View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8893_low_13 (Length: 528)

Name: NF8893_low_13
Description: NF8893
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8893_low_13
NF8893_low_13
[»] chr3 (149 HSPs)
chr3 (1-518)||(30065732-30066249)
chr3 (1-518)||(11165335-11165852)
chr3 (1-518)||(55022653-55023170)
chr3 (1-518)||(11069854-11070371)
chr3 (1-517)||(15617161-15617677)
chr3 (1-518)||(27409449-27409967)
chr3 (2-518)||(28949510-28950027)
chr3 (1-518)||(22336505-22337023)
chr3 (1-517)||(7109485-7110002)
chr3 (1-517)||(7113420-7113937)
chr3 (36-518)||(22321450-22321932)
chr3 (1-518)||(14499111-14499628)
chr3 (9-440)||(11854597-11855028)
chr3 (144-518)||(4111204-4111572)
chr3 (144-518)||(4107352-4107720)
chr3 (1-280)||(20461306-20461585)
chr3 (1-280)||(15482684-15482962)
chr3 (1-280)||(7793152-7793435)
chr3 (1-280)||(326970-327250)
chr3 (1-280)||(2897629-2897908)
chr3 (1-280)||(31097360-31097640)
chr3 (144-440)||(15964833-15965123)
chr3 (144-440)||(15968757-15969047)
chr3 (144-440)||(15972681-15972971)
chr3 (144-440)||(37439591-37439881)
chr3 (144-439)||(19775630-19775919)
chr3 (1-279)||(15849891-15850166)
chr3 (280-440)||(4588858-4589018)
chr3 (1-223)||(11300317-11300539)
chr3 (278-440)||(12339662-12339824)
chr3 (278-439)||(5223261-5223422)
chr3 (278-440)||(16796442-16796604)
chr3 (1-280)||(16797860-16798138)
chr3 (278-439)||(12469858-12470019)
chr3 (297-440)||(11300532-11300675)
chr3 (278-440)||(324191-324353)
chr3 (278-440)||(43889628-43889790)
chr3 (1-280)||(16808687-16808965)
chr3 (1-280)||(17241995-17242272)
chr3 (278-440)||(52989724-52989886)
chr3 (278-440)||(18700309-18700471)
chr3 (1-277)||(38814409-38814684)
chr3 (284-439)||(14966126-14966281)
chr3 (1-280)||(1982616-1982903)
chr3 (74-280)||(19725790-19726003)
chr3 (278-403)||(15465068-15465193)
chr3 (278-405)||(14670914-14671041)
chr3 (278-437)||(21837384-21837543)
chr3 (278-440)||(11914018-11914180)
chr3 (1-277)||(3833699-3833974)
chr3 (74-280)||(18383795-18384008)
chr3 (278-440)||(17691711-17691872)
chr3 (74-280)||(322616-322829)
chr3 (1-280)||(3402761-3403049)
chr3 (74-280)||(12496281-12496495)
chr3 (1-280)||(3389741-3390029)
chr3 (278-405)||(14682413-14682540)
chr3 (278-433)||(16643135-16643290)
chr3 (74-280)||(11862817-11863031)
chr3 (278-440)||(54876389-54876554)
chr3 (74-280)||(11298407-11298620)
chr3 (1-134)||(26190814-26190947)
chr3 (1-280)||(11594945-11595232)
chr3 (125-280)||(5223086-5223239)
chr3 (83-280)||(11851605-11851810)
chr3 (125-280)||(15464887-15465040)
chr3 (1-281)||(12037758-12038045)
chr3 (142-280)||(14665425-14665570)
chr3 (142-280)||(14668581-14668726)
chr3 (433-508)||(12891426-12891501)
chr3 (433-508)||(17253067-17253142)
chr3 (342-440)||(22652077-22652174)
chr3 (342-440)||(35961596-35961694)
chr3 (125-280)||(12339488-12339641)
chr3 (1-281)||(11557190-11557478)
chr3 (181-280)||(8489459-8489555)
chr3 (125-280)||(11300696-11300849)
chr3 (1-277)||(15941710-15941985)
chr3 (144-275)||(16750543-16750668)
chr3 (433-518)||(7985716-7985801)
chr3 (433-518)||(16333182-16333267)
chr3 (171-280)||(11854439-11854545)
chr3 (1-178)||(15060427-15060605)
chr3 (1-163)||(16864939-16865101)
chr3 (1-178)||(16909885-16910063)
chr3 (1-277)||(1598286-1598560)
chr3 (278-346)||(3265017-3265085)
chr3 (433-509)||(5420315-5420391)
chr3 (433-509)||(5426713-5426789)
chr3 (236-280)||(12172820-12172864)
chr3 (114-193)||(12172924-12173004)
chr3 (286-350)||(14763736-14763800)
chr3 (286-350)||(23371482-23371546)
chr3 (278-346)||(36527794-36527862)
chr3 (281-347)||(9577674-9577738)
chr3 (1-123)||(856327-856449)
chr3 (278-340)||(14179427-14179489)
chr3 (433-518)||(10325862-10325947)
chr3 (74-174)||(15051655-15051756)
chr3 (286-347)||(51300611-51300672)
chr3 (433-518)||(13320984-13321066)
chr3 (279-346)||(14568804-14568871)
chr3 (342-400)||(41813-41871)
chr3 (125-210)||(4589039-4589125)
chr3 (1-178)||(16369543-16369721)
chr3 (125-218)||(19775515-19775608)
chr3 (433-518)||(24187789-24187871)
chr3 (74-280)||(42325965-42326180)
chr3 (278-347)||(10834105-10834174)
chr3 (433-518)||(28351173-28351258)
chr3 (278-347)||(37427764-37427833)
chr3 (278-326)||(10542434-10542482)
chr3 (433-509)||(12482449-12482525)
chr3 (228-280)||(12511085-12511137)
chr3 (433-509)||(15584730-15584806)
chr3 (433-509)||(15591388-15591464)
chr3 (236-280)||(23053136-23053180)
chr3 (228-280)||(46822293-46822345)
chr3 (245-280)||(14878574-14878609)
chr3 (433-506)||(839270-839340)
chr3 (230-280)||(4589228-4589278)
chr3 (342-400)||(16325249-16325307)
chr3 (1-278)||(16696809-16697092)
chr3 (230-280)||(19775369-19775419)
chr3 (433-518)||(20723013-20723095)
chr3 (433-518)||(55148990-55149072)
chr3 (115-179)||(23052996-23053061)
chr3 (284-328)||(8928437-8928481)
chr3 (284-328)||(34852664-34852708)
chr3 (245-280)||(15051532-15051567)
chr3 (245-280)||(15060308-15060343)
chr3 (245-280)||(15878109-15878144)
chr3 (125-191)||(15964745-15964812)
chr3 (125-191)||(15968669-15968736)
chr3 (125-191)||(15972593-15972660)
chr3 (245-280)||(17525216-17525251)
chr3 (286-345)||(28194743-28194802)
chr3 (245-280)||(30029868-30029903)
chr3 (443-509)||(1333080-1333146)
chr3 (443-509)||(16633871-16633937)
chr3 (443-509)||(16640481-16640547)
chr3 (443-509)||(43161146-43161212)
chr3 (443-509)||(43167383-43167449)
chr3 (443-509)||(48423388-48423454)
chr3 (443-509)||(48430166-48430232)
chr3 (471-508)||(15337456-15337493)
chr3 (339-438)||(14569023-14569122)
chr3 (1-81)||(16690440-16690519)
chr3 (244-280)||(16909766-16909802)
[»] chr4 (111 HSPs)
chr4 (1-518)||(17810055-17810572)
chr4 (1-518)||(14757228-14757745)
chr4 (1-518)||(9556313-9556830)
chr4 (1-518)||(4561139-4561657)
chr4 (1-517)||(5756743-5757261)
chr4 (1-518)||(33742163-33742678)
chr4 (1-441)||(27533886-27534325)
chr4 (1-280)||(36133768-36134047)
chr4 (144-440)||(14954122-14954412)
chr4 (1-280)||(1951567-1951845)
chr4 (144-440)||(25689731-25690021)
chr4 (144-440)||(10712717-10713004)
chr4 (144-440)||(10926487-10926774)
chr4 (144-440)||(12487572-12487862)
chr4 (1-280)||(18222184-18222462)
chr4 (278-440)||(17048136-17048298)
chr4 (1-280)||(17152293-17152570)
chr4 (1-280)||(18228659-18228937)
chr4 (1-277)||(23139296-23139570)
chr4 (3-277)||(26243473-26243746)
chr4 (278-440)||(13591928-13592089)
chr4 (1-154)||(43255967-43256120)
chr4 (142-277)||(22634369-22634504)
chr4 (278-440)||(14746585-14746747)
chr4 (1-280)||(18236913-18237192)
chr4 (1-277)||(19757407-19757682)
chr4 (1-277)||(19782124-19782399)
chr4 (1-280)||(3412820-3413096)
chr4 (331-440)||(43256213-43256322)
chr4 (1-277)||(16243206-16243481)
chr4 (284-439)||(15497043-15497198)
chr4 (1-277)||(2014803-2015078)
chr4 (74-280)||(16487956-16488170)
chr4 (1-276)||(9530460-9530733)
chr4 (1-280)||(15353112-15353400)
chr4 (74-280)||(16356831-16357044)
chr4 (278-382)||(10056653-10056757)
chr4 (16-280)||(5338801-5339074)
chr4 (74-280)||(16348543-16348756)
chr4 (284-438)||(19857480-19857634)
chr4 (125-280)||(43256343-43256496)
chr4 (433-508)||(53433397-53433472)
chr4 (342-440)||(15008211-15008309)
chr4 (342-440)||(15884123-15884221)
chr4 (142-280)||(20157407-20157552)
chr4 (344-440)||(40619776-40619872)
chr4 (1-280)||(11250367-11250654)
chr4 (342-440)||(10694955-10695053)
chr4 (342-440)||(10908721-10908819)
chr4 (1-218)||(25555599-25555816)
chr4 (142-280)||(13812966-13813111)
chr4 (354-440)||(14650780-14650866)
chr4 (77-193)||(12570142-12570259)
chr4 (2-278)||(28569251-28569526)
chr4 (1-165)||(18602551-18602715)
chr4 (278-345)||(18212784-18212851)
chr4 (279-346)||(40907122-40907189)
chr4 (1-277)||(45938173-45938447)
chr4 (278-347)||(24047301-24047370)
chr4 (433-518)||(35613948-35614033)
chr4 (1-191)||(16351654-16351845)
chr4 (75-183)||(44675762-44675872)
chr4 (433-518)||(14678974-14679056)
chr4 (433-518)||(14685182-14685264)
chr4 (433-518)||(23838445-23838527)
chr4 (284-374)||(52873150-52873240)
chr4 (278-347)||(14185029-14185098)
chr4 (82-183)||(23843608-23843711)
chr4 (1-67)||(16678395-16678461)
chr4 (472-518)||(20682161-20682207)
chr4 (281-347)||(26045298-26045364)
chr4 (281-347)||(26050479-26050545)
chr4 (342-400)||(28385529-28385587)
chr4 (433-509)||(12299908-12299984)
chr4 (433-509)||(12349584-12349660)
chr4 (434-518)||(12522093-12522177)
chr4 (230-278)||(14708668-14708716)
chr4 (433-509)||(17962335-17962411)
chr4 (236-280)||(25555504-25555548)
chr4 (384-440)||(26013440-26013496)
chr4 (284-328)||(40906983-40907027)
chr4 (25-146)||(18609169-18609290)
chr4 (433-518)||(41385757-41385839)
chr4 (443-509)||(55795478-55795544)
chr4 (230-275)||(15224821-15224866)
chr4 (284-329)||(30146454-30146499)
chr4 (433-518)||(35170638-35170723)
chr4 (1-278)||(42997256-42997532)
chr4 (284-328)||(4831543-4831587)
chr4 (284-328)||(4834838-4834882)
chr4 (236-280)||(12570038-12570082)
chr4 (284-328)||(14047708-14047752)
chr4 (125-191)||(14954433-14954500)
chr4 (245-280)||(15093799-15093834)
chr4 (103-171)||(15125060-15125130)
chr4 (245-280)||(23843502-23843537)
chr4 (125-191)||(25689643-25689710)
chr4 (471-518)||(30235225-30235272)
chr4 (443-509)||(8384853-8384919)
chr4 (443-509)||(8391508-8391574)
chr4 (443-509)||(14073849-14073915)
chr4 (144-218)||(15224962-15225035)
chr4 (443-509)||(15256627-15256693)
chr4 (443-509)||(17089999-17090065)
chr4 (443-509)||(17808432-17808498)
chr4 (443-509)||(29040920-29040986)
chr4 (278-328)||(32306997-32307047)
chr4 (245-282)||(13569524-13569561)
chr4 (342-440)||(53631320-53631420)
chr4 (278-322)||(16043087-16043131)
chr4 (250-282)||(16240032-16240064)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (1-514)||(3682-4194)
[»] chr1 (86 HSPs)
chr1 (1-518)||(1010506-1011023)
chr1 (1-518)||(21407138-21407656)
chr1 (1-518)||(16375263-16375782)
chr1 (1-518)||(52639324-52639842)
chr1 (1-440)||(20228615-20229054)
chr1 (1-280)||(16080250-16080529)
chr1 (1-280)||(36819114-36819394)
chr1 (1-354)||(23819105-23819457)
chr1 (1-280)||(24782906-24783185)
chr1 (144-440)||(1925084-1925374)
chr1 (144-440)||(20924098-20924388)
chr1 (1-280)||(19211889-19212167)
chr1 (1-154)||(33797680-33797833)
chr1 (278-429)||(48603420-48603571)
chr1 (278-439)||(27653224-27653385)
chr1 (1-278)||(12646895-12647169)
chr1 (1-280)||(22449071-22449358)
chr1 (278-436)||(13881383-13881541)
chr1 (284-440)||(51326749-51326905)
chr1 (1-275)||(46975494-46975767)
chr1 (1-276)||(18882393-18882667)
chr1 (1-280)||(18181926-18182213)
chr1 (334-440)||(33797478-33797584)
chr1 (278-440)||(48520468-48520629)
chr1 (1-280)||(20138105-20138383)
chr1 (294-440)||(12271511-12271657)
chr1 (5-221)||(8761442-8761658)
chr1 (1-280)||(17678393-17678678)
chr1 (1-280)||(45310172-45310461)
chr1 (1-280)||(18393769-18394058)
chr1 (282-405)||(41781594-41781718)
chr1 (342-440)||(46198433-46198531)
chr1 (125-280)||(33797304-33797457)
chr1 (433-508)||(50887763-50887838)
chr1 (74-280)||(3472804-3473015)
chr1 (342-440)||(29764346-29764444)
chr1 (342-440)||(50000719-50000817)
chr1 (1-280)||(45489549-45489836)
chr1 (331-412)||(22130961-22131043)
chr1 (1-193)||(6151976-6152169)
chr1 (74-185)||(21022767-21022879)
chr1 (1-280)||(3704870-3705157)
chr1 (284-381)||(43543144-43543241)
chr1 (1-193)||(22831183-22831375)
chr1 (1-52)||(21305563-21305614)
chr1 (278-344)||(22124338-22124404)
chr1 (144-275)||(39244096-39244221)
chr1 (144-275)||(39247651-39247776)
chr1 (144-275)||(41388196-41388321)
chr1 (433-518)||(19104762-19104847)
chr1 (433-518)||(19111419-19111504)
chr1 (278-347)||(20437995-20438064)
chr1 (278-347)||(20958158-20958227)
chr1 (77-183)||(42865092-42865200)
chr1 (286-350)||(16372044-16372108)
chr1 (433-518)||(23763223-23763305)
chr1 (278-347)||(28312564-28312633)
chr1 (433-509)||(18626285-18626361)
chr1 (125-210)||(20229075-20229161)
chr1 (289-347)||(21043294-21043352)
chr1 (433-518)||(20525226-20525311)
chr1 (236-281)||(33050074-33050119)
chr1 (433-509)||(27898669-27898745)
chr1 (433-509)||(43063286-43063362)
chr1 (433-509)||(44756125-44756201)
chr1 (433-509)||(49334592-49334668)
chr1 (433-506)||(21437818-21437888)
chr1 (226-280)||(21788081-21788135)
chr1 (278-343)||(14800583-14800648)
chr1 (278-343)||(14809457-14809522)
chr1 (244-280)||(21313149-21313185)
chr1 (284-328)||(32649780-32649824)
chr1 (284-327)||(2332982-2333025)
chr1 (245-280)||(20135215-20135250)
chr1 (278-348)||(20454554-20454625)
chr1 (281-348)||(21533877-21533944)
chr1 (245-280)||(22468754-22468789)
chr1 (443-509)||(43078459-43078525)
chr1 (247-280)||(6151872-6151905)
chr1 (172-280)||(20229208-20229314)
chr1 (247-280)||(21022655-21022688)
chr1 (247-280)||(22831446-22831479)
chr1 (1-98)||(33049893-33049989)
chr1 (433-518)||(8305152-8305231)
chr1 (279-323)||(16381256-16381300)
chr1 (284-328)||(29534617-29534661)
[»] chr2 (93 HSPs)
chr2 (1-518)||(10101451-10101966)
chr2 (1-518)||(27601579-27602097)
chr2 (1-518)||(12901318-12901835)
chr2 (36-518)||(24628320-24628802)
chr2 (1-518)||(27379238-27379755)
chr2 (1-518)||(27383284-27383801)
chr2 (1-518)||(24649140-24649657)
chr2 (1-440)||(41530815-41531249)
chr2 (1-280)||(24735424-24735703)
chr2 (1-218)||(19688562-19688779)
chr2 (144-440)||(30344946-30345236)
chr2 (144-440)||(1283250-1283540)
chr2 (278-438)||(31345075-31345235)
chr2 (278-440)||(23069285-23069447)
chr2 (278-440)||(23707290-23707452)
chr2 (278-440)||(24918067-24918229)
chr2 (278-440)||(34874214-34874376)
chr2 (1-280)||(22460996-22461272)
chr2 (278-440)||(24670952-24671114)
chr2 (278-440)||(27472376-27472538)
chr2 (278-440)||(24681371-24681533)
chr2 (276-440)||(22459562-22459726)
chr2 (278-440)||(21081738-21081900)
chr2 (2-277)||(18855268-18855541)
chr2 (278-438)||(18358735-18358895)
chr2 (1-280)||(23187097-23187375)
chr2 (1-280)||(23598360-23598638)
chr2 (1-280)||(24716336-24716621)
chr2 (1-193)||(15477711-15477904)
chr2 (1-277)||(19928308-19928583)
chr2 (1-280)||(25961340-25961627)
chr2 (282-405)||(9784673-9784796)
chr2 (74-280)||(25963595-25963808)
chr2 (1-280)||(21327372-21327660)
chr2 (73-280)||(22811788-22812004)
chr2 (1-278)||(60840-61115)
chr2 (1-280)||(21318441-21318729)
chr2 (1-280)||(40428487-40428776)
chr2 (433-508)||(24872418-24872493)
chr2 (433-508)||(30970990-30971065)
chr2 (1-278)||(27263296-27263573)
chr2 (125-280)||(31344899-31345052)
chr2 (1-280)||(24174824-24175111)
chr2 (433-518)||(21147302-21147387)
chr2 (433-508)||(21139284-21139359)
chr2 (433-508)||(24880303-24880378)
chr2 (342-440)||(34492200-34492298)
chr2 (1-280)||(24655144-24655431)
chr2 (342-440)||(21914868-21914966)
chr2 (278-347)||(9241976-9242045)
chr2 (433-518)||(11677458-11677543)
chr2 (433-518)||(24640973-24641058)
chr2 (278-347)||(34136990-34137059)
chr2 (74-280)||(37524699-37524905)
chr2 (165-280)||(21916069-21916191)
chr2 (74-163)||(21918194-21918284)
chr2 (278-347)||(21073494-21073563)
chr2 (286-350)||(19662430-19662494)
chr2 (114-193)||(24673697-24673777)
chr2 (283-353)||(26392426-26392496)
chr2 (286-347)||(19201985-19202046)
chr2 (433-518)||(27196895-27196980)
chr2 (286-350)||(6261154-6261218)
chr2 (77-194)||(22758596-22758715)
chr2 (236-280)||(24869904-24869948)
chr2 (286-350)||(30644056-30644120)
chr2 (171-278)||(41666973-41667078)
chr2 (433-518)||(24503122-24503204)
chr2 (3-163)||(44370106-44370267)
chr2 (281-353)||(23287407-23287480)
chr2 (236-280)||(22799175-22799219)
chr2 (384-440)||(24316193-24316248)
chr2 (354-438)||(39827952-39828036)
chr2 (433-509)||(44381202-44381278)
chr2 (226-280)||(25616213-25616267)
chr2 (443-509)||(27369322-27369388)
chr2 (443-509)||(27375832-27375898)
chr2 (471-508)||(19646014-19646051)
chr2 (77-207)||(22740841-22740973)
chr2 (284-328)||(22703167-22703211)
chr2 (433-509)||(44387872-44387948)
chr2 (2-191)||(24870000-24870190)
chr2 (443-509)||(9340302-9340368)
chr2 (443-509)||(9488936-9489002)
chr2 (443-509)||(9608197-9608263)
chr2 (443-509)||(13306610-13306676)
chr2 (443-509)||(16922551-16922617)
chr2 (443-509)||(16985963-16986029)
chr2 (443-509)||(19489945-19490011)
chr2 (443-509)||(28431933-28431999)
chr2 (247-280)||(45678189-45678222)
chr2 (236-272)||(23019755-23019791)
chr2 (236-280)||(24673593-24673637)
[»] chr7 (138 HSPs)
chr7 (1-518)||(70571-71088)
chr7 (1-518)||(74680-75197)
chr7 (1-518)||(32890-33407)
chr7 (1-518)||(12714647-12715165)
chr7 (1-518)||(12718451-12718969)
chr7 (1-518)||(16907006-16907524)
chr7 (1-518)||(12704464-12704982)
chr7 (1-518)||(26292178-26292695)
chr7 (1-518)||(18279186-18279704)
chr7 (1-518)||(12723362-12723880)
chr7 (1-518)||(16114024-16114542)
chr7 (1-518)||(16117177-16117695)
chr7 (1-518)||(18283149-18283667)
chr7 (1-440)||(39722127-39722566)
chr7 (2-280)||(11312669-11312947)
chr7 (1-280)||(13635275-13635554)
chr7 (1-280)||(12318148-12318427)
chr7 (5-280)||(15605082-15605358)
chr7 (1-280)||(16583277-16583555)
chr7 (1-280)||(15580712-15580991)
chr7 (144-439)||(45169961-45170250)
chr7 (1-280)||(9593367-9593645)
chr7 (1-280)||(18864-19142)
chr7 (1-224)||(9644384-9644608)
chr7 (282-440)||(25927254-25927412)
chr7 (278-440)||(1858833-1858995)
chr7 (1-280)||(11987233-11987512)
chr7 (278-440)||(13918527-13918689)
chr7 (278-440)||(14258407-14258569)
chr7 (278-440)||(16460767-16460929)
chr7 (1-280)||(2760155-2760442)
chr7 (278-440)||(8940206-8940368)
chr7 (278-440)||(16579715-16579877)
chr7 (278-440)||(16585786-16585948)
chr7 (278-440)||(16998549-16998711)
chr7 (278-440)||(46580677-46580839)
chr7 (1-280)||(8917448-8917726)
chr7 (1-280)||(13461782-13462061)
chr7 (278-440)||(15719952-15720114)
chr7 (278-440)||(32301244-32301406)
chr7 (1-280)||(3271847-3272134)
chr7 (1-277)||(13149179-13149454)
chr7 (1-280)||(12321547-12321834)
chr7 (278-437)||(14273474-14273633)
chr7 (1-277)||(6801237-6801512)
chr7 (284-440)||(8468674-8468830)
chr7 (74-280)||(14429907-14430120)
chr7 (294-438)||(15112902-15113046)
chr7 (331-440)||(2530191-2530299)
chr7 (294-440)||(16324008-16324153)
chr7 (1-280)||(16724437-16724714)
chr7 (1-280)||(17701451-17701728)
chr7 (1-110)||(48593262-48593371)
chr7 (285-420)||(17060433-17060568)
chr7 (278-405)||(20487533-20487660)
chr7 (1-278)||(15728348-15728624)
chr7 (1-146)||(16438840-16438985)
chr7 (142-280)||(9751703-9751847)
chr7 (1-278)||(14216938-14217214)
chr7 (297-438)||(15116439-15116580)
chr7 (125-280)||(13918710-13918863)
chr7 (433-508)||(6017182-6017257)
chr7 (357-440)||(15084057-15084140)
chr7 (342-440)||(16550712-16550810)
chr7 (342-440)||(16614852-16614950)
chr7 (125-280)||(1859016-1859169)
chr7 (125-280)||(25927433-25927586)
chr7 (142-280)||(2832389-2832534)
chr7 (150-280)||(16457312-16457441)
chr7 (1-280)||(9445964-9446251)
chr7 (167-280)||(7519331-7519441)
chr7 (342-440)||(32160910-32161007)
chr7 (146-280)||(2530342-2530475)
chr7 (1-278)||(18556996-18557271)
chr7 (142-280)||(39267847-39267992)
chr7 (278-347)||(42461999-42462068)
chr7 (167-275)||(18425464-18425566)
chr7 (278-347)||(11661322-11661391)
chr7 (284-381)||(14270034-14270131)
chr7 (286-350)||(16008591-16008655)
chr7 (342-440)||(17232875-17232973)
chr7 (5-131)||(42205284-42205410)
chr7 (433-518)||(14148579-14148664)
chr7 (278-347)||(18607503-18607572)
chr7 (278-347)||(38519422-38519491)
chr7 (92-160)||(2530040-2530108)
chr7 (278-346)||(10501425-10501493)
chr7 (433-509)||(10869467-10869543)
chr7 (433-509)||(10875547-10875623)
chr7 (278-346)||(14157106-14157174)
chr7 (286-350)||(14566215-14566279)
chr7 (286-350)||(18872373-18872437)
chr7 (39-218)||(20569440-20569619)
chr7 (433-518)||(11262340-11262422)
chr7 (433-518)||(11554874-11554956)
chr7 (281-347)||(16996272-16996338)
chr7 (1-123)||(17137868-17137990)
chr7 (433-518)||(44408349-44408431)
chr7 (433-518)||(7536194-7536279)
chr7 (286-347)||(11525574-11525635)
chr7 (278-347)||(14422000-14422069)
chr7 (433-509)||(23519965-23520041)
chr7 (433-518)||(20109-20191)
chr7 (289-347)||(9033359-9033417)
chr7 (433-518)||(11548278-11548360)
chr7 (433-518)||(12692507-12692589)
chr7 (433-518)||(14959175-14959257)
chr7 (433-518)||(18531255-18531337)
chr7 (433-518)||(26420011-26420093)
chr7 (286-347)||(20619430-20619491)
chr7 (433-509)||(8706015-8706091)
chr7 (384-440)||(14981543-14981599)
chr7 (384-440)||(15411019-15411075)
chr7 (230-278)||(16275515-16275563)
chr7 (433-509)||(18553542-18553618)
chr7 (433-509)||(18585310-18585386)
chr7 (236-280)||(42204018-42204062)
chr7 (231-278)||(35151629-35151676)
chr7 (121-191)||(45170268-45170339)
chr7 (433-518)||(14953209-14953291)
chr7 (284-328)||(837364-837408)
chr7 (284-328)||(1202544-1202588)
chr7 (245-280)||(19649547-19649582)
chr7 (284-327)||(38828298-38828341)
chr7 (443-509)||(21701-21767)
chr7 (443-509)||(8202095-8202161)
chr7 (443-509)||(15022148-15022214)
chr7 (281-323)||(18203887-18203929)
chr7 (278-311)||(9177667-9177700)
chr7 (471-508)||(9409966-9410003)
chr7 (245-282)||(9703285-9703322)
chr7 (245-282)||(32216606-32216643)
chr7 (284-328)||(833368-833412)
chr7 (284-328)||(1198548-1198592)
chr7 (433-509)||(8719431-8719507)
chr7 (284-328)||(16109521-16109565)
chr7 (77-194)||(18154717-18154836)
chr7 (236-280)||(20569645-20569689)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (1-518)||(12205-12722)
[»] chr6 (121 HSPs)
chr6 (1-518)||(22862729-22863246)
chr6 (1-518)||(19870373-19870891)
chr6 (1-518)||(11566645-11567163)
chr6 (1-518)||(23394851-23395369)
chr6 (1-518)||(23989703-23990221)
chr6 (1-518)||(8243644-8244161)
chr6 (1-518)||(12618650-12619165)
chr6 (1-441)||(14472131-14472570)
chr6 (1-440)||(18917072-18917511)
chr6 (1-441)||(18955569-18956009)
chr6 (1-440)||(1644569-1645005)
chr6 (1-280)||(17804218-17804497)
chr6 (12-280)||(25766985-25767253)
chr6 (1-280)||(22429836-22430115)
chr6 (144-440)||(31477765-31478055)
chr6 (144-440)||(16760156-16760446)
chr6 (144-440)||(22948969-22949259)
chr6 (144-440)||(22952925-22953215)
chr6 (144-440)||(23871413-23871703)
chr6 (144-440)||(23875369-23875659)
chr6 (1-280)||(12706711-12706988)
chr6 (1-277)||(16741231-16741506)
chr6 (278-440)||(23414841-23415003)
chr6 (278-440)||(27556599-27556761)
chr6 (278-440)||(19773544-19773706)
chr6 (1-154)||(27415748-27415901)
chr6 (278-440)||(22805889-22806051)
chr6 (1-280)||(5616620-5616899)
chr6 (278-440)||(15705445-15705607)
chr6 (278-440)||(28103900-28104062)
chr6 (5-280)||(2685129-2685402)
chr6 (1-280)||(19662792-19663068)
chr6 (1-280)||(18907135-18907422)
chr6 (331-440)||(27415994-27416103)
chr6 (1-277)||(12496333-12496608)
chr6 (1-277)||(9482099-9482374)
chr6 (278-440)||(15817523-15817685)
chr6 (1-280)||(20907787-20908074)
chr6 (278-432)||(14979389-14979543)
chr6 (314-440)||(17743334-17743460)
chr6 (1-277)||(22592610-22592884)
chr6 (1-280)||(18180518-18180803)
chr6 (284-440)||(15875340-15875496)
chr6 (1-278)||(1587537-1587813)
chr6 (308-440)||(17377829-17377961)
chr6 (125-280)||(23414667-23414820)
chr6 (125-280)||(27556425-27556578)
chr6 (1-280)||(22408111-22408396)
chr6 (1-280)||(19790585-19790872)
chr6 (342-440)||(18913902-18914000)
chr6 (342-440)||(18937160-18937258)
chr6 (296-404)||(18696480-18696589)
chr6 (1-278)||(20803359-20803636)
chr6 (342-438)||(15174163-15174259)
chr6 (88-224)||(21834782-21834916)
chr6 (140-280)||(16523330-16523476)
chr6 (435-518)||(18917676-18917759)
chr6 (331-401)||(18706301-18706371)
chr6 (433-518)||(22758861-22758946)
chr6 (144-275)||(16624158-16624283)
chr6 (125-280)||(27416124-27416271)
chr6 (433-518)||(34832666-34832748)
chr6 (77-193)||(15894310-15894427)
chr6 (433-518)||(16371868-16371953)
chr6 (278-347)||(23838224-23838293)
chr6 (433-518)||(25928306-25928391)
chr6 (167-280)||(27325581-27325703)
chr6 (278-345)||(20136722-20136789)
chr6 (278-345)||(22196080-22196147)
chr6 (1-279)||(23657226-23657513)
chr6 (278-347)||(18453232-18453301)
chr6 (433-518)||(34369984-34370069)
chr6 (286-350)||(4476871-4476935)
chr6 (74-193)||(21739900-21740020)
chr6 (167-280)||(21766719-21766839)
chr6 (125-218)||(31478076-31478169)
chr6 (433-518)||(34298635-34298717)
chr6 (278-342)||(20182848-20182912)
chr6 (278-342)||(22153079-22153143)
chr6 (1-101)||(27553413-27553513)
chr6 (226-280)||(19848034-19848088)
chr6 (3-163)||(22059550-22059711)
chr6 (342-400)||(23956148-23956206)
chr6 (433-518)||(19808537-19808622)
chr6 (433-509)||(17016932-17017008)
chr6 (236-280)||(27553620-27553664)
chr6 (433-509)||(32565252-32565328)
chr6 (471-518)||(4167938-4167985)
chr6 (471-518)||(4208618-4208665)
chr6 (279-346)||(23539020-23539087)
chr6 (1-280)||(27567415-27567702)
chr6 (230-280)||(1644309-1644359)
chr6 (125-210)||(1644462-1644548)
chr6 (443-509)||(8228907-8228973)
chr6 (471-517)||(14098640-14098686)
chr6 (226-280)||(15041589-15041643)
chr6 (443-509)||(16552040-16552106)
chr6 (443-509)||(16576847-16576913)
chr6 (443-509)||(16618467-16618533)
chr6 (443-509)||(16628596-16628662)
chr6 (226-280)||(23992455-23992509)
chr6 (230-280)||(31478265-31478315)
chr6 (77-207)||(25642064-25642196)
chr6 (236-280)||(15894487-15894531)
chr6 (282-353)||(33443091-33443163)
chr6 (125-191)||(16760068-16760135)
chr6 (245-280)||(19863002-19863037)
chr6 (245-280)||(19873144-19873179)
chr6 (125-191)||(22948881-22948948)
chr6 (125-191)||(22952837-22952904)
chr6 (125-191)||(23871325-23871392)
chr6 (125-191)||(23875281-23875348)
chr6 (284-345)||(18199424-18199486)
chr6 (443-509)||(18931096-18931162)
chr6 (443-509)||(29587700-29587766)
chr6 (443-509)||(29593841-29593907)
chr6 (74-123)||(16523281-16523330)
chr6 (368-441)||(19656104-19656177)
chr6 (1-278)||(21702311-21702587)
chr6 (471-508)||(25595399-25595436)
chr6 (284-328)||(29416912-29416956)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (1-517)||(4907-5423)
[»] scaffold0029 (7 HSPs)
scaffold0029 (1-517)||(61418-61934)
scaffold0029 (1-517)||(65334-65850)
scaffold0029 (1-439)||(80577-81012)
scaffold0029 (1-130)||(12943-13072)
scaffold0029 (146-218)||(80462-80533)
scaffold0029 (230-280)||(80316-80366)
scaffold0029 (236-280)||(12787-12831)
[»] chr5 (107 HSPs)
chr5 (1-518)||(19472525-19473043)
chr5 (1-518)||(20295630-20296148)
chr5 (1-340)||(15236586-15236925)
chr5 (281-518)||(15236921-15237158)
chr5 (1-280)||(23535395-23535672)
chr5 (215-440)||(40723607-40723832)
chr5 (144-440)||(10753225-10753515)
chr5 (278-439)||(18356154-18356315)
chr5 (278-439)||(20910918-20911079)
chr5 (1-280)||(42805442-42805720)
chr5 (1-276)||(20232577-20232850)
chr5 (11-280)||(26742562-26742830)
chr5 (278-440)||(22107436-22107598)
chr5 (1-154)||(18356474-18356627)
chr5 (140-280)||(17410461-17410601)
chr5 (1-154)||(20910606-20910759)
chr5 (1-280)||(18774225-18774504)
chr5 (1-280)||(26665937-26666214)
chr5 (1-280)||(26937534-26937811)
chr5 (3-280)||(23451372-23451655)
chr5 (1-277)||(33409253-33409528)
chr5 (278-440)||(6765785-6765947)
chr5 (3-280)||(23462877-23463160)
chr5 (1-280)||(24532854-24533131)
chr5 (1-277)||(16674177-16674452)
chr5 (3-280)||(23458616-23458899)
chr5 (74-280)||(21366544-21366757)
chr5 (1-280)||(18784068-18784347)
chr5 (1-102)||(17410646-17410747)
chr5 (296-436)||(33895665-33895805)
chr5 (1-280)||(21340573-21340850)
chr5 (1-277)||(17718245-17718520)
chr5 (276-440)||(29447960-29448125)
chr5 (125-280)||(20911101-20911254)
chr5 (342-440)||(17010971-17011069)
chr5 (1-280)||(12028371-12028658)
chr5 (342-440)||(263103-263201)
chr5 (1-280)||(1858782-1859069)
chr5 (1-218)||(22757219-22757436)
chr5 (125-280)||(18355979-18356132)
chr5 (433-518)||(22325937-22326022)
chr5 (1-278)||(25229212-25229488)
chr5 (1-278)||(25293368-25293644)
chr5 (142-276)||(24767493-24767634)
chr5 (74-280)||(20805576-20805788)
chr5 (433-508)||(22343517-22343592)
chr5 (433-508)||(22352917-22352992)
chr5 (1-280)||(17918957-17919244)
chr5 (1-280)||(123111-123398)
chr5 (1-280)||(26680606-26680890)
chr5 (1-280)||(26952213-26952497)
chr5 (1-278)||(21884995-21885271)
chr5 (1-278)||(4036243-4036520)
chr5 (1-278)||(26172488-26172764)
chr5 (77-280)||(20766998-20767207)
chr5 (333-405)||(20910854-20910925)
chr5 (433-518)||(15441966-15442051)
chr5 (286-350)||(42960589-42960653)
chr5 (1-280)||(24221901-24222188)
chr5 (331-405)||(18356308-18356381)
chr5 (286-350)||(28371031-28371095)
chr5 (286-350)||(37598892-37598956)
chr5 (433-518)||(21295275-21295357)
chr5 (433-518)||(24554546-24554628)
chr5 (77-183)||(14079278-14079386)
chr5 (433-518)||(14359829-14359914)
chr5 (286-350)||(22336614-22336678)
chr5 (286-350)||(22340152-22340216)
chr5 (285-353)||(26732841-26732909)
chr5 (125-218)||(10753111-10753204)
chr5 (433-518)||(25535000-25535082)
chr5 (342-400)||(33473272-33473330)
chr5 (278-347)||(23469853-23469921)
chr5 (433-509)||(22258482-22258558)
chr5 (433-509)||(22410609-22410685)
chr5 (434-518)||(23337301-23337385)
chr5 (281-353)||(26740650-26740722)
chr5 (236-280)||(31342171-31342215)
chr5 (284-346)||(10816453-10816515)
chr5 (226-280)||(17517240-17517294)
chr5 (1-123)||(18769809-18769931)
chr5 (443-509)||(20775908-20775974)
chr5 (278-324)||(30138930-30138976)
chr5 (4-109)||(23572285-23572390)
chr5 (433-509)||(29316438-29316514)
chr5 (146-218)||(31342219-31342291)
chr5 (125-191)||(11220521-11220588)
chr5 (125-191)||(11228930-11228997)
chr5 (125-191)||(11230919-11230986)
chr5 (245-280)||(21873278-21873313)
chr5 (245-280)||(23201384-23201419)
chr5 (230-280)||(10752965-10753015)
chr5 (126-191)||(11226940-11227006)
chr5 (284-345)||(15796471-15796533)
chr5 (443-509)||(16354864-16354930)
chr5 (443-509)||(16361523-16361589)
chr5 (443-509)||(25106803-25106869)
chr5 (443-509)||(25165896-25165962)
chr5 (443-509)||(34564857-34564923)
chr5 (443-509)||(34571512-34571578)
chr5 (245-278)||(14079175-14079208)
chr5 (247-280)||(23501415-23501448)
chr5 (236-280)||(22757149-22757193)
chr5 (228-280)||(23512122-23512174)
chr5 (236-280)||(23572108-23572152)
chr5 (279-323)||(27988934-27988978)
chr5 (278-345)||(41861455-41861523)
[»] chr8 (90 HSPs)
chr8 (1-518)||(21976475-21976993)
chr8 (1-518)||(19278089-19278606)
chr8 (1-518)||(43251596-43252113)
chr8 (1-518)||(21972390-21972904)
chr8 (144-440)||(21827969-21828259)
chr8 (1-280)||(16231281-16231559)
chr8 (144-440)||(18862600-18862890)
chr8 (149-440)||(21410811-21411096)
chr8 (149-440)||(21805303-21805588)
chr8 (327-518)||(22111714-22111905)
chr8 (1-280)||(23834194-23834473)
chr8 (36-248)||(22111904-22112116)
chr8 (38-280)||(22044906-22045147)
chr8 (1-210)||(22028647-22028857)
chr8 (1-223)||(18619555-18619778)
chr8 (1-280)||(30308560-30308837)
chr8 (278-440)||(18833519-18833680)
chr8 (278-440)||(37515662-37515824)
chr8 (278-439)||(14397864-14398017)
chr8 (1-280)||(20465844-20466131)
chr8 (278-440)||(17461054-17461216)
chr8 (1-277)||(23846821-23847096)
chr8 (278-433)||(23659371-23659526)
chr8 (278-440)||(22238021-22238182)
chr8 (279-440)||(19808365-19808526)
chr8 (1-277)||(15538473-15538748)
chr8 (278-440)||(23409752-23409914)
chr8 (1-277)||(15531914-15532188)
chr8 (278-405)||(23914029-23914156)
chr8 (74-280)||(30643169-30643384)
chr8 (1-280)||(20856230-20856517)
chr8 (1-280)||(22010484-22010767)
chr8 (74-280)||(17926585-17926798)
chr8 (82-280)||(15602903-15603109)
chr8 (74-280)||(16410133-16410346)
chr8 (295-424)||(16402021-16402150)
chr8 (1-280)||(16861132-16861417)
chr8 (82-280)||(15611355-15611561)
chr8 (344-440)||(23478326-23478422)
chr8 (433-508)||(26935187-26935262)
chr8 (342-440)||(19880074-19880172)
chr8 (342-440)||(26453956-26454054)
chr8 (342-440)||(19929556-19929655)
chr8 (1-178)||(377414-377592)
chr8 (125-280)||(14398039-14398192)
chr8 (1-277)||(17828389-17828663)
chr8 (144-280)||(21387095-21387228)
chr8 (77-193)||(24755842-24755959)
chr8 (151-280)||(21383675-21383801)
chr8 (74-178)||(19259460-19259565)
chr8 (284-381)||(1327015-1327112)
chr8 (433-518)||(19905507-19905592)
chr8 (279-347)||(20502104-20502172)
chr8 (433-518)||(20527461-20527543)
chr8 (1-95)||(24434043-24434137)
chr8 (77-183)||(19983223-19983331)
chr8 (1-278)||(32605234-32605510)
chr8 (1-110)||(39094747-39094856)
chr8 (146-280)||(39094875-39095017)
chr8 (278-329)||(25363204-25363255)
chr8 (342-400)||(8414418-8414476)
chr8 (342-400)||(11775008-11775066)
chr8 (226-280)||(18678141-18678195)
chr8 (226-280)||(32121760-32121814)
chr8 (286-347)||(17438227-17438288)
chr8 (77-183)||(19899225-19899333)
chr8 (433-509)||(18065351-18065427)
chr8 (3-102)||(22166189-22166288)
chr8 (1-102)||(22113534-22113635)
chr8 (1-102)||(22135037-22135138)
chr8 (289-347)||(22963426-22963484)
chr8 (77-179)||(16184862-16184966)
chr8 (241-278)||(17055424-17055461)
chr8 (278-347)||(17086155-17086224)
chr8 (112-278)||(32598702-32598867)
chr8 (236-280)||(377295-377339)
chr8 (236-280)||(23776884-23776928)
chr8 (236-280)||(24755738-24755782)
chr8 (471-518)||(3216273-3216320)
chr8 (245-280)||(17354001-17354036)
chr8 (125-191)||(18862911-18862978)
chr8 (125-191)||(21828280-21828347)
chr8 (286-340)||(5083164-5083218)
chr8 (278-328)||(22253167-22253217)
chr8 (245-278)||(19983119-19983152)
chr8 (278-347)||(22995893-22995962)
chr8 (278-343)||(23943995-23944060)
chr8 (244-280)||(19259648-19259684)
chr8 (236-280)||(21162107-21162151)
chr8 (236-280)||(21168780-21168824)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (36-518)||(58560-59042)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (1-441)||(35749-36188)
scaffold0109 (1-279)||(6967-7244)
scaffold0109 (1-131)||(45288-45418)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (144-518)||(233-602)
scaffold0676 (1-280)||(4454-4741)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (1-280)||(66221-66500)
[»] scaffold0031 (5 HSPs)
scaffold0031 (1-280)||(53586-53865)
scaffold0031 (144-440)||(36041-36331)
scaffold0031 (125-191)||(36352-36419)
scaffold0031 (245-280)||(65856-65891)
scaffold0031 (250-282)||(128777-128809)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (1-280)||(12925-13204)
scaffold0044 (1-280)||(19209-19488)
scaffold0044 (174-278)||(62284-62386)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (1-276)||(13293-13568)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (1-280)||(173313-173590)
scaffold0001 (1-280)||(422337-422624)
scaffold0001 (342-400)||(168724-168782)
scaffold0001 (342-400)||(176078-176136)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (1-280)||(18438-18717)
[»] scaffold0013 (3 HSPs)
scaffold0013 (1-280)||(2479-2757)
scaffold0013 (433-518)||(9349-9434)
scaffold0013 (278-347)||(30381-30451)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (1-280)||(228179-228457)
scaffold0009 (278-440)||(85502-85664)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (290-518)||(67397-67624)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (1-278)||(19823-20099)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (144-440)||(11456-11746)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (144-440)||(189332-189622)
scaffold0012 (1-280)||(24774-25053)
scaffold0012 (278-345)||(221208-221275)
scaffold0012 (125-191)||(189643-189710)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (1-280)||(9471-9750)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (144-440)||(14042-14332)
scaffold0141 (125-191)||(14353-14420)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (144-440)||(256-548)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (1-280)||(3336-3614)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (144-440)||(32615-32905)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-196)||(10390-10585)
scaffold0004 (245-280)||(69818-69853)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (278-440)||(39209-39371)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (1-280)||(18166-18444)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (278-440)||(809-971)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (1-228)||(1-229)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (280-440)||(207587-207747)
scaffold0016 (125-278)||(207768-207931)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (278-440)||(31080-31242)
scaffold0051 (125-280)||(30906-31059)
[»] scaffold0293 (3 HSPs)
scaffold0293 (278-440)||(20212-20374)
scaffold0293 (125-278)||(20395-20546)
scaffold0293 (278-347)||(17552-17621)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (278-440)||(21123-21285)
scaffold0096 (245-280)||(16406-16441)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (278-440)||(125912-126074)
[»] scaffold0037 (5 HSPs)
scaffold0037 (280-424)||(80420-80564)
scaffold0037 (74-224)||(21447-21597)
scaffold0037 (403-440)||(80562-80599)
scaffold0037 (146-210)||(80642-80706)
scaffold0037 (230-280)||(80810-80860)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (1-279)||(6063-6340)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (278-440)||(119965-120127)
scaffold0034 (171-278)||(16640-16745)
[»] scaffold0003 (5 HSPs)
scaffold0003 (1-154)||(71460-71613)
scaffold0003 (331-440)||(71258-71367)
scaffold0003 (1-277)||(139736-140010)
scaffold0003 (1-277)||(413856-414140)
scaffold0003 (146-280)||(71090-71215)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (1-280)||(5610-5896)
scaffold0476 (1-280)||(6805-7091)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (1-280)||(15111-15397)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (278-411)||(17559-17692)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-280)||(23238-23516)
scaffold0010 (433-518)||(242069-242151)
scaffold0010 (278-347)||(697-766)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (278-440)||(169751-169913)
scaffold0020 (286-347)||(142631-142692)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (74-280)||(183-398)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-277)||(9928-10203)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (278-439)||(117-278)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (284-440)||(53846-54002)
scaffold0022 (152-280)||(73725-73859)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (1-280)||(1295-1582)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-280)||(5806-6084)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (278-439)||(6943-7104)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (1-280)||(16926-17204)
scaffold0216 (433-518)||(8867-8949)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (1-221)||(19097-19317)
[»] scaffold0107 (4 HSPs)
scaffold0107 (1-154)||(15224-15376)
scaffold0107 (284-440)||(10092-10248)
scaffold0107 (331-422)||(15469-15560)
scaffold0107 (278-347)||(36230-36299)
[»] scaffold0042 (4 HSPs)
scaffold0042 (1-277)||(63878-64153)
scaffold0042 (1-277)||(75762-76037)
scaffold0042 (77-193)||(34791-34908)
scaffold0042 (236-280)||(34968-35012)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (278-440)||(15698-15861)
scaffold0156 (433-518)||(2821-2903)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-277)||(9445-9720)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (278-440)||(1876-2038)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (278-440)||(24599-24760)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (1-280)||(46532-46819)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (74-280)||(417-631)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (314-440)||(2751-2877)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (278-440)||(516-678)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (278-440)||(1294-1456)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (1-277)||(18379-18654)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (278-439)||(7793-7952)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (9-201)||(822-1014)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (74-280)||(42651-42860)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-280)||(30550-30835)
scaffold0008 (171-278)||(1900-2005)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (74-280)||(1518-1731)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (1-280)||(18461-18748)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (284-438)||(376-530)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (82-280)||(6195-6401)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (278-408)||(6161-6291)
[»] scaffold0780 (2 HSPs)
scaffold0780 (284-440)||(3335-3491)
scaffold0780 (442-508)||(136-199)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-277)||(36331-36605)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (1-280)||(1889-2177)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (82-280)||(9537-9741)
scaffold0104 (82-280)||(1854-2059)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (278-440)||(67218-67379)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (296-439)||(495-639)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (278-378)||(20769-20869)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (427-518)||(68090-68181)
scaffold0066 (284-328)||(48396-48440)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (278-440)||(6904-7066)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (338-440)||(1227-1329)
scaffold0017 (338-440)||(7978-8080)
scaffold0017 (77-280)||(19613-19825)
scaffold0017 (77-280)||(15091-15303)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (342-439)||(22477-22574)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (1-215)||(4030-4245)
scaffold0184 (236-280)||(4275-4319)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (74-280)||(44105-44318)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (1-280)||(35316-35604)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (82-280)||(921-1126)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (342-440)||(5704-5802)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (278-403)||(14991-15116)
scaffold0306 (342-440)||(4276-4374)
[»] scaffold0299 (2 HSPs)
scaffold0299 (125-280)||(6702-6855)
scaffold0299 (384-440)||(6876-6932)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (342-439)||(70536-70633)
[»] scaffold1552 (2 HSPs)
scaffold1552 (1-165)||(490-653)
scaffold1552 (231-278)||(392-439)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (142-276)||(9990-10131)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (1-280)||(8584-8871)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (284-399)||(105078-105193)
scaffold0023 (236-280)||(38528-38572)
[»] scaffold1220 (2 HSPs)
scaffold1220 (1-194)||(1909-2102)
scaffold1220 (239-279)||(1817-1857)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (342-440)||(10467-10564)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (74-280)||(6294-6507)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (1-280)||(313-590)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (342-440)||(33163-33261)
[»] scaffold0741 (2 HSPs)
scaffold0741 (278-387)||(4271-4380)
scaffold0741 (375-440)||(6851-6916)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (39-280)||(7495-7744)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-278)||(76977-77253)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (142-276)||(2933-3074)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (342-440)||(4276-4374)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-131)||(501-631)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (1-178)||(6883-7061)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (2-218)||(192123-192340)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (1-280)||(2241-2529)
scaffold0439 (1-280)||(10101-10389)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (342-440)||(15539-15638)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (354-440)||(166426-166512)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (356-440)||(7627-7711)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-280)||(7076-7363)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (342-439)||(56926-57024)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (88-193)||(13969-14075)
scaffold0056 (236-280)||(14135-14179)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (1-218)||(11472-11680)
scaffold0410 (236-280)||(2192-2236)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (278-347)||(1944-2013)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (77-183)||(3872-3980)
scaffold0149 (77-183)||(8303-8411)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (284-381)||(36038-36135)
[»] scaffold0158 (4 HSPs)
scaffold0158 (74-193)||(2960-3080)
scaffold0158 (74-193)||(6626-6746)
scaffold0158 (236-280)||(2856-2900)
scaffold0158 (236-280)||(6522-6566)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (284-347)||(11196-11259)
scaffold0040 (284-347)||(22296-22359)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (390-440)||(13490-13540)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (286-347)||(988-1049)
[»] scaffold0210 (4 HSPs)
scaffold0210 (1-130)||(21611-21740)
scaffold0210 (1-130)||(29503-29632)
scaffold0210 (245-280)||(21861-21896)
scaffold0210 (245-280)||(29753-29788)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (278-347)||(3307-3376)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (278-346)||(8082-8150)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (286-350)||(110700-110764)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (433-508)||(10196-10271)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (278-345)||(75830-75897)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (433-518)||(6627-6709)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (278-347)||(762-831)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (284-381)||(10859-10956)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (278-347)||(3917-3986)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (354-438)||(8967-9051)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (77-194)||(15550-15669)
scaffold0297 (245-280)||(15737-15772)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (284-347)||(9728-9791)
[»] scaffold0111 (3 HSPs)
scaffold0111 (114-194)||(32554-32636)
scaffold0111 (1-278)||(8523-8799)
scaffold0111 (230-278)||(15667-15715)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (278-324)||(6684-6730)
[»] scaffold0242 (2 HSPs)
scaffold0242 (433-518)||(19587-19669)
scaffold0242 (433-518)||(25761-25843)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (278-348)||(15240-15310)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (278-347)||(18169-18238)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (281-353)||(206528-206601)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (230-278)||(9358-9406)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (278-346)||(10524-10592)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (433-509)||(8809-8885)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (433-509)||(22224-22300)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (433-509)||(4088-4164)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (224-280)||(4841-4897)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-123)||(2068-2190)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (278-324)||(15067-15113)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (230-276)||(15363-15409)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (278-328)||(132985-133035)
scaffold0019 (284-346)||(29261-29323)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (286-347)||(7499-7560)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (278-347)||(10213-10282)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (433-505)||(24989-25058)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (77-130)||(174952-175005)
scaffold0021 (284-328)||(146254-146298)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (236-280)||(6119-6163)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (77-194)||(18334-18453)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (77-194)||(36577-36696)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (433-518)||(5811-5893)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (443-509)||(38723-38789)
[»] scaffold0052 (2 HSPs)
scaffold0052 (443-509)||(10378-10444)
scaffold0052 (443-509)||(56800-56866)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (342-440)||(1314-1414)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (245-282)||(4891-4928)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (286-347)||(3006-3067)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (77-134)||(8838-8895)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (248-280)||(7878-7910)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (278-346)||(29723-29791)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (165-221)||(33639-33694)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (236-280)||(14688-14732)
scaffold0081 (236-280)||(23703-23747)
scaffold0081 (236-280)||(39127-39171)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 414; Significance: 0; HSPs: 149)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 30066249 - 30065732
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30066249 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaaga 30066150  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30066149 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaa 30066050  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30066049 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 30065950  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30065949 tattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgctgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 30065850  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30065849 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgaaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgttgttattt 30065750  T
Q  501 aactaagtacatgatgtc 518  Q
    || |||||||||||||||    
T  30065749 aaataagtacatgatgtc 30065732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 11165335 - 11165852
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11165335 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaaga 11165434  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  |||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11165435 tgttaactgttatttgtgaaactatattgaaatgccaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaa 11165534  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11165535 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttga 11165634  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11165635 tattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 11165734  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11165735 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttattt 11165834  T
Q  501 aactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  11165835 aactaagtgcatgatgtc 11165852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 55023170 - 55022653
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  55023170 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttagatactaatgagacctatctaaga 55023071  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55023070 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaa 55022971  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55022970 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatactgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttga 55022871  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55022870 tattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 55022771  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55022770 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttattt 55022671  T
Q  501 aactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  55022670 aactaagtgcatgatgtc 55022653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 11070371 - 11069854
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11070371 cgagcacatccagaattaagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaaga 11070272  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11070271 tgttaactgttatttgtgaagctatatcgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattcttgaatgattaggaa 11070172  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11070171 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 11070072  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11070071 tattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 11069972  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11069971 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttattt 11069872  T
Q  501 aactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  11069871 aactaagtgcatgatgtc 11069854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 15617677 - 15617161
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  15617677 cgagcacttccagaattgagtgttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaag 15617579  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    ||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617578 ataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattacattacttgaattattattgaatgatcagga 15617479  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617478 acttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 15617379  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617378 atattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgctgctgctgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 15617279  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15617278 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgaaattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatt 15617179  T
Q  500 taactaagtacatgatgt 517  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  15617178 taactaagtgcatgatgt 15617161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 27409449 - 27409967
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  27409449 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 27409547  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27409548 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 27409647  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27409648 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 27409747  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27409748 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 27409847  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27409848 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 27409947  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  27409948 ttaactaagtgcatgatgtc 27409967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 28950027 - 28949510
Alignment:
Q  2 gagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  28950027 gagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaag 28949929  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    ||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949928 ataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 28949829  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28949828 agttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttg 28949729  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949728 atattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 28949629  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28949628 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatt 28949529  T
Q  500 taactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  28949528 taactaagtgcatgatgtc 28949510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22337023 - 22336505
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  22337023 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgtttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 22336925  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336924 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 22336825  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22336824 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 22336725  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336724 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 22336625  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22336624 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgaattgactgtgctactgctgttat 22336525  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  22336524 ttaactaagtgcatgatgtc 22336505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 7110002 - 7109485
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  7110002 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttgaattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 7109904  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7109903 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 7109804  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7109803 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 7109704  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7109703 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 7109604  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7109603 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 7109504  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgt 517  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  7109503 ttaactaagtgcatgatgt 7109485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 7113937 - 7113420
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  7113937 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttgaattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 7113839  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113838 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 7113739  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7113738 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 7113639  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113638 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 7113539  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7113538 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 7113439  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgt 517  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  7113438 ttaactaagtgcatgatgt 7113420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22321932 - 22321450
Alignment:
Q  36 tgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatg 134  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||| | | ||  || |||||||||||  |||||||    
T  22321932 tgagacttgagttgtttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatg 22321834  T
Q  135 ctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgat 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22321833 ctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctattgat 22321734  T
Q  235 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 334  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321733 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 22321634  T
Q  335 atgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtg 434  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321633 atgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtg 22321534  T
Q  435 aattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22321533 aattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgaattgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtc 22321450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 14499628 - 14499111
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaa-tttaggtactaatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||| || |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14499628 cgagcacatctagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaa-tgaaactttaggtagtaatgagacctatctaag 14499530  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || |||||||  |  |||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14499529 atgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaattgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattagga 14499430  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14499429 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgataagatctgattatgcggttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttaattatcattgg 14499330  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14499329 atattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgccaatgtggctgttgtgggttatgtaaaatattaatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 14499230  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatt 499  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  14499229 tggttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgattggactgtgctactgctattatt 14499130  T
Q  500 taactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  14499129 taactaagtgcatgatgtc 14499111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 11855028 - 11854597
Alignment:
Q  9 tccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagatattaact 108  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  11855028 tccagaactgagtgtttttgaggagtttgagacttgagttgcttggattgtttaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaact 11854929  T
Q  109 gaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttga 208  Q
    |  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11854928 gttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttattga 11854829  T
Q  209 aaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattctta 308  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11854828 aaatgaattgatgttaagttgttgatatgatctgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattattatttgatattgtta 11854729  T
Q  309 tatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatg 408  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11854728 tatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtttatatgtcttatgaggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 11854629  T
Q  409 cttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11854628 ctccgtattaatattgttatgttgtgaattgc 11854597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 144 - 518
Target Start/End: Original strand, 4111204 - 4111572
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  4111204 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 4111297  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4111298 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 4111397  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaat 443  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4111398 ttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaat 4111497  T
Q  444 tgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4111498 tgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtc 4111572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 144 - 518
Target Start/End: Original strand, 4107352 - 4107720
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  4107352 tatactgtgaattaatgattaaatgcattagttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 4107445  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4107446 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 4107545  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaat 443  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4107546 ttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaat 4107645  T
Q  444 tgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4107646 tgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtc 4107720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 20461306 - 20461585
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461306 cgagcacttccagaactgagtgcatttaaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 20461405  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20461406 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaa 20461505  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20461506 gttgttgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 20461585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15482962 - 15482684
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15482962 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacttgagttgcttggattgattaggaaatgaactt-aggtactaatgagacctatttaaga 15482864  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15482863 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgctcaagaa 15482764  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15482763 attgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 15482684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 7793152 - 7793435
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgatta---ggaaatgaaatttaggtactaatgagacctattta 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7793152 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctattta 7793251  T
Q  98 agatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcag 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7793252 agatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttgttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaa 7793351  T
Q  198 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctg-attatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7793352 gaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgaattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 7793435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 326970 - 327250
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  326970 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattagaaaaggaaccttaggtactaatgagacctatttaaga 327069  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  327070 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaa 327169  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga-ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  327170 attgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatcttagttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 327250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 2897629 - 2897908
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||||||| || |||| |||||||||||    
T  2897629 cgagcacttccagaacttagtgcatttgaggagtttgagacctgagttgcttagattgattaggagtggaactttaggtaatagtgaggcctatttaaga 2897728  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  2897729 tgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattactggaattattattgaatgatcaagaa 2897828  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2897829 gttgatgaaaataaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 2897908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 31097360 - 31097640
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31097360 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaagattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactactgagacctatttaaga 31097459  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatga-aatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31097460 tattaactgagaactgtgaagcttttatgagaatgctaagtgattatgttgtgatatattgattgattccactacttgaattattgttgaatgatcaaga 31097559  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31097560 aattgttgaaaatgaattgttattaagctattgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactatgttgcatgagt 31097640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15965123 - 15964833
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  15965123 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 15965030  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15965029 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttg 15964930  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  15964929 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgttgtgaattgc 15964833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15969047 - 15968757
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  15969047 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 15968954  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15968953 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttg 15968854  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  15968853 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgttgtgaattgc 15968757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15972971 - 15972681
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  15972971 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 15972878  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15972877 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttg 15972778  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  15972777 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgttgtgaattgc 15972681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Original strand, 37439591 - 37439881
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  37439591 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 37439684  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37439685 ttatgctacaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattattatttgatatggttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 37439784  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37439785 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 37439881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 144 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19775919 - 19775630
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  19775919 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 19775826  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||     
T  19775825 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacatgtcgcctatgttgcta 19775726  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19775725 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgctatgttgtgaattg 19775630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 15849891 - 15850166
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || | ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15849891 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaagtttgagactttaggtacttggattgattaggattggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 15849990  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||| | ||| | | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15849991 tatttaatgagatcggtgaagcttttatgaaatgctaaatgattatattgtgatatatggattgattgcataacttgaattattgttgaatgatcaagaa 15850090  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgag 279  Q
     ||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15850091 attg-tgaaaatgaattgttattaaac--ttgatatgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgag 15850166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 280 - 440
Target Start/End: Original strand, 4588858 - 4589018
Alignment:
Q  280 ttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588858 ttgttgttgattatcatttgaaattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtg 4588957  T
Q  380 gaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588958 gaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 4589018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 11300317 - 11300539
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11300317 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggagtttgagacttgagttgcttggattgtttaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaaga 11300416  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  || ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11300417 tgttaactgttaattgtaaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaa 11300516  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  11300517 gttattgaaaatgaattgatatt 11300539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12339824 - 12339662
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12339824 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 12339725  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339724 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 12339662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 278 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 5223422 - 5223261
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5223422 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgctgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 5223323  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5223322 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 5223261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16796604 - 16796442
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16796604 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgaaatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 16796505  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16796504 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 16796442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 16797860 - 16798138
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  16797860 cgagcacttccagaactgagtgcatttgttgattgtgaggcctgagttgtttggattgattaggaaaggaactataggtactaatggaacctattaaaga 16797959  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16797960 tattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaaga 16798059  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||    
T  16798060 aattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaaactatgttgcatgagt 16798138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 278 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12470019 - 12469858
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12470019 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttcacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 12469920  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12469919 tggaaaatgtgtgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattg 12469858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 297 - 440
Target Start/End: Original strand, 11300532 - 11300675
Alignment:
Q  297 ttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttt 396  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11300532 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgttt 11300631  T
Q  397 aagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11300632 aagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 11300675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 324353 - 324191
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  324353 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 324254  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  324253 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 324191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 43889628 - 43889790
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43889628 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 43889727  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  43889728 tagaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtctctcattaatattgttatgttgtgaattgc 43889790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 16808687 - 16808965
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  16808687 cgagcacttccagaactgagtgcatttgttgattgtgaggcctgagttgtttgtattgattaggaaaggaactataggtactaatggaacctattaaaga 16808786  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  16808787 tattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatggtcaaga 16808886  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | |||||| |||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||| |||  |||||||| |||||  ||||||||||    
T  16808887 aattgttgcaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgttgcacttgttattaaactatattgcatgagt 16808965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17242272 - 17241995
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  |||    
T  17242272 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttaggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagaga 17242173  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  17242172 tattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaaga 17242073  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17242072 a-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagt 17241995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 52989724 - 52989886
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52989724 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 52989823  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  52989824 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 52989886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 18700309 - 18700471
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18700309 agttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatg 18700408  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18700409 tgggaaatgtatgatgtttaagtttttgatgtttctcattaatattgttatgttgtgaattgc 18700471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 38814684 - 38814409
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38814684 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggtttggttaggaaaggaactttaggtactaatgcgacctattaaaga 38814585  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  38814584 taatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggaatgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaaga 38814485  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38814484 aattgttgagaatgatttgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 38814409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 284 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 14966281 - 14966126
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 383  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14966281 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaa 14966182  T
Q  384 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    || | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  14966181 atatatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattg 14966126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 1982616 - 1982903
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||   ||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  1982616 cgagcacttccagaactgagtacatttgagaagtttgagacctgagttgtttggattggttaggaatggagccttaggtagtaatgtgacctaattaaga 1982715  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | ||||||| ||  ||||||| | ||||||| || ||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||| |   |     
T  1982716 tgttaactgcaatatgtgaagttgttatgaactgttaagttattgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaactatttttgaatgacctatat 1982815  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1982816 gttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttatagtgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagt 1982903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Original strand, 19725790 - 19726003
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||||| ||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  19725790 ttaggtagtaatgtgacccatttaagatgtcaactgaaatctgtgaaactgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattacatt 19725889  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt-------aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaa 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||       | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19725890 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgagtcatgctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 19725988  T
Q  266 ctaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||    
T  19725989 ctaagttgcatgagt 19726003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 278 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15465193 - 15465068
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15465193 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 15465094  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgt 403  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  15465093 tggaaaatgtatgatgtttatgttgt 15465068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 278 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14671041 - 14670914
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14671041 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 14670942  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttg 405  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  14670941 tggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 14670914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 278 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21837543 - 21837384
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21837543 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgatgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 21837444  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaat 437  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  21837443 tggaaaatgtatgatgtttatgttgttgatgcttttcatgaatattattatgttgtgaat 21837384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 11914018 - 11914180
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  11914018 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctggctatgttgttgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatg 11914117  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  11914118 tggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 11914180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3833974 - 3833699
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3833974 cgagcacttccagatttgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggtttggttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaaga 3833875  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |  | ||||  |||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |     
T  3833874 tgatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagc 3833775  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3833774 aattgttgagaatgacttgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 3833699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Original strand, 18383795 - 18384008
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18383795 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatcagtgaagctgttatgaactgttaagctgattttaatgtgatttaatgattaattgcatt 18383894  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaa 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||       ||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18383895 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 18383993  T
Q  266 ctaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||    
T  18383994 ctaagttgcatgagt 18384008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 17691711 - 17691872
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17691711 agttgatgttgataatcatttgatgttattatatc-tgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 17691809  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| || |  | |||||||||||||||  ||||||||    
T  17691810 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttcgttaatattgttatgtgttgaattgc 17691872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 322829 - 322616
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | | |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  322829 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactaagatctgtgaagctgttatgaagtgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 322730  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaa 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||       ||   | ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  322729 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatattgttgtgatctgattatgccgctattgttatttaa 322631  T
Q  266 ctaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||    
T  322630 ctaagttgcatgagt 322616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 3402761 - 3403049
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaa-tttaggtactaatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||| || | | |||||||||||  || ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3402761 cgagcacttccagaactaagtacttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtagg-aatgaaactttaggtagtaatgtgacctatttaag 3402859  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    || |||||||| | |||||||||||||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||| | |  |    
T  3402860 atgttaactgagacctgtgaagctattatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattccttgatttattcttgaataaccttg 3402959  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||||||||||||        ||| ||||   || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3402960 atgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 3403049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12496495 - 12496281
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  12496495 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 12496397  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 263  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||         ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  12496396 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttattt 12496298  T
Q  264 aactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||    
T  12496297 aactaagttgcatgagt 12496281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 3389741 - 3390029
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| || | | |||||||||||  || ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3389741 cgagcacttccagaactaagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatggaactttaggtagtaatgtgacctatttaaga 3389840  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| | |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||  | |  ||    
T  3389841 tgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaaaaaccttga 3389940  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||||||||||        ||| ||||   || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3389941 tgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 3390029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 278 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14682540 - 14682413
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14682540 agttgttgttgattatcatttgatcttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 14682441  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttg 405  Q
    ||||| ||    ||||||||||||||||    
T  14682440 tggaaaattgacgatgtttaagttgttg 14682413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 278 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16643290 - 16643135
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||  | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16643290 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttatgtgatgtctaagttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 16643191  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 433  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||    
T  16643190 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcagtaatattgttatgttgt 16643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11863031 - 11862817
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||  |||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  11863031 ttaggtattaatgtgacctatttaagatgttatttgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcatt 11862932  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgt--tgata------tgatctgattatgctgctattgttattta 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||| |  ||  | |||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11862931 acttgaaatattattgaatgaccaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttataatattttggtgatctgattatgctgctattgttattta 11862833  T
Q  265 actaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||    
T  11862832 actaagttgcatgagt 11862817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 54876389 - 54876554
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgccta---tgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgcctt 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  | |||   ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54876389 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtctatgttgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgcctt 54876488  T
Q  375 atgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||| ||||||    
T  54876489 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttccttaatattgttatgttgtaaattgc 54876554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Original strand, 11298407 - 11298620
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  11298407 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatttgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 11298505  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| | ||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11298506 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 11298604  T
Q  265 actaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||    
T  11298605 actaagttgcatgagt 11298620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 26190814 - 26190947
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26190814 cgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgtcatgacctgagttgcttggattgattaggaatggaactttaggtagtaatgagacctatttaaga 26190913  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatg 134  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  26190914 tgttaactgaaaattgtgaacctattttgaaatg 26190947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 11594945 - 11595232
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || | | |||||||||||  || ||||||||||||  || ||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  11594945 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggacatt-aggtagtaatgaaacctatttaaga 11595043  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  ||    
T  11595044 tgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttga 11595143  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||||||||||        ||| ||||   || || | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11595144 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 11595232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5223239 - 5223086
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  5223239 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 5223141  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5223140 aagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgtatgagt 5223086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11851810 - 11851605
Alignment:
Q  83 aatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaatt 181  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||  |||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  11851810 aatgtgacctatttaagatgttatctgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 11851711  T
Q  182 attattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 273  Q
    |||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||| |         ||||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11851710 attattgaatgaacaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctaattatgctactatcgttatttaactaagttg 11851612  T
Q  274 catgagt 280  Q
    |||||||    
T  11851611 catgagt 11851605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15465040 - 15464887
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  15465040 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 15464942  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15464941 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 15464887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 12037758 - 12038045
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||| |||||||  |||  ||    |  |||  || | || ||||||| ||    
T  12037758 cgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgtcgtgacctgagttgcttgaattgatttagaatggacccctgagtagcaacgtgatctatttagga 12037857  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | || | ||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  12037858 tgtttaatgaaatctgtgaaaccattttgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagatattattgaatgatcaaga 12037957  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtt 281  Q
     ||||||| ||||||||        ||| ||||   ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12037958 tgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgct-ttgttatttaactaagttgcatgagtt 12038045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14665570 - 14665425
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 233  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||   |||     |||||||    
T  14665570 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattttaaagttatactgttga 14665472  T
Q  234 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665471 tgtgatctgattatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 14665425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14668726 - 14668581
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta---ag-----ctgttga 233  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||   ||     |||||||    
T  14668726 attataatatgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttatactgttga 14668628  T
Q  234 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668627 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 14668581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 433 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 12891501 - 12891426
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12891501 tgaattgcaattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 12891426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 433 - 508
Target Start/End: Original strand, 17253067 - 17253142
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17253067 tgaattgcaattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 17253142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22652174 - 22652077
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22652174 tgttgttggttatgtgaaataattatatgcattatgtggaa-atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatactgttatgttgtgaattgc 22652077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Original strand, 35961596 - 35961694
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||    
T  35961596 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatatttttatgttgagaattgc 35961694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12339641 - 12339488
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  12339641 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 12339543  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    || |  |||||  ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12339542 aaac--ttgatgagaattgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 12339488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 11557190 - 11557478
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  || | | |||||||||||  || ||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||||     
T  11557190 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgaaacctatttaagg 11557289  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | ||| ||| || |||||||| | ||| ||| || |||| || || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| |    ||    
T  11557290 tgttagctggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaattaga 11557389  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtt 281  Q
     |||| || ||||||||        ||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11557390 tgttgatg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtt 11557478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 280
Target Start/End: Original strand, 8489459 - 8489555
Alignment:
Q  181 tattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8489459 tattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 8489555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Original strand, 11300696 - 11300849
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || |||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  11300696 ttatgaactgctaagttgtttgtaatttgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 11300794  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    || | ||| || |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11300795 aaac-gtt-atgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagttgcatgagt 11300849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 15941710 - 15941985
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| || |||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||  ||     
T  15941710 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgagagacttgagctgtttggattggttagaaaaggaactttaggtgctaatgagacctattagagg 15941809  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattga-ttgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    || | ||||  | || ||||| | ||||||| || |||  ||| || | ||||  ||| || ||||||| | |||||||| |||||  | | |||||| |    
T  15941810 taatgactgtgagctttgaagattttatgaactgttaaaggataatgaagtgaaatatggatttgattgcctttacttgatttattgctaattgatcaag 15941909  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||    ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15941910 aa-ttgttgaaaatgatttgttattaa--atttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 15941985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 16750543 - 16750668
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  16750543 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 16750636  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16750637 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgca 16750668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 7985801 - 7985716
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  7985801 tgaattgcaattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 7985716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16333267 - 16333182
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16333267 tgaattgcaattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 16333182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11854545 - 11854439
Alignment:
Q  171 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 270  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||| | || |||||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11854545 ttactcgaaatattattgaaagattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgccgcaattgttatttaactaag 11854449  T
Q  271 ttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||    
T  11854448 ttgcatgagt 11854439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15060605 - 15060427
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  | ||||| ||| || ||| || || || |||||||||| |  ||   ||||||| || || ||||||| |||||    
T  15060605 cgagcacttccaggactgattgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtattgtgacctatataaga 15060506  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttga 178  Q
    |  |||||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  15060505 tggtaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacttga 15060427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 16864939 - 16865101
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  16864939 cgagcacttccagaattgagtgttttagagaattgtgagacctgagatgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctatcaaaga 16865038  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgatt 163  Q
    || | | |   |||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||||||| ||||    
T  16865039 taatgattatgaactgtgaagattttatgaattgttaagagattatgaaatgatttatggatt 16865101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16910063 - 16909885
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||| || |   || ||| |||||||| |||||||||| |  ||   ||||||| ||||| |||||||  ||||    
T  16910063 cgagcacttctagaactgagtgcaagtgagaatgtcatgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatacaaga 16909964  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttga 178  Q
    | ||||||| || |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||    
T  16909963 tgttaactgcaatctgtgaagcttttatgaattgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattttattacttga 16909885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 1598286 - 1598560
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||  ||||||||   ||    
T  1598286 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgagagacttgagctgtttggattgattagaaaagggactttaggtgctaatatgacctattaggga 1598385  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattga-ttgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    || | ||||  |||||||| | | ||||||| || |||| ||| || |  |||  |||  | |||||||| || ||||| |||||| || | |||||| |    
T  1598386 taatgactgtgaactgtgatgattttatgaactgttaagggataatgaaatgaaatatgaatttgattgccttcacttg-attattgttaattgatcaag 1598484  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgata-ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    || ||||||||||||| ||| || ||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1598485 aa-ttgttgaaaatgatttgttatttaagc--ttgatgtgatttgattatgctgc-aatgttatttaactaagttgcatg 1598560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 346
Target Start/End: Original strand, 3265017 - 3265085
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttg 346  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3265017 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcatgagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttg 3265085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 5420315 - 5420391
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  5420315 tgaattgctattgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactttgctgctgctgttatttaactgagta 5420391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 5426713 - 5426789
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  5426713 tgaattgctattgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 5426789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12172864 - 12172820
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12172864 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 12172820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12173004 - 12172924
Alignment:
Q  114 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 193  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  12173004 ctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 12172924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Original strand, 14763736 - 14763800
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  14763736 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttga 14763800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Original strand, 23371482 - 23371546
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  23371482 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttga 23371546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 36527862 - 36527794
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttg 346  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36527862 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatatttatgtgttgcctatgttgctgttg 36527794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9577738 - 9577674
Alignment:
Q  281 tgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9577738 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgaga--tttatgtgttgcctatgttgctgttgt 9577674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 856449 - 856327
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| || ||| |||||||| |||||||||| |  ||   ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  856449 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 856350  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagct 123  Q
      ||||||| || ||||||||||    
T  856349 agttaactgcaatctgtgaagct 856327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14179489 - 14179427
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  14179489 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttg 14179427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 10325947 - 10325862
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  10325947 tgaattggaattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcataatgtc 10325862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15051756 - 15051655
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  15051756 ttaggtagtattgtgacctatataagatgttaactgcaatttgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcatt 15051657  T
Q  173 ac 174  Q
    ||    
T  15051656 ac 15051655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51300672 - 51300611
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  51300672 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgt 51300611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 13321066 - 13320984
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   |||||||   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13321066 tgaattgcaatttatatattgatatcatcctgttat---gtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 13320984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 346
Target Start/End: Original strand, 14568804 - 14568871
Alignment:
Q  279 gttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttg 346  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||||||||    
T  14568804 gttggtgttaattatcatttgatattcttatatcttgagatgtatatgtgctgcctgtgttgctgttg 14568871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 41871 - 41813
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  41871 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 41813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 210
Target Start/End: Original strand, 4589039 - 4589125
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaa 210  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4589039 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 4589125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16369721 - 16369543
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || | | ||  || |||||||| |||||||||| |   |   ||||||| ||||| || |||| |||||    
T  16369721 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgtcgtgatatgtgttgcttgaattgattagggatacacccttaggtagtaatgtgatctatataaga 16369622  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttga 178  Q
    | ||||||  ||  ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||    
T  16369621 tgttaactccaatatgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatcattaatttcattacttga 16369543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19775608 - 19775515
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 218  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  19775608 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 19775515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 24187871 - 24187789
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24187871 tgaattgcaattgatatattgatatc-atcccttat--tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 24187789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 42326180 - 42325965
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||||| | ||| ||| || ||| | | || ||||||||||||  |||| | ||||||    
T  42326180 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacttgtgaagttgttaagaactgttaacttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 42326081  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 264  Q
    |||||||||||| | |||| | |  || |||||||||||||||||| | ||| |         || || | ||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  42326080 acttgaattattctcgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgtttttta 42325981  T
Q  265 actaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||    
T  42325980 actaagttgcatgagt 42325965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Original strand, 10834105 - 10834174
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||| || ||||||||||    
T  10834105 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatttgctgccaatattgctgttgt 10834174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 28351173 - 28351258
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| || | |||| |||||||| |||||| ||| |||||    
T  28351173 tgaattgcaattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgttgctgccgttatttagctaagtgcataatgtc 28351258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37427833 - 37427764
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  37427833 agttgttgatgattatcatttgatactgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctgtgctgctgttgt 37427764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 326
Target Start/End: Original strand, 10542434 - 10542482
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  10542434 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatg 10542482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12482525 - 12482449
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  12482525 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 12482449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12511137 - 12511085
Alignment:
Q  228 tgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12511137 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 12511085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 15584730 - 15584806
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  15584730 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 15584806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 15591388 - 15591464
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  15591388 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 15591464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Original strand, 23053136 - 23053180
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23053136 tgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagt 23053180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 46822345 - 46822293
Alignment:
Q  228 tgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822345 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 46822293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Original strand, 14878574 - 14878609
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14878574 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 14878609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 839340 - 839270
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaa 506  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  839340 tgaattgcaattggtatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgctgctgctgttatttaactaa 839270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Original strand, 4589228 - 4589278
Alignment:
Q  230 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4589228 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagt 4589278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 400
Target Start/End: Original strand, 16325249 - 16325307
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  16325249 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttacgtggaaaatgtatgatgtttaagt 16325307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16697092 - 16696809
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || | ||||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  16697092 cgagcacttccagaagtgagtgttttagtggatcgtgagacctgagttgtttggattggttag-aaaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaag 16696994  T
Q  100 atatt-------aactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaa 190  Q
    ||| |       |||||  |||||||||||| ||||||| || ||| |||| || | |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || |||||    
T  16696993 ataatgattgtgaactgtgaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgatcatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaa 16696895  T
Q  191 tgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    |||||| |||  | |||| ||||  ||| | || | ||  |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16696894 tgatcaagaaactattgagaatgttttgttctttaact--tgatgtgatttgtttatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 16696809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19775419 - 19775369
Alignment:
Q  230 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19775419 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagt 19775369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20723095 - 20723013
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  20723095 tgaattgcaattgatatattgatatc-atctgttat--tgtgacctgactatgctgctgttgttatttaaataagtgcataatgtc 20723013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 55149072 - 55148990
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  55149072 tgaattgcaattgatacattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 55148990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 179
Target Start/End: Original strand, 23052996 - 23053061
Alignment:
Q  115 tgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 179  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  23052996 tgtgaagctattatgaaattttaagttgtttataatgtgatttaattattaattgcattacttgaa 23053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Original strand, 8928437 - 8928481
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  8928437 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 8928481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Original strand, 34852664 - 34852708
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  34852664 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 34852708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15051567 - 15051532
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15051567 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 15051532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15060343 - 15060308
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15060343 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 15060308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Original strand, 15878109 - 15878144
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15878109 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 15878144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15964812 - 15964745
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15964812 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 15964745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15968736 - 15968669
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15968736 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 15968669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15972660 - 15972593
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15972660 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 15972593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Original strand, 17525216 - 17525251
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17525216 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagt 17525251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28194802 - 28194743
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgtt 345  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  28194802 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtctatgttgctgtt 28194743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30029903 - 30029868
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30029903 tatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 30029868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 1333080 - 1333146
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  1333080 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 1333146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16633937 - 16633871
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16633937 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 16633871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16640547 - 16640481
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16640547 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 16640481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43161212 - 43161146
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  43161212 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 43161146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43167449 - 43167383
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  43167449 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 43167383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 48423454 - 48423388
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  48423454 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 48423388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 48430232 - 48430166
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  48430232 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 48430166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 15337493 - 15337456
Alignment:
Q  471 tgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15337493 tgtgacttgattatgctactgctgttatttaactaagt 15337456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 438
Target Start/End: Original strand, 14569023 - 14569122
Alignment:
Q  339 tgctgttgttgattatg-tgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaat 437  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||    
T  14569023 tgctgttgttggttatggtaaaatatgtatataccttatgtggaaaatgtatgatgttaaag-agttgatgtttgtcattattattcatatgttgtgaat 14569121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16690519 - 16690440
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac 81  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || | ||||  |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||| |||||||||    
T  16690519 cgagcacttccagaagtgagtgttttagtggatcgtgagacctgagttgtttggattggtta-gaaaggaactttaggtac 16690440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16909802 - 16909766
Alignment:
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16909802 ttatgctactattgttatttaaccaagttgcatgagt 16909766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 111)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 17810572 - 17810055
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17810572 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaaga 17810473  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810472 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgttaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 17810373  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810372 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 17810273  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810272 tattgttatatcctgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 17810173  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810172 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgaaattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 17810073  T
Q  501 aactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  17810072 aactaagtgcatgatgtc 17810055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 14757228 - 14757745
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||  | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14757228 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaagttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaaga 14757327  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14757328 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaa 14757427  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14757428 gttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 14757527  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14757528 tattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 14757627  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14757628 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttattt 14757727  T
Q  501 aactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  14757728 aactaagtgcatgatgtc 14757745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 9556830 - 9556313
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || | | ||| ||| || | |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  9556830 cgagcacttccagaattgagtgttttagtgcattgtgaaacttaagttgcttggatttgttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaag 9556732  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    ||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9556731 ataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattagtattgaatgatcagga 9556632  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556631 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 9556532  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556531 atattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 9556432  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9556431 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatt 9556332  T
Q  500 taactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  9556331 taactaagtgcatgatgtc 9556313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 4561139 - 4561657
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  4561139 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 4561237  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4561238 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattagg 4561337  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561338 aagttgttgaaaataaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 4561437  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561438 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 4561537  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4561538 gttgttgatgcttcacattaataatgttatgttgtgaatcgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 4561637  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  4561638 ttaactaagtgcatgatgtc 4561657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 5756743 - 5757261
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  5756743 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 5756841  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5756842 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 5756941  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5756942 aagttgttgaaaatgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 5757041  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757042 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 5757141  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc-aattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgtta 497  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5757142 gttgttggtgcttcacattaatattgttatgttgtggattgcaaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgtta 5757241  T
Q  498 tttaactaagtacatgatgt 517  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  5757242 tttaactaagtgcatgatgt 5757261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 33742678 - 33742163
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  33742678 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 33742580  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33742579 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 33742480  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
     ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33742479 gagttgttgaaa-tgaattggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 33742381  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33742380 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtctcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatt--tatgtcttatgtggaagatgtttgatgtttaa 33742283  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33742282 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgctgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 33742183  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  33742182 ttaactaagtgcatgatgtc 33742163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27534325 - 27533886
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  27534325 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggagtttgagacttgagttgcttggattgtttag-aaccgaactttaggtactaatgagacctatctgaga 27534227  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  || |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  27534226 tgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagttgttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaatcattattgaatgattaagaa 27534127  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27534126 gttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 27534027  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27534026 tattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 27533927  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgca 441  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  27533926 tgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgca 27533886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 36133768 - 36134047
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36133768 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttgggttgattaggaaagaaactttaggtattaatgagacctatttaaga 36133867  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36133868 tattaactgggaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgagttattattgaatgatcaggaa 36133967  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36133968 gttgttgaagatgaatggatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 36134047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Original strand, 14954122 - 14954412
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||| ||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  14954122 tatattgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattga 14954215  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14954216 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttg 14954315  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14954316 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgc 14954412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 1951567 - 1951845
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  1951567 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaagattgtgagacctgagttgtttgaattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctaataaaga 1951666  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| || | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1951667 tattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaaga 1951766  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1951767 aattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 1951845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25690021 - 25689731
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||| ||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  25690021 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattga 25689928  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25689927 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttg 25689828  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25689827 ttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgc 25689731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10713004 - 10712717
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  10713004 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 10712911  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10712910 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttg---attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 10712814  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10712813 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttgtgttgtgaattgc 10712717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10926774 - 10926487
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  10926774 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 10926681  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10926680 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttg---attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 10926584  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10926583 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttgtgttgtgaattgc 10926487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12487862 - 12487572
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||| ||||| |||||||||  ||| ||||  |||    
T  12487862 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgacatgaattga 12487769  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12487768 ttatgctgtaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 12487669  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12487668 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 12487572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 18222184 - 18222462
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18222184 cgagcacttccagaattgagtgtatttgaggattgtgagccctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaaga 18222283  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |     
T  18222284 taatgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaagg 18222383  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18222384 aattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 18222462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 17048136 - 17048298
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17048136 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 17048235  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17048236 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 17048298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 17152293 - 17152570
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||| || ||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  17152293 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacttgagttgtttggtttggttagggaaggaactttaggtgttaatgagacctattaaaga 17152392  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |     
T  17152393 tattgactgagaactgtgaagattttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaagg 17152492  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  17152493 aattgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagt 17152570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 18228659 - 18228937
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18228659 cgagcacttctagaattgagtgtatttgaggattgtgagccctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaaga 18228758  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |     
T  18228759 taatgactgagaactgtgaagcttttacgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgtctttacttgaattattattgaatgatcaagg 18228858  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | |||||| |||||||||| ||| ||||  ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18228859 aattgttggaaatgaattgttatgaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaatttttatttaactaagttgcatgagt 18228937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23139570 - 23139296
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  |||    
T  23139570 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttaggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagaga 23139471  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||| || | |||||| ||    
T  23139470 tattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccatacttgaattattgttaattgatcaaga 23139371  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23139370 a-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 23139296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Original strand, 26243473 - 26243746
Alignment:
Q  3 agcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagata 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||    
T  26243473 agcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtcagacctgagctgtttggattggttaggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagata 26243572  T
Q  103 ttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaggaag 201  Q
    || ||||| |||||||||||  ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  26243573 ttgactgagaactgtgaagcctttatgaattgttaagagattatgaaatgaaatatggaatgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaa 26243672  T
Q  202 ttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26243673 ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 26243746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 13591928 - 13592089
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13591928 agttgatgttgattatcatttgatattgttatattttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 13592027  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13592028 tggaa-atgtatgatgtttaagttgatgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgc 13592089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 43255967 - 43256120
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43255967 cgagcacttccagaaccgagtgcatttgaggatttttagacctaagttgcttggattgattaggagaggaaccttaggtactaatgagacctatttaaga 43256066  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 154  Q
    | |||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43256067 tgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 43256120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 277
Target Start/End: Original strand, 22634369 - 22634504
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatct 241  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22634369 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatct 22634468  T
Q  242 gattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22634469 gattatgctgctattgttaattaactaagttgcatg 22634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 14746585 - 14746747
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14746585 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 14746684  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  14746685 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 14746747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18237192 - 18236913
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||| | ||||    
T  18237192 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagtcgtttggaatggttaggaaaggaactttaggtgcaaataagacctactaaaga 18237093  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaag-ctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||  ||||| |||| |||||  | ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | |    
T  18237092 tatggactgagaactttgaagatttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgattaag 18236993  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    || ||||||| ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18236992 aaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 18236913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 19757407 - 19757682
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19757407 cgagcacttccagaactgagtacttttgaggattgtgagacctgagctgtttggtttggttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaaga 19757506  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19757507 taatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaaga 19757606  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19757607 aattgttgagaatgatttgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 19757682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19782399 - 19782124
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19782399 cgagcacttccagaactgagtacttttgaggattgtgagacctgagctgtttggtttggttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaaga 19782300  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19782299 taatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaaga 19782200  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19782199 aattgttgagaatgatttgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 19782124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3413096 - 3412820
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3413096 cgagcacttccagaactgaatgcttttgaggattgtgagacctgagtgatttggattggttaggagaggaaccttaggtactaatgagacctattaaaga 3412997  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg-attgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| | ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||| |||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||    
T  3412996 tattga-tgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaattatatttattgaattattgttgaatgatcaaga 3412899  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | || |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3412898 aattattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 3412820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 331 - 440
Target Start/End: Original strand, 43256213 - 43256322
Alignment:
Q  331 gcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 430  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43256213 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatatgt 43256312  T
Q  431 tgtgaattgc 440  Q
    ||||||||||    
T  43256313 tgtgaattgc 43256322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 16243206 - 16243481
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16243206 cgagcacttccagaattcagtgttttagaggattgtgagacctgagtggtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaaga 16243305  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||||||| | ||||||| || |||| |||| | |  |||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16243306 taatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattgtgaaatgaaatatggattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaaga 16243405  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16243406 aattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 16243481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 284 - 439
Target Start/End: Original strand, 15497043 - 15497198
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 383  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  15497043 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaa 15497142  T
Q  384 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15497143 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgagaattg 15497198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2015078 - 2014803
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||    
T  2015078 cgagcacttccagaattgagtgttttagaggattgtgagacctgagtggtttggattggttaggaaatgaactttaggtactaaggtgacctattaaaga 2014979  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||||||| | ||||||| || ||||  ||||| |  |||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  2014978 taatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaagaaattatgaaatgaaatatggattgattgcctttacttgaattattgtggaatgatcaaga 2014879  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||  ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2014878 aattgttgcgaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 2014803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Original strand, 16487956 - 16488170
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  16487956 ttaggtagtaatgtgtcctatttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaaatgcatt 16488055  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||        ||| |||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16488056 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaa-gaattgatattatgaagttatgctgcttttgtgatctgattatgctgctattgttattta 16488154  T
Q  265 actaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||    
T  16488155 actaagttgcatgagt 16488170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9530733 - 9530460
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||  | |||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9530733 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggaaaggttaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctattaaaga 9530634  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | || || |||||||||||| ||||||  || ||||||||||  |  |||  ||| || |||||| | ||||| |||||||| || | |||||| ||    
T  9530633 taatgaccgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattaggaaatgaaatatggagtgattgcctttactcgaattattgttaattgatcaaga 9530534  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 276  Q
    | ||||||| ||||| ||  ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  9530533 a-ttgttgagaatgatttattattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgtcatttaactaagttgcat 9530460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 15353112 - 15353400
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||| |||||| |||||    
T  15353112 cgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgttatgacctgagttgtttggattggttaggaatggaactttaggtagtaatgaaacctatctaaga 15353211  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat-cagg 198  Q
    | ||||||| ||  ||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||| || |  |    
T  15353212 tgttaactggaatttgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataatccttg 15353311  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15353312 atgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgctgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 15353400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Original strand, 16356831 - 16357044
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-taatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||  ||  |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  16356831 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttttttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 16356929  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16356930 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 16357028  T
Q  265 actaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||    
T  16357029 actaagttgcatgagt 16357044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 278 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10056757 - 10056653
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10056757 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 10056658  T
Q  378 tggaa 382  Q
    |||||    
T  10056657 tggaa 10056653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 280
Target Start/End: Original strand, 5338801 - 5339074
Alignment:
Q  16 ctgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaact 115  Q
    ||||||||||||||| || | | ||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||  ||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  5338801 ctgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgaattgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatct 5338900  T
Q  116 gtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 214  Q
    | |||||| |||||||    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||    
T  5338901 gagaagctgttatgaaccattaagctgattatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaagattttgttg-aaatga 5338999  T
Q  215 attgata---------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||         ||| ||||||| | ||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  5339000 attgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttgtgctgttattgttatttaactatgatgcatgagt 5339074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Original strand, 16348543 - 16348756
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || | || ||||||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  16348543 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagct-ttttaaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 16348641  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 264  Q
    |||| || ||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16348642 acttaaaatattattgaattatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 16348740  T
Q  265 actaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||    
T  16348741 actaagttgcatgagt 16348756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 284 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19857634 - 19857480
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 383  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||      
T  19857634 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcataagccttatgtggaga 19857535  T
Q  384 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaatt 438  Q
    || | |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  19857534 atatatgatatttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttgtgaatt 19857480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Original strand, 43256343 - 43256496
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  43256343 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 43256441  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  43256442 aagc--ttgatgtgatttgattatgctacaattgttatttaactaagttgcatgagt 43256496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 433 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 53433472 - 53433397
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53433472 tgaattgcaattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 53433397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15008309 - 15008211
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15008309 tgttgttggttatgtgaaataattatatatcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgc 15008211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Original strand, 15884123 - 15884221
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15884123 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgagaattgc 15884221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 280
Target Start/End: Original strand, 20157407 - 20157552
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttga 233  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||   || |     |||||    
T  20157407 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttataccgttga 20157505  T
Q  234 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20157506 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaatttgcatgagt 20157552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 344 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 40619872 - 40619776
Alignment:
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40619872 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtaagatgtttaggttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgtgaattgc 40619776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 11250367 - 11250654
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || | | |||||||||||  || |||||||||| |||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  11250367 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattagg-aatggacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 11250465  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| | || ||||| | ||| ||| || |||| || || ||||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||| |||||| | |  ||    
T  11250466 tgttaactgagacctatgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacatgaattattcttgaataaacttga 11250565  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||||||||||        ||| ||||   || || | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11250566 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 11250654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Original strand, 10694955 - 10695053
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10694955 tgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 10695053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Original strand, 10908721 - 10908819
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10908721 tgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 10908819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25555816 - 25555599
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  || | | |||||||||||  || ||||||||||||  || ||| ||||| |||||| || |||||||||    
T  25555816 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggacatt-aggtagtaatgaaacttatttaaga 25555718  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  ||    
T  25555717 tgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttga 25555618  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattg 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  25555617 tgttgttgaaaatgaattg 25555599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 280
Target Start/End: Original strand, 13812966 - 13813111
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttga 233  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |         |||||     
T  13812966 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttttaatgttgt 13813064  T
Q  234 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13813065 ggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 13813111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 354 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14650866 - 14650780
Alignment:
Q  354 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14650866 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgc 14650780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12570259 - 12570142
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 175  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12570259 ggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 12570160  T
Q  176 tgaattattattgaatga 193  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  12570159 tgaaatgttaatgaatga 12570142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 278
Target Start/End: Original strand, 28569251 - 28569526
Alignment:
Q  2 gagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||  || | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||| || || |||||||| ||||    
T  28569251 gagcacttccagaattgagtgttttagtggattgtgagacctgagttgtttggattggttag-aaaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaaga 28569349  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgcatt-acttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    || | | |   |||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | | ||||||||| || ||||||||||| |    
T  28569350 taatgattatgaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatactcacttgaattgttgttgaatgatcaag 28569448  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    ||  | |||| ||||| ||| |||| |   |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28569449 aaactattgagaatgatttgttatttaa--gttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 28569526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 18602551 - 18602715
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaag- 99  Q
    |||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||   ||||| || |||||| |  ||  |||||||||||| ||||||||| |||     
T  18602551 cgagcacttccaaaactgaatgtttttgaggattgtgagacctgagtgatttggaatggttaggagagtaaccttaggtactaataagacctattaaaga 18602650  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 165  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  18602651 atattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga 18602715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18212851 - 18212784
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgtt 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18212851 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgtt 18212784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40907189 - 40907122
Alignment:
Q  279 gttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttg 346  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  40907189 gttgatgttgattatcatttgatatttttatatcttgagatgtttatgtgttgcctgtgttgctgttg 40907122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 45938447 - 45938173
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||| || |||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||  | |    
T  45938447 cgagcacttccagaactaagtgcttttgaggattgagagacttgagctgtttggattggttagaaaaggaactttaggtgctaatgagacctattagaaa 45938348  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-taatgtgatttattga-ttgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |  | |||   |||||||||| | ||| ||| || |||| ||| | | |  |||  ||| || |||||||| ||||||| |||||| || | |||||| |    
T  45938347 tgatgactatgaactgtgaagattttacgaactgttaagagataattgaaatgaaatatggatttgattgccttacttg-attattgttaattgatcaag 45938249  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    || ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  45938248 aa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagatgcatg 45938173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Original strand, 24047301 - 24047370
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24047301 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttaagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 24047370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 35614033 - 35613948
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  35614033 tgaattgcaattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgatgttatttaactaagtgcataatgtc 35613948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 16351654 - 16351845
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  |  | | |||||||||||  || ||||||||||||  |||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16351654 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataaaatcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 16351753  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    | ||| | | ||  ||||||| | ||| ||| || |||| || || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  16351754 tgttagccggaatttgtgaagtttttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaat 16351845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 44675872 - 44675762
Alignment:
Q  75 taggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  44675872 taggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcatt 44675773  T
Q  173 acttgaattat 183  Q
    |||||| ||||    
T  44675772 acttgagttat 44675762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 14679056 - 14678974
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14679056 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 14678974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 14685264 - 14685182
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14685264 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 14685182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 23838527 - 23838445
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23838527 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--actcgactatgctactgctgttatttaactaagtgcataatgtc 23838445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 374
Target Start/End: Original strand, 52873150 - 52873240
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgcctt 374  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||| | |||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  52873150 tgttgattattatttgatgttgttataccttgaggtgtttaagtgttggctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgcctt 52873240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14185098 - 14185029
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  14185098 agttgatgttgattatcatttgatgatgttatatcttgagacgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 14185029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23843711 - 23843608
Alignment:
Q  82 taatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 179  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||     
T  23843711 taatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgttttaatgattaattgtattacttgag 23843612  T
Q  180 ttat 183  Q
    ||||    
T  23843611 ttat 23843608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 16678395 - 16678461
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaa 67  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16678395 cgagcacttccaaaactgagtatttttgagaagtttgaaacctgagttgcttggattgattaggaaa 16678461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 472 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20682207 - 20682161
Alignment:
Q  472 gtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20682207 gtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataatgtc 20682161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 281 - 347
Target Start/End: Original strand, 26045298 - 26045364
Alignment:
Q  281 tgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  26045298 tgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttttgtgctgcctattttgctgttgt 26045364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 281 - 347
Target Start/End: Original strand, 26050479 - 26050545
Alignment:
Q  281 tgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  26050479 tgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttttgtgctgcctattttgctgttgt 26050545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28385587 - 28385529
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28385587 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 28385529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 12299908 - 12299984
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  12299908 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 12299984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 12349584 - 12349660
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  12349584 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 12349660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 12522177 - 12522093
Alignment:
Q  434 gaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   ||||| || ||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12522177 gaattgcaattgatataatgatatcatcctgttgttatgttacttgactatgatgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 12522093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 278
Target Start/End: Original strand, 14708668 - 14708716
Alignment:
Q  230 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14708668 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 14708716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 17962335 - 17962411
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||    
T  17962335 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactgagta 17962411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25555548 - 25555504
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25555548 tgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 25555504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26013496 - 26013440
Alignment:
Q  384 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  26013496 atgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 26013440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 40907027 - 40906983
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40907027 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtg 40906983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Original strand, 18609169 - 18609290
Alignment:
Q  25 tttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaag-atattaactgaaaactgtgaagct 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||   ||||| || |||| | |  ||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18609169 tttgaggattgtgagacctgagtgatttggaatggttagaagagtaaccttaggtactaataagacctattaaagaatattgactgagaactgtgaagct 18609268  T
Q  124 attatgaaatgctaagtgattat 146  Q
     ||||||| || |||||||||||    
T  18609269 -ttatgaattgttaagtgattat 18609290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 41385757 - 41385839
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||  |||||||||||| || | |||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  41385757 tgaattgcaattgatatattgatatc-atccgttat--tgtgacttgactatgttgctgcggttatttaactaagtgcataatgtc 41385839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 55795544 - 55795478
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||| || | || |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||    
T  55795544 ttgatatattgatatctctttgctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactgagta 55795478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15224866 - 15224821
Alignment:
Q  230 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgca 275  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15224866 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgca 15224821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 284 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 30146499 - 30146454
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgt 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  30146499 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgt 30146454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 35170723 - 35170638
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35170723 tgaattgtaattgatacaatgatatcatcctgttgttgtgtcacttgcctatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 35170638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 42997256 - 42997532
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtact-aatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| |||| |  || | | ||| |||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||  |||||||||| |||| |||||||| |||    
T  42997256 cgagcacttccagaattgagagttttagtgcattgtgagacctgagttgtttggaattgttag-aaatgagctttaggtacttaatgtgacctattaaag 42997354  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcag 197  Q
    ||| | |     |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || || ||||||||     
T  42997355 ataatgatcatgaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaa 42997453  T
Q  198 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    |||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  42997454 gaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatga 42997532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Original strand, 4831543 - 4831587
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  4831543 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 4831587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Original strand, 4834838 - 4834882
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  4834838 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 4834882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12570082 - 12570038
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12570082 tgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagt 12570038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14047752 - 14047708
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  14047752 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 14047708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Original strand, 14954433 - 14954500
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  14954433 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 14954500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15093834 - 15093799
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15093834 tatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagt 15093799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 171
Target Start/End: Original strand, 15125060 - 15125130
Alignment:
Q  103 ttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcat 171  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15125060 ttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcat 15125130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23843537 - 23843502
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23843537 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagt 23843502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25689710 - 25689643
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  25689710 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 25689643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 471 - 518
Target Start/End: Original strand, 30235225 - 30235272
Alignment:
Q  471 tgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30235225 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 30235272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8384919 - 8384853
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  8384919 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 8384853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8391574 - 8391508
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  8391574 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 8391508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14073915 - 14073849
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  14073915 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 14073849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15225035 - 15224962
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 218  Q
    |||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  15225035 tataatatgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgaccaagatgttgtt-aaaatgaattg 15224962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 15256693 - 15256627
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  15256693 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 15256627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 17089999 - 17090065
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  17089999 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgttgttatttaactaagta 17090065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 17808498 - 17808432
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  17808498 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 17808432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 29040920 - 29040986
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  29040920 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 29040986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 328
Target Start/End: Original strand, 32306997 - 32307047
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32306997 agttgatgttgattattatttaatattgttatatcttgagatgtttatgtg 32307047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13569561 - 13569524
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13569561 tatgctgttattgttatttaactatgttgcatgagttg 13569524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Original strand, 53631320 - 53631420
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttata--tgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    |||||||| | |||||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  53631320 tgttgttggtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattg 53631419  T
Q  440 c 440  Q
    |    
T  53631420 c 53631420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16043131 - 16043087
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtt 322  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  16043131 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 16043087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 282
Target Start/End: Original strand, 16240032 - 16240064
Alignment:
Q  250 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 282  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16240032 tgctattgttatttaattaagttgcatgagttg 16240064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Original strand, 3682 - 4194
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  3682 cgagcacatccagaattgagtgc-tttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctgaga 3780  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3781 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 3880  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3881 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 3980  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3981 tattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttaatgtttaagt 4080  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4081 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttatgaattgaaattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 4180  T
Q  501 aactaagtacatga 514  Q
    ||||||||||||||    
T  4181 aactaagtacatga 4194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 86)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 1011023 - 1010506
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1011023 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaaga 1010924  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1010923 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaa 1010824  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010823 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 1010724  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010723 tattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 1010624  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1010623 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttattt 1010524  T
Q  501 aactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  1010523 aactaagtgcatgatgtc 1010506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 21407656 - 21407138
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  21407656 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 21407558  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21407557 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 21407458  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21407457 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 21407358  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21407357 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 21407258  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21407257 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 21407158  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  21407157 ttaactaagtgcatgatgtc 21407138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 16375263 - 16375782
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  16375263 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 16375361  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16375362 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 16375461  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16375462 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 16375561  T
Q  299 ga-tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 397  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16375562 gaatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttta 16375661  T
Q  398 agttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgtta 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16375662 agttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctatattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgtta 16375761  T
Q  498 tttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  16375762 tttaactaagtgcatgatgtc 16375782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 52639842 - 52639324
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  52639842 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattatgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 52639744  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52639743 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 52639644  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  52639643 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattc 52639544  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52639543 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtggaagatgtttgatgtctaa 52639444  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52639443 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 52639344  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  52639343 ttaactaagtgcatgatgtc 52639324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Original strand, 20228615 - 20229054
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  || | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  20228615 cgagcacatccagaattgagtgttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaag 20228713  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    ||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20228714 ataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 20228813  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20228814 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 20228913  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20228914 atattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 20229013  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20229014 ttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgc 20229054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 16080250 - 16080529
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16080250 cgagcacttccagaactgagtgcattcgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 16080349  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
     ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16080350 gattaactgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattggatgatcaagaa 16080449  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16080450 gttgttgaaaatgaattgataataagttattgatgtgatctgattatgctgctatttttaattaactaagttgcatgagt 16080529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 36819114 - 36819394
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36819114 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaagtttgaaacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 36819213  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36819214 tattaaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattatattgtgatttatttattgattgcatttcttgaattattattgaatgatcaagaa 36819313  T
Q  201 gttgttgaaaatgaa-ttgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36819314 gttgttgaaaatgaatttgatattaagctggtgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 36819394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 23819105 - 23819457
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||| || |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23819105 cgagcacttccagaactgagtgtttttgaagattgtgagacctgagtggtttggaatggttaggaaaggaaccttaggtgctaatgagacctattaaaga 23819204  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23819205 tattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggattgattgtctttacttgaattattattgaatgatcaaga 23819304  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23819305 aattgctgaaaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaacgaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 23819402  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattat 354  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23819403 atattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttat 23819457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 24782906 - 24783185
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | | || |||||| ||||||||||||  ||| |||| ||  || ||||||||| ||||||    
T  24782906 cgagcacttctagaactgagtgcatttgagaagtttgaggctttaggtgcttgaattgattaggaatggaactttaagttatagtgagacctacttaaga 24783005  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24783006 tgttaactgaaaattgtgaagctgttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattaattaattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaa 24783105  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24783106 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttcatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 24783185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Original strand, 1925084 - 1925374
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  1925084 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 1925177  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1925178 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 1925277  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1925278 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 1925374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Original strand, 20924098 - 20924388
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  20924098 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 20924191  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20924192 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 20924291  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20924292 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 20924388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19212167 - 19211889
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19212167 cgagcacttccaaaactgagtgcatttgaggattgtgagacctgagttgcttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctataaaaga 19212068  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19212067 tattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaaga 19211968  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19211967 aattgttgagaatgaattgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 19211889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33797833 - 33797680
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33797833 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattaattaggagaggaaccttaggtactaatgagacctatttaaga 33797734  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 154  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33797733 tgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 33797680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 278 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 48603571 - 48603420
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  48603571 agttgttgttgattatcatttgatattgttagatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggctatgtgaaatatttatatgccttatg 48603472  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatg 429  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603471 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatg 48603420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 278 - 439
Target Start/End: Original strand, 27653224 - 27653385
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27653224 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 27653323  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    | ||| || | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27653324 tagaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 27653385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12647169 - 12646895
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| | || |||||| ||| |||||||||||  |||    
T  12647169 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttaggaaa-ggaacttaggtgctagtgagacctattggaga 12647071  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  12647070 tattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaaga 12646971  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    | ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  12646970 a-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatga 12646895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 22449071 - 22449358
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||   ||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  22449071 cgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaatggacccttaggtagtaatgtgacatatataaga 22449170  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | ||||||| || |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  22449171 tgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacttgaaatattattgaatgatcaaga 22449270  T
Q  200 agttgttgaaaa----tga-at--tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     |||||||||||    ||| ||  ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22449271 tgttgttgaaaagtattgatattatgaaattatgctcttgttgtgatctgattatgctgctactattatttaactaagttgcatgagt 22449358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 278 - 436
Target Start/End: Original strand, 13881383 - 13881541
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13881383 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 13881482  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 436  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13881483 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaa 13881541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 284 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 51326905 - 51326749
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 383  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  51326905 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggtgctgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaa 51326806  T
Q  384 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  51326805 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 51326749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 46975767 - 46975494
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  46975767 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggtttggttaggaaatgaactttaggtactaatgtgacctattaaaga 46975668  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||| ||||| | ||||||  || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  46975667 taatgactgtgaactatgaagtttttatgacctgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgtctttacttgaattattgttgaatgatcaaga 46975568  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgca 275  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  46975567 aattgttgagaatgatttgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgca 46975494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18882667 - 18882393
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  |||    
T  18882667 cgagcacttcaagaactgagtgcttttgaggattgcgagacctgagctgtttggattggttaggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagaga 18882568  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||||||||| || ||||||||  ||||||| || |||| |||||| |   ||  ||| || | |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18882567 tattaactgagaattgtgaagcctttatgaattgttaagagattatgaaaagaaatatggaataattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaaga 18882468  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 276  Q
    | ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  18882467 aattgttgataatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgaaaatgttatttaactaagttgcat 18882393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 18181926 - 18182213
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||| || ||| || || |  |||||||||| |  ||   ||||||| ||||| ||| | | |||||    
T  18181926 cgagcacttccagaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacttgtataaga 18182025  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
      ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18182026 agttaactgcaaactgtgaagctgttatgagatgctaagttgtttataatgtgattcaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga 18182125  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| |||| ||||||||        ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18182126 tgttgttg-aaataaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 18182213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 334 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 33797584 - 33797478
Alignment:
Q  334 tatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 433  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33797584 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttcacattaatattgttatgttgt 33797485  T
Q  434 gaattgc 440  Q
    |||||||    
T  33797484 gaattgc 33797478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48520629 - 48520468
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48520629 agttgatgttgtttattatttgatattgttatatc-tgagatgttcatgttctacctatgttgctgctgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 48520531  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  48520530 tggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgatatgttgtgaattgc 48520468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20138383 - 20138105
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| |||| |  || ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20138383 cgagcacttccagaattgagagttttagaggattgtgagacctgagtggtttggattggttagggaaggaactttaggtactaatgagacctattaaaga 20138284  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || ||||||  |||||||||| | ||||||| || |||| |||| | |  |||  ||| ||||| ||| | || ||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  20138283 taataactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattttgaaatgaaatatggattggttgcctttgcttgaattattgttgaatgttcaaga 20138184  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20138183 aattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 20138105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12271657 - 12271511
Alignment:
Q  294 catttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatg 393  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12271657 catttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggaaaatgtatgatg 12271558  T
Q  394 tttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12271557 tttaagttgttgatacttttcattaattttgttatgctgtgaattgc 12271511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 8761442 - 8761658
Alignment:
Q  5 cacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagatatt 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |  | | |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||    
T  8761442 cacttccagaactgagtgcttttgagaacgtcgtgacctgagttgcttggattggttaggaatggaactttaggtagtagtgaaacctatataagatgtt 8761541  T
Q  105 aactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagtt 203  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||| |  |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||    
T  8761542 aaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctaattatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaagatgtt 8761641  T
Q  204 gttgaaaatgaattgata 221  Q
    |||| |||||||||||||    
T  8761642 gttg-aaatgaattgata 8761658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 17678393 - 17678678
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||| || | |||| |||||||||    
T  17678393 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacatatttaaga 17678492  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||||| |||| | ||| || |||| || |||| || || |||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  17678493 tgttaactgaaatctgtaaggctgtt-tgaactgttaagttgtttgtaatgttatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattaaga 17678591  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| |||||||||| | ||| |        ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17678592 tgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 17678678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 45310172 - 45310461
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||  | | | ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||||| | |||||||||||    
T  45310172 cgagcactttcagaactgagtgcttttgagattgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgtggcctatttaaga 45310271  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| | |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||| | |  ||    
T  45310272 tgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattgcttgatttattcttgaataaccttga 45310371  T
Q  200 agttgttgaaaatg-aattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||| ||||| |        ||||   || || | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  45310372 agttgttgaaaatgaaattgttgttatggaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgtcgttatttaactaagttgcatgagt 45310461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 18393769 - 18394058
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||||||  | | | ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18393769 cgagcacttatagaacggagtgcttttgagattgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgtgacctatttaaga 18393868  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| | |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||| | |  ||    
T  18393869 tgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttga 18393968  T
Q  200 agttgttgaaaatgaa----ttgatat-----taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||| ||    ||| |||     ||   || || | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18393969 agttgttgaaaataaaattgttgttatggaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 18394058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 282 - 405
Target Start/End: Original strand, 41781594 - 41781718
Alignment:
Q  282 gttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtgg- 380  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41781594 gttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 41781693  T
Q  381 aagatgtttgatgtttaagttgttg 405  Q
    || ||||  ||||||||||||||||    
T  41781694 aaaatgtacgatgtttaagttgttg 41781718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Original strand, 46198433 - 46198531
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  46198433 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgaggcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 46198531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33797457 - 33797304
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||| | ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  33797457 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattaatcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 33797359  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33797358 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 33797304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 433 - 508
Target Start/End: Original strand, 50887763 - 50887838
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50887763 tgaattgcaattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 50887838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Original strand, 3472804 - 3473015
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  | || |||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| | || |||    
T  3472804 ttaggtagtaatgtgacctatt-aagatgttaatgggaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgtttgaaatgtgatttaatgattaaatgaatt 3472902  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgata------tgatctgattatgctgctattgttatttaac 266  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||| |  ||| |||      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3472903 acttgaaatattgttgaatgatcaagatgttgttg-aagtgatttgatattatgaagttaatactcttgtgatctgattatgctgctattgttatttaac 3473001  T
Q  267 taagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||    
T  3473002 taagttgcatgagt 3473015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Original strand, 29764346 - 29764444
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  29764346 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgttttcaattaatattgttatgttgtgaattgc 29764444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 50000817 - 50000719
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  50000817 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgtgaattgc 50000719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 45489549 - 45489836
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || | | |||||||||||  || |||||||||| |||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  45489549 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattagg-aatggacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 45489647  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| | |||||||| | ||| ||| || |||| || || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| | |||| | |  ||    
T  45489648 tgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattctcgaataaacttga 45489747  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||||||||||        ||| ||||   || || | ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  45489748 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctattatttaactaagttgcatgagt 45489836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 331 - 412
Target Start/End: Original strand, 22130961 - 22131043
Alignment:
Q  331 gcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatg-tttaagttgttgatgcttc 412  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22130961 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttttaagttgttgatgcttc 22131043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6152169 - 6151976
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| || ||| || || || |||||||||| |  ||   ||||||| ||||| ||||||| || ||    
T  6152169 cgagcacttccagaactgaatgcatgttaggatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatatagga 6152070  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 193  Q
    | |||| || || |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  6152069 tgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgtttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttagtgaatga 6151976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21022879 - 21022767
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  21022879 ttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagctgattataatgtgaattaatgattaattgcatt 21022780  T
Q  173 acttgaattatta 185  Q
    ||||||| |||||    
T  21022779 acttgaaatatta 21022767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 3704870 - 3705157
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||  || ||  ||||||| ||| ||||||||  ||||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3704870 cgagcacttccagaaccgagtgcttttgacaatgttatgacctgatttgtttggattggctaggaatggaactttaggtagtaatgaaacctatttaaga 3704969  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | ||| | | || |||||||| | ||| ||| |  |||| || || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  ||    
T  3704970 tgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactattaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactaga 3705069  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| ||||||||        ||| |||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3705070 tgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattttgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 3705157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 284 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 43543241 - 43543144
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 381  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43543241 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtgga 43543144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 22831183 - 22831375
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||| || ||| || || ||  ||| ||||| |  ||   ||||||| ||||| ||||||| || ||    
T  22831183 cgagcacttcctgaactgagtgcaattgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgacttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatatagga 22831282  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 193  Q
    | |||| || || |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  22831283 tgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 22831375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 21305614 - 21305563
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgctt 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21305614 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgctt 21305563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22124404 - 22124338
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22124404 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgt 22124338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 39244096 - 39244221
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||  ||||||| |  ||||||||  |||    
T  39244096 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattcttattaagtt--tgatatgaattga 39244189  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39244190 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgca 39244221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 39247651 - 39247776
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||  ||||||| |  ||||||||  |||    
T  39247651 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattcttattaagtt--tgatatgaattga 39247744  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39247745 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgca 39247776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Original strand, 41388196 - 41388321
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||  |||||||||  ||||| ||  |||    
T  41388196 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaatttttattaagct--tgatacgaattga 41388289  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41388290 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgca 41388321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 19104847 - 19104762
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19104847 tgaattgcaattgatataatgatatcatcatgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 19104762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 19111504 - 19111419
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19111504 tgaattgcaattgatataacgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 19111419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Original strand, 20437995 - 20438064
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20437995 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgaggtgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 20438064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20958227 - 20958158
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20958227 agttgatgttgattatcatttgatattgtcatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 20958158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Original strand, 42865092 - 42865200
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 174  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| |||||||| | |||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42865092 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaaggttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 42865191  T
Q  175 ttgaattat 183  Q
    |||| ||||    
T  42865192 ttgagttat 42865200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16372108 - 16372044
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  16372108 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttga 16372044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 23763305 - 23763223
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23763305 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 23763223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28312633 - 28312564
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||||    
T  28312633 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtctatgttgatgttgt 28312564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 18626285 - 18626361
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  18626285 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 18626361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 210
Target Start/End: Original strand, 20229075 - 20229161
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaa 210  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20229075 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 20229161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 21043294 - 21043352
Alignment:
Q  289 attatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21043294 attatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgt 21043352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 20525226 - 20525311
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  20525226 tgaattgtaattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgttgctgttgttatttaactaagtgcataatgtc 20525311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 281
Target Start/End: Original strand, 33050074 - 33050119
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtt 281  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33050074 tgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtt 33050119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 27898669 - 27898745
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  27898669 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 27898745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 43063286 - 43063362
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  43063286 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 43063362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 44756201 - 44756125
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  44756201 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 44756125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 49334668 - 49334592
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  49334668 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 49334592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 21437888 - 21437818
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaa 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21437888 tgaattgcaattgatatattgatatc-atccattat--tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaa 21437818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Original strand, 21788081 - 21788135
Alignment:
Q  226 gctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21788081 gctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagt 21788135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14800648 - 14800583
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  14800648 agttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcatatgttgctg 14800583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14809522 - 14809457
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  14809522 agttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcatatgttgctg 14809457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21313185 - 21313149
Alignment:
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21313185 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 21313149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 32649824 - 32649780
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  32649824 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 32649780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 327
Target Start/End: Original strand, 2332982 - 2333025
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  2332982 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgt 2333025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20135250 - 20135215
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20135250 tatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagt 20135215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 348
Target Start/End: Original strand, 20454554 - 20454625
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatg-tttatgtgtcgcctatgttgctgttgtt 348  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | |||| || ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20454554 agttgatgttgattgtcatttgatattgttataccatgagctgttttatgtgctgcctatgttgctgttgtt 20454625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 348
Target Start/End: Original strand, 21533877 - 21533944
Alignment:
Q  281 tgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgtt 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||   || ||||||| |||||||    
T  21533877 tgttgttgattattatttgatattgttatatcctaagaagtttatgtactgcgtatgttgttgttgtt 21533944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Original strand, 22468754 - 22468789
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22468754 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 22468789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 43078525 - 43078459
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  43078525 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 43078459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6151905 - 6151872
Alignment:
Q  247 tgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6151905 tgctgctattgttatttaactacgttgcatgagt 6151872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 280
Target Start/End: Original strand, 20229208 - 20229314
Alignment:
Q  172 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 271  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  | || |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20229208 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaacttttgagaatgatttgttatttaact--taatgtgatttgattatgctggaattgttatttaactaagt 20229305  T
Q  272 tgcatgagt 280  Q
    |||| ||||    
T  20229306 tgcaagagt 20229314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21022688 - 21022655
Alignment:
Q  247 tgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21022688 tgctgctattgttatttaactatgttgcatgagt 21022655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 280
Target Start/End: Original strand, 22831446 - 22831479
Alignment:
Q  247 tgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22831446 tgctgctattgttatttaactatgttgcatgagt 22831479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 33049893 - 33049989
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  || | |  ||||||||||  || |||||||||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  33049893 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataatgtcgtaacctgagttgaatgaattgattagg-aatgaacattaggtagtaatgaaacctatttaa 33049989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 8305231 - 8305152
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||| |  |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  8305231 tgaattgcaattgatatattgatatc-atccgttgt--tgtgacttgactgtg---ctgctgttgtttaactaagtgcataatgtc 8305152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16381300 - 16381256
Alignment:
Q  279 gttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgttt 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  16381300 gttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 16381256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29534661 - 29534617
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  29534661 tgttgattatcatttgatatcgttatatcttgagatgtctatgtg 29534617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 93)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 10101451 - 10101966
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10101451 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatgaattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaaga 10101550  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10101551 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 10101650  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10101651 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 10101750  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10101751 tattgttatatcctgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 10101850  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 500  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10101851 tgttgatgtttcacattaatattgttatgttgtgaattgaaattgatatattgata--tctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 10101948  T
Q  501 aactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  10101949 aactaagtgcatgatgtc 10101966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27602097 - 27601579
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  27602097 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 27601999  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601998 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 27601899  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27601898 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 27601799  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601798 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 27601699  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27601698 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 27601599  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  27601598 ttaactaagtgcatgatgtc 27601579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 12901318 - 12901835
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || | | ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  12901318 cgagcacttccagaattgagtgttttagtgcattgtgagacttgagttgcttagattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaag 12901416  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    ||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901417 ataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattagga 12901516  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901517 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 12901616  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901617 atattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 12901716  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12901717 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatt 12901816  T
Q  500 taactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  12901817 taactaagtgcatgatgtc 12901835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 518
Target Start/End: Original strand, 24628320 - 24628802
Alignment:
Q  36 tgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatg 134  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||| | | ||  || |||||||||||  |||||||    
T  24628320 tgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatg 24628418  T
Q  135 ctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgat 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24628419 ctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattgcttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttaat 24628518  T
Q  235 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 334  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24628519 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 24628618  T
Q  335 atgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtg 434  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24628619 atgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtg 24628718  T
Q  435 aattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24628719 aattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtc 24628802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 27379238 - 27379755
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  27379238 cgagcacttccagaattgagtgtctttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 27379336  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27379337 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaatgatcagg 27379436  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379437 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 27379536  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379537 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 27379636  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27379637 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgcgaattgcaattgatatattgatatctctct-ttgttgtgtgatttgactgtgttactgctgttat 27379735  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  27379736 ttaactaagtgcatgatgtc 27379755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 27383284 - 27383801
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  27383284 cgagcacttccagaattgagtgtctttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 27383382  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27383383 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaatgatcagg 27383482  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383483 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 27383582  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383583 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 27383682  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27383683 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgcgaattgcaattgatatattgatatctctct-ttgttgtgtgatttgactgtgttactgctgttat 27383781  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  27383782 ttaactaagtgcatgatgtc 27383801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 24649657 - 24649140
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||  | |||||||| |||    
T  24649657 cgagcacttccagaattgagtgttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagcgtgacctattaaag 24649559  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    ||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24649558 ataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattagga 24649459  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24649458 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 24649359  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24649358 atattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctaggttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgcttaag 24649259  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24649258 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttact 24649159  T
Q  500 taactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  24649158 taactaagtgcatgatgtc 24649140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Original strand, 41530815 - 41531249
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  41530815 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 41530913  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41530914 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaag 41531013  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    | ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41531014 atgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 41531107  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41531108 gatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttactgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaa 41531207  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  41531208 gttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgc 41531249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24735703 - 24735424
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735703 cgagcacttccagaactgattgcatttgaggattttgacacccgagttgcttggattgattaagaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 24735604  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24735603 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatcgcattacttgaattattattgaatgatcaagaa 24735504  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24735503 gttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 24735424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 19688562 - 19688779
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688562 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaactttaggtactaatgagacctatttaaga 19688661  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19688662 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaa 19688761  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattg 218  Q
     |||||||| ||||||||    
T  19688762 attgttgaagatgaattg 19688779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Original strand, 30344946 - 30345236
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  30344946 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 30345039  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30345040 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 30345139  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30345140 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 30345236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1283540 - 1283250
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  1283540 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 1283447  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1283446 ttatgctgcaattgttgttaatctaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 1283347  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1283346 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 1283250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 278 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31345235 - 31345075
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31345235 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 31345136  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaatt 438  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31345135 tggaagatgtatgatgtttaagttgttaatgcttcacactaatattgttatgttgtgaatt 31345075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 23069285 - 23069447
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23069285 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 23069384  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23069385 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgc 23069447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 23707290 - 23707452
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23707290 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcattatg 23707389  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  23707390 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 23707452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24918229 - 24918067
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24918229 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 24918130  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  24918129 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 24918067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 34874214 - 34874376
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34874214 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgccgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 34874313  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    || || |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  34874314 tgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 34874376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 22460996 - 22461272
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| | || |||||| ||| |||||||||||  |||    
T  22460996 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttaggaaa-ggaacttaggtgctagtgagacctattggaga 22461094  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  22461095 tattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaaga 22461194  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22461195 a-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagt 22461272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24671114 - 24670952
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  24671114 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtactgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgggttatg 24671015  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  24671014 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 24670952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27472538 - 27472376
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27472538 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 27472439  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  27472438 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttgtgaattgc 27472376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24681533 - 24681371
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24681533 agttgatgttgatcatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 24681434  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24681433 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcgtcattagtattgttatgttgtgaattgc 24681371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 276 - 440
Target Start/End: Original strand, 22459562 - 22459726
Alignment:
Q  276 tgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgcctta 375  Q
    |||| ||||| ||| | ||||||||| || ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22459562 tgagatgttgatgactttcatttgatgttgttatatctttagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgtcggttatgtgaaatatttatatgcctta 22459661  T
Q  376 tgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22459662 tgtggaaaatgtataatgttgaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 22459726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 21081738 - 21081900
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21081738 agttgatgttgattatcatttgatgtttttatatctttagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatg 21081837  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    || || |||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  21081838 tgaaaaatgtatgatgtttaagttattgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 21081900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Original strand, 18855268 - 18855541
Alignment:
Q  2 gagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||    
T  18855268 gagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttaggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagat 18855367  T
Q  102 attaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | | ||||| |||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |  |||  |||  | |||||| | |||||||||||||| || | |||||| |||    
T  18855368 aatgactgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaaatgaaatatgaagtgattgcctttacttgaattattgttaattgatcaagaa 18855467  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
     ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  18855468 -ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttgtttaactaagttgcatg 18855541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 278 - 438
Target Start/End: Original strand, 18358735 - 18358895
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  18358735 agttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtaccgcctatgttgctgttgttggttttgtgaaatgtttatatgccttatg 18358834  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaatt 438  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  18358835 tggaaaatgtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattattatgttgtgaatt 18358895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23187375 - 23187097
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23187375 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttgggaaggttaggaaaggaatcttaggtactaatgagacctattaaaga 23187276  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||||||||| ||||||  || ||||||||||| | |||| || | |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23187275 taatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtggattaattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaaga 23187176  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |  | |||| ||||| ||  |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  23187175 aactattgagaatgattttttatttaac--ctgatatgatttgattatgctgcaattgttattaaaccaagttccatgagt 23187097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23598638 - 23598360
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23598638 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttgggaaggttaggaaaggaatcttaggtactaatgagacctattaaaga 23598539  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||||||||| ||||||  || ||||||||||| | |||| || | |||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23598538 taatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtggattaattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaaga 23598439  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |  | |||| ||||| ||  |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  23598438 aactattgagaatgattttttatttaac--ctgatatgatttgattatgctgcaattgttattaaaccaagttccatgagt 23598360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 24716336 - 24716621
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  24716336 cgagcacttctagagccgagtgcaattgagaatgttgagacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatttaaga 24716435  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||||| |||||| ||| || |||| ||||||| || || ||||||||||||  |||| | ||||||||| ||  |||||||||||||| | ||    
T  24716436 tgttaactgaaacctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattactagacatattattgaatgattatga 24716534  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| |||||||||| | ||| |        ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24716535 tgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 24716621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15477904 - 15477711
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  15477904 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 15477806  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 193  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15477805 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 15477711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 19928308 - 19928583
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||| | |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19928308 cgagcacttccagaattgagtgttttagaggattgtgagacctgagtggtttggatcggttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaaga 19928407  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||||||| | ||||||| || || | |||||| |  |||  ||| ||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  19928408 taatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaggagattatgaaatgaaatatggattgattgtctttatttgaattattgttgaatgatcaaga 19928507  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19928508 aattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 19928583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 25961340 - 25961627
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  |  | | |||||||||||  || ||||||||||||  |||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25961340 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataaaatcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 25961439  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | ||| ||| ||  ||||||  | ||||||| || |||||  || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  25961440 tgttagctgcaatatgtgaatttgttatgaactgttaagttgttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaattattcttgaatgatctagat 25961539  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25961540 gttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 25961627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 282 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 9784796 - 9784673
Alignment:
Q  282 gttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 381  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784796 gttgttgattatcattggatgttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 9784697  T
Q  382 agatgtttgatgtttaagttgttg 405  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||    
T  9784696 aaatgtacgatgtttaaattgttg 9784673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Original strand, 25963595 - 25963808
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  25963595 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 25963693  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| |    
T  25963694 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattga 25963792  T
Q  265 actaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||    
T  25963793 actaagttgcatgagt 25963808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 21327372 - 21327660
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||  ||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||| |||| ||| || |||||| ||||||| |    
T  21327372 cgagcactcccagaactgagtgtatttgagaatgttttgacctgagttgattgaattgactaggaatggaactttaagtagtagtgagacatatttaaaa 21327471  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||| ||||  |||||||||| ||||||| |  |||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| |||| ||    
T  21327472 tgttaagtgaattctgtgaagctgttatgaactattaagctgtttatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattgttgaataatcaaga 21327571  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||| | |||||||||||||         ||| |||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21327572 tgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgctgctgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 21327660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 280
Target Start/End: Original strand, 22811788 - 22812004
Alignment:
Q  73 tttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgatt-gattgca 170  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  22811788 tttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaagtgaaatctgtgaagctgctatgaactattaagttgattataatgtgatttaatgattaaattgca 22811887  T
Q  171 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatt 262  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||        |||   ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22811888 ttacctgaagtattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatgatgaagttataatgttgttgtgatttgattatgctgctattgttatt 22811986  T
Q  263 taactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22811987 taactaagttgcatgagt 22812004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 61115 - 60840
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | | ||    
T  61115 cgagcacttccagaactgagtgtttttgaggattgtgagacttgagttgtttggattagttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatga 61016  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg--attgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| || || |||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| | |||| |||| |||||  ||    || ||||||||||| ||||||||||| |    
T  61015 tattgaccgagaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaag 60917  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  60916 aaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgat-tgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 60840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 21318441 - 21318729
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||| || | | ||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||| |||| ||| || |||||| |||||||||    
T  21318441 cgagcactcccagaactaagtgtatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgactaggaatggaactttaagtagtagtgagacatatttaaga 21318540  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||| ||||   |||||||||  |||||| |  |||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| |||| ||    
T  21318541 tgttaagtgaattatgtgaagctgctatgaactattaagctgtttatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattgttgaataatcaaga 21318640  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||| | |||||||||||||         ||| |||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21318641 tgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 21318729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40428776 - 40428487
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaa-ctgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| || | | |||||||||||  || ||||| ||||||  ||| ||  |||| ||||| ||||||||||||    
T  40428776 cgagcacttccagaaactgagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatggaacttagggtagtaatgtgacctatttaag 40428677  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    || |||||||| | |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||| | |  |    
T  40428676 atgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttaaataaccttg 40428577  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |         | ||| | |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  40428576 atgttgttgaaaatgaattgttattatgaagttataatattgttgtgatctgaatatgctgcttttgttattgaactaagttgcatgagt 40428487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 433 - 508
Target Start/End: Original strand, 24872418 - 24872493
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24872418 tgaattgcaattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 24872493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 433 - 508
Target Start/End: Original strand, 30970990 - 30971065
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30970990 tgaattgcaattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 30971065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27263573 - 27263296
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | | ||    
T  27263573 cgagcacttccagaactgagtgtttttgaggattgtgagacttgagttgtttggattagttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatga 27263474  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg--attgcattacttgaa-ttattattgaatgatcag 197  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||| | | || ||| ||||||| | |||| |||| |||||  ||    || |||||| ||||| |||||||||||     
T  27263473 tattgactgagaactgtgaagct-ttacggattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaatttattgttgaatgatcaa 27263375  T
Q  198 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    |||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27263374 gaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 27263296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31345052 - 31344899
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||  ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  31345052 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttcatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 31344954  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31344953 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattattatttaactaagttgcatgagt 31344899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24175111 - 24174824
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  || | | |||||||||||  || ||||||||||||  |||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24175111 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 24175012  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | ||| | | || |||||||| | ||| ||| || |||| || || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  ||    
T  24175011 tgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactaga 24174912  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24174911 tgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 24174824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 21147302 - 21147387
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21147302 tgaattgcaattgatatattgatatcttcctgttgttgtgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 21147387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 433 - 508
Target Start/End: Original strand, 21139284 - 21139359
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21139284 tgaattgcaattgatatattgatatcttcctgttgttgtgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagt 21139359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 433 - 508
Target Start/End: Original strand, 24880303 - 24880378
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24880303 tgaattgcaattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgatttgactgtgttactgctgttatttaactaagt 24880378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Original strand, 34492200 - 34492298
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  34492200 tgttgttggttatgtgaaataattatataccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgctttttattaatattgttatgttgagaattgc 34492298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 24655144 - 24655431
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  |  | | |||||||||||  || ||||||||||||  |||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24655144 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataaagtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 24655243  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | ||| | | || |||||||| | ||| ||| || |||| || || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  ||    
T  24655244 tgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactaga 24655343  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24655344 tgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 24655431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21914966 - 21914868
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||    
T  21914966 tgttgtaggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttatttaatattgttatgttgagaattgc 21914868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9242045 - 9241976
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9242045 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 9241976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 11677543 - 11677458
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11677543 tgaattgcaattgatatattgacatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 11677458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 24640973 - 24641058
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24640973 tgaattgcaattgatatattgatatcatcctgttgttgtgtgacctgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 24641058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34137059 - 34136990
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34137059 agttgatgttgattatcatttgatattgttatctcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 34136990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 37524905 - 37524699
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||  ||||||||||  |||||| || || | ||||||||||||||||||       ||||||||    
T  37524905 ttaggtagtaatgtgacctatt-aagatgttaattgaagtctgtgaagctgctatgaactgttaggctgattataatgtgattta-------attgcatt 37524814  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| | ||| |         ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37524813 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttattgaaa-tgaattgttgttatgaagttacaatgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttattta 37524715  T
Q  265 actaagttgcatgagt 280  Q
    || |||||||||||||    
T  37524714 accaagttgcatgagt 37524699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 280
Target Start/End: Original strand, 21916069 - 21916191
Alignment:
Q  165 attgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctatt 256  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||        ||| ||| ||| | ||||||||||||| || | ||    
T  21916069 attgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaatttatgcttttgttgtgatctgattatgttgttttt 21916167  T
Q  257 gttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21916168 gttatttaactaagttgcatgagt 21916191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 163
Target Start/End: Original strand, 21918194 - 21918284
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgatt 163  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21918194 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgatt 21918284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Original strand, 21073494 - 21073563
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  21073494 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcatatgttgctgttgt 21073563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Original strand, 19662430 - 19662494
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  19662430 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttga 19662494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24673777 - 24673697
Alignment:
Q  114 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  24673777 ctgtgaagctattatgaaatgttaagctgattatactgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 24673697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26392496 - 26392426
Alignment:
Q  283 ttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgatta 353  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||    
T  26392496 ttgttgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgcactgcctatgttgctgttgtttatta 26392426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Original strand, 19201985 - 19202046
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19201985 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 19202046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 27196980 - 27196895
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  27196980 tgaattgtaattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcataatgtc 27196895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Original strand, 6261154 - 6261218
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  6261154 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagacgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttga 6261218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 22758596 - 22758715
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 174  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||| |||   ||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  22758596 ggtagtaatgagacctatataagaaattaactgcaatctatgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattac 22758695  T
Q  175 ttgaattattattgaatgat 194  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  22758696 ttgaattatgaatgaatgat 22758715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24869948 - 24869904
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24869948 tgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 24869904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Original strand, 30644056 - 30644120
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  30644056 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagacgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttga 30644120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41667078 - 41666973
Alignment:
Q  171 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 270  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41667078 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 41666981  T
Q  271 ttgcatga 278  Q
    ||||||||    
T  41666980 ttgcatga 41666973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 24503204 - 24503122
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24503204 tgaattgcaattgatatattgatatc-atccgtta--atgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 24503122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Original strand, 44370106 - 44370267
Alignment:
Q  3 agcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaa-tttaggtactaatgagacctatttaagat 101  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || | | ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||  || || ||||    
T  44370106 agcacttctagaactgagtgcaattgagaatgtcgtgacttgagttgcttgaattgatgagg-aatgaaactttaggtagtagtgagatatagtttagat 44370204  T
Q  102 attaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgatt 163  Q
     ||||  ||||  ||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  44370205 gttaaacgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgatt 44370267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23287480 - 23287407
Alignment:
Q  281 tgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatg-tttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgatta 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  23287480 tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgcctatgttgctgttgtttatta 23287407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Original strand, 22799175 - 22799219
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22799175 tgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 22799219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 440
Target Start/End: Original strand, 24316193 - 24316248
Alignment:
Q  384 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24316193 atgtatgatgtttaagttgt-gatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 24316248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 438
Target Start/End: Original strand, 39827952 - 39828036
Alignment:
Q  354 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaatt 438  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| |||||||| || |||  |||| |||| |||||| ||||||||    
T  39827952 tgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttaattcttatcattgatatggttatgctgtgaatt 39828036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 44381202 - 44381278
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||    
T  44381202 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactgagta 44381278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25616267 - 25616213
Alignment:
Q  226 gctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||| | |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25616267 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatgagt 25616213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27369388 - 27369322
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  27369388 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 27369322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27375898 - 27375832
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  27375898 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 27375832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 471 - 508
Target Start/End: Original strand, 19646014 - 19646051
Alignment:
Q  471 tgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19646014 tgtgacttgactgtactactgctgttatttaactaagt 19646051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 207
Target Start/End: Original strand, 22740841 - 22740973
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 174  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  ||||||| || || ||||| | |||||| ||| |||   ||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  22740841 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctttgaagttgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattac 22740940  T
Q  175 ttgaattattattgaatgatcaggaagttgttg 207  Q
    ||||||||| | |||||||| | || |||||||    
T  22740941 ttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 22740973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22703211 - 22703167
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  22703211 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 22703167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 44387872 - 44387948
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||    
T  44387872 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgttgttgctgttatttaactgagta 44387948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24870190 - 24870000
Alignment:
Q  2 gagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaat-ttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  |  | | |||||||||||  || ||||| |||||| |||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24870190 gagcacttccagaactgaatgcttttgataaggtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaa-tgaaacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 24870092  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    | ||| | | || |||||| | | ||| ||| ||||||| || || ||||||||||||  |||| | | ||||||| |||||||| ||||||    
T  24870091 tgttagccggaatctgtgaggttgttaagaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatacattactcgaattattcttgaat 24870000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9340368 - 9340302
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  9340368 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 9340302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9489002 - 9488936
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  9489002 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 9488936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 9608263 - 9608197
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  9608263 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 9608197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 13306610 - 13306676
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  13306610 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 13306676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16922617 - 16922551
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16922617 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 16922551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16986029 - 16985963
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16986029 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 16985963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 19489945 - 19490011
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  19489945 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 19490011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 28431933 - 28431999
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  28431933 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 28431999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 280
Target Start/End: Original strand, 45678189 - 45678222
Alignment:
Q  247 tgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45678189 tgctgctattgttatttaactatgttgcatgagt 45678222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 272
Target Start/End: Original strand, 23019755 - 23019791
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 272  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019755 tgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagtt 23019791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24673637 - 24673593
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  24673637 tgatctgcttgtgctgctattgttatttaaccatgttgcatgagt 24673593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 138)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 70571 - 71088
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  | |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  70571 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtagtaatgagacctatctaaga 70670  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  70671 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaataattaggaa 70770  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70771 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 70870  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70871 tattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 70970  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 500  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70971 tgtcgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgaaattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 71070  T
Q  501 aactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  71071 aactaagtgcatgatgtc 71088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 74680 - 75197
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  | |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  74680 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtagtaatgagacctatctaaga 74779  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  74780 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaataattaggaa 74879  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74880 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 74979  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74980 tattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 75079  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 500  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75080 tgtcgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgaaattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 75179  T
Q  501 aactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  75180 aactaagtgcatgatgtc 75197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 33407 - 32890
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  | |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33407 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgtttggattaggaatggaactttaggtagtaatgagacctatctaaga 33308  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33307 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaa 33208  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33207 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgttccgattatgctgttattgttatttaactcagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 33108  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33107 tattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 33008  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33007 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttattt 32908  T
Q  501 aactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  32907 aactaagtgcatgatgtc 32890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 12715165 - 12714647
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  12715165 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 12715067  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12715066 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 12714967  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12714966 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 12714867  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714866 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 12714767  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12714766 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 12714667  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  12714666 ttaactaagtgcatgatgtc 12714647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 12718969 - 12718451
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  12718969 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 12718871  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718870 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 12718771  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12718770 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 12718671  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718670 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 12718571  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12718570 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 12718471  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  12718470 ttaactaagtgcatgatgtc 12718451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 16907006 - 16907524
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  16907006 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 16907104  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907105 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 16907204  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16907205 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 16907304  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907305 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 16907404  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16907405 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 16907504  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  16907505 ttaactaagtgcatgatgtc 16907524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 12704464 - 12704982
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||| |||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||||  ||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  12704464 cgagcacatccataattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtacatagtgtgacctattaaag 12704563  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    ||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12704564 ataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgaatgcattacttgaattattattgaatgatcagga 12704663  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12704664 agttgttgaaaatgaattggtattaagctgctgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttg 12704763  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12704764 atattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 12704863  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12704864 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatt 12704963  T
Q  500 taactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  12704964 taactaagtgcatgatgtc 12704982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 26292695 - 26292178
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  26292695 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggagtttgagacgtgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaag 26292597  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    ||| | | ||  |  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26292596 ataatgattgtgacttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattaattgaattattattgaatgataagga 26292497  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292496 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 26292397  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292396 atattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgtcaatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 26292297  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26292296 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttgttgtatgacttgactgtgctactggtgttatt 26292197  T
Q  500 taactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  26292196 taactaagtgcctgatgtc 26292178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 18279704 - 18279186
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  18279704 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 18279606  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18279605 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 18279506  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18279505 aagttgttgaaaatgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 18279406  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18279405 gatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 18279306  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18279305 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttttgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 18279206  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  18279205 ttaactaagtgcatgatgtc 18279186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 12723880 - 12723362
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  12723880 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttgtattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 12723782  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723781 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 12723682  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12723681 aagttgttgaaaataaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgatattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 12723582  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723581 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 12723482  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12723481 gctgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 12723382  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  12723381 ttaactaagtgcatgatgtc 12723362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16114542 - 16114024
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |  ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  16114542 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttaggttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 16114444  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16114443 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 16114344  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16114343 aagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 16114244  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16114243 gatattgttatatcctgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 16114144  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16114143 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 16114044  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||  ||||||||    
T  16114043 ttaactaagtgtatgatgtc 16114024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16117695 - 16117177
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |  ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  16117695 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttaggttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 16117597  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16117596 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 16117497  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16117496 aagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 16117397  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16117396 gatattgttatatcctgagatgttcatgtgtcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 16117297  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16117296 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 16117197  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||  ||||||||    
T  16117196 ttaactaagtgtatgatgtc 16117177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 18283667 - 18283149
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  18283667 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttagattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 18283569  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18283568 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 18283469  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18283468 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 18283369  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18283368 gatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 18283269  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18283268 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctatattgttgtgtgatttgactatgctactgctgttat 18283169  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  18283168 ttaactaagtgcatgatgtc 18283149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 39722566 - 39722127
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||||| |  || |||||||| |||    
T  39722566 cgagcacttccagaattgagtgcttttgaggagtttgagacttgagttacttggattggttag-aattgaactttaggtacatggtgtgacctattaaag 39722468  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||   | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39722467 ataaggattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattaattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 39722368  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39722367 agttgttgaaaatgagttgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 39722268  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39722267 atattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaag 39722168  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39722167 ttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgc 39722127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11312947 - 11312669
Alignment:
Q  2 gagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312947 gagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagat 11312848  T
Q  102 attaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaag 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11312847 attaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaag 11312748  T
Q  202 ttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11312747 ttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 11312669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 13635275 - 13635554
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13635275 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacttgagttgcttggattgattagataatgaaccttaggtactaatgaggcctatttaaga 13635374  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13635375 tattaacagagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaa 13635474  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13635475 attgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 13635554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12318427 - 12318148
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318427 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaagtttgagaccggagttgcttggaatggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 12318328  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12318327 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaagaa 12318228  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12318227 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 12318148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 15605082 - 15605358
Alignment:
Q  5 cacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagatatt 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605082 cacttctagaactgagtgcatttgaggactttgagacccgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatatt 15605181  T
Q  105 aactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttg 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15605182 aactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttg 15605281  T
Q  205 ttgaaaatgaa-ttgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  15605282 ttgaaaatgaatttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaaaatgcatgagt 15605358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16583555 - 16583277
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16583555 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacttgagttgcttggattgattaggaagtgaaccttaggtactaatgagacctatataaga 16583456  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  16583455 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgattta-tgattgattgcattacttgaattattgttgaatgatcgagaa 16583357  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16583356 attgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactacgttgcatgagt 16583277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15580991 - 15580712
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| | | || |||||| ||||||||||||  ||| |||||||  || ||||||||||||| ||    
T  15580991 cgagcacttccaaaactgagtgcatttgagaagtttgaggctttaggtgcttgaattgattaggaatggaactttaggttatagtgagacctatttagga 15580892  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  15580891 tgttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattaattgattgcattacttgaattattattgaatgataaaaaa 15580792  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15580791 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatcgttatttaactaagttgcatgagt 15580712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 144 - 439
Target Start/End: Original strand, 45169961 - 45170250
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  45169961 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 45170054  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45170055 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 45170154  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  45170155 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattg 45170250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9593645 - 9593367
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  9593645 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaagattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctaataaaga 9593546  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| || | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9593545 tattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaaga 9593446  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9593445 aattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 9593367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 18864 - 19142
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18864 cgagcacttccagaactgagtgctattgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaaga 18963  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |     
T  18964 tattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaagg 19063  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19064 aattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagt 19142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9644608 - 9644384
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  9644608 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaagattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctaataaaga 9644509  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| || | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9644508 tattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaaga 9644409  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatatta 224  Q
    | ||||||||||||||||| |||||    
T  9644408 aattgttgaaaatgaattgttatta 9644384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 282 - 440
Target Start/End: Original strand, 25927254 - 25927412
Alignment:
Q  282 gttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 381  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25927254 gttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtgga 25927353  T
Q  382 agatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25927354 agatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 25927412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 1858833 - 1858995
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1858833 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 1858932  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1858933 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatatgttgtgaattgc 1858995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11987512 - 11987233
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatt-taag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||| ||| |||| |||  |||||||||| |||||||||||  |||    
T  11987512 cgagcacttccagaactgagtgcatttgatgattgtgaggcttgagttgtttggattggttaagaaaggaaccttaggtactagtgagacctattaaaag 11987413  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  | |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11987412 atattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaataataagtgaattatggattgattgcatttacttgatttattattgaatgatcaag 11987313  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11987312 aaactgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 11987233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 13918527 - 13918689
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  13918527 agttgttgttaattatcatttgatatcgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttata 13918626  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918627 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 13918689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14258569 - 14258407
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14258569 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 14258470  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14258469 tggaaaatgtatgatgtttgagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgc 14258407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 16460767 - 16460929
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16460767 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatg 16460866  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16460867 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcatcaatattgttatgttgtgaattgc 16460929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2760442 - 2760155
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| || | |||| |||||||||    
T  2760442 cgagcacttccagaactgagtgcaattgagattgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacatatttaaga 2760343  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||||| |||||| ||| || | || ||||||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  2760342 tgttaactgaaatctgtgaggctgtt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgagatattattgaatgatcatga 2760244  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     |||||||||||||||||||||||| |         ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2760243 tgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttcgttatttaactaagttgcatgagt 2760155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8940368 - 8940206
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8940368 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 8940269  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  8940268 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 8940206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16579877 - 16579715
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16579877 agttgtttttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatg 16579778  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    || || |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16579777 tgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgc 16579715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 16585786 - 16585948
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16585786 agttgtttttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatg 16585885  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    || || |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16585886 tgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgc 16585948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16998711 - 16998549
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16998711 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 16998612  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    | ||| || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16998611 ttgaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 16998549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 46580677 - 46580839
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46580677 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 46580776  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  46580777 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgctgtgaattgc 46580839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8917726 - 8917448
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | ||||| || || ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  8917726 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaagattgtgagacctgagtagtttggaatggttcggaaaggaactttgggtgctaatgagacctattaaaga 8917627  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| || || |||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8917626 tattgaccgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattgttgaatgatcaaga 8917527  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||  ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8917526 aattgttgtgaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgttgcaattgttattaaactaagttgcatgagt 8917448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13462061 - 13461782
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13462061 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggaatggttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaaga 13461962  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    | || ||||| |||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||| | ||| | |||| |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13461961 tgttgactgagaactctgaagcttttatgaattgttaattgattatgaagtgaaattatggattgattgtttttacttgaattattgttgaatgatcaag 13461862  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    || ||||||  ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  13461861 aaattgttgtgaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgtaattaaactaatttgcatgagt 13461782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15720114 - 15719952
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15720114 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcatatgtttctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 15720015  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15720014 tgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 15719952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 32301406 - 32301244
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  32301406 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatg 32301307  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  32301306 tggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 32301244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3272134 - 3271847
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||  ||||||| || |||||||||| |||||    
T  3272134 cgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgttgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataaga 3272035  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||| |||||  ||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  3272034 tgttaaatgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttactgattaattgcattacttgaa-tattattgaataatcaaga 3271936  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||| | |||||||||||||         ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3271935 tgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 3271847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13149454 - 13149179
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13149454 cgagcacttccagaattgagtgttttagaggattgtgagacctgagtggtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaaga 13149355  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13149354 taatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaaga 13149255  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13149254 aattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 13149179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 12321547 - 12321834
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || | | || ||| || || || |||||||||| |  ||   ||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  12321547 cgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgtagcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataaga 12321646  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | ||||||| || ||||||| || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  12321647 tgttaactgcaatctgtgaaactgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatggaatgatcaaga 12321746  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12321747 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactacgttgcatgagt 12321834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 278 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14273633 - 14273474
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  14273633 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatg 14273534  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaat 437  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  14273533 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttcattaatattgttatgttgcgaat 14273474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6801512 - 6801237
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttgga-ttgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||||||| | || |||||| ||| |||||||||||  ||    
T  6801512 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggatttggttaggaaa-ggaacttaggtgctagtgagacctattggag 6801414  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcag 197  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| | ||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||     
T  6801413 atattgactgagaactgtgaagccattatgatatattaagtgattatgaagtgaaattatggattgattgcccttacttgaattattgttaattgatcaa 6801314  T
Q  198 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  6801313 gaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacatgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatg 6801237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 284 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8468830 - 8468674
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 383  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||      
T  8468830 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggaga 8468731  T
Q  384 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8468730 atatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 8468674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14430120 - 14429907
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14430120 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 14430021  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaa 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||       ||  |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14430020 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtatactgttgttgtgatctgattatgcggctattgttatttaa 14429922  T
Q  266 ctaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||    
T  14429921 ctaagttgcatgagt 14429907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15113046 - 15112902
Alignment:
Q  294 catttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatg 393  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  15113046 catttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgttgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtagaaaatgtatgatg 15112947  T
Q  394 tttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaatt 438  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15112946 tttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaatt 15112902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 331 - 440
Target Start/End: Original strand, 2530191 - 2530299
Alignment:
Q  331 gcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 430  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2530191 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatt-atatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 2530289  T
Q  431 tgtgaattgc 440  Q
    ||||||||||    
T  2530290 tgtgaattgc 2530299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 294 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16324153 - 16324008
Alignment:
Q  294 catttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatg 393  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||  |||||    
T  16324153 cattcgatattgttatatcttgagatgtttaagtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtt-atatgccttttgtggaaaatgcatgatg 16324055  T
Q  394 tttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  16324054 tttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 16324008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 16724437 - 16724714
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16724437 cgagcactttcagaactgagtgcttttgaggattgtgagacttgagttgtttggaaaggttaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctattaaaga 16724536  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg-attgca-ttacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| ||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||| |||  | ||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  16724537 tattgactgagaactgtgaag-ttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaattatatttatttgaattattgttgaatgatcaag 16724635  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16724636 aa-ctattgagaatgacttgttatttaac--ctgatgtgatttcattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagt 16724714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 17701451 - 17701728
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17701451 cgagcactttcagaactgagtgcttttgaggattgtgagacttgagttgtttggaaaggttaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctattaaaga 17701550  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg-attgca-ttacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| ||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||| |||  | ||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  17701551 tattgactgagaactgtgaag-ttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaattatatttatttgaattattgttgaatgatcaag 17701649  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17701650 aa-ctattgagaatgacttgttatttaac--ctgatgtgatttcattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagt 17701728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 48593262 - 48593371
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48593262 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaagattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactactgagacctatttaaga 48593361  T
Q  101 tattaactga 110  Q
    ||||||||||    
T  48593362 tattaactga 48593371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 285 - 420
Target Start/End: Original strand, 17060433 - 17060568
Alignment:
Q  285 gttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaga 384  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17060433 gttgattatcgtttgatattgttatattttgagatgtttatgtgctgcatatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatattccttatgtggaaaa 17060532  T
Q  385 tgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaat 420  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17060533 tgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaat 17060568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 20487660 - 20487533
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20487660 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatgtcttgagatatttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatg 20487561  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttg 405  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  20487560 tggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 20487533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15728624 - 15728348
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | | ||    
T  15728624 cgagcacttccagaactgagtgtttttgaggattgtgagacttgagttgtttggattagttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatga 15728525  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg--attgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | |||| |||| |||||  ||    || ||||||||||| ||||||||||| |    
T  15728524 tattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattaggaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaag 15728426  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15728425 aaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 15728348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 16438840 - 16438985
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16438840 cgagcacttcctgaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttaggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattaaaga 16438939  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattat 146  Q
    |||  ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  16438940 tatggactgagaactgtgaagcttatatgaaatgttaagtgattat 16438985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 280
Target Start/End: Original strand, 9751703 - 9751847
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgat 234  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||| |       ||||||||    
T  9751703 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttggaa-tgaattgatattatgaattatactgttgat 9751801  T
Q  235 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9751802 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 9751847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14217214 - 14216938
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||  |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| | | ||    
T  14217214 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgaggcttgagttgtttggattagttaggaaaggaactgtaggtgctaatgagacctaataatga 14217115  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg--attgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| ||| | |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||  ||    || ||||||||||| ||||||||||| |    
T  14217114 tattgactaagaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgagttatggattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaag 14217016  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  14217015 aaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattgaactaagttgcatga 14216938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 297 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15116580 - 15116439
Alignment:
Q  297 ttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgttt 396  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15116580 ttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgctgcctatgttgctgttgtttgttatgtgaaatgtgcatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttt 15116481  T
Q  397 aagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaatt 438  Q
    | |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  15116480 acgttgttgatgtttttcattaatattgttattttgtgaatt 15116439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Original strand, 13918710 - 13918863
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  13918710 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 13918808  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13918809 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 13918863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 433 - 508
Target Start/End: Original strand, 6017182 - 6017257
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6017182 tgaattgcaattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 6017257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 357 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15084140 - 15084057
Alignment:
Q  357 gaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15084140 gaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 15084057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Original strand, 16550712 - 16550810
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16550712 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttttgaattgc 16550810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16614950 - 16614852
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16614950 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttttgaattgc 16614852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Original strand, 1859016 - 1859169
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || || ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  1859016 ttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaa-gaattgttatt 1859114  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||  || | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1859115 aagct--tgttgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 1859169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Original strand, 25927433 - 25927586
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||    
T  25927433 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaatttttatt 25927531  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||| |  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25927532 aagtt--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 25927586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 280
Target Start/End: Original strand, 2832389 - 2832534
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 233  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||   |||      ||||||    
T  2832389 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattataaagttatattgttga 2832487  T
Q  234 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2832488 tgggatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 2832534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 280
Target Start/End: Original strand, 16457312 - 16457441
Alignment:
Q  150 gtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatg 248  Q
    |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  16457312 gtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatg 16457409  T
Q  249 ctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16457410 ctgcaattgttattaaactatgttgcatgagt 16457441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 9445964 - 9446251
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  || ||| |||||||||||  || ||||||||||||  ||| |||||||| |||||| || |||||||||    
T  9445964 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataatgttgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgaaacatatttaaga 9446063  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | ||| | | || |||||||| | ||| ||| || |||| || || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  ||    
T  9446064 tgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactaga 9446163  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9446164 tgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 9446251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 280
Target Start/End: Original strand, 7519331 - 7519441
Alignment:
Q  167 tgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaac 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7519331 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaac 7519427  T
Q  267 taagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| ||||||    
T  7519428 taagttggatgagt 7519441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Original strand, 32160910 - 32161007
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  32160910 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaat-tgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 32161007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 280
Target Start/End: Original strand, 2530342 - 2530475
Alignment:
Q  146 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgat-atgatctgat 244  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||    
T  2530342 taatgtgatttaatgattaaatgcattactcaaaaaattatggaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagct--tgattatgatttgat 2530439  T
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2530440 tatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 2530475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18557271 - 18556996
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| |||| || |||| ||| ||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18557271 cgagcacttccagaaccgagtgcttttgaggattgagagacttgagctgtttggtttggttagg-aatggaacttaggtgctagtgagacctattaaaga 18557173  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    ||||| |||| |||||||||||  ||||||  || ||||||||||  |  ||| ||||   |||| ||| | |||||||||||||| || |||||||| |    
T  18557172 tattatctgagaactgtgaagc-cttatgagttgttaagtgattaagaaatgaattatgatttgatttgtatttacttgaattattgttaaatgatcaag 18557074  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18557073 aaactattgagaatgatttgctattgaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatga 18556996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 280
Target Start/End: Original strand, 39267847 - 39267992
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttga 233  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |         |||||     
T  39267847 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatagtattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttttaatgttgt 39267945  T
Q  234 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39267946 ggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 39267992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42462068 - 42461999
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42462068 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 42461999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18425566 - 18425464
Alignment:
Q  167 tgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaac 266  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  18425566 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaac 18425473  T
Q  267 taagttgca 275  Q
    |||||||||    
T  18425472 taagttgca 18425464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11661391 - 11661322
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11661391 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 11661322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 284 - 381
Target Start/End: Original strand, 14270034 - 14270131
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 381  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  14270034 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatgttcatatgctttatgtgga 14270131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16008655 - 16008591
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16008655 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgccgttgttga 16008591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17232973 - 17232875
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  17232973 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttataaattgc 17232875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 42205410 - 42205284
Alignment:
Q  5 cacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagatatt 104  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||  || |||||||||||  || ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||    
T  42205410 cacttccagaactgagttcttttgagaatgatgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatggaactttaggtagtaatgtgacctatttgagatgtt 42205311  T
Q  105 aactgaaaactgtgaagctattatgaa 131  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||    
T  42205310 aactgagacctgtgaagctgttatgaa 42205284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 14148664 - 14148579
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14148664 tgaattgtaattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 14148579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18607572 - 18607503
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18607572 agttgatgttgattatcatttgatatttttatatattgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 18607503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38519491 - 38519422
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  38519491 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgt 38519422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Original strand, 2530040 - 2530108
Alignment:
Q  92 tatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattg 160  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2530040 tatttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgatatattg 2530108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 346
Target Start/End: Original strand, 10501425 - 10501493
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttg 346  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10501425 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttg 10501493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 10869543 - 10869467
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  10869543 tgaattgctattgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 10869467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 10875623 - 10875547
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  10875623 tgaattgctattgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 10875547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 346
Target Start/End: Original strand, 14157106 - 14157174
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttg 346  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14157106 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgttgtctatgttgctgttg 14157174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14566279 - 14566215
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  14566279 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttga 14566215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18872437 - 18872373
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  18872437 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttga 18872373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Original strand, 20569440 - 20569619
Alignment:
Q  39 gacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaa 138  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||  || ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| |  ||||||| | ||| ||| || |||    
T  20569440 gacctgagttgaatgaattgattaggaatggacatt-aggtagtaatgaaacctatttaagatgttagctgatacatgtgaagttgttaagaactgttaa 20569538  T
Q  139 gt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 218  Q
    || | || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  20569539 gttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 20569619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 11262422 - 11262340
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11262422 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 11262340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 11554874 - 11554956
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11554874 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 11554956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16996338 - 16996272
Alignment:
Q  281 tgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  16996338 tgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctacgttgctgttgt 16996272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 17137868 - 17137990
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| || ||| |||||||| |||||||||| |  ||   ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17137868 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 17137967  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagct 123  Q
      ||||||| || ||||||||||    
T  17137968 agttaactgcaatctgtgaagct 17137990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 44408349 - 44408431
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  44408349 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 44408431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 7536279 - 7536194
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  7536279 tgaattgcaatcgatataatgatatcatcatgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 7536194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Original strand, 11525574 - 11525635
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  11525574 ttgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgt 11525635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14422069 - 14422000
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  14422069 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgaggtgtttatgtgctgcctatgttactgttgt 14422000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 23519965 - 23520041
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||    
T  23519965 tgaattgctattgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatactgctgctgttatttaactgagta 23520041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 20109 - 20191
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||| |  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20109 tgaattgcaattgatatattgatatc-atccgttgt--tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 20191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 9033359 - 9033417
Alignment:
Q  289 attatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9033359 attattatttgatattgttatatcctgagatatttatgtgttgcctatgttgttgttgt 9033417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 11548278 - 11548360
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  11548278 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcataatgtc 11548360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 12692589 - 12692507
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  12692589 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgctgctgctgttttttaactaagtgcataatgtc 12692507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 14959257 - 14959175
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||   |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14959257 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgta--acttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 14959175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 18531337 - 18531255
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  18531337 tgaattgcaattgatatattgatatc-atccgttgt--tgtgacttgactgtgctgctgctgttgtttaactaagtgcataatgtc 18531255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 26420093 - 26420011
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  26420093 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcataatgtc 26420011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20619491 - 20619430
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20619491 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttgt 20619430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8706091 - 8706015
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  8706091 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 8706015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 440
Target Start/End: Original strand, 14981543 - 14981599
Alignment:
Q  384 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  14981543 atgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 14981599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 440
Target Start/End: Original strand, 15411019 - 15411075
Alignment:
Q  384 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  15411019 atgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 15411075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16275563 - 16275515
Alignment:
Q  230 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16275563 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 16275515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 18553542 - 18553618
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  18553542 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 18553618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 18585310 - 18585386
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  18585310 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 18585386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 42204062 - 42204018
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42204062 tgatctgattatgctgctgttgttgtttaactaagttgcatgagt 42204018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35151676 - 35151629
Alignment:
Q  231 tgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35151676 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 35151629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 191
Target Start/End: Original strand, 45170268 - 45170339
Alignment:
Q  121 gctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  45170268 gctattatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 45170339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 14953291 - 14953209
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||  | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14953291 tgaattgcaattgatatattgatatc-atccgttat--tttgacttgactatgctgcttctgttatttaactaagtgcataatgtc 14953209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Original strand, 837364 - 837408
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  837364 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 837408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Original strand, 1202544 - 1202588
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  1202544 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 1202588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Original strand, 19649547 - 19649582
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19649547 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 19649582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 38828341 - 38828298
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  38828341 tgttgattatcatttgatattattatatcttgagatgtctatgt 38828298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 21767 - 21701
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  21767 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 21701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 8202095 - 8202161
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  8202095 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 8202161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 15022214 - 15022148
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  15022214 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 15022148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18203929 - 18203887
Alignment:
Q  281 tgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgttt 323  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18203929 tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 18203887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 311
Target Start/End: Original strand, 9177667 - 9177700
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatat 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9177667 agttgttgttgattatcatttgatattattatat 9177700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 9410003 - 9409966
Alignment:
Q  471 tgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9410003 tgtgacatgactgtgctgctgctgttatttaactaagt 9409966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9703322 - 9703285
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9703322 tatgctgttattgttatttaactatgttgcatgagttg 9703285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 282
Target Start/End: Original strand, 32216606 - 32216643
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 282  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32216606 tatgctgctattattatttaactatgttgcatgagttg 32216643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Original strand, 833368 - 833412
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  833368 tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 833412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Original strand, 1198548 - 1198592
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  1198548 tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 1198592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8719507 - 8719431
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | ||| | |||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  8719507 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtaaattgactatgctgctgctgttatttaactgagta 8719431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Original strand, 16109521 - 16109565
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||    
T  16109521 tgttgattatcatttgatattgctatatcttgagatgtctatgtg 16109565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 18154717 - 18154836
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 174  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||  ||||||||| |||||| ||| |||   ||| ||| ||| ||| || || || ||||||||||    
T  18154717 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgcgatataatgtttaattgcattac 18154816  T
Q  175 ttgaattattattgaatgat 194  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  18154817 ttgaattatgaatgaatgat 18154836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Original strand, 20569645 - 20569689
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20569645 tgatatgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 20569689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 12722 - 12205
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| || |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12722 cgagcacatctagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaaga 12623  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  12622 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattaaatgattgggaa 12523  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12522 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttga 12423  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12422 tattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 12323  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12322 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttattt 12223  T
Q  501 aactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  12222 aactaagtgcatgatgtc 12205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 121)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22863246 - 22862729
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22863246 cgagcacttccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaaga 22863147  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22863146 tgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattagaaa 22863047  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22863046 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 22862947  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22862946 tattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 22862847  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttattt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22862846 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaactgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgatactgctgttattt 22862747  T
Q  501 aactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||    
T  22862746 aactaagtgcatgatgtc 22862729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 19870891 - 19870373
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  19870891 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctatttaa 19870793  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870792 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 19870693  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19870692 aagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 19870593  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870592 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 19870493  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870492 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 19870393  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||  |||||||||    
T  19870392 ttaactaagagcatgatgtc 19870373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 11567163 - 11566645
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  11567163 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 11567065  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11567064 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 11566965  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11566964 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 11566865  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11566864 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 11566765  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11566764 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 11566665  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  11566664 ttaactaagtgcatgatgtc 11566645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 23395369 - 23394851
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  23395369 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 23395271  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23395270 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 23395171  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23395170 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 23395071  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23395070 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 23394971  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23394970 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 23394871  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  23394870 ttaactaagtgcatgatgtc 23394851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 23990221 - 23989703
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  23990221 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 23990123  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23990122 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 23990023  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23990022 aagttgttgaaaatgaattggtaataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 23989923  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989922 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttaggtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 23989823  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23989822 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 23989723  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  23989722 ttaactaagtgcatgatgtc 23989703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 8244161 - 8243644
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  8244161 cgagcacttccagaattgagtgtttttagcgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtg-gacctattaaa 8244064  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8244063 gataatgattgtgaattgtggagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 8243964  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8243963 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 8243864  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8243863 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 8243764  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8243763 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 8243664  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  8243663 ttaactaagtgcatgatgtc 8243644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 12618650 - 12619165
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  12618650 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 12618748  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12618749 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 12618848  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
     ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12618849 gagttgttgaaa-tgaattggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 12618947  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12618948 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtctcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatgt--cttatgtggaagatgtttgatgtttaa 12619045  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12619046 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgctgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 12619145  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  12619146 ttaactaagtgcatgatgtc 12619165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14472570 - 14472131
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14472570 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaaga 14472471  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14472470 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 14472371  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14472370 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgtta-ttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 14472272  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  14472271 tattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtataatgttgaagt 14472172  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgca 441  Q
    | ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14472171 tattgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgca 14472131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Original strand, 18917072 - 18917511
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    |||||||||| |||| ||||||  || | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  18917072 cgagcacttctagaattgagtgttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaattttaggtacatagtgtgacctattaaag 18917170  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    ||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18917171 ataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattgcttgaattattattgaatgatcagga 18917270  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917271 agttgttgaaaatgaattgatattgggctgttgatatgatataattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 18917370  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917371 atattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 18917470  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917471 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 18917511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 18955569 - 18956009
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18955569 cgagcacttctcgaattgagtgcttttgaggagtttgagacttgagttttttggattgtttaggaatggaactttaggtactaatgagacctatataaga 18955668  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18955669 tgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattgattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaagaa 18955768  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18955769 gttattgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagttgtggttgattatcatttga 18955868  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18955869 tattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagt 18955968  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgca 441  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18955969 tgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgca 18956009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1645005 - 1644569
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaa-tgagacctatttaag 99  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  | || |||||||| |||    
T  1645005 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggagtttgagacgtgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacacagtgtgacctattaaag 1644907  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    ||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644906 ataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 1644807  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  1644806 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatgagtt---gttgattatcatttg 1644710  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644709 atattgttatattctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 1644610  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1644609 ttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgc 1644569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17804497 - 17804218
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17804497 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 17804398  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17804397 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaa 17804298  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17804297 gttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 17804218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 280
Target Start/End: Original strand, 25766985 - 25767253
Alignment:
Q  12 agaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25766985 agaactgattgcatttgaggattttgagacctgagttgcttgggttgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgag 25767084  T
Q  112 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaa 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  25767085 aactgtgaaactattatgaaatgctaagtgattataatgtaatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaga 25767184  T
Q  212 tgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25767185 tgaattgatattaagctgttggtgtgatctgattatgctgctattgttacttaactaagttgcatgagt 25767253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 22429836 - 22430115
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || |||||| ||||||||||||  ||| |||||||  |  ||||||||||||||||    
T  22429836 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaagtttgagactttaggtgcttgaattgattaggaatggaactttaggttatggtgagacctatttaaga 22429935  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22429936 tgttagctgagaactgtgaagttattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattaaatgatcaagaa 22430035  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  22430036 attgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatagttaattaactaagttgcatgagt 22430115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Original strand, 31477765 - 31478055
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  31477765 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 31477858  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31477859 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgtctatgttgctg 31477958  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31477959 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 31478055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16760446 - 16760156
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  16760446 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 16760353  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16760352 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcacgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 16760253  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16760252 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgc 16760156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22949259 - 22948969
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||| ||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  22949259 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattga 22949166  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22949165 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttg 22949066  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22949065 ttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgc 22948969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22953215 - 22952925
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||| ||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  22953215 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattga 22953122  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22953121 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttg 22953022  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  22953021 ttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgagaattgc 22952925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23871703 - 23871413
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||| ||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  23871703 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattga 23871610  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  23871609 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttg 23871510  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  23871509 ttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgagaattgc 23871413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23875659 - 23875369
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||| ||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  23875659 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgatatgaattga 23875566  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  23875565 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttg 23875466  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  23875465 ttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgagaattgc 23875369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12706988 - 12706711
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaa-tttaggtactaatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12706988 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggaatgtgagacttgagttgcttggattgattaggaa--gaaactttaggtactaatgagacctattaaag 12706891  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12706890 atattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaaatgaattatggattgattgcatttacttgaattatttttgaatgatcaag 12706791  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12706790 aaattgctgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 12706711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16741506 - 16741231
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16741506 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagtcgtttggattggttaggaaatgaactttaggtactagtgagacctattaaaga 16741407  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16741406 tattgactgagaattgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaaga 16741307  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| | ||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  16741306 aattgttgacagtgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctacaattgttattaaactaagttgcatg 16741231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23415003 - 23414841
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23415003 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 23414904  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414903 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 23414841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27556761 - 27556599
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27556761 agttgttgttgatcatcatttgatgttgttatatattgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 27556662  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556661 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 27556599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 19773544 - 19773706
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19773544 agttgttcttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcatatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 19773643  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773644 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 19773706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 27415748 - 27415901
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27415748 cgagcacttccagaattgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggagaggaaccttaggtactaatgagacctatttaaga 27415847  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 154  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27415848 tgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 27415901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22806051 - 22805889
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  22806051 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgtgatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatattcgttatg 22805952  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22805951 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgc 22805889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 5616620 - 5616899
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||| | || |||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||| | ||||    
T  5616620 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagtcgtttgaaatggttaggaaaggaactttaggtgcaaataagacctactaaaga 5616719  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaag-ctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||  ||||| |||| |||||  | ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5616720 tatggactgagaactttgaagatttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaag 5616819  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||| ||| ||||| ||| |||||| |  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5616820 aagttgctgagaatgatttgttattaaac--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 5616899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 15705445 - 15705607
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15705445 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacttgttttctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatg 15705544  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15705545 tggaaaatgtatgatgtataagttgatgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgc 15705607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 28103900 - 28104062
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28103900 agttgatgttgattatcatttgatgttgttataccttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 28103999  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  28104000 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 28104062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 2685129 - 2685402
Alignment:
Q  5 cacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagatatt 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||  |||||||    
T  2685129 cacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttaggaaaggaactctaggtgctagtgagacctattagagatatt 2685228  T
Q  105 aactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaggaagtt 203  Q
     ||||| |||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| | || |||||| ||| ||    
T  2685229 gactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgtcgattgatcaagaa-tt 2685327  T
Q  204 gttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2685328 gttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagt 2685402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19663068 - 19662792
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| | || |||||| ||| |||||||||||  |||    
T  19663068 cgagcacttccaaaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttaggaaa-ggaacttaggtgctagtgagacctattggaga 19662970  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  19662969 tattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaaga 19662870  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19662869 a-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagt 19662792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18907422 - 18907135
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| || ||| || ||| || || || |||||||||| |  ||   ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18907422 cgagcacttccagaacagagtgcaaatgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaaga 18907323  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtg-attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | ||||||| ||  ||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18907322 tgttaactgcaatatgtgaagctgttatgaactgttaagttcattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga 18907223  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18907222 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagt 18907135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 331 - 440
Target Start/End: Original strand, 27415994 - 27416103
Alignment:
Q  331 gcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 430  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27415994 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 27416093  T
Q  431 tgtgaattgc 440  Q
    ||||||||||    
T  27416094 tgtgaattgc 27416103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12496608 - 12496333
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||||    
T  12496608 cgagcacttccagaattgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttaggaaaggaactttaggtagttatgagacctattaaaga 12496509  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||||||||| ||| ||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  12496508 taatgactgtgaactgtgaagcttttaggaactgttaagagattatgaactgaaatatggattgattgcctttacttgaaatattgttgaatgatcaaga 12496409  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatat-taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||  || ||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12496408 aattgttgagaatgatttgttatagaacctgttg---tgatctgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 12496333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 9482099 - 9482374
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  9482099 cgagcacttccagaattgagtgttttagaggattgtgagacctaagtggtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgtgaactattaaaga 9482198  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9482199 taatgactgtaaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattatgaaatgaattatagattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaaga 9482298  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||||| |   |||| |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9482299 aattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgcttatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 9482374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 15817523 - 15817685
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15817523 agttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcatatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatg 15817622  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15817623 tggaaaatgtatgatgtttaagtagttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 15817685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 20907787 - 20908074
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20907787 cgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgttatgacctgagttgtttggattggttaggaatggaactttaggtagtaatgaaacctatttaaga 20907886  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | ||||||  || ||| |||| | ||| ||| || |||| || || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20907887 tgttaactagaatctgggaagttgttaagaattgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaatgatcaaga 20907986  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20907987 tgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 20908074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 278 - 432
Target Start/End: Original strand, 14979389 - 14979543
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14979389 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttaagtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 14979488  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 432  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  14979489 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgattttcattaatattgttatgttg 14979543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 314 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17743460 - 17743334
Alignment:
Q  314 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 413  Q
    ||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  17743460 tgagatgtttacgtgctacctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttct 17743361  T
Q  414 cattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17743360 cattaatattgttatgttgtgaattgc 17743334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 22592610 - 22592884
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || || | ||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22592610 cgagcacttccagaactgaatgcttttgaggattgtgagacatgagctgtttagtttggttaggaaagaaactttaggtactaatgtgacctattaaaga 22592709  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || ||||||  |||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22592710 taataactgtgaactgtgaag-ttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaaga 22592808  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  22592809 aattgttgagaatgatttgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctacaaatgttatttaactaagttgcatg 22592884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18180803 - 18180518
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || | | ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||| || | |||| |||||||||    
T  18180803 cgagcacttccagaactgaatgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacatatttaaga 18180704  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||||| |||| | ||| || | || || |||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  18180703 tgttaactgaaatctgtaaggctgtt-tcaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattaaga 18180605  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| |||||||||| | ||| |        ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18180604 tgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 18180518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 284 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15875496 - 15875340
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 383  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||||| |||  || |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  15875496 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcatatgttgctgatgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaa 15875397  T
Q  384 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15875396 atgtatgatgtttaagttgttgataattttcattaatattgttatgttgtgaattgc 15875340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 1587537 - 1587813
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | | ||    
T  1587537 cgagcacttccagaactgagtgtttttgaggattgtgagacttgagttgtttggattagttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatga 1587636  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg--attgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  | |||| |||| |||||  ||    || ||||||||||| ||||||||||| |    
T  1587637 tattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattaggaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaag 1587735  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1587736 aaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 1587813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 308 - 440
Target Start/End: Original strand, 17377829 - 17377961
Alignment:
Q  308 atatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgat 407  Q
    ||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  17377829 atatcttgagatgtttacgtgctgcatatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtttat 17377928  T
Q  408 gcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    | |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  17377929 gttcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 17377961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23414820 - 23414667
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  23414820 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 23414722  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23414721 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 23414667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27556578 - 27556425
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  27556578 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 27556480  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27556479 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 27556425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 22408111 - 22408396
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||| || | |||| |||||||||    
T  22408111 cgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaa-tggaacttaggtagtagtaagacttatttaaga 22408209  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||| ||||| ||||||  || || |||| |||||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||    
T  22408210 tgttaattgaaatctgtgagactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattcttgaatgatctaga 22408308  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     |||||||||| ||||||| | |||   || |     |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  22408309 tgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaagttataaagttgttgtgatctgattatactgcttttgttatttaaccaagttgcacgagt 22408396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 19790585 - 19790872
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||  || | | |||||||||||  || ||||||||||||  || ||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  19790585 cgagcacttccagaactgaatgtttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggacatt-aggtagtaatgaaacctatttaaga 19790683  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  ||    
T  19790684 tgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttga 19790783  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||||||||||        ||| ||||   || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19790784 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgatgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 19790872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18914000 - 18913902
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18914000 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaattgc 18913902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18937258 - 18937160
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18937258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaattgc 18937160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 18696589 - 18696480
Alignment:
Q  296 tttgatattcttatatcctgagatgttt-atgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgt 394  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18696589 tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtattgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgt 18696490  T
Q  395 ttaagttgtt 404  Q
    ||||||||||    
T  18696489 ttaagttgtt 18696480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 20803359 - 20803636
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||  ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | | ||    
T  20803359 cgagcacttccataactgactgttttttaggattgtgagacttgagttgtttggattagttaggaaaagaactttaggtgctaatgagacctaataatga 20803458  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg--attgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| ||| | |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||  ||    || ||||||||||| ||||||||||| |    
T  20803459 tattgacttagaactgtgaagcttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaag 20803558  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  20803559 aaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagctgcatga 20803636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 342 - 438
Target Start/End: Original strand, 15174163 - 15174259
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaatt 438  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  15174163 tgttgttggttatgtgaaataattatatgacttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgagaatt 15174259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 224
Target Start/End: Original strand, 21834782 - 21834916
Alignment:
Q  88 gacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattat 186  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||   || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  21834782 gacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgttt--aactgctaagttgattataatgtgatttaatgattaaatgtattacttgaaatattat 21834879  T
Q  187 tgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 224  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  21834880 tgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 21834916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 280
Target Start/End: Original strand, 16523330 - 16523476
Alignment:
Q  140 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttg 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||       ||    ||||    
T  16523330 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacctgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataaagttg 16523428  T
Q  233 atatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523429 ttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 16523476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 435 - 518
Target Start/End: Original strand, 18917676 - 18917759
Alignment:
Q  435 aattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18917676 aattgcagttgatatattgatatatctcttttgttgtgtgacttgactgtgctatggctgttatttaactaagtgcatgatgtc 18917759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 331 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18706371 - 18706301
Alignment:
Q  331 gcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagtt 401  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18706371 gcctatgttgctgtttttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtt 18706301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22758946 - 22758861
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22758946 tgaattgcaattgatatattgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 22758861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16624283 - 16624158
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| ||||||| |  ||||||||  |||    
T  16624283 tatattgtgaattaatgattaaatgcattacttgaagtattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagtt--tgatatgaattga 16624190  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgca 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16624189 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgca 16624158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Original strand, 27416124 - 27416271
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | |||||||||  || ||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  27416124 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactctaaatattaatgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 27416222  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||  |||||      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27416223 aagc--ttgat------tgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 27416271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 34832748 - 34832666
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34832748 tgaattgcaattgatatattgatatca-tctgtt--tatgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataatgtc 34832666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Original strand, 15894310 - 15894427
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 175  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| ||||||  || |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15894310 ggtagtaatgtgacctatataggatgttaactacaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 15894409  T
Q  176 tgaattattattgaatga 193  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  15894410 tgaaatgttaatgaatga 15894427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16371953 - 16371868
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16371953 tgaattgcaattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 16371868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23838293 - 23838224
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23838293 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 23838224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 25928391 - 25928306
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25928391 tgaattgcaattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 25928306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 280
Target Start/End: Original strand, 27325581 - 27325703
Alignment:
Q  167 tgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgtt-gaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattg 257  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| |        |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27325581 tgcattacttgaaatattatggaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgatattatgaagttatactgttgatgtgatatgattatgctgctattg 27325680  T
Q  258 ttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  27325681 ttaattaactaagttgcatgagt 27325703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20136789 - 20136722
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgtt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  20136789 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgtt 20136722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 345
Target Start/End: Original strand, 22196080 - 22196147
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgtt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  22196080 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgtt 22196147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 23657226 - 23657513
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || | | ||||||||||| | |||||| ||| |||  ||| |||||||| ||||  || |||| | |||    
T  23657226 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgttcggattggttaagaatggaactttaggtagtaatatgatctatgtgaga 23657325  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||| | |||||| ||| |||||| ||| ||||   || ||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||||| |||||| | |   |     
T  23657326 tgttaactgagatctgtgaggctgttatgatatgttaagctgttgtaatgtgatttaaagattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttaat 23657425  T
Q  201 g-ttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgag 279  Q
    | ||||||||||||||||| |        ||||   || || | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23657426 gattgttgaaaatgaattgttctgatgaaattataatgctgctgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgag 23657513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18453301 - 18453232
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18453301 agttgatgttgattatcatttgattttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 18453232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 34369984 - 34370069
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34369984 tgaattgtaattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 34370069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4476935 - 4476871
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  4476935 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttga 4476871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 193
Target Start/End: Original strand, 21739900 - 21740020
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || ||| |||| || || |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  21739900 ttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctggttataatgtgacttaatgattaattgcatt 21739999  T
Q  173 acttgaattattattgaatga 193  Q
    ||||||| | ||| |||||||    
T  21740000 acttgaaatgttaatgaatga 21740020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21766839 - 21766719
Alignment:
Q  167 tgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgt 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| | ||||| | |||||||  |||| |||||||||    
T  21766839 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgttgctattgt 21766741  T
Q  259 tatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21766740 tatttaactaagttgcatgagt 21766719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Original strand, 31478076 - 31478169
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 218  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  31478076 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 31478169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 34298635 - 34298717
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34298635 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 34298717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20182912 - 20182848
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgct 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||    
T  20182912 agttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatattgct 20182848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 342
Target Start/End: Original strand, 22153079 - 22153143
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgct 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||    
T  22153079 agttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatattgct 22153143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 27553413 - 27553513
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || | | |||||||||||  || ||||||||||||  |||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27553413 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 27553512  T
Q  101 t 101  Q
    |    
T  27553513 t 27553513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Original strand, 19848034 - 19848088
Alignment:
Q  226 gctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19848034 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 19848088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Original strand, 22059550 - 22059711
Alignment:
Q  3 agcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaa-tttaggtactaatgagacctatttaagat 101  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || | | ||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||  || || ||||    
T  22059550 agcacttctagaactgagtgcaattgagaatgtcgtgacttgagttgcttgaattgatgagg-aatgaaactttaggtagtagtgagatatagtttagat 22059648  T
Q  102 attaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgatt 163  Q
     ||||  ||||  ||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22059649 gttaaacgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgatt 22059711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23956206 - 23956148
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23956206 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 23956148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 19808622 - 19808537
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||   || || ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19808622 tgaattgtaattgatataatgatatcatcctattgttgtgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 19808537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 17016932 - 17017008
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  17016932 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 17017008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Original strand, 27553620 - 27553664
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27553620 tgatctgattatgctgctgttgttctttaactaagttgcatgagt 27553664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 32565252 - 32565328
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  32565252 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 32565328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 471 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 4167985 - 4167938
Alignment:
Q  471 tgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4167985 tgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 4167938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 471 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 4208665 - 4208618
Alignment:
Q  471 tgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4208665 tgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 4208618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23539087 - 23539020
Alignment:
Q  279 gttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttg 346  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||||||||    
T  23539087 gttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtatatgtgctgcctgtgttgctgttg 23539020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 27567415 - 27567702
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |  || | | |||||||||||  || |||| |||||||  |||  ||||||| || ||| ||||||||||||    
T  27567415 cgagcacttccagaactgagtgttttttataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgcttaggaatggaacattaggtagtactgaaacctatttaaga 27567514  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | | | | |||| |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||||  |||||| | |  ||    
T  27567515 tgtcagccgaaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgatttatgcttgaataaactaga 27567614  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  27567615 tgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattacgatgtttttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgtatgagt 27567702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1644359 - 1644309
Alignment:
Q  230 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1644359 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagt 1644309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1644548 - 1644462
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaa 210  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  1644548 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatatttttgaatgatcaagatgttgttgaaa 1644462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8228973 - 8228907
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  8228973 ttgatatattgatatctccttgctgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 8228907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 14098686 - 14098640
Alignment:
Q  471 tgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgt 517  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14098686 tgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgt 14098640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Original strand, 15041589 - 15041643
Alignment:
Q  226 gctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15041589 gctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagt 15041643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 16552040 - 16552106
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16552040 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 16552106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16576913 - 16576847
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16576913 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 16576847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 16618467 - 16618533
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16618467 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 16618533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 16628596 - 16628662
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16628596 ttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 16628662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23992509 - 23992455
Alignment:
Q  226 gctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23992509 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagt 23992455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Original strand, 31478265 - 31478315
Alignment:
Q  230 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31478265 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagt 31478315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 207
Target Start/End: Original strand, 25642064 - 25642196
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 174  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  ||||||| || || ||||| | |||||| ||| |||   ||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  25642064 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctttgaagttgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattac 25642163  T
Q  175 ttgaattattattgaatgatcaggaagttgttg 207  Q
    ||||||||| | |||||||| | || |||||||    
T  25642164 ttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 25642196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Original strand, 15894487 - 15894531
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15894487 tgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagt 15894531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 33443163 - 33443091
Alignment:
Q  282 gttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgttt-atgtgtcgcctatgttgctgttgttgatta 353  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || |   |||||||||||||||||| ||||    
T  33443163 gttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttttatatactgcctatgttgctgttgtttatta 33443091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16760135 - 16760068
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  16760135 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 16760068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19863037 - 19863002
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19863037 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 19863002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19873179 - 19873144
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19873179 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 19873144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22948948 - 22948881
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22948948 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 22948881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22952904 - 22952837
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22952904 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 22952837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23871392 - 23871325
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  23871392 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 23871325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23875348 - 23875281
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  23875348 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 23875281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 345
Target Start/End: Original strand, 18199424 - 18199486
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatg-tttatgtgtcgcctatgttgctgtt 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||   ||||||||||||||    
T  18199424 tgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttcctatgttgctgtt 18199486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18931162 - 18931096
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  18931162 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 18931096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 29587700 - 29587766
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  29587700 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 29587766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Original strand, 29593841 - 29593907
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  29593841 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 29593907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 123
Target Start/End: Original strand, 16523281 - 16523330
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagct 123  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  16523281 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagct 16523330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 441
Target Start/End: Original strand, 19656104 - 19656177
Alignment:
Q  368 atgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgca 441  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| |||||||||||    
T  19656104 atgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgca 19656177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21702587 - 21702311
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaa-tgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| |||| |  || | | ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||  |||||||||| | || |||||||| |||    
T  21702587 cgagcacttccagaattgagagttttagtgcattgtgagacctgagttgtttggattggttag-aaaggagctttaggtacttagtgtgacctattaaag 21702489  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcag 197  Q
    ||| | |     |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | || |||||||| || |||||||||||     
T  21702488 ataatgatcatgaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatactttcttgaatttttgttgaatgatcaa 21702390  T
Q  198 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    |||  | ||||  |||| ||| |||| | ||  |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21702389 gaaactattgagtatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattttgctgcaattgttatttaattaagttgcatga 21702311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 508
Target Start/End: Original strand, 25595399 - 25595436
Alignment:
Q  471 tgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25595399 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagt 25595436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Original strand, 29416912 - 29416956
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  29416912 tgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 29416956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 4907 - 5423
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| || || |||||||| |||    
T  4907 cgagcacttccagaattgagtgttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactgtaggtacatagtgtgacctattaaag 5005  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    ||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5006 ataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 5105  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5106 agttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgagctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 5205  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5206 atattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgatgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 5305  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5306 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatt 5405  T
Q  500 taactaagtacatgatgt 517  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  5406 taactaagtgcatgatgt 5423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 378; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 61418 - 61934
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || | | ||| |||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||  || || |||||||| |||    
T  61418 cgagcacttccagaattgagtgttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggataggttag-aaatgaactttaggtaaatagtgtgacctattaaag 61516  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    ||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61517 ataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 61616  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  61617 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattag 61716  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61717 atattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgaatatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 61816  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  61817 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctcttttgttgtgttacttgactgtgctactgctgttatt 61916  T
Q  500 taactaagtacatgatgt 517  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  61917 taactaagtgcatgatgt 61934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 517
Target Start/End: Original strand, 65334 - 65850
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  || | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  65334 cgagcacttccagaattgattgttttagtgcattatgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaag 65432  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    ||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  65433 ataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaaga 65532  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  65533 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcgtttg 65632  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65633 atattgttatatcctgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 65732  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65733 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttgctgtgtgacttgactgtgctactgctgttatt 65832  T
Q  500 taactaagtacatgatgt 517  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  65833 taactaagtgcatgatgt 65850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 81012 - 80577
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  81012 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgaatggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaaga 80913  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80912 tgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattaattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 80813  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  80812 gatgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttaa 80716  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80715 tattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 80616  T
Q  401 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  80615 tgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattg 80577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13072 - 12943
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||  ||||||||||| |||||||| | |  ||   ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13072 cgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatatgagttgcttgaattgattatggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 12973  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatga 130  Q
      ||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  12972 agttaactgcaatttgtgaagctaatatga 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 80533 - 80462
Alignment:
Q  146 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 218  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  80533 taatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 80462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 80366 - 80316
Alignment:
Q  230 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  80366 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagt 80316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12831 - 12787
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12831 tgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagt 12787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 107)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 19472525 - 19473043
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  19472525 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 19472623  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19472624 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttaaattattattgaatgatcagg 19472723  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19472724 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 19472823  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19472824 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 19472923  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19472924 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 19473023  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  19473024 ttaactaagtgcatgatgtc 19473043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20296148 - 20295630
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  20296148 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 20296050  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20296049 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 20295950  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20295949 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 20295850  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295849 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 20295750  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20295749 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 20295650  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  20295649 ttaactaagtgcatgatgtc 20295630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 15236586 - 15236925
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  | |||||||||  |||  || |||||||||||||||||| |||||    
T  15236586 cgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaatggaacctttggtactaatgagacctatctaaga 15236685  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15236686 tgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattaattgattgcattacttgaattattcttgaatgattaggaa 15236785  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236786 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttga 15236885  T
Q  301 tattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttg 340  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236886 tattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttg 15236925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 281 - 518
Target Start/End: Original strand, 15236921 - 15237158
Alignment:
Q  281 tgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtgg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236921 tgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgg 15237020  T
Q  381 aagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  15237021 aagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttga 15237120  T
Q  481 ctgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15237121 ctgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtc 15237158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 23535395 - 23535672
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23535395 cgagcacttccagaactgagtgcattttaggattgtgagacctgagttgcttggtttgattaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctgtttaaga 23535494  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23535495 tattaaatgagaactgtgaagcttctatgaaatgctaagtgattat-acgtgatttattgatagattgcattactttaattattattgaatgatcaagaa 23535593  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23535594 attgttg-aaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 23535672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 215 - 440
Target Start/End: Original strand, 40723607 - 40723832
Alignment:
Q  215 attgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcct 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |    
T  40723607 attgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttaatattgatatatctt 40723706  T
Q  315 gagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcac 414  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  40723707 gagatgtttacgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcat 40723806  T
Q  415 attaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  40723807 aatagtattgttatgttgtgaattgc 40723832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10753515 - 10753225
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  10753515 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 10753422  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||     
T  10753421 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacatgttgcctatgttgcta 10753322  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10753321 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgctatgttgtgaattgc 10753225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 278 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18356315 - 18356154
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18356315 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 18356216  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18356215 tggaagatgtatgatgtttgagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 18356154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 278 - 439
Target Start/End: Original strand, 20910918 - 20911079
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20910918 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatg 20911017  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20911018 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 20911079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 42805720 - 42805442
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||| | |||||||| ||| ||||||| | | ||||||||||| ||||    
T  42805720 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgaggcctgagttgttttgataggttaggaaaggaactttaggtgccattgagacctattaaaga 42805621  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |     
T  42805620 tattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattttatttacttgaattattattaaatgatcaagg 42805521  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  42805520 aattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaaccaagttgcatgagt 42805442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20232850 - 20232577
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20232850 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggattgggtaggaaagaaactttaggtactaataagacctatttaaga 20232751  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||  |    
T  20232750 tattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcctttacttgaattattgttgattgatcaata 20232651  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 276  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  20232650 a-ttgttgagaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcat 20232577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 280
Target Start/End: Original strand, 26742562 - 26742830
Alignment:
Q  11 cagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagatattaactga 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26742562 cagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtgccattgagacctattaaagatattgactga 26742661  T
Q  111 aaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaa 209  Q
     |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||     
T  26742662 gaactgtgaagcttttatgatatattaagtgattataaagtgaattatggtttgattgtatttactcgaattattattgaatgatcaaggaattgttgag 26742761  T
Q  210 aatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||| ||| ||||||||   |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26742762 aatgagttgttattaagc--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagt 26742830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 22107436 - 22107598
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22107436 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtcaaatatttatatgccttatg 22107535  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22107536 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgc 22107598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18356627 - 18356474
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18356627 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggagaggaaccttagatactaatgagacctatttaaga 18356528  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 154  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18356527 tgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 18356474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 140 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17410601 - 17410461
Alignment:
Q  140 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgat 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  17410601 tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgtcgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgat 17410502  T
Q  240 ctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17410501 ctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 17410461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 20910606 - 20910759
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  20910606 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggagaggaaccctaggtactaatgagacctatttaaga 20910705  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 154  Q
    | ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20910706 tgttatctgaggactgtgaagctattgtgaaatgctaagtgattataatgtgat 20910759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18774504 - 18774225
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||| |    ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18774504 cgagcacttccagaactgggtgcttttgaggattgcgagacccgagttgttacatttggttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaaga 18774405  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||| || | ||||||||| | ||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18774404 tattacctgagaactgtgaagcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaag 18774305  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18774304 aaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagt 18774225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 26665937 - 26666214
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||  |||    
T  26665937 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttaggaaaggaactctaggtgctagtgagacctattagaga 26666036  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  26666037 tattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaaga 26666136  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26666137 a-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagt 26666214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 26937534 - 26937811
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||  |||    
T  26937534 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttaggaaaggaactctaggtgctagtgagacctattagaga 26937633  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||||| ||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  26937634 tattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaaga 26937733  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26937734 a-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagt 26937811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23451655 - 23451372
Alignment:
Q  3 agcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagata 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  23451655 agcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgagacctgagttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatg 23451556  T
Q  103 ttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaag 201  Q
    |||||||||| |||||| ||| || |||| ||||||| || || ||| ||||||||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | || |    
T  23451555 ttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaaagtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattatgatg 23451457  T
Q  202 ttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |        ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23451456 ttgttgaaaa-gaattgatgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 23451372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33409528 - 33409253
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  33409528 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggtttggttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaaga 33409429  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  33409428 taatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaaga 33409329  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  33409328 aattgttgagaatgatttgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 33409253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6765947 - 6765785
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  6765947 agttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaagtgccgcctatgttgctgttgttggttgtgtgaaatgtttatatgccttatg 6765848  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6765847 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 6765785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23463160 - 23462877
Alignment:
Q  3 agcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagata 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  23463160 agcacttccagaactgagtgcatttgagaatgttgagacctgagttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatg 23463061  T
Q  103 ttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaag 201  Q
    |||||||||| |||||| ||| || |||| ||||||| || || ||||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | || |    
T  23463060 ttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattatgatg 23462962  T
Q  202 ttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||| |||||| | ||| |        ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  23462961 ctgttgaaaa-gaattgctgttatgaagtatagtgttgttgtgatctgattatgcttcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 23462877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 24532854 - 24533131
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||  |||||||||||  |||    
T  24532854 cgagcacttttagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttaggaaaggaactctaggtgcttgtgagacctattagaga 24532953  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||||| || |||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  24532954 tattgactgagaactgtgaagcctttatgatatactaagtgattatgaagtgaattatggattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaaga 24533053  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24533054 a-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgttgcaattgttattaaactatgttgcatgagt 24533131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16674452 - 16674177
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16674452 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggtttggttaggaaacgaactttaggtactaatgtgacctattaaaga 16674353  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||| ||| | ||||||| || |||| || ||| |  |||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16674352 taatgactgtgaactgtaaagtttttatgaactgttaagagactatgaaatgaaatatagattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaaga 16674253  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16674252 aattgttgagaatgatttgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 16674177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23458899 - 23458616
Alignment:
Q  3 agcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagata 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  23458899 agcacttcaagaactgagtgcatttgagaatgttgagacctgagttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatg 23458800  T
Q  103 ttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaag 201  Q
    |||||||||| |||||| ||| || |||| ||||||| || || ||||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | || |    
T  23458799 ttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattatgatg 23458701  T
Q  202 ttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||| |||||| | ||| |        ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  23458700 ctgttgaaaa-gaattgctgttatgaagtatagtgttgttgtgatctgattatgcttcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 23458616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Original strand, 21366544 - 21366757
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21366544 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 21366643  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaa 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||       ||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366644 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 21366742  T
Q  266 ctaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||    
T  21366743 ctaagttgcatgagt 21366757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18784347 - 18784068
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||| |||| | |||| ||| ||||||||||  |||||| |||||| |   |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  18784347 cgagcacgtccaaagctgaatgcttttgaggattgcgagaccggagttgttacaattggttaggaaaggaactttaggtgctaatgagaccaattaaaga 18784248  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| ||||||| || | ||||||||| | ||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | |    
T  18784247 tattgactgagaactgtgaggcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgataaag 18784148  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18784147 aaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgagt 18784068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 17410747 - 17410646
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410747 cgagcacttccagaactgagtgcacttgaggattttgatacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 17410648  T
Q  101 ta 102  Q
    ||    
T  17410647 ta 17410646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 296 - 436
Target Start/End: Original strand, 33895665 - 33895805
Alignment:
Q  296 tttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtt 395  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  33895665 tttgatattgttgtatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgtgggttttgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtt 33895764  T
Q  396 taagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 436  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  33895765 taagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaa 33895805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 21340573 - 21340850
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  |||    
T  21340573 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagcagtttggattggttaggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagaga 21340672  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||||||||  || |||| || |||| |||||| |  |||  ||| || |||||| | ||||| |||||||| || | |||||| ||    
T  21340673 taatgactgggaactgtgaagcctttttgaattgttaagggattatgaaatgaaatatggagtgattgcctttactcgaattattgttaattgatcaaga 21340772  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||| | ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21340773 a-ttgtttagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatgagt 21340850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 17718245 - 17718520
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || |||| ||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17718245 cgagcacttccagaactgaatgcttttgaggattgtgagacttgagatgtttggtttggttagaagaggaactttaggtactaatgagacctattaaaga 17718344  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||  |||||||||| | ||||||| || | || |||||| |  |||  |||  ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17718345 tattgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgtttagagattatgaaatgaaatatgaattgatttcctttacttgaattattattgaatgatcaaga 17718444  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| |||||  || |||| | |   |||| |||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  17718445 aattgttgagaatgatctgttattgaac--atgatgtgatttgattatgcggcaaatgttatttaactaagttgcatg 17718520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 276 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29448125 - 29447960
Alignment:
Q  276 tgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgttt-atgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgcctt 374  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |   ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29448125 tgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaataattatatgcctt 29448026  T
Q  375 atgtggaagatgtttgatgtttaagttg-ttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  29448025 atgtggaa-atgtataatgtttaaattgattgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 29447960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Original strand, 20911101 - 20911254
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  20911101 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 20911199  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20911200 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 20911254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17011069 - 17010971
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17011069 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 17010971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 12028371 - 12028658
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || | | |||||||||||  || |||||||||| |||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12028371 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattagg-aatggacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 12028469  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| | |||||||| | ||| ||| || |||| || || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| | |||| | |  ||    
T  12028470 tgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattctcgaataaacttga 12028569  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||||||||||        ||| ||||   || || | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12028570 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 12028658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 263201 - 263103
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  263201 tgttgttggttatgtgaaataattatgtgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 263103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 1858782 - 1859069
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||| ||||||| ||| |||||||||| | || || ||||||| || |||||| |||||||||    
T  1858782 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacttgagttgattgaattgattagg-attggaacttaggtagtagtgagacatatttaaga 1858880  T
Q  101 tattaactgaaaa-ctgtgaagctattatgaaatgctaa---gtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatca 196  Q
    | |||| |||||| |||||| ||| || |||| | ||||    || || ||||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  1858881 tgttaattgaaaatctgtgaggctgtt-tgaactactaattgttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatta 1858979  T
Q  197 ggaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     || ||||||| |||||||||| | ||| |        ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1858980 tgatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 1859069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22757436 - 22757219
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || | | |||||||||||  || ||||||||||||  || ||| ||||| |  ||| ||||||||||||    
T  22757436 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattgattaggaatggacatt-aggtagttgtgaaacctatttaaga 22757338  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| | |||||||| | ||| ||| |||||||| | || ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| | |  ||    
T  22757337 tgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattattgaataaacttga 22757238  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattg 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  22757237 tgttgttgaaaatgaattg 22757219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18356132 - 18355979
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  18356132 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 18356034  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    || |  ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18356033 aaac--ttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 18355979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 22325937 - 22326022
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  22325937 tgaattgcaattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgccgttatttaactaagtgcataatgtc 22326022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 25229212 - 25229488
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | | ||    
T  25229212 cgagcacttccagaactgagtgttttttaggattgtgagacttgagttgtttggattagttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatga 25229311  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg--attgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| ||||| ||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||  ||    || ||||||||||| |||||||||||      
T  25229312 tattgactgagaactgagaag-ttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaat 25229410  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  25229411 aaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 25229488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 25293368 - 25293644
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | | ||    
T  25293368 cgagcacttccagaactgagtgttttttaggattgtgagacttgagttgtttggattagttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatga 25293467  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg--attgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| ||||| ||||| |||| | ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||  ||    || ||||||||||| |||||||||||      
T  25293468 tattgactgagaactgagaag-ttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaat 25293566  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  25293567 aaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 25293644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 276
Target Start/End: Original strand, 24767493 - 24767634
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 233  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||   |||     || ||||    
T  24767493 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattataaagttatactattga 24767591  T
Q  234 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 276  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24767592 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 24767634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20805788 - 20805576
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-taatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| || |||| |||||||| |||  |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  20805788 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttattggtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 20805690  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 264  Q
    ||||||| | |||||||||||||  || |||||||  ||||||||||||||| |         ||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20805689 acttgaaatgttattgaatgatctagatgttgttg--aatgaattgatattatgaaattattttgttcttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 20805592  T
Q  265 actaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||    
T  20805591 actaagttgcatgagt 20805576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 433 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 22343592 - 22343517
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22343592 tgaattgcaattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctattgctgttatttaactaagt 22343517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 433 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 22352992 - 22352917
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22352992 tgaattgcaattaatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 22352917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 17918957 - 17919244
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaa-tttaggtactaatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || | | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||     
T  17918957 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgtttggattggttagg-aatgaaactttaggtagtaaggaaacctatttaat 17919055  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || || | |||   ||||||  || ||||||| || |||||  || ||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||||| |||||| | |  ||    
T  17919056 atgttgagtgaggtctgtgagactgttatgaattgttaagttgttgtaatgtgatttaaagattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttga 17919155  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||||||||||        ||| ||||   || || | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17919156 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattacaatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 17919244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 123111 - 123398
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||   || | |  |||||||||| |||||||| |||||||  |||  ||||||| ||||  ||||||| | |||    
T  123111 cgagcacttccagaattgagtgcttttgttaatgtcgtaacctgagttgtttggattggttaggaatggaaccttaggtagtaatatgacctatgtgaga 123210  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||| | |||||| ||| ||||||| || ||||   || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| |    ||     
T  123211 tgttaactgagatctgtgaggctgttatgaattgttaagctgttgtaatgtgatttaaagattaaatgcattacttgaattattcttgaataactttgat 123310  T
Q  201 gttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||        ||| ||||   ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  123311 gttgttgaaaatgaattgttgtgatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 123398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26680890 - 26680606
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26680890 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatttcgtgacctgagttgtttggattgattagg-aatggacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 26680792  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat-gatcagg 198  Q
    | |||||||| |  ||||||| | ||| |||   ||||| || || ||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||| ||||||  | |  |    
T  26680791 tgttaactgagacttgtgaagttgttaagaa---ctaagttgtttgtaatgtgatttaacgatcaaatgcattacttgaattattcttgaataaaccttg 26680695  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||| ||| ||||||||        ||| |||| | || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26680694 atgttattg-aaatgaattgttactatgaaattatgatgatgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 26680606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26952497 - 26952213
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26952497 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatttcgtgacctgagttgtttggattgattagg-aatggacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 26952399  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat-gatcagg 198  Q
    | |||||||| |  ||||||| | ||| |||   ||||| || || ||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||| ||||||  | |  |    
T  26952398 tgttaactgagacttgtgaagttgttaagaa---ctaagttgtttgtaatgtgatttaacgatcaaatgcattacttgaattattcttgaataaaccttg 26952302  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||| ||| ||||||||        ||| |||| | || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26952301 atgttattg-aaatgaattgttactatgaaattatgatgatgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagt 26952213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 21884995 - 21885271
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  21884995 cgagcacttccagaattgagtgttttagtggattgtgagacctgagttgtttggattggttag-aaaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaag 21885093  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcag 197  Q
    ||| | | |   |||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||||     
T  21885094 ataattattatgaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaa 21885192  T
Q  198 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    |||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21885193 gaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 21885271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4036520 - 4036243
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| || |||| |||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | | ||    
T  4036520 cgagcacttccagaactgagtgttttttaggattgtgagacttgggttgtttggattagttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatga 4036421  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg--attgcattacttgaattattattgaatgatc-ag 197  Q
    |||| ||  | |||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| | |||| |||| |||||  ||    || ||||||||||| |||||||||| ||    
T  4036420 tattgaccaagaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaag 4036322  T
Q  198 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
     ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4036321 aaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatga 4036243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26172764 - 26172488
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  26172764 cgagcacttccagaattgagtgttttagtggattgtgagacctgagttgtttggattggtta-gaaaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaag 26172666  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg-attgca-ttacttgaattattattgaatgatcag 197  Q
    ||| | | |   |||||||||||| ||||||| ||  || ||||||| | |||| |||| ||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||     
T  26172665 ataatgattatgaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattgaattacacttacttgaattgttgttgaatgatcaa 26172567  T
Q  198 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    |||  | |||| || || ||| |||| | |  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26172566 gaaactattgagaacgatttgttatttaac--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgaatga 26172488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20767207 - 20766998
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgatta-taatgtgatttattgattgattgcattact 175  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| || |||| | ||||||  ||  |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  20767207 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactactaagttgttggtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 20767109  T
Q  176 tgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 267  Q
    |||| | |||||||||||||  || |||||||||  ||||||||||||| |         ||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  20767108 tgaaatgttattgaatgatctagatgttgttgaa--tgaattgatattatgaacttatgttgttgttgtgatttgcctatgctgctattgttatttaact 20767011  T
Q  268 aagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||    
T  20767010 aagttgcatgagt 20766998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 333 - 405
Target Start/End: Original strand, 20910854 - 20910925
Alignment:
Q  333 ctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttg 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  20910854 ctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttat-tggaaaatgtatgatgtataagttgttg 20910925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 15441966 - 15442051
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15441966 tgaattgcaattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 15442051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42960653 - 42960589
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42960653 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgccgttgttga 42960589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24222188 - 24221901
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  |  | | |||||||||||  || ||||| ||||||  |||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24222188 cgagcacttccagaactgaatgcttttgataaggtcgtgacctgagttgaatgaattgagtaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaaga 24222089  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
      ||| | | || |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  ||    
T  24222088 cgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactaga 24221989  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  24221988 tgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaggttgcatgagt 24221901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 331 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 18356381 - 18356308
Alignment:
Q  331 gcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttg 405  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18356381 gcctatgttgctgttgttggttatctgaaatatttatatgctttat-tggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 18356308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Original strand, 28371031 - 28371095
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  28371031 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttga 28371095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Original strand, 37598892 - 37598956
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  37598892 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttga 37598956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 21295275 - 21295357
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21295275 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 21295357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 24554628 - 24554546
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24554628 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 24554546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14079386 - 14079278
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 174  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14079386 ggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctcttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattac 14079287  T
Q  175 ttgaattat 183  Q
    |||| ||||    
T  14079286 ttgagttat 14079278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 14359829 - 14359914
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14359829 tgaattgtaattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 14359914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22336678 - 22336614
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||    
T  22336678 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgtcgttgttga 22336614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22340216 - 22340152
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||    
T  22340216 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgtcgttgttga 22340152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 353
Target Start/End: Original strand, 26732841 - 26732909
Alignment:
Q  285 gttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgatta 353  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||    
T  26732841 gttgattattatttgatattgttatatcctgagatgtttatgcactgcctatgttgctgttgtttatta 26732909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10753204 - 10753111
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 218  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  10753204 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 10753111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 25535082 - 25535000
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25535082 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 25535000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 400
Target Start/End: Original strand, 33473272 - 33473330
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33473272 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 33473330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23469921 - 23469853
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23469921 agttgatgttgattatcatttgatatggt-atatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 23469853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 22258482 - 22258558
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||    
T  22258482 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgactatgctgctgttgttatttaactgagta 22258558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 22410609 - 22410685
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  22410609 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 22410685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 518
Target Start/End: Original strand, 23337301 - 23337385
Alignment:
Q  434 gaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   || || |||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23337301 gaattgcaattgatataatgatatcatcctattgttgtgttacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 23337385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 353
Target Start/End: Original strand, 26740650 - 26740722
Alignment:
Q  281 tgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgatta 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    | |||||||||||||||| ||||    
T  26740650 tgttgttgattattatttgatattgttatatccttagatgtttatgcactgtctatgttgctgttgtttatta 26740722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31342215 - 31342171
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31342215 tgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 31342171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10816515 - 10816453
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||   |||||| ||||||||    
T  10816515 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgctacctatgatgctgttg 10816453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Original strand, 17517240 - 17517294
Alignment:
Q  226 gctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17517240 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 17517294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 18769809 - 18769931
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||| || | | || ||| |||||||| |||||||||| |  ||   ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18769809 cgagcacttccagaactgagcgcaagtgagaatgtagtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 18769908  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagct 123  Q
      ||||||| || ||||||||||    
T  18769909 agttaactgcaatctgtgaagct 18769931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 20775974 - 20775908
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||    
T  20775974 ttgatatattgatatctccctgctgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactgagta 20775908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 324
Target Start/End: Original strand, 30138930 - 30138976
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgttta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  30138930 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 30138976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23572390 - 23572285
Alignment:
Q  4 gcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagatat 103  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| || ||| || || ||||||||| |||||||||| |  ||   ||||||| ||||||||||||| |||||  |    
T  23572390 gcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctaagttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagt 23572291  T
Q  104 taactg 109  Q
    ||||||    
T  23572290 taactg 23572285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 29316514 - 29316438
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  29316514 tgaattgctgttgatatattgatatatccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 29316438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31342291 - 31342219
Alignment:
Q  146 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattg 218  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  31342291 taatgtgatttaacgattaattgcattacttgaattatccttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 31342219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11220588 - 11220521
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11220588 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11220521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11228997 - 11228930
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11228997 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11228930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11230986 - 11230919
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11230986 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11230919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21873313 - 21873278
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21873313 tatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagt 21873278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23201419 - 23201384
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23201419 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 23201384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 10753015 - 10752965
Alignment:
Q  230 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10753015 ttgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagt 10752965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11227006 - 11226940
Alignment:
Q  126 tatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  11227006 tatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 11226940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15796533 - 15796471
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatg-tttatgtgtcgcctatgttgctgtt 345  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||||    
T  15796533 tgttgattatcatttgatattgctatatcatgagctgttttatgtgctgcctatgttgctgtt 15796471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16354930 - 16354864
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16354930 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 16354864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16361589 - 16361523
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16361589 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 16361523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25106869 - 25106803
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  25106869 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 25106803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25165962 - 25165896
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  25165962 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 25165896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 34564923 - 34564857
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  34564923 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 34564857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 34571578 - 34571512
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  34571578 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 34571512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14079208 - 14079175
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14079208 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 14079175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 280
Target Start/End: Original strand, 23501415 - 23501448
Alignment:
Q  247 tgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23501415 tgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 23501448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22757193 - 22757149
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  22757193 tgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttacatgagt 22757149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23512174 - 23512122
Alignment:
Q  228 tgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23512174 tgttgatgcgatctgcctatgctgctattgttatttaactaaagtgcatgagt 23512122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23572152 - 23572108
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23572152 tgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagt 23572108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 323
Target Start/End: Original strand, 27988934 - 27988978
Alignment:
Q  279 gttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgttt 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  27988934 gttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagctgttt 27988978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 345
Target Start/End: Original strand, 41861455 - 41861523
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatg-tttatgtgtcgcctatgttgctgtt 345  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||||    
T  41861455 agttgatggtgattgtcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtgctgcctatgttgctgtt 41861523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 90)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 21976475 - 21976993
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  21976475 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 21976573  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21976574 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 21976673  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21976674 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 21976773  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21976774 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 21976873  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21976874 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgctgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 21976973  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  21976974 ttaactaagtgcatgatgtc 21976993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 19278089 - 19278606
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||| ||||| ||||||  || | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  19278089 cgagcactttcagaattgagtgttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaag 19278187  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    ||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19278188 ataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 19278287  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19278288 agttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttg 19278387  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19278388 atattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 19278487  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19278488 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttctgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatt 19278587  T
Q  500 taactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  19278588 taactaagtgcatgatgtc 19278606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 43252113 - 43251596
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||  | |||||||| |||    
T  43252113 cgagcacttccagaattgagtgttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagcgtgacctattaaag 43252015  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    ||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43252014 ataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgattagga 43251915  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251914 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 43251815  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251814 atattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 43251715  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatt 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  43251714 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttact 43251615  T
Q  500 taactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  43251614 taactaagtgcatgatgtc 43251596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 518
Target Start/End: Original strand, 21972390 - 21972904
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcattt-gaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaa 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| ||    
T  21972390 cgagcacttccagaattgagtgtttttagtgcattgtgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaa 21972488  T
Q  99 gatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21972489 gataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 21972588  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcattt 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21972589 aagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcattt 21972688  T
Q  299 gatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21972689 gatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 21972788  T
Q  399 gttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttat 498  Q
        || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21972789 ----ttaatgcttcacataaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttat 21972884  T
Q  499 ttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  21972885 ttaactaagtgcatgatgtc 21972904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Original strand, 21827969 - 21828259
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  21827969 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 21828062  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21828063 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 21828162  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21828163 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgc 21828259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 16231281 - 16231559
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16231281 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacttgagttgttcggattggttaggaaagggactttaggtactaatgagacctattaaaga 16231380  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16231381 tattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaaga 16231480  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16231481 atttgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 16231559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Original strand, 18862600 - 18862890
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  18862600 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 18862693  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18862694 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgttg 18862793  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18862794 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgc 18862890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 149 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21411096 - 21410811
Alignment:
Q  149 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatg 248  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  21411096 tgtgaattaatgattaaatgcattatttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatg 21411003  T
Q  249 ctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgtt 348  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21411002 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgtt 21410903  T
Q  349 gattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21410902 ggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 21410811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 149 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21805588 - 21805303
Alignment:
Q  149 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatg 248  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  21805588 tgtgaattaatgattaaatgcattatttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattgattatg 21805495  T
Q  249 ctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgtt 348  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21805494 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgtt 21805395  T
Q  349 gattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21805394 ggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 21805303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 327 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22111905 - 22111714
Alignment:
Q  327 tgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111905 tgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgtt 22111806  T
Q  427 atgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22111805 atgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctttattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtc 22111714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23834473 - 23834194
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23834473 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctattaaaga 23834374  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtg-atttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| ||||| ||||||||| || ||||||| || ||||||||||| | ||| |||||| || |||||| | |||||||||||||| |||||||| || |    
T  23834373 tattgactgagaactgtgaatcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaatttatggactgattgtatttacttgaattattgttgaatgaccaag 23834274  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    || ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23834273 aaattgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgactatgatgcaattgttattaaactatgttgcatgagt 23834194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 36 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22112116 - 22111904
Alignment:
Q  36 tgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatg 134  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||| | | ||  || |||||||||||  |||||||    
T  22112116 tgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatg 22112018  T
Q  135 ctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgat 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22112017 ctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgat 22111918  T
Q  235 atgatctgattatg 248  Q
    || |||||||||||    
T  22111917 ataatctgattatg 22111904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22045147 - 22044906
Alignment:
Q  38 agacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgcta 137  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||    
T  22045147 agacctgagttgtttggtttggttaggaaatgaactttagatactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgtta 22045048  T
Q  138 agtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatat 236  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |    
T  22045047 agtgattataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattatggaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgt 22044950  T
Q  237 gatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  22044949 gatttgattgtgctgcaattgttatcaaactaagttgcatgagt 22044906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22028857 - 22028647
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22028857 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattgtgagacctgagttgttcggattggttaggaaaggaactttaagtactaatgagacctattgaaga 22028758  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22028757 tattgactaagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaaga 22028658  T
Q  200 agttgttgaaa 210  Q
    | |||||||||    
T  22028657 aattgttgaaa 22028647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18619778 - 18619555
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18619778 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggaatggttaggaaaggaaccttaggtgctaatgagacctattaaaga 18619679  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18619678 tattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatggattgattgtctttacttgaattattattgaatgatcaaga 18619579  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    | ||| |||||||||||||| |||    
T  18619578 aattgctgaaaatgaattganatt 18619555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 30308560 - 30308837
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30308560 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggaatggttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaaga 30308659  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  30308660 tattgactgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtattacttgaattattgttgaatgatcaagaa 30308759  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||  ||||| ||| ||||||     ||||  ||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30308760 attgttgtgaatgatttgttattaa--atctgatgggatttgattatgttgcaattgttattaaactaatttgcatgagt 30308837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18833680 - 18833519
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18833680 agttgatgttgtttattatttgatattgttatatc-tgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 18833582  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18833581 tggaaaatgtatgatgtttaagttttttatgcttctcattaatattgatatgttgtgaattgc 18833519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 37515824 - 37515662
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37515824 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatgtgccttatg 37515725  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  37515724 tggaaaaagtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgc 37515662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 278 - 439
Target Start/End: Original strand, 14397864 - 14398017
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||          
T  14397864 agttgctgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgc------ 14397957  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
      |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14397958 --gaagatgtatgatgtttaagttgttgttgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 14398017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 20465844 - 20466131
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || | | |  ||| |||||||| |||||||||| |  ||   ||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  20465844 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgtcgtgttctgtgttgcttgaattgattagggacggacccttaggtagtaatgtgacctatataaga 20465943  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
      ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  20465944 ggttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga 20466043  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466044 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgcctatactgctattgttatttaactaagttgcatgagt 20466131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 17461054 - 17461216
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17461054 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctctagatgtttatgtgtttcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 17461153  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17461154 tggaaaatgtaagatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 17461216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 23846821 - 23847096
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23846821 cgagcacttccagaattgagtgttttagaggattgtgagacctgagtggtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaaga 23846920  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23846921 taatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaaga 23847020  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23847021 aattgttgagaatgatttgttattaaatctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 23847096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 278 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23659526 - 23659371
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23659526 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 23659427  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 433  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  23659426 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttcattaatattgttatgttgt 23659371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 22238021 - 22238182
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22238021 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtttcttatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 22238120  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  22238121 tggaa-atgtatgatgtttaagttgttgatcctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 22238182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 279 - 440
Target Start/End: Original strand, 19808365 - 19808526
Alignment:
Q  279 gttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgt 378  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19808365 gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgcctcatgt 19808464  T
Q  379 ggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19808465 ggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatatttttatgttgtgaattgc 19808526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15538748 - 15538473
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||  |||    
T  15538748 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttagaaaaggaactttaggtgctaatgagacctattagaga 15538649  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  ||| |||||| | ||||||| || |||| ||| || |  |||  ||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  15538648 taatgactgtgaacagtgaagattttatgaactgttaagggataatgaaatgaaatatggattgattgcctttacttgagttattgttgaatgatcaaga 15538549  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||||||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15538548 aattgttgagaatgaattgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 15538473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23409914 - 23409752
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23409914 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatg 23409815  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||  |||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  23409814 tggaaaatgaatgatatttaagttgttgatgttcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 23409752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15532188 - 15531914
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||  |||    
T  15532188 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttagaaaaggaactttaggtgctaatgagacctattagaga 15532089  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||| ||||| | |||| || || |||| ||| || |  |||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15532088 taatgactgtgaactatgaagattttat-aactgttaagggataatgaaatgaaatatggattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaaga 15531990  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||||||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15531989 aattgttgagaatgaattgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 15531914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 278 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 23914156 - 23914029
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23914156 agttgttgctgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 23914057  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttg 405  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  23914056 tggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 23914029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Original strand, 30643169 - 30643384
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaa-gctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcat 171  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| ||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  30643169 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatctgtgaaagctgttacgaactgttaagttgattataatatgatttaatgattaattgcat 30643268  T
Q  172 tacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattt 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30643269 tacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttattt 30643367  T
Q  264 aactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||    
T  30643368 aactaagttgcatgagt 30643384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 20856230 - 20856517
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |   | ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  20856230 cgagcacttccagaactgagtgcttttgagattgccgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaaattcaggtagtaatgtgacctattaaaga 20856329  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | ||| |||| | ||||||| || ||||||| ||||||| || || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  ||    
T  20856330 tgttagctgagatctgtgaacctgttatgaattgctaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaattattcttgaataacctaga 20856429  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     |||||||||||||||||| | ||| |         | ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20856430 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatattgttgtgatctgattatgctgct-ttgttatttaactaagttgcatgagt 20856517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 22010484 - 22010767
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| || | |||| |||||||||    
T  22010484 cgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacatatttaaga 22010583  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||||| |||||| | | || |||| ||||||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||    
T  22010584 tgttaactgaaatctgtgaggttgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattcttgaatgatctaga 22010682  T
Q  200 agttgttgaaaatgaa---ttgatattaagct-----gttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||    |||||||   ||| ||| ||| |     |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22010683 tgttg----aaatgaattgttgttatgaagttataaagttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 22010767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Original strand, 17926585 - 17926798
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  17926585 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 17926683  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  17926684 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattgtgaaattatgctgttgttttgatctgcctatgctactattgttattta 17926782  T
Q  265 actaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||    
T  17926783 actaagttgcatgagt 17926798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 15602903 - 15603109
Alignment:
Q  82 taatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagtgat-tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 179  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||  | | |||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  15602903 taatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaaactgctaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaa 15603001  T
Q  180 ttattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta--------agctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 271  Q
     |||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||         ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15603002 atattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaatcgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagt 15603100  T
Q  272 tgcatgagt 280  Q
    |||||||||    
T  15603101 tgcatgagt 15603109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Original strand, 16410133 - 16410346
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  16410133 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatatgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 16410231  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||        ||| |||| ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||     
T  16410232 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattggtattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttc 16410330  T
Q  265 actaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||    
T  16410331 actaagttgcatgagt 16410346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 424
Target Start/End: Original strand, 16402021 - 16402150
Alignment:
Q  295 atttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgt 394  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  16402021 atttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgt 16402120  T
Q  395 ttaagttgttgatgcttcacattaatattg 424  Q
    ||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  16402121 ttaagttgttgatactcttcattaatattg 16402150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 16861132 - 16861417
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||| || |||||||||  ||| |||||||| || |||||| |||||||||    
T  16861132 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaatcgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacatatttaaga 16861231  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
      ||| |||||| |||| | ||| || |||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  16861232 ggttagctgaaatctgtaaggctgtt-tgaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatacattacttgaaatattattgaatgattaaga 16861330  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| |||||||||| | ||| |        ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  16861331 tgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaatataatgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccgagttgcatgagt 16861417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 15611355 - 15611561
Alignment:
Q  82 taatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagtgat-tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 179  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| | ||||||  | | |||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  15611355 taatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaaactactaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaa 15611453  T
Q  180 ttattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta--------agctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagt 271  Q
     |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  15611454 atattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgattatgctggttttgttatttaaccaagt 15611552  T
Q  272 tgcatgagt 280  Q
    |||||||||    
T  15611553 tgcatgagt 15611561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 344 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23478422 - 23478326
Alignment:
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23478422 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtttatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 23478326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 433 - 508
Target Start/End: Original strand, 26935187 - 26935262
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26935187 tgaattgcaattgatatattgatatctccctgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 26935262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19880172 - 19880074
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||    
T  19880172 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgagaattgc 19880074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26454054 - 26453956
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26454054 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 26453956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Original strand, 19929556 - 19929655
Alignment:
Q  342 tgttgttgattat-gtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19929556 tgttgttgattattgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattaatattgttatgctgtgaattgc 19929655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 377592 - 377414
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| || | | || ||| |||||||| |||||||||| |  ||   ||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  377592 cgagcacttccagaactgagtgctaatgagaatgtcgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatataaga 377493  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttga 178  Q
    | ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  377492 tgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgatcataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 377414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Original strand, 14398039 - 14398192
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||    
T  14398039 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagttgttgttgaaa-tgaattgttatt 14398137  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||| |  ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14398138 aagcttt--atgcgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 14398192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 17828389 - 17828663
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| || | || ||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||  |||    
T  17828389 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgagagacttgagctgttgggtttggttagaaaatgaactttaggtgctaacgagacctattagaga 17828488  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattga-ttgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    || | ||||  |||||||||| | ||||||  || |||| ||| || |  |||  ||| || ||||||| | ||||||| |||||| || | |||||| |    
T  17828489 taatgactgtgaactgtgaagattttatgatttgttaagggataatgaaatgaaatatggatttgattgtctttacttg-attattgttaattgatcaag 17828587  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    || ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  17828588 aa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttaattaactaagttgcatg 17828663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21387228 - 21387095
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||  | ||| || ||| ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||| |||    
T  21387228 tatactgtgatttaatgattaaatgcattgttcgaaatagtatcgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttga 21387132  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21387131 ttatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 21387095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24755959 - 24755842
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 175  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24755959 ggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 24755860  T
Q  176 tgaattattattgaatga 193  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  24755859 tgaaatgttaatgaatga 24755842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21383801 - 21383675
Alignment:
Q  151 tgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgct 250  Q
    ||||||| ||||| | |||||| || ||| || ||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||| |    
T  21383801 tgatttaatgattaaatgcattgctcgaaatagtattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgtt 21383705  T
Q  251 gctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21383704 gcaattgttatttaactaagttgcatgagt 21383675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 178
Target Start/End: Original strand, 19259460 - 19259565
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  19259460 ttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcatt 19259559  T
Q  173 acttga 178  Q
    ||||||    
T  19259560 acttga 19259565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 284 - 381
Target Start/End: Original strand, 1327015 - 1327112
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 381  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1327015 tgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctaagttgctgttgtaggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtgga 1327112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 19905592 - 19905507
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19905592 tgaattgtaattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 19905507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 347
Target Start/End: Original strand, 20502104 - 20502172
Alignment:
Q  279 gttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  20502104 gttgttgttggttatcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgctgcctatgttgctgttgt 20502172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20527543 - 20527461
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20527543 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 20527461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 24434043 - 24434137
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| || |||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  24434043 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgagagacttgagctgtttggattggttagaaaaggaactttaggtgctaatatgacctatt 24434137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19983331 - 19983223
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 174  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19983331 ggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattac 19983232  T
Q  175 ttgaattat 183  Q
    |||| ||||    
T  19983231 ttgagttat 19983223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 32605510 - 32605234
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaa-tgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| |||| |  || | | ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||  |||||||||| | || |||||||| |||    
T  32605510 cgagcacttccagaattgagagttttagtgcattgtgagacctgagttgtttggattggttag-aaaggagctttaggtacttagtgtgacctattaaag 32605412  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcag 197  Q
    ||| | |     |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||||     
T  32605411 ataatgatcatgaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaa 32605313  T
Q  198 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    |||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32605312 gaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 32605234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 39094747 - 39094856
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||  || ||||| ||| ||  ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  39094747 cgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgaattgagtagaaatggaacttaaggtagtaatgtgacctatttaaga 39094846  T
Q  101 tattaactga 110  Q
    | ||||||||    
T  39094847 tgttaactga 39094856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 280
Target Start/End: Original strand, 39094875 - 39095017
Alignment:
Q  146 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatatg 237  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||| ||||| |         ||||| | ||    
T  39094875 taatgtaatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttattatgaagttataatgttgttgtg 39094974  T
Q  238 atctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39094975 atctgaatatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagt 39095017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 329
Target Start/End: Original strand, 25363204 - 25363255
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25363204 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 25363255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 400
Target Start/End: Original strand, 8414418 - 8414476
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8414418 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 8414476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11775066 - 11775008
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11775066 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 11775008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Original strand, 18678141 - 18678195
Alignment:
Q  226 gctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18678141 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 18678195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32121814 - 32121760
Alignment:
Q  226 gctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32121814 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 32121760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Original strand, 17438227 - 17438288
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17438227 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgtttctgttgt 17438288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19899333 - 19899225
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 174  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  19899333 ggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaatttcattac 19899234  T
Q  175 ttgaattat 183  Q
    |||| ||||    
T  19899233 ttgagttat 19899225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 18065427 - 18065351
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  18065427 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 18065351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Original strand, 22166189 - 22166288
Alignment:
Q  3 agcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaagat 101  Q
    ||||||||||||| ||||||  || | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||||| || || |||||||| |||||    
T  22166189 agcacttccagaattgagtgttttagtggattttgagacctgagttgtttggattggtta-gaaaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaagat 22166287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 22113534 - 22113635
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  22113534 cgagcacttccagaattgagtgttttagtggattgtgagacctgagttgtttggattggtta-gaaaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaag 22113632  T
Q  100 ata 102  Q
    |||    
T  22113633 ata 22113635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 22135037 - 22135138
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  22135037 cgagcacttccagaattgagtgttttagtggattgtgagacctgagttgtttggattggtta-gaaaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaag 22135135  T
Q  100 ata 102  Q
    |||    
T  22135136 ata 22135138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 347
Target Start/End: Original strand, 22963426 - 22963484
Alignment:
Q  289 attatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22963426 attattatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtactgcctatgttgctgttgt 22963484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16184966 - 16184862
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 174  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||  ||||| ||| |||   |||||||||||||||||| || || |||||||| |    
T  16184966 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgatatgagatgttaatgttgattataatgtgatttaatgtttaattgcattgc 16184867  T
Q  175 ttgaa 179  Q
    |||||    
T  16184866 ttgaa 16184862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 278
Target Start/End: Original strand, 17055424 - 17055461
Alignment:
Q  241 tgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17055424 tgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 17055461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Original strand, 17086155 - 17086224
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||    
T  17086155 agttgatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctattttgcttttgt 17086224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 32598867 - 32598702
Alignment:
Q  112 aactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaa 209  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||| |||  | ||||     
T  32598867 aactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgag 32598769  T
Q  210 aatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    ||||| ||| ||||   ||  |||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32598768 aatgatttgttatttgact--tgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 32598702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 377339 - 377295
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  377339 tgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagt 377295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Original strand, 23776884 - 23776928
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23776884 tgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagt 23776928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24755782 - 24755738
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24755782 tgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagt 24755738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 471 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 3216320 - 3216273
Alignment:
Q  471 tgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3216320 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 3216273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Original strand, 17354001 - 17354036
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17354001 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 17354036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Original strand, 18862911 - 18862978
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  18862911 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 18862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Original strand, 21828280 - 21828347
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  21828280 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 21828347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 340
Target Start/End: Original strand, 5083164 - 5083218
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttg 340  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  5083164 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttg 5083218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 328
Target Start/End: Original strand, 22253167 - 22253217
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  22253167 agttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtatatgtg 22253217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19983152 - 19983119
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19983152 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatga 19983119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22995962 - 22995893
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   | |||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  22995962 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatctgaatatgttattgtgctgcctatgttgctgttgt 22995893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 343
Target Start/End: Original strand, 23943995 - 23944060
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  || ||||| |||||  || ||||||||||    
T  23943995 agttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttaatgtgctgcatatgttgctg 23944060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 280
Target Start/End: Original strand, 19259648 - 19259684
Alignment:
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19259648 ttatgctactattgttatttaaccaagttgcatgagt 19259684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Original strand, 21162107 - 21162151
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21162107 tgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagt 21162151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Original strand, 21168780 - 21168824
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21168780 tgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagt 21168824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 518
Target Start/End: Original strand, 58560 - 59042
Alignment:
Q  36 tgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatg 134  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||| | | ||  || |||||||||||  |||||||    
T  58560 tgagacttgagttgcttggattggttag-aaatgaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatg 58658  T
Q  135 ctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgat 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  58659 ctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgat 58758  T
Q  235 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcct 334  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  58759 ataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcct 58858  T
Q  335 atgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtg 434  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58859 atgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtg 58958  T
Q  435 aattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  58959 aattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtc 59042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 35749 - 36188
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||| |||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  35749 cgagcacatccaaaattgagtgcttttgaggagtttgagacgtgagttgcttggattggttat-aattgaactttaggtacatagtgtgacctattaaag 35847  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    ||| | | ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35848 ataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 35947  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 299  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35948 agttgttgaaatt-aattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttg 36046  T
Q  300 atattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaag 399  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36047 atattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaag 36146  T
Q  400 ttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgca 441  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36147 ttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgca 36188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7244 - 6967
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  7244 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggaatggttaggaaaagaactttaggtgctaatgtgacctattaaaga 7145  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| ||||||| || || |||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7144 tattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaaga 7045  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgag 279  Q
    ||||| ||  ||||| ||| |||||| |  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7044 agttgctgtgaatgatttgttattaaac--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgag 6967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 45418 - 45288
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||   |||||| || |||||||||| |||||    
T  45418 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacaataggtagtagtgagacctatataaga 45319  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaa 131  Q
    | |||| ||||| |||||||| | |||||||    
T  45318 tgttaaatgaaatctgtgaagttgttatgaa 45288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 144 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 602 - 233
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  602 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 509  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaa-gttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgct 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  508 ttatgctgctattgttatttaactaaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgct 409  T
Q  343 gttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaa 442  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408 gttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaagatgtttgatgtttaagttattgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaa 309  T
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    || |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  308 ttaatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtc 233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4741 - 4454
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||| || ||| |||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||||| |||||    
T  4741 cgagcacttccagaactgagttcaagtgagaatgttgtgaactgtgttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatataaga 4642  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
      ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  4641 agttaactgtaaactgtgaaactattatgaaatgctaagttgattataatgtgatttattgattaattgcattacttgaaatattatcgaatgatcaaga 4542  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4541 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattatgctgccattgttatttaactaagttgcatgagt 4454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 66221 - 66500
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  66221 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 66320  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  66321 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaa 66420  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  66421 gttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 66500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 5)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 53865 - 53586
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53865 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaaga 53766  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53765 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaa 53666  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53665 gttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 53586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Original strand, 36041 - 36331
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  36041 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 36134  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36135 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 36234  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  36235 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgc 36331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Original strand, 36352 - 36419
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  36352 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 36419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Original strand, 65856 - 65891
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  65856 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 65891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 128809 - 128777
Alignment:
Q  250 tgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  128809 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagttg 128777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13204 - 12925
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13204 cgagcacttccagaaccgagtgcatatgaggattttgagacttgagttgcttggattgattaggaaatgaactttaggtactaatgagacctatttaaga 13105  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13104 tattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaa 13005  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13004 attgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagt 12925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19488 - 19209
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||    
T  19488 cgagcacttccagaactgagtgcatatgaggattttgagacttgagttgcttagattgattaggaaatgaactttcggtactaatgagatatatttaaga 19389  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  19388 tattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaatgatcaagaa 19289  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19288 attgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctattgttaattaactaagttgcatgagt 19209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 62386 - 62284
Alignment:
Q  174 cttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  62386 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgagttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttg 62289  T
Q  274 catga 278  Q
    |||||    
T  62288 catga 62284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 13293 - 13568
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaattttaggtactaatgagacctatttaaga 13392  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  13393 tattaactgataactgtgtagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattactttaattattattgaatgatcaagaa 13492  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 276  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  13493 gttgttgaagatcgattgatattaagttgttgatgtgatctgattattctgttattgttaattaactgagttgcat 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 173590 - 173313
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  173590 cgagcacttccataactgagtgcatttgaggattttgagacttgagttgcttggattgattaggaaaggaactttaggtactaaagagacctattaaaga 173491  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  173490 tattaactgagaactttgaagctattatgaaatgctaagtgattatattgtgatatattgattgattgcattacttgaattattattgaatgataaagaa 173391  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  173390 attgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 173313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 422337 - 422624
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |   || |||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  422337 cgagcacttccagaacagagtgcttttgaggatgtaatgatctgagttgtttggattggttaggaatggaactttaggtagtaatgaaacctatttaaga 422436  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | ||||||  || |||||||| | ||| ||| |  |||| || || ||||||||||||  || | | |||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  422437 tgttaactagaatctgtgaagttgttaagaactattaagttgtttgtaatgtgatttaacgactaaatgcattacttgaattattcttgaatgatctaga 422536  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  422537 tgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctaattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 422624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 168782 - 168724
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  168782 tgttgttgcttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 168724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 176136 - 176078
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagt 400  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  176136 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 176078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 18438 - 18717
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  18438 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattgtgagacctgagttgtttggattagttaggaagggaactttaggtactgctgagacctattaaaga 18537  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  18538 tattgaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattatttttgaatgatcaagaa 18637  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18638 attattgaaaatgaattgttattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttacctaagttgcatgagt 18717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 2479 - 2757
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2479 cgagcacttccagaattgagtgcatttgagaagtttgaaacctgagttgcttggattgattaggaaatgaactttaggtactaatgagacctatttaaga 2578  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  2579 tattaactgagaattgtgaagcttttatgaactgctaagtgattatattgtgatatattgattgattggattacttgaattgttattgaatgatcaagaa 2678  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2679 attgttg-aaatgaattgttattaagctgttgatgtgatctgattatgctgcaattgttaattaactaagttgcatgagt 2757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 9434 - 9349
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  9434 tgaattgcaattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 9349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30451 - 30381
Alignment:
Q  278 agttgttg-ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30451 agttgttgattgattattatttgacattgttatgtcttgagatgtttatgtgatgcctatgttgctgttgt 30381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 228179 - 228457
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  228179 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctacttaaga 228278  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  228279 tattaactgagaactgtgaagtttttatgaaatgctaagtgattatatagtgatttattgattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaaga 228378  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  228379 aatagttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 228457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 85664 - 85502
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||    
T  85664 agttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcagatgccttatg 85565  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  85564 tggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 85502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 290 - 518
Target Start/End: Original strand, 67397 - 67624
Alignment:
Q  290 ttatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgttt 389  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67397 ttatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgttgttgttggttatgt-aaatatttatatgccttatgtggaagatgttt 67495  T
Q  390 gatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctac 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  67496 gatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctac 67595  T
Q  490 tgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  67596 tgctgttacttaactaagtgcatgatgtc 67624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 19823 - 20099
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19823 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctattaaaga 19922  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19923 tattaattgagaactgtgaagcttttatgaaacgttaagtgattataatgtgatttattgattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaaga 20022  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20023 aattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattatgttgcaattgttattaaactaagttgcatga 20099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Original strand, 11456 - 11746
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  11456 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 11549  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11550 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 11649  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11650 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 11746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Original strand, 189332 - 189622
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  189332 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 189425  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  189426 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 189525  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  189526 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgc 189622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 24774 - 25053
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24774 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctattaaaga 24873  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatc--ag 197  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24874 tattgactgagaactgtgaagcttttaggaaatgttaagtgattataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaaag 24973  T
Q  198 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||| || |||||||||  ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24974 gaa-ttattgaaaatgtgttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactgagttgcatgagt 25053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 345
Target Start/End: Original strand, 221208 - 221275
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgtt 345  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  221208 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgtagctgtt 221275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Original strand, 189643 - 189710
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  189643 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 189710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 9471 - 9750
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9471 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattatgagacctgagttgtttggattgattaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctatttaaga 9570  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9571 tattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgattataatgtgatttattgattgatcgcatttacttgaattattattgaatgatcaaga 9670  T
Q  200 agttgtt-gaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | |||||   |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9671 aattgttattaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattacgctgcaattgttaattaactatgttgcatgagt 9750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Original strand, 14042 - 14332
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  14042 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 14135  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  14136 ttatgctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttacgtgtcgcctatgttcctg 14235  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14236 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgc 14332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Original strand, 14353 - 14420
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaat 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||    
T  14353 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaat 14420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 548 - 256
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||    
T  548 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagct--tgatatgaattga 455  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaa-ctaa-gttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgc 341  Q
    ||||||||| |||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  454 ttatgctgcaattgttgttaaaactaaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgc 355  T
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  354 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 3336 - 3614
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3336 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattgtgagaccttagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgagacccattaaaga 3435  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  3436 tattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatatagagtgaattatggattgattgcatttacttgaattgttattgaatgatcaaga 3535  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3536 aattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatactgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 3614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 144 - 440
Target Start/End: Original strand, 32615 - 32905
Alignment:
Q  144 tataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctga 243  Q
    |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||| ||||| |||||||||  ||| ||||  |||    
T  32615 tatactgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagct--tgacatgaattga 32708  T
Q  244 ttatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctg 343  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32709 ttatgctgtaattgttgttaaactaagttgcatgagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctg 32808  T
Q  344 ttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32809 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgc 32905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 10390 - 10585
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10390 cgagcacttcaagaaatgagtgcatttaagaattttgagacctgagttgcttggattgataaggaaaagaactttaagtactaatgagacctatttaaga 10489  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatca 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10490 tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatactaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatca 10585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 69853 - 69818
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  69853 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 69818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 39371 - 39209
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39371 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 39272  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39271 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 39209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 138; Significance: 7e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 18166 - 18444
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18166 cgagcacttccagaattgattgtatttgaggattgcgagccctgagttgtttggattggttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaaga 18265  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |     
T  18266 taatgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaaaataaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaagg 18365  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18366 aattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 18444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 971 - 809
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  971 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 872  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  871 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 229 - 1
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  229 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggattggttaggataggaactttaggtactaatgagacttattaaaaa 130  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  129 tattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaaga 30  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagct 228  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  29 aattgttgagaatgaattgttattaagct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 280 - 440
Target Start/End: Original strand, 207587 - 207747
Alignment:
Q  280 ttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  207587 ttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgtcgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtg 207686  T
Q  380 gaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  207687 gaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatcttgtgaattgc 207747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 278
Target Start/End: Original strand, 207768 - 207931
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttg-ttgaaaatgaattgatat 222  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  207768 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgatat 207867  T
Q  223 taag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    || |        ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  207868 tatgaagttatactgttgatatgatatgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 207931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31242 - 31080
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31242 agttgttgtttattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatg 31143  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31142 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttttgaattgc 31080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31059 - 30906
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  31059 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttatt 30961  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||  |||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30960 aagc--ttgatgagatttgattatgctgtaattgttatttaactaagttgcatgagt 30906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 20212 - 20374
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  20212 agttgttgttgattagcatttgatattgttaaatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatg 20311  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20312 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 20374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 278
Target Start/End: Original strand, 20395 - 20546
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||  ||| ||||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||| ||||    
T  20395 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacacgaaatattattgaataatcaagatgttgatgaaa-tgaattgttatt 20493  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20494 aagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 20546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17621 - 17552
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  17621 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtactgcctaagttgctgttgt 17552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21285 - 21123
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21285 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 21186  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21185 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcagtaatattgttatgttgtgaattgc 21123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Original strand, 16406 - 16441
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16406 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 16441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 126074 - 125912
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  126074 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 125975  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  125974 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgc 125912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 5)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 280 - 424
Target Start/End: Original strand, 80420 - 80564
Alignment:
Q  280 ttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  80420 ttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatatgaaatatttatatgccttatgtg 80519  T
Q  380 gaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattg 424  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80520 gaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattg 80564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 224
Target Start/End: Original strand, 21447 - 21597
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  21447 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgtatt 21546  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  21547 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 21597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 440
Target Start/End: Original strand, 80562 - 80599
Alignment:
Q  403 ttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80562 ttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 80599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 210
Target Start/End: Original strand, 80642 - 80706
Alignment:
Q  146 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaa 210  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  80642 taatgtgatttaatgattaaatgcattgctcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 80706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 280
Target Start/End: Original strand, 80810 - 80860
Alignment:
Q  230 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  80810 ttgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagttgcaagagt 80860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 6063 - 6340
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  6063 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggaatggttaggaaaagaactttaggtgctaatgtgacctattaaaga 6162  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| ||||||| || || |||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  6163 tattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaaga 6262  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgag 279  Q
    ||||| ||  ||||| ||| |||||| |  ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6263 agttgctgtgaatgatttgttattaaac--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactatgttgcatgag 6340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 120127 - 119965
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  120127 agttattgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 120028  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  120027 tgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattattatgttgtgaattgc 119965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 278
Target Start/End: Original strand, 16640 - 16745
Alignment:
Q  171 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 270  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| |   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16640 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaa--gttgatatgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 16737  T
Q  271 ttgcatga 278  Q
    | ||||||    
T  16738 tcgcatga 16745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 5)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 71613 - 71460
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  71613 cgagcacttccagaattgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggagaggaaccttaggtactaatgagacctatttaaga 71514  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 154  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  71513 tgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 71460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 331 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 71367 - 71258
Alignment:
Q  331 gcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 430  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71367 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 71268  T
Q  431 tgtgaattgc 440  Q
    ||||||||||    
T  71267 tgtgaattgc 71258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 140010 - 139736
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  |||    
T  140010 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttaggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagaga 139911  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||| ||||||||||   ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| || |||||| | ||||| ||||||||  | | |||||| ||    
T  139910 taatgactgagaactgtgaaggctttatgaattgttaagagattatgaaatgaaatatggagtgattgcctttactcgaattattgattattgatcaaga 139811  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| | ||||||  ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  139810 a-ttgttgagaatgatttgttgttaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 139736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 413856 - 414140
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||| || ||  |||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||||||| ||| || || ||| |||||    
T  413856 cgagcacttccagaactgaatgtaattgagaatgttatgacctgagttgcttggattggttaggaatggaaccttaggtagtaaagaaacatatataaga 413955  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | ||||||| || |||||||| | ||| ||| || |||| || || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  413956 tgttaactggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaatgatctaga 414055  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
     ||||||| ||| ||||        ||| ||||   ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  414056 tgttgttg-aaacgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatg 414140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 71215 - 71090
Alignment:
Q  146 taatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgatt 245  Q
    |||||||||||  ||||| | ||||||| || || |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||       |||| |||||    
T  71215 taatgtgattttatgattaaatgcattattttaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct-------tgat-tgatt 71125  T
Q  246 atgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  71124 atgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 71090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5896 - 5610
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  | | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  5896 cgagcacttccataactgaatgcaaattaagatgttaagacctgagttgcttggattgattaggaatgggactttaggtagtaatgtgacctatt-aaga 5798  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| | || ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  5797 tgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgattaaatgaataattgcattacttgagatattattgaatgatcaaga 5698  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||||||||||||||||       || ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5697 tgttgttgaaaatgaattgatattatgaactatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatttaactaagttgcatgagt 5610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7091 - 6805
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  | | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  7091 cgagcacttccataactgaatgcaaattaagatgttaagacctgagttgcttggattgattaggaatgggactttaggtagtaatgtgacctatt-aaga 6993  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| | || ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  6992 tgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgattaaatgaataattgcattacttgagatattattgaatgatcaaga 6893  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||||||||||||||||       || ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6892 tgttgttgaaaatgaattgatattatgaactatgctgttgttgtgatctgattatgctgctactgttatttaactaagttgcatgagt 6805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15397 - 15111
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||| |||||||| || |||||||| | |||||    
T  15397 cgagcactttcagaactgagtgcatttgagaatgttttgacctgagttgctttaattgatttggaatggaactttaggtagtagtgagacctttataaga 15298  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | ||||||| || |||||||||| |||| ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  15297 tgttaactgcaatctgtgaagctgttataaaaagttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga 15198  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgt-------tgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| |||||||||||||||| |  ||       || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15197 tgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgtgttgtgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 15111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 278 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 17692 - 17559
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17692 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 17593  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgctt 411  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17592 tggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctt 17559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23516 - 23238
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23516 cgagcacttccataactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttgtattggttaggaaaggaaccttagttactaatgagacctattcaaga 23417  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  23416 tattgactgagaactatgaagcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgaccaaga 23317  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  23316 aattgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattaagctgcaattattattaaactatgtttcatgagt 23238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 242151 - 242069
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  242151 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtc 242069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 766 - 697
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||  | | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  766 agttgatgttgattattatttcatgatgtgatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 169751 - 169913
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  169751 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 169850  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  169851 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 169913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 142692 - 142631
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  142692 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 142631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 398 - 183
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  398 ttaggtagtaatgtgacctaattaagatgttaacggaaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgactaattgcatt 299  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||        ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  298 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttatgttgttgatgtgatctgattatgctgctattgttattta 199  T
Q  265 actaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||    
T  198 actaagttgcatgagt 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10203 - 9928
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10203 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggtttggttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaaga 10104  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10103 taatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaaga 10004  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||||| |   |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10003 aattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 9928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 278 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 117
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  278 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttagg 179  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  178 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 284 - 440
Target Start/End: Original strand, 53846 - 54002
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 383  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  53846 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaa 53945  T
Q  384 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  53946 atgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 54002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 280
Target Start/End: Original strand, 73725 - 73859
Alignment:
Q  152 gatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatatgatctgat 244  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| | |        ||||| | |||||||||    
T  73725 gatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaa-tgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgat 73823  T
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73824 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 73859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 1295 - 1582
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  1295 cgagcacttccagaactaagtgcaagtgagaatgatgagacctgagttgcttggattgactaggaatggaactttagttagtaatgtgacctatttaaga 1394  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| | |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| |||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  1395 tgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgacttaacgaataattgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga 1494  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| |||||||||| | ||| |         ||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1495 tgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttggttatttaactaagttgcatgagt 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 5806 - 6084
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||    
T  5806 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagttgtttggattgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctaataatga 5905  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattg--attgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||  ||    |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5906 tattgactgagaattgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattattaagtgaattatggattgaaatatacttacttgaattattgttgaatgatcaag 6004  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6005 aaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttattaaactaagttgcatgagt 6084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 278 - 439
Target Start/End: Original strand, 6943 - 7104
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| ||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6943 agttgatgttgattatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgactatgttgctgttgttggttatgtgaaatatgtatatgccttatg 7042  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7043 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 7104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 16926 - 17204
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||   | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||||||         
T  16926 cgagcacttcaagaaccgagtgcatttgagaatgccgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatt----- 17020  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
        |||||||  || |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  17021 ----aactgaattctatgaagctattataaactg-taagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgttcaaga 17115  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17116 tgttgttggaaatgaattgatattatgaagttatgctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttccatgagt 17204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 8867 - 8949
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||| |  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  8867 tgaattgcaattgatatattgatatc-atccgttgt--tgtgacttgaccgtgctgctgctgttgtttaactaagtgcataatgtc 8949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 19097 - 19317
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||  ||||||| || |||||||||| |||||    
T  19097 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataaga 19196  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||| ||||| |||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||    
T  19197 tgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaaga 19296  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgata 221  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  19297 tgttgttg-aaatgaattgata 19317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 15224 - 15376
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||  || |||||||||||||| || |||| |    
T  15224 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgctttgattgattaggagaggaacctttggtactaatgagacata-ttaaaa 15322  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgat 154  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15323 tgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgataagtgattataatgtgat 15376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 284 - 440
Target Start/End: Original strand, 10092 - 10248
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 383  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  10092 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgtttctgctattggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaa 10191  T
Q  384 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10192 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaattttgttattttgtgaattgc 10248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 331 - 422
Target Start/End: Original strand, 15469 - 15560
Alignment:
Q  331 gcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatat 422  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15469 gcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcgcattaatat 15560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36299 - 36230
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  36299 agttgtcgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgttgttgt 36230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 64153 - 63878
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || || | ||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  64153 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgacctgtttagtttggttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaaga 64054  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | |||   |||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  64053 taatgactatgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaaga 63954  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||||||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  63953 aattgttgagaatgaattgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 63878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 76037 - 75762
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || | ||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||    
T  76037 cgagcacttccagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttagtttggttaggaaaggaaatttcggtactaatgtgacatattaaaga 75938  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||||||| | ||||||| || |||| |||||| |  |||  ||| ||| ||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  75937 taatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatggatagattgcctttacttgaattattgttgaatggtcaaga 75838  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||||||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  75837 aattgttgagaatgaattgttattaaacctgttg---tgatttgattatgctgaaaatgttatttaactaagttgcatg 75762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Original strand, 34791 - 34908
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 175  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34791 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaattgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 34890  T
Q  176 tgaattattattgaatga 193  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  34891 tgaaatgttaatgaatga 34908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Original strand, 34968 - 35012
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34968 tgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagt 35012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15861 - 15698
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatat-ttatatgccttat 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||    
T  15861 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttacctatgttgctgttgttggttatgtgaaaaatattatatgtcttat 15762  T
Q  377 gtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15761 gtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 15698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 2903 - 2821
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  2903 tgaattgcaattgatatattgatatc-atccgttgt--tgtgacttgactgtgcttctgctgttgtttaactaagtgcataatgtc 2821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9720 - 9445
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9720 cgagcacttccagaactgagagcttttgaggattgtgagacctgagctgcttggtttggttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaaga 9621  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||||||||| | | ||||| || |||| |||||| |  |||  |||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9620 taatgactgtgaactgtgaagttttcatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatgaattgattgcctttacttgaattattattgaatgatcaaga 9521  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| | ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9520 aattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttatgatttaattatactgcaaatgttatttaactaagttgcatg 9445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 1876 - 2038
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  1876 agttgatgttgattatcatttgatgatgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctttgttgctgttattggttatgtgaaatatttatatgtcttatg 1975  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1976 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 2038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 24599 - 24760
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  24599 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgtttaagtgttgcctatgttgatgttgatggttatgtgaaatatttatatgccttatc 24698  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24699 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt-tcattaatattgttatgttctgaattgc 24760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 46532 - 46819
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||| || ||| || || |  |||||||||| |  ||   ||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  46532 cgagcacttccagaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataaga 46631  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
      ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  46632 agttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaaga 46731  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     |||| || |||||||||||||        ||| ||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46732 tgttg-tggaaatgaattgatattatgaagttatgctattgttgtgatctgcctatgctgctattgttatgtaactaagttgcatgagt 46819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 631 - 417
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  631 ttaggtagtaatgcgacctatttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaaatgcatt 532  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||        ||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  531 acttgaaatattattgaatgatcaagatgtcgttgaaaa-gaattgatattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattatgctgctattgttattta 433  T
Q  265 actaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||    
T  432 actaagttgcatgagt 417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 314 - 440
Target Start/End: Original strand, 2751 - 2877
Alignment:
Q  314 tgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttca 413  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||      
T  2751 tgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgctttt 2850  T
Q  414 cattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  2851 cattaatattgttatgttgtgaattgc 2877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 678 - 516
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  678 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctttctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 579  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  578 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttgtgaattgc 516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 1294 - 1456
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  1294 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctggctatgttgttgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatg 1393  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  1394 tggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 1456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18654 - 18379
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18654 cgagcacttccagaattgagtgttttagaggattgtgagacctgagtggtttggattggttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaaga 18555  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||  |||| ||||| | ||||||| || |||| |||||| |  ||| |||| || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18554 taatgactgtgaactatgaagtttttatgaattgttaagagattattaaatgaattatggactgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaaga 18455  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||||| |   |||| |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18454 aattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgtttatgctgcaaatgttatttaactaagttgcatg 18379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 278 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 7952 - 7793
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7952 agttgatgttgcttattatttgatattgttatatc-tgagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 7854  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    ||||| |||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  7853 tggaaaatgtatgaag-ttaagtggttgatgcttctcattaatattgacatgttgtgaattg 7793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 822 - 1014
Alignment:
Q  9 tccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaagatattaac 107  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||  |||||||| |  || |||||||| ||||||   |     
T  822 tccagaattgagtgcttttgaggagtttgagacttgagttgcttggattggttag-aattgaaccttaggtacatggtgtgacctattaaagataaggat 920  T
Q  108 tgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaag 201  Q
    ||  || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  921 tgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaag 1014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 42860 - 42651
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  42860 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaactgttaagctgattctaatgtgatttaatgattaaatgcatt 42761  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaac 266  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||||||||| |       ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42760 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgatattatgaagttaatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaac 42665  T
Q  267 taagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||    
T  42664 taagttgcatgagt 42651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 30550 - 30835
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  30550 cgagcacttacagaactgagtgcatttgagaatgttgtgacctgagttgcttgaattgattaggaatggaactttaggtagttgtgagacctatttaaga 30649  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||||| |||| ||| | || |||| | ||||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  30650 tgttaactgaaatctgtaaagttgtt-tgaacttctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgataaaga 30748  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     || |||| |||||||||| | ||| |        ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30749 tgtagttg-aaatgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatccgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagt 30835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2005 - 1900
Alignment:
Q  171 ttacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaag 270  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  |||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2005 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgtgatttaactaag 1908  T
Q  271 ttgcatga 278  Q
    ||||||||    
T  1907 ttgcatga 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1731 - 1518
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1731 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 1632  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaa 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||       ||    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1631 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataaagttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaa 1533  T
Q  266 ctaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||    
T  1532 ctaagttgcatgagt 1518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 18461 - 18748
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || | | |  ||| |||||||  ||||||| || |  ||   ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18461 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgtcgtgttctgtgttgcttcaattgatttgggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 18560  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
      ||||||| || |||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18561 agttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatggtatgttgattataatgtgatttaatgattaattccattacttgaaatattattgaatgatcaaga 18660  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| ||| |||||||||||| |        |||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18661 tgttgttg-aaacgaattgatattatgaagttattctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 18748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 284 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 530 - 376
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 383  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  530 tgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctccctatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaa 431  T
Q  384 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaatt 438  Q
    || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||    
T  430 atatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttacgtcgtgaatt 376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Original strand, 6195 - 6401
Alignment:
Q  82 taatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 180  Q
    ||||| || ||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||     
T  6195 taatgtgatctatttaggatgttaaatgcaatctgtgaagctattatgaaatgttaagttgtttatattgtgatttaattattaattgcattacttgaaa 6294  T
Q  181 tattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6295 tattattgaatgatcaagaagttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 6393  T
Q  273 gcatgagt 280  Q
    ||||||||    
T  6394 gcatgagt 6401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 278 - 408
Target Start/End: Original strand, 6161 - 6291
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6161 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatg 6260  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatg 408  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||||    
T  6261 tggaaaatatacgatgtttaagttgttgatg 6291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 284 - 440
Target Start/End: Original strand, 3335 - 3491
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 383  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||  | |||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  3335 tgttgattatcatttaatgttgttatataataagatatttaagtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgaattatgtggaaa 3434  T
Q  384 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3435 atgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 3491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 199 - 136
Alignment:
Q  442 attgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||   ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  199 attgatataatgatatcattctgttat---gtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagt 136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36605 - 36331
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  |||    
T  36605 cgagcacttctagaactgagtgcttttgaggattgtgagacctgagctgtttggattggttatgaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagaga 36506  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    || | ||||| |||||||||||| ||||||  || ||||||||||| | ||||  ||| ||||||||| ||||||   |||| || || | |||||| ||    
T  36505 taatgactgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaaatatggattgattgccattacccaaattgttgttaattgatcaaga 36406  T
Q  200 agttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 277  Q
    | ||||| | ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  36405 a-ttgttaagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaattaagttgcatg 36331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 1889 - 2177
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| || ||| || || || || |||||||    ||   ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1889 cgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatctgtgtcgcatgaatcgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaaga 1988  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatg-aaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagg 198  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| || || |||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| | | |||||||||||| |    
T  1989 tattaactgaaatatgtgaagctgttatgaaaatgctaagttgtttgtaatgtaatttaatgattaaatgcattacttgaaatttcattgaatgatcaag 2088  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||| ||||| |||||||        ||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2089 atgttgttg-aaatggattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 2177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9741 - 9537
Alignment:
Q  82 taatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 180  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||| || || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||     
T  9741 taatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaa 9643  T
Q  181 tattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata-------ttaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttg 273  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||       ||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9642 tattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgagttatgctgttgatgtgatctgattatgttgttattgttatttaactaagttg 9544  T
Q  274 catgagt 280  Q
    |||||||    
T  9543 catgagt 9537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2059 - 1854
Alignment:
Q  82 taatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 180  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||| || || |||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||     
T  2059 taatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaa 1961  T
Q  181 tattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 272  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1960 tattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgttatttaactaagtt 1862  T
Q  273 gcatgagt 280  Q
    ||||||||    
T  1861 gcatgagt 1854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 67379 - 67218
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||    
T  67379 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttggg-tgtttacgtgctgcttatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgaataatg 67281  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    || || |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  67280 tgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgc 67218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 296 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 639 - 495
Alignment:
Q  296 tttgatattcttatatcctgagatgttt-atgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgt 394  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||| |||| | | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||    
T  639 tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtattgtctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtacgatgt 540  T
Q  395 ttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  539 ttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 278 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20869 - 20769
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20869 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatg 20770  T
Q  378 t 378  Q
    |    
T  20769 t 20769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 427 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 68181 - 68090
Alignment:
Q  427 atgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  68181 atgttgtgaattgcaattgatatattgatatctctctattgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtc 68090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 48440 - 48396
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  48440 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 48396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 6904 - 7066
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||| |||||||| || || ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6904 agttgatgttgagtatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttactgttgttggttatgtgaaatttttatatgcgttatg 7003  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| | |||| |||||    
T  7004 tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatactgttacgatgtgtattgc 7066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 338 - 440
Target Start/End: Original strand, 1227 - 1329
Alignment:
Q  338 ttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaat 437  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  1227 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaat 1326  T
Q  438 tgc 440  Q
    |||    
T  1327 tgc 1329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 338 - 440
Target Start/End: Original strand, 7978 - 8080
Alignment:
Q  338 ttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaat 437  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  7978 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaat 8077  T
Q  438 tgc 440  Q
    |||    
T  8078 tgc 8080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 280
Target Start/End: Original strand, 19613 - 19825
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 175  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||  | || |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  19613 ggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 19712  T
Q  176 tgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 267  Q
     |  ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||| || ||||| |         ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19713 gggtttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgctgcttttgttatttaact 19812  T
Q  268 aagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||    
T  19813 aagttgcatgagt 19825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 280
Target Start/End: Original strand, 15091 - 15303
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 175  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||  | || |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  15091 ggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 15190  T
Q  176 tgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 267  Q
     |  ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||| || ||||| |         ||||| | |||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  15191 gggtttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgatgcttttgttatttaact 15290  T
Q  268 aagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||    
T  15291 aagttgcatgagt 15303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 342 - 439
Target Start/End: Original strand, 22477 - 22574
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22477 tgttgttgattatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 22574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 4030 - 4245
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |   | ||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4030 cgagcacttccagaactgagtgcttttgagattgccgtgacttgagttgattgaattgattaggaatggaactttaggtagtaatgtgacctatttaaga 4129  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| |  |||||| || ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||| | |  ||    
T  4130 tgttaactgagatatgtgaatctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttga 4229  T
Q  200 agttgttgaaaatgaa 215  Q
    ||||||||||||||||    
T  4230 agttgttgaaaatgaa 4245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Original strand, 4275 - 4319
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4275 tgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 4319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 44318 - 44105
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || | || ||||||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  44318 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagct-ttttaaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 44220  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 264  Q
    |||| || ||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44219 acttaaaatattattgaattatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 44121  T
Q  265 actaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||    
T  44120 actaagttgcatgagt 44105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 35316 - 35604
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||   | |||||||||||  ||  |||| ||||||  ||  |||| ||| ||||| ||||||||| |||    
T  35316 cgagcacttccagaactgagtgcttttgagaatgacgtgacctgagttgaatgagttgagtaggaatggagctttatgtagtaatgtgacctatttgaga 35415  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| | |||||||||| ||||||| |  |||| || || |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||| | |  ||    
T  35416 tgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattattaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttga 35515  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||||||||||        ||| ||||   ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  35516 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 35604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1126 - 921
Alignment:
Q  82 taatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 180  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| || |||  |||||||| | || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||     
T  1126 taatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgacctgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaa 1028  T
Q  181 tattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagtt 272  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1027 tattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttattgaactaagtt 929  T
Q  273 gcatgagt 280  Q
    ||||||||    
T  928 gcatgagt 921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5802 - 5704
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5802 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatagttatgttgtgaattgc 5704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15116 - 14991
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15116 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacatgtggcctatgttggtgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatg 15017  T
Q  378 tggaagatgtttgatgtttaagttgt 403  Q
     | || |||| ||||||| |||||||    
T  15016 ggaaaaatgtatgatgttaaagttgt 14991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4276
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4374 tgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 4276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6855 - 6702
Alignment:
Q  125 ttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt 223  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  6855 ttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatagaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttatt 6757  T
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||  ||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6756 aagct--tgatgagatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 6702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 384 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6932 - 6876
Alignment:
Q  384 atgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6932 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 6876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 439
Target Start/End: Original strand, 70536 - 70633
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  70536 tgttcttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattg 70633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 653 - 490
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||   ||||| || |||||| | |||  |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  653 cgagcacttccagaactgaatgtttttgaggattgtgagacctgagtgatttggaatggttaggagaggaaccttaggtactaatgaaacctattaaaga 554  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga 165  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||||||    
T  553 tattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga 490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 392
Alignment:
Q  231 tgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  439 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaattaagttgcatga 392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 276
Target Start/End: Original strand, 9990 - 10131
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 233  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||   |||     || ||||    
T  9990 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattataaagttatactattga 10088  T
Q  234 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 276  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10089 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 10131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8871 - 8584
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  || | | |||||||||||  || |||| |||||||  || ||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  8871 cgagcatttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgaatgaattggttaggaatggacatt-aggtagtaatgaaacctatttaaga 8773  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| | |||||||| | ||| ||| || ||||| | || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  ||    
T  8772 tgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttga 8673  T
Q  200 agttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||||||||||||        ||| ||||   || || | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8672 tgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 8584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 284 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 105193 - 105078
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaag 383  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  105193 tgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgttgttgtcggttatgcgaaataattatatgccttatgtggaaa 105094  T
Q  384 atgtttgatgtttaag 399  Q
    |||| |||||||||||    
T  105093 atgtatgatgtttaag 105078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Original strand, 38528 - 38572
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38528 tgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 38572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2102 - 1909
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | | | || |||||| ||| ||| ||||||||  |||  ||||||| || |||||||||| |||||    
T  2102 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgccccgagttgattgaatttattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataaga 2003  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat 194  Q
    | |||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2002 tgttaaatgaaatatgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgat 1909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1857 - 1817
Alignment:
Q  239 tctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgag 279  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1857 tctgattatgctgcctttgttatttaactaagttgcatgag 1817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10564 - 10467
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10564 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttt-agtttttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 10467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Original strand, 6294 - 6507
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| || |||| |||||| | | || |||||||||||| ||||| | ||||||    
T  6294 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatatgtgaagctgtt-tgaactgctaacttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 6392  T
Q  173 acttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttattta 264  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||        |||| ||| ||| | ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  6393 actcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctattgttgtgatcttcctatgctgctattgttattta 6491  T
Q  265 actaagttgcatgagt 280  Q
    |||| |||||||||||    
T  6492 actatgttgcatgagt 6507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 590 - 313
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  | | ||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||  | | |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  590 cgagcacttccagaactgaatgcaaattaagatgttaagacctcagttgcttgaattgattaggaatgggactttaggtagtaatgtgacctatttaaga 491  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcagga 199  Q
    | |||||||| | |||||||||| ||||||| || |||| |||||| |           ||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  490 tgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattaca-----------tgaataattgcattactttaaatattattgaatgatcaaga 402  T
Q  200 agttgttgaaaatgaa----ttgatattaag-----ctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
     ||||||| |||||||    ||| ||| |||      ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  401 tgttgttg-aaatgaaattgttgttatgaagttatattgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagt 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 33261 - 33163
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  33261 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgcttttaattaatattgttatgttgagaattgc 33163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 278 - 387
Target Start/End: Original strand, 4271 - 4380
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatg 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  4271 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttgcctattttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatacgttatg 4370  T
Q  378 tggaagatgt 387  Q
    ||||| ||||    
T  4371 tggaaaatgt 4380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 440
Target Start/End: Original strand, 6851 - 6916
Alignment:
Q  375 atgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6851 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgatgtgaattgc 6916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7744 - 7495
Alignment:
Q  39 gacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaa 138  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||  |||  ||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||| || |||||||| | ||| ||| || |||    
T  7744 gacctgagttgcttagattggttaggaatggaaccttaggtagtaatgaaacctatataagatgttaactggaatctgtgaagttgttaagaactgttaa 7645  T
Q  139 g-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctg 229  Q
    | || || ||||| ||||||  || | | |||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||    
T  7644 gttgtttgtaatgcgatttaacgaataaatgcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatg 7546  T
Q  230 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7545 ttgctgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 7495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 76977 - 77253
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||| || || |||||||| |||    
T  76977 cgagcacttccagaattgagtgttttagtggattatgagacctgagttgtttggattggttagaaaa-gaactttaggtacatagtgtgacctattaaag 77075  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcag 197  Q
    ||| | | |   |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||||     
T  77076 ataatgattatgaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaa 77174  T
Q  198 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    |||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  77175 gaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 77253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3074 - 2933
Alignment:
Q  142 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttga 233  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||   || |     |||||    
T  3074 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatt-aattgatattataaagttatattgttga 2976  T
Q  234 tatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 276  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2975 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 2933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4276
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4374 tgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 4276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 631 - 501
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||  ||||||| || |||||||||| |||||    
T  631 cgagcacttccagaactgagtgcatttgagaatgtcgtgacctgagttgattgaattgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataaga 532  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaa 131  Q
    | |||| ||||| |||||||| | |||||||    
T  531 tgttaaatgaaatctgtgaagttgttatgaa 501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 6883 - 7061
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || ||| || || ||  ||||||||| |  |    ||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  6883 cgagcacttccagaactgagtgcaattgagaatgttgcgatctgtgtcgcatgagttgattagggatgggcccttaggtagtaatgtgacctatataaga 6982  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttga 178  Q
    | ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6983 tgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgagatttaatgattaattgcattacttga 7061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 192123 - 192340
Alignment:
Q  2 gagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaagat 101  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| || | | |||||||||||  ||  |||| ||||||  ||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  192123 gagcacttccagaattgagtgcttttgagaatgtcgtgacctgagttgaatgatttgagtaggaatggaacttagggtagtaatgtgacctatttaagat 192222  T
Q  102 attaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
     |||||||| | |||||||| | ||||||| |  |||| || || |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||| | |  ||     
T  192223 gttaactgagatctgtgaagttgttatgaatttttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaattaccttgat 192322  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattg 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  192323 gttgttgaaaatgaattg 192340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2529
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||| || ||  ||||||||||| ||| |||| |||||||  | | |||||||| |||||| |||||| | |||    
T  2241 cgagcacttccagaaccgagtgctttagagaatgttatgacctgagttgtttgaattggttaggaatgggactttaggtagtaatgaaacctatcttaga 2340  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat-cagg 198  Q
    | ||||||| || |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | | |||||||||| ||||| |||||| || |  |    
T  2341 tgttaactggaatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatacattacttgatttattcttgaataatccttg 2440  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||| || |||||        ||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  2441 atgttgttg-aattgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaaattgcatgagt 2529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 10101 - 10389
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||| || ||  ||||||||||| ||| |||| |||||||  | | |||||||| |||||| |||||| | |||    
T  10101 cgagcacttccagaaccgagtgctttagagaatgttatgacctgagttgtttgaattggttaggaatgggactttaggtagtaatgaaacctatcttaga 10200  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat-cagg 198  Q
    | ||||||| || |||||||||| ||||||| || |||| || || |||||||||||| ||||| | | |||||||||| ||||| |||||| || |  |    
T  10201 tgttaactggaatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatacattacttgatttattcttgaataatccttg 10300  T
Q  199 aagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    | ||||||| || |||||        ||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  10301 atgttgttg-aattgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaaattgcatgagt 10389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15638 - 15539
Alignment:
Q  342 tgttgttgattat-gtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15638 tgttgatgattattgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgatgtgaattgc 15539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 354 - 440
Target Start/End: Original strand, 166426 - 166512
Alignment:
Q  354 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  166426 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgc 166512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 356 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 7711 - 7627
Alignment:
Q  356 tgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7711 tgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgc 7627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 7076 - 7363
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |  |||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||| || |  || |||| | |||    
T  7076 cgagcacttccagaactgagtgcttttgataatgtcgtaacctgagttgtttggattgtttaggaatggaactttaggtagtattatgatctatgtgaga 7175  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | |||||||| | |||||| ||| |||||||| | |||    || ||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||||| |||||| |    ||     
T  7176 tgttaactgagatctgtgaggctgttatgaaaagttaaactgttgtaatgtgatttaaagattaaatgcattacttgatttattcttgaataactttgat 7275  T
Q  201 gttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||        ||| ||||   ||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7276 gttgttgaaaatgaattgttgtgatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 7363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 342 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 57024 - 56926
Alignment:
Q  342 tgttgttgattat-gtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||||||||    
T  57024 tgttgatgattattgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtcgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattg 56926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Original strand, 13969 - 14075
Alignment:
Q  88 gacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattat 186  Q
    ||||||| || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | |||     
T  13969 gacctatataggatgttaactgaaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgaattacttgaaatgttaa 14068  T
Q  187 tgaatga 193  Q
    |||||||    
T  14069 tgaatga 14075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Original strand, 14135 - 14179
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14135 tgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagt 14179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11680 - 11472
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||  || | | ||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||| ||| ||| || ||||||||||||    
T  11680 cgagcacttccataactgagtgcttttgataatgtcgtgacctgagttgtttggattggttaggaatggaactttatgtagtaaggaaacctatttaaga 11581  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaa 200  Q
    | ||||||| || |||||||||| |||         |  || || ||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  ||     
T  11580 tgttaactggaatctgtgaagctgtta---------agttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttgat 11490  T
Q  201 gttgttgaaaatgaattg 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11489 gttgttgaaaatgaattg 11472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2236 - 2192
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2236 tgatttgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 2192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2013 - 1944
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2013 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3980 - 3872
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 174  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3980 ggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 3881  T
Q  175 ttgaattat 183  Q
    |||| ||||    
T  3880 ttgagttat 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8411 - 8303
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattac 174  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8411 ggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 8312  T
Q  175 ttgaattat 183  Q
    |||| ||||    
T  8311 ttgagttat 8303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 284 - 381
Target Start/End: Original strand, 36038 - 36135
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 381  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| |||| |||||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36038 tgttgattattttttgatgttcttatatcttgaggtgtttaagtgctgcatatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtgga 36135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3080 - 2960
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| || || ||||||| || ||| |||| || || |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3080 ttaggtagtagtgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 2981  T
Q  173 acttgaattattattgaatga 193  Q
    ||||||| | ||| |||||||    
T  2980 acttgaaatgttaatgaatga 2960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6746 - 6626
Alignment:
Q  74 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcatt 172  Q
    ||||||| || || ||||||| || ||| |||| || || |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6746 ttaggtagtagtgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 6647  T
Q  173 acttgaattattattgaatga 193  Q
    ||||||| | ||| |||||||    
T  6646 acttgaaatgttaatgaatga 6626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2900 - 2856
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2900 tgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagt 2856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6566 - 6522
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6566 tgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagt 6522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 284 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11259 - 11196
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  11259 tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgctgcctgtgttgctgttgt 11196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 284 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22359 - 22296
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  22359 tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgctgcctgtgttgctgttgt 22296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 440
Target Start/End: Original strand, 13490 - 13540
Alignment:
Q  390 gatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13490 gatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgc 13540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1049 - 988
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1049 ttgattattatttgacattcttatatcttgagatgtttatgtgttgcctatgttgctgttgt 988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 21611 - 21740
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| || ||| |||||||| |||| ||||| |  ||   ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21611 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 21710  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatga 130  Q
    | ||||||| || |||||||||| ||||||    
T  21711 tgttaactgcaatctgtgaagctgttatga 21740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 29503 - 29632
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| || ||| |||||||| |||| ||||| |  ||   ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29503 cgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 29602  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagctattatga 130  Q
    | ||||||| || |||||||||| ||||||    
T  29603 tgttaactgcaatctgtgaagctgttatga 29632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Original strand, 21861 - 21896
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21861 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 21896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Original strand, 29753 - 29788
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29753 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 29788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3376 - 3307
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3376 agttgatgttgattgtcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgttgcctatgttgctgttgt 3307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8150 - 8082
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttg 346  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8150 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttatgtgttgcatatgttgctgttg 8082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 110764 - 110700
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttga 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  110764 ttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgccgttgttga 110700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 10271 - 10196
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagt 508  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  10271 tgaattgcaattgatataatgatatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctcttatttaactaagt 10196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 345
Target Start/End: Original strand, 75830 - 75897
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgtt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  75830 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctacgttgctgtt 75897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 6709 - 6627
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6709 tgaattgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--actcgactatgctactgctgttatttaactaagtgcataatgtc 6627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Original strand, 762 - 831
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  762 agttgttgttgattatcttttgatattgttatatcttgagatgtttatatgctgcctatgttgttgttgt 831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 381
Target Start/End: Original strand, 10859 - 10956
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtgga 381  Q
    |||||| ||| ||||||| || ||||||| |||| |||||| |||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  10859 tgttgagtattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgcttatattgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgcattatgtgga 10956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3986 - 3917
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| |||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3986 agttgatgttgattatcatttggtaatgttatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 3917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 354 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 9051 - 8967
Alignment:
Q  354 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaatt 438  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| |||||||  || |||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  9051 tgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtgaattcttatcattgatattgttatgttgtgaatt 8967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 15550 - 15669
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 174  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| ||||||  || ||||| ||||||||||    
T  15550 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagataatgattaattgcattac 15649  T
Q  175 ttgaattattattgaatgat 194  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  15650 ttgaattatgaatgaatgat 15669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Original strand, 15737 - 15772
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15737 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 15772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 347
Target Start/End: Original strand, 9728 - 9791
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  9728 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgctgcctatgttgttgttgt 9791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 32636 - 32554
Alignment:
Q  114 ctgtgaagctattatgaaatgctaag--tgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat 194  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  32636 ctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgaatgat 32554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8799 - 8523
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtac-taatgagacctatttaag 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||  |||||||| || || |||||||| |||    
T  8799 cgagcacttccagaattgagtgttttagtggattgtgagacctgagttgtttggattggttag-aaaggaaccttaggtacatagtgtgacctattaaag 8701  T
Q  100 atattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcag 197  Q
    ||| | |     |||| | ||||| ||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||  | ||||| ||||| || |||||||||||     
T  8700 ataatgatcatgaactataaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttactagaattgttgttgaatgatcaa 8602  T
Q  198 gaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    |||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  |||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8601 gaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatga 8523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15715 - 15667
Alignment:
Q  230 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15715 ttgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaagttgcatga 15667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6730 - 6684
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgttta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6730 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 19669 - 19587
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| || | ||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  19669 tgaattgcaattgatatattgatatc-atctgttat--tgtgacttgactatgatgctgttgttatttaactaagtgcataatgtc 19587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 25843 - 25761
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| || | ||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  25843 tgaattgcaattgatatattgatatc-atctgttat--tgtgacttgactatgatgctgttgttatttaactaagtgcataatgtc 25761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 348
Target Start/End: Original strand, 15240 - 15310
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgtt 348  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||| |||||    
T  15240 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgcctatgttgctattgtt 15310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Original strand, 18169 - 18238
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  18169 agttgatgtttattatcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgctgcctatgttgttgttgt 18238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 353
Target Start/End: Original strand, 206528 - 206601
Alignment:
Q  281 tgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatg-tttatgtgtcgcctatgttgctgttgttgatta 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  206528 tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgcctatgttgctgttgtttatta 206601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9406 - 9358
Alignment:
Q  230 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 278  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9406 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatga 9358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10592 - 10524
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttg 346  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10592 agttgatgttgattatcatttgatgttgttacatctagagatgtttatgtgttgcctatgttgttgttg 10524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8885 - 8809
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  8885 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 8809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 22300 - 22224
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  22300 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 22224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 509
Target Start/End: Original strand, 4088 - 4164
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  4088 tgaattgctgttgatatattgatatctccctgctgatatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 4164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 280
Target Start/End: Original strand, 4841 - 4897
Alignment:
Q  224 aagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4841 aagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagt 4897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 2190 - 2068
Alignment:
Q  1 cgagcacttccagaactgagtgcatttgaggattttgagacctgagttgcttggattgattaggaaatgaaatttaggtactaatgagacctatttaaga 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||| || ||  || ||| |||||||| |||||||||| |  ||   ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  2190 cgagcacttcgagaactgagtgcaagtgagaatgttatgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataaga 2091  T
Q  101 tattaactgaaaactgtgaagct 123  Q
      ||||||| || ||||||||||    
T  2090 agttaactgcaatctgtgaagct 2068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 324
Target Start/End: Original strand, 15067 - 15113
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgttta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  15067 agttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 15113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15409 - 15363
Alignment:
Q  230 ttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 276  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15409 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcat 15363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 133035 - 132985
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  133035 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgaaatgtttatgtg 132985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 29323 - 29261
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||| | |||||||| |||||    
T  29323 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgttattgtgttgtctatgttgttgttg 29261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Original strand, 7499 - 7560
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7499 ttgattattatttgacattgatatatcttgagatgtttatgtgctgcctatgttgctgttgt 7560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10282 - 10213
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  10282 agttgatgatgattattatttgatattgttacatcttgagatgtttatgtgctgcttatgttgctgttgt 10213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 505
Target Start/End: Original strand, 24989 - 25058
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaacta 505  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24989 tgaaatgcaattgatatattgatatca-tccgttattgtg--acttgactatgctgctgctgttatttaacta 25058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 175005 - 174952
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatga 130  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  175005 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgaaatctgtgaagctattatga 174952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 146298 - 146254
Alignment:
Q  284 tgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtg 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  146298 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtg 146254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6163 - 6119
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6163 tgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 6119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Original strand, 18334 - 18453
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaa--gtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 174  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||  || |||||||||| |||||||||| |||   ||| ||| ||||||||||  || | ||||||||||    
T  18334 ggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactacaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaacgaataattgcattac 18433  T
Q  175 ttgaattattattgaatgat 194  Q
    |||| |||| | ||||||||    
T  18434 ttgagttatgaatgaatgat 18453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36696 - 36577
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgcta--agtgattataatgtgatttattgattgattgcattac 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||    ||| ||| ||||||| || || || ||||||||||    
T  36696 ggtagtaatgagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattac 36597  T
Q  175 ttgaattattattgaatgat 194  Q
    ||||| ||| | ||||||||    
T  36596 ttgaactatgaatgaatgat 36577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 518
Target Start/End: Original strand, 5811 - 5893
Alignment:
Q  433 tgaattgcaattgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgatgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  5811 tgaattgcaattgatatattgatatc-atccgttgt--tgtgacttgaccgtgctgctgttgttgtttaactaagtgcataatgtc 5893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 38789 - 38723
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  38789 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 38723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 10444 - 10378
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  10444 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 10378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 56866 - 56800
Alignment:
Q  443 ttgatatattgatatctctctgttattgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagta 509  Q
    ||||||||||||||||||  || | || || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  56866 ttgatatattgatatctccttgctgttatgcgacttgactatgctgctgctgttatttaactgagta 56800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 440
Target Start/End: Original strand, 1314 - 1414
Alignment:
Q  342 tgttgttgattatgtgaaatatttata--tgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattg 439  Q
    |||||||| | |||||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  1314 tgttgttggtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattg 1413  T
Q  440 c 440  Q
    |    
T  1414 c 1414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 282
Target Start/End: Original strand, 4891 - 4928
Alignment:
Q  245 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagttg 282  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4891 tatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttg 4928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3067 - 3006
Alignment:
Q  286 ttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttgt 347  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  3067 ttgattattatttgacattgttatatcttgagatgtttatgtgctacctatgttgttgttgt 3006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 134
Target Start/End: Original strand, 8838 - 8895
Alignment:
Q  77 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgaaaactgtgaagctattatgaaatg 134  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  8838 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgtaatctgtgaagctgttatgaaatg 8895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 280
Target Start/End: Original strand, 7878 - 7910
Alignment:
Q  248 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7878 gctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 7910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 29791 - 29723
Alignment:
Q  278 agttgttgttgattatcatttgatattcttatatcctgagatgtttatgtgtcgcctatgttgctgttg 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||  ||||| | |||||||| |||||    
T  29791 agttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggatatgttattgtgttgtctatgttgttgttg 29723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33694 - 33639
Alignment:
Q  165 attgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgata 221  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||    
T  33694 attgcattacttgagatattattgaataatcaagatgttgttg-aaatgaattgata 33639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14732 - 14688
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14732 tgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagt 14688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23747 - 23703
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23747 tgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagt 23703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 39171 - 39127
Alignment:
Q  236 tgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 280  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  39171 tgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagt 39127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University