View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8890_low_99 (Length: 230)

Name: NF8890_low_99
Description: NF8890
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8890_low_99
NF8890_low_99
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (1-228)||(7072950-7073177)
chr3 (1-230)||(4796946-4797175)
chr3 (1-230)||(4721367-4721596)
chr3 (1-230)||(35880502-35880731)
chr3 (1-227)||(6192055-6192281)
chr3 (1-230)||(18050998-18051227)
chr3 (1-228)||(7996300-7996527)
chr3 (1-228)||(10642808-10643035)
chr3 (10-228)||(28116259-28116477)
chr3 (1-228)||(21674431-21674658)
chr3 (1-230)||(29149048-29149277)
chr3 (1-228)||(17985249-17985476)
chr3 (1-228)||(47023191-47023418)
chr3 (10-228)||(11110663-11110881)
chr3 (10-228)||(20577164-20577382)
chr3 (1-228)||(24327897-24328124)
chr3 (10-228)||(6542776-6542994)
chr3 (1-230)||(18330410-18330634)
chr3 (1-228)||(28339040-28339267)
chr3 (1-228)||(31964766-31964993)
chr3 (1-228)||(50134364-50134591)
chr3 (1-228)||(5013450-5013677)
chr3 (1-228)||(5609615-5609842)
chr3 (10-228)||(4416654-4416872)
chr3 (10-228)||(29665287-29665505)
chr3 (10-228)||(36997391-36997609)
chr3 (10-228)||(51781749-51781967)
chr3 (10-228)||(51796838-51797056)
chr3 (11-228)||(22871177-22871394)
chr3 (11-228)||(22886236-22886453)
chr3 (5-228)||(18224929-18225152)
chr3 (10-225)||(48465656-48465871)
chr3 (60-230)||(15741434-15741604)
chr3 (10-228)||(18242465-18242683)
chr3 (13-230)||(8295711-8295928)
chr3 (1-228)||(10395874-10396098)
chr3 (5-230)||(15893003-15893228)
chr3 (83-228)||(20065784-20065929)
chr3 (1-228)||(18277345-18277572)
chr3 (1-228)||(18292646-18292873)
chr3 (1-228)||(18307947-18308174)
chr3 (13-227)||(8301569-8301783)
chr3 (83-228)||(8211479-8211624)
chr3 (86-228)||(5466723-5466865)
chr3 (86-228)||(4347062-4347204)
chr3 (86-228)||(5596744-5596886)
chr3 (86-228)||(28021016-28021158)
chr3 (1-180)||(5713013-5713192)
chr3 (1-180)||(5723923-5724102)
chr3 (1-180)||(5757375-5757554)
chr3 (1-180)||(5768266-5768445)
chr3 (83-202)||(4892977-4893096)
chr3 (80-230)||(16626875-16627025)
chr3 (60-206)||(18530157-18530303)
chr3 (83-202)||(22387950-22388069)
chr3 (83-202)||(32438921-32439040)
chr3 (1-39)||(15741387-15741425)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (1-228)||(34279222-34279449)
chr2 (1-228)||(13936785-13937012)
chr2 (1-230)||(34286125-34286354)
chr2 (1-230)||(34291185-34291414)
chr2 (1-230)||(28881985-28882214)
chr2 (1-228)||(21677423-21677650)
chr2 (1-230)||(23128807-23129036)
chr2 (1-228)||(12716846-12717073)
chr2 (1-228)||(32049571-32049798)
chr2 (10-228)||(11635439-11635657)
chr2 (10-228)||(11641628-11641846)
chr2 (10-228)||(39889835-39890053)
chr2 (1-228)||(37925266-37925493)
chr2 (1-228)||(16829579-16829806)
chr2 (1-228)||(16891675-16891902)
chr2 (1-228)||(31876054-31876281)
chr2 (1-228)||(34861453-34861680)
chr2 (1-228)||(37686150-37686377)
chr2 (1-228)||(37701415-37701642)
chr2 (10-228)||(261015-261233)
chr2 (10-228)||(12586574-12586792)
chr2 (10-228)||(27803465-27803683)
chr2 (10-228)||(40233272-40233490)
chr2 (1-228)||(19416740-19416967)
chr2 (1-228)||(22926269-22926496)
chr2 (10-228)||(27776980-27777198)
chr2 (10-228)||(27816747-27816965)
chr2 (1-230)||(12655313-12655542)
chr2 (10-228)||(9350244-9350462)
chr2 (1-230)||(20837689-20837918)
chr2 (1-230)||(27434685-27434914)
chr2 (11-225)||(39052079-39052293)
chr2 (83-228)||(37374934-37375079)
chr2 (60-230)||(19456718-19456888)
chr2 (80-230)||(21703481-21703631)
chr2 (83-180)||(31891648-31891745)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (1-230)||(26918152-26918381)
chr6 (1-230)||(26999845-27000074)
chr6 (1-230)||(16749626-16749855)
chr6 (1-230)||(26988773-26989002)
chr6 (1-230)||(15424512-15424741)
chr6 (1-228)||(29572787-29573014)
chr6 (1-228)||(30558211-30558438)
chr6 (10-228)||(27360214-27360432)
chr6 (10-228)||(27450557-27450775)
chr6 (10-228)||(34463565-34463783)
chr6 (1-230)||(13299146-13299375)
chr6 (1-230)||(24304813-24305042)
chr6 (1-230)||(24863489-24863718)
chr6 (10-228)||(3695837-3696055)
chr6 (10-228)||(4772771-4772989)
chr6 (10-228)||(27007486-27007704)
chr6 (11-228)||(4757535-4757752)
chr6 (1-228)||(16944222-16944449)
chr6 (10-225)||(4545988-4546203)
chr6 (10-225)||(4724347-4724562)
chr6 (10-225)||(17025039-17025254)
chr6 (10-225)||(28207219-28207434)
chr6 (10-228)||(27484891-27485109)
chr6 (10-225)||(16673904-16674119)
chr6 (10-228)||(26777831-26778049)
chr6 (10-228)||(26116623-26116841)
chr6 (13-230)||(22935084-22935301)
chr6 (13-230)||(23857529-23857746)
chr6 (83-228)||(27044164-27044309)
chr6 (83-228)||(29549252-29549397)
chr6 (86-228)||(29501180-29501322)
chr6 (86-228)||(4525063-4525205)
chr6 (10-206)||(22477477-22477673)
chr6 (80-210)||(20160496-20160626)
chr6 (80-210)||(22172205-22172335)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-230)||(382-611)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (1-230)||(5127768-5127997)
chr7 (1-228)||(45387121-45387348)
chr7 (1-228)||(16736598-16736825)
chr7 (1-228)||(16751652-16751879)
chr7 (1-228)||(17523310-17523537)
chr7 (1-228)||(17529678-17529905)
chr7 (1-230)||(2154349-2154578)
chr7 (1-230)||(11424914-11425143)
chr7 (1-228)||(24592679-24592906)
chr7 (1-228)||(26275232-26275459)
chr7 (10-228)||(11441338-11441556)
chr7 (10-228)||(31564546-31564764)
chr7 (1-228)||(9618429-9618656)
chr7 (1-228)||(26320007-26320234)
chr7 (10-230)||(31124687-31124907)
chr7 (1-228)||(26435035-26435262)
chr7 (10-228)||(3445072-3445290)
chr7 (1-228)||(26670052-26670279)
chr7 (10-228)||(26485891-26486109)
chr7 (11-225)||(26538021-26538235)
chr7 (13-230)||(10917015-10917232)
chr7 (5-228)||(5147482-5147705)
chr7 (1-230)||(16503518-16503747)
chr7 (1-230)||(16518554-16518783)
chr7 (1-228)||(4145261-4145488)
chr7 (80-230)||(16041102-16041252)
chr7 (80-230)||(16450212-16450362)
chr7 (83-202)||(5159326-5159445)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (1-228)||(15658909-15659136)
chr5 (1-228)||(41674495-41674722)
chr5 (1-230)||(33777271-33777500)
chr5 (1-228)||(9548692-9548919)
chr5 (1-230)||(23718137-23718366)
chr5 (1-230)||(23752599-23752828)
chr5 (1-230)||(22999263-22999492)
chr5 (1-228)||(8665624-8665851)
chr5 (1-230)||(11549138-11549367)
chr5 (14-228)||(24681223-24681437)
chr5 (14-228)||(24723750-24723964)
chr5 (1-230)||(24688306-24688535)
chr5 (1-228)||(5637696-5637923)
chr5 (1-228)||(9317237-9317464)
chr5 (1-228)||(26480178-26480405)
chr5 (10-228)||(18500906-18501124)
chr5 (1-228)||(12131941-12132168)
chr5 (1-228)||(18375561-18375788)
chr5 (1-228)||(29967215-29967442)
chr5 (1-228)||(30029201-30029428)
chr5 (1-228)||(30168255-30168482)
chr5 (1-228)||(33516142-33516369)
chr5 (10-228)||(13325002-13325220)
chr5 (10-228)||(31826577-31826795)
chr5 (10-228)||(37358813-37359031)
chr5 (1-228)||(15759006-15759233)
chr5 (10-228)||(6874088-6874306)
chr5 (10-228)||(28649012-28649230)
chr5 (10-228)||(31431214-31431432)
chr5 (10-228)||(37671650-37671868)
chr5 (1-228)||(30151804-30152031)
chr5 (10-228)||(3789312-3789530)
chr5 (10-228)||(37754754-37754972)
chr5 (11-228)||(43078035-43078252)
chr5 (1-225)||(2510840-2511064)
chr5 (10-228)||(37771157-37771375)
chr5 (13-230)||(30934420-30934637)
chr5 (11-228)||(40473711-40473928)
chr5 (10-228)||(28959956-28960174)
chr5 (86-228)||(32599703-32599845)
chr5 (86-228)||(34616307-34616449)
chr5 (14-168)||(24969870-24970024)
chr5 (60-230)||(23891990-23892160)
chr5 (80-230)||(25198816-25198966)
chr5 (173-230)||(24951894-24951951)
chr5 (83-202)||(33292340-33292459)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (1-228)||(6569645-6569872)
chr4 (13-230)||(24592575-24592792)
chr4 (1-228)||(21969493-21969720)
chr4 (1-228)||(27163569-27163796)
chr4 (10-228)||(30753534-30753752)
chr4 (1-228)||(14098333-14098560)
chr4 (1-230)||(17013790-17014019)
chr4 (11-228)||(18800884-18801101)
chr4 (1-228)||(31126770-31126997)
chr4 (10-228)||(5005662-5005880)
chr4 (1-228)||(40105890-40106117)
chr4 (10-228)||(33674071-33674289)
chr4 (1-230)||(14664808-14665037)
chr4 (10-225)||(39850418-39850633)
chr4 (1-228)||(14763556-14763783)
chr4 (83-228)||(54833182-54833327)
chr4 (80-228)||(19373053-19373201)
chr4 (83-228)||(36344846-36344991)
chr4 (80-230)||(1900050-1900200)
chr4 (60-227)||(15285236-15285403)
chr4 (80-230)||(15227663-15227813)
chr4 (83-202)||(24112483-24112602)
chr4 (83-202)||(34189291-34189410)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (1-230)||(16277329-16277558)
chr8 (1-230)||(27609116-27609345)
chr8 (10-228)||(19674215-19674433)
chr8 (1-230)||(2137470-2137699)
chr8 (10-228)||(19518363-19518581)
chr8 (1-228)||(19208571-19208798)
chr8 (1-228)||(33258500-33258727)
chr8 (10-228)||(3329739-3329957)
chr8 (1-230)||(19687873-19688102)
chr8 (1-228)||(28362166-28362393)
chr8 (10-228)||(29829090-29829308)
chr8 (13-230)||(14557402-14557619)
chr8 (1-228)||(31489961-31490188)
chr8 (1-225)||(12092944-12093168)
chr8 (17-225)||(18710366-18710574)
chr8 (1-228)||(31354301-31354528)
chr8 (5-230)||(16283224-16283449)
chr8 (83-228)||(19286242-19286387)
chr8 (83-180)||(44562929-44563026)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-230)||(27067-27296)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-230)||(30228-30457)
scaffold0124 (80-230)||(20187-20337)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (1-225)||(41793560-41793784)
chr1 (1-228)||(10962446-10962673)
chr1 (1-228)||(51637994-51638221)
chr1 (1-228)||(28584757-28584984)
chr1 (80-230)||(20460882-20461032)
chr1 (173-226)||(16208449-16208502)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-230)||(47237-47466)
scaffold0089 (1-230)||(40321-40550)
scaffold0089 (5-230)||(29538-29763)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-228)||(7491-7718)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-228)||(15182-15409)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-228)||(26454-26681)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-228)||(9318-9545)
scaffold0159 (1-213)||(19807-20019)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (10-225)||(7717-7932)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (10-228)||(5765-5986)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (17-220)||(1-204)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (86-228)||(8009-8151)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7073177 - 7072950
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7073177 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 7073078  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7073077 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 7072978  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7072977 attgactggctccagctgacaccatccc 7072950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 4796946 - 4797175
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4796946 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 4797045  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4797046 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 4797145  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4797146 attgaccggctccagctgacaccatcccta 4797175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4721596 - 4721367
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4721596 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 4721497  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4721496 tgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 4721397  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721396 attgaccggctccagctgacaccatcccta 4721367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35880731 - 35880502
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  35880731 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 35880632  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35880631 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 35880532  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880531 attgaccggctccagctgacaccatcccta 35880502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6192281 - 6192055
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6192281 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 6192182  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6192181 taatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 6192082  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcc 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6192081 attgaccggctccaactgacaccatcc 6192055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18051227 - 18050998
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18051227 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 18051128  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18051127 tgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 18051028  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051027 attgaccggctccagctgacaccatcccta 18050998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7996527 - 7996300
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7996527 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 7996428  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  7996427 tgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattg 7996328  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7996327 attgaccggctccagctgacaccatccc 7996300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10643035 - 10642808
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10643035 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 10642936  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  10642935 tgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattg 10642836  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10642835 attgaccggctccagctgacaccatccc 10642808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 28116259 - 28116477
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28116259 ttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataa 28116358  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28116359 aatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccgg 28116458  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28116459 ctccagctgacaccatccc 28116477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21674658 - 21674431
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  21674658 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgatgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtac 21674559  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  21674558 tgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagccacggtagccatgg 21674459  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  21674458 gttgaccggctccagctgacaccatccc 21674431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 29149048 - 29149277
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  29149048 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtac 29149147  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29149148 tgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaatagtagccatgg 29149247  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29149248 attgaccggctccagctgacaccatcccta 29149277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 17985249 - 17985476
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  17985249 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtac 17985348  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  17985349 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgg 17985448  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985449 attgaccggctccagctgacaccatccc 17985476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47023418 - 47023191
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  47023418 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtac 47023319  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  47023318 tgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattg 47023219  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47023218 attgaccggctccagctgacaccatccc 47023191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 11110663 - 11110881
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11110663 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataa 11110762  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11110763 aacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccgg 11110862  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11110863 ctccagctgacaccatccc 11110881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 20577164 - 20577382
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20577164 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaa 20577263  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20577264 aacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccgg 20577363  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20577364 ctccagctgacaccatccc 20577382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24328124 - 24327897
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  24328124 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 24328025  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24328024 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 24327925  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24327924 attgcccggctccagctgacaccatccc 24327897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 6542776 - 6542994
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  6542776 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 6542875  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  6542876 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccgg 6542975  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6542976 ctccagctgacaccatccc 6542994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18330634 - 18330410
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||       
T  18330634 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg--- 18330538  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
      ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18330537 --atgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 18330440  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330439 attgaccggctccagctgacaccatcccta 18330410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28339267 - 28339040
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  28339267 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 28339168  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  28339167 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatgg 28339068  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28339067 attgaccggctcccgctgacaccatccc 28339040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 31964766 - 31964993
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  31964766 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 31964865  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  31964866 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatgg 31964965  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31964966 attgaccggctcccgctgacaccatccc 31964993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 50134364 - 50134591
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  50134364 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 50134463  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  50134464 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatgg 50134563  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50134564 attgaccggctcccgctgacaccatccc 50134591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5013677 - 5013450
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  5013677 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 5013578  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  5013577 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattg 5013478  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5013477 attgaccggctccagctgataccatccc 5013450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 5609615 - 5609842
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  5609615 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 5609714  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  5609715 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgtcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatgg 5609814  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5609815 attgaccggctcccgctgacaccatccc 5609842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4416872 - 4416654
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  4416872 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtgctgatgataa 4416773  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  4416772 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccgg 4416673  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4416672 ctccagctgacaccatccc 4416654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 29665287 - 29665505
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  29665287 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataa 29665386  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  29665387 aacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccgg 29665486  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29665487 ctccagctgacaccatccc 29665505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 36997391 - 36997609
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| |||    
T  36997391 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataa 36997490  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  36997491 aacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccgg 36997590  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36997591 ctccagctgacaccatccc 36997609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 51781967 - 51781749
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51781967 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaa 51781868  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  51781867 aacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccgg 51781768  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  51781767 ctccagctgacaccatccc 51781749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 51797056 - 51796838
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51797056 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaa 51796957  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  51796956 aacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccgg 51796857  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  51796856 ctccagctgacaccatccc 51796838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 22871177 - 22871394
Alignment:
Q  11 tgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||    
T  22871177 tgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaa 22871276  T
Q  111 atggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggc 210  Q
    | || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22871277 acggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggc 22871376  T
Q  211 tccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22871377 tccagctgacaccatccc 22871394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 22886236 - 22886453
Alignment:
Q  11 tgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||    
T  22886236 tgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaa 22886335  T
Q  111 atggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggc 210  Q
    | || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22886336 acggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggc 22886435  T
Q  211 tccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22886436 tccagctgacaccatccc 22886453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18225152 - 18224929
Alignment:
Q  5 tgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  18225152 tgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgat 18225053  T
Q  105 ggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattg 204  Q
    | ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18225052 gataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattg 18224953  T
Q  205 accggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  18224952 accggctccagctgataccatccc 18224929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48465871 - 48465656
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  48465871 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcggggggtactgatggtaa 48465772  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  48465771 aacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccgg 48465672  T
Q  210 ctccagctgacaccat 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  48465671 ctccagctgacaccat 48465656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Original strand, 15741434 - 15741604
Alignment:
Q  60 cattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacgg 159  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741434 cattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgg 15741533  T
Q  160 aggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741534 aggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatcccta 15741604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18242683 - 18242465
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||| |||    
T  18242683 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgctgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagagtactgatgataa 18242584  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18242583 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccgg 18242484  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  18242483 ctccggctgacaccatccc 18242465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8295928 - 8295711
Alignment:
Q  13 ttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaat 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| || | | |||| || || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8295928 ttgttgttgttgaattggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaat 8295829  T
Q  113 ggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctc 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8295828 ggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctc 8295729  T
Q  213 cagctgacaccatcccta 230  Q
    | || |||||||||||||    
T  8295728 cggcagacaccatcccta 8295711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10396098 - 10395874
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| || |   ||||||| || || || || || |||||||||| |||||||    
T  10396098 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgt---acctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 10396002  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10396001 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatgg 10395902  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10395901 attgaccggctccagctgacaccatccc 10395874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 15893003 - 15893228
Alignment:
Q  5 tgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgat 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  15893003 tgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgat 15893102  T
Q  105 ggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattg 204  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15893103 gatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattg 15893202  T
Q  205 accggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||| || |||||||||||||    
T  15893203 accggctccggcagacaccatcccta 15893228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20065929 - 20065784
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 182  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20065929 cccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgatag 20065830  T
Q  183 gagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20065829 gagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 20065784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18277345 - 18277572
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| || |   ||||||| || || || || || |||||||||| |||||||    
T  18277345 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 18277444  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18277445 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattg 18277544  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18277545 attgaccggctccagctgacaccatccc 18277572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18292646 - 18292873
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| || |   ||||||| || || || || || |||||||||| |||||||    
T  18292646 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 18292745  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18292746 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattg 18292845  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18292846 attgaccggctccagctgacaccatccc 18292873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18307947 - 18308174
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| || |   ||||||| || || || || || |||||||||| |||||||    
T  18307947 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 18308046  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18308047 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattg 18308146  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18308147 attgaccggctccagctgacaccatccc 18308174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Original strand, 8301569 - 8301783
Alignment:
Q  13 ttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaat 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  8301569 ttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaat 8301668  T
Q  113 ggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctc 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8301669 ggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgagtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacaatagccatggattgaccggctc 8301768  T
Q  213 cagctgacaccatcc 227  Q
    | || ||||||||||    
T  8301769 cggcagacaccatcc 8301783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8211624 - 8211479
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 182  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211624 cccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 8211525  T
Q  183 gagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211524 gagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 8211479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5466865 - 5466723
Alignment:
Q  86 ggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggag 185  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5466865 ggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtg 5466766  T
Q  186 caacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5466765 caacagtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccc 5466723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Original strand, 4347062 - 4347204
Alignment:
Q  86 ggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggag 185  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4347062 ggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatacatgggtatgacggaggcatttgggctgcgttgataggag 4347161  T
Q  186 caacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4347162 caacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 4347204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Original strand, 5596744 - 5596886
Alignment:
Q  86 ggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggag 185  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5596744 ggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggag 5596843  T
Q  186 caacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5596844 caacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 5596886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28021158 - 28021016
Alignment:
Q  86 ggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggag 185  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28021158 ggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggag 28021059  T
Q  186 caacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28021058 caacagtagccatggattgcccggctccagctgacaccatccc 28021016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5713192 - 5713013
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5713192 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 5713093  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 180  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  || |||| | ||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  5713092 tgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 5713013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5724102 - 5723923
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5724102 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 5724003  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 180  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  || |||| | ||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  5724002 tgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 5723923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 5757375 - 5757554
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5757375 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 5757474  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 180  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  || |||| | ||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  5757475 tgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 5757554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 5768266 - 5768445
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5768266 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 5768365  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 180  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  || |||| | ||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  5768366 tgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgat 5768445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4893096 - 4892977
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 182  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||    
T  4893096 cccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgatag 4892997  T
Q  183 gagcaacagtggccatggat 202  Q
    |||||||||| ||| |||||    
T  4892996 gagcaacagtagccttggat 4892977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Original strand, 16626875 - 16627025
Alignment:
Q  80 tgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattga 179  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||  |  |||| ||||| |||||||| |  || || ||||| |    
T  16626875 tgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaa 16626974  T
Q  180 taggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16626975 taggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatcccta 16627025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18530303 - 18530157
Alignment:
Q  60 cattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacgg 159  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||  || |||| ||||| || ||    
T  18530303 cattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatgg 18530204  T
Q  160 aggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgac 206  Q
    ||| |  || || ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  18530203 aggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgac 18530157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 202
Target Start/End: Original strand, 22387950 - 22388069
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 182  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||| ||||| || ||  |||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||    
T  22387950 cccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgatag 22388049  T
Q  183 gagcaacagtggccatggat 202  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  22388050 gagcaacagtagccatggat 22388069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32439040 - 32438921
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 182  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||    
T  32439040 cccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacag 32438941  T
Q  183 gagcaacagtggccatggat 202  Q
    |||||||||| ||| |||||    
T  32438940 gagcaacagtagccttggat 32438921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 15741387 - 15741425
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15741387 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg 15741425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34279449 - 34279222
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34279449 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 34279350  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34279349 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 34279250  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34279249 attgaccggctcccgctgacaccatccc 34279222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 13936785 - 13937012
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13936785 ttgctgactttgctgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 13936884  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13936885 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 13936984  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13936985 attgaccggctccagctgacaccatccc 13937012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34286354 - 34286125
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  34286354 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtac 34286255  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34286254 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatgg 34286155  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34286154 attgaccggctccacctgacaccatcccta 34286125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34291414 - 34291185
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  34291414 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtac 34291315  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291314 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatgg 34291215  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34291214 attgaccggctccacctgacaccatcccta 34291185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28882214 - 28881985
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28882214 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 28882115  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28882114 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 28882015  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882014 attgaccggctccagctgacaccatcccta 28881985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21677423 - 21677650
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21677423 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 21677522  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21677523 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 21677622  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21677623 attgaccggctccagctgataccatccc 21677650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 23128807 - 23129036
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23128807 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 23128906  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23128907 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 23129006  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23129007 attgaccggctccagctgacaccatcccta 23129036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 12716846 - 12717073
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  12716846 ttgctgctgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtac 12716945  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12716946 tgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatgg 12717045  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717046 attgaccggctccagctgacaccatccc 12717073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32049798 - 32049571
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  32049798 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 32049699  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  32049698 tgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattg 32049599  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32049598 attgaccggctccagctgacaccatccc 32049571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 11635439 - 11635657
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11635439 ttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataa 11635538  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11635539 aatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccgg 11635638  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  11635639 ctcctgctgacaccatccc 11635657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 11641628 - 11641846
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11641628 ttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataa 11641727  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11641728 aatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccgg 11641827  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  11641828 ctcctgctgacaccatccc 11641846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39890053 - 39889835
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||| |||    
T  39890053 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataa 39889954  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39889953 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 39889854  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39889853 ctccagctgacaccatccc 39889835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37925493 - 37925266
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  37925493 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtac 37925394  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  37925393 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 37925294  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37925293 attgaccggctccagctgacaccatccc 37925266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16829579 - 16829806
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  16829579 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtac 16829678  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16829679 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagccatgg 16829778  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16829779 attgaccggctccagctgacaccatccc 16829806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16891902 - 16891675
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  16891902 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtac 16891803  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16891802 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagccatgg 16891703  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16891702 attgaccggctccagctgacaccatccc 16891675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31876281 - 31876054
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  31876281 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 31876182  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  31876181 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 31876082  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31876081 attgaccggctccagctgacaccatccc 31876054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34861680 - 34861453
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  34861680 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 34861581  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  34861580 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 34861481  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34861480 attgaccggctccagctgacaccatccc 34861453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 37686150 - 37686377
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  37686150 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 37686249  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  37686250 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 37686349  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37686350 attgaccggctccagctgacaccatccc 37686377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 37701415 - 37701642
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  37701415 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 37701514  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  37701515 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 37701614  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37701615 attgaccggctccagctgacaccatccc 37701642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 261015 - 261233
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  261015 ttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataa 261114  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  261115 aacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccgg 261214  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  261215 ctccagctgacaccatccc 261233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12586792 - 12586574
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12586792 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaa 12586693  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12586692 aacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatggatatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccgg 12586593  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12586592 ctccagctgacaccatccc 12586574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27803683 - 27803465
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27803683 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaa 27803584  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  27803583 aacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccgg 27803484  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27803483 ctccagctgacaccatccc 27803465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40233490 - 40233272
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40233490 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaa 40233391  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  40233390 aacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccgg 40233291  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40233290 ctccagctgacaccatccc 40233272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 19416740 - 19416967
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  19416740 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 19416839  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19416840 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtagccattg 19416939  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19416940 attgcccggctccagctgacaccatccc 19416967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22926269 - 22926496
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  22926269 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 22926368  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  22926369 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatgg 22926468  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22926469 attgaccggctcccgctgacaccatccc 22926496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27777198 - 27776980
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27777198 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaa 27777099  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  27777098 aacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccgg 27776999  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27776998 ctccagctgacaccatccc 27776980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27816965 - 27816747
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27816965 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaa 27816866  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  27816865 aacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccgg 27816766  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27816765 ctccagctgacaccatccc 27816747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12655542 - 12655313
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  12655542 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtac 12655443  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12655442 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 12655343  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  12655342 attgaccggctccgactgacaccattccta 12655313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 9350244 - 9350462
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9350244 ttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtagcagggggtactgatggtaa 9350343  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  9350344 aacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccgg 9350443  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9350444 ctccagctgacaccatccc 9350462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20837918 - 20837689
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  20837918 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtac 20837819  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20837818 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggatgcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 20837719  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  20837718 attgaccggctccgactgacaccattccta 20837689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27434685 - 27434914
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  27434685 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtac 27434784  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27434785 tgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatgg 27434884  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27434885 attgaccggctccggcagacaccatcccta 27434914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 39052079 - 39052293
Alignment:
Q  11 tgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39052079 tgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaa 39052178  T
Q  111 atggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggc 210  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || || |||||||||||    
T  39052179 acggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattggtaggagcaacggttgctattgattgaccggc 39052278  T
Q  211 tccagctgacaccat 225  Q
    |||||||||||||||    
T  39052279 tccagctgacaccat 39052293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37375079 - 37374934
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 182  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37375079 cccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcgttgatag 37374980  T
Q  183 gagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37374979 gagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 37374934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Original strand, 19456718 - 19456888
Alignment:
Q  60 cattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacgg 159  Q
    |||| |||||||| || || ||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | ||  || |||||||||| |||||    
T  19456718 cattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcatatgggtacgacgg 19456817  T
Q  160 aggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||| |  || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  19456818 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatcccta 19456888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Original strand, 21703481 - 21703631
Alignment:
Q  80 tgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattga 179  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||| |  |  || ||||| |    
T  21703481 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactaggcagcattaa 21703580  T
Q  180 taggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  21703581 taggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatcccta 21703631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 180
Target Start/End: Original strand, 31891648 - 31891745
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 180  Q
    |||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  31891648 cccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 31891745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26918381 - 26918152
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26918381 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcgtctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 26918282  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26918281 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 26918182  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918181 attgaccggctccagctgacaccatcccta 26918152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27000074 - 26999845
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27000074 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 26999975  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26999974 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 26999875  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26999874 attgaccggctccagctgacaccatcccta 26999845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16749855 - 16749626
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16749855 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 16749756  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16749755 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatgg 16749656  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16749655 attgaccggctccagctgacaccatcccta 16749626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26989002 - 26988773
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26989002 ttgctgattttgttgatgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 26988903  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26988902 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 26988803  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26988802 attgaccggctccagctgacaccatcccta 26988773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 15424512 - 15424741
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15424512 ttgctgattttgttgttgttgttcaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 15424611  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15424612 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 15424711  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424712 attgaccggctccagctgacaccatcccta 15424741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29573014 - 29572787
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  29573014 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 29572915  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  29572914 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 29572815  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29572814 attgaccggctccagctgacaccatccc 29572787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 30558211 - 30558438
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  30558211 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtac 30558310  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  30558311 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgg 30558410  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30558411 attgaccggctccagctgacaccatccc 30558438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 27360214 - 27360432
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  27360214 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 27360313  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  27360314 aacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccgg 27360413  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27360414 ctccagctgacaccatccc 27360432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 27450557 - 27450775
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  27450557 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 27450656  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  27450657 aacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccgg 27450756  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27450757 ctccagctgacaccatccc 27450775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 34463565 - 34463783
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34463565 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaa 34463664  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  34463665 aacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccgg 34463764  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34463765 ctccagctgacaccatccc 34463783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 13299146 - 13299375
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13299146 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 13299245  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13299246 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 13299345  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  13299346 attgaccagctccggcagacaccatcccta 13299375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24304813 - 24305042
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24304813 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggaaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 24304912  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24304913 tgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatgg 24305012  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24305013 attgaccggctccagctgacaccatcccta 24305042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24863718 - 24863489
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||    
T  24863718 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtac 24863619  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24863618 tgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 24863519  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24863518 attgaccggctccggctgacaccatcccta 24863489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3696055 - 3695837
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  3696055 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataa 3695956  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  3695955 aacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccgg 3695856  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3695855 ctccagctgacaccatccc 3695837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4772989 - 4772771
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  4772989 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 4772890  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  4772889 aacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccgg 4772790  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  4772789 ctccggctgacaccatccc 4772771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27007704 - 27007486
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  27007704 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 27007605  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27007604 aacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatataggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccgg 27007505  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27007504 ctccagctgacaccatccc 27007486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4757752 - 4757535
Alignment:
Q  11 tgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4757752 tgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaa 4757653  T
Q  111 atggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggc 210  Q
    | || || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  4757652 acggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacagtagccattgattgaccggc 4757553  T
Q  211 tccagctgacaccatccc 228  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  4757552 tccggctgacaccatccc 4757535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16944222 - 16944449
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  16944222 ttgctgattttgttgttgctgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 16944321  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16944322 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 16944421  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16944422 attgcccggctccagctgacaccatccc 16944449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 4545988 - 4546203
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  4545988 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 4546087  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  4546088 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccgg 4546187  T
Q  210 ctccagctgacaccat 225  Q
    || |||||||||||||    
T  4546188 ctgcagctgacaccat 4546203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 4724347 - 4724562
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  4724347 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 4724446  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  4724447 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccgg 4724546  T
Q  210 ctccagctgacaccat 225  Q
    || |||||||||||||    
T  4724547 ctgcagctgacaccat 4724562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17025254 - 17025039
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  17025254 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 17025155  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  17025154 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatagcttgaccgg 17025055  T
Q  210 ctccagctgacaccat 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  17025054 ctccagctgacaccat 17025039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28207434 - 28207219
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  28207434 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 28207335  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  28207334 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccgg 28207235  T
Q  210 ctccagctgacaccat 225  Q
    || |||||||||||||    
T  28207234 ctgcagctgacaccat 28207219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27485109 - 27484891
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||    
T  27485109 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgctgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataa 27485010  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  27485009 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccgg 27484910  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27484909 ctccagctgacaccatccc 27484891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16674119 - 16673904
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16674119 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaa 16674020  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  16674019 aacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccgg 16673920  T
Q  210 ctccagctgacaccat 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  16673919 ctccagctgacaccat 16673904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 26777831 - 26778049
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  26777831 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 26777930  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26777931 aacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagccattgattgcccgg 26778030  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26778031 ctccagctgacaccatccc 26778049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 26116623 - 26116841
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  26116623 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttttatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 26116722  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  26116723 aacggtgggaagaacgaatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgataggagcaacggtagctatagattgaccgg 26116822  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26116823 ctccagctgacaccatccc 26116841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 22935084 - 22935301
Alignment:
Q  13 ttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| || || || |||||||||||||  || |||||||| || |||    
T  22935084 ttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaat 22935183  T
Q  113 ggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctc 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  22935184 ggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccc 22935283  T
Q  213 cagctgacaccatcccta 230  Q
    | ||||||||||||||||    
T  22935284 cggctgacaccatcccta 22935301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 23857529 - 23857746
Alignment:
Q  13 ttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| || || || |||||||||||||  || |||||||| || |||    
T  23857529 ttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaat 23857628  T
Q  113 ggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctc 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  23857629 ggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccc 23857728  T
Q  213 cagctgacaccatcccta 230  Q
    | ||||||||||||||||    
T  23857729 cggctgacaccatcccta 23857746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27044309 - 27044164
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 182  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27044309 cccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgatag 27044210  T
Q  183 gagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27044209 gagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 27044164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29549397 - 29549252
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 182  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29549397 cccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 29549298  T
Q  183 gagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29549297 gagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccc 29549252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29501322 - 29501180
Alignment:
Q  86 ggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggag 185  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29501322 ggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggag 29501223  T
Q  186 caacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29501222 caacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 29501180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4525205 - 4525063
Alignment:
Q  86 ggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggag 185  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4525205 ggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtg 4525106  T
Q  186 caacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4525105 caacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccc 4525063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 22477477 - 22477673
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||| || || || ||||||| ||||| ||| |||| ||| ||     
T  22477477 ttgtcgttgttgttgaaccggtgactgttgttgcatttgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatag 22477576  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgac 206  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| || |||| ||||| ||| |||| | ||| || ||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  22477577 aatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcatacgggtacgacagaggtaattgggcagcattaattggggcaacagtagccatggattgac 22477673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20160626 - 20160496
Alignment:
Q  80 tgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattga 179  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |  || |  ||||||  ||||| | |||||  ||||| |    
T  20160626 tgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatggtggaggtaattgagtagcattaa 20160527  T
Q  180 taggagcaacagtggccatggattgaccggc 210  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20160526 caggggcaacagtagccatggattgaccggc 20160496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 210
Target Start/End: Original strand, 22172205 - 22172335
Alignment:
Q  80 tgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattga 179  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |  || |  ||||||  ||||| | |||||  ||||| |    
T  22172205 tgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatggtggaggtaattgagtagcattaa 22172304  T
Q  180 taggagcaacagtggccatggattgaccggc 210  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22172305 caggggcaacagtagccatggattgaccggc 22172335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 382 - 611
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  382 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 481  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  482 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 581  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  582 attgaccggctccagttgacaccatcccta 611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5127997 - 5127768
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  5127997 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatac 5127898  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5127897 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 5127798  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5127797 attgaccggctccagctgacaccatcccta 5127768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45387348 - 45387121
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  45387348 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 45387249  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  45387248 tgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 45387149  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45387148 attgaccggctccagctgataccatccc 45387121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16736598 - 16736825
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  16736598 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtat 16736697  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16736698 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatgg 16736797  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16736798 attgaccggctccagctgataccatccc 16736825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16751652 - 16751879
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  16751652 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtat 16751751  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16751752 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatgg 16751851  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16751852 attgaccggctccagctgataccatccc 16751879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17523537 - 17523310
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  17523537 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtat 17523438  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  17523437 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatgg 17523338  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17523337 attgaccggctccagctgataccatccc 17523310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 17529678 - 17529905
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  17529678 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtat 17529777  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  17529778 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatgg 17529877  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17529878 attgaccggctccagctgataccatccc 17529905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2154578 - 2154349
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| | |||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2154578 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccagcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtac 2154479  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2154478 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 2154379  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154378 attgaccggctccagctgacaccatcccta 2154349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 11424914 - 11425143
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11424914 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 11425013  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11425014 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggagcaacagtagccatgg 11425113  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11425114 attgaccggctccagctgacaccatcccta 11425143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 24592679 - 24592906
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  24592679 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 24592778  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24592779 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 24592878  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592879 attgaccggctccagctgacaccatccc 24592906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 26275232 - 26275459
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  26275232 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 26275331  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26275332 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 26275431  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26275432 attgaccggctccagctgacaccatccc 26275459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11441556 - 11441338
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11441556 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataa 11441457  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  11441456 aacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccgg 11441357  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11441356 ctccagctgacaccatccc 11441338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 31564546 - 31564764
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  31564546 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 31564645  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  31564646 aacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccgg 31564745  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31564746 ctccagctgacaccatccc 31564764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9618656 - 9618429
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  9618656 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 9618557  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9618556 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 9618457  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9618456 attgaccggctccagctgataccatccc 9618429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 26320007 - 26320234
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  26320007 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 26320106  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26320107 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 26320206  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26320207 attgaccggctccagctgacaccatccc 26320234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31124907 - 31124687
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||    
T  31124907 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggttgcaaagggtactgatgataa 31124808  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  31124807 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccgg 31124708  T
Q  210 ctccagctgacaccatcccta 230  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31124707 ctccagctgacaccatcccta 31124687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26435262 - 26435035
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26435262 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 26435163  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26435162 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcactgataggagcaacagtggccatgg 26435063  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26435062 actgaccggctcctgctgacaccatccc 26435035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3445290 - 3445072
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3445290 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaa 3445191  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3445190 aacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccgg 3445091  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3445090 ctccagctgacaccatccc 3445072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 26670052 - 26670279
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  26670052 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 26670151  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |    
T  26670152 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattg 26670251  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26670252 attgaccggctccagctgacaccatccc 26670279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 26485891 - 26486109
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26485891 ttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaa 26485990  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  26485991 aacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccgg 26486090  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26486091 ctccagctgacaccatccc 26486109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 26538021 - 26538235
Alignment:
Q  11 tgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26538021 tgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaa 26538120  T
Q  111 atggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggc 210  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  26538121 acggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggc 26538220  T
Q  211 tccagctgacaccat 225  Q
    |||||||||||||||    
T  26538221 tccagctgacaccat 26538235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 10917015 - 10917232
Alignment:
Q  13 ttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaat 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| || || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10917015 ttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaat 10917114  T
Q  113 ggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctc 212  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10917115 ggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgaaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctc 10917214  T
Q  213 cagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10917215 cagctgacaccatcccta 10917232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 5147482 - 5147705
Alignment:
Q  5 tgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgat 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5147482 tgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgat 5147581  T
Q  105 ggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattg 204  Q
    | ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  5147582 gataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattg 5147681  T
Q  205 accggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5147682 accggctccagctgacaccatccc 5147705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16503518 - 16503747
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| || || || |||||||||||||  || |||    
T  16503518 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatac 16503617  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16503618 tgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatgg 16503717  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16503718 attgaccggctccggcagacaccatcccta 16503747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16518554 - 16518783
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| || || || |||||||||||||  || |||    
T  16518554 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatac 16518653  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16518654 tgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatgg 16518753  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16518754 attgaccggctccggcagacaccatcccta 16518783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4145261 - 4145488
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||| || |   ||||||| || || || || || |||||||||| |||||||    
T  4145261 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 4145360  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4145361 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 4145460  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4145461 attgaccggctccagctgataccatccc 4145488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16041252 - 16041102
Alignment:
Q  80 tgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattga 179  Q
    ||||||| || || ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||| |  || || ||||| |    
T  16041252 tgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaa 16041153  T
Q  180 taggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16041152 taggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatcccta 16041102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Original strand, 16450212 - 16450362
Alignment:
Q  80 tgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattga 179  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| || | || ||||| |||||||| |  || || ||||| |    
T  16450212 tgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgtacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaa 16450311  T
Q  180 taggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16450312 taggggcaacagtagctatggattgaccggctccggcagataccatcccta 16450362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5159445 - 5159326
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 182  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||    
T  5159445 cccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgatag 5159346  T
Q  183 gagcaacagtggccatggat 202  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  5159345 gagcaacagtagccatggat 5159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15658909 - 15659136
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15658909 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 15659008  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15659009 tgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatggatatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattg 15659108  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15659109 attgaccggctccagctgacaccatccc 15659136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41674722 - 41674495
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  41674722 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtac 41674623  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  41674622 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagcatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatgg 41674523  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41674522 attgaccggctccagctgacaccatccc 41674495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33777500 - 33777271
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33777500 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 33777401  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33777400 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatgg 33777301  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33777300 attgaccagctccagctgacaccatcccta 33777271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 9548692 - 9548919
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9548692 ttgctgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 9548791  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9548792 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtggccatgg 9548891  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548892 attgaccggctccagctgacaccatccc 9548919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 23718137 - 23718366
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23718137 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 23718236  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23718237 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 23718336  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23718337 attgaccggctccagctgacaccatcccta 23718366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 23752599 - 23752828
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23752599 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 23752698  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23752699 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 23752798  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752799 attgaccggctccagctgacaccatcccta 23752828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22999263 - 22999492
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  22999263 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtac 22999362  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22999363 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 22999462  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999463 attgaccggctccagctgacaccatcccta 22999492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 8665624 - 8665851
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  8665624 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtac 8665723  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  8665724 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 8665823  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8665824 attgaccggctccagctgataccatccc 8665851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11549367 - 11549138
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11549367 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 11549268  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11549267 tgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgtgaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 11549168  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549167 attgaccggctccagctgacaccatcccta 11549138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24681437 - 24681223
Alignment:
Q  14 tgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24681437 tgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatg 24681338  T
Q  114 gcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcc 213  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24681337 gcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctcc 24681238  T
Q  214 agctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||    
T  24681237 agctgacaccatccc 24681223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24723964 - 24723750
Alignment:
Q  14 tgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24723964 tgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatg 24723865  T
Q  114 gcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcc 213  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24723864 gcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctcc 24723765  T
Q  214 agctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||    
T  24723764 agctgacaccatccc 24723750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24688306 - 24688535
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24688306 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgtattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 24688405  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24688406 tgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 24688505  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24688506 attgaccggctccggcagacaccatcccta 24688535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5637923 - 5637696
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  5637923 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 5637824  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  5637823 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 5637724  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637723 attgaccggctccagctgacaccatccc 5637696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9317464 - 9317237
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  9317464 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 9317365  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9317364 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 9317265  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9317264 attgaccggctccagctgacaccatccc 9317237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26480405 - 26480178
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  26480405 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 26480306  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26480305 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 26480206  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26480205 attgaccggctccagctgacaccatccc 26480178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 18500906 - 18501124
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18500906 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataa 18501005  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18501006 aacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccgg 18501105  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18501106 ctccagctgacaccatccc 18501124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12132168 - 12131941
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  12132168 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 12132069  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12132068 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 12131969  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12131968 attgaccggctccagctgacaccatccc 12131941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18375561 - 18375788
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  18375561 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtac 18375660  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  18375661 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattg 18375760  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18375761 attgaccggctccagctgataccatccc 18375788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 29967215 - 29967442
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  29967215 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 29967314  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  29967315 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 29967414  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29967415 attgcccggctccagctgacaccatccc 29967442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30029428 - 30029201
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  30029428 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 30029329  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  30029328 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 30029229  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30029228 attgcccggctccagctgacaccatccc 30029201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30168482 - 30168255
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  30168482 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtac 30168383  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  30168382 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaatagtagccatgg 30168283  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30168282 attgaccggctccagctgataccatccc 30168255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33516369 - 33516142
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  33516369 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtac 33516270  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  33516269 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatgggagcaacggtagccatgg 33516170  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33516169 attgaccggctccagctgacaccatccc 33516142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 13325002 - 13325220
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  13325002 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 13325101  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  13325102 aacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccag 13325201  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13325202 ctccagctgacaccatccc 13325220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 31826577 - 31826795
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||    
T  31826577 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataa 31826676  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31826677 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccgg 31826776  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31826777 ctccagctgacaccatccc 31826795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 37358813 - 37359031
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  37358813 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 37358912  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  37358913 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccgg 37359012  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37359013 ctccagctgacaccatccc 37359031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15759006 - 15759233
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  15759006 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 15759105  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15759106 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 15759205  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15759206 attgacctgctccagctgacaccatccc 15759233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6874306 - 6874088
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  6874306 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 6874207  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  6874206 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccgg 6874107  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6874106 ctccagctgacaccatccc 6874088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28649230 - 28649012
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  28649230 ttgttgttgttgttgaaccggaaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 28649131  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| | ||||||||    
T  28649130 aatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgatagttgcaacagtagccatagcttgaccgg 28649031  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28649030 ctccagctgacaccatccc 28649012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31431432 - 31431214
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31431432 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataa 31431333  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  31431332 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccgg 31431233  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  31431232 ctccagctgataccatccc 31431214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 37671650 - 37671868
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  37671650 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 37671749  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  37671750 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccgg 37671849  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  37671850 ctccggctgacaccatccc 37671868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30152031 - 30151804
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  30152031 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 30151932  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  30151931 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattg 30151832  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30151831 attgaccggctccagctgataccatccc 30151804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3789530 - 3789312
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  3789530 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 3789431  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  3789430 aacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccgg 3789331  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3789330 ctccagctgacaccatccc 3789312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37754972 - 37754754
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||    
T  37754972 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataa 37754873  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  37754872 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccgg 37754773  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37754772 ctccagctgacaccatccc 37754754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43078252 - 43078035
Alignment:
Q  11 tgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43078252 tgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaa 43078153  T
Q  111 atggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggc 210  Q
    | || || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||    
T  43078152 acggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggc 43078053  T
Q  211 tccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  43078052 tccagttgacaccatccc 43078035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2511064 - 2510840
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  2511064 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacggacacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 2510965  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2510964 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatgg 2510865  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccat 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  2510864 attgaccggctccagctgataccat 2510840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 37771157 - 37771375
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||    
T  37771157 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataa 37771256  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  37771257 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggatacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccgg 37771356  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  37771357 ctccagctgataccatccc 37771375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30934637 - 30934420
Alignment:
Q  13 ttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaat 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30934637 ttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaat 30934538  T
Q  113 ggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctc 212  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  30934537 ggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattggccggctc 30934438  T
Q  213 cagctgacaccatcccta 230  Q
    | |  |||||||||||||    
T  30934437 cggtagacaccatcccta 30934420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 40473711 - 40473928
Alignment:
Q  11 tgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40473711 tgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggcggcagggggtactgatggtaaa 40473810  T
Q  111 atggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggc 210  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  40473811 acggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtgtgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggc 40473910  T
Q  211 tccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40473911 tccagctgacaccatccc 40473928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 28959956 - 28960174
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||| |||    
T  28959956 ttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataa 28960055  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||    
T  28960056 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggtgcaacagtagccgttgattgcccgg 28960155  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28960156 ctccagctgacaccatccc 28960174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Original strand, 32599703 - 32599845
Alignment:
Q  86 ggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggag 185  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32599703 ggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggag 32599802  T
Q  186 caacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599803 caacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccc 32599845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34616449 - 34616307
Alignment:
Q  86 ggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggag 185  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  34616449 ggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggtg 34616350  T
Q  186 caacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34616349 caacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccc 34616307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24970024 - 24969870
Alignment:
Q  14 tgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| || || || |||||||||||||  || |||||||| || ||||    
T  24970024 tgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatg 24969925  T
Q  114 gcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttg 168  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  24969924 gcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacggaggcatttg 24969870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23892160 - 23891990
Alignment:
Q  60 cattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacgg 159  Q
    |||||||||| || || || ||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  23892160 cattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacgg 23892061  T
Q  160 aggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  23892060 aggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctccggcagataccatcccta 23891990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25198966 - 25198816
Alignment:
Q  80 tgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattga 179  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |  ||||| |    
T  25198966 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcaattgggaagcattaa 25198867  T
Q  180 taggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  25198866 taggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatcccta 25198816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24951951 - 24951894
Alignment:
Q  173 gcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24951951 gcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatcccta 24951894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33292459 - 33292340
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 182  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||    
T  33292459 cccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgatag 33292360  T
Q  183 gagcaacagtggccatggat 202  Q
    |||||||||| ||| |||||    
T  33292359 gagcaacagtagccttggat 33292340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6569872 - 6569645
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6569872 ttgctgattttgttgttgctgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 6569773  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6569772 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattg 6569673  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6569672 attgaccggctccagctgacaccatccc 6569645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 24592575 - 24592792
Alignment:
Q  13 ttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24592575 ttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaat 24592674  T
Q  113 ggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctc 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24592675 ggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctc 24592774  T
Q  213 cagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24592775 cagctgacaccatcccta 24592792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21969720 - 21969493
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21969720 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 21969621  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  21969620 tgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattg 21969521  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21969520 attgaccggctccagctgacaccatccc 21969493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27163569 - 27163796
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27163569 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 27163668  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  27163669 tgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattg 27163768  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27163769 attgaccggctccagctgataccatccc 27163796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30753752 - 30753534
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  30753752 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataa 30753653  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30753652 aatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccgg 30753553  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  30753552 ctccagctgacatcatccc 30753534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14098560 - 14098333
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  14098560 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtac 14098461  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  14098460 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 14098361  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098360 attgaccggctccagctgacaccatccc 14098333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17014019 - 17013790
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17014019 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 17013920  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17013919 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgaaggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 17013820  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17013819 attgaccagctccggctgacaccatcccta 17013790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 18800884 - 18801101
Alignment:
Q  11 tgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18800884 tgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaa 18800983  T
Q  111 atggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggc 210  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||    
T  18800984 atggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggc 18801083  T
Q  211 tccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18801084 tccagctgacaccatccc 18801101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 31126770 - 31126997
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  31126770 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtac 31126869  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  31126870 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 31126969  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31126970 attgaccggctccagctgataccatccc 31126997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5005880 - 5005662
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5005880 ttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataa 5005781  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  5005780 aatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccgg 5005681  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  5005680 ctcccgctgacaccatccc 5005662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 40105890 - 40106117
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  40105890 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 40105989  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  40105990 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 40106089  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40106090 attgaccggctccagctgacaccatccc 40106117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 33674071 - 33674289
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33674071 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaa 33674170  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  33674171 aatggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccgg 33674270  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33674271 ctccagctgacaccatccc 33674289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14665037 - 14664808
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14665037 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 14664938  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  14664937 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatgg 14664838  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  14664837 attgaccagctccggcagacaccatcccta 14664808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39850633 - 39850418
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  39850633 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaa 39850534  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  39850533 aacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccgg 39850434  T
Q  210 ctccagctgacaccat 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  39850433 ctccagctgacaccat 39850418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 14763556 - 14763783
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| || |   ||||||| || || || || || |||||||||| |||||||    
T  14763556 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 14763655  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14763656 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattg 14763755  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763756 attgaccggctccagctgacaccatccc 14763783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54833327 - 54833182
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 182  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833327 cccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 54833228  T
Q  183 gagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54833227 gagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccc 54833182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 80 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19373201 - 19373053
Alignment:
Q  80 tgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattga 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19373201 tgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattga 19373102  T
Q  180 taggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19373101 taggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccc 19373053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Original strand, 36344846 - 36344991
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 182  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36344846 cccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatag 36344945  T
Q  183 gagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36344946 gagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 36344991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1900200 - 1900050
Alignment:
Q  80 tgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattga 179  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||| |  || || ||||| |    
T  1900200 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaa 1900101  T
Q  180 taggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  1900100 taggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatcccta 1900050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 227
Target Start/End: Original strand, 15285236 - 15285403
Alignment:
Q  60 cattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacgg 159  Q
    |||| |||||||| || || ||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||  | ||    
T  15285236 cattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatatgggtacaatgg 15285335  T
Q  160 aggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcc 227  Q
    ||| |  || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  15285336 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatcc 15285403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15227813 - 15227663
Alignment:
Q  80 tgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattga 179  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  || || ||||| |    
T  15227813 tgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaa 15227714  T
Q  180 taggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  15227713 taggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatcccta 15227663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24112602 - 24112483
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 182  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||    
T  24112602 cccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacag 24112503  T
Q  183 gagcaacagtggccatggat 202  Q
    |||||||||| ||| |||||    
T  24112502 gagcaacagtagccttggat 24112483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 202
Target Start/End: Original strand, 34189291 - 34189410
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 182  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||    
T  34189291 cccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgatag 34189390  T
Q  183 gagcaacagtggccatggat 202  Q
    |||| ||||| ||| |||||    
T  34189391 gagcgacagtagccttggat 34189410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16277558 - 16277329
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16277558 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 16277459  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16277458 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 16277359  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277358 attgaccggctccagctgacaccatcccta 16277329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27609116 - 27609345
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27609116 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 27609215  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27609216 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgacacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 27609315  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27609316 attgaccggctccagctgacaccatcccta 27609345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19674433 - 19674215
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19674433 ttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataa 19674334  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  19674333 aatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactgg 19674234  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19674233 ctccagctgacaccatccc 19674215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 2137470 - 2137699
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2137470 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 2137569  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2137570 tgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 2137669  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137670 attgaccggctccagctgacaccatcccta 2137699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 19518363 - 19518581
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  19518363 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 19518462  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  19518463 aatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccgg 19518562  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19518563 ctccagctgacaccatccc 19518581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 19208571 - 19208798
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  19208571 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 19208670  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19208671 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 19208770  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19208771 attgaccggctccagctgacaccatccc 19208798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33258727 - 33258500
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  33258727 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 33258628  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  33258627 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 33258528  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33258527 attgcccggctccagctgacaccatccc 33258500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 3329739 - 3329957
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  3329739 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 3329838  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  3329839 aacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacgatagccatggattgaccgg 3329938  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3329939 ctccagctgacaccatccc 3329957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19688102 - 19687873
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19688102 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccgacaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 19688003  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19688002 tggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatgg 19687903  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19687902 attgaccggctccggctgacaccatcccta 19687873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 28362166 - 28362393
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  28362166 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 28362265  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  28362266 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatgg 28362365  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28362366 attgaccggctccagctgataccatccc 28362393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29829308 - 29829090
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  29829308 ttgttgttgttgttgaaccgacaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 29829209  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  29829208 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccgg 29829109  T
Q  210 ctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29829108 ctccagctgacaccatccc 29829090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14557619 - 14557402
Alignment:
Q  13 ttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaat 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14557619 ttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaat 14557520  T
Q  113 ggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctc 212  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14557519 ggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctc 14557420  T
Q  213 cagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14557419 cagctgacaccatcccta 14557402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 31489961 - 31490188
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  31489961 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtac 31490060  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  31490061 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattg 31490160  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31490161 attgaccggctccagctgacaccatccc 31490188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 12092944 - 12093168
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||    
T  12092944 ttgctgttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtac 12093043  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  12093044 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcacttgagctgcattgataggagcaatagtagccatag 12093143  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccat 225  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  12093144 attggccggctgcagctgacaccat 12093168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18710574 - 18710366
Alignment:
Q  17 tgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || || || || |||||||||| |||||||||||| ||||| || |    
T  18710574 tgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtg 18710475  T
Q  117 gaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagc 216  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  18710474 ggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagc 18710375  T
Q  217 tgacaccat 225  Q
    |||||||||    
T  18710374 tgacaccat 18710366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31354528 - 31354301
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||| || |   ||||||| || || || || || |||||||||| |||||||    
T  31354528 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 31354429  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31354428 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtggccatgg 31354329  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31354328 attgaccggctccagctgataccatccc 31354301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16283449 - 16283224
Alignment:
Q  5 tgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgat 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| | ||| || || || ||||| ||||||| ||| |||| ||    
T  16283449 tgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaat 16283350  T
Q  105 ggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattg 204  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16283349 gatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattg 16283250  T
Q  205 accggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||| || |||||||||||||    
T  16283249 accggctccggcagacaccatcccta 16283224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19286387 - 19286242
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 182  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19286387 cccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatag 19286288  T
Q  183 gagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19286287 gagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccc 19286242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 44563026 - 44562929
Alignment:
Q  83 cccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 180  Q
    |||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  44563026 cccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 44562929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27296 - 27067
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  27296 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtac 27197  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27196 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 27097  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27096 attgaccggctccagctgacaccatcccta 27067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30457 - 30228
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  30457 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 30358  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30357 tgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 30258  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30257 attgaccggctccagctgacaccatcccta 30228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20337 - 20187
Alignment:
Q  80 tgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattga 179  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||  |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||| |  || || ||||| |    
T  20337 tgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaa 20238  T
Q  180 taggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  20237 taggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatcccta 20187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 41793560 - 41793784
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  41793560 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgtggagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtac 41793659  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  41793660 tgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatgg 41793759  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccat 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  41793760 attgaccggctccagctgataccat 41793784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10962673 - 10962446
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  10962673 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 10962574  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  10962573 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 10962474  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10962473 attgaccggctccagctgacaccatccc 10962446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 51638221 - 51637994
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||    
T  51638221 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttttatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccgggtggcaaagggtac 51638122  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  51638121 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 51638022  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51638021 attgaccggctccagctgacaccatccc 51637994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28584984 - 28584757
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  28584984 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 28584885  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28584884 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 28584785  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28584784 attgcccggctccagctgacaccatccc 28584757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20461032 - 20460882
Alignment:
Q  80 tgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattga 179  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||  || |||| ||||| | |||||| |  || || ||||| |    
T  20461032 tgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacggcggaggtaactgggcagcattaa 20460933  T
Q  180 taggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  20460932 taggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatcccta 20460882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 226
Target Start/End: Original strand, 16208449 - 16208502
Alignment:
Q  173 gcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatc 226  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  16208449 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatc 16208502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 47237 - 47466
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  47237 ttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtac 47336  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  47337 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgatggaggcatttgggctgcattgataagagcaacagtagccatgg 47436  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47437 gttgaccggctccagctgacaccatcccta 47466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 40321 - 40550
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| || || || ||||||||||||| |||||||    
T  40321 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatttacgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtac 40420  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40421 tgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacggcggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 40520  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  40521 attgaccggctccggcagacaccatcccta 40550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29763 - 29538
Alignment:
Q  5 tgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgat 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  29763 tgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagctattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgat 29664  T
Q  105 ggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattg 204  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  29663 gatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacgggtacgatggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattg 29564  T
Q  205 accggctccagctgacaccatcccta 230  Q
    ||||||||| || |||||||||||||    
T  29563 accggctccggcagacaccatcccta 29538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 7491 - 7718
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  7491 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 7590  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  7591 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 7690  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7691 attgaccggctccagctgacaccatccc 7718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15182 - 15409
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  15182 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtac 15281  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  15282 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattg 15381  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15382 attgaccggctccagctgataccatccc 15409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 26454 - 26681
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||    
T  26454 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcctctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaacgggtac 26553  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26554 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattg 26653  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26654 attgaccggctccagctgacaccatccc 26681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 9318 - 9545
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  9318 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 9417  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  9418 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatgg 9517  T
Q  201 attgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9518 attgaccggctcccgctgacaccatccc 9545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20019 - 19807
Alignment:
Q  1 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  20019 ttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtac 19920  T
Q  101 tgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatgg 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  19919 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatgg 19820  T
Q  201 attgaccggctcc 213  Q
    |||||||||||||    
T  19819 attgaccggctcc 19807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7932 - 7717
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  7932 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataa 7833  T
Q  110 aatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccgg 209  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  7832 aacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccgg 7733  T
Q  210 ctccagctgacaccat 225  Q
    || |||||||||||||    
T  7732 ctgcagctgacaccat 7717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5986 - 5765
Alignment:
Q  10 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaacta-cattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5986 ttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgata 5887  T
Q  109 aaat-ggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggcca-tggattgac 206  Q
    |||  || || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  5886 aaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccatttgattgac 5787  T
Q  207 cggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5786 cggctccagctgacaccatccc 5765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Original strand, 1 - 204
Alignment:
Q  17 tgttgttgaaccggcaactgttgtttcacctgttgggcaactacattgacgggcacttgtggctgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| || |    
T  1 tgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtg 100  T
Q  117 gaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagc 216  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  101 ggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagc 200  T
Q  217 tgac 220  Q
    ||||    
T  201 tgac 204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8151 - 8009
Alignment:
Q  86 ggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggag 185  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8151 ggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggag 8052  T
Q  186 caacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 228  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8051 caacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccc 8009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University