View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8890_low_65 (Length: 299)

Name: NF8890_low_65
Description: NF8890
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8890_low_65
NF8890_low_65
[»] chr7 (85 HSPs)
chr7 (17-283)||(14949112-14949378)
chr7 (17-283)||(11972402-11972668)
chr7 (17-283)||(32125397-32125663)
chr7 (17-283)||(41522823-41523089)
chr7 (17-283)||(41525285-41525551)
chr7 (17-283)||(15376703-15376969)
chr7 (17-283)||(21189585-21189851)
chr7 (17-283)||(456227-456493)
chr7 (17-283)||(16232426-16232692)
chr7 (17-283)||(16409965-16410231)
chr7 (17-283)||(20385113-20385379)
chr7 (17-283)||(11393277-11393543)
chr7 (17-283)||(24702144-24702410)
chr7 (17-283)||(27216766-27217032)
chr7 (17-283)||(18640178-18640444)
chr7 (17-283)||(24704594-24704857)
chr7 (17-283)||(44116414-44116681)
chr7 (17-283)||(20110461-20110718)
chr7 (17-281)||(3386240-3386503)
chr7 (17-283)||(38898366-38898634)
chr7 (21-283)||(13647236-13647501)
chr7 (17-283)||(26355973-26356253)
chr7 (17-283)||(26358425-26358705)
chr7 (85-283)||(18430686-18430884)
chr7 (17-279)||(13869251-13869515)
chr7 (17-283)||(17061905-17062171)
chr7 (17-230)||(48273297-48273512)
chr7 (17-273)||(3564319-3564577)
chr7 (17-273)||(18456368-18456625)
chr7 (83-283)||(16213656-16213856)
chr7 (17-273)||(9509097-9509355)
chr7 (36-260)||(24275089-24275320)
chr7 (14-273)||(12698736-12698998)
chr7 (37-237)||(13831299-13831499)
chr7 (17-273)||(38227388-38227646)
chr7 (17-273)||(10588944-10589204)
chr7 (17-279)||(26211903-26212168)
chr7 (127-283)||(12756661-12756817)
chr7 (17-279)||(2280068-2280330)
chr7 (17-279)||(34200693-34200954)
chr7 (33-273)||(15143993-15144230)
chr7 (17-207)||(16386268-16386461)
chr7 (17-273)||(40443299-40443555)
chr7 (17-230)||(67653-67868)
chr7 (37-169)||(28505357-28505492)
chr7 (17-279)||(10063772-10064032)
chr7 (38-279)||(19486693-19486937)
chr7 (17-161)||(11996095-11996241)
chr7 (17-140)||(15082017-15082138)
chr7 (37-283)||(16495329-16495574)
chr7 (24-133)||(14258175-14258286)
chr7 (17-161)||(47831714-47831860)
chr7 (17-161)||(15754955-15755101)
chr7 (17-158)||(27847901-27848043)
chr7 (17-269)||(16219677-16219926)
chr7 (17-161)||(811199-811341)
chr7 (17-269)||(16056241-16056488)
chr7 (17-269)||(18005559-18005806)
chr7 (78-229)||(22072882-22073036)
chr7 (17-89)||(18427438-18427510)
chr7 (17-161)||(44014091-44014231)
chr7 (17-94)||(13032666-13032744)
chr7 (204-283)||(15081939-15082019)
chr7 (130-279)||(12255740-12255892)
chr7 (195-279)||(15113031-15113114)
chr7 (37-118)||(16213550-16213632)
chr7 (195-279)||(15116568-15116651)
chr7 (17-273)||(1867950-1868202)
chr7 (17-273)||(15008454-15008707)
chr7 (93-169)||(18154901-18154980)
chr7 (17-154)||(12901233-12901369)
chr7 (17-273)||(20220145-20220395)
chr7 (17-154)||(14044660-14044792)
chr7 (17-154)||(14354690-14354822)
chr7 (112-213)||(14932749-14932851)
chr7 (112-213)||(15356184-15356286)
chr7 (112-213)||(15360298-15360400)
chr7 (17-52)||(16579482-16579517)
chr7 (17-52)||(16586146-16586181)
chr7 (83-166)||(2832504-2832588)
chr7 (81-169)||(18203789-18203873)
chr7 (17-52)||(16461127-16461162)
chr7 (112-166)||(19649552-19649606)
chr7 (112-169)||(12187019-12187076)
chr7 (112-169)||(17138120-17138177)
[»] chr6 (71 HSPs)
chr6 (17-283)||(18334582-18334848)
chr6 (17-283)||(2291170-2291436)
chr6 (17-283)||(19004952-19005218)
chr6 (17-283)||(24422453-24422719)
chr6 (17-283)||(33861700-33861966)
chr6 (17-283)||(19858909-19859175)
chr6 (17-283)||(33864184-33864450)
chr6 (17-283)||(26924630-26924896)
chr6 (17-283)||(8054935-8055201)
chr6 (17-283)||(12742223-12742489)
chr6 (17-283)||(1540901-1541167)
chr6 (17-283)||(1595455-1595721)
chr6 (24-283)||(22782139-22782399)
chr6 (15-283)||(20556884-20557151)
chr6 (17-283)||(25754716-25754981)
chr6 (17-281)||(3852009-3852272)
chr6 (17-283)||(25688407-25688674)
chr6 (17-283)||(16448516-16448781)
chr6 (37-283)||(34963292-34963545)
chr6 (38-283)||(30676700-30676952)
chr6 (17-273)||(25629310-25629568)
chr6 (17-270)||(29060447-29060703)
chr6 (17-273)||(20593681-20593939)
chr6 (17-273)||(19303496-19303753)
chr6 (17-256)||(17287768-17288009)
chr6 (17-273)||(20360915-20361174)
chr6 (17-273)||(18409782-18410044)
chr6 (127-283)||(18456735-18456891)
chr6 (18-256)||(22780199-22780439)
chr6 (101-279)||(25656619-25656797)
chr6 (17-273)||(20076608-20076862)
chr6 (19-258)||(20638253-20638495)
chr6 (127-263)||(18461895-18462031)
chr6 (17-169)||(25714325-25714478)
chr6 (17-279)||(28496424-28496685)
chr6 (17-279)||(29808835-29809096)
chr6 (69-273)||(16496204-16496410)
chr6 (37-283)||(19847939-19848194)
chr6 (17-279)||(20109048-20109312)
chr6 (39-279)||(8227460-8227703)
chr6 (79-273)||(25644295-25644487)
chr6 (17-133)||(19773818-19773936)
chr6 (21-269)||(23019320-23019567)
chr6 (127-273)||(18821801-18821946)
chr6 (17-258)||(35245493-35245735)
chr6 (17-161)||(1561210-1561356)
chr6 (17-161)||(19652107-19652248)
chr6 (17-155)||(22080799-22080936)
chr6 (18-169)||(22831412-22831565)
chr6 (17-109)||(22805656-22805749)
chr6 (19-161)||(16920698-16920841)
chr6 (17-222)||(19668284-19668488)
chr6 (17-161)||(11185421-11185558)
chr6 (37-220)||(23992349-23992540)
chr6 (21-169)||(4185880-4186023)
chr6 (17-206)||(25603406-25603603)
chr6 (17-206)||(25611744-25611941)
chr6 (111-169)||(27333277-27333336)
chr6 (111-169)||(27394017-27394076)
chr6 (16-169)||(9098573-9098715)
chr6 (21-160)||(4738626-4738759)
chr6 (38-161)||(31155465-31155582)
chr6 (21-160)||(4186286-4186419)
chr6 (92-149)||(19008787-19008843)
chr6 (135-262)||(15041516-15041644)
chr6 (129-169)||(33443068-33443108)
chr6 (17-55)||(13019402-13019439)
chr6 (112-166)||(18907111-18907165)
chr6 (112-166)||(19862978-19863032)
chr6 (112-166)||(19873120-19873174)
chr6 (112-169)||(21766695-21766752)
[»] chr3 (89 HSPs)
chr3 (17-283)||(34159232-34159498)
chr3 (17-283)||(16454271-16454537)
chr3 (17-283)||(17463084-17463350)
chr3 (17-283)||(13151780-13152047)
chr3 (17-283)||(13154245-13154512)
chr3 (17-283)||(8899000-8899266)
chr3 (17-283)||(28848601-28848867)
chr3 (17-283)||(45606897-45607163)
chr3 (17-283)||(7781337-7781603)
chr3 (17-283)||(16282801-16283067)
chr3 (17-283)||(17446645-17446910)
chr3 (17-283)||(9707597-9707863)
chr3 (17-283)||(10247713-10247979)
chr3 (17-273)||(29172583-29172840)
chr3 (17-283)||(38961881-38962148)
chr3 (17-283)||(6469124-6469386)
chr3 (37-283)||(55476417-55476663)
chr3 (25-283)||(41123804-41124059)
chr3 (17-242)||(15977418-15977646)
chr3 (17-222)||(55500848-55501053)
chr3 (17-283)||(50242729-50242994)
chr3 (14-273)||(14972759-14973020)
chr3 (17-283)||(12119714-12119982)
chr3 (17-279)||(8499423-8499687)
chr3 (17-279)||(15412334-15412598)
chr3 (14-273)||(40213676-40213936)
chr3 (17-283)||(43550468-43550737)
chr3 (37-283)||(12567479-12567732)
chr3 (37-283)||(13543944-13544197)
chr3 (17-273)||(17487764-17488022)
chr3 (17-273)||(17499246-17499504)
chr3 (17-253)||(21618354-21618590)
chr3 (17-253)||(36166503-36166739)
chr3 (17-273)||(24153164-24153421)
chr3 (17-273)||(25476340-25476598)
chr3 (17-273)||(23083316-23083574)
chr3 (17-273)||(43840840-43841098)
chr3 (17-273)||(26686795-26687053)
chr3 (17-273)||(13442182-13442440)
chr3 (18-273)||(20698391-20698648)
chr3 (17-273)||(11424718-11424972)
chr3 (17-214)||(10556890-10557088)
chr3 (17-273)||(18438441-18438700)
chr3 (17-279)||(27165155-27165419)
chr3 (17-164)||(45577947-45578094)
chr3 (111-281)||(17672626-17672796)
chr3 (17-258)||(12399117-12399360)
chr3 (127-283)||(53070643-53070799)
chr3 (17-279)||(24340672-24340937)
chr3 (34-279)||(53301499-53301747)
chr3 (17-210)||(44494716-44494908)
chr3 (17-273)||(14576788-14577043)
chr3 (17-209)||(17737143-17737337)
chr3 (17-254)||(14572499-14572735)
chr3 (17-169)||(28194600-28194752)
chr3 (17-279)||(23274594-23274859)
chr3 (17-222)||(13210333-13210541)
chr3 (38-279)||(37642214-37642458)
chr3 (126-273)||(42386428-42386576)
chr3 (17-222)||(12510958-12511172)
chr3 (17-269)||(15470836-15471085)
chr3 (17-279)||(52523676-52523937)
chr3 (39-279)||(22147474-22147717)
chr3 (17-279)||(16097240-16097499)
chr3 (17-236)||(30029740-30029968)
chr3 (17-269)||(14234391-14234648)
chr3 (37-236)||(46822187-46822394)
chr3 (17-169)||(9512834-9512982)
chr3 (17-169)||(9520809-9520957)
chr3 (17-169)||(49668135-49668283)
chr3 (17-279)||(16103694-16103950)
chr3 (17-233)||(32307591-32307802)
chr3 (17-279)||(12174212-12174458)
chr3 (189-279)||(2051148-2051238)
chr3 (17-273)||(22110307-22110560)
chr3 (227-283)||(17248231-17248287)
chr3 (17-273)||(37251123-37251376)
chr3 (17-271)||(43925872-43926123)
chr3 (17-169)||(1644733-1644880)
chr3 (93-169)||(14665380-14665458)
chr3 (112-169)||(856140-856197)
chr3 (112-169)||(23077537-23077594)
chr3 (129-169)||(13919350-13919390)
chr3 (93-166)||(14668536-14668611)
chr3 (81-154)||(606401-606470)
chr3 (112-166)||(15878114-15878168)
chr3 (17-50)||(10542621-10542654)
chr3 (93-166)||(11862772-11862847)
chr3 (112-160)||(26196500-26196548)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (17-283)||(20653-20919)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (17-283)||(94317-94583)
scaffold0023 (17-270)||(44360-44614)
scaffold0023 (115-283)||(17430-17598)
scaffold0023 (17-169)||(119783-119937)
scaffold0023 (17-269)||(100287-100534)
scaffold0023 (17-269)||(40135-40382)
scaffold0023 (17-161)||(101413-101552)
scaffold0023 (38-166)||(38542-38672)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (17-283)||(5853282-5853548)
chr8 (17-283)||(1484308-1484574)
chr8 (17-283)||(20403133-20403399)
chr8 (17-283)||(4542363-4542629)
chr8 (25-283)||(22001667-22001925)
chr8 (17-283)||(15203221-15203487)
chr8 (17-283)||(20046185-20046451)
chr8 (17-283)||(19896171-19896440)
chr8 (17-283)||(14823680-14823945)
chr8 (17-283)||(41598094-41598360)
chr8 (17-283)||(45290684-45290952)
chr8 (17-283)||(14409434-14409701)
chr8 (37-283)||(4483207-4483452)
chr8 (17-273)||(16092297-16092555)
chr8 (17-253)||(26225268-26225504)
chr8 (17-279)||(25484269-25484523)
chr8 (17-253)||(26219622-26219858)
chr8 (17-273)||(6759167-6759421)
chr8 (37-283)||(16413306-16413547)
chr8 (17-273)||(18818364-18818622)
chr8 (17-273)||(23406287-23406547)
chr8 (17-260)||(7372686-7372931)
chr8 (17-273)||(28648999-28649261)
chr8 (17-273)||(22874973-22875230)
chr8 (17-273)||(20536116-20536374)
chr8 (25-256)||(21923900-21924133)
chr8 (17-273)||(21918955-21919213)
chr8 (37-283)||(26223841-26224091)
chr8 (84-283)||(19936995-19937194)
chr8 (17-273)||(22626643-22626901)
chr8 (17-273)||(18879191-18879442)
chr8 (17-279)||(13597566-13597831)
chr8 (17-279)||(13508034-13508299)
chr8 (127-283)||(19801372-19801527)
chr8 (17-273)||(31971164-31971421)
chr8 (17-279)||(17612059-17612324)
chr8 (124-270)||(15070571-15070718)
chr8 (17-207)||(45131019-45131209)
chr8 (17-207)||(16199666-16199857)
chr8 (17-273)||(23648455-23648719)
chr8 (17-279)||(5866227-5866487)
chr8 (17-158)||(21255130-21255272)
chr8 (17-279)||(21490902-21491163)
chr8 (17-279)||(17140824-17141084)
chr8 (17-269)||(38855212-38855462)
chr8 (17-158)||(21249292-21249434)
chr8 (17-222)||(21389458-21389663)
chr8 (17-222)||(21778784-21778989)
chr8 (17-222)||(6520276-6520483)
chr8 (21-222)||(21395988-21396189)
chr8 (21-222)||(21790481-21790682)
chr8 (17-279)||(20498475-20498734)
chr8 (17-169)||(23760903-23761053)
chr8 (17-269)||(21285508-21285758)
chr8 (37-236)||(32121654-32121861)
chr8 (37-115)||(22965628-22965707)
chr8 (17-161)||(26355766-26355907)
chr8 (17-169)||(983465-983614)
chr8 (17-269)||(21673617-21673864)
chr8 (224-283)||(24486034-24486093)
chr8 (81-236)||(18678094-18678256)
chr8 (17-273)||(17266948-17267202)
chr8 (81-273)||(37116324-37116514)
chr8 (234-283)||(32810054-32810103)
chr8 (81-273)||(17439461-17439651)
chr8 (81-271)||(24352997-24353184)
chr8 (17-65)||(19937195-19937243)
[»] chr5 (67 HSPs)
chr5 (17-283)||(10732930-10733196)
chr5 (17-283)||(42245355-42245621)
chr5 (17-283)||(29329840-29330106)
chr5 (17-283)||(264758-265024)
chr5 (17-283)||(20908918-20909184)
chr5 (17-283)||(29345886-29346152)
chr5 (17-283)||(32027299-32027565)
chr5 (17-283)||(2154603-2154870)
chr5 (17-283)||(29348359-29348625)
chr5 (17-283)||(29350832-29351098)
chr5 (17-283)||(39245042-39245308)
chr5 (37-283)||(39363310-39363556)
chr5 (17-283)||(11581189-11581456)
chr5 (17-278)||(10775670-10775933)
chr5 (17-283)||(20917942-20918203)
chr5 (17-281)||(36154775-36155037)
chr5 (36-283)||(20901998-20902248)
chr5 (17-283)||(18319023-18319288)
chr5 (17-283)||(31060975-31061241)
chr5 (17-283)||(24067015-24067280)
chr5 (17-279)||(23064416-23064680)
chr5 (17-273)||(23390451-23390709)
chr5 (17-253)||(22412092-22412329)
chr5 (17-273)||(24529128-24529386)
chr5 (18-269)||(38619337-38619593)
chr5 (17-215)||(21997547-21997747)
chr5 (17-273)||(9077860-9078118)
chr5 (17-273)||(1096374-1096633)
chr5 (17-273)||(24493476-24493734)
chr5 (21-273)||(25421443-25421698)
chr5 (17-273)||(25431302-25431560)
chr5 (17-273)||(13025218-13025476)
chr5 (17-273)||(13095402-13095660)
chr5 (17-273)||(8286797-8287057)
chr5 (17-273)||(21808344-21808602)
chr5 (40-273)||(21729019-21729255)
chr5 (17-273)||(22074928-22075185)
chr5 (17-169)||(19660894-19661048)
chr5 (17-170)||(20806845-20806997)
chr5 (17-256)||(37723811-37724050)
chr5 (17-207)||(21292992-21293182)
chr5 (19-279)||(21565456-21565713)
chr5 (39-279)||(40725782-40726025)
chr5 (17-273)||(22143960-22144215)
chr5 (37-169)||(36314504-36314639)
chr5 (17-169)||(21329556-21329706)
chr5 (17-269)||(26011995-26012246)
chr5 (17-161)||(19668807-19668951)
chr5 (17-169)||(22959591-22959739)
chr5 (37-236)||(17517193-17517400)
chr5 (78-269)||(21502116-21502308)
chr5 (17-222)||(20026945-20027149)
chr5 (17-273)||(22178175-22178428)
chr5 (166-253)||(20766095-20766181)
chr5 (17-169)||(26740705-26740852)
chr5 (17-154)||(27989004-27989137)
chr5 (118-206)||(18418590-18418678)
chr5 (112-166)||(26704075-26704129)
chr5 (112-166)||(26973808-26973862)
chr5 (42-133)||(22107709-22107802)
chr5 (44-169)||(26732892-26733014)
chr5 (17-65)||(14047990-14048038)
chr5 (37-88)||(18418528-18418580)
chr5 (112-169)||(22032323-22032380)
chr5 (183-279)||(18356389-18356485)
chr5 (112-207)||(21873254-21873350)
chr5 (17-65)||(41095699-41095746)
[»] chr4 (68 HSPs)
chr4 (17-283)||(12297-12563)
chr4 (17-282)||(50222330-50222595)
chr4 (17-283)||(15118342-15118608)
chr4 (17-283)||(44615194-44615460)
chr4 (17-283)||(52312416-52312682)
chr4 (17-283)||(18239409-18239675)
chr4 (17-283)||(44773077-44773343)
chr4 (17-283)||(1837499-1837765)
chr4 (17-283)||(18215264-18215531)
chr4 (17-283)||(15355314-15355582)
chr4 (17-279)||(44928873-44929137)
chr4 (17-283)||(7641182-7641438)
chr4 (17-283)||(51463858-51464123)
chr4 (38-281)||(44102140-44102384)
chr4 (17-283)||(23803255-23803520)
chr4 (17-283)||(12610857-12611115)
chr4 (17-253)||(54798729-54798967)
chr4 (17-273)||(16377478-16377734)
chr4 (17-283)||(15402611-15402879)
chr4 (84-279)||(19242673-19242867)
chr4 (21-283)||(15367602-15367866)
chr4 (17-283)||(15369926-15370193)
chr4 (17-283)||(15371110-15371378)
chr4 (83-283)||(3514979-3515179)
chr4 (17-273)||(7798682-7798940)
chr4 (37-283)||(19618162-19618415)
chr4 (17-283)||(15373391-15373659)
chr4 (37-283)||(14970697-14970950)
chr4 (17-283)||(20149737-20150002)
chr4 (17-273)||(22636343-22636601)
chr4 (21-283)||(16223444-16223708)
chr4 (17-273)||(7893610-7893869)
chr4 (17-229)||(14280221-14280434)
chr4 (17-220)||(52873375-52873580)
chr4 (17-273)||(14038564-14038814)
chr4 (25-253)||(8574844-8575072)
chr4 (17-273)||(12902665-12902923)
chr4 (17-273)||(16270191-16270449)
chr4 (17-273)||(44052737-44052995)
chr4 (17-271)||(16239927-16240183)
chr4 (127-283)||(21815575-21815731)
chr4 (64-273)||(7088832-7089043)
chr4 (27-273)||(6899808-6900056)
chr4 (17-193)||(3096201-3096379)
chr4 (17-273)||(23374314-23374566)
chr4 (37-283)||(22353760-22354009)
chr4 (17-169)||(15551725-15551879)
chr4 (17-279)||(13800-14059)
chr4 (17-207)||(14053323-14053514)
chr4 (17-279)||(43198502-43198760)
chr4 (17-169)||(17046395-17046549)
chr4 (17-161)||(39706356-39706502)
chr4 (78-279)||(52243143-52243343)
chr4 (37-169)||(8846287-8846418)
chr4 (17-273)||(46640411-46640663)
chr4 (17-233)||(12773922-12774132)
chr4 (182-271)||(15464888-15464977)
chr4 (17-222)||(12288214-12288418)
chr4 (17-121)||(14927842-14927946)
chr4 (81-273)||(53082107-53082296)
chr4 (17-61)||(29267526-29267570)
chr4 (127-262)||(6190481-6190618)
chr4 (17-109)||(14157762-14157854)
chr4 (17-109)||(14164467-14164559)
chr4 (207-279)||(8846472-8846543)
chr4 (129-169)||(17333298-17333338)
chr4 (17-65)||(19242624-19242672)
chr4 (93-166)||(20157522-20157597)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (17-283)||(18808849-18809115)
chr2 (17-283)||(23135496-23135762)
chr2 (17-283)||(23712003-23712269)
chr2 (17-283)||(39682219-39682485)
chr2 (17-283)||(24905622-24905889)
chr2 (17-283)||(24908097-24908364)
chr2 (17-283)||(26505285-26505551)
chr2 (17-283)||(26507763-26508029)
chr2 (17-283)||(24898185-24898452)
chr2 (17-283)||(24900668-24900935)
chr2 (17-283)||(24903145-24903412)
chr2 (17-283)||(23709522-23709788)
chr2 (17-283)||(571303-571569)
chr2 (17-283)||(6725901-6726167)
chr2 (17-283)||(21155050-21155316)
chr2 (17-283)||(32039488-32039754)
chr2 (17-283)||(45029844-45030110)
chr2 (17-283)||(24367679-24367946)
chr2 (17-283)||(28577005-28577271)
chr2 (37-283)||(23130788-23131034)
chr2 (37-283)||(23133255-23133501)
chr2 (37-283)||(34402512-34402758)
chr2 (17-283)||(24529518-24529786)
chr2 (17-281)||(43137205-43137469)
chr2 (17-283)||(22105319-22105585)
chr2 (17-278)||(38967280-38967542)
chr2 (37-283)||(32214911-32215164)
chr2 (17-273)||(23060420-23060679)
chr2 (17-273)||(23076349-23076608)
chr2 (17-189)||(24643034-24643207)
chr2 (18-273)||(22731189-22731446)
chr2 (17-273)||(22337031-22337281)
chr2 (17-273)||(22738135-22738392)
chr2 (26-273)||(23659940-23660188)
chr2 (17-283)||(19671737-19672005)
chr2 (17-273)||(298769-299026)
chr2 (17-169)||(23040249-23040403)
chr2 (24-273)||(23654341-23654592)
chr2 (17-169)||(8946564-8946718)
chr2 (25-207)||(38136-38321)
chr2 (64-273)||(23285820-23286027)
chr2 (17-258)||(20309016-20309257)
chr2 (25-256)||(23103369-23103600)
chr2 (17-159)||(23072019-23072162)
chr2 (78-279)||(23708568-23708769)
chr2 (17-273)||(7688-7941)
chr2 (196-283)||(24642846-24642933)
chr2 (17-120)||(21900562-21900667)
chr2 (37-236)||(25616107-25616314)
chr2 (17-229)||(28405890-28406099)
chr2 (17-161)||(18786971-18787111)
chr2 (17-229)||(25175763-25175972)
chr2 (17-169)||(7679489-7679647)
chr2 (17-169)||(22134266-22134419)
chr2 (17-273)||(23207190-23207443)
chr2 (81-273)||(20520148-20520337)
chr2 (17-273)||(22413091-22413345)
chr2 (203-279)||(22459511-22459587)
chr2 (234-283)||(22173819-22173868)
chr2 (20-273)||(23791189-23791440)
chr2 (127-262)||(32451894-32452031)
chr2 (189-273)||(24697561-24697644)
chr2 (129-169)||(23287384-23287424)
chr2 (129-169)||(26392403-26392443)
chr2 (17-55)||(23713058-23713095)
chr2 (81-263)||(23004725-23004905)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (17-283)||(136586-136852)
scaffold0028 (17-283)||(139055-139321)
scaffold0028 (17-283)||(143993-144259)
scaffold0028 (17-283)||(134117-134383)
scaffold0028 (17-283)||(141524-141790)
scaffold0028 (17-233)||(132572-132784)
scaffold0028 (126-269)||(62216-62355)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (17-283)||(13988772-13989038)
chr1 (17-283)||(21923281-21923547)
chr1 (17-283)||(21475077-21475343)
chr1 (17-279)||(23593729-23593991)
chr1 (17-279)||(29298043-29298304)
chr1 (17-283)||(31612218-31612485)
chr1 (17-283)||(22123057-22123324)
chr1 (17-283)||(29776593-29776860)
chr1 (36-283)||(21346885-21347134)
chr1 (17-281)||(21707072-21707337)
chr1 (17-281)||(21711614-21711879)
chr1 (37-283)||(13212851-13213099)
chr1 (17-279)||(45574836-45575101)
chr1 (17-273)||(34509688-34509946)
chr1 (36-283)||(21342021-21342269)
chr1 (37-283)||(21840686-21840939)
chr1 (17-283)||(40389062-40389327)
chr1 (50-279)||(432950-433178)
chr1 (36-279)||(16361835-16362085)
chr1 (20-283)||(16275353-16275616)
chr1 (17-273)||(50210168-50210430)
chr1 (17-273)||(22532177-22532435)
chr1 (17-273)||(27250684-27250942)
chr1 (84-283)||(15859998-15860197)
chr1 (17-209)||(20847173-20847367)
chr1 (17-271)||(20135089-20135351)
chr1 (22-273)||(22468651-22468910)
chr1 (17-279)||(33680919-33681178)
chr1 (37-283)||(14295500-14295745)
chr1 (17-279)||(21896205-21896464)
chr1 (17-118)||(27161617-27161719)
chr1 (17-169)||(38801447-38801600)
chr1 (78-273)||(21026649-21026846)
chr1 (81-279)||(21861519-21861714)
chr1 (17-269)||(22237539-22237788)
chr1 (37-169)||(20454613-20454752)
chr1 (17-273)||(35261036-35261286)
chr1 (17-233)||(21753959-21754170)
chr1 (20-161)||(52928038-52928176)
chr1 (17-109)||(21477549-21477643)
chr1 (25-279)||(16758570-16758822)
chr1 (17-269)||(22921830-22922077)
chr1 (17-273)||(41049991-41050244)
chr1 (17-161)||(20248193-20248332)
chr1 (21-183)||(21161635-21161792)
chr1 (17-273)||(50686525-50686778)
chr1 (17-154)||(16368361-16368493)
chr1 (112-166)||(21714546-21714600)
chr1 (124-279)||(20918620-20918772)
chr1 (184-273)||(22354527-22354616)
chr1 (195-279)||(12271642-12271725)
chr1 (17-65)||(20916135-20916182)
chr1 (17-273)||(26064851-26065104)
chr1 (17-54)||(431664-431701)
chr1 (93-166)||(24783155-24783230)
chr1 (38-169)||(42865273-42865406)
chr1 (84-153)||(21533948-21534013)
chr1 (17-65)||(15860198-15860246)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (17-283)||(13298-13564)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (17-283)||(37727-37993)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (17-283)||(40306-40572)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (17-283)||(158440-158707)
scaffold0003 (17-273)||(339905-340160)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (17-283)||(13853-14119)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (17-283)||(11969-12230)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (17-283)||(9654-9922)
scaffold0145 (17-273)||(32849-33107)
scaffold0145 (17-273)||(38668-38926)
scaffold0145 (17-98)||(32383-32465)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (17-278)||(4119-4382)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (38-281)||(16710-16954)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (17-283)||(85569-85837)
scaffold0001 (37-283)||(501003-501256)
scaffold0001 (17-279)||(160596-160854)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (16-283)||(81977-82244)
scaffold0037 (17-279)||(22620-22878)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (17-283)||(13-278)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (34-283)||(2118-2369)
scaffold0247 (17-279)||(17976-18241)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (37-283)||(29856-30104)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (17-253)||(44682-44920)
scaffold0122 (115-273)||(26020-26179)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (17-282)||(161080-161347)
scaffold0007 (190-283)||(164580-164674)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (17-283)||(1270-1535)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (17-253)||(116334-116571)
scaffold0022 (84-273)||(128925-129111)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (83-283)||(4666-4866)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (37-283)||(10692-10945)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (37-283)||(9161-9414)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (17-273)||(4416-4673)
scaffold0228 (17-273)||(11998-12255)
scaffold0228 (17-273)||(21950-22207)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (17-273)||(16555-16813)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (17-273)||(3106-3363)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (17-273)||(1759-2017)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (25-273)||(13127-13377)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (17-273)||(51821-52079)
scaffold0011 (17-273)||(167934-168191)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (17-273)||(128659-128916)
scaffold0031 (127-279)||(20373-20524)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (37-282)||(11207-11459)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (37-283)||(12239-12492)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (17-272)||(16021-16278)
scaffold0120 (17-273)||(32913-33169)
scaffold0120 (17-273)||(45836-46092)
scaffold0120 (21-170)||(17388-17538)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (17-273)||(3141-3403)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (17-273)||(8488-8742)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (17-273)||(3378-3636)
scaffold0292 (17-273)||(252-508)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (84-273)||(22859-23048)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (17-273)||(17170-17434)
scaffold0056 (127-283)||(79274-79430)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (17-273)||(1004-1261)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (17-273)||(25803-26061)
scaffold0026 (18-273)||(39766-40023)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (25-273)||(39392-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (25-273)||(75170-75420)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (17-279)||(38651-38915)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (17-273)||(6076-6337)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (17-222)||(28321-28529)
scaffold0046 (17-161)||(4459-4605)
scaffold0046 (17-161)||(1904-2050)
scaffold0046 (69-222)||(11252-11407)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (17-273)||(39821-40078)
scaffold0080 (17-273)||(19840-20093)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (114-281)||(4300-4467)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (17-273)||(4757-5015)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (17-256)||(8389-8628)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (17-169)||(15298-15451)
scaffold0106 (21-169)||(1201-1351)
scaffold0106 (37-161)||(7193-7319)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (17-169)||(121674-121827)
scaffold0021 (17-256)||(174674-174913)
scaffold0021 (17-117)||(136491-136592)
scaffold0021 (17-117)||(145199-145300)
scaffold0021 (197-273)||(124675-124751)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (17-258)||(1860-2103)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (17-169)||(4893-5046)
scaffold0395 (184-273)||(918-1006)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (17-198)||(4620-4803)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (17-164)||(181-329)
scaffold0175 (17-279)||(34031-34291)
scaffold0175 (173-273)||(13158-13258)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (17-273)||(31975-32230)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (17-279)||(11371-11636)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (17-279)||(38205-38470)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (17-258)||(10395-10637)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (17-279)||(15571-15829)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (17-207)||(11464-11657)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (17-207)||(13404-13596)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (17-280)||(27697-27957)
scaffold0165 (38-133)||(3442-3539)
scaffold0165 (38-133)||(7506-7603)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (17-273)||(20817-21077)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (17-258)||(4426-4675)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (17-207)||(15485-15677)
scaffold0114 (112-169)||(7295-7352)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (17-161)||(46903-47048)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (17-279)||(8379-8640)
scaffold0621 (17-269)||(6445-6695)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (17-280)||(16048-16308)
scaffold0357 (127-280)||(13147-13302)
scaffold0357 (81-154)||(2638-2707)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (17-135)||(32068-32188)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (17-279)||(10491-10750)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (17-279)||(45742-46001)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (17-161)||(5196-5341)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (17-161)||(1102-1247)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (17-161)||(6519-6664)
scaffold0333 (17-161)||(13899-14044)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (37-283)||(1018-1263)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (17-154)||(1124-1262)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (17-144)||(27783-27913)
scaffold0130 (188-273)||(27911-27996)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (17-269)||(19175-19424)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (17-279)||(53498-53757)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (17-269)||(40-290)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (17-161)||(2713-2852)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (17-161)||(15845-15990)
scaffold0020 (112-166)||(178898-178952)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (17-279)||(12481-12739)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (17-269)||(32446-32696)
scaffold0034 (127-273)||(51839-51985)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (17-135)||(2494-2613)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (17-169)||(23942-24092)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (37-169)||(51509-51644)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (17-269)||(14658-14907)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (18-222)||(16191-16395)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (126-273)||(24257-24406)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (17-269)||(129817-130066)
scaffold0010 (81-273)||(60670-60860)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (17-229)||(2805-3013)
scaffold0628 (17-53)||(3280-3315)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (173-273)||(3485-3585)
scaffold0327 (112-166)||(289-343)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (17-233)||(32012-32224)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (17-209)||(946-1134)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (17-269)||(5556-5803)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (195-268)||(13092-13165)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (17-269)||(10438-10688)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (93-161)||(6191-6259)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (17-279)||(6730-6980)
scaffold0556 (182-269)||(8090-8176)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (17-279)||(8008-8268)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (17-161)||(12674-12819)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (21-222)||(12855-13054)
scaffold0138 (200-273)||(18193-18265)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (17-161)||(997-1135)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (17-160)||(28839-28977)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (182-279)||(225482-225578)
scaffold0012 (17-109)||(225362-225455)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (127-187)||(11982-12042)
scaffold0503 (217-281)||(12039-12103)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (17-269)||(8033-8281)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (44-273)||(96944-97172)
scaffold0006 (44-273)||(106222-106450)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (17-169)||(30244-30392)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (127-273)||(6238-6386)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (112-166)||(23843-23897)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (17-154)||(103706-103839)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (81-273)||(267637-267826)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (112-161)||(36454-36503)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (123-283)||(25121-25282)
scaffold0123 (189-273)||(620-702)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (131-273)||(38339-38483)
scaffold0139 (112-161)||(19980-20029)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (17-153)||(1874-2006)
scaffold0737 (189-273)||(1753-1835)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (17-55)||(6508-6546)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (234-283)||(6070-6119)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (173-258)||(6676-6761)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (17-58)||(20916-20957)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (94-166)||(193039-193112)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (17-60)||(10204-10247)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (112-213)||(29558-29660)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (112-166)||(159-213)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (112-166)||(21866-21920)
scaffold0210 (112-166)||(29758-29812)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (112-166)||(69794-69848)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (112-169)||(1881-1938)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (112-169)||(10582-10639)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (83-158)||(4875-4954)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (189-269)||(88-167)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (129-169)||(206584-206624)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 85)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14949378 - 14949112
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949378 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 14949279  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949278 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 14949179  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949178 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 14949112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 11972402 - 11972668
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972402 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 11972501  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972502 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 11972601  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11972602 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 11972668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 32125397 - 32125663
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125397 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 32125496  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125497 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 32125596  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32125597 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 32125663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 41522823 - 41523089
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522823 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 41522922  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522923 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 41523022  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41523023 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 41523089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 41525285 - 41525551
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525285 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 41525384  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525385 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 41525484  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41525485 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 41525551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15376969 - 15376703
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376969 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 15376870  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376869 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 15376770  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15376769 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 15376703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21189851 - 21189585
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189851 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 21189752  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189751 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 21189652  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21189651 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 21189585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 456227 - 456493
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456227 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 456326  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456327 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 456426  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  456427 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 456493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 16232426 - 16232692
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232426 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 16232525  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232526 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 16232625  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16232626 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 16232692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 16409965 - 16410231
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16409965 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacgtcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 16410064  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410065 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 16410164  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16410165 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcatagtataacaac 16410231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20385379 - 20385113
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385379 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 20385280  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385279 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 20385180  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20385179 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 20385113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11393543 - 11393277
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11393543 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaactccatca 11393444  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393443 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 11393344  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11393343 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 11393277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 24702144 - 24702410
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702144 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 24702243  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702244 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 24702343  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24702344 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 24702410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 27216766 - 27217032
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27216766 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 27216865  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27216866 tcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 27216965  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27216966 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 27217032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 18640178 - 18640444
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18640178 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgaactcttaatatcttaaatcgacaacctcttatatagtccaataatttggaccttcatca 18640277  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640278 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 18640377  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18640378 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 18640444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 24704594 - 24704857
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704594 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 24704693  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||    
T  24704694 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaa---caagacataataatatcaaatgcaagtc 24704790  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24704791 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 24704857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 44116414 - 44116681
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116414 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 44116513  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44116514 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 44116613  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44116614 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 44116681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 20110461 - 20110718
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110461 catcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 20110560  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110561 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc----------tatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 20110650  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20110651 caataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 20110718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 281
Target Start/End: Original strand, 3386240 - 3386503
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3386240 catcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatgaactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcatc 3386337  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3386338 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaatgcaagt 3386437  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataaca 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  3386438 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcacaatataaca 3386503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 38898634 - 38898366
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38898634 catcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcacc 38898535  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898534 atcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 38898435  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898434 caatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 38898366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 13647236 - 13647501
Alignment:
Q  21 aagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcatcat 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13647236 aagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcat 13647334  T
Q  118 cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
     || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647335 attcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 13647434  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13647435 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 13647501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26356253 - 26355973
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaa---tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 113  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26356253 catcaagccctcaactatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaaaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 26356154  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc-----------aacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataat 202  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |           |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26356153 tcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataataat 26356054  T
Q  203 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26356053 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 26355973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26358705 - 26358425
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaa---tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 113  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358705 catcaagccctcaactatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaaaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 26358606  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc-----------aacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataat 202  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |           |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26358605 tcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataataat 26358506  T
Q  203 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26358505 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 26358425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 85 - 283
Target Start/End: Original strand, 18430686 - 18430884
Alignment:
Q  85 cttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18430686 cttatataatccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatataaaa 18430785  T
Q  185 acagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430786 acatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 18430884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 13869251 - 13869515
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13869251 catcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcatc 13869350  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869351 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 13869450  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||||  || | ||||||||||||||||||| || |||||    
T  13869451 caatcaacgtctcaattattcaaagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataa 13869515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17062171 - 17061905
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17062171 catcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggatt-gacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttgaaacttcatc 17062073  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17062072 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactcagcagtatacaaaat-agcatgacataataatatcaaatgcaag 17061974  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17061973 tcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 17061905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Original strand, 48273297 - 48273512
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48273297 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttggaacttcatc 48273396  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48273397 atcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 48273496  T
Q  215 tcaacaacgtctcaat 230  Q
    |||||||| |||||||    
T  48273497 tcaacaacatctcaat 48273512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3564577 - 3564319
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3564577 catcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttagaacttcatc 3564478  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  3564477 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgtaag 3564378  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  3564377 tcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcaca 3564319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18456625 - 18456368
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456625 catcaagcccctaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 18456526  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18456525 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 18456427  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  18456426 tcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 18456368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 83 - 283
Target Start/End: Original strand, 16213656 - 16213856
Alignment:
Q  83 ctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16213656 ctcttatataatccaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaa 16213755  T
Q  183 aaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaa 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  16213756 aaacaacatgacataataatatcaaatccaagtcaacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaacataacaa 16213855  T
Q  283 c 283  Q
    |    
T  16213856 c 16213856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 9509097 - 9509355
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9509097 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 9509196  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  9509197 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaattgcaat 9509296  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  9509297 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcaca 9509355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 36 - 260
Target Start/End: Original strand, 24275089 - 24275320
Alignment:
Q  36 aaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca------tcttaatcaact 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||      ||||||||||||    
T  24275089 aaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacgtcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacataatcaacaacatcttaatcaact 24275188  T
Q  129 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275189 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 24275288  T
Q  229 attattcacatataattcaagtaatgcatata 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275289 attattcacatataattcaagtaatgcatata 24275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Original strand, 12698736 - 12698998
Alignment:
Q  14 ggacatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctta-acatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  12698736 ggacatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttagacatcttaattcaacaaccttttatataatccaataatttggaacatc 12698835  T
Q  113 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaaatg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  12698836 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaattg 12698935  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  12698936 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 12698998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Original strand, 13831299 - 13831499
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 135  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13831299 aatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaatttagaccg 13831397  T
Q  136 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13831398 actcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 13831497  T
Q  236 ac 237  Q
    ||    
T  13831498 ac 13831499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 38227388 - 38227646
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  38227388 catcaagcccccaacaatgaaattctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaatttgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 38227487  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227488 catcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 38227586  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||| | |||  |||||||||||    
T  38227587 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatatcaca 38227646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 10588944 - 10589204
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaa--tgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttc 112  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  10588944 catcaagcccccaacaatgaatgctgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatc 10589043  T
Q  113 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 211  Q
    ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  10589044 atcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatcaattgc 10589143  T
Q  212 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    || |||||||| |||  | | |||| ||||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  10589144 aattcaacaacatcttcaatgttcaaatattcttcaagcaatgcataaac-attatatcaca 10589204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 26211903 - 26212168
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  26211903 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaagcaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 26212001  T
Q  115 cat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26212002 cattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgca 26212101  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    | |||||||| ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  26212102 attcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataa 26212168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 127 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756661
Alignment:
Q  127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 226  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataacaacagcaacacaacaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtct 12756718  T
Q  227 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12756717 caattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 12756661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2280330 - 2280068
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||| ||||| || | || ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  2280330 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacctcttagaaacaacgacctcttatataaattcaataatttggaacatcat 2280232  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |  |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2280231 catctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataataatatcaaatgca 2280135  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    | |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  2280134 aatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataa 2280068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 34200693 - 34200954
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  34200693 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatca 34200791  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 211  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||     
T  34200792 tcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgt 34200890  T
Q  212 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    || |||||||   |||||||| ||| |  ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  34200891 aaatcaacaa---ctcaatta-tcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 34200954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15144230 - 15143993
Alignment:
Q  33 atgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttag 131  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||    
T  15144230 atgaaatactaatgcatgaactcgacatcttaaacctctttaaacaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatct----caacttag 15144135  T
Q  132 accgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaatt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  15144134 accgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaacatctcaagt 15144035  T
Q  232 attcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    || ||   |||||| ||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15144034 atacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcaca 15143993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16386461 - 16386268
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  16386461 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 16386363  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 207  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  16386362 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 16386268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 40443299 - 40443555
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||    
T  40443299 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaaccttttatattagtccaataatttggaatatcat 40443397  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  40443398 catcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaac--aaacagcatgacataataatatcaatttca 40443495  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    | ||| |||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40443496 attcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcataaac-attatatcaca 40443555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Original strand, 67653 - 67868
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  67653 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 67751  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  67752 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 67850  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaat 230  Q
    | |||||||| |||||||    
T  67851 aatcaacaacatctcaat 67868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28505492 - 28505357
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  28505492 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcatcatcttagacc 28505393  T
Q  135 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28505392 gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 28505357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10064032 - 10063772
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttat-ataatccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||     
T  10064032 catcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttcattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaa 10063933  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    || ||| | | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |  | |||| | | |||| ||||| ||||||||||| ||  ||    
T  10063932 caccttcaacgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgc-acaacatcatgatataataatatcgaacaca 10063834  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||    
T  10063833 agtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaa-----acatatacaattatatcacattataa 10063772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19486937 - 19486693
Alignment:
Q  38 atgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 135  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| | | |||| |||||    
T  19486937 atgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccg 19486838  T
Q  136 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 233  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||||| |  |||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||| |||||| |||||| ||     
T  19486837 actcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataa 19486739  T
Q  234 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19486738 tcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataa 19486693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11996241 - 11996095
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  11996241 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatca 11996143  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11996142 tcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaa 11996095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15082138 - 15082017
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   ||    
T  15082138 catcaagccccaaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaact---tc 15082042  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactca 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15082041 atcttaatcaacttagaccgactca 15082017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Original strand, 16495329 - 16495574
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagacc 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  16495329 aatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagacc 16495428  T
Q  135 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaatta 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| || |||||||   ||||||||    
T  16495429 gactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaatta 16495524  T
Q  233 ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
     ||| |  ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16495525 -tcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataacaac 16495574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 133
Target Start/End: Original strand, 14258175 - 14258286
Alignment:
Q  24 cccccaacaa-tgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatctta 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  14258175 cccccaacaaatgaaatgctaatgtatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttc 14258274  T
Q  122 atcaacttagac 133  Q
    ||||||||||||    
T  14258275 atcaacttagac 14258286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 47831714 - 47831860
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctctta-tata-atccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  47831714 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaatatatatccaataatttggaacatca 47831812  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831813 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 47831860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15755101 - 15754955
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  15755101 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggattcgacctcttaaaacaacttaattcgacaatctcgtatattaatccaattatttggaacatca 15755003  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15755002 tcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15754955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27848043 - 27847901
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  27848043 catcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcggcaacctcttatactagtccaataatttggaacatcat 27847945  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 158  Q
    |||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27847944 catcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataa 27847901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16219926 - 16219677
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||| |||| | | |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  16219926 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacaacttagaacaacaacctcttatataagtcgaataatttggaacatcatc 16219828  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  16219827 atctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 16219732  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    |||| |||| ||| ||  | ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16219731 gtcatcaacatcttaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 16219677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 811341 - 811199
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  811341 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttatataagtccaataatttggaacatcat 811243  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811242 catc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 811199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 16056241 - 16056488
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||| ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  16056241 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacctcttagaaacaacaacctcttatataaatccaataatttggaac---at 16056336  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    | ||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| |  ||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  16056337 cttctt--tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgc--aaacaacatgatataacaatatcaaatgca 16056432  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    | |||||||| ||||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16056433 aatcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 16056488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 18005559 - 18005806
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||    
T  18005559 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatgaacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttata-agtccaataattcggaacatcatc 18005656  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||   ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  18005657 atc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtat-ggaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 18005752  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
     |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  18005753 atcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 18005806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 22072882 - 22073036
Alignment:
Q  78 acaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-ca 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||    
T  22072882 acaacctcttatatatatccaatagtttggaacatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 22072981  T
Q  175 gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 229  Q
     ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22072982 ctatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 22073036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Original strand, 18427438 - 18427510
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttat 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18427438 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttat 18427510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 44014091 - 44014231
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  44014091 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttata-agtccaataatttggaacatcatc 44014188  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014189 atc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 44014231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 94
Target Start/End: Original strand, 13032666 - 13032744
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataat 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13032666 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataat 13032744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 204 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15082019 - 15081939
Alignment:
Q  204 tcaaatgcaagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15082019 tcaaatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 15081939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255740
Alignment:
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||| ||||   |  ||||| |||| ||||||||||| || || ||||| |||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  227 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  12255792 caaacattcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataa 12255740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 279
Target Start/End: Original strand, 15113031 - 15113114
Alignment:
Q  195 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  15113031 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaat-attcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataa 15113114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 118
Target Start/End: Original strand, 16213550 - 16213632
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16213550 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaatgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatc 16213632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 279
Target Start/End: Original strand, 15116568 - 15116651
Alignment:
Q  195 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  15116568 ataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaat-attcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataa 15116651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1868202 - 1867950
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||| ||||||| || |  | ||||||||||||| | ||||||||||||||   |     
T  1868202 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataaattcaataatttggaac---aa 1868108  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatg 210  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |  |||||||  |||||||  ||||| |||| |||||| ||||    
T  1868107 catctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacaatatc-aatg 1868012  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| | |||||| ||||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1868011 caaatgaacaacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcaca 1867950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15008707 - 15008454
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||||||||||| || |    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15008707 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacattgacctcttatataaatccaataatttggaacatcat 15008609  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaac-agtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatg 210  Q
      |||| |||   || ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |   |||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||    
T  15008608 --tcttcatc---ttggaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaa-tg 15008516  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| ||||||||  |||||  || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15008515 caaatcaacaacacctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcaca 15008454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18154980 - 18154901
Alignment:
Q  93 atccaataatttggaacttca---tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    |||||||||||||||  ||||   ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18154980 atccaataatttggaggttcaacttcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaaca 18154901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 12901233 - 12901369
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaa-atcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  ||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||      
T  12901233 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagcaacaacgacctcttatataaatcctataatttggaacatcgg 12901331  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 154  Q
    | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12901332 cctctt--tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaa 12901369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20220395 - 20220145
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||| ||||||| || |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||   |     
T  20220395 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaac---aa 20220301  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatg 210  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||| |  ||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||||||    
T  20220300 catctt--tcatcttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatg 20220204  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| ||||||   ||||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20220203 caaatcaaca---tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaattatatcaca 20220145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 14044660 - 14044792
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||| ||||||| || |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||   |     
T  14044660 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaac---aa 14044754  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 154  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044755 catctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 14044792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Original strand, 14354690 - 14354822
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||| ||||||| || |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||   |     
T  14354690 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaac---aa 14354784  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 154  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354785 catctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 14354822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932749
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || |   ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 14932752  T
Q  211 caa 213  Q
    |||    
T  14932751 caa 14932749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356184
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || |   ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15356187  T
Q  211 caa 213  Q
    |||    
T  15356186 caa 15356184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360298
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || |   ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15360301  T
Q  211 caa 213  Q
    |||    
T  15360300 caa 15360298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 52
Target Start/End: Original strand, 16579482 - 16579517
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgga 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579482 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgga 16579517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 16586181 - 16586146
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgga 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16586181 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgga 16586146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2832588 - 2832504
Alignment:
Q  83 ctcttatataatccaataatttggaact--tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2832588 ctcttata-aatccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 2832504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 169
Target Start/End: Original strand, 18203789 - 18203873
Alignment:
Q  81 acctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18203789 acctcttatataaatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacaacaaca 18203873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 16461162 - 16461127
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgga 52  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16461162 catcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcatgga 16461127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649552
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 19649552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 169
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187076
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 12187076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138120
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 17138120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 71)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18334848 - 18334582
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334848 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 18334749  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334748 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 18334649  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334648 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 18334582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2291436 - 2291170
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291436 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 2291337  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291336 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 2291237  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291236 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 2291170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 19004952 - 19005218
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19004952 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 19005051  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005052 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 19005151  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19005152 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 19005218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 24422453 - 24422719
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422453 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 24422552  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422553 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 24422652  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24422653 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 24422719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 33861700 - 33861966
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861700 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 33861799  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861800 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 33861899  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33861900 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 33861966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19859175 - 19858909
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19859175 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatatagtccaataatttggaacttcatca 19859076  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859075 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 19858976  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19858975 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 19858909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 33864184 - 33864450
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864184 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 33864283  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864284 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 33864383  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33864384 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 33864450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26924896 - 26924630
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924896 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 26924797  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924796 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 26924697  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924696 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 26924630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 8054935 - 8055201
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8054935 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 8055034  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055035 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaaaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 8055134  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8055135 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 8055201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 12742223 - 12742489
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742223 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgaccttgtaatatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 12742322  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742323 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 12742422  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12742423 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 12742489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1541167 - 1540901
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1541167 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 1541068  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1541067 tcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaatgcaagtc 1540968  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1540967 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatataacaac 1540901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 1595455 - 1595721
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595455 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 1595554  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1595555 tcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaattc 1595654  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1595655 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcacaatataacaac 1595721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 24 - 283
Target Start/End: Original strand, 22782139 - 22782399
Alignment:
Q  24 cccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22782139 cccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctctcatataatccaataatttggaaattcatcatcttaa 22782238  T
Q  123 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782239 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 22782338  T
Q  223 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22782339 gtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 22782399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20557151 - 20556884
Alignment:
Q  15 gacatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20557151 gacatcaagcccacaacaatgaaatgttaatgcatggactcgaccacttaaacatcttaaattgaaaacctcttatataatccaataatttggaacttca 20557052  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20557051 tcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaatgcaa 20556952  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20556951 gtcaacaacgtctcaat--ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 20556884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 25754716 - 25754981
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25754716 catcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcatc 25754813  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25754814 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaat 25754913  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  25754914 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 25754981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3852272 - 3852009
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3852272 catcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcatc 3852175  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3852174 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaatgcaagt 3852075  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataaca 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3852074 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaca 3852009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 25688407 - 25688674
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  25688407 catcaagccctcaactttgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcgtaaatcgataacctcttatataatccaataatttggaacctcatt 25688506  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25688507 atcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagt 25688606  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  25688607 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataatcatatcacaatataacaac 25688674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16448781 - 16448516
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16448781 catcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcatc 16448682  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448681 ---ttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 16448585  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16448584 caatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 16448516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Original strand, 34963292 - 34963545
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttaatcaactt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||    
T  34963292 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacatcttaatcaactt 34963391  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963392 agaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 34963491  T
Q  230 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34963492 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 34963545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30676952 - 30676700
Alignment:
Q  38 atgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttaatcaactta 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      ||||||||||||    
T  30676952 atgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacatcttaatcaactta 30676853  T
Q  131 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaat 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676852 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaat 30676753  T
Q  231 tattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  30676752 tattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 30676700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25629568 - 25629310
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25629568 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgaaaacttcttatataatccaataatttggaacatcatc 25629469  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25629468 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaag 25629369  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  25629368 tcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 25629310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 270
Target Start/End: Original strand, 29060447 - 29060703
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  29060447 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 29060546  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29060547 catcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 29060646  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatc 270  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  29060647 gtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatc 29060703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 20593681 - 20593939
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20593681 catcaagcccccagcaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 20593780  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593781 atcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 20593880  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  20593881 tcaacaacatctcaattatacaatcataaatcaagtaatgcgtataacaatatatcaca 20593939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19303753 - 19303496
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19303753 catcaagcccccaacaatgaaatactaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 19303654  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19303653 atcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaggaagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 19303555  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| |||||||||| ||   ||| ||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  19303554 tcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgtacataacattatatcaca 19303496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17288009 - 17287768
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17288009 catcaagcccacaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaagcatcttaattcggcaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 17287910  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17287909 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaattgcaag 17287810  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 256  Q
    |||||| | ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  17287809 tcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 17287768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20361174 - 20360915
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20361174 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 20361075  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20361074 cattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 20360975  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20360974 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 20360915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18410044 - 18409782
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa----ctt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |    
T  18410044 catcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 18409945  T
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18409944 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaatg 18409845  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||    
T  18409844 caagtcaacaacatctcaatcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcaca 18409782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 283
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456891
Alignment:
Q  127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 18456834  T
Q  227 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18456835 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 18456891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22780439 - 22780199
Alignment:
Q  18 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22780439 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgactacctcttatataatccaataatttggaacatcatca 22780340  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22780339 tcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatcaattgcaagt 22780240  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 256  Q
    ||||| | ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  22780239 caacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 22780199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 101 - 279
Target Start/End: Original strand, 25656619 - 25656797
Alignment:
Q  101 atttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataata 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656619 atttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagcagtatacaaaaacagcatgacataata 25656718  T
Q  201 atatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  25656719 atatcaaatgcaagttaataacgtctcaattattcacatataattcaactaatacatatataattatatcacaatataa 25656797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 20076608 - 20076862
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20076608 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaaaatcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 20076707  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20076708 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaa 20076806  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||   ||| ||  |||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  20076807 tcaaca---tcttaaaaattcaattatacttcaagtaatgcgtataacattatatcaca 20076862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20638495 - 20638253
Alignment:
Q  19 tcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20638495 tcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatca 20638396  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20638395 tcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaatt 20638296  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 258  Q
     | |||| |||  | |||||| | ||  |||||||||||||||    
T  20638295 tatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcata 20638253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 127 - 263
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462031
Alignment:
Q  127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 18461994  T
Q  227 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461995 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaa 18462031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 25714325 - 25714478
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25714325 catcaagccctcaactttgaaaagttaatgcatggactcgacctcttaaacatattaaaccggcaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 25714424  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714425 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28496685 - 28496424
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg-aacttcat 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28496685 catcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 28496586  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| |    
T  28496585 catcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgta 28496487  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    | |||||||   ||||| || ||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  28496486 aatcaacaa---ctcaaata-tcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 28496424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 29809096 - 29808835
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg-aacttcat 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  29809096 catcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 29808997  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| |    
T  29808996 catcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgta 29808898  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    | |||||||   ||||| || ||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  29808897 aatcaacaa---ctcaaata-tcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 29808835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 273
Target Start/End: Original strand, 16496204 - 16496410
Alignment:
Q  69 cttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaa 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496204 cttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaa 16496303  T
Q  168 caca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 266  Q
    || |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  ||||    
T  16496304 cataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatatta 16496403  T
Q  267 tatcaca 273  Q
    |||||||    
T  16496404 tatcaca 16496410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19848194 - 19847939
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat------catcttaatcaactt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||    
T  19848194 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 19848095  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 228  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || |  |||  ||||  |||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||  ||| |    
T  19848094 agactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaattgcaattcaacaatatctta 19847995  T
Q  229 atta-ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19847994 aatatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaac 19847939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 20109048 - 20109312
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||| ||||| || | || ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  20109048 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacctcttagaaacaacgacctcttatataaattcaataatttggaacatcat 20109146  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||| | |||| |||||||||||||    
T  20109147 catctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatcaaatgca 20109243  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatataca--attatatcacagtataa 279  Q
    ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||    
T  20109244 agtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataa 20109312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8227703 - 8227460
Alignment:
Q  39 tgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccga 136  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| | |||||| ||||||    
T  8227703 tgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacaacttggaccga 8227604  T
Q  137 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 234  Q
    |||||||||||||||||  |||  | |||||||  |  |||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||| |||||| |||||| || |    
T  8227603 ctcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 8227505  T
Q  235 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8227504 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 8227460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 273
Target Start/End: Original strand, 25644295 - 25644487
Alignment:
Q  79 caacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaa-cag 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||    
T  25644295 caacctcttatataaatccaataatttggaac---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcag 25644389  T
Q  176 tatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25644390 tatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcaca 25644487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19773936 - 19773818
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19773936 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 19773837  T
Q  115 catcttaatcaacttagac 133  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  19773836 catcttcatcaacttagac 19773818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 269
Target Start/End: Original strand, 23019320 - 23019567
Alignment:
Q  21 aagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatcatc 118  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23019320 aagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacaacaacttaacctcttataaacaacaacctcttatatatatccaataatttggaacatcatcatc 23019418  T
Q  119 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23019419 tt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtc 23019515  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    |||||| ||||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23019516 aacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 23019567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821801
Alignment:
Q  127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-cgtc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||| | ||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgccataacaatatc-aacgcaagccaacaatcatc 18821848  T
Q  226 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||||||  || | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18821847 tcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtatac-attatatcaca 18821801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 35245493 - 35245735
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  || ||| | || |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  35245493 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagactcgacctcttaaaacaacttgattcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatca 35245591  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 211  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | |    
T  35245592 tcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatac---aacaacatgacataataatatcaatttc 35245688  T
Q  212 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 258  Q
    || ||| |||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  35245689 aattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 35245735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 1561210 - 1561356
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  1561210 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggattcgacctcttaaaacaacttaattcgacaatctcgtatattaatccaattatttggaacatca 1561308  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1561309 tcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 1561356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 19652107 - 19652248
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  19652107 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaacaacaacctcttaaataactccaataatttggaacatcatc 19652205  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19652206 atc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaa 19652248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22080936 - 22080799
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |  |  ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22080936 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgtatggacacatcaacttaaca-cttaaaacaacaacctcttatataagtccaataatttggaacatcatc 22080839  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080838 atcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Original strand, 22831412 - 22831565
Alignment:
Q  18 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  22831412 atcaagcccccaactatgaa-tgctaatgtatggactcgacctcttaaacaacttaattcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 22831510  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    ||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22831511 atcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 22831565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 22805656 - 22805749
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22805656 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacttcttatataatccaataatttggaac 22805749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16920841 - 16920698
Alignment:
Q  19 tcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||    
T  16920841 tcaagccccctactatgaa-tgctaatgcatggacttgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaacaatttggaacatcatca 16920743  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    |||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16920742 tcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 16920698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 19668284 - 19668488
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  19668284 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaatcaacgacctcttatataaatccaataatttggaac---at 19668379  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatg 210  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  19668380 catctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgc-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatg 19668476  T
Q  211 caagtcaacaac 222  Q
    ||| ||||||||    
T  19668477 caaatcaacaac 19668488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 11185421 - 11185558
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt--aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  11185421 catcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatca 11185519  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
     |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185520 acat---------cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 11185558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 220
Target Start/End: Original strand, 23992349 - 23992540
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat------catcttaatcaactt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | || ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||    
T  23992349 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaatacaacgaccgcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 23992448  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 220  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| || |  |||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  23992449 agactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaaca 23992540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4186023 - 4185880
Alignment:
Q  21 aagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatct 119  Q
    |||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| ||| |||||||||||||||| || |||||     
T  4186023 aagcccccaacaaatgtatgataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaa----caacttcttaaatagtccaataatttggaacatcgtcatc- 4185929  T
Q  120 taatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaaca 169  Q
      |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4185928 --atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaaca 4185880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25603603 - 25603406
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg------aac 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | || || |||||||| ||| |||||||||||||      |||    
T  25603603 catcaagccctcaacaatgaaatgctaatgcatggacacgacctcttaaacatctt-attcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcaac 25603505  T
Q  110 ttcatcatcttaa-tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 206  Q
     ||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| || |  |||  ||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  25603504 atcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatca 25603406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25611941 - 25611744
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg------aac 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | || || |||||||| ||| |||||||||||||      |||    
T  25611941 catcaagcccccaacaatgaaatcctaatgcatggacacgacctcttaaacatctt-attcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcaac 25611843  T
Q  110 ttcatcatcttaa-tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 206  Q
     ||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| || |  |||  ||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  25611842 atcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatca 25611744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27333336 - 27333277
Alignment:
Q  111 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27333336 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 27333277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27394076 - 27394017
Alignment:
Q  111 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27394076 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 27394017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9098715 - 9098573
Alignment:
Q  16 acatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttca 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||        ||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  9098715 acatcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactc--------aacatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaac---a 9098628  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9098627 tcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 9098573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 4738759 - 4738626
Alignment:
Q  21 aagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctta-acatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatct 119  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||  ||||| ||| |||||||||||||||| || |||||     
T  4738759 aagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaaa----caatttcttaaatagtccaataatttggaacatcgtcatc- 4738665  T
Q  120 taatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 160  Q
      |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4738664 --atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaaca 4738626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31155582 - 31155465
Alignment:
Q  38 atgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccga 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    |||| || || ||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||| ||  ||    
T  31155582 atgctaatgcatggactcgacatcttaaacatcttaaa----caacttcgtaaatagtccaataatttggaacatcatcatc---atcaacttggattga 31155490  T
Q  137 ctcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  31155489 ctcatgcaacttagttaaataacaa 31155465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 160
Target Start/End: Original strand, 4186286 - 4186419
Alignment:
Q  21 aagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatct 119  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| ||| |||||||||||||||  || |||||     
T  4186286 aagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgacctcgacctcttaaacatcttaaa----caacttcttaaatagtccaataatttggaatatcgtcatc- 4186380  T
Q  120 taatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 160  Q
      |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4186381 --atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaaca 4186419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Original strand, 19008787 - 19008843
Alignment:
Q  92 aatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctta 149  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19008787 aatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttggaccaactcatgcagctta 19008843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15041644 - 15041516
Alignment:
Q  135 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | || |  |||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| || |||    
T  15041644 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatcttaagtat 15041545  T
Q  234 tcacatataat-tcaagtaatgcatataca 262  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||| |||||    
T  15041544 tca-ataaaatctcaagtaatgcacataca 15041516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 169
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443108
Alignment:
Q  129 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 33443108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 55
Target Start/End: Original strand, 13019402 - 13019439
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 55  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13019402 catcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactc 13019439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Original strand, 18907111 - 18907165
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    |||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18907111 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcagcttagttaaataacaatagca 18907165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863032
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 19863032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873174
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 19873174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 169
Target Start/End: Original strand, 21766695 - 21766752
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21766695 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaaca 21766752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 89)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 34159232 - 34159498
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159232 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 34159331  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159332 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 34159431  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159432 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 34159498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16454537 - 16454271
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454537 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 16454438  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454437 tcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 16454338  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454337 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 16454271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 17463084 - 17463350
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463084 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 17463183  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463184 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 17463283  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17463284 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 17463350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13152047 - 13151780
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13152047 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 13151948  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151947 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 13151848  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151847 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 13151780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13154512 - 13154245
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154512 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 13154413  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154412 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 13154313  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154312 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 13154245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 8899000 - 8899266
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899000 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 8899099  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899100 tcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 8899199  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8899200 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 8899266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28848867 - 28848601
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848867 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 28848768  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848767 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 28848668  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28848667 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaac 28848601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45607163 - 45606897
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607163 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 45607064  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607063 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 45606964  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45606963 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 45606897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7781603 - 7781337
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781603 catcaagccctcaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 7781504  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7781503 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatc 7781404  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7781403 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 7781337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16283067 - 16282801
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16283067 catcaagcccccaacaataaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaactttatca 16282968  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16282967 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgcaagtc 16282868  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16282867 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 16282801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17446910 - 17446645
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446910 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgggctcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 17446811  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446810 tcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 17446712  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17446711 aacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 17446645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9707863 - 9707597
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707863 catcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcatca 9707764  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9707763 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatacaagtc 9707664  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9707663 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 9707597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10247979 - 10247713
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247979 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttggaacttcatca 10247880  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247879 tcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 10247780  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10247779 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 10247713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29172840 - 29172583
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29172840 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgaaacttcatc 29172741  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172740 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 29172641  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172640 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29172583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 38962148 - 38961881
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962148 catcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatagactcgatctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 38962049  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962048 attttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 38961949  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38961948 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 38961881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6469386 - 6469124
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469386 catcaagcccccaacaatgacatgctaatgcatggactcgacctctta----cttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 6469291  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469290 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 6469191  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6469190 aacaacgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 6469124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Original strand, 55476417 - 55476663
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476417 aatgctaatgcatagactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 55476515  T
Q  136 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476516 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 55476615  T
Q  236 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476616 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 55476663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 25 - 283
Target Start/End: Original strand, 41123804 - 41124059
Alignment:
Q  25 ccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatc 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41123804 ccccatcaatgaaatgctaatgcatggattcgacctcttaacatcttaaatcgacaaccttttatataatccaataatttggaactttatcatcttaatc 41123903  T
Q  125 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123904 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa---caacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 41124000  T
Q  225 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41124001 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 41124059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 242
Target Start/End: Original strand, 15977418 - 15977646
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaa---tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15977418 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaaaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttggaacttca 15977517  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15977518 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 15977617  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatata 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977618 gtcaacaacgtctcaattattcacatata 15977646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 55500848 - 55501053
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55500848 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 55500947  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55500948 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 55501047  T
Q  217 aacaac 222  Q
    ||||||    
T  55501048 aacaac 55501053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 50242729 - 50242994
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||| |||  | | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50242729 catcaagcccccaacaaagaac-gttgatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcatc 50242826  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  50242827 attttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaat 50242926  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  50242927 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 50242994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Original strand, 14972759 - 14973020
Alignment:
Q  14 ggacatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttc 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14972759 ggacatcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatc 14972858  T
Q  113 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972859 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 14972958  T
Q  212 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    || |||||||| |||||  ||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14972959 aaatcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 14973020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12119982 - 12119714
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119982 catcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggcctttacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 12119883  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119882 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 12119783  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12119782 caatcaacgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 12119714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 8499423 - 8499687
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8499423 catcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcatc 8499522  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8499523 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 8499622  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8499623 caatcaatgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataa 8499687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 15412334 - 15412598
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15412334 catcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcatc 15412433  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412434 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 15412533  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||||| || |||||    
T  15412534 caatcaacgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataa 15412598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 40213936 - 40213676
Alignment:
Q  14 ggacatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttc 112  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213936 ggacatcaagccatccacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttc 40213837  T
Q  113 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40213836 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacacagcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaatgca 40213737  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||||| |||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  40213736 agtcaacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcaca 40213676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43550737 - 43550468
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  43550737 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatca 43550639  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43550638 tcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 43550539  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43550538 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataacaac 43550468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Original strand, 12567479 - 12567732
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat------catcttaatcaactt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||    
T  12567479 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcataaacaacatcttaatcaactt 12567578  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567579 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 12567678  T
Q  230 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12567679 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 12567732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Original strand, 13543944 - 13544197
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat------catcttaatcaactt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||    
T  13543944 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 13544043  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544044 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 13544143  T
Q  230 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13544144 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 13544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 17487764 - 17488022
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17487764 catcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 17487863  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  17487864 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 17487963  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17487964 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 17488022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 17499246 - 17499504
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17499246 catcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 17499345  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  17499346 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 17499445  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17499446 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 17499504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Original strand, 21618354 - 21618590
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21618354 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacttcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttggaacttcatc 21618453  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618454 ttctcaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 21618552  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 253  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  21618553 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 21618590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Original strand, 36166503 - 36166739
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36166503 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcggcctctttaacttcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttggaacttcatc 36166602  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166603 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 36166701  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 253  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  36166702 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 36166739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24153421 - 24153164
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153421 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 24153322  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153321 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 24153223  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||||| |||  || ||||||||    
T  24153222 tcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcaca 24153164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25476598 - 25476340
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25476598 catcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 25476499  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476498 atcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 25476399  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  25476398 tcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcaca 25476340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23083574 - 23083316
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23083574 catcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 23083475  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  23083474 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaattgcaag 23083375  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| ||| || ||||||  | || ||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  23083374 tcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcaca 23083316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 43840840 - 43841098
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  43840840 catcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatt 43840939  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43840940 atcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 43841039  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  43841040 tcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 43841098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 26686795 - 26687053
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26686795 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatatagtccaataatttggaacatcatc 26686894  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26686895 atcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 26686994  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||| | ||| || |||||   |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  26686995 tcaacatcatcttaaatattccattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 26687053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 13442182 - 13442440
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13442182 catcaagcccccaacaatgaaatattaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 13442281  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  13442282 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaat 13442381  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  13442382 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 13442440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20698648 - 20698391
Alignment:
Q  18 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20698648 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatc 20698549  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  20698548 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaattgcaat 20698449  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||| ||| |  |||||| ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20698448 tcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcataaac-attatatcaca 20698391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11424972 - 11424718
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11424972 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 11424873  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||     
T  11424872 atcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataacaatatcaatagcaaa 11424774  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||   |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11424773 tcaaca---tctcaattatgcattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 11424718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Original strand, 10556890 - 10557088
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10556890 catcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataattcaataatttggaacttcatc 10556989  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10556990 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacatcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaatgcaag 10557088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 18438441 - 18438700
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  18438441 catcaagcctccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttgaaaacatcat 18438540  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18438541 catcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaa 18438640  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||||| |||   |||| ||   |||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18438641 gtcaacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcaca 18438700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 27165155 - 27165419
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27165155 catcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcatc 27165254  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||| | |||||| ||||| |||  ||||||||||||||    
T  27165255 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgc-aaaacaacatgatataccaatatcaaatgcaa 27165353  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||| |||  |||||| |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27165354 gtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 27165419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 45578094 - 45577947
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578094 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 45577995  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577994 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 45577947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 111 - 281
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672796
Alignment:
Q  111 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 17672725  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataaca 281  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17672726 caaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatataaca 17672796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 12399117 - 12399360
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  12399117 catcaagccaccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaatttgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 12399215  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399216 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaa 12399315  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 258  Q
     |||||||| ||| || |||||| |||    ||||||||||||||    
T  12399316 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcata 12399360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070643
Alignment:
Q  127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataacagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 53070700  T
Q  227 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  53070699 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatctaacaac 53070643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24340937 - 24340672
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttat-ataatccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||     
T  24340937 catcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaa 24340838  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  |||||| | | |||| ||||| ||||||||||| || |||    
T  24340837 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgc-acaacatcatgatataataatatcgaacgca 24340739  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24340738 agtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 24340672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 53301747 - 53301499
Alignment:
Q  34 tgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttaga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53301747 tgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttaga 53301648  T
Q  133 ccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtca-acaacgtctcaa 229  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||  ||||||    
T  53301647 ccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcattcaatatctcaa 53301549  T
Q  230 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
     |||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||    
T  53301548 atattcatatataattcaagtattacgtatacaattatatcacaatataa 53301499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 44494716 - 44494908
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  44494716 catcaagcccccaacaaagaa-tgttaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataattcaataatttagaacttcatc 44494813  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44494814 atcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatg 44494908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14577043 - 14576788
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  14577043 catcaagcccccaaaaatgaaatgcaaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaaataacaacctcttaagtaagtccaataatttggaacatcat 14576944  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    || |   |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14576943 caac---atcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtata-aacaacagcatgacataataatatcaattgcaa 14576848  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14576847 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 14576788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 17737143 - 17737337
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17737143 catcaagcccccaacaaagaa-tgataatgcatagactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tattgtatgatccaataacttggaacttcatc 17737240  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagta---tacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17737241 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatactacaacaacagcatgacataataatatcaaat 17737337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 14572499 - 14572735
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||  |||    
T  14572499 catcaagcccccaacaatgaaatgcaaatgcatagactcgacctcttaaacatcttaaaacaacatcctcttaagtaagtccaataatttggaacaacat 14572598  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    || |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  14572599 caac---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgaga 14572694  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatg 254  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||    
T  14572695 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatg 14572735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 28194600 - 28194752
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28194600 catcaaacccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacctcatc 28194697  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28194698 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 28194752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 23274594 - 23274859
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||| || ||||||| |||| ||| |||     
T  23274594 catcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaatttgacaaccttttataatagtccaatactttgaaacatcaa 23274693  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    ||||||     |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||    
T  23274694 catcttcgatgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgca 23274792  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||    
T  23274793 agtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataa 23274859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13210541 - 13210333
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacat--cttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  13210541 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgaaacatca 13210443  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 211  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  13210442 tcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgc 13210344  T
Q  212 aagtcaacaac 222  Q
    || ||||||||    
T  13210343 aaatcaacaac 13210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 37642458 - 37642214
Alignment:
Q  38 atgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 135  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| | | |||| |||||    
T  37642458 atgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccg 37642359  T
Q  136 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 233  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||||| |  |||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||| |||||| |||||| ||     
T  37642358 actcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataa 37642260  T
Q  234 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37642259 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 37642214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 126 - 273
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386576
Alignment:
Q  126 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
Q  225 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcaca 42386576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 12510958 - 12511172
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12510958 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaatttgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 12511057  T
Q  115 ------catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 207  Q
          ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| || |  |||  ||||  |||| || ||||||| ||||||||    
T  12511058 tatcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaa 12511157  T
Q  208 atgcaagtcaacaac 222  Q
     ||||| ||||||||    
T  12511158 ttgcaattcaacaac 12511172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 15470836 - 15471085
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||  ||||||| |||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  15470836 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcattgacacaacaacttaacaacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatc 15470934  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  15470935 atctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 15471030  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    |||| |||| ||||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15471031 gtcatcaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 15471085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 52523937 - 52523676
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  52523937 catcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggactcaacaactcaacatcttagaaataacaaactcttatataaatccaataatttggaac---at 52523842  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatg 210  Q
    | |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||| ||||| |||  ||||| |||| |||||| ||||    
T  52523841 cttctg--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagttcatgatataacaatatcgaatg 52523745  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||| |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52523744 caaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 52523676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22147717 - 22147474
Alignment:
Q  39 tgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccga 136  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| | | |||| ||||||    
T  22147717 tgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccga 22147618  T
Q  137 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 234  Q
     ||||||||||||||||  |||  | |||||||  |  | |||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||| |||||| |||||| || |    
T  22147617 gtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 22147519  T
Q  235 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22147518 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 22147474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 16097240 - 16097499
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| | || |||||||| |||| | | |||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  16097240 catcaagcccccaacaatgaa-tgttaattcatggacacaacatcttaacaacttagaacaacaatctcttaaataagtccaataatttggaacatcatc 16097338  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  || ||| | ||| || ||| | |||| |||||| |||||||    
T  16097339 atc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaatgcaa 16097434  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||| |||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  16097435 gtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 16097499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Original strand, 30029740 - 30029968
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaaca--atgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  30029740 catcaagcccccatcactatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttgtatagtccaataatttggaacatca 30029839  T
Q  114 t------catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 206  Q
    |      ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| || | ||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30029840 tcatcaacatctcattcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaatatca 30029939  T
Q  207 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattca 236  Q
      ||||| || ||||||||| || ||||||    
T  30029940 tttgcaattc-acaacgtcttaaatattca 30029968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 14234391 - 14234648
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-----atccaataatttggaact 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   |||||| ||||| || | ||||||| |||||||     |||||||||||||||||     
T  14234391 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaataacttaacttcttataaacaacaaccttttatatatatatatccaataatttggaaca 14234489  T
Q  111 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  14234490 tcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaa 14234588  T
Q  209 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    ||||||||| |||| ||  ||  | ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14234589 tgcaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 14234648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Original strand, 46822187 - 46822394
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat------catcttaatcaactt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||    
T  46822187 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 46822286  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 228  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || |  |||  ||||  |||| || ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  46822287 agactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatctta 46822386  T
Q  229 attattca 236  Q
    | ||||||    
T  46822387 aatattca 46822394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 9512834 - 9512982
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||||| | ||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  9512834 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacatcatca 9512931  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9512932 tc---atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaaca 9512982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 9520809 - 9520957
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| | | ||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  9520809 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacatcttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacatcatca 9520906  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9520907 tc---atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaaca 9520957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 49668283 - 49668135
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||| | | ||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  49668283 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacatcatca 49668186  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49668185 tc---atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 49668135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 16103694 - 16103950
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |  | ||||| || |||||| | ||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  16103694 catcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacatcatcttagcaacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacatcatca 16103791  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||     
T  16103792 tc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa- 16103886  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||||||| |||||| || ||| | ||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  16103887 tcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataa 16103950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 32307591 - 32307802
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||   || |||||||| |||| | | ||| | ||||||| | ||||||||||||||||  |||||    
T  32307591 catcaagcccccaatagtgaa-tgctaatgcatggacataacatcttaacaacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacaacatca 32307688  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||     
T  32307689 tc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa- 32307783  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattat 233  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  32307784 tcaacaacatctcaattat 32307802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12174458 - 12174212
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |        ||||||||| | | ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  12174458 catcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacac--------aacatcttagaacaacaacctcttata-agtccaataatttggaacatcatca 12174369  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||     
T  12174368 tc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa- 12174274  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
      ||||||  ||||| || ||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  12174273 --aacaacaactcaaata-tcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 12174212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2051238 - 2051148
Alignment:
Q  189 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2051238 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 2051148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22110560 - 22110307
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||||||||||| || | || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22110560 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcat 22110462  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatg 210  Q
    | |     ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |  ||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  22110461 cct-----tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatg 22110368  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||||| | ||||||    ||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  22110367 caaatcaacagcatctcaa--catcatatagaattcatgtaatgcgtatacatttatatcaca 22110307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17248287 - 17248231
Alignment:
Q  227 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17248287 caattattcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaac 17248231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37251376 - 37251123
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcga-caacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||| ||  |||||||||||| |   | | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  37251376 catcaagcccccgacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaaaatcgacctcttatataaatccaataatttggaacatcat 37251278  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatg 210  Q
    | ||     || |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| |  |||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  37251277 cttc-----catcttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatg 37251184  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||||||| ||||||    ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37251183 caaatcaacaacatctcaa--catcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcaca 37251123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 43925872 - 43926123
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||| ||||||| || |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||   |     
T  43925872 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaactta-catcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaac---aa 43925966  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaaatg 210  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  ||||| | |||| ||||  |||| |||| |||||||||||    
T  43925967 catctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatg 43926063  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatca 271  Q
    ||| |||||||| ||||||  | ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43926064 caaatcaacaacatctcaaaca-tcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatca 43926123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1644880 - 1644733
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||| | | ||| | ||||||| | ||||||||||||||||  ||||     
T  1644880 catcaagcccctaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacaacatcg 1644783  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    ||   ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  1644782 tc---atcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaacaacaaca 1644733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 169
Target Start/End: Original strand, 14665380 - 14665458
Alignment:
Q  93 atccaataatttggaact--tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14665380 atccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaaca 14665458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 169
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856197
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaaca 856197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077537
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaaca 23077537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 169
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919390
Alignment:
Q  129 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 13919390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 166
Target Start/End: Original strand, 14668536 - 14668611
Alignment:
Q  93 atccaataatttggaact--tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14668536 atccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 14668611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 606470 - 606401
Alignment:
Q  81 acctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 154  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||     ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  606470 acctcttatataaatccaacaatttggaacatcatcat-----tcatcttataccgactcatgcagcttagttaa 606401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878114
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 15878114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 10542654 - 10542621
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 50  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10542654 catcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatg 10542621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 166
Target Start/End: Original strand, 11862772 - 11862847
Alignment:
Q  93 atccaataatttgga--acttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    |||||||||||||||  ||  |||||||||||||| |||  |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11862772 atccaataatttggagcacaacatcatcttaatcatcttgtaaagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 11862847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26196548 - 26196500
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 160  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  26196548 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataaca 26196500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 263; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 20653 - 20919
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20653 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 20752  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20753 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 20852  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20853 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 20919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 263; Significance: 1e-147; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 94317 - 94583
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94317 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 94416  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94417 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 94516  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  94517 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 94583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 270
Target Start/End: Original strand, 44360 - 44614
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44360 catcaagtccccaacaattaaaagctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataattttgaacttcatca 44459  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatac-aaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44460 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 44559  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatc 270  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44560 caacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatatc 44614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 115 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17430
Alignment:
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 17499  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17498 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacagtataacaac 17430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 119783 - 119937
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  119783 catcaagccctcaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 119881  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  119882 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 119937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 100287 - 100534
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  100287 catcaagctcccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaaaaacaacctcttatata-tccaataatttggaacatcatc 100384  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  100385 atc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaatgcaa 100480  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
     |||||||| |||||| |||| ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  100481 atcaacaacatctcaaatattaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 100534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 40382 - 40135
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  40382 catcaagtccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaccaacaacctcttata-agtccaataatttggaacatcatc 40285  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||  | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  40284 atc---atcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 40189  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
     |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  40188 atcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 40135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 101413 - 101552
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||||| | ||| | ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||    
T  101413 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttagaacatcatca 101510  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  101511 tc---atcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaa 101552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 38672 - 38542
Alignment:
Q  38 atgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca---tcatcttaatcaacttaga 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||  || | ||||||| ||||||||||||||||  ||||   |||||||||||| |||| |    
T  38672 atgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa-tcatcatc-tcttata-aatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatcatcttata 38576  T
Q  133 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
      |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38575 ttgactcatgcaacttagttaaataacaatagca 38542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 263; Significance: 1e-147; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5853548 - 5853282
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853548 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 5853449  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853448 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 5853349  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5853348 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 5853282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 1484308 - 1484574
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484308 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 1484407  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484408 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 1484507  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1484508 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 1484574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 20403133 - 20403399
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403133 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 20403232  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403233 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 20403332  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20403333 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 20403399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4542629 - 4542363
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542629 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 4542530  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542529 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 4542430  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542429 aacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 4542363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 25 - 283
Target Start/End: Original strand, 22001667 - 22001925
Alignment:
Q  25 ccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatc 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001667 ccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatgttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatc 22001766  T
Q  125 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001767 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 22001866  T
Q  225 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001867 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 22001925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15203487 - 15203221
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203487 catcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 15203388  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15203387 tcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagtc 15203288  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15203287 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 15203221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20046451 - 20046185
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046451 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 20046352  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046351 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 20046252  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20046251 aacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 20046185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 19896171 - 19896440
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896171 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 19896270  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgac---ataataatatcaaatgcaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19896271 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacggtatacaaaaacagcatgacataataataatatcaaatgcaa 19896370  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19896371 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 19896440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 14823680 - 14823945
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823680 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 14823779  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823780 tcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 14823878  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14823879 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 14823945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 41598094 - 41598360
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598094 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 41598192  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598193 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 41598292  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41598293 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 41598360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45290952 - 45290684
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45290952 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcaac 45290853  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  45290852 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagc 45290753  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45290752 caatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcagatacaattatatcacagtataacaac 45290684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14409701 - 14409434
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14409701 catcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcatc 14409602  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409601 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 14409502  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14409501 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 14409434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Original strand, 4483207 - 4483452
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483207 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 4483305  T
Q  136 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483306 actcatgcagcttagttaa-taacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 4483404  T
Q  236 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483405 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 4483452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16092555 - 16092297
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16092555 catcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatagtttggaacatcatc 16092456  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092455 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 16092356  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16092355 tcaacaacatctcaaatatacattcataatttaagtaatgcgtataacattatatcaca 16092297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26225504 - 26225268
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26225504 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttggaacttcatc 26225405  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26225404 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacaatatac-aaaacagtatgacataataatatcaaatacaagt 26225306  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 253  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  26225305 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26225268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25484523 - 25484269
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25484523 catcaagcccacaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttagaacttcatc 25484426  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25484425 atcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagcta-------gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaat 25484333  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25484332 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 25484269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Original strand, 26219622 - 26219858
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26219622 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttggaacttcatc 26219721  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26219722 atcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatac-aaaatagtatgacataataatatcaaatgcaagt 26219820  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 253  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  26219821 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26219858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 6759167 - 6759421
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  6759167 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgga-catcatc 6759265  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6759266 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 6759365  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||   |||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  6759366 tcaaca---tctcaattatacactcataattcaattaatgcgtataacattatatcaca 6759421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16413547 - 16413306
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |  |||||||| ||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  16413547 aatgctaatgcatggactcgaccacttaaacatcttaattaaatgacctcttaaatagtccaataatttggaac------atcttaatcaacttagaccg 16413454  T
Q  136 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413453 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 16413354  T
Q  236 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16413353 acatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 16413306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18818622 - 18818364
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18818622 catcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 18818523  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  18818522 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaag 18818423  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  18818422 tcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 18818364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 23406287 - 23406547
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23406287 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 23406386  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23406387 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaag 23406486  T
Q  215 tcaac--aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||  | | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23406487 tcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23406547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Original strand, 7372686 - 7372931
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7372686 catcaagcccccaacaatgaaatgttgatgcatggactcaacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 7372785  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7372786 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 7372885  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 260  Q
    |||||| | ||| || ||||||  |||| |||||||||||| ||||    
T  7372886 tcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcttata 7372931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28649261 - 28648999
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa----ctt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |    
T  28649261 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 28649162  T
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649161 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatg 28649062  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  28649061 caagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcaca 28648999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 22874973 - 22875230
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaac-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22874973 catcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatggactcgacctcttaaatatcttaaatcaacaacctcttatatagtccaataatttggaacatcatc 22875072  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22875073 atcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 22875171  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22875172 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 22875230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 20536116 - 20536374
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctta-acatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20536116 catcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactagacctcttagacatcttaattcaacaatctcttatataattcaataatttggaacatcatc 20536215  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20536216 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 20536315  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  20536316 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 20536374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21924133 - 21923900
Alignment:
Q  25 ccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaat 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  21924133 ccccaacaatgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttacataatccaataatttggaacatcatcatcttcat 21924034  T
Q  124 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21924033 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaattgcaagtcaacaac 21923934  T
Q  223 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 256  Q
     ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  21923933 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 21923900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21919213 - 21918955
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21919213 catcaagcccgcaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 21919115  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21919114 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 21919015  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacat-ataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     |||||||| ||| || |||||| || ||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21919014 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattcttcaagtaatgcataaac-attatatcaca 21918955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Original strand, 26223841 - 26224091
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca---tcttaatcaacttaga 132  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  26223841 aatgttaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcaacatcttaatcaacttaga 26223940  T
Q  133 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaatta 232  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26223941 tcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaataaagcaatatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaatta 26224040  T
Q  233 ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26224041 ttcacatataatttaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 26224091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 84 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19937194 - 19936995
Alignment:
Q  84 tcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19937194 tcttatataatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaa 19937096  T
Q  184 aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaa 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  19937095 aacagcatgacataataagatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattactcacaaataattcaatcaatgcacatacagttatatcacaatataacaa 19936996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 22626643 - 22626901
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  22626643 catcaagcctccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttgaaaacatcat 22626742  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  22626743 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatacaa 22626841  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  22626842 atcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcaca 22626901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18879442 - 18879191
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18879442 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaat--gacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 18879345  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||     
T  18879344 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acataataatatcaattgcaat 18879250  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  18879249 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcaca 18879191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13597831 - 13597566
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||     
T  13597831 catcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacgtcaa 13597732  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| || ||||| || ||||| ||||||||||| || |||    
T  13597731 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgca 13597633  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13597632 agtaaacaacatcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 13597566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13508299 - 13508034
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttat-ataatccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||     
T  13508299 catcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacgtcaa 13508200  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  || ||| | | |||| ||||| ||||||||||| || |||    
T  13508199 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgc-acaacatcatgatataataatatcgaacgca 13508101  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13508100 agtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 13508034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 127 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801372
Alignment:
Q  127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtct 19801429  T
Q  227 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19801428 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataacaac 19801372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 31971164 - 31971421
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  31971164 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgatctcttaaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatca 31971262  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  31971263 tcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaattcca 31971361  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    | ||| |||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31971362 attcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataaac-attatatcaca 31971421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17612324 - 17612059
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||     
T  17612324 catcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcaacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaa 17612225  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |  |||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |    
T  17612224 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgta 17612126  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17612125 agtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 17612059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 124 - 270
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070718
Alignment:
Q  124 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caac 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaac 15070670  T
Q  223 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatc 270  Q
    |||||||||||||||| |||||  || | |||||||||||||||||||    
T  15070671 gtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatc 15070718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 45131209 - 45131019
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||    
T  45131209 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaattagtccaataatttggaacatcat 45131111  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 207  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45131110 catcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagcatgacataataatatcaa 45131019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16199857 - 16199666
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  16199857 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 16199759  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 207  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  16199758 catcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattc--aaacaacatgacataataatatcaa 16199666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 23648455 - 23648719
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat- 114  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  23648455 catcaagcccccaactgtgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatatagtccaataatttggaacatcatc 23648554  T
Q  115 -----catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 208  Q
         ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |  |||  ||||| |||| ||||||||||||||||||      
T  23648555 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatcatt 23648654  T
Q  209 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataa-ttcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||  ||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  23648655 tgcaatacaacaacatcttaaatattca-ataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcaca 23648719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5866487 - 5866227
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  5866487 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 5866389  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| |    
T  5866388 catcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgta 5866290  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    | |||||||   |||||||| ||| |  ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  5866289 aatcaacaa---ctcaatta-tcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 5866227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 158
Target Start/End: Original strand, 21255130 - 21255272
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21255130 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 21255228  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 158  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255229 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21255272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 21490902 - 21491163
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  21490902 catcaagcccccaacaacgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaattcaataatttggaacatca 21491000  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 211  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||  ||||     
T  21491001 tcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatattgaatgt 21491099  T
Q  212 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    || |||||||   |||||||| ||| |  ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  21491100 aaatcaacaa---ctcaatta-tcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 21491163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 17140824 - 17141084
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17140824 catcaagcccccaacaatgaa-tactaatgtatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 17140922  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||  || ||||||||||||||||| |||| |    
T  17140923 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aatccatcatgacataataatatcgaatgta 17141021  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    | ||| |||   |||||||| ||| |  ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  17141022 aatcatcaa---ctcaatta-tcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 17141084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38855462 - 38855212
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||  |||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38855462 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacataacaacttaacttcttataaacaacaacctcttatata-tccaataatttggaacatcatc 38855365  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  38855364 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 38855266  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
     |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  38855265 atcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 38855212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 158
Target Start/End: Original strand, 21249292 - 21249434
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21249292 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcggcctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 21249390  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 158  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249391 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21249434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21389663 - 21389458
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctctta-tataatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  21389663 catcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatttggaacatcat 21389565  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   |||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  21389564 catcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatcaaattca 21389468  T
Q  213 agtcaacaac 222  Q
    | ||| ||||    
T  21389467 attcatcaac 21389458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21778989 - 21778784
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctctta-tataatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  21778989 catcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatttggaacatcat 21778891  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   |||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  21778890 catcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatcaaattca 21778794  T
Q  213 agtcaacaac 222  Q
    | ||| ||||    
T  21778793 attcatcaac 21778784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 6520276 - 6520483
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6520276 catcaagcccccgacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 6520374  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  6520375 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 6520473  T
Q  213 agtcaacaac 222  Q
    ||||| ||||    
T  6520474 agtcatcaac 6520483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21396189 - 21395988
Alignment:
Q  21 aagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctctta-tataatccaataatttggaacttcatcatc 118  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  21396189 aagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatgtggaacatcatcatc 21396091  T
Q  119 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||    
T  21396090 ttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatcaaattcaattc 21395994  T
Q  217 aacaac 222  Q
    | ||||    
T  21395993 atcaac 21395988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21790682 - 21790481
Alignment:
Q  21 aagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctctta-tataatccaataatttggaacttcatcatc 118  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  21790682 aagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatgtggaacatcatcatc 21790584  T
Q  119 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||    
T  21790583 ttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatcaaattcaattc 21790487  T
Q  217 aacaac 222  Q
    | ||||    
T  21790486 atcaac 21790481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 20498475 - 20498734
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  || | ||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  20498475 catcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaactcagcatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaac---at 20498570  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    | ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||  ||||  ||||||| |||| |||||||||||||    
T  20498571 cttctt--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgca 20498667  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20498668 agtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataa 20498734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23761053 - 23760903
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||||| |||| | | | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23761053 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacaaaacatcttaacaacttagaacaataacctcttatataagtccaataatttggaacatcatc 23760955  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23760954 atctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 23760903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 21285508 - 21285758
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||| || || || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  21285508 catcaagccctcagcaatgaa-tgctaatgcatggactcaactactcaacctcatagaaacaacaacctcttatataaatccaataatttggaac---at 21285603  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |  |||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  21285604 cttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgca 21285702  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    | |||||||| ||||||  | ||| | ||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  21285703 aatcaacaacatctcaaaca-tcaaacatagttcatgtaatgtatatacaattatat 21285758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Original strand, 32121654 - 32121861
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat------catcttaatcaactt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||    
T  32121654 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaactcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 32121753  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 228  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| || |  |||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  32121754 agaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatctta 32121853  T
Q  229 attattca 236  Q
    | ||||||    
T  32121854 aatattca 32121861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 115
Target Start/End: Original strand, 22965628 - 22965707
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22965628 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcggcaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 22965707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26355907 - 26355766
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||   ||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  26355907 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaaccatttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatc 26355809  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26355808 atc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaa 26355766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 983614 - 983465
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| || | || |||||||||| || ||||||||||||||||   ||    
T  983614 catcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacaacgacctcttataaaaatccaataatttggaac---at 983519  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaca 169  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  983518 catctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaaca 983465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 21673617 - 21673864
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||    
T  21673617 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttata-agtccaataatttggaacatgatc 21673714  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| |  || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  21673715 atc---atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 21673810  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
     |||||||| |||||| || ||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  21673811 atcaacaacatctcaaata-tca-atataatttatttaatgtatatacaattatat 21673864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 224 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24486093 - 24486034
Alignment:
Q  224 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24486093 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 24486034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18678256 - 18678094
Alignment:
Q  81 acctcttatataatccaataatttggaacttcat------catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-ac 173  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || |  |    
T  18678256 acctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggc 18678157  T
Q  174 agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattca 236  Q
    ||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  18678156 agattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattca 18678094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17267202 - 17266948
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||||||||||| ||   || ||||||||||||| ||||||||||||||||   |     
T  17267202 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaaaaacgacctcttatataaatccaataatttggaac---aa 17267107  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatg 210  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |  ||||| |  ||||| |  ||||| |||| |||||||||||    
T  17267106 catctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtaca-taaaacggttcatgatataacaatatcaaatg 17267010  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||||||| ||||||  | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17267009 caaatcaacaacatctcaaaca-tcatatataattcttgtaatgcatatacatttatatcaca 17266948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 273
Target Start/End: Original strand, 37116324 - 37116514
Alignment:
Q  81 acctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagta 177  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  |||||    
T  37116324 acctcttatataaatccaataatttggaac---aacatttt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagta 37116418  T
Q  178 tacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     | |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37116419 cataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcaca 37116514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 234 - 283
Target Start/End: Original strand, 32810054 - 32810103
Alignment:
Q  234 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32810054 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 32810103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 81 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17439651 - 17439461
Alignment:
Q  81 acctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagta 177  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |  |||||    
T  17439651 acctcttatataaatccaataatttggaac---aacatttt--tcatcttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 17439557  T
Q  178 tacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     | |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17439556 cataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcaca 17439461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 271
Target Start/End: Original strand, 24352997 - 24353184
Alignment:
Q  81 acctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagta 177  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |  |||||    
T  24352997 acctcttatataaatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagta 24353091  T
Q  178 tacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatca 271  Q
     |  |||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||  | ||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24353092 ca-taaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaaca-tcgtatacaattcatgtaatgcatatacatttatatca 24353184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 19937243 - 19937195
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa 65  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19937243 catcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaa 19937195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 263; Significance: 1e-147; HSPs: 67)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10733196 - 10732930
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733196 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 10733097  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733096 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 10732997  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10732996 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaccgtataacaac 10732930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42245621 - 42245355
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245621 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 42245522  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245521 tcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 42245422  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245421 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 42245355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 29329840 - 29330106
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29329840 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttcgaacttcatca 29329939  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329940 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 29330039  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29330040 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 29330106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 265024 - 264758
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  265024 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 264925  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264924 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 264825  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  264824 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 264758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 20908918 - 20909184
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20908918 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 20909017  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909018 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 20909117  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909118 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 20909184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 29345886 - 29346152
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29345886 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 29345985  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29345986 tcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 29346085  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29346086 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 29346152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 32027299 - 32027565
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027299 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 32027398  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32027399 tcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatccaagtc 32027498  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32027499 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 32027565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2154870 - 2154603
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154870 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 2154771  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2154770 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagtc 2154671  T
Q  217 aacaacgtctcaatta-ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2154670 aacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaac 2154603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 29348359 - 29348625
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348359 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 29348458  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348459 tcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 29348558  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29348559 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 29348625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 29350832 - 29351098
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29350832 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 29350931  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29350932 tcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 29351031  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29351032 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 29351098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 39245042 - 39245308
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245042 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttagtatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 39245141  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245142 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 39245241  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39245242 aataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatataacaac 39245308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Original strand, 39363310 - 39363556
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363310 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 39363408  T
Q  136 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363409 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 39363508  T
Q  236 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363509 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 39363556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11581456 - 11581189
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581456 catcaagcccccaacaatgaaatgctaagtcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgaaaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 11581357  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11581356 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 11581257  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11581256 caataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataacaac 11581189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10775933 - 10775670
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775933 catcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 10775834  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775833 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacacagcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaatgcaagt 10775734  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtata 278  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10775733 caatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatata 10775670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20918203 - 20917942
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20918203 catcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatg-actcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatagtttggaacttcatca 20918105  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    |||||    
T  20918104 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacaaaataatataaa----aagtc 20918009  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20918008 aacaacgtctcaattattcacatctaattcaagtaaagcatatataattatatcacaatataacaac 20917942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 36155037 - 36154775
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| ||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36155037 catcaagccctcaactttaaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcatc 36154938  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154937 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaca---acacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 36154841  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataaca 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36154840 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaca 36154775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20902248 - 20901998
Alignment:
Q  36 aaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaat-caacttagac 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20902248 aaatgctaatgtatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacctcttaaatagtccaataatttggaacttcatcatcttaattcaacttagac 20902149  T
Q  134 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaatta- 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20902148 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaacgtctcaattat 20902049  T
Q  233 ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20902048 ttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaac 20901998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18319288 - 18319023
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| ||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18319288 catcaagccctcaactttaaaatgataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcatc 18319189  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319188 ---ttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 18319092  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18319091 caatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 18319023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 31060975 - 31061241
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31060975 catcaagctcccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcatc 31061072  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061073 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 31061172  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  31061173 caatcaacgtatcaattattcacaaataatttaattaatgcatataaaattatatcacaatataacaac 31061241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 24067015 - 24067280
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  24067015 catcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcat- 24067113  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
      ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24067114 --cttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 24067211  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24067212 caatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 24067280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 23064416 - 23064680
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23064416 catcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaaccccatc 23064515  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23064516 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacagtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatgcaagt 23064615  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||||| || |||||    
T  23064616 caatcaacgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataa 23064680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23390709 - 23390451
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23390709 catcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 23390610  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  23390609 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaat 23390510  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23390509 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23390451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Original strand, 22412092 - 22412329
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412092 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 22412191  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412192 atcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 22412290  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 253  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  22412291 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 22412329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 24529128 - 24529386
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529128 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttatataatccaataatttggaacttcatc 24529227  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24529228 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaatgcaag 24529327  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| ||| |||||| ||   |||  ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24529328 tcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcaca 24529386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Original strand, 38619337 - 38619593
Alignment:
Q  18 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgac---ctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 113  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  38619337 atcaagcccctatcactgaaatgctaatgcatggactcgactaattcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatcaaataatttggaacctca 38619436  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619437 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 38619536  T
Q  214 gtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||||    
T  38619537 gtcaatcaacgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatat 38619593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21997747 - 21997547
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21997747 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 21997648  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21997647 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 21997548  T
Q  215 t 215  Q
    |    
T  21997547 t 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 9077860 - 9078118
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9077860 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 9077959  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9077960 atcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaag 9078059  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9078060 tcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcaca 9078118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 1096374 - 1096633
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  1096374 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcaa 1096473  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1096474 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaatgcaa 1096573  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     |||||||| |||||  ||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1096574 atcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 1096633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 24493476 - 24493734
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  24493476 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttatttcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 24493575  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493576 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 24493674  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  24493675 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcaca 24493734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Original strand, 25421443 - 25421698
Alignment:
Q  21 aagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcatcatc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  25421443 aagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcataattcgacaacctcttatataatccaataaattggaaacatcatcatc 25421542  T
Q  119 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtca 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25421543 ttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtca 25421642  T
Q  218 acaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  25421643 acagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 25421698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 25431302 - 25431560
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  25431302 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataaattggaaacatcat 25431401  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25431402 catcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 25431500  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||||| ||| || | ||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  25431501 gtcaacaacatcttaaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 25431560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 13025218 - 13025476
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  13025218 catcaagcccccaacagtgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 13025317  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13025318 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacatattgatatcaaatgcaa 13025416  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||| | |||  |||||||||||    
T  13025417 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcaca 13025476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 13095402 - 13095660
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  13095402 catcaagcccccaacagtgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 13095501  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13095502 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacatattgatatcaaatgcaa 13095600  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||| | |||  |||||||||||    
T  13095601 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcaca 13095660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8287057 - 8286797
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||    
T  8287057 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcataattcgacaaccacttatattagtccagtaatttggaacatcat 8286958  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatac-aaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8286957 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 8286858  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    | ||| |||| ||| || || ||| | ||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  8286857 attcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 8286797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21808602 - 21808344
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  21808602 catcaagcccccaacaatgaag-gctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 21808504  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21808503 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaa 21808404  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     |||||||| ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21808403 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 21808344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21729255 - 21729019
Alignment:
Q  40 gctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgac 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  21729255 gctaatgcatgaactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgac 21729156  T
Q  138 tcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattca 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  21729155 tcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattca 21729056  T
Q  237 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21729055 aataattctcaagtaatgcataaaatattatatcaca 21729019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 22074928 - 22075185
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  22074928 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaagcatct--attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 22075024  T
Q  115 cat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  22075025 cattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatcaattgca 22075124  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    | |||||||| ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  22075125 attcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 22075185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19661048 - 19660894
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19661048 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 19660950  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19660949 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 19660894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20806997 - 20806845
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20806997 catcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaaattcatc 20806900  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac 170  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20806899 atcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaacagcgacac 20806845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 37723811 - 37724050
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctctta-tataatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||     
T  37723811 catcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatttagtccaataatttggaacttcaa 37723909  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||   ||||||||||||| || |||||||||  |    
T  37723910 catcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatcaaattaa 37724006  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 256  Q
    | ||| |||| ||||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  37724007 attcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgca 37724050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21293182 - 21292992
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||    
T  21293182 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaattcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaattagtccaataatttggaacatcat 21293084  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 207  Q
    |||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  21293083 catcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagtatgacataataatatcaa 21292992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 279
Target Start/End: Original strand, 21565456 - 21565713
Alignment:
Q  19 tcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcat 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || |||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21565456 tcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggtcacaacatcttaacaacttagaacgacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatcat 21565554  T
Q  118 cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  21565555 c---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagt 21565650  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    || |||| | |||| || ||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  21565651 catcaacatttcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 21565713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 279
Target Start/End: Original strand, 40725782 - 40726025
Alignment:
Q  39 tgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccga 136  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| | | |||| ||||||    
T  40725782 tgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccga 40725881  T
Q  137 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 234  Q
    |||||||||||||||||  |||  | |||||||  |  |||||| | ||| || ||||| |||||||||||  | | |||| |||||| |||||| || |    
T  40725882 ctcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaagcatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 40725980  T
Q  235 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40725981 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 40726025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 22143960 - 22144215
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacct-cttaacatcttaaatcgacaacctcttatata---atccaataatttggaacttc 112  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |  || |||| |||| | | |||||||||||||||   |||||||||||||||||       
T  22143960 catcaagccctcaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaaacaactcaacaacttagaacaacaacctcttatatatatatccaataatttggaac--- 22144055  T
Q  113 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaac-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 210  Q
    ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |   ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||    
T  22144056 atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaattg 22144152  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144153 caaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22144215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Original strand, 36314504 - 36314639
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  36314504 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagacc 36314603  T
Q  135 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36314604 gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 36314639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21329706 - 21329556
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  || ||| ||||| |   |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  21329706 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactcaacctcttaga---acaacctcttatataaattcaataatttggaacatcatc 21329611  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21329610 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 21329556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26012246 - 26011995
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26012246 catcaaacccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacctcttataaacaacaacctcttatatatatccaataatttggaacatcat 26012148  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||||||||      
T  26012147 catctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaagcaacatgatataacaatatcaaatgtg 26012051  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    | |||||||| ||||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26012050 aatcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 26011995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 19668807 - 19668951
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  19668807 catcaagcccccaagaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatc 19668905  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19668906 atcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaa 19668951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22959739 - 22959591
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||| | | ||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  22959739 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacatcatca 22959642  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22959641 tc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 22959591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17517400 - 17517193
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat------catcttaatcaactt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||      |||||||||||||||    
T  17517400 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacgacctcttaaatagtccaataatttgaaacatcattatcaacatcttaatcaactt 17517301  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 228  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |  |||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||| |    
T  17517300 agactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaatcgcaattcaacaacatctta 17517201  T
Q  229 attattca 236  Q
    | ||||||    
T  17517200 aatattca 17517193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21502308 - 21502116
Alignment:
Q  78 acaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-aca 174  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |  ||    
T  21502308 acaacctcttatataaattcaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggca 21502209  T
Q  175 gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    ||||   ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| || | ||| ||  | ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21502208 gtat-gtaaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcatcatcttaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 21502116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20027149 - 20026945
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||| ||||| || | || ||||||||||||| |||||||||||| |||   ||    
T  20027149 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacctcttataaacaacgacctcttatataaatccaataatttgaaac---at 20027054  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatg 210  Q
    | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  20027053 cttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-ccaaaacagttcatgatataataatatcaaatg 20026957  T
Q  211 caagtcaacaac 222  Q
    ||| ||||||||    
T  20026956 caattcaacaac 20026945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22178428 - 22178175
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  ||||||||||| || |  | ||||||||||| ||||||||||||||||||   | |    
T  22178428 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttgaaacatcgacctcttatatcaatccaataatttggaac---aac 22178333  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgc 211  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||| |  |||||||  |||||||  ||||| || | ||||||||||||    
T  22178332 atctt--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtata-taaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgc 22178236  T
Q  212 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    || |||||||| ||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22178235 aaatcaacaacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcaca 22178175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20766181 - 20766095
Alignment:
Q  166 aacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 253  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  20766181 aacacaacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 20766095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26740852 - 26740705
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| ||  |||||||||||| || |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||   |     
T  26740852 catcaagcccccaaca-tgaa-tgattatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacatcgacctcttatataactccaataatttggaac---aa 26740758  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26740757 catctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26740705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 27989137 - 27989004
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||| ||||||| || |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27989137 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttagcatcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacatcat 27989039  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 154  Q
    |||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989038 cat-----tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaa 27989004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 206
Target Start/End: Original strand, 18418590 - 18418678
Alignment:
Q  118 cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 206  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18418590 cttaatcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatac--aaacagcatgacataataatatca 18418678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704129
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 26704129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973862
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 26973862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22107802 - 22107709
Alignment:
Q  42 taatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagac 133  Q
    |||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||    
T  22107802 taatgcatagactcgacttcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcattatcttcaaaaacttagac 22107709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26733014 - 26732892
Alignment:
Q  44 atgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcat 141  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| || |  | ||||||||||||| || |||||||||||||   | ||||||   |||| |||||||||||||    
T  26733014 atgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacatcgacctcttatataactctaataatttggaac---aacatcttg--caacatagaccgactcat 26732920  T
Q  142 gcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||    
T  26732919 gcagcttagttaataaacaacagcaaca 26732892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Original strand, 14047990 - 14048038
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa 65  Q
    |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14047990 catcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa 14048038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 88
Target Start/End: Original strand, 18418528 - 18418580
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctctta 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||    
T  18418528 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctctta 18418580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 169
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032380
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 22032380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 279
Target Start/End: Original strand, 18356389 - 18356485
Alignment:
Q  183 aaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| |||  | |||||| ||||   | |||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  18356389 aaacagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaatatttcttaagtaatgcataaaacattatatcacattataa 18356485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 207
Target Start/End: Original strand, 21873254 - 21873350
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 207  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| || |  ||| |||||| | ||||||||| | ||||||||||    
T  21873254 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataggcaggatacaacatcagcatgacttcataatatcaa 21873350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 41095746 - 41095699
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa 65  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41095746 catcaagcctccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaa 41095699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 263; Significance: 1e-147; HSPs: 68)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12563 - 12297
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12563 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 12464  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12463 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 12364  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12363 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 12297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 50222595 - 50222330
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222595 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 50222496  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222495 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 50222396  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222395 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaa 50222330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15118608 - 15118342
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118608 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 15118509  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118508 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 15118409  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15118408 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 15118342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 44615194 - 44615460
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615194 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 44615293  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615294 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 44615393  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615394 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 44615460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 52312416 - 52312682
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312416 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 52312515  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312516 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 52312615  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52312616 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 52312682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18239675 - 18239409
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239675 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 18239576  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239575 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 18239476  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18239475 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaac 18239409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44773343 - 44773077
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773343 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 44773244  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773243 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 44773144  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44773143 aacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 44773077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1837765 - 1837499
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837765 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 1837666  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1837665 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtc 1837566  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1837565 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattataacaac 1837499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18215531 - 18215264
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18215531 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctctcatataatccaataatttgaaacttcatc 18215432  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215431 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 18215332  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18215331 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 18215264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15355582 - 15355314
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15355582 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacttcttaaatcgactacctcttatataatccaataatttggaacttcaac 15355483  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355482 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 15355383  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15355382 caatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 15355314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 44929137 - 44928873
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44929137 catcaagccaccaacaatgaaatgctaatccatggattcgacctcttaaacatctttaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 44929038  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44929037 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaatgcaag 44928938  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44928937 tcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 44928873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7641438 - 7641182
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641438 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 7641339  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641338 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaac----------acaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 7641249  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7641248 aacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 7641182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 51464123 - 51463858
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51464123 catcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcatc 51464026  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51464025 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaat 51463926  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  51463925 caacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatataacaac 51463858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 38 - 281
Target Start/End: Original strand, 44102140 - 44102384
Alignment:
Q  38 atgctaatgcatggactcgacctctta-acatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102140 atgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccga 44102239  T
Q  137 ctcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattca 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44102240 ctcatgcagcttagttaaataacaacaataacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtctcaattattca 44102339  T
Q  237 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataaca 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44102340 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaca 44102384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23803520 - 23803255
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23803520 catcaagcccacaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataattcaataatttggaacttcatc 23803423  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23803422 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaat 23803323  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23803322 caacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 23803255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 12610857 - 12611115
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  12610857 catcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tattgtataatccaataatttggaacttcatc 12610954  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12610955 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-------acaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaat 12611047  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12611048 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 12611115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 54798967 - 54798729
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaca-tcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54798967 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaaatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttggaacttcatc 54798868  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798867 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 54798768  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 253  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  54798767 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 54798729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16377734 - 16377478
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  16377734 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttacataatccaataatttggaacttcatt 16377635  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377634 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 16377537  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16377536 tcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 16377478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 15402611 - 15402879
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaac-atcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||     
T  15402611 catcaagcccccaacaaagaa-tgcaaatgcatggactcgacttcttaaccatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaa 15402709  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402710 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 15402809  T
Q  215 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15402810 tcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaac 15402879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 84 - 279
Target Start/End: Original strand, 19242673 - 19242867
Alignment:
Q  84 tcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19242673 tcttatataatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaa 19242771  T
Q  184 aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19242772 aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 19242867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 15367602 - 15367866
Alignment:
Q  21 aagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatc 118  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  15367602 aagcccccaacaaagaa-tgctaatgaatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcaacatc 15367700  T
Q  119 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 218  Q
    || | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367701 ttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15367800  T
Q  219 -caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15367801 tcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaac 15367866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 15369926 - 15370193
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||     
T  15369926 catcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaa 15370024  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370025 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 15370124  T
Q  215 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15370125 tcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaact-acgcatatacaattatatcacaatataacaac 15370193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 15371110 - 15371378
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||     
T  15371110 catcaagcccccaacaaagaa-tggtaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaa 15371208  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371209 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 15371308  T
Q  215 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15371309 tcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaac 15371378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 83 - 283
Target Start/End: Original strand, 3514979 - 3515179
Alignment:
Q  83 ctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3514979 ctcttatataatccaataatttagaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacacagcagtatacaa 3515078  T
Q  183 aaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaa 282  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3515079 aaacagcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaa 3515178  T
Q  283 c 283  Q
    |    
T  3515179 c 3515179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 7798682 - 7798940
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7798682 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttagaacatcatc 7798781  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7798782 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 7798881  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  7798882 tcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcaca 7798940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19618415 - 19618162
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttaatcaactt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||      |||||||||||    
T  19618415 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaatagtttggaacattatcatcaacatcttaatcaactt 19618316  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618315 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19618216  T
Q  230 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19618215 ttattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 19618162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 15373391 - 15373659
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||     
T  15373391 catcaagcccccaacaaagaa-tggtaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttgaaacatcaa 15373489  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373490 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 15373589  T
Q  215 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15373590 tcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaac 15373659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14970950 - 14970697
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttaatcaactt 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||    
T  14970950 aatgctaatgcatcgactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacattttaatcaactt 14970851  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970850 agaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaacagcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 14970751  T
Q  230 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14970750 ttattcacatataattcaagtaatacatatataattatatcacaatataacaac 14970697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 20149737 - 20150002
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  20149737 catcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctctttaacatcttaaattgataaactcttgtataatccaataatttggaacttcat- 20149835  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
      |||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20149836 --cttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacacatcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 20149933  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20149934 caatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 20150002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 22636343 - 22636601
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctta-acatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22636343 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaattcaacaacctcttatataatccaataatttggaaaatcatc 22636442  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22636443 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 22636542  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22636543 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 22636601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 16223444 - 16223708
Alignment:
Q  21 aagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatc 118  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  16223444 aagcccccaacaaagaa-tgctaatgaatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcaacatc 16223542  T
Q  119 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 218  Q
    || | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16223543 ttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatctaatgcaagtcaa 16223642  T
Q  219 -caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16223643 tcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacccatatacaattatatcacaatataacaac 16223708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 7893610 - 7893869
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  7893610 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 7893709  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7893710 catcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 7893809  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  7893810 gtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcaca 7893869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 14280221 - 14280434
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14280221 catcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcatc 14280320  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14280321 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 14280420  T
Q  216 caacaacgtctcaa 229  Q
    ||||||| ||||||    
T  14280421 caacaacatctcaa 14280434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 52873580 - 52873375
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52873580 catcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 52873481  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52873480 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 52873381  T
Q  215 tcaaca 220  Q
    ||||||    
T  52873380 tcaaca 52873375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 14038564 - 14038814
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||    
T  14038564 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataattt--------atc 14038655  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14038656 atcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgcaag 14038755  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| |||||||||| ||   ||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  14038756 tcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgcacataacattatatcaca 14038814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8575072 - 8574844
Alignment:
Q  25 ccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaat 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  8575072 ccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatccacaacctcttatataatccaatgctttggaacctcatcatcttaat 8574973  T
Q  124 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  8574972 taacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgtaattcaacaaca 8574874  T
Q  224 tctcaattattcacatataattcaagtaat 253  Q
    |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  8574873 tctcaaatatacattcataattcaagtaat 8574844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 12902665 - 12902923
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  12902665 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 12902763  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  12902764 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaa 12902863  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     ||| |||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  12902864 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 12902923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16270449 - 16270191
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16270449 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 16270350  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270349 catcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 16270251  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    || |||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  16270250 gttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 16270191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 44052737 - 44052995
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44052737 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcgtagattcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 44052836  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  44052837 atcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 44052936  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  44052937 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcaca 44052995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16240183 - 16239927
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  16240183 catcaagcccccatcaatgaaatgctaatgcatggactcgacctgttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatctaataatttggaaacatcat 16240084  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16240083 catcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 16239985  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatca 271  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| || |||||||||| |||  |||||||||    
T  16239984 gtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatca 16239927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 127 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815575
Alignment:
Q  127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaactgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtct 21815632  T
Q  227 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21815631 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcataatataacaac 21815575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 273
Target Start/End: Original strand, 7088832 - 7089043
Alignment:
Q  64 aacatcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac 162  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088832 aacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttagaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac 7088931  T
Q  163 agcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatac 261  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |  |||||| |||| |||||||||||||||| |     
T  7088932 agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaa 7089031  T
Q  262 aattatatcaca 273  Q
     |||||||||||    
T  7089032 cattatatcaca 7089043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 273
Target Start/End: Original strand, 6899808 - 6900056
Alignment:
Q  27 ccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcatcatcttaatc 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  6899808 ccaataatgaaatgctaatgcatggattcgacctcttaaacattttaattcgaaaacctcttatataattcaataatttggaaacatcatcatcttcatc 6899907  T
Q  125 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  6899908 aacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatagcataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 6900006  T
Q  224 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| || ||||||  |||| ||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  6900007 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcaca 6900056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Original strand, 3096201 - 3096379
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatcc-aataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||    
T  3096201 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattattctaataatttggaacatcat 3096299  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga 193  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  3096300 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23374566 - 23374314
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         
T  23374566 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaactcgacaacctcttatattaatccaataatttggaac----- 23374473  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
     ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  23374472 -atcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaa 23374374  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     |||||||| ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  23374373 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 23374314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Original strand, 22353760 - 22354009
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaact-tcatcatcttaatcaacttaga 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||  |||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||| || | || ||||||    
T  22353760 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaatttgac--cctcttatattaatcgaataatttgggaatatcatcatattcaacatcttaga 22353857  T
Q  133 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaatt 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |  |||  |  |  |||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  22353858 ccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaattacaattcaacaacgtctcaatt 22353957  T
Q  232 attcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22353958 attcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 22354009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 15551725 - 15551879
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15551725 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctattaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 15551823  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15551824 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 15551879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14059 - 13800
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaat-cgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||  || |||||||||||  | || ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  14059 catcaagcccccaacaatgaa-tgtgaatgcatggactcaacaactcaacatcttaaaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaac---at 13964  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
T  13963 cttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 13867  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13866 agtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataa 13800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14053514 - 14053323
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||    
T  14053514 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttacattagtccaataatttggaacatcat 14053416  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 207  Q
    |||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || || || | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14053415 catcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaa 14053323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 43198760 - 43198502
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  || ||| ||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  43198760 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactcaacctcttagaa--acaacctcttatataaatccaataatttggaac---atc 43198667  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaaatgca 212  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||  |  ||||| ||||  ||||||||||||    
T  43198666 ttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgca 43198569  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43198568 agtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataa 43198502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 17046395 - 17046549
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  17046395 catcaagccctcaactatgaa-tgttaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 17046493  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17046494 catcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 17046549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 39706502 - 39706356
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctctta-tata-atccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  39706502 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaatatatatccaataatttggaacatca 39706404  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706403 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 39706356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 52243343 - 52243143
Alignment:
Q  78 acaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-ca 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  52243343 acaacctcttatataaatccaataatttggaac---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 52243249  T
Q  175 gtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 272  Q
    |||| ||||  |||  ||||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52243248 gtatgcaaat-cagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaacaacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcac 52243150  T
Q  273 agtataa 279  Q
    | |||||    
T  52243149 attataa 52243143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Original strand, 8846287 - 8846418
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 135  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||| |||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  8846287 aatgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatcatc---atcaacttagaccg 8846383  T
Q  136 actcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8846384 acttattcagcttagttaaataacaaacagcaaca 8846418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 46640663 - 46640411
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| || ||||||||||||| | |  | ||||||||||||| |||||||||||| |||   | |    
T  46640663 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacatcttaacatcttagaccatcgacctcttatataaatccaataatttgaaac---aac 46640568  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgc 211  Q
    || ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||||||     
T  46640567 atttt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatga 46640471  T
Q  212 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    || |||| ||| ||||||    ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  46640470 aaatcaataacatctcaaca--tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcaca 46640411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 12773922 - 12774132
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |  | |||||||| |||||| | ||| | ||||||| | |||||||||||| ||| ||||||    
T  12773922 catcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatcgacacatcatcttaacaacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttg-aacatcatca 12774018  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||| |||     
T  12774019 tc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatacaa- 12774113  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattat 233  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  12774114 tcaacaacatctcaattat 12774132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15464977 - 15464888
Alignment:
Q  182 aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatca 271  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15464977 aaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattatatca 15464888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12288418 - 12288214
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||  | |||||||||| || | |  | ||||||| ||| ||||||||||||||||   ||    
T  12288418 catcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgctgggactcaacaacctaacatcttagaaacaatgatctcttatgtaaatccaataatttggaac---at 12288323  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatg 210  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| |||  ||||| |||| |||||||||||    
T  12288322 catctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatg 12288226  T
Q  211 caagtcaacaac 222  Q
    ||| ||||||||    
T  12288225 caattcaacaac 12288214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 14927946 - 14927842
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| | ||| | | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  14927946 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaactttttataacaacaacctcttatatatatctaataatttggaacatcatc 14927848  T
Q  116 atctta 121  Q
    ||||||    
T  14927847 atctta 14927842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 53082296 - 53082107
Alignment:
Q  81 acctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaa-cagta 177  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| || |||||    
T  53082296 acctcttatataaatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagta 53082202  T
Q  178 tacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     |  |||||||  ||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  53082201 ca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcaca 53082107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Original strand, 29267526 - 29267570
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctc 61  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29267526 catcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctc 29267570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 262
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190618
Alignment:
Q  127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-cg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |  ||| || |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||  ||||| |     
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgtaagcgaacaatca 6190579  T
Q  224 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatataca 262  Q
    |||||||||||||  || | |||||||||||| ||||||    
T  6190580 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtataca 6190618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 14157762 - 14157854
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataatccaataatttggaac 109  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14157762 catcaagccctcaacaatgta-tgctaatgcatggactagacaactcaacctcttagaaacgacaacatcttatatagtccaataatttggaac 14157854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 14164467 - 14164559
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataatccaataatttggaac 109  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14164467 catcaagccctcaacaatgta-tgctaatgcatggactagacaactcaacctcttagaaacgacaacatcttatatagtccaataatttggaac 14164559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 279
Target Start/End: Original strand, 8846472 - 8846543
Alignment:
Q  207 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||| || | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  8846472 aatgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 8846543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 169
Target Start/End: Original strand, 17333298 - 17333338
Alignment:
Q  129 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17333298 tagactgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 17333338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Original strand, 19242624 - 19242672
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa 65  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19242624 catcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaa 19242672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20157597 - 20157522
Alignment:
Q  93 atccaataatttggaact--tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    |||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  20157597 atccaataatttggagttcatcatcgtcttaatcaacttatatagactcatgcaaattagttaaataacaatagca 20157522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 263; Significance: 1e-147; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 18808849 - 18809115
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18808849 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 18808948  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18808949 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 18809048  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18809049 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 18809115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 23135496 - 23135762
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135496 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 23135595  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135596 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 23135695  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23135696 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaac 23135762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23712269 - 23712003
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712269 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 23712170  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712169 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 23712070  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23712069 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 23712003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 39682219 - 39682485
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682219 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 39682318  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682319 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 39682418  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39682419 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 39682485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24905889 - 24905622
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905889 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 24905790  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905789 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 24905690  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905689 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 24905622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24908364 - 24908097
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908364 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 24908265  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908264 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 24908165  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908164 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 24908097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 26505285 - 26505551
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505285 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 26505384  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505385 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 26505484  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505485 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 26505551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 26507763 - 26508029
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507763 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 26507862  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507863 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 26507962  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507963 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 26508029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24898452 - 24898185
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898452 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 24898353  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898352 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 24898253  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898252 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 24898185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24900935 - 24900668
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900935 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 24900836  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900835 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 24900736  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900735 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 24900668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24903412 - 24903145
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903412 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 24903313  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903312 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 24903213  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903212 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 24903145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23709788 - 23709522
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709788 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 23709689  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709688 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 23709589  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23709588 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 23709522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 571303 - 571569
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571303 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 571402  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571403 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 571502  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  571503 aacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 571569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 6725901 - 6726167
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6725901 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttacatcgacaacctcttatataattcaataatttggaacttcatca 6726000  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6726001 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagtc 6726100  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6726101 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 6726167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21155316 - 21155050
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21155316 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcttca 21155217  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21155216 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtc 21155117  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21155116 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 21155050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32039754 - 32039488
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039754 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 32039655  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039654 tcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 32039555  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32039554 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 32039488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45030110 - 45029844
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45030110 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 45030011  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45030010 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaacaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtc 45029911  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  45029910 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatatcacaatataacaac 45029844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 24367679 - 24367946
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367679 catcaagcccccaacaatgtaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 24367778  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367779 attttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 24367878  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24367879 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 24367946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 28577005 - 28577271
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577005 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcaacaacttcttatataatccaataatttggaacttcatca 28577104  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  28577105 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgcaacagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagcc 28577204  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28577205 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 28577271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Original strand, 23130788 - 23131034
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130788 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 23130886  T
Q  136 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130887 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 23130986  T
Q  236 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130987 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 23131034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Original strand, 23133255 - 23133501
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133255 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 23133353  T
Q  136 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133354 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 23133453  T
Q  236 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133454 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 23133501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34402758 - 34402512
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402758 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 34402660  T
Q  136 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402659 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 34402560  T
Q  236 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402559 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 34402512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24529786 - 24529518
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529786 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 24529687  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24529686 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacacatcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagt 24529587  T
Q  216 caacaacgtctcaatta-ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24529586 taacaacgtctcaattatttcatatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaac 24529518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 281
Target Start/End: Original strand, 43137205 - 43137469
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  43137205 catcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaatactttggaacttaatc 43137303  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43137304 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 43137403  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataaca 281  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43137404 caacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaca 43137469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 22105319 - 22105585
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22105319 catcaagtccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttgaaacttcatc 22105416  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105417 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 22105516  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22105517 tcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 22105585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 278
Target Start/End: Original strand, 38967280 - 38967542
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38967280 catcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaaactcctatataatccaatattttggaacttcatc 38967378  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38967379 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacacaacaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaatgcaagt 38967478  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtata 278  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38967479 caatcaacatctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatata 38967542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32215164 - 32214911
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttaatcaactt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||    
T  32215164 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacatcttaatcaactt 32215065  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215064 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 32214965  T
Q  230 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32214964 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 32214911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 23060420 - 23060679
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23060420 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 23060519  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23060520 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 23060619  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||||| ||| || |||| |  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23060620 gtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23060679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 23076349 - 23076608
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23076349 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcggcctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 23076448  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23076449 catcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 23076548  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||||  ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23076549 gtcaacaatatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23076608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24643207 - 24643034
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24643207 catcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatcatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcgtc 24643108  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24643107 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatcagtatacaaaaacagc 24643034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22731446 - 22731189
Alignment:
Q  18 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctta-acatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22731446 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctgttagacatctttattcaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatca 22731347  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22731346 tcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaatt 22731247  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    || |||| | | || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22731246 catcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 22731189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 22337031 - 22337281
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||        |||||||| |||||    
T  22337031 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacttcttaattcgacaacctcttatataa--------tttggaacatcatc 22337122  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337123 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 22337222  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     ||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22337223 acaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 22337281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22738392 - 22738135
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctta-acatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22738392 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggatccgaccttttagacatcttaattcaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 22738293  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22738292 atcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaaataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaatt 22738193  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    || |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22738192 catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 22738135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Original strand, 23659940 - 23660188
Alignment:
Q  26 cccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatc 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  23659940 cccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatc 23660039  T
Q  125 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 223  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23660040 aacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatac-gaaacaggatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaaca 23660138  T
Q  224 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| || ||||||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23660139 tcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcaca 23660188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 19671737 - 19672005
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||     
T  19671737 catcaagctcccaaccatgaaatgctaatgcatagactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaa 19671836  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||    
T  19671837 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgca 19671935  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19671936 agtaaacaacatctcaat-attcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataacaac 19672005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 299026 - 298769
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  299026 catcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatgttaaatcgacaac-tcttgtataatccaaaaatttgaaacttcatc 298929  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  298928 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaa 298829  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     |||||||| ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  298828 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 298769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23040403 - 23040249
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  23040403 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgcactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 23040304  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040303 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 23040249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23654592 - 23654341
Alignment:
Q  24 cccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatctta 121  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||     
T  23654592 cccccaacaatgaa-tgctagtgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttc 23654494  T
Q  122 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 220  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  23654493 aacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaattgcaattcatca 23654394  T
Q  221 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    || ||| || ||||||  ||| | |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  23654393 acatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcaca 23654341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 8946564 - 8946718
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  8946564 catcaagtccctaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 8946663  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8946664 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaaca 8946718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38321 - 38136
Alignment:
Q  25 ccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaat-cgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatctt 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  || | ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38321 ccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactccacctcttaaaacaacataaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatctt 38223  T
Q  121 aatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 207  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38222 caacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 38136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 273
Target Start/End: Original strand, 23285820 - 23286027
Alignment:
Q  64 aacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac 162  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285820 aacatcttaattcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac 23285919  T
Q  163 agcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatac 261  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| || |||||| || |  ||||||||||||||| |     
T  23285920 agcaacataggcagtatacaaaaaca----gacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataaaa 23286015  T
Q  262 aattatatcaca 273  Q
     |||||||||||    
T  23286016 cattatatcaca 23286027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 20309016 - 20309257
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  20309016 catcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacatcttaaacaacttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcat 20309114  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  20309115 catcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatcaaattca 20309211  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 258  Q
    | ||| |||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  20309212 attcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 20309257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23103600 - 23103369
Alignment:
Q  25 ccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaa 122  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  23103600 ccccaacaatgag-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaattagtccaatattttggaacatcatcatcttca 23103502  T
Q  123 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 221  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| |||    
T  23103501 acatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacatgattatatcaaattcaattcatcaa 23103404  T
Q  222 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 256  Q
    | ||||||| |||||   ||||||||||| |||||    
T  23103403 catctcaatcattcattcataattcaagtcatgca 23103369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23072162 - 23072019
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23072162 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgaaaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 23072064  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 159  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23072063 catcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataac 23072019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23708769 - 23708568
Alignment:
Q  78 acaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacaca-aca 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||    
T  23708769 acaacctcttatataaatccaataatttggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggca 23708672  T
Q  175 gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacag 274  Q
    |||| | |||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||| | || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23708671 gtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacat 23708573  T
Q  275 tataa 279  Q
    |||||    
T  23708572 tataa 23708568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7941 - 7688
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||| ||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  7941 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacctcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaac---at 7846  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    | ||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
T  7845 cttctt--tcatcttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 7749  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7748 agtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcaca 7688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 196 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24642933 - 24642846
Alignment:
Q  196 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24642933 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 24642846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 21900667 - 21900562
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  21900667 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 21900568  T
Q  115 catctt 120  Q
    ||||||    
T  21900567 catctt 21900562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Original strand, 25616107 - 25616314
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat------catcttaatcaactt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||    
T  25616107 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattattaacatcttaatcaactt 25616206  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 228  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| || |  |||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  25616207 agactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatctta 25616306  T
Q  229 attattca 236  Q
    | ||||||    
T  25616307 aatattca 25616314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 28405890 - 28406099
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||| |||| | | ||| | ||||||| | |||||||||||||||  ||||||    
T  28405890 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacatcatcttaacaacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaaaatcatca 28405987  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||||||     
T  28405988 tc---atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaa 28406084  T
Q  215 tcaacaacgtctcaa 229  Q
    |||||||| ||||||    
T  28406085 tcaacaacatctcaa 28406099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18787111 - 18786971
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  18787111 catcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaac---at 18787016  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18787015 catctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18786971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 25175763 - 25175972
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  25175763 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttata-agtccaataatttggaacatcatc 25175860  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  25175861 atc---atcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 25175956  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaa 229  Q
     |||||||| ||||||    
T  25175957 atcaacaacatctcaa 25175972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 7679489 - 7679647
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||  |||||| ||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7679489 catcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacttcaacctcttatatatatccaataatttggaacatcat 7679587  T
Q  115 c----atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    |    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7679588 ccatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 7679647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22134419 - 22134266
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||| | | ||  | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  22134419 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaacaacttcatcttata-agtccaataatttggaacatcatca 22134322  T
Q  117 tcttaatcaactt---agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    || | |||| | |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22134321 tcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcaaca 22134266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 23207190 - 23207443
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  ||||||||| || || |    ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  23207190 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaacatcatagaaacattgacctcttatataaatccaataatttggaac---at 23207285  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatg 210  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |  |||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  23207286 catctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatg 23207382  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| ||||| || ||||||  ||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23207383 caaatcaacgacatctcaa-catt-ataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcaca 23207443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20520337 - 20520148
Alignment:
Q  81 acctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagta 177  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||   || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  |||||    
T  20520337 acctcttatataaatccaataatttggaac---attatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagta 20520243  T
Q  178 tacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     | |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20520242 cataaaa-cagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcaca 20520148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22413345 - 22413091
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||||||||||||| |    ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  22413345 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttaaaacattgacctcttatataaatccaataatttggaac---atc 22413250  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacag--catgacataata--atatcaaat 209  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||| |  |||||||  |||||||  ||||| |||| |  |||||||||    
T  22413249 atctt--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacaatatatcaaat 22413153  T
Q  210 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||| |||||||| ||||||    ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22413152 gcaaatcaacaacatctcaa--catcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcaca 22413091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 203 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22459587 - 22459511
Alignment:
Q  203 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22459587 atcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataa 22459511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 234 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22173868 - 22173819
Alignment:
Q  234 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22173868 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 22173819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 273
Target Start/End: Original strand, 23791189 - 23791440
Alignment:
Q  20 caagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcat 117  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||||||||||| || |    ||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||    
T  23791189 caagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacattgacctcttatataaatccaataatttggaac---aacat 23791284  T
Q  118 cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||  | ||| || ||||| |  ||||| | |||| |||  ||||| |||| ||||||||||||||    
T  23791285 ctt--tcatcttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataaaaatatcaaatgcaa 23791381  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     |||||||| ||||||  ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23791382 atcaacaacatctcaaacatt-atatataattcatgtaatgcatatacatttatatcaca 23791440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451894
Alignment:
Q  127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-cg 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| |  ||| || |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |     
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgcaagccaacaatca 32451933  T
Q  224 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatataca 262  Q
    |||||||||||||  || | |||||||||||| ||||||    
T  32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtataca 32451894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24697644 - 24697561
Alignment:
Q  189 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||   |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24697644 catgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaac-ttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcaca 24697561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 169
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287424
Alignment:
Q  129 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 23287424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 169
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392443
Alignment:
Q  129 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26392443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 23713095 - 23713058
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 55  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23713095 catcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactc 23713058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 263
Target Start/End: Original strand, 23004725 - 23004905
Alignment:
Q  81 acctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaac-agta 177  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |   ||||    
T  23004725 acctcttatataaatccaacaatttggaac---atcatctt--tcatcttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagta 23004819  T
Q  178 tacaaaa-acagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaa 263  Q
     | |||| |   || || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | ||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  23004820 cataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca-tcatatataatccacataatgcatatacaa 23004905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 136586 - 136852
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136586 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 136685  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136686 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 136785  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136786 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 136852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 139055 - 139321
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139055 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 139154  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139155 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 139254  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139255 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 139321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 143993 - 144259
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143993 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 144092  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144093 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 144192  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144193 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 144259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 134117 - 134383
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134117 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 134216  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134217 tcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 134316  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134317 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 134383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 141524 - 141790
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141524 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 141623  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141624 tcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 141723  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141724 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 141790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 132572 - 132784
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||| |||||| | ||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  132572 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacatcatcttaacaacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacatcatca 132669  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||   |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||| || ||||| | || |||||| |||| ||     
T  132670 tc---atcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaatgtaa- 132765  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattat 233  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  132766 tcatcaacgtctcaattat 132784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 269
Target Start/End: Original strand, 62216 - 62355
Alignment:
Q  126 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||   |||||||     
T  62216 acttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat-gaaaaacatcatggtataataatatcgaatgca---caacaaca 62311  T
Q  224 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  62312 tctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 62355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 13988772 - 13989038
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988772 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 13988871  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988872 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 13988971  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13988972 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 13989038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21923547 - 21923281
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923547 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 21923448  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923447 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 21923348  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21923347 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 21923281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21475343 - 21475077
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475343 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 21475244  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475243 tcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 21475144  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21475143 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 21475077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23593991 - 23593729
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593991 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 23593892  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593891 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 23593792  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23593791 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 23593729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 29298043 - 29298304
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29298043 catcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgaaacttcatca 29298142  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29298143 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaatgcaagtc 29298241  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29298242 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 29298304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 31612218 - 31612485
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612218 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttatataatccaataatttggaacttcatc 31612317  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612318 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 31612417  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31612418 caacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 31612485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22123324 - 22123057
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123324 catcaagcccccaacaacgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 22123225  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123224 tcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacacaacagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagt 22123125  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22123124 caacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 22123057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 29776593 - 29776860
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776593 catcaagccccaatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 29776692  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  29776693 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaatgcaagt 29776792  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29776793 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 29776860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 36 - 283
Target Start/End: Original strand, 21346885 - 21347134
Alignment:
Q  36 aaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21346885 aaatgctaatgcatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagacc 21346984  T
Q  135 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacgtctcaattat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21346985 gactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattat 21347084  T
Q  234 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21347085 tcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 21347134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 281
Target Start/End: Original strand, 21707072 - 21707337
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21707072 catcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacattctaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcatc 21707171  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21707172 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaatagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgcaagt 21707271  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataaca 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21707272 caacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcacaatataaca 21707337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 281
Target Start/End: Original strand, 21711614 - 21711879
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21711614 catcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacattctaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcatc 21711713  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21711714 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaatagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgcaagt 21711813  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataaca 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21711814 caacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcacaatataaca 21711879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13213099 - 13212851
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13213099 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccg 13213000  T
Q  136 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacgtctcaattatt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13212999 actcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgcaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattatt 13212900  T
Q  235 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13212899 cacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 13212851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45575101 - 45574836
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  45575101 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatca 45575003  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45575002 tcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaaatgca 45574903  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45574902 agtcaacaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 45574836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 34509688 - 34509946
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509688 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 34509787  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34509788 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaatgcaag 34509887  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| ||| |||||| ||   |||  ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34509888 tcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcaca 34509946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 283
Target Start/End: Original strand, 21342021 - 21342269
Alignment:
Q  36 aaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21342021 aaatgctaatgcatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttagacc 21342119  T
Q  135 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacgtctcaattat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21342120 gactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattat 21342219  T
Q  234 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21342220 tcacaaataattcaattaatgcatatacaattacatcacaatataacaac 21342269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Original strand, 21840686 - 21840939
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaactt------catcatcttaatcaactt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |      || |||||||||||||||    
T  21840686 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaaccttttaaatagtccaataatttggaacattgttatcaacatcttaatcaactt 21840785  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840786 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 21840885  T
Q  230 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21840886 ttattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 21840939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 40389062 - 40389327
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  40389062 catcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctctttaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcat- 40389160  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
      |||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389161 --cttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacacatcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 40389258  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40389259 caatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 40389327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 279
Target Start/End: Original strand, 432950 - 433178
Alignment:
Q  50 ggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  432950 ggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt 433049  T
Q  149 agttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattca 247  Q
    |||||||||||    ||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  433050 agttaaataacg---gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattca 433146  T
Q  248 agtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  433147 agtaatgcatatacaattatatcacaatataa 433178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 279
Target Start/End: Original strand, 16361835 - 16362085
Alignment:
Q  36 aaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttaatcaact 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      ||||||||||    
T  16361835 aaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacatcttaatcaact 16361934  T
Q  129 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361935 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacacaacagtatataaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 16362034  T
Q  229 attattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16362035 attattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 16362085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 20 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16275616 - 16275353
Alignment:
Q  20 caagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatc 118  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16275616 caagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacagc-tcttgtataatccaataatttagaacttcatcatc 16275519  T
Q  119 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16275518 ttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgacatagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaa 16275419  T
Q  219 -caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16275418 tcaacgtctcaattattcacataaaattcaattaatgcatataccattatatcacaatataacaac 16275353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 50210430 - 50210168
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa----ctt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |    
T  50210430 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 50210331  T
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50210330 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 50210231  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  50210230 caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 50210168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 22532177 - 22532435
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22532177 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 22532276  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  22532277 atcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccattgcaat 22532376  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| ||| || ||||||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22532377 tcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 22532435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27250942 - 27250684
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  27250942 catcaagcccctatcaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaatctcttatattagtccaataatttggaacatcat 27250844  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27250843 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 27250744  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     ||| |||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  27250743 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 27250684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 84 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15860197 - 15859998
Alignment:
Q  84 tcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15860197 tcttatataatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaa 15860099  T
Q  184 aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaa 282  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15860098 aacaacatgacataataatattaaatgcaagtcaatcaacgtcttaattactcacaaataattcaatcaatgcacatacaattatatcacaatataacaa 15859999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20847367 - 20847173
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  20847367 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 20847269  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 209  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  20847268 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatcaaat 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 271
Target Start/End: Original strand, 20135089 - 20135351
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat- 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  20135089 catcaagcccccaactatgaaatgctgatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatatagtccaataatttggaacatcatc 20135188  T
Q  115 -----catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 208  Q
         ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| || |  |||  ||||| |||| ||||||||||||||||||      
T  20135189 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatcatg 20135288  T
Q  209 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataa-ttcaagtaatgcatatacaattatatca 271  Q
    ||||| |||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  20135289 tgcaattcaacaacatcttaagtattca-ataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatca 20135351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22468910 - 22468651
Alignment:
Q  22 agcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaac---ttcatca- 116  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||   |||||||     
T  22468910 agcccccaacaaatatatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcttaatcaaacaacctcgtatatagtccaaaaatttggaacatcttcatcaa 22468811  T
Q  117 --tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22468810 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaattgcaa 22468711  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     |||||||| ||| |||||||||   |||  |||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22468710 ttcaacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcaca 22468651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 33680919 - 33681178
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||  |||| | | || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33680919 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaaccacttagaacaaccacctcttatataagtccaataatttggaacatcatc 33681017  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  33681018 atctt---caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 33681113  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||  |||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  33681114 gtcgtcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 33681178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14295745 - 14295500
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||  |||||||    
T  14295745 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacattttagacc 14295646  T
Q  135 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaatta 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| || |||||||   ||||||||    
T  14295645 gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaatta 14295550  T
Q  233 ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
     ||| |  ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14295549 -tcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataacaac 14295500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21896464 - 21896205
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  || ||||||||| || | |   |||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  21896464 catcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaactcaacatcttagaaacaatggcctcttatataaatccaataatttggaacatctt 21896366  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    | |     ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  21896365 cct-----tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgca 21896272  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21896271 agtcatcaacatctcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataa 21896205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27161719 - 27161617
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161719 catccagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactagacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttatataatccaataatttggaacttcatc 27161620  T
Q  116 atc 118  Q
    |||    
T  27161619 atc 27161617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 38801600 - 38801447
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  38801600 catcaagcccccaactatgaa-tgcttatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 38801502  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    |||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38801501 catcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 38801447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 273
Target Start/End: Original strand, 21026649 - 21026846
Alignment:
Q  78 acaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acag 175  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  21026649 acaacctctcatattagtccaataatttggaacatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcag 21026748  T
Q  176 tatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  ||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21026749 tatacaaaatcagcatgacgtaaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 21026846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21861714 - 21861519
Alignment:
Q  81 acctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagta 177  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| |  |||||    
T  21861714 acctcttatataaatccaataatttggaac---atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagta 21861620  T
Q  178 tacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtat 277  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  21861619 tgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattat 21861521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 22237539 - 22237788
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||| |||| | | ||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||    
T  22237539 catcaagcccccaacgatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacaacttagaacaacaacctcttatacaagtccaataatttgaaacatcatc 22237637  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |  || ||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  22237638 atctt---caacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 22237733  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    |||| |||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22237734 gtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 22237788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20454752 - 20454613
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttaatcaactt 129  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||      |||||||||||    
T  20454752 aatgttaatgcatggactcgacatcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacattatcatcaacatcttaatcaactt 20454653  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454652 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 20454613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 35261286 - 35261036
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||||||||||| || | || ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  35261286 catcaagcctccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaacataat 35261188  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
      |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  35261187 --tcttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgca 35261094  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    | ||||||   ||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35261093 aatcaaca---tctcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 35261036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 21753959 - 21754170
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | || |||||||| |||| | | ||| | ||||||| | ||||||||||||||||  |||||    
T  21753959 catcaagcccccaacaatgga-tgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacaacatca 21754056  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||||||||||     
T  21754057 tc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa- 21754151  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattat 233  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  21754152 tcaacaacatctcaattat 21754170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 52928176 - 52928038
Alignment:
Q  20 caagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatc 118  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||  ||||||| |||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  52928176 caagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacaacaacttaacaacttagaacaacaacctcttatataagtccaataatttggaacatcaccatc 52928078  T
Q  119 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928077 tt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 52928038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 21477549 - 21477643
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttat-ataatccaataatttggaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21477549 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaac 21477643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Original strand, 16758570 - 16758822
Alignment:
Q  25 ccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaa 122  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  || | ||||||| || | || ||||| |||| || ||||||||||||||||   ||||||||      
T  16758570 ccccaacaatgaa-tgcaaatgcatggactcaacgactcagcatcttagaaacaacgacctcgtataaaaatccaataatttggaac---atcatctt-- 16758663  T
Q  123 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||  |||  ||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaac-cagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaa 16758762  T
Q  219 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||| || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16758763 caacatcacaac-attcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 16758822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22922077 - 22921830
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| | ||  | |||| ||||| || | ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  22922077 catcaagcccctaacaatgaa-tgttaatgcatggacacaacaacataacttcttataaacaacaacctcttatatt-tccaataatttggaacatcatc 22921980  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  22921979 atc---atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 22921884  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
     |||||||| |||||| |||  ||  | ||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22921883 atcaacaacatctcaaatatcaac--aaaattcatataatgtatatacaattatat 22921830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41050244 - 41049991
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||| ||||||| || | || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41050244 catcaagcccctaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttagcatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcat 41050146  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaa-cagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaaatgc 211  Q
    | |     ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| |  ||||||| |||| |   ||||| |||| ||||||||||||    
T  41050145 cct-----tcatcttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgc 41050051  T
Q  212 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    || |||||||| ||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41050050 aaatcaacaacatctcaaca--tcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcaca 41049991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 20248193 - 20248332
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | || |||||||| |||| | |  || | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  20248193 catcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaacatcatcatcttata-agtccaataatttggaacatcatca 20248290  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20248291 tc---atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaa 20248332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 183
Target Start/End: Original strand, 21161635 - 21161792
Alignment:
Q  21 aagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatct 119  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    |||| || || ||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  21161635 aagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggacttgacatcttaaacatcttaaa----caacttcgtaaatagtccaataatttggaacatcatcatc- 21161729  T
Q  120 taatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaacagtatacaaa 183  Q
      |||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21161730 --atcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaacaaaacagtatgcaaa 21161792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 50686525 - 50686778
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||||||||||| | |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||   | |    
T  50686525 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaac---aac 50686620  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||| |  ||||  | |||| |   ||||| |||| ||| |||||||||    
T  50686621 atctt--tcatcttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaatagttcatgatataacaatgtcaaatgca 50686718  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    | |||||||| ||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  50686719 aatcaacaacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcaca 50686778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16368493 - 16368361
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||| ||||||| | |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16368493 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttagcatcttagaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaacatcatc 16368395  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 154  Q
    ||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368394 at-----tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaa 16368361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714600
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 21714600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 279
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918772
Alignment:
Q  124 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| || |||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 20918718  T
Q  222 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
       |||||||| ||| |  ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  20918719 ---ctcaatta-tcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 20918772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354527
Alignment:
Q  184 aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 22354527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 279
Target Start/End: Original strand, 12271642 - 12271725
Alignment:
Q  195 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| || ||||| | |||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  12271642 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa-tatttacgtataactaaagtaatatatatacaattatatcacattataa 12271725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Original strand, 20916135 - 20916182
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa 65  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20916135 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacctcttaa 20916182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 26064851 - 26065104
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  |||||||||||| || |    ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  26064851 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacattgacctcttatataaatccaataatttggaac---at 26064946  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaaatgc 211  Q
    ||||||  ||| | |||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| |  ||||| | ||||  |  ||||| |||| |||| ||| |||    
T  26064947 catctt--tcatcatagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaataccaa-tgc 26065043  T
Q  212 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    || |||||||| ||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26065044 aaatcaacaacatctcaaagat-catatataattcaagtaatacatatacaaatatatcaca 26065104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 54
Target Start/End: Original strand, 431664 - 431701
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggact 54  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  431664 catcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggact 431701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24783230 - 24783155
Alignment:
Q  93 atccaataatttggaact--tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24783230 atccaataatttggatttcatcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 24783155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 42865406 - 42865273
Alignment:
Q  38 atgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca---tcatcttaatcaacttaga 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||  || | |||||| || ||||||||||||||  ||||   ||||||| |||| |||| |    
T  42865406 atgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa-tcatcatc-tcttatgta-tccaataatttggaggttcaacatcatcttgatcatcttata 42865310  T
Q  133 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  42865309 tcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcaaca 42865273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21534013 - 21533948
Alignment:
Q  84 tcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtta 153  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21534013 tcttatataactccaataatttgga---tcaacatctta--catcttagaccgactcatgcagcttagtta 21533948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15860246 - 15860198
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa 65  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15860246 catcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaa 15860198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 13298 - 13564
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13298 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 13397  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13398 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 13497  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13498 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaac 13564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 37727 - 37993
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37727 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 37826  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37827 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 37926  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37927 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 37993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 40306 - 40572
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40306 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 40405  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40406 tcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaatgcaagtc 40505  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40506 aacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 40572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 158707 - 158440
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158707 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 158608  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158607 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 158508  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  158507 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 158440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 340160 - 339905
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  340160 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataattttgaacttcatc 340061  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  340060 atcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-acaacaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat-caag 339964  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  339963 tcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcaca 339905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 13853 - 14119
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13853 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgatctcgtaatatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 13952  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13953 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtc 14052  T
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14053 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 14119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 11969 - 12230
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11969 catcaagccaccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 12068  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12069 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtta------aacagcaacacagcagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 12162  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12163 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 12230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 9654 - 9922
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9654 catcaagcccccaacaatgaaaaaataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcctatataatccaataatttgggacttcatc 9753  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  9754 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaagtgcaagt 9853  T
Q  216 caacaacgtctcaatta-ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9854 caacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaac 9922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 32849 - 33107
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  32849 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 32948  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32949 catcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 33047  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    || |||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  33048 gttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 33107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 38668 - 38926
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  38668 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactagaactcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 38767  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38768 catcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 38866  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     | |||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  38867 ataaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 38926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Original strand, 32383 - 32465
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32383 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaa 32465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 278
Target Start/End: Original strand, 4119 - 4382
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4119 catcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 4218  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4219 atcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacacagcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaatgcaagt 4318  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtata 278  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4319 caatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatata 4382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 38 - 281
Target Start/End: Original strand, 16710 - 16954
Alignment:
Q  38 atgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccga 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16710 atgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgaccaactcttgtataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccga 16809  T
Q  137 ctcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattca 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16810 ctcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattta 16909  T
Q  237 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataaca 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16910 catataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaca 16954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 85837 - 85569
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85837 catcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 85738  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85737 atcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 85638  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  85637 caatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 85569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Original strand, 501003 - 501256
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca------tcttaatcaactt 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||      |||||||||||||    
T  501003 aatgctaatgcatagactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacataatcaacaacatcttaatcaactt 501102  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501103 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 501202  T
Q  230 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  501203 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 501256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 160596 - 160854
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataat-ccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||    
T  160596 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacgcaacctcttaacaacttaaagcaacaacctcttaaataattccaataatttgggacatcatc 160694  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||||||||||    
T  160695 atc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa 160790  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
     |||||||| | |||| || ||| | |||| ||| |||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  160791 -tcaacaacatgtcaaata-tcaaacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataa 160854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 283
Target Start/End: Original strand, 81977 - 82244
Alignment:
Q  16 acatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaac-ttca 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  81977 acatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaaccttca 82074  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82075 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 82174  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  82175 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 82244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22878 - 22620
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||| | | ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  22878 catcaagcccccaa-aatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaacaacaacctcttatacaagtccaataatttggaacatcatc 22781  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  22780 acctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 22685  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||| |||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  22684 gtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 22620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Original strand, 13 - 278
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13 catcaagcccccaacaaagaa-tgccaatacatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataattgggaacttcatc 110  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  111 atcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaat 210  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  211 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2369 - 2118
Alignment:
Q  34 tgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttaga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2369 tgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacattttaaaccgacaacctcttatataatccaataatttagaacttcatcattttaatcaacttaga 2270  T
Q  133 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacgtctcaatt 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2269 ccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaattaacgtctcaatt 2170  T
Q  232 attcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2169 attcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 2118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18241 - 17976
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||     
T  18241 catcaaccccccaacactgaaatgataatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaa 18142  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  || ||| | | |||| ||||| ||||||||||| || |||    
T  18141 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgc-acaacatcatgatataataatatcgaacgca 18043  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18042 agtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 17976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Original strand, 29856 - 30104
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatc-aacttagacc 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29856 aatgctaatgcatggaatcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacttcatcatcttaattgaacttagacc 29955  T
Q  135 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  29956 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacgtctcaattatt 30055  T
Q  235 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30056 cacatataattcaaataattcatatacaattatatcacaatataacaac 30104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44920 - 44682
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44920 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatattaaatcgacaacctcttatataatccaatactttggaacttcatc 44821  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44820 atcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 44721  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 253  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  44720 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 44682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 115 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26020
Alignment:
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 26080  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     ||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  26079 ttcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 26020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 161347 - 161080
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  161347 catcaagcccctatcgctgaaatgttaatgcatggactcgacttcttaaacattttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgaaacttcatc 161248  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  161247 atcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacacagcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaatgcaagt 161148  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaa 282  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  161147 caatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaa 161080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164580
Alignment:
Q  190 atgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 164580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1535 - 1270
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1535 catcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcatc 1436  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1435 ---ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatgagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 1339  T
Q  216 caa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1338 caatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaac 1270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Original strand, 116334 - 116571
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaa-taatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  116334 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaaatactttggaacttcat 116433  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  116434 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatac-aaaacagcatgacataatcatatcaaatgcaag 116532  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 253  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  116533 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 129111 - 128925
Alignment:
Q  84 tcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatac 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||| |     
T  129111 tcttatataaatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacat 129018  T
Q  181 aaaaacag-catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||  |  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  | ||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  129017 aaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcaca 128925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 83 - 283
Target Start/End: Original strand, 4666 - 4866
Alignment:
Q  83 ctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4666 ctcttatataatccaataatttggaacctcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaa 4765  T
Q  183 aaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaa 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4766 aaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaa 4865  T
Q  283 c 283  Q
    |    
T  4866 c 4866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Original strand, 10692 - 10945
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaactt------catcatcttaatcaactt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |      || |||||||||||||||    
T  10692 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaaccttttaaatagtccaataatttggaacattgttatcaacatcttaatcaactt 10791  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10792 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 10891  T
Q  230 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10892 ttattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 10945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Original strand, 9161 - 9414
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat------catcttaatcaactt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || |      |||||||||||||||    
T  9161 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaaccttttaaatagtccaataatttggaacatcgttatcaacatcttaatcaactt 9260  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9261 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 9360  T
Q  230 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  9361 ttattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 9414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 4416 - 4673
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  4416 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttggaacataatc 4515  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4516 attttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 4614  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4615 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 4673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 11998 - 12255
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  11998 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttggaacataatc 12097  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12098 attttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 12196  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12197 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 12255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 21950 - 22207
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  21950 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttggaacataatc 22049  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050 attttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 22148  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22149 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 22207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16813 - 16555
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16813 catcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgaaacatcatc 16714  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16713 atcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatggaag 16614  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||| | |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16613 tcaacagcatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 16555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3363 - 3106
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3363 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 3264  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3263 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 3165  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3164 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 3106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 1759 - 2017
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1759 catcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 1858  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  1859 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaat 1958  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  1959 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 2017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 273
Target Start/End: Original strand, 13127 - 13377
Alignment:
Q  25 ccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaat 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  13127 ccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcat 13226  T
Q  124 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  13227 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaac 13326  T
Q  223 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13327 atcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 13377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 51821 - 52079
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51821 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaaacaaaaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 51920  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51921 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 52020  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  52021 tcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 52079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 168191 - 167934
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  168191 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 168093  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  168092 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaa 167993  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     ||| |||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  167992 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaac-attatatcaca 167934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 128659 - 128916
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  128659 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 128758  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 215  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128759 atcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaacaaaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 128858  T
Q  216 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  128859 caacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcaca 128916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 127 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20373
Alignment:
Q  127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 20426  T
Q  227 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20425 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 20373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 282
Target Start/End: Original strand, 11207 - 11459
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttaatcaactt 129  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||      |||||||| ||    
T  11207 aatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacattatcatcaacatcttaatcaaatt 11306  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11307 agaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 11406  T
Q  230 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaa 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11407 ttattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaa 11459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12492 - 12239
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttaatcaactt 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||      |||||||||||    
T  12492 aatgctaatgcatgtactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggtacatcatcatcaacatcttaatcaactt 12393  T
Q  130 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12392 agaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 12293  T
Q  230 ttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12292 ttattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaac 12239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 16021 - 16278
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16021 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgaaaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 16120  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  16121 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaaatgcaag 16220  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 272  Q
     ||||| | |||||| ||| ||   |||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16221 ccaacatcatctcaagtatacattcataactcaagtaatgcatataacattatatcac 16278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33169 - 32913
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33169 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 33070  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  33069 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 32971  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||    
T  32970 tcaacaacatcttaaatattca-ttatacttcgagtaatgcatataacattataacaca 32913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 45836 - 46092
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45836 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 45935  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  45936 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 46034  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||    
T  46035 tcaacaacatcttaaatattca-ttatacttcgagtaatgcatataacattataacaca 46092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17538 - 17388
Alignment:
Q  21 aagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatct 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17538 aagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcaacctcttaaacattttagaacgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatct 17439  T
Q  120 taatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac 170  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17438 tcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacac 17388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3403 - 3141
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaac-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa----ctt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |    
T  3403 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaatatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 3304  T
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3303 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatg 3204  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     || |||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  3203 taattcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 3141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8742 - 8488
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8742 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 8643  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8642 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca---gcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 8547  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  8546 tcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 8488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 3378 - 3636
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctta-acatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3378 catctagcccccaaaaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaattcaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 3477  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  3478 atcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaat 3577  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  3578 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcaca 3636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 252 - 508
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  252 catcaagcccccaacaaagaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgaca-cctcttatatagtctaataatttggaacatcatc 350  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || |||    
T  351 atctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatac-aaaatagcatgacgtaataatatcaattggaag 449  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||| ||| || |||||   |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  450 tcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 84 - 273
Target Start/End: Original strand, 22859 - 23048
Alignment:
Q  84 tcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22859 tcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaccagtatacaaa 22958  T
Q  184 aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22959 aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17434 - 17170
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa----ctt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    | |    
T  17434 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcgtaaacatcttaattcgacaacctctcatataatccaataatttggaaacatcat 17335  T
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatac--aaaaacagcatgacataataatatcaaa 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17334 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatcaaa 17235  T
Q  209 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  17234 tgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 17170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79274
Alignment:
Q  127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtct 79331  T
Q  227 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  79330 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatataacaac 79274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1261 - 1004
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  1261 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 1163  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1162 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaa 1063  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     ||| |||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1062 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaac-attatatcaca 1004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 25803 - 26061
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctta-acatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  25803 catcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttatacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 25902  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  25903 tatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatcaaatgcaa 26001  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    || |||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  26002 gtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcaca 26061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Original strand, 39766 - 40023
Alignment:
Q  18 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacat-cttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  39766 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaaaacttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatc 39865  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  39866 atcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatcaaatgcaag 39964  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    | |||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  39965 taaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcaca 40023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 273
Target Start/End: Original strand, 39392 - 39642
Alignment:
Q  25 ccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaact-tcatcatcttaa 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| |    
T  39392 ccccaacaattaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattggacaacctcttatataatccaataatttggaaagatcatcgtcttca 39491  T
Q  123 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39492 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 39590  T
Q  222 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    | |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  39591 catctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 39642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 75420 - 75170
Alignment:
Q  25 ccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaact-tcatcatcttaa 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| |    
T  75420 ccccaacaattaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattggacaacctcttatataatccaataatttggaaagatcatcgtcttca 75321  T
Q  123 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75320 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 75222  T
Q  222 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    | |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  75221 catctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 75170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38915 - 38651
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38915 catcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgaaaacctcttatataatccaataatttggaacctcatc 38816  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  38815 atcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaa 38717  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||| |||  |||||| |||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38716 gtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataa 38651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6337 - 6076
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6337 catcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatagactcgacctcttaaacatcttaatttgacaacctcttatataatccaaaaatttggaacatcatc 6238  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa----cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  6237 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaattgc 6138  T
Q  212 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    || ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  6137 aattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 6076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 222
Target Start/End: Original strand, 28321 - 28529
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  28321 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaatagtttggaacatcat 28420  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28421 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 28520  T
Q  214 gtcaacaac 222  Q
     ||||||||    
T  28521 ttcaacaac 28529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 4459 - 4605
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  4459 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctctaaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatca 4557  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4558 tcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 1904 - 2050
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  || ||| | || |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  1904 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagactcgacctcttaaaacaacttgattcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatca 2002  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2003 tcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 2050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 222
Target Start/End: Original strand, 11252 - 11407
Alignment:
Q  69 cttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagca 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11252 cttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagca 11351  T
Q  167 acaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 222  Q
    ||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  11352 acataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac 11407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 39821 - 40078
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39821 catcaagtccccaacaatgaaatgctaatgcatggacccgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 39920  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  39921 atcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcatg 40019  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||| ||| ||| || ||||    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  40020 tcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 40078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20093 - 19840
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||    || ||||||||||| ||  |||||| ||||| || |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  20093 catcaagcccccaacaatgaataagta-tgcatggactcaacaacttaacctcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaac---at 19998  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatg 210  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| |  |||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  19997 catctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatg 19901  T
Q  211 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| |||||||| |||||     ||| | |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19900 caattcaacaacatctca--gcatcataaataactcatgtaatgcatatacatttatatcaca 19840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 114 - 281
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4467
Alignment:
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 4399  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataaca 281  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4400 atcaacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaca 4467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 4757 - 5015
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  4757 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaaattaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 4855  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4856 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaa 4955  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     |||||||| ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  4956 ttcaacaacatcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 5015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 8389 - 8628
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaca-tcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8389 catcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaaatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 8486  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8487 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaattgcaag 8586  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 256  Q
    |||||||| ||| ||  |||||  | || |||||||||||||    
T  8587 tcaacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgca 8628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15451 - 15298
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15451 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttatataatccaataatttggaacttcatc 15352  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15351 atcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaaca 15298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Original strand, 1201 - 1351
Alignment:
Q  21 aagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatc 118  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  1201 aagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatc 1299  T
Q  119 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1300 ttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 1351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 161
Target Start/End: Original strand, 7193 - 7319
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  7193 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagacc 7292  T
Q  135 gactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7293 gactcatgcagcttagttaaataacaa 7319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 121674 - 121827
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  121674 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatattaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 121773  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  121774 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca 121827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 174674 - 174913
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctctta-tataatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| | || |||||||||||||| | ||||    
T  174674 catcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgataacctcttaatttagtccaataatttggagcatcat 174772  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    || ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||   ||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  174773 caacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatcaaattca 174869  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 256  Q
    | |||||||| ||||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  174870 attcaacaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgca 174913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 136592 - 136491
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||||| || |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  136592 catcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcgacaactcaacatcttagaaacctcgacctcttatataaatccaataatttggaacatcat 136494  T
Q  115 cat 117  Q
    |||    
T  136493 cat 136491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 145300 - 145199
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||||| || |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  145300 catcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcgacaactcaacatcttagaaacctcgacctcttatataaatccaataatttggaacatcat 145202  T
Q  115 cat 117  Q
    |||    
T  145201 cat 145199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 273
Target Start/End: Original strand, 124675 - 124751
Alignment:
Q  197 aataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  124675 aataatatcaattgcaattcatcaacgttttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 124751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 1860 - 2103
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  1860 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 1958  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  1959 catcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaattgcaa 2058  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 258  Q
     |||||||| ||| || |||||| | || ||||||||||||||||    
T  2059 ttcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcata 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 5046 - 4893
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5046 catcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatc 4947  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4946 atcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaca 4893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1006 - 918
Alignment:
Q  184 aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  1006 aacagcatggcataataatatcaa-tgcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 4620 - 4803
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa-cttcat 114  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4620 catcaagcccctaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcat 4718  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataa 198  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4719 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataa 4803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 181 - 329
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  181 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatt 280  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 164  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  281 atcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacag 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 34031 - 34291
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34031 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagactcgacctcttaagcaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 34129  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||| ||  || ||||| ||||||||||| |||| |    
T  34130 catcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac-aacccatcatgatataataatatcgaatgta 34228  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    | |||||||   |||||||| ||| |  ||| |||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  34229 aatcaacaa---ctcaatta-tcaaacttaagtcaagtaatatatatacaattatataacattataa 34291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Original strand, 13158 - 13258
Alignment:
Q  173 cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  13158 cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcac 13257  T
Q  273 a 273  Q
    |    
T  13258 a 13258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 31975 - 32230
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  31975 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcat 32073  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  32074 catcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacaacatgacataataatatcaatttcaa 32171  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     ||| |||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32172 ttcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcataaac-attatatcaca 32230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 11371 - 11636
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||     
T  11371 catcaagcccctatcgctgaaatgataatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaa 11470  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | | |    
T  11471 catcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgta 11569  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11570 agtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 11636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38470 - 38205
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||     
T  38470 catcaagcccctatcgctgaaatgataatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaa 38371  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | | |    
T  38370 catcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgta 38272  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38271 agtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 38205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10637 - 10395
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacat--cttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  10637 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatca 10539  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 211  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |    
T  10538 tcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataataatatcaatttc 10442  T
Q  212 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 258  Q
    || |||||||| ||| || ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  10441 aattcaacaacatcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcata 10395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 15571 - 15829
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15571 catcaagcccccaacaaagaa-tgctaatccatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcatc 15668  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||  || ||||| ||||||||||| |||| ||    
T  15669 atcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaac-catcatgatataataatatcgaatgtaa 15767  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
     ||||||||   |||||||| || |  ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  15768 atcaacaac---tcaattat-caaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 15829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11657 - 11464
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacat--cttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  11657 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatct 11559  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 207  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11558 tcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Original strand, 13404 - 13596
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacat--cttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  13404 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatca 13502  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 207  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  13503 tcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacatgataatatcaa 13596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27957 - 27697
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  27957 catcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaac---at 27862  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaac-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  27861 catctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgta 27765  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataac 280  Q
    | |||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27764 aatcaacaacatctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataac 27697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 133
Target Start/End: Original strand, 3442 - 3539
Alignment:
Q  38 atgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagac 133  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  3442 atgctaatgcatggacttgacttcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagac 3539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 133
Target Start/End: Original strand, 7506 - 7603
Alignment:
Q  38 atgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagac 133  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  7506 atgctaatgcatggactagacttcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagac 7603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 20817 - 21077
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||     
T  20817 catcaatcccccaacaatgaaatcctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcaa 20916  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |  || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20917 catcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 21016  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    | |||||||| ||| |  |||||| || |  | ||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21017 attcaacaacatcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcaca 21077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 4426 - 4675
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4426 catcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttaaa-caacaacctcgtatataatccaataatttggaacatcatc 4524  T
Q  116 atcttaatcaac-------ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 207  Q
    ||||||||||||        |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |  |||||| ||| | ||||| || || ||||||||||    
T  4525 atcttaatcaacctcttatatagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaa 4624  T
Q  208 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 258  Q
    ||  || |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||    
T  4625 atataattcaacaacatcttaaatattcatttatacttcaagtaatgcata 4675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15677 - 15485
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa--catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  || ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  15677 catcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggactagacctcttaaaacaacttgattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatca 15579  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 207  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15578 tcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaa 15485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 169
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7352
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 7352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 46903 - 47048
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  46903 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttgaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 47001  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47002 catcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaa 47048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 8379 - 8640
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataat-ccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||| ||||| || | ||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||    
T  8379 catcaagccaccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaactactcaacctcttagaaacaacaacctcttatataaaaccaataatttggaat---at 8474  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8475 cttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgca 8571  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatataca--attatatcacagtataa 279  Q
    ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||    
T  8572 agtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataa 8640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 6445 - 6695
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| ||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  6445 catcaagcccgcaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaaaaacaacctcttata-agtccaataatttggaacatcatc 6542  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  6543 atcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 6641  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
     |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  6642 atcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16308 - 16048
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  || ||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  16308 catcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaactcaacatcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaac---at 16213  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |   ||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||| |    
T  16212 catctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgta 16116  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataac 280  Q
    | |||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16115 aatcaacaacatctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataac 16048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 280
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13302
Alignment:
Q  127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  225 ctcaatt-attcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataac 280  Q
    || ||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13246 ctgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataac 13302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 154
Target Start/End: Original strand, 2638 - 2707
Alignment:
Q  81 acctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2638 acctcttatataaatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaa 2707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 135
Target Start/End: Original strand, 32068 - 32188
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaac-ttcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  32068 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacaatcat 32167  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccg 135  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  32168 catcttcatcaacttagaccg 32188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10750 - 10491
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | || |||||||| |||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  10750 catcaagcccccaacgatgaa-tgcaaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaacaacaacctcttatataagtccaataatttggaacatcacc 10652  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  10651 atctt---caacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 10556  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||| |||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  10555 gtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 10491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 46001 - 45742
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  46001 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatc 45903  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| ||    
T  45902 atc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaa 45807  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||| |||| ||||||||| ||| | |||||||| || ||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  45806 gtcatcaacatctcaatta-tcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataa 45742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 5341 - 5196
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  5341 catcaagcccccaactatgaa-tgttaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacgtcat 5243  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5242 catcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 5196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1247 - 1102
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1247 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 1149  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1148 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 6519 - 6664
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6519 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 6617  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6618 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 6664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 13899 - 14044
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13899 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 13997  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13998 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 14044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1263 - 1018
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagacc 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  1263 aatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagacc 1164  T
Q  135 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaatta 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| || |||||||   ||||||||    
T  1163 gactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaatta 1068  T
Q  233 ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
     ||| |  ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1067 -tcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataacaac 1018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1262 - 1124
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttata-taatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||    
T  1262 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaaatagtccaataatttggaacatcat 1164  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 154  Q
    |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1163 catcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaa 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Original strand, 27783 - 27913
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa--cttca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  27783 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaaaccatca 27882  T
Q  114 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgca 144  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27883 tcatcttcataaacttagaccgactcatgca 27913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 273
Target Start/End: Original strand, 27911 - 27996
Alignment:
Q  188 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 27996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 19175 - 19424
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||  |||||| ||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19175 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacataacaacttaacttcttataaacaacaacctcttatataagtccaataatttggaacatcat 19273  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  19274 catc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 19369  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    | |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19370 aatcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 19424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 53757 - 53498
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||  || | ||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  53757 catcaagcccccaacaatgaa-tgtgaatgcatggactcaacaactcatcatcttataaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaac---at 53662  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    | ||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
T  53661 cttctt--tcatcttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 53565  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  53564 agtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataa 53498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 40 - 290
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  40 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttataatcaacaacctcttaagtatatccaataatttggaacatcat 138  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  139 catc---atcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 234  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    | |||||||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  235 aatcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2852 - 2713
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  2852 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttaaaacaacaacctcttata-agtccaataatttggaacatcatca 2755  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2754 tc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 2713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15990 - 15845
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 114  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15990 catcaaacccccaacaatgaa-tgctaatgcatagacacaacaacttaacttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 15892  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15891 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178952
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 178952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 12481 - 12739
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||   || ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  12481 catcaagcccccaacgat-aaatgcgaatgcatggactcaacaacttaacatcttagaaaaaacgacctcttatataaatccaataatttggaac---at 12576  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    | ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  12577 cttctt--tcatcttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgca 12673  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    ||||| |||| |||||| || | | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12674 agtcatcaacatctcaaatacttatatataattc-agtaatgtatatacaattatatcacattataa 12739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 32446 - 32696
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||| ||||| || | || ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  32446 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacctcttagaaacaacgacctcttatataaattcaataatttggaacatcat 32544  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |  |||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  32545 catctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgca 32641  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    | |||||||| ||||||  | ||| | |||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  32642 a-tcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatat 32696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51839
Alignment:
Q  127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-cg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |  ||| || |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |     
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagca-cataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatc-aatgcaagccaacaatca 51888  T
Q  224 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||||||||  || | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  51887 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtatac-attatatcaca 51839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2613 - 2494
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2613 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcat 2515  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccg 135  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  2514 catcttcaacaacttagaccg 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24092 - 23942
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24092 catcaatcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaacaacaacctcttatataagtccaataatttggaacatcatc 23994  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23993 atctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaaca 23942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Original strand, 51509 - 51644
Alignment:
Q  37 aatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagacc 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| || | || ||||||||    
T  51509 aatgctcatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcattttcaacatcttagacc 51608  T
Q  135 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51609 gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 51644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14907 - 14658
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaat-cgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14907 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcttatattcaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacatcat 14809  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||| | |||| || ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14808 catc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagta-agaaaatcatcatgatatagtaatatcgaatgca 14713  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    | |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  14712 aatcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatactattatat 14658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 222
Target Start/End: Original strand, 16191 - 16395
Alignment:
Q  18 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctta-acatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| || | || ||||||||||||| |||||    
T  16191 atcaagcgcccaactatgaa-tgctattgcatggactcgatctcttagacaacttaattcgacaacctcttacattagtctaataatttggaacatcatc 16289  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  16290 atcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatcaaattcaa 16386  T
Q  214 gtcaacaac 222  Q
     ||| ||||    
T  16387 ttcatcaac 16395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24257
Alignment:
Q  126 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||     
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
Q  224 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 24257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 129817 - 130066
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||  | | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||    
T  129817 catcaagcctgcaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttggaacaacaacctcttaaataagtccattaatttggaacatcttc 129915  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  129916 atc---atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 130011  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    |||| |||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  130012 gtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 130066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 60860 - 60670
Alignment:
Q  81 acctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagta 177  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  |||||    
T  60860 acctcttatataaatccaataatttggaac---atcatctt--tcatcttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagta 60766  T
Q  178 tacaaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||||| ||||  |||| |||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  60765 tacaaaa-cagctcatgatataccaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcaca 60670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3013 - 2805
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||| |||||| | ||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  3013 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacatcatcttaacaacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacatcatca 2916  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| ||||||||||||||     
T  2915 tc---atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaa 2820  T
Q  215 tcaacaacgtctcaa 229  Q
    |||||||| ||||||    
T  2819 tcaacaacatctcaa 2805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 3315 - 3280
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggac 53  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3315 catcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggac 3280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 173 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3585 - 3485
Alignment:
Q  173 cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  3585 cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacattatatcac 3486  T
Q  273 a 273  Q
    |    
T  3485 a 3485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Original strand, 289 - 343
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  289 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaaaagca 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 32012 - 32224
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||| |||||| | ||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  32012 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacatcatcttaacaacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacatcatca 32109  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 214  Q
    ||   |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||  ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||| ||     
T  32110 tc---atcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaa- 32205  T
Q  215 tcaacaacgtctcaattat 233  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  32206 tcatcaacgtctcaattat 32224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 946 - 1134
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  || |||| | || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  946 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactcaacaacatagatcaacaacctcttatataagtccaataatttggaac---atc 1041  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 209  Q
     ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1042 ttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaat 1134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 5556 - 5803
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||  |||||| || || || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||     
T  5556 catcaagcccccaacaatgga-tgctaatgcatggacacaacaacttaacttcatataaacaacaacctcttata-aatccaataatttggaacatgatt 5653  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  5654 atc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtat-gaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 5749  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
     |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  5750 atcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 5803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Original strand, 13092 - 13165
Alignment:
Q  195 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattata 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13092 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattgaagtaatgcatatataattata 13165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Original strand, 10438 - 10688
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatata-atccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||  |||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  10438 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatccatggacacaacaacttaacctcttataaacaacaacctcttatatatatccaataatttggaacat-at 10535  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 212  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||    
T  10536 catctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 10632  T
Q  213 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    ||||| |||| ||||||  | ||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  10633 agtcatcaacatctcaaaca-tcgaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 10688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 6259 - 6191
Alignment:
Q  93 atccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6259 atccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 6191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 6730 - 6980
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  6730 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacctcttaacaacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatc 6828  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 213  Q
    ||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||  |||||||    
T  6829 at---------cttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaatgcaa 6918  T
Q  214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
     |||||||   ||||| || ||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  6919 atcaacaa---ctcaaata-tcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataa 6980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 269
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8176
Alignment:
Q  182 aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8090 aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8268 - 8008
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||   | |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  8268 catcaatcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaagtcaacaacttagatcaacaacctcttatataaatccaataatttggaac---atc 8173  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacacaa-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaaatgc 211  Q
     ||||  ||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || |  |||||| ||||  ||||  |||| ||||||||||||||||     
T  8172 ttctt--tcatcatagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaat-cagctcatgatataataatatcaaatga 8076  T
Q  212 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    || |||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  8075 aattcaacaacatcttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataa 8008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 12674 - 12819
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaa-atcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||  |||||| |||||  | | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  12674 catcaagcccccaacaatgaa-tgataatgcatggacacaacaacttaacttcttattaacaacaacctcttatataagtccaatcatttggaacatcat 12772  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12773 cataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaa 12819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Original strand, 12855 - 13054
Alignment:
Q  21 aagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatct 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||  ||||||| |||| | | |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  12855 aagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggaaacaacaacttaacaacttagaacaacaacctcttatataagtccaataattttgaacatcatcatct 12953  T
Q  120 taatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtca 217  Q
    |   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| |  |||||| | ||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  12954 t---caacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 13049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18265 - 18193
Alignment:
Q  200 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18265 aatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcaca 18193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Original strand, 997 - 1135
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||  || ||| ||||| |   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  997 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaattcatggacacaacaactcaacctcttaga---acaatctcttatataaatccaataatttggaac---atc 1089  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1090 ttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28977 - 28839
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatca 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||| | | ||| | |||| || | |||||||||||||||| ||||||    
T  28977 catcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacaacttagaacaacatcatctttta-agtccaataatttggaacatcatca 28880  T
Q  117 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 160  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28879 tc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaaca 28839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 182 - 279
Target Start/End: Original strand, 225482 - 225578
Alignment:
Q  182 aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataa 279  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  225482 aaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 225578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 225362 - 225455
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaac 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  || ||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  225362 catcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactcaacaactcaacctcttagaaacaacaacctcttatataaatccaataatttggaac 225455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 187
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12042
Alignment:
Q  127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaaca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtataccaaaaca 12042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 281
Target Start/End: Original strand, 12039 - 12103
Alignment:
Q  217 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataaca 281  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12039 aacaacgcctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatataaca 12103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8281 - 8033
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaaatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatc 115  Q
    |||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||  |  |||| |||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||    
T  8281 catcaagccccccactatgag-tgcaaatgcatggactcatcaacttagcatcttaaatcatcaacctcttaaataaatccaataatttggaac---atc 8186  T
Q  116 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgc 211  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |  |||||||| ||| |||  ||||| |||| |||||||||| |    
T  8185 atctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatac 8089  T
Q  212 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    || |||||||| || |||    ||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  8088 aaatcaacaacatcacaa--catcatatataattcatgtaatgtatatacaactatat 8033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 273
Target Start/End: Original strand, 96944 - 97172
Alignment:
Q  44 atgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcat 141  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| || |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||  ||| |||||||| ||||||    
T  96944 atgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagacccactcat 97038  T
Q  142 gcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcac 237  Q
    |||||||||||||  || || |||||||| |  ||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  || ||     
T  97039 gcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-cat 97136  T
Q  238 atataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  97137 atataattcatgtaatgcatatacaaatatatcaca 97172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 273
Target Start/End: Original strand, 106222 - 106450
Alignment:
Q  44 atgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcat 141  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| || |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||  ||| |||||||| ||||||    
T  106222 atgcatggactcaacaacttaacatcttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagacccactcat 106316  T
Q  142 gcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcac 237  Q
    |||||||||||||  || || |||||||| |  ||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  || ||     
T  106317 gcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-cat 106414  T
Q  238 atataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  106415 atataattcatgtaatgcatatacaaatatatcaca 106450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Original strand, 30244 - 30392
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatat-aatccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| || |  | ||||||||||| |||||||||||||||||   ||     
T  30244 catcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggacttgacgtctt-acaacttagaaacatcgacctcttatataaatccaataatttggaa---caa 30339  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||    
T  30340 catctt--tcatcttagaccgactcatgcagtttaattaatatacaacagcaaca 30392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6238
Alignment:
Q  127 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||| |||| ||||  |||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
Q  223 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
     ||||||  || || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6287 atctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcaca 6238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Original strand, 23843 - 23897
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 103839 - 103706
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatcttaa-atcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||  ||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  103839 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaacatcttagcaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaac---at 103744  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 154  Q
    | ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  103743 cctctt--tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaa 103706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 273
Target Start/End: Original strand, 267637 - 267826
Alignment:
Q  81 acctcttatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagta 177  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||| |  |||||    
T  267637 acctcttatataaatcaaataatttggaac---atcatctt--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagta 267731  T
Q  178 tacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    || |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||    ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  267732 tataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaatatctcaaca--tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcaca 267826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 161
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36503
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 283
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25282
Alignment:
Q  123 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |  |||||||  |||||||  ||||| ||||  ||||| ||||||| ||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaa 25218  T
Q  219 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||| ||||||  | ||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  25219 caacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattattacaac 25282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 273
Target Start/End: Original strand, 620 - 702
Alignment:
Q  189 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  620 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcaca 702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 273
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38483
Alignment:
Q  131 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||| |||| ||||  |||| || | |||||||||||||| |||||||| |||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatct 38437  T
Q  227 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    |||  || || |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  38438 caaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatatatatcaca 38483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 161
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20029
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 161  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaa 20029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2006 - 1874
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaacatctta-aatcgacaacctcttatataa-tccaataatttggaacttcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||| ||  |||||||||||| ||   || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2006 catcaagcccccaacaatgaa-tgagtgtgcatggactcaacaacttaacatcttagaaaaaacgacctcttatataaatccaataatttggaacatcat 1908  T
Q  115 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtta 153  Q
    | |     ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1907 cct-----tcatcttagaccgactcatgcagcttagtta 1874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1835 - 1753
Alignment:
Q  189 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 273  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    ||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  1835 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa--catcatatataatttatgtaatgcatatacatttatatcaca 1753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 55
Target Start/End: Original strand, 6508 - 6546
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6508 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 6546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 283
Target Start/End: Original strand, 6070 - 6119
Alignment:
Q  234 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  6070 tcacatataattcaagtaatgcatatgcaattaaatcacaatataacaac 6119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 258
Target Start/End: Original strand, 6676 - 6761
Alignment:
Q  173 cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 258  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||| |||||||| ||| || |||||| | || ||||||||||||||||    
T  6676 cagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcata 6761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 58
Target Start/End: Original strand, 20916 - 20957
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgac 58  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20916 catcaaggccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgac 20957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 193112 - 193039
Alignment:
Q  94 tccaataatttggaacttcatcatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  193112 tccaataatttggaacatcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcaacttagttaattaacaacagca 193039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 10204 - 10247
Alignment:
Q  17 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacct 60  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10204 catcaaggcccaaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacct 10247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 213
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29660
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || | || |   ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaataatagcatgacataataatatcaattg 29657  T
Q  211 caa 213  Q
    |||    
T  29658 caa 29660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Original strand, 159 - 213
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  159 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21866
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 21866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29758
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 29758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69848
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 166  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 69848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 169
Target Start/End: Original strand, 1881 - 1938
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 1938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10582
Alignment:
Q  112 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcaaca 10582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4875
Alignment:
Q  83 ctcttatata-atccaataatttggaacttca---tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 158  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||   |||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  4954 ctcttatatatatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataa 4875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 269
Target Start/End: Original strand, 88 - 167
Alignment:
Q  189 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 269  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  88 catgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatat 167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206584
Alignment:
Q  129 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 169  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University