View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8893_low_39 (Length: 351)

Name: NF8893_low_39
Description: NF8893
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8893_low_39
NF8893_low_39
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-340)||(9325-9675)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (1-340)||(14079326-14079676)
chr8 (1-340)||(41628043-41628382)
chr8 (2-340)||(30825593-30825942)
chr8 (1-340)||(33424754-33425104)
chr8 (1-340)||(38961316-38961666)
chr8 (1-340)||(38991661-38992010)
chr8 (1-340)||(6477988-6478338)
chr8 (1-340)||(41976610-41976950)
chr8 (1-340)||(39203783-39204122)
chr8 (1-340)||(41907000-41907349)
chr8 (1-340)||(20663440-20663790)
chr8 (1-340)||(30548803-30549153)
chr8 (1-340)||(19247254-19247603)
chr8 (1-340)||(19320438-19320787)
chr8 (1-340)||(44213557-44213906)
chr8 (34-340)||(23626840-23627157)
chr8 (1-340)||(44383436-44383786)
chr8 (1-340)||(12759615-12759967)
chr8 (1-340)||(41155780-41156130)
chr8 (3-340)||(29433199-29433530)
chr8 (150-345)||(42811426-42811621)
chr8 (1-219)||(6301103-6301320)
chr8 (67-238)||(22343102-22343271)
chr8 (67-238)||(22354762-22354931)
chr8 (177-340)||(36598035-36598198)
chr8 (1-182)||(36602722-36602914)
chr8 (152-340)||(12250690-12250878)
chr8 (152-340)||(39444329-39444517)
chr8 (1-219)||(23967006-23967234)
chr8 (1-219)||(37029111-37029339)
chr8 (1-219)||(42061280-42061508)
chr8 (1-219)||(44939715-44939943)
chr8 (1-154)||(42811643-42811796)
chr8 (3-186)||(19396015-19396209)
chr8 (1-144)||(45294755-45294898)
chr8 (234-340)||(22342308-22342414)
chr8 (182-288)||(45294646-45294752)
chr8 (281-340)||(45294073-45294132)
chr8 (1-73)||(22345559-22345631)
chr8 (1-73)||(22357219-22357291)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (1-340)||(1073779-1074129)
chr6 (1-340)||(18599502-18599852)
chr6 (1-340)||(14888453-14888803)
chr6 (1-340)||(34855336-34855686)
chr6 (1-329)||(4423765-4424092)
chr6 (1-340)||(11945985-11946335)
chr6 (1-340)||(2520544-2520894)
chr6 (32-340)||(11935196-11935515)
chr6 (1-340)||(7222125-7222475)
chr6 (1-340)||(15275039-15275389)
chr6 (1-336)||(25532646-25532980)
chr6 (1-336)||(9979579-9979914)
chr6 (1-336)||(24445361-24445696)
chr6 (1-340)||(33978354-33978693)
chr6 (1-336)||(1219958-1220287)
chr6 (1-340)||(7219380-7219730)
chr6 (1-340)||(33321969-33322319)
chr6 (1-340)||(17938903-17939253)
chr6 (1-340)||(249293-249643)
chr6 (1-340)||(12580312-12580662)
chr6 (1-340)||(34320473-34320823)
chr6 (37-337)||(1931460-1931761)
chr6 (1-340)||(22374357-22374718)
chr6 (1-219)||(13457350-13457578)
chr6 (209-340)||(4424087-4424218)
chr6 (1-84)||(1080374-1080457)
chr6 (257-340)||(14831133-14831216)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (1-340)||(34686992-34687342)
chr1 (1-340)||(41830544-41830894)
chr1 (1-340)||(18813624-18813974)
chr1 (1-340)||(31619094-31619444)
chr1 (3-340)||(52522063-52522411)
chr1 (1-339)||(41963426-41963775)
chr1 (1-340)||(38845719-38846069)
chr1 (1-340)||(15314666-15315005)
chr1 (1-336)||(4891534-4891869)
chr1 (1-336)||(29186618-29186953)
chr1 (1-340)||(34691530-34691870)
chr1 (1-336)||(33361143-33361472)
chr1 (1-322)||(50560458-50560779)
chr1 (1-340)||(51966228-51966567)
chr1 (1-340)||(28566214-28566562)
chr1 (9-340)||(48339737-48340084)
chr1 (1-340)||(12713882-12714232)
chr1 (1-340)||(52309239-52309589)
chr1 (1-340)||(42681795-42682145)
chr1 (34-340)||(13662900-13663214)
chr1 (1-340)||(29841182-29841532)
chr1 (1-335)||(10694689-10695034)
chr1 (1-219)||(18111123-18111351)
chr1 (1-219)||(43255170-43255398)
chr1 (1-219)||(50395584-50395812)
chr1 (233-340)||(10763030-10763137)
chr1 (1-65)||(10762959-10763023)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (1-340)||(30567375-30567714)
chr2 (1-340)||(36633596-36633935)
chr2 (1-336)||(21097131-21097477)
chr2 (1-340)||(33664305-33664644)
chr2 (1-340)||(16724859-16725209)
chr2 (1-340)||(26821052-26821402)
chr2 (50-340)||(30571060-30571350)
chr2 (1-336)||(9544132-9544467)
chr2 (1-340)||(42884823-42885173)
chr2 (1-340)||(4810981-4811331)
chr2 (1-337)||(10048508-10048844)
chr2 (41-340)||(19168153-19168449)
chr2 (1-340)||(1515500-1515850)
chr2 (1-336)||(4291166-4291495)
chr2 (1-340)||(14752605-14752955)
chr2 (3-340)||(10822436-10822780)
chr2 (1-339)||(16883368-16883705)
chr2 (1-339)||(17041058-17041395)
chr2 (1-340)||(18093223-18093572)
chr2 (1-340)||(45205528-45205883)
chr2 (1-340)||(3710327-3710677)
chr2 (1-340)||(11866739-11867089)
chr2 (1-340)||(35358132-35358482)
chr2 (34-340)||(17036734-17037051)
chr2 (34-340)||(17091242-17091559)
chr2 (1-340)||(9917199-9917552)
chr2 (34-340)||(17025057-17025374)
chr2 (142-340)||(11447950-11448148)
chr2 (1-219)||(1993555-1993783)
chr2 (1-219)||(6343343-6343571)
chr2 (1-219)||(14323827-14324055)
chr2 (1-219)||(28501715-28501943)
chr2 (5-132)||(11447085-11447212)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (1-339)||(6104635-6104973)
chr3 (1-340)||(31369525-31369875)
chr3 (1-340)||(51247769-51248107)
chr3 (1-340)||(35088346-35088693)
chr3 (1-340)||(50771755-50772094)
chr3 (1-340)||(52841041-52841381)
chr3 (1-340)||(21700078-21700417)
chr3 (1-340)||(50740760-50741099)
chr3 (1-340)||(11326150-11326500)
chr3 (1-340)||(48976081-48976431)
chr3 (1-340)||(52853950-52854300)
chr3 (1-340)||(23192858-23193208)
chr3 (5-340)||(49112475-49112821)
chr3 (1-340)||(918078-918417)
chr3 (1-340)||(36167959-36168309)
chr3 (24-340)||(19893877-19894193)
chr3 (1-340)||(55295287-55295637)
chr3 (1-340)||(8242102-8242446)
chr3 (1-340)||(44073229-44073574)
chr3 (1-340)||(11951483-11951833)
chr3 (1-340)||(22477104-22477454)
chr3 (24-340)||(40827543-40827870)
chr3 (1-340)||(11598472-11598822)
chr3 (34-340)||(16495323-16495637)
chr3 (1-328)||(11382570-11382903)
chr3 (1-263)||(35436378-35436651)
chr3 (1-219)||(39796971-39797188)
chr3 (135-340)||(48521530-48521736)
chr3 (1-222)||(9879550-9879771)
chr3 (147-340)||(2845365-2845558)
chr3 (1-219)||(5252872-5253100)
chr3 (170-340)||(54793473-54793643)
chr3 (1-136)||(28164809-28164944)
chr3 (1-112)||(54512355-54512466)
chr3 (1-126)||(54793688-54793812)
chr3 (1-84)||(2845558-2845641)
chr3 (1-84)||(11952053-11952136)
chr3 (278-340)||(54512465-54512527)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (1-340)||(8926403-8926753)
chr7 (1-340)||(23766951-23767301)
chr7 (1-340)||(14308331-14308681)
chr7 (1-340)||(19520575-19520917)
chr7 (1-339)||(33030209-33030546)
chr7 (1-340)||(5962100-5962450)
chr7 (1-340)||(17477301-17477640)
chr7 (1-340)||(17575574-17575913)
chr7 (1-340)||(17481747-17482087)
chr7 (1-340)||(17571127-17571467)
chr7 (3-340)||(42245368-42245705)
chr7 (1-340)||(42686970-42687303)
chr7 (1-336)||(17170460-17170795)
chr7 (1-336)||(31898306-31898641)
chr7 (1-337)||(39649464-39649802)
chr7 (7-340)||(47173894-47174227)
chr7 (1-336)||(48528275-48528611)
chr7 (1-340)||(9226733-9227083)
chr7 (1-340)||(23300232-23300571)
chr7 (1-340)||(42917251-42917601)
chr7 (1-340)||(19034168-19034518)
chr7 (1-340)||(20720118-20720468)
chr7 (1-340)||(27735561-27735911)
chr7 (1-340)||(29490358-29490708)
chr7 (1-340)||(33230474-33230824)
chr7 (1-340)||(20764780-20765129)
chr7 (1-340)||(34282617-34282967)
chr7 (1-340)||(33639187-33639537)
chr7 (1-340)||(9148762-9149112)
chr7 (1-340)||(3794911-3795261)
chr7 (3-340)||(47164064-47164419)
chr7 (1-263)||(4481789-4482062)
chr7 (152-340)||(38435062-38435250)
chr7 (152-340)||(42996016-42996204)
chr7 (1-219)||(6911977-6912205)
chr7 (1-219)||(47573955-47574183)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (1-340)||(2194528-2194878)
chr5 (1-340)||(26321581-26321931)
chr5 (1-340)||(20996450-20996800)
chr5 (1-338)||(4881648-4881984)
chr5 (1-340)||(7285040-7285390)
chr5 (1-340)||(33611646-33611996)
chr5 (5-340)||(30688682-30689022)
chr5 (1-340)||(1852436-1852773)
chr5 (1-340)||(21029471-21029821)
chr5 (3-336)||(25697033-25697366)
chr5 (1-337)||(30141937-30142273)
chr5 (1-340)||(20349303-20349636)
chr5 (1-336)||(41690710-41691045)
chr5 (1-336)||(34717024-34717359)
chr5 (1-340)||(27065265-27065613)
chr5 (1-340)||(3151110-3151459)
chr5 (1-340)||(3397644-3397997)
chr5 (1-340)||(37463747-37464097)
chr5 (3-340)||(289973-290321)
chr5 (34-340)||(9701648-9701965)
chr5 (1-340)||(3210704-3211053)
chr5 (1-340)||(12588786-12589136)
chr5 (3-219)||(31296170-31296385)
chr5 (1-192)||(3027823-3028014)
chr5 (172-340)||(19447546-19447716)
chr5 (1-219)||(19394852-19395079)
chr5 (191-337)||(3028312-3028458)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (1-340)||(19831920-19832259)
chr4 (1-340)||(14830034-14830384)
chr4 (1-340)||(28135589-28135928)
chr4 (1-340)||(23478324-23478676)
chr4 (3-340)||(36856519-36856854)
chr4 (1-340)||(33503521-33503860)
chr4 (1-339)||(34057087-34057437)
chr4 (1-340)||(54332166-54332515)
chr4 (1-345)||(53341826-53342181)
chr4 (1-340)||(19590262-19590601)
chr4 (1-340)||(28120744-28121082)
chr4 (1-336)||(13627468-13627814)
chr4 (1-336)||(39715037-39715372)
chr4 (1-336)||(52800459-52800794)
chr4 (18-340)||(55999220-55999553)
chr4 (1-340)||(17739456-17739806)
chr4 (1-340)||(10259846-10260196)
chr4 (1-340)||(21564259-21564609)
chr4 (1-340)||(26924785-26925135)
chr4 (1-340)||(43331780-43332130)
chr4 (1-340)||(51451847-51452197)
chr4 (1-340)||(24077915-24078265)
chr4 (9-340)||(1943920-1944257)
chr4 (1-340)||(40621562-40621914)
chr4 (1-340)||(35496066-35496385)
chr4 (128-340)||(17698730-17698942)
chr4 (1-340)||(47720592-47720932)
chr4 (37-340)||(574669-574980)
chr4 (1-223)||(39745486-39745719)
chr4 (1-198)||(5274409-5274617)
chr4 (152-340)||(26870807-26870995)
chr4 (193-340)||(5272778-5272925)
chr4 (1-219)||(15520264-15520492)
chr4 (1-219)||(740923-741151)
chr4 (191-340)||(7644307-7644456)
chr4 (3-199)||(7644773-7644980)
chr4 (195-336)||(37702126-37702267)
chr4 (217-340)||(39743269-39743392)
chr4 (1-126)||(17698422-17698547)
chr4 (222-340)||(38007492-38007610)
chr4 (233-340)||(35708151-35708258)
chr4 (266-339)||(3839895-3839968)
chr4 (1-62)||(35712922-35712983)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (1-340)||(26868-27218)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (1-336)||(18898-19233)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (7-336)||(119443-119783)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (9-340)||(65143-65480)
scaffold0006 (34-340)||(152662-152979)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (71-340)||(4597-4877)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (1-340)||(49465-49798)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (176-340)||(1-165)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (1-195)||(13201-13395)
scaffold0069 (228-336)||(13394-13502)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (152-340)||(898-1086)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (4-237)||(4866-5110)
scaffold0032 (4-237)||(11315-11559)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (152-284)||(54664-54796)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (1-201)||(13493-13704)
scaffold0045 (286-340)||(13439-13493)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (1-186)||(10991-11187)
[»] scaffold1555 (1 HSPs)
scaffold1555 (66-182)||(1521-1648)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (233-340)||(30505-30612)


Alignment Details
Target: scaffold0005 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 9325 - 9675
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9325 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 9424  T
Q  101 catgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9425 catgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 9524  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9525 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 9624  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9625 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 9675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14079676 - 14079326
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079676 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 14079577  T
Q  101 catgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079576 catgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 14079477  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14079476 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 14079377  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079376 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 14079326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 41628043 - 41628382
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41628043 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcgtaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 41628142  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41628143 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcctgctacattttatttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 41628242  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41628243 gtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcatttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 41628342  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41628343 attctgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcattgatg 41628382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Original strand, 30825593 - 30825942
Alignment:
Q  2 caaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgc 101  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30825593 caaatggtgttggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgc 30825692  T
Q  102 atgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 190  Q
    |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30825693 atgcatttatctagactttataggaggataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttta 30825792  T
Q  191 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 290  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  30825793 taaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttttcaaacgaggt 30825892  T
Q  291 gtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30825893 gtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 30825942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33425104 - 33424754
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33425104 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 33425005  T
Q  101 catgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33425004 catgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatccgttatgctacctttatttt 33424905  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33424904 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccgtgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 33424805  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33424804 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgtaaaacaatcactctcattgatg 33424754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 38961316 - 38961666
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  38961316 tcaaatggtgctagctatatatgcatatgcgaaagtgatgtttaattttcatttgtttcaacaatgttaattgatcaacggggtacatataatctacatg 38961415  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961416 catgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctatattttatttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 38961515  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961516 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 38961615  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961616 tgtcaagaacaattttgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 38961666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 38991661 - 38992010
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  38991661 tcaaatggtgctagctatatatgcatatgcgaaagtgatgtttaattttcatttgtttcaacaatgttaattgatcaacggggtacatataatctacatg 38991760  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38991761 catgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctatattttatttagcttaaaatcagttatgctacctttattt- 38991859  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38991860 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 38991959  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38991960 tgtcaagaacaattttgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 38992010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6478338 - 6477988
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6478338 tcaaatggtggcagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaacttccatttgttttaacaatattaattgatcaacggggtacatataatgtacatg 6478239  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6478238 catgcatttatctagactttatgggaagataataggaaaataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacatttatttt 6478139  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  6478138 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcttgtttaacatttcccaaatgagg 6478039  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6478038 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 6477988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 41976610 - 41976950
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41976610 tcaaatggtgctggctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacattgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 41976709  T
Q  101 catgcattt-atctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattata 199  Q
     |||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41976710 aatgcattttatttagcctttttaggaagataaattagaagtcattgtacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattata 41976809  T
Q  200 tgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaac 299  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41976810 tgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccttgtttagcatttcccaaaagaggtgtcaagaac 41976909  T
Q  300 aattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41976910 aattctaaaagtaaagcgcaaaacaatcgctctcattgatg 41976950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 39203783 - 39204122
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||||| || |||||| || | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||     
T  39203783 tcaaatggttctagctataaatgcgcatgcgggagtgaagcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggcgaacggggtacatataatccacatt 39203882  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||    
T  39203883 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcgtggtacattttctttagcttaaaatcaattatgctacattcattttataaattttat 39203982  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  39203983 gtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtcgttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaat 39204082  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
     || |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39204083 tttttgaaagaaaagcgcaaaacaataactctcattgatg 39204122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 41907000 - 41907349
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  41907000 tcaaatggtgctcgctatagatgcacatgcggaagcgatgcttaattttcgtttgtttcaacaatgtta-ttggccaacggggtacatataatccacatg 41907098  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41907099 catgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcatttt 41907198  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41907199 ataaattatatgtaattatatttgtatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaacgagg 41907298  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41907299 tgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacattcactctcattgatg 41907349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20663790 - 20663440
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20663790 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 20663691  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  20663690 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 20663591  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  20663590 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 20663491  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20663490 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 20663440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30549153 - 30548803
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30549153 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 30549054  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  30549053 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 30548954  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  30548953 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 30548854  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30548853 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 30548803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 19247254 - 19247603
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||    
T  19247254 tcaaatggtgatagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtaaacgggattcatataatgcacatg 19247353  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||           |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  19247354 catgcatttatctagcctttataggaagataacaggaagataaattaaaagtcataatacattttctttagcttaaaattagttatgctacctttattt- 19247452  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  19247453 atgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccgaacgagg 19247552  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19247553 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcacaaaacaatcactctcattgatg 19247603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 19320438 - 19320787
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||    
T  19320438 tcaaatggtgatagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtaaacgggattcatataatgcacatg 19320537  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||           |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  19320538 catgcatttatctagcctttataggaagataacaggaagataaattaaaagtcataatacattttctttagcttaaaattagttatgctacctttattt- 19320636  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  19320637 atgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccgaacgagg 19320736  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19320737 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcacaaaacaatcactctcattgatg 19320787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44213906 - 44213557
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || ||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44213906 tcaaatggtgttagctatagatgcacatggaga-gtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 44213808  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  44213807 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 44213708  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  44213707 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 44213608  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44213607 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 44213557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 34 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23627157 - 23626840
Alignment:
Q  34 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-- 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||      
T  23627157 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatcaacatgcatgcatttatctagaatttataggaagatagt 23627058  T
Q  132 ---------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatct 222  Q
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23627057 aggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatct 23626958  T
Q  223 tatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaa 322  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23626957 tatccataataatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaa 23626858  T
Q  323 caatcactctcattgatg 340  Q
    ||| || |||||||||||    
T  23626857 caaacattctcattgatg 23626840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44383786 - 44383436
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44383786 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 44383687  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggat-----------gataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     |||||||||||||| |||| || ||            |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383686 aatgcatttatctagcctttttaagaaaaaaaaaagaagataaattagaagtcatgatacatgttctttaacttaaaatcagttatgctacctttatttt 44383587  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||     
T  44383586 ataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttgatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtatagcatttcccaaacgaga 44383487  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  44383486 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgtaagacaatcactttcattgatg 44383436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 12759615 - 12759967
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccat---ttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtac 97  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| ||    
T  12759615 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccataatttgtttcaacaattttaattggttaacgggtt-catataatgcac 12759713  T
Q  98 atgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttat 186  Q
    ||| |||||||||||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12759714 atgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacaatttttttagcttaaaatcaattatgctacctttat 12759813  T
Q  187 tttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacg 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12759814 tttataaattatatataactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgaattagactaatattgttgttattttcctgtttagcatttcccaaacg 12759913  T
Q  287 aggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12759914 aggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 12759967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 41155780 - 41156130
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || || |||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||||||| |||||    
T  41155780 tcaaatggtgctagctatagatgcatatgcttgagtgatgcttaatttctatttgtttcaacaattttatttggtcaatggtgttcatataatgcacatg 41155879  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     |||||||||||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  41155880 aatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaattcagttatgttacctttatttt 41155979  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||  || |||| ||||||||||||| ||    
T  41155980 ataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatgttgttgttatttccctatttaacatttcccaaacgcgg 41156079  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41156080 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 41156130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 29433199 - 29433530
Alignment:
Q  3 aaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgca 102  Q
    |||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  |||||||    
T  29433199 aaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacagggtacatgtaatccacatgca 29433298  T
Q  103 tgcatttatctagactttataggatgataaatt---agaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattata 199  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29433299 tgcatttatcttaactttataggaagataataggaaagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatctgttatgctaccttcattttataaattata 29433398  T
Q  200 tgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaac 299  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29433399 tgtaactttattcgcatacatgtta---------atatgcattagactaatattgcagttatttccatgtttagcatttcccaaaggaggtgtcaagaac 29433489  T
Q  300 aattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29433490 aattatgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 29433530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 150 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42811621 - 42811426
Alignment:
Q  150 attttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaa 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42811621 attttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaa 42811522  T
Q  250 tattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatgtccat 345  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42811521 tattgcagttattttcttgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatgaccat 42811426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6301320 - 6301103
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  6301320 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 6301221  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6301220 catgtatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttattttataaattatat 6301122  T
Q  201 gtaactatattcacataca 219  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  6301121 gtaactatattcgcataca 6301103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22343271 - 22343102
Alignment:
Q  67 ttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaa 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22343271 ttaattggtcaacggggtacatataatgtgcatacatgcatttatctagattttataggaagataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaa 22343172  T
Q  167 atcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22343171 atcagttatgctacctttattttataaattatatgtaac--tattcgcatacatcttatccatgtaaatatg 22343102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22354931 - 22354762
Alignment:
Q  67 ttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaa 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354931 ttaattggtcaacggggtacatataatgtgcatacatgcatttatctagattttataggaagataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaa 22354832  T
Q  167 atcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22354831 atcagttatgctacctttattttataaattatatgtaac--tattcgcatacatcttatccatgtaaatatg 22354762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 177 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36598198 - 36598035
Alignment:
Q  177 ctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36598198 ctacctttattttataaattatatgtaattatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctatttagcat 36598099  T
Q  277 ttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  36598098 ttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagtgcaaaactatcactctcattgatg 36598035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36602914 - 36602722
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36602914 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 36602815  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacct 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36602814 catgcatttatctagactttataggatgataataggaagataaattagaagtcatgttacattttctgtagcttaaaatcagttatgctacct 36602722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12250878 - 12250690
Alignment:
Q  152 tttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaata 251  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12250878 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 12250779  T
Q  252 ttgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  12250778 ttgcagttatttccctgtttagcatttcccaaaaaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaaacattctcattgatg 12250690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 340
Target Start/End: Original strand, 39444329 - 39444517
Alignment:
Q  152 tttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaata 251  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39444329 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 39444428  T
Q  252 ttgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  39444429 ttgcagttatttccctgtttagcatttcccaaaaaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaaacattctcattgatg 39444517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23967234 - 23967006
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  23967234 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 23967135  T
Q  101 catgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23967134 catgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 23967036  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23967035 ataaattatatgtaactatattcgcataca 23967006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 37029111 - 37029339
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  37029111 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 37029210  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||           |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  37029211 catgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 37029309  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37029310 ataaattatatgtaactatattcgcataca 37029339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 42061508 - 42061280
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  42061508 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 42061409  T
Q  101 catgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  42061408 catgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 42061310  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42061309 ataaattatatgtaactatattcgcataca 42061280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 44939715 - 44939943
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  44939715 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 44939814  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||           |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44939815 catgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 44939913  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44939914 ataaattatatgtaactatattcgcataca 44939943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 42811796 - 42811643
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42811796 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaacgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 42811697  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacatttt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42811696 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacatttt 42811643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19396209 - 19396015
Alignment:
Q  3 aaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgca 102  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  19396209 aaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaatggagtacatataatgtacatgca 19396110  T
Q  103 tgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttat 186  Q
    | |||||||||||||||||||           ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19396109 tacatttatctagactttatacgaagataattggaagataaattagacgtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttaagctacctttat 19396015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 45294898 - 45294755
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  45294898 tcaaatggtgttagctatagatgcaaatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaatggggttcatataatgcacatg 45294799  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcat 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45294798 catgcatttatctagcctttataggaagataaattagaagtcat 45294755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 234 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22342414 - 22342308
Alignment:
Q  234 atatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22342414 atatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaagaattctgaatggaaagcgcaaaacaatcactctc 22342315  T
Q  334 attgatg 340  Q
    |||||||    
T  22342314 attgatg 22342308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 45294752 - 45294646
Alignment:
Q  182 tttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttccc 281  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||    
T  45294752 tttattttatgaattatatgtaactatattcacatacattttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccccgtttagcatttccc 45294653  T
Q  282 aaacgag 288  Q
    |||||||    
T  45294652 aaacgag 45294646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45294132 - 45294073
Alignment:
Q  281 caaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45294132 caaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 45294073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 22345631 - 22345559
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattg 73  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22345631 tcaaatggtgctagctatatatacacatacggaagtgatgcttaatttccatttgtctgaacaatgttaattg 22345559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 22357291 - 22357219
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattg 73  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22357291 tcaaatggtgctagctatatatacacatacggaagtgatgcttaatttccatttgtctgaacaatgttaattg 22357219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1074129 - 1073779
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1074129 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 1074030  T
Q  101 catgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1074029 catgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 1073930  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1073929 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 1073830  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1073829 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 1073779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18599852 - 18599502
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599852 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 18599753  T
Q  101 catgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599752 catgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 18599653  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18599652 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 18599553  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599552 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 18599502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14888803 - 14888453
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14888803 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttcattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 14888704  T
Q  101 catgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14888703 catgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 14888604  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14888603 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 14888504  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14888503 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 14888453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 34855336 - 34855686
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34855336 tcaaatgatgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtgcatataatgtacatg 34855435  T
Q  101 catgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34855436 catgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 34855535  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34855536 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 34855635  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34855636 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 34855686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 4423765 - 4424092
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4423765 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggttaacggggtacatataatgtacatg 4423864  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423865 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 4423964  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423965 gtaactatattcgcatacattttatccatgtaaata-gcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 4424063  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcac 329  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4424064 attctgaaaggaaagcgcaaaacattcac 4424092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11946335 - 11945985
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11946335 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 11946236  T
Q  101 catgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11946235 catgcatttatctagactttatagtaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacatttatttt 11946136  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11946135 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttctcaaacgagg 11946036  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11946035 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 11945985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 2520544 - 2520894
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2520544 tcaaatggtgttggctatatatgcacatgcggaagagatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacttg 2520643  T
Q  101 catgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2520644 catgcatttatctagactttataggtagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgatacctttatttt 2520743  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2520744 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttaacatttcccaaacgagg 2520843  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2520844 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagtgcaaaacaatcactctcattgatg 2520894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 32 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11935515 - 11935196
Alignment:
Q  32 gaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttatag------- 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  11935515 gaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatgcatgcatttatctagactttatagtaagata 11935416  T
Q  125 ----gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacat 220  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11935415 ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacatttattttataaattatatgtaactatattcgcatacat 11935316  T
Q  221 cttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11935315 cttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttctcaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaa 11935216  T
Q  321 aacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11935215 aacaatcactctcattgatg 11935196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 7222125 - 7222475
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7222125 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcgtaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 7222224  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7222225 catgcatttatctagactttataggaagataataggaagagaaattagaagtcatgctgcattttctttaacttaaaatcagttatgctacctttatttt 7222324  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  7222325 ataaattatatgtaactgtattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacaagg 7222424  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7222425 tgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 7222475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 15275039 - 15275389
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15275039 tcaaatggtgctagctatatattcacatgcgaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatt 15275138  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15275139 catgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttaacttaaaatcagttatgctacctttatttt 15275238  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15275239 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattatactaatattgaacttatttccctgtttagcatttcccaaacgagg 15275338  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15275339 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 15275389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 25532646 - 25532980
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||||||||  ||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25532646 tcaaatggtgctatctatacatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 25532745  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     ||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25532746 aatgcatttatctagcattt-taggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 25532844  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25532845 gtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 25532944  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25532945 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 25532980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9979914 - 9979579
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9979914 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 9979815  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9979814 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 9979715  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9979714 gtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 9979615  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9979614 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 9979579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 24445361 - 24445696
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24445361 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 24445460  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24445461 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 24445560  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24445561 gtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 24445660  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24445661 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 24445696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 33978354 - 33978693
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  33978354 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaataatgttaattggtcaatggggtacatataatgcacatg 33978453  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  33978454 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatggtacattttatttagcttaaaatcagttatgttaccttcattttataaattatat 33978553  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33978554 gtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcatcatactaatattacaattatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaata 33978653  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33978654 attctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 33978693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 1219958 - 1220287
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1219958 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 1220057  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1220058 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 1220157  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1220158 gtaactatattcgca------ttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 1220251  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1220252 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 1220287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7219730 - 7219380
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  7219730 tcaaattgtgctagctatatatgccaatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattgatcaacggggtacatataatgtacatg 7219631  T
Q  101 catgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7219630 catgcatttatctagactttatatgaagataataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgctacctttatttt 7219531  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  7219530 ataaattagatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactattattacagttatttccctgtttagcatttcccaaatgagg 7219431  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7219430 tgtcaagaacaattctgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcattgatg 7219380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33322319 - 33321969
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33322319 tcaaatggtgctagctatagatgcaaatgtggaagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 33322220  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     |||||||||||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33322219 aatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 33322120  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  33322119 ataaattatatgtaactatatctgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttctctgtttcgcatttcccaaacgagg 33322020  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33322019 tgtcaagaacaattataaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 33321969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 17938903 - 17939253
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17938903 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatttaatgtacatg 17939002  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  17939003 catgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagttatgctacatgttctttagcttaaaatcagttatggtacctttattta 17939102  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| || |    
T  17939103 ataaattatttgtaactatattcgaatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttccctatttagcatttctcaaatgatg 17939202  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  17939203 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaagcaatcactatcattgatg 17939253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 249293 - 249643
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  249293 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 249392  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  249393 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 249492  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  249493 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 249592  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  249593 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 249643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12580662 - 12580312
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  12580662 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaatggggtacatataatgcacatg 12580563  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  12580562 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 12580463  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  12580462 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 12580363  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12580362 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 12580312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 34320473 - 34320823
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| | |||| || |||| | || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  34320473 tcaaatggtgctagatatagatgcacaagcgggagtgatgtttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataattcacatg 34320572  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||           ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34320573 catgcatttatctagcctttataggaagataataggaacatatattagaagtcataatacattttctttatcttaaaatcagttatgctacctttatttt 34320672  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  34320673 ataaattatatgtaactatattcgcataaatctcatccatgttaatatgtattagactaatgttgttgttatttccctgtttagcatttcacaaacgagg 34320772  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34320773 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaactatcactctcattgatg 34320823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 337
Target Start/End: Original strand, 1931460 - 1931761
Alignment:
Q  37 gatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatg-------- 128  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |            
T  1931460 gatgtttaatttccgtttgcttcaacaatgttaattagccaacggggtacatataatccacatgcatgcatttatctagactttataggaagctaatagg 1931559  T
Q  129 ---ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttat 225  Q
       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1931560 aagataaattagaagtcatgatacattttctttagctta----------tgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttat 1931649  T
Q  226 ccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaa 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  1931650 ccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttctctgtttagcattttccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagtgcaaaacaa 1931749  T
Q  326 tcactctcattg 337  Q
    ||||||||||||    
T  1931750 tcactctcattg 1931761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22374718 - 22374357
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  22374718 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggaacatataatatacatg 22374619  T
Q  101 catgcatttatctagacttt----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaat---cagttatgctacct----- 182  Q
    ||||||||||||||||||||          ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||   ||  |||| || ||         
T  22374618 catgcatttatctagacttttaagaagataataagaagataaattagaagtcatgctacattttctttagactaatattcgcatatatg-taactataaa 22374520  T
Q  183 ttattttataaat-----tatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatt 277  Q
    ||||||||||  |     ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22374519 ttattttatagttacatatatatgtaactatattcgcatatatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatt 22374420  T
Q  278 tcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  22374419 tcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagtgcaaaacagtcattctcattgatg 22374357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13457578 - 13457350
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  13457578 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 13457479  T
Q  101 catgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13457478 catgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 13457380  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13457379 ataaattatatgtaactatattcgcataca 13457350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 209 - 340
Target Start/End: Original strand, 4424087 - 4424218
Alignment:
Q  209 attcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424087 attcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcttgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaa 4424186  T
Q  309 atgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4424187 aggaaagcgcaaaacaatcattctcaatgatg 4424218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 1080457 - 1080374
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggt 84  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1080457 tcaaatggtgttggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggt 1080374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 257 - 340
Target Start/End: Original strand, 14831133 - 14831216
Alignment:
Q  257 gttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14831133 gttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgttaagaacaattctaaaaagaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 14831216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 34686992 - 34687342
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34686992 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 34687091  T
Q  101 catgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34687092 catgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 34687191  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34687192 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 34687291  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34687292 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 34687342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41830894 - 41830544
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41830894 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 41830795  T
Q  101 catgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41830794 catgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 41830695  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41830694 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 41830595  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41830594 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 41830544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 18813624 - 18813974
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18813624 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 18813723  T
Q  101 catgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813724 catgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 18813823  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18813824 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 18813923  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813924 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 18813974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 31619094 - 31619444
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||| |||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31619094 tcaaatgatgccagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgcacatg 31619193  T
Q  101 catgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31619194 catgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 31619293  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31619294 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattaaactaatattgcagttatttttctgtttggcatttcccaaacgagg 31619393  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31619394 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 31619444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 52522411 - 52522063
Alignment:
Q  3 aaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgca 102  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52522411 aaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttagttggtcaacggggtacatataatgtacatgca 52522312  T
Q  103 tgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttat 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52522311 tgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcaattatgctacctttattttat 52522212  T
Q  192 aaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtg 291  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  52522211 aaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatactgcagttattttcctatttagcatttcccaaacgaggtg 52522112  T
Q  292 tcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52522111 tcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 52522063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 41963775 - 41963426
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41963775 tcaaatggtaccggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaatggggtgcatataatgtacatg 41963676  T
Q  101 catgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41963675 catgcatttatctagactttataggaagataagaggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttacgctacctttatttt 41963576  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  41963575 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattatactaatattgcagttattttcctgtttagcatttctcaaacgggg 41963476  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 339  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41963475 tgtgaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 41963426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38846069 - 38845719
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38846069 tcaaatggtgctagctatatatgcacgtgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 38845970  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38845969 catgcgtttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagtcatgctacctttatttt 38845870  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38845869 ataaattatatgtaaatatattcaaatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 38845770  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38845769 tgtcaagaataattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 38845719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 15314666 - 15315005
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || || |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  15314666 tcaaatggtgatagctataaatgcaaatgaaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatccacatg 15314765  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15314766 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcattttataaattatat 15314865  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15314866 gtaactatatttgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 15314965  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15314966 attctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 15315005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 4891534 - 4891869
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4891534 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 4891633  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4891634 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 4891733  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4891734 gtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 4891833  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4891834 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 4891869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 29186953 - 29186618
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29186953 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 29186854  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29186853 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 29186754  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29186753 gtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 29186654  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29186653 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 29186618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 34691530 - 34691870
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  34691530 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgaagcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacacg 34691629  T
Q  101 catgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34691630 catgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcgtgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 34691729  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  34691730 ataaa----------ctatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcatatttagcatttcccaaacgagg 34691819  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34691820 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 34691870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 33361143 - 33361472
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33361143 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 33361242  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33361243 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 33361342  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33361343 gtaactatattcgca------ttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaatgaggtgtcaagaaca 33361436  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33361437 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 33361472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 50560458 - 50560779
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  50560458 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 50560557  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     ||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50560558 aatgaatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttatttagcttaaaatcagttatgctatctttattttataaattatat 50560657  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50560658 gtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcactagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 50560757  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaa 322  Q
    ||||| ||| ||||||||||||    
T  50560758 attctaaaaggaaagcgcaaaa 50560779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 51966567 - 51966228
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  51966567 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagagatgcttaatttccatttgtatcaacaatgttaattggtcaacggagttcatataatgcacatg 51966468  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51966467 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcaattatgctacctatattttataaattatat 51966368  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51966367 gtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgtattaaactaatattgttgttatttccctgtttagcattttccaaacgaggtgtcaagaaca 51966268  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  51966267 attctaaaaggaatacgcaaaacaatcactctcattgatg 51966228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28566562 - 28566214
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  |||||    
T  28566562 tcaaatggtgttagctataaatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacagggtacatataatccacatg 28566463  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggat-----------gataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||            |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28566462 catgcatatatctagactttataggaatataataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgctaccttcatttt 28566363  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||| |    
T  28566362 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagtta--tctccctttagcatttcccaaacgatg 28566265  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28566264 tgttaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 28566214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 48339737 - 48340084
Alignment:
Q  9 tgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatt 108  Q
    |||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  48339737 tgctagctatatatgcccatgcggaagtgatgcttaatttctatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacgaggtacatataatgtacatgcatgcatt 48339836  T
Q  109 tatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaa--- 194  Q
    |||||||||||||||           ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  48339837 tatctagactttatattaagataataggaagataaattagaaatcatggtgcattttctttaacttaaaatcagttatgatacctttattttataaatta 48339936  T
Q  195 --ttatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgt 292  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||    
T  48339937 aattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttctcaaatgaggtgt 48340036  T
Q  293 caagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48340037 caagaacaattatgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcattgatg 48340084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 12713882 - 12714232
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  |||||    
T  12713882 tcaaatggtgttagctataaatgcacatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacaaggtgcatataatccacatg 12713981  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggat-----------gataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||| |||||||||||||||||            |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12713982 catgcattaatctagactttataggaatataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttttttaacttaaaatcagttatgataccttcatttt 12714081  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |    
T  12714082 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatctccctgtttagcattttccaaacgatg 12714181  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||| || |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12714182 tgttaaaaacaattctgaaagaaaatcgcaaaacaatcactctcattgatg 12714232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 52309239 - 52309589
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  52309239 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttgcatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 52309338  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     ||||||||| |||| |||            |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52309339 aatgcatttacctagccttcttaagaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagtcatgctacctttatttt 52309438  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  52309439 ataaattatatgtaactatattcgcatatgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtgtagcatttctcaaacgagg 52309538  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  52309539 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcacaaaacaatcactctcgttgatg 52309589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 42681795 - 42682145
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  42681795 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaataatattagttggtcaacgggattcatataatgcacatg 42681894  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||           ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42681895 aatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 42681994  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42681995 ataaattatatgtaactatattcgcatacattttatccatgttaatatccattagactaatattgttcttatttccctgtttagcatttcccaaacgagg 42682094  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42682095 tgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaagcaatcactctcattgatg 42682145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13663214 - 13662900
Alignment:
Q  34 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa- 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||     
T  13663214 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgaggtacatataatccacatgcatgcatttatctagattttataggaatataat 13663115  T
Q  133 ----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatct 222  Q
              ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13663114 aggacgatacattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattaacatacatct 13663015  T
Q  223 tatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaa 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13663014 tatccatgttaatatgcattagactaatattgcagtta--tctccctttagcatttcccaaacaaggtattaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaa 13662917  T
Q  323 caatcactctcattgatg 340  Q
     |||||||||||||||||    
T  13662916 -aatcactctcattgatg 13662900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29841532 - 29841182
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |  || | |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29841532 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcggtgcttaatttccatttgtttcaacgatattagttggtcaacggggttcatataatgcacatg 29841433  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||           ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29841432 aatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttatcttaaaatcagttatgctacctttatttt 29841333  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  29841332 ataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttcttatttccctgtttagcatttctcaaacgagg 29841233  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29841232 tgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaagcaatcactctcattgatg 29841182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10695034 - 10694689
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  10695034 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtaatgcttagtttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgaggttcatataatgcacatg 10694935  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||           |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  10694934 aatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagatcaattagaggtcatgatacattttctttagcttaaagtaagttatgctacatttatttt 10694835  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||| |||    
T  10694834 ataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttcactgtttagcatttctcaaacaagg 10694735  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcat 335  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||||    
T  10694734 tgtcaagaacaattctaaaaggaaggtgcaaaacaatcacactcat 10694689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 18111123 - 18111351
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  18111123 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 18111222  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||           |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18111223 catgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 18111321  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18111322 ataaattatatgtaactatattcgcataca 18111351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43255398 - 43255170
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  43255398 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 43255299  T
Q  101 catgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  43255298 catgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 43255200  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43255199 ataaattatatgtaactatattcgcataca 43255170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 50395812 - 50395584
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  50395812 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 50395713  T
Q  101 catgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  50395712 catgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 50395614  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50395613 ataaattatatgtaactatattcgcataca 50395584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 233 - 340
Target Start/End: Original strand, 10763030 - 10763137
Alignment:
Q  233 aatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactct 332  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||    
T  10763030 aatatgcattagactaatattgttcttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaagcaatcactct 10763129  T
Q  333 cattgatg 340  Q
     |||||||    
T  10763130 aattgatg 10763137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 10762959 - 10763023
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaat 65  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10762959 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaat 10763023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30567714 - 30567375
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  30567714 tcaaatggttctagctatatatgcacatgtggtagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtacatataatgtacatg 30567615  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30567614 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 30567515  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30567514 gtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcatgaaca 30567415  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30567414 attctgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcattgatg 30567375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36633935 - 36633596
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36633935 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 36633836  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36633835 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 36633736  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36633735 gtaactatattcgattacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacg 36633636  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  36633635 attctgaaaggaaagcgcaaaactatcactcttattgatg 36633596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 21097131 - 21097477
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21097131 tcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 21097230  T
Q  101 catgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21097231 catgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaattagttatgctacctttatttt 21097330  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21097331 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 21097430  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21097431 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcacaaaacaatcactctcatt 21097477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33664644 - 33664305
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33664644 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggagtacatataatgtacatg 33664545  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33664544 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagtttaaaatcagttatggtacctttatttaataaattatat 33664445  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33664444 gtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgtactagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 33664345  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33664344 attctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactttcattgatg 33664305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16725209 - 16724859
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16725209 tcaaatgatgctagttatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgggatgcatataatgtacatg 16725110  T
Q  101 catgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16725109 catgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 16725010  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16725009 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttagccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctctttagcatttcccaaacgagg 16724910  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16724909 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 16724859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 26821052 - 26821402
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26821052 tcaattggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 26821151  T
Q  101 catgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821152 catgcatttatctagactttataggaagataataagatgataaattagaagccatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 26821251  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26821252 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcctttcccaaacgagg 26821351  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821352 tgtcaagaacaattatgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 26821402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 50 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30571350 - 30571060
Alignment:
Q  50 catttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttac 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  30571350 catttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtacatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctac 30571251  T
Q  150 attttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaa 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30571250 attttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaa 30571151  T
Q  250 tattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30571150 tattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcatgaacaattctgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcattgatg 30571060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9544467 - 9544132
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9544467 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 9544368  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544367 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 9544268  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544267 gtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 9544168  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9544167 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 9544132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 42884823 - 42885173
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42884823 tcaaatggtgtcagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttacatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 42884922  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  42884923 catgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagtaatgttacctttatttt 42885022  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  42885023 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattaaactaatattgtagttattttcctgtttatcatttcccgaacgagg 42885122  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42885123 tgttaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaataactctcattgatg 42885173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 4810981 - 4811331
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4810981 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgaacatg 4811080  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||           ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4811081 catgcatatatctagactttatatgaagataataggaatataaattagaagtcatgatacattttttttagcttaaaatcagttacgctacctttatttt 4811180  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  4811181 ataaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactgatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaatgagg 4811280  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4811281 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 4811331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 10048844 - 10048508
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10048844 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 10048745  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10048744 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatatattttctttaacttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 10048645  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10048644 gtaactatattcgcatatgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattattgttatttccctgtttagcatttcccaaaccaggtgtcaagaaca 10048545  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattg 337  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10048544 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctaattg 10048508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 41 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19168449 - 19168153
Alignment:
Q  41 cttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaag 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  19168449 cttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatatattgtacatgcatgcagttatctagact--ataggaagataaattagaag 19168352  T
Q  141 tcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgca 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  19168351 tcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatactacctttattttaaaaattatatgtaactatattcgcagacatcttatccatgtaaatatgca 19168252  T
Q  241 ttagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19168251 tta-actaatattgtagttattttcctgtttagcatttctcaaacgaggtgtcaagaataattctgaaaagaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 19168153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1515850 - 1515500
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1515850 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 1515751  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     |||||||||||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1515750 aatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 1515651  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  1515650 ataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtttttatttatctgtttagcatttcccaaacgaga 1515551  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1515550 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacattcactctcattgatg 1515500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4291495 - 4291166
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4291495 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 4291396  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4291395 aatgcatttatctagcctttttagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 4291296  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4291295 gtaactatattcgca------ttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 4291202  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4291201 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 4291166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 14752605 - 14752955
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  14752605 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgtgggagcgatgcataattttcgtttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatccacatg 14752704  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14752705 catgcatttatctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcatttt 14752804  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  14752805 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccatgtttagcatttcccaaatgagg 14752904  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14752905 tgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgtaaaacaatcactctcattgatg 14752955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10822780 - 10822436
Alignment:
Q  3 aaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgca 102  Q
    |||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  10822780 aaatggtgctagctataaatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgtggtacatataatccacatgca 10822681  T
Q  103 tgcatttatctagactttataggatgataaattag-------aagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaat 195  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||       |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10822680 tgcatttatctatactatataggaagataaattagttatgctacttcatggtacattttctttagcttaaaatcagttttgctaccttcattttataaat 10822581  T
Q  196 tatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaa 295  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10822580 catatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttctctgtttagcattttccaaacgaggtgtcaa 10822481  T
Q  296 gaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10822480 gaaaaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 10822436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 16883368 - 16883705
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||||||  |||||    
T  16883368 tcaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggattgatgcttaattttcatttgtttcaacaattttacttggccaacggagtacatataatccacatg 16883467  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16883468 catgcatttatctagactttataggaagataaattataagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcattttataacttatat 16883567  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16883568 gtaactatatattcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctatttagca-ttcccaaacgaggtgtcaagaaca 16883666  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 339  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16883667 attttgaaaggaaagtgcaaaacaatcactctcattgat 16883705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 17041058 - 17041395
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||||||  |||||    
T  17041058 tcaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggattgatgcttaattttcatttgtttcaacaattttacttggccaacggagtacatataatccacatg 17041157  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17041158 catgcatttatctagactttataggaagataaattataagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcattttataacttatat 17041257  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17041258 gtaactatatattcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctatttagca-ttcccaaacgaggtgtcaagaaca 17041356  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 339  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17041357 attttgaaaggaaagtgcaaaacaatcactctcattgat 17041395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18093572 - 18093223
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18093572 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcggaagcgatgcttaattttcatctgtttcagcaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 18093473  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     |||||||||||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18093472 aatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagt-atgctacctttatttt 18093374  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  18093373 ataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaga 18093274  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18093273 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 18093223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45205883 - 45205528
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||| ||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  45205883 tcaaattgtgcaagctatatatgcccatgcggaagtgatgcttaatttctatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacgaggtacatataatgtagatg 45205784  T
Q  101 catgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45205783 catgcatttatctagactttatattaagataataggaagataaattagaagtcatggtgcattttctttaacttaaaatcagttatgctacctttatttt 45205684  T
Q  190 ataaatta-----tatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaa 284  Q
    ||||||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45205683 ataaattaaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtagttatttccctgtttagcatttcccaaa 45205584  T
Q  285 cgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45205583 cgaggtgtaaagaacaattctgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcattgatg 45205528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 3710327 - 3710677
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3710327 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 3710426  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  3710427 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 3710526  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  3710527 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 3710626  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3710627 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 3710677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11867089 - 11866739
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11867089 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 11866990  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  11866989 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 11866890  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  11866889 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 11866790  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11866789 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 11866739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35358482 - 35358132
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35358482 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 35358383  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  35358382 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 35358283  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  35358282 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 35358183  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35358182 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 35358132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 34 - 340
Target Start/End: Original strand, 17036734 - 17037051
Alignment:
Q  34 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-- 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||      
T  17036734 agtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatccacatgcatgcatttatctagaatttataggaagatagt 17036833  T
Q  132 ---------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatct 222  Q
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17036834 aggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatct 17036933  T
Q  223 tatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaa 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17036934 tatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaa 17037033  T
Q  323 caatcactctcattgatg 340  Q
    ||| || |||||||||||    
T  17037034 caaacattctcattgatg 17037051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 34 - 340
Target Start/End: Original strand, 17091242 - 17091559
Alignment:
Q  34 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-- 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||      
T  17091242 agtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatccacatgcatgcatttatctagaatttataggaagatagt 17091341  T
Q  132 ---------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatct 222  Q
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17091342 aggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatct 17091441  T
Q  223 tatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaa 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17091442 tatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaa 17091541  T
Q  323 caatcactctcattgatg 340  Q
    ||| || |||||||||||    
T  17091542 caaacattctcattgatg 17091559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9917552 - 9917199
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9917552 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 9917453  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagctta---aaatcagttatgctacctttat 186  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||           ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  9917452 aatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaattagaagtcataatacattttctttagcttattaaaatcagttatgctacctttat 9917353  T
Q  187 tttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9917352 tttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttcttattttcctgtttagtatttcccaaacg 9917253  T
Q  287 aggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  9917252 aggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcttaaagcaatcactctcattgatg 9917199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 340
Target Start/End: Original strand, 17025057 - 17025374
Alignment:
Q  34 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-- 131  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||      
T  17025057 agtgatgtttcatttccatttgtttcaacaatattaattggccaacggggtacatataatccacatgcatgcatttatctagaatttataggaagatagt 17025156  T
Q  132 ---------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatct 222  Q
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17025157 aggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatct 17025256  T
Q  223 tatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaa 322  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17025257 tatccataataatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaa 17025356  T
Q  323 caatcactctcattgatg 340  Q
    ||| || ||| |||||||    
T  17025357 caaacattcttattgatg 17025374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 142 - 340
Target Start/End: Original strand, 11447950 - 11448148
Alignment:
Q  142 catgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcat 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11447950 catggtacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaaatatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcat 11448049  T
Q  242 tagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11448050 tagactaatattgaagttatttccctctttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 11448148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1993783 - 1993555
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  1993783 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgtgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 1993684  T
Q  101 catgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  1993683 catgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 1993585  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1993584 ataaattatatgtaactatattcgcataca 1993555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6343571 - 6343343
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  6343571 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 6343472  T
Q  101 catgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6343471 catgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 6343373  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6343372 ataaattatatgtaactatattcgcataca 6343343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14324055 - 14323827
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  14324055 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 14323956  T
Q  101 catgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14323955 catgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 14323857  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14323856 ataaattatatgtaactatattcgcataca 14323827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 28501715 - 28501943
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  28501715 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 28501814  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||           ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28501815 catgtatttatctagactttctaggaagataataagaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 28501913  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28501914 ataaattatatgtaactatattcgcataca 28501943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Original strand, 11447085 - 11447212
Alignment:
Q  5 atggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatg 104  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11447085 atggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgggttacatataatgtacatgcatg 11447184  T
Q  105 catttatctagactttataggatgataa 132  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11447185 catttatctagactttataggaagataa 11447212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6104973 - 6104635
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6104973 tcaaatggtgctggctatatatggacatgcggaagtgatacttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtctacggggtgcatataatgtacatg 6104874  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6104873 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 6104774  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  6104773 gtaactatattcgcatgcatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcccgtttaacatttcccaaacgagttgtcaagaaca 6104674  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 339  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6104673 attctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 6104635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31369875 - 31369525
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31369875 tcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 31369776  T
Q  101 catgcatttatctagacttta-----------taggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31369775 catgcatttatctagactttagaggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaataagttatgctacctttatttt 31369676  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31369675 ataaattatacgtaactatattcatatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 31369576  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31369575 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 31369525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 51247769 - 51248107
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51247769 tcaaatggtgctagctatatatgcacgtgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 51247868  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51247869 cgtgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 51247968  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  51247969 gtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctatttagcatttcccaaacgaggtg-cgagaaca 51248067  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51248068 attctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 51248107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35088693 - 35088346
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35088693 tcaattggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 35088594  T
Q  101 catgcatttatctagacttt--------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttata 192  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35088593 catgcatttatctagacttttgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttata 35088494  T
Q  193 aattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgt 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35088493 aattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagccttttccaaacgaggtgt 35088394  T
Q  293 caagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35088393 caagaacaattatgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 35088346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 50772094 - 50771755
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50772094 tcaaatggtggtagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaatggggtgcatataatgtacatg 50771995  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  50771994 catgcatttatctagactttataggaagataaattataagtcatgctacattttttttagcttaaaatcagttatggtacctttatttaataaattatat 50771895  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50771894 gtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 50771795  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50771794 attctgaaaggaaagcgtaaaacaatcactctcattgatg 50771755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 52841381 - 52841041
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52841381 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcgaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 52841282  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  52841281 catgcatttatctggactttgtaggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcggttatgccacctttatttcataaattatat 52841182  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52841181 gtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagacttatattgcagttatttccctgtttagcatttctcaaacgaggtgtcaagaaca 52841082  T
Q  301 attctgaaatg-aaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52841081 attctgaaaggaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 52841041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21700417 - 21700078
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  21700417 tcaaatggtgctaactatatatgcacatgcagaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtaaatataatgtacatg 21700318  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21700317 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaataatat 21700218  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21700217 gtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactgatattccagttattttcatgtttagcatttctcaaacgacgtgtcaagaaca 21700118  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21700117 attttgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 21700078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 50740760 - 50741099
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  50740760 tcaaatggtggtagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaatggggttcatataatgtacatg 50740859  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  50740860 catgcatttatctagactttataggaagataaattataagtcatgctacattttttttagcttaaaatcagttatggtacctttatttaataaattatat 50740959  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50740960 gtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctttttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 50741059  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50741060 attctgaaaggaaagcgtaaaacaatcactctcattgatg 50741099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11326500 - 11326150
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11326500 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 11326401  T
Q  101 catgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11326400 catgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 11326301  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  11326300 ataaattatatgtaactatattcgaatacatcttatccatgtaaatatgcattagagtaatattgtagttattttcctgtttggcgtttcccaaacgagg 11326201  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11326200 tgtcaagaacaattttgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcattgatg 11326150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 48976081 - 48976431
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  48976081 tcaaatggtgctggctatatatgcacatgcgaaagtgatgcataattttcatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatgtacatg 48976180  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||           |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48976181 tatgcatttatctatactttataggaagataatatgaagataaattagaagtcaagctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 48976280  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48976281 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 48976380  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48976381 tgtcaagaacaattatgaaaggaaagcggaaaacaatcactctcattgatg 48976431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 52854300 - 52853950
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  52854300 tcaaatggtgctagctatatatccacatgcagaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgtggtacatataatgtacatg 52854201  T
Q  101 catgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  52854200 catgcatttatctagactttatatgaagatgataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaattagttatgatatctttatttt 52854101  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  52854100 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatattcattatactaatattgcagttatttttctgtttagcatttgccaaacgacg 52854001  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52854000 tgtcaagaacaattttgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctctttgatg 52853950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 23192858 - 23193208
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23192858 tcaaattgtgctagctatatatgcccatgcgaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgggatacatataatgtacatg 23192957  T
Q  101 catgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23192958 catgcatttatctagactttatatgaagataataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgctacctttattat 23193057  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23193058 aaaaattaaatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaacgagg 23193157  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23193158 tgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 23193208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 340
Target Start/End: Original strand, 49112475 - 49112821
Alignment:
Q  5 atggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatg 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49112475 atggtgctggctatatatgcacatgcgaaagtgatgcataatttccatttgtttcaacaatgttgtttggtcaacggggtacatataatgtacatgcatg 49112574  T
Q  105 catttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataa 193  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||           |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49112575 catttatctagactttatatgaagataataagaagataaattagaattcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataa 49112674  T
Q  194 attatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtc 293  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  49112675 attatatgtaactatattcgaatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttttcaaacgaggtgtc 49112774  T
Q  294 aagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49112775 aagaacaattctgaaagaaaagtgcaaaacaatcactctcattgatg 49112821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 918078 - 918417
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  918078 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaatggggtacatataatgcacatg 918177  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||    
T  918178 catgcatttctctagactttataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttcataagttatat 918277  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  918278 ataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactatgtgtcaagaaca 918377  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  918378 attctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 918417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36168309 - 36167959
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||    
T  36168309 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccgtttgtttcaacaatgttaattggccaacagggtgcatataatccacatg 36168210  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |           ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  36168209 catgcatttttctagactttataggaagctaataagaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgataccttgatttt 36168110  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  36168109 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatacgcattagactaatattgcagttattttcctgtttaacatttcccaaacgagg 36168010  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36168009 tgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 36167959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19894193 - 19893877
Alignment:
Q  24 cacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttata 123  Q
    |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  19894193 cacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtctacggggttcatataatgcacatgaatgcatttatctagcctattta 19894094  T
Q  124 ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatctt 223  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19894093 ggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataagttatatgtaactatattcgcatacgtctt 19893994  T
Q  224 atccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaac 323  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  19893993 atccatgttaatatgcattagagtaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgagatgtcaagaacgattctaaaaggaaagcgcaaaac 19893894  T
Q  324 aatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||    
T  19893893 aatcactctcattgatg 19893877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 55295637 - 55295287
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  55295637 tcaaatggtgctagctataaattcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaatttgtcaacggggttcatataatgcacatg 55295538  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     |||||||| ||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55295537 aatgcatttttctagccttttcaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaataagttatgctacctttctttt 55295438  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  55295437 ataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcacaaacgagg 55295338  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55295337 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 55295287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 8242102 - 8242446
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| || ||| || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  8242102 tcaaatggtgctagcaatagatgcacatgcgagagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggttaacggggtacatataatgcacatg 8242201  T
Q  101 catgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||           ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||||    
T  8242202 catgcatttatctagactctataagaagataagaggaagataaattagaagtcatgatacattt-ctttagcttaaaatcag-----ctacctttatttt 8242295  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8242296 ataaattatatgtaactacattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttctctgtttagcatttctcaaacgagg 8242395  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8242396 tgttaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 8242446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44073574 - 44073229
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  44073574 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacgaggtacatataatgcacatg 44073475  T
Q  101 catgcatttatctagacttta------taggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaa 194  Q
    ||||||||| ||||||||| |      ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||     
T  44073474 catgcatttctctagacttgaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttcataag 44073375  T
Q  195 ttatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtca 294  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44073374 ttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactaggtgtca 44073275  T
Q  295 agaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  44073274 agaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataattactctcattgatg 44073229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11951833 - 11951483
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11951833 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 11951734  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     |||||||||||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11951733 aatgcatttatctagcctttttaagaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttgaaatcagttatgctacctttatttt 11951634  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   ||||||  |||||||||||||| |||| ||||    
T  11951633 ataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatactgttcttatttccctgtttagcatttcacaaatgagg 11951534  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11951533 tgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaagcaatcactctcattgatg 11951483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 22477104 - 22477454
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  22477104 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattagttggtcaacggagttcatataatgcacatg 22477203  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||           ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477204 aatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 22477303  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22477304 ataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttcttatttccctgtttagcatttcccaaacgagg 22477403  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22477404 tgtcaagaacaattcaaaaagaaaagcgcaaagcaatcactctcattgatg 22477454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40827870 - 40827543
Alignment:
Q  24 cacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagacttt--- 120  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||       
T  40827870 cacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttagttggtcaacgagtttcatataatgcacatgaatgcatttatctagcctttttt 40827771  T
Q  121 --------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattc 212  Q
            |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40827770 ggaagataataggaagataaattagaagtgatgatacattttctttagcttaaaatcagttatactacctttattttataaattatatgtaactatattc 40827671  T
Q  213 acatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatga 312  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  40827670 gcatacgtcttatccatgttaatatgcattagattaatattgttgttatttccttgtttagcattttccaaacgaggtgtcatgaacaattctaaaagga 40827571  T
Q  313 aagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40827570 aagcgcaaaacaatcactctcattgatg 40827543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11598822 - 11598472
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  11598822 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcaggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcatatg 11598723  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
      ||||||||||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  11598722 agtgcatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcaattaagatacctttatttt 11598623  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  11598622 ataaattatatgtaactatattagcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttctctgtttaacattttccaaacgagg 11598523  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  11598522 tgtcaagaacaaatctaaaaggaaagtgcaaaacaattaccctcattgatg 11598472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 340
Target Start/End: Original strand, 16495323 - 16495637
Alignment:
Q  34 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa- 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||     
T  16495323 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgaggtacatataatccacatgcatgcatttatctagattttataggaatataat 16495422  T
Q  133 ----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatct 222  Q
              ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16495423 aggacgatacattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattaacatacatct 16495522  T
Q  223 tatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaa 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16495523 tatccatgttaatatgcattagactaatattgcagtta--tctccctttagcatttcccaaacaaggtattaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaa 16495620  T
Q  323 caatcactctcattgatg 340  Q
     |||||||||||||||||    
T  16495621 -aatcactctcattgatg 16495637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 11382570 - 11382903
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  11382570 tcaaatggtgctagctatagatgtacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatccacatg 11382669  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatg------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaa 194  Q
    |||| |||||| | |||||||||||| |      |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  11382670 catggatttatatggactttataggaagctgaggataaattacaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttacgttaccttcattttataaa 11382769  T
Q  195 ttatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtca 294  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||   ||||||||||| |    
T  11382770 ttatatataactatattcgcagacattttatccatgttaatgtgcattagactaatattgcagtcatttccctttttagcattttgaaaacgaggtgtga 11382869  T
Q  295 agaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatca 328  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11382870 agaaaaaatctgaaaggaaagcgcaaaacaatca 11382903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 35436378 - 35436651
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||| ||||||| |||||| || |||||| || || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  35436378 tcaactggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttttgtttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatccacatg 35436477  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35436478 catgcatttatctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcatttt 35436577  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35436578 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttattt 35436651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39797188 - 39796971
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  39797188 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 39797089  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39797088 catgtatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttattttataaattatat 39796990  T
Q  201 gtaactatattcacataca 219  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  39796989 gtaactatattcgcataca 39796971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 135 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 48521736 - 48521530
Alignment:
Q  135 tagaagtcatgttacattttctttagcttaaaa-tcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaa 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  48521736 tagaagtcatgatacattttctttagcttaaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgtta 48521637  T
Q  234 atatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctc 333  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  48521636 atatgcattagactaatattgttgttatttccctgttaagcatttcccaaacgaggtgtcaagaagaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctc 48521537  T
Q  334 attgatg 340  Q
    |||||||    
T  48521536 attgatg 48521530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9879771 - 9879550
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||| |||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||    
T  9879771 tcaaatgatgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggagtacatataatccacatg 9879672  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9879671 catgcatttatctagactttataggaagataaattaaaagtgatgatacattttctttagtttaaaatcaattatgctaccttcattttataaattatat 9879572  T
Q  201 gtaactatattcacatacatct 222  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  9879571 gtaattatattcgcatacatct 9879550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2845558 - 2845365
Alignment:
Q  147 tacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagac 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2845558 tacatttgctttagcttaaaatcaattatgctacctttattttataaattatatgtaactatatttacatacaccttacacatgttaatatgcattagac 2845459  T
Q  247 taatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2845458 taatattgcagttattttcctatttagcatttcctaaacgaggtgtcaataacaattccgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 2845365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5253100 - 5252872
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  5253100 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 5253001  T
Q  101 catgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  5253000 catgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 5252902  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5252901 ataaattatatgtaactatattcgcataca 5252872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 54793643 - 54793473
Alignment:
Q  170 agttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgt 269  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||    
T  54793643 agttgtgctaccttcattttataaattatatgtaattatattcacatacatcttatccatgttaatatgcatcagactaatattgcagttatatccctgt 54793544  T
Q  270 ttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54793543 ttagcatttcccaaacgaggtgttaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 54793473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 28164944 - 28164809
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||    
T  28164944 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgagggagtgatgcttaatttccattcgtttcaaaaatgttaattgatcaacgaggttcatataatgtgcatg 28164845  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaatta 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28164844 catgcatttatctagactttataggaagataaatta 28164809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 54512355 - 54512466
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  54512355 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttctaattgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacataaaatgtacatg 54512454  T
Q  101 catgcatttatc 112  Q
    ||||||||||||    
T  54512455 catgcatttatc 54512466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 54793812 - 54793688
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  |||||    
T  54793812 tcaaatggtgttagctataaatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaac-gggtacatataatccacatg 54793714  T
Q  101 catgcatttatctagactttatagga 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  54793713 catgcatttatctagactttatagga 54793688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 2845641 - 2845558
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggt 84  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2845641 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcatcaatgttaattggtcaaccgggt 2845558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 11952136 - 11952053
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggt 84  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11952136 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggtcaacggggt 11952053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Original strand, 54512465 - 54512527
Alignment:
Q  278 tcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  54512465 tcccaaacaaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgtaaaacaatcattctcattgatg 54512527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8926753 - 8926403
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8926753 tcaaatggtgctggctataaatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 8926654  T
Q  101 catgcatttatctagacttta-----------taggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8926653 catgcatttatctagactttacaggaagataataggatgataaattaaaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 8926554  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8926553 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctatttagcatttcccaaacgagg 8926454  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8926453 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaaaaatcactctcattgatg 8926403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23767301 - 23766951
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767301 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 23767202  T
Q  101 catgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23767201 catgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagtcatgctacctttatttt 23767102  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23767101 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 23767002  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23767001 tgtcaagaacaattctgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcattgatg 23766951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 14308331 - 14308681
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14308331 tcaaatggtgctggctatatatacacatgcggaagtgatgtttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgggttgcatataatgtacatg 14308430  T
Q  101 catgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14308431 catgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 14308530  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  14308531 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgttgttattttcctgtttagcatttcccaaacgatg 14308630  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14308631 tgtcaagaacaattctgaaagtaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 14308681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 19520575 - 19520917
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataat---gtac 97  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||    
T  19520575 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatcatgcac 19520674  T
Q  98 atgcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaatta 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19520675 atgcatgaatttatctagactttataggaagataaactagaaatcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaatta 19520774  T
Q  198 tatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaaga 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19520775 tatgtaactatattcgcatacatcttatcaatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctctttagcatttcccaaacgaggtgtcaaaa 19520874  T
Q  298 acaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19520875 acaattttgaaagggaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 19520917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 33030209 - 33030546
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  33030209 tcaaatggtactagctatatatgcacatgcggaagtggtgcttaattttcatttgtttcaagaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacata 33030308  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33030309 catacatttatctagactttataggaagataaattagaagtcacgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttta-tttataaattatat 33030407  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33030408 gtaactatatttgcatacatcttatccatgtaaatatgcattatgctaatattgcagttatttttctatttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 33030507  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 339  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33030508 attctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 33030546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 5962100 - 5962450
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5962100 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgttttattaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 5962199  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5962200 catgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 5962299  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5962300 ataaattatatgtaattatattcgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 5962399  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5962400 tgtcaagaacatttctgaaaggaaagcgcaaaacaatcattctcattgatg 5962450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 17477301 - 17477640
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17477301 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgtggaagtgattcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 17477400  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  17477401 catgcatttatctagcctttataggaagataaattttaagtcatgctatattttttttagcttaaaatcagttatggtacctttatttaataaactatat 17477500  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17477501 gtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcaattatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 17477600  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17477601 attctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 17477640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17575913 - 17575574
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17575913 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgtggaagtgattcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 17575814  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  17575813 catgcatttatctagcctttataggaagataaattttaagtcatgctatattttttttagcttaaaatcagttatggtacctttatttaataaactatat 17575714  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575713 gtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcaattatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 17575614  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575613 attctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 17575574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 17481747 - 17482087
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17481747 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgtggaagtgattcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 17481846  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttcttt-agcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattata 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  17481847 catgcatttatctagcctttataggaagataaattttaagtcatgctatatttttttttagcttaaaatcagttatggtacctttatttaataaactata 17481946  T
Q  200 tgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaac 299  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17481947 tgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcaattatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaac 17482046  T
Q  300 aattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17482047 aattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 17482087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17571467 - 17571127
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17571467 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgtggaagtgattcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 17571368  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttcttt-agcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattata 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  17571367 catgcatttatctagcctttataggaagataaattttaagtcatgctatatttttttttagcttaaaatcagttatggtacctttatttaataaactata 17571268  T
Q  200 tgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaac 299  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17571267 tgtaactatatttgcatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcaattatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaac 17571168  T
Q  300 aattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17571167 aattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 17571127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 42245705 - 42245368
Alignment:
Q  3 aaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgca 102  Q
    |||||||||| |||||| || |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||    
T  42245705 aaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggcaaacggggtacatataatccacatgca 42245606  T
Q  103 tgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgt 202  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42245605 tgcatttatccaaactttataggaagataaattagaagtcatggtacagtttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcattttataaattatatgt 42245506  T
Q  203 aactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaat 302  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42245505 aactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaaggaggtgtcaagaacaat 42245406  T
Q  303 tctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245405 tctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 42245368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 42686970 - 42687303
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42686970 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttatttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 42687069  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    ||||||   |  ||      |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42687070 catgcaggaagata------ataggaagataaattagaggtcatgctacattttctttagcttaaaattagttatgctacctttattttataaattacat 42687163  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42687164 gtatctatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaagtgtcaagaaca 42687263  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42687264 attctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 42687303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 17170460 - 17170795
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17170460 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 17170559  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17170560 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 17170659  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17170660 gtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 17170759  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17170760 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 17170795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 31898641 - 31898306
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31898641 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 31898542  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31898541 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 31898442  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31898441 gtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttattgccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 31898342  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31898341 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 31898306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 39649802 - 39649464
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39649802 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 39649703  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39649702 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 39649603  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagacta--atattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaa 298  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39649602 gtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaa 39649503  T
Q  299 caattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattg 337  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  39649502 caattctaaaaggaaatcgcaaaacaatcactctcattg 39649464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 340
Target Start/End: Original strand, 47173894 - 47174227
Alignment:
Q  7 ggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgca 106  Q
    |||||| |||||| || |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||    
T  47173894 ggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaagttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgaggtacatataatgcacatgcgtgca 47173993  T
Q  107 tttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaact 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  47173994 tttatctagactttataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcggttatgctacctttactttataaattatatataatt 47174093  T
Q  207 atattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctg 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47174094 atattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattaaactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaataattctg 47174193  T
Q  307 aaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||| |||||||||||||| || |||| |||||||    
T  47174194 aaaggaaagcgcaaaacagtcgctctaattgatg 47174227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48528611 - 48528275
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgt-ttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacat 99  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48528611 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtgttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacat 48528512  T
Q  100 gcatgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattata 199  Q
    | |||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48528511 gaatgcatttatctagcctttttacgaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattata 48528412  T
Q  200 tgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaac 299  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48528411 tgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaac 48528312  T
Q  300 aattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48528311 aattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 48528275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9227083 - 9226733
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  9227083 tcaaatggtgctagctatagatgcatatgcgggagcgatgcttaatttccgtttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatccacatg 9226984  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9226983 catgcatttatctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcatttt 9226884  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  9226883 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctatttagcatttcccaaacgagg 9226784  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9226783 tgtcaagaacaattttgaaagaaaagcgtaaaacaatcactctcattgatg 9226733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23300571 - 23300232
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||    
T  23300571 tcaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggagtaatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggatcctataatgcacatg 23300472  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23300471 aatgcatttatctagcctttttaggaagatatattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattacat 23300372  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23300371 gtaactatattcgcatatgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccatgtttagcattttccgaacgaggtgtcaagaaca 23300272  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23300271 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 23300232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 42917251 - 42917601
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||||||||  ||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| |||||    
T  42917251 tcaaatggtgctacctatagacgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggttaacgaagttcatataatgcacatg 42917350  T
Q  101 catgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||  ||| |||           ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42917351 catgcatttatctaaccttcatatgaagataataggaagataaattagaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 42917450  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42917451 atgaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgagg 42917550  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42917551 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 42917601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19034518 - 19034168
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19034518 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 19034419  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  19034418 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 19034319  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  19034318 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 19034219  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19034218 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 19034168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 20720118 - 20720468
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20720118 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 20720217  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  20720218 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 20720317  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  20720318 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 20720417  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20720418 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 20720468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27735911 - 27735561
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27735911 tcaaatggtgctagctataaatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaatttgtcaacggggttcatataatgcacatg 27735812  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     |||||||| ||||| ||||           |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27735811 aatgcatttttctagccttttcaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttaacttaaaatcagttatgctacctttctttt 27735712  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||| ||||    
T  27735711 ataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcacaaatgagg 27735612  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27735611 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 27735561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 29490358 - 29490708
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29490358 tcaaatggtgttagctatagatgcacattcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 29490457  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  29490458 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 29490557  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29490558 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttattttcctgtttagcatttcccaaactagg 29490657  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29490658 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 29490708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33230824 - 33230474
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||| || || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  33230824 tcaaatggtgctagctgtagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaaaggggtacatataatgcacatg 33230725  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  33230724 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 33230625  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  33230624 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 33230525  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33230524 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 33230474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 20764780 - 20765129
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20764780 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgggga-gtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 20764878  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  20764879 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 20764978  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| |||    
T  20764979 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccatgtttagcatttcccaaactagg 20765078  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20765079 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 20765129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34282967 - 34282617
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34282967 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggaatgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 34282868  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  34282867 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 34282768  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  34282767 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 34282668  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34282667 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 34282617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33639537 - 33639187
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33639537 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgtttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 33639438  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggat-----------gataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     |||||||||||||| |||| |||||            |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33639437 aatgcatttatctagcctttttaggaaaataatatgaagataaattagaattcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 33639338  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||   ||||||  || |||||||||||||||| ||||    
T  33639337 ataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgtaatagactaatattgtttttatttccctatttagcatttcccaaatgagg 33639238  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33639237 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 33639187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 9148762 - 9149112
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9148762 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagcgatacttaattttcatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 9148861  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     ||| |||||||||  |||| ||||| ||||           |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9148862 aatgtatttatctaccctttttaggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttattctacctttatttt 9148961  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  9148962 ataaattatatgtaactatattcgcatatgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccttgtttagcatttcccaaacgagg 9149061  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9149062 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgaaaaacaatcactctcattgatg 9149112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 3794911 - 3795261
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |  || | |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3794911 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcggtgcttaatttccatttgtttcaacgatattagttggtcaacggggttcatataatgcacatg 3795010  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||           ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795011 aatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttatcttaaaatcagttatgctacctttatttt 3795110  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  3795111 ataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttcttatttccctgtttagcatttctcaaacgagg 3795210  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3795211 tgtcaagaataattctaaaagaaaagcgcaaagcaatcactctcattgatg 3795261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 47164419 - 47164064
Alignment:
Q  3 aaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgca 102  Q
    |||||||||| |||||| || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |  |||||||    
T  47164419 aaatggtgctagctataaatgcacatgcgagagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgggatacatatagttcacatgca 47164320  T
Q  103 tgcatttatctagactttataggatgataa-----------attag-------aagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttt 184  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||           |||||       |  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47164319 tgcatttatctatactctataggaagataatatgaagataaattagttatgctacttcctggtacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttc 47164220  T
Q  185 attttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaa 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  47164219 attttataaattatatgtaactatatttgcatacatcttatccatgttaatatgcattagagtcatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaa 47164120  T
Q  285 cgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47164119 cgaggtgtcaagaaaaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 47164064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4482062 - 4481789
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||     
T  4482062 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatccatata 4481963  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4481962 catgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagtttaaaatcaattatgctaccttcatttt 4481863  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4481862 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgttaatatgcattaaactaatattgcagttattt 4481789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38435250 - 38435062
Alignment:
Q  152 tttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaata 251  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38435250 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 38435151  T
Q  252 ttgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  38435150 ttgcagttatttccctgtttagcatttcccaaaaaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaaacattctcattgatg 38435062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 340
Target Start/End: Original strand, 42996016 - 42996204
Alignment:
Q  152 tttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaata 251  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42996016 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 42996115  T
Q  252 ttgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  42996116 ttgcagttatttccctgtttagcatttcccaaaaaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaaacattctcattgatg 42996204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6912205 - 6911977
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  6912205 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 6912106  T
Q  101 catgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  6912105 catgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 6912007  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6912006 ataaattatatgtaactatattcgcataca 6911977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 47574183 - 47573955
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  47574183 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 47574084  T
Q  101 catgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  47574083 catgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 47573985  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47573984 ataaattatatgtaactatattcgcataca 47573955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 2194528 - 2194878
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2194528 tcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtaatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 2194627  T
Q  101 catgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2194628 catgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 2194727  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2194728 ataaattatatataactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaag 2194827  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2194828 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 2194878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26321931 - 26321581
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26321931 tcaaatgatgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggagtgcatataatgtacatg 26321832  T
Q  101 catgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26321831 catgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 26321732  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26321731 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatattcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 26321632  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26321631 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 26321581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20996800 - 20996450
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20996800 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 20996701  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20996700 catgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgttacgttttctttagcttaaaatatgttatgctacctttatttt 20996601  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20996600 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 20996501  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20996500 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaactatcactctcattgatg 20996450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 4881648 - 4881984
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  4881648 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcagaagtgatgcttaattttcatttatttcaacaatgttaattggtcaacagggtacatataatatacatg 4881747  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4881748 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaagatcagttatgctacctttattttataaattatat 4881847  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4881848 gtaactatattc-gatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttaacatttcccaaacgaggcgtcaagaaca 4881946  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattga 338  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4881947 attctgaaaggaaagcacaaaacaatcactctcattga 4881984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 7285040 - 7285390
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7285040 tcaaatggtgctaactatatatgcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaatggggtacatataatgtacatg 7285139  T
Q  101 catgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285140 catgcatttatctagactttattggaagataataagatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 7285239  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||      
T  7285240 atagattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcaattattttcctgtttaacatttcccaaacgata 7285339  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285340 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 7285390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33611996 - 33611646
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33611996 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttctatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 33611897  T
Q  101 catgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    | ||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33611896 cttgcatttatctagactttataggaagataataggatgataaattagaagtcgtgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 33611797  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  33611796 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattatactaatattgcagttattttcatatttagcatttcccaaacgagg 33611697  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33611696 tgtcaaaaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 33611646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 5 - 340
Target Start/End: Original strand, 30688682 - 30689022
Alignment:
Q  5 atggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatg 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30688682 atggtgctggctatatatgcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatg 30688781  T
Q  105 catttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataa 193  Q
    |||||||||||| |||           ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30688782 catttatctagaatttataggaagataataggatgataaagtagaagtcaagttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataa 30688881  T
Q  194 attatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtc 293  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30688882 attatatgtaactatattcgcatacatcttatcc------atatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtc 30688975  T
Q  294 aagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30688976 aagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactcttattgatg 30689022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1852773 - 1852436
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1852773 tcaaatcgtgctagctatatatgcacatgcgaaagtgatacttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggtacatataatgtacatg 1852674  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1852673 catacatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 1852574  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    ||   |||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1852573 gt--ttatattcgtgtatatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 1852476  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1852475 attctgaaaggaaagcacaaaacaatcactctcattgatg 1852436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 21029471 - 21029821
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21029471 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 21029570  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||           ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21029571 catgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcaaactacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 21029670  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21029671 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattacactaatattgcagttattttcctgtttagcattttccaaacgagg 21029770  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21029771 tgtcaagaacaattcttaaaggaaagcgcaaatcaatcactctcattgatg 21029821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25697366 - 25697033
Alignment:
Q  3 aaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgca 102  Q
    |||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  25697366 aaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgaa 25697267  T
Q  103 tgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgt 202  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25697266 tgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgt 25697167  T
Q  203 aactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaat 302  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25697166 aactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaat 25697067  T
Q  303 tctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25697066 tctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 25697033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 30141937 - 30142273
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30141937 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 30142036  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30142037 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 30142136  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30142137 gtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtttcaagaaca 30142236  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattg 337  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30142237 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattg 30142273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 20349303 - 20349636
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20349303 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttgaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 20349402  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20349403 catgcatttatctagactttataggaagataaattataagtcatgctacattttttttagcttaaaatcagttatggtacctttatttaataaattatat 20349502  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    ||||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20349503 gtaact------ggatacattttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 20349596  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20349597 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 20349636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 41690710 - 41691045
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41690710 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 41690809  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41690810 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 41690909  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41690910 gtaactatattcacatatgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 41691009  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41691010 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 41691045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 34717024 - 34717359
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34717024 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 34717123  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34717124 aatgcatttatctaacctttttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 34717223  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34717224 gtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgttaagaaca 34717323  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34717324 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 34717359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 27065265 - 27065613
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27065265 tcaaatggtgctagctgtatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaataatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 27065364  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaa-----------ttagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||            |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27065365 catgcatttatctagactttataggaagataataggaagataatttagaagtcatgctacattttctttagtttaaaatcagttatactacctttatttt 27065464  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  27065465 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattctcctatttagcatttcccaaacgagg 27065564  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  27065565 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaagcaat--ctctcattgatg 27065613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3151459 - 3151110
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||| ||| ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3151459 tcaaatggagctagctatatgtgcacatgcagaagtgatgcttaatttt-agttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 3151361  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3151360 catgcatttatctagactttataggaagataatatgaagataaattagaagtaatgctacattttctttagcttaaaattagttatgctacctttatttt 3151261  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3151260 ataaattatatgtaattatattcgcatatatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgaagttattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 3151161  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3151160 tgttaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 3151110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3397997 - 3397644
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  3397997 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcaaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtaaatata-tgtacatg 3397899  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     || |||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3397898 tatacatttatctagactttataggaagataatgggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 3397799  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacata----catcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaac 285  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  3397798 ataaattatatgtaactatatttgcataagatcatcttatctatgtaaatatgtattagactaatattgcagttattttcctgtttatcatttcccaaaa 3397699  T
Q  286 gaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3397698 gaggtgtcaagaacaattttgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 3397644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 37463747 - 37464097
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  37463747 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaatggggtacatataatgcacatg 37463846  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  37463847 catgcatttctctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 37463946  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  37463947 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 37464046  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37464047 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 37464097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 289973 - 290321
Alignment:
Q  3 aaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgca 102  Q
    |||||||||| |||||| || |||||| || || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||    
T  289973 aaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttttgtttgtttcaacaatgttaattggccaacgggatacatataatctacatgca 290072  T
Q  103 tgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttat 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |           ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  290073 tgcatttacctagactttataggaagctaataggaagataaattagaagtcattgtatattttctttagtttaaaatcagttatgctacctttattttat 290172  T
Q  192 aaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  290173 aaattatatgtaactatattcacatatatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtagttatttctctgtttagcatttcccaaacgaggtg 290272  T
Q  292 tcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  290273 tcaagaacaattctgaaagaaaagcgtaaaacaagcactctcattgatg 290321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 340
Target Start/End: Original strand, 9701648 - 9701965
Alignment:
Q  34 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgata-- 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||      
T  9701648 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacggggtacatataatctacatgcatgcatttatctagaatttataggaagatagt 9701747  T
Q  132 ---------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatct 222  Q
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9701748 aggaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatctatcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcgcatacatct 9701847  T
Q  223 tatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaa 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9701848 tatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccgtgtttagcatttcccaaacaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaa 9701947  T
Q  323 caatcactctcattgatg 340  Q
    ||| || |||||||||||    
T  9701948 caaacattctcattgatg 9701965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3211053 - 3210704
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||  |||||    
T  3211053 tcaaatggtgctagctataaatgcgcatgcgggagtgaagcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggccaacggg-tacatataatccacatg 3210955  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||    
T  3210954 catgcatttatctagactttataggaagataatgggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatgaattatgctacattcatttt 3210855  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3210854 ataaattacatgtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtcgttatttccctgtttagcatttcccaaacgagg 3210755  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3210754 tgttaagaaaaattatgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 3210704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12589136 - 12588786
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12589136 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaataatattagttggtcaacggggttcatataatgcacatg 12589037  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||           ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12589036 aatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 12588937  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12588936 ataaattatatgtaactatattcgcatacattttatccatgttaatatccattagattaatattgttcttatttccctgtttagcatttcccaaacgagg 12588837  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12588836 tgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaagcaatcactctcattgatg 12588786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31296385 - 31296170
Alignment:
Q  3 aaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgca 102  Q
    |||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  31296385 aaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacataca 31296286  T
Q  103 tgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgt 202  Q
    || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31296285 tgtatttatctaaactttataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttattttataaattatatgt 31296187  T
Q  203 aactatattcacataca 219  Q
    |||||||||| ||||||    
T  31296186 aactatattcgcataca 31296170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 3027823 - 3028014
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3027823 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttatttcaacaatgttaattggtcaacgtggtacatataatgtacatg 3027922  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttata 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3027923 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagttatgctacattttctatagcttaaaatcagttatgctacctttattttata 3028014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 172 - 340
Target Start/End: Original strand, 19447546 - 19447716
Alignment:
Q  172 ttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgttt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19447546 ttatgctacctttattttataaattatatataactatattcgtatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgtagttattttcctgttt 19447645  T
Q  272 agcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaa--acaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19447646 agcatttctcaaatgagatgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacacaatcactctcattgatg 19447716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 19394852 - 19395079
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||     
T  19394852 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacgaggttcatataatgca-ata 19394950  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||           |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19394951 catgtatttatctagactttataagaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 19395049  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19395050 ataaattatatgtaactatattcgcataca 19395079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 337
Target Start/End: Original strand, 3028312 - 3028458
Alignment:
Q  191 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 290  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  3028312 taaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgtattggactaatattgcagttattttcctgtttagcatttctcaaatgaggt 3028411  T
Q  291 gtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattg 337  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3028412 gtcaaaaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattg 3028458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19832259 - 19831920
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  19832259 tcaaatggtgctagctatatatacacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtagatg 19832160  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19832159 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagctcaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 19832060  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19832059 gtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcttgtttaacattttccaaacgaggtgtcaagaaca 19831960  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19831959 attctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactatcattgatg 19831920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14830384 - 14830034
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14830384 tcaaatgatgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgcacatg 14830285  T
Q  101 catgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14830284 catgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 14830185  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14830184 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttggcatttcccaaacgagg 14830085  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14830084 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgtaaaacaatcactctcattgatg 14830034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28135928 - 28135589
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28135928 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcgaaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggagtacatataatgtacatg 28135829  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135828 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagataaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 28135729  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28135728 gtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattagactaatattgtagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 28135629  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28135628 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcaatgatg 28135589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 23478324 - 23478676
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478324 tcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 23478423  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacatttt-ctttag-cttaaaatcagttatgctacctttatt 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||           |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23478424 catgcgtttatctagactttataggaagataataggataataaattagaagtcatgttacattttactttagtcttaaaatcagttatgctacctttatt 23478523  T
Q  188 ttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacga 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478524 ttataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacga 23478623  T
Q  288 ggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23478624 ggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcattctcattgatg 23478676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 36856519 - 36856854
Alignment:
Q  3 aaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgca 102  Q
    ||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36856519 aaatgatgctagctatatatgca-atgcggaagtgatgcttaatttcaatttgtttcaa-aatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatgca 36856616  T
Q  103 tgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  36856617 tgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgatacttttattttataaattatatgt 36856716  T
Q  203 aactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaat 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36856717 aactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgtattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaat 36856816  T
Q  303 tctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36856817 tctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 36856854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33503860 - 33503521
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| | | |||||||||||||||    
T  33503860 tcaaatggtgctagctatttatgcagatgcggaagtgatgcttaatctccatttgtttcaacaatgttaattgattaacgagatacatataatgtacatg 33503761  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33503760 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 33503661  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33503660 gtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctatttagcattttccaaacgaggtgtcaagaaca 33503561  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33503560 attttgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 33503521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 34057437 - 34057087
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaattt-ccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacat 99  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34057437 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacat 34057338  T
Q  100 gcatgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattt 188  Q
     |||| |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34057337 acatgtatttatctagactttataggaagataatatgatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattt 34057238  T
Q  189 tataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgag 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  34057237 tataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgac 34057138  T
Q  289 gtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34057137 gtgtcaagaacaattatgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 34057087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 54332515 - 54332166
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54332515 tcaattggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 54332416  T
Q  101 catgcatttatctagactttatagga-----------tgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54332415 catgcatttatctagactttataggaagataatatgatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 54332316  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  54332315 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatctatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctatttagcctttcccaaacgagg 54332216  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54332215 tgtcaagaacaattgtgaaa-ggaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 54332166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 53341826 - 53342181
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53341826 tcaaatggtgctggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtctcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 53341925  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53341926 cattcatttatctagactttataggaagataataggaagacaaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 53342025  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53342026 ataaattatatataactatattcgcatatatcttatccatgtaaatatgcattagactaatagtgcaattattttcctgtttagcatttcccaaacgagg 53342125  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatgtccat 345  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53342126 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatgaccat 53342181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 19590262 - 19590601
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||    
T  19590262 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaatgggatacatataatgcacatg 19590361  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19590362 catgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatggtacattttatttagcttaaaatcagttatgttaccttcattttataaattatat 19590461  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19590462 gtaactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattatactaatattacagttatttccctgtttaacatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 19590561  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19590562 attctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 19590601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28121082 - 28120744
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  28121082 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcaggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaatagggtacatataatgcacatg 28120983  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28120982 gatgcatttatctagactttataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcattttataaattatat 28120883  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  28120882 gt-actatattcacatacatcttatccatgttaatatgcatcagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttccaaaacgaggcgtcaagaaca 28120784  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28120783 attctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 28120744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 13627468 - 13627814
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13627468 tcaaatggttctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatgtaatgtacatg 13627567  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13627568 aatgcatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttttttagtttaaaatcagttatgctacctttatttt 13627667  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13627668 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatggattagattaatattgcagttatttttctgtttagcatttctcaaacgagg 13627767  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13627768 tgtcaagaacaattctgaaaggaaaacgcaaaacaatcactctcatt 13627814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 39715372 - 39715037
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39715372 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 39715273  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715272 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 39715173  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715172 gtaactatattcgcatacgtcttatctatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 39715073  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39715072 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 39715037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 52800459 - 52800794
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  52800459 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 52800558  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52800559 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattaaaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 52800658  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52800659 gtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 52800758  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52800759 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 52800794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 55999553 - 55999220
Alignment:
Q  18 tatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagac 117  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55999553 tatatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttatttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgttcatgcatgcatttatctagac 55999454  T
Q  118 tttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaact 206  Q
    ||||||||| |||||           |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55999453 tttataggaagataatatcaagataaattataagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaact 55999354  T
Q  207 atattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctg 306  Q
    |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55999353 atatttgcatacatcttatacatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctg 55999254  T
Q  307 aaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55999253 aaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 55999220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 17739456 - 17739806
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||||| ||  ||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17739456 tcaaatggtactaactatagatgcaaatgaggaagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 17739555  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     ||||||||||| ||  |||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17739556 aatgcatttatccagcttttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 17739655  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||    
T  17739656 ataaattatatgtaactatattcacatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccatgtttagcattttccaaacgagg 17739755  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17739756 tgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 17739806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10260196 - 10259846
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10260196 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 10260097  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  10260096 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 10259997  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  10259996 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 10259897  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10259896 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 10259846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 21564259 - 21564609
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21564259 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 21564358  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  21564359 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 21564458  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  21564459 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 21564558  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21564559 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 21564609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26925135 - 26924785
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26925135 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 26925036  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  26925035 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 26924936  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  26924935 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 26924836  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26924835 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 26924785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 43331780 - 43332130
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43331780 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 43331879  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||           |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  43331880 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 43331979  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  43331980 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 43332079  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43332080 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 43332130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 51451847 - 51452197
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  51451847 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 51451946  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  51451947 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaaaataaattagaagtcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 51452046  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  51452047 ataagttatatataactatattcgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 51452146  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51452147 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 51452197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24078265 - 24077915
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24078265 tcaaatggtgttagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaaaaatgttaattggtcaacggggtacatataatgcacatg 24078166  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||           ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  24078165 catgcatttctctagactttataggaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgttaccttcatttc 24078066  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  24078065 ataagttatatataactatatttgcatacatcttatccatgttaatatgcattagattaatattacagttatttccctgtttagcatttcccaaactagg 24077966  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24077965 tgtcaagaacaattatgaaaggaaagcgcaaaataatcactctcattgatg 24077915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 1943920 - 1944257
Alignment:
Q  9 tgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatt 108  Q
    |||| |||||| || |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  1943920 tgctagctataaatgcacatgcgggagggatgcttaatt-ccatctgtttcaacaatgttaattggccaacagggtacatataatccacatgcatgcatt 1944018  T
Q  109 tatctagactttataggatgataaattag-------aagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatg 201  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||       |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1944019 tatctatactctataggaagataaattagttatgctacttcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcattttataaattatatg 1944118  T
Q  202 taactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaa 301  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1944119 taactatattcgaatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaaaa 1944218  T
Q  302 ttctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1944219 ttctgaaagaaaggcgtaaaacaatcactctcattgatg 1944257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 40621562 - 40621914
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaattt--ccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtaca 98  Q
    ||||| |||||| |||||| || |||||| |  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  40621562 tcaaacggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacagggttcatataatgcaca 40621661  T
Q  99 tgcatgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatt 187  Q
    || ||||||||||||||  |||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40621662 tgaatgcatttatctagcatttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatt 40621761  T
Q  188 ttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacga 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  40621762 ttataaattatatgtaactatatttgcatacgtcttatccatgttaatatgtattagactaatattgttgttatttccctgtttaacattttccaaacga 40621861  T
Q  288 ggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40621862 ggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 40621914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35496385 - 35496066
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35496385 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagtgatgcttaatttccatcagtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 35496286  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35496285 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 35496186  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||                    |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35496185 gtaactatattcgcatacgtcttacccatgtaaatat--------------------ttattttcatgtttagcattttccaaacgaggtgtcaagaaca 35496106  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35496105 attctgaaaggaaagcgcaaaattatcactctcattgatg 35496066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 128 - 340
Target Start/End: Original strand, 17698730 - 17698942
Alignment:
Q  128 gataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatcc 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17698730 gataaattagaagtcatgctacattttctttagcttaaaatcagttatggtacctttattttataaattatatgtaaatatattcgcatacatcttatcc 17698829  T
Q  228 atgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17698830 atgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaagtgtcaaaaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatc 17698929  T
Q  328 actctcattgatg 340  Q
    | |||||||||||    
T  17698930 aatctcattgatg 17698942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 47720932 - 47720592
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||| |||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||  |||||    
T  47720932 tcaaatgatgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccgtttgtttcaacaatgttaattagccaacgaggtacatataattcacatg 47720833  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||          ||| |||||||||||    
T  47720832 catgcatttatctagactttataggaagctaatatgaagataaattagaagtcatggtacattttctttagctta----------tgccacctttatttt 47720743  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  47720742 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagtattttccaaacgagg 47720643  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||    
T  47720642 tgtcaagaacaattctgaaagaaatgcgcaaaacaatcactatcattgatg 47720592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 574980 - 574669
Alignment:
Q  37 gatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa---- 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||        
T  574980 gatgcttaatttccatttgtttcaacaatattaattggtcaacggggttcatataatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataatagg 574881  T
Q  133 -------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttat 225  Q
           ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  574880 aaaataaattagaagtcataatacattttctttagctta---tcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttat 574784  T
Q  226 ccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaa 325  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||    
T  574783 ctatgttaatatgcattagactaatattgttctaatttccctgtttagcatttcccgaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaagcaa 574684  T
Q  326 tcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||    
T  574683 tcactctcattgatg 574669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39745719 - 39745486
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39745719 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtacatataatgtacatg 39745620  T
Q  101 catgcatttatctagact-----------ttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||           | |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39745619 catgcatttatctagactctataggaagataataggaagataaattagaagtcatgctacattttttttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 39745520  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatctt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39745519 ataaattatatgtaactatattcgcatacatctt 39745486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5274617 - 5274409
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5274617 tcaaatggtgttggctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 5274518  T
Q  101 catgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5274517 catgcatttatctagactttataggaagatgatatgatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 5274418  T
Q  190 ataaattat 198  Q
    |||||||||    
T  5274417 ataaattat 5274409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 152 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26870995 - 26870807
Alignment:
Q  152 tttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaata 251  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26870995 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 26870896  T
Q  252 ttgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  26870895 ttgcagttatttccctgtttagcatttcccaaaaaaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaaacattctcattgatg 26870807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 193 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5272925 - 5272778
Alignment:
Q  193 aattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5272925 aattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagtatttcccaaacgaggtgt 5272826  T
Q  293 caagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5272825 caagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatcgatg 5272778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 15520264 - 15520492
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  15520264 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacata 15520363  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||           |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15520364 catgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 15520462  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15520463 ataaattatatgtaactatattcgcataca 15520492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 741151 - 740923
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||     
T  741151 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcatcggggttcatataatgcacata 741052  T
Q  101 catgcatttatctagactttat-----------aggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  741051 catgtatttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagctt-aaatcagttaagctacctttatttt 740953  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacataca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  740952 ataaattatatgtaactatattcgcataca 740923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7644456 - 7644307
Alignment:
Q  191 taaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggt 290  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7644456 taaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactgatattgcaattattttcctgtttagcatttcccaaacgaggt 7644357  T
Q  291 gtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7644356 gttaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacagtcactctcattgatg 7644307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7644980 - 7644773
Alignment:
Q  3 aaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgca 102  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7644980 aaatggtgctagctatatatgcatatgcagaagtgatgattaattcccatttgttttaacaatgttaattggtcaacgggctacatataatgtacatgca 7644881  T
Q  103 tgcatttatctagactttatag-----------gatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttat 191  Q
    ||||||||||||||||||||||           || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7644880 tgcatttatctagactttataggaagataatatgaagataaattagacgtcatgctacattttctttagcgtaaaatcagttatgctacctttattttat 7644781  T
Q  192 aaattata 199  Q
    ||||||||    
T  7644780 aaattata 7644773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 195 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 37702267 - 37702126
Alignment:
Q  195 ttatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtca 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37702267 ttatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacaaggtgtca 37702168  T
Q  295 agaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  37702167 aaaacaattctgaaaggaaagcgcaattcaatcactctcatt 37702126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 217 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39743392 - 39743269
Alignment:
Q  217 acatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagc 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39743392 acatcttatccatgtaaatatacattagactaatattacagttattttcccgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagc 39743293  T
Q  317 gcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39743292 gcaaaacaatcactctcattgatg 39743269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 17698422 - 17698547
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  17698422 tcaaatggtgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaatcggtcaacgggttacatataatgtacatg 17698521  T
Q  101 catgcatttatctagactttatagga 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17698522 catgcatttatctagactttatagga 17698547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 222 - 340
Target Start/End: Original strand, 38007492 - 38007610
Alignment:
Q  222 ttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  38007492 ttatccatgtaaatatgcattagactgatattgcagttattttcctgtataacattttccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaacggaaagtgcaaa 38007591  T
Q  322 acaatcactctcattgatg 340  Q
    | |||||||||||||||||    
T  38007592 aaaatcactctcattgatg 38007610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 233 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35708258 - 35708151
Alignment:
Q  233 aatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactct 332  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||    
T  35708258 aatatgcattagactaatattgttcttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaagcaatcactct 35708159  T
Q  333 cattgatg 340  Q
    ||||||||    
T  35708158 cattgatg 35708151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3839968 - 3839895
Alignment:
Q  266 ctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 339  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3839968 ctgtttagcatttaccgaaggaggtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgat 3839895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 35712983 - 35712922
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaac 62  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35712983 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgagagcgatgcttaatttccatttgtttcaac 35712922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27218 - 26868
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27218 tcaaatgatgctagctatatatgcacatgcggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgcacatg 27119  T
Q  101 catgcatttatctagactttata-----------ggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118 catgcatttatctagactttatatgaagataataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 27019  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27018 ataaattatatgtaactatattcgcatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttggcatttcccaaacgagg 26919  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26918 tgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgtaaaacaatcactctcattgatg 26868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19233 - 18898
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19233 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatctgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 19134  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 200  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19133 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatat 19034  T
Q  201 gtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19033 gtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaca 18934  T
Q  301 attctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18933 attctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 18898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 336
Target Start/End: Original strand, 119443 - 119783
Alignment:
Q  7 ggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgca 106  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  119443 ggtgctggctatagatgcacatgcggaagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattgctcaacggggtacatataatgcacatgcattca 119542  T
Q  107 tttatctagactttataggatgata-----------aattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaat 195  Q
    |||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119543 tttatctagactttataggaagataataggaagataaattagaagtcataatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaat 119642  T
Q  196 tatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaa 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119643 tatatgtaactatattcacttacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgtggttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaa 119742  T
Q  296 gaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcatt 336  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  119743 gaataattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcatt 119783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 65480 - 65143
Alignment:
Q  9 tgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatt 108  Q
    |||| |||||| || |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  65480 tgctagctataaatgcacatgcgggagggatgcttaatt-ccatctgtttcaacaatgttaattggccaacagggtacatataatccacatgcatgcatt 65382  T
Q  109 tatctagactttataggatgataaattag-------aagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatg 201  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||       |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  65381 tatctatactctataggaagataaattagttatgctacttcatggtacattttctttagcttaaaatcagttatgctaccttcattttataaattatatg 65282  T
Q  202 taactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaa 301  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  65281 taactatattcgaatacatcttatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttattttcctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaaaaa 65182  T
Q  302 ttctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  65181 ttctgaaagaaaggcgcaaaacaatcactctcattgatg 65143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 34 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 152979 - 152662
Alignment:
Q  34 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa- 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||     
T  152979 agtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggccaacgaggtacatataatccacatgcatgcatttatctagattttataggaatataat 152880  T
Q  133 ----------attagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatct 222  Q
              ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  152879 aggacgatacattagaagtcatggtacattttctttaacttaaaatcagttatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatct 152780  T
Q  223 tatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaa 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  152779 tatccatgttaatatgcattagactaatattgcagttatttccctgtttagcatttcccaaaaaaggtgtcaagaacaattctgaaggaaaagcgcaaaa 152680  T
Q  323 caatcactctcattgatg 340  Q
    ||| || |||||||||||    
T  152679 caaacattctcattgatg 152662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 71 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4877 - 4597
Alignment:
Q  71 ttggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataa-----------attagaagtcatgttacattttcttta 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||           ||| ||||||||  |||||||||||||    
T  4877 ttggtcaacggggttcatataatgcacatgaatgcatttatctagcctttttaggaagataataggaaaataaatttgaagtcataatacattttcttta 4778  T
Q  160 gcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagtt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||    
T  4777 gcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatatgcattagactaatattgttctt 4678  T
Q  260 atttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4677 atttccctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaagaaaagcgcaaagcaatcactctcattgatg 4597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 49465 - 49798
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    ||||||| |||| |||||| || |||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||    
T  49465 tcaaatgatgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttctatttgtttcaacaatgttaattagccaacggggtacatataatccacatg 49564  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |           ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||          |||||||||||||||    
T  49565 catgcatttatctaggctttataagaagctaataggaatataaattagaagtcatggtacattttatttagctta----------tgctacctttatttt 49654  T
Q  190 ataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgagg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  49655 ataaattatatgtaactatattcacatacatct-------gttaatatgcattagactaatgttgcaattatttctctatttagcatttcctaaacgagg 49747  T
Q  290 tgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49748 tgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 49798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 340
Target Start/End: Original strand, 1 - 165
Alignment:
Q  176 gctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1 gctacctttattttataaattatatgtaactatattcgcatacatcctatccatgtaaatatgcattagactaatattgcagctattttcctgtttagca 100  T
Q  276 tttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 tttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 13201 - 13395
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13201 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatg 13300  T
Q  101 catgcatttatctagactttataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaat 195  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13301 aatgcatttatctagcctttttaggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaat 13395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 228 - 336
Target Start/End: Original strand, 13394 - 13502
Alignment:
Q  228 atgtaaatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13394 atgttaatatgcattagactaatattgttgttatttccctgtttagcatttccaaaacgaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatc 13493  T
Q  328 actctcatt 336  Q
    |||||||||    
T  13494 actctcatt 13502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 152 - 340
Target Start/End: Original strand, 898 - 1086
Alignment:
Q  152 tttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaata 251  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  898 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 997  T
Q  252 ttgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  998 ttgcagttatttccctgtttagcatttcccaaaaaaagtgtcaagaacaattctgaaagaaaagcgcaaaacaaacattctcattgatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5110 - 4866
Alignment:
Q  4 aatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcat 103  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |    
T  5110 aatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgagt 5011  T
Q  104 gcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttata 192  Q
    | |||||||||| ||||           |||||| ||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5010 ggatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaatcagaagtcattatatattttatttagcttaaaatcagttatgctacctttattttata 4911  T
Q  193 aattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatat 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  4910 aattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 4866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11559 - 11315
Alignment:
Q  4 aatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcat 103  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |    
T  11559 aatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatgagt 11460  T
Q  104 gcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttata 192  Q
    | |||||||||| ||||           |||||| ||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11459 ggatttatctagcctttttaggaagataataggaagataaatcagaagtcattatatattttatttagcttaaaatcagttatgctacctttattttata 11360  T
Q  193 aattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatat 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  11359 aattatatgtaactatattcgcatacgtcttatccatgttaatat 11315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 54796 - 54664
Alignment:
Q  152 tttctttagcttaaaatcagttatgctacctttattttataaattatatgtaactatattcacatacatcttatccatgtaaatatgcattagactaata 251  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54796 tttctttagcttaaaatttgtcatgctaccttcattttataaattatatgtaactatattcccatacatcttatccatgttaatatgcattagactaata 54697  T
Q  252 ttgcagttatttttctgtttagcatttcccaaa 284  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  54696 ttgcagttatttccctgtttagcatttcccaaa 54664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13704 - 13493
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| |||||    
T  13704 tcaaatagtgctagctatagatgcacatgcgggagtgatgcttaattttcatttgtttcaacaatgttaattggtcaattgggctcatataatgcacatg 13605  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 189  Q
     |||| ||||||||| ||||           |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13604 aatgcttttatctagcctttttatgaagataatagaaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttatttt 13505  T
Q  190 ataaattatatg 201  Q
    |||| |||||||    
T  13504 ataacttatatg 13493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 286 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13493 - 13439
Alignment:
Q  286 gaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13493 gaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaagcgcaaaacaatcactctcattgatg 13439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11187 - 10991
Alignment:
Q  1 tcaaatggtgctggctatatattcacatgtggaagtgatgcttaatttccatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatg 100  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  11187 tcaaatggtgctagctatagatgcacatgcgggagcgatgcttaatttttatttgtttcaacaatgttaattggtcaacggggttcatataatgcacatc 11088  T
Q  101 catgcatttatctagacttt-----------ataggatgataaattagaagtcatgttacattttctttagcttaaaatcagttatgctacctttat 186  Q
     |||||||||||||  ||||           |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11087 aatgcatttatctaacctttttaggaagataataggaagataaattagaagtcatgatacattttctttagcttaaaattagttatgctacctttat 10991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1555 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1555
Description:

Target: scaffold1555; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 1648 - 1521
Alignment:
Q  66 gttaattggtcaacggggtgcatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatg-----------ataaattagaagtcatgttacatttt 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||    
T  1648 gttaattggtcaacggggtacatataatgtacatgcatgcatttatctagactttataggatgataataggaagataaattagaagtcatgttacatttt 1549  T
Q  155 ctttagcttaaaatcagttatgctacct 182  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  1548 ctgtagcttaaaatcagttatgctacct 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 233 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30612 - 30505
Alignment:
Q  233 aatatgcattagactaatattgcagttatttttctgtttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattctgaaatgaaagcgcaaaacaatcactct 332  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30612 aatatgcattagactaatattgttgttatttccctatttagcatttcccaaacgaggtgtcaagaacaattcttaaaggaaagcgcaaaacaatcactct 30513  T
Q  333 cattgatg 340  Q
    ||||||||    
T  30512 cattgatg 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University