatgtataggatataaatgatgatatgagaagctggttatgacgaattgaggttattaatatgataaacttgtataa 15280055  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||| |||||| ||  || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||  || ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15280056 gtattacttgattg-tgagaaaatgttagacatcgttgaattgcataagatactgttatatcacgctgttgtatactgctgtgttgctgttgattgatta 15280154  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| || ||||||      
T  15280155 tgattgttgatgaatgctggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaatgtgttggttcg-gttgtaagttgtgagttgtcg-ttataagtaat 15280252  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15280253 ggagtcataggttgttgatgt 15280273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16359852 - 16359433
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||  |||  |||||||||||||  |||||| |     
T  16359852 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgccgtgtgtagg-tttctcgtggttttgtcgcacgagtagttgtgggt 16359754  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||| |    
T  16359753 tgaactttgggataacaatgaaagatgtataggatataaatgatgatatgagaagctggctatgacgaattgaggttattaatatgataaacttgtatga 16359654  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||| ||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  |||  || |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  16359653 gtattacttggattgtgagaaaatgttagacatcgttgaattgcataagatactgttatatcacactgttgtatactattgtgttgctgttaattgatta 16359554  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaa--tgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagta 398  Q
    ||||| || ||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||   ||||||||| || ||||||    
T  16359553 tgattattgatgaatgatggcttatacttaactgcattcaattagaatataccaggtgtgttggttcg-gttgtaagttgtgagttgtcg-ttataagta 16359456  T
Q  399 tcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  16359455 acggagtcataggttgttgatgt 16359433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 33849168 - 33848835
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttatt---aatgttat 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||  | |||||||| || ||   |||||||||||||   ||| | ||    
T  33849168 gttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtttgaagctgattgtgatgaattgaggttatttttaatatgat 33849069  T
Q  189 aaaattgtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgac-gtgtactgtt-gtgttg 286  Q
    | ||||| ||| | | ||||||| |||||||  |||  |||| |  |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| | || ||||||| ||||||    
T  33849068 ataattgcatacgcattacttggattatgtgggaattttagatagtgttgaattgca-aagatattgttatatcacgctgtctgtatactgtttgtgttg 33848970  T
Q  287 ttgttgattgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgt 386  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33848969 ctgtttattgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgt 33848870  T
Q  387 cgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33848869 cgtttctaagtaacggagtcataggttgttgatgt 33848835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Original strand, 56115462 - 56115796
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttatt---aatgttat 188  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||  |   |||||||||||||   ||| | ||    
T  56115462 gttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctgattgcgatgaattgaggttatttttaatatgat 56115561  T
Q  189 aaaattgtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgac-gtgtactgtt-gtgttg 286  Q
    | ||||| ||| | | ||||||| |||||||  |||| |||| |  |||| |||| | ||||||||||||||||| | || | || ||||||| ||||||    
T  56115562 ataattgcatacgcattacttggattatgtgggaatgttagatagtgttgaattgca-aagatattgttatatcacgttgtctgtatactgtttgtgttg 56115660  T
Q  287 ttgttgattgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt--aagtgacgagtt 384  Q
     |||||||||| ||||||||||  |||| | | ||||||  |||| ||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||  | ||||    
T  56115661 ctgttgattgagtatgattgttgctgattgctagtttatgtttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttgcaagtt 56115760  T
Q  385 gtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  56115761 gtcg-ttctaagtaacggagtcataggttgttgatgt 56115796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 308
Target Start/End: Original strand, 43251189 - 43251410
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggtta---ttaatgttat 188  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||   ||||| | ||    
T  43251189 gttgtgagttgaactttgggataacaatgaaagttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctgattatgatgaattgaggttatttttaatatgat 43251288  T
Q  189 aaaattgtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctg-acgtgtactg-ttgtgttg 286  Q
    | ||||||||| | | || |||| |||| || ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| | ||||   || ||| | ||||||||    
T  43251289 ataattgtatacgcattatttggattatatggaaatgttagacattgttgaattgcataagatattggtatataacgctgtttgtataccgtttgtgttg 43251388  T
Q  287 ttgttgattgattatgattgtt 308  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  43251389 ctgttgattgaatatgattgtt 43251410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 421
Target Start/End: Original strand, 16278157 - 16278298
Alignment:
Q  282 tgttgttgttgattgattatgatt-gttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgac 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |  |||| |||||| ||| | ||  ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |  |    
T  16278157 tgttgttgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 16278256  T
Q  380 gagttgtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16278257 aagttgtcgtttctaagtaatggagtcataggttgttgatgt 16278298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 41791695 - 41791585
Alignment:
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |  | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41791695 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 41791597  T
Q  410 ggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||    
T  41791596 ggttgttgatgt 41791585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 421
Target Start/End: Original strand, 31117183 - 31117225
Alignment:
Q  379 cgagttgtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31117183 cgagttgtcgtttctaagtaacagagtcataggttgttgatgt 31117225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 421
Target Start/End: Original strand, 55502878 - 55502920
Alignment:
Q  379 cgagttgtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  55502878 cgagttgtcgtttctaagtaacagagtcataggttgttgatgt 55502920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 14038526 - 14038106
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  14038526 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagt 14038427  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14038426 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggatagggcaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 14038327  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14038326 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatt 14038227  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  14038226 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 14038128  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14038127 cggagtcataggttgttgatgt 14038106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 2034754 - 2035174
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  2034754 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagt 2034853  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2034854 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggatagggtaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 2034953  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2034954 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatt 2035053  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  2035054 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 2035152  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2035153 cggagtcataggttgttgatgt 2035174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 2038261 - 2038681
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  2038261 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagt 2038360  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2038361 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggatagggtaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 2038460  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2038461 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatt 2038560  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  2038561 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 2038659  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2038660 cggagtcataggttgttgatgt 2038681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 2042002 - 2042422
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  2042002 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagt 2042101  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2042102 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggatagggtaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 2042201  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2042202 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatt 2042301  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  2042302 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 2042400  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2042401 cggagtcataggttgttgatgt 2042422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 14041994 - 14041574
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  14041994 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagt 14041895  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14041894 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggatagggtaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 14041795  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14041794 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatt 14041695  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  14041694 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 14041596  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14041595 cggagtcataggttgttgatgt 14041574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 39231073 - 39230654
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  39231073 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactacgttgtt-aggaattcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagt 39230975  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39230974 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggatagggtaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 39230875  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  39230874 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatactgttgtgttgttgttgattgatt 39230775  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  39230774 atgattgttaatgaccgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 39230676  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39230675 cggagtcataggttgttgatgt 39230654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 18959243 - 18958825
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18959243 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgtcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagt 18959144  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18959143 tgaactt-gagatagcaatgaaagacgtataggatataaacgatgaactgtgaatctagtcatggcaaattgaggttattaatgtgataaaattgtataa 18959045  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18959044 gtaatacctggattatgtgaaaatgctagacatcgttgaattgtataagatattgttatatcatgctgatgtatactgttgtgttgctgttgattgatta 18958945  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  18958944 tgattgttgatgatcgctggattatacttaattgcattcaattagaatgtacaatatgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaac 18958846  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  18958845 gtagttataggttgttgatgt 18958825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 10 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 54047052 - 54046644
Alignment:
Q  10 gcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagctgaactttg 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  54047052 gcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgccttgtttagg-tttcttgtggctt-gtcgcacgagtggttgtgagttgaactttg 54046955  T
Q  110 ggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataagtaatactt 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||    
T  54046954 ggatagcgatgaaagatgtataggatataaatgatgatatgtgaagctggttatgaggaattgaggttatttatataataaaattgtataagtattactt 54046855  T
Q  210 ggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgattatgattgtta 309  Q
     | | ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  54046854 agatcatgtgcaaatgctagacatcgttgaattgcataagatattgttatatcactctgttgtatacttttgtgttgttgttgattgattatgattgttg 54046755  T
Q  310 atgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  54046754 atgattgttggtttatgcttaactgcattcaattagaatatacaaggtgttggttcgagttgtaagttgcgagttgtcg-ttctaagtaacggagtcata 54046656  T
Q  410 ggttgttgatgt 421  Q
    | ||||||||||    
T  54046655 gtttgttgatgt 54046644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 15009929 - 15010346
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| |||||||||     
T  15009929 ctcgccgtggcgagtagaggctcacgcctcgcgagctagtgcttgacagactgccttgtttagg-tttcttgtggctt-gtcgcacgagtggttgtgagt 15010026  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15010027 tgaactttgggatagcgatgaaagatgtataggatataaaagatgatctatgaagctggttttgaggaattgaggttattaatataataaaattgtataa 15010126  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||| ||||| | | ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15010127 gtattacttagatcatgtgcaaatgctagacatcattgaattgcataagatattgttatatcacgctgttgtatactgttgtgttgttgttgattgatta 15010226  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| |    
T  15010227 tgattgttgatgattgatggtttatgcttaactgcattcaattagaatatacaaggtgttggttcgagttgtaagttgagagttgtcg-ttctaagtaac 15010325  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15010326 ggagtcataggttgttgatgt 15010346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 421
Target Start/End: Original strand, 603413 - 603836
Alignment:
Q  2 tcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagct 101  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |    
T  603413 tcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgacctaatgcttgacagactgccttgtttagg-tttcttgtggctt-gtcgcacgagtggttgtgagtt 603510  T
Q  102 gaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataag 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  603511 gaactttgggatagcgatgaaagatgtataggatataaatgatgatatgtgaagctggttatgaggaattgaggttattaatataataaaattgtataag 603610  T
Q  202 taatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctg-------acgtgtactgttgtgttgttgttgat 294  Q
    || ||||| | | ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||         || ||||||||||||| |||||||    
T  603611 tattacttagatcatgtgcaaatgctagacatcgttgaattgcataagatattgttatatcacgatgttgtatattgtatactgttgtgttgctgttgat 603710  T
Q  295 tgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttcta 394  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  603711 tgattatgattgttgatgattgcaggtttatgcttaactgcattcaattagaatatataaggtgttggttcgagttgtaagttgcgagttgtcg-ttcta 603809  T
Q  395 agtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  603810 agtaacggagtcataggttgttgatgt 603836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Original strand, 10989429 - 10989762
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttatt---aatgttat 188  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||   |||||||||||||   ||| | ||    
T  10989429 gttgtgagttgaactttgggatatcaatgaaagttatataggatattaaggatgatctgtgaagctgattgtgatgaattgaggttatttttaatatgat 10989528  T
Q  189 aaaattgtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgac-gtgtactgtt-gtgttg 286  Q
    | ||||| ||| | | ||||||| |||||||  |||| |||| |  |||| |||| |  |||||||||||||||| |||| | || ||||||| ||||||    
T  10989529 ataattgcatacgcattacttggattatgtgggaatgttagatagtgttgaattgca--agatattgttatatcacgctgtctgtatactgtttgtgttg 10989626  T
Q  287 ttgttgattgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt--aagtgacgagtt 384  Q
     |||||||||| ||||||||||  |||| |||| |||||  |||| ||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||  | ||||    
T  10989627 ctgttgattgagtatgattgttgctgattgttgatttatgtttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttgcaagtt 10989726  T
Q  385 gtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10989727 gtcg-ttctaagtaaaggagtcataggttgttgatgt 10989762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16800163 - 16800000
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| || |||||| || | |||||||||     
T  16800163 ctcgccgtggcaagtagaggctctcgcctcgcgagttagtgcttggcagactggcttgtttagg-tttcttgtggctatgtcgcccgggtggttgtgagt 16800065  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggata-taaatgatgaactgtgaagctggttatg 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  16800064 tgaaccttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaattgatgatctgtgaagctgattatg 16800000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 54973409 - 54973299
Alignment:
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |  | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  54973409 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 54973311  T
Q  410 ggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||    
T  54973310 ggttgttgatgt 54973299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 54976019 - 54975909
Alignment:
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |  | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  54976019 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 54975921  T
Q  410 ggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||    
T  54975920 ggttgttgatgt 54975909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 54978629 - 54978519
Alignment:
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |  | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  54978629 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 54978531  T
Q  410 ggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||    
T  54978530 ggttgttgatgt 54978519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 10554489 - 10554349
Alignment:
Q  282 tgttgttgttgattgattatgatt-gttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgac 379  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | |  |||| ||||||||||   ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |  |    
T  10554489 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatggataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 10554390  T
Q  380 gagttgtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10554389 aagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggttgttgatgt 10554349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 421
Target Start/End: Original strand, 55292471 - 55292611
Alignment:
Q  282 tgttgttgttgattgattatgatt-gttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgac 379  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | |  |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |  |    
T  55292471 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 55292570  T
Q  380 gagttgtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
     |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55292571 aagttgtcgttcc-aagtaacggagtcataggttgttgatgt 55292611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 606139 - 606226
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgag 89  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||  || |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  606139 ctcgccatggcgagtagaggtcctcgcctcgcgagctagtgttagacagaacgccttgtttagga-taaatgtgaccttgtcgcacgag 606226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16102692 - 16102272
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16102692 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagt 16102593  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16102592 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggatagggtaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 16102493  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16102492 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatt 16102393  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  16102392 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 16102294  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16102293 cggagtcataggttgttgatgt 16102272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 12596306 - 12595886
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  12596306 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactacgttgtttaggatttcatgtgattttgtcgcacgagaggttgtgagt 12596207  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaatt-gtata 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| | |||||    
T  12596206 tgaactttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggttagggcaaattgaggttattaatgcgataaaaatcgtata 12596107  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12596106 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgttgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatt 12596007  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||     
T  12596006 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggtccgagctgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 12595908  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12595907 cggagtcataggttgttgatgt 12595886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16813125 - 16812707
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||||||     
T  16813125 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgccgtgtttagg-tttcttgtggttttgtcgcacgagtggttgtgagt 16813027  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16813026 tgaactttgggataacaatgaaagatgtataggatataaatgatgatctgagaagctggttatgacaaattgaggttattaatatgataaaattgtataa 16812927  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16812926 gtattacttggattatgtgaaaatgttagacatcgttgaattgcataagatactgttatatcacgctgttgtatactgttgtgttgttgttgattgatta 16812827  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||| || |||||| |    
T  16812826 tgattgttgatgaatgttggtttatacttaactgtattcaattagaatatacaaggtgttggttcgggttgtaagttgtgagttgtcg-ttataagtaac 16812728  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16812727 ggagtcataggttgttgatgt 16812707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16830145 - 16829727
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||||||     
T  16830145 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgccgtgtttagg-tttcttgtggttttgtcgcacgagtggttgtgagt 16830047  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16830046 tgaactttgggataacaatgaaagatgtataggatataaatgatgatctgagaagctggttatgacaaattgaggttattaatatgataaaattgtataa 16829947  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16829946 gtattacttggattatgtgaaaatgttagacatcgttgaattgcataagatactgttatatcacgctgttgtatactgttgtgttgatgttgattgatta 16829847  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    |||||||| || |||||| |    
T  16829846 tgattgttgatgaatgctggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaaggtgttggttcgggttgtaagttgttagttgtcg-ttataagtaac 16829748  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  16829747 agagtcataggttgttgatgt 16829727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 29493102 - 29492687
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| ||||  |||||| ||||||  ||||||||     
T  29493102 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgctttacagactgccgtgtttagg-tttcttgtggttttgtcacacgagtagttgtgagt 29493004  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29493003 tgaactctgggataacaatgaaagacgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggtcatggcaaattgaggttattaatgtgataaaattgtataa 29492904  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||     
T  29492903 gtattacttggattatgtgaaaatgttagacatcgttgaattgcataagctactgttatatcacgctgttgtatactgttgtgttgttgttgattgattg 29492804  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||| ||||  | |||  |||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||   ||| ||||| || |||||| |    
T  29492803 tgattgttgatgaatgctggcctatacttaaccgcattcaattagaatatacaaggtgtgggttcgggttgtaagttgtgagatgtcg-ttataagtaac 29492705  T
Q  401 ggagtcataggttgttga 418  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  29492704 ggagtcataagttgttga 29492687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15539627 - 15539464
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||| ||||| ||  || | |||||||||     
T  15539627 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttagtgcttgacagactgccttgtttagg-tatcttgtggctttgacgtccgggtggttgtgagt 15539529  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggata-taaatgatgaactgtgaagctggttatg 164  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  15539528 tgaaccttgggatagcaatgaaggttgtataggatattaattgatgatctgtgaagctgattatg 15539464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 2287679 - 2287814
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| || |||||| |  | |||||||||     
T  2287679 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttagtgcttggtagactgccttgtttagg-tttcttgtggctatgtcgcccaggtggttgtgagt 2287777  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatat 137  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2287778 tgaaccttgggatatcaatgaaagttgtataggatat 2287814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17106082 - 17105985
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgag 99  Q
    |||||| | |||||||||||  |||| |||||||||||||| | | |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  17106082 ctcgccatggcgagtagaggccctcgactcgcgagctagtgttagacagactgccttgtttagg-gttcatgtgattttgtcgcacgagttgttgtgag 17105985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8522955 - 8522845
Alignment:
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |  | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8522955 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 8522857  T
Q  410 ggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||    
T  8522856 ggttgttgatgt 8522845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23539318 - 23539221
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgag 99  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | | || ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  23539318 ctcgccatggcgagtagaggtgttcgcctcgcaagctagtgttagacaaactgccttgtttagg-gttcatgtgattttgtcgcacgagttgttgtgag 23539221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 10645 - 11065
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  10645 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagt 10744  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10745 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggatagggtaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 10844  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| |||||||  ||||||||||||    
T  10845 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgttgttgtatactattgtgttactgttgattgatt 10944  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  10945 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 11043  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11044 cggagtcataggttgttgatgt 11065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 9194 - 9084
Alignment:
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |  | |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  9194 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaactgagtcata 9096  T
Q  410 ggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||    
T  9095 ggttgttgatgt 9084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 44621276 - 44620857
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44621276 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcgttgtt-aggaattcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagt 44621178  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44621177 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaatgatgaactgtgaagctggatagggtaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 44621078  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  44621077 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatt 44620978  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  44620977 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 44620879  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44620878 cggagtcataggttgttgatgt 44620857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Original strand, 41684533 - 41684950
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  41684533 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggctgtgagt 41684632  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaa-ttgtata 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41684633 tgaaccttgagatagcaatgaaagatgtataggatttaaacgatgaactgtgaagctggatagggtaaattgaggttattaatgtgataaaaattgtata 41684732  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||| ||||||||||||    
T  41684733 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgttgtatattgttgtgttgctgttgattgatt 41684832  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||     
T  41684833 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaactacattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaggtaa 41684931  T
Q  400 cggagtcataggttgttga 418  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41684932 cggagtcataggttgttga 41684950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31756266 - 31755900
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31756266 ctcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcttggtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 31756167  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31756166 tgaactttgggatagcaatgagagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggccaattgaggttattaatgtgataaaattgtacaa 31756067  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||    
T  31756066 gtaatacttggtttatgttataatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtatac-----tgttgttgttgattgatta 31755972  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31755971 tgattgttaatgatcgctggtttatatttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 31755900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 12627663 - 12628080
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| ||| |||||||||| |||||||||     
T  12627663 ctcgccgtggcgagtagaggctcttgccccccgagctagtgcttgacagactgccttgtttagg-tttcttgtggctt-gtcgcacgagtggttgtgagt 12627760  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  12627761 tgaactttgggatagcgatgaaagatgtatatgatataaatgatgatctgtgaaactggttatgaggaattgaggttattagtataataaaattgtataa 12627860  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||| ||||| | | ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  12627861 gtattacttagatcatgtgcaaatgctagacatcgttgaattgcataagatattgttatatcacgctgttgtatactgttgtgttgttgttgattgatta 12627960  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |    
T  12627961 tgattgttgatgattgctggtttatgcttaactgcattcaattagaacatacaaggtgttggttcgagttgtaagttgcgagttgtcg-ttctaagtaac 12628059  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12628060 ggagtcataggttgttgatgt 12628080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Original strand, 23339026 - 23339359
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttatt---aatgttat 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||||||||| || ||   |||||||||||||   ||| | ||    
T  23339026 gttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatgtgtgaagctgattgtgatgaattgaggttatttttaatatgat 23339125  T
Q  189 aaaattgtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgac-gtgtactgtt-gtgttg 286  Q
    | ||||| ||| | | ||||||| |||||||  |||  |||| |  |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| | || ||||||| ||||||    
T  23339126 ataattgcatacgcattacttggattatgtgggaattttagatagtgttgaattgca-aagatattgttatatcacgctgtctgtatactgtttgtgttg 23339224  T
Q  287 ttgttgattgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgt 386  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23339225 ctgtttattgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgt 23339324  T
Q  387 cgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23339325 cgtttctaagtaacggagtcataggttgttgatgt 23339359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 28349334 - 28348999
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttat---taatgttat 188  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||   |||| | ||    
T  28349334 gttgtgatttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaatgatgatctgtgaagctgattatgatgaattgaggttatttctaatatgat 28349235  T
Q  189 aaaattgtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctg-acgtgtactg-ttgtgttg 286  Q
    | ||||||||| | | ||||||| |||| || ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||   || ||||| ||||||||    
T  28349234 ataattgtatacgcattacttggattatatggaaatgttagacattgttgaattgcataagatattgttatatcacgctgtttgtatactgtttgtgttg 28349135  T
Q  287 ttgttgattgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt--aagtgacgagtt 384  Q
     |||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||  | ||||    
T  28349134 ctgttgattgaatatgattgttgctgattgctggtttatgcttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtagaagttgcaagtt 28349035  T
Q  385 gtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28349034 gtcg-ttctaagtaacggagtcataggttgttgatgt 28348999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 333 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 31503601 - 31503513
Alignment:
Q  333 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaa-gtgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31503601 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaaggttgcaagttgtcg-ttctaagtaacggagtcatagattgttgatgt 31503513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 333 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 31506167 - 31506079
Alignment:
Q  333 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaa-gtgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31506167 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaaggttgcaagttgtcg-ttctaagtaacggagtcatagattgttgatgt 31506079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 420
Target Start/End: Original strand, 21239203 - 21239312
Alignment:
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |  | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21239203 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 21239301  T
Q  410 ggttgttgatg 420  Q
    |||||||||||    
T  21239302 ggttgttgatg 21239312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 420
Target Start/End: Original strand, 21241753 - 21241862
Alignment:
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |  | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21241753 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 21241851  T
Q  410 ggttgttgatg 420  Q
    |||||||||||    
T  21241852 ggttgttgatg 21241862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24504726 - 24504616
Alignment:
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |  | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24504726 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 24504628  T
Q  410 ggttgttgatgt 421  Q
    | ||||||||||    
T  24504627 gattgttgatgt 24504616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 421
Target Start/End: Original strand, 20591253 - 20591292
Alignment:
Q  381 agttgtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20591253 agttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggttgttgatgt 20591292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23693806 - 23693387
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  23693806 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgc-ttgtttaggatttcatgtgactttgacgcacgagaggttgtgagt 23693708  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaa-ttgaggttattaatgttataaaattgtata 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23693707 tgaactttgagatagcaatgaaagatgtataagatataaatgaagaactgtgaagctggttatgacaaaattgaggtgattaatgtgataaaattgtata 23693608  T
Q  200 agtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatt 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23693607 agtaatacttggattatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgatgtcgtatactgttgtgttgctgttgattgatt 23693508  T
Q  300 atgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtat 399  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  23693507 atgattgttaatgatcgctggtttatacttaacggcattccattagaatgtgcaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaa 23693409  T
Q  400 cggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  23693408 caaagtcataggttgttgatgt 23693387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22880556 - 22880190
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22880556 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcttggtttaggatttcatgtgactttgtcacacgagaggttgtgagc 22880457  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  22880456 tgaactttgggatagcaatgagagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggccaattgagggtattaatgtgataaaattgtacaa 22880357  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||    
T  22880356 gtaatacttggtttatgttataatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtatac-----tgttgttgttgattgatta 22880262  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880261 tgattgttaatgatcgctggtttatatttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 22880190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 16255706 - 16256124
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| ||||  |||||| ||||||  ||||||||     
T  16255706 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgctttacagactgccgtgtttagg-tttcttgtggttttgtcacacgagtagttgtgagt 16255804  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16255805 tgaactttgggataacaatgaaagacgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggtcatggcaaattgaggttattaatgtgataaaattgtataa 16255904  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  16255905 gtaatacttagattatgtgaaaatgctagacatcattgaattgtataagatattgttatatcatgctgtcgtatactgttgtgttgccgttgattgatta 16256004  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |    
T  16256005 tgattgttaatgatcgctgatttatacttaactgcattcaattagaatgaacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagctgtcg-ttccaagtaac 16256103  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  16256104 ggagtcataggtggttgatgt 16256124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 22589503 - 22589921
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| ||||  |||||| ||||||  ||||||||     
T  22589503 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgctttacagactgccgtgtttagg-tttcttgtggttttgtcacacgagtagttgtgagt 22589601  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22589602 tgaactttgggataacaatgaaagacgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggtcatggcaaattgaggttattaatgtgataaaattgtataa 22589701  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  22589702 gtaatacttagattatgtgaaaatgctagacatcattgaattgtataagatattgttatatcatgctgtcgtatactgttgtgttgccgttgattgatta 22589801  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |    
T  22589802 tgattgttaatgatcgctgatttatacttaactgcattcaattagaatgaacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagctgtcg-ttccaagtaac 22589900  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  22589901 ggagtcataggtggttgatgt 22589921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 22593058 - 22593476
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| ||||  |||||| ||||||  ||||||||     
T  22593058 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgctttacagactgccgtgtttagg-tttcttgtggttttgtcacacgagtagttgtgagt 22593156  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22593157 tgaactttgggataacaatgaaagacgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggtcatggcaaattgaggttattaatgtgataaaattgtataa 22593256  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  22593257 gtaatacttagattatgtgaaaatgctagacatcattgaattgtataagatattgttatatcatgctgtcgtatactgttgtgttgccgttgattgatta 22593356  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |    
T  22593357 tgattgttaatgatcgctgatttatacttaactgcattcaattagaatgaacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagctgtcg-ttccaagtaac 22593455  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  22593456 ggagtcataggtggttgatgt 22593476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 22596613 - 22597031
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| ||||  |||||| ||||||  ||||||||     
T  22596613 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgctttacagactgccgtgtttagg-tttcttgtggttttgtcacacgagtagttgtgagt 22596711  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22596712 tgaactttgggataacaatgaaagacgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggtcatggcaaattgaggttattaatgtgataaaattgtataa 22596811  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  22596812 gtaatacttagattatgtgaaaatgctagacatcattgaattgtataagatattgttatatcatgctgtcgtatactgttgtgttgccgttgattgatta 22596911  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |    
T  22596912 tgattgttaatgatcgctgatttatacttaactgcattcaattagaatgaacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagctgtcg-ttccaagtaac 22597010  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  22597011 ggagtcataggtggttgatgt 22597031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 16259339 - 16259757
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| ||||  |||||| ||||||  ||||||||     
T  16259339 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgctttacagactgccgtgtttagg-tttcttgtggttttgtcacacgagtagttgtgagt 16259437  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16259438 tgaactttgggataacaatgaaagacgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggtcatggcaaattgaggttattaatgtgataaaattgtataa 16259537  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  16259538 gtaatacttagattatgtgaaaatgctagacatcattgaattgtataagatattgttatatcatgctgtcgtatactgttgtgttgccgttgattgatta 16259637  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| |    
T  16259638 tgattgttaatgatcgctgatttatacttaactgcattcaattagaatgaacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagctgttg-ttccaagtaac 16259736  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  16259737 ggagtcataggtggttgatgt 16259757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43121511 - 43121139
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43121511 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcttggtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 43121412  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  43121411 tgaactttgggatagcaatgagagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgtgataaaattgtacaa 43121312  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgac-gtgtactg-ttgtgttgttgttgattgat 298  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||| |  |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| | || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  43121311 gtaatacttggtttatgttataatgttagatagtgttgaattgca-aagatattgttatatcacgctgtctgtatactgtttgtgttgctgttgattgat 43121213  T
Q  299 tatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43121212 tatgattgttaatgatcgctggtttatatttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 43121139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43125044 - 43124672
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43125044 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcttggtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 43124945  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  43124944 tgaactttgggatagcaatgagagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgtgataaaattgtacaa 43124845  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgac-gtgtactg-ttgtgttgttgttgattgat 298  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||| |  |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| | || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  43124844 gtaatacttggtttatgttataatgttagatagtgttgaattgca-aagatattgttatatcacgctgtctgtatactgtttgtgttgctgttgattgat 43124746  T
Q  299 tatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124745 tatgattgttaatgatcgctggtttatatttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 43124672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 4398056 - 4397638
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| ||||  |||||||||||||  ||||||||     
T  4398056 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgccgtgtttagg-tttcttgtggttttgtcgcacgagtagttgtgagt 4397958  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  4397957 tgaactttaggataacaatgaaagatgtataggatataaataatgatctgagaagctagttatgacgaattgaggttattaatatgatcaaattgtataa 4397858  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||  || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4397857 gtattacttggattatgtgaaaatgttagacatcgttgaattgcataagatactgttatatcacgttgttgtatactgttgtgttgctgttgattgatta 4397758  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||| || |||| | |    
T  4397757 tgattgttgatgaatgctggtttatacttaactgcattcaattcgaatatacaaggtgttggttcgggttgtaagttgtgagttgtcg-ttataagaaac 4397659  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4397658 ggagtcataggttgttgatgt 4397638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 26360856 - 26361272
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||  |||  |||||||||||||  |||||| |     
T  26360856 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgccgtgtgtagg-tttctcgtggttttgtcgcacgagtagttgtgggt 26360954  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  26360955 tgaactttgggataacaatgaaagatgtataggatataaatgatgatatgagaagctggttatgacgaattgaggttattaatatgataaacttgtataa 26361054  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    ||| |||||| ||  || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||  || |||||||| |||| |||||||||||||    
T  26361055 gtattacttgattg-tgagaaaatgttagacatcgttgaattgcataagatactgttatatcacgctgttgtatactgttgcgttgctgttgattgatta 26361153  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| || |||| | |    
T  26361154 tgattgttgatgaatgctggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaatgtgttggttcg-gttgtaagttgtgagttgtcg-ttataagaaac 26361251  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26361252 ggagtcataggttgttgatgt 26361272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Original strand, 22758517 - 22758851
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttatt---aatgttat 188  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||  |||||||||| || ||   |||||||||||||   ||| | ||    
T  22758517 gttgtgagttgaactttgggataacaatgaaagttgtataagatattaaggatgatatgtgaagctgattgtgatgaattgaggttatttttaatatgat 22758616  T
Q  189 aaaattgtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgac-gtgtactgtt-gtgttg 286  Q
    | ||||| ||| | | ||||||| |||||||  |||| |||| |  |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| | || ||||||| ||||||    
T  22758617 ataattgcatacgcattacttggattatgtgggaatgttagatagtgttgaattgca-aagatattgttatatcacgctgtccgtatactgtttgtgttg 22758715  T
Q  287 ttgttgattgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt--aagtgacgagtt 384  Q
     | |||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||  |||| ||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||  | ||||    
T  22758716 ctattgattgagtatgattgttgctgattgctggtttatgtttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttgcaagtt 22758815  T
Q  385 gtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  22758816 gtcg-ttctaagtaatggagtcaaaggttgttgatgt 22758851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Original strand, 29325318 - 29325428
Alignment:
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |  | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29325318 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 29325416  T
Q  410 ggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||    
T  29325417 ggttgttgatgt 29325428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 26495909 - 26495800
Alignment:
Q  311 tgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcata 409  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |  | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26495909 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 26495811  T
Q  410 ggttgttgatg 420  Q
    |||||||||||    
T  26495810 ggttgttgatg 26495800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15796762 - 15796674
Alignment:
Q  10 gcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgag 99  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||  || | | || ||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  15796762 gcgagtagaggccctcgcctcgcgagctcctgttagacaaactaccttgtttaggattt-atgtgattttgtcgcacgagttgttgtgag 15796674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33495 - 33129
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33495 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcttggtttaggatttcatgtgaccttgtcgcacgagaggttgtgagc 33396  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  33395 tgaactttgggatagcaatgagagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggccaattgaggttattaatgtgataaaattgtacaa 33296  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||    
T  33295 gtaatacttggtttatgttataatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtatac-----tgttgttgttgattgatta 33201  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33200 tgattgttaatgatcgctggtttatatttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 33129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 81317 - 81683
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  81317 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgcttggtttaggatttcatgtgaccttgtcgcacgagaggttgtgagc 81416  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  81417 tgaactttgggatagcaatgagagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggccaattgaggttattaatgtgataaaattgtacaa 81516  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||    
T  81517 gtaatacttggtttatgttataatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtatac-----tgttgttgttgattgatta 81611  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81612 tgattgttaatgatcgctggtttatatttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 81683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 421
Target Start/End: Original strand, 81676 - 81718
Alignment:
Q  379 cgagttgtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  81676 cgagttgtcgtttctaagtaacagagtcataggttgttgatgt 81718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 133742 - 134158
Alignment:
Q  1 ctcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagc 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||  |||  |||||||||||||  |||||| |     
T  133742 ctcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctagtgcttgacagactgccgtgtgtagg-tttctcgtggttttgtcgcacgagtagttgtgggt 133840  T
Q  101 tgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttattaatgttataaaattgtataa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  133841 tgaactttgggataacaatgaaagatgtataggatataaatgatgatatgagaagctggttatgacgaattgaggttattaatatgataaacttgtataa 133940  T
Q  201 gtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgacgtgtactgttgtgttgttgttgattgatta 300  Q
    |||  ||||| ||  || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||  || |||  |||||| | |||||||||||||    
T  133941 gtatcacttgattg-tgagaaaatgttagacatcgttgaattgcataagatactgttatatcacgctgttgtataccattgtgtggatgttgattgatta 134039  T
Q  301 tgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatc 400  Q
    |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| || |||| | |    
T  134040 tgattgttgatgaatgctggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaatgtgttggttcg-gttgtaagttgtgagttgtcg-ttataagaaac 134137  T
Q  401 ggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  134138 ggagtcataggttgttgatgt 134158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 421
Target Start/End: Original strand, 8265 - 8688
Alignment:
Q  2 tcgccgttgcgagtagaggttctcgcctcgcgagctagtgcttggcagactgcgttgtttaggatttcatgtgactttgtcgcacgagaggttgtgagct 101  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||| |    
T  8265 tcgccgtggcgagtagaggctctcacctcgcgagctagtgctagacagactgccttgtgtaggatt-catgtggctttgtcgcccgagtggttgtgagtt 8363  T
Q  102 gaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggtta---ttaatgttataaaattgtat 198  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||||   |||| ||||||   ||||| | ||| ||||| ||    
T  8364 aaactttgggatagcaatgaaagttgtatagagtattaatgatgatctgtgaagctgattatgatgaattaaggttatttttaatatgatataattgcat 8463  T
Q  199 aagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctg-acgtgtactg-ttgtgttgttgttgattg 296  Q
    | | | ||||||| |||||||  |||| |||| |  |||| |||| | ||||||||||||||||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||||    
T  8464 acgcattacttggattatgtgggaatgttagatagtgttgaattgca-aagatattgttatatcacgctgtttgtatactgtttgtgttgttgttgattg 8562  T
Q  297 attatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt--aagtgacgagttgtcgtttcta 394  Q
    | ||||||||||  |||| | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||  | |||||||| |||||    
T  8563 aatatgattgttgctgattgctggtttatgcttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttgcaagttgtcg-ttcta 8661  T
Q  395 agtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8662 agtaacggagtcataggttgttgatgt 8688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 162710 - 162376
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttatt---aatgttat 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| || || || | |||||||||||||   ||| | ||    
T  162710 gttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagttgattgtgacgaattgaggttatttttaatatgat 162611  T
Q  189 aaaattgtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgac-gtgtactgtt-gtgttg 286  Q
    | ||||| ||| | | ||||||| |||||||  |||| |||| |  |||| |||| | ||||||||||||||||| ||||   || ||||||| | ||||    
T  162610 ataattgcatacgcattacttggattatgtgggaatggtagatagtgttgaattgca-aagatattgttatatcacgctgtttgtatactgtttgcgttg 162512  T
Q  287 ttgttgattgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt--aagtgacgagtt 384  Q
     |||||||||||||||||||||  |||| | | ||||||  |||| ||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||  | ||||    
T  162511 ctgttgattgattatgattgttgctgattgctagtttatgtttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttgcaagtt 162412  T
Q  385 gtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  162411 gtcg-ttctaagtaacggagtcataggttgttgatgt 162376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 2765 - 2431
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttatt---aatgttat 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||| |||||||| || || ||   |||||||||||||   ||| | ||    
T  2765 gttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttttataggatattaaggatgatctgtgaagatgattgtgatgaattgaggttatttttaatatgat 2666  T
Q  189 aaaattgtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgac-gtgtactgtt-gtgttg 286  Q
    | ||||| ||| | | ||||||| ||||||   |||| |||| |  | || |||| | ||||||||||||||||| |||| | || ||||||| | ||||    
T  2665 ataattgcatacgcattacttggattatgtcggaatgttagatagtgctgaattgca-aagatattgttatatcacgctgtctgtatactgtttgcgttg 2567  T
Q  287 ttgttgattgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt--aagtgacgagtt 384  Q
     |||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||  |||| | ||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||  | ||||    
T  2566 ctgttgattgagtatgattgttgctgattgctggtttatgtttaactacattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttgcaagtt 2467  T
Q  385 gtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2466 gtcg-ttctaagtaacggagtcataggttgttgatgt 2431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 138201 - 137867
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggtta---ttaatgttat 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||||||||| || ||   |||||| ||||   ||||| | ||    
T  138201 gttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatttgtgaagctgattgtgatgaattgatgttatttttaatatgat 138102  T
Q  189 aaaattgtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgac-gtgtactg-ttgtgttg 286  Q
    | ||||| ||| | | ||||||| |||||||  |||  |||| |  |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||    
T  138101 ataattgcatacgcattacttggattatgtgggaattttagatagtgttgaattgca-aagatattgttatatcacgctgtctgtatactgtttgtgttg 138003  T
Q  287 ttgttgattgattatgattgttaatgatcgttggtttatacttaattgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt--aagtgacgagtt 384  Q
     |||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||  |||| | ||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||  || |  | ||||    
T  138002 ctgttgattgagtatgattgttgctgattgctggtttatgtttaacttcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaatttgcaagtt 137903  T
Q  385 gtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  137902 gtcg-ttctaagtaatggagtcataggttgttgatgt 137867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 333 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 1716 - 1629
Alignment:
Q  333 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtgacgagttgtcgtttctaagtatcggagtcataggttgttgatgt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||||||    
T  1716 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaagtggcgagttgtcg-ttctaagtaacggagtcttaggtgggtgatgt 1629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22995 - 22775
Alignment:
Q  92 gttgtgagctgaactttgggatagcaatgaaagatgtataggatataaatgatgaactgtgaagctggttatggcaaattgaggttatt---aatgttat 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||   |||||||||||||   ||| | ||    
T  22995 gttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctgattgtgatgaattgaggttatttttaatatgat 22896  T
Q  189 aaaattgtataagtaatacttggtttatgtgaaaatgctagacatcgttggattgtataagatattgttatatcatgctgac-gtgtactg-ttgtgttg 286  Q
    | ||||| ||| | | ||||||| |||||||  |||| |||| |  |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||    
T  22895 ataattgcatacgcattacttggattatgtgggaatgttagatagtgttgaattgca-aagatattgttatatcacgctgtctgtatactgtttgtgttg 22797  T
Q  287 ttgttgattgattatgattgtt 308  Q
     |||||||||| ||||||||||    
T  22796 ctgttgattgagtatgattgtt 22775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University