View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8890_low_37 (Length: 401)

Name: NF8890_low_37
Description: NF8890
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8890_low_37
NF8890_low_37
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (49-386)||(90-427)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (49-386)||(27629561-27629898)
chr6 (62-386)||(4757775-4758099)
chr6 (54-386)||(4545636-4545968)
chr6 (62-386)||(4773017-4773341)
chr6 (54-386)||(28207457-28207789)
chr6 (62-387)||(27359852-27360177)
chr6 (62-387)||(27450195-27450520)
chr6 (62-386)||(4525297-4525621)
chr6 (62-386)||(26116271-26116595)
chr6 (53-386)||(29573015-29573348)
chr6 (53-294)||(30557969-30558210)
chr6 (54-386)||(4723995-4724327)
chr6 (62-294)||(3696092-3696324)
chr6 (53-328)||(16749856-16750131)
chr6 (62-328)||(27007738-27008004)
chr6 (113-294)||(16943980-16944161)
chr6 (113-386)||(17025339-17025612)
chr6 (53-386)||(24863719-24864052)
chr6 (113-369)||(29549537-29549793)
chr6 (53-294)||(15424270-15424511)
chr6 (113-294)||(26777568-26777749)
chr6 (113-294)||(29501477-29501658)
chr6 (62-294)||(16674150-16674382)
chr6 (62-294)||(34463299-34463531)
chr6 (62-321)||(27485140-27485399)
chr6 (53-386)||(24304479-24304812)
chr6 (53-294)||(26918382-26918623)
chr6 (53-386)||(26989003-26989336)
chr6 (53-294)||(27000075-27000316)
chr6 (53-386)||(13298812-13299145)
chr6 (53-386)||(22934741-22935074)
chr6 (53-386)||(23857186-23857519)
chr6 (62-294)||(27044398-27044631)
chr6 (54-255)||(20160704-20160905)
chr6 (54-255)||(22171926-22172127)
chr6 (59-357)||(27272470-27272768)
chr6 (137-386)||(22456795-22457044)
chr6 (137-386)||(27290231-27290480)
chr6 (137-369)||(14143163-14143395)
chr6 (266-386)||(17092301-17092421)
chr6 (137-369)||(26788030-26788262)
chr6 (137-369)||(27196403-27196635)
chr6 (137-369)||(27252605-27252837)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (53-386)||(4416885-4417218)
chr3 (52-328)||(22870873-22871149)
chr3 (52-328)||(22885932-22886208)
chr3 (59-374)||(5713199-5713514)
chr3 (59-374)||(5724109-5724424)
chr3 (59-374)||(5757053-5757368)
chr3 (59-374)||(5767944-5768259)
chr3 (53-386)||(7073178-7073511)
chr3 (53-369)||(7996528-7996844)
chr3 (53-369)||(10643036-10643352)
chr3 (62-321)||(6542486-6542745)
chr3 (113-294)||(8211764-8211945)
chr3 (53-386)||(28339268-28339601)
chr3 (53-386)||(29148714-29149047)
chr3 (53-294)||(47023419-47023660)
chr3 (113-386)||(51782049-51782322)
chr3 (62-386)||(11110308-11110632)
chr3 (62-294)||(20576898-20577130)
chr3 (52-386)||(4346646-4346980)
chr3 (116-386)||(21674722-21674992)
chr3 (53-386)||(17984915-17985248)
chr3 (53-294)||(31964524-31964765)
chr3 (113-294)||(36997128-36997309)
chr3 (53-294)||(50134122-50134363)
chr3 (53-321)||(5609346-5609614)
chr3 (62-294)||(29665021-29665253)
chr3 (53-328)||(28115971-28116246)
chr3 (113-386)||(51797138-51797412)
chr3 (113-386)||(5013738-5014011)
chr3 (113-294)||(5596408-5596589)
chr3 (53-386)||(8301226-8301559)
chr3 (113-294)||(18225217-18225398)
chr3 (53-294)||(18277103-18277344)
chr3 (53-294)||(18292404-18292645)
chr3 (53-294)||(18307705-18307946)
chr3 (113-386)||(24328185-24328458)
chr3 (52-328)||(22387595-22387871)
chr3 (62-294)||(48465902-48466134)
chr3 (53-294)||(4796704-4796945)
chr3 (113-294)||(5467011-5467192)
chr3 (62-294)||(18242714-18242946)
chr3 (52-294)||(28021240-28021482)
chr3 (52-354)||(32439119-32439421)
chr3 (62-354)||(20066018-20066310)
chr3 (53-328)||(18330635-18330910)
chr3 (53-294)||(10396099-10396340)
chr3 (53-386)||(15741053-15741386)
chr3 (53-357)||(18051228-18051532)
chr3 (53-386)||(6192282-6192615)
chr3 (53-386)||(8295938-8296271)
chr3 (53-386)||(15892665-15892998)
chr3 (53-294)||(35880732-35880973)
chr3 (53-328)||(4721597-4721872)
chr3 (52-249)||(4893175-4893372)
chr3 (137-374)||(16626477-16626714)
chr3 (137-369)||(31034093-31034325)
chr3 (137-369)||(32292802-32293034)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (62-386)||(31564194-31564518)
chr7 (53-386)||(4144927-4145260)
chr7 (53-386)||(9618657-9618990)
chr7 (53-294)||(16736356-16736597)
chr7 (53-294)||(16751410-16751651)
chr7 (53-294)||(17523538-17523779)
chr7 (53-294)||(17529436-17529677)
chr7 (53-294)||(5147236-5147477)
chr7 (53-294)||(26319765-26320006)
chr7 (53-386)||(26669718-26670051)
chr7 (53-369)||(45387349-45387665)
chr7 (53-294)||(26274990-26275231)
chr7 (113-294)||(3445372-3445553)
chr7 (62-294)||(26537766-26537998)
chr7 (53-386)||(10916672-10917005)
chr7 (113-294)||(24592437-24592618)
chr7 (113-294)||(26435323-26435504)
chr7 (53-294)||(5127998-5128239)
chr7 (113-294)||(11441638-11441819)
chr7 (62-386)||(31124935-31125259)
chr7 (53-328)||(11424638-11424913)
chr7 (53-357)||(16503213-16503517)
chr7 (61-386)||(2154587-2154912)
chr7 (52-321)||(5159524-5159793)
chr7 (53-357)||(16518249-16518553)
chr7 (137-354)||(18540889-18541106)
chr7 (137-374)||(16449814-16450051)
chr7 (137-369)||(2108826-2109058)
chr7 (137-369)||(26484784-26485016)
chr7 (137-369)||(39210844-39211076)
chr7 (137-384)||(16041413-16041660)
chr7 (137-369)||(2775449-2775681)
chr7 (272-369)||(4200772-4200869)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (54-386)||(31431455-31431787)
chr5 (62-386)||(37671298-37671622)
chr5 (62-386)||(37755003-37755327)
chr5 (62-321)||(37770867-37771126)
chr5 (53-386)||(9317465-9317798)
chr5 (53-386)||(12132169-12132502)
chr5 (53-386)||(15758672-15759005)
chr5 (53-321)||(2511065-2511333)
chr5 (62-386)||(13324644-13324968)
chr5 (53-328)||(15658633-15658908)
chr5 (53-294)||(8665382-8665623)
chr5 (53-386)||(9548358-9548691)
chr5 (53-386)||(26480406-26480739)
chr5 (53-294)||(33516370-33516611)
chr5 (113-386)||(37358458-37358731)
chr5 (113-386)||(43078326-43078599)
chr5 (62-294)||(28649258-28649490)
chr5 (62-386)||(40473364-40473688)
chr5 (53-291)||(5637924-5638162)
chr5 (52-294)||(34616531-34616773)
chr5 (53-294)||(6874319-6874560)
chr5 (53-294)||(18375319-18375560)
chr5 (53-386)||(22998929-22999262)
chr5 (53-294)||(30152032-30152273)
chr5 (53-294)||(30168483-30168724)
chr5 (62-294)||(18500637-18500869)
chr5 (62-294)||(24681463-24681695)
chr5 (62-294)||(24723990-24724222)
chr5 (113-294)||(29966973-29967154)
chr5 (113-294)||(30029489-30029670)
chr5 (113-294)||(31826314-31826495)
chr5 (52-359)||(28959628-28959935)
chr5 (53-294)||(41674723-41674964)
chr5 (62-294)||(3789564-3789796)
chr5 (53-357)||(11549368-11549672)
chr5 (53-351)||(24970032-24970330)
chr5 (52-294)||(32599379-32599621)
chr5 (53-294)||(23717895-23718136)
chr5 (52-321)||(33292538-33292807)
chr5 (137-384)||(25199127-25199374)
chr5 (53-328)||(30934647-30934922)
chr5 (53-294)||(33777501-33777742)
chr5 (53-294)||(23752357-23752598)
chr5 (53-386)||(24687972-24688305)
chr5 (137-369)||(22888568-22888800)
chr5 (137-386)||(29888897-29889146)
chr5 (137-386)||(23892304-23892553)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (53-328)||(11635151-11635426)
chr2 (53-328)||(11641340-11641615)
chr2 (53-368)||(32049799-32050114)
chr2 (53-328)||(34286355-34286630)
chr2 (53-328)||(34291415-34291690)
chr2 (53-386)||(34861681-34862014)
chr2 (52-386)||(39890074-39890408)
chr2 (53-294)||(16829337-16829578)
chr2 (53-294)||(16891903-16892144)
chr2 (53-294)||(21677181-21677422)
chr2 (62-369)||(9349906-9350213)
chr2 (53-294)||(34279450-34279691)
chr2 (53-294)||(37685908-37686149)
chr2 (53-294)||(37701173-37701414)
chr2 (62-294)||(12716601-12716833)
chr2 (53-369)||(22925952-22926268)
chr2 (62-294)||(27777232-27777464)
chr2 (62-294)||(27816990-27817222)
chr2 (53-294)||(31876282-31876523)
chr2 (62-294)||(27803717-27803949)
chr2 (62-294)||(39051821-39052053)
chr2 (59-294)||(13936543-13936778)
chr2 (53-386)||(23128473-23128806)
chr2 (56-386)||(19416406-19416736)
chr2 (53-386)||(12655543-12655876)
chr2 (53-386)||(28882215-28882548)
chr2 (53-294)||(37925494-37925735)
chr2 (62-294)||(260752-260984)
chr2 (62-294)||(12586820-12587052)
chr2 (62-294)||(37375171-37375403)
chr2 (62-386)||(40233521-40233845)
chr2 (53-328)||(20837919-20838194)
chr2 (53-386)||(27434351-27434684)
chr2 (143-384)||(21703073-21703314)
chr2 (134-327)||(27393051-27393244)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (53-294)||(19674446-19674687)
chr8 (62-328)||(3329442-3329708)
chr8 (53-386)||(28361832-28362165)
chr8 (113-386)||(12092601-12092874)
chr8 (53-386)||(19208237-19208570)
chr8 (53-386)||(31489627-31489960)
chr8 (98-386)||(29829372-29829660)
chr8 (52-369)||(18710590-18710907)
chr8 (53-386)||(31354529-31354862)
chr8 (113-294)||(33258788-33258969)
chr8 (53-294)||(2137228-2137469)
chr8 (53-328)||(27608840-27609115)
chr8 (53-294)||(14557629-14557870)
chr8 (53-386)||(16277559-16277892)
chr8 (62-294)||(19286476-19286708)
chr8 (53-357)||(19688103-19688407)
chr8 (53-357)||(16283454-16283758)
chr8 (213-328)||(189259-189374)
chr8 (134-327)||(22080814-22081007)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (53-294)||(10962674-10962915)
chr1 (113-386)||(51638282-51638555)
chr1 (53-294)||(28584985-28585226)
chr1 (53-294)||(41793318-41793559)
chr1 (137-374)||(20340265-20340502)
chr1 (137-384)||(16207951-16208198)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (54-386)||(7955-8287)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (53-328)||(21969721-21969996)
chr4 (62-328)||(33673774-33674040)
chr4 (53-386)||(27163235-27163568)
chr4 (53-386)||(40105556-40105889)
chr4 (53-386)||(14665038-14665371)
chr4 (53-294)||(31126528-31126769)
chr4 (62-294)||(18800623-18800855)
chr4 (53-294)||(14098561-14098802)
chr4 (53-294)||(14763314-14763555)
chr4 (62-386)||(39850667-39850991)
chr4 (53-294)||(5005893-5006134)
chr4 (53-327)||(24592291-24592565)
chr4 (113-294)||(6569933-6570114)
chr4 (113-294)||(30753834-30754015)
chr4 (52-354)||(24112681-24112983)
chr4 (52-354)||(34188910-34189212)
chr4 (62-386)||(36344433-36344757)
chr4 (62-294)||(54833416-54833648)
chr4 (53-386)||(17014020-17014353)
chr4 (140-384)||(1900364-1900608)
chr4 (116-294)||(15227953-15228131)
chr4 (134-326)||(15391316-15391508)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (53-294)||(7249-7490)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (53-294)||(14940-15181)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (52-294)||(9570-9812)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (53-294)||(9076-9317)
scaffold0159 (53-294)||(20020-20261)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (98-294)||(30502-30698)
scaffold0124 (137-384)||(20477-20723)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (53-357)||(27297-27601)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (53-294)||(26211-26453)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (53-386)||(46903-47236)
scaffold0089 (53-328)||(29768-30043)
scaffold0089 (53-386)||(39987-40320)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (116-294)||(6080-6260)
scaffold0415 (137-384)||(1838-2084)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (182-386)||(47-251)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (137-374)||(2588-2825)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (170-327)||(21683-21840)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (143-327)||(5-189)


Alignment Details
Target: scaffold2173 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 49 - 386
Target Start/End: Original strand, 90 - 427
Alignment:
Q  49 ttttgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcct 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90 ttttgctaggcctacttttcctccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcct 189  T
Q  149 ccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagt 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  190 ccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagt 289  T
Q  249 atattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacat 348  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  290 atattgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatgctgcagtaaacat 389  T
Q  349 gattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  390 gattgaagcgtatgaagaagcacccaaactagatgtcc 427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 49 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27629898 - 27629561
Alignment:
Q  49 ttttgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcct 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27629898 ttttgctaggcctacttttcctccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaggcct 27629799  T
Q  149 ccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagt 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27629798 ccgccagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagt 27629699  T
Q  249 atattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacat 348  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27629698 atattgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatgctgcagtaaacat 27629599  T
Q  349 gattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27629598 gattgaagcgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 27629561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 386
Target Start/End: Original strand, 4757775 - 4758099
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  4757775 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 4757874  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  4757875 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4757974  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| |    
T  4757975 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4758074  T
Q  362 gaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    || ||||| || | ||| |||||||    
T  4758075 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4758099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4545968 - 4545636
Alignment:
Q  54 ctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgcc 153  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || ||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||    
T  4545968 ctaggccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 4545869  T
Q  154 agatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatatt 253  Q
     |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||     
T  4545868 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 4545769  T
Q  254 gtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattg 353  Q
    ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||| | || || || ||||| |    
T  4545768 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4545669  T
Q  354 aagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    |||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  4545668 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4545636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 386
Target Start/End: Original strand, 4773017 - 4773341
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  4773017 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 4773116  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  4773117 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4773216  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| |    
T  4773217 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4773316  T
Q  362 gaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    || ||||| || | ||| |||||||    
T  4773317 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4773341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 386
Target Start/End: Original strand, 28207457 - 28207789
Alignment:
Q  54 ctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgcc 153  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || ||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||    
T  28207457 ctaggccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacc 28207556  T
Q  154 agatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatatt 253  Q
     |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28207557 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatt 28207656  T
Q  254 gtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattg 353  Q
    ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| |    
T  28207657 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 28207756  T
Q  354 aagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    |||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  28207757 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28207789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 27360177 - 27359852
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  27360177 acttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 27360078  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  27360077 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27359978  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| |    
T  27359977 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 27359878  T
Q  362 gaagaagcgcccaaactagatgtcca 387  Q
    || ||||| || | ||| ||||||||    
T  27359877 gaggaagctcctagacttgatgtcca 27359852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 27450520 - 27450195
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  27450520 acttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 27450421  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  27450420 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27450321  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| |    
T  27450320 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 27450221  T
Q  362 gaagaagcgcccaaactagatgtcca 387  Q
    || ||||| || | ||| ||||||||    
T  27450220 gaggaagctcctagacttgatgtcca 27450195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 386
Target Start/End: Original strand, 4525297 - 4525621
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  4525297 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgcacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 4525396  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||     
T  4525397 tgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 4525496  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||| | || || || ||||| ||||||| |    
T  4525497 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4525596  T
Q  362 gaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    || ||||| || | ||| |||||||    
T  4525597 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4525621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26116595 - 26116271
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | |||||||| ||  | ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  26116595 acttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccgactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 26116496  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  26116495 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 26116396  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||| | || || || ||||| ||||||| |    
T  26116395 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 26116296  T
Q  362 gaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    || ||||| || | ||| |||||||    
T  26116295 gaggaagctcctagacttgatgtcc 26116271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 29573015 - 29573348
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||| || |    
T  29573015 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggtaagcccccac 29573114  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29573115 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 29573214  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |   || || ||||| || |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  29573215 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 29573314  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||    
T  29573315 gaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 29573348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30558210 - 30557969
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  30558210 gctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 30558111  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30558110 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 30558011  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30558010 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 30557969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4724327 - 4723995
Alignment:
Q  54 ctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgcc 153  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || ||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||    
T  4724327 ctaggccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacc 4724228  T
Q  154 agatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatatt 253  Q
     |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||     
T  4724227 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 4724128  T
Q  254 gtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattg 353  Q
    ||  |||  || |||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| || ||||| || ||| | ||| | || || || ||||| |    
T  4724127 gtgaagaaactcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4724028  T
Q  354 aagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    |||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  4724027 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4723995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Original strand, 3696092 - 3696324
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  3696092 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 3696191  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  3696192 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 3696291  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3696292 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 3696324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Original strand, 16749856 - 16750131
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  16749856 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 16749955  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  16749956 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 16750055  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || ||||||||||||    
T  16750056 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcca 16750131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 328
Target Start/End: Original strand, 27007738 - 27008004
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  27007738 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 27007837  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  27007838 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27007937  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27007938 gctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttcca 27008004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16944161 - 16943980
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  16944161 cagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 16944062  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  16944061 tgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 16943980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 386
Target Start/End: Original strand, 17025339 - 17025612
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||    
T  17025339 cagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgcct 17025438  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtcct 312  Q
    | || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||    
T  17025439 taggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcct 17025538  T
Q  313 tgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  17025539 tgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 17025612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 24863719 - 24864052
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  24863719 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 24863818  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  24863819 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 24863918  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  24863919 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 24864018  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  24864019 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24864052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 113 - 369
Target Start/End: Original strand, 29549537 - 29549793
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || |||     
T  29549537 cagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccc 29549636  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtcct 312  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || || |||||    
T  29549637 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcct 29549736  T
Q  313 tgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagc 369  Q
     || |||||||||||| | ||| | || || |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  29549737 cgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagc 29549793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15424511 - 15424270
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  15424511 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 15424412  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  15424411 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 15424312  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424311 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 15424270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26777749 - 26777568
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  26777749 cagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 26777650  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26777649 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 26777568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Original strand, 29501477 - 29501658
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  29501477 cagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 29501576  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29501577 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 29501658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Original strand, 16674150 - 16674382
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  16674150 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 16674249  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  16674250 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 16674349  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16674350 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 16674382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34463531 - 34463299
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||| || || ||||| || || |||||||    
T  34463531 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacaaggaaagcccccacctgatccgt 34463432  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  34463431 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 34463332  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34463331 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 34463299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 321
Target Start/End: Original strand, 27485140 - 27485399
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  27485140 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 27485239  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  27485240 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27485339  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcc 321  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| |||||    
T  27485340 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 27485399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24304812 - 24304479
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  24304812 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 24304713  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  24304712 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagtatat 24304613  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  24304612 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 24304513  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  24304512 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24304479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 26918382 - 26918623
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  26918382 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 26918481  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  26918482 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatat 26918581  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918582 cgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 26918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 26989003 - 26989336
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  26989003 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 26989102  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  26989103 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 26989202  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  26989203 cgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 26989302  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  26989303 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26989336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 27000075 - 27000316
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  27000075 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 27000174  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  27000175 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 27000274  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27000275 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 27000316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13299145 - 13298812
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  13299145 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 13299046  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| || || ||| | || ||  |||| ||||||||    
T  13299045 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagtatat 13298946  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  13298945 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 13298846  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  13298845 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 13298812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22935074 - 22934741
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  22935074 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 22934975  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || || |||||  |  | || ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  22934974 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 22934875  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  22934874 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 22934775  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  22934774 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 22934741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23857519 - 23857186
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  23857519 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 23857420  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || || |||||  |  | || ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  23857419 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 23857320  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  23857319 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 23857220  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  23857219 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23857186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Original strand, 27044398 - 27044631
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||    
T  27044398 acttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgacccgt 27044497  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggt-gttatgctttaaagtatattgtccaga 260  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||  |||    
T  27044498 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatatcgtgaaga 27044597  T
Q  261 ggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
      || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27044598 aactcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 27044631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Original strand, 20160704 - 20160905
Alignment:
Q  54 ctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgcc 153  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| | || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||    
T  20160704 ctagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacc 20160803  T
Q  154 agatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatatt 253  Q
     ||||||||||| || |||||  || | |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||||    
T  20160804 tgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatatt 20160903  T
Q  254 gt 255  Q
    ||    
T  20160904 gt 20160905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22172127 - 22171926
Alignment:
Q  54 ctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgcc 153  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| | || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||    
T  22172127 ctagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacc 22172028  T
Q  154 agatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatatt 253  Q
     ||||||||||| || |||||  || | |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||||    
T  22172027 tgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatatt 22171928  T
Q  254 gt 255  Q
    ||    
T  22171927 gt 22171926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27272768 - 27272470
Alignment:
Q  59 cctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatc 158  Q
    |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || ||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||    
T  27272768 cctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactctactccagagagggcattgtacaaccagacagggtaagcccccacctgatc 27272669  T
Q  159 cgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtcca 258  Q
    |||  || || |||||  |  | || ||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||  |    
T  27272668 cgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaa 27272569  T
Q  259 gaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagt 357  Q
     | ||| || |||||||| |||||||| |||||||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| || || ||||| |||||    
T  27272568 aaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagt 27272470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22457044 - 22456795
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||| || | ||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  22457044 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 22456945  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    | ||||||||||| |||||  ||| ||| || || ||||||||| | ||||||||||| | |   ||||||||||| || |||||||||||  | ||  |    
T  22456944 acgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 22456845  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||| || ||| ||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  22456844 tgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 22456795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27290480 - 27290231
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  27290480 cagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 27290381  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    | || || ||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |   |||||||||||  | |||| ||||||  | ||| |    
T  27290380 acgcgttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgc 27290281  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    | | ||||| |||||||| || ||||| ||||| || | ||| |||||||    
T  27290280 tactgtaaatatgattgaggtatatgaggaagctcctagacttgatgtcc 27290231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14143395 - 14143163
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  14143395 caggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 14143296  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    ||||||| || || |||||  ||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||| || || ||||||||| | ||  |    
T  14143295 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 14143196  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagc 369  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| |||||    
T  14143195 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 14143163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 17092421 - 17092301
Alignment:
Q  266 attgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtatgaag 365  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||  |||| || ||||||| ||| || | ||| |    
T  17092421 attgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgaggtatgtgagg 17092322  T
Q  366 aagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||  ||||||| |||||||    
T  17092321 aagctaccaaacttgatgtcc 17092301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Original strand, 26788030 - 26788262
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  26788030 caggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 26788129  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    ||||||| || || |||||  ||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||| || || ||||||||| | ||  |    
T  26788130 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 26788229  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagc 369  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| |||||    
T  26788230 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 26788262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Original strand, 27196403 - 27196635
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  27196403 caggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 27196502  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    ||||||| || || |||||  ||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||| || || ||||||||| | ||  |    
T  27196503 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 27196602  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagc 369  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| |||||    
T  27196603 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 27196635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27252837 - 27252605
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  27252837 caggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 27252738  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    ||||||| || || |||||  ||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||| || || ||||||||| | ||  |    
T  27252737 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 27252638  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagc 369  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| |||||    
T  27252637 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 27252605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 4416885 - 4417218
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || |    
T  4416885 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaaacccccac 4416984  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4416985 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 4417084  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  4417085 tgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 4417184  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  4417185 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4417218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22871149 - 22870873
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22871149 tgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagccccca 22871050  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  22871049 cctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtata 22870950  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
    | ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22870949 tcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttcca 22870873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22886208 - 22885932
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22886208 tgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagccccca 22886109  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  22886108 cctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtata 22886009  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
    | ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22886008 tcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttcca 22885932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 374
Target Start/End: Original strand, 5713199 - 5713514
Alignment:
Q  59 cctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatc 158  Q
    |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  5713199 cctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatc 5713298  T
Q  159 cgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtcca 258  Q
    |||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  5713299 cgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaa 5713398  T
Q  259 gaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtg 358  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||| | || |||||||||||  | ||  |||| |||||||||||||| ||     
T  5713399 gaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggta 5713498  T
Q  359 tatgaagaagcgccca 374  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  5713499 tatgaggaagctccca 5713514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 374
Target Start/End: Original strand, 5724109 - 5724424
Alignment:
Q  59 cctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatc 158  Q
    |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  5724109 cctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatc 5724208  T
Q  159 cgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtcca 258  Q
    |||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  5724209 cgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaa 5724308  T
Q  259 gaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtg 358  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||| | || |||||||||||  | ||  |||| |||||||||||||| ||     
T  5724309 gaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggta 5724408  T
Q  359 tatgaagaagcgccca 374  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  5724409 tatgaggaagctccca 5724424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5757368 - 5757053
Alignment:
Q  59 cctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatc 158  Q
    |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  5757368 cctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatc 5757269  T
Q  159 cgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtcca 258  Q
    |||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  5757268 cgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaa 5757169  T
Q  259 gaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtg 358  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||| | || |||||||||||  | ||  |||| |||||||||||||| ||     
T  5757168 gaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggta 5757069  T
Q  359 tatgaagaagcgccca 374  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  5757068 tatgaggaagctccca 5757053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5768259 - 5767944
Alignment:
Q  59 cctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatc 158  Q
    |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  5768259 cctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatc 5768160  T
Q  159 cgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtcca 258  Q
    |||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  5768159 cgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaa 5768060  T
Q  259 gaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtg 358  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||| | || |||||||||||  | ||  |||| |||||||||||||| ||     
T  5768059 gaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggta 5767960  T
Q  359 tatgaagaagcgccca 374  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  5767959 tatgaggaagctccca 5767944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 7073178 - 7073511
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  7073178 gctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacaaggtaagcccccgc 7073277  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7073278 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 7073377  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |   || || ||||| || |||||||||||| | ||| | || || ||||||||     
T  7073378 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatc 7073477  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  7073478 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 7073511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 369
Target Start/End: Original strand, 7996528 - 7996844
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  7996528 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 7996627  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  7996628 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatat 7996727  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||| | || || || |||||     
T  7996728 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 7996827  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagc 369  Q
    ||||||| |||||||||    
T  7996828 gaagtgtgtgaagaagc 7996844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 369
Target Start/End: Original strand, 10643036 - 10643352
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  10643036 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 10643135  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  10643136 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatat 10643235  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||| | || || || |||||     
T  10643236 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 10643335  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagc 369  Q
    ||||||| |||||||||    
T  10643336 gaagtgtgtgaagaagc 10643352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6542745 - 6542486
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  6542745 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 6542646  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  6542645 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 6542546  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcc 321  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||    
T  6542545 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcc 6542486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Original strand, 8211764 - 8211945
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  8211764 cagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcct 8211863  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8211864 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 8211945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 28339268 - 28339601
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  28339268 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28339367  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28339368 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28339467  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||| | || || || |||||     
T  28339468 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 28339567  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||    
T  28339568 gaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28339601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 29149047 - 29148714
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  29149047 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 29148948  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  29148947 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 29148848  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  29148847 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 29148748  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  29148747 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29148714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 47023419 - 47023660
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  47023419 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 47023518  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  47023519 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 47023618  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  47023619 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 47023660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 386
Target Start/End: Original strand, 51782049 - 51782322
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  51782049 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 51782148  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtcct 312  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||    
T  51782149 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcct 51782248  T
Q  313 tgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  51782249 tgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 51782322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11110632 - 11110308
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  11110632 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctgatccgt 11110533  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  11110532 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 11110433  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||| ||| | ||| | || || || ||||||||||||| |    
T  11110432 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgt 11110333  T
Q  362 gaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    || ||||| || | ||| |||||||    
T  11110332 gaggaagctccaagacttgatgtcc 11110308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20577130 - 20576898
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  20577130 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 20577031  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  20577030 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 20576931  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20576930 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 20576898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4346980 - 4346646
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||     
T  4346980 tgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagccccca 4346881  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  4346880 cctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtata 4346781  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgat 351  Q
    | ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |   || || ||||| ||||||||||||||| | ||| | || || || |||||    
T  4346780 tcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 4346681  T
Q  352 tgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
     ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  4346680 cgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4346646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 386
Target Start/End: Original strand, 21674722 - 21674992
Alignment:
Q  116 agaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgg 215  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |    
T  21674722 agagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttag 21674821  T
Q  216 gtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttga 315  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||    
T  21674822 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcga 21674921  T
Q  316 taatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
     |||||||| ||| | ||| | || || || ||||| ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  21674922 caatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 21674992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 17985248 - 17984915
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  17985248 gctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 17985149  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  17985148 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgctttgaagtatat 17985049  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  17985048 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 17984949  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||    
T  17984948 gaagtgtgtgaagaagctcctagacttgatgtcc 17984915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31964765 - 31964524
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  31964765 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 31964666  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31964665 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 31964566  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  31964565 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 31964524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36997309 - 36997128
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  36997309 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 36997210  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36997209 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 36997128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 50134363 - 50134122
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  50134363 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 50134264  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  50134263 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 50134164  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  50134163 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 50134122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5609614 - 5609346
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  5609614 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 5609515  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  5609514 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatat 5609415  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcc 321  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| |||||    
T  5609414 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 5609346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29665253 - 29665021
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  29665253 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 29665154  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  29665153 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 29665054  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29665053 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 29665021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28116246 - 28115971
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  28116246 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 28116147  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
      |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28116146 ttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28116047  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
     ||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |   || |||||||| || ||||||||||||    
T  28116046 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcca 28115971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 386
Target Start/End: Original strand, 51797138 - 51797412
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccac-caaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcc 211  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || | |||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  51797138 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcc 51797237  T
Q  212 ttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtcc 311  Q
    || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| |||||||    
T  51797238 ttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcc 51797337  T
Q  312 ttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    |||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  51797338 ttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 51797412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 386
Target Start/End: Original strand, 5013738 - 5014011
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || |||     
T  5013738 cagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccc 5013837  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtcct 312  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||    
T  5013838 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcct 5013937  T
Q  313 tgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||| ||||| || ||| | ||| | || || || ||||| ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||    
T  5013938 tgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 5014011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5596589 - 5596408
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  5596589 cagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 5596490  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5596489 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 5596408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8301559 - 8301226
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  8301559 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 8301460  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  8301459 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagtatat 8301360  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  8301359 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 8301260  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  8301259 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8301226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Original strand, 18225217 - 18225398
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  18225217 cagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 18225316  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  18225317 taggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 18225398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18277344 - 18277103
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  18277344 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 18277245  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||| ||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18277244 ctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 18277145  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18277144 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 18277103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18292645 - 18292404
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  18292645 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 18292546  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||| ||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18292545 ctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 18292446  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18292445 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 18292404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18307946 - 18307705
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  18307946 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 18307847  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||| ||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18307846 ctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 18307747  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18307746 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 18307705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 386
Target Start/End: Original strand, 24328185 - 24328458
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || |||     
T  24328185 cagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccc 24328284  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtcct 312  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||    
T  24328285 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcct 24328384  T
Q  313 tgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||| ||||| || ||| | ||| | || || || ||||| ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||    
T  24328385 tgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 24328458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22387871 - 22387595
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||     
T  22387871 tgctagaccgacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagccccca 22387772  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||    
T  22387771 cctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtata 22387672  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
    | ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || ||||||||||||    
T  22387671 tcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcca 22387595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Original strand, 48465902 - 48466134
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| || || |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  48465902 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccaaagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 48466001  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  48466002 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 48466101  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48466102 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 48466134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4796945 - 4796704
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  4796945 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 4796846  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  4796845 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 4796746  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796745 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 4796704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Original strand, 5467011 - 5467192
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  5467011 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 5467110  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5467111 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaa 5467192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Original strand, 18242714 - 18242946
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  18242714 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 18242813  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  18242814 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18242913  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18242914 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 18242946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 294
Target Start/End: Original strand, 28021240 - 28021482
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||     
T  28021240 tgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactatactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccacca 28021339  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    || ||||| ||||| ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  28021340 cctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtata 28021439  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28021440 tcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 28021482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 354
Target Start/End: Original strand, 32439119 - 32439421
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||     
T  32439119 tgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctcca 32439218  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    || || || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||| |||| |||||| ||||||| |    
T  32439219 ccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtaca 32439318  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgat 351  Q
    | ||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |   || |||||||| |||||||| || ||| | ||| |||| || || |||||    
T  32439319 tcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 32439418  T
Q  352 tga 354  Q
    |||    
T  32439419 tga 32439421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 354
Target Start/End: Original strand, 20066018 - 20066310
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |  || |    
T  20066018 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgggccctt 20066117  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||| |||| |||||| ||||||| || ||| |||     
T  20066118 tacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaa 20066217  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattga 354  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| ||  || |||||||| |||||||| || ||| | ||| |||| || || ||||||||    
T  20066218 gcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatatgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattga 20066310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Original strand, 18330635 - 18330910
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  18330635 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 18330734  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  18330735 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatat 18330834  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || ||||||||||||    
T  18330835 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcca 18330910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 10396099 - 10396340
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| || |    
T  10396099 gctagacctactttccctccgatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggtaagcccccac 10396198  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10396199 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 10396298  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10396299 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaa 10396340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15741386 - 15741053
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  15741386 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 15741287  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | ||| |||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||  ||||||| ||||| ||| | || |||||||| ||||||||    
T  15741286 ctgattcgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatat 15741187  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  15741186 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 15741087  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  15741086 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15741053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 357
Target Start/End: Original strand, 18051228 - 18051532
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  18051228 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 18051327  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||| | || || |||||  |  | |||||||| ||||| ||  |||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  18051328 ctgatccgctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 18051427  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || || |||||||||    
T  18051428 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatt 18051527  T
Q  353 gaagt 357  Q
    |||||    
T  18051528 gaagt 18051532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 6192282 - 6192615
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  6192282 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 6192381  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||| | | || ||||||||  |  | || ||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  6192382 ctgatctgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 6192481  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  6192482 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 6192581  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  6192582 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 6192615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 8295938 - 8296271
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |  |    
T  8295938 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccacagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccctac 8296037  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||| ||| || || |||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  8296038 ctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 8296137  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  8296138 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 8296237  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  8296238 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8296271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15892998 - 15892665
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||  | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  15892998 gctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 15892899  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | ||||| || || || |||||  |  | |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  15892898 ctgatcctttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 15892799  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  15892798 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 15892699  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  15892698 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15892665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 35880732 - 35880973
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || |  ||||| ||||| || |    
T  35880732 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccaaacagggcaagcccccac 35880831  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||| | || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  35880832 ctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 35880931  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880932 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 35880973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Original strand, 4721597 - 4721872
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  4721597 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 4721696  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||| | || ||||||||  |  | || ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| ||  |||| ||||||||    
T  4721697 ctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagtatat 4721796  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
     ||  | |  || |||||||||||||||||||||||| |||| | |   || |||||||| || ||||||||||||    
T  4721797 cgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcca 4721872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 249
Target Start/End: Original strand, 4893175 - 4893372
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| || |||||     
T  4893175 tgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaaacctcca 4893274  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagta 249  Q
    || || || ||||| |||||||| |   ||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  4893275 ccggaccctttacctccaaggttccactctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagta 4893372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16626714 - 16626477
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||||||  | || |    
T  16626714 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgct 16626615  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    | ||||| ||||| |||||  | | ||| || || ||||||||  |||| |||||||| |     |||||||||||||| |||||||||||  | || ||    
T  16626614 acgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacac 16626515  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgccca 374  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  16626514 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccca 16626477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31034325 - 31034093
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  31034325 caggggaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 31034226  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    ||||||| || || |||||  ||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||| || || ||||||||| | ||  |    
T  31034225 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 31034126  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagc 369  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| |||||    
T  31034125 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 31034093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Original strand, 32292802 - 32293034
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  32292802 caggggaagtctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 32292901  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    ||||||| || || |||||  ||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||| || || ||||||||| | ||  |    
T  32292902 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 32293001  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagc 369  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| |||||    
T  32293002 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 32293034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 31564518 - 31564194
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  31564518 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 31564419  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  31564418 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31564319  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| |    
T  31564318 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 31564219  T
Q  362 gaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    || ||||| || | ||| |||||||    
T  31564218 gaggaagctcctagacttgatgtcc 31564194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4145260 - 4144927
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  4145260 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 4145161  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4145160 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 4145061  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |   || || ||||| || |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  4145060 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 4144961  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||    
T  4144960 gaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 4144927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 9618657 - 9618990
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  9618657 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 9618756  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9618757 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 9618856  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |   || || ||||| || |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  9618857 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 9618956  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||    
T  9618957 gaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 9618990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16736597 - 16736356
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  16736597 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 16736498  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | ||||||||||| ||||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16736497 ctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 16736398  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16736397 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 16736356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16751651 - 16751410
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  16751651 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 16751552  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | ||||||||||| ||||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16751551 ctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 16751452  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16751451 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 16751410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 17523538 - 17523779
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  17523538 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 17523637  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | ||||||||||| ||||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17523638 ctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 17523737  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17523738 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 17523779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17529677 - 17529436
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  17529677 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 17529578  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | ||||||||||| ||||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17529577 ctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 17529478  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17529477 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 17529436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5147477 - 5147236
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  5147477 gctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 5147378  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5147377 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 5147278  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5147277 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 5147236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26320006 - 26319765
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  26320006 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 26319907  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26319906 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 26319807  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  26319806 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 26319765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26670051 - 26669718
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  26670051 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 26669952  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26669951 ctgatccgttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 26669852  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |   || || ||||| || |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  26669851 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 26669752  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||    
T  26669751 gaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26669718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 369
Target Start/End: Original strand, 45387349 - 45387665
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  45387349 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 45387448  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  45387449 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 45387548  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |   || || ||||| || |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  45387549 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 45387648  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagc 369  Q
    ||||||| |||||||||    
T  45387649 gaagtgtgtgaagaagc 45387665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26275231 - 26274990
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  26275231 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 26275132  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  26275131 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatat 26275032  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  26275031 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 26274990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Original strand, 3445372 - 3445553
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  3445372 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 3445471  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3445472 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 3445553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26537998 - 26537766
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  26537998 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtgcgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 26537899  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  26537898 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 26537799  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26537798 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 26537766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10917005 - 10916672
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  10917005 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 10916906  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  10916905 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 10916806  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  10916805 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 10916706  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  10916705 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 10916672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24592618 - 24592437
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  24592618 cagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 24592519  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  24592518 taggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 24592437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Original strand, 26435323 - 26435504
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  26435323 cagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcct 26435422  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26435423 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 26435504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 5127998 - 5128239
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || |    
T  5127998 gctagacctacttttcctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggtaagcccccac 5128097  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    |  ||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||||||    
T  5128098 ctaatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatat 5128197  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128198 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 5128239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Original strand, 11441638 - 11441819
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  11441638 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 11441737  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  11441738 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 11441819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 386
Target Start/End: Original strand, 31124935 - 31125259
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  31124935 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 31125034  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  31125035 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31125134  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
     || || |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||| | || || || ||||| ||||||| |    
T  31125135 actcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 31125234  T
Q  362 gaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    || ||||| || | ||| |||||||    
T  31125235 gaggaagctcctagacttgatgtcc 31125259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11424913 - 11424638
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |    
T  11424913 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgcacaaccagacagggcaagcccccac 11424814  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  11424813 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 11424714  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || ||||||||||||    
T  11424713 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcca 11424638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16503517 - 16503213
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  16503517 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 16503418  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  16503417 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatat 16503318  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  16503317 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 16503218  T
Q  353 gaagt 357  Q
    |||||    
T  16503217 gaagt 16503213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 386
Target Start/End: Original strand, 2154587 - 2154912
Alignment:
Q  61 tacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccg 160  Q
    |||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||||    
T  2154587 tactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccg 2154686  T
Q  161 ttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccaga 260  Q
    || || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| | || || ||||| |||||||| ||  |||    
T  2154687 ttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaaga 2154786  T
Q  261 ggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgta 360  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| ||||| ||||| |     
T  2154787 agctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatg 2154886  T
Q  361 tgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  2154887 tgaggaagctcctagacttgatgtcc 2154912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 321
Target Start/End: Original strand, 5159524 - 5159793
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||     
T  5159524 tgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctcca 5159623  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    || || || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || |||||| || |||| |||||| ||||||| |    
T  5159624 ccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtaca 5159723  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcc 321  Q
    | ||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |   || |||||||| ||||||||    
T  5159724 tcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatcc 5159793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16518553 - 16518249
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  16518553 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 16518454  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  16518453 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatat 16518354  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  16518353 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 16518254  T
Q  353 gaagt 357  Q
    |||||    
T  16518253 gaagt 16518249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 354
Target Start/End: Original strand, 18540889 - 18541106
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||| |||| |    
T  18540889 caggggaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgct 18540988  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    ||||| ||||||| || ||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |   || |||||||| |||||||| || ||| | ||| |    
T  18540989 atgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgc 18541088  T
Q  337 tgcagtaaacatgattga 354  Q
    ||| || || ||||||||    
T  18541089 tgccgtgaatatgattga 18541106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16450051 - 16449814
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  16450051 cagggcaagcctccacctgatcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 16449952  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    | ||||| ||||| |||||  ||| ||| |||||||| |||||| | ||||||||||| |     ||||||||||| || |||||||||||  | ||  |    
T  16449951 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 16449852  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgccca 374  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  16449851 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccca 16449814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2109058 - 2108826
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  2109058 caggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 2108959  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    ||||||| || || |||||  ||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||| || || ||||||||| | ||  |    
T  2108958 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 2108859  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagc 369  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| |||||    
T  2108858 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 2108826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Original strand, 26484784 - 26485016
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  26484784 caggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 26484883  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    ||||||| || || |||||  ||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||| || || ||||||||| | ||  |    
T  26484884 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 26484983  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagc 369  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| |||||    
T  26484984 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 26485016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39211076 - 39210844
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||| ||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||  | || |    
T  39211076 caggggaagcttccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgct 39210977  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    ||||||| || || |||||  ||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||| || || ||||||||| | ||  |    
T  39210976 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 39210877  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagc 369  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| |||||    
T  39210876 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 39210844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 384
Target Start/End: Original strand, 16041413 - 16041660
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||| |||| || |||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  16041413 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgct 16041512  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    | ||||| ||||| |||||  | | ||| |||||||| |||||| | ||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||||  | ||  |    
T  16041513 acgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 16041612  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgt 384  Q
    ||| || ||||||||||| || || || ||||| |||| ||| |||||    
T  16041613 tgctgtgaacatgattgaggtatacgaggaagctcccagactcgatgt 16041660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Original strand, 2775449 - 2775681
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  2775449 caggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 2775548  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    ||||||| ||  | |||||  ||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||| || || ||||||||| | ||  |    
T  2775549 atgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 2775648  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagc 369  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| |||||    
T  2775649 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 2775681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 369
Target Start/End: Original strand, 4200772 - 4200869
Alignment:
Q  272 caaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagc 369  Q
    ||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||  |||| || ||||||||||| || ||||| |||||    
T  4200772 caaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagc 4200869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 386
Target Start/End: Original strand, 31431455 - 31431787
Alignment:
Q  54 ctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgcc 153  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || ||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  31431455 ctaggccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 31431554  T
Q  154 agatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatatt 253  Q
     |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||     
T  31431555 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 31431654  T
Q  254 gtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattg 353  Q
    ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| |    
T  31431655 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 31431754  T
Q  354 aagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    |||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  31431755 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31431787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 37671622 - 37671298
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  37671622 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 37671523  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  37671522 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 37671423  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| |    
T  37671422 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 37671323  T
Q  362 gaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    || ||||| || | ||| |||||||    
T  37671322 gaggaagctcctagacttgatgtcc 37671298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 386
Target Start/End: Original strand, 37755003 - 37755327
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||    
T  37755003 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 37755102  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  37755103 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 37755202  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||| | || || || ||||| ||||||| |    
T  37755203 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 37755302  T
Q  362 gaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    || ||||| || | ||| |||||||    
T  37755303 gaggaagctcctagacttgatgtcc 37755327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 37771126 - 37770867
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  37771126 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 37771027  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |  |||     
T  37771026 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcatgaagaa 37770927  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcc 321  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||    
T  37770926 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcc 37770867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 9317465 - 9317798
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  9317465 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 9317564  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9317565 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 9317664  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |   || || ||||| || |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  9317665 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 9317764  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||    
T  9317765 gaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 9317798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 12132169 - 12132502
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  12132169 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 12132268  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12132269 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 12132368  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |   || || ||||| || |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  12132369 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 12132468  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||    
T  12132469 gaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 12132502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15759005 - 15758672
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  15759005 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccac 15758906  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15758905 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 15758806  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||| | || || || |||||     
T  15758805 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 15758706  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  15758705 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15758672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 321
Target Start/End: Original strand, 2511065 - 2511333
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  2511065 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccac 2511164  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2511165 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 2511264  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcc 321  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| |||||    
T  2511265 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcc 2511333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13324968 - 13324644
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  13324968 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 13324869  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  13324868 tacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 13324769  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| |    
T  13324768 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 13324669  T
Q  362 gaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    || ||||| || | ||| |||||||    
T  13324668 gaggaagctcctagacttgatgtcc 13324644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15658908 - 15658633
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  15658908 gctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 15658809  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15658808 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 15658709  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || ||||||||||||    
T  15658708 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcca 15658633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8665623 - 8665382
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  8665623 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccac 8665524  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8665523 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 8665424  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  8665423 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 8665382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 9548691 - 9548358
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  9548691 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 9548592  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  9548591 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 9548492  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  9548491 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 9548392  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  9548391 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 9548358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 26480406 - 26480739
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  26480406 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 26480505  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26480506 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 26480605  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |   || || ||||| || |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  26480606 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 26480705  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||    
T  26480706 gaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26480739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 33516370 - 33516611
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  33516370 gctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 33516469  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33516470 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 33516569  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33516570 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 33516611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 113 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 37358731 - 37358458
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  37358731 cagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 37358632  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtcct 312  Q
    | || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||    
T  37358631 taggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatattccacatgtcct 37358532  T
Q  313 tgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
     || |||||||||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  37358531 cgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 37358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 113 - 386
Target Start/End: Original strand, 43078326 - 43078599
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  43078326 cagagagggcattgtacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcct 43078425  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtcct 312  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||    
T  43078426 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcct 43078525  T
Q  313 tgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  43078526 tgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 43078599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Original strand, 28649258 - 28649490
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  28649258 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 28649357  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  28649358 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 28649457  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28649458 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 28649490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 40473688 - 40473364
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  40473688 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 40473589  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  40473588 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 40473489  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | || || || ||||| ||||||| |    
T  40473488 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 40473389  T
Q  362 gaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    || ||||| || | ||| |||||||    
T  40473388 gaggaagctcctagacttgatgtcc 40473364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 291
Target Start/End: Original strand, 5637924 - 5638162
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  5637924 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 5638023  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5638024 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 5638123  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttga 291  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  5638124 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttga 5638162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 294
Target Start/End: Original strand, 34616531 - 34616773
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || ||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||     
T  34616531 tgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagccccca 34616630  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  34616631 cctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtata 34616730  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||  |||  || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34616731 tcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 34616773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 6874319 - 6874560
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || ||||||||  | |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  6874319 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagctgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccac 6874418  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6874419 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 6874518  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6874519 cgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 6874560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18375560 - 18375319
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||| | |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  18375560 gctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 18375461  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18375460 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 18375361  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  18375360 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 18375319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22999262 - 22998929
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  22999262 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 22999163  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  22999162 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 22999063  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| ||||| | || ||||| |||||     
T  22999062 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctgtaaatatgatc 22998963  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  22998962 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 22998929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 30152032 - 30152273
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  30152032 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 30152131  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30152132 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 30152231  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  30152232 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 30152273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 30168483 - 30168724
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  30168483 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccac 30168582  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30168583 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 30168682  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30168683 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaa 30168724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18500869 - 18500637
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  18500869 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 18500770  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  18500769 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18500670  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18500669 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 18500637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Original strand, 24681463 - 24681695
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  24681463 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 24681562  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  24681563 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 24681662  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24681663 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 24681695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Original strand, 24723990 - 24724222
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  24723990 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 24724089  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  24724090 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 24724189  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24724190 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 24724222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29967154 - 29966973
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  29967154 cagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 29967055  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  29967054 tgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 29966973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Original strand, 30029489 - 30029670
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  30029489 cagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 30029588  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  30029589 tgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 30029670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31826495 - 31826314
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  31826495 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 31826396  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31826395 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 31826314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28959935 - 28959628
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | ||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||     
T  28959935 tgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccacca 28959836  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  28959835 cctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtata 28959736  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgat 351  Q
    | ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| |||||||| || ||||| || ||| | ||| | || ||||| |||||    
T  28959735 tcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtaaatatgat 28959636  T
Q  352 tgaagtgt 359  Q
     |||||||    
T  28959635 cgaagtgt 28959628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 41674723 - 41674964
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  41674723 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 41674822  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| | || || ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||    
T  41674823 ctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 41674922  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  41674923 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaa 41674964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Original strand, 3789564 - 3789796
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  3789564 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 3789663  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  3789664 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 3789763  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3789764 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 3789796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 357
Target Start/End: Original strand, 11549368 - 11549672
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  11549368 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 11549467  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  11549468 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 11549567  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  11549568 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 11549667  T
Q  353 gaagt 357  Q
    |||||    
T  11549668 gaagt 11549672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 351
Target Start/End: Original strand, 24970032 - 24970330
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  24970032 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 24970131  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  24970132 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 24970231  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgat 351  Q
     ||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||| |||||    
T  24970232 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgat 24970330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32599621 - 32599379
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||     
T  32599621 tgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagccccca 32599522  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||    
T  32599521 cctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtata 32599422  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32599421 tcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 32599379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23718136 - 23717895
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  23718136 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 23718037  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  23718036 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 23717937  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23717936 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 23717895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 321
Target Start/End: Original strand, 33292538 - 33292807
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||     
T  33292538 tgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctcca 33292637  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    || || || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||| |||| |||||| ||||||| |    
T  33292638 ccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtaca 33292737  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcc 321  Q
    | ||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |   || |||||||| ||||||||    
T  33292738 tcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatcc 33292807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 384
Target Start/End: Original strand, 25199127 - 25199374
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  25199127 cagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 25199226  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    | ||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||||  | ||  |    
T  25199227 acgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 25199326  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgt 384  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||  |||| |||| ||| |||||    
T  25199327 tgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttgatgt 25199374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Original strand, 30934647 - 30934922
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  30934647 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 30934746  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || || |||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  30934747 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 30934846  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || ||||||||||||    
T  30934847 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttcca 30934922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 33777501 - 33777742
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  33777501 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 33777600  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | || ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  33777601 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatat 33777700  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777701 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 33777742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23752598 - 23752357
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  23752598 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 23752499  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | || ||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  23752498 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 23752399  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752398 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 23752357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24688305 - 24687972
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  24688305 gctagacctactttccctccgataccgatattgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 24688206  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || || |||||  |  | |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  24688205 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 24688106  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  24688105 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 24688006  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  24688005 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24687972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Original strand, 22888568 - 22888800
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  22888568 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 22888667  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    | ||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||||  | ||  |    
T  22888668 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 22888767  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagc 369  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  22888768 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagc 22888800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 29889146 - 29888897
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||  |||| ||||  ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  29889146 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 29889047  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    ||||||| ||||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||||  | ||  |    
T  29889046 atgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 29888947  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  29888946 tgctgtgaacatgattgaggtgtatgaggaagctcccagacttgatgtcc 29888897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 386
Target Start/End: Original strand, 23892304 - 23892553
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||  | || ||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| || || || |    
T  23892304 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgct 23892403  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    ||||| | ||||| || ||  ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||||  | ||| |    
T  23892404 atgctctgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgc 23892503  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||| || ||| ||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  23892504 tgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 23892553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11635426 - 11635151
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  11635426 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 11635327  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  11635326 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacat 11635227  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
     ||  ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11635226 cgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttcca 11635151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11641615 - 11641340
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || | | | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  11641615 gctagacctactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 11641516  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  11641515 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacat 11641416  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
     ||  ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11641415 cgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttcca 11641340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 368
Target Start/End: Original strand, 32049799 - 32050114
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  32049799 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaaacccccac 32049898  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | || ||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  32049899 cggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 32049998  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||||    
T  32049999 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatt 32050098  T
Q  353 gaagtgtatgaagaag 368  Q
    ||||||| ||| ||||    
T  32050099 gaagtgtgtgaggaag 32050114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Original strand, 34286355 - 34286630
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  34286355 gctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 34286454  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34286455 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 34286554  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |  ||| |||||||| || ||||||||||||    
T  34286555 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttcca 34286630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Original strand, 34291415 - 34291690
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  34291415 gctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 34291514  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34291515 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 34291614  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |  ||| |||||||| || ||||||||||||    
T  34291615 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttcca 34291690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 34861681 - 34862014
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  34861681 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 34861780  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34861781 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 34861880  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |   || || ||||| || |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  34861881 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 34861980  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||||||||||    
T  34861981 gaagtgtgtgaagaagctccgagactagatgtcc 34862014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 386
Target Start/End: Original strand, 39890074 - 39890408
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||     
T  39890074 tgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccacca 39890173  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  39890174 cctgatccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtata 39890273  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgat 351  Q
    | ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | || || || |||||    
T  39890274 tcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 39890373  T
Q  352 tgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
     ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  39890374 cgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39890408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16829578 - 16829337
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  16829578 gctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 16829479  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16829478 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 16829379  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16829378 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 16829337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 16891903 - 16892144
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  16891903 gctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 16892002  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16892003 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 16892102  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16892103 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 16892144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21677422 - 21677181
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  21677422 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccac 21677323  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21677322 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 21677223  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  21677222 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 21677181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9350213 - 9349906
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || || |    
T  9350213 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcaaggcaagcctccaccggaccctt 9350114  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  9350113 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 9350014  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||| || || ||||||||| | ||  |||| || ||||||||||| || |||    
T  9350013 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatat 9349914  T
Q  362 gaagaagc 369  Q
    || |||||    
T  9349913 gaggaagc 9349906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 34279450 - 34279691
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  34279450 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 34279549  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34279550 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 34279649  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279650 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 34279691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37686149 - 37685908
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  37686149 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 37686050  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37686049 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 37685950  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  37685949 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 37685908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37701414 - 37701173
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  37701414 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 37701315  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37701314 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 37701215  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  37701214 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 37701173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12716833 - 12716601
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  12716833 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 12716734  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  12716733 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 12716634  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12716633 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 12716601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22926268 - 22925952
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  22926268 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 22926169  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22926168 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22926069  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| |||||||| || ||||| || ||| | ||  |||| || |||||||||    
T  22926068 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 22925969  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagc 369  Q
    || || ||||| |||||    
T  22925968 gaggtatatgaggaagc 22925952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Original strand, 27777232 - 27777464
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  27777232 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 27777331  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  27777332 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27777431  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27777432 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 27777464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Original strand, 27816990 - 27817222
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  27816990 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 27817089  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  27817090 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27817189  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27817190 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 27817222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 31876282 - 31876523
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  | ||||| || ||  | ||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  31876282 gctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 31876381  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31876382 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 31876481  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  31876482 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 31876523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Original strand, 27803717 - 27803949
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  27803717 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 27803816  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  27803817 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27803916  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27803917 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 27803949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39052053 - 39051821
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  39052053 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 39051954  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  39051953 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 39051854  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39051853 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 39051821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13936778 - 13936543
Alignment:
Q  59 cctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatc 158  Q
    |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || |    
T  13936778 cctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacc 13936679  T
Q  159 cgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtcca 258  Q
    | ||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||  |    
T  13936678 ctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaa 13936579  T
Q  259 gaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13936578 gaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 13936543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23128806 - 23128473
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  23128806 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 23128707  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  23128706 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 23128607  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  23128606 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 23128507  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  23128506 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23128473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 19416736 - 19416406
Alignment:
Q  56 aggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccag 155  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||| | |||||||| ||  | ||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |    
T  19416736 aggccaactttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 19416637  T
Q  156 atccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgt 255  Q
    ||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||    
T  19416636 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgt 19416537  T
Q  256 ccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaa 355  Q
      |||  || || |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||| | || || || ||||| |||    
T  19416536 gaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 19416437  T
Q  356 gtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    |||| ||||||||| || | ||| |||||||    
T  19416436 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 19416406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 12655543 - 12655876
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  12655543 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 12655642  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  12655643 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatat 12655742  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  12655743 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatc 12655842  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  12655843 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12655876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 28882215 - 28882548
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  28882215 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 28882314  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || || |||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  28882315 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 28882414  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  28882415 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 28882514  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  28882515 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28882548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 37925494 - 37925735
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||  | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  37925494 gctaggcctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 37925593  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | || ||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37925594 ccgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 37925693  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  37925694 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 37925735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 260984 - 260752
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || |||| ||    
T  260984 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgt 260885  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  260884 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 260785  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  260784 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 260752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Original strand, 12586820 - 12587052
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | || |||||||| |  |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  12586820 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagtcgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 12586919  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  12586920 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 12587019  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12587020 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 12587052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Original strand, 37375171 - 37375403
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  37375171 acttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 37375270  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  37375271 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 37375370  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37375371 gctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaa 37375403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 386
Target Start/End: Original strand, 40233521 - 40233845
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  40233521 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 40233620  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || |||||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  40233621 tgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 40233720  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| |||||||| || |||||||| ||| | ||| | || || || ||||| ||||||| |    
T  40233721 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgt 40233820  T
Q  362 gaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    || ||||| || | ||| |||||||    
T  40233821 gaggaagctcctagacttgatgtcc 40233845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Original strand, 20837919 - 20838194
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  20837919 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 20838018  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||| ||| || || |||||  |  | || || || ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  20838019 ctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 20838118  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || ||||||||||||    
T  20838119 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttcca 20838194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27434684 - 27434351
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || |||||  | || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  27434684 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccggctttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 27434585  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || || | |||  |  | || ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  27434584 ctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 27434485  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  27434484 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 27434385  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  27434384 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27434351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21703314 - 21703073
Alignment:
Q  143 aagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctt 242  Q
    |||||||| || |||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| |||||  |  | || || ||||    
T  21703314 aagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctt 21703215  T
Q  243 taaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagt 342  Q
    | ||||| |||||  ||| ||| |||||||| |||||| | ||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||||  | ||  |||| ||    
T  21703214 tgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt 21703115  T
Q  343 aaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgt 384  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  21703114 aaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgt 21703073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Original strand, 27393051 - 27393244
Alignment:
Q  134 aggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggt 233  Q
    |||||||| |||||||| ||  | ||||| || || ||||| | | |||| |||||||| || || ||||| || ||  |||| || ||||||||  | |    
T  27393051 aggcagggcaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggat 27393150  T
Q  234 gttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcc 327  Q
    |||| ||||| ||||| |||||  ||| ||| |||||||| |||||| | ||||||||||||| |   |||||||| ||||| |||||||||||    
T  27393151 gttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttcc 27393244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 19674446 - 19674687
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || |    
T  19674446 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaaacccccac 19674545  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19674546 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatat 19674645  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19674646 tgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 19674687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3329708 - 3329442
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  3329708 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 3329609  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  3329608 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 3329509  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3329508 gctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttcca 3329442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28362165 - 28361832
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  28362165 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 28362066  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28362065 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28361966  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |   || || ||||| || |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  28361965 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 28361866  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||    
T  28361865 gaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28361832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 113 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 12092874 - 12092601
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  12092874 cagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctt 12092775  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtcct 312  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||    
T  12092774 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcct 12092675  T
Q  313 tgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  12092674 tgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12092601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 19208570 - 19208237
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  19208570 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 19208471  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19208470 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 19208371  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |   || || ||||| || |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  19208370 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 19208271  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||    
T  19208270 gaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 19208237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 31489960 - 31489627
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  31489960 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 31489861  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31489860 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 31489761  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |   || || ||||| || |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  31489760 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 31489661  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||    
T  31489660 gaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 31489627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 386
Target Start/End: Original strand, 29829372 - 29829660
Alignment:
Q  98 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 197  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||  ||||||| || ||||| |    
T  29829372 cttccaactttactccagagagggcattgtaccaccagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgatt 29829471  T
Q  198 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacag 297  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  29829472 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataa 29829571  T
Q  298 tactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    |  ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  29829572 tgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29829660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 369
Target Start/End: Original strand, 18710590 - 18710907
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |     
T  18710590 tgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccctca 18710689  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    || |||||| | || ||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||    
T  18710690 cctgatccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtata 18710789  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgat 351  Q
    | ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || || ||||||||| | ||  |||| || ||||||||    
T  18710790 tcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgat 18710889  T
Q  352 tgaagtgtatgaagaagc 369  Q
    ||| || ||||| |||||    
T  18710890 tgaggtatatgaggaagc 18710907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 31354529 - 31354862
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || ||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  31354529 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgccgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccac 31354628  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | ||||| || || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31354629 ctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 31354728  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| |||||||| || ||||| || ||| | ||| | || || || |||||     
T  31354729 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 31354828  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  31354829 gaagtgtgtgaggaagctcccagacttgatgtcc 31354862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Original strand, 33258788 - 33258969
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  33258788 cagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 33258887  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  33258888 tgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 33258969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2137469 - 2137228
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  2137469 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 2137370  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  2137369 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 2137270  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137269 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 2137228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27609115 - 27608840
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  27609115 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 27609016  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| | || |||||||| ||||||||    
T  27609015 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatat 27608916  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || ||||||||||||    
T  27608915 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcca 27608840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 14557629 - 14557870
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||  | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| |||||  |||    
T  14557629 gctagacctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagccctcgc 14557728  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  14557729 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 14557828  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557829 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 14557870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 16277559 - 16277892
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  16277559 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 16277658  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || || |||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  16277659 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatat 16277758  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  16277759 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatc 16277858  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  16277859 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 16277892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Original strand, 19286476 - 19286708
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||    
T  19286476 acttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgt 19286575  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  19286576 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 19286675  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19286676 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 19286708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 357
Target Start/End: Original strand, 19688103 - 19688407
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  19688103 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 19688202  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  19688203 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 19688302  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  | | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  19688303 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 19688402  T
Q  353 gaagt 357  Q
    |||||    
T  19688403 gaagt 19688407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 357
Target Start/End: Original strand, 16283454 - 16283758
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || |  ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  16283454 gctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccttagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 16283553  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || || |||||  |  | || ||||| ||||| || ||||| ||  || ||||||| ||||| ||  |||| |||||||| ||||||||    
T  16283554 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatat 16283653  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || || |||||||||    
T  16283654 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatt 16283753  T
Q  353 gaagt 357  Q
    |||||    
T  16283754 gaagt 16283758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 328
Target Start/End: Original strand, 189259 - 189374
Alignment:
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtcct 312  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   || ||||||||    
T  189259 tgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcct 189358  T
Q  313 tgataatcctcttcca 328  Q
     || ||||||||||||    
T  189359 cgacaatcctcttcca 189374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22081007 - 22080814
Alignment:
Q  134 aggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggt 233  Q
    |||||||| |||||||| ||  | ||||| || || ||||| ||| |||| |||||||| || || ||||| || ||  |||| || ||||||||  | |    
T  22081007 aggcagggaaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggat 22080908  T
Q  234 gttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcc 327  Q
    |||| ||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||| || |||||| | ||||||||||||| |   |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22080907 gttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttcc 22080814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 10962674 - 10962915
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  10962674 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttgctccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 10962773  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10962774 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 10962873  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  10962874 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 10962915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 386
Target Start/End: Original strand, 51638282 - 51638555
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  51638282 cagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcct 51638381  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtcct 312  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||    
T  51638382 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcct 51638481  T
Q  313 tgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  51638482 tgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 51638555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 28584985 - 28585226
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  28584985 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 28585084  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28585085 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28585184  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  28585185 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 28585226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41793559 - 41793318
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  41793559 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccac 41793460  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41793459 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 41793360  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| |||  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  41793359 cgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaa 41793318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20340502 - 20340265
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  20340502 cagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 20340403  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    | ||||| ||||| |||||  ||| ||| ||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||  | ||  |    
T  20340402 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 20340303  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgccca 374  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  20340302 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccca 20340265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16208198 - 16207951
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  16208198 cagggaaaacctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 16208099  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    | ||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||||  | ||  |    
T  16208098 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 16207999  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgt 384  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||  |||| |||| ||| |||||    
T  16207998 tgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttgatgt 16207951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 386
Target Start/End: Original strand, 7955 - 8287
Alignment:
Q  54 ctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgcc 153  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || ||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||    
T  7955 ctaggccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacc 8054  T
Q  154 agatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatatt 253  Q
     |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8055 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatt 8154  T
Q  254 gtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattg 353  Q
    ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | || || || ||||| |    
T  8155 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 8254  T
Q  354 aagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    |||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  8255 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Original strand, 21969721 - 21969996
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  21969721 gctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacgactaggcaaggcaagcctccac 21969820  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | || || ||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21969821 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 21969920  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
     ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21969921 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttcca 21969996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 33674040 - 33673774
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||    
T  33674040 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccgt 33673941  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  33673940 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 33673841  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33673840 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttcca 33673774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27163568 - 27163235
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  27163568 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 27163469  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  27163468 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatat 27163369  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  27163368 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 27163269  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  27163268 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27163235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 40105889 - 40105556
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || ||||||||  | |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  40105889 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgaacttcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccac 40105790  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  40105789 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 40105690  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |   || || ||||| || |||||||||||| | ||| | || || || |||||     
T  40105689 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 40105590  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||| |||||||    
T  40105589 gaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 40105556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 14665038 - 14665371
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  14665038 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 14665137  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  14665138 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 14665237  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  14665238 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 14665337  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  14665338 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14665371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31126769 - 31126528
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  31126769 gctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 31126670  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | || ||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31126669 ctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 31126570  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31126569 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 31126528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18800855 - 18800623
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  18800855 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 18800756  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  18800755 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18800656  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18800655 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 18800623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 14098561 - 14098802
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  14098561 gctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 14098660  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14098661 ctgatccgttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 14098760  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14098761 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 14098802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14763555 - 14763314
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  14763555 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 14763456  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14763455 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 14763356  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14763355 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 14763314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 386
Target Start/End: Original strand, 39850667 - 39850991
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  39850667 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 39850766  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  39850767 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 39850866  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| || || |||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| |    
T  39850867 gctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 39850966  T
Q  362 gaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    || ||||| || | ||| |||||||    
T  39850967 gaggaagctcctagacttgatgtcc 39850991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 5005893 - 5006134
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |    
T  5005893 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaaggcaagcccccac 5005992  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5005993 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 5006092  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  5006093 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaa 5006134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24592565 - 24592291
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  24592565 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 24592466  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  24592465 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatat 24592366  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcc 327  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||    
T  24592365 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcc 24592291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Original strand, 6569933 - 6570114
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  6569933 cagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctt 6570032  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6570033 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 6570114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Original strand, 30753834 - 30754015
Alignment:
Q  113 cagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggcct 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  30753834 cagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcct 30753933  T
Q  213 tgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||  || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30753934 taggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 30754015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 354
Target Start/End: Original strand, 24112681 - 24112983
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||     
T  24112681 tgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctcca 24112780  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    || || || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||| |||| |||||| ||||||| |    
T  24112781 ccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtaca 24112880  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgat 351  Q
    | ||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |   || |||||||| |||||||| || ||| | ||| |||| || || |||||    
T  24112881 tcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 24112980  T
Q  352 tga 354  Q
    |||    
T  24112981 tga 24112983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 34189212 - 34188910
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||     
T  34189212 tgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctcca 34189113  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    || || || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||| |||| |||||| ||||||| |    
T  34189112 ccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtaca 34189013  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgat 351  Q
    | ||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |   || |||||||| |||||||| || ||| | ||| |||| || || |||||    
T  34189012 tcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34188913  T
Q  352 tga 354  Q
    |||    
T  34188912 tga 34188910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 36344757 - 36344433
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  36344757 acttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 36344658  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || || |||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  36344657 tgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 36344558  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtat 361  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || || || ||||| ||||||| |    
T  36344557 gctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 36344458  T
Q  362 gaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    || ||||| || | ||| |||||||    
T  36344457 gaggaagctcctagacttgatgtcc 36344433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 294
Target Start/End: Original strand, 54833416 - 54833648
Alignment:
Q  62 acttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgt 161  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||    
T  54833416 acttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgt 54833515  T
Q  162 taccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagag 261  Q
    | || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||     
T  54833516 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 54833615  T
Q  262 gcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54833616 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 54833648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 17014020 - 17014353
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  17014020 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccaaagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 17014119  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || || |||||  |  | || ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  17014120 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatat 17014219  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  17014220 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 17014319  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  17014320 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 17014353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 384
Target Start/End: Original strand, 1900364 - 1900608
Alignment:
Q  140 ggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatg 239  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  |  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||||||  | || ||      
T  1900364 ggtaagcctccacctgatccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctaca 1900463  T
Q  240 ctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgc 339  Q
    |||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||| | |   ||| |||||||||| |||||||||||  | ||  ||||    
T  1900464 ctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatgtcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgc 1900563  T
Q  340 agtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgt 384  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  1900564 tgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgt 1900608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 294
Target Start/End: Original strand, 15227953 - 15228131
Alignment:
Q  116 agaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgg 215  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||    
T  15227953 agagggcactgtacaaccagacagggtaagcctccacctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 15228052  T
Q  216 gtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    |||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||  ||| ||| |||||||| |||||| | || ||||||||    
T  15228053 gtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaa 15228131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15391508 - 15391316
Alignment:
Q  134 aggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggt 233  Q
    |||||||| |||||||| ||  | ||||| || || ||||| ||| |||| |||||||| || || ||||| || ||  |||| || ||||||||  | |    
T  15391508 aggcaggggaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggat 15391409  T
Q  234 gttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttc 326  Q
    |||| ||||| ||||| |||||  ||| ||| |||||  | |||||| | ||||||||||||| |   |||||||| ||||| ||||||||||    
T  15391408 gttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttc 15391316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7490 - 7249
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  7490 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 7391  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7390 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 7291  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  7290 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 7249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15181 - 14940
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||| | |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  15181 gctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 15082  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15081 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 14982  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  14981 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 14940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 294
Target Start/End: Original strand, 9570 - 9812
Alignment:
Q  52 tgctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccg 151  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  9570 tgctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccccca 9669  T
Q  152 ccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  9670 cctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtata 9769  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9770 ttgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaa 9812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9317 - 9076
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  9317 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 9218  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9217 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 9118  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  9117 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 9076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Original strand, 20020 - 20261
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  20020 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 20119  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20120 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 20219  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
     ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  20220 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 20261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 294
Target Start/End: Original strand, 30502 - 30698
Alignment:
Q  98 cttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgact 197  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||  |  ||||||| || |||||||    
T  30502 cttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgact 30601  T
Q  198 ttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30602 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 30698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 384
Target Start/End: Original strand, 20477 - 20723
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  20477 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 20576  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    | ||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||||  | ||  |    
T  20577 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 20675  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgt 384  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||    
T  20676 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgt 20723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 357
Target Start/End: Original strand, 27297 - 27601
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  27297 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 27396  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  27397 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 27496  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  27497 cgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 27596  T
Q  353 gaagt 357  Q
    |||||    
T  27597 gaagt 27601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26453 - 26211
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  26453 gctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 26354  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttc-gtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtata 251  Q
    | |||||||| || |||| | ||| |  |||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  26353 ctgatccgttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtata 26254  T
Q  252 ttgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    | ||  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  26253 tcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaa 26211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 47236 - 46903
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  47236 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 47137  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||||||||    
T  47136 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatat 47037  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  47036 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 46937  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  46936 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 46903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 328
Target Start/End: Original strand, 29768 - 30043
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  29768 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 29867  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||| || || || || ||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  29868 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 29967  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcca 328  Q
     ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || ||||||||||||    
T  29968 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttcca 30043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 40320 - 39987
Alignment:
Q  53 gctaggcctacttttcctccaatcccggttttgtatgctgatttacttccaacattgcttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 152  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  40320 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 40221  T
Q  153 cagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 252  Q
    | |||||||| || || |||||  |  | |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  40220 ctgatccgttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 40121  T
Q  253 tgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgatt 352  Q
     ||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| |||||     
T  40120 cgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 40021  T
Q  353 gaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgtcc 386  Q
    ||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||    
T  40020 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 294
Target Start/End: Original strand, 6080 - 6260
Alignment:
Q  116 agaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtga-ctttcatcagggggccttg 214  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||  |||||||| || |||||     
T  6080 agagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgcctta 6179  T
Q  215 ggtcacgatgttgagaggtgttatgc-tttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaa 294  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| ||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6180 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaa 6260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2084 - 1838
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  2084 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 1985  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    | ||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||||  | ||  |    
T  1984 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 1886  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactagatgt 384  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||    
T  1885 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgt 1838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 182 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 251 - 47
Alignment:
Q  182 gatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagc 281  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  251 gatctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 152  T
Q  282 tgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatactgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgcccaaactaga 381  Q
    ||||||||||||| | |   || |||||||| || |||||||||||| | ||| | || ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| || | ||| ||    
T  151 tgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 52  T
Q  382 tgtcc 386  Q
    |||||    
T  51 tgtcc 47  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2825 - 2588
Alignment:
Q  137 cagggtaagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgtt 236  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||| ||  | || |    
T  2825 cagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 2726  T
Q  237 atgctttaaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttccagaccatac 336  Q
    | ||||| ||||| |||||  ||| ||| ||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||  | ||  |    
T  2725 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 2626  T
Q  337 tgcagtaaacatgattgaagtgtatgaagaagcgccca 374  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  2625 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccca 2588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 327
Target Start/End: Original strand, 21683 - 21840
Alignment:
Q  170 aggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccagaggcttattg 269  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| || || ||||| |||||  |||| || ||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||    
T  21683 aggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgtaaagaagctcattg 21782  T
Q  270 atcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcc 327  Q
    | || |||||| | |||||| |||||| |   |||||||| ||||| |||||||||||    
T  21783 accagggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttcc 21840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 5
Alignment:
Q  143 aagcctccgccagatccgttaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgatgttgagaggtgttatgctt 242  Q
    |||||||| || |||||||| ||  | ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| || ||  ||||||| ||||||||  | || || ||||    
T  189 aagcctccacctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctt 90  T
Q  243 taaagtatattgtccagaggcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataatcctcttcc 327  Q
    | ||||| |||||  ||| ||| |||||||| |||||| | || || |||||||     ||||||||||| || |||||||||||    
T  89 tgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University