View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8890_low_82 (Length: 253)

Name: NF8890_low_82
Description: NF8890
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8890_low_82
NF8890_low_82
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (10-245)||(16742543-16742778)
chr8 (10-245)||(19230649-19230884)
chr8 (10-245)||(19424196-19424431)
chr8 (10-245)||(44486985-44487220)
chr8 (10-240)||(36083797-36084027)
chr8 (10-245)||(3353402-3353637)
chr8 (10-245)||(6156937-6157172)
chr8 (10-245)||(9346969-9347204)
chr8 (10-245)||(13693337-13693572)
chr8 (10-245)||(19134551-19134786)
chr8 (10-245)||(25678755-25678990)
chr8 (10-245)||(29082262-29082497)
chr8 (10-245)||(36298797-36299032)
chr8 (10-245)||(247679-247914)
chr8 (10-245)||(810799-811034)
chr8 (10-245)||(30319472-30319707)
chr8 (10-245)||(32082463-32082698)
chr8 (10-245)||(15785477-15785712)
chr8 (10-245)||(21294170-21294405)
chr8 (20-245)||(22668929-22669154)
chr8 (10-245)||(19934981-19935216)
chr8 (10-240)||(22465910-22466140)
chr8 (10-240)||(17293355-17293585)
chr8 (10-240)||(24650773-24651002)
chr8 (4-240)||(20376582-20376809)
chr8 (20-240)||(16400619-16400839)
chr8 (10-235)||(18159915-18160140)
chr8 (26-160)||(45494835-45494969)
chr8 (11-142)||(20748622-20748753)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (10-245)||(16310996-16311231)
chr4 (10-245)||(14840793-14841028)
chr4 (10-245)||(10745334-10745569)
chr4 (10-245)||(10959103-10959338)
chr4 (10-245)||(15201539-15201774)
chr4 (10-245)||(36024175-36024410)
chr4 (10-245)||(49513420-49513655)
chr4 (10-245)||(55749988-55750223)
chr4 (10-245)||(10296555-10296790)
chr4 (10-245)||(16261749-16261984)
chr4 (10-240)||(24646220-24646450)
chr4 (10-240)||(27171956-27172186)
chr4 (10-240)||(27662501-27662731)
chr4 (10-245)||(456446-456681)
chr4 (10-245)||(4992531-4992766)
chr4 (10-245)||(5018021-5018256)
chr4 (10-245)||(17923982-17924217)
chr4 (10-245)||(19949131-19949366)
chr4 (10-245)||(27819667-27819902)
chr4 (10-245)||(30931229-30931464)
chr4 (10-245)||(18757226-18757461)
chr4 (10-245)||(40461481-40461716)
chr4 (15-245)||(22002301-22002531)
chr4 (10-240)||(14907785-14908015)
chr4 (10-245)||(16849875-16850110)
chr4 (99-245)||(15467148-15467294)
chr4 (10-130)||(39530919-39531039)
chr4 (16-96)||(14008592-14008672)
chr4 (11-142)||(26816492-26816623)
chr4 (11-142)||(54695430-54695561)
chr4 (26-160)||(14936543-14936677)
chr4 (10-135)||(11534406-11534531)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (10-245)||(17900821-17901056)
chr3 (10-245)||(1788603-1788839)
chr3 (10-245)||(11210826-11211061)
chr3 (10-245)||(4749589-4749824)
chr3 (10-245)||(5584365-5584600)
chr3 (10-245)||(5870428-5870663)
chr3 (10-245)||(8780533-8780768)
chr3 (10-245)||(9000521-9000756)
chr3 (10-245)||(12242291-12242526)
chr3 (10-245)||(19784292-19784527)
chr3 (10-245)||(24388250-24388485)
chr3 (10-245)||(41689519-41689754)
chr3 (15-245)||(7799358-7799588)
chr3 (10-245)||(508902-509137)
chr3 (10-245)||(6214793-6215028)
chr3 (10-245)||(9986619-9986854)
chr3 (10-245)||(12290921-12291156)
chr3 (10-245)||(14471491-14471726)
chr3 (10-245)||(16395779-16396014)
chr3 (10-245)||(20677929-20678164)
chr3 (10-240)||(11277117-11277347)
chr3 (10-240)||(38200527-38200757)
chr3 (10-240)||(39377959-39378189)
chr3 (10-245)||(4429048-4429283)
chr3 (10-245)||(5541753-5541988)
chr3 (10-245)||(10631555-10631790)
chr3 (10-245)||(13127561-13127796)
chr3 (10-245)||(15655773-15656008)
chr3 (10-245)||(24665740-24665975)
chr3 (10-245)||(28318970-28319205)
chr3 (10-245)||(37872331-37872566)
chr3 (10-245)||(37880849-37881084)
chr3 (10-245)||(1059450-1059685)
chr3 (10-245)||(5516543-5516778)
chr3 (10-245)||(13266390-13266625)
chr3 (10-245)||(13377399-13377634)
chr3 (10-245)||(13387993-13388228)
chr3 (10-245)||(23763164-23763399)
chr3 (10-245)||(29465937-29466172)
chr3 (10-245)||(6495076-6495311)
chr3 (10-245)||(9385315-9385550)
chr3 (10-245)||(29938286-29938521)
chr3 (10-245)||(29987440-29987675)
chr3 (10-245)||(13145004-13145239)
chr3 (10-245)||(15839092-15839327)
chr3 (10-245)||(5198971-5199206)
chr3 (16-245)||(16439075-16439303)
chr3 (10-245)||(17999523-17999758)
chr3 (10-240)||(18126453-18126683)
chr3 (10-240)||(14970516-14970746)
chr3 (10-240)||(17249494-17249722)
chr3 (10-240)||(18703277-18703507)
chr3 (52-240)||(11186247-11186435)
chr3 (19-240)||(20765986-20766206)
chr3 (15-163)||(48982899-48983047)
chr3 (10-58)||(17013241-17013289)
chr3 (10-44)||(11186430-11186464)
chr3 (11-79)||(6426953-6427021)
chr3 (11-83)||(28360394-28360466)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (10-245)||(7684963-7685198)
chr1 (10-245)||(51650651-51650886)
chr1 (10-240)||(3177418-3177648)
chr1 (10-245)||(5644482-5644717)
chr1 (10-245)||(7694248-7694483)
chr1 (10-245)||(12617930-12618165)
chr1 (10-245)||(12736340-12736575)
chr1 (10-245)||(21869475-21869710)
chr1 (10-245)||(35642815-35643050)
chr1 (10-245)||(36241208-36241443)
chr1 (10-245)||(38100897-38101132)
chr1 (10-240)||(5839021-5839251)
chr1 (10-240)||(47612710-47612940)
chr1 (10-245)||(4173114-4173349)
chr1 (10-245)||(7513086-7513321)
chr1 (10-245)||(19164429-19164664)
chr1 (10-245)||(21210501-21210736)
chr1 (10-229)||(21129076-21129295)
chr1 (10-240)||(22127307-22127537)
chr1 (10-240)||(17715713-17715943)
chr1 (62-245)||(20871952-20872135)
chr1 (10-220)||(23978338-23978548)
chr1 (152-240)||(22446506-22446593)
chr1 (152-240)||(22451740-22451827)
chr1 (10-58)||(22650725-22650773)
chr1 (68-148)||(14277687-14277767)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (10-245)||(37627-37862)
scaffold0047 (18-183)||(4313-4478)
[»] chr6 (38 HSPs)
chr6 (10-245)||(20034667-20034902)
chr6 (10-245)||(25793538-25793773)
chr6 (10-245)||(4636750-4636985)
chr6 (10-245)||(9117234-9117469)
chr6 (10-245)||(12721578-12721813)
chr6 (10-245)||(26031244-26031479)
chr6 (10-245)||(27347569-27347804)
chr6 (10-245)||(27408309-27408544)
chr6 (10-245)||(32305788-32306023)
chr6 (10-245)||(3667250-3667485)
chr6 (10-245)||(11255330-11255565)
chr6 (10-245)||(16954832-16955067)
chr6 (10-245)||(18829052-18829287)
chr6 (10-245)||(26039440-26039675)
chr6 (10-245)||(26870626-26870861)
chr6 (10-245)||(32966688-32966923)
chr6 (10-245)||(34811905-34812140)
chr6 (10-240)||(12860760-12860990)
chr6 (10-240)||(13919075-13919305)
chr6 (10-245)||(27378616-27378851)
chr6 (10-245)||(27468999-27469234)
chr6 (10-245)||(27499528-27499763)
chr6 (10-245)||(25681723-25681958)
chr6 (10-245)||(22381858-22382093)
chr6 (10-245)||(14058109-14058343)
chr6 (10-245)||(14064238-14064472)
chr6 (10-240)||(16882001-16882231)
chr6 (10-223)||(19956625-19956838)
chr6 (111-245)||(1656602-1656736)
chr6 (10-240)||(19445693-19445923)
chr6 (10-175)||(17613254-17613419)
chr6 (10-185)||(22810769-22810944)
chr6 (120-245)||(18920359-18920484)
chr6 (102-245)||(17053273-17053416)
chr6 (136-220)||(14367097-14367181)
chr6 (117-218)||(14169919-14170020)
chr6 (10-42)||(13019493-13019525)
chr6 (11-79)||(24927792-24927860)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (10-245)||(4217860-4218095)
chr7 (10-245)||(9165416-9165651)
chr7 (10-245)||(1993408-1993643)
chr7 (10-245)||(15882639-15882874)
chr7 (10-245)||(26394910-26395145)
chr7 (10-245)||(40046920-40047155)
chr7 (10-240)||(42871705-42871935)
chr7 (10-245)||(172742-172977)
chr7 (10-245)||(9091086-9091321)
chr7 (10-245)||(11011039-11011274)
chr7 (10-245)||(20985109-20985344)
chr7 (10-245)||(24739953-24740188)
chr7 (10-240)||(8006882-8007112)
chr7 (10-245)||(461802-462037)
chr7 (10-245)||(2710429-2710664)
chr7 (10-245)||(6872046-6872281)
chr7 (10-245)||(17954930-17955165)
chr7 (10-245)||(18434375-18434610)
chr7 (10-245)||(26658151-26658386)
chr7 (10-240)||(9439120-9439350)
chr7 (19-245)||(20998244-20998470)
chr7 (10-245)||(22094993-22095228)
chr7 (10-245)||(8623215-8623451)
chr7 (16-240)||(13125778-13126002)
chr7 (10-239)||(13662324-13662553)
chr7 (10-241)||(14141758-14141989)
chr7 (10-237)||(16314286-16314513)
chr7 (10-240)||(4416810-4417040)
chr7 (10-240)||(10652695-10652927)
chr7 (10-240)||(16157917-16158147)
chr7 (10-62)||(25206045-25206097)
chr7 (11-145)||(15179737-15179871)
chr7 (189-239)||(4824767-4824817)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (10-245)||(19468827-19469062)
chr5 (10-245)||(27048008-27048243)
chr5 (10-245)||(14034897-14035132)
chr5 (10-245)||(14452783-14453018)
chr5 (10-245)||(14563824-14564059)
chr5 (10-245)||(20556602-20556837)
chr5 (10-245)||(21670707-21670942)
chr5 (10-245)||(22680971-22681206)
chr5 (10-245)||(23301132-23301367)
chr5 (10-245)||(24571927-24572162)
chr5 (10-245)||(24822647-24822882)
chr5 (10-245)||(24942361-24942596)
chr5 (10-245)||(27465017-27465252)
chr5 (10-245)||(34056788-34057023)
chr5 (10-245)||(34776751-34776986)
chr5 (10-245)||(39496658-39496893)
chr5 (10-245)||(1117073-1117308)
chr5 (10-245)||(6980660-6980895)
chr5 (10-245)||(9340810-9341045)
chr5 (10-245)||(13529083-13529318)
chr5 (10-245)||(15999067-15999302)
chr5 (10-245)||(22151371-22151606)
chr5 (10-245)||(23366791-23367026)
chr5 (10-245)||(23701635-23701870)
chr5 (10-245)||(24812768-24813003)
chr5 (10-245)||(30233197-30233432)
chr5 (10-245)||(36692553-36692788)
chr5 (10-245)||(42047635-42047870)
chr5 (10-240)||(35220358-35220588)
chr5 (10-240)||(37735743-37735973)
chr5 (10-245)||(17452483-17452718)
chr5 (10-245)||(39357351-39357586)
chr5 (10-240)||(15744824-15745054)
chr5 (10-240)||(17611917-17612147)
chr5 (10-240)||(31353389-31353619)
chr5 (10-245)||(5296313-5296548)
chr5 (10-245)||(27617943-27618178)
chr5 (10-245)||(31838335-31838570)
chr5 (10-245)||(40395217-40395452)
chr5 (10-240)||(17723773-17724003)
chr5 (10-245)||(20784900-20785135)
chr5 (10-245)||(36588288-36588523)
chr5 (10-245)||(23483973-23484208)
chr5 (10-245)||(23400766-23401001)
chr5 (15-163)||(5604796-5604944)
chr5 (15-90)||(21203721-21203796)
chr5 (11-142)||(24416831-24416962)
chr5 (11-142)||(30450246-30450377)
chr5 (26-160)||(15326397-15326531)
chr5 (26-160)||(18712238-18712372)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (10-245)||(26872792-26873027)
chr2 (10-245)||(10272812-10273047)
chr2 (10-245)||(24332501-24332736)
chr2 (10-245)||(28726069-28726304)
chr2 (10-245)||(29250046-29250281)
chr2 (10-245)||(9767515-9767750)
chr2 (10-245)||(9902325-9902560)
chr2 (10-245)||(11399924-11400159)
chr2 (10-245)||(19307171-19307406)
chr2 (10-245)||(21125694-21125929)
chr2 (10-245)||(21166699-21166934)
chr2 (10-245)||(34794969-34795204)
chr2 (10-245)||(39174846-39175081)
chr2 (10-245)||(40246434-40246669)
chr2 (10-245)||(43088523-43088758)
chr2 (10-240)||(27227269-27227499)
chr2 (10-240)||(35258835-35259065)
chr2 (10-240)||(35269460-35269690)
chr2 (10-245)||(22938409-22938644)
chr2 (10-245)||(43351228-43351463)
chr2 (10-245)||(4215721-4215956)
chr2 (10-245)||(22746097-22746332)
chr2 (15-245)||(22777077-22777307)
chr2 (10-245)||(28705961-28706196)
chr2 (10-220)||(24721176-24721386)
chr2 (10-245)||(24809126-24809361)
chr2 (10-118)||(24419778-24419886)
chr2 (15-163)||(1795181-1795329)
chr2 (195-245)||(24419882-24419932)
chr2 (169-241)||(18944906-18944978)
chr2 (111-145)||(10835151-10835185)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (10-245)||(36986-37221)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (10-245)||(47710-47945)
[»] scaffold0382 (3 HSPs)
scaffold0382 (10-245)||(6058-6293)
scaffold0382 (10-240)||(753-983)
scaffold0382 (99-240)||(11405-11546)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (10-245)||(41727-41962)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (10-245)||(12976-13211)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (10-245)||(21637-21872)
scaffold0185 (190-245)||(14909-14964)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (10-245)||(9733-9968)
[»] scaffold0497 (2 HSPs)
scaffold0497 (10-210)||(98-298)
scaffold0497 (202-240)||(1607-1645)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (10-245)||(4441-4676)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (10-240)||(12549-12779)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (10-240)||(29555-29785)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (10-240)||(6601-6831)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (10-215)||(117064-117269)
scaffold0035 (10-215)||(108563-108768)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (10-229)||(26308-26526)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (10-240)||(10282-10512)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (10-240)||(5434-5664)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (10-240)||(3990-4220)
scaffold0004 (10-240)||(6536-6766)
scaffold0004 (10-181)||(11206-11377)
[»] scaffold0863 (1 HSPs)
scaffold0863 (15-240)||(2215-2440)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (10-239)||(10738-10967)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (10-245)||(47916-48151)
[»] scaffold0594 (1 HSPs)
scaffold0594 (10-240)||(1016-1246)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (10-245)||(1070-1305)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (10-240)||(7939-8168)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (10-240)||(45261-45491)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (15-239)||(43258-43482)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (10-245)||(4278-4513)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (10-240)||(74162-74392)
scaffold0037 (159-240)||(86352-86433)
[»] scaffold1578 (1 HSPs)
scaffold1578 (47-240)||(1120-1315)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (16-240)||(4280-4504)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (10-223)||(10706-10919)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (10-178)||(22742-22910)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (86-245)||(129487-129646)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (10-157)||(3204-3351)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (10-235)||(33955-34177)
scaffold0001 (10-235)||(39262-39484)
[»] scaffold0161 (3 HSPs)
scaffold0161 (128-240)||(21228-21340)
scaffold0161 (10-124)||(14611-14725)
scaffold0161 (10-124)||(19284-19398)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (38-225)||(5589-5789)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (170-245)||(160521-160596)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (11-142)||(99944-100075)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (11-142)||(6895-7026)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (10-68)||(30170-30228)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (11-79)||(30529-30597)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-79)||(84215-84283)
[»] scaffold0764 (1 HSPs)
scaffold0764 (11-79)||(6506-6574)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (11-79)||(46-114)
scaffold0313 (11-79)||(14203-14271)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16742778 - 16742543
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16742778 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaaca 16742679  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16742678 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccaattgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 16742579  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16742578 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 16742543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19230884 - 19230649
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19230884 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 19230785  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19230784 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataacattatat 19230685  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19230684 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 19230649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19424431 - 19424196
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  19424431 acattattggatcaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcgaca 19424332  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19424331 agaagacattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 19424232  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19424231 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 19424196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44487220 - 44486985
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  44487220 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 44487121  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44487120 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 44487021  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44487020 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 44486985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36084027 - 36083797
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  36084027 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 36083928  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36083927 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 36083828  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36083827 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 36083797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 3353402 - 3353637
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  3353402 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 3353501  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3353502 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 3353601  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3353602 caaatggatgtcaaaagtgattttcttaatggtgtc 3353637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6157172 - 6156937
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6157172 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 6157073  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6157072 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 6156973  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6156972 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 6156937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9347204 - 9346969
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9347204 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaatcagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 9347105  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9347104 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 9347005  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9347004 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 9346969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 13693337 - 13693572
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13693337 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 13693436  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13693437 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 13693536  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13693537 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 13693572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19134786 - 19134551
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19134786 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 19134687  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19134686 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtat 19134587  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19134586 caaatggatgtaaaaagtgcttttcttaatggtgtc 19134551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 25678755 - 25678990
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  25678755 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 25678854  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25678855 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 25678954  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25678955 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 25678990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29082497 - 29082262
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29082497 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 29082398  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29082397 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 29082298  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  29082297 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 29082262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36299032 - 36298797
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  36299032 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 36298933  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36298932 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 36298833  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36298832 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 36298797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 247914 - 247679
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  247914 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgatcaaggctacagtcaaca 247815  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  247814 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 247715  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  247714 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 247679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 811034 - 810799
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  811034 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgatcaaggctacagtcaaca 810935  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  810934 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 810835  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  810834 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 810799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 30319472 - 30319707
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  30319472 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgagcaaggagagataaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 30319571  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30319572 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 30319671  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30319672 taaatggatgtcaaaagtgattttcttaatggtgtc 30319707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 32082463 - 32082698
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  32082463 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 32082562  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32082563 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 32082662  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  32082663 caaatggatgtcgaaagtgcctttcttaatggtgtc 32082698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 15785477 - 15785712
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15785477 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagcagaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 15785576  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15785577 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 15785676  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  15785677 caaatggatgtcaaaagtgcccttcttaatggtgtc 15785712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21294405 - 21294170
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21294405 acattattggaacaaaatgggtattcaaaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 21294306  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21294305 agaaggcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttgatcatggcataatattatat 21294206  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  21294205 caaatggatgtcaagagtgcatttcttaatggtgtc 21294170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22669154 - 22668929
Alignment:
Q  20 aacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcatt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||  || |||||||| |||||||||    
T  22669154 aacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagccaaacttgttacacaaggttatagtcaacaagaaggcatt 22669055  T
Q  120 gattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatg 219  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22669054 gattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagaaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatcaaatggatg 22668955  T
Q  220 tcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||| ||||  |||||||||| ||||    
T  22668954 tcaatagtgaatttcttaatggtgtc 22668929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19935216 - 19934981
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||  |||| || ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19935216 acattattggaacaaaatgagtatttagaaagaagttgaatgataaaggtgaagtaaccaaaaacaaagtcagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 19935117  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19935116 agaatgcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 19935017  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  19935016 caaatggatgtcaagagtgcatttcttaatggtgtc 19934981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 22465910 - 22466140
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  22465910 acattattggaacaaaatgggtatttagaaacaagctcaatgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgctcaaggttacaatcaaca 22466009  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22466010 agaaggtattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcttatgcagtaaatcatggcataatattatat 22466109  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  22466110 caaatggatgtaaagagtgcatttctcaatg 22466140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 17293355 - 17293585
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  17293355 acattatttgaacaaaataggtattcaaaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagaattgttgaacaaggttacagtcaaca 17293454  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  17293455 agaaggcattgactacactgaaacatttgctccagtcgcaagattggaagcaattaggttacttctatcttatgcagtaaatcatgacataatattatat 17293554  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17293555 caaatggatgtcaagagtgcatttcttaatg 17293585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24651002 - 24650773
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  24651002 acattattggaacaaaatgggt-ttcataaataagttgaataaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagctagacatgttgcacaaggttacagtcaaca 24650904  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||    
T  24650903 agaaggcattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcatatgcagtttataatggcataatattatat 24650804  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    ||||||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  24650803 caaatggatatcaagggtgcatttcttaatg 24650773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 20376582 - 20376809
Alignment:
Q  4 agatggacatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacag 103  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20376582 agatgaacattattggaacaaaatgggtattcataaacaagttggatgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacag 20376681  T
Q  104 tcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataata 203  Q
    |||||| |||| ||||||         ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||   |||||    
T  20376682 tcaacaagaagacattga---------aacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcagcttacttctatcctatgcagttaatcatgaagtaata 20376772  T
Q  204 ttatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20376773 ttatatcaaatggatgtcaaaagtgcatttcttaatg 20376809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16400839 - 16400619
Alignment:
Q  20 aacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcatt 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| || || |||    
T  16400839 aacaaaatgggtatttaggaacaagcttaatgaacaaggagaggttgttagaaacaaagctagacttattgaacaaggatacattcaacaagagggtatt 16400740  T
Q  120 gattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatg 219  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| | |    
T  16400739 gactatactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagaaatcaggttacatctatcctatgcagttaatcatgacattatattatatcaaatgaagg 16400640  T
Q  220 tcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    | || ||||| ||||| ||||    
T  16400639 ttaagagtgcatttctcaatg 16400619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18160140 - 18159915
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| | ||| || || | || ||||||||| |||||||| ||  |||  ||||| |||||    
T  18160140 acattattggaacaagatgggtattaagaaacaagttcaatgatctaggtgaagttatcataaacaaagcaagacttgtagctgaaggttacaggcaaca 18160041  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||  | |||||||| ||||  |||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  18160040 agagtgtattgattatactgggacatttgctccaattgcaagactagaagcaataaggttacttctatcatatgcagttaatcatggcataactttatat 18159941  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttct 235  Q
    || |||||||| || ||||| |||||    
T  18159940 cagatggatgttaagagtgcctttct 18159915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 45494969 - 45494835
Alignment:
Q  26 atgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattac 125  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||  ||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| || || ||     
T  45494969 atgggtattcagaaacaaattggatgaagaaggaaaggtaactcgaaacaaggcaagactagttgcacaaggatacaatcaacaagaaggaatcgactat 45494870  T
Q  126 actgaaacatttgctccagttgcatgattggaagc 160  Q
      |||||| | ||||||||| ||| || |||||||    
T  45494869 gatgaaacttatgctccagtagcaagactggaagc 45494835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Original strand, 20748622 - 20748753
Alignment:
Q  11 catcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacag 110  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || |||||| ||||| | || |  ||||||||||||||| | || || ||||  |||| ||||||     
T  20748622 catcattggaacaagatgagtatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagttataagaaacaaagctagattggtagctcaagggtacaatcaacaa 20748721  T
Q  111 gaaggcattgattacactgaaacatttgctcc 142  Q
    ||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  20748722 gaaggtattgattacgatgaaacctttgctcc 20748753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16311231 - 16310996
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16311231 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaaca 16311132  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16311131 agaaggcattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 16311032  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16311031 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 16310996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 14840793 - 14841028
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14840793 acattattggaacaaaataggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccaaaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaaca 14840892  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14840893 agaaggcattgatgacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 14840992  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14840993 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 14841028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 10745334 - 10745569
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  10745334 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 10745433  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10745434 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 10745533  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10745534 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 10745569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 10959103 - 10959338
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  10959103 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 10959202  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10959203 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 10959302  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10959303 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 10959338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 15201539 - 15201774
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15201539 acattattgaaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaaca 15201638  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15201639 agaaggcattgattacactgaaacatttgctcaagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcagttaatcatggcataatattatat 15201738  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15201739 caaatggatgtcaagagtgcttttcttaatggtgtc 15201774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36024410 - 36024175
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  36024410 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 36024311  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36024310 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 36024211  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36024210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 36024175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 49513655 - 49513420
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  49513655 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 49513556  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49513555 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 49513456  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49513455 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 49513420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 55749988 - 55750223
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  55749988 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 55750087  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55750088 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 55750187  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55750188 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 55750223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10296790 - 10296555
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  10296790 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 10296691  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10296690 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 10296591  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  10296590 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 10296555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16261984 - 16261749
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16261984 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 16261885  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16261884 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 16261785  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16261784 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 16261749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24646450 - 24646220
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24646450 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 24646351  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24646350 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 24646251  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24646250 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 24646220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27172186 - 27171956
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27172186 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 27172087  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27172086 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 27171987  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27171986 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 27171956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27662731 - 27662501
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27662731 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 27662632  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27662631 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 27662532  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27662531 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 27662501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 456681 - 456446
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  456681 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccggaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 456582  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  456581 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 456482  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  456481 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 456446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 4992531 - 4992766
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4992531 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaaaaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 4992630  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4992631 agaaggcattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctttcctatgcaattaatcatggcataatattatat 4992730  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4992731 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 4992766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5018256 - 5018021
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5018256 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaaaaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 5018157  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5018156 agaaggcattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcatgttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 5018057  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5018056 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 5018021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17924217 - 17923982
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17924217 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 17924118  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17924117 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 17924018  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  17924017 caaatggatgtcaaaagtgtctttcttaatggtgtc 17923982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 19949131 - 19949366
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19949131 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 19949230  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19949231 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatagcataatattatat 19949330  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19949331 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 19949366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 27819667 - 27819902
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27819667 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 27819766  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27819767 agaaggcattgattacaccgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctattctatgcaattaatcatggcataatattgtat 27819866  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27819867 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 27819902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 30931229 - 30931464
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  30931229 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 30931328  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30931329 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcatacgcaattaatcatggcataatattatat 30931428  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  30931429 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 30931464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 18757226 - 18757461
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18757226 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaaaaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 18757325  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18757326 agaaggcattgattatactgaaacattttctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 18757425  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18757426 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 18757461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 40461481 - 40461716
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  40461481 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctaaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagtcagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 40461580  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40461581 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccaattgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 40461680  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40461681 caaatggatgtaaaaagtgcttttcttaatggtgtc 40461716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22002531 - 22002301
Alignment:
Q  15 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  22002531 attgaaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaag 22002432  T
Q  115 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22002431 gcattaattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaaacaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 22002332  T
Q  215 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  22002331 ggatgtcaaaagtgtctttcttaatggtgtc 22002301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 14907785 - 14908015
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14907785 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggatccagtcaaca 14907884  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  14907885 agaaggcattaactacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagtttatcataacataatattatat 14907984  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  14907985 caaatagatgtcaagagtgcatttcttaatg 14908015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16850110 - 16849875
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  16850110 acattattggaacaaaatggatattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagtcagacttgttgcacaaggttacattcaaca 16850011  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16850010 agaaggcattgattacacagaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttatatcctatgcagttaatcatgacataatattatat 16849911  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  16849910 caaatggatgtcaagagtgcatttctcaatggtgtc 16849875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 15467148 - 15467294
Alignment:
Q  99 tacagtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggca 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15467148 tacagtcaacaagaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaatattggaagaaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggca 15467247  T
Q  199 taatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  15467248 taatattatatcaaatggatgtcaagagtgcatttcttaatggtgtc 15467294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Original strand, 39530919 - 39531039
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||    
T  39530919 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagttagacttgttgcacaaggttataatcagca 39531018  T
Q  110 ggaaggcattgattacactga 130  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  39531019 agaaggcattgattacactga 39531039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 14008672 - 14008592
Alignment:
Q  16 ttggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaag 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14008672 ttggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgctcaag 14008592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Original strand, 26816492 - 26816623
Alignment:
Q  11 catcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacag 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||| | || | |||||||||||||||| | || || ||||  |||| ||||||     
T  26816492 catcattggaacaagatgggtatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagttatcagaaacaaagctagattggtagctcaagggtacaatcaacaa 26816591  T
Q  111 gaaggcattgattacactgaaacatttgctcc 142  Q
    ||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  26816592 gaaggtattgattacgatgaaacctttgctcc 26816623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 54695561 - 54695430
Alignment:
Q  11 catcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacag 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||| | || | |||||||||||||||| | || || ||||  |||| ||||||     
T  54695561 catcattggaacaagatgggtatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagttatcagaaacaaagctagattggtagctcaagggtacaatcaacaa 54695462  T
Q  111 gaaggcattgattacactgaaacatttgctcc 142  Q
    ||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  54695461 gaaggtattgattacgatgaaacctttgctcc 54695430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 160
Target Start/End: Original strand, 14936543 - 14936677
Alignment:
Q  26 atgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattac 125  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||  ||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| || || ||     
T  14936543 atgggtattcagaaacaaattggatgaagaaggaaaggtaactcgaaacaaggcaagactagttgcacaaggatacaatcaacaagaaggaatcgactat 14936642  T
Q  126 actgaaacatttgctccagttgcatgattggaagc 160  Q
      |||||| | ||||||||| ||| || |||||||    
T  14936643 gatgaaacttatgctccagtagcaagactggaagc 14936677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 11534531 - 11534406
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||| ||    
T  11534531 acattattggaacaaaaggggtgttcataaacaaactcaatgagcaaggtgaggtgataagaaacaaagctagacttgcagcacaaggctacaatcacca 11534432  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacat 135  Q
    | |||| ||||| || | ||||||||    
T  11534431 gcaaggtattgactatattgaaacat 11534406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 17900821 - 17901056
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17900821 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 17900920  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17900921 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 17901020  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17901021 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgttgtc 17901056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 1788603 - 1788839
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaacca-gaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaac 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1788603 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccaagaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaac 1788702  T
Q  109 aggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattata 208  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1788703 aagaagacattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattata 1788802  T
Q  209 tcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1788803 tcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 1788839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 11210826 - 11211061
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11210826 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaggctagacttgttgcacaaggatacagtcaaca 11210925  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11210926 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggtataatattatat 11211025  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11211026 caaatggatgtcaagagtgcttttcttaatggtgtc 11211061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4749824 - 4749589
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4749824 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 4749725  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4749724 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 4749625  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4749624 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 4749589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 5584365 - 5584600
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5584365 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 5584464  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5584465 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 5584564  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5584565 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 5584600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 5870428 - 5870663
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5870428 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 5870527  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5870528 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 5870627  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5870628 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 5870663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8780768 - 8780533
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  8780768 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 8780669  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8780668 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 8780569  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8780568 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 8780533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 9000521 - 9000756
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9000521 acattatttgaacaaaatgggtattcaaaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 9000620  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9000621 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 9000720  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9000721 caaatggatgtcaagagtgcttttcttaatggtgtc 9000756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 12242291 - 12242526
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12242291 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaaaaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 12242390  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12242391 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 12242490  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12242491 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 12242526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19784527 - 19784292
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19784527 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 19784428  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19784427 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 19784328  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19784327 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 19784292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 24388250 - 24388485
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24388250 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 24388349  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24388350 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 24388449  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24388450 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 24388485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41689754 - 41689519
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  41689754 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 41689655  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41689654 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 41689555  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41689554 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 41689519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Original strand, 7799358 - 7799588
Alignment:
Q  15 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  7799358 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaagagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 7799457  T
Q  115 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799458 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagactggaagcaatcaggttacttctatcatatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 7799557  T
Q  215 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7799558 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 7799588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 508902 - 509137
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  508902 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 509001  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  509002 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 509101  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  509102 caaatggatatcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 509137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 6214793 - 6215028
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6214793 acattattggaacaaaataggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 6214892  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6214893 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 6214992  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6214993 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 6215028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 9986619 - 9986854
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9986619 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaaaaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 9986718  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9986719 agaaggcattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 9986818  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9986819 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 9986854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 12290921 - 12291156
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12290921 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaatcagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 12291020  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12291021 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 12291120  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12291121 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 12291156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14471726 - 14471491
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14471726 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 14471627  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14471626 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 14471527  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14471526 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 14471491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 16395779 - 16396014
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16395779 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 16395878  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16395879 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 16395978  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16395979 caaatggatgtcaaaagtgcatttcttaatggtgtc 16396014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 20677929 - 20678164
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  20677929 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 20678028  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20678029 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 20678128  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20678129 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 20678164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 11277117 - 11277347
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11277117 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 11277216  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11277217 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 11277316  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11277317 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 11277347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38200757 - 38200527
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  38200757 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 38200658  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38200657 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 38200558  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38200557 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 38200527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39378189 - 39377959
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  39378189 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 39378090  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39378089 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 39377990  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39377989 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 39377959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4429283 - 4429048
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4429283 acattattggaacaaaatgggtatttagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagttagacttgttgcacaaggatacagtcaaca 4429184  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4429183 agaaggcattgattatactgaaacttttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcagttaatcatggcataatattatat 4429084  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4429083 caaatggatgtcaagagtgcttttcttaatggtgtc 4429048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 5541753 - 5541988
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5541753 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 5541852  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5541853 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 5541952  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  5541953 caaatggatgtcaaaagtgtctttcttaatggtgtc 5541988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 10631555 - 10631790
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  10631555 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggagagataaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 10631654  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10631655 agagggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtat 10631754  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10631755 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 10631790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13127796 - 13127561
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13127796 acattattggaacaaaatgggtattcagaaagaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 13127697  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13127696 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 13127597  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13127596 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 13127561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 15655773 - 15656008
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15655773 acattattggaacaaaatgggtattcaaaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccaaaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 15655872  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15655873 agaaggtattaattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 15655972  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15655973 caaatggatgtcaagagtgcttttcttaatggtgtc 15656008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24665975 - 24665740
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24665975 acattattggaacaaaatgggtattcaaaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 24665876  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24665875 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcattgcataatattatat 24665776  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24665775 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 24665740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 28318970 - 28319205
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  28318970 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 28319069  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28319070 agaagacattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 28319169  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28319170 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 28319205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37872566 - 37872331
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  37872566 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 37872467  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37872466 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 37872367  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  37872366 caaatggatgtcaaaaatgcctttcttaatggtgtc 37872331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37881084 - 37880849
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  37881084 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 37880985  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37880984 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 37880885  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  37880884 caaatggatgtcaaaaatgcctttcttaatggtgtc 37880849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1059685 - 1059450
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  1059685 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaaca 1059586  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1059585 agaaggcattgattacactgagatatttgctgcagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 1059486  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  1059485 caaatggatatcaagagtgcttttcttaatggtgtc 1059450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5516778 - 5516543
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5516778 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaatcagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 5516679  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5516678 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcagcttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 5516579  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5516578 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 5516543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 13266390 - 13266625
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  13266390 acattattggaacaaaatgtgtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctaaacttgttgcacaaggttacagtcaaca 13266489  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  13266490 agaaggcattgattacactgaaacattttctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcggttaatcatgacataatattatat 13266589  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13266590 caaatggatgtcaagagtgcttttcttaatggtgtc 13266625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 13377399 - 13377634
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13377399 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaatgagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 13377498  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13377499 agaagacattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 13377598  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13377599 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 13377634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 13387993 - 13388228
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13387993 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaatgagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 13388092  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13388093 agaagacattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 13388192  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13388193 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 13388228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23763399 - 23763164
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23763399 acattattgaaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccaaacttgttgctcaaggctacagtcaaca 23763300  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23763299 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 23763200  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23763199 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 23763164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 29465937 - 29466172
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29465937 acattattggaacaaaatgagtattcagaaacaagctgaatgagcaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 29466036  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29466037 agaagacattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatgacataatattatat 29466136  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29466137 caaatggatgtcaaaagtgtttttcttaatggtgtc 29466172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 6495076 - 6495311
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6495076 acattattggaacaaaatgggtatttagaaacaagatgaatgaaaaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 6495175  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6495176 agaaggcattgattatactgaaacatttgctccagtggcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 6495275  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6495276 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 6495311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 9385315 - 9385550
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9385315 acattattggaacaaaatgggttttcagaaacaagctgagtgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 9385414  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9385415 aaaaggcattgattacactgaaacatttgcttcagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 9385514  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9385515 taaatggatgtcaagagtgcttttcttaatggtgtc 9385550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 29938286 - 29938521
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29938286 acattattgaaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggatacagtcaaca 29938385  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  29938386 agaaggcattgattacactaaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggtttaatattatat 29938485  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  29938486 caaatggatgtgaagagcgcttttcttaatggtgtc 29938521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 29987440 - 29987675
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29987440 acattattgaaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggatacagtcaaca 29987539  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  29987540 agaaggcattgattacactaaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggtttaatattatat 29987639  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  29987640 caaatggatgtgaagagcgcttttcttaatggtgtc 29987675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13145239 - 13145004
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13145239 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacaaagccagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 13145140  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13145139 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagtttggaagcaattaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 13145040  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  13145039 caaatggatgtcaagagtgcatttcttaatggtgtc 13145004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15839327 - 15839092
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15839327 acatgattggaacaaaatgggtattcggaaacaagttgaatgaacaaggtcaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggatacagtcaaca 15839228  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15839227 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaataaggttacttctatcctatgcagttaatcatgtcataatattatat 15839128  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  15839127 caaatggatgtcaagagtacatttcttaatggtgtc 15839092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5199206 - 5198971
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  5199206 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaatccagacttcttgcacaaggttacaatcaaca 5199107  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5199106 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatgacataatattatat 5199007  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  5199006 cgaatggatgtcaagagtgcatttcttaatggtgtc 5198971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Original strand, 16439075 - 16439303
Alignment:
Q  16 ttggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaagg 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  16439075 ttggaacaaaatggatattcagaaacaagttgaatgaacaaggacaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaagg 16439174  T
Q  116 cattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatg 215  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16439175 cattggttacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggaataatattgtatcaaatg 16439274  T
Q  216 gatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16439275 gatgtc-aaagtgcttttcttaatggtgtc 16439303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17999758 - 17999523
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  17999758 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttaaatgaacaaggagaagtaatcagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagccaaca 17999659  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  17999658 agaagacattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcatgttacttctatcctatgcagtcaatcatgatataatattatat 17999559  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||    
T  17999558 caaatggatgttaagagtgcatttcttaatggtgtc 17999523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 18126453 - 18126683
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18126453 acattattggaacaaaatgggtgttcagaaacaagttgaatgaacaaggtgatgtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaagattacagtcaaca 18126552  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||   |||| ||||||||    
T  18126553 agaagacattgactacactgaaacatttactccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctatgtagttaatcacaacatactattatat 18126652  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  18126653 caaatggatgtcaagaatgcatttcttaatg 18126683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14970746 - 14970516
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||  || ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||    
T  14970746 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaagtgaagtagtcataaacaaagctagacttgttacacaaggttacagtcagca 14970647  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  14970646 agaaggcattaattatactgaaacattttctccaattgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcatatgaagttaatcataacataatattatat 14970547  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14970546 caaatggatgtcaagagtgcatttcttaatg 14970516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 17249494 - 17249722
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  17249494 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaagt-gaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacggtcaaca 17249592  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  17249593 agaaggcattaattacactaaaa-atttgctccagttgcaagattcgaagcaatcaggttacttatatcctatgcagttaatcatggcattattttatat 17249691  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  17249692 caaatggatgtcaagagtgcatatcttaatg 17249722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 18703277 - 18703507
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||   ||||||||| | |||| |||||| |||| ||| ||||||||    
T  18703277 acattattgaaacaaagtgggtgttcagaaacaagcttaatgaacagggagaagtagttagaaacaaaaccagacatgttgctcaaggatatagtcaaca 18703376  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  18703377 agaaggcattgattacactgaaacatttactccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatgacattatattatat 18703476  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  18703477 caaatggatgttaagagtgcatttctcaatg 18703507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11186435 - 11186247
Alignment:
Q  52 aacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatg 151  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | || || || |    
T  11186435 aacaaggtgaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaaggcattgactacattgaaacatttgtttcaatttcaag 11186336  T
Q  152 attggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  11186335 attggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcataacataatattatatcaaatggatgtcaagagtgcatttctcaatg 11186247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 240
Target Start/End: Original strand, 20765986 - 20766206
Alignment:
Q  19 gaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcat 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||| || |||||| |||| |  |  ||||||||||| ||  | ||    
T  20765986 gaacaaaatgggtatttagaaacaagctcaatgaactaggagaagtagtcagaaacaa-gcaagacttattgctccgggttacagtcaacaagagagtat 20766084  T
Q  119 tgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggat 218  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20766085 gtattacattgaaacatttgcttcagttgcaagattggaggcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggat 20766184  T
Q  219 gtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    || || ||||| ||||||||||    
T  20766185 gttaagagtgcatttcttaatg 20766206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 163
Target Start/End: Original strand, 48982899 - 48983047
Alignment:
Q  15 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 114  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  |  ||||| ||||| | || | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  48982899 attggaacaagatgggtcttcagaaacaaattagatgaagaaggaaaagtcatcagaaataaagccagacttgttgcacaaggatataatcaacaggaag 48982998  T
Q  115 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaat 163  Q
    | || || ||   |||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  48982999 gtatagactatgatgaaacatttgctccagttgcaaggttagaagcaat 48983047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 17013289 - 17013241
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaagg 58  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17013289 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaagg 17013241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 11186464 - 11186430
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaag 44  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11186464 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaag 11186430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Original strand, 6426953 - 6427021
Alignment:
Q  11 catcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagc 79  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  ||||   ||||||||||||    
T  6426953 catcattggaacaagatgggttttcagaaacaagcttgatgaagaaggtaaggttgtcagaaacaaagc 6427021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 28360466 - 28360394
Alignment:
Q  11 catcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctaga 83  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || |||||| ||||| | || | ||||||||||||||||    
T  28360466 catcattggaacaagatgtgtatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagttatcagaaacaaagctaga 28360394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7685198 - 7684963
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  7685198 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 7685099  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7685098 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 7684999  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7684998 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 7684963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 51650651 - 51650886
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  51650651 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 51650750  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51650751 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 51650850  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51650851 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 51650886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3177648 - 3177418
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  3177648 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 3177549  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3177548 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 3177449  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3177448 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 3177418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 5644482 - 5644717
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5644482 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaagcctacagtcaaca 5644581  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5644582 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 5644681  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5644682 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 5644717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 7694248 - 7694483
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  7694248 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaactagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 7694347  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7694348 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 7694447  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7694448 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 7694483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 12617930 - 12618165
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12617930 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 12618029  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12618030 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 12618129  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12618130 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 12618165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12736575 - 12736340
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12736575 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 12736476  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12736475 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 12736376  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12736375 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 12736340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21869710 - 21869475
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  21869710 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 21869611  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21869610 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 21869511  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21869510 caaatggatgtcaaaagtgcatttcttaatggtgtc 21869475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 35642815 - 35643050
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  35642815 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 35642914  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35642915 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 35643014  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  35643015 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 35643050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 36241208 - 36241443
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  36241208 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 36241307  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36241308 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 36241407  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36241408 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 36241443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 38101132 - 38100897
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  38101132 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 38101033  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38101032 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 38100933  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38100932 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 38100897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5839251 - 5839021
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5839251 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 5839152  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5839151 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 5839052  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5839051 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 5839021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 47612710 - 47612940
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  47612710 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 47612809  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47612810 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 47612909  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47612910 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 47612940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4173349 - 4173114
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  4173349 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagccaaca 4173250  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4173249 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 4173150  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  4173149 caaatggatgtcaaaagtgtctttcttaatggtgtc 4173114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7513321 - 7513086
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  7513321 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaaaccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 7513222  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7513221 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatgacataatattatat 7513122  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7513121 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 7513086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 19164429 - 19164664
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  19164429 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacaaagtcagacttgttgcacaaggttatagtcaaca 19164528  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19164529 agaaggcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 19164628  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  19164629 caaatggatgtcaagagtgcatttcttaatggtgtc 19164664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 21210501 - 21210736
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  21210501 acattatttgaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaaca 21210600  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21210601 agaaggcattgattacactgaaacttttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctttcctatgcagttaatcatggcataatattatat 21210700  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21210701 caaatggatgtcaagagtgcttttcttaatggtgtc 21210736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 21129076 - 21129295
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  21129076 acattattggaacaaaatgggtattcagaaataagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagtcagacttgttgcacaaggttacattcaaca 21129175  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21129176 agaaggcattgattacacagaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 21129275  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgc 229  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  21129276 caaatggatgtcaagagtgc 21129295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22127537 - 22127307
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  22127537 acattattggaacaaaatgggtattcataaacaagttgaatgaacaagatgaagtaattagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaaca 22127438  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22127437 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaagttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 22127338  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  22127337 caaatggatgttaagagtgcattttttaatg 22127307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17715943 - 17715713
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |    
T  17715943 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggtgaagtagtaagaaacaaagctagacttgttgctcaaggttacagtcaaaa 17715844  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||    
T  17715843 agaaggcattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatgctatacagtaaatcatggcataatattatat 17715744  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  17715743 caaatggatgtaaagagtgcatttctcaatg 17715713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 20871952 - 20872135
Alignment:
Q  62 ggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagca 161  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20871952 ggtaactagaaagaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaacaagaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagca 20872051  T
Q  162 atcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  20872052 atcaggttacttctatcctatgtagttaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaagagtgcatttcttaatggtgtc 20872135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 23978338 - 23978548
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23978338 acattattggaacaaaatgggtggtcaggaacaagcttaatgaacaaggagaagttgttagaaacaaagaacgacttgttgcacaaggatatagtcaaca 23978437  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     || || |||||||||||||||| |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||| |||||||||    
T  23978438 agagggtattgattacactgaaatatttactcaaattgcaagattataagcaatcaggttacttctatcctatgcagttatttaagacattatattatat 23978537  T
Q  210 caaatggatgt 220  Q
    |||||||||||    
T  23978538 caaatggatgt 23978548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 240
Target Start/End: Original strand, 22446506 - 22446593
Alignment:
Q  152 attggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  22446506 attggaagcaatcaggttacttttatcctatgcagttaat-atggcaaaatattatatcaaatggatgtcaagagtgtatttcttaatg 22446593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 240
Target Start/End: Original strand, 22451740 - 22451827
Alignment:
Q  152 attggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  22451740 attggaagcaatcaggttacttttatcctatgcagttaat-atggcaaaatattatatcaaatggatgtcaagagtgtatttcttaatg 22451827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22650773 - 22650725
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaagg 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22650773 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaagg 22650725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14277767 - 14277687
Alignment:
Q  68 cagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgc 148  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||||  |||| |||||| ||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  14277767 cagaaataaagctagattagtagcacaaggctacaatcaacaagaaggtattgactatgatgaaacatttgctccagttgc 14277687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 37627 - 37862
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37627 acattattggaacaaaataggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccaaaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaaca 37726  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37727 agaaggcattgatgacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 37826  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37827 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 37862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4478 - 4313
Alignment:
Q  18 ggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggca 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | || |||   ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||    
T  4478 ggaacaaaatgggtattcaggaacaagttgaatgaacaatgtgaagtagttagaaacaaagctagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaagaca 4379  T
Q  118 ttgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatg 183  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4378 ttgattatattgaaacatttgctccaattgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatg 4313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 20034667 - 20034902
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  20034667 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagttaaca 20034766  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20034767 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 20034866  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20034867 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 20034902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25793773 - 25793538
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25793773 acattattggaacaaaatgggtattcataaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgctcaaggatacagtcaaca 25793674  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25793673 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 25793574  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25793573 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 25793538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4636985 - 4636750
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4636985 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 4636886  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4636885 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 4636786  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4636785 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 4636750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 9117234 - 9117469
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9117234 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 9117333  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9117334 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtat 9117433  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9117434 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 9117469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 12721578 - 12721813
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12721578 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 12721677  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12721678 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 12721777  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12721778 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 12721813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26031479 - 26031244
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26031479 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 26031380  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26031379 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 26031280  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26031279 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 26031244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27347804 - 27347569
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27347804 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 27347705  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27347704 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 27347605  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27347604 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 27347569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27408544 - 27408309
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27408544 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 27408445  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27408444 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 27408345  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27408344 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 27408309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 32305788 - 32306023
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  32305788 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 32305887  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32305888 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 32305987  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32305988 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 32306023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3667485 - 3667250
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  3667485 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 3667386  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3667385 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 3667286  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3667285 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 3667250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 11255330 - 11255565
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11255330 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 11255429  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11255430 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaagtaatcatggcataatattatat 11255529  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11255530 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 11255565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16955067 - 16954832
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16955067 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 16954968  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16954967 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 16954868  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16954867 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 16954832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 18829052 - 18829287
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  18829052 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaaca 18829151  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18829152 agaaggcattgattacactgaaacttttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 18829251  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18829252 caaatggatgtcaagagtgcttttcttaatggtgtc 18829287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26039675 - 26039440
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26039675 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaaaaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 26039576  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26039575 agaaggcattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 26039476  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26039475 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 26039440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26870861 - 26870626
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26870861 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 26870762  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26870761 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 26870662  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26870661 caaatggatgtcaaaagtgcatttcttaatggtgtc 26870626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 32966688 - 32966923
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  32966688 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggatacagtcaaca 32966787  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32966788 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagactggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 32966887  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32966888 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 32966923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 34811905 - 34812140
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34811905 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 34812004  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34812005 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 34812104  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34812105 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 34812140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12860990 - 12860760
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12860990 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 12860891  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12860890 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 12860791  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12860790 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 12860760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13919305 - 13919075
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13919305 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 13919206  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13919205 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 13919106  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13919105 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 13919075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27378851 - 27378616
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27378851 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 27378752  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27378751 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtat 27378652  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  27378651 caaatggatgtcaaaagtggttttattaatggtgtc 27378616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27469234 - 27468999
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27469234 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 27469135  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27469134 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtat 27469035  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  27469034 caaatggatgtcaaaagtggttttattaatggtgtc 27468999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27499763 - 27499528
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27499763 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaaaaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 27499664  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27499663 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaaccatggcataatattgtat 27499564  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27499563 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 27499528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 25681723 - 25681958
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25681723 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaacgagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggatacagtcaaca 25681822  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  25681823 agaaggcattgactacactgaagcatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcccatgcagttaatcatggtttaatattatat 25681922  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||| ||||    
T  25681923 caaatggatgtcaagagcgcctttcttaatggtgtc 25681958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22382093 - 22381858
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22382093 acattattagaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacaaatccagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 22381994  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22381993 agaaggcattaattacactgaaacaattgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 22381894  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  22381893 caaatagatgtcaagagtgcatttcttaatggtgtc 22381858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 14058109 - 14058343
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14058109 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctaaatgaggaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggatatagtcaaca 14058208  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  14058209 agaaggcattgattatactgaaacttttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttcta-cctatgcaatcaatcatggaataataatatat 14058307  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  14058308 caaatagatgttaagagtgcttttcttaatggtgtc 14058343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 14064238 - 14064472
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14064238 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctaaatgaggaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggatatagtcaaca 14064337  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  14064338 agaaggcattgattatactgaaacttttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttcta-cctatgcaatcaatcatggaataataatatat 14064436  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  14064437 caaatagatgttaagagtgcttttcttaatggtgtc 14064472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16882231 - 16882001
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  16882231 acattattgaaacaaaatgggtattcagaaacaagttcaatgaacaaggtgaagtaacaagaaacaaagccagacttgttgcacaaggttatagtcaaca 16882132  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  16882131 agaaggcataaactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagtcaatcatgacataatattatat 16882032  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||    
T  16882031 caaatggatatcaagagtgcatttattaatg 16882001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 19956625 - 19956838
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19956625 acattattggaacaaaacgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggggaagtaaccagaaaaaaagtcagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 19956724  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  19956725 agaaggcattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttatatcctatgcagttaatcataaaataatattatat 19956824  T
Q  210 caaatggatgtcaa 223  Q
     |||||||||||||    
T  19956825 taaatggatgtcaa 19956838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 111 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1656736 - 1656602
Alignment:
Q  111 gaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1656736 gaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatatc 1656637  T
Q  211 aaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  1656636 aaatggatgtcaagagtgcatttcttaatggtgtc 1656602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19445923 - 19445693
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| || |||  |||||||||| |||||||| || | ||||  |||||||||||    
T  19445923 acattattggaacaaaatgggtattaataatcaagttgaatgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaaactagacttatttctcaaggttacagtcaaca 19445824  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||    
T  19445823 agaaggcattgattatactgaaacatttcctccatttgcaagattggaagcagtcaggttacttctatcctgtgcagtaaatcatggcattatattatat 19445724  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  19445723 caaatggatgtaaagagtgcatttctaaatg 19445693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 17613254 - 17613419
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17613254 acattattggaataaaatgggtattcaaaaacaagttgaacgaacaaggtgaagtaactagaaacaaagccagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 17613353  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttct 175  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17613354 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttct 17613419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22810944 - 22810769
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||  |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  22810944 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacagggtgaagtagtcagaaacaaagctatacttgttgaacaaggttacagtcaaca 22810845  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgca 185  Q
     ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22810844 agaaggtattgagtacattgaaaaatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgca 22810769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 120 - 245
Target Start/End: Original strand, 18920359 - 18920484
Alignment:
Q  120 gattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatg 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18920359 gattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatgacataatattatatcaaatggatg 18920458  T
Q  220 tcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  18920459 tcaatagtgcttttcttaatggtgtc 18920484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17053416 - 17053273
Alignment:
Q  102 agtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataa 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || |    
T  17053416 agtcaacaagaaggcattgattacactgagacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggtttcttctttcctatgctattaatcatgatatca 17053317  T
Q  202 tattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
       ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  17053316 ccctatatcaaatggacgtcaagagtgcatttcttaatggtgtc 17053273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14367181 - 14367097
Alignment:
Q  136 ttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatgt 220  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14367181 ttgctccacttgcaagattggaagcaatcagattacttctatcctatgcggtaaatcatgccataatattatatcaaatggatgt 14367097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Original strand, 14169919 - 14170020
Alignment:
Q  117 attgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatgg 216  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  | || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||| | ||||    
T  14169919 attgattacactaatacatttgctccagttgcaagaccgaaaacaataaggttacttctatcttatgcagttaatcatgacataactttatataagatgg 14170018  T
Q  217 at 218  Q
    ||    
T  14170019 at 14170020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 13019525 - 13019493
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaaca 42  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13019525 acattattggaacaaaatgggtattcagaaaca 13019493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24927860 - 24927792
Alignment:
Q  11 catcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagc 79  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  ||||   ||||||||||||    
T  24927860 catcattggaacaagatgggttttcagaaacaagcttgatgaagaaggtaaggttgtcagaaacaaagc 24927792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4218095 - 4217860
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4218095 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 4217996  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4217995 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 4217896  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4217895 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 4217860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9165651 - 9165416
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9165651 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 9165552  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9165551 agaaggcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 9165452  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9165451 caaatggatgtcaaaagtgctttttttaatggtgtc 9165416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1993643 - 1993408
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  1993643 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 1993544  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1993543 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 1993444  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1993443 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 1993408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 15882639 - 15882874
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15882639 acattattggaacaaaatgggtattcaaaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 15882738  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15882739 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 15882838  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15882839 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 15882874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 26394910 - 26395145
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26394910 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 26395009  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26395010 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 26395109  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26395110 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 26395145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 40046920 - 40047155
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  40046920 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 40047019  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40047020 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 40047119  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40047120 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 40047155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42871935 - 42871705
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  42871935 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 42871836  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42871835 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 42871736  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42871735 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 42871705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 172977 - 172742
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  172977 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 172878  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  172877 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 172778  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  172777 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 172742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9091321 - 9091086
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9091321 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 9091222  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9091221 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 9091122  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9091121 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 9091086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11011274 - 11011039
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11011274 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 11011175  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11011174 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 11011075  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11011074 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 11011039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20985344 - 20985109
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  20985344 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagtcagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 20985245  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20985244 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtat 20985145  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20985144 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 20985109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24740188 - 24739953
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24740188 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaactagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 24740089  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24740088 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 24739989  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24739988 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 24739953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 8006882 - 8007112
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  8006882 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 8006981  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8006982 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 8007081  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8007082 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 8007112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 461802 - 462037
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  461802 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 461901  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  461902 agaaggcattgattacactgaaacatttgcttcagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 462001  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  462002 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 462037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 2710429 - 2710664
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  2710429 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 2710528  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2710529 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaaacaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 2710628  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2710629 caaatggatgtcaaaagtgcatttcttaatggtgtc 2710664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 6872046 - 6872281
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6872046 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 6872145  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6872146 agaagacattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 6872245  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6872246 caaatggatgttaaaagtgcttttcttaatggtgtc 6872281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 17954930 - 17955165
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17954930 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 17955029  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17955030 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcgattaatcatggcataatattatat 17955129  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17955130 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 17955165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18434610 - 18434375
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  18434610 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaaca 18434511  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18434510 agaaggcattgattacactgagacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaattatggcataatattatat 18434411  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  18434410 caaatggatgtcaagagtgctttccttaatggtgtc 18434375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 26658151 - 26658386
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26658151 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 26658250  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26658251 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 26658350  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  26658351 caaatggatgtcaaaagtgtctttcttaatggtgtc 26658386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9439350 - 9439120
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9439350 acattattggaacaaaatggatattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccataaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 9439251  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9439250 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtat 9439151  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9439150 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 9439120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 245
Target Start/End: Original strand, 20998244 - 20998470
Alignment:
Q  19 gaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  20998244 gaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagtcagacttgttgctcaaggctacagtcaacaagaaggcat 20998343  T
Q  119 tgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20998344 tgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtatcaaatggat 20998443  T
Q  219 gtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20998444 gtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 20998470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22095228 - 22094993
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22095228 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 22095129  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22095128 agaaggcattgattacactgaaacatttgctatagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 22095029  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22095028 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 22094993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8623451 - 8623215
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagactt-gttgcacaagaatacagtcaac 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  8623451 acattattggaacaaaatgggtattcaaaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagactttgttgctcaaggctacagtcaac 8623352  T
Q  109 aggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattata 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8623351 aagaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattata 8623252  T
Q  209 tcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8623251 tcaaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 8623215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 240
Target Start/End: Original strand, 13125778 - 13126002
Alignment:
Q  16 ttggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaagg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13125778 ttggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaatcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaagg 13125877  T
Q  116 cattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatg 215  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13125878 cattgactacactgaaaaatttgctccagttacaagattggaagcaatcaggttacttctatcctaagcaattaatcatggcataatattatatcaaatg 13125977  T
Q  216 gatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13125978 gatgtcaagagtgcatttcttaatg 13126002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13662553 - 13662324
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  13662553 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttaaatgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacaatcaaca 13662454  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  13662453 agaaggcattgactacactgaaacatttgctcctgttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtagttaatcatggcataaaattatat 13662354  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaat 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13662353 caaatggatgtcaagagtgcttttcttaat 13662324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14141989 - 14141758
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||    
T  14141989 acattattgtaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgaacaaggttatagtcaaca 14141890  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14141889 agaaggcatagactacactaaaacatttgctctagttgcaagattggtagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggaataatattatat 14141790  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatga 241  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14141789 caaatggatgtcaagagtgtatttcttaatga 14141758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 16314286 - 16314513
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||    
T  16314286 acattattggaacaaaatgggtattcataaacaaattgaatgaacaaggtgaagtaatcagaaacaaagctagacttgttgcataatgttacagttaaca 16314385  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  16314386 agaaggcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctatgtagttaatcacggcataatattatat 16314485  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttctta 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16314486 caaatggatgtcaagagtgcatttctta 16314513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 4416810 - 4417040
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| || | ||||  ||||  |||||    
T  4416810 acataattgaaacaaaatgggtattcagaaacaagctcaatgaaaagggagaagtaatcagaaagaaagccagacttattactcaagggtacaaccaaca 4416909  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||  || |  ||||||    
T  4416910 agaaggcattgattacactgagacatttgctccagttgcaagattggaagcaattaggttacttctttcctatgcagtaaatcatgatatcaccttatat 4417009  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  4417010 caaatggatgtcaagagtgcatttctcaatg 4417040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10652927 - 10652695
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||  |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  10652927 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaattaattagaaacaaagttagacttgttgcataaggttacagtcaaca 10652828  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctcca--gttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattat 207  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||  |   ||   |||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||| |  |||||||||||    
T  10652827 agaacgcattgactacactgaaacatttgctacactgaaacaaagttggaaacaatcaagttacttctatcctatgtagttaatcgtaacataatattat 10652728  T
Q  208 atcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  10652727 atcaaatagatgttaaaagtgcatttcttaatg 10652695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 16157917 - 16158147
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||    
T  16157917 acattattggaacaaaatgggtgttcaggaacaaacttaatgaacaaggtgaaaatgtcagaaacaaagctagacttgttgtataaggatatagtcagca 16158016  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     || |||||  |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||    
T  16158017 agagggcataaattatacttaaacattttctccagttgcaagattataagcaatcaggttacttctatcctattcattttatcatggcattatattatat 16158116  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  16158117 caaatagatgtcaagagtgcatttctcaatg 16158147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Original strand, 25206045 - 25206097
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagag 62  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25206045 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagag 25206097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Original strand, 15179737 - 15179871
Alignment:
Q  11 catcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacag 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||| | || | |||||||||||||||| | || || ||||  |||| ||||||     
T  15179737 catcattggaacaagatgggtatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagttatcagaaacaaagctagattggtagctcaagggtacaatcaacaa 15179836  T
Q  111 gaaggcattgattacactgaaacatttgctccagt 145  Q
    ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  15179837 gaaggtattgattacgatgaaacctttgctccagt 15179871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4824817 - 4824767
Alignment:
Q  189 aatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  4824817 aatcatggcataatattatatcaaatggatgtgaagagtgcatttcttaat 4824767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 19468827 - 19469062
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19468827 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 19468926  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19468927 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 19469026  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19469027 caaatggatgtcaagagtgcttttcttaatggtgtc 19469062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27048243 - 27048008
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27048243 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaagactacagtcaaca 27048144  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27048143 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 27048044  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27048043 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 27048008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 14034897 - 14035132
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14034897 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 14034996  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14034997 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 14035096  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14035097 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 14035132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14453018 - 14452783
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14453018 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 14452919  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14452918 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 14452819  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14452818 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 14452783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14564059 - 14563824
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14564059 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 14563960  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14563959 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 14563860  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14563859 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 14563824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 20556602 - 20556837
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20556602 acattattggaacaaaatggatattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 20556701  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20556702 agaaggcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagtaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 20556801  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20556802 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 20556837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 21670707 - 21670942
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  21670707 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaaca 21670806  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21670807 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 21670906  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21670907 caaatggatgtcaagagtgcttttcttaatggtgtc 21670942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 22680971 - 22681206
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22680971 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 22681070  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22681071 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 22681170  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22681171 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 22681206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 23301132 - 23301367
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23301132 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 23301231  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23301232 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 23301331  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23301332 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 23301367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 24571927 - 24572162
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24571927 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 24572026  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24572027 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 24572126  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24572127 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 24572162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24822882 - 24822647
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24822882 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 24822783  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24822782 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 24822683  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24822682 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 24822647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24942596 - 24942361
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24942596 acattattggaacaaaatgggtattcaaaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 24942497  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24942496 agaaggcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 24942397  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24942396 caaatggatgtcaaaagtgtttttcttaatggtgtc 24942361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 27465017 - 27465252
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27465017 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 27465116  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27465117 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 27465216  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27465217 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 27465252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 34056788 - 34057023
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34056788 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaaca 34056887  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34056888 agaaggcattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctatgcagttaatcatgacataatattatat 34056987  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34056988 caaatggatgtcaagagtgcttttcttaatggtgtc 34057023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 34776751 - 34776986
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34776751 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 34776850  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34776851 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtat 34776950  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34776951 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 34776986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39496893 - 39496658
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  39496893 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 39496794  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39496793 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 39496694  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39496693 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 39496658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1117308 - 1117073
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  1117308 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgagcaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 1117209  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1117208 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctatgcaattaatcatggcataatactatat 1117109  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1117108 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 1117073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 6980660 - 6980895
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6980660 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 6980759  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6980760 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatgacataatattatat 6980859  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6980860 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 6980895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 9340810 - 9341045
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9340810 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 9340909  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9340910 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 9341009  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9341010 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 9341045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13529318 - 13529083
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  13529318 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggggaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaaca 13529219  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13529218 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 13529119  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  13529118 caaatggatgtcaatagtgcatttcttaatggtgtc 13529083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15999302 - 15999067
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15999302 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 15999203  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15999202 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 15999103  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15999102 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 15999067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 22151371 - 22151606
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22151371 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 22151470  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22151471 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 22151570  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22151571 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 22151606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 23366791 - 23367026
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23366791 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 23366890  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23366891 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 23366990  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23366991 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 23367026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 23701635 - 23701870
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23701635 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 23701734  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23701735 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 23701834  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23701835 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 23701870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 24812768 - 24813003
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24812768 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 24812867  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24812868 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 24812967  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24812968 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 24813003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30233432 - 30233197
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  30233432 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 30233333  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30233332 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 30233233  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  30233232 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 30233197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 36692553 - 36692788
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  36692553 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 36692652  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36692653 agaatgcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 36692752  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36692753 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 36692788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 42047635 - 42047870
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  42047635 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 42047734  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42047735 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 42047834  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  42047835 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 42047870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 35220358 - 35220588
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  35220358 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 35220457  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35220458 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 35220557  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35220558 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 35220588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37735973 - 37735743
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  37735973 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 37735874  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37735873 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 37735774  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37735773 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 37735743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17452718 - 17452483
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17452718 acattattggaacaaaatgggtatttagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaaca 17452619  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  17452618 agaaggcattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcgggttacttttatcctatgcagttaatcttgacataatattatat 17452519  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17452518 caaatggatgtcaagagtgcttttcttaatgatgtc 17452483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 39357351 - 39357586
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  39357351 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 39357450  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39357451 agaaggcattgattacactgaaacatttgttccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 39357550  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  39357551 caaatggatgtcaaaagtgcatttcttaatggtgtc 39357586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 15744824 - 15745054
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15744824 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 15744923  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15744924 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaaaattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 15745023  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15745024 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 15745054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 17611917 - 17612147
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17611917 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 17612016  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17612017 agaaggcattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 17612116  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17612117 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 17612147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 31353389 - 31353619
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  31353389 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 31353488  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31353489 agaaggcattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 31353588  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31353589 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 31353619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5296548 - 5296313
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5296548 acattattggaacaaaatgggtattcaaaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 5296449  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5296448 agaagacattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcagattacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtat 5296349  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5296348 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 5296313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27618178 - 27617943
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27618178 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 27618079  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27618078 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcgtacgcaattaatcatggcataatattatat 27617979  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27617978 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 27617943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 31838335 - 31838570
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  31838335 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagtcagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 31838434  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31838435 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggaataatattatat 31838534  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31838535 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 31838570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 40395217 - 40395452
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  40395217 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 40395316  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40395317 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 40395416  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  40395417 caaatggatgttaaaagtgtctttcttaatggtgtc 40395452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 17723773 - 17724003
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17723773 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 17723872  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17723873 agaaggcattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatgacataatattatat 17723972  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17723973 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 17724003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 20784900 - 20785135
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| |    
T  20784900 acattattggaacaaaatgggtattcagaaagaagctgaatgaagaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggttacagtcaaga 20784999  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20785000 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctacgcaattaatcatggcataatagtatat 20785099  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20785100 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 20785135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36588523 - 36588288
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  36588523 acattattggaacaaaatgggtattcaaaaacaagctgaatgaacaacgagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacaatcaaca 36588424  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36588423 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 36588324  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36588323 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 36588288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23484208 - 23483973
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  23484208 acattattggtacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacaaagccagacttgtggcacaaggttacagtcaaca 23484109  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23484108 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 23484009  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  23484008 caaatggatgtcaagagtgcatttcttaatggtgtc 23483973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 23400766 - 23401001
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23400766 acattattggaacaaaatggatattcagaaacaagctaaatgaacaaggagaaataaccataaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 23400865  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23400866 agaagacattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaaaaaggttacttttatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 23400965  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23400966 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 23401001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 163
Target Start/End: Original strand, 5604796 - 5604944
Alignment:
Q  15 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 114  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  |  ||||| ||||| | || | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  5604796 attggaacaagatgggtcttcagaaacaaattagatgaagaaggaaaagtcatcagaaataaagccagacttgttgcacaaggatataatcaacaggaag 5604895  T
Q  115 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaat 163  Q
    | || || ||   |||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  5604896 gtatagactatgatgaaacatttgctccagttgcaaggttagaagcaat 5604944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 21203721 - 21203796
Alignment:
Q  15 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttg 90  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  21203721 attgaaacaaaatgggtattcagaaacaagttaaatgaacaaggtaaagtagtcagaaacaaagctagacttgttg 21203796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Original strand, 24416831 - 24416962
Alignment:
Q  11 catcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacag 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||| | || | |||||||||||||||| | || || ||||  |||| ||||||     
T  24416831 catcattggaacaagatgggtatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagtcatcagaaacaaagctagattggtagctcaagggtacaatcaacaa 24416930  T
Q  111 gaaggcattgattacactgaaacatttgctcc 142  Q
    ||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  24416931 gaaggtattgattacgatgaaacctttgctcc 24416962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 30450377 - 30450246
Alignment:
Q  11 catcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacag 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||| | || | |||||||||||||||| | || || ||||  |||| ||||||     
T  30450377 catcattggaacaagatgggtatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagttatcagaaacaaagctagattggtagctcaagggtacaatcaacaa 30450278  T
Q  111 gaaggcattgattacactgaaacatttgctcc 142  Q
    ||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  30450277 gaaggtattgattacgatgaaacctttgctcc 30450246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15326531 - 15326397
Alignment:
Q  26 atgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattac 125  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| || || ||     
T  15326531 atgggtattcagaaacaaattggatgaagaaggaaaggtgactcgaaacaaggcaagactagttgcacaaggatacaatcaacaagaaggaatcgactat 15326432  T
Q  126 actgaaacatttgctccagttgcatgattggaagc 160  Q
      |||||| | ||||||||| ||| || |||||||    
T  15326431 gatgaaacttatgctccagtagcaagactggaagc 15326397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 160
Target Start/End: Original strand, 18712238 - 18712372
Alignment:
Q  26 atgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattac 125  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||| ||  ||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| || || ||     
T  18712238 atgggtattcagaaacaaattggatgaagaaggaaaggtgactcgaaacaaggcaagactagttgcacaaggatacaatcaacaagaaggaatcgactat 18712337  T
Q  126 actgaaacatttgctccagttgcatgattggaagc 160  Q
      |||||| | ||||||||| ||| || |||||||    
T  18712338 gatgaaacttatgctccagtagcaagactggaagc 18712372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26873027 - 26872792
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26873027 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcataaggatacagtcaaca 26872928  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26872927 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 26872828  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26872827 caaatggatgtcaagagtgcttttcttaatggtgtc 26872792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10273047 - 10272812
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  10273047 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 10272948  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10272947 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 10272848  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10272847 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 10272812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 24332501 - 24332736
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24332501 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 24332600  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24332601 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 24332700  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24332701 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 24332736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 28726069 - 28726304
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28726069 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 28726168  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28726169 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcagttaatcatgacataatattatat 28726268  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28726269 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 28726304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29250281 - 29250046
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29250281 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 29250182  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29250181 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattgtat 29250082  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29250081 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 29250046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 9767515 - 9767750
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9767515 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 9767614  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9767615 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 9767714  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9767715 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 9767750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 9902325 - 9902560
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9902325 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 9902424  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9902425 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 9902524  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9902525 caaatggatgtcaaaagtgtttttcttaatggtgtc 9902560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 11399924 - 11400159
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11399924 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 11400023  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11400024 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 11400123  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11400124 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 11400159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 19307171 - 19307406
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  19307171 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 19307270  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19307271 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 19307370  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19307371 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 19307406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 21125694 - 21125929
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  21125694 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 21125793  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21125794 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 21125893  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21125894 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 21125929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 21166699 - 21166934
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21166699 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 21166798  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21166799 agaaggcattgattacactaaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 21166898  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21166899 caaatggatgtcaaaagtgattttcttaatggtgtc 21166934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 34794969 - 34795204
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34794969 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 34795068  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34795069 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 34795168  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34795169 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 34795204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 39174846 - 39175081
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  39174846 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 39174945  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39174946 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatgacataatattatat 39175045  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39175046 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 39175081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40246669 - 40246434
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  40246669 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 40246570  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40246569 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 40246470  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40246469 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 40246434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43088758 - 43088523
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  43088758 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 43088659  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43088658 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 43088559  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  43088558 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 43088523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27227499 - 27227269
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27227499 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 27227400  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27227399 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 27227300  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27227299 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 27227269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35259065 - 35258835
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  35259065 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 35258966  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35258965 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 35258866  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35258865 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 35258835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35269690 - 35269460
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  35269690 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 35269591  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35269590 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 35269491  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35269490 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatg 35269460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 22938409 - 22938644
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22938409 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaaactgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 22938508  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22938509 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 22938608  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22938609 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 22938644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43351463 - 43351228
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  43351463 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 43351364  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43351363 agaaggcattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 43351264  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  43351263 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 43351228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4215956 - 4215721
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4215956 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 4215857  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4215856 agaaggcattggttacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 4215757  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  4215756 cagatggatgtcaaaagtgtctttcttaatggtgtc 4215721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 22746097 - 22746332
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22746097 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacagggatacagtcaaca 22746196  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22746197 agaaggcattgattacactgaaacttttgctccagttgcaagattggaagctatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 22746296  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  22746297 caaatggatgtcaagagtgcttttcgtaatggtgtc 22746332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22777307 - 22777077
Alignment:
Q  15 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22777307 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggatacagtcaacaagaag 22777208  T
Q  115 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22777207 gcattgactacactgaaacatttgctccaattgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggtttaatattatatcaaat 22777108  T
Q  215 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||| || || |||||||||| ||||    
T  22777107 ggatgtcaagagcgcctttcttaatgttgtc 22777077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 28705961 - 28706196
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  28705961 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttaaatgaacaaggtgaagtgaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggttacaatcaaca 28706060  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  28706061 agaaggcattgattacactaaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagtaaatcatggcataatattatat 28706160  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  28706161 caaatggatgtcaagagtgcatttattaatggtgtc 28706196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24721386 - 24721176
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24721386 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagcaagacttgttgctcaaggttacagtcaaca 24721287  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24721286 ggaaggcattgactatactgaaacatttgctcaagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctatgcagtaaatcatggcataatattatat 24721187  T
Q  210 caaatggatgt 220  Q
    |||||||||||    
T  24721186 caaatggatgt 24721176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 24809126 - 24809361
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  24809126 acattattggaacaaaattggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacaaagccagacttgttgcacaaggttatagtcaaca 24809225  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24809226 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattagaagcaatcaagttatttctgtcctatgcagttaatcatggtataatattatat 24809325  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
     ||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  24809326 taaatggatgtctagagtgcatttcttaatggtgtc 24809361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 118
Target Start/End: Original strand, 24419778 - 24419886
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24419778 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaaggatacagtcaaca 24419877  T
Q  110 ggaaggcat 118  Q
     ||||||||    
T  24419878 agaaggcat 24419886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 163
Target Start/End: Original strand, 1795181 - 1795329
Alignment:
Q  15 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 114  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  |  ||||| ||||| | || | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  1795181 attggaacaagatgggtcttcagaaacaaattagatgaagaaggaaaagtcatcagaaataaagccagacttgttgcacaaggatataatcaacaggaag 1795280  T
Q  115 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaat 163  Q
    | || || ||   |||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  1795281 gtatagactatgatgaaacatttgctccagttgcaaggttagaagcaat 1795329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 245
Target Start/End: Original strand, 24419882 - 24419932
Alignment:
Q  195 ggcataatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24419882 ggcataatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 24419932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18944978 - 18944906
Alignment:
Q  169 tacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatga 241  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  18944978 tacttctatgcaatgcagttaatcataacataatattatatcaaatgaatgtcaatagtgcatttctcaatga 18944906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 145
Target Start/End: Original strand, 10835151 - 10835185
Alignment:
Q  111 gaaggcattgattacactgaaacatttgctccagt 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10835151 gaaggcattgactacactgaaacatttgctccagt 10835185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37221 - 36986
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  37221 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 37122  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37121 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 37022  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37021 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 36986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 47710 - 47945
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  47710 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 47809  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47810 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaagttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 47909  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47910 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatggtgtc 47945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 6058 - 6293
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6058 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 6157  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6158 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 6257  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6258 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 6293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 753 - 983
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  753 acattattggaacagaatgggtattcagaaacaacctgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaagtttacagtcaaca 852  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || | |||| | |||||||  || |  |||||     
T  853 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcagattacttctttcttttgcagtaaatcatgatatcaccttatac 952  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  953 caaatggatgtcaagagtgcttttctcaatg 983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 240
Target Start/End: Original strand, 11405 - 11546
Alignment:
Q  99 tacagtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggca 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || | |||| | |||||||  |    
T  11405 tacagtcaacaagaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcagattacttctttcttttgcagtaaatcatgata 11504  T
Q  199 taatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    | |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11505 tcaccttataccaaatggatgtcaagagtgcttttctcaatg 11546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 41727 - 41962
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  41727 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgctcaaggctacagtcaaca 41826  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41827 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctacgcaattaatcatggcataatattatat 41926  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  41927 caaatggatgtcaaaagtgcctttcttaatggtgtc 41962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13211 - 12976
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  13211 acattattggaacaaaatgggtattcagaaataagctgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttgttccacaaggttacagtcaaca 13112  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13111 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 13012  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||    
T  13011 caaatggatgtcaagagttctttttttaatggtgtc 12976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21872 - 21637
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21872 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaagaaggtgaagtaaccagaaacaaagacagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 21773  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21772 agaaggcatcgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 21673  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  21672 caaatggatgtcaagagtgcatttcttaatggtgtc 21637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14964 - 14909
Alignment:
Q  190 atcatggcataatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  14964 atcatggcataatattatatcaaatggatgtcaagagtgcatttcttaatggtgtc 14909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 9733 - 9968
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9733 acattattggaacaaaatgggtattcagaaataagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttgttgcacaaggctacagtcaaca 9832  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  9833 agaaggcattgattacactgaaacatttgctaaagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcatataattatat 9932  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  9933 caaatggatgtcaagagtgcatttcttaatggtgtc 9968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 210
Target Start/End: Original strand, 98 - 298
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  98 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcgcaaggttatagtcaaca 197  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  198 agaagacattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctttgcagttaatcatggcataatattatat 297  T
Q  210 c 210  Q
    |    
T  298 c 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 240
Target Start/End: Original strand, 1607 - 1645
Alignment:
Q  202 tattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1607 tattatatgaaatggatgtcaagagtgcttttcttaatg 1645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 4441 - 4676
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4441 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctcaatgaaaagggagaagtaatcagaaacaaagccagacttgttgctcaagggtacagtcaaca 4540  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4541 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaagttacttctatcctatgcagctaatcatggcataatattatat 4640  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  4641 caaatggatgtcaagagtgcatttctttatggtgtc 4676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12779 - 12549
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12779 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccataaacaaagccagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 12680  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12679 agaaggcattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttttatcctatgcaataaatcatggcataatattatat 12580  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    ||||  |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  12579 caaaccgatgtcaagagtgcatttctgaatg 12549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 29555 - 29785
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29555 acattattggaacaaaatgggtattcagaaaaaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccagtaacaaagccagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 29654  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29655 agaaggcattgactacagtgaaacatttgctccaattgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 29754  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29755 taaatggatgtcaagagtgcatttcttaatg 29785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 6601 - 6831
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  6601 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtagtcagaagcaaagctatacttgttgcacaaggttacagtcaaca 6700  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6701 agaaggcattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcagtttacttctatcttatccagttaatcatggcataatattatat 6800  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6801 caaatggatgtcaagagtgcatttcttaatg 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 215
Target Start/End: Original strand, 117064 - 117269
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  117064 acattattagaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccaaaaacaaagccagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 117163  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  117164 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatgacataatattatat 117263  T
Q  210 caaatg 215  Q
    ||||||    
T  117264 caaatg 117269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 215
Target Start/End: Original strand, 108563 - 108768
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  108563 acattattagaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaaccaaaaacaaagccagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 108662  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  108663 agaaggcattgattacactgaaacatttgctcaagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatgacataatattatat 108762  T
Q  210 caaatg 215  Q
    ||||||    
T  108763 caaatg 108768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26526 - 26308
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26526 acattattggaacaaa-tgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacaaacccagacttgttgcacaaggctacagtcaaca 26428  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26427 agaaggcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatagcataatattatat 26328  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgc 229  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  26327 caaatggatgtcaagagtgc 26308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 10282 - 10512
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  10282 acattattggataaaaataggtattcagaaacaagttaaatgaacaaggtgaagtaaccagaaacaaagctagagttgttgcacaaggttacactcaaca 10381  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10382 agaaggcattgactacactgaaacatttgctcctgttgcaagattggaagcaatcaagttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 10481  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10482 caaatggatgtcaagagtgcatttcttaatg 10512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 5434 - 5664
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  5434 acattattggaataaaatgggtattcagaaacaaattgaatgaacaaggtgaagtaatcagaaacaaagctagatttgttgcacaaggttacagtcaaca 5533  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  5534 agaaggcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttatatcctctgcagttaatcataacataatattatat 5633  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5634 caaatggatgtcaagagtgcatttcttaatg 5664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4220 - 3990
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  4220 acattattggaagaaaatgggtattcataaacaagttgagtgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacaatcaaca 4121  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  4120 agaagacaatgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtagttaatcatggcataatattatat 4021  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4020 caaatggatgtcaagagtgcatttcttaatg 3990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 6536 - 6766
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |    
T  6536 acattatttgaacaaaatgagtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgcacaaagttacagtcaata 6635  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6636 agtatgcattgactacactaaaacatttgctccagttgtaagattgcaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 6735  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6736 caaatggatgtcaaaagtgcatttctcaatg 6766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11377 - 11206
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  11377 acattattggaagaaaatgggtattcataaacaagttgagtgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacaatcaaca 11278  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatccta 181  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11277 agaagacaatgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatccta 11206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0863 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0863
Description:

Target: scaffold0863; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Original strand, 2215 - 2440
Alignment:
Q  15 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  2215 attggaacaaaatttgtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtagtcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaacaagaag 2314  T
Q  115 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 214  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2315 gcattgactacactgaaatatttgctccaattgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtagttaatcatggcataatattatatgaaat 2414  T
Q  215 ggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2415 ggatgtcaagagtgcatttcttaatg 2440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10967 - 10738
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  | |||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  10967 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtagtctgaaacaaagcaagacttgttgcacaaggttatagtcaaca 10868  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  10867 agaaggcattgattatactgaaacatttgctccagttacatgattggaagcaatcagattacttctatcctatgctgtaaatcatggcataatattatat 10768  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaat 239  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10767 caaatggatgtcaagagtgcatttcttaat 10738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 47916 - 48151
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  47916 acattattggaacaaaatggatattcagaaacaagctgaatgagcaaggtgaagtaaccagaaacaaagccagacttattgcacaaggatacagtcaaca 48015  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||    
T  48016 agagggcattgactaccctgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgttgtcaatcatgacataatattatat 48115  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||    
T  48116 caaatggatgtgaagagtgcatttcttaatggtgtc 48151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0594 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0594
Description:

Target: scaffold0594; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 1016 - 1246
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  1016 acattattggatcaaaatgggtattcagaaacaagttaaatgaacaaggtgaattagtcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacaatcaaca 1115  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1116 agaaggcattaattacactgaaacatttgctctagttgcaagattgaaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatggcataatattatat 1215  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  1216 caaatggatgtcaagagtgaatttcttaatg 1246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 1070 - 1305
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  1070 acattattggaacaaaattggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacaaagccagacttgttgcacaaggttatagtcaaca 1169  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1170 agaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcaagattagaagcaatcaagttatttctgtcctatgcagttaatcatggtataatattatat 1269  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
     ||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  1270 taaatggatgtctagagtgcatttcttaatggtgtc 1305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 7939 - 8168
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| | |||||||||  | |||||||||    
T  7939 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaatcataaacaaagctagacatattgcacaaggttgcagtcaaca 8038  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8039 agaaggcattgactacactgaa-catttactcaagttgcatgattggaagcaatcaggttacttttatcctttgcagttaatcatggcataatattatat 8137  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8138 caaatggatgtcaatagtgcttttctaaatg 8168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45491 - 45261
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||   ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||    
T  45491 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtagtgagaaacaaagctatacttgttgcacaaggttacaatcaaca 45392  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||    
T  45391 agaaggcattgactacagtaaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgtaggtaatcataacataatattatat 45292  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45291 caaatggatgtcaagagtgcatttcttaatg 45261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43482 - 43258
Alignment:
Q  15 attggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaag 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||    
T  43482 attggaacaaaatgggtatttagaaacaagttgaatgaacaacgtgaagtagtcagaaagaaagctagacttgttgcacaaggttacagttaacaagaag 43383  T
Q  115 gcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaat 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43382 gcattgactacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatacagttaatcatggcataatattatatcaaat 43283  T
Q  215 ggatgtcaaaagtgcttttcttaat 239  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||||    
T  43282 gaatgtcaagagtgcattttttaat 43258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4513 - 4278
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4513 acattattggaacaaaatgggtgttcagaaacaagttgagtgaacaaggtgaagtaatcagagacaaatctagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 4414  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  4413 agaagacattgattacactgaaagatttgctccaattgcaagatttgaagcaatcaggttacttctatcctatgtagttaatcatggcattatattatat 4314  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  4313 gaaatggatgtcaagagtgcatttcttaatggtgtc 4278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 74392 - 74162
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  74392 acattattggaacgaaatgggtattcagaaacaagcttaatgaacaaggagaagtagtcagaaacatagctagacttgttgctgaaggatacagtcaaca 74293  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  74292 agaaggcattgattatactgaaacattttctccagttgcaagattggaagcaattaggttacttctatcctatgcagtaaatcatggcattatattatat 74193  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  74192 caaacggatgtaaagagtgcatttctcaatg 74162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 86433 - 86352
Alignment:
Q  159 gcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  86433 gcaattaggttacttctatcctatgcagtaaatcatggcattatattatatcaaacggatgtaaagagtgcatttctcaatg 86352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1578 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1578
Description:

Target: scaffold1578; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1315 - 1120
Alignment:
Q  47 gaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagtt 146  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1315 gaatgaacaaggtgaagtaatcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttatagtcaacaagaaggcattgattacacttaaacatttgctccagtt 1216  T
Q  147 gcatgattggaagcaatcagg--ttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1215 gcaagattggaagcaatcaggttttacttctatcctatgcagttaatcataacataatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttctaaatg 1120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4504 - 4280
Alignment:
Q  16 ttggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacaggaagg 115  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| || |    |||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  4504 ttggaacaaaatgagtatttagaaacaagctgaatgacaaaggtgaagctgtcagaaacaaaactagacttgttgctcaaggttacagtcaacaagaagg 4405  T
Q  116 cattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatg 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4404 cattgattatactgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaataaatcatggcattatattatatcaaatg 4305  T
Q  216 gatgtcaaaagtgcttttcttaatg 240  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  4304 gatgtaaatagtgcatttctcaatg 4280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10919 - 10706
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||   ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  10919 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtagttagaaacaaaactagatttgttgcacaaggttacaatcaaca 10820  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
      || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10819 aaaatgcattgattatactgaaaaatttgctctagttgcaagattgaaagcaatcaggttacttctatcctatgcagttaatcatagcataatattatat 10720  T
Q  210 caaatggatgtcaa 223  Q
    ||||||||||||||    
T  10719 caaatggatgtcaa 10706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22910 - 22742
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22910 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaactagaaacatagccagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 22811  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatc 178  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22810 agaaggcattgattacactgaaacatttgctctagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatc 22742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 245
Target Start/End: Original strand, 129487 - 129646
Alignment:
Q  86 tgttgcacaagaatacagtcaacaggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgca 185  Q
    |||||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  129487 tgttgcacaaggttatagtcaacaagaaggcattgactacaccgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaggttacttctatcctataca 129586  T
Q  186 attaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  129587 gttaatcatggcataatattatatcaaattgatgtcaagagtgcatttcttaatggtgtc 129646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3351 - 3204
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3351 acattattggaacaaagagggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaatcagaaacaaagctagacttgttgcacaaggttacagtcaaca 3252  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattgga 157  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3251 agaagacattgactacactgaaacatttgctccagttgcaagattgga 3204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 33955 - 34177
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||   |||||||||| | ||||||||||| ||||  || ||||| |     
T  33955 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgtacaagaagttgt---cagaaacaaaaccagacttgttgctcaaggttatagtcatct 34051  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||    
T  34052 agaaggcactgattatacataaacatttgttccagttgcacgattggaagaaatcaagttacttctatcctatgcactaaatcatgacattatatcatat 34151  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttct 235  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||||    
T  34152 caaatggctgttaagagtgcatttct 34177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 235
Target Start/End: Original strand, 39262 - 39484
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||   |||||||||| | ||||||||||| ||||  || ||||| |     
T  39262 acattattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgtacaagaagttgt---cagaaacaaaaccagacttgttgctcaaggttatagtcatct 39358  T
Q  110 ggaaggcattgattacactgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatat 209  Q
     ||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||    
T  39359 agaaggcactgattatacataaacatttgttccagttgcacgattggaagaaatcaagttacttctatcctatgcactaaatcatgacattatatcatat 39458  T
Q  210 caaatggatgtcaaaagtgcttttct 235  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||||    
T  39459 caaatggctgttaagagtgcatttct 39484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 128 - 240
Target Start/End: Original strand, 21228 - 21340
Alignment:
Q  128 tgaaacatttgctccagttgcatgattggaagcaatcaggttacttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaaaagt 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21228 tgaaacatttgctccagttgcaagattggaagcaatcaagttacttctatcatatgcagtaaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaatagt 21327  T
Q  228 gcttttcttaatg 240  Q
    || ||||| ||||    
T  21328 gcatttctaaatg 21340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Original strand, 14611 - 14725
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||   | ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| ||||    
T  14611 acattattggaacaaaatgggtatttagaaataagctgaatgaacaaggtaaagtagtaaaaaacaaagcaagacttgttgcccaaggttacagttaaca 14710  T
Q  110 ggaaggcattgatta 124  Q
     ||||||||||||||    
T  14711 tgaaggcattgatta 14725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Original strand, 19284 - 19398
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaaca 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||   | ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| ||||    
T  19284 acattattggaacaaaatgggtatttagaaataagctgaatgaacaaggtaaagtagtaaaaaacaaagcaagacttgttgcccaaggttacagttaaca 19383  T
Q  110 ggaaggcattgatta 124  Q
     ||||||||||||||    
T  19384 tgaaggcattgatta 19398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Original strand, 5589 - 5789
Alignment:
Q  38 aaacaagct-gaatgaacaagga-gaggtaaccagaaac--aaagctagacttgttgcacaagaata-cagt-caacaggaaggcattga-ttacact-g 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  5589 aaacaagctagaatgaacaaggaagaagtaaccagaaactaaaagctagacttgttgcacaaggttaacagttcaacaagaaggcattgaattacactag 5688  T
Q  130 aaacatttg-ctccag--ttgcatgattggaagcaatcaggttacttct-atccta-tgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaaa 224  Q
    ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5689 aaacatttgtctctaagtttgcaagattggaagcaatcaggttacttcttatcctaatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaaa 5788  T
Q  225 a 225  Q
    |    
T  5789 a 5789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 245
Target Start/End: Original strand, 160521 - 160596
Alignment:
Q  170 acttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatgtcaaaagtgcttttcttaatgatgtc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  160521 acttctatcctatgcaattaatcatggcataatattatatcaaatggatgtaaaaagtgcatttcttaatggtgtc 160596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 100075 - 99944
Alignment:
Q  11 catcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacag 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||| | || | |||||||||||||||| | || || ||||  |||| ||||||     
T  100075 catcattggaacaagatgggtatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagttatcagaaacaaagctagattggtagctcaagggtacaatcaacaa 99976  T
Q  111 gaaggcattgattacactgaaacatttgctcc 142  Q
    ||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  99975 gaaggtattgattacgatgaaacctttgctcc 99944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Original strand, 6895 - 7026
Alignment:
Q  11 catcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagctagacttgttgcacaagaatacagtcaacag 110  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||| || || |||||| ||||| | || | |||||||||||||||| | || || ||||  |||| ||||||     
T  6895 catcattggaacaagatggatatttagaaataaactaaatgaagaaggaaaagttatcagaaacaaagctagattggtagctcaagggtacaatcaacaa 6994  T
Q  111 gaaggcattgattacactgaaacatttgctcc 142  Q
    ||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  6995 gaaggtattgattacgatgaaacctttgctcc 7026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 68
Target Start/End: Original strand, 30170 - 30228
Alignment:
Q  10 acatcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaacc 68  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  30170 acattattggaaccaaatgggtattcagaaacaagttgaatgaacaaggtgaagtaacc 30228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Original strand, 30529 - 30597
Alignment:
Q  11 catcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagc 79  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||   ||||||||||||    
T  30529 catcattggaacaagatgggttttcagaaacaagcttgatgaagaaggaaaggttgtcagaaacaaagc 30597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 84283 - 84215
Alignment:
Q  11 catcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagc 79  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||   ||||||||||||    
T  84283 catcattggaacaagatgggttttcagaaacaagcttgatgaagaaggaaaggttgtcagaaacaaagc 84215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0764 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0764
Description:

Target: scaffold0764; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 6574 - 6506
Alignment:
Q  11 catcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagc 79  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  ||||   ||||||||||||    
T  6574 catcattggaacaagatgggttttcagaaacaagcttgatgaagaaggtaaggttgtcagaaacaaagc 6506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Original strand, 46 - 114
Alignment:
Q  11 catcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagc 79  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  ||||   ||||||||||||    
T  46 catcattggaacaagatgggttttcagaaacaagcttgatgaagaaggtaaggttgtcagaaacaaagc 114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Original strand, 14203 - 14271
Alignment:
Q  11 catcattggaacaaaatgggtattcagaaacaagctgaatgaacaaggagaggtaaccagaaacaaagc 79  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  ||||   ||||||||||||    
T  14203 catcattggaacaagatgggttttcagaaacaagcttgatgaagaaggtaaggttgtcagaaacaaagc 14271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University