View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8893_low_4 (Length: 776)

Name: NF8893_low_4
Description: NF8893
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8893_low_4
NF8893_low_4
[»] chr3 (119 HSPs)
chr3 (21-636)||(28754573-28755188)
chr3 (21-636)||(47124199-47124814)
chr3 (21-533)||(10384223-10384735)
chr3 (26-635)||(16337772-16338381)
chr3 (26-635)||(16328920-16329530)
chr3 (90-635)||(11960429-11960974)
chr3 (41-635)||(11303033-11303627)
chr3 (41-635)||(14574204-14574792)
chr3 (41-635)||(17492905-17493499)
chr3 (41-635)||(16827463-16828056)
chr3 (41-627)||(18133614-18134200)
chr3 (41-635)||(12359787-12360396)
chr3 (21-636)||(16835769-16836384)
chr3 (21-624)||(4678693-4679296)
chr3 (21-624)||(41177777-41178380)
chr3 (21-624)||(16380199-16380802)
chr3 (187-630)||(31694451-31694894)
chr3 (21-624)||(44777502-44778105)
chr3 (21-507)||(13942279-13942765)
chr3 (21-561)||(8758416-8758956)
chr3 (194-630)||(31939331-31939767)
chr3 (43-498)||(15227926-15228381)
chr3 (42-497)||(14086949-14087404)
chr3 (41-635)||(10419305-10419899)
chr3 (47-497)||(13971518-13971968)
chr3 (275-635)||(13319762-13320122)
chr3 (44-498)||(10906478-10906932)
chr3 (44-498)||(20061462-20061916)
chr3 (44-498)||(15588800-15589254)
chr3 (47-498)||(5424338-5424789)
chr3 (95-498)||(13253009-13253412)
chr3 (44-498)||(16636041-16636495)
chr3 (44-498)||(43163365-43163819)
chr3 (95-487)||(15339588-15339980)
chr3 (75-498)||(15248446-15248869)
chr3 (44-498)||(10005868-10006322)
chr3 (75-498)||(15209190-15209613)
chr3 (44-489)||(6601004-6601449)
chr3 (41-254)||(13322293-13322506)
chr3 (631-768)||(47124841-47124978)
chr3 (47-498)||(26791807-26792258)
chr3 (44-498)||(48425715-48426169)
chr3 (47-470)||(15347681-15348104)
chr3 (95-498)||(15724342-15724745)
chr3 (44-474)||(16756017-16756447)
chr3 (631-768)||(28755215-28755352)
chr3 (44-489)||(53384435-53384880)
chr3 (47-489)||(16411699-16412141)
chr3 (47-480)||(12498519-12498952)
chr3 (127-596)||(14875809-14876277)
chr3 (95-498)||(15401925-15402321)
chr3 (75-407)||(9523018-9523350)
chr3 (41-183)||(15952680-15952822)
chr3 (42-440)||(16491647-16492045)
chr3 (636-768)||(16337607-16337739)
chr3 (75-449)||(17490149-17490523)
chr3 (42-378)||(15015284-15015620)
chr3 (351-528)||(13299889-13300066)
chr3 (351-528)||(13310547-13310724)
chr3 (127-498)||(14126002-14126373)
chr3 (666-768)||(16328755-16328857)
chr3 (639-768)||(11960264-11960393)
chr3 (47-407)||(16806425-16806785)
chr3 (95-440)||(16371732-16372076)
chr3 (318-449)||(14580399-14580530)
chr3 (636-768)||(31939805-31939937)
chr3 (639-768)||(13319597-13319726)
chr3 (75-407)||(16692463-16692795)
chr3 (636-768)||(31694281-31694413)
chr3 (636-738)||(12359652-12359754)
chr3 (651-768)||(14087590-14087707)
chr3 (633-736)||(14574822-14574925)
chr3 (651-768)||(13971215-13971332)
chr3 (651-738)||(16827328-16827415)
chr3 (639-733)||(16835640-16835734)
chr3 (639-768)||(10419140-10419269)
chr3 (636-768)||(12179240-12179372)
chr3 (173-293)||(17193501-17193621)
chr3 (639-738)||(5424066-5424165)
chr3 (639-738)||(15588528-15588627)
chr3 (639-738)||(16636668-16636767)
chr3 (639-738)||(20061190-20061289)
chr3 (639-738)||(43163992-43164091)
chr3 (639-738)||(48426342-48426441)
chr3 (639-736)||(6151991-6152088)
chr3 (639-736)||(6601631-6601728)
chr3 (242-407)||(15062210-15062375)
chr3 (651-768)||(17187291-17187408)
chr3 (639-756)||(18133453-18133570)
chr3 (639-736)||(25767223-25767320)
chr3 (95-195)||(15062075-15062175)
chr3 (651-739)||(16491316-16491404)
chr3 (639-738)||(10006495-10006594)
chr3 (639-738)||(10907105-10907204)
chr3 (639-738)||(13253585-13253684)
chr3 (639-738)||(15260525-15260624)
chr3 (639-738)||(15401653-15401752)
chr3 (173-207)||(6152550-6152584)
chr3 (639-733)||(14580083-14580177)
chr3 (651-709)||(17490757-17490815)
chr3 (663-733)||(44778176-44778246)
chr3 (639-736)||(6711549-6711646)
chr3 (639-736)||(8273537-8273634)
chr3 (639-736)||(13966482-13966579)
chr3 (639-736)||(16741841-16741938)
chr3 (639-736)||(30138711-30138808)
chr3 (639-736)||(30148262-30148359)
chr3 (639-736)||(53384156-53384253)
chr3 (414-498)||(15234165-15234249)
chr3 (639-763)||(16258049-16258173)
chr3 (639-739)||(16806082-16806182)
chr3 (639-763)||(18750849-18750973)
chr3 (639-738)||(15340164-15340263)
chr3 (639-738)||(15724070-15724169)
chr3 (663-733)||(13942953-13943023)
chr3 (663-733)||(41178451-41178521)
chr3 (173-214)||(266987-267028)
chr3 (639-724)||(15347395-15347480)
chr3 (639-736)||(15611008-15611105)
[»] scaffold0010 (6 HSPs)
scaffold0010 (21-636)||(41367-41982)
scaffold0010 (41-630)||(46439-47028)
scaffold0010 (75-627)||(2632-3177)
scaffold0010 (631-768)||(41203-41340)
scaffold0010 (639-768)||(46269-46398)
scaffold0010 (639-728)||(3221-3310)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (21-636)||(37677721-37678336)
chr1 (21-636)||(31539100-31539715)
chr1 (21-627)||(20295053-20295659)
chr1 (47-635)||(24098707-24099295)
chr1 (149-635)||(21951678-21952164)
chr1 (41-635)||(19662241-19662839)
chr1 (41-635)||(20939167-20939761)
chr1 (41-635)||(19854974-19855560)
chr1 (41-635)||(20835004-20835586)
chr1 (43-633)||(20855866-20856457)
chr1 (46-474)||(41352927-41353355)
chr1 (75-474)||(50619509-50619908)
chr1 (41-255)||(22432600-22432814)
chr1 (47-489)||(51332743-51333185)
chr1 (95-498)||(21831018-21831421)
chr1 (380-635)||(23197350-23197605)
chr1 (631-768)||(31538936-31539073)
chr1 (47-470)||(21837617-21838040)
chr1 (631-768)||(37678363-37678500)
chr1 (44-627)||(19759985-19760561)
chr1 (75-440)||(20139525-20139890)
chr1 (95-489)||(16349848-16350243)
chr1 (47-489)||(19107034-19107477)
chr1 (47-470)||(33390298-33390721)
chr1 (42-407)||(21749603-21749968)
chr1 (636-768)||(21952197-21952329)
chr1 (75-488)||(22361495-22361908)
chr1 (42-498)||(20250464-20250919)
chr1 (229-624)||(16373378-16373774)
chr1 (230-617)||(22109872-22110259)
chr1 (230-617)||(22113721-22114108)
chr1 (636-738)||(24098572-24098674)
chr1 (47-440)||(17044314-17044707)
chr1 (640-768)||(20295704-20295832)
chr1 (127-405)||(16077990-16078268)
chr1 (636-768)||(19662076-19662208)
chr1 (636-768)||(19855593-19855725)
chr1 (636-768)||(20834839-20834971)
chr1 (42-227)||(16369959-16370144)
chr1 (639-768)||(20939002-20939131)
chr1 (651-768)||(23197185-23197302)
chr1 (128-312)||(20937662-20937846)
chr1 (651-738)||(21744521-21744608)
chr1 (651-768)||(20855699-20855816)
chr1 (639-744)||(21234694-21234799)
chr1 (636-736)||(20060923-20061023)
chr1 (639-738)||(16349565-16349664)
chr1 (639-733)||(41352636-41352730)
chr1 (639-736)||(22134528-22134625)
chr1 (651-739)||(431084-431172)
chr1 (639-763)||(19107659-19107783)
chr1 (639-738)||(21831594-21831693)
chr1 (639-738)||(21838241-21838340)
chr1 (639-736)||(20830363-20830460)
chr1 (639-724)||(33390012-33390097)
chr1 (651-738)||(16373833-16373920)
chr1 (639-738)||(21025464-21025563)
[»] chr4 (77 HSPs)
chr4 (21-636)||(3263825-3264440)
chr4 (21-636)||(29452568-29453183)
chr4 (21-636)||(44660897-44661512)
chr4 (21-636)||(11206262-11206877)
chr4 (47-635)||(20891634-20892222)
chr4 (47-635)||(33223575-33224163)
chr4 (39-635)||(15246568-15247164)
chr4 (41-633)||(15002398-15002990)
chr4 (41-624)||(1648320-1648903)
chr4 (41-635)||(27901032-27901626)
chr4 (42-498)||(8706565-8707021)
chr4 (260-635)||(15358152-15358527)
chr4 (41-635)||(15078281-15078875)
chr4 (42-635)||(15414058-15414651)
chr4 (264-635)||(16148580-16148951)
chr4 (264-635)||(16152726-16153097)
chr4 (41-482)||(15319797-15320237)
chr4 (75-627)||(14850146-14850698)
chr4 (41-216)||(15358541-15358716)
chr4 (44-498)||(12477249-12477703)
chr4 (44-498)||(29038313-29038767)
chr4 (47-488)||(8052542-8052983)
chr4 (47-498)||(19777702-19778153)
chr4 (44-498)||(8387061-8387515)
chr4 (47-498)||(14302887-14303338)
chr4 (47-489)||(18297857-18298299)
chr4 (631-768)||(3263661-3263798)
chr4 (631-768)||(29452404-29452541)
chr4 (47-498)||(23956399-23956850)
chr4 (47-449)||(1639383-1639785)
chr4 (95-498)||(14681267-14681670)
chr4 (95-498)||(40473740-40474143)
chr4 (44-489)||(12524325-12524770)
chr4 (42-303)||(14691549-14691810)
chr4 (47-470)||(27711988-27712411)
chr4 (42-492)||(14160117-14160567)
chr4 (636-768)||(11206098-11206230)
chr4 (47-407)||(18226446-18226806)
chr4 (651-768)||(20892270-20892387)
chr4 (333-627)||(14695051-14695345)
chr4 (95-465)||(15146827-15147197)
chr4 (651-760)||(44660741-44660850)
chr4 (636-768)||(33224196-33224328)
chr4 (639-744)||(14160746-14160851)
chr4 (47-405)||(16354447-16354805)
chr4 (639-768)||(16148987-16149116)
chr4 (639-768)||(16153133-16153262)
chr4 (50-366)||(7091087-7091403)
chr4 (651-738)||(15002261-15002348)
chr4 (651-768)||(27901674-27901791)
chr4 (651-738)||(15358017-15358104)
chr4 (639-738)||(8387688-8387787)
chr4 (639-738)||(12477876-12477975)
chr4 (639-738)||(14681843-14681942)
chr4 (639-738)||(15320412-15320511)
chr4 (47-218)||(16251634-16251805)
chr4 (639-738)||(18298481-18298580)
chr4 (639-738)||(19777430-19777529)
chr4 (639-738)||(29038041-29038140)
chr4 (639-742)||(40474316-40474419)
chr4 (639-736)||(9292111-9292208)
chr4 (639-736)||(14998592-14998689)
chr4 (651-736)||(15247212-15247297)
chr4 (651-700)||(18548994-18549043)
chr4 (639-739)||(12524952-12525052)
chr4 (639-738)||(8052260-8052359)
chr4 (651-738)||(8707208-8707295)
chr4 (651-738)||(15071647-15071734)
chr4 (639-738)||(16354082-16354181)
chr4 (651-724)||(1648188-1648261)
chr4 (639-736)||(15292057-15292154)
chr4 (639-724)||(23957023-23957108)
chr4 (639-724)||(27712612-27712697)
chr4 (175-210)||(12342321-12342356)
chr4 (663-733)||(51605694-51605764)
chr4 (639-700)||(13248921-13248982)
chr4 (639-728)||(14850013-14850102)
[»] chr7 (98 HSPs)
chr7 (21-636)||(49152917-49153532)
chr7 (21-636)||(11305281-11305896)
chr7 (21-636)||(13967686-13968301)
chr7 (21-636)||(26117623-26118238)
chr7 (65-635)||(12457300-12457870)
chr7 (47-635)||(13021999-13022587)
chr7 (21-436)||(8211346-8211761)
chr7 (47-635)||(12456344-12456932)
chr7 (47-635)||(16949491-16950078)
chr7 (47-635)||(426-1014)
chr7 (41-635)||(15101622-15102216)
chr7 (41-624)||(14285406-14285989)
chr7 (41-629)||(13666173-13666761)
chr7 (21-624)||(14434307-14434910)
chr7 (26-636)||(15341052-15341662)
chr7 (41-632)||(19147847-19148438)
chr7 (41-632)||(20747246-20747837)
chr7 (41-635)||(16071314-16071907)
chr7 (41-633)||(14263265-14263857)
chr7 (21-624)||(23504900-23505503)
chr7 (21-624)||(18052983-18053586)
chr7 (21-434)||(14130489-14130902)
chr7 (44-635)||(11387447-11388038)
chr7 (75-627)||(11771290-11771842)
chr7 (42-635)||(19613312-19613905)
chr7 (42-498)||(12205956-12206412)
chr7 (42-635)||(15625188-15625783)
chr7 (41-249)||(6414147-6414355)
chr7 (44-498)||(44790529-44790983)
chr7 (44-498)||(10871633-10872087)
chr7 (44-498)||(8199266-8199720)
chr7 (42-498)||(15153835-15154291)
chr7 (47-498)||(8708246-8708697)
chr7 (78-378)||(21662633-21662933)
chr7 (75-498)||(14040365-14040787)
chr7 (75-498)||(14350395-14350817)
chr7 (47-470)||(18550964-18551387)
chr7 (43-489)||(11552289-11552735)
chr7 (44-474)||(18178380-18178810)
chr7 (631-768)||(11305117-11305254)
chr7 (47-498)||(11236391-11236842)
chr7 (209-627)||(15204422-15204840)
chr7 (631-768)||(49153559-49153696)
chr7 (95-487)||(12688190-12688581)
chr7 (75-498)||(321215-321638)
chr7 (75-474)||(23202815-23203214)
chr7 (75-474)||(23508942-23509341)
chr7 (48-488)||(14333039-14333478)
chr7 (95-470)||(13686753-13687128)
chr7 (47-470)||(15160263-15160686)
chr7 (128-498)||(14955280-14955646)
chr7 (636-768)||(26117459-26117591)
chr7 (636-768)||(13967522-13967654)
chr7 (47-474)||(9596698-9597125)
chr7 (641-763)||(12457908-12458030)
chr7 (47-440)||(16554-16945)
chr7 (636-768)||(16949326-16949458)
chr7 (639-768)||(13022623-13022752)
chr7 (651-768)||(19613953-19614070)
chr7 (639-768)||(13666803-13666932)
chr7 (651-763)||(11387287-11387399)
chr7 (636-738)||(290-393)
chr7 (651-738)||(16071179-16071266)
chr7 (639-763)||(14955819-14955943)
chr7 (651-738)||(14263128-14263215)
chr7 (651-738)||(15101487-15101574)
chr7 (651-738)||(19148489-19148576)
chr7 (651-738)||(20747888-20747975)
chr7 (639-738)||(15159963-15160062)
chr7 (639-738)||(44790257-44790356)
chr7 (651-709)||(40081-40139)
chr7 (639-744)||(14212939-14213044)
chr7 (663-768)||(14285230-14285335)
chr7 (639-744)||(18179007-18179112)
chr7 (639-738)||(12688765-12688865)
chr7 (639-738)||(8199893-8199992)
chr7 (639-738)||(8708870-8708969)
chr7 (639-738)||(11236119-11236218)
chr7 (639-738)||(13687329-13687428)
chr7 (639-738)||(14333661-14333760)
chr7 (663-726)||(15341721-15341784)
chr7 (639-738)||(18550664-18550763)
chr7 (173-299)||(13455514-13455640)
chr7 (663-733)||(18052842-18052912)
chr7 (663-733)||(23504759-23504829)
chr7 (639-736)||(7825165-7825262)
chr7 (639-736)||(14937612-14937709)
chr7 (639-736)||(15365205-15365302)
chr7 (636-709)||(17144196-17144269)
chr7 (639-736)||(27106682-27106779)
chr7 (639-736)||(27171546-27171643)
chr7 (639-738)||(10872260-10872359)
chr7 (639-718)||(13456012-13456091)
chr7 (173-207)||(4440695-4440729)
chr7 (86-135)||(4440608-4440657)
chr7 (657-738)||(12205684-12205765)
chr7 (639-744)||(23202513-23202618)
chr7 (639-744)||(23508640-23508745)
[»] chr8 (98 HSPs)
chr8 (21-636)||(14565834-14566449)
chr8 (21-636)||(6679803-6680418)
chr8 (21-636)||(803147-803762)
chr8 (21-636)||(6604350-6604965)
chr8 (21-635)||(16270699-16271313)
chr8 (21-635)||(27355240-27355853)
chr8 (21-635)||(12305450-12306064)
chr8 (47-635)||(29302901-29303489)
chr8 (47-635)||(31415949-31416537)
chr8 (39-635)||(23655637-23656233)
chr8 (41-635)||(1266950-1267544)
chr8 (41-635)||(19852123-19852717)
chr8 (41-635)||(19858159-19858753)
chr8 (41-635)||(20975126-20975720)
chr8 (26-636)||(22051560-22052170)
chr8 (41-633)||(21841129-21841721)
chr8 (21-624)||(31570328-31570931)
chr8 (41-488)||(22371652-22372099)
chr8 (107-635)||(20009395-20009922)
chr8 (42-498)||(20388812-20389268)
chr8 (42-624)||(20395618-20396193)
chr8 (42-624)||(22376940-22377522)
chr8 (42-624)||(22383115-22383697)
chr8 (139-620)||(22247907-22248388)
chr8 (44-470)||(23949634-23950060)
chr8 (46-474)||(19483700-19484128)
chr8 (75-627)||(22987942-22988494)
chr8 (41-297)||(22061246-22061502)
chr8 (631-768)||(14566476-14566613)
chr8 (47-470)||(17673663-17674086)
chr8 (47-596)||(19978685-19979234)
chr8 (310-635)||(20985022-20985347)
chr8 (47-474)||(21166174-21166601)
chr8 (95-489)||(19113456-19113850)
chr8 (631-768)||(6604992-6605129)
chr8 (47-498)||(18857295-18857746)
chr8 (75-474)||(21921372-21921770)
chr8 (95-480)||(30312774-30313159)
chr8 (75-498)||(21251687-21252113)
chr8 (80-487)||(21393488-21393895)
chr8 (80-487)||(21787982-21788389)
chr8 (631-733)||(6680445-6680547)
chr8 (651-768)||(16270534-16270651)
chr8 (178-498)||(22128570-22128890)
chr8 (128-498)||(21043244-21043614)
chr8 (75-480)||(22132671-22133076)
chr8 (47-480)||(32600862-32601295)
chr8 (672-768)||(12306133-12306229)
chr8 (47-498)||(16407657-16408109)
chr8 (47-480)||(22040577-22041010)
chr8 (95-498)||(22119786-22120189)
chr8 (95-407)||(23650807-23651119)
chr8 (636-768)||(29302736-29302868)
chr8 (47-219)||(22164083-22164255)
chr8 (651-738)||(31415811-31415898)
chr8 (188-358)||(12274441-12274611)
chr8 (687-768)||(27355926-27356007)
chr8 (666-768)||(20974966-20975068)
chr8 (639-744)||(30312478-30312583)
chr8 (639-739)||(21165877-21165977)
chr8 (636-727)||(21324620-21324710)
chr8 (127-412)||(15534178-15534466)
chr8 (639-744)||(15534725-15534830)
chr8 (651-736)||(23656281-23656366)
chr8 (387-627)||(23886082-23886322)
chr8 (639-738)||(17673363-17673462)
chr8 (651-738)||(19852765-19852852)
chr8 (651-738)||(19858801-19858888)
chr8 (651-738)||(20984887-20984974)
chr8 (173-299)||(22983277-22983403)
chr8 (639-733)||(19483409-19483503)
chr8 (651-709)||(19869047-19869105)
chr8 (651-739)||(21252298-21252386)
chr8 (639-738)||(18857919-18858018)
chr8 (639-738)||(19114032-19114131)
chr8 (639-738)||(20017603-20017702)
chr8 (663-738)||(21841783-21841858)
chr8 (651-738)||(22372285-22372372)
chr8 (631-685)||(803066-803120)
chr8 (663-733)||(22052229-22052299)
chr8 (648-738)||(22247773-22247863)
chr8 (639-736)||(16876437-16876534)
chr8 (173-214)||(23156908-23156949)
chr8 (631-739)||(21043779-21043887)
chr8 (652-736)||(21195844-21195928)
chr8 (173-293)||(21196319-21196439)
chr8 (241-293)||(22283916-22283968)
chr8 (83-210)||(22366565-22366692)
chr8 (651-738)||(20009261-20009347)
chr8 (639-738)||(22119514-22119613)
chr8 (639-738)||(22128298-22128397)
chr8 (663-733)||(1267604-1267674)
chr8 (173-207)||(20652236-20652270)
chr8 (639-733)||(22435645-22435739)
chr8 (648-738)||(23886375-23886465)
chr8 (663-733)||(31570187-31570257)
chr8 (651-728)||(21921086-21921163)
chr8 (86-135)||(22983190-22983239)
[»] chr5 (98 HSPs)
chr5 (21-636)||(14886204-14886819)
chr5 (21-636)||(24797610-24798225)
chr5 (21-636)||(37542594-37543209)
chr5 (21-636)||(20342822-20343437)
chr5 (21-636)||(25848615-25849230)
chr5 (21-635)||(22503219-22503833)
chr5 (47-635)||(23079303-23079891)
chr5 (21-624)||(24619520-24620123)
chr5 (21-624)||(24715751-24716354)
chr5 (21-624)||(24748779-24749382)
chr5 (41-635)||(22235134-22235728)
chr5 (21-561)||(17268622-17269162)
chr5 (41-635)||(21889973-21890567)
chr5 (43-633)||(22462514-22463103)
chr5 (41-495)||(20774319-20774773)
chr5 (41-495)||(28894296-28894750)
chr5 (41-495)||(28915767-28916221)
chr5 (41-495)||(28923122-28923576)
chr5 (41-497)||(20822013-20822469)
chr5 (42-488)||(21831122-21831568)
chr5 (42-635)||(21563187-21563780)
chr5 (78-627)||(26737949-26738498)
chr5 (197-506)||(21496789-21497098)
chr5 (21-449)||(23471787-23472215)
chr5 (47-498)||(27610938-27611389)
chr5 (44-498)||(16357083-16357537)
chr5 (190-635)||(21679992-21680437)
chr5 (44-498)||(27518988-27519442)
chr5 (44-498)||(34567075-34567529)
chr5 (631-768)||(24797446-24797583)
chr5 (44-498)||(20467448-20467901)
chr5 (47-498)||(41771426-41771877)
chr5 (95-489)||(40709412-40709806)
chr5 (631-768)||(14886040-14886177)
chr5 (95-498)||(22332238-22332641)
chr5 (47-449)||(22349007-22349409)
chr5 (47-470)||(19770544-19770967)
chr5 (47-498)||(29475424-29475875)
chr5 (47-489)||(27667850-27668292)
chr5 (47-455)||(37290890-37291298)
chr5 (47-464)||(14999124-14999541)
chr5 (631-768)||(37542430-37542567)
chr5 (636-768)||(20343469-20343601)
chr5 (636-768)||(25849262-25849394)
chr5 (47-470)||(27684779-27685202)
chr5 (42-492)||(25423768-25424217)
chr5 (47-360)||(21407722-21408035)
chr5 (95-596)||(22135300-22135801)
chr5 (128-487)||(21338659-21339018)
chr5 (47-186)||(22381765-22381904)
chr5 (47-498)||(20800032-20800483)
chr5 (95-498)||(23440842-23441245)
chr5 (50-401)||(23574329-23574675)
chr5 (127-480)||(18776434-18776787)
chr5 (651-738)||(22503881-22503968)
chr5 (49-474)||(23517112-23517537)
chr5 (636-768)||(23079138-23079270)
chr5 (639-768)||(20822643-20822772)
chr5 (651-768)||(21679827-21679944)
chr5 (639-768)||(28893991-28894120)
chr5 (639-768)||(28915462-28915591)
chr5 (639-768)||(28922817-28922946)
chr5 (639-768)||(28930730-28930859)
chr5 (636-768)||(22234969-22235101)
chr5 (651-768)||(24619344-24619461)
chr5 (651-768)||(24715575-24715692)
chr5 (651-768)||(24748603-24748720)
chr5 (651-768)||(22463153-22463270)
chr5 (639-738)||(16357710-16357809)
chr5 (651-738)||(21872129-21872216)
chr5 (651-738)||(21876409-21876496)
chr5 (639-738)||(27519614-27519713)
chr5 (639-738)||(27667569-27667668)
chr5 (639-738)||(27684479-27684578)
chr5 (639-738)||(34567702-34567801)
chr5 (639-738)||(40709988-40710087)
chr5 (639-744)||(18777004-18777109)
chr5 (639-736)||(41772050-41772147)
chr5 (639-738)||(14998818-14998917)
chr5 (639-726)||(20774949-20775036)
chr5 (639-738)||(22135876-22135975)
chr5 (639-738)||(22331966-22332065)
chr5 (639-738)||(27611562-27611661)
chr5 (639-738)||(29475152-29475251)
chr5 (242-440)||(21881728-21881926)
chr5 (663-728)||(17268423-17268488)
chr5 (639-724)||(19771168-19771253)
chr5 (663-728)||(21497156-21497221)
chr5 (639-736)||(21936269-21936366)
chr5 (639-736)||(24582400-24582497)
chr5 (639-736)||(27012274-27012371)
chr5 (639-738)||(23441418-23441517)
chr5 (639-738)||(23472436-23472535)
chr5 (639-738)||(23574937-23575036)
chr5 (639-738)||(37290575-37290674)
chr5 (652-738)||(21563052-21563138)
chr5 (41-114)||(21497772-21497845)
chr5 (639-728)||(26737816-26737905)
[»] chr2 (81 HSPs)
chr2 (21-636)||(1064008-1064623)
chr2 (21-636)||(20828516-20829131)
chr2 (21-636)||(31830915-31831530)
chr2 (21-513)||(20833242-20833734)
chr2 (21-435)||(11357646-11358060)
chr2 (41-635)||(19651622-19652218)
chr2 (41-635)||(23277053-23277647)
chr2 (144-635)||(23294315-23294806)
chr2 (41-635)||(24948866-24949461)
chr2 (21-624)||(27787998-27788601)
chr2 (21-492)||(12574610-12575081)
chr2 (41-635)||(27209744-27210338)
chr2 (39-312)||(24642017-24642290)
chr2 (47-497)||(27364789-27365239)
chr2 (42-635)||(23111013-23111607)
chr2 (41-360)||(21125006-21125325)
chr2 (44-498)||(16925640-16926094)
chr2 (44-498)||(16999280-16999734)
chr2 (47-498)||(27371552-27372003)
chr2 (75-407)||(45529822-45530154)
chr2 (75-498)||(24819395-24819818)
chr2 (44-498)||(9610416-9610870)
chr2 (47-492)||(24876464-24876909)
chr2 (44-498)||(10869130-10869584)
chr2 (44-489)||(27218296-27218741)
chr2 (44-498)||(16923169-16923623)
chr2 (44-498)||(16982432-16982886)
chr2 (44-498)||(17063997-17064451)
chr2 (44-498)||(17067655-17068109)
chr2 (631-768)||(1064650-1064787)
chr2 (631-768)||(31831557-31831694)
chr2 (47-470)||(24710316-24710740)
chr2 (95-498)||(21144750-21145153)
chr2 (47-498)||(44385278-44385729)
chr2 (75-470)||(22324593-22324988)
chr2 (47-470)||(24262653-24263076)
chr2 (631-768)||(20829158-20829295)
chr2 (47-596)||(21324877-21325426)
chr2 (47-407)||(30210717-30211077)
chr2 (47-470)||(41608122-41608545)
chr2 (42-487)||(23107450-23107895)
chr2 (47-474)||(22756198-22756625)
chr2 (47-474)||(24675772-24676199)
chr2 (42-488)||(21890437-21890883)
chr2 (636-768)||(24949494-24949626)
chr2 (651-768)||(23277695-23277812)
chr2 (95-498)||(24707191-24707594)
chr2 (242-488)||(23066869-23067115)
chr2 (651-738)||(23099455-23099542)
chr2 (651-768)||(23294854-23294971)
chr2 (639-733)||(27209614-27209708)
chr2 (414-635)||(23099590-23099811)
chr2 (41-121)||(23294235-23294315)
chr2 (173-293)||(23816957-23817077)
chr2 (639-738)||(10869757-10869856)
chr2 (639-738)||(16923796-16923895)
chr2 (639-738)||(16926267-16926366)
chr2 (639-738)||(16983059-16983158)
chr2 (639-738)||(16999907-17000006)
chr2 (639-738)||(17064624-17064723)
chr2 (639-738)||(27218923-27219022)
chr2 (631-736)||(24569107-24569212)
chr2 (639-739)||(21144477-21144577)
chr2 (639-738)||(22324293-22324392)
chr2 (651-738)||(23111655-23111742)
chr2 (639-738)||(24710941-24711040)
chr2 (639-738)||(27372176-27372275)
chr2 (639-738)||(41607822-41607921)
chr2 (639-738)||(44385006-44385105)
chr2 (663-733)||(27788671-27788741)
chr2 (666-736)||(45533279-45533349)
chr2 (639-736)||(12639672-12639769)
chr2 (86-135)||(23817115-23817164)
chr2 (639-724)||(24676396-24676481)
chr2 (639-739)||(24876185-24876285)
chr2 (639-738)||(24706919-24707018)
chr2 (663-733)||(12575284-12575354)
chr2 (666-768)||(19651457-19651559)
chr2 (648-738)||(24263286-24263376)
chr2 (639-724)||(21324717-21324802)
chr2 (173-214)||(21906162-21906203)
[»] chr6 (89 HSPs)
chr6 (21-633)||(24364902-24365514)
chr6 (47-635)||(10468026-10468614)
chr6 (41-635)||(5296383-5296977)
chr6 (41-635)||(14380644-14381238)
chr6 (41-635)||(8762110-8762704)
chr6 (41-635)||(19453930-19454524)
chr6 (41-635)||(21472111-21472705)
chr6 (182-635)||(19435653-19436106)
chr6 (21-624)||(28282001-28282604)
chr6 (43-635)||(25768703-25769295)
chr6 (47-635)||(18795206-18795794)
chr6 (41-497)||(15459846-15460302)
chr6 (41-635)||(21563309-21563903)
chr6 (41-635)||(21569168-21569762)
chr6 (47-498)||(34644900-34645351)
chr6 (47-635)||(19879814-19880402)
chr6 (41-312)||(22796132-22796403)
chr6 (44-627)||(15896607-15897190)
chr6 (21-323)||(27560106-27560408)
chr6 (44-621)||(18196916-18197496)
chr6 (95-440)||(5838591-5838936)
chr6 (41-227)||(17415996-17416182)
chr6 (188-498)||(19488586-19488896)
chr6 (47-498)||(16626031-16626482)
chr6 (47-498)||(25113068-25113519)
chr6 (44-627)||(18966477-18967054)
chr6 (44-455)||(27187949-27188360)
chr6 (44-455)||(27260880-27261291)
chr6 (47-498)||(29591234-29591685)
chr6 (43-498)||(1542398-1542853)
chr6 (75-498)||(23079013-23079436)
chr6 (47-596)||(22434385-22434934)
chr6 (44-489)||(28262520-28262965)
chr6 (44-489)||(28341269-28341714)
chr6 (47-498)||(22442783-22443234)
chr6 (47-470)||(24312510-24312933)
chr6 (95-487)||(2874128-2874520)
chr6 (353-635)||(14379094-14379376)
chr6 (47-440)||(19865203-19865596)
chr6 (50-489)||(20636624-20637063)
chr6 (95-449)||(25609224-25609578)
chr6 (75-488)||(22078014-22078427)
chr6 (42-474)||(22761793-22762225)
chr6 (651-768)||(24365564-24365681)
chr6 (44-324)||(28291860-28292140)
chr6 (47-498)||(16926954-16927405)
chr6 (42-489)||(18407265-18407712)
chr6 (641-768)||(10467861-10467988)
chr6 (105-498)||(16962759-16963152)
chr6 (127-465)||(27566327-27566665)
chr6 (636-768)||(19454557-19454689)
chr6 (636-768)||(8761945-8762077)
chr6 (42-438)||(27391547-27391943)
chr6 (651-738)||(21563174-21563261)
chr6 (651-738)||(21569033-21569120)
chr6 (636-768)||(14378929-14379061)
chr6 (636-768)||(14380479-14380611)
chr6 (242-438)||(27330807-27331003)
chr6 (651-738)||(5296248-5296335)
chr6 (83-411)||(18436157-18436489)
chr6 (651-768)||(18795842-18795959)
chr6 (636-760)||(19880435-19880559)
chr6 (651-738)||(21472753-21472840)
chr6 (639-768)||(15460476-15460605)
chr6 (638-727)||(19436141-19436230)
chr6 (173-293)||(23027235-23027355)
chr6 (639-738)||(29590962-29591061)
chr6 (639-736)||(27188576-27188673)
chr6 (639-736)||(27260567-27260664)
chr6 (639-738)||(2873845-2873944)
chr6 (639-738)||(16625759-16625858)
chr6 (639-718)||(18572793-18572872)
chr6 (639-738)||(25113692-25113791)
chr6 (173-207)||(15077971-15078005)
chr6 (639-724)||(1542140-1542225)
chr6 (639-736)||(16381417-16381514)
chr6 (639-736)||(16649013-16649110)
chr6 (639-736)||(18836952-18837049)
chr6 (663-736)||(28281857-28281930)
chr6 (639-763)||(1647831-1647955)
chr6 (47-114)||(11280203-11280270)
chr6 (651-738)||(19865839-19865926)
chr6 (651-738)||(22761497-22761584)
chr6 (639-734)||(23997388-23997483)
chr6 (173-207)||(21927847-21927881)
chr6 (648-738)||(22435018-22435108)
chr6 (648-738)||(22443416-22443506)
chr6 (639-736)||(14129609-14129706)
chr6 (639-736)||(16926684-16926781)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (21-636)||(15747-16362)
scaffold0089 (651-768)||(15583-15700)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (26-635)||(26923-27532)
[»] scaffold0060 (2 HSPs)
scaffold0060 (47-635)||(43466-44054)
scaffold0060 (636-768)||(44087-44219)
[»] scaffold0034 (6 HSPs)
scaffold0034 (47-634)||(12937-13524)
scaffold0034 (41-635)||(3988-4582)
scaffold0034 (41-635)||(68047-68641)
scaffold0034 (636-768)||(12778-12910)
scaffold0034 (636-768)||(3823-3955)
scaffold0034 (651-768)||(68689-68806)
[»] scaffold0190 (2 HSPs)
scaffold0190 (47-635)||(32354-32942)
scaffold0190 (636-768)||(32189-32321)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (47-635)||(249296-249884)
scaffold0009 (636-768)||(249917-250049)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (66-630)||(20096-20660)
scaffold0104 (66-630)||(22916-23480)
scaffold0104 (636-768)||(20698-20830)
scaffold0104 (636-768)||(23518-23650)
[»] scaffold0076 (5 HSPs)
scaffold0076 (47-635)||(55935-56523)
scaffold0076 (42-635)||(32712-33305)
scaffold0076 (636-768)||(55770-55902)
scaffold0076 (651-768)||(32547-32664)
scaffold0076 (639-736)||(41565-41662)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (41-635)||(27902-28496)
scaffold0156 (651-738)||(35432-35519)
[»] scaffold1061 (2 HSPs)
scaffold1061 (41-635)||(2265-2859)
scaffold1061 (636-768)||(2892-3024)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (41-635)||(5427-6021)
scaffold0404 (652-736)||(6070-6154)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (41-635)||(3428-4020)
scaffold0035 (651-768)||(4068-4185)
scaffold0035 (651-700)||(12134-12183)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (41-635)||(19797-20391)
scaffold0058 (636-733)||(20424-20521)
[»] scaffold0708 (2 HSPs)
scaffold0708 (161-635)||(7180-7654)
scaffold0708 (651-768)||(7015-7132)
[»] scaffold0114 (7 HSPs)
scaffold0114 (41-635)||(45194-45788)
scaffold0114 (208-597)||(20744-21133)
scaffold0114 (41-300)||(44182-44441)
scaffold0114 (173-498)||(19513-19838)
scaffold0114 (639-733)||(21194-21288)
scaffold0114 (639-733)||(45824-45918)
scaffold0114 (651-739)||(19240-19328)
[»] scaffold1646 (2 HSPs)
scaffold1646 (70-635)||(30-595)
scaffold1646 (639-733)||(631-725)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (59-636)||(80866-81443)
scaffold0046 (663-733)||(80737-80807)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (41-635)||(41594-42188)
scaffold0126 (636-768)||(42221-42353)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (41-635)||(4487-5081)
scaffold0101 (639-733)||(4357-4451)
[»] scaffold0067 (9 HSPs)
scaffold0067 (41-635)||(51215-51809)
scaffold0067 (41-635)||(60249-60843)
scaffold0067 (41-635)||(66637-67231)
scaffold0067 (461-635)||(27722-27896)
scaffold0067 (637-733)||(51085-51181)
scaffold0067 (637-733)||(60119-60215)
scaffold0067 (637-733)||(66507-66603)
scaffold0067 (353-450)||(26389-26486)
scaffold0067 (687-738)||(27979-28030)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (59-635)||(149265-149841)
scaffold0011 (41-635)||(194739-195333)
scaffold0011 (44-627)||(25576-26159)
scaffold0011 (636-768)||(194574-194706)
scaffold0011 (636-768)||(149874-150005)
[»] scaffold0742 (2 HSPs)
scaffold0742 (41-636)||(5890-6485)
scaffold0742 (663-733)||(6544-6614)
[»] scaffold0053 (4 HSPs)
scaffold0053 (41-635)||(56882-57476)
scaffold0053 (41-635)||(48069-48663)
scaffold0053 (651-738)||(47934-48021)
scaffold0053 (651-768)||(56717-56834)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (41-635)||(32087-32682)
scaffold0106 (42-327)||(14717-15002)
scaffold0106 (42-291)||(18234-18483)
scaffold0106 (651-738)||(32730-32817)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (41-635)||(5371-5964)
scaffold0213 (651-733)||(5241-5323)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (41-635)||(13334-13928)
scaffold0203 (666-768)||(13169-13271)
[»] scaffold0367 (2 HSPs)
scaffold0367 (41-630)||(6278-6867)
scaffold0367 (636-768)||(6108-6240)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (41-635)||(5107-5701)
scaffold0165 (651-738)||(5749-5836)
[»] scaffold0004 (6 HSPs)
scaffold0004 (41-635)||(323381-323975)
scaffold0004 (42-498)||(202640-203096)
scaffold0004 (41-258)||(118245-118462)
scaffold0004 (636-768)||(324008-324140)
scaffold0004 (651-738)||(202368-202455)
scaffold0004 (152-220)||(115061-115129)
[»] scaffold0222 (4 HSPs)
scaffold0222 (47-635)||(2390-2978)
scaffold0222 (41-635)||(7737-8331)
scaffold0222 (651-768)||(8379-8496)
scaffold0222 (651-760)||(2233-2342)
[»] scaffold0298 (7 HSPs)
scaffold0298 (39-635)||(20658-21254)
scaffold0298 (162-635)||(11092-11565)
scaffold0298 (162-635)||(14862-15335)
scaffold0298 (47-158)||(12873-12984)
scaffold0298 (47-158)||(16643-16754)
scaffold0298 (651-768)||(10927-11044)
scaffold0298 (651-768)||(14697-14814)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (41-635)||(100597-101181)
scaffold0020 (47-440)||(180882-181275)
scaffold0020 (636-763)||(100437-100564)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (41-632)||(24914-25494)
scaffold0113 (636-768)||(24746-24878)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (41-633)||(27201-27793)
scaffold0192 (651-738)||(27843-27930)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (41-635)||(1008-1601)
[»] scaffold0403 (3 HSPs)
scaffold0403 (41-617)||(3468-4044)
scaffold0403 (42-440)||(7050-7448)
scaffold0403 (651-739)||(7691-7779)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (41-527)||(22519-23005)
scaffold0261 (41-527)||(14340-14826)
scaffold0261 (651-738)||(14200-14286)
scaffold0261 (651-738)||(22379-22465)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (21-636)||(260965-261580)
scaffold0005 (95-474)||(278026-278405)
scaffold0005 (639-738)||(277730-277829)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (41-635)||(10470-11064)
scaffold0309 (651-738)||(11112-11199)
[»] scaffold0235 (4 HSPs)
scaffold0235 (41-635)||(10492-11086)
scaffold0235 (41-635)||(20706-21300)
scaffold0235 (648-768)||(10327-10447)
scaffold0235 (648-768)||(20541-20661)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (41-635)||(48241-48836)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (21-617)||(11839-12434)
scaffold0239 (663-733)||(11691-11761)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (41-631)||(28734-29324)
scaffold0026 (42-449)||(29622-30030)
scaffold0026 (651-738)||(29376-29463)
[»] scaffold0682 (2 HSPs)
scaffold0682 (41-635)||(560-1154)
scaffold0682 (636-733)||(1187-1284)
[»] scaffold0049 (3 HSPs)
scaffold0049 (41-506)||(51027-51492)
scaffold0049 (651-738)||(50775-50862)
scaffold0049 (548-635)||(50910-50997)
[»] scaffold0102 (3 HSPs)
scaffold0102 (41-393)||(40415-40767)
scaffold0102 (447-635)||(40781-40969)
scaffold0102 (651-736)||(41017-41102)
[»] scaffold0523 (2 HSPs)
scaffold0523 (41-635)||(546-1140)
scaffold0523 (651-736)||(1188-1273)
[»] scaffold0465 (2 HSPs)
scaffold0465 (41-633)||(270-863)
scaffold0465 (639-768)||(103-232)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (40-635)||(1584-2179)
[»] scaffold0244 (3 HSPs)
scaffold0244 (123-635)||(18107-18620)
scaffold0244 (654-736)||(18671-18753)
scaffold0244 (639-736)||(25679-25776)
[»] scaffold0090 (4 HSPs)
scaffold0090 (47-635)||(19532-20120)
scaffold0090 (47-635)||(23694-24282)
scaffold0090 (651-768)||(20168-20285)
scaffold0090 (651-768)||(24330-24447)
[»] scaffold0751 (3 HSPs)
scaffold0751 (212-635)||(3024-3447)
scaffold0751 (41-286)||(2471-2716)
scaffold0751 (651-763)||(3495-3607)
[»] scaffold0139 (5 HSPs)
scaffold0139 (41-600)||(219-778)
scaffold0139 (320-635)||(28173-28488)
scaffold0139 (320-635)||(34426-34741)
scaffold0139 (663-768)||(28548-28653)
scaffold0139 (663-768)||(34801-34906)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (162-635)||(12996-13471)
scaffold0124 (47-158)||(11571-11682)
scaffold0124 (651-768)||(13519-13636)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (168-635)||(20476-20943)
scaffold0077 (639-736)||(16466-16563)
scaffold0077 (639-736)||(27168-27265)
[»] scaffold0232 (3 HSPs)
scaffold0232 (206-635)||(722-1150)
scaffold0232 (65-211)||(2336-2482)
scaffold0232 (651-768)||(558-674)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (41-635)||(47801-48375)
scaffold0108 (651-736)||(48423-48508)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (357-635)||(27926-28204)
scaffold0088 (636-768)||(28237-28369)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (47-399)||(547-899)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (103-498)||(24244-24638)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (94-624)||(108-637)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (41-366)||(17841-18166)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (83-627)||(15596-16140)
scaffold0040 (75-498)||(112660-113082)
scaffold0040 (651-738)||(16196-16283)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (42-635)||(39794-40387)
scaffold0064 (42-345)||(28093-28396)
[»] scaffold0149 (4 HSPs)
scaffold0149 (41-399)||(6507-6866)
scaffold0149 (41-399)||(10938-11297)
scaffold0149 (514-635)||(6365-6486)
scaffold0149 (514-635)||(10796-10917)
[»] scaffold0028 (9 HSPs)
scaffold0028 (42-635)||(49549-50142)
scaffold0028 (43-498)||(43833-44288)
scaffold0028 (95-487)||(9205-9597)
scaffold0028 (95-487)||(15667-16059)
scaffold0028 (320-498)||(788-966)
scaffold0028 (651-768)||(49384-49501)
scaffold0028 (83-137)||(106106-106160)
scaffold0028 (639-724)||(44458-44543)
scaffold0028 (639-709)||(105502-105572)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (42-627)||(4709-5294)
[»] scaffold1715 (2 HSPs)
scaffold1715 (407-635)||(1-229)
scaffold1715 (657-768)||(287-398)
[»] scaffold0585 (3 HSPs)
scaffold0585 (41-372)||(6334-6665)
scaffold0585 (651-738)||(5989-6078)
scaffold0585 (556-635)||(6126-6205)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (42-621)||(218466-219045)
scaffold0012 (42-474)||(229721-230153)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (41-378)||(6861-7198)
scaffold0348 (662-733)||(10794-10865)
[»] scaffold0029 (5 HSPs)
scaffold0029 (59-624)||(95048-95613)
scaffold0029 (42-635)||(113237-113830)
scaffold0029 (44-498)||(108983-109437)
scaffold0029 (636-768)||(113863-113995)
scaffold0029 (651-736)||(108713-108798)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (44-492)||(9986-10434)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (129-620)||(17446-17937)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (42-627)||(4549-5134)
scaffold0270 (42-627)||(11679-12264)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (283-635)||(89480-89832)
scaffold0001 (283-635)||(90158-90510)
scaffold0001 (45-233)||(114866-115054)
scaffold0001 (75-378)||(390492-390795)
scaffold0001 (651-738)||(89345-89432)
scaffold0001 (651-738)||(90023-90110)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (83-498)||(116077-116492)
scaffold0037 (574-627)||(115948-116001)
[»] scaffold0120 (7 HSPs)
scaffold0120 (47-297)||(897-1147)
scaffold0120 (334-635)||(587-887)
scaffold0120 (42-450)||(6701-7106)
scaffold0120 (152-474)||(12846-13168)
scaffold0120 (636-768)||(422-554)
scaffold0120 (631-739)||(7319-7427)
scaffold0120 (639-700)||(23483-23544)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (42-360)||(25029-25347)
scaffold0100 (422-498)||(24879-24955)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (75-627)||(17020-17572)
[»] scaffold0476 (3 HSPs)
scaffold0476 (260-635)||(2365-2740)
scaffold0476 (636-768)||(2200-2332)
scaffold0476 (242-330)||(10195-10283)
[»] scaffold0600 (2 HSPs)
scaffold0600 (173-635)||(4585-5047)
scaffold0600 (654-738)||(5098-5182)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (44-498)||(14251-14705)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (75-474)||(9681-10080)
[»] scaffold0518 (3 HSPs)
scaffold0518 (321-635)||(11690-12004)
scaffold0518 (41-285)||(11446-11690)
scaffold0518 (651-718)||(12052-12119)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (42-498)||(31925-32381)
scaffold0180 (663-768)||(12397-12502)
scaffold0180 (584-635)||(12562-12613)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (75-498)||(11369-11792)
scaffold0018 (75-498)||(17561-17984)
[»] scaffold0304 (2 HSPs)
scaffold0304 (317-635)||(2520-2838)
scaffold0304 (651-763)||(2360-2472)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (75-498)||(3851-4274)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (42-627)||(6934-7519)
scaffold0379 (663-728)||(6801-6866)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (47-476)||(39014-39443)
scaffold0042 (47-480)||(66088-66521)
scaffold0042 (639-744)||(66712-66817)
[»] scaffold0431 (2 HSPs)
scaffold0431 (47-487)||(8049-8489)
scaffold0431 (639-739)||(8673-8773)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (95-498)||(7670-8073)
scaffold0454 (639-738)||(8246-8345)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (42-474)||(8283-8715)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (42-303)||(12172-12433)
[»] scaffold0109 (4 HSPs)
scaffold0109 (47-480)||(32763-33196)
scaffold0109 (47-480)||(9279-9712)
scaffold0109 (639-744)||(9903-10008)
scaffold0109 (639-744)||(32467-32572)
[»] scaffold0081 (6 HSPs)
scaffold0081 (47-596)||(19285-19834)
scaffold0081 (47-596)||(34709-35258)
scaffold0081 (166-498)||(50234-50566)
scaffold0081 (639-709)||(50739-50809)
scaffold0081 (639-739)||(19909-20009)
scaffold0081 (639-739)||(35333-35433)
[»] scaffold0358 (3 HSPs)
scaffold0358 (42-440)||(6727-7125)
scaffold0358 (651-739)||(7368-7456)
scaffold0358 (639-709)||(3538-3608)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (127-407)||(4855-5134)
[»] scaffold0228 (2 HSPs)
scaffold0228 (42-498)||(374-830)
scaffold0228 (639-688)||(1003-1052)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (130-490)||(3637-3997)
scaffold0023 (137-498)||(28544-28905)
scaffold0023 (122-378)||(59513-59769)
scaffold0023 (242-498)||(130985-131241)
[»] scaffold1288 (2 HSPs)
scaffold1288 (380-635)||(1889-2144)
scaffold1288 (651-763)||(1729-1841)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (190-453)||(34014-34277)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (47-480)||(3595-4028)
scaffold0546 (639-744)||(3299-3404)
[»] scaffold0324 (3 HSPs)
scaffold0324 (42-474)||(19198-19630)
scaffold0324 (307-474)||(14407-14574)
scaffold0324 (651-739)||(14110-14198)
[»] scaffold1830 (2 HSPs)
scaffold1830 (380-635)||(17-272)
scaffold1830 (651-768)||(320-437)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (95-498)||(6745-7148)
[»] scaffold0342 (3 HSPs)
scaffold0342 (173-627)||(18258-18709)
scaffold0342 (639-738)||(18115-18214)
scaffold0342 (42-143)||(18732-18833)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (47-449)||(63252-63654)
scaffold0031 (633-738)||(108931-109036)
scaffold0031 (593-635)||(108859-108901)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (47-412)||(1097-1462)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (242-627)||(102111-102496)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (47-407)||(22550-22910)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (78-366)||(85823-86110)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (75-498)||(1387-1810)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (75-498)||(2986-3409)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (166-498)||(1239-1571)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (80-440)||(3090-3450)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (75-351)||(15742-16011)
[»] scaffold1373 (2 HSPs)
scaffold1373 (651-768)||(1704-1821)
scaffold1373 (574-635)||(1869-1930)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (41-198)||(49449-49606)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (42-366)||(2145-2469)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (103-498)||(7503-7898)
scaffold0540 (657-739)||(7230-7312)
[»] scaffold0017 (5 HSPs)
scaffold0017 (47-498)||(196650-197101)
scaffold0017 (242-480)||(56895-57133)
scaffold0017 (260-498)||(19239-19477)
scaffold0017 (639-738)||(196378-196477)
scaffold0017 (639-738)||(57324-57423)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (145-627)||(13249-13731)
[»] scaffold2112 (2 HSPs)
scaffold2112 (403-635)||(17-249)
scaffold2112 (651-738)||(297-384)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (47-487)||(8080-8520)
scaffold0080 (637-738)||(8702-8803)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (42-492)||(16333-16782)
scaffold0333 (651-738)||(16973-17060)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (75-360)||(4-289)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (261-498)||(26116-26353)
scaffold0243 (639-736)||(789-886)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (42-327)||(39354-39639)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (131-487)||(1660-2016)
[»] scaffold0319 (3 HSPs)
scaffold0319 (128-498)||(2029-2403)
scaffold0319 (651-739)||(2588-2676)
scaffold0319 (651-739)||(85-173)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (47-407)||(8473-8833)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (173-596)||(3003-3426)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (47-465)||(28-446)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (47-405)||(25657-26015)
scaffold0079 (639-738)||(26281-26380)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (47-440)||(79724-80117)
[»] scaffold0266 (3 HSPs)
scaffold0266 (548-635)||(15296-15383)
scaffold0266 (651-738)||(15431-15518)
scaffold0266 (651-736)||(8763-8848)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (278-488)||(116-326)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (75-312)||(24209-24446)
scaffold0198 (639-738)||(24774-24873)
[»] scaffold0117 (4 HSPs)
scaffold0117 (636-760)||(6563-6687)
scaffold0117 (639-736)||(326-423)
scaffold0117 (381-498)||(6857-6974)
scaffold0117 (173-214)||(880-921)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (47-294)||(15043-15290)
scaffold0044 (47-294)||(1303-1550)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (287-616)||(4407-4736)
scaffold0056 (639-739)||(4252-4352)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (95-219)||(4550-4674)
[»] scaffold0865 (2 HSPs)
scaffold0865 (437-635)||(3307-3505)
scaffold0865 (631-728)||(3182-3279)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (437-635)||(30320-30518)
scaffold0133 (631-728)||(30195-30292)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (75-429)||(5932-6286)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (332-498)||(10188-10354)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (631-736)||(6473-6578)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (651-763)||(8491-8603)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (639-738)||(29471-29570)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (631-736)||(25261-25366)
scaffold0021 (639-736)||(15738-15835)
scaffold0021 (639-718)||(32333-32412)
scaffold0021 (173-207)||(24772-24806)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (639-738)||(39686-39785)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (687-733)||(1-47)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (173-299)||(24689-24815)
scaffold0008 (639-736)||(133391-133488)
scaffold0008 (179-209)||(232370-232400)
scaffold0008 (639-736)||(25133-25230)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (639-736)||(2777-2874)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (86-135)||(9708-9757)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (639-736)||(769-866)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (639-736)||(24701-24798)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (639-736)||(14215-14312)
[»] scaffold0876 (2 HSPs)
scaffold0876 (663-763)||(1794-1894)
scaffold0876 (83-137)||(3261-3315)
[»] scaffold0567 (2 HSPs)
scaffold0567 (173-205)||(10103-10135)
scaffold0567 (639-733)||(10601-10695)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (173-207)||(517-551)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (83-137)||(14270-14324)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (173-207)||(458-492)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (663-733)||(96495-96565)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (173-206)||(8074-8107)
scaffold0160 (639-700)||(8572-8633)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (86-135)||(44260-44309)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 540; Significance: 0; HSPs: 119)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 540; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Original strand, 28754573 - 28755188
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28754573 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 28754672  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28754673 gacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggggtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 28754772  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28754773 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggacc 28754872  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28754873 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 28754972  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28754973 ttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaa 28755072  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28755073 tcaacaaacttcaaatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaatcttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaatt 28755172  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  28755173 cacagacaagactcat 28755188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Original strand, 47124199 - 47124814
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47124199 catgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccgggtaactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 47124298  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47124299 gacaactacccaaatagcgtcatgcctcctcggagtgttcggtaaacttgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 47124398  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47124399 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggacc 47124498  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47124499 accaaaacagcttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 47124598  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47124599 ctcattgtcaggaatgcaaactctacctctgaacctcaacacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaa 47124698  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47124699 tcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaatt 47124798  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  47124799 cacagacaagactcat 47124814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 533
Target Start/End: Original strand, 10384223 - 10384735
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10384223 catgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtc 10384322  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10384323 gacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 10384422  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10384423 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 10384522  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10384523 accaaaacaatttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 10384622  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10384623 ttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaa 10384722  T
Q  521 tcaacaaacttca 533  Q
    |||||||||||||    
T  10384723 tcaacaaacttca 10384735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16338381 - 16337772
Alignment:
Q  26 agcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaa 125  Q
    |||||||| | ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16338381 agcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattaataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaa 16338282  T
Q  126 ctacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgt 225  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16338281 caacccaaatggcgtcatgccctcttggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatccatagagatattgtcccacttccactccggtacatccaacggtgt 16338182  T
Q  226 caacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaa 325  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16338181 gaacaaccctgcaggcttctgatgctcaactttagacttctaacaagtcaaacaagcataaacaaactgagcaacatctcgtttcaaaccggaccaccaa 16338082  T
Q  326 aacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcat 425  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  16338081 aacagtttcttcagatcatggtacatctttgtagcccccaggtgaatactcaacctactcttatgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcat 16337982  T
Q  426 tgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaac 525  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16337981 tgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactattctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaac 16337882  T
Q  526 aaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacag 625  Q
    |||||||| |    | | ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16337881 aaacttcaaaaatacctgctgagcttctctgatactgttcaagaaatcactatcaatcctcaacattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacat 16337782  T
Q  626 acaagactca 635  Q
    || |||||||    
T  16337781 accagactca 16337772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16329530 - 16328920
Alignment:
Q  26 agcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaa 125  Q
    |||||||| | ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16329530 agcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattgataggaatgaagtgtgctgacttcgtcaaccggttgacaa 16329431  T
Q  126 ctacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatc-taacggtg 224  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16329430 caacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatcctaacggtg 16329331  T
Q  225 tcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccacca 324  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16329330 tcaacaaccttgcaagcttttgatgctcaaccttggacttttgacaaatcaagcaagcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccacca 16329231  T
Q  325 aaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtca 424  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16329230 aaataatttcttcagatcatggtacatctttgtagaccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactcatca 16329131  T
Q  425 ttgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaa 524  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  16329130 ttgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactgtcctcagtgtcactaccagtagtcatcaaatcaa 16329031  T
Q  525 caaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcaca 624  Q
    |||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16329030 caaatttcaaatctgctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaatcttcattatccccaactgtatactctgagatgacagttcaca 16328931  T
Q  625 gacaagactca 635  Q
    |||||||||||    
T  16328930 gacaagactca 16328920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 90 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 11960974 - 11960429
Alignment:
Q  90 gaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagat 189  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||| || |  ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||    
T  11960974 gaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggaaaactcgtcacaaaatccatagaaat 11960875  T
Q  190 actatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaaca 289  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  11960874 actgtctcatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcataaaca 11960775  T
Q  290 aactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgt 389  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||    
T  11960774 aactgagcaacatctcgtttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttatagcccctgggtgaatactcaaactactatcgt 11960675  T
Q  390 gactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  11960674 gactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaaatcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcact 11960575  T
Q  490 atcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagc 589  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||| |    
T  11960574 atcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaatcctcatc 11960475  T
Q  590 attcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11960474 atccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 11960429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 11303627 - 11303033
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |    
T  11303627 tgaatataaatctccgccaactgagctaccagataactaatattgatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacgacgacccaaatggcat 11303528  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  |    
T  11303527 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaaatgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctacaag 11303428  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  11303427 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacatttcaacccggaccaccaaaatagcttcttcaaa 11303328  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | | ||||| |  | || || ||||| |||||||| ||||    
T  11303327 tcatgatacattttcgtagctcccagatgaatactcaagctactcttgtgcctttcctctaaactcaaccttttgaaatcatcattatcaggaatgcaaa 11303228  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| |  | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||   |  |||||||||||||||||| | |||  |    
T  11303227 ttcttcctctgaaccttaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccattaaccatcaaatcaacaaacttaacatctac 11303128  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||| | ||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11303127 ttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaattcacagacaagactca 11303033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 14574204 - 14574792
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||     ||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  14574204 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgat-----tag-aataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcat 14574297  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14574298 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgctatcccacttccactctggcacatctaacgatgtcaacaaccctgcagg 14574397  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||     
T  14574398 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaaccgagcaacatctcgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaag 14574497  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    || || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||| ||| | |||||||| ||||    
T  14574498 tcgtgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcttctagaatcaactttttcaactcatcactatcaggaatgcaaa 14574597  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| | |  |||||||||||||||||| | |||| |    
T  14574598 ttcttcctctgaacctcaacacaccatgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcactaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccac 14574697  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || ||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  14574698 ttgctgtgcttctcggatactactcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgcacactctgaggtgacaactcgcaaacaagactca 14574792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 17492905 - 17493499
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||| |    
T  17492905 tgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataattgatattaattggaataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcgacaataacccatatggcat 17493004  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  17493005 catgccctcttggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttcaactctggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 17493104  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| ||||| | ||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17493105 cttctgatgttcaaccttagatttctgacaagtcaaacatgcatacaaaaattgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaa 17493204  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| || || |||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17493205 tcatgatacattttcgtagctccagaatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactcgtcattatcaggaatacaaa 17493304  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| ||||| || | || |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||| | |||| |    
T  17493305 ttcttcctctaaacctcaacacaccctgatcatcaacctttaagtcactatcttcagtgtcactaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccac 17493404  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17493405 ttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaaatgtacactctgaggtgtcaattcacagacacgactca 17493499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16828056 - 16827463
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  || ||| | ||||||||||| |    
T  16828056 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatccaca-caacccaaatggcat 16827958  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16827957 catgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcagg 16827858  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  16827857 cttctgatgctcaaccttggacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaaa 16827758  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | ||||| || || ||||| |||||  | ||||| | |||||||||  |||| || ||||| ||| |||||||||    
T  16827757 tcatgatacatttttgtagctccctgatgaatacttaagctacttttgtgggtttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcatgaatacaaa 16827658  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     | | |||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||  | |  |||||||||||||||||| | |||  |    
T  16827657 tttttcctctgaacctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcattatcttcagtttcattactagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatcaac 16827558  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16827557 ttgatgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtacaccctgaggtgacaactcacagataagactca 16827463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 41 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 18134200 - 18133614
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||| |||||| || ||||| || || |    
T  18134200 tgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaataaagtgcgccgaattcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcat 18134101  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18134100 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccattgaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 18134001  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18134000 cttctaatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaa 18133901  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || || | ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  18133900 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctactcttgtgactttcttccaaaattaactttttcaactcgtcattatcaggaatactaa 18133801  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| |  | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||   | ||||||||| ||||||||||| |||  |    
T  18133800 ttcttcctctgaaccttaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtttcattaccaacaatcatcaaatgaacaaacttcacatctac 18133701  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    || ||| |||||||||||| | |||||||| | ||| | ||| || |||||  ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  18133700 ttgctgcgcttctcggatattattcaagaaatcactgttaatctttagcatcgccaactgaacactatgaggtgtcaattcacagac 18133614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12360396 - 12359787
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||| || || ||| |||| ||||||| |||||| || ||||| ||||| |    
T  12360396 tgaatgtaaatctccgccaactgagctatcggatatttgatattaatcggaataaagtgcgccaactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatggcat 12360297  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  12360296 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgttatcccacttccactccggcacatccaactgtgtcaacaaccctgcagg 12360197  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||| ||  |||||||  |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12360196 cttctaatattcaacctgagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaa 12360097  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaact---------------cgtcat 425  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||| |               | ||||    
T  12360096 tcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcatcatcaggaacatcat 12359997  T
Q  426 tgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaac 525  Q
      |||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |  ||| ||||||||    
T  12359996 catcaggaatgcaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccaacaaccattaaatcaac 12359897  T
Q  526 aaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacag 625  Q
    |||||||| |||  |||  || |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12359896 aaacttcacatctacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaattcacag 12359797  T
Q  626 acaagactca 635  Q
    ||||| ||||    
T  12359796 acaaggctca 12359787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 16836384 - 16835769
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||  |||    
T  16836384 catgaagcttcacaacattatgaatgtaaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgataggaatgaagtgcgccgactttgtcaacttgtc 16836285  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    ||| || |||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16836284 gaccacaacccaaatagaatcatgtcctcttggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggcacatctaac 16836185  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  16836184 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtgaagcacgcatacacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggacc 16836085  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||  || ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  |  | ||    
T  16836084 accaaaacaactttttcaactcatgatacatcttcgtagctccgggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaacttttttgattc 16835985  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | |   |||| |    
T  16835984 ttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatcttaatactccctgatcatcaactttgaagtcactatcttcagtgccattaccagcaacaatcaga 16835885  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||| ||||| | |||| | | ||| ||||||||||||||  ||||||| | ||| | |||||||| ||| |||||||| | |||||  |||| ||| |    
T  16835884 tcaaccaacttgacatccacctgctgtgcttctcggatactactcaagaaatcactgttaattttcaacatacccaactgaacactcttcggtgtcaact 16835785  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    |||| |||||||||||    
T  16835784 cacacacaagactcat 16835769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 624
Target Start/End: Original strand, 4678693 - 4679296
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  4678693 catgtagctttaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgataggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatc 4678792  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     || || |||||||| |  ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  4678793 aaccaccacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaat 4678892  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || ||||    
T  4678893 ggtgtcaacaatcctgcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagacc 4678992  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||  |||  ||    
T  4678993 accaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttc 4679092  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||  | ||||||| | |  ||||| |    
T  4679093 ttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgttcatcaaccttgaagtcactatcttcaacgccattaccagcaaccatcaga 4679192  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||| ||||| | |||| ||| ||| ||||||||||||||  |||  || | ||| | ||| || ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  4679193 tcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatactactcagaaaatcactgttaatctttagcatccccaactgtacactttgaggcgacaact 4679292  T
Q  621 caca 624  Q
    ||||    
T  4679293 caca 4679296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 624
Target Start/End: Original strand, 41177777 - 41178380
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  41177777 catgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgataggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatc 41177876  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     || || |||||||| |  ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  41177877 aaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaat 41177976  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || ||||    
T  41177977 ggtgtcaacaatcctgcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagacc 41178076  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  |||  ||    
T  41178077 accaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggatcaactttttcatttc 41178176  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||  | ||||||| | |  ||||| |    
T  41178177 ttcattatcaggaatacaaattctacctctgattctcaacacaccctgttcatcaaccttgaagtcactatcttcaacgccattaccagcaaccatcaga 41178276  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||| ||||| | |||| ||| ||| ||||||||||||||  |||  || | ||| | ||| || ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  41178277 tcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatactactcagaaaatcactgttaatctttagcatccccaactgtacactttgaggcgacaact 41178376  T
Q  621 caca 624  Q
    ||||    
T  41178377 caca 41178380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 16380802 - 16380199
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | ||| |  ||    
T  16380802 catgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgataggaataaaatgtgccgactttgacaatctatc 16380703  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     || || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  16380702 aaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaagcttgtcacgaaatccatagaaatgctatcccatttccactctggtacatccaac 16380603  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||  ||||| ||| |||    
T  16380602 ggcgtcaacaatcctgcaggcttttgatgctcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatacacaaaatgagcgacatctcaattcaacccgtacc 16380503  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  |||| ||    
T  16380502 accaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaattc 16380403  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| | |   ||||||    
T  16380402 ttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtgccattaccagtaacaatcaaa 16380303  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||| ||||| | |||| | |  || ||||||||||||||  |||  || | ||| | ||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  16380302 tcaaccaacttgacatccacctgttgtgcttctcggatactactcagaaaatcactgttaatctttagcatgcccaactgtatgctttgaggcgacaact 16380203  T
Q  621 caca 624  Q
    ||||    
T  16380202 caca 16380199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 187 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 31694894 - 31694451
Alignment:
Q  187 gatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataa 286  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||     
T  31694894 gatactgtcccacttccactccggcacatttaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacatgcatac 31694795  T
Q  287 acaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactct 386  Q
    ||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  31694794 acaaaatgagcgacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaacttcttcagatcataatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactct 31694695  T
Q  387 tgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatc 486  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||  |||| |||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  31694694 tgtgactttcctctaaaatcaactttttcaattcgtcatcatcaggaatgcaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtc 31694595  T
Q  487 actatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttc 586  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |  ||| || ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||||| | ||||| ||| |||    
T  31694594 actatcctcagtgccattaccagcaaccattaagtcaacaaacttcacatccacttgctgtgcttctcgaatactattcaagaaatcactattaatcttc 31694495  T
Q  587 agcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaag 630  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31694494 agcatccccaactgaacactctgaggtgtcaattcacagacaag 31694451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 624
Target Start/End: Original strand, 44777502 - 44778105
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  44777502 catgtagcttcacaacactatgtatataaatttcagccaactgagctaccggataattgatgttgataggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatc 44777601  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     || || |||||||| |  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||     
T  44777602 aaccaccacccaaatcgaatcatgtcccttcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactctggtacatccaat 44777701  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || ||||    
T  44777702 ggtgtcaacaatcctgcgggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagacc 44777801  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||  |||  ||    
T  44777802 accaaaacagctttttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttc 44777901  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||  |  ||||||| | |  ||| | |    
T  44777902 ttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatcttagcacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcgataccattaccagcaaccattaga 44778001  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||| ||||| | |||| ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||| | ||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  44778002 tcaaccaacttgacatccacttgctgcgcttcccggatactattcaggaaatcactgttaatctttagcatccccaactgtatgctctgaggcgacaact 44778101  T
Q  621 caca 624  Q
    ||||    
T  44778102 caca 44778105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 507
Target Start/End: Original strand, 13942279 - 13942765
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  13942279 catgtagcttcaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgataggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatc 13942378  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     || || |||||||| |  ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  13942379 aaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaat 13942478  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    | ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| || || |||||||||||||  ||||| || ||||    
T  13942479 gatgtcaacaatcctgcaggtttctgatgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacgaaatgagcaacatctcgcttcaacccagacc 13942578  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||  |||  ||    
T  13942579 accaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttc 13942678  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacc 507  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||    
T  13942679 ttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatcttagcacaccctgatcatcaacctggaagtcactatcttcaatgccattacc 13942765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 8758956 - 8758416
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  8758956 catgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgataggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatc 8758857  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     || || |||||||| |  ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  8758856 aaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaat 8758757  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || ||||    
T  8758756 ggtgtcaacaatcctgcaggtttctggtgttcaactttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagacc 8758657  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||  |||  ||    
T  8758656 accaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttc 8758557  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||  |||  | ||||||| | |  ||||| |    
T  8758556 ttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgttcatcaaccttgaagtcactattttcaacgccattaccagcaaccatcaga 8758457  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatact 561  Q
    ||||| ||||| | |||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  8758456 tcaactaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatact 8758416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 194 - 630
Target Start/End: Original strand, 31939331 - 31939767
Alignment:
Q  194 tcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaact 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| |    
T  31939331 tcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgaaggcttctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacatgcatacacaaaat 31939430  T
Q  294 gagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgact 393  Q
    |||| || || | |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  31939431 gagcgacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcagatcataatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacccttgtgact 31939530  T
Q  394 ctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcc 493  Q
     ||||| | |||||||||  |||| |||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31939531 ttcctctaaaatcaactttttcaattcgtcatcatcaggaatgcaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcc 31939630  T
Q  494 tcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattc 593  Q
    |||||| ||||||| | |  ||| || ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |    
T  31939631 tcagtgccattaccagcaaccattaagtcaacaaacttcacatccacttgctgtgcttctcgaatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatcc 31939730  T
Q  594 ccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaag 630  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31939731 ccaactgaacactctgaggtgtcaattcacaggcaag 31939767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 43 - 498
Target Start/End: Original strand, 15227926 - 15228381
Alignment:
Q  43 aatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtca 142  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| |||    
T  15227926 aatgtaaatctctgccaactgtgccaccagaaaactaatattaatcggaataaagtgtgctgacttcgtcaatctatcaacaactacccatatggcatca 15228025  T
Q  143 tgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggct 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||  || ||||| |||||  |||||||||||||  |  |||    
T  15228026 tgccctctcggagtattcggtaaacttgttacaaagtccatggatatgctatcccatttcctttctggtacttctaatagtgtcaacaacccaacaagct 15228125  T
Q  243 tctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatc 342  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  15228126 tctgatgttcaactttagatttctgacaagtcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagtc 15228225  T
Q  343 atggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaact 442  Q
    ||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| || || |||||  ||||||| || || | ||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||| ||| |    
T  15228226 atgatacatctttatagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaacgttttcaactcatcattatcaggaatagaaatt 15228325  T
Q  443 ctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||  ||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15228326 cttactcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 15228381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 497
Target Start/End: Original strand, 14086949 - 14087404
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| |||||||| || ||||| || |||||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |  ||||| || ||||| || |  ||    
T  14086949 gaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatc 14087048  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||     
T  14087049 atgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggt 14087148  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  14087149 ttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccaggccaccaaaacagctttttcaaat 14087248  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    | || ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || | ||||||| |  ||| ||| || ||||| ||||| ||||     
T  14087249 cgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtctggaatgcaaat 14087348  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcag 497  Q
    ||| ||||||||   || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14087349 tctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcag 14087404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 10419899 - 10419305
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  |    
T  10419899 tgaatgtaaatctccgccagctgagctactggataacttatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaat 10419800  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    | || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||    
T  10419799 cgtgtcctctcggggtattgggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtatatccaacggtgtcaacaatcccgcagg 10419700  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| |||||| | || |||||  | ||||| |  |||||||||||||  ||||||||     
T  10419699 cttctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacacgcatacacaaaccgcgcgacatccttcttcaatctagaccaccaaaacaacttcttcaag 10419600  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  ||||||| ||||| || || | |||||||||| |||| || |||||||| |||| |||||    
T  10419599 tcatgatacattttcgtagctcctggatgaatactcaaattactcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcgggaacacaaa 10419500  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| ||||| |||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||    |  ||| ||||| |||||||| | |||  |    
T  10419499 ttctgcctctaaatctcaatacaccttgttcatcaactttgaaatcaccatcctcagcttgattactatcaaccattaaatccacaaacttgacatcaac 10419400  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |   || ||||||| |||||| |||||||||| |||||  || |||| ||| |||||||| | ||| |||| ||| |||||||| || |||||||    
T  10419399 tcgttgtgcttctctgatactattcaagaagtcactattgatcttcaacatacccaactgcacactttgagatgataattcacacactagactca 10419305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 47 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13971968 - 13971518
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || ||||| || |||||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |  ||||| || ||||| || |  ||||| |    
T  13971968 taaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtc 13971869  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13971868 ctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtatatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctg 13971769  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||     
T  13971768 atgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccagaccaccaaaacagctttttcaagtcgtga 13971669  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || | ||||||| |  ||| ||| || ||||| ||||| |||| ||| |    
T  13971668 tacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtcgggaatgcaaattctgc 13971569  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcag 497  Q
    |||||||   || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13971568 ctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcag 13971518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 275 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 13320122 - 13319762
Alignment:
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  13320122 aaacacgcatacacaaactgagcgacgtcacgcttcaaaccagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacattttcgtagctcccgggtgaatac 13320023  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||  | ||||  ||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||||||||    
T  13320022 tcaatctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaaccatcatcatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatc 13319923  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtta 574  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| | | |||| ||||||||||| || | |||  | | ||||||||| |||||||| |||||||| | |    
T  13319922 aaccttgaaatcactattctcagtttcataaccagcaatcattaaatcaacaaattttacatctacctgctgagcttcacggatactattcaagaaatca 13319823  T
Q  575 ctatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || | ||| |||| ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13319822 ctgttaatcttcaacatccccgactgaatactttgaggtgacaattcacaaacaaggctca 13319762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 10906478 - 10906932
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||      
T  10906478 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgc 10906577  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || ||    
T  10906578 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggttt 10906677  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||    
T  10906678 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatca 10906777  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  10906778 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 10906877  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  10906878 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaattttaaaatcactgtcttcagt 10906932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 20061916 - 20061462
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||      
T  20061916 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgc 20061817  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || || ||| || || ||    
T  20061816 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcaggttt 20061717  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  20061716 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 20061617  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  20061616 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcctcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 20061517  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  20061516 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 20061462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15589254 - 15588800
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||      
T  15589254 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgc 15589155  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| || || ||    
T  15589154 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggttt 15589055  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  15589054 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 15588955  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  15588954 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 15588855  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  15588854 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 15588800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 5424789 - 5424338
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||   ||    
T  5424789 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctcc 5424690  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || || ||| ||||| |||||    
T  5424689 ctctcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctg 5424590  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  5424589 atgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 5424490  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  5424489 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 5424390  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  5424389 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 5424338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 95 - 498
Target Start/End: Original strand, 13253009 - 13253412
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  13253009 aaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactat 13253108  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  13253109 cccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactg 13253208  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  13253209 tgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactc 13253308  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcct 494  Q
    || |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |    
T  13253309 tcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtctt 13253408  T
Q  495 cagt 498  Q
    ||||    
T  13253409 cagt 13253412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 16636041 - 16636495
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||      
T  16636041 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggcaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgc 16636140  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || ||    
T  16636141 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggttt 16636240  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  16636241 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 16636340  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  16636341 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 16636440  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  16636441 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 16636495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 43163365 - 43163819
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||      
T  43163365 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgc 43163464  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || ||    
T  43163465 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggttt 43163564  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  43163565 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 43163664  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  43163665 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 43163764  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  43163765 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 43163819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 95 - 487
Target Start/End: Original strand, 15339588 - 15339980
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15339588 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactat 15339687  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  15339688 cccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcgggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactg 15339787  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  15339788 tgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactc 15339887  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatca 487  Q
    || |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||||    
T  15339888 tcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatca 15339980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 498
Target Start/End: Original strand, 15248446 - 15248869
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  || ||||  |||||||| |||| || |||| | ||||| | ||| |||||||| ||    
T  15248446 aactgatattaatcggaatgaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgttattccctttaggagtatacggcaaactcgtcac 15248545  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || || || ||||| ||||||||  |||||||||| | |  || || ||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  15248546 aaaatccatggatatgctgtcccatttccactctagtacatctaaagataccatcatcccagcaggtttttgatgctcaactttcgacttctgacaaatc 15248645  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  15248646 aaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatac 15248745  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | ||||| || |||||||||| |||| ||| ||| || | |||||||||||||| ||| ||||  || | || ||| |||||||||||    
T  15248746 tcaagctacttctatgactttcttcaagaatcatcttcttcatctcatcgtcgtcaggaatacaaattctgcctcgaaaacgcaacactccctgatcatc 15248845  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     | ||| ||||||||||| |||||    
T  15248846 gattttaaaatcactatcttcagt 15248869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 10005868 - 10006322
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||      
T  10005868 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgc 10005967  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||  | ||||| |||  || ||  || || || ||    
T  10005968 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcgcgtctaaaggtaccatcattccagcaggttt 10006067  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||    
T  10006068 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatca 10006167  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||| ||| || ||||||| ||    
T  10006168 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcatcgtctgggatacaaattc 10006267  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  10006268 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 10006322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 498
Target Start/End: Original strand, 15209190 - 15209613
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |  || ||||  | |||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||| ||    
T  15209190 aactgatattaatcggaatgaaataagccgactttgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcac 15209289  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| | |  || || ||| || || |||||||||||||  || ||||||||||| |||    
T  15209290 aaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaaagataccatcatcccagcaggtttctgatgctcaattttcgacttctgacaaatc 15209389  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  15209390 aaacaggaatacacaaactgcgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagcacccggatgaatac 15209489  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| || | |||| ||| ||||| ||| ||||  || | || ||| || ||||||||    
T  15209490 tcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcgtcgtcaagaaaacaaattctgcctcgaaaacgcaacactccatgatcatc 15209589  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     | ||| ||||||||||| |||||    
T  15209590 gattttaaaatcactatcttcagt 15209613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 489
Target Start/End: Original strand, 6601004 - 6601449
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||||| |  || ||||  |||||||| | |||      
T  6601004 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcgc 6601103  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  || || ||| ||||| ||    
T  6601104 tccctctcggagtattcggaaaacttgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattccggcacatccaaaggtaccatcatcccagcgggttt 6601203  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||  ||||||||  ||||||||||| |  ||||| | ||||    
T  6601204 ctgatgctcgaccttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcttgtttcaaactagaccaccaaaaaatcttctttagatca 6601303  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  6601304 tgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtcgggaatgcaaattc 6601403  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    | |||| ||||| || ||| || | |||||| | ||| ||||||||    
T  6601404 tccctcggaatctcaacacgccttcatcatcgattttaaaatcact 6601449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13322506 - 13322293
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||| |||||| || ||||| || |  |    
T  13322506 tgaatataaatctctgccaactgagctaccggataactgatattaatcgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaat 13322407  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  13322406 catgtcctctcggagtattaggtaaactcgtcacaaaatccatagagatgctgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaga 13322307  T
Q  241 cttctgatgctcaa 254  Q
    | || |||||||||    
T  13322306 cctccgatgctcaa 13322293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Original strand, 47124841 - 47124978
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47124841 actctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 47124940  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  47124941 atccttcagtaactctaaccacctcctctgcctcatgt 47124978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 26792258 - 26791807
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| || || || || ||  |||| |||||||| || || ||||| ||| |||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  26792258 taaatctctgccaaatgggcaacggggaaactaatattaattggtataaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 26792159  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  26792158 ctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 26792059  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  26792058 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 26791959  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  26791958 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 26791859  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  26791858 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 26791807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 48425715 - 48426169
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||  || ||||  |||||||| ||||| |    
T  48425715 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgt 48425814  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||| | ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| ||||| ||    
T  48425815 tccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggttt 48425914  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |  |||||||  || |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  48425915 ctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggattacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 48426014  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  48426015 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 48426114  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  48426115 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 48426169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15348104 - 15347681
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||   ||    
T  15348104 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctcc 15348005  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  15348004 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 15347905  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||||    
T  15347904 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgg 15347805  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  15347804 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcgagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 15347705  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgat 470  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||    
T  15347704 ctcggaatctcaacacaccttgat 15347681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15724745 - 15724342
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15724745 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactat 15724646  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  15724645 cccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactg 15724546  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  15724545 tgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactc 15724446  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcct 494  Q
    || |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||| | ||| |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |    
T  15724445 tcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacagattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtctt 15724346  T
Q  495 cagt 498  Q
    ||||    
T  15724345 cagt 15724342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 16756447 - 16756017
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||      
T  16756447 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgc 16756348  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | ||||| || |||  || || ||| ||||| ||    
T  16756347 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattccagcacatccaaaggtaccatcatcccagcgggttt 16756248  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||| ||| || |  || || | ||||    
T  16756247 ctgatgctcgaccttcgactcctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagacccccagaaaatcttttttagatca 16756148  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  16756147 tgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatgcaaattc 16756048  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    | |||| ||||| || ||| || ||||||||    
T  16756047 tccctcggaatctcaacacgccttgatcatc 16756017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Original strand, 28755215 - 28755352
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28755215 actctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaagcatccgcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcaaa 28755314  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28755315 atccttcagtaactctaaccacctcctctgcctcatgt 28755352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 53384880 - 53384435
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || ||||| ||||| |  || || |  |||||||| || ||      
T  53384880 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgc 53384781  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| || |||  || || ||| ||||| ||    
T  53384780 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattccgacacatccaaaggtaccatcatcccagcgggttt 53384681  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |  || |||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  53384680 ctgatgctcgacctttgacttctgacaaactaagcaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 53384581  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| || | ||| |||||||||| ||    
T  53384580 tgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcgtcgtctggaatacaaattc 53384481  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    | |||| ||||| || ||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  53384480 tccctcggaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcact 53384435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 16412141 - 16411699
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| || || | ||    
T  16412141 taaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttcc 16412042  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |  || |||||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  16412041 ctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattttggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 16411942  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||     
T  16411941 atgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtga 16411842  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| |||||||||| ||| |    
T  16411841 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaacctcttcattgtctggaatacaaattcttc 16411742  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  16411741 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcact 16411699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Original strand, 12498519 - 12498952
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| ||||||||| |||| |  || ||||  |||||||| | ||||| ||    
T  12498519 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcatcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattcc 12498618  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||| |  || ||  || || || |||||    
T  12498619 ctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatagatatactatcccatttccattctggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttctg 12498718  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| | || ||| ||||||||||| |  ||||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||| || |||||||| || |  ||||| | ||||||     
T  12498719 atgtttaatcttcgacttctgacaaactaaacaagaatacacaaattgtgccacatcgcatttcaatccagaccaccagaaaatcttctttagatcatga 12498818  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||  | ||    
T  12498819 tacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcctcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaatgcaaatccgac 12498918  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaacttt 480  Q
    ||| ||||| || |||||| || ||||| |||||    
T  12498919 ctcggaatctcaacacaccatggtcatcgacttt 12498952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 14876277 - 14875809
Alignment:
Q  127 tacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtc 226  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  |    
T  14876277 tacccaaattgcgtcattccctctaggagtattctgcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagatacc 14876178  T
Q  227 aacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaa 326  Q
    | ||  || || || |||||||| |||| |||  |||||||| | |  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| |    
T  14876177 atcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcaacttctgataaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaaaccagaccaccaga 14876078  T
Q  327 acagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcatt 426  Q
    | | |||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | | |||||  ||||||||||  ||| ||| ||| ||||     
T  14876077 aaattttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctataactcttttcaagaatcattttcttcatctcttcatc 14875978  T
Q  427 gtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaaca 526  Q
     ||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| || ||||| || || || |||| ||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||    
T  14875977 atcaggaatacaaattcaacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgacctt-aagtcaccatcttcagtctgattacttgcaaccaacaagtctaca 14875879  T
Q  527 aacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattccca 596  Q
    ||||| |||||  |||| || || |||   ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  14875878 aacttgatatcaactttttgtgcctctttaatacttttcaaaaattcactatcaattttcagcattccca 14875809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15402321 - 15401925
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15402321 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcatactcgtcacaaaatccatggatatactat 15402222  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || ||||| |||||||||||||| || |||       | |  ||||||| ||| ||||||||    
T  15402221 cccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcgggtttctgatgctcaactttcgac-------aaactaaacaggaatacacaaactg 15402129  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  15402128 tgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatattctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactc 15402029  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcct 494  Q
    || |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |||  ||||| || |||||| |||||||||| ||| |||||||| || |    
T  15402028 tcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttccttggaatctcaacacaccttgatcatcaattttaaaatcactgtctt 15401929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 407
Target Start/End: Original strand, 9523018 - 9523350
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || |||| ||||||||| | ||||| |||| | ||||| ||||| ||||| || ||    
T  9523018 aactgatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacccaaatcgggtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcac 9523117  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||| ||  || || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  9523118 aaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaatggtatcatcataccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatc 9523217  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||||| | ||| |  |  |||||||||||||  ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| |    
T  9523218 aaacaagaatacacaaactgtgcaacatcacgtttgagtctagaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgaatgaatac 9523317  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 407  Q
    ||||  ||||  | |||||||| ||||||||||    
T  9523318 tcaagttacttctatgactctcttcaagaatca 9523350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15952822 - 15952680
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||   ||||| || ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |    
T  15952822 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataagcaatattgatcggaataaagtgtgccgacttcgtcagcctgtcgacaaccacccaaatggcat 15952723  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccat 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15952722 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccat 15952680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16492045 - 16491647
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |  || ||| |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  16492045 gaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtc 16491946  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| | ||| ||| |||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| || |||||||||| |  || ||  || || ||     
T  16491945 attccctttaggagtatgcggaaaaatcgtcacaaaatccatggatatattatcccatttccactctggcacatctaacgataccatcataccagcaggt 16491846  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| || | || ||| | ||||||||||||||  ||||| | ||    
T  16491845 ttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacgtcgcgttacaatctggaccaccaaaacaaattctttagat 16491746  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  |||| || ||   ||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  16491745 catgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttttatggtactcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaa 16491647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 16337739 - 16337607
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16337739 ttcaccatcaaagcagacatatgtaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacatcggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcct 16337640  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  16337639 tcagtaactctaaccatctcctctgcctcatgt 16337607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 449
Target Start/End: Original strand, 17490149 - 17490523
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || | ||  |||||||| ||||||| |||| |  |||| ||||| |||||||  ||    
T  17490149 aactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaataatcacccaaattgcgtcattccctttaagagtattcggcaaactcgacac 17490248  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || || ||||| || |||||||| || |||||||| |    || ||  || || || ||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  17490249 aaaatccatggatatgctatctcatttccactctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatc 17490348  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||| | ||| ||||||| |||||| || | |||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  17490349 aaacaagaatacacaaactaagcaacgtcgcgtttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatac 17490448  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctc 449  Q
    ||||  ||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  17490449 tcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaatcctacctc 17490523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15015620 - 15015284
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||| || || ||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||| |  |  || |||| || |||||| || ||    
T  15015620 gaatataaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatattaatcggaaccaaatgagctgacttcgttagtctatccacaattatccaaatcgcatc 15015521  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||| ||| | ||||| ||||  |||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||||| |||  | ||     
T  15015520 atgtccttttggagtattcgacaaactcttcacaaaatccatggatatactatcccacttccactcgggaatatctaaagatgtcaacatcccaacaggt 15015421  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||  ||||| | | |||||||||| |  ||||||||||    
T  15015420 ttctggtgttcaactttcgacttctgacaaattaaacacgcatacacaaattgtgccacatctcgcttcaacctgaaccaccaaaataacttcttcaaat 15015321  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaa 378  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15015320 catgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaa 15015284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 351 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 13300066 - 13299889
Alignment:
Q  351 tttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctct 450  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||  | ||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  13300066 ttttcgtagctcccgggtgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaaccatcatcatcaggaatacaaattcttcctct 13299967  T
Q  451 gaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaa 528  Q
    ||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| | | |||| |||||||||||    
T  13299966 gaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactattctcagtttcataaccagcaatcattaaatcaacaaa 13299889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 351 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 13310724 - 13310547
Alignment:
Q  351 tttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctct 450  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||  | ||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  13310724 ttttcgtagctcccgggtgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaaccatcatcatcaggaatacaaattcttcctct 13310625  T
Q  451 gaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaa 528  Q
    ||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| | | |||| |||||||||||    
T  13310624 gaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactattctcagtttcataaccagcaatcattaaatcaacaaa 13310547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14126373 - 14126002
Alignment:
Q  127 tacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtc 226  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |  |    
T  14126373 tacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccaattccattctggcacatctaaagatacc 14126274  T
Q  227 aacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaa 326  Q
    | ||  || || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||| || ||| |||||||| |  ||||| | |||||| || |||||||| |    
T  14126273 atcataccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacgggaatacacaaactgtgtcacatcacgtttcaatccagaccaccaga 14126174  T
Q  327 acagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcatt 426  Q
    | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| |||  |||     
T  14126173 aaatcttctttaaatcttgatacatcttcgtagctcccggttgaatgctcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcatcatctctacatc 14126074  T
Q  427 gtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    || |||||| ||||  | ||||| ||||| || |||||| |||| ||| ||||| || |||| ||| |||||    
T  14126073 gtaaggaatgcaaatacaacctcggaatctcaacacaccatgataatcgactttaaagtcaccatcttcagt 14126002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 666 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 16328857 - 16328755
Alignment:
Q  666 ttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaaccacctcctctgcctga 765  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |    
T  16328857 ttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcgtaatccttcagtaactctaaccatctcctgtgcctca 16328758  T
Q  766 tgt 768  Q
    |||    
T  16328757 tgt 16328755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 639 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 11960393 - 11960264
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11960393 accatcaaagcagacatatgcaatgttttcctcctcaatgcatcagcaaccacattggccttactaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttca 11960294  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | |||| | ||||||||||| ||||    
T  11960293 gtagttctaacaatctcctctgcctcatgt 11960264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16806785 - 16806425
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || || | |||| |||| | ||| | ||    
T  16806785 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacctaaattgtgtcgttcc 16806686  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |  || ||  || || || |||||    
T  16806685 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaagtccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctg 16806586  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||     
T  16806585 atgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtga 16806486  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 407  Q
    ||||| || ||||| ||  | ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||    
T  16806485 tacatcttcgtagctcctagatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 16806425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 440
Target Start/End: Original strand, 16371732 - 16372076
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| || ||||||||||| |  || ||||  ||||||||  |||||| |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  16371732 aaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactat 16371831  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| |  ||||| | ||| ||||||||    
T  16371832 cccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaagaatacacaaactg 16371931  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||| | |||| |||| |||||||| || |  ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  16371932 tgccacatcgcgtttc-aaccagaccaccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactc 16372030  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    || ||||||||||  ||| ||| ||| | ||  |||||||||||||    
T  16372031 tcttcaagaatcattttcttcatctctttatcatcaggaatacaaa 16372076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 318 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14580530 - 14580399
Alignment:
Q  318 accaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaa 417  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| | |     
T  14580530 accaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcctgggtgaatactcaagctacttctgtgactctcctcaagaatcatcttcttaat 14580431  T
Q  418 ctcgtcattgtcaggaatacaaactctacctc 449  Q
    ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  14580430 ctcttcatcgtctggaatacaaattctacctc 14580399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 31939805 - 31939937
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||  || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  31939805 ttcaccatcaaagcagacatatgcagcgttttcctactcaaagcatctgcaactacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaagtcataatcct 31939904  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  31939905 tcaacagctccaaccacctcctctgcctcatgt 31939937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 639 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 13319726 - 13319597
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  13319726 accatcagtgcagacatatgtaaggtcttcctgctcaacgcattcgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaagtcataatccttca 13319627  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
      | || |||||| ||||||||||| ||||    
T  13319626 acagctctaaccatctcctctgcctcatgt 13319597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 407
Target Start/End: Original strand, 16692463 - 16692795
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    |||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||| |   | || | |||||||||  |||||| |||| | ||||| ||||| |  ||||| ||    
T  16692463 aactaatattaatcggtaggaaatgagccgacttcgtcaatctaccaacgattacccaaattacgtcattccctttaggagtattcggcaggctcgtcac 16692562  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| || || | |||||| | |  || ||  || || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |      
T  16692563 aaaatccatggatatactatcccatttccattctggcatatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaact 16692662  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| |||||||| || |||||||  |||||||| |||||||| || |  ||||| || || || ||||| || ||||| | ||| ||||| |    
T  16692663 aaacaggaatacacaaactgcgccacatctcgcttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaagtcctgatacatcttcgtagctctcggatgaatac 16692762  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 407  Q
    |||| |||||  | |||||||| ||||||||||    
T  16692763 tcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 16692795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 31694413 - 31694281
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||  || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  31694413 ttcaccatcaaagcagacatatgcagcgttttcctactcaaagcatctgcaactacattggctttaccaggatgttaattcaaaccaaagtcataatcct 31694314  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  31694313 tcaacagctccaaccacctcctctgcctcatgt 31694281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 636 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 12359754 - 12359652
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12359754 ttcaccatcaaagcagacatatgcaacgtctttctactcaaggaatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatcct 12359655  T
Q  736 tca 738  Q
    |||    
T  12359654 tca 12359652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 14087590 - 14087707
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||| ||||||||| || || |||||    
T  14087590 gacatgtgtaatgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattggctttacccggatgatagtttaacccaaaatcataatccttcaatagctctaacc 14087689  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  14087690 atctcctctgcctcatgt 14087707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 633 - 736
Target Start/End: Original strand, 14574822 - 14574925
Alignment:
Q  633 tcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaat 732  Q
    ||||| |||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  14574822 tcatttaccatcatagcagacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataat 14574921  T
Q  733 cctt 736  Q
    ||||    
T  14574922 cctt 14574925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 13971332 - 13971215
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||| || || |||||    
T  13971332 gacatgtgtaacgtcttcctactcaaggcatctgcaactacattggctttacccggatgatagttcaacccaaagtcataatccttcaatagctctaacc 13971233  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  13971232 atctcctctgcctcatgt 13971215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 16827415 - 16827328
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  16827415 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaacacattagctttacccggatggtaattcaaactaaaatcataatccttca 16827328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 16835734 - 16835640
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16835734 accattaatgcagacatgtgcaaagtctttctgctcaacgcatccgcaactacattggctttatcaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 16835640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 10419269 - 10419140
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||| || |    
T  10419269 accatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaactacattagctttacccggatgatagttcaaaccaaaatcataatctttta 10419170  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
     |||||  | ||| ||||||||||| ||||    
T  10419169 ataactcaagccatctcctctgcctcatgt 10419140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 12179240 - 12179372
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||  || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12179240 ttcaccatcatagcagacatatgcaacgttttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttgcccggctggtaattcaaaccaaaatcataatcct 12179339  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||| || |||||||| ||||    
T  12179340 tcaacagctctaaccatcttctctgcctcatgt 12179372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 293
Target Start/End: Original strand, 17193501 - 17193621
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaga 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||  |  || ||| || |  || |||||||| |||| ||| ||||||||||| |    
T  17193501 acaaaatccatagagatactatcccacttccactctggcacaaacaacatttgcatcaaacccgatggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaa 17193600  T
Q  273 tcaaacaggcataaacaaact 293  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  17193601 tcaaacaagcataaacaaact 17193621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 5424165 - 5424066
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  5424165 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaagccaaagtcataatctttca 5424066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 15588627 - 15588528
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  15588627 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 15588528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 16636668 - 16636767
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  16636668 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 16636767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 20061289 - 20061190
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  20061289 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 20061190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 43163992 - 43164091
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  43163992 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 43164091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 48426342 - 48426441
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  48426342 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 48426441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 6152088 - 6151991
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  6152088 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagccttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 6151991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 6601631 - 6601728
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  6601631 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaagtcataatcctt 6601728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 407
Target Start/End: Original strand, 15062210 - 15062375
Alignment:
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||| |  ||||| | ||| |||||||  || |||||   |||||| || |||||||| || |  ||||| | ||    
T  15062210 ttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaagaatacacaaactatgccacatcaagtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttagat 15062309  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 407  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  15062310 catgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctactcctatgactctcttcaagaatca 15062375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 17187291 - 17187408
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| | ||||||| ||||||||| || || |||||    
T  17187291 gacatatgcaatgccttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccgggtgatagttcaaactaaaatcataatccttcaatagctctaacc 17187390  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  17187391 atctcctctgcctcatgt 17187408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 18133570 - 18133453
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || | ||  || |||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18133570 accatcaaagcagacatatgcaacgttttcctacttaaggtatatgcaaccacattagctttacccggatggtaattcatgccaaaatcataatccttca 18133471  T
Q  739 gtaactttaaccacctcc 756  Q
      | || |||||||||||    
T  18133470 acagctctaaccacctcc 18133453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 25767223 - 25767320
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||   |||||| ||||||||    
T  25767223 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagccttcccaggatgataactcaattgaaaatcgaaatcctt 25767320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 195
Target Start/End: Original strand, 15062075 - 15062175
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| || ||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15062075 aaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactat 15062174  T
Q  195 c 195  Q
    |    
T  15062175 c 15062175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 16491404 - 16491316
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcag 739  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||    
T  16491404 gacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatcttcaacaacattagctttacccggatgatagctcaacccaaaatcataatccttcag 16491316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 10006495 - 10006594
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||| |||||||||    
T  10006495 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccgaagtcataatccttca 10006594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 10907105 - 10907204
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||| |||||||||    
T  10907105 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccgaagtcataatccttca 10907204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 13253585 - 13253684
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  13253585 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgggtgataattcaaaccaaagtcataatccttca 13253684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 15260525 - 15260624
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  15260525 accatcatagcggacatatgcaaagttttcctacttaaggcatctgcaacaacattagccttacccggatggtaattcaactcaaaatcataatctttca 15260624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 15401752 - 15401653
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  15401752 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 15401653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6152584 - 6152550
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6152584 acaaaatccatagagatactatcccacttccactc 6152550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 14580177 - 14580083
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  14580177 accatcatagcggacatgtgtaaattcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaaatcataatc 14580083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 709
Target Start/End: Original strand, 17490757 - 17490815
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatg 709  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||    
T  17490757 gacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttaccaggatg 17490815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 663 - 733
Target Start/End: Original strand, 44778176 - 44778246
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  44778176 gtcttcctactcaatgcatcagcgactacattagctttgcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 44778246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 6711646 - 6711549
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| | | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||   ||| |||||||||||    
T  6711646 accatcaaagcagacatatgcaacggcatcctactcaaagcatctgccaccacattcgccttcccgggatggtaactcaactgaaagtcaaaatcctt 6711549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 8273634 - 8273537
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  8273634 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 8273537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 13966579 - 13966482
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  13966579 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactaaaaatcaaaatcctt 13966482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 16741938 - 16741841
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  16741938 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 16741841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 30138711 - 30138808
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  30138711 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 30138808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 30148262 - 30148359
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  30148262 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 30148359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 53384253 - 53384156
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |  ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  53384253 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaataacattagctttacccggatgttaattcaaaccaaagtcataatcctt 53384156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 498
Target Start/End: Original strand, 15234165 - 15234249
Alignment:
Q  414 tcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||  ||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15234165 tcaactcatcattatcaggaatagaaattcttactcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 15234249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 763
Target Start/End: Original strand, 16258049 - 16258173
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| |  ||||| ||| ||||   ||||||||||||||| |    
T  16258049 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttctgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaa 16258148  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcct 763  Q
    |  | || ||||| |||||||||||    
T  16258149 gatatttcaaccatctcctctgcct 16258173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 16806182 - 16806082
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||  |||| ||||||||  |||| ||| |||| ||||    
T  16806182 accatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacctagatgataattcaaagcaaagtcataatctttca 16806083  T
Q  739 g 739  Q
    |    
T  16806082 g 16806082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 763
Target Start/End: Original strand, 18750849 - 18750973
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||  |||||||| |    
T  18750849 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagccttccctggatgataactcaactgaaaattgaaatccttaa 18750948  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcct 763  Q
    |  |||  |||||||| ||||||||    
T  18750949 gatactccaaccaccttctctgcct 18750973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 15340164 - 15340263
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||  |||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  15340164 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacagcattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 15340263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 15724169 - 15724070
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  15724169 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctacaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 15724070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 663 - 733
Target Start/End: Original strand, 13942953 - 13943023
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13942953 gtcttcctgctcaatgcatcagcgactacattagcttttcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 13943023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 663 - 733
Target Start/End: Original strand, 41178451 - 41178521
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  41178451 gtcttcctactcaacgcatccgcgactacattagcttttcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 41178521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 267028 - 266987
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtaca 214  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  267028 acaaaattcatagaaatattatcccacttccactccggtaca 266987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 15347480 - 15347395
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaa 724  Q
    |||||||  |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15347480 accatcatggcggacatatgcaatttcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaa 15347395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 15611008 - 15611105
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   ||||||||| |||||    
T  15611008 accatcaaagcagacatatgcaaaatcttcctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaagtcctt 15611105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 528; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 41982 - 41367
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41982 catgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 41883  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41882 gacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 41783  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41782 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 41683  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41682 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 41583  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41582 ttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaa 41483  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41482 tcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaatt 41383  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  41382 cacagacaagactcat 41367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 41 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 47028 - 46439
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||| || || |    
T  47028 tgaatataaatctccgccaactaagctatcggataattgatattaatcggaataaaatgcgccgacttcgtcaacctgttgaccacaacccatatagcat 46929  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  46928 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaacccttcagg 46829  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46828 cttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaa 46729  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| | |||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||| |    
T  46728 tcatgattcatttttgtagctcctggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaattaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaga 46629  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||||||  | |  |||||||||||||||||||| |||  |    
T  46628 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagcttcattactagcaaccatcaaatcaacaaacttcacatctac 46529  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaag 630  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  46528 ttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaattcacagacaag 46439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 627
Target Start/End: Original strand, 2632 - 3177
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||  | |||||| ||| ||| |||| | ||||| ||||  |||||||| ||    
T  2632 aactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcagccaaattgcgccattccctttaggagtattcgacaaactcgtcac 2731  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||  || || |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||       ||||| |||    
T  2732 aaaatccacggatatgctatcccatttccattctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgctcaacttt-------tgacaaatc 2824  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  2825 aaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccgggtgaatac 2924  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||  | ||||||||||| ||| |||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  2925 tcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcattaggaatacaaattctgcctcagaatctcaacaccccctgatcatc 3024  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtta 574  Q
     | ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | |  || ||| || |||||||| | |||   |||||| ||||||  |||||| || ||||| | |    
T  3025 gattttaaaatcactatcttcagtctgattactagtaaccaacaagtccacaaacttaacatcggttttctgcgcttctttgatactatttaagaattca 3124  T
Q  575 ctatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    |||||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||    
T  3125 ctatcaatctttagcattcccaacttcacactctgaggtgacaattcgcagac 3177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 41340 - 41203
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41340 actctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 41241  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41240 atccttcagtaactctaaccacctcctctgcctcatgt 41203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 639 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 46398 - 46269
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46398 accatcaaagcagacatatgcaacgttttcctactcaaggcatgtgcaactacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttca 46299  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
      | ||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  46298 acagctccaaccatctcctctgcctcatgt 46269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 728
Target Start/End: Original strand, 3221 - 3310
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatca 728  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || | ||| || ||||| ||||  |||||||| ||| |||||    
T  3221 accatcaatgcggacatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctgcaacaaaattagctttacctggataataattcaacccacaatca 3310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 528; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Original strand, 37677721 - 37678336
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37677721 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 37677820  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37677821 gacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactagttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 37677920  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37677921 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactaagcaacatcccttttcaaaccggacc 37678020  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37678021 accaaaacagtttcttcaaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 37678120  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37678121 ttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagtacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccggaagtcatcaaa 37678220  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37678221 tcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaatcttcaacattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 37678320  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  37678321 cacagacaagactcat 37678336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 484; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 31539715 - 31539100
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31539715 catgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 31539616  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31539615 gacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaac 31539516  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31539515 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggacc 31539416  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  31539415 accaaaacagtttcttcaaatcatgatacattttcgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctccagaatcaacttcttcaactc 31539316  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31539315 ttcattgtcaggaatacaaactctacctgtgaacctcagcacaccctgatcatcaattttgaaatcactatccccagtgtcattaccagaagtcaccaaa 31539216  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31539215 tcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 31539116  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  31539115 cacagacaagactcat 31539100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 627
Target Start/End: Original strand, 20295053 - 20295659
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295053 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccgagtaactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 20295152  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20295153 gacaataacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagataatgtcccacttccagtccggtacatccaac 20295252  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295253 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 20295352  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  20295353 accaaaacagtttcttcagatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatc 20295452  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |  |||||| ||    
T  20295453 atcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactgtcctcggtgtcactaccagtcgtcatccaa 20295552  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20295553 tcaaccaatttcacatccgctttctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgaatactctgaggtgacaatt 20295652  T
Q  621 cacagac 627  Q
    |||||||    
T  20295653 cacagac 20295659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 24099295 - 24098707
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| || |||||||    
T  24099295 taaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattgattggaatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatagcatcatgcc 24099196  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24099195 ctctcgtagtgttcggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatactgtcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctg 24099096  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24099095 atgctcaaccttagacttctgacaagtcaagcaagcataaacaaaatgagcaacatcatgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 24098996  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| ||| |    
T  24098995 tacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaacccatcattgtcaggaatacaaattcttc 24098896  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||| | ||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  24098895 ctctgaacctcaaaacaccctgatcgtcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccagtaatcatcaaatcaacaaacttcaaatccacttgctg 24098796  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  24098795 agcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacagacaaggctca 24098707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 149 - 635
Target Start/End: Original strand, 21951678 - 21952164
Alignment:
Q  149 ctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgat 248  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21951678 ctcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgat 21951777  T
Q  249 gctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggta 348  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  21951778 gctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgaaa 21951877  T
Q  349 catttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacct 448  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21951878 catatttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaaggatcaacttcttcaaatcatcattgttaggaatacaaactcttcct 21951977  T
Q  449 ctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgag 548  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| || |||| |||  ||||||| |    
T  21951978 ctgaatctcagtacaccctgatcatccaccttaaaatcactgtcctcagtgtcactaccagtagtcatcaaatcaaccaatttcaaatctgctttctggg 21952077  T
Q  549 cttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  21952078 cttctcgaatactgttcaaaaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgagatgacagttcacagacaaggctca 21952164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 19662839 - 19662241
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || || |    
T  19662839 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccacatagcat 19662740  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggt----acatctaacggtgtcaacaaccctg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||| |||    
T  19662739 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccataaaaatgctataccacttccactccggccggcacatccaacggtgtcaacaactctg 19662640  T
Q  237 cgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttctt 336  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19662639 caggcttctgatgttcaaccttagacttcagacaagtcaaacatgcatacacaaattgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttctt 19662540  T
Q  337 caaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaata 436  Q
    ||||||||| |||||||| |||||  ||||  |||| || || |||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  19662539 caaatcatgatacattttcgtagcttccggacgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactcgtcattatcaggaata 19662440  T
Q  437 caaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatat 536  Q
    |||| ||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||| | |  |||||||||||| | ||| | ||    
T  19662439 caaattcttcctctgaacctcaatacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatccttagtgccattaccagcaaccatcaaatcaaccagcttgacat 19662340  T
Q  537 cctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || ||| ||| |||||||||||||| |||||||| | | | | ||| |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  19662339 ccacttcctgtgcttctcggatactattcaagaaatcattgttaatcttcagcatccccaactgtacactctggggtgtcaattcacaaacaagactca 19662241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 20939761 - 20939167
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||| | ||| || || | |||||||||||||| |||||| || ||||| || || |    
T  20939761 tgaatataaatctccgccaactgagctaccgaataattgatattaatcgaaataaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcat 20939662  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20939661 catgccctctcggagcgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaataaaatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 20939562  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20939561 cttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaatagcttcttcaaa 20939462  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||  | || || ||||  |||||||| ||||    
T  20939461 tcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaattaacttttttaaatcatcatcatcaggaatgcaaa 20939362  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| | |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |  ||| |||||||||| ||||| |||| |    
T  20939361 ttcttcttctgaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaccttcacatccac 20939262  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20939261 ttgttgtgcttctcggatactattcaagaaattactattaattttcagcatccccaattgtacactctgaggtgtcaattcacagacaaggctca 20939167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 19854974 - 19855560
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||        || ||||| || || |    
T  19854974 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgatcggaataaagtgcgccgactttgtcaacc--------acaacccatatagcat 19855065  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  19855066 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacatccaacggtgtcaacaaccccgcagg 19855165  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||  ||||||| ||| | |||||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  19855166 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaatttgagcaatatcccgtttcaacccagaccaccaaaacagcgtcttcaaa 19855265  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| || || ||| |||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19855266 tcatgatacattttcgtagctcccagatgaatacttaagctattcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactcgtcattatcaggaatacaaa 19855365  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
      || |||||||| | ||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| | |   ||||||||||||||||| | |||| |    
T  19855366 tccttcctctgaacctcaatacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaacaatcaaatcaacaaacttaacatccac 19855465  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19855466 ttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaattcacagacaaggctca 19855560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 20835586 - 20835004
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||  |||||| || ||||| || || |    
T  20835586 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaataaaatgcgtcgactttgtcaacatgtcgaccacaacccatatagcat 20835487  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20835486 catgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 20835387  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||||     
T  20835386 cttctgatgttcaaccttagacatctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaag 20835287  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||           || ||||  || ||||| ||||    
T  20835286 tcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctc-tgaacca-----------tcatcatcatcgggaatgcaaa 20835199  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| | |  ||| |||||||||||||||| |||| |    
T  20835198 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacatccac 20835099  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |   || |||||||||||||| |||||||| | | ||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  20835098 tagttgtgcttctcggatactattcaagaaatcattattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgttaattcacagacaaggctca 20835004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 43 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 20856457 - 20855866
Alignment:
Q  43 aatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtca 142  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |||    
T  20856457 aatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcagaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatca 20856358  T
Q  143 tgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggct 242  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||     
T  20856357 tgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgatatcccatttccactctggtacctccaacggtgtcaacaaacctgcaggcc 20856258  T
Q  243 tctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacat-ctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||  | ||||| ||||| |||||| |||| |||| ||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  20856257 tctgatgttcaaccttagacttctaacaagtgaaacacgcatacacaaaccgagcgacatccttctttaaaaccagaccaccaaaacaatttcttcaagt 20856158  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| || || | |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||     
T  20856157 catgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcctcattgtcaggaatacaaat 20856058  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctct 541  Q
    ||| ||||| |||| || |||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |    |||||  |    ||||||||| |||||||| | |||  ||    
T  20856057 tctgcctcttaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactattctccgctagattactagcgaccatcaaatccacaaacttaacatcaact 20855958  T
Q  542 ttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagact 633  Q
    |  || ||||||| |||||| | |||||| | |||||  || |||||||| |||||||| | ||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  20855957 tgttgcgcttctctgatactatccaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgcacactttgagatgacaattcacacacgagact 20855866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 41353355 - 41352927
Alignment:
Q  46 gtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgc 145  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || || |||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |    
T  41353355 gtaaatctctgccaactgtgcgacagggaaactaatattaataggcagaaaatgagctgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttc 41353256  T
Q  146 cctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttct 245  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| ||||| ||||    
T  41353255 cctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttct 41353156  T
Q  246 gatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatg 345  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||    
T  41353155 gatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcatg 41353056  T
Q  346 gtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactcta 445  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||     
T  41353055 atacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaatcctt 41352956  T
Q  446 cctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  41352955 cctcggaatctcaacacaccttgatcatc 41352927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 50619908 - 50619509
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  50619908 aactgatattaatcgggatgaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttcctctaggagtattcggcaaactcgtcac 50619809  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |  ||  | ||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  50619808 aaaatccatggatatactatcccatttccactctggtacatctaaagataccataatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttttgacaaatc 50619709  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  50619708 aaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatac 50619609  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||  || | || |||||| ||||||||    
T  50619608 tcaagctacttttatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcattgtatggaatacaaattctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatc 50619509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22432814 - 22432600
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || ||||| || |  |    
T  22432814 tgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaat 22432715  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22432714 tatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactctggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 22432615  T
Q  241 cttctgatgctcaac 255  Q
    ||||||||| |||||    
T  22432614 cttctgatgttcaac 22432600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 47 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 51333185 - 51332743
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  51333185 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaatcggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 51333086  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| ||||| |||||    
T  51333085 ctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctg 51332986  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||     
T  51332985 atgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtga 51332886  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  51332885 tacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 51332786  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  51332785 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcact 51332743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 498
Target Start/End: Original strand, 21831018 - 21831421
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  21831018 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggatatactat 21831117  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  21831118 cccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggcttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactg 21831217  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  21831218 tgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgataaatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactc 21831317  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcct 494  Q
    || |||||||||| |||| | | ||| ||||||||  | ||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |    
T  21831318 tcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctaggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtctt 21831417  T
Q  495 cagt 498  Q
    ||||    
T  21831418 cagt 21831421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 380 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23197605 - 23197350
Alignment:
Q  380 ctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactt 479  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  23197605 ctactcttgtcactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaactt 23197506  T
Q  480 tgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatc 579  Q
    | || |||||||| ||||| ||| |||| | |  ||||||||| |||||||| | |||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||     
T  23197505 taaagtcactatcttcagtttcactaccagcaaccatcaaatccacaaacttaacatccacttgctgtgcttcacggatactattcaagaaatcactatt 23197406  T
Q  580 aattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23197405 aatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaattcacagacaagactca 23197350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 31539073 - 31538936
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31539073 actctttcaccatcaaagctgacacgtgcaacgttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 31538974  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31538973 atccttcagtaactctaaccacctcctctgcctcatgt 31538936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 470
Target Start/End: Original strand, 21837617 - 21838040
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  21837617 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 21837716  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| || || |||||    
T  21837717 ctctgggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctg 21837816  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  21837817 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 21837916  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||  | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  21837917 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttattaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 21838016  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgat 470  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||    
T  21838017 ctcggaatctcaacacaccttgat 21838040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Original strand, 37678363 - 37678500
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37678363 actctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaagcatcaacaaccacattggccttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcaaa 37678462  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  37678463 atccttcagtaactctaaccacctcctctgcctcatgt 37678500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 19760561 - 19759985
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||  || ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |  || ||||  |||||||| |||||||    
T  19760561 atgtaaatctccgctaactaagatacatgaaaactgatattaatcgaaattaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatagcgtcat 19760462  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
      ||| |||||||  |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| | |  || ||||||  | |  ||    
T  19760461 ttcctttcggagtactcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatctcatttccactctggcacatctaaagataccatcaacccaacagattt 19760362  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| ||       ||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  19760361 ctgatgctcaacttt-------tgacaaatcaaacatgaatatacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttctttaaatca 19760269  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| ||| |||| || || || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| || | |||||||||||||| ||    
T  19760268 tgatacatctttatagctcctggatggatactcaagctacttatgtgactctcttcaagaatcatctttctcatctcatcgtcgtcaggaatacaaattc 19760169  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctcttt 543  Q
    |||||| ||||| || ||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||| | | | |||  | | |  ||||| |||||||| | |||  | ||    
T  19760168 tacctcggaatcgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcagtctgagtccctccaataaataaatctacaaactttacatcagcctt 19760069  T
Q  544 ctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    ||| ||||||   ||||| ||||  || | ||||||||| ||||||||| | ||||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  19760068 ctgtgcttcttttatactattcataaattcactatcaatcttcagcatttctaacttcacactctgaggtgacacttcacagac 19759985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 440
Target Start/End: Original strand, 20139525 - 20139890
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| || ||||||||||| |  || ||||  |||||||| | ||||| |||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  20139525 aactaatattaatcggaagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgtgtcattccctctaggagtatttggcaaactcgtcac 20139624  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||||||| | |  || ||  || || || |||| ||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  20139625 aaaatccatggatatactatcccatttccactctagcacatctaatgataccatcataccagcaggtttctaatgctcaactttcgacttttgacaaatc 20139724  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  20139725 aaacaagaatagacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatac 20139824  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    |||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| |||  || |||| ||| ||||||||||    
T  20139825 tcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatttcttcatagtctggaatacaaa 20139890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 95 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 16350243 - 16349848
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  16350243 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactat 16350144  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  16350143 cccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactg 16350044  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  16350043 tgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactc 16349944  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaact-ctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    || |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| | || |||| ||||| || |||||| |||| ||| | ||| ||||||||    
T  16349943 tcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattacttcctcggaatctcaacacaccttgattatcgattttaaaatcact 16349848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 489
Target Start/End: Original strand, 19107034 - 19107477
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |  |||||  | ||||||||||| |  || || | ||||||||| ||||| | ||    
T  19107034 taaatctctgctaactgggcaacaggaaaactaatattaattggtagaaaatgaactgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttcc 19107133  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaa-tccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttct 245  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||| | || || |||||||| |||  || ||  || || || ||||    
T  19107134 ctctaggagtattcggcaaactcatcacaaaaatccattgatatactatcccatttcaattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttct 19107233  T
Q  246 gatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatg 345  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |  ||||| | ||| |||||||| || |||||||  ||||||||  ||||||| || |  ||||| ||||||||    
T  19107234 gatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacatgaatacacaaactgtgccacatctcgcttcaaaccaaaccaccagaaaatcttctttaaatcatg 19107333  T
Q  346 gtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactcta 445  Q
     ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| |||||||||| |||     
T  19107334 atacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtggctctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattctt 19107433  T
Q  446 cctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  19107434 cctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcact 19107477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 33390721 - 33390298
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||   ||    
T  33390721 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctcc 33390622  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || | ||| |||  || ||  || || || |||||    
T  33390621 ctctaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtttaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 33390522  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || |||||||| || |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||||    
T  33390521 atgctcaactttcgacttctggcaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgg 33390422  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  33390421 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcgagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 33390322  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgat 470  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||    
T  33390321 ctcggaatctcaacacaccttgat 33390298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 407
Target Start/End: Original strand, 21749603 - 21749968
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  || ||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  21749603 gaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtc 21749702  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |    || ||  || || ||     
T  21749703 attccctttaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctagagacaccatcataccagcaggt 21749802  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||| | ||    
T  21749803 ttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaattgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacatcttctttagat 21749902  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 407  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | |||||||| ||||||||||    
T  21749903 catgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatca 21749968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 21952197 - 21952329
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  21952197 ttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcgtaatcct 21952296  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  21952297 tcagtaactctaaccatctcctctgcctcatgt 21952329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 22361908 - 22361495
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||| | ||||| ||||| |||||||| ||    
T  22361908 aactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcgttccctttaggagtattcggcaaactcgtcac 22361809  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    || ||  || || || ||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  22361808 aaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatc 22361709  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||| | ||| |||||||  ||||| || | |||||| || |||||||||||||  ||||| | |||||| || || || ||||| ||||| ||||| |    
T  22361708 aaacaagaatacacaaactatgcaacgtcgcgtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcatgatagatcttcgtagctcccggatgaatac 22361609  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    ||||  | ||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||  ||||||||||  |||||||  || | ||||||||| ||||||||    
T  22361608 tcaagtttcttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtttggaatacaaatcctacctcgaaacctcagcacaccttgatcatc 22361509  T
Q  475 aactttgaaatcac 488  Q
     | ||| |||||||    
T  22361508 gattttaaaatcac 22361495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 498
Target Start/End: Original strand, 20250464 - 20250919
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  || ||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||     
T  20250464 gaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgta 20250563  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    || ||  || || ||     
T  20250564 attccctttaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatgtatatactatcccatttccactctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggt 20250663  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | | ||| |||||||| |||||||| | |||||  ||  ||||||||||||  ||||| | ||    
T  20250664 ttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaataagaatacacaaactgtgcaacatcacgtttcagtcc-aaccaccaaaacaacttctttagat 20250762  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||  ||||| |||||  ||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||     
T  20250763 catgatacatcttcgtagctcccgaatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaat 20250862  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     |||||||  || | || || ||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  20250863 cctacctcaaaacctcaacataccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 20250919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 229 - 624
Target Start/End: Original strand, 16373378 - 16373774
Alignment:
Q  229 caaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaac 328  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| | | ||||| || | ||| ||||| || |  || || | |||||| || ||||||||||||    
T  16373378 caaccctgcaggtttctgatgctcaactttcgacttcttaaaaatcaagcaagaatacacaaattgtgtcacgtcacgtttcaatccagaccaccaaaac 16373477  T
Q  329 agtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgt 428  Q
    |  |||||||||||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| ||    
T  16373478 aacttcttcaaatcatgatacatcttcgcagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgt 16373577  T
Q  429 caggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaa 528  Q
    | |||||||||| ||||||||  |||| || |||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| | |||||  | |  || ||| || |||||    
T  16373578 ctggaatacaaattctacctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgaccttaaagtcactgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaa 16373677  T
Q  529 cttcatatcctctttctgag-cttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcaca 624  Q
    ||| | |||  ||||||| | ||| |   ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||    
T  16373678 cttaacatcaactttctgcgtcttttttaatacttttcaagaattcactatcaatcttcagcattcccagcttcacactctgaggtgaccattcaca 16373774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 617
Target Start/End: Original strand, 22109872 - 22110259
Alignment:
Q  230 aaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaaca 329  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||   |||||| || |||||||||||||    
T  22109872 aaccctgcaggtttttgatgctcaactttcaacttctaacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcatgtttcaacccagaccaccaaaaca 22109971  T
Q  330 gtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtc 429  Q
      ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||  ||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| |||    
T  22109972 acttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtc 22110071  T
Q  430 aggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaac 529  Q
     |||||||||| ||| |||| ||||| || ||| || || ||||| |  || ||||||||||| ||||| | |||||  | |  || ||| || ||||||    
T  22110072 tggaatacaaattctgcctcggaatctcaacactccttggtcatcgatcttaaaatcactatcttcagtctgattactaggaaccaacaagtccacaaac 22110171  T
Q  530 ttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgaca 617  Q
    || | |||   ||| || ||||||   |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| ||  | ||||||| ||||||    
T  22110172 ttaacatcgattttatgcgcttctttaatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcccagcttcacactctgatgtgaca 22110259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 617
Target Start/End: Original strand, 22113721 - 22114108
Alignment:
Q  230 aaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaaca 329  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||   |||||| || |||||||||||||    
T  22113721 aaccctgcaggtttttgatgctcaactttcaacttctaacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcatgtttcaacccagaccaccaaaaca 22113820  T
Q  330 gtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtc 429  Q
      ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||  ||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| |||    
T  22113821 acttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtc 22113920  T
Q  430 aggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaac 529  Q
     |||||||||| ||| |||| ||||| || ||| || || ||||| |  || ||||||||||| ||||| | |||||  | |  || ||| || ||||||    
T  22113921 tggaatacaaattctgcctcggaatctcaacactccttggtcatcgatcttaaaatcactatcttcagtctgattactaggaaccaacaagtccacaaac 22114020  T
Q  530 ttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgaca 617  Q
    || | |||   ||| || ||||||   |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| ||  | ||||||| ||||||    
T  22114021 ttaacatcgattttatgcgcttctttaatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcccagcttcacactctgatgtgaca 22114108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 636 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 24098674 - 24098572
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24098674 ttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatcagcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcct 24098575  T
Q  736 tca 738  Q
    |||    
T  24098574 tca 24098572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17044707 - 17044314
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| || || || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| ||| |||||||||| |  || || | ||||||||| || || | ||    
T  17044707 taaatctctgccaattgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttcc 17044608  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |  || ||  || || || |||||    
T  17044607 ctctctgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctg 17044508  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |  || |||| ||| |||||||  || ||||||  ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||     
T  17044507 atgctcaatctttgacttctgacaaactaagcaggaatacacaaactttgccacatcttgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtga 17044408  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| |||  ||| ||| ||||||||||    
T  17044407 tacatcttcgtagctcccgggtggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcgggaatacaaa 17044314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 640 - 768
Target Start/End: Original strand, 20295704 - 20295832
Alignment:
Q  640 ccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcag 739  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  20295704 ccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctgctcaaagcatcagcaactacattggccttaccagggtggtaattcaagccaaaatcataatccttcaa 20295803  T
Q  740 taactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
     | || |||||| || |||||||| ||||    
T  20295804 cagctctaaccatcttctctgcctcatgt 20295832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16078268 - 16077990
Alignment:
Q  127 tacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtc 226  Q
    ||||||||| || || | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |  |    
T  16078268 tacccaaattgcatcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaagatacc 16078169  T
Q  227 aacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaa 326  Q
    | ||  || ||  | ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||| | |    
T  16078168 atcataccagcaagtttctgatgctcaatcttcgacttctgacagactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacatttcaaaccagaccactaga 16078069  T
Q  327 acagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaat 405  Q
    | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  16078068 aaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16077990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 19662208 - 19662076
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  19662208 ttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatgataattcaaaccaaaatcataatcct 19662109  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||||||||||||||| ||||    
T  19662108 tcaacagctctaaccacctcctctgcctcatgt 19662076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 19855593 - 19855725
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19855593 ttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatcct 19855692  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||| ||||||||||| ||||    
T  19855693 tcaacagctctaaccatctcctctgcctcatgt 19855725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 20834971 - 20834839
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    |||||||| || || ||||| ||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20834971 ttcaccattaaagcagacatatgcagcgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcct 20834872  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  ||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  20834871 tcaacaactccaaccatctcctctgcctcatgt 20834839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 227
Target Start/End: Original strand, 16369959 - 16370144
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |  ||||  |||||||  |||||    
T  16369959 gaatataaatctctgccaactgagctataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctataaacaatcacccaaaaagcgtc 16370058  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtca 227  Q
    || |||| | ||||| ||||  || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||    
T  16370059 attccctttaggagtattcgacaacctcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctagcacatctaacggagtca 16370144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 639 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 20939131 - 20939002
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||| |||||  | ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20939131 accatcaaagcagacatatgcaacattttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaatttaagccaaaatcataatccttca 20939032  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
      | || |||||| ||||||||||| ||||    
T  20939031 acagctctaaccatctcctctgcctcatgt 20939002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 23197302 - 23197185
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || |||||    
T  23197302 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaacgcatcagcaaccacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctctaacc 23197203  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | || |||||||| ||||    
T  23197202 atcttctctgcctcatgt 23197185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 312
Target Start/End: Original strand, 20937662 - 20937846
Alignment:
Q  128 acccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtca 227  Q
    |||||||| ||||| | |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  ||    
T  20937662 acccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtacca 20937761  T
Q  228 acaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaa 312  Q
     ||  || || || |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  20937762 tcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacagactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaa 20937846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 21744608 - 21744521
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21744608 gacatgtgcaacgtcttcctactcaaagcatctgcaaccacattagctttactcggatggtaattcaacccaaaatcataatccttca 21744521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 20855816 - 20855699
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||  | ||    
T  20855816 gacatgtgcaacgtcttcctactcaacgcatctgcaactacattaactttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatcatttaataactcaagcc 20855717  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  20855716 atctcctctgcctcatgt 20855699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 21234799 - 21234694
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  21234799 accatcaaagcggacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 21234700  T
Q  739 gtaact 744  Q
    | ||||    
T  21234699 gcaact 21234694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 636 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 20061023 - 20060923
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||  || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20061023 ttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttcctactcaacgcatctgcaactacattagctttacccgaatggtagttcaagccaaaatcataatcct 20060924  T
Q  736 t 736  Q
    |    
T  20060923 t 20060923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 16349664 - 16349565
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  16349664 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 16349565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 41352730 - 41352636
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  41352730 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatggtaattcaacccaaagtcataatc 41352636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 22134625 - 22134528
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  22134625 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagccttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 22134528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 431172 - 431084
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcag 739  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  |||||||| ||||||||||    
T  431172 gacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcataatccttcag 431084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 763
Target Start/End: Original strand, 19107659 - 19107783
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  19107659 accatcatagcggacatatacaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 19107758  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcct 763  Q
      || |  | |||||||||||||||    
T  19107759 acaattcaagccacctcctctgcct 19107783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 21831594 - 21831693
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  21831594 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 21831693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 21838241 - 21838340
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  21838241 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 21838340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 20830460 - 20830363
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  20830460 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 20830363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 33390097 - 33390012
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaa 724  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  33390097 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaa 33390012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 16373833 - 16373920
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  16373833 gacatatgcaaagtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaaatcataatctttca 16373920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 21025464 - 21025563
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||  |||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  21025464 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaccattagctttacctggatgataattcaaaccaaattcataatctttca 21025563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 524; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 3264440 - 3263825
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3264440 catgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtc 3264341  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3264340 gacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 3264241  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3264240 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 3264141  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3264140 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 3264041  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3264040 ttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaa 3263941  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3263940 tcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaatt 3263841  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  3263840 cacagacaagactcat 3263825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 29453183 - 29452568
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29453183 catgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatgttaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 29453084  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29453083 gacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 29452984  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29452983 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctccaccttggacttctgacaaaccaaacaggcataaacgaacttagcaacatctcttttcaaaccagacc 29452884  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  29452883 accaaaacagtttcttcaaatcatgatacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatc 29452784  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29452783 atcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcattatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 29452684  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29452683 tcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaatt 29452584  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  29452583 cacagacaagactcat 29452568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 44661512 - 44660897
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  44661512 catgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataattgatattgataggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtc 44661413  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44661412 gacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 44661313  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44661312 ggtgtcaacaaccccgcaggcttctgatgctcagccttggacttctgacagatcaaacaggcataaaagaactgagcaacatcccttttcaaaccggacc 44661213  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44661212 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 44661113  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44661112 ttcattatcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcggtatcattacctgaagtcatcaaa 44661013  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44661012 tcaacaaacttcaaatccactttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcgctatcaattttcaacattcccaactgtatactctgagatgacaatt 44660913  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  44660912 cacagacaagactcat 44660897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 484; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 11206877 - 11206262
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11206877 catgaagcttcaccacactgtgaatgtatatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaatcggtc 11206778  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11206777 gacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaac 11206678  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11206677 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 11206578  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  11206577 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactattgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatc 11206478  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11206477 atcattgtcaggaatacaaacccttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcggtgtcattacctgaagtcatcaaa 11206378  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11206377 tcaacaaactttaaatccactttctgagcttctcagatactgttcaagaaatcactatcaatcttcaacatccccaactgtatactctgagatgacaatt 11206278  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  11206277 cacagacaagactcat 11206262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Original strand, 20891634 - 20892222
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20891634 taaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgcc 20891733  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  20891734 ctctcggagtgttcggtagactcgtcacgaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcatcaaccctgtaggcttctg 20891833  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20891834 atgctcaaccttggacttctgacaaatcaagcaagcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcagatcatgg 20891933  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||| ||||||||||||      
T  20891934 tacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcgttgtcagaaatacaaactcttt 20892033  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||| | ||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||    
T  20892034 ctctgaacctcaggaaaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagcgtcactaccagtagtcatcaaatcaacaaatttcaaatctgctttctg 20892133  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20892134 agcttctcggatactgttcaagaaattactaacaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagaccagactca 20892222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Original strand, 33223575 - 33224163
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  33223575 taaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaatccaaatggcatcatgcc 33223674  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33223675 ctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccattccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctg 33223774  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33223775 atgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacatctcgtttcaaactggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 33223874  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| |    
T  33223875 tacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttatgactctcttctagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaattcttc 33223974  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||    
T  33223975 ctctgaaccacagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcgttatcctcagtgtcattactagtagtcatcaaatcaacaaacttcaagtctacttgctg 33224074  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||  ||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  33224075 agcttctcgggtactattcaagaaatcactattaatcctcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaaggctca 33224163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 39 - 635
Target Start/End: Original strand, 15246568 - 15247164
Alignment:
Q  39 tgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggc 138  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15246568 tgtgaatataaatctctgccaactgagctattggataactaatattgatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggc 15246667  T
Q  139 gtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcg 238  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  15246668 atcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgca 15246767  T
Q  239 ggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttca 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||   | |||||||||||||  |||||||    
T  15246768 ggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcagctcagaccaccaaaacaacttcttca 15246867  T
Q  339 aatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaataca 438  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  15246868 agtcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctccagaatcaactttttcaactcgtcattatcaggaataca 15246967  T
Q  439 aactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcc 538  Q
    || ||| || ||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||    
T  15246968 aattcttcccctgaacctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtgtcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatcc 15247067  T
Q  539 tctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     ||| ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  15247068 acttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtacactctgaagtgtcaactcatagacaagactca 15247164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 15002990 - 15002398
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||| | |||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  15002990 tgaatataaatctccgccaaccgagctaccggataactaacattgatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcat 15002891  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  15002890 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgatctcccacttccgctctggcacatctaacggtgtcaacaacactgcagg 15002791  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  15002790 cttctgatgctcaaccttagacttttgacaagtcaaacatgcatagacaaaatgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaaa 15002691  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| ||  |||| || ||||| |||||||||||||    
T  15002690 tcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcttctagaatcaattttttcaaatcatcattatcaggaatacaaa 15002591  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||  | |  ||| ||||| |||||||| | ||| ||    
T  15002590 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcattatcttcagtttcattactagcaaccattaaatccacaaacttgacatcatc 15002491  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagact 633  Q
    ||  || ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15002490 ttgttgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacagacaagact 15002398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 41 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 1648903 - 1648320
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||| || |  |    
T  1648903 tgaatataaatctcagccaactgagctaccgaataactaatattaataggaatgaaatgtgccgacttagtcaacctatcgaccacaacccatatagaat 1648804  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
     ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  1648803 tatgccctctcggagtattaggtaaactcgttacaaaatccatagaaatgctgtcccatttccactccagtatatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 1648704  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  1648703 cctctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgtgcgacatccctcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaaa 1648604  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1648603 tcatggtacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctagaattaaccttttcaactcatcattatcaggaatacaaa 1648504  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| | |||||||| || |||||| || |||||||| |||||||||| || |||||| |||||||| | | |||| ||||||||||| || | |||| |    
T  1648503 ttctgcttctgaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatcaccattctcagtttcattaccagcaatcattaaatcaacaaattttacatccac 1648404  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcaca 624  Q
     |  ||||||||||||||||| |||||||| | ||| | ||| |||||||| || || |  ||||| ||||||||||| |||||    
T  1648403 ctgttgagcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatcccaaatttaatactttgaggtgacaactcaca 1648320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 27901032 - 27901626
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |    
T  27901032 tgaatgtaaatctctgccaactgagctactggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatagaat 27901131  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  27901132 catgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 27901231  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  27901232 cctctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcgacatccctcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaaa 27901331  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || || | |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  27901332 tcatgatacatttttgtagcttccggatgaatactcaagttactcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaaa 27901431  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| ||||| |||| || |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||  | |||||  | |  ||| ||||| ||||||||   |||  |    
T  27901432 ttctgcctctaaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatctctatcctcagcttgattactagtaaccattaaatccacaaactttgcatcaac 27901531  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || |||||||  ||||| |||||||| | |||||  || |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  27901532 ttgttgtgcttctcttatactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactttacactttgaggtgacaattcacaaacgagactca 27901626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 498
Target Start/End: Original strand, 8706565 - 8707021
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| |||||||| || ||||| || |||||| |||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| ||    
T  8706565 gaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattgattggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatggcatc 8706664  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  8706665 atgccctcttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggatatgctatctcatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggc 8706764  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||| || |    
T  8706765 ttctgatgttcaactttagatttctgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaatttctttaagt 8706864  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||| ||||| || ||  |||| |||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  8706865 catgatacatctttgtagctctcggatgaatacttaagttacttttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaat 8706964  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| |||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  8706965 tctgcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagt 8707021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 260 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 15358527 - 15358152
Alignment:
Q  260 gacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtag 359  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15358527 gacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacgtttcaaaccagaccaccaaaatagtttcttcaaatcatgatacattttcgtag 15358428  T
Q  360 cccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacag 459  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||||||||| | ||| | |||||||||  |||| || ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| | ||     
T  15358427 ctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttactctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaa 15358328  T
Q  460 cacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggata 559  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||| | |||  ||| ||| ||||||||||||    
T  15358327 cacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatctacttgctgtgcttctcggata 15358228  T
Q  560 ctgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || |||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15358227 ctattcaagaagtcactattaatcttcagcatccctaactgtacactatgaggtgtcaattcacagacaagactca 15358152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 15078281 - 15078875
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||||||||||||  | ||||  ||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||  |    
T  15078281 tgaatgtaaatctccaccaactaagctaccggaaaactaatattgatcggaataaaatgcgccgacttcatcaacctttcaacaacaacccaaatggtat 15078380  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||| ||    
T  15078381 catgccctctcggagtattcgataaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcattaaccctgcagg 15078480  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||| | |||||||||     
T  15078481 cttctgatgttcaaccttagacttctgacaaatcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaatccgaaccaccaaaataatttcttcaag 15078580  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || || |||||  | ||||| || || |||||||||||  ||||||| ||| | ||| |||| ||||    
T  15078581 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctatgactttcttccagaatcaactttttcaactcatcactatcaagaatgcaaa 15078680  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| |  | ||||||||| ||||| || ||||||||    || ||||| | |||||  | |  ||| ||||| |||||||| | |||       
T  15078681 ttcttcctctgaaccttaacacaccctgctcatcgaccttgaaatcttcctcttcagtttgattactagcatccattaaatccacaaacttgacatcaat 15078780  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15078781 tttctgtgcttccctgatactattcaagaattcactattgatcttcaacatacccaactgcacactttgaggtgacaactcacaaacaagactca 15078875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 15414651 - 15414058
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||| ||    
T  15414651 gaatgtaaatctctgccaactatgccaccgaaaaactaatattaatcggaataaagtgtgctgacttcgttaatctatcaacaaccagccatatggcatc 15414552  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||| |||||| || |||    
T  15414551 atgccctctcgaagtattcagtaaacttgttacaaagtccatggatatgctatcccatttccactctggcacatctaatggtttcagcaacccagcaggc 15414452  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15414451 ttctgatgttcaactttagatttctgacaagtcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttaaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagt 15414352  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| |||||||| || || ||||| || || |||||  ||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||     
T  15414351 catgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaaactacttctgtgactttcttccaaaatcaactttttcaactcatcattatgaggaatacaaat 15414252  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctct 541  Q
    ||| |||| ||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| | |||||    |  || |||||| |||||||| |||||  |     
T  15414251 tcttcctcagaatctcaacacaccctgatcatgaaccttgaaatcactttcttcagtttgattactaacaaccaacaaatccacaaacttaatatcaacc 15414152  T
Q  542 ttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||| ||||||   ||||| |||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||  | ||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15414151 ttctgtgcttctttaatactattcaagaactcactattgatcttcaacatacccaacttcacactttgaggtgacaactcacaaactagactca 15414058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 264 - 635
Target Start/End: Original strand, 16148580 - 16148951
Alignment:
Q  264 tctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccc 363  Q
    |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  16148580 tctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcgacgtcacgcttcaagccggaccaccaaaacaacttcttcaaatcgtgatacattttcgtagctcc 16148679  T
Q  364 cgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcaca 463  Q
    ||| || || || || || ||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| | || ||||    
T  16148680 cggatggatacttaagctgctcttgtgactttcctccagagtcaactttttcaacccttcattgtcaggaatacaaattcttcctatgaacctcaacaca 16148779  T
Q  464 ccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgt 563  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||| | |||  ||| ||||| |||||| |||||||    
T  16148780 ccctgatcatcgactttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatctacttgctgagtttctcgtatactgt 16148879  T
Q  564 tcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16148880 tcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgtcaattcacagacaaggctca 16148951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 264 - 635
Target Start/End: Original strand, 16152726 - 16153097
Alignment:
Q  264 tctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccc 363  Q
    |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  16152726 tctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcgacgtcacgcttcaagccggaccaccaaaacaacttcttcaaatcgtgatacattttcgtagctcc 16152825  T
Q  364 cgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcaca 463  Q
    ||| || || || || || ||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| | || ||||    
T  16152826 cggatggatacttaagctgctcttgtgactttcctccagagtcaactttttcaacccttcattgtcaggaatacaaattcttcctatgaacctcaacaca 16152925  T
Q  464 ccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgt 563  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||| | |||  ||| ||||| |||||| |||||||    
T  16152926 ccctgatcatcgactttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatctacttgctgagtttctcgtatactgt 16153025  T
Q  564 tcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16153026 tcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgtcaattcacagacaaggctca 16153097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 482
Target Start/End: Original strand, 15319797 - 15320237
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||||||| |||| ||||| || || || |||||  |||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||  |    
T  15319797 tgaatataaatttccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcgggataaaatgccccgagttcgtcaacctatcaacaacaacccaaatggtat 15319896  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15319897 catgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggagatgttgtcccacttccactctcgcacatctaacggtgtcaacaaccctgcagg 15319996  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||  ||||| || || ||||||||  ||||||| ||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  15319997 cttctgat-ttcaactttagatttctgacaagtcaaacatgcatatacaaactatgcaacatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaag 15320095  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    || || ||||| |||||||  || || ||||| || || |||||  ||||||| || |  | |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||  |||    
T  15320096 tcgtgatacatctttgtaggtcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttttaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatgtaaa 15320195  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttga 482  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||    
T  15320196 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttga 15320237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 14850698 - 14850146
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||| || |||| ||||| |||||| | ||    
T  14850698 aactcatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatcgcgtcattccctttctgagtattcggaaaactcatcac 14850599  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||| ||| || ||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  14850598 aaaatacatggatatgttatcccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatc 14850499  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||  |||| ||||| ||||| |    
T  14850498 aaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaacccagaccaccaaaacaacttctttaaatcatgatacatcttcatagctcccggatgaatac 14850399  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | ||| |||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||| || ||||||||    
T  14850398 tcaagctacttctatgaatctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaattctgcctcggaatctcaacacgccttgatcatc 14850299  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtta 574  Q
     || || || || ||||| ||| | | |||||  | |  || ||| || |||||||| | |||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||| | |    
T  14850298 gaccttaaagtctctatcttcaatctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaactttctgcgcttctttgatactgttcaagaattca 14850199  T
Q  575 ctatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    |||||||| || ||||||| ||  | || ||||||||||||||| || |||||    
T  14850198 ctatcaatctttagcattcacagttttacactctgaggtgacaactcgcagac 14850146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15358716 - 15358541
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  15358716 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaattggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcat 15358617  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15358616 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcagaaaatccatagaaatactgtcccatttccactccggcacatc 15358541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 12477249 - 12477703
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||      
T  12477249 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgc 12477348  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || ||    
T  12477349 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggttt 12477448  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  12477449 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 12477548  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  12477549 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 12477648  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  12477649 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 12477703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 29038767 - 29038313
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||      
T  29038767 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgc 29038668  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || ||    
T  29038667 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggttt 29038568  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  29038567 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 29038468  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  29038467 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 29038368  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  29038367 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 29038313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 8052983 - 8052542
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  8052983 taaatctctgctaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctgtcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 8052884  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  8052883 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 8052784  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  8052783 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 8052684  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||| |||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  8052683 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgaatctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 8052584  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcac 488  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||    
T  8052583 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcac 8052542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 19778153 - 19777702
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||   ||    
T  19778153 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctcc 19778054  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  19778053 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 19777954  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||||    
T  19777953 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttaaaatcatgg 19777854  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  19777853 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 19777754  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  19777753 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 19777702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 8387061 - 8387515
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| ||||| |    
T  8387061 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgt 8387160  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || ||    
T  8387161 tccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggttt 8387260  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||    
T  8387261 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatca 8387360  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  8387361 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 8387460  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  8387461 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 8387515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14303338 - 14302887
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  14303338 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 14303239  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  14303238 ctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 14303139  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||     
T  14303138 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcatga 14303039  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | ||||| | |||||| || ||||||| ||| |    
T  14303038 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaaactctttattgtctgggatacaaattcttc 14302939  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| || ||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  14302938 ctcggaatctcaacacaccttggtcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 14302887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 489
Target Start/End: Original strand, 18297857 - 18298299
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  18297857 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 18297956  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| ||||| |||||    
T  18297957 ctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaattcatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctg 18298056  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||| || || |||||| |||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||     
T  18298057 atgctcgactttcgacttccgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtga 18298156  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  18298157 tacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 18298256  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    ||| |||||  | |||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  18298257 ctcggaatctaaacacaccttgatcatcgattttaaaatcact 18298299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 3263798 - 3263661
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3263798 actctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 3263699  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3263698 atccttcagtaactctaaccacctcctctgcctcatgt 3263661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 29452541 - 29452404
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29452541 actccttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 29452442  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29452441 atccttcagtaactctaaccacctcctctgcctcatgt 29452404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Original strand, 23956399 - 23956850
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  23956399 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 23956498  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  23956499 ctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 23956598  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||||    
T  23956599 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgg 23956698  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| ||||||||  | ||||||| ||| |    
T  23956699 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtcctggatacaaattcttc 23956798  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  23956799 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 23956850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 1639785 - 1639383
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||| |  |||||||  |||||||| ||||||| ||    
T  1639785 taaatctctgtcaactgagctacgggaaaactgatattaatcggaagaaaatgagccgtcttcgtcaatctatcgacaatcacccaaatcgcgtcattcc 1639686  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  1639685 ctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccacttccactctggtatatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 1639586  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||| || || ||||| ||||| | |||||| | ||| ||||| |  |||||||| | |||||| || |||||||||||||  || |||||||||||     
T  1639585 atgctcgactttcgacttttgacaaaccaaacaagaatacacaaaatatgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatga 1639486  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| || | | | ||| |||||||| | |||||||| |||||    
T  1639485 tacatcttcgtagctctcgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatctccttaatctcttcattgtctgaaatacaaattctac 1639386  T
Q  447 ctc 449  Q
    |||    
T  1639385 ctc 1639383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 498
Target Start/End: Original strand, 14681267 - 14681670
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  14681267 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactat 14681366  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||  ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || ||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  14681367 cccttttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactg 14681466  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| | |||||| || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  14681467 tgccacatctcgtttcaaaccaggccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgactc 14681566  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcct 494  Q
    || |||||||||| |||| | | ||| |||||||| |||||||||| ||| ||||  |||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |    
T  14681567 tcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtctt 14681666  T
Q  495 cagt 498  Q
    ||||    
T  14681667 cagt 14681670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 498
Target Start/End: Original strand, 40473740 - 40474143
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| || || | |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  40473740 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactat 40473839  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  40473840 cccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactg 40473939  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  40473940 tgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcatagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactc 40474039  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcct 494  Q
    || |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |    
T  40474040 tcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtctt 40474139  T
Q  495 cagt 498  Q
    ||||    
T  40474140 cagt 40474143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 489
Target Start/End: Original strand, 12524325 - 12524770
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| |    
T  12524325 atgtaaatctctgctaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgt 12524424  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || |   || || || ||    
T  12524425 tccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatctttccagcaggttt 12524524  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| ||| |||||| | || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||     
T  12524525 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaaccgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcg 12524624  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || |||||  |||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| || | | | |||  ||| ||| |||||||||| ||    
T  12524625 tgatacatcttcgtagcttccggatggatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatctccttaatctctccatcgtctggaatacaaattc 12524724  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    | |||| ||||| || |||||| | |||||| | ||| ||||||||    
T  12524725 ttcctcggaatctcaacacaccttcatcatcgattttaaaatcact 12524770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 303
Target Start/End: Original strand, 14691549 - 14691810
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||||||  | ||||| | ||| ||| ||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  14691549 gaatgtaaatctccaccaactgaggtacaggaaaactgatattactcgaaatgaaatgagccgacttcgtcaatccatctacaatcacccaaatcgcgtc 14691648  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  14691649 attccctttcgaagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaacggtgtcatcaaccctgcaggt 14691748  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatc 303  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||||    
T  14691749 ttctgatgttcaacctttgacttttgacaaatcaaacaggaatacaccaactgtgccacatc 14691810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 470
Target Start/End: Original strand, 27711988 - 27712411
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| | |||   ||    
T  27711988 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgtgtcgctcc 27712087  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||  |  || |||||    
T  27712088 ctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcctagtaggtttctg 27712187  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  27712188 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 27712287  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  27712288 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 27712387  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgat 470  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||    
T  27712388 ctcggaatctcaacacaccttgat 27712411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 492
Target Start/End: Original strand, 14160117 - 14160567
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |  || ||| |||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||  |  | |||||  |||||||| | |||    
T  14160117 gaatataaatttctgccaactgagacacaggaaaactaatattaattggaaggaaatgagccgacttagtcagtctatagacaatcacccaaatcgtgtc 14160216  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||| |||||| |    || ||  || || ||     
T  14160217 attccctttaggagtattcggcaaaatcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtatatctaaagacaccatcattccagcaggt 14160316  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  14160317 ttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaat 14160416  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||||   || ||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||     
T  14160417 catgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactccgatggctctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcattgtctggaatacaaat 14160516  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatc 492  Q
    |||||| | ||||| || ||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  14160517 tctaccgcggaatctcaacactccttggtcatcaactttaaagtcactatc 14160567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 11206230 - 11206098
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11206230 ttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctgctcaaagcatcagcaacaacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcct 11206131  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  11206130 tcagtaactctaaccacctcctctacctcatgt 11206098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18226806 - 18226446
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||  || || ||| ||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || || | ||||||||| ||||| | ||    
T  18226806 taaatctctgccaactaggcaacaggaaaactgatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttcc 18226707  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |  || ||  || || || |||||    
T  18226706 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctg 18226607  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||  ||     
T  18226606 atgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaattgtga 18226507  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 407  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||    
T  18226506 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 18226446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 20892270 - 20892387
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  20892270 gacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcgtaatccttcagtaactctaacc 20892369  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  20892370 atctcctctgcctcatgt 20892387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 333 - 627
Target Start/End: Original strand, 14695051 - 14695345
Alignment:
Q  333 tcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcagg 432  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||||||    
T  14695051 tcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgagtactcaagctacttatatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcagg 14695150  T
Q  433 aatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttc 532  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| || ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||  || ||| || ||||||||     
T  14695151 aatacaaattctgcctcggaatctcaacactccctgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtttaattactagaaaccaacaagtccacaaactta 14695250  T
Q  533 atatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    | |||   |||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| ||  | |||||||||||||||||| |||||    
T  14695251 acatctattttctacgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcccagcttcacactctgaggtgacaattcgcagac 14695345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15147197 - 15146827
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || || |  |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15147197 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaactatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccatggatatactat 15147098  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  |  || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| | |||| ||| ||| ||||||||    
T  15147097 cccatttccactctggcacatctaaagataccatcatactagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaataggaatacacaaactg 15146998  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||| | |||||| || ||| |||| || |  ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  15146997 tgccacatcgcatttcaatccagacgaccagaatatcttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactc 15146898  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacacc 465  Q
    || ||||||||||  ||| ||| ||| ||||  ||||||||||| | || ||||| ||||| || ||||||    
T  15146897 tcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacatattcgacctcggaatctcaacacacc 15146827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 651 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 44660850 - 44660741
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  44660850 gacatatgcaaagttttcttgctcaaagcatcagcaacaacgttggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatctttcagtaactctaacc 44660751  T
Q  751 acctcctctg 760  Q
    ||||||||||    
T  44660750 acctcctctg 44660741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 33224196 - 33224328
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  33224196 ttcaccatcaaagcagacatatgtaatgtcttcctgctcaacgcatcagcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatctt 33224295  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || ||||||||| |||||||| ||||    
T  33224296 tcaacagctctaaccaccttctctgcctcatgt 33224328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 639 - 744
Target Start/End: Original strand, 14160746 - 14160851
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14160746 accatcatagcggacatatgcaaggtctttctacttaaggcatcagctacgacattcgctttacccggatgataattcaagccaaaatcaaaatccttca 14160845  T
Q  739 gtaact 744  Q
    ||||||    
T  14160846 gtaact 14160851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16354805 - 16354447
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||| ||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| | ||||| ||    
T  16354805 taaatctttgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattcc 16354706  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||   |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||| |  || ||  |  || || |||||    
T  16354705 ctccatgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaacgataccatcatacaagcaggtttctg 16354606  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||| ||| ||| |||||||| || ||||||| |||||| || |||||||| || |   |||||| ||||||     
T  16354605 atgttcaatcttcgacttgtgacaaactaaataggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaatccagaccaccagaaaatcatcttcagatcatga 16354506  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaat 405  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  16354505 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 16354447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 639 - 768
Target Start/End: Original strand, 16148987 - 16149116
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  16148987 accatcaaggcggacatatgcaatgtcttcctgctcaacgtatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttca 16149086  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
      |||| |||||| ||||||| ||| ||||    
T  16149087 acaactctaaccatctcctctacctcatgt 16149116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 639 - 768
Target Start/End: Original strand, 16153133 - 16153262
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  16153133 accatcaaggcggacatatgcaatgtcttcctgctcaacgtatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttca 16153232  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
      |||| |||||| ||||||| ||| ||||    
T  16153233 acaactctaaccatctcctctacctcatgt 16153262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 366
Target Start/End: Original strand, 7091087 - 7091403
Alignment:
Q  50 atctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctc 149  Q
    |||||||| ||||| |  || ||| |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||| ||| ||||||| ||||     
T  7091087 atctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcaccctaatcgcgtcattccctt 7091186  T
Q  150 tcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatg 249  Q
    | ||||| ||||  ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    || ||  || || || ||||||||    
T  7091187 taggagtattcgacaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatg 7091286  T
Q  250 ctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtac 349  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| | ||| ||||| || |||||||| | |||||| || |||||||||||||   |||| | |||||| |||    
T  7091287 ctcaaccttcgatttctgataaatcaaacaagaatacacaaattgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacctctttagatcatgatac 7091386  T
Q  350 atttttgtagcccccgg 366  Q
    || || ||||| |||||    
T  7091387 atcttcgtagctcccgg 7091403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 15002348 - 15002261
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15002348 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 15002261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 27901674 - 27901791
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||  | ||    
T  27901674 gacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatcttttaataactcaagcc 27901773  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  27901774 atctcctctgcctcatgt 27901791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 15358104 - 15358017
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15358104 gacatatgcaacgtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatctttca 15358017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 8387688 - 8387787
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  8387688 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 8387787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 12477876 - 12477975
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  12477876 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 12477975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 14681843 - 14681942
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  14681843 accatcaaaacggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 14681942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 15320412 - 15320511
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||| || ||||| || || |||||||  ||||||||| |||||||||    
T  15320412 accatcaaagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaatcacattagctttacctgggtgataattcataccaaaatcataatccttca 15320511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16251805 - 16251634
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || || | ||||||||| || || | ||    
T  16251805 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttcc 16251706  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatcta 218  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  16251705 ccctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgaatatactatcccatttccattctggcacatcta 16251634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 18298481 - 18298580
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  18298481 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 18298580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 19777529 - 19777430
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  19777529 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 19777430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 29038140 - 29038041
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  29038140 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 29038041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 742
Target Start/End: Original strand, 40474316 - 40474419
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  40474316 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctacttaaggcatctgcaaccacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 40474415  T
Q  739 gtaa 742  Q
    ||||    
T  40474416 gtaa 40474419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 9292111 - 9292208
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||    
T  9292111 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagccctcccaggatgataactcaagtgaaaatcaaagtcctt 9292208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 14998592 - 14998689
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  14998592 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagccttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 14998689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 651 - 736
Target Start/End: Original strand, 15247212 - 15247297
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15247212 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaaaacatctgcaaccacattagctttacccgaatggtaattcaaaccaaagtcataatcctt 15247297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 651 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 18549043 - 18548994
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggcctt 700  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18549043 gacatgtgcaaggacttcctactcaaggcatcagctactacattggcctt 18548994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 739
Target Start/End: Original strand, 12524952 - 12525052
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  12524952 accatcatagcgaacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 12525051  T
Q  739 g 739  Q
    |    
T  12525052 g 12525052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 8052359 - 8052260
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  8052359 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 8052260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 8707208 - 8707295
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  8707208 gacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaaatcatagtccttca 8707295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 15071647 - 15071734
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| || | ||||||| | |||||||    
T  15071647 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaactacattagctttacccggatggtaatttaaactaaaatcatagtccttca 15071734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 16354181 - 16354082
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  16354181 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 16354082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 651 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 1648261 - 1648188
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaa 724  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||    
T  1648261 gacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatccgccacaacattagccttattagggtggtaattcaaaccaaa 1648188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 15292154 - 15292057
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  15292154 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 15292057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 724
Target Start/End: Original strand, 23957023 - 23957108
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaa 724  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  23957023 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaa 23957108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 724
Target Start/End: Original strand, 27712612 - 27712697
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaa 724  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27712612 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatccgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaa 27712697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12342356 - 12342321
Alignment:
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccgg 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12342356 aaaatccatagagatgctatcccacttccactccgg 12342321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 663 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 51605764 - 51605694
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  51605764 gtcttcctactcaacgcatccgcgactacattagcttttcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 51605694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 700
Target Start/End: Original strand, 13248921 - 13248982
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggcctt 700  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  13248921 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcctt 13248982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 14850102 - 14850013
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatca 728  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || ||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  14850102 accatcacagcggacatatgcaacgtcttcctacttaaagcatctgcaacaacagtagctttacctggatgataattaaacccaaaatca 14850013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 520; Significance: 0; HSPs: 98)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 520; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Original strand, 49152917 - 49153532
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49152917 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 49153016  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49153017 gacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 49153116  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49153117 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggatttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcttttttcaaaccggacc 49153216  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49153217 accaaaacagtttcttcaaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 49153316  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  49153317 ttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagaacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcaacaaa 49153416  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  49153417 tcaacaaacttcaaatcctctttctgagcttctcggatactgttcaaaaagttactatcaattttcaacattcccaactgaatactctggggtgaccatt 49153516  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    |||||||||| |||||    
T  49153517 cacagacaaggctcat 49153532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 11305896 - 11305281
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11305896 catgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 11305797  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11305796 gacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 11305697  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11305696 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaatcggacc 11305597  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11305596 accaaaacagtttcttcaaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 11305497  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11305496 ttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagtacaccttgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcgttaccagaagtcatcaaa 11305397  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11305396 tcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaatt 11305297  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  11305296 cacagacaagactcat 11305281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 484; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 13968301 - 13967686
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13968301 catgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataacttatattaataggaataaagtgtgccgacttcgtcaaccggtc 13968202  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  13968201 gacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccagtccggtacatccaac 13968102  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13968101 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaacctttgacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 13968002  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||    
T  13968001 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcgagaatcaaattcttcaaatc 13967902  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13967901 atcactgtcaagaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttaaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 13967802  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13967801 tcaacaaacttcaaatccgctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctaaggtgacaatt 13967702  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  13967701 cacagacaagactcat 13967686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 480; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 26118238 - 26117623
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26118238 catgaagtttcactacactgtgaatataaatttctgctaactgcgctaccggataattgatattgataggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtc 26118139  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26118138 gacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 26118039  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26118038 ggtgtcaacaaccccgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacgaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 26117939  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26117938 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacattttagtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 26117839  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26117838 ttcattatcaggaatacaaactttacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 26117739  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||    
T  26117738 tcaacaaacttcaaatccactttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaaatgtatactctggaatgacaatt 26117639  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  26117638 cacagacaagactcat 26117623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 65 - 635
Target Start/End: Original strand, 12457300 - 12457870
Alignment:
Q  65 gctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggta 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  12457300 gctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtctacaacaacctaaatagcatcatgccctctcggagtgttccgta 12457399  T
Q  165 aactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggactt 264  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  12457400 aactcgtcacgaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaactttagactt 12457499  T
Q  265 ctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagccccc 364  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12457500 ctgacaagtcaaacaagcataaacaaactgagcaacatctcacttcaaatcggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagccccc 12457599  T
Q  365 gggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacac 464  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||    
T  12457600 gggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcgttgtcaggaatacaaactcttcctctaaacctcagcacac 12457699  T
Q  465 cctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgtt 564  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  12457700 cttggtcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattacccgtatttatcaaatccacaaacttcaaatctacttgctgagcttctcgaatactgtt 12457799  T
Q  565 caagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12457800 caagaaatcactatcaatcttcagcatccccaactatatactctgaggtgacaattcacggacaagactca 12457870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Original strand, 13021999 - 13022587
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13021999 taaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgcc 13022098  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13022099 ccctcggagtgtttggttaactcgtcacgaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctg 13022198  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13022199 atgatcaacattagacttctgacaagtcaaacaagcataaacaaactgagcaacatcacacttcaaaacggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 13022298  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  13022299 tacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 13022398  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||| | |  ||| |||||||||||||| | |||| ||| |||    
T  13022399 ctctgaacctcagaacaccctgatcataaaccttgaagtcactatcctctgtctcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttacatccacttgctg 13022498  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13022499 cgcttctcggatactattcaagaaattactattaatcttcagcatccccaattgtatactctgaggtgacaattcacaaacaaggctca 13022587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 8211761 - 8211346
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8211761 catgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaattgcgctaccggataactgatattgataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtc 8211662  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8211661 gacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagagatactgtctcacttccactccggtacatctaac 8211562  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211561 ggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 8211462  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  8211461 accaaaacaatttctttaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctccagaatcaacttcttcaactc 8211362  T
Q  421 gtcattgtcaggaata 436  Q
     |||||||||||||||    
T  8211361 ttcattgtcaggaata 8211346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Original strand, 12456344 - 12456932
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12456344 taaatctctaccaactgtgctaccggataactgatattgataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgcc 12456443  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12456444 ctctcgtagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatattgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctg 12456543  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||||| ||||| || || | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12456544 atgctcaaccttagacttctgacaagtcaagcatgcatacacaaaatgagctacgtcacgtttcaaactggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgg 12456643  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  12456644 tacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttc 12456743  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| ||| | |    
T  12456744 ctctgaaccttagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcaatgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcgaatccacttgccg 12456843  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  12456844 agcttctcggatactattcaagaaatcattattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaaggctca 12456932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16950078 - 16949491
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  16950078 taaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaatcggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgcc 16949979  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16949978 ctctcggagtgctcggtagactcgtcacgaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgttaacaaccctgcaggcttctg 16949879  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16949878 atgctcaaccttagacttctgacaagtcaagcatgcatacacaaaatgagcaacatcacgcttgaaaccggaccaccaaaacagtttc-tcaaatcgtgg 16949780  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |    
T  16949779 tacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgttaggaatacaaattcttc 16949680  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    |||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  16949679 ctctaaatctcaaaacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccaataatcattaaatcaacaaacttcaaatccacttgctg 16949580  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16949579 agcttctcagatactattctagaagtcactattaatcctcagcatccccaactgtatactctgaggtgtcaattcacagacaagactca 16949491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 1014 - 426
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  1014 taaatctccgccaactgtgctaccagataactgatattgatcggaatgaaatgtgctgacttcgtcaacctgtcgacaatgacccaaatggcatcatgcc 915  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  914 ctctcggagtgttcggtaaacttggcacgaaatccatagaaatattgtcccacttccactccggcacatctaacgatgtcaacaaccctgcaggcttctg 815  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  814 atgctcaaccttagacttctgacaagtcaagcacgcataaacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 715  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | | |    
T  714 tacatctttgttgctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaatttttc 615  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
     |||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||    
T  614 ttctgaacctcataacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattacccgtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 515  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  514 agcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaatactctgaggtgtcaactcatagacaagactca 426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 15102216 - 15101622
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |    
T  15102216 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctgtcgacaaccacccaaatggcat 15102117  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15102116 catgccgtctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 15102017  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| || |||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  15102016 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatagacaaactaagaaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaa 15101917  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||| || || || |||||||||||||    
T  15101916 tcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcgttatcaggaatacaaa 15101817  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||   |  ||||||||||| |||||| | |||| |    
T  15101816 ttcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtgtcattaccaacaaccatcaaatcaataaacttgacatccac 15101717  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||||| | ||| | ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15101716 ttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcaacatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacagacaagactca 15101622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 41 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 14285989 - 14285406
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | |||||||||||||| |||||| || |||||||| |  |    
T  14285989 tgaatgtagatctccgctaactgtgctaccggataactgatgttaatcggaatgaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaat 14285890  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  14285889 catgtcctctcggagtgtttggtaaacttgttacaaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 14285790  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||  | || || ||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14285789 cttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaagtatgcgtatacaaaatgagcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaa 14285690  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14285689 tcatggtacatttttgtagctccaggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaa 14285590  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
      || |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | | ||||||||||||| | ||| | ||||      
T  14285589 tcctccctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtgccattaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgacatccag 14285490  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcaca 624  Q
    || ||| |||||||| |||||   |||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14285489 ttgctgtgcttctcgaatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaactgtatactctgaggcgacaactcaca 14285406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 41 - 629
Target Start/End: Original strand, 13666173 - 13666761
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||| |||||| || ||||| || || |    
T  13666173 tgaatataaatctccaccaactgagctaccggataactgatattgatcggaataaagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcat 13666272  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  13666273 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccatcggtgtcaacaaccctgcagg 13666372  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13666373 cttctgatgttcaaccttcgacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaa 13666472  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||    
T  13666473 tcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaa 13666572  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||| ||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||| | |  ||| |||||||||||||||| |||  |    
T  13666573 ttcttcctctgaacctcaacacatcctgatcatcaaccttaaagtcactatccttagtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacatctac 13666672  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaa 629  Q
    ||  || ||||||||||| || |||||||| | ||| | ||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13666673 ttgttgtgcttctcggatgctattcaagaaataactgttaatcttcagcatccccaactgaacactttgaggtgtcaattcacagacaa 13666761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 624
Target Start/End: Original strand, 14434307 - 14434910
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||    
T  14434307 catgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgataggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatc 14434406  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     || || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14434407 aaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggcacatctaac 14434506  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||    
T  14434507 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatatacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaacggacc 14434606  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  |||| ||    
T  14434607 accaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaattc 14434706  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| | |   |||| |    
T  14434707 ttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtgccattaccagcaacaatcaga 14434806  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||| ||||| | |||| | | ||| ||||||||||||||  ||| ||| | ||| | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  14434807 tcaaccaacttgacatccacctgctgtgcttctcggatactactcaggaaatcactgttaatcttcagcatgcccaactgtatgctttgaggcgacaact 14434906  T
Q  621 caca 624  Q
    ||||    
T  14434907 caca 14434910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 26 - 636
Target Start/End: Original strand, 15341052 - 15341662
Alignment:
Q  26 agcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaa 125  Q
    |||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || |||||| |||| |||||||  ||||| |    
T  15341052 agcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgataggaataaagtgtgccaactttgtcaacctatcgacta 15341151  T
Q  126 ctacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgt 225  Q
    | ||||| || |  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15341152 caacccatatagaatcatgtcctctcggggtgtttggtaaactcgtcataaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgt 15341251  T
Q  226 caacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaa 325  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||    
T  15341252 caacaaccctgcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagctacgtcacgtttcaaaccggaccaccaa 15341351  T
Q  326 aacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcat 425  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| | || || | ||| |||||  |||| || ||||    
T  15341352 aacagcttcttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgaatttcttctaaaattaactttttcaattcttcat 15341451  T
Q  426 tgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaac 525  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || |||||||||||||| ||||| |||||||  ||  || ||||||| | | |||||||||||||    
T  15341452 tgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactattttctttgccattaccagcaatcatcaaatcaac 15341551  T
Q  526 aaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacag 625  Q
     | ||| | |||| ||| ||  ||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||     
T  15341552 cagcttgacatccacttgctttgcttctcggatactactcaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaactgtatactctgagtcgacaactcacat 15341651  T
Q  626 acaagactcat 636  Q
    || ||||||||    
T  15341652 accagactcat 15341662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 41 - 632
Target Start/End: Original strand, 19147847 - 19148438
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  19147847 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcat 19147946  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19147947 cataccctctaggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgctatcccacttccattctggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 19148046  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||||||     
T  19148047 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaag 19148146  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || || ||| |  ||||||| || || | |||||||||  |||| || ||||| |||||||| ||||    
T  19148147 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctatttatgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaa 19148246  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || || ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||||  | |  ||| ||| | |||||||| | |||  |    
T  19148247 ttcttcctctgaacctcaacataccctgatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttgattactagcaaccattaaacccacaaacttgacatcaac 19148346  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagac 632  Q
    || ||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19148347 ttgctgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaattttcagcatacccatctgtacactctgaggtgacaactcacaaacaagac 19148438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 41 - 632
Target Start/End: Original strand, 20747246 - 20747837
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  20747246 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcat 20747345  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20747346 cataccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgctatcccacttccattctggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 20747445  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||||||     
T  20747446 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaag 20747545  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || || ||| |  ||||||| || || | |||||||||  |||| || ||||| |||||||| ||||    
T  20747546 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctatttatgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaa 20747645  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || || ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||||  | |  ||| ||| | |||||||| | |||  |    
T  20747646 ttcttcctctgaacctcaacataccctgatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttgattactagcaaccattaaacccacaaacttgacatcaac 20747745  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagac 632  Q
    || ||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20747746 ttgctgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaattttcagcatacccatctgtacactctgaggtgacaactcacaaacaagac 20747837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16071907 - 16071314
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  16071907 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgatcggaagaaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcat 16071808  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16071807 catgccctctttgagtgttcgataaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctagcacatctaacggtgtcaacaaccctgcagg 16071708  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |  ||||||||||| | ||||||||||    
T  16071707 cttctgatgctcaaccttagacttttgacgagtcaaacatgcataaacaaactgaccaacatcacgtttcaacctagaccaccaaaataatttcttcaaa 16071608  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||  | || || ||||| | |||||||||  | || || ||||| ||| |||||||||    
T  16071607 tcatggtatatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctatggctttcctctaaaatcaactt-tttaaatcatcattatcatgaatacaaa 16071509  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  | |||||  | |  ||| |||||||||||||| | ||||      
T  16071508 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagcttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatccat 16071409  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||   | |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16071408 ttgacgtgcttctcggatactattcaagaaattactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacaaacaagactca 16071314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 41 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 14263857 - 14263265
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||||| |    
T  14263857 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggaataaagtgtgccgacttcgttaacctatcgacaacaacgcaaatggcat 14263758  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| || ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  14263757 catgccctctcggagtattcgataaactcgtcacaaaattcatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccacgcagg 14263658  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||||||     
T  14263657 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaag 14263558  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||  || || ||||| || |  ||| |  ||||||| ||||| | |||||||||  |||| || ||| | |||||||| ||||    
T  14263557 tcatgatacatctttgtagttcctggatgaatacttaggctatttctgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcactatcaggaatgcaaa 14263458  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  | |  ||| |||||||| ||||| | |||  |    
T  14263457 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattactagtaaccattaaatcaacgaacttgacatcaac 14263358  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagact 633  Q
    ||  || ||||||| ||||||  ||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14263357 ttgttgtgcttctctgatactactcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtaaactctgaggtgacaactcacaaacaagact 14263265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 23505503 - 23504900
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  23505503 catgtagcttcaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgataggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatc 23505404  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     || || |||||||| |  ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  23505403 aaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaat 23505304  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || ||||    
T  23505303 ggcgtcaacaatcctgcaggtttctgatgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagacc 23505204  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||  |||  ||    
T  23505203 accaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttc 23505104  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |  ||||||| | |  ||| | |    
T  23505103 ttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatcttagcacaccctgatcatcaaccttgaagtcattatcttcaataccattaccagcaaccattaga 23505004  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||| ||||| | |||| |||  || |||||||||||||| |||| ||| |  || | ||| || ||||| ||||||||||  || ||||| ||||| |    
T  23505003 tcaaccaacttgacatccacttgttgtgcttctcggatactattcaggaaatcgctgttaatctttagcatccccaactgtacgctttgaggcgacaact 23504904  T
Q  621 caca 624  Q
    ||||    
T  23504903 caca 23504900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 18053586 - 18052983
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  18053586 catgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgataggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatc 18053487  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     || || |||||||| |  ||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  18053486 aaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaattcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaat 18053387  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || ||||    
T  18053386 ggtgtcaacaatcctgcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagacc 18053287  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |  || |||||  |||  ||    
T  18053286 accaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaagattaactttttcatttc 18053187  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||  | ||||||| | |  ||||| |    
T  18053186 ttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgttcatcaaccttgaagtcactatcttcaacgccattaccagcaaccatcaga 18053087  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||| ||||| | |||| ||| ||| ||||||||||||||  |||  || | ||| | ||| || ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  18053086 tcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatactactcagaaaatcactgttaatctttagcatccccaactgtacactttgaggcgacaact 18052987  T
Q  621 caca 624  Q
    ||||    
T  18052986 caca 18052983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 434
Target Start/End: Original strand, 14130489 - 14130902
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||    
T  14130489 catgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgataggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatc 14130588  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     || || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14130589 aaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggcacatctaac 14130688  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||    
T  14130689 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatatacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaacggacc 14130788  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  |||| ||    
T  14130789 accaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaattc 14130888  T
Q  421 gtcattgtcaggaa 434  Q
     |||||||||||||    
T  14130889 ttcattgtcaggaa 14130902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 44 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 11388038 - 11387447
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    ||||||||||| || | ||| | ||||||| |||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||  || ||||  |||||||| || ||||    
T  11388038 atgtaaatctccgccagctgaggtaccggaaaactgatatttatcggaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccacaaaaacccaaatagcatcat 11387939  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11387938 gccctatcggagtattcggtaaactcgtcataaaatccgtagaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggctt 11387839  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  11387838 ctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaatctcttcaagtca 11387739  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| || || || ||  ||||| |||| || ||||| | ||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  11387738 tgatacatcttcgtagctcccggatggatacttaagttactcctgtggctttcctctaaaattaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaattc 11387639  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctcttt 543  Q
    | |||||||| | || ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||  | |  ||| ||||| |||||||| | |||  |||     
T  11387638 tgcctctgaacctcaacacgccttgttcatcaaccttgaaatcactatcctcagcttgattactagtaaccattaaatccacaaacttgacatcaacttg 11387539  T
Q  544 ctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11387538 ttgcgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaacttcacactctgaggtgacaattcacaaacaagactca 11387447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 75 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 11771842 - 11771290
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||    
T  11771842 aactgatatttatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttcggagtattcggcaaactcgtcac 11771743  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||| |||    
T  11771742 aaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctaatgctcaactttcgacttctgacaaatc 11771643  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  11771642 aaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatac 11771543  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||  |||| || ||| || ||||||||    
T  11771542 tcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaattctgcctcgaaatctcaccacgccttgatcatc 11771443  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtta 574  Q
     | ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | | ||| ||| || |||||||| | |||   |||||| ||||||   ||||| ||||  || | |    
T  11771442 gattttaaaatcactatcttcagtctgattactagcaatcaacaagtccacaaacttaacatcaattttctgcgcttctttaatacttttcagaaattca 11771343  T
Q  575 ctatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    |||||||| |||||||||||||  |  | ||||||||||||||| || |||||    
T  11771342 ctatcaatcttcagcattcccagtttcacactctgaggtgacaactcgcagac 11771290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 635
Target Start/End: Original strand, 19613312 - 19613905
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| |||||||| || ||||| || |||| | |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |  || || || ||||| || |  ||    
T  19613312 gaatataaatctccgccaactgagccaccgaaaaactgatatttatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcaaccacaacccatatagaatc 19613411  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  19613412 atgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggc 19613511  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  19613512 ttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccagaccaccaaaacagctttttcaaat 19613611  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    | || ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || | ||||||| |  ||| ||| || ||||||||||| ||||     
T  19613612 cgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaat 19613711  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattac-ctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
    ||| ||||||||   || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | || | || ||||| |||||||| | |||  |    
T  19613712 tctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagcttgattactattaact-attaaatccacaaacttgacatcaac 19613810  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     |  || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  ||||||| ||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  19613811 ctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcatcatacccaactgcacactctggggtgacaattcgcaaacaagactca 19613905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 12206412 - 12205956
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| |  || ||||| | ||| ||| | ||    
T  12206412 gaatgtaaatctctgccaactgtgccactggaaaactaatattaattggaataaagtgtgctgacttcttcaatctatcaacaaccatccatatgacatc 12206313  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    |||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  12206312 atgccctctcagagtatttggtaaacttgttacaaagtccatggatatgctatcccatttccattctggaacatctaatggtgtcaacaacccagcaggc 12206213  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12206212 ttctgatgttcaactttagatttctgacaagtcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagt 12206113  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    ||||  |||| ||| |||| ||||| ||||| || || |||||  ||||||| || || | ||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  12206112 catgaaacatctttatagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaaccttttcaactcatcattatcaggaatacaaat 12206013  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| |||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  12206012 tcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 12205956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 635
Target Start/End: Original strand, 15625188 - 15625783
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |  || ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| | |||    
T  15625188 gaatgtagatctccgccaactgagacacaggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagagtc 15625287  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| || ||  |||| ||||||| |||||| || ||     
T  15625288 attcccttttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggatatagtatcccatttccactctggcacgcctaaaggtgtcatcaacccagcaggt 15625387  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||  | |||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  15625388 ttctgatgctctacttttgacttctgacaaatcaaacatgaatacacaaactgtgccacattacatttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaat 15625487  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||     
T  15625488 catgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactttcttcaagaatcatcttcttcatctcatcattgtcaggaatacaaat 15625587  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatca--actttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcct 539  Q
    ||| ||||  |||| || ||| |||||||||||   || || || |||||||| ||||| | ||| ||   | |    ||||| |||||||| | ||||     
T  15625588 tctgcctcgaaatcgcaacactccctgatcatctcgaccttaaagtcactatcttcagtctgatttccaccaatatataaatctacaaactttacatcca 15625687  T
Q  540 ctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||| || ||||||   ||||| || |  || | ||||||||| ||||||||||| ||||  | | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15625688 ctttttgcgcttctttaatactattgagaaattcactatcaatcttcagcattcctaacttcacaatctgaggtgacaattcacagactagactca 15625783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 249
Target Start/End: Original strand, 6414147 - 6414355
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |  |    
T  6414147 tgaatataaatctctgctaactgagctatcggataactgatattgatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaat 6414246  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  6414247 catgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatactatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 6414346  T
Q  241 cttctgatg 249  Q
    |||||||||    
T  6414347 cttctgatg 6414355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 44790983 - 44790529
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||      
T  44790983 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgc 44790884  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || || ||| ||||| ||    
T  44790883 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggttt 44790784  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||    
T  44790783 ctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgctacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatca 44790684  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  44790683 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 44790584  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  44790583 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 44790529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 10871633 - 10872087
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||      
T  10871633 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgc 10871732  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || || ||| || || ||    
T  10871733 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcaggttt 10871832  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||    
T  10871833 ctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaattgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatca 10871932  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  10871933 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 10872032  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  10872033 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 10872087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 8199266 - 8199720
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| ||||| |    
T  8199266 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgt 8199365  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| ||||| ||    
T  8199366 tccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggttt 8199465  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  8199466 ctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 8199565  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  8199566 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 8199665  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  8199666 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 8199720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15154291 - 15153835
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  || ||| || |||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || |||| ||||||||| | |||    
T  15154291 gaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaattgatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacccaaatcgagtc 15154192  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || |      
T  15154191 attccctttaggagtattcggcaaactcgttaaaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcagat 15154092  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||||| ||    
T  15154091 ttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaaattcttcagat 15153992  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| ||  |||| ||||| || || ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||     
T  15153991 catgatacatcttcatagctcccggatggatactcaagctactcctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaat 15153892  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     |||||||  || | || |||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  15153891 cctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagt 15153835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Original strand, 8708246 - 8708697
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| ||||||||||| |  ||||| |  ||||| |||||||  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  8708246 taaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaataggtagaaaatgagttgactttgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 8708345  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| || || |||||    
T  8708346 ctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctg 8708445  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  8708446 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaataaacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 8708545  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  8708546 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 8708645  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  8708646 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 8708697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 378
Target Start/End: Original strand, 21662633 - 21662933
Alignment:
Q  78 tgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaa 177  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |  || |||| ||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21662633 tgatgttaatcggaataaaatgagccgacttcgtcagtctatccacaattacccaaatcgcatcatgtccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaa 21662732  T
Q  178 atccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaa 277  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||    
T  21662733 atccatggatatactatcccacgtccactctggaacatctaaaggtgtcaacaacccaacaggtttctgatgttcaactttcgacttttgacaaattaaa 21662832  T
Q  278 caggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctca 377  Q
    || ||||| ||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  21662833 cacgcatacacaaattgtgccacatctcgcttcaacccggaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatatatttttgtagctcccggatgaatactca 21662932  T
Q  378 a 378  Q
    |    
T  21662933 a 21662933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 498
Target Start/End: Original strand, 14040365 - 14040787
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||| | ||| | ||||| |||||||| ||    
T  14040365 aactgatattaatcggaataaagtgagccgacttcgtcaatctatc-acaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggaatattcggcaaactcgtcac 14040463  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    || |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | |  || || ||| |  || |||| ||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  14040464 aacatccatggatatactatcccatttccactctggtacatttaaagataccatcatcccagaaggtttctaatgatcaactttcgacttctgacaaatc 14040563  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  14040564 aaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatac 14040663  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | |||||||| |||||| |||  ||| ||| ||| |||  ||| |||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  14040664 tcaaactacttctatgactctcttcaagattcattttcttcatctcatcagcgtctggaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatc 14040763  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     | ||| ||||||||||| |||||    
T  14040764 gattttaaaatcactatcttcagt 14040787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 498
Target Start/End: Original strand, 14350395 - 14350817
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||| | ||| | ||||| |||||||| ||    
T  14350395 aactgatattaatcggaataaagtgagccgacttcgtcaatctatc-acaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggaatattcggcaaactcgtcac 14350493  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    || |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | |  || || ||| |  || |||| ||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  14350494 aacatccatggatatactatcccatttccactctggtacatttaaagataccatcatcccagaaggtttctaatgatcaactttcgacttctgacaaatc 14350593  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  14350594 aaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatac 14350693  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | |||||||| |||||| |||  ||| ||| ||| |||  ||| |||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  14350694 tcaaactacttctatgactctcttcaagattcattttcttcatctcatcagcgtctggaatacaaattctacctcggaatctcaacacaccttgatcatc 14350793  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     | ||| ||||||||||| |||||    
T  14350794 gattttaaaatcactatcttcagt 14350817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18551387 - 18550964
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  18551387 taaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaataggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 18551288  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| || || |||||    
T  18551287 ctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctg 18551188  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||| |||     
T  18551187 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaattatga 18551088  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| | |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  18551087 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaattatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 18550988  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgat 470  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||    
T  18550987 ctcggaatctcaacacaccttgat 18550964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 11552735 - 11552289
Alignment:
Q  43 aatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtca 142  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||| || || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||     
T  11552735 aatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcg 11552636  T
Q  143 tgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggct 242  Q
    | |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || |    
T  11552635 ttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccattgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtt 11552536  T
Q  243 tctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatc 342  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| | |||||| || |  |||||  ||||    
T  11552535 tctgatgctcgactttcgacttatgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccaggccaccagaaaatcttctttcaatc 11552436  T
Q  343 atggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaact 442  Q
    ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||||||  |||||||||| |    
T  11552435 atgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtgactctcctcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtatggaatacaaatt 11552336  T
Q  443 ctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    || |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  11552335 cttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcact 11552289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 474
Target Start/End: Original strand, 18178380 - 18178810
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| |    
T  18178380 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgt 18178479  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | ||| || |||  || || ||| ||||| ||    
T  18178480 tccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatagatatactatcccatttccattctggcagatccaaaggtaccatcatcccagcgggttt 18178579  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |  || |||| ||| ||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||    
T  18178580 ctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaagcaggaatacacaaattgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatca 18178679  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | ||||| || |||||||||| |||| | | ||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  18178680 tgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactttcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatgcaaattc 18178779  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    | |||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  18178780 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 18178810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 11305254 - 11305117
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11305254 actccttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactcaaagcatcagcaaccacattagccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 11305155  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11305154 atccttcagtaactctaaccacctcctctgcctcatgt 11305117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11236842 - 11236391
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  11236842 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaatcggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttcc 11236743  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||  | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  11236742 ctctaggagtattttgcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 11236643  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || || |||||||| |  ||||| | ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  11236642 atgctcaactttcgatttctgacaaactaaacaagaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 11236543  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  11236542 tacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 11236443  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  11236442 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 11236391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 209 - 627
Target Start/End: Original strand, 15204422 - 15204840
Alignment:
Q  209 ggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttt 308  Q
    ||||||||||| | |  || |||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||| | ||    
T  15204422 ggtacatctaaggataccatcaacccagcaggtttctgatgctcaacttttgacttctgacaaatcaaacatgaatatacaaactgtgccacatcacgtt 15204521  T
Q  309 tcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaa 408  Q
    |||| |  |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  15204522 tcaacctagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagcttccggatgaatactcaagctacttttgtgactctcttcaagaatcat 15204621  T
Q  409 cttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacct 508  Q
    |||| | | ||| |||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||  ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| | |||||      
T  15204622 cttctttatctcttcatcgtcaggaatacaaattctgcctcggaatctcaacattccctgatcatcgaccttgaagtcactatcttcagtctaattacta 15204721  T
Q  509 gaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactct 608  Q
    | |  || |||  | |||||||| | |||  |||| || ||||||   |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | || |||||| |    
T  15204722 gcaaccaacaagcccacaaacttaacatcaactttatgcgcttctttaatactgttcaagaattcactatcaatcttcagcattcctagctttatactat 15204821  T
Q  609 gaggtgacaattcacagac 627  Q
    |||| |||| ||| |||||    
T  15204822 gaggcgacagttcgcagac 15204840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Original strand, 49153559 - 49153696
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49153559 actccttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactcaaagcgtccgcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 49153658  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  49153659 atctttcagtaactctaaccacctcctctgcctcatgt 49153696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 487
Target Start/End: Original strand, 12688190 - 12688581
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | ||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  12688190 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccccctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactat 12688289  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || ||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  12688290 cccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcactccggcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactg 12688389  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||  | ||||||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  12688390 tgccacatctcgtttcaaactaggccaccaaaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtgactc 12688489  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatca 487  Q
    || |||||||||| |||| | | ||| ||| ||||  ||||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||||    
T  12688490 tcttcaagaatcatcttcttaatctcttca-tgtctagaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatca 12688581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 321638 - 321215
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| ||||| || ||    
T  321638 aactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcac 321539  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||||||| | ||||| ||  || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  321538 aaaatccatggatatactatcccatttccactctagcacatctaaagatgtcatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttttgacaaatt 321439  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    |||||   ||| |||||| | || ||||| | ||| || || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || |    
T  321438 aaacaaaaatatacaaaccgtgccacatcgcgttttaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcctggatggatac 321339  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | | ||| || ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  321338 tcaagctacttctatcactttcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctatctcggaatctcaacacaccttgatcatc 321239  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    || ||| |||||||| || |||||    
T  321238 aattttaaaatcactgtcttcagt 321215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 23203214 - 23202815
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  23203214 aactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcgtagtattcggcaaactcgtcac 23203115  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || || ||| ||||| |||||||| |  || || || |||||||| |      
T  23203114 aaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgtttgactttcgatttctgacaaact 23203015  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| | || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  23203014 aaacaggaatacacaaactgcgccacatctcgtttcaaaccagaccactagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatac 23202915  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| ||||| || | ||| |||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  23202914 tcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatgcatattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 23202815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 23509341 - 23508942
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  23509341 aactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcgtagtattcggcaaactcgtcac 23509242  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || || ||| ||||| |||||||| |  || || || |||||||| |      
T  23509241 aaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgtttgactttcgatttctgacaaact 23509142  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| | || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  23509141 aaacaggaatacacaaactgcgccacatctcgtttcaaaccagaccactagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatac 23509042  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| ||||| || | ||| |||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  23509041 tcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatgcatattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatc 23508942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 488
Target Start/End: Original strand, 14333039 - 14333478
Alignment:
Q  48 aaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccc 147  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| |||| ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||  || ||||  |||||||| ||||| | |||    
T  14333039 aaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaataggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccc 14333138  T
Q  148 tctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctga 247  Q
    |||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || ||||||    
T  14333139 tctaagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctga 14333238  T
Q  248 tgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggt 347  Q
    |||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||| | |  ||||| |||||||| |    
T  14333239 tgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagacca-caagaaatcttctttaaatcatgat 14333337  T
Q  348 acatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacc 447  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||| | || ||||||| ||| ||    
T  14333338 acatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgcctgggatacaaattcttcc 14333437  T
Q  448 tctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcac 488  Q
    || ||||| || ||||||  ||||||| | ||| |||||||    
T  14333438 tcggaatctcaacacacctagatcatcgattttaaaatcac 14333478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 95 - 470
Target Start/End: Original strand, 13686753 - 13687128
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  13686753 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactat 13686852  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || |||||||||||||| || ||||||||||| |  || |||| ||| ||||||||    
T  13686853 cccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttagacttctgacaaactaagcaggaatacacaaactg 13686952  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  13686953 tgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactc 13687052  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgat 470  Q
    || ||||||||||  ||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| ||||    
T  13687053 tcttcaagaatcattttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcagcacaccttgat 13687128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15160686 - 15160263
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  15160686 taaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 15160587  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  15160586 ctctaggagtatttggcaaactcgtcaaaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 15160487  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  || |||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  15160486 atgctcaactttagacttctgacaaactaagcaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 15160387  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  ||||| | |||||||| ||||||||||  ||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  15160386 tacatcttcgtagctcccggatgaatactaaatatactcctatgactctcttcaagaatcattttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 15160287  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgat 470  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  15160286 ctcggaatctcagcacaccttgat 15160263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 128 - 498
Target Start/End: Original strand, 14955280 - 14955646
Alignment:
Q  128 acccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtca 227  Q
    |||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  ||    
T  14955280 acccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaagtccatcgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtacca 14955379  T
Q  228 acaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaa 327  Q
     ||  || || || ||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||  |||||||| || ||||||  ||||||||| | |||||| ||    
T  14955380 tcattccggcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaattcacaaactgtgccacatcttgtttcaaaccaggccaccagaa 14955479  T
Q  328 cagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattg 427  Q
     |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| |     ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||| | | ||| ||||||    
T  14955480 aatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctc----atgaatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattg 14955575  T
Q  428 tcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    || |||||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  14955576 tctggaatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 14955646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 26117591 - 26117459
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26117591 ttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctgctcaaagcatcagccacaacattggcttaacccggatggtaattcaagccaaaatcataatcct 26117492  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  26117491 tcagtaactctaaccatctcctctgcctcatgt 26117459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 13967654 - 13967522
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||   | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13967654 ttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttccgggttaaagcatcagcaacaacattggccttaccaggatggtaatttaagccaaaatcataatcct 13967555  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13967554 tcaataactctaaccacctcctctgcctcatgt 13967522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 474
Target Start/End: Original strand, 9596698 - 9597125
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || || | ||||||||| || || | ||    
T  9596698 taaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttcc 9596797  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |  || ||  || || || ||||     
T  9596798 ctctaggagtattcggcaaacttgtcacaaagtccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttcta 9596897  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||| || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||     
T  9596898 atgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaattgtgccacatcacgtttcaaaccagaccaccataaaatcttctttaaatcgtga 9596997  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| ||| |||  ||| ||||||||| ||||  | ||    
T  9596998 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgac 9597097  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    ||| ||||| || |||||| || |||||    
T  9597098 ctcggaatctcaacacaccttggtcatc 9597125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 641 - 763
Target Start/End: Original strand, 12457908 - 12458030
Alignment:
Q  641 catcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagt 740  Q
    |||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12457908 catcaaagcagacatatgcaatgtttttctgctcaaagcatcagcaactacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcagt 12458007  T
Q  741 aactttaaccacctcctctgcct 763  Q
    |||| |||||| ||||| |||||    
T  12458008 aactctaaccatctcctttgcct 12458030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16945 - 16554
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||| ||| |  || || |  |||||||| | ||| | ||    
T  16945 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgacaatctatcaacgatgacccaaattgtgtcgttcc 16846  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||  ||||||| | |  ||  |  || || || |||||    
T  16845 ctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcccatctaaagataccattataccagcaggtttctg 16746  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||     
T  16745 atgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtga 16646  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  16645 taca--ttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatacaaa 16554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 16949458 - 16949326
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16949458 ttcaccatcagagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatcagcaaccacattggttttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcct 16949359  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || ||||||||| |||||||| ||||    
T  16949358 tcaacagctctaaccaccttctctgcctcatgt 16949326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 639 - 768
Target Start/End: Original strand, 13022623 - 13022752
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13022623 accatcaaagcagacatatgtaatgttttcctgctcaacgcatcagcaaccacattggctttaccagggtggtaattcaagccaaaatcataatccttca 13022722  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
      | || |||||| ||||||||||| ||||    
T  13022723 acagctctaaccatctcctctgcctcatgt 13022752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 19613953 - 19614070
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| || || |||||    
T  19613953 gacatgtgtaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattggctttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatccttcaatagctctaacc 19614052  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  19614053 atctcctctgcctcatgt 19614070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 639 - 768
Target Start/End: Original strand, 13666803 - 13666932
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||  || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  13666803 accatcaaagcagacatatgcaacgttttcctactcaaggcatttgcaaccacgttggctttactaggatggtaattcaaactaaaatcataatccttca 13666902  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
      | || |||||||||||||||||| ||||    
T  13666903 acagctctaaccacctcctctgcctcatgt 13666932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 651 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 11387399 - 11387287
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |  | ||    
T  11387399 gacatgtgcaacgtcttcctactcaaagcatctacaactacattagctttacccggatggtaattcaatccaaaatcataatccttcaataattcaagcc 11387300  T
Q  751 acctcctctgcct 763  Q
    |||| ||||||||    
T  11387299 accttctctgcct 11387287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 636 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 393 - 290
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatc-agctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcc 734  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  393 ttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgcgcaacgcatttagcaacaacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcc 294  T
Q  735 ttca 738  Q
    ||||    
T  293 ttca 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 16071266 - 16071179
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16071266 gacatgtgcaatgtcttcctgctcaaagcatctacaaccacattagctttaccagaatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 16071179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 639 - 763
Target Start/End: Original strand, 14955819 - 14955943
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14955819 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaacccaaaatcataatccttca 14955918  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcct 763  Q
      || |  | |||||||||||||||    
T  14955919 acaattcaagccacctcctctgcct 14955943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 14263215 - 14263128
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  14263215 gacatgtgtaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaacccaaaatcatagtccttca 14263128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 15101574 - 15101487
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| |||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15101574 gacatatgcaacgtcttcctgctcagagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 15101487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 19148489 - 19148576
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  19148489 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatgataattcaatccaaaatcatagtccttca 19148576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 20747888 - 20747975
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  20747888 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatgataattcaatccaaaatcatagtccttca 20747975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 15160062 - 15159963
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  15160062 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaagccaaagtcataatctttca 15159963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 44790356 - 44790257
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  44790356 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 44790257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 651 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 40139 - 40081
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatg 709  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  40139 gacatgtgcaaggacttcctactcaaggcatcagctactacattggcctttcctggatg 40081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 744
Target Start/End: Original strand, 14212939 - 14213044
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || | ||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  14212939 accatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaaaattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 14213038  T
Q  739 gtaact 744  Q
    | ||||    
T  14213039 gcaact 14213044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 663 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 14285335 - 14285230
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaaccacctcctctgcc 762  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |  | || |||||| ||||||||||    
T  14285335 gtcttcctgctcaacgcatcagcaactacgttagctttaccaggatggtaattcaacccaaaatcataatcttttaacagctctaaccatctcctctgcc 14285236  T
Q  763 tgatgt 768  Q
    | ||||    
T  14285235 tcatgt 14285230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 744
Target Start/End: Original strand, 18179007 - 18179112
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  18179007 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 18179106  T
Q  739 gtaact 744  Q
    | ||||    
T  18179107 gcaact 18179112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 12688765 - 12688865
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatca-aaatccttc 737  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  12688765 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataaatccttc 12688864  T
Q  738 a 738  Q
    |    
T  12688865 a 12688865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 8199893 - 8199992
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  8199893 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 8199992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 8708870 - 8708969
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  8708870 accatcatggcggacatatgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 8708969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 11236218 - 11236119
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  11236218 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 11236119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 13687329 - 13687428
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  13687329 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatatgcaacaacattagctttacctggatgataattcaagccaaagtcataatctttca 13687428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 14333661 - 14333760
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  14333661 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 14333760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 663 - 726
Target Start/End: Original strand, 15341721 - 15341784
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaat 726  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15341721 gtcttcctgctcaatgcatcagcaactacattagctttaccaggatggtaattcaaaccaaaat 15341784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 18550763 - 18550664
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  18550763 accatcatggcggacatatgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 18550664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 299
Target Start/End: Original strand, 13455514 - 13455640
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaga 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||   ||||||  || ||| |||   || |||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  13455514 acaaaatccatagagatactatctcatttccattctggaacaaacaacggttgcatcaaacctaacggtttctgatgttcaaccttcgacttctgacaaa 13455613  T
Q  273 tcaaacaggcataaacaaactgagcaa 299  Q
     ||| || ||||||||||||| |||||    
T  13455614 ccaagcaagcataaacaaactcagcaa 13455640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 663 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 18052912 - 18052842
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18052912 gtcttcctactcaaagcatccgcgactacattagctttgcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 18052842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 663 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 23504829 - 23504759
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23504829 gtcttcctactcaatgcatcagcgactacattagctttgcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 23504759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 7825165 - 7825262
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  7825165 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 7825262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 14937612 - 14937709
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||   |||||| ||||||||    
T  14937612 accatcaaagcagacatttgcaaagtctttctactcaaagcatcaacaacaacattcgcctttccaggatgataactcaactgaaaatcgaaatcctt 14937709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 15365205 - 15365302
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||   |||||| ||||||||    
T  15365205 accatcaaagcagacatttgcaaagtctttctactcaaagcatcaacaacaacattcgcctttccaggatgataactcaactgaaaatcgaaatcctt 15365302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 636 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 17144269 - 17144196
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatg 709  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  17144269 ttcactatcaatgcagacatatgaaacgacttcctactcaaagcatctgctaccacattcgcctttcctggatg 17144196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 27106779 - 27106682
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  27106779 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 27106682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 27171546 - 27171643
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  27171546 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 27171643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 10872260 - 10872359
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||| ||| ||||| ||| |||| ||||    
T  10872260 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataatccaacccaaagtcataatctttca 10872359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 718
Target Start/End: Original strand, 13456012 - 13456091
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaa 718  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||    
T  13456012 accatcaaagcagacatatgcaaagtcttcctactcaaagcatcaacaacaacattcgcctttccgggatgataactcaa 13456091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 207
Target Start/End: Original strand, 4440695 - 4440729
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactc 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4440695 acaaaatccatagagatattatcccacttccactc 4440729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 135
Target Start/End: Original strand, 4440608 - 4440657
Alignment:
Q  86 ataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaat 135  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  4440608 ataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcaacaaccacccaaat 4440657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 657 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 12205765 - 12205684
Alignment:
Q  657 tgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||||||| | |||||||    
T  12205765 tgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattggctttacccggatgataatttaaactaaaatcatagtccttca 12205684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 23202618 - 23202513
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||  |||| || ||||| ||||| | |||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  23202618 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacatcattagctttacccggatgatgattcaaaccaaagtcataatctttca 23202519  T
Q  739 gtaact 744  Q
    | ||||    
T  23202518 gcaact 23202513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 23508745 - 23508640
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||  |||| || ||||| ||||| | |||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  23508745 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacatcattagctttacccggatgatgattcaaaccaaagtcataatctttca 23508646  T
Q  739 gtaact 744  Q
    | ||||    
T  23508645 gcaact 23508640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 516; Significance: 0; HSPs: 98)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 516; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Original strand, 14565834 - 14566449
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14565834 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatc 14565933  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14565934 gacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 14566033  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14566034 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaattaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggacc 14566133  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14566134 accaaaacagtttcttcaaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctacttttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 14566233  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14566234 ttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttaaaatcactatcctcagtgtcgttaccagaagtcatcaaa 14566333  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14566334 tcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaatt 14566433  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  14566434 cacagacaagactcat 14566449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Original strand, 6679803 - 6680418
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6679803 catgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtc 6679902  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6679903 gacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 6680002  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6680003 ggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 6680102  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  6680103 accaaaacaatttcttcaaatcatgatacatttttgtagcttccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatc 6680202  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6680203 atcattgtcaggaatacagactctacccctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcaccaaa 6680302  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6680303 tcaacaaacttcaaatcctccttttgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaatt 6680402  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  6680403 cacagacaagactcat 6680418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 484; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 803762 - 803147
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  803762 catgaagtttcaccacactatgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtc 803663  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  803662 gacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccgtagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 803563  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  803562 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaaccaaacaggcataaacgaacttagcaacatctcttttcaaaccagacc 803463  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  803462 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctctagaatcaacttcttcaactc 803363  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  803362 ttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcgttaccagaagtcatcaaa 803263  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  803262 tcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaatt 803163  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  803162 cacagacaagactcat 803147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 480; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Original strand, 6604350 - 6604965
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6604350 catgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtc 6604449  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6604450 gacaacaacccaaatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 6604549  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6604550 ggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 6604649  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  6604650 accaaaacaatttcttcaaatcatgatacatttttgtagcttccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatc 6604749  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6604750 atcattgtcaggaatacagactctacccctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcaccaaa 6604849  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6604850 tcaacaaacttcaaatcctccttttgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaatcttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaatt 6604949  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  6604950 cacagacaagactcat 6604965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16271313 - 16270699
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16271313 catgaagcttcaccacattgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattaatcggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtc 16271214  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16271213 gacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 16271114  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16271113 ggtgtcaacaaccttgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 16271014  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16271013 accaaaacagcttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatc 16270914  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||| |||| |  |||||||||    
T  16270913 atcattgtcaggaatacatactcttcctctgaacctcagtacaccctgatcatcaaccttaaaatcacggtcctcggtgtcactaccagttgtcatcaaa 16270814  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16270813 tcaaccaatttcacatccgctttctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacagtt 16270714  T
Q  621 cacagacaagactca 635  Q
    |||||||||||||||    
T  16270713 cacagacaagactca 16270699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 635
Target Start/End: Original strand, 27355240 - 27355853
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27355240 catgaagcttcaccacactatgaatgtaaatctctgccaactgttctaccggataactgatattgatgggaatgaagtgtgtcgacttcgtcaaccggtc 27355339  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27355340 gacaacaacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaattcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccagtacatctaac 27355439  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27355440 ggtgtcaaaaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 27355539  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||    
T  27355540 accaaaacagtttcttcaaatcatgatacatctttgtagcccccgggtgtatactcaatctactcttgtgactatcttcaagaatcaac-ccttcaactc 27355638  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||| |||| |||| | |||||| |||    
T  27355639 atcgctgtcaggaatacaaactctccctctgaatctcagtacaccctgatcatcaaccttaaagtcactgtcctcagcgtcactaccagtagtcattaaa 27355738  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27355739 tcaacaaatttcaaatctgctttctgagcttctcggatactattcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacagtt 27355838  T
Q  621 cacagacaagactca 635  Q
    |||||||||||||||    
T  27355839 cacagacaagactca 27355853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 635
Target Start/End: Original strand, 12305450 - 12306064
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305450 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 12305549  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12305550 gacaacaactcaaatagtgtcataccctctcggagtgttcggtaaggtcgtcacgaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaac 12305649  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  12305650 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgatcaaccttagacttctgacaaataaaacaagcataaaaaaactgagcaacatcacaattcaaaccggacc 12305749  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  12305750 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacattttagtagcccccgggtgaatactcaacctactcttatgactctcttcaagaattaacttcttcaactc 12305849  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||| || ||||| | |||||| | ||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  12305850 atcattgtcaggaatgcatactcttcatctgaacctcaaaacaccctgatcatcaaccttaaaatcactgtcctcagtgtcactaccagtagtcatcaaa 12305949  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||| || |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305950 tcaaccaatttcaaatctgctttctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcaacatccccaactgtatactctgaggtgacaatt 12306049  T
Q  621 cacagacaagactca 635  Q
    ||||||| |||||||    
T  12306050 cacagactagactca 12306064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 29303489 - 29302901
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29303489 taaatctctgccaattgtgctaccgaataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgcc 29303390  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29303389 ctctcgaagtgtttggtaaattcgtcacgaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctg 29303290  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| || || || ||||||||  |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  29303289 atgttccactttagacttctggaaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacatctcgtttcaaaccggaccaccaaaacagttccttcaaatcatga 29303190  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  29303189 tacatctttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctctacaagaatcaatttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 29303090  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||   || |||    
T  29303089 atctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattgccagatgtcatcaaatcaacaaacttcaaatctatttgctg 29302990  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29302989 agcttctcggatactgtttaagaaatcactatcaatcttcagcatccccaaccgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 29302901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 31416537 - 31415949
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  31416537 taaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaatcggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgcc 31416438  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31416437 ctctcggagtgctcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctg 31416338  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31416337 atgctcaaccttagacttctgacaagtcaagcatgcataaacaaaatgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgg 31416238  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  31416237 tacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttc 31416138  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||||| ||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  31416137 ctctgaatctcaatacgccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccagtaatcattaaatcaacaaacttcaaatccacttgctg 31416038  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  31416037 agcttctcggatactattcaagaattcactattaatcttcagcatccccaactgcacactctgaggtgtcaactcactgacaagactca 31415949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 39 - 635
Target Start/End: Original strand, 23655637 - 23656233
Alignment:
Q  39 tgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggc 138  Q
    ||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23655637 tgtgaatataaatctccgccaactaagctaccggataactaatattaatcaaaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaactacccaaatggc 23655736  T
Q  139 gtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcg 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||     
T  23655737 atcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactccggcacatctaacggtgttaataaccctgca 23655836  T
Q  239 ggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttca 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  23655837 ggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacgtcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttca 23655936  T
Q  339 aatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaataca 438  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||  || || |||||||||||  |||| || ||||| |||||||| ||    
T  23655937 aatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgaccttcttccagaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgca 23656036  T
Q  439 aactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcc 538  Q
    || ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||    
T  23656037 aattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatcc 23656136  T
Q  539 tctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     |||  || ||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23656137 acttgttgtgcttctcggatactactcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtatactctgaggtgacaactcacagacaagactca 23656233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 1266950 - 1267544
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||| || ||||| || |  |    
T  1266950 tgaatgtaaatctccgccaactgtgctacaggataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaat 1267049  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    | || |||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  1267050 cgtgtcctctaagagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 1267149  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||| ||||| ||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1267150 cttctgatgctcaaccttagacttctggaaagtcaaacatgcatacacaaaatgggcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaa 1267249  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1267250 tcatggtacatctttgtagctcctggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaa 1267349  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| | ||| | |||| |    
T  1267350 ttcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagcaaccatcaaatcaaccagcttgacatccac 1267449  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || ||||||||||||||| ||||||| | ||| | ||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  1267450 ttgatgtgcttctcggatactgctcaagaaatcactgttaatcttcagcatccctaattgtatactttgaggtgataactcacagactagactca 1267544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 19852123 - 19852717
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  19852123 tgaatgtaaatttctgccaactgtgctaccggaaaactaatattgatcgaaataaaatgtaccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcat 19852222  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  19852223 catgccctcttggagtattcggcaaactcgtctcaaaatccatggaaatgctgtcccacttccactctggcacatcgaacggtgtcaacaaccctgcatg 19852322  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  19852323 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcataaaaaaactgagcaacatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaag 19852422  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || || |||||  ||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  19852423 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatgcaaa 19852522  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| | | |||  | | |||| ||||| |||||||| | |||       
T  19852523 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcatccttgaaatcaccatcttcagtttgaatactagcaatcattaaatccacaaacttgacatcaat 19852622  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  19852623 tttctgcgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaattgtacactctgaggtgacaactcacaaactagactca 19852717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 19858159 - 19858753
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  19858159 tgaatgtaaatttctgccaactgtgctaccggaaaactaatattgatcgaaataaaatgtaccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcat 19858258  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  19858259 catgccctcttggagtattcggcaaactcgtctcaaaatccatggaaatgctgtcccacttccactctggcacatcgaacggtgtcaacaaccctgcatg 19858358  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  19858359 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcataaaaaaactgagcaacatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaag 19858458  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || || |||||  ||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  19858459 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatgcaaa 19858558  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| | | |||  | | |||| ||||| |||||||| | |||       
T  19858559 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcatccttgaaatcaccatcttcagtttgaatactagcaatcattaaatccacaaacttgacatcaat 19858658  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  19858659 tttctgcgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaattgtacactctgaggtgacaactcacaaactagactca 19858753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 20975720 - 20975126
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||| || ||||| || |  |    
T  20975720 tgaatataaatctccgccaactgagctatcggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaat 20975621  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  20975620 catgccctctcggagtatgtggtaaattcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaacactgcagg 20975521  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  ||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20975520 cttctgatgttcaaccttagacttctagcaagtcaaacatgcatatacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcctcaaa 20975421  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||  | ||||  |||||||| ||||    
T  20975420 tcatgatacattttcgtagctcccgtatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaaccatcatcatcaggaatgcaaa 20975321  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |  ||| |||||||||||||||| |||| |    
T  20975320 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacatccac 20975221  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  |  |||||||  ||||| |||||||| | ||| | ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20975220 ttgttttgcttctcttatactattcaagaaatcacttttaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaattcacagacaaggctca 20975126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 26 - 636
Target Start/End: Original strand, 22051560 - 22052170
Alignment:
Q  26 agcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaa 125  Q
    |||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||  | |    
T  22051560 agcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgataggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcaccca 22051659  T
Q  126 ctacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgt 225  Q
    | |||||||| |  ||||| | ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22051660 caacccaaatagaatcatgtcttctcggagtgtttagtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggcgt 22051759  T
Q  226 caacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaa 325  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||  ||  ||||||| ||||| | ||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  22051760 caacaaccctgcaggcttctgatgctcaatgttagacttctagcaagtcaaacatgcatacataaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaa 22051859  T
Q  326 aacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcat 425  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||  |||| || ||||    
T  22051860 aacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaacctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaattcttcat 22051959  T
Q  426 tgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaac 525  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||  | | |||| ||||||||    
T  22051960 tgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctccgtgccattactagcaatcattaaatcaac 22052059  T
Q  526 aaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacag 625  Q
     | ||| | |||| ||| ||| ||||||||||||||   |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||| |||||     
T  22052060 cagcttgacatccacttgctgtgcttctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaactatatgctttgaggcgacaactcacat 22052159  T
Q  626 acaagactcat 636  Q
    || ||||||||    
T  22052160 accagactcat 22052170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 41 - 633
Target Start/End: Original strand, 21841129 - 21841721
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| |    
T  21841129 tgaatataaatctccgctaactgagctactggaaaactaatattgatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgaccaccacccaaatggcat 21841228  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21841229 catgccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcagg 21841328  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||||||     
T  21841329 cttctaatgctcaaccttagacttctaacaagtcaaacatgcataaacaaacatagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaag 21841428  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || || |||||  ||||||| || || | |||||||||  |||| || ||||| |||||||| ||||    
T  21841429 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaa 21841528  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
      || |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| | |||||  | |  ||| ||||| |||||||| | |||  |    
T  21841529 tccttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcaccctcttcagtttaattactagcaaccattaaatccacaaacttgacatcaac 21841628  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagact 633  Q
    ||  || ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21841629 ttgttgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacaaacaagact 21841721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 31570931 - 31570328
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  31570931 catgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccgaataactaatgttgataggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatc 31570832  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     || || |||||||| |  ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  31570831 aaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaat 31570732  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || ||||    
T  31570731 ggtgtcaacaatcctgcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagacc 31570632  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||  |||  ||    
T  31570631 accaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttc 31570532  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |   |||||| | |  ||| | |    
T  31570531 ttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatactattaccagtaaccattaga 31570432  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||| ||||| | |||| ||| ||| |||||||| ||||| |||| ||| |  || | ||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  31570431 tcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctcgaatactattcaggaaatcgctgttaatctttagcatccccaactgtatgctttgaggcgacaact 31570332  T
Q  621 caca 624  Q
    ||||    
T  31570331 caca 31570328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 488
Target Start/End: Original strand, 22371652 - 22372099
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||||||||| |  || || ||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |    
T  22371652 tgaatgtaaatctccgtcaaatgagctaccggaaaactaatattgatcggaataaaatgcgccgacttcgtcaacctatcaacaactacccaaatggcat 22371751  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22371752 catgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactcaggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcagg 22371851  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||| | |||||||||     
T  22371852 cttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcatgtttcaatctggaccaccaaaataatttcttcaag 22371951  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| || || |||||  ||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||| | ||||||||  | |    
T  22371952 tcatgatacatctttgtagctcccaggtgaatacttaagctacttctgtgactttcttctataatcaactttttcaactcatcactatcaggaatgaata 22372051  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcac 488  Q
     ||| |||||||| | || ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22372052 ttcttcctctgaacctcaacacacacagatcatcaaccttgaaatcac 22372099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 107 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 20009922 - 20009395
Alignment:
Q  107 ttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccact 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||||||||    
T  20009922 ttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcattccctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccact 20009823  T
Q  207 ccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctct 306  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  20009822 ctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacg 20009723  T
Q  307 tttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatc 406  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || || |||||  ||||||| || || | ||||    
T  20009722 tttcaaa-cggaccaccaaaataatttcttcaaatcatgatacatatttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatc 20009624  T
Q  407 aacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattac 506  Q
    |||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| ||||  || |||||   |||||    
T  20009623 aactttttcaactcatcattatcaagaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccctcttcagttcgattac 20009524  T
Q  507 ctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatact 606  Q
      | |  ||| ||||| |||| ||| | |||   |||||| ||||||  |||| |||||||||| | ||||| ||| |||| ||| ||||| || | |||    
T  20009523 tagtaaccattaaatccacaagcttgacatcaattttctgcgcttctatgatattgttcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaattgcacact 20009424  T
Q  607 ctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||    
T  20009423 ctgaggtgacaactcacaaactagactca 20009395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 498
Target Start/End: Original strand, 20388812 - 20389268
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| |||||||| || ||||| || || ||| |||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||    
T  20388812 gaatataaatctccgccaactgagccactggaaaactaatattgattggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggcatc 20388911  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  20388912 atgccctctcggagtattcggtaaacttgtcacacaatccatggatatgctatcccatttccactccggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaggc 20389011  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  20389012 ttctgatgttcaactttagatttctgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtacaacatcacgcttcaatccggaccactaaaacaatttcttcaagt 20389111  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||   ||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||     
T  20389112 catgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacgtatgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaat 20389211  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| |||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  20389212 tctgcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagt 20389268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 20396193 - 20395618
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    ||||||||||||| || ||||| | ||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| || |  || ||||  |||||||| ||| |    
T  20396193 gaatgtaaatctccgccaactgagatagaggaaaactgatattaaccggaatgaaatgagctgacttcgttaatctatccacaatcacccaaatagcggc 20396094  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||     
T  20396093 atgccctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccattttcactctggcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggt 20395994  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||||||||| ||       ||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  20395993 ttctgatgctcaacttt-------tgacaaatcaaacatgaataaacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaaat 20395901  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||||||| |||| | | ||| |||||||| |||||| |||     
T  20395900 catgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactttcttcaagaatcatcttctttatctcatcattgtcgggaatataaat 20395801  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctct 541  Q
    ||| ||||  |||| || ||  ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | ||| ||   | |||   |||| |||||||| | |||| ||    
T  20395800 tctgcctcgaaatcgcaacaatccctgatcatcaacttttaagtcaccatcctcagtctgattcccaccaatcaaataatctacaaactttacatccact 20395701  T
Q  542 ttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcaca 624  Q
    ||||| |||||    ||||| ||||| || | ||||| ||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  20395700 ttctgtgcttccttaatactattcaaaaattcactattaatcttcaacattcccaacttcacactctgaggtgacaattcaca 20395618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 22377522 - 22376940
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||| || || ||||| | ||| ||| |||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| | |||    
T  22377522 gaatgtaaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatattaatcagaatagaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtc 22377423  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | | ||| ||| | |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||     
T  22377422 attccctttagaagtattcagcaaactcgtcacaaaattcatggatatgctatcccattcccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggt 22377323  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||||||  | || || ||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||   |||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  22377322 ttctgatgctcaactattgatttatgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgtgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaat 22377223  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| || |||||||||||     
T  22377222 catgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctatttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgttaggaatacaaat 22377123  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctct 541  Q
    ||| |||| ||||| || ||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||  || ||| |  |||||||| | |||   |    
T  22377122 tctgcctcagaatctcaacactcccagatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactagaaaccaacaagtgcacaaacttaacatcaatt 22377023  T
Q  542 ttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcaca 624  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||    
T  22377022 ttctgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcacagcttcacactctgaggtgacaattcaca 22376940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 22383697 - 22383115
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||| || || ||||| | ||| ||| |||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| | |||    
T  22383697 gaatgtaaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatattaatcagaatagaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtc 22383598  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | | ||| ||| | |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||     
T  22383597 attccctttagaagtattcagcaaactcgtcacaaaattcatggatatgctatcccattcccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggt 22383498  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||||||  | || || ||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||   |||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  22383497 ttctgatgctcaactattgatttatgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgtgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaat 22383398  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| || |||||||||||     
T  22383397 catgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctatttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgttaggaatacaaat 22383298  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctct 541  Q
    ||| |||| ||||| || ||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||  || ||| |  |||||||| | |||   |    
T  22383297 tctgcctcagaatctcaacactccccgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactagaaaccaacaagtgcacaaacttaacatcaatt 22383198  T
Q  542 ttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcaca 624  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||    
T  22383197 ttctgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcacagcttcacactctgaggtgacaattcaca 22383115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 22248388 - 22247907
Alignment:
Q  139 gtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcg 238  Q
    ||||| |||| ||||||| | ||| ||| |||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||     
T  22248388 gtcattccctttcggagtatacggcaaaatcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgttatcaaccctgca 22248289  T
Q  239 ggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttca 338  Q
    || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  22248288 ggtttctgatgctcaactttcgacttttgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttca 22248189  T
Q  339 aatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaataca 438  Q
    ||||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| | ||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  22248188 aatcatgatacatcctcgtagctcccggatgaatacacaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcgtcaatgtcaggaataca 22248089  T
Q  439 aactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcc 538  Q
    || ||| |||  ||||| || ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | | ||| ||| || |||||||| | |||     
T  22248088 aattctgccttggaatctcaacactccctgatcatcgattttaaaatcactatcttcagtctgattactagcaatcaacaagtccacaaacttaacatca 22247989  T
Q  539 tctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
      ||||||  |||||  ||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| | ||  | |||||||||||||||||    
T  22247988 attttctgcacttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcctagcttcacactctgaggtgacaatt 22247907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 470
Target Start/End: Original strand, 23949634 - 23950060
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||||    
T  23949634 atgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgttaatcggaatgaaatgagccaacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatagcgtcat 23949733  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||  || |||||||| | | ||| |||||| ||  | ||    
T  23949734 tccctcttggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatattatcccatttccactttggcacatctaaagatatcatcaacccagcaagttt 23949833  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||    
T  23949834 ctgatgctcgacttttgacttctgacaaatcaaacatgaatatacaaactgtgccacatcacttttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatca 23949933  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||||||  ||    
T  23949934 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttatgtgactctcttcaagaatcgtcttcttcatctcatcattgtcaggaatacaatttc 23950033  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgat 470  Q
    | |||| ||||| || ||| |||||||    
T  23950034 tgcctcggaatcgcaacactccctgat 23950060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 19484128 - 19483700
Alignment:
Q  46 gtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgc 145  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || || |||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |    
T  19484128 gtaaatctctgccaactgtgcgacagggaaactaatattaataggcagaaaatgagctgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttc 19484029  T
Q  146 cctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttct 245  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| ||||| ||||    
T  19484028 cctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttct 19483929  T
Q  246 gatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatg 345  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||    
T  19483928 gatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatcatg 19483829  T
Q  346 gtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactcta 445  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||     
T  19483828 atacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaatcctt 19483729  T
Q  446 cctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  19483728 cctcggaatctcaacacaccttgatcatc 19483700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 627
Target Start/End: Original strand, 22987942 - 22988494
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| || || |||||  ||||||| ||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||| ||    
T  22987942 aactgatattaatcggtataaaatgatccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcac 22988041  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||  ||||||| ||| |||| || || ||| | | |  || || ||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  22988042 aaaatccatggatatgttatcccatttctactctggcacgtcttaagataccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatc 22988141  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| |||||||| || | ||| | |||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  22988142 aaacaggaatacacaaactgtgccatatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcagatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatac 22988241  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| || ||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||| || ||||||||    
T  22988242 tcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtaaggaatagaaattctgcctcggaatctcaacacgccttgatcatc 22988341  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtta 574  Q
     | ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||| ||| ||| || |||||||| | |||   ||| || ||||||   ||||| |||| ||| | |    
T  22988342 gattttaaaatcactatcttcagtctgattactagaaatcaacaattccacaaacttaacatcaattttatgcgcttctttaatactcttcaggaattca 22988441  T
Q  575 ctatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| |||||    
T  22988442 ctatcaatcttcagcattcctaactttacactctgagatgacaattcgcagac 22988494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22061502 - 22061246
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||||||  |||||| |||||| || ||||| || |  |    
T  22061502 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggatacttgatgttaataggaatgaagtgcgccgactttctcaacctgtcgaccacaacccatatagaat 22061403  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    | || ||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  22061402 cgtgtcctctcgtagtgtttggtaaactcatcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaataaccctgcagg 22061303  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagc 297  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||    
T  22061302 cttctgatgttcaaccttaaacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagc 22061246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Original strand, 14566476 - 14566613
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14566476 actccttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 14566575  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14566576 atccttcagtaactctaaccacctcctctgcctcatgt 14566613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 17674086 - 17673663
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||   ||    
T  17674086 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctcc 17673987  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  17673986 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 17673887  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||||    
T  17673886 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttaaaatcatgg 17673787  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  17673786 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 17673687  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgat 470  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||    
T  17673686 ctcggaatctcaacacaccttgat 17673663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 596
Target Start/End: Original strand, 19978685 - 19979234
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || |||   |||||||| ||||||| ||    
T  19978685 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacagtcacccaaattgcgtcattcc 19978784  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || || |||||    
T  19978785 ctctaggagtattcggcaaactcatcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctg 19978884  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||| || || |||||||| || |  ||||| | ||||||     
T  19978885 atgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgttttaatccagaccaccagaatatcttctttagatcatga 19978984  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| || ||    
T  19978985 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcattgtcaagaatacaaattcgac 19979084  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||| ||||| ||  ||||| || ||||| || || || |||| ||| ||||  | |||||  | |  || ||| || |||||||| | |||  |||||||    
T  19979085 ctcggaatctcaatacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagcctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctg 19979184  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattccca 596  Q
     ||||||  |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  19979185 tgcttctttgatactcttcaaaaattcactatcaattttcagcattccca 19979234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 310 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 20985347 - 20985022
Alignment:
Q  310 caaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaac 409  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||||| || ||  ||||  ||||||| || || | |||||||    
T  20985347 caaaccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctctcgggtgaatacttaagatacttctgtgactttcttccaaaatcaac 20985248  T
Q  410 ttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctg 509  Q
    ||  ||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||||| || | || |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||  |    
T  20985247 tttttcaactcatcatttttaggaatacaaattcttcctctaaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttcattactag 20985148  T
Q  510 aagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctg 609  Q
     |   || |||||||||||||| | |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||| | ||||||    
T  20985147 taactattaaatcaacaaacttgacatcaactttctgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgcacactctg 20985048  T
Q  610 aggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20985047 aggtgacaactcacaaacaagactca 20985022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21166601 - 21166174
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||||||||  || || ||| ||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| ||    
T  21166601 taaatctctgctaactaggcaacaggaaaactgatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattcc 21166502  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||||| | |  || ||  || ||||  |||||    
T  21166501 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatattatcccacttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcggatttctg 21166402  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||| ||| ||||||||| | | |||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| |  |||||||| || |  ||||| | ||||||     
T  21166401 atgttcaatcttcgacttctgataaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaatctagaccaccagaatatcttctttagatcatga 21166302  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||  |||||||||| || ||    
T  21166301 tacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgttgggaatacaaattcgac 21166202  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    ||| ||||| || |||||| || |||||    
T  21166201 ctcggaatctcaacacaccatggtcatc 21166174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 95 - 489
Target Start/End: Original strand, 19113456 - 19113850
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  19113456 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactat 19113555  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  19113556 cccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactg 19113655  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  19113656 tgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactc 19113755  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    || |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||| ||| | ||| ||||||||    
T  19113756 tcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgattatcgattttaaaatcact 19113850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Original strand, 6604992 - 6605129
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6604992 actctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 6605091  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    ||| |||||||||| |||||| || |||||||| ||||    
T  6605092 atctttcagtaactctaaccatcttctctgcctcatgt 6605129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Original strand, 18857295 - 18857746
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  18857295 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatgttaataggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttcc 18857394  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || ||||     
T  18857395 ctctaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttcta 18857494  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |  |||||||  || |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  18857495 atgctcaactttcgacttttgacaaactaaacaggagtacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 18857594  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||||||| |||| | | ||| |||||||| ||||||||||  || |    
T  18857595 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttctagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaatccttc 18857694  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  18857695 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactttcttcagt 18857746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21921770 - 21921372
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| ||| |  || ||||  |||||||| ||||||| || | | ||||| ||||| |||||||| ||    
T  21921770 aactgatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgacaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccgtttaggagt-ttcggcaaactcgtcac 21921672  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || || ||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  21921671 aaaatccatggatatattatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaacctttgatttctgacaaatc 21921572  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||| | ||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  21921571 aaacaagaatacacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcgtggtacatcttcgtagctcccggatgaatac 21921472  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    ||||  ||||| | |||||||| ||||||||||  ||| | | ||| |||| |||  |||||||||  |||||||  || | ||||||||| ||||||||    
T  21921471 tcaagttactcctatgactctcttcaagaatcattttctttatctcatcatcgtcttgaatacaaatcctacctcgaaacctcagcacaccttgatcatc 21921372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 30313159 - 30312774
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || || | ||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  30313159 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactat 30313060  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || |  |||||||| | |  || ||  || || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  30313059 cccatttccattctgacacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatagacaaactg 30312960  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  30312959 tgccacatctcttttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactc 30312860  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaacttt 480  Q
    || ||||||||||  ||| ||| |||  ||| ||||||||| ||||  | ||||| ||||| || |||||| ||||| || |||||    
T  30312859 tcttcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgacttt 30312774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 498
Target Start/End: Original strand, 21251687 - 21252113
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||| | ||||| || || |||||||| ||    
T  21251687 aactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcac 21251786  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || |||| |||||| ||||| || || |||||||||| |  || ||  || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  21251787 aaaatccatggatatacgatcccatttccaatctggcacatctaacgataccatcacaccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatc 21251886  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacattt---ttgtagcccccgggtgaa 371  Q
    ||||| | ||| |||||||| | ||| || | |||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||||| |   | ||||| ||||| ||||    
T  21251887 aaacaagaatatacaaactgtgtaacgtcgcgtttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtcgtagctcccggatgaa 21251986  T
Q  372 tgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatc 471  Q
    | ||||   ||||  |||| ||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||  | |||||  || | ||||||||| |||||    
T  21251987 tactcaggttacttctgtggctctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaatccgacctcgaaacctcagcacaccttgatc 21252086  T
Q  472 atcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| | ||| |||||||| || |||||    
T  21252087 atcgattttaaaatcactgtcttcagt 21252113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 21393895 - 21393488
Alignment:
Q  80 atattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaat 179  Q
    |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||| | ||||| || || |||||||| |||||||    
T  21393895 atattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaat 21393796  T
Q  180 ccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaaca 279  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||  || |||||||||  |  || ||  || || || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  21393795 ccatggatatactatcccatttccactatggcacatctaaccataccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctggcaaatcaaaca 21393696  T
Q  280 ggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaac 379  Q
     ||||| |||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||||| |  ||||| | ||||||  |||| || ||||| || || ||||| |||||     
T  21393695 agcatacacaaactgtgcaacgtcgcgtttcaatccggaccaccaaaataacttctttagatcatgacacatcttcgtagctcctggatgaatactcaag 21393596  T
Q  380 ctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactt 479  Q
     ||||  | || ||||| ||||||||||  | | ||| ||| |||| ||||||||||||||  | |||||  || | ||||||||| |||||||| | ||    
T  21393595 ttacttctatggctctcttcaagaatcatttccttcatctcatcatcgtcaggaatacaaatccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcgattt 21393496  T
Q  480 tgaaatca 487  Q
    | ||||||    
T  21393495 taaaatca 21393488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 21788389 - 21787982
Alignment:
Q  80 atattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaat 179  Q
    |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||| | ||||| || || |||||||| |||||||    
T  21788389 atattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaat 21788290  T
Q  180 ccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaaca 279  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||  || |||||||||  |  || ||  || || || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  21788289 ccatggatatactatcccatttccactatggcacatctaaccataccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctggcaaatcaaaca 21788190  T
Q  280 ggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaac 379  Q
     ||||| |||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||||| |  ||||| | ||||||  |||| || ||||| || || ||||| |||||     
T  21788189 agcatacacaaactgtgcaacgtcgcgtttcaatccggaccaccaaaataacttctttagatcatgacacatcttcgtagctcctggatgaatactcaag 21788090  T
Q  380 ctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactt 479  Q
     ||||  | || ||||| ||||||||||  | | ||| ||| |||| ||||||||||||||  | |||||  || | ||||||||| |||||||| | ||    
T  21788089 ttacttctatggctctcttcaagaatcatttccttcatctcatcatcgtcaggaatacaaatccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcgattt 21787990  T
Q  480 tgaaatca 487  Q
    | ||||||    
T  21787989 taaaatca 21787982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 631 - 733
Target Start/End: Original strand, 6680445 - 6680547
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6680445 actctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 6680544  T
Q  731 atc 733  Q
    |||    
T  6680545 atc 6680547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 16270651 - 16270534
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  16270651 gacatgtgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcctttagtaactctaacc 16270552  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  16270551 atctcctctgcctcatgt 16270534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 178 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22128890 - 22128570
Alignment:
Q  178 atccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaa 277  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || |   || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |  |||    
T  22128890 atccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatccttccagcaggcttctgatgctcaacttttgatttctgacaaactaaa 22128791  T
Q  278 caggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctca 377  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  22128790 caggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactca 22128691  T
Q  378 acctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaac 477  Q
    | |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | |  || |||||||| || ||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||||||| |     
T  22128690 aactacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatatcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgat 22128591  T
Q  478 tttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| |||||||| || |||||    
T  22128590 tttaaaatcactgtcttcagt 22128570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 498
Target Start/End: Original strand, 21043244 - 21043614
Alignment:
Q  128 acccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtca 227  Q
    |||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    |     
T  21043244 acccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagacaccg 21043343  T
Q  228 acaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaa 327  Q
     ||  || || || ||||||||||||||||| || |||||||| | |||||| | ||| ||||| || ||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  21043344 tcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagaatacacaaattgtgcaacgtcgcatttcaatccggaccaccaaaa 21043443  T
Q  328 cagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattg 427  Q
    ||  ||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| |||||  ||||  | || ||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| |    
T  21043444 caacttctttaaatcatgatacatcttcgtagctctcggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcg 21043543  T
Q  428 tcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    || ||||||||||  |||||||  || | |||||| |  |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  21043544 tctggaatacaaatcctacctcgaaacctcagcactctttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 21043614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22133076 - 22132671
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    |||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||| |  || || | ||||||||| | ||| | |||||| ||||| ||||| |||||| | ||    
T  22133076 aactaatattaatcggtaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgtgtcgttccctctaggagtattcggaaaactcatcac 22132977  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |  || ||  || || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |      
T  22132976 aaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatctttgacttctgacaaact 22132877  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    || |||| ||  |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  22132876 aagcaggaattcacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatac 22132777  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||    |||||||||||||||||||  ||| ||| |||  ||| ||| ||||| ||||  | ||||| ||||| || |||||| ||||| ||    
T  22132776 tcaagctacttcaatgactctcctcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcgggaatgcaaatccgacctcagaatctcaacacaccgtgatcgtc 22132677  T
Q  475 aacttt 480  Q
     |||||    
T  22132676 gacttt 22132671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Original strand, 32600862 - 32601295
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || || | ||||||||| || || | ||    
T  32600862 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttcc 32600961  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| || || |||||||| | |  || ||  || || || |||||    
T  32600962 ctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatctcatttccattctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctg 32601061  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |  || |||| ||| |||||||  || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  || || | ||| ||     
T  32601062 atgctcaatctttgacttctgacaaactaagcaggaatacacaaactttgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttatttatatcgtga 32601161  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  | | ||| |||  ||| ||| ||||||||||  | ||    
T  32601162 tacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatttccttcatctctgcatcgtcgggaatacaaatccgac 32601261  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaacttt 480  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| |||||    
T  32601262 ctcggaatctcaacacaccgtgatcatcgacttt 32601295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 672 - 768
Target Start/End: Original strand, 12306133 - 12306229
Alignment:
Q  672 ctcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  12306133 ctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcctttagtaactataaccatctcctctgcctcatgt 12306229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16408109 - 16407657
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| ||||| || || |  ||||| |||||||||||||| |  || |  |  |||||||| |||| || ||    
T  16408109 taaatctctgccaactgggccacaggaaaactaatatttatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaattataacccaaattgcgtaattcc 16408010  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||||| |  || ||  || || || |||||    
T  16408009 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacgtctaacgataccatcataccagcaggtttctg 16407910  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaa-ccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatg 345  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||| |  ||| ||| ||| |||||||| ||  |||||| ||||||| || ||| |||| || |  ||||| | ||||||    
T  16407909 atgttcaatcttcgacttctgacaaactaaataggaatacacaaactgtgccgcatctcgtttcaaatccagactaccagaaaatcttctttagatcatg 16407810  T
Q  346 gtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactcta 445  Q
     ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||  ||| ||| |||| ||||||||| ||||  | |    
T  16407809 atacatcttcgtagctcctgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttattcatctcttcatcgtcaggaatgcaaatccga 16407710  T
Q  446 cctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    |||| ||||| || |||||| || ||||| ||||| || |||| ||| |||||    
T  16407709 cctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagt 16407657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Original strand, 22040577 - 22041010
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| | ||| || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || || | ||||||||| || || | ||    
T  22040577 taaatctctgccagctgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttcc 22040676  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |  || ||  || || |  |||||    
T  22040677 ctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattccggcacatctaaagataccatcataccagcagatttctg 22040776  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||| || |  ||||| ||||| ||     
T  22040777 atgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtga 22040876  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||  | ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| |||  |   ||| ||||||||| ||||  | ||    
T  22040877 tacatcttcgtagctcctagatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatatttgcatcgtcaggaatgcaaatccgac 22040976  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaacttt 480  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| |||||    
T  22040977 ctcggaatctcaacacaccgtgatcatcgacttt 22041010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22120189 - 22119786
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||| ||||| |  || ||||  |||||||| || || | |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  22120189 aaatgagccgactttgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactgt 22120090  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  ||  | || |||||||||||||| || || |||||||| |  ||||||| ||| || |||||    
T  22120089 cccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccaacaggtttctgatgctcaactttcgatttctgacaaactaaacaggaatacacgaactg 22119990  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||  ||||||||| |||||| | || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | |||  | ||||||    
T  22119989 tgccacatcttgtttcaaaccagaccactagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagcaacttctatgactc 22119890  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcct 494  Q
    |  |||||||||| |||| | |  || |||||||| || ||||||| ||| |||| ||||| || || ||| |||||||| | ||| |||||||| || |    
T  22119889 tattcaagaatcatcttcttaatatcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacataccttgatcatcgattttaaaatcactgtctt 22119790  T
Q  495 cagt 498  Q
    ||||    
T  22119789 cagt 22119786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 407
Target Start/End: Original strand, 23650807 - 23651119
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  || ||||  |||||||| | ||||| |||| | ||||| || || |||||||| |||||||||   || |||||||    
T  23650807 aaatgagccgaattcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatcctgggatatactat 23650906  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || ||  | |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||    
T  23650907 cccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaagtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatccaacaagaatacacaaactg 23651006  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     |||||||| | |||||| || |||||||||||||  || |||| |||||| ||||| || ||||| ||| | ||||| |||||  ||||  | ||||||    
T  23651007 tgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaactttttcagatcatgatacatcttcgtagctcccagatgaatactcaagatacttctatgactc 23651106  T
Q  395 tcctcaagaatca 407  Q
    || ||||||||||    
T  23651107 tcttcaagaatca 23651119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 29302868 - 29302736
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29302868 ttcaccatcaaagcagacatatgcaatgttttcctgcttaacgcatctgcaaccacattagccttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcataatcct 29302769  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||| ||||||||||| ||||    
T  29302768 tcaacagctctaaccatctcctctgcctcatgt 29302736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22164255 - 22164083
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || | ||| || |||||||||||||| |  || || | ||||||||| ||||| | ||    
T  22164255 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggtaggaattgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttcc 22164156  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaa 219  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  22164155 ctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaa 22164083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 31415898 - 31415811
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31415898 gacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcgtcagcaaccacattggctttaccagaatggtaattcaagccaaaatcataatccttca 31415811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12274611 - 12274441
Alignment:
Q  188 atactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaa 287  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || || ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |    
T  12274611 atactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaataca 12274512  T
Q  288 caaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgta 358  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  12274511 caaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatctttgta 12274441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 687 - 768
Target Start/End: Original strand, 27355926 - 27356007
Alignment:
Q  687 accacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || |||||| || |||||||| ||||    
T  27355926 accacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatcttctctgcctcatgt 27356007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 666 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 20975068 - 20974966
Alignment:
Q  666 ttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaaccacctcctctgcctga 765  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||  | || |||||| ||||||||||| |    
T  20975068 ttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcgtagtccttcaacagctctaaccatctcctctgcctca 20974969  T
Q  766 tgt 768  Q
    |||    
T  20974968 tgt 20974966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 639 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 30312583 - 30312478
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  30312583 accatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 30312484  T
Q  739 gtaact 744  Q
    | ||||    
T  30312483 gcaact 30312478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 639 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 21165977 - 21165877
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  21165977 accatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 21165878  T
Q  739 g 739  Q
    |    
T  21165877 g 21165877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 636 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 21324710 - 21324620
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatc 727  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21324710 ttcaccatcaa-gcagacacatgcaacgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatc 21324620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 412
Target Start/End: Original strand, 15534178 - 15534466
Alignment:
Q  127 tacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtc 226  Q
    |||| |||| || |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| || || |||||||  | |  |    
T  15534178 taccaaaattgcatcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcgcatttccattctggcacatctagagatacc 15534277  T
Q  227 aacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccacc--a 324  Q
    | ||  || || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| || || |  || ||||||| ||||||||| |||||||  |    
T  15534278 atcataccagcaggtttctgatgctcaatctttgacttctgacaaactaaacaggaatacacgaattatgccacatctcgtttcaaaccagaccaccaga 15534377  T
Q  325 aaacagtttcttc-aaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttc 412  Q
    |||   ||| ||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| ||||    
T  15534378 aaatctttttttctaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttc 15534466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 744
Target Start/End: Original strand, 15534725 - 15534830
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  15534725 accatcaaagcggacatgtgcaatgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatcataattcaaaccaaagtcataatctttca 15534824  T
Q  739 gtaact 744  Q
    | ||||    
T  15534825 gcaact 15534830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 736
Target Start/End: Original strand, 23656281 - 23656366
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23656281 gacatatgcaacgtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccggatagtaattcaaaccaaaatcataatcctt 23656366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 627
Target Start/End: Original strand, 23886082 - 23886322
Alignment:
Q  387 tgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatc 486  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  || ||| |||| |||||| || ||  | ||    
T  23886082 tgtgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcattgtcaggaatacaaattctgcctcggaattgcaacactccctaatcatcgaccttagagtc 23886181  T
Q  487 actatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttc 586  Q
    |||||| ||||| | ||| ||   | | |  ||||| |||||||| | |||| |||  || || |||   ||||| ||||  || | ||||||||| |||    
T  23886182 actatcttcagtctgatttccaccaataaataaatctacaaactttacatccacttcatgcgcctctttaatactattcagaaattcactatcaatcttc 23886281  T
Q  587 agcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  23886282 agcattcctaacttcacactctgaggtgacaattcacagac 23886322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 17673462 - 17673363
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  17673462 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaagccaaagtcataatctttca 17673363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 19852765 - 19852852
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  19852765 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttaccggggtgataattcaaaccaaaatcatagtccttca 19852852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 19858801 - 19858888
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  19858801 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttaccggggtgataattcaaaccaaaatcatagtccttca 19858888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 20984974 - 20984887
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  20984974 gacatgtgcaacgtctttctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatggtaattcaacccaaaatcatagtccttca 20984887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 299
Target Start/End: Original strand, 22983277 - 22983403
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaac-aaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacag 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||   ||||||  || | |||||||| || |||||||| |||| ||| |||||||||||     
T  22983277 acaaaatccatagagatactatcccaattccactctggcacaaacaacggttgcatcaaaccctgc-ggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaa 22983375  T
Q  272 atcaaacaggcataaacaaactgagcaa 299  Q
    | |||||| ||||| ||||||| |||||    
T  22983376 accaaacaagcatatacaaactcagcaa 22983403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 19483503 - 19483409
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  19483503 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatggtaattcaacccaaagtcataatc 19483409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 651 - 709
Target Start/End: Original strand, 19869047 - 19869105
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatg 709  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  19869047 gacatgtgcaaggacttcctactcaaggcatcagctactacattggccttccctggatg 19869105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 739
Target Start/End: Original strand, 21252298 - 21252386
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcag 739  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  |||||||| ||||||||||    
T  21252298 gacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcataatccttcag 21252386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 18857919 - 18858018
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  18857919 accatcatagcggacatatgcaaagtcttcctactcaaggcatctgcaacgacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 18858018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 19114032 - 19114131
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  19114032 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 19114131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 20017702 - 20017603
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  20017702 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 20017603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 663 - 738
Target Start/End: Original strand, 21841783 - 21841858
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  21841783 gtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaacagaaatcataatccttca 21841858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 22372285 - 22372372
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| || | ||||||| | |||||||    
T  22372285 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaactacattagctttacccggatggtaatttaaactaaaatcatagtccttca 22372372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 631 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 803120 - 803066
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagc 685  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  803120 actctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctactcaaagcatcagc 803066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 663 - 733
Target Start/End: Original strand, 22052229 - 22052299
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22052229 gtcttcctgctcaatgcatcagcaactacgttagctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 22052299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 648 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 22247863 - 22247773
Alignment:
Q  648 gcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22247863 gcggacatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacttggatgataattcaacccaaaatcataatccttca 22247773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 16876534 - 16876437
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  16876534 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 16876437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23156949 - 23156908
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtaca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23156949 acaaaatccatagagatactatcccacttccaatctggtaca 23156908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 631 - 739
Target Start/End: Original strand, 21043779 - 21043887
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  |||||||| |    
T  21043779 actctttcaccatcatagcagacatatgcaaggtcttcctactcagagcatctgcaacaacattagctttacctggatgatagctcaactcaaaatcata 21043878  T
Q  731 atccttcag 739  Q
     ||||||||    
T  21043879 gtccttcag 21043887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 652 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 21195928 - 21195844
Alignment:
Q  652 acatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  21195928 acatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattcgccttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 21195844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21196439 - 21196319
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaga 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||   ||||||  || ||| || |  || |||||||| ||||  || ||||||||||| |    
T  21196439 acaaaatccatagagatactatcccacctccactatggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtttctgatgttcaatttttgacttctgacaaa 21196340  T
Q  273 tcaaacaggcataaacaaact 293  Q
     |||||| |||||||||||||    
T  21196339 ccaaacaagcataaacaaact 21196319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 293
Target Start/End: Original strand, 22283916 - 22283968
Alignment:
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaact 293  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22283916 cttctgatgttcaatcttagacttctgacagatcaaacaagcatacacaaact 22283968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22366692 - 22366565
Alignment:
Q  83 ttaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtca-tgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatcc 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||| | |||| | |||| ||| ||| ||||  |||  |   |||||||||    
T  22366692 ttaataggaataaaatgtgccaacttcgtcaactgatcaacaacaacccaaattgagtcactaccct-tcgcagtcttcgacaaatccccaacaaaatcc 22366594  T
Q  182 atagagatactatcccacttccactccgg 210  Q
    || || |||||||||||||||||||||||    
T  22366593 atcgaaatactatcccacttccactccgg 22366565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 20009347 - 20009261
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  20009347 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattag-tttaccggggtgataattcaaaccaaaatcacagtccttca 20009261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 22119613 - 22119514
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  22119613 accatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactcaagccatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 22119514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 22128397 - 22128298
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  22128397 accatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactcaagacatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 22128298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 663 - 733
Target Start/End: Original strand, 1267604 - 1267674
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1267604 gtcttcctcctcaacgcatctgcaaccacattgactttacccagatggtaattcaaaccaaaatcataatc 1267674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20652270 - 20652236
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactc 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20652270 acaaagtccatagagatactatcccacttccactc 20652236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 733
Target Start/End: Original strand, 22435645 - 22435739
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||   ||||||||||||    
T  22435645 accatcaaagcagacatatgcaaagtttttctactcaaagcatctgcaacaacattagccttcccaggatgataactcaactgaaaatcaaaatc 22435739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 648 - 738
Target Start/End: Original strand, 23886375 - 23886465
Alignment:
Q  648 gcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |  || |||||||| |||||||| || || ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  23886375 gcggacatgtgtagagttttcctacttaaagcatctgcaacaacattagttttaccaggatgataattcaacccaaaatcataatctttca 23886465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 663 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 31570257 - 31570187
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31570257 gtcttcctactcaacgcatccgcgactacattagcttttcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 31570187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 21921163 - 21921086
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatca 728  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| || |||||  ||||||||    
T  21921163 gacatgtgaaaagtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagttcaactcaaaatca 21921086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 135
Target Start/End: Original strand, 22983190 - 22983239
Alignment:
Q  86 ataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaat 135  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  22983190 ataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaatcacccaaat 22983239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 516; Significance: 0; HSPs: 98)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 516; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 14886819 - 14886204
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14886819 catgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 14886720  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14886719 gacaactacccaaatggcatcatgtcctttcgaagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 14886620  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14886619 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 14886520  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14886519 accaaaacagtttcttcaaatcatgatacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 14886420  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14886419 ttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcaccccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaa 14886320  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14886319 tcaacaaatttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaatt 14886220  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  14886219 cacagacaagactcat 14886204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 24798225 - 24797610
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24798225 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 24798126  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24798125 gacaactacccaaatggcatcatgtcctttcgaagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 24798026  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24798025 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 24797926  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24797925 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagctcccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 24797826  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24797825 ttcattgtcaggaatgcaaactctacctctgaacctcaaaacaccttgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaa 24797726  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24797725 tcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaaatccctatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaatt 24797626  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  24797625 cacagacaagactcat 24797610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 37543209 - 37542594
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37543209 catgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgactttgtcaaccggtc 37543110  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37543109 gacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagataatgtcccacttccactctggtacatctaac 37543010  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37543009 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaaccaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcataccggacc 37542910  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37542909 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacattttcgtagctcctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaatttcttcaactc 37542810  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37542809 ttcgttgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagtacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaa 37542710  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37542709 tcaacaaacttcaaatcctctttctgagcttctcggatactgtttaagaagttactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaatt 37542610  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  37542609 cacagacaagactcat 37542594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 480; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Original strand, 20342822 - 20343437
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20342822 catgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgataggaatgaagtgtgccgacttcctcaaccggtc 20342921  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  20342922 gacaacgacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacgtccaac 20343021  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20343022 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaactggacc 20343121  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  20343122 accaaaacagtttcttcaaatcatggtatatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatc 20343221  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343222 atcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 20343321  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20343322 tcaacaaacttcaaatccactttctgagcttctcgaatactgttcaagaaatcactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgagatgacaatt 20343421  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    || |||||||||||||    
T  20343422 catagacaagactcat 20343437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Original strand, 25848615 - 25849230
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  25848615 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctactggataactgatattgataggaataaagtgtgccgacttcatcaaccggtc 25848714  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  25848715 gacaacaacccaaatagcgtcatgctctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaac 25848814  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25848815 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaattcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 25848914  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  25848915 accaaaacaatttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttatgactatcatcaagaatcaacttcttcaactc 25849014  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25849015 atcattgtcaggaatacatactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 25849114  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25849115 tcaataaacttcaaatccactttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaatctttagcatccccaactgtatactctgagatgacaatt 25849214  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  25849215 cacagacaagactcat 25849230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 635
Target Start/End: Original strand, 22503219 - 22503833
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22503219 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 22503318  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  22503319 gacaacaacccaaatagcgtcatgccctttcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatactgtcccacttccactccgatacatccaac 22503418  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22503419 ggtgacaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaattaagcaagcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 22503518  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22503519 actaaaatagtttcttcaaatcatggtacattttagtagccccgggctgaatactcaacctactcttatgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 22503618  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  22503619 atcattgtcaggaatacatactcttcctctgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttaaaatcattgtcctcagtgtcactaccagtagtcatcaaa 22503718  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||| || |||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22503719 tcaaccaatttcaaatctgctttctaagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaact 22503818  T
Q  621 cacagacaagactca 635  Q
    ||||||| |||||||    
T  22503819 cacagactagactca 22503833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23079891 - 23079303
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23079891 taaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaatatgaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgcc 23079792  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23079791 ctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaaatattgtccgacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctg 23079692  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23079691 atgttcaaccttagacttctgacaagtcaagcatgcatacacaaactgagctacgtcgcgtttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 23079592  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  23079591 tacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactacttttgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 23079492  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||    
T  23079491 ctctgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcattatcctccgtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgttg 23079392  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  23079391 agcttctcagatactattcaagaaattactgttaatcttcaacatccccaactatatactctgaagtgacaattcacaaacaaggctca 23079303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 21 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 24620123 - 24619520
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24620123 catgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttattggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatc 24620024  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24620023 gacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaaataatgtcccatttccactccggtacatccaac 24619924  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  24619923 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatacacaaactgagcaacgtcacgtttcaaaccggacc 24619824  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  |||||||    
T  24619823 accaaaatagtttcttcaaatcatggtacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactc 24619724  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  |||||||    
T  24619723 atcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaacctcagaacaccctgaacatcaaccttgaaatcgctatcctcagtgtcattaccagcaaccatcaaa 24619624  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||| | |||  ||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| |    
T  24619623 tcaacaaacttaacatcgacttgctaagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgccaact 24619524  T
Q  621 caca 624  Q
    ||||    
T  24619523 caca 24619520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 21 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 24716354 - 24715751
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24716354 catgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttattggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatc 24716255  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24716254 gacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaaataatgtcccatttccactccggtacatccaac 24716155  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  24716154 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatacacaaactgagcaacgtcacgtttcaaaccggacc 24716055  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  |||||||    
T  24716054 accaaaatagtttcttcaaatcatggtacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactc 24715955  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  |||||||    
T  24715954 atcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaacctcagaacaccctgaacatcaaccttgaaatcgctatcctcagtgtcattaccagcaaccatcaaa 24715855  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||| | |||  ||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| |    
T  24715854 tcaacaaacttaacatcgacttgctaagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgccaact 24715755  T
Q  621 caca 624  Q
    ||||    
T  24715754 caca 24715751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 21 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 24749382 - 24748779
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24749382 catgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttattggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatc 24749283  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  24749282 gacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaaataatgtcccatttccactccagtacatccaac 24749183  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  24749182 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatacacaaactgagcaacgtcacgtttcaaaccggacc 24749083  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  |||||||    
T  24749082 accaaaatagtttcttcaaatcatggtacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactc 24748983  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  |||||||    
T  24748982 atcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaacctcagaacaccctgaacatcaaccttgaaatcgctatcctcagtgtcattaccagcaaccatcaaa 24748883  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||| | |||  ||| || ||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| |    
T  24748882 tcaacaaacttaacatcgacttgctaagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgccaact 24748783  T
Q  621 caca 624  Q
    ||||    
T  24748782 caca 24748779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 22235728 - 22235134
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||  ||||||| |||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||| || ||| | || || |    
T  22235728 tgaatataaatctccgccaactaagctaccgaataactaatattaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaaccaatatagcat 22235629  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  22235628 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctacagg 22235529  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  |||||||| |||||| ||||||| || ||||||    
T  22235528 cttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccagaccactaaaacagctttttcaaa 22235429  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  22235428 tcatggtacatctttgtagctcccagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaactcttcattatcatgaatacaaa 22235329  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||| |||||||||| || || || |||||||||||||  ||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||  |    
T  22235328 ttcttcctctgaacctcaacacatcctgatcatcgaccttaaagtcactatcctcagcttcattaccaacaaccatcaaatcaacaaacttcacatctac 22235229  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     | ||| |||||||||||| | |||||||| | ||| | ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22235228 ctgctgcgcttctcggatattattcaagaaatcactgttaatctttagcatccccaactgaatactctgaggtgtcaattcacagacaaggctca 22235134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 17269162 - 17268622
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  17269162 catgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgataggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatc 17269063  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     || || |||||||| |  ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  17269062 aaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactctggtacatccaac 17268963  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  ||||| || ||||    
T  17268962 ggtgtcaacaatcctgcaggtttctgatggtcaaccttagacttctggcaagttaaacatgcatacacaaaatgagcgacatctcgcttcaacccagacc 17268863  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||  ||    
T  17268862 accaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgctcaagctactcttgtgactttcctctaggattaactttttcatttc 17268763  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||| | |  ||||| |    
T  17268762 ttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatgccattaccagcaaccatcaga 17268663  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatact 561  Q
    ||||||||||| | |||| | | ||| ||||||||||||||    
T  17268662 tcaacaaacttgacatccacctgctgtgcttctcggatact 17268622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 21890567 - 21889973
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||| |    
T  21890567 tgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggaataaagtgtgtcgacttcgtcaacctatagacaacaacccaaatggcat 21890468  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21890467 catgccctctcggagtattttgtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaacccttcagg 21890368  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||  || |||| |||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  21890367 cttctgatgctcaaccttagacttttgacaagtcgaacatgcataaacaaactgagcaacatcatgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaaa 21890268  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || || || | | |||||||  ||||||| ||| | |||||||| ||||    
T  21890267 tcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactaaagctacttttgtggctttcttccaaactcaactttttcaactcatcactatcaggaatgcaaa 21890168  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || ||||||||||||| |||| ||||| |||||||  | ||| | |||||  | |  ||| ||||| |||||||| | |||  |    
T  21890167 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcaccaaccttgaagtcactatatttagtttgattactagcaaccattaaatcgacaaacttgacatcaac 21890068  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || ||||||| ||||||||||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  21890067 ttgttgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgtacactctgaggtgacaactcataaacaagactca 21889973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 43 - 633
Target Start/End: Original strand, 22462514 - 22463103
Alignment:
Q  43 aatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtca 142  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |||    
T  22462514 aatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatca 22462613  T
Q  143 tgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggct 242  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||     
T  22462614 tgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgatatcccatttccactctggtacctccaacggtgtcaacaaacctgcaggcc 22462713  T
Q  243 tctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatc 342  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||| ||| |  | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  22462714 tctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaaccgagcgacagccttcttcaaaccagaccaccaaaacagcttcttcaagtc 22462813  T
Q  343 atggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaact 442  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| || || | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |    
T  22462814 atgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttccaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaaatt 22462913  T
Q  443 ctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctt 542  Q
    || ||||| |||| || |||||| || | |||||| ||||||||||||| ||| |  | |||||| | |  ||| ||||| |||||||| | |||  |||    
T  22462914 ctgcctctaaatctcaacacaccttg-ttatcaaccttgaaatcactattctctgcttgattaccagcaaccattaaatccacaaacttaacatcaactt 22463012  T
Q  543 tctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagact 633  Q
      || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  || |||||||| |||||||| | ||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  22463013 gttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgcacactttgagatgacaattcacacacgagact 22463103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 495
Target Start/End: Original strand, 20774319 - 20774773
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |    
T  20774319 tgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaat 20774418  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||| ||||||| ||| || |||||||| |  |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20774419 catgtcctctcgaagtattaggtaaacttgacacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcggg 20774518  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    | ||||||| ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||| |||||  | |||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  20774519 cctctgatgttcaactttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaaccgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaag 20774618  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    || || |||||||||||||| ||| ||||||| |||||  | ||||| ||||  || || | |||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||    
T  20774619 tcttgatacatttttgtagctcccaggtgaatactcaagttgctcttatgaccttcttctaaaatcaacttcttcaattcctcattgtcagggatacaaa 20774718  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctc 495  Q
     ||| ||||| |||| || |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  20774719 ttctgcctctaaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactctcctc 20774773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 28894750 - 28894296
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || || || ||||| || |  |    
T  28894750 tgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaat 28894651  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28894650 catgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcggg 28894551  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    | ||||||| ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||| |||||  | |||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  28894550 cctctgatgttcaactttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaaccgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaag 28894451  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||  || || | |||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||    
T  28894450 tcttgatacatttttgtagctcccgggtgaatactcaagttgctcttatgaccttcttctaaaatcaacttcttcagttcctcattgtcagggatacaaa 28894351  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctc 495  Q
     ||| ||||| |||| || |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  28894350 ttctgcctctaaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactctcctc 28894296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 28916221 - 28915767
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || || || ||||| || |  |    
T  28916221 tgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaat 28916122  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28916121 catgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcggg 28916022  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    | ||||||| ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||| |||||  | |||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  28916021 cctctgatgttcaactttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaaccgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaag 28915922  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||  || || | |||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||    
T  28915921 tcttgatacatttttgtagctcccgggtgaatactcaagttgctcttatgaccttcttctaaaatcaacttcttcagttcctcattgtcagggatacaaa 28915822  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctc 495  Q
     ||| ||||| |||| || |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  28915821 ttctgcctctaaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactctcctc 28915767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 28923576 - 28923122
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || || || ||||| || |  |    
T  28923576 tgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaat 28923477  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28923476 catgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcggg 28923377  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    | ||||||| ||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||| |||||  | |||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  28923376 cctctgatgttcaactttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaaccgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaag 28923277  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||| ||||  || || | |||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||    
T  28923276 tcttgatacatttttgtagctcccgggtgaatactcaagttgctcttatgaccttcttctaaaatcaacttcttcagttcctcattgtcagggatacaaa 28923177  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctc 495  Q
     ||| ||||| |||| || |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  28923176 ttctgcctctaaatctcaacacaccttgctcatcaaccttgaaatcactctcctc 28923122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 497
Target Start/End: Original strand, 20822013 - 20822469
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |    
T  20822013 tgaatgtagatttccgccaactgagctactggataacttatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaactacaacccatatagaat 20822112  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||    
T  20822113 catgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacgaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcccgcagg 20822212  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    | ||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| |||||| | || |||||  | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||     
T  20822213 cctctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacacgcatacacaaaccgtgcgacatccttcttcaatccggaccaccaaaacaacttcttcaag 20822312  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || || | |||||||||| |||| || |||||||| |||| |||||    
T  20822313 tcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaaattactcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcgggaacacaaa 20822412  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcag 497  Q
     ||| ||||| |||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20822413 ttctgcctctaaatctcaatacaccttgttcatcaactttgaaatcaccatcttcag 20822469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 21831568 - 21831122
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| |||||||| || ||||| || |||||| |||| ||||| || ||||| || || |||||||||| ||| |  || ||||| ||||||||||| ||    
T  21831568 gaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattgattggaataaagtgcgccgacttcgacaatctatcaacaaccacccaaatggcatc 21831469  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  | || ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  21831468 atgccctctcggagtattcggtaatcttgttacaaaatccatgcatatgctatctcattttcactccggcacatctaacggtgtcaacaacccagtaggc 21831369  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  21831368 ttctgatgttcaactttagatttttgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgcttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagt 21831269  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||     
T  21831268 catgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaaactacttttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcagggatacaaat 21831169  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcac 488  Q
    ||| |||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  21831168 tctgcctcagaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcac 21831122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 21563780 - 21563187
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| |||||||| || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||    
T  21563780 gaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcggaataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggcatc 21563681  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  |  |     
T  21563680 gtgccctcttggagtattcggtaaacttgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactccggcacatccaatggtgtcaacaacccaacaagt 21563581  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  21563580 ttctgatgttcaactttagatttatggcaaatcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagt 21563481  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| |||||||| || || ||||| || || |||||  ||||||| || || | |||||||||  ||||||| | ||| | |||||||||||     
T  21563480 catgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcataattataaggaatacaaat 21563381  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctct 541  Q
    | |   || ||||| || |||||  ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| | |||||  | |  || ||| || |||||||| | |||  ||    
T  21563380 tatgtgtcggaatctcaacacacgttgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaact 21563281  T
Q  542 ttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||| |  || |||| ||| |||||||  | ||||| ||| ||||| ||||| || |||||||    
T  21563280 ttctgtgcttctttgatactgttcaagaactcactgttgatcttcaacatacccaacttcacactctaaggcgacaactcacaaacgagactca 21563187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 78 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 26738498 - 26737949
Alignment:
Q  78 tgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaa 177  Q
    ||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  26738498 tgatattaattagaaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaa 26738399  T
Q  178 atccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaa 277  Q
    |||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| | |  || || ||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  26738398 atccatggatatgctatcacatttccactctggtacatctaaagataccatcatcccagcaggtttctgatgctcaacttttgacttctgacaaatcaaa 26738299  T
Q  278 caggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctca 377  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| ||||    
T  26738298 caggaatacacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcagatcatgatacattttcgtagctccctgatgaatactca 26738199  T
Q  378 acctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaac 477  Q
    | |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||  |||| || | |||| |||||||| |     
T  26738198 agctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaattcttcctcgaaatctcaacgcaccatgatcatcgat 26738099  T
Q  478 tttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttacta 577  Q
    ||| ||||||| ||| ||||| | |||||  | | ||| ||| || |||||||| | |||  |||| ||   ||||   ||||| ||||  || | ||||    
T  26738098 tttaaaatcaccatcttcagtctgattactagcaatcaacaagtccacaaacttaacatcaactttatgtctttctttaatacttttcagaaattcacta 26737999  T
Q  578 tcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| |||||    
T  26737998 tcaatcttcagcattcccagcttcacactctgaggtgacaattcgcagac 26737949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 197 - 506
Target Start/End: Original strand, 21496789 - 21497098
Alignment:
Q  197 cacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgag 296  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  21496789 cacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttttgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgag 21496888  T
Q  297 caacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctc 396  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || || |||||  ||||||| ||    
T  21496889 caacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaggtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttc 21496988  T
Q  397 ctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctca 496  Q
     || | |||||||||  |||| || || || | |||||| |||| ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||    
T  21496989 ttctaaaatcaactttttcaaatcatccttattaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttca 21497088  T
Q  497 gtgtcattac 506  Q
    || |||||||    
T  21497089 gtttcattac 21497098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Original strand, 23471787 - 23472215
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||| | | || ||||||||||||| || ||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||    
T  23471787 catgtagcttcacaatattgcgaatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatattaatcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatc 23471886  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     |||| ||| ||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||  |||| ||||||     
T  23471887 aacaattacacaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactatggtatatctaaa 23471986  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| || ||||  || ||||  | |||||| || ||||    
T  23471987 ggtgttatcaaccctgcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacatatcaaacaggaatataccaactatgccacataacgtttcaacccagacc 23472086  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||  || |||| ||||| ||||| || || |||||  | | | |||| |||||||||| |||| ||| |||    
T  23472087 accaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcgttctagctcccggatgaatacttaagctacttctataaatctcttcaagaatcatcttcttcatctc 23472186  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctc 449  Q
     |||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  23472187 atcatcgtcaggaatacaaattctgcctc 23472215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Original strand, 27610938 - 27611389
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  27610938 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgactttgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 27611037  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || || ||| ||||| |||||    
T  27611038 ctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctg 27611137  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  27611138 atgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 27611237  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  27611238 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 27611337  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| |||| ||| | ||| |||||||| || |||||    
T  27611338 ctcggaatctcaacacaccttgattatcgattttaaaatcactgtcttcagt 27611389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 16357083 - 16357537
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||      
T  16357083 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgc 16357182  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || ||    
T  16357183 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggttt 16357282  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  16357283 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 16357382  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  16357383 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 16357482  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  16357483 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 16357537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 190 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 21680437 - 21679992
Alignment:
Q  190 actatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaaca 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| |||    
T  21680437 actatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggtttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacaca 21680338  T
Q  290 aactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgt 389  Q
    || ||||||||||| |  |||||||| | |||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  21680337 aattgagcaacatcacgcttcaaaccaggccaccaaaacagctttttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgt 21680238  T
Q  390 gactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    |||| || || | ||||||| |  | | ||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||   || |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21680237 gactttcttccaaaatcaacctttttatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcact 21680138  T
Q  490 atcctcagtgtcattac-ctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcag 588  Q
    ||||||||  | |||||  | || | || ||||| |||||||| | |||  | |  || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  |||||||     
T  21680137 atcctcagcttgattactattaact-attaaatccacaaacttgacatcaacctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcat 21680039  T
Q  589 cattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  21680038 catacccaactgcacactctggggtgacaattcgcaaacaagactca 21679992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 27518988 - 27519442
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||      
T  27518988 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgc 27519087  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || ||    
T  27519088 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggttt 27519187  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  27519188 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 27519287  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  27519288 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 27519387  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  27519388 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 27519442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 34567075 - 34567529
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||      
T  34567075 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgc 34567174  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || ||    
T  34567175 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggttt 34567274  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  34567275 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 34567374  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  34567375 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 34567474  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  34567475 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 34567529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 24797583 - 24797446
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24797583 actctttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 24797484  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24797483 atccttcagtaactctaaccacctcctctgcctcatgt 24797446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 20467901 - 20467448
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    ||||||||||| |  ||||| | ||| ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| | |||||    
T  20467901 atgtaaatctccgtcaactgagatacaggacaactgatattaatcggaatgaa-tgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagtgtcat 20467803  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||||| |||||| || || ||    
T  20467802 tcccttttggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacttctaaagatgtcatcaacccagcaggttt 20467703  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    || ||||||||| || ||||| | ||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  20467702 ctaatgctcaacttttgacttttaacaaatcaaacatgaatatacaaactgtgccacatcacgtttcaaccccgaccaccaaaccaacttcttcaaatca 20467603  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  ||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||  ||||||||||||| |     
T  20467602 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgttactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcatcaggaatacaaattt 20467503  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | ||||  |||| || ||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  20467502 tgcctcgaaatcgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcagt 20467448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Original strand, 41771426 - 41771877
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||| ||||||| |  ||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  41771426 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatactaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 41771525  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| || || |||||    
T  41771526 ctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctg 41771625  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  41771626 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 41771725  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  41771726 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 41771825  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  41771826 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 41771877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 489
Target Start/End: Original strand, 40709412 - 40709806
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  40709412 aaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactat 40709511  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  40709512 cccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactg 40709611  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  40709612 tgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactc 40709711  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    || |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  40709712 tcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcact 40709806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 14886177 - 14886040
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14886177 actctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 14886078  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14886077 atccttcagtaactctaaccacctcctctgcctcatgt 14886040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22332641 - 22332238
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  22332641 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactat 22332542  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||  || ||  || || || |||||||||||||| || || ||||| || |  ||||||| ||| ||||||||    
T  22332541 cccacttccattccggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcaactttcgatttctggcaaactaaacaggaatacacaaactg 22332442  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  22332441 tgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttatttaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactc 22332342  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcct 494  Q
    || |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |    
T  22332341 tcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtctt 22332242  T
Q  495 cagt 498  Q
    ||||    
T  22332241 cagt 22332238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 449
Target Start/End: Original strand, 22349007 - 22349409
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||  || ||||  |||| ||| ||||| | ||    
T  22349007 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataaccctaattgcgtcgttcc 22349106  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  22349107 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccggcaggtttctg 22349206  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  22349207 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 22349306  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||| |||| | | ||| ||||||||  ||||||||| ||| |    
T  22349307 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcccgtgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctagaatacaaattcttc 22349406  T
Q  447 ctc 449  Q
    |||    
T  22349407 ctc 22349409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 470
Target Start/End: Original strand, 19770544 - 19770967
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||   ||    
T  19770544 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctcc 19770643  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| || || |||||    
T  19770644 ctctcggagtatttggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctg 19770743  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  19770744 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 19770843  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  19770844 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 19770943  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgat 470  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||    
T  19770944 ctcggaatctcaacacaccttgat 19770967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 29475875 - 29475424
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| || || || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  29475875 taaatctctgccaattgggcaacagggaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 29475776  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  29475775 ctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 29475676  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||| | ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||  | |  ||||| ||||||||     
T  29475675 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacatgaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccaggaaatcttctttaaatcatga 29475576  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  29475575 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 29475476  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  29475475 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 29475424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 27668292 - 27667850
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  27668292 taaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 27668193  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |  || || ||||| |||  || || ||| ||||| |||||    
T  27668192 ctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattttggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctg 27668093  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  27668092 atgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 27667993  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||  ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| ||||| |||| ||| |    
T  27667992 tacatcttcgtagatcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatgcaaattcttc 27667893  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    |||  |||| || ||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  27667892 ctcgaaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcact 27667850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 37291298 - 37290890
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  37291298 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 37291199  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  37291198 ctctaggagtgtttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 37291099  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||| || |  ||||||||||||||     
T  37291098 atgctcaactttctacttctgacagactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaactagaccaccagaaaatcttcttcaaatcatga 37290999  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||| |||| || ||||||| ||| |    
T  37290998 tacatcttcgtggctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcctaatctcttcaatgtctgggatacaaattcttc 37290899  T
Q  447 ctctgaatc 455  Q
    ||| |||||    
T  37290898 ctcggaatc 37290890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 14999541 - 14999124
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| || || | ||    
T  14999541 taaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttcc 14999442  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  14999441 ctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 14999342  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  14999341 atgctcaactttagacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 14999242  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  14999241 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 14999142  T
Q  447 ctctgaatcacagcacac 464  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  14999141 ctcggaatctcaacacac 14999124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 37542567 - 37542430
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37542567 actccttcaccatcaaagcagacacgtgcaaagttttcctacttaaagcgtcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 37542468  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  37542467 atccttcaataactctaaccacctcctctgcctcatgt 37542430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 20343469 - 20343601
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20343469 ttcatcatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctgctcaaagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcct 20343568  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  20343569 tcagtaactctaaccacctcctatgcctcatgt 20343601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 25849262 - 25849394
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  25849262 ttcaccatcaaagcagacatgtgcaaagttttcctgctcaaagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatctt 25849361  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  25849362 tcagtaactctaaccatctcctctgcctcatgt 25849394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27685202 - 27684779
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  27685202 taaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 27685103  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  27685102 ctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 27685003  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  27685002 atgctcaattttagacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 27684903  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| ||||||||  | ||||||| ||| |    
T  27684902 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctaggatacaaattcttc 27684803  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgat 470  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||    
T  27684802 ctcggaatctcaacacaccttgat 27684779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 492
Target Start/End: Original strand, 25423768 - 25424217
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||||||||| || || |  || ||| |||| |||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  25423768 gaatataaatctctgccaattgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtc 25423867  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||||| |    || ||  || || ||     
T  25423868 attccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctgacacatctaaagacaccatcataccagcaggt 25423967  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||| | ||    
T  25423968 ttctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacatcgcgtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagat 25424067  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||     
T  25424068 catgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaa-ttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaat 25424166  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatc 492  Q
     |||||||  || | || |||||  |||||||| | ||| |||||||||||    
T  25424167 cctacctcgaaacctcaacacacgttgatcatcgattttaaaatcactatc 25424217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 360
Target Start/End: Original strand, 21407722 - 21408035
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |     || |||| ||||||||| || | ||| |    
T  21407722 taaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgttaatcggaataaaatgggccgacttcgttagtgtatccacaattacccaaatcgcataatgtc 21407821  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||  | || |||||    
T  21407822 cttttggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatatattatcccacttccactctggaatatctaaaggtgtcaacaaaccaacaggtttctg 21407921  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
     || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||  ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||     
T  21407922 gtgttcaacttttgacttctgacaaattaaacacgcatacacaaattgtgccacatctcgcttcaacccggaccaccaaaataaattcttcaaatcatga 21408021  T
Q  347 tacatttttgtagc 360  Q
    ||||||||||||||    
T  21408022 tacatttttgtagc 21408035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 596
Target Start/End: Original strand, 22135300 - 22135801
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  22135300 aaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgatatactat 22135399  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  22135400 cccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcactccagtaggtttttgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactg 22135499  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||| ||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  22135500 tgccacacctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactc 22135599  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcct 494  Q
    || || ||||||| |||| | | ||| |||||||| ||||||||||  ||  ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |    
T  22135600 tcttctagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaatcctttctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactttctt 22135699  T
Q  495 cagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcc 594  Q
    |||| | |||||  | |  || |||||| |||||||| | |||  ||||||| |||||   |||||| ||||  || | ||||||||| |||||||| ||    
T  22135700 cagtctgattactagcaaccaacaaatctacaaacttgacatcaactttctgtgcttccttgatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatacc 22135799  T
Q  595 ca 596  Q
    ||    
T  22135800 ca 22135801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 128 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 21339018 - 21338659
Alignment:
Q  128 acccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtca 227  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||| | |  ||    
T  21339018 acccaaattgcgtcattccctttaagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccaatctggcacatctaaagatacca 21338919  T
Q  228 acaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaa 327  Q
     || ||| |  || |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||| || |||||| ||||    
T  21338918 tcatccccgtaggtttctgatgctcaactttcgacttttgacaaattaaacaagaatacacgaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccacgaaaa 21338819  T
Q  328 cagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattg 427  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| |    
T  21338818 caacttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcg 21338719  T
Q  428 tcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatca 487  Q
    ||  ||||||||| |||||||| ||||| ||  || ||||||||||| | ||| ||||||    
T  21338718 tctagaatacaaattctacctcggaatctcaatactccctgatcatcgattttaaaatca 21338659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 186
Target Start/End: Original strand, 22381765 - 22381904
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |  ||||||||||| |||||||    
T  22381765 taaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctatcaaccagaacccaaatggcatcatgcc 22381864  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccataga 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  22381865 ctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccataga 22381904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Original strand, 20800032 - 20800483
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| | || |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| |  || | ||  |||||||| ||||||| ||    
T  20800032 taaatctctgccaactgggcaacaggaaacctaatattaatcggtagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaataataacccaaattgcgtcattcc 20800131  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || || ||||     
T  20800132 ctctaggagtattcggtaaacgcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttcta 20800231  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| | || ||| ||| ||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||| || |  ||||| | ||||||     
T  20800232 atgtttaatcttcgacctctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttagatcatga 20800331  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||   ||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| |||||||||||||| || ||    
T  20800332 tacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaggttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaaattcgac 20800431  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| || ||||| ||||| || |||| ||| |||||    
T  20800432 ctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagt 20800483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 498
Target Start/End: Original strand, 23440842 - 23441245
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| || ||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  23440842 aaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactat 23440941  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  23440942 cccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttatgacaaactaaacaagaatacacaaattg 23441041  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||| | |||||| || |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  23441042 tgctacatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactc 23441141  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcct 494  Q
    |||||||||||||  ||| ||| ||| |||| |||| |||| ||||  | ||||| ||||| || |||||| || ||||| ||||| || |||| ||| |    
T  23441142 tcctcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcacgaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatctt 23441241  T
Q  495 cagt 498  Q
    ||||    
T  23441242 cagt 23441245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 401
Target Start/End: Original strand, 23574329 - 23574675
Alignment:
Q  50 atctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctc 149  Q
    |||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||     || ||||  |||||| | | ||||| |||||    
T  23574329 atctctgccaactgggcaaccggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtca-----tcaacaatcacccaatttgtgtcattccctc 23574423  T
Q  150 tcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatg 249  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || || ||||||||    
T  23574424 taggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatg 23574523  T
Q  250 ctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtac 349  Q
     |||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| || |  ||||| | |||||| |||    
T  23574524 ttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatac 23574623  T
Q  350 atttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaa 401  Q
    || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||    
T  23574624 atcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaa 23574675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 127 - 480
Target Start/End: Original strand, 18776434 - 18776787
Alignment:
Q  127 tacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtc 226  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||  |||| | ||| |||||||| | |  |    
T  18776434 tacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatctcatatccatttcggcacatctaaagatacc 18776533  T
Q  227 aacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaa 326  Q
    | ||  || || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||| | ||| |||||||| || ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  18776534 atcataccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaagaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccaaaccaccaga 18776633  T
Q  327 acagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcatt 426  Q
    | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| |||  |||     
T  18776634 aaatcttctttaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctgcatc 18776733  T
Q  427 gtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaacttt 480  Q
    ||||||||| ||||  | ||||| ||||| || |||||| ||||| || |||||    
T  18776734 gtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgacttt 18776787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 22503881 - 22503968
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22503881 gacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttca 22503968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 474
Target Start/End: Original strand, 23517112 - 23517537
Alignment:
Q  49 aatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccct 148  Q
    ||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  ||  ||   |||||||| ||||||| ||||    
T  23517112 aatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcagcagtcacccaaattgcgtcattccct 23517211  T
Q  149 ctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgat 248  Q
     | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | |||||||| | |  || |   || || || |||||||    
T  23517212 ttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctagcacatctaaagataccatcgtaccagcaggtttctgat 23517311  T
Q  249 gctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggta 348  Q
    | |||| |||  |||||||||| |  |||||||  || |||||||  || ||||| | |||||| |  ||||||   || | |||||||| |||||| ||    
T  23517312 gttcaatcttcaacttctgacaaactaaacaggattacacaaactatgccacatcgcatttcaatcaagaccactggaaaattttcttcagatcatgata 23517411  T
Q  349 catttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacct 448  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||  | ||||||||||| || ||||    
T  23517412 catcttcatagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatctttaggaatacaaattcgacct 23517511  T
Q  449 ctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    | ||||| || |||||| || |||||    
T  23517512 cggaatctcaacacaccatggtcatc 23517537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 23079270 - 23079138
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  23079270 ttcaccatcaaagcagacatatgtaatgttttcctgctcaacgcattagcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcat 23079171  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||| ||||||||||| ||||    
T  23079170 tcaacagctctaaccatctcctctgcctcatgt 23079138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 639 - 768
Target Start/End: Original strand, 20822643 - 20822772
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  20822643 accatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatctttta 20822742  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
     |||||  | ||| ||||||||||| ||||    
T  20822743 ataactcaagccatctcctctgcctcatgt 20822772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 21679944 - 21679827
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| || || |||||    
T  21679944 gacatgtgtaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattggctttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatccttcaatagctctaacc 21679845  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  21679844 atctcctctgcctcatgt 21679827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 639 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 28894120 - 28893991
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  28894120 accatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatggtagttcaaaccaaaatcataatccttta 28894021  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
     |||||  | ||| ||||||||||| ||||    
T  28894020 ataactcaagccatctcctctgcctcatgt 28893991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 639 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 28915591 - 28915462
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  28915591 accatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatggtagttcaaaccaaaatcataatccttta 28915492  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
     |||||  | ||| ||||||||||| ||||    
T  28915491 ataactcaagccatctcctctgcctcatgt 28915462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 639 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 28922946 - 28922817
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  28922946 accatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatggtagttcaaaccaaaatcataatccttta 28922847  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
     |||||  | ||| ||||||||||| ||||    
T  28922846 ataactcaagccatctcctctgcctcatgt 28922817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 639 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 28930859 - 28930730
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  28930859 accatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatggtagttcaaaccaaaatcataatccttta 28930760  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
     |||||  | ||| ||||||||||| ||||    
T  28930759 ataactcaagccatctcctctgcctcatgt 28930730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 22235101 - 22234969
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  22235101 ttcaccatcaaagcagacatatgcaacgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaagatggtaattcaagccaaattcatagtcct 22235002  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | ||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  22235001 tcaacagctccaaccatctcctctgcctcatgt 22234969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 24619461 - 24619344
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | || |||||    
T  24619461 gacatgtgtaacgttttcctgctcaaagcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaagtcaaaatcataatccttcaacagctctaacc 24619362  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | || |||||||| ||||    
T  24619361 atcttctctgcctcatgt 24619344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 24715692 - 24715575
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | || |||||    
T  24715692 gacatgtgtaacgttttcctgctcaaagcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaagtcaaaatcataatccttcaacagctctaacc 24715593  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | || |||||||| ||||    
T  24715592 atcttctctgcctcatgt 24715575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 24748720 - 24748603
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | || |||||    
T  24748720 gacatgtgtaacgttttcctgctcaaagcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaagtcaaaatcataatccttcaacagctctaacc 24748621  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | || |||||||| ||||    
T  24748620 atcttctctgcctcatgt 24748603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 22463153 - 22463270
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||  | ||    
T  22463153 gacatgtgcaacgtcttcctactcaacgcatctgcaactacattaactttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatcttttaataactcaagcc 22463252  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  22463253 atctcctctgcctcatgt 22463270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 16357710 - 16357809
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  16357710 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 16357809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 21872216 - 21872129
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21872216 gacatgtgcaacgtctttcagctcaaagcatctgcaaccacattagctttactcggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 21872129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 21876496 - 21876409
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21876496 gacatgtgcaacgtctttcagctcaaagcatctgcaaccacattagctttactcggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 21876409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 27519614 - 27519713
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  27519614 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 27519713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 27667668 - 27667569
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27667668 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaagccaaagtcataatctttca 27667569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 27684578 - 27684479
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  27684578 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaagccaaagtcataatctttca 27684479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 34567702 - 34567801
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  34567702 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 34567801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 40709988 - 40710087
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  40709988 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 40710087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 744
Target Start/End: Original strand, 18777004 - 18777109
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||  |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  18777004 accatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacctagatgataattcaaaccaaaatcataatctttca 18777103  T
Q  739 gtaact 744  Q
    | ||||    
T  18777104 gcaact 18777109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 41772050 - 41772147
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  41772050 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatcctt 41772147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 14998917 - 14998818
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  14998917 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 14998818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 726
Target Start/End: Original strand, 20774949 - 20775036
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaat 726  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || || || ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  20774949 accatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaactactttagctttatctggatggtagttcaagccaaaat 20775036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 22135876 - 22135975
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  22135876 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 22135975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 22332065 - 22331966
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  22332065 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 22331966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 27611562 - 27611661
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  27611562 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 27611661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 29475251 - 29475152
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  29475251 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 29475152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 440
Target Start/End: Original strand, 21881728 - 21881926
Alignment:
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || |||||   |||||| || |||||||| || |  ||||||| ||    
T  21881728 ttctgatgttcaatctttgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgcgacatcgtgtttcaatccagaccaccagaatatcttcttcagat 21881827  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
     ||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| |||||  | |||||||  ||||||||||  ||| ||| |||  |||  |||||||||||||    
T  21881828 tatgatacatcttcgtagctctcgggtgaatactcaagctacttctatgactctattcaagaatcattttcttcatctctacataatcaggaatacaaa 21881926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 663 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 17268488 - 17268423
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatca 728  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||    
T  17268488 gtcttcctactcaatgcatcagcgactacattagcttttcccggatggtaattcaacccaaaatca 17268423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 724
Target Start/End: Original strand, 19771168 - 19771253
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaa 724  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19771168 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatccgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaa 19771253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 663 - 728
Target Start/End: Original strand, 21497156 - 21497221
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatca 728  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21497156 gtcttcctgctcaaagcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatca 21497221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 21936366 - 21936269
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  21936366 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 21936269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 24582400 - 24582497
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  24582400 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 24582497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 27012274 - 27012371
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  27012274 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 27012371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 23441418 - 23441517
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  23441418 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagttttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 23441517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 23472436 - 23472535
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||  |||| ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  23472436 accatcatagcggacatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctagatgataatttaacccaaaatcataatccttca 23472535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 23574937 - 23575036
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  23574937 accatcatagcggacatatgcaatgccttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 23575036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 37290674 - 37290575
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  37290674 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgggtgataattcaaaccaaagtcgtaatccttca 37290575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 652 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 21563138 - 21563052
Alignment:
Q  652 acatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||| | |||||||    
T  21563138 acatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaactaaaatcatagtccttca 21563052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 21497845 - 21497772
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaa 114  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |  || ||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21497845 tgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaa 21497772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 26737905 - 26737816
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatca 728  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||  ||||| |||||||| | |||||||    
T  26737905 accatcatagcggacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacttggatgataattcaaactaaaatca 26737816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 504; Significance: 0; HSPs: 81)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 504; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Original strand, 1064008 - 1064623
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1064008 catgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattgataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtc 1064107  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1064108 gacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 1064207  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1064208 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaaccaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggacc 1064307  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1064308 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 1064407  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1064408 ttcattgttaggaatacaaactctacctctgaacctcagtacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 1064507  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1064508 tcaacaaacttcaaatcctctttctgagcttctcgaatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaatt 1064607  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  1064608 cacagacaagactcat 1064623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Original strand, 20828516 - 20829131
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20828516 catgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtc 20828615  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20828616 gacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 20828715  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20828716 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctaacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatccctttttaaaccggacc 20828815  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20828816 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 20828915  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  20828916 ttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcgttaccagaagtcatcaga 20829015  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20829016 tcaacaaacttcaaatcttctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaatt 20829115  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  20829116 cacagacaagactcat 20829131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Original strand, 31830915 - 31831530
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31830915 catgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccgggtaactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 31831014  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31831015 gacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 31831114  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31831115 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaaatcaaacatgcataaacaaactgagcaacatctcttttcataccggacc 31831214  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  31831215 accaaaacagcttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttctttaactc 31831314  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31831315 ctcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcaacacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattaccagaagtcatcaaa 31831414  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31831415 tcaacaaacttcaaatcttctttctgagctcctcggatactgttcaagaaatcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctggggtgacaatt 31831514  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  31831515 cacagacaagactcat 31831530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 513
Target Start/End: Original strand, 20833242 - 20833734
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20833242 catgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtc 20833341  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20833342 gacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 20833441  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20833442 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctaacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatccctttttaaaccggacc 20833541  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20833542 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccctgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 20833641  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagt 513  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20833642 ttcattgtcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcgttaccagaagt 20833734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11358060 - 11357646
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11358060 catgaagttttaccacactgcgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataattgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 11357961  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357960 gacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 11357861  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11357860 ggtgccaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggacc 11357761  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11357760 accaaaacagtttcttcaagtcatgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 11357661  T
Q  421 gtcattgtcaggaat 435  Q
     ||| ||||||||||    
T  11357660 ttcaatgtcaggaat 11357646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 19652218 - 19651622
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| |    
T  19652218 tgaatataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaatcggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtctacaataacccaaatggcat 19652119  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19652118 catgccctctcggagtgttcggtatacttgtcactaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 19652019  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    | ||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19652018 cctctgatgttcaacgttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaatcagcttcttcaaa 19651919  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||| || || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19651918 tcatgatacattttcgtagctcccggatgaatattcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatgcaaa 19651819  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaat--cactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcc 538  Q
     ||| |||||||||| ||  |||||| ||||||| || ||||| |  ||||||||||| || ||||||| | |   ||||||||||||||||||| ||||    
T  19651818 ttcttcctctgaatctcaatacaccccgatcatccaccttgaagtcacactatcctcaatgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcacatcc 19651719  T
Q  539 tctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     ||| ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19651718 acttgctgcgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaattgaacactctgaggtgtcaattcacagacaagactca 19651622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 23277053 - 23277647
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||| || ||||| || || |    
T  23277053 tgaatataaatctccgccaactgcgctaccggataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcat 23277152  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  23277153 catgccctcttggagtgttcggtaaaatcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccattccggcacatctaacagtgtcaacaaccctgcagg 23277252  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||||| ||||| || ||    |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23277253 cttctgatgttcaaccttagacttctgacaactcaagcacgcatatacaaattgagcgacgtcatgcttcaaaccggaccaccaaaatagcttcttcaaa 23277352  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||    
T  23277353 tcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaa 23277452  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   |  |||||||||||| ||||||| |||  |    
T  23277453 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcttcagtttcattaccaacaaccatcaaatcaacgaacttcacatctac 23277552  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| ||||| || |||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23277553 ttgctgcgcttctcggatactattcaagaagtcactgttaatcttcagaatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactca 23277647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 144 - 635
Target Start/End: Original strand, 23294315 - 23294806
Alignment:
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23294315 gccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccactttcactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggctt 23294414  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23294415 ctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacacttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatca 23294514  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || |||||||| || || ||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |  ||||  |||||||| |||| ||    
T  23294515 tgatacattttcgttgctcccggatgaatattcaagctactcttgtgactttcctctagaattaactttttcaaattatcatcatcaggaatgcaaattc 23294614  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctcttt 543  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| | |  ||| ||||| |||||||||| |||| |||     
T  23294615 ttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagcttcattaccagcaaccattaaatccacaaacttcacatccactta 23294714  T
Q  544 ctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||| | ||| |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23294715 ctgagcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaacttaatactctgaggtgtcaattcacagacaaggctca 23294806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 24948866 - 24949461
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||| ||||| |||||| |||||| || ||||| || || |    
T  24948866 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaataaagtgcgccaacttcatcaacctgtcgaccacaacccatatagcat 24948965  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||    
T  24948966 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatcctatcccatttcaactccggcacatccaacgatatcaacaaccctgcagg 24949065  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| |||||||| || |  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24949066 cttctgatgttcaaccttagacttctgataagtcaaacatgcatacacaaaatgagcaacgtcacgcttcaaactggaccaccaaaacagcttcttcaaa 24949165  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||  | ||||  | |||||| ||||    
T  24949166 tcatgatacattttcgtagctcccagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaaccatcatcatgaggaatgcaaa 24949265  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcac-accctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcct 539  Q
     ||| |||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| ||||||| | |  | | |||| |||| |||||| ||||     
T  24949266 ttcttcctctgaatctcatcacaaccatgatcatcaaccttgaagtcacgatccttagtgccattaccagcaacccttaaattaacatacttcacatcca 24949365  T
Q  540 ctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||| | |||   ||| |||||||| |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  24949366 ctttctgtgcttctcggatactatctaagaaatcactgataatcttcagcatccccaactgaacactctgaagtgtcaattcacagacaaggctca 24949461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 624
Target Start/End: Original strand, 27787998 - 27788601
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  27787998 catgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgataggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatc 27788097  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     || || |||||||| |  ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  27788098 aaccacgacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaat 27788197  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || ||||    
T  27788198 ggtgtcaacaatcctgcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagacc 27788297  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||  |||  ||    
T  27788298 accaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttc 27788397  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |   |||||| | |  ||| | |    
T  27788398 ttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatactattaccagtaaccattaga 27788497  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||| ||||| | |||| ||| ||| |||||||| ||||| |||| ||| |  || | ||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  27788498 tcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctcgaatactattcaggaaatcgctgttaatctttagcatccccaactgtatgctttgaggcgacaact 27788597  T
Q  621 caca 624  Q
    ||||    
T  27788598 caca 27788601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 492
Target Start/End: Original strand, 12574610 - 12575081
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  12574610 catgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgataggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatc 12574709  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     || ||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  12574710 aaccactacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaat 12574809  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || ||||    
T  12574810 ggtgtcaacaatcctgcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagacc 12574909  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||  |||  ||    
T  12574910 accaaaacagctctttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttc 12575009  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatc 492  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12575010 ttcattatcagggatacaaactctacctctgaatctaagcacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatc 12575081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 27210338 - 27209744
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |    
T  27210338 tgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatagaat 27210239  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  27210238 catgccccctcggagtattaggtaaacttatcacaaaatccatataaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcctgcagg 27210139  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||  |||| |||||  | |||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  27210138 cctctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaaacgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaag 27210039  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| || || |  ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| |    
T  27210038 tcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttctaatatcaacttcttcaattctttattgtcaggaatacaga 27209939  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     | | ||||| |||| || |||||| || |||||||  ||||||||||||| |||||  | |||||  | |  ||| ||||| |||||||| | |||  |    
T  27209938 ttttgcctctaaatctcaacacaccttgctcatcaatcttgaaatcactattctcagcctgattactagtaaccataaaatccacaaacttgacatcaac 27209839  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  || |||||||| |||||||| | ||| |||| ||| |||||||| || |||||||    
T  27209838 ttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgcacactttgagatgataattcacatacgagactca 27209744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Original strand, 24642017 - 24642290
Alignment:
Q  39 tgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggc 138  Q
    ||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24642017 tgtgaatatgaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaattggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggc 24642116  T
Q  139 gtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcg 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||     
T  24642117 atcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgccaacaaccctgca 24642216  T
Q  239 ggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaa 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  24642217 ggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcaa 24642290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 47 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 27365239 - 27364789
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || ||||| || |||||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |  ||||| || ||||| || |  ||||| |    
T  27365239 taaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtc 27365140  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27365139 ctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtatatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctg 27365040  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||     
T  27365039 atgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccagaccaccaaaacagctttttcaaatcgtga 27364940  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || | ||||||| |  ||| ||| || ||||||||||| |||| ||| |    
T  27364939 tacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgc 27364840  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcag 497  Q
    |||||||   || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27364839 ctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcag 27364789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 635
Target Start/End: Original strand, 23111013 - 23111607
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| |||||||| || ||||| || |||||| |||| |||||||| || || ||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  23111013 gaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcgggataaaatgcgctaacttcgtcaatctatcgacaactacccaaatagcatc 23111112  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||    
T  23111113 atgccctcttggagtattgggtaaacttgttacaaaatccatggatatgttatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaggc 23111212  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||| | ||||| |||||||| |||||||| |  || || |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  23111213 ttctgatgttcaactttagatttctggcaagtcaaatatgcatatacaaactgtgcaacatcacacttaaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagt 23111312  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc-tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | | || |||||  ||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||  |||    
T  23111313 catgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaaagctacttatgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactcatcactgtcaagaatgaaaa 23111412  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||| |||| |||   ||| | |||||  | |  || |||||| |||||||| | |||       
T  23111413 ttctgcctcagaatctcaacataccctgatcatcaaccttgaagtcaccatctctagtttgattactagcaaccaacaaatccacaaacttaacatcaaa 23111512  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||| ||||||   |||||||||||||| | ||| |  || |||| ||| |||||||  | | ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23111513 tttctgtgcttctttaatactgttcaagaattcactgttgatcttcaacatacccaacttcacaatctgaggtgacaactcacaaacaagactca 23111607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21125325 - 21125006
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||      
T  21125325 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgaaaacaacccaaatggcac 21125226  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |     
T  21125225 catgtcctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgtaga 21125126  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||||| || ||||||||||||| |||||||||     
T  21125125 cttgtgatgctcaaccttagacttctgacaagccaaacatgcataaacaaattgagcaagatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaag 21125026  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagc 360  Q
    ||||| ||||| | ||||||    
T  21125025 tcatgatacatctctgtagc 21125006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 16925640 - 16926094
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||      
T  16925640 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgc 16925739  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || || ||| ||||| ||    
T  16925740 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgttatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggttt 16925839  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||    
T  16925840 ctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgctacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatca 16925939  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  16925940 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 16926039  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  16926040 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 16926094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 16999280 - 16999734
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||      
T  16999280 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgc 16999379  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || || ||| ||||| ||    
T  16999380 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgttatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggttt 16999479  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||    
T  16999480 ctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgctacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatca 16999579  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  16999580 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 16999679  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  16999680 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 16999734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Original strand, 27371552 - 27372003
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  27371552 taaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaataggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 27371651  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  27371652 ctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 27371751  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||||    
T  27371752 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgg 27371851  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  27371852 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 27371951  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  27371952 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 27372003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 407
Target Start/End: Original strand, 45529822 - 45530154
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||  |  || |||| ||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||    
T  45529822 aactgatgttaattagaataaaatgagccgacttcgtcagtctatccacaattacccaaatcgcatcatgtccttttggagtattcggcaaactcgtcac 45529921  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| ||     
T  45529922 aaaatccatggacatactatcccacttccactctagaacatctaaaggtgtcaacaacccagcaggtttctgatgttcaactttcgacttctgacaaatt 45530021  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||| ||||| ||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  45530022 aaacacgcatacacaaattgtgccacatctcgcttcaacccggaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatac 45530121  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 407  Q
    ||||  ||||  ||||||| || || |||||||    
T  45530122 tcaaattacttctgtgactttcttctagaatca 45530154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 24819818 - 24819395
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    |  ||||  |||| ||| | ||||| |||| | ||||| ||||| |||||||| ||    
T  24819818 aactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatcaccccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcac 24819719  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| | |    
T  24819718 aaaatccatggatatgctatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgctcaacttttgacttttgacaaagc 24819619  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| ||||| || || ||||  |||||||| |  |||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||| || || |    
T  24819618 aaacaggaatacacaaattgtgccacattacttttcaacctagaccaccaaaacaacctcttcaaataatgatacatctttctagctcccggatggatac 24819519  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  |||||||||| | |||| ||| |||| ||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||| || ||||||||    
T  24819518 tcaagctacttctgtgactctctttaagagtcatcttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctacctcagaatctcaacactccttgatcatc 24819419  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     |||||||| |||||||| |||||    
T  24819418 gactttgaagtcactatcttcagt 24819395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 9610416 - 9610870
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||      
T  9610416 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgc 9610515  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || ||    
T  9610516 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggttt 9610615  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  9610616 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 9610715  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  9610716 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 9610815  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  9610816 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 9610870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24876909 - 24876464
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||| || || | |||||| ||||| |||||||| |  || ||||| |||||||| ||||| | ||    
T  24876909 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgatcggtaggaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaacaacccaaattgcgtcgttcc 24876810  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  24876809 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccggcaggtttctg 24876710  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||||||  ||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  24876709 atgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccaaaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 24876610  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| |||||||||| ||| |    
T  24876609 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttc 24876510  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatc 492  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  24876509 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatc 24876464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 10869130 - 10869584
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||      
T  10869130 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaatcgcgtcgc 10869229  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| || || ||    
T  10869230 tccctctcggagtactcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggttt 10869329  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  10869330 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 10869429  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||| ||| || ||||||| ||    
T  10869430 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcatcgtctgggatacaaattc 10869529  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  10869530 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 10869584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 489
Target Start/End: Original strand, 27218296 - 27218741
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||      
T  27218296 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgc 27218395  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || | ||| |||  || || ||| || || ||    
T  27218396 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtgtaaaggtaccatcatcccagcaggttt 27218495  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  27218496 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgttttaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 27218595  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  27218596 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 27218695  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  27218696 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcact 27218741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 16923169 - 16923623
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||| ||  || ||||  |||||||| ||||| |    
T  16923169 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgt 16923268  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| ||||| ||    
T  16923269 tccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggttt 16923368  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  16923369 ctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 16923468  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  16923469 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 16923568  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  16923569 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 16923623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 16982432 - 16982886
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||| ||  || ||||  |||||||| ||||| |    
T  16982432 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgt 16982531  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| ||||| ||    
T  16982532 tccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggttt 16982631  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  16982632 ctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 16982731  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  16982732 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 16982831  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  16982832 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 16982886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 17063997 - 17064451
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||| ||  || ||||  |||||||| ||||| |    
T  17063997 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgt 17064096  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| ||||| ||    
T  17064097 tccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggttt 17064196  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  17064197 ctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 17064296  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  17064297 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 17064396  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  17064397 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 17064451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Original strand, 17067655 - 17068109
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||| ||  || ||||  |||||||| ||||| |    
T  17067655 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgt 17067754  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| ||||| ||    
T  17067755 tccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcgggttt 17067854  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  17067855 ctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 17067954  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||    
T  17067955 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattc 17068054  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  17068055 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 17068109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Original strand, 1064650 - 1064787
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1064650 actctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 1064749  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1064750 atccttcagtaactctaaccacctcctctgcctcatgt 1064787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Original strand, 31831557 - 31831694
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31831557 actccttcaccatcaaagcagacatgtgtaaagttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 31831656  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31831657 atccttcagtaactctaaccacctcctctgcctcatgt 31831694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 470
Target Start/End: Original strand, 24710316 - 24710740
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtca-accggtcgacaactacccaaatggcgtcatgc 145  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||| |||  |  ||||  |||||||| |||||   |    
T  24710316 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcacacccctacacaataacccaaattgcgtcgctc 24710415  T
Q  146 cctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttct 245  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || || ||| || || ||||    
T  24710416 cctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcaggtttct 24710515  T
Q  246 gatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatg 345  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||    
T  24710516 gatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatg 24710615  T
Q  346 gtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactcta 445  Q
     ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| |||     
T  24710616 atacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattctt 24710715  T
Q  446 cctctgaatcacagcacaccctgat 470  Q
    |||| ||||| || |||||| ||||    
T  24710716 cctcggaatctcaacacaccttgat 24710740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21145153 - 21144750
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  21145153 aaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgatatactat 21145054  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || ||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  21145053 cccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactg 21144954  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  21144953 tgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactc 21144854  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcct 494  Q
    || |||||||||| |||| | | ||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |    
T  21144853 tcttcaagaatcatcttcttaatctcctcattgtctggaatacaaattctccctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtctt 21144754  T
Q  495 cagt 498  Q
    ||||    
T  21144753 cagt 21144750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 44385729 - 44385278
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| | |||   ||    
T  44385729 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaattgtgtcgctcc 44385630  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
     ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || || ||| ||||| |||||    
T  44385629 atctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctg 44385530  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||| | || || ||||||||||| |  ||||||| ||| | |||||  || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  44385529 atgcccgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacataaactatgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 44385430  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  44385429 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 44385330  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||  || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  44385329 ctcggaatttcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 44385278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 22324988 - 22324593
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  22324988 aactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcac 22324889  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| |      
T  22324888 aaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaact 22324789  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  22324788 aaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatac 22324689  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgat 470  Q
    |||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| ||||| || || | ||||| ||| |||| ||||| || |||||| ||||    
T  22324688 tcaaactacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattatctgggacacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgat 22324593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 470
Target Start/End: Original strand, 24262653 - 24263076
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  24262653 taaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 24262752  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  24262753 ctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 24262852  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  24262853 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 24262952  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||| ||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  24262953 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgaccctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 24263052  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgat 470  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||    
T  24263053 ctcggaatctcaacacaccttgat 24263076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 631 - 768
Target Start/End: Original strand, 20829158 - 20829295
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20829158 actctttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaagcatcagcaaccacattggcctcaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 20829257  T
Q  731 atccttcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    ||| |||||||||| |||||| || |||||||| ||||    
T  20829258 atctttcagtaactctaaccatcttctctgcctcatgt 20829295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 21325426 - 21324877
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||  ||||||  |    
T  21325426 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatctcgtcatatc 21325327  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || || |||||    
T  21325326 ctctaggagtattcggaaaactcgtcacgaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctg 21325227  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| || || || |||||||| | |||||| || |||||||| || |  ||||| ||||| ||     
T  21325226 atgttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatatacgaattgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtga 21325127  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||  ||||||||||||| || ||    
T  21325126 tacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcgac 21325027  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||| ||||| || |||||| || ||||| || || || |||| ||| ||||| | |||||  | | ||| ||| || |||||||| | |||  |||||||    
T  21325026 ctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaatcaacaagtctacaaacttgacatcaactttctg 21324927  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattccca 596  Q
     || |||   ||||| ||||  || | ||||||||| |||||||||||||    
T  21324926 tgcctctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcattccca 21324877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30211077 - 30210717
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaa-tggcgtcatgc 145  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||  | |||||||||||| |  || |||| |||||||| |  | |||||     
T  30211077 taaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgttaattggaataaaattagtcgacttcgtcaatctatccacaattacccaaaatcacatcatgt 30210978  T
Q  146 cctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttct 245  Q
    ||| | ||||| ||||| |||||||  |||||||| || || |||||||||||  ||||||| || | ||||||  ||||||||||||| || || ||||    
T  30210977 ccttttggagtattcggcaaactcgacacaaaatctatggatatactatcccatatccactctggaatatctaaatgtgtcaacaacccagcaggtttct 30210878  T
Q  246 gatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatg 345  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||  ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  30210877 gatgttcaactttcgacttctgacaaattaaacacgcatacacaaattgtgccacatctcgcttcaacccggaccacc-aaacaacttcttcaaatcatg 30210779  T
Q  346 gtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 407  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||| || || |||||||    
T  30210778 atacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttttgtgactttcttctagaatca 30210717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 41608545 - 41608122
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  41608545 taaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 41608446  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || ||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  41608445 ctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccattttcattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 41608346  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  41608345 atgttcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaattgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 41608246  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  41608245 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 41608146  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgat 470  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||    
T  41608145 ctcggaatctcaacacaccttgat 41608122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 23107895 - 23107450
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |  || ||| |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  23107895 gaatgtagatctcggccaactgaggaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtc 23107796  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||  ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || ||     
T  23107795 atttcctttaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggt 23107696  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||| ||| || |  ||||| | ||    
T  23107695 ttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaatccagaccgccagaatatcttctttagat 23107596  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||  ||||  | || ||||| ||| ||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||||||     
T  23107595 catgatacatcttcgtagctcccggattaatactcaagttacttctatggctctcttcaggaatcattttcttcatctcatcattgtcaggaatacaaat 23107496  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatca 487  Q
     | |||||  || | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  23107495 ccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatcaattttaaaatca 23107450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 22756625 - 22756198
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| |  || | ||  |||||| | ||||||| ||    
T  22756625 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaatcggtagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaaaaatcacccaagtcgcgtcattcc 22756526  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  |  || || |||||    
T  22756525 ctctaggagtattcggcaaactcgtcgcaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcatactagcaggtttctg 22756426  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||| ||| ||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| |  |||||||| || |  ||||| | ||||||     
T  22756425 atgttcaatcttcgacttcttacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaatctagaccaccagaatatcttctttagatcatga 22756326  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| |  ||| ||| ||| ||||  ||||||||||||| || ||    
T  22756325 tacatcttcgtagctcccggttgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaattattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcgac 22756226  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    ||| ||||| || |||||| || |||||    
T  22756225 ctcggaatctcaacacaccatggtcatc 22756198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 474
Target Start/End: Original strand, 24675772 - 24676199
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||  || || ||| ||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| | ||||| ||    
T  24675772 taaatctctgccaactaggcaacaggaaaactgatattaatcggtagaaaatgggccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattcc 24675871  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||| ||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || ||  | ||||     
T  24675872 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctattccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaagtttcta 24675971  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||| ||| |||||  |||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||| || |  ||||||| ||||||     
T  24675972 atgctcaatcttcgactttagacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttcttcagatcatga 24676071  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||  ||||||||||||| ||  |    
T  24676072 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaggctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcggc 24676171  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    ||| ||||| || |||||| || |||||    
T  24676172 ctcggaatctcaacacaccatggtcatc 24676199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 21890883 - 21890437
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  || ||| |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| || ||    
T  21890883 gaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcatc 21890784  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||| || |||||||| |    || ||  || || ||     
T  21890783 attccctttaggattattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccttttccactctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggt 21890684  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  21890683 ttctaatgttcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaattgtgcaacatcgcgcttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagat 21890584  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    | |||||||| || ||||| ||  | ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| || | |||  |||||||||     
T  21890583 cgtggtacatcttcgtagctcctagatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcgtcgtctagaatacaaat 21890484  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcac 488  Q
     |||||||  || | || |||||| |||||||| | ||| |||||||    
T  21890483 cctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcac 21890437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 24949494 - 24949626
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24949494 ttcaccatcaaagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccagaatggtaattcaaaccaaaatcataatcct 24949593  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    ||| || || |||||| ||||||||||| ||||    
T  24949594 tcaatagctctaaccatctcctctgcctcatgt 24949626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 23277695 - 23277812
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | || |||||    
T  23277695 gacatgtgcaacgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctaacc 23277794  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  23277795 atctcctctgcctcatgt 23277812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 24707594 - 24707191
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| || | ||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  24707594 aaatgagccgacttcgtcaatctgtcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactat 24707495  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| |  || |||||||| | |  || |   || || || |||| ||| |||| ||| ||||||||||| |  ||||| | ||| ||||| ||    
T  24707494 cccatttccattatggcacatctaaagataccatcgtaccagcaggtttctaatgttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaagaatacacaaattg 24707395  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  24707394 tgccacatcgcgtttcaatccggaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagatcccgggtgaatactcaagctacttctatgactc 24707295  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcct 494  Q
    || ||||||| ||  ||| ||| |   ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| || ||||| ||||| || |||| ||| |    
T  24707294 tcttcaagaaccattttcttcatcaattcatcatcaggaatacaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatctt 24707195  T
Q  495 cagt 498  Q
    ||||    
T  24707194 cagt 24707191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 242 - 488
Target Start/End: Original strand, 23066869 - 23067115
Alignment:
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||| |||| ||| | |||||| || |||||||||||||  ||||| | ||    
T  23066869 ttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaataatacacaaactgtgcaatatcgcgtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagat 23066968  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    | || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||     
T  23066969 cgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaat 23067068  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcac 488  Q
     |||||||  || | || |||||| |||||||| | ||| |||||||    
T  23067069 cctacctcgaaaccgcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcac 23067115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 23099542 - 23099455
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23099542 gacatgtgcaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatccttca 23099455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 23294854 - 23294971
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||  ||||    
T  23294854 gacatatgcaacgtcttcctgctcaacgcatctgccaccaaattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctccaacc 23294953  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  23294954 atctcctctgcctcatgt 23294971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 639 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 27209708 - 27209614
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27209708 accatcaaggcggacatgtgcaatgtctttctactcaacgcatctgcgactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatc 27209614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23099811 - 23099590
Alignment:
Q  414 tcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagt 513  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| | || ||| || || |||||||| |||||||||||| ||||||  | |||||  | |      
T  23099811 tcaactcatcattatcaggaatacaaattctgcctctgaacctcaacacgccttgttcatcaaccttgaaatcactagcctcagcttgattactagtaac 23099712  T
Q  514 catcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggt 613  Q
    ||  ||||| |||||||| | |||  |||  || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  ||||||| ||| |||| ||| | ||||||||||    
T  23099711 caataaatccacaaacttgacatcaacttgttgcgcttctctgatacttttcaagaaatcactattgattttcaacatacccagctgcacactctgaggt 23099612  T
Q  614 gacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||||||| || |||||||    
T  23099611 gacaattcacaaaccagactca 23099590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 121
Target Start/End: Original strand, 23294235 - 23294315
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcg 121  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  23294235 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgattttaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcg 23294315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23817077 - 23816957
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaga 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||   ||||||   | ||| ||||  || |||||||| |||| ||| ||||||||||| |    
T  23817077 acaaaatccatagcgatactatcccacttccactctggcacaaacaacggttgtatcaaacctgacggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaa 23816978  T
Q  273 tcaaacaggcataaacaaact 293  Q
     |||||| |||||||||||||    
T  23816977 ccaaacaagcataaacaaact 23816957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 10869757 - 10869856
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||    
T  10869757 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatggtaattcagaccaaagtcataatccttca 10869856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 16923796 - 16923895
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  16923796 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 16923895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 16926267 - 16926366
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  16926267 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 16926366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 16983059 - 16983158
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  16983059 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 16983158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 16999907 - 17000006
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  16999907 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 17000006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 17064624 - 17064723
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  17064624 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 17064723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 27218923 - 27219022
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  27218923 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 27219022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 631 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 24569212 - 24569107
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||| ||||   |||||||||    
T  24569212 actctttcaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacatttgtcttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaa 24569113  T
Q  731 atcctt 736  Q
    ||||||    
T  24569112 atcctt 24569107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 21144577 - 21144477
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  21144577 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 21144478  T
Q  739 g 739  Q
    |    
T  21144477 g 21144477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 22324392 - 22324293
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  22324392 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 22324293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 23111655 - 23111742
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||  ||||| |||||||| | ||||||| | |||||||    
T  23111655 gacatatgcaacgtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattggctttacttggatgataattcaaactaaaatcatagtccttca 23111742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 24710941 - 24711040
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  24710941 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 24711040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 27372176 - 27372275
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  27372176 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 27372275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 41607921 - 41607822
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  41607921 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 41607822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 44385105 - 44385006
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  44385105 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 44385006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 663 - 733
Target Start/End: Original strand, 27788671 - 27788741
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27788671 gtcttcctactcaatgcatcagcgactacattagcttttcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 27788741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 666 - 736
Target Start/End: Original strand, 45533279 - 45533349
Alignment:
Q  666 ttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  45533279 ttcctacttaaagcatctgcaacaacattagccttacccggatggtaattcaacccgaaatcataatcctt 45533349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 12639769 - 12639672
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  12639769 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatctgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaattgaaaatcaaaatcctt 12639672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 23817164 - 23817115
Alignment:
Q  86 ataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaat 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  23817164 ataggaataaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaatcacccaaat 23817115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 724
Target Start/End: Original strand, 24676396 - 24676481
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaa 724  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24676396 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaa 24676481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 24876285 - 24876185
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||  ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  24876285 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacttggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 24876186  T
Q  739 g 739  Q
    |    
T  24876185 g 24876185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 24707018 - 24706919
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| |||||||  ||||  |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  24707018 accatcaatgcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaggcatctgcaaaaacattagccttacttggataataattcaaaccaaagtcataatctttca 24706919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 663 - 733
Target Start/End: Original strand, 12575284 - 12575354
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12575284 gtcttcctactcaatgcatccgcgactacattagctttgcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 12575354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 666 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 19651559 - 19651457
Alignment:
Q  666 ttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaaccacctcctctgcctga 765  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||  | || |||||| ||||||||||| |    
T  19651559 ttcctacttaaggcatctgcaaccacattagctttcctaggatggtaattcaaaccaaaatcatagtctttcaacagctctaaccatctcctctgcctca 19651460  T
Q  766 tgt 768  Q
    |||    
T  19651459 tgt 19651457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 648 - 738
Target Start/End: Original strand, 24263286 - 24263376
Alignment:
Q  648 gcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  24263286 gcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctgggtgataattcaaaccaaagtcataatctttca 24263376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 21324802 - 21324717
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaa 724  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||  | || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21324802 accatcatagcggacatatgcaaagtcttcctactcaaggcgtctacaacaacattagccttacctggatgataattcaaaccaaa 21324717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21906203 - 21906162
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtaca 214  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21906203 acaaaattcatagatatactatcacacttccactccggtaca 21906162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 485; Significance: 0; HSPs: 89)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 633
Target Start/End: Original strand, 24364902 - 24365514
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24364902 catgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctgccggataattgatattgataggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtc 24365001  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24365002 gacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagatatactgtcccacttccactccggtacatccaac 24365101  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24365102 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacgaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 24365201  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24365202 accaaaacaatttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctactattgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 24365301  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24365302 ttcattatcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatcctcggtgtcattacctgaagtcatcaaa 24365401  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24365402 tcaacaaacttcaaatccactttctgagcttctcggatactgttcaagaagtcactatcaattttcaacattcccaactgtatactctgagatgacaatt 24365501  T
Q  621 cacagacaagact 633  Q
    |||||||||||||    
T  24365502 cacagacaagact 24365514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 10468614 - 10468026
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  10468614 taaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaattgcttcatgcc 10468515  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10468514 ctctcggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatctatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctg 10468415  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| ||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10468414 atgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcatgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 10468315  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  10468314 tacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttctagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttc 10468215  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |  ||| |||||||||||||| | |||| ||| |||    
T  10468214 ctctgaacctcaaaacaccctgatcatcaactttgaagtcactatcctctgtctcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttacatccacttgctg 10468115  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10468114 tgcttctcggatactattcaagaaatcactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattctcagacaagactca 10468026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 5296977 - 5296383
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  5296977 tgaatataaatctcagccaactgagctacccgataattgatgttaataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcat 5296878  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  5296877 catgccctctcggagtgtttggtaaactagtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 5296778  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5296777 cttctgatgctcaaccttagacttctgataagtcaagcatgcatacacaaactgagcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 5296678  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || || | |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||    
T  5296677 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatactcaagctactcttgtaactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaa 5296578  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| | |  ||| |||||||||||||| | ||||      
T  5296577 ttctacctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattacccgcaaacattaaatcaacaaactttacatccag 5296478  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||||| | ||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  5296477 ttgttgcgcttctcggatactattcaagaaatcactgttaattctcagcatccccaattgtatactctgaggtgataactcacaaacaaggctca 5296383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 14381238 - 14380644
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| ||||||||  | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |    
T  14381238 tgaatataaatctcccccaactgagctaccaggtaactaatattaataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcat 14381139  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  14381138 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaatcctgcagg 14381039  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14381038 cctctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 14380939  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14380938 tcatggtacatctttgtagctcccggatgaacactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaactcatcattgtcacgaatacaaa 14380839  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | ||  |||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||| ||||||| | |   ||||||||||||||||||| |||| |    
T  14380838 ttcttcctctgaacctcaatacaccctgatcatccaccatgaagtcactttcctcagtgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcacatccac 14380739  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || ||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||| || ||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14380738 ttgctgcgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatctttagcatccccaattgaacactctgaggtgtcaattcacagacaagactca 14380644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 8762704 - 8762110
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||  |||| || || |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |    
T  8762704 tgaatatagatctccgccaactgagctaccggataattgatatcaatcagaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatggcat 8762605  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  8762604 catgccctctctgagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatataaatgtcgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 8762505  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8762504 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaa 8762405  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  || | |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||    
T  8762404 tcatggtacatttttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttttgtgactttattctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaa 8762305  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| | |  ||| |||||||||||||| | |||| |    
T  8762304 ttctacctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttacatccac 8762205  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || ||| | |||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8762204 ttgctgcggttctcggatactattcaggaaatcactattaattttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaattcacagacaaggctca 8762110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 19453930 - 19454524
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||| ||| || || ||||||||||| |    
T  19453930 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaataaagtgcgctgactttgtcaacctgtcaaccacaacccaaatggcat 19454029  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |     
T  19454030 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgatatcccaattccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaga 19454129  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19454130 cttctgatgttcaaccttagacttctaacaagtcaaacatgcatacacaaattgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaa 19454229  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||  ||||||||||||| ||||| | |||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||    
T  19454230 tcatgttacattttcgtagctcccggatgaatacttaagttactcttgtgactttcctcgaaaatcaattttttcaactcgtcatcatcaggaatacaaa 19454329  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||| | |||| |    
T  19454330 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatccac 19454429  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || ||||||| |||| | |||||||| | ||| | ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19454430 ttgttgtgcttctctgatattattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgcacactctgaggtgtcaattcacagacaagactca 19454524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 21472111 - 21472705
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  21472111 tgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcgggataaaatgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcat 21472210  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21472211 catgccctcttggagtattcggtaaactcgtcgcaaaattcatggagatactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcagg 21472310  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21472311 cttctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaaa 21472410  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||  ||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||| | |||||||| ||||    
T  21472411 tcatggtacatctttgtagctcccgggtgaatacttaagctgcttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcactatcaggaatgcaaa 21472510  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     | | |||||||| | || ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||  | |  ||||||||| |||||||| | |||       
T  21472511 ttattcctctgaacctcaacacgccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttgattactagcaaccatcaaatccacaaacttgacatcaat 21472610  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||| ||||| |  |||||||||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||| || || ||||||||||    
T  21472611 tttctgcgcttccctaatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgcacactctgaggtggcaactcgcaaacaagactca 21472705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 182 - 635
Target Start/End: Original strand, 19435653 - 19436106
Alignment:
Q  182 atagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacagg 281  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |    
T  19435653 atagaaatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacacg 19435752  T
Q  282 cataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacct 381  Q
    |||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  19435753 catacataaactgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagct 19435852  T
Q  382 actcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttg 481  Q
    |||||||||||| |  || | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||| || |||    
T  19435853 actcttgtgactttattctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatccaccttg 19435952  T
Q  482 aaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaa 581  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| | |   ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||    
T  19435953 aagtcactatcctcagtgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcacatccacttgctgagcttctcagatactattcaagaaatcactatgaa 19436052  T
Q  582 ttttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||||||| |  || || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19436053 ttttcagcatcctgaattgaacactctgaggtgtcaattcacagacaagactca 19436106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 28282604 - 28282001
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  28282604 catgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgataggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatc 28282505  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     || || |||||||| |  ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  28282504 aaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaat 28282405  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || ||||    
T  28282404 ggtgtcaacaatcctgcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagacc 28282305  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || |||||  |||  ||    
T  28282304 accaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatgcttaagctactcttatgactttcctctaggattaactttttcatttc 28282205  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |   |||||| | |  ||| | |    
T  28282204 ttcattatcaggaatacaaattctacctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcaatactattaccagtaaccattaga 28282105  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||| ||||| | |||| ||| ||| |||||||| ||||| |||| ||| |  || | ||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  28282104 tcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctcgaatactattcaggaaatcgctgttaatctttagcatccccaactgtatgctttgaggcgacaact 28282005  T
Q  621 caca 624  Q
    ||||    
T  28282004 caca 28282001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 43 - 635
Target Start/End: Original strand, 25768703 - 25769295
Alignment:
Q  43 aatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtca 142  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||| || | ||| ||||| |||||||||||||||   ||||| || ||||||||||| |||    
T  25768703 aatgtaaatctccgccaactgagctactggaaaactaatattgatcgaaataaaatgcgccgacttcgtcaacgtatcgacgacaacccaaatggcatca 25768802  T
Q  143 tgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggct 242  Q
    || || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25768803 tgtcccctcgaagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatactgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggct 25768902  T
Q  243 tctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatc 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25768903 tctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttaaaatc 25769002  T
Q  343 atggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaact 442  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||  ||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||| |    
T  25769003 atggtacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttccaaaatcaactttttcaactcatcactatcaggaatacaaatt 25769102  T
Q  443 ctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctt 542  Q
    || ||||| || | || |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| | | |||||  | |  ||| ||||| |||||||| | |||   ||    
T  25769103 cttcctctaaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcattttgattactagcaaccattaaatccacaaacttgacatcaattt 25769202  T
Q  543 tctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||| ||||| | |||| |||| ||||| | |||||  || |||| ||| ||| |||| | |||||||||||| || ||||| | ||||||||    
T  25769203 tctgcgcttccctgatattgtttaagaaatcactattgatcttcaacataccctactgcacactctgaggtgataactcacaaagaagactca 25769295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Original strand, 18795206 - 18795794
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||  ||||| || ||||| || |  ||||| |    
T  18795206 taaatctccgccaactgagctaccggaaaactgatatttatcggaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtc 18795305  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    | ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18795306 ccctcggagtgtttggtaaaattgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccacttccactctggaacatctaatggtatcaacaaccctgcaggcttctg 18795405  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  18795406 atgctcgaccttagacttctggcaagtcaaacacgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatga 18795505  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || |  ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  18795506 tacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcttgtgactttcttccaagatcaactttttcaactcatcattgtccggaatacaaattctac 18795605  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||   ||  ||| ||||| |||||||| | |||  | |  ||    
T  18795606 ctctgaacctcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcttcagattgattactataaaacattaaatccacaaacttgacatcaacctgttg 18795705  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     ||||||| |||||| |||||||| | |||||  ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18795706 cgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctgaggtgacaattcacaaacaagactca 18795794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 497
Target Start/End: Original strand, 15459846 - 15460302
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  |    
T  15459846 tgaatgtaaatctctgccagctgagctactggataacttatattaatcggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaat 15459945  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    | || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  15459946 cgtgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtatatccaacggtgtcaacaatcctgcagg 15460045  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||| | || |||||  | ||||| || |||||||||||||  ||||||||     
T  15460046 cttctgatgttcaatcttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaaccgcgcgacatccttcttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaag 15460145  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | ||||| ||||| || || | |||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  15460146 tcatgatacattttcgtagctcctggatgaatactcaaattgctcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcgggaatacaaa 15460245  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcag 497  Q
     ||| ||||| |||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15460246 ttctgcctctaaatctcaatacaccttgttcatcaactttgaaatcaccatcctcag 15460302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 21563903 - 21563309
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  ||||| || ||||| || |  |    
T  21563903 tgaatatatatctccgccaactgagctacctgataactgatattgatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaat 21563804  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  |    
T  21563803 catgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgttatcccatttccactccggcacatccaacgatgtcaacaaccctgcaag 21563704  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  21563703 cttctgatgttcgaccttagacttctggcaagtcaaatatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaatctcttcaag 21563604  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||  ||||| |||| || ||||| | ||| ||||   ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21563603 tcatgatacatcttcgtagctcccggatggatgcttaagttactcctgtggctttcctctaaaattaactgtttcaactcatcattatcaggaatacaaa 21563504  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| ||||| |||| || ||| || || |||||||| |||||||||||| ||||||  | |||||  | |  ||  | ||| |||||||| | |||  |    
T  21563503 ttctgcctctaaatctcaacacgccttgttcatcaaccttgaaatcactagcctcagcttgattactagtaaccaatatatccacaaacttgacatcaac 21563404  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  ||||||| ||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21563403 ttgttgcgcttctctgatacttttcaagaaatcactattgattttcaacatacccagctgcacactctgaggtgacaattcacaaacaagactca 21563309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 21569762 - 21569168
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  ||||| || ||||| || |  |    
T  21569762 tgaatatatatctccgccaactgagctaccagataactgatattgatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaat 21569663  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  |    
T  21569662 catgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgttatcccatttccactccggcacatccaacgatgtcaacaaccctgcaag 21569563  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  21569562 cttctgatgttcgaccttagacttctggcaagtcaaatatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaatctcttcaag 21569463  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||  ||||| |||| || ||||| | ||| ||||   ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21569462 tcatgatacatcttcgtagctcccggatggatgcttaagttactcctgtggctttcctctaaaattaactgtttcaactcatcattatcaggaatacaaa 21569363  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| ||||| |||| || ||| || || |||||||| |||||||||||| ||||||  | |||||  | |  ||  | ||| |||||||| | |||  |    
T  21569362 ttctgcctctaaatctcaacacgccttgttcatcaaccttgaaatcactagcctcagcttgattactagtaaccaatacatccacaaacttgacatcaac 21569263  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  ||||||| ||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21569262 ttgttgcgcttctctgatacttttcaagaaatcactattgattttcaacatacccagctgcacactctgaggtgacaattcacaaacaagactca 21569168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 34645351 - 34644900
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| || || || |||||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |  ||||| || ||||| || |  ||||| |    
T  34645351 taaatctctgccaattgcgccaccggaaaactgatatttatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgactacaacccatatagaatcatgtc 34645252  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34645251 ctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcctctg 34645152  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||   |||||||||||| || ||||| || |||    
T  34645151 atgttcaacctttgacttctgacaagtcaaacacgcatatacaaactgagcaacatcacgcttcaaaccaacccaccaaaacagctttttcaagtcgtgg 34645052  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || | ||||||  |  ||| ||| || || |||||||| |||| ||| |    
T  34645051 tacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaatcttttcatctcatcgttatcaggaatgcaaattctgc 34644952  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||||||||| || |||||| || |||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  34644951 ctctgaatctcaacacaccgtgttcatcaaccttgaaatcaccatcttcagt 34644900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Original strand, 19879814 - 19880402
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || ||||| || | |||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |  ||||| || ||||| || |  ||||  |    
T  19879814 taaatctccgccaactgcgccatcggaaaactgatatttatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatattgaatcatatc 19879913  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    | ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19879914 ccctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagaaatgctatcccatttccactctggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctg 19880013  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||| || ||||| || ||     
T  19880014 atgttcaactttagacttctggcaagtcaaacaggcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccagaccactaaaacagctttttcaagtcgtga 19880113  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || | ||||||| |  ||| ||| || |||| ||||||||||| ||| |    
T  19880114 tacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcttgtggctttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgttaggaatacaaattctgc 19880213  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    |  ||| ||||| |||||||| | |||  | |  ||    
T  19880214 ctctgaacctcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcttcagtctgattactatcaaccattaaatccacaaacttgacatcaacctgttg 19880313  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     ||||||| ||||||  ||||||| | | |||  ||||||| ||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  19880314 tgcttctctgatactactcaagaattcattattgattttcaacatgcccaactgcacactctggggtgacaattcacaaacaaggctca 19880402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22796403 - 22796132
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || ||||| || |||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  22796403 tgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactaataatgatcggaataaagtgtgtcgactttgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcat 22796304  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||  | | |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22796303 catgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatgtatatgttgttccacttccactttggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcagg 22796204  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaa 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22796203 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaa 22796132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 627
Target Start/End: Original strand, 15896607 - 15897190
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||  ||||||||  || |||    
T  15896607 atgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaataacgccat 15896706  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||  | |  || |||||| || || ||    
T  15896707 tccctttcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactttggtacatctatagataccatcaacccagcaggttt 15896806  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || | ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||| || ||||||||||| |   |||||||||||    
T  15896807 ctgatgctcaacttttgacttctgacaaattagacatgaatatacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaataacctcttcaaatca 15896906  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| |||||||| || || || || |||||  ||||  |||||||||| | |||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||| || ||    
T  15896907 tgatacatctttgtagctcctggatggatactcaagatacttgtgtgactctctttaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcaggaatacgaattc 15897006  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctcttt 543  Q
    | ||||  |||| || ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| | ||| ||   |   |  ||||| |||||||| | |||  ||||    
T  15897007 tgcctcgtaatcgcaacactccctgatcatcaaccttaaagtcactatcttcagtctgatttccaccaacaagtaaatctacaaactttacatcaacttt 15897106  T
Q  544 ctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
     || ||||||   |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  15897107 ttgtgcttctttaatactgttcaagaattcactatcaatcttcagcattcctaacttcacactctgaggtgacacttcacagac 15897190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 27560408 - 27560106
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  27560408 catgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgataggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatc 27560309  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
     || || |||||||| |  ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  27560308 aaccaccacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaat 27560209  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  27560208 ggcgtcaacaatcctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctctcttcaacccagacc 27560109  T
Q  321 acc 323  Q
    |||    
T  27560108 acc 27560106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 18197496 - 18196916
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||||||||| | |||   | ||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||    || ||||  |||||||| ||||| |    
T  18197496 atgtaaatctctgctaactgagatacaaaaaaactgatgttaatcggaatgaaatgatctgacttcgtcaatttatccacaatcacccaaatagcgtcgt 18197397  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | || |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| || ||    
T  18197396 tccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgcatatgctatcccatttccactctggtatatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggttt 18197297  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttc---aaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||||||||| |||||||   | |||||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||   || || |||||||||||||  || ||||||    
T  18197296 ctgatgctcaacctttgacttctagaaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaataatcccgaccaccaaaacaaatttttcaaa 18197197  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| || | ||| ||||||||||    
T  18197196 tcatgatacatcttggtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcgtcgtctggaatacaaa 18197097  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||||||||  |||| || |||||| |||||||| || || || |||||||||| ||||| |||||  | |  || ||| || |||||||| |  ||  |    
T  18197096 ttctacctcgaaatctcaacacaccttgatcatcgaccttaaagtcactatccttagtgtgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacgtcaac 18196997  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattc 621  Q
    |||||| |||||    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||  | |||||||| |||||||||    
T  18196996 tttctgcgcttcaataatacttttcaagaaatcactatcaatcttcagcattcctagcttcacactctgagatgacaattc 18196916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 95 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5838936 - 5838591
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  5838936 aaatgagccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactagtcacaaaatccatggatatactat 5838837  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||| |  || ||  || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  5838836 cccatttccattccggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttctgatgctcgaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactg 5838737  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     |||||||| | |||||| ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  5838736 tgcaacatcacgtttcaatccaaaccaccaaaataacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactc 5838637  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||  ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  5838636 tcctcgagaatcattttcttcatctcttcattgtcagggatacaaa 5838591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 227
Target Start/End: Original strand, 17415996 - 17416182
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  17415996 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaattggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgactactacccaaatggcat 17416095  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtca 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17416096 catgtcctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaaatgttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtca 17416182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 188 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 19488896 - 19488586
Alignment:
Q  188 atactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaa 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |    
T  19488896 atactatcccatttccactccggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaggcttctaatgatcaactttagatttctgacaaatcaaacatgcatata 19488797  T
Q  288 caaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactctt 387  Q
    ||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||  |    
T  19488796 caaactgtgcaacatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttct 19488697  T
Q  388 gtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatca 487  Q
    |||||| || || | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||| ||||| || |||||| ||||||||||| | ||| |||    
T  19488696 gtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacgaattctgcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaacctggaagtca 19488597  T
Q  488 ctatcctcagt 498  Q
    | ||| |||||    
T  19488596 ccatcttcagt 19488586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16626482 - 16626031
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  16626482 taaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaataggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 16626383  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  16626382 ctctcagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 16626283  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||||    
T  16626282 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgg 16626183  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  16626182 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 16626083  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  16626082 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 16626031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Original strand, 25113068 - 25113519
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  25113068 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 25113167  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  25113168 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgatatactatcccatttccattctggtacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 25113267  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  25113268 atgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 25113367  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| |||||||||| ||| |    
T  25113368 tacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttc 25113467  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  25113468 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgaatttaaaatcactgtcttcagt 25113519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 18967054 - 18966477
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    ||||||||||| || ||||| | |||  || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |  || ||||  ||||||||  ||||||    
T  18967054 atgtaaatctccgccaactgagatacaagaaaactgatgttaatcggaatgaaatgagccgacgtcgtcaatctatccacaatcacccaaataacgtcat 18966955  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||| | ||||| ||| | |||||| | ||||||||||| || ||||      | |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||  | || ||    
T  18966954 tcccttttggagtattcagaaaactcatcacaaaatccatggatatac------atttccactctggcacatctaaaggtgtcatcaacccaccaggttt 18966861  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
     ||||||||| | || ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || |  ||||| || ||||| |  ||||| |||||||  || |||||||||    
T  18966860 atgatgctcaccttttgacttctgacaaatcaaacatgaatacacaaattgtggcacatcactattcaacctagaccagcaaaacaaatttttcaaatca 18966761  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18966760 tgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatcttcctcatctcatcattgtcaggaatacaaattc 18966661  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctcttt 543  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| | ||| | ||| ||   | | |  ||||| |||||||| | || | ||||    
T  18966660 tacctcgaaatcacaacactccctgatcatcaaccttaaagtcactatctttagtctgatttccaccaataaataaatctacaaactttacattcacttt 18966561  T
Q  544 ctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    ||| ||||||   ||||| || |  || | ||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| ||||    
T  18966560 ctgcgcttctttaatactattgagaaattcactatcaatcttcagcattcctaacttcacactctgaggtgacaattcatagac 18966477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 455
Target Start/End: Original strand, 27187949 - 27188360
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || || |||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| |    
T  27187949 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgt 27188048  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || |||  |||| ||    
T  27188049 tccctctaggtgtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccaacgggttt 27188148  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||    
T  27188149 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgagccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatca 27188248  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  27188249 tgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatgcaaattc 27188348  T
Q  444 tacctctgaatc 455  Q
    | |||| |||||    
T  27188349 ttcctcggaatc 27188360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 27261291 - 27260880
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || || |||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| |    
T  27261291 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgt 27261192  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || |||  |||| ||    
T  27261191 tccctctaggtgtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccaacgggttt 27261092  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||    
T  27261091 ctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgagccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatca 27260992  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  27260991 tgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatgcaaattc 27260892  T
Q  444 tacctctgaatc 455  Q
    | |||| |||||    
T  27260891 ttcctcggaatc 27260880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 29591685 - 29591234
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || | |||||| || |||||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  29591685 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaatcggtaggaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 29591586  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| || || |||||    
T  29591585 ctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctg 29591486  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  29591485 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 29591386  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  29591385 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 29591286  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| |||| ||| | ||| |||||||| || |||||    
T  29591285 ctcggaatctcaacacaccttgattatcgattttaaaatcactgtcttcagt 29591234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 1542853 - 1542398
Alignment:
Q  43 aatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtca 142  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||  || ||||  |||||||| || |      
T  1542853 aatgtaaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcatat 1542754  T
Q  143 tgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggct 242  Q
    | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || |    
T  1542753 ttccctctgggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtt 1542654  T
Q  243 tctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatc 342  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||  || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  1542653 tctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactatgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatc 1542554  T
Q  343 atggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaact 442  Q
     || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| |||||||||| |    
T  1542553 gtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaatt 1542454  T
Q  443 ctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||  ||| ||||| || || ||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  1542453 ctctctcggaatctcaacagaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 1542398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 498
Target Start/End: Original strand, 23079013 - 23079436
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| | || | ||||| |||   |||||||| ||    
T  23079013 aactgatattaatcggaatgaaatgagccaacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatcgcgtcattcactttaggagtattctaaaaactcgtcac 23079112  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| | |  || || |||  | || |||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  23079113 aaaatccatggatatactatctcatttccactctggtacatctaaagataccatcatcccaacaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatc 23079212  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| ||||| |  || ||||| | |||||| || |||||||||||||  || |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || || |    
T  23079213 aaacaggaatacacaaattatgctacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcagatcatgatacattttcgtagctcccggatggatac 23079312  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||| || ||||||||    
T  23079313 tcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcaggaatagaaattctccctcggaatctcaacactccttgatcatc 23079412  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     | ||| ||||||||||| |||||    
T  23079413 gattttaaaatcactatcttcagt 23079436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 596
Target Start/End: Original strand, 22434385 - 22434934
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||  ||||| || || ||| |||||||||||||  | |  ||||| ||||||||||||||    |||||||  |||||||| ||||||| ||    
T  22434385 taaatctctgtcaactgggcaacaggaaaactgatattaatcagtagaaaatgagccgacttcgtcaatatatcgacaatcacccaaatcgcgtcattcc 22434484  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |  || ||||||| |  || ||  || |  || |||||    
T  22434485 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctgccacgtctaacgataccatcataccagtaggtttctg 22434584  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||     
T  22434585 atgctcaaccttcgacttctgacaaattaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaatccggaccaccaaaatattttcttcagatcatga 22434684  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| |||  || ||||   |||||||||||| || |     
T  22434685 aacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatttcttcatcaacaggaatacaaattcgat 22434784  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||| ||||| || |||||| || ||||| || ||||| |||| ||| ||||| | |||||  | |  || ||| || |||||||| | |||  || ||||    
T  22434785 ctcggaatctcaacacaccgtggtcatcgaccttgaagtcaccatcttcagtctaattactagcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactctctg 22434884  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattccca 596  Q
     ||||||  |||||| ||||  || | ||||||||| |||||||||||||    
T  22434885 tgcttctttgatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattccca 22434934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 28262965 - 28262520
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || ||||| ||||| |  || || |  |||||||| || ||      
T  28262965 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgc 28262866  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  || || ||| ||||| ||    
T  28262865 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattccggcacatccaaaggtaccatcatcccagcgggttt 28262766  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  28262765 ctgatgctcgaccttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcctttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 28262666  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| || | ||| |||||||||| ||    
T  28262665 tgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcgtcgtctggaatacaaattc 28262566  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    | |||| ||||| || ||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  28262565 tccctcggaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcact 28262520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 28341714 - 28341269
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || ||||| ||||| |  || || |  |||||||| || ||      
T  28341714 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgc 28341615  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  || || ||| ||||| ||    
T  28341614 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattccggcacatccaaaggtaccatcatcccagcgggttt 28341515  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||||    
T  28341514 ctgatgctcgaccttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcctttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatca 28341415  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| || | ||| |||||||||| ||    
T  28341414 tgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcgtcgtctggaatacaaattc 28341315  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
    | |||| ||||| || ||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  28341314 tccctcggaatctcaacacgccttgatcatcgattttaaaatcact 28341269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Original strand, 22442783 - 22443234
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||  ||||| || || ||| |||||||||||||  | |  ||||| ||||||||||||||    |||||||  |||||||| ||||||| ||    
T  22442783 taaatctctgtcaactgggcaacaggaaaactgatattaatcagtagaaaatgagccgacttcgtcaatatatcgacaatcacccaaatcgcgtcattcc 22442882  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |  || ||||||| |  || ||  || |  || |||||    
T  22442883 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctgccacgtctaacgataccatcataccagtaggtttctg 22442982  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||     
T  22442983 atgctcaaccttcgacttctgacaaattaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaatccggaccaccaaaatattttcttcagatcatga 22443082  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| |||  || ||||   |||||||||||| || |     
T  22443083 aacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatttcttcatcaacaggaatacaaattcgat 22443182  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| || ||||| || ||||| |||| ||| |||||    
T  22443183 ctcggaatctcaacacaccgtggtcatcgaccttgaagtcaccatcttcagt 22443234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24312933 - 24312510
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  24312933 taaatctctgccaactgggcaacgggaaaactgatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 24312834  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||  || || ||| || || |||||    
T  24312833 ctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacgtctaaaggtaccatcatcccagcaggtttctg 24312734  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| | || |  ||||| ||||||||     
T  24312733 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccactagaaaatcttctttaaatcatga 24312634  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| ||| |    
T  24312633 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgggatacaaattcttc 24312534  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgat 470  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||    
T  24312533 ctcggaatctcaacacaccttgat 24312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 2874520 - 2874128
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  2874520 aaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactat 2874421  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || || ||||| ||   || || ||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  2874420 cccatttccattctggcacgtctaaaggcaccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactg 2874321  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  2874320 tgccacatctcgtttcaaaccagaccaccaaaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactc 2874221  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatca 487  Q
    || |||||||||| |||| | | |||  ||||||| || ||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||||    
T  2874220 tcttcaagaatcatcttcttaatctctccattgtctgggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatca 2874128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 353 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 14379376 - 14379094
Alignment:
Q  353 tttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctga 452  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  14379376 tttgtagctcccggatgaacactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaactcatcattgtcacgaatacaaattcttcctctga 14379277  T
Q  453 atcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttc 552  Q
    | | ||  |||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||| ||||||| | |   ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||    
T  14379276 acctcaatacaccctgatcatccaccatgaagtcactttcctcagtgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcacatccacttgctgcgcttc 14379177  T
Q  553 tcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || |||||| |||||||| | ||||| ||| || ||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14379176 tctgatactattcaagaaatcactattaatctttagcatccccaattgaacactctgaggtgtcaattcacagacaagactca 14379094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 440
Target Start/End: Original strand, 19865203 - 19865596
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || ||  || ||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| ||    
T  19865203 taaatctctgccaactgggcaacacgaaaactgatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattcc 19865302  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || || |||||    
T  19865303 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctg 19865402  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||| || |  ||||||| || |||     
T  19865403 atgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttcttcagataatga 19865502  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  19865503 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaa 19865596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 20637063 - 20636624
Alignment:
Q  50 atctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctc 149  Q
    |||||||| ||||| |  || |||||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| ||||     
T  20637063 atctctgccaactgagaaacaggataactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctt 20636964  T
Q  150 tcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatg 249  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |    || ||  || || || ||||||||    
T  20636963 taggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatg 20636864  T
Q  250 ctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtac 349  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||||| |  ||||| | |||||| |||    
T  20636863 ctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacgtcgcgtttcaatccggaccaccaaaataacttctttagatcatgatac 20636764  T
Q  350 atttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctc 449  Q
    || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||| |||||| |||  |||||||    
T  20636763 atcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaataaaaatcctacctc 20636664  T
Q  450 tgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
      || | || |||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  20636663 gaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcact 20636624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 25609578 - 25609224
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| ||||  |||||||| ||||||| |||| | |||||  |||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  25609578 aaatgtgctgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtaatcggcaaactcgtcacgaaatccatggatatactat 25609479  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || |||||||| | |  || ||  || || || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||| |    
T  25609478 cccatttccaatctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttttgacaaatcaaacaagaatacacaaacgg 25609379  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     |||||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  25609378 tgcaacatcacatttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactc 25609279  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctc 449  Q
    || |||||||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  25609278 tcttcaagaatcatcttcttcatctcttcatcgtctggaatacaaatcctacctc 25609224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 22078427 - 22078014
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||| | ||||| ||||| |||||| | ||    
T  22078427 aactgatattaaccggaagaaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcgttccctttaggagtattcggcaaactcatcac 22078328  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||| |    || ||  || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22078327 aaaatccacggatatactatcccacttccactctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatc 22078228  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||| || ||||||||||| | ||| || | |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  22078227 aaacaagaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaaaataatttttttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatac 22078128  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| |||  || |||||| ||| ||||  || | || || ||| ||||||||    
T  22078127 tcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctagagtacaaattcttcctcgaaacctcaacataccttgatcatc 22078028  T
Q  475 aactttgaaatcac 488  Q
    || ||| |||||||    
T  22078027 aattttaaaatcac 22078014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 22762225 - 22761793
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  || ||| |||||||||||||   ||  ||||| |||||||| ||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  22762225 gaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaatcataagaaaatgagccgacttagtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtc 22762126  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    || ||  || || ||     
T  22762125 attccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggt 22762026  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | ||| | |||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||| | ||    
T  22762025 ttctgatgctcaaccttcgacttctgaaaaatcaaacaagaatacataaactgtgcaacatcgcgtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagat 22761926  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||     
T  22761925 catgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaat 22761826  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
     |||||||  || | || |||||| ||||||||    
T  22761825 cctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatc 22761793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 24365564 - 24365681
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24365564 gacatgtgcaaggttttcctgctcaaagcatcagcaacaacgttggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcagtaactctaacc 24365663  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  24365664 atctcctctgcctcatgt 24365681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28292140 - 28291860
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| | |||||| || ||||| ||||| |  || || |  |||||||| || ||      
T  28292140 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgc 28292041  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  || || ||| ||||| ||    
T  28292040 tccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattccggcacatccaaaggtaccatcatcccagcgggttt 28291941  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccacca 324  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28291940 ctgatgctcgaccttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcttttcaaaccagaccacca 28291860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16927405 - 16926954
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||| |||||| |||| ||| || ||| ||||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||| | ||| ||||  |||||||| ||||||| ||    
T  16927405 taaacctctgccaactatgcaacaggaaaactgatgttaatcggtagaaaatgtgctgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatcgcgtcattcc 16927306  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    || ||  || || || |||||    
T  16927305 ctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctg 16927206  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||||||||  || ||||||| ||| |||||| | |  || |||||||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||    ||||| | ||| ||     
T  16927205 atgctcaattttcgacttctaacaaatcaaataagagtacacaaactgtgccacatcgcgcttcaatccagaccaccaaaatctcttctttagatcgtga 16927106  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||  ||| ||||||||| ||||  | ||    
T  16927105 tacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcattttcctcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgac 16927006  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||| || ||||| ||||| || |||| ||| |||||    
T  16927005 ctcggaatctcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagt 16926954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 18407712 - 18407265
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||||||||| ||| | |  || ||| ||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||| |  || ||||  ||| |||| |||||    
T  18407712 gaatgtaaatctctgccaacagagaaacaggaaaactgatattaatcggaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcaccaaaatcgcgtc 18407613  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    || ||  || || ||     
T  18407612 attccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggt 18407513  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| | |||||| |||||||| | |||||| || ||| | |||||||  ||||| | ||    
T  18407512 ttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacaaaaactgtgcaacatcgcgtttcaatccagactagcaaaacaacttctttagat 18407413  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| || ||||| ||| | ||||| |||||  ||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||  || ||||||||||     
T  18407412 catgatacatcttcgtagctcccagatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatctggaatacaaat 18407313  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcact 489  Q
     |||||||  || | || |||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  18407312 cctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcact 18407265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 641 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 10467988 - 10467861
Alignment:
Q  641 catcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagt 740  Q
    |||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10467988 catcaaagcagacatatgcaatgtttttctgctcaaagcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcattcagt 10467889  T
Q  741 aactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  10467888 aactctaaccatctcctctgcctcatgt 10467861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16963152 - 16962759
Alignment:
Q  105 acttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttcca 204  Q
    |||||||||| | ||| ||||  |||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |    
T  16963152 acttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcga 16963053  T
Q  205 ctccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatct 304  Q
     || || |||||||||| |  || ||  || || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |  || |||||||| || |||||     
T  16963052 ttctggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttctgatgctcaatcttcgacttctgacaaatcaaacaagagtacacaaactgtgccacatcg 16962953  T
Q  305 cttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaa 404  Q
    |  ||||| || ||||||||||| |  ||||| | ||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||    
T  16962952 cgcttcaatccagaccaccaaaatatattctttagatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaa 16962853  T
Q  405 tcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    |||  ||||||| |||  ||| ||||||||| ||||  | ||||| ||||| || ||| || || ||||| ||||| || |||| ||| |||||    
T  16962852 tcattttcctcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacgccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagt 16962759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 127 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27566665 - 27566327
Alignment:
Q  127 tacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtc 226  Q
    ||||||||| || || | |||| | ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| | |  |    
T  27566665 tacccaaattgcatcgttccctataggagtattctgcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccacttccattctggcacatctaaagatacc 27566566  T
Q  227 aacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaa 326  Q
    | ||  || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||| || || ||||| | |||||| || |||||||| |    
T  27566565 atcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaattgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaga 27566466  T
Q  327 acagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcatt 426  Q
    | |  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||  ||| ||| |||  |||     
T  27566465 aaatcttctttaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttttatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctgcatc 27566366  T
Q  427 gtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacacc 465  Q
    ||||||||| ||||  | ||||| ||||| || ||||||    
T  27566365 gtcaggaatgcaaatccgacctcggaatctcaacacacc 27566327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 19454557 - 19454689
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19454557 ttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatcct 19454656  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||||||||||||||| ||||    
T  19454657 tcaacagctctaaccacctcctctgcctcatgt 19454689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 8762077 - 8761945
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    |||||||| || || ||||| ||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8762077 ttcaccattaaagcagacatatgcagcgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcct 8761978  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||| ||||||||||| ||||    
T  8761977 tcaacagctctaaccatctcctctgcctcatgt 8761945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27391943 - 27391547
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |  || ||| |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  ||||||||  ||||    
T  27391943 gaatataaatctctgtcaactgagaaacaggaaaacttatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtc 27391844  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || ||||   ||||| || || || || || ||||||||||| || || |||||||| ||| |||| || |||||||| |    || ||  || || ||     
T  27391843 attcccttaaggagtatttggcaagcttgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttctactctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggt 27391744  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||  | |||||| || ||||||||||| |  ||||| | ||    
T  27391743 ttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaattgtgccacattgcgtttcaacccagaccaccaaaataacttctttagat 27391644  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaataca 438  Q
    |||| ||||| || | ||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  27391643 catgttacatcttcgcagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcgagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaataca 27391547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 21563261 - 21563174
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21563261 gacatgtgcaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatccttca 21563174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 21569120 - 21569033
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21569120 gacatgtgcaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatccttca 21569033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 14379061 - 14378929
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    |||||||| || || ||||| ||||  || |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  14379061 ttcaccattaaggcagacatatgcagcgttttcctacttaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcatagtcct 14378962  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||||||||||||||| ||||    
T  14378961 tcaacagctctaaccacctcctctgcctcatgt 14378929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 14380611 - 14380479
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    |||||||| || || ||||| ||||  || |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  14380611 ttcaccattaaggcagacatatgcagcgttttcctacttaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcatagtcct 14380512  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||||||||||||||| ||||    
T  14380511 tcaacagctctaaccacctcctctgcctcatgt 14380479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 242 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27331003 - 27330807
Alignment:
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||  | |||||| || ||||||||||| |  ||||| | ||    
T  27331003 ttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaattgtgccacattgcgtttcaacccagaccaccaaaataacttctttagat 27330904  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaataca 438  Q
    |||| ||||| || | ||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| || ||||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  27330903 catgttacatcttcgcagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcgagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaataca 27330807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 5296335 - 5296248
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5296335 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaacgcatcaacaaccacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatccttca 5296248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 411
Target Start/End: Original strand, 18436157 - 18436489
Alignment:
Q  83 ttaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatcca 182  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |  || |||| ||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||  ||| | || | ||||||||    
T  18436157 ttaatcggaataaaatgggccgacttcgtcagtctatccacaattacccaaatcgcatcatgtccttttggagtattcgacaaagtagtgaaaaaatcca 18436256  T
Q  183 tagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggc 282  Q
    |  | ||||||||| ||||| |||  || | ||| || |||||||||||||  || || |||||||| ||||| || ||||||| ||| || ||||| ||    
T  18436257 tgaatatactatcctacttcgactttggaatatcaaaaggtgtcaacaaccaagcaggtttctgatgttcaactttagacttctaacaaattaaacacgc 18436356  T
Q  283 ataaacaaactgagcaacatctcttttca----aaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaa 378  Q
    ||| ||||| || || |||||||  ||||    | || ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  18436357 atacacaaattgtgccacatctcacttcaacccacccagaccaccaaaataacttcttcaaatcatgatacatttttgtaggtcccggatgaatactcaa 18436456  T
Q  379 cctactcttgtgactctcctcaagaatcaactt 411  Q
      ||||  ||||||| || || |||||||||||    
T  18436457 attacttctgtgactttcttccagaatcaactt 18436489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 18795842 - 18795959
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||  | || |||||    
T  18795842 gacatgtgtaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattggctttacccggatgatagttcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctaacc 18795941  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  18795942 atctcctctgcctcatgt 18795959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 636 - 760
Target Start/End: Original strand, 19880435 - 19880559
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||    
T  19880435 ttcaccatcatggccgacatgtgcaacgtctttctactcaaagcatctgcaactacgttggctttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatcct 19880534  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctg 760  Q
    ||| || || |||||| ||||||||    
T  19880535 tcaatagctctaaccatctcctctg 19880559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 21472753 - 21472840
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  21472753 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttca 21472840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 639 - 768
Target Start/End: Original strand, 15460476 - 15460605
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  15460476 accatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaactacattagctttacccggatgatagttcaaaccaaaatcataatccttta 15460575  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
     ||| | || ||| ||||||||||| ||||    
T  15460576 ataattctagccatctcctctgcctcatgt 15460605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 638 - 727
Target Start/End: Original strand, 19436141 - 19436230
Alignment:
Q  638 caccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatc 727  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19436141 caccatcaaagcagacatatgcaatgtcttccggctcaacgcattagcaaccacattggctttactaggatggtaattcaaaccaaaatc 19436230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23027355 - 23027235
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaga 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||  || ||| || |  |  |||||||| |||| ||| ||||||||||| |    
T  23027355 acaaaatccataaagatactatcccacttccactccggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacgatttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaa 23027256  T
Q  273 tcaaacaggcataaacaaact 293  Q
     |||||| |||||||||||||    
T  23027255 ccaaacaagcataaacaaact 23027235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 29591061 - 29590962
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  29591061 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 29590962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 27188576 - 27188673
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  27188576 accatcatggcggacatatgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaagtcataatcctt 27188673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 27260664 - 27260567
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  27260664 accatcatggcggacatatgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgataattcaaaccaaagtcataatcctt 27260567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 2873944 - 2873845
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  2873944 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcgacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 2873845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 16625858 - 16625759
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  16625858 accatcatggcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 16625759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 718
Target Start/End: Original strand, 18572793 - 18572872
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaa 718  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||    
T  18572793 accatcaaagcagacatatgcaaggtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagccttcccgggatgataactcaa 18572872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 25113692 - 25113791
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  25113692 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 25113791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15078005 - 15077971
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15078005 acaaaatccatagagatactatcccacttccactc 15077971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 1542225 - 1542140
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaa 724  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  1542225 accatcatagcggacatatgcaatgtcttccgactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatggtaattcaaaccaaa 1542140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 16381514 - 16381417
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  16381514 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 16381417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 16649110 - 16649013
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  16649110 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 16649013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 18837049 - 18836952
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  18837049 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagccttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 18836952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 663 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 28281930 - 28281857
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28281930 gtcttcctactcaatgcatccgcgactacatttgcttttcccggatggtaattcaacccaaaatcataatcctt 28281857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 1647955 - 1647831
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   ||||||||| ||||| |    
T  1647955 accatcaaagcagacacatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttcctggatgataactcaattgaaaatcaaagtccttaa 1647856  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcct 763  Q
    |  | || |||||||||||||||||    
T  1647855 gatatttcaaccacctcctctgcct 1647831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11280270 - 11280203
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaa 114  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||||| || || ||| ||||||||||    
T  11280270 taaatctctgccaactgtgccaccggaaaactgatatttatcggaataaagtgcgccaacttcgtcaa 11280203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 19865839 - 19865926
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  19865839 gacatatgcaacgttttcctactcaaggcatcagcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 19865926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 22761584 - 22761497
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  |||||||| | |||||||    
T  22761584 gacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgatagctcaactcaaaatcatagtccttca 22761497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 734
Target Start/End: Original strand, 23997388 - 23997483
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcc 734  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  23997388 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcc 23997483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 207
Target Start/End: Original strand, 21927847 - 21927881
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactc 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21927847 acaaagtccatagagatactatcccacttccactc 21927881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 648 - 738
Target Start/End: Original strand, 22435018 - 22435108
Alignment:
Q  648 gcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  22435018 gcggacatatgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagttcaaaccaaagtcataatctttca 22435108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 648 - 738
Target Start/End: Original strand, 22443416 - 22443506
Alignment:
Q  648 gcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  22443416 gcggacatatgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagttcaaaccaaagtcataatctttca 22443506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 14129609 - 14129706
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| | || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  14129609 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctacacaaagcatcaacaacaacattagccttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 14129706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 16926781 - 16926684
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  |||||||| |||||||    
T  16926781 accatcatagcggacatgtgcaatgacttcctactcaatgcatctgcaacaacattagctttacctggatgatagctcaactcaaaatcataatcctt 16926684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 468; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 16362 - 15747
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16362 catgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactacgctaccggataattgatattgataggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtc 16263  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16262 gacaacaacccaaatagcgttatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatctaac 16163  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16162 ggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacagccataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 16063  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16062 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaactc 15963  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  15962 ttcattatcaggaatacaaactctacctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaaatcactatccttggtatcattacctgaagtcatcaaa 15863  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15862 tcaacaaacttcaaatccactttttgagcttctcggatactattcaagaagtcattatcaattttcaaccttcccaactatatactctgagatgacaatt 15763  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    ||||||||||||||||    
T  15762 cacagacaagactcat 15747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 15700 - 15583
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15700 gacatatgcaaagtcttcctgctcaaagcatcagcaacaacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcagtaactctaacc 15601  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  15600 acctcctctgcctcatgt 15583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 635
Target Start/End: Original strand, 26923 - 27532
Alignment:
Q  26 agcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaa 125  Q
    |||||||| | ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26923 agcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaa 27022  T
Q  126 ctacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgt 225  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27023 caacccaaacagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatccatagagatactgtcccacttccactacggtacatcaaacggtgt 27122  T
Q  226 caacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaa 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27123 caacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaagcataaacaaaatgagcaacatatcttttcaaaccggaccaccaa 27222  T
Q  326 aacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcat 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  27223 aacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcttcaaatcatcat 27322  T
Q  426 tgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaac 525  Q
      ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||    
T  27323 gatcaggaatacaaactcttcctttgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcactaccaatagtcatcaaatcaac 27422  T
Q  526 aaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacag 625  Q
    ||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27423 aaatttcaaatctattttctgagcttctcggatactgttcaagaaattactatcaatcttcagcatccccaactgtatactctgagatgacaattcacag 27522  T
Q  626 acaagactca 635  Q
    ||||||||||    
T  27523 acaagactca 27532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Original strand, 43466 - 44054
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  43466 taaatctctgccaactgtgctaccagataactgatattaataggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatgacatcatgcc 43565  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||     
T  43566 ctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggcttcta 43665  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43666 atgctcaaccttagacttctgacaagtcaagcatgcatacacaaactgagctacgtcaagtttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcattg 43765  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  43766 tacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttctagaattaacttcttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttc 43865  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||    
T  43866 ctctgaacctcaaaacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccagcagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacttgctg 43965  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  43966 agcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaaggctca 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 44087 - 44219
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44087 ttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctactcaacgcattagcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcct 44186  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||| || |||||||| ||||    
T  44187 tcaaaagctctaaccatcttctctgcctcatgt 44219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 13524 - 12937
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  13524 taaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaatcggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcaacaataacccaaatggcatcatgcc 13425  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13424 ctctcggagtgttcggtaaacttgttacaaaatccatagaaatattgtcccacttccactccggcacatctaacggcgtcaacaaccctgcaggcttctg 13325  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13324 atgctcaaccttagacttgtgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 13225  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |    
T  13224 tacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatgcaaattcttc 13125  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||| | |||| |||  ||    
T  13124 ctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattacccgcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgttg 13025  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactc 634  Q
     |||||||| ||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13024 tgcttctcgtatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtatactctgaggtgacaactcacagacaagactc 12937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 4582 - 3988
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||  |||||| || ||||| || || |    
T  4582 tgaatataaatctccgccaactgagccaccggataactaatattaatcggaataaagtgcgccgactttgtcaacttgtcgaccacaacccatatagcat 4483  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4482 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 4383  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4382 cttttgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaattgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttctttaaa 4283  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| || || |||||||||||||| ||||| | ||| ||| |  | || || ||||| |||||||||||||    
T  4282 tcatgatacatctttgtagctcccgaatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaaccttttgaaatcatcattatcaggaatacaaa 4183  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || ||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||| | |  ||| |||||||||||||||| |||  |    
T  4182 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatccaccttaaactcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacatctac 4083  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |   || |||||||||||||| |||||||| | ||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4082 tagttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgtacactctaaggtgtcaattcacaaacaagactca 3988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 68047 - 68641
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||| || ||||| || |  |    
T  68047 tgaatgtaaatctctgccaactgagctactggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaat 68146  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  68147 catgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaagtccatagaaatgttgtcccatttccactccagtacatccaacggtgtcaacaaccctgtagg 68246  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||  |||||||||    
T  68247 cctctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcgacatccctcttcaaaccagaccacaaaaacaacttcttcaaa 68346  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || || | |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  68347 tcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagttactcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaaa 68446  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| ||||| |||| || |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||  | |||||  | |  ||| ||||| ||||||||   |||  |    
T  68447 ttctgcctctaaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatctctatcctcagcttgattactagtaaccattaaatccacaaacttagcatcaac 68546  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  68547 ttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgacaattcacaaacgagactca 68641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 12910 - 12778
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12910 ttcaccatcaaaggagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttaccatgatggtaattcaagccaaaatcataatcct 12811  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    ||| || ||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  12810 tcaatagctccaaccatctcctctgcctcatgt 12778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 3955 - 3823
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3955 ttcaccatcaaagcagacatatgcaacgtcttgctactcaaggcatctgcaaccacattagctttacccgggtggtaattcaagccaaaatcataatcct 3856  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||| ||||||||||| ||||    
T  3855 tcaacagctctaaccatctcctctgcctcatgt 3823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 68689 - 68806
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||  | ||    
T  68689 gacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatcttttaataactcaagcc 68788  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  68789 atctcctctgcctcatgt 68806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 32942 - 32354
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||    
T  32942 taaatctctaccaactgtgctaccgggtaactgacattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgatagcaacccaaatggcatcatgcc 32843  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32842 ctctcggagtgtttggtaaacttgtcacgaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctg 32743  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  32742 atgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcagatcacgg 32643  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| |    
T  32642 tacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttctagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaattcttc 32543  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||| | ||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  | | |||    
T  32542 ctctgaacctcattacaccctgatcatctaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcatcaaatcaacaaacttcaaatctacctgctg 32443  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||   || ||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  32442 agcgtctcggatactgttcaagaaatcactattaatccgcaacatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaaggctca 32354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 32321 - 32189
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32321 ttcaccatcaaagcagacatatgtaatgttttgctgctcaacgcatcagcaaccacattggctttaccaagatggtaattcaagccaaaatcataatcct 32222  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||| | || |||||| || |||| ||| ||||    
T  32221 tcagcagctctaaccatcttctctacctcatgt 32189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Original strand, 249296 - 249884
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| || |||||||    
T  249296 taaatctctaccaactgtgctaccggataactgatattaattggaatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaattgcatcatgcc 249395  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  249396 ctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaaatactgtcccacttcgactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctg 249495  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  249496 atgctcaaccttagacttctgacaagtcaagcatgcatatacaaaatgagctacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgg 249595  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  249596 tacatttttgtagcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgacttttttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttc 249695  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  249696 ctctgaacctcagaacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgtcattaccagtagtcaccaaatcaacaaacttcaaatccacttgctg 249795  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||||||||| || |||||||| | | ||| ||| |||||||| | |||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  249796 agcttctcggatgctattcaagaaatcattattaatcttcagcatccgcaactgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaaggctca 249884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 249917 - 250049
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  249917 ttcaccatcaaagcagacatatgtaatgttttcctgctcaacgcatcagcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcct 250016  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||| | || |||||| || |||||||| ||||    
T  250017 tcagcagctctaaccatcttctctgcctcatgt 250049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 66 - 630
Target Start/End: Original strand, 20096 - 20660
Alignment:
Q  66 ctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20096 ctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgatttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatgtcatcatgccctctcggagtgttcggtaa 20195  T
Q  166 actcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttc 265  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20196 acttgtcacgaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttc 20295  T
Q  266 tgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccg 365  Q
    |||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20296 tgacaagtcaagcatgcatacacaaactgagcaacatcacgctttaaaccggaccaccaaaacagattcttcaaatcatggtacatttttgtagcccctg 20395  T
Q  366 ggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacacc 465  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| | ||| |||||    
T  20396 ggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttctagaatcaacttcttcaaatcatcattctcaggaatacaaattcttcctatgaacctcagaacacc 20495  T
Q  466 ctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttc 565  Q
    |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||| |||    
T  20496 ctgatcatcaaccttgaagtcgttatcctcagtgtcattactagtagtcatcaaatcaacaaacttcaagtctacttgctgagcttctcggatactattc 20595  T
Q  566 aagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaag 630  Q
    ||||| | ||||| |||  ||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  20596 aagaaatcactattaatcctcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaag 20660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 66 - 630
Target Start/End: Original strand, 22916 - 23480
Alignment:
Q  66 ctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22916 ctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgatttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatgtcatcatgccctctcggagtgttcggtaa 23015  T
Q  166 actcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttc 265  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23016 acttgtcacgaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttc 23115  T
Q  266 tgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccg 365  Q
    |||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23116 tgacaagtcaagcatgcatacacaaactgagcaacatcacgctttaaaccggaccaccaaaacagattcttcaaatcatggtacatttttgtagcccctg 23215  T
Q  366 ggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacacc 465  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| | ||| |||||    
T  23216 ggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttctagaatcaacttcttcaaatcatcattctcaggaatacaaattcttcctatgaacctcagaacacc 23315  T
Q  466 ctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttc 565  Q
    |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||| |||    
T  23316 ctgatcatcaaccttgaagtcgttatcctcagtgtcattactagtagtcatcaaatcaacaaacttcaagtctacttgctgagcttctcggatactattc 23415  T
Q  566 aagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaag 630  Q
    ||||| | ||||| |||  ||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  23416 aagaaatcactattaatcctcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacaaacaag 23480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 20698 - 20830
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  20698 ttcaccatcaaagcagacatatgtaatgtcttcctgctcaacgcatcaacaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatctt 20797  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | ||  |||||||| |||||||| ||||    
T  20798 tcaacagctcgaaccaccttctctgcctcatgt 20830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 23518 - 23650
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  23518 ttcaccatcaaagcagacatatgtaatgtcttcctgctcaacgcatcatcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatctt 23617  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | ||  |||||||| |||||||| ||||    
T  23618 tcaacagctcgaaccaccttctctgcctcatgt 23650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 5)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 56523 - 55935
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || ||||| || || |||| ||    
T  56523 taaatctccgccaactgtgctaccggataactaatattaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatacc 56424  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||| |||||| |||||||| |   | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56423 ctctcgaagtgtttggtaaacttggctccaaatccatagaaatgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctg 56324  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  56323 atgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacttcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgg 56224  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  56223 tacatctttgtagctctcggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaattcttc 56124  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||||||||||  ||||  || |||    
T  56123 ctctgaatctcaatacaccctgatcatccaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaattatcaaatcaacaaacttcccatccaattgctg 56024  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  56023 agcttctcggatactattcaagaaattactattaattttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaactcacaaacaagactca 55935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 33305 - 32712
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| |||||||| || ||||| || |||||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |  ||||| || ||||| || |  ||    
T  33305 gaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatc 33206  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||     
T  33205 atgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggt 33106  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  33105 ttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccaggccaccaaaacagctttttcaaat 33006  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    | || ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || | ||||||| |  ||| ||| || ||||||||||| ||||     
T  33005 cgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttgtcaggaatgcaaat 32906  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattac-ctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
    ||| ||||||||   || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | || | || ||||| |||||||| | |||  |    
T  32905 tctgcctctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagcttgattactattaact-attaaatccacaaacttgacatcaac 32807  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     |  || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  ||||||| ||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  32806 ctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcatcatacccaactgcacactctggggtgacaattcgcaaacaagactca 32712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 55902 - 55770
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  55902 ttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattgaagccaaaatcataatcct 55803  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||| ||||||||||| ||||    
T  55802 tcaacagctctaaccatctcctctgcctcatgt 55770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 32664 - 32547
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| || || |||||    
T  32664 gacatgtgtaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattggctttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatccttcaatagctctaacc 32565  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  32564 atctcctctgcctcatgt 32547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 41565 - 41662
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  41565 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 41662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 27902 - 28496
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  27902 tgaatgtaaatctctgccaactgagctaacggataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcat 28001  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  28002 catgtcctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccgtgcagg 28101  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||||     
T  28102 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaag 28201  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28202 tcgtgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctccagaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaa 28301  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| |  | |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| | |   ||||  ||||||||||| | |||| |    
T  28302 ttcttcctctgaaccttaacacaccctgatcatcaaccttatagtcactatcctcagtttcattaccagcaactatcaggtcaacaaacttgacatccac 28401  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28402 ttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaactcacagacaagactca 28496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 35432 - 35519
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35432 gacatgtgcaacatcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 35519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 2265 - 2859
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  2265 tgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcat 2364  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  | ||    
T  2365 catgccctctcggagtgttcggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatcaaacggtgtcaaaaacccaacagg 2464  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2465 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacttttcaaaccagaccaccaaaacagcttcttcaaa 2564  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||| ||||| | |||||| ||  |||| || ||||| |||||||| ||||    
T  2565 tcatgatacattttcgtagctcccggatgaataattaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaattttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaa 2664  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| |  | |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||| ||||||| | |||  |    
T  2665 ttcttcctctgaaccttaacacaccctaatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcatcaaacttaagatctac 2764  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2765 ttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaattcacagacaagactca 2859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 2892 - 3024
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||  || ||||| |||||  ||||||| ||||  ||||| || |||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2892 ttcaccatcatagcagacatatgcaacatcttcctgctcagcgcatctgcaaccatattggctttacccagatggtaattcaaaccaaaatcataatcct 2991  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||| || |||||||| ||||    
T  2992 tcaacagctctaaccatcttctctgcctcatgt 3024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 5427 - 6021
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  5427 tgaatataaatctccgctaactgagctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccaacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcat 5526  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5527 catgccctctcgtattattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccagtctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcagg 5626  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  5627 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaaa 5726  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||    
T  5727 tcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcttccagaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaa 5826  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || || ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||| | |  |||||||||||||||||| | |||  |    
T  5827 ttcttcctctgaacctcaacataccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatcaac 5926  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5927 ttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaactgtacactctgaggtgacaactcatagacaagactca 6021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 652 - 736
Target Start/End: Original strand, 6070 - 6154
Alignment:
Q  652 acatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6070 acatgtgcaacgttttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatcctt 6154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 3428 - 4020
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  3428 tgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataactgatattaattggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcat 3527  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |     
T  3528 catgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctgtcccacttccattccgccacatccaacggtgtcaacaaccctgcagt 3627  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||| ||||||| |||||||||    
T  3628 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccactaaaacagcttcttcaaa 3727  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||| || ||||| |||||||| ||||    
T  3728 tcatgatacattttcgtagctcctggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaa 3827  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| || || |||||||||||| || ||||||| | |  |||||||||||||||||| | |||  |    
T  3828 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcaatgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatctac 3927  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || ||| |||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3928 ttgctgtgcttcttggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcattcccaactg--tactctgaggtgacaactcacagacaagactca 4020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 4068 - 4185
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||| ||||| | |||| | ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||| |||||    
T  4068 gacatatgcaacgccttcatgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacctggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacaactctaacc 4167  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | || |||||||| ||||    
T  4168 atcttctctgcctcatgt 4185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 651 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 12183 - 12134
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggcctt 700  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12183 gacatgtgcaaggacttcctactcaaggcatcagctactacattggcctt 12134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 19797 - 20391
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||| || ||||| || || |    
T  19797 tgaatataaatctccgccaactgagctacgagataactgatattaataggaatgaagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcat 19896  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  19897 catgccctttcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 19996  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19997 cttctgatgttcaacctttgacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaa 20096  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||  || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20097 tcatgatacaaattagtagctccaggatgaatactcaagctactcttgtgactctcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgtcaggaatacaaa 20196  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||| | |  |||||||||||||||||| | |||| |    
T  20197 ttcttcctctgaatctcaatacaccctgatcatcaactttgaagtcaatatcttcagcttcattaccagtaaccatcaaatcaacaaacttaacatccac 20296  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20297 ttgttgcgcttctcggatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaatactctgaggtgtcaattcacaaacaagactca 20391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 636 - 733
Target Start/End: Original strand, 20424 - 20521
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20424 ttcaccatcaacgcagacatatgcaatgtcttcctgctcaacgcatccgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatc 20521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 161 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 7654 - 7180
Alignment:
Q  161 ggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttgg 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  7654 ggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccagtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttag 7555  T
Q  261 acttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagc 360  Q
    ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7554 acttctgacaactcaagcaagcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgatacatctttgtagc 7455  T
Q  361 ccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagc 460  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  7454 cctcgggtgaatactcaacctactcttgtgactctcttcaagaatcaacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcaga 7355  T
Q  461 acaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatac 560  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||| | |  ||| |||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  7354 acaccctgatcataaaccttgaagtcactatcctctgtctcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttacatccacttgctgcgcttctcggatac 7255  T
Q  561 tgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    | ||||| || ||||| | ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7254 tattcaaaaaattactgttaatcttcaacatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacaaacaaggctca 7180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 7132 - 7015
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || |||||    
T  7132 gacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacatctctaacc 7033  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  7032 atctcctctgcctcatgt 7015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 7)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 45194 - 45788
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||  ||||| || ||||| || |  |    
T  45194 tgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactcatgttaatagggatgaagtgttccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaat 45293  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  45294 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgttacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 45393  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| ||||  || |||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  45394 cttctgatgttcaaatttagacttctgacaagtcaaacatgcatacaaaaactgagcaacgtcgcgtttcaaaccggaccaccgaaacagcttcttcaaa 45493  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  |||| || ||||||||| || ||||||    
T  45494 tcatggtacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaagattacaaa 45593  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| | | |  ||| |||||||||||||| | |||| |    
T  45594 ttctacatctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattatccgcaaccattaaatcaacaaactttacatccac 45693  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45694 ttgctgcgcttctcggatactattcaagaaattactgttaatcttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacaaacaaggctca 45788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 208 - 597
Target Start/End: Original strand, 20744 - 21133
Alignment:
Q  208 cggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctctt 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| | |    
T  20744 cggtacatccaacggtgtcaacaaccttgcaggtttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcataaataaattgagctacatcacgt 20843  T
Q  308 ttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||  |||||||||||||| || || | |||||    
T  20844 ttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatttttgtaggtcccggatgaatactcatgctactcttgtgactttcttctaaaatca 20943  T
Q  408 acttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacc 507  Q
    ||||  |||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20944 actttttcaattcttcattgtaaggaatacaaattctacctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattacc 21043  T
Q  508 tgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaa 597  Q
     | |  ||| |||||||||| ||| | |||| |||  || |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||    
T  21044 cgcaaccattaaatcaacaatctttacatccacttgttgcgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaa 21133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 300
Target Start/End: Original strand, 44182 - 44441
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||  ||||| || ||||| || |  |    
T  44182 tgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactcatgttaatagggatgaagtgttccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaat 44281  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  44282 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgttacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 44381  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaac 300  Q
    ||||||||| ||||  || |||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  44382 cttctgatgttcaaatttagacttctgacaagtcaaacatgcatacaaaaactgagcaac 44441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 19838 - 19513
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaga 272  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    || ||  || || || ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  19838 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgatttctgacaaa 19739  T
Q  273 tcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaat 372  Q
    ||||||| | ||| || ||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  19738 tcaaacaagaatacacgaactgtgcaacgtcgcgtttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 19639  T
Q  373 gctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatca 472  Q
     |||||  |||   | || ||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||  | |||||  || | ||| ||||| ||||||    
T  19638 actcaagttacatctatggctctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaatccgacctcgaaacctcagtacaccttgatca 19539  T
Q  473 tcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    || | ||| |||||||| || |||||    
T  19538 tcgattttaaaatcactgtcttcagt 19513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 733
Target Start/End: Original strand, 21194 - 21288
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21194 accatcaacgcagacatatgtaaggtcttcctgctcaacgcatccgcaaccacattagctttactaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 21288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 733
Target Start/End: Original strand, 45824 - 45918
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||| || ||||| || | ||||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  45824 accatcaacgcagacatatgtagggtcttcctgcttaacgcatccgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 45918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 651 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 19328 - 19240
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcag 739  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  |||||||| | ||||||||    
T  19328 gacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaacacaaaatcatagtccttcag 19240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 2)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 70 - 635
Target Start/End: Original strand, 30 - 595
Alignment:
Q  70 cggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactc 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || ||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30 cggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactc 129  T
Q  170 gttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgac 269  Q
    || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  130 gtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctacaggcttctgatgttcaactttagacttctgac 229  T
Q  270 agatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtg 369  Q
    |  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  230 aagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacgtcatgtttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagctcccggatg 329  T
Q  370 aatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctga 469  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  |||| || ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||     
T  330 aatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattttcaggaatataaattctacctctgaatctcaatacaccctgg 429  T
Q  470 tcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaaga 569  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| | |  ||| |||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  430 tcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttacatccacttgctgcgcttcttggatactattcaaga 529  T
Q  570 agttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    | | ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  530 aatcactattaattctcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaactcacaaacaaggctca 595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 639 - 733
Target Start/End: Original strand, 631 - 725
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  631 accatcaacgcagacatatgtaaggtcttcctgctcaacgcatccgcaaccacattggctttaccagggtggtaattcaaaccaaaatcataatc 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 59 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 81443 - 80866
Alignment:
Q  59 aactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgt 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || ||||| || |  ||||||||||||| |||||    
T  81443 aactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcgtagtgt 81344  T
Q  159 tcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaacctt 258  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  81343 ttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaacttt 81244  T
Q  259 ggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgta 358  Q
     ||||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81243 agacttctcacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacgtcacatttcaaaccggaccgccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgta 81144  T
Q  359 gcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcaca 458  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  81143 gcccccgggtgaatactcaaactactcttgtgactctcttcaagaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctca 81044  T
Q  459 gcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggat 558  Q
      || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| | | ||||| ||||||| | ||| | |||| ||| ||| |||||||||||    
T  81043 atactccctgatcatcaaccttgaagtcactgtcctctgtttcattaccagcaatcatcgaatcaaccagcttgacatccacttgctgtgcttctcggat 80944  T
Q  559 actgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcat 636  Q
    |||   |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||| ||| || |||||  |||| ||||| || ||||||||    
T  80943 actacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaactttattctttgaggctacaactcacataccagactcat 80866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 663 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 80807 - 80737
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  80807 gtcttcctgctcaacgcatcagcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 80737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 41594 - 42188
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||| |||||| || ||||| || |  |    
T  41594 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcatcaacctgtcgaccacaacccatatagaat 41693  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  41694 catgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacgaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcatatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 41793  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41794 cttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaa 41893  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  41894 tcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactcgtcattattaggaatacaaa 41993  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||| | | || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  || ||||||| | |  ||  | |||||||||||||| |||| |    
T  41994 ttcttcctctggacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctatgccattaccagcaaccaatatatcaacaaacttcacatccac 42093  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  42094 ttgctgagcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgtcaattcacagacaaggctca 42188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 42221 - 42353
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    |||||||| || || ||||| ||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  42221 ttcaccattaaagcagacatatgcagcgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttacctggatggtaattcaaaccaaaatcatagtcct 42320  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||| ||||||||||| ||||    
T  42321 tcaacagctctaaccatctcctctgcctcatgt 42353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 267; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 5081 - 4487
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || | ||| || |  |    
T  5081 tgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaatccatatagaat 4982  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4981 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgttatcccatttccactccgatacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 4882  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4881 cttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaa 4782  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || | |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||    
T  4781 tcatggtacattttcgtagcttccggatgaatactcaagctactcttatgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaa 4682  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||| | |  ||| |||||||||||||| | |||| |    
T  4681 ttctacctctgaatctcaatacaccctaatcatcaaccttgaagtcattatcctctgtttcattacccgcaaccattaaatcaacaaactttacatccac 4582  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || ||| |||||||| ||| | |||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  4581 ttgctgcgcttctcgaatattattcaagaaatcactattaattctcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaactcacaaacaaggctca 4487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 639 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 4451 - 4357
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4451 accatcaatgcagacatatgtaaggtcttcctgctcaacgcatccgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 4357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 9)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 51809 - 51215
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || ||||| || |  |    
T  51809 tgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaat 51710  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  51709 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 51610  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||  |||| || || | |||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  51609 cttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatatacaaaacgagcgacgtcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttctttaaa 51510  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  51509 tcatgatacattttcgtagctcgcggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcgtcattgtcaggaatacaaa 51410  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     |||| ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||| |    
T  51409 ttctatctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcggtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcacatccac 51310  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || ||||| |||||| | |||| ||| | ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  51309 ttgttgtgcttcacggatattattcaggaaatcactattaattctcaacatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacaaacaaggctca 51215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 60843 - 60249
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || ||||| || |  |    
T  60843 tgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaat 60744  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  60743 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 60644  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||  |||| || || | |||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  60643 cttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatatacaaaacgagcgacgtcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttctttaaa 60544  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  60543 tcatgatacattttcgtagctcgcggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcgtcattgtcaggaatacaaa 60444  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     |||| ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||| |    
T  60443 ttctatctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcggtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcacatccac 60344  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || ||||| |||||| | |||| ||| | ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  60343 ttgttgtgcttcacggatattattcaggaaatcactattaattctcaacatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacaaacaaggctca 60249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 67231 - 66637
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || ||||| || |  |    
T  67231 tgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaat 67132  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  67131 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 67032  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||  |||| || || | |||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  67031 cttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatatacaaaacgagcgacgtcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttctttaaa 66932  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  66931 tcatgatacattttcgtagctcgcggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcgtcattgtcaggaatacaaa 66832  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     |||| ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||| |    
T  66831 ttctatctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcggtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcacatccac 66732  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || ||||| |||||| | |||| ||| | ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  66731 ttgttgtgcttcacggatattattcaggaaatcactattaattctcaacatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacaaacaaggctca 66637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 461 - 635
Target Start/End: Original strand, 27722 - 27896
Alignment:
Q  461 acaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatac 560  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  27722 acaccctgatcatcaaccttgaagtcattatcttcagtgtcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatac 27821  T
Q  561 tgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    | |||||||| | | | | ||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  27822 tattcaagaaatcattgttaatcttcaacatacccaactgtacactctaaggtgacaactcgcaaacaagactca 27896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 637 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 51181 - 51085
Alignment:
Q  637 tcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  51181 tcaccatcaacgcagacatatgtaaggtcttcctgatcaacgcatccgcagccacattgcctttactaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 51085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 637 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 60215 - 60119
Alignment:
Q  637 tcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  60215 tcaccatcaacgcagacatatgtaaggtcttcctgatcaacgcatccgcagccacattgcctttactaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 60119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 637 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 66603 - 66507
Alignment:
Q  637 tcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  66603 tcaccatcaacgcagacatatgtaaggtcttcctgatcaacgcatccgcagccacattgcctttactaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 66507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 450
Target Start/End: Original strand, 26389 - 26486
Alignment:
Q  353 tttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctct 450  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||| || || || ||||||||||||| ||| |||||    
T  26389 tttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcgttatcaggaatacaaattcttcctct 26486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 738
Target Start/End: Original strand, 27979 - 28030
Alignment:
Q  687 accacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27979 accacattagctttacctggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 28030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 59 - 635
Target Start/End: Original strand, 149265 - 149841
Alignment:
Q  59 aactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgt 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  149265 aactgagctaccggataactgatattaatcggaatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatggaatcatgccctctcggagtgt 149364  T
Q  159 tcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaacctt 258  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  149365 tcagtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctgtcccaattacactccagcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaacatt 149464  T
Q  259 ggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgta 358  Q
     |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  149465 agacttctgacaagtcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatctttgta 149564  T
Q  359 gcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcaca 458  Q
    || ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| || ||||| |||||||| |||| | | |||||||| | ||    
T  149565 gctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctccagaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaatttttcctctgaacctca 149664  T
Q  459 gcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggat 558  Q
     |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| | |  |||||| || |||||||| | |||| ||   || |||||||||||    
T  149665 acacaccctgatcatcaaccttaaagtcactttcctcagtttcattaccagcaaccatcaagtccacaaacttgacatccactagttgtgcttctcggat 149764  T
Q  559 actgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  149765 actattcaagaaatcactattaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactca 149841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 195333 - 194739
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||| |||||| || ||||| || || |    
T  195333 tgaatataaacctctgctaactgagctaccggataaatgatattaatcggaataaagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcat 195234  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  195233 catgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatccaacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgtagg 195134  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  195133 cttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaa 195034  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    || || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  |||| || ||||  |||||||| ||||    
T  195033 tcgtgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaatcatcatcatcaggaatgcaaa 194934  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   |  ||| |||||||||||||||| |||| |    
T  194933 ttcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccaacaaccattaaatcaacaaacttcacatccac 194834  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || |||||||| ||||| |||||||| | ||| | ||| |||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||| || ||||||||||    
T  194833 ttgttgtgcttctcgaatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgtacactcagaggtgtcaattcgcaaacaagactca 194739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 26159 - 25576
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||| || || ||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || | ||  |||||||| |||||||    
T  26159 atgtaaatttccgccaactgggatacaggaaaactgatattaatcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaataatcacccaaatcgcgtcat 26060  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  | ||    
T  26059 tccctttcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatgccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaagttt 25960  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||   |||||| || |||||||||||||  |||||||||||     
T  25959 ctgatgctcaacttttgacttttgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgtgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcg 25860  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  25859 tgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcattgtcaggaatacaaattc 25760  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctcttt 543  Q
    | ||||  || | || ||| |||| |||||| | ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  | | ||| ||| || |||||||| | |||   |||    
T  25759 tccctcgaaaacgcaacactccctaatcatcgattttaaaatcgctatcttcagtctgattactagcaatcaacaagtccacaaacttaacatcaatttt 25660  T
Q  544 ctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    ||| |||| |   |||||||||| ||| | ||||||||| || |||||||| |  |  | |||||||||||||| ||| |||||    
T  25659 ctgcgcttttttaatactgttcaggaattcactatcaatctttagcattccaagtttcacactctgaggtgacatttcgcagac 25576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 194706 - 194574
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  194706 ttcaccatcaaagcagacatatgcaacgtcttcctactcaaggcatcaataaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcct 194607  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | ||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  194606 tcaacacctccaaccatctcctctgcctcatgt 194574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 149874 - 150005
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  149874 ttcaccatcaaagcagacatattcaatgtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattg-ctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatcct 149972  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||| ||||||||||| ||||    
T  149973 tcaacagctctaaccatctcctctgcctcatgt 150005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 636
Target Start/End: Original strand, 5890 - 6485
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || |||||||| |  |    
T  5890 tgaatgtaaatctcagccaactgagctacaggataactaatgttaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaat 5989  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  5990 catgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 6089  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| || || ||||||    
T  6090 cttctgatgctcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatacacaaaatgagcgacatctcgcttcaaactggaccaccaaaatagctttttcaaa 6189  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||    
T  6190 tcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaa 6289  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     |||| ||||||||| ||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | | ||||||||||||| | ||| | |||| |    
T  6290 ttctatctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtgccattaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgacatccac 6389  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactcat 636  Q
    || ||| ||||||||||||||   |||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  6390 ttgctgtgcttctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaactgtatgctctgaggcgacaactcacataccagactcat 6485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 663 - 733
Target Start/End: Original strand, 6544 - 6614
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6544 gtcttcctgctcaatgcatcagcaactacgttagctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 6614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 4)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 57476 - 56882
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || |||||||| |  |    
T  57476 tgaatgtaaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaat 57377  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  57376 catgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 57277  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  || || |||    
T  57276 cttctgatgctcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatacacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaacttttttaaa 57177  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  ||||   |||||  |||||||| ||||    
T  57176 tcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaactgtcatcatcaggaatgcaaa 57077  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| || ||||| | ||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||   |  |||||||||||||||||||| |||| |    
T  57076 ttcttcccctgaacctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcaatgccattaccaacaaccatcaaatcaacaaacttcacatccac 56977  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  56976 ttgttgcgcttctcggatactattcaagaaatcactattaattctcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaactcacaaacaaggctca 56882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 48663 - 48069
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||| |||| |||| ||||| || ||||  || | |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| |    
T  48663 tgaatataaatctccgccaactgagctatcggaaaactaatattgatcggaagaaagtttgccgacttcgtcaacctatcgacaacaatccaaatggcat 48564  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||  | |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  48563 catgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatcaatggaaatgttgtcccacttccactctggcatatctaacggtgtcaacaaccctgcagg 48464  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||| |  |||||||||||||  ||||||||     
T  48463 cttctgatgctcaaccttatacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcaggtttcaacctagaccaccaaaacaacttcttcaag 48364  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||  | ||||| || || |||||| | || || || || | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48363 tcatgatacatctttgtagctcctagatgaatacttaagctactcctatggctttcttccaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaa 48264  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||  | |  ||| |||||||||||||| | |||  |    
T  48263 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcactatcttcagtttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcaac 48164  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || ||| ||||||| |||| |||||||||| | |||||  ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48163 ttgctgtgcttctctgataatgttcaagaaatcactattgattttcaacatacccaactatacactctgaggtgacaactcacagacaagactca 48069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 48021 - 47934
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  48021 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcgaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 47934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 56834 - 56717
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||||||||  |||||| | ||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  | || |||||    
T  56834 gacatgtgcagcgtcttcttgctcaacgcatcagcaactacgttagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatcctttaacagctctaacc 56735  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  56734 atctcctctgcctcatgt 56717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 32087 - 32682
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||  |  ||||||| || ||||  || | ||| ||||||||||| |    
T  32087 tgaatataaatctccgccaattgagctaccggataactgatattgattggaataaagagcaccgactttgttaacctatcaaaaacaacccaaatggcat 32186  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| | ||    
T  32187 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccacttccactcctgcacatccaacggtgtcaacagccctacagg 32286  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaa-cagtttcttcaa 339  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  32287 attctgatgctcaaccttagacttctaacaagtcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaaacagtttcttcaa 32386  T
Q  340 atcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaa 439  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| || ||||| |||||||| |||    
T  32387 gtcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctccagaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaa 32486  T
Q  440 actctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcct 539  Q
    | ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||     
T  32487 attcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatcca 32586  T
Q  540 ctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||  || |||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32587 cttgttgcgcttcttggatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgacaattcacagacaagactca 32682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 327
Target Start/End: Original strand, 14717 - 15002
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |  || ||| |||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||  || ||||  |||||||| | |||    
T  14717 gaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaatcgtgtc 14816  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| || || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |  || ||  || || ||     
T  14817 attccctttaggagtattaggcaaactcttcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaacgataccatcataccagcaggt 14916  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaa 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  14917 ttctgatgctcaaccttcgacttctaacaaatcaaacaagcatacacaaactgtgcaacgtcgcgtttcaatccggaccaccaaaa 15002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18483 - 18234
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||| || || ||||| |  || ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||| |    
T  18483 gaatgtaaatttccgccaactgagaaacaggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcggc 18384  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |   | || ||| || |      
T  18383 attccctttaggagtattcgttaaactcgtcacaaaatacatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaagatacaatcatcccagcagat 18284  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaa 291  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  18283 ttctgatgctcagctttcgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaa 18234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 32730 - 32817
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||| || ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  32730 gacatatgcaacgttttcctgctcagagtatccgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 32817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 5964 - 5371
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||| || ||||| || |  |    
T  5964 tgaatataaatcttagccaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgtgtcgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaat 5865  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  5864 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgtagg 5765  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||  ||||| || ||||||| |||   |||||| ||||| ||||||||||| || || | |||||||| |||||||||||| || || ||||||    
T  5764 cttctgatattcaactttagacttctaacaagacaaacatgcatacacaaactgagctacgtcacgtttcaaactggaccaccaaaatagctt-ttcaaa 5666  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||    
T  5665 tcgtggtacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaa 5566  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     |||||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||| |  |  ||| |||||||||||||| | |||| |    
T  5565 ttctacctctgaatctcaatactccctaatcatcaactttgaagtcactatcctgtgtttcactacatacaaccattaaatcaacaaactttacatccac 5466  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5465 ttgctgcgcttctcggatactattcaagaaattactgttaatcttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacaaacaagactca 5371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 5323 - 5241
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  5323 gacatatgtaaggtcttcctcctcaacgcatccgcaactacattggctttaccaagatggtaatccaaaccaaaatcataatc 5241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 13928 - 13334
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||| || ||||| || || |    
T  13928 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatgttaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcat 13829  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  13828 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggtacatccaacggtgtcaacaaccttgcagg 13729  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13728 cttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaa 13629  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  | ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| || ||||  ||| |||| ||||    
T  13628 tcatgatacatttttgtagctcctagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctagaattaactttttcaaatcatcatcatcaagaatgcaaa 13529  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  | |  ||| |||||||||||||||| |||| |    
T  13528 ttcttcctctgaatctcaacacacccttttcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattactagcaaccattaaatcaacaaacttcacatccac 13429  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13428 ttgttgtgcttctcggatactattcaagaaattacttttaattttcagcatccccaactgaacactctaaggtgtcaattcacagacaaggctca 13334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 666 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 13271 - 13169
Alignment:
Q  666 ttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaaccacctcctctgcctga 765  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||  | |||||||  | || |||||| ||||||||||| |    
T  13271 ttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttatcaggatggtaattcaaaccaaaatcgtagtccttcaacagctctaaccatctcctctgcctca 13172  T
Q  766 tgt 768  Q
    |||    
T  13171 tgt 13169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 41 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 6867 - 6278
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||||||| |||||| || ||||| || || |    
T  6867 tgaatgtagatttccgccaactgagctaccggataactgatattaatcagaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcat 6768  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  6767 catgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggtacatccagcggtgtcaacaaccctgcagg 6668  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6667 cttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaa 6568  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| | || ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  |||| || ||||  |||||||| ||||    
T  6567 tcatgatgcactttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaatcatcatcatcaggaatgcaaa 6468  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| ||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |  ||| |||||||| ||||||| | || |    
T  6467 ttcttcctctaaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaaatcaactaacttcacagccac 6368  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaag 630  Q
    || ||  |||||||||||||| |||||||| | ||| | ||| |||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||    
T  6367 ttgctttgcttctcggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgtacactcagaggtgtcaattcacatacaag 6278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 6240 - 6108
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    |||||||| || || ||||| |||||  | ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6240 ttcaccattaaagcagacatatgcaacattttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatcct 6141  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||| || |||||||| ||||    
T  6140 tcaacatctctaaccatcttctctgcctcatgt 6108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 5107 - 5701
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||| |||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  5107 tgaatataaatctccgccaactgagctatcggaaaactaatattgatcggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcat 5206  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5207 catgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggagatgttgtcccacttccactatggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcagg 5306  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  5307 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagtttcttcaag 5406  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || || |||||  ||||  | || || | |||| ||||  ||||||| ||| | |||||||| ||||    
T  5407 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgtatttcttccaaaatcgactttttcaactcatcactatcaggaatgcaaa 5506  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||  | |  ||| ||||| ||| |||| | |||  |    
T  5507 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttcattactagtaaccattaaatccacacacttgacatcaac 5606  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5607 tttttgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacaaacaagactca 5701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 5749 - 5836
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5749 gacatgtgcaacgtcttccttctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 5836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 6)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 323381 - 323975
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||| || ||||| || || |    
T  323381 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccacaacccatatagcat 323480  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  323481 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaag 323580  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| || || ||||| ||||  || || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  323581 cttttgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcgtacacaaaatgagtgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaa 323680  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  |||| || ||||  ||| |||| ||||    
T  323681 tcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctccaaaattaactttttcaaatcatcatcatcaagaatgcaaa 323780  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| | |  ||| |||||||||||||||| | || |    
T  323781 ttcttcctctgaatctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcattgccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacacccac 323880  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||||| | | | | ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  323881 ttgttgtgcttctcggatactcttcaagaaatcattgttaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaattcacaaacaaggctca 323975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 203096 - 202640
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || || ||| |||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||  ||    
T  203096 gaatataaatttctgccaactgagccactggaaaactaatattgattggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatggtatc 202997  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||    
T  202996 atgccctctcggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggatatgctatcctatttccactccggcacatctaacgatgtcaacaacccagcaggc 202897  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||  | ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  202896 ttctgatgttcaactttagatttctgacaaatcaaacattcatatacaaactgtgcaacattacgtttgaatgcggaccaccaaaacaatttcttcaagt 202797  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| | ||||| || || |||||  ||||||| || || | |||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||     
T  202796 catgatacatctttgtagctccctgatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaacttttttaactcatcattatcaggaatacaaat 202697  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    |||||| | ||||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  202696 tctaccgcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagt 202640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 258
Target Start/End: Original strand, 118245 - 118462
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||  |||||| || ||||| || || |    
T  118245 tgaatataaatctccgccaactgcgctaccggataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcatcaacatgtcgaccacaacccatatagcat 118344  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  118345 catgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaaataaaatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 118444  T
Q  241 cttctgatgctcaacctt 258  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  118445 cttctgatgttcaacctt 118462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 324008 - 324140
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  324008 ttcaccattaaagcagacatgtgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttactaggatggtaattcaaaccaaaatcatagtcct 324107  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||| ||||||||||| ||||    
T  324108 tcaacagctctaaccatctcctctgcctcatgt 324140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 202455 - 202368
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  202455 gacatatgcaatgtcttcctgctcaaagcatctgcaacaacatttgctttacctggatgataattcaaaccaaaatcatagtccttca 202368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Original strand, 115061 - 115129
Alignment:
Q  152 ggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||| ||||    
T  115061 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccagttccactctggcacatgtaac 115129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 4)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 2978 - 2390
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||| ||| | || || || ||||    
T  2978 taaatctccgccaactatgctaccagataactgatattaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgataacaacctatatagcatcgtgcc 2879  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| |||||||| | || |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  2878 ctcttggagtgtttgctatactcgtcacaaaattcatagaaatactatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctt 2779  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| || || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  2778 atgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacgaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaacttcttcaaatcatga 2679  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||  || |    
T  2678 tacattttcgtagctcctggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaaatccttc 2579  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||| |  | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||   |  ||| |||||||||||||||| |||  |||  ||    
T  2578 ctctgaaccttaacacaccctgatcatcgaccttgaagtcactatcctctgtttcattaccaacaaccattaaatcaacaaacttcacatctacttgttg 2479  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  2478 cgcttctcggatactgttcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaactcacacacaagactca 2390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 7737 - 8331
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||  |||||| || ||||| || || |    
T  7737 tgaatataaatctccaccaactgagctaccagataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcatcaacttgtcgaccacaacccatatagcat 7836  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  7837 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccagagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 7936  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||| ||||||||||||||  || ||||||    
T  7937 cttctgatgttcaaccttagacttctgataagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaactggaccaccaaaacaacttattcaaa 8036  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||  ||||  | ||||  ||||||||  |||    
T  8037 tcatgatacattttcgtagctcccagatgaatactcaagctactcttgtgactctcctctaaaattaactttttcaaaccatcatcatcaggaatgaaaa 8136  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| ||||| || | || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| | |  |||||||||||||||||||| |||  |    
T  8137 ttcttcctctaaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctcagtgcccttaccagtaaccatcaaatcaacaaacttcacatctac 8236  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     | ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8237 atgctgcgcttctcgaatactattcaagaagtcactgttaatcttcagcatccccaactgaacactctgaggtgtcaattcacagacaaggctca 8331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 8379 - 8496
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||  |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||  ||||    
T  8379 gacatatgcaacgtcttcctattcaagacatctgcaaccacattggctttaccaagatggtaattcaagccaaaatcataatccttcaacagctccaacc 8478  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  8479 atctcctctgcctcatgt 8496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 2342 - 2233
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  | || |||||    
T  2342 gacatatgcaacgttttcctacgcaaggcatctgcaactacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcataatctttcaacagctctaacc 2243  T
Q  751 acctcctctg 760  Q
    | ||||||||    
T  2242 atctcctctg 2233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 7)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 39 - 635
Target Start/End: Original strand, 20658 - 21254
Alignment:
Q  39 tgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggc 138  Q
    ||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||     
T  20658 tgtgaatataaatctccacaaactgagctaccgggtaactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccaaatgga 20757  T
Q  139 gtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcg 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||      
T  20758 atcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcataaaatccatagaaatgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcatcaaccctgta 20857  T
Q  239 ggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttca 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||| || |||||||||||||| | |||||| || ||| ||||||| || |||||||    
T  20858 ggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtctaacacgcatacaccaactgagcaacatcacgtttcaacccagacaaccaaaatagcttcttca 20957  T
Q  339 aatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaataca 438  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||| || ||||| |||||||||||    
T  20958 aatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaataca 21057  T
Q  439 aactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcc 538  Q
    ||  || ||| ||||   ||  | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| | |||||||| | |  |||||||||||||||||| | ||||    
T  21058 aatccttcctgtgaacttcaatataccctgatcattaaccttgaagtcactatcttcaatttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatcc 21157  T
Q  539 tctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     ||| ||| |||||||||||||| |||||||| | | | | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21158 acttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcaatgttaatcttcagcattcccaactgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactca 21254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 162 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 11565 - 11092
Alignment:
Q  162 gtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttgga 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  11565 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttaga 11466  T
Q  262 cttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcc 361  Q
    ||| |||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  11465 cttttgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagct 11366  T
Q  362 cccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagca 461  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| | |||||||||  |||  || ||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||| || ||    
T  11365 cccggatgaatacttaagctactcttgtggctttcctccaaaatcaactttttcacatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctttgaatctcaaca 11266  T
Q  462 caccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatact 561  Q
    |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  11265 caccttgatcatcaaccttaaagtcactatcttcagtttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcacatctacttgctgcgcttctcgaatact 11166  T
Q  562 gttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     |||||||| | | | | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11165 attcaagaaatcaatgttaatcttcagcattcccaactgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactca 11092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 162 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 15335 - 14862
Alignment:
Q  162 gtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttgga 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  15335 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttaga 15236  T
Q  262 cttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcc 361  Q
    ||| |||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  15235 cttttgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagct 15136  T
Q  362 cccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagca 461  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| | |||||||||  |||  || ||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||| || ||    
T  15135 cccggatgaatacttaagctactcttgtggctttcctccaaaatcaactttttcacatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctttgaatctcaaca 15036  T
Q  462 caccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatact 561  Q
    |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||| |||||    
T  15035 caccttgatcatcaaccttaaagtcactatcttcagtttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttcacatctacttgctgcgcttctcgaatact 14936  T
Q  562 gttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     |||||||| | | | | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14935 attcaagaaatcaatgttaatcttcagcattcccaactgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactca 14862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12984 - 12873
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||| |||||| || ||||| || || |||||||    
T  12984 taaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgcc 12885  T
Q  147 ctctcggagtgt 158  Q
    |||| |||||||    
T  12884 ctctaggagtgt 12873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16754 - 16643
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||| |||||| || ||||| || || |||||||    
T  16754 taaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgcc 16655  T
Q  147 ctctcggagtgt 158  Q
    |||| |||||||    
T  16654 ctctaggagtgt 16643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 11044 - 10927
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||  | || |||||    
T  11044 gacatgtgcaacgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatgataattcaagccaaaatcataatctttcaacagctctaacc 10945  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | || |||||||| ||||    
T  10944 atcttctctgcctcatgt 10927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14697
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||  | || |||||    
T  14814 gacatgtgcaacgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatgataattcaagccaaaatcataatctttcaacagctctaacc 14715  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | || |||||||| ||||    
T  14714 atcttctctgcctcatgt 14697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 101181 - 100597
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||| || |||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||  || || || ||||||||||| |    
T  101181 tgaatataaatctccgccaactgagctaccagaaaactaatatttatcgggataaaatgtgccgacttcgtcaacctatctaccacgacccaaatggcat 101082  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  101081 catgccctcttggagtgtttggcaaactcgtcacaaaatccatagaaatattgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 100982  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  100981 cttctgatgttcaaccttagacttctgacaaatcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacgcttcaaatcagaccaccaaaacagcttcttcaaa 100882  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtg---aatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatac 437  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| | ||   ||| || || |||||||||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  100881 tcatgatacatctttgtagctcccagatgaataatacttaagctactcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattgttaggaatac 100782  T
Q  438 aaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatc 537  Q
    ||| ||| |||||||||| || ||||||             ||||| |||||||||| |||| ||||||| | |   ||||||||||||||||||| |||    
T  100781 aaattcttcctctgaatctcaacacacc-------------ttgaagtcactatccttagtgccattaccagcaactatcaaatcaacaaacttcacatc 100695  T
Q  538 ctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    | ||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  100694 cacttgctgagcttctcggatactattcaagaaatcactattaattttcagcatccccaattgaatactctaaggtgtcaattcacagacaagactca 100597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 440
Target Start/End: Original strand, 180882 - 181275
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || |  ||| ||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| ||    
T  180882 taaatctctgccaactgggcaagaggaaaactgatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattcc 180981  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || || |||||    
T  180982 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctg 181081  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| || | ||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||| || |  ||||||| ||||||     
T  181082 atgttcgatcttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttcttcagatcatga 181181  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  181182 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaaa 181275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 636 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 100564 - 100437
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||   | ||||    
T  100564 ttcaccatcaaagcagacatatgcaatgtcttcctgctcaatgcatctgcaaccacattggctttaccatgatggtaattcaaaccaaaattgtagtcct 100465  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcct 763  Q
    ||| || || |||||| |||||||||||    
T  100464 tcaatagctctaaccatctcctctgcct 100437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 41 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 25494 - 24914
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || || || ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| |    
T  25494 tgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataactgataataattggaataaagtgcgctgacttcgtcaacctgtcaaccacaacccaaatggcat 25395  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |     
T  25394 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgttttcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaaaaaccctgcaga 25295  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  25294 cttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaa 25195  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||    
T  25194 tcaggatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaa 25095  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| ||||||||           ||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||| | |  |||||||||||||||||| | |||  |    
T  25094 ttcttcctctgaa-----------cctgatcatcaaccttaaagtcactatccttagtgccattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttaacatctac 25006  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagac 632  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25005 ttgatgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatccccaactgtacactctcaggtgtcaattcacagacaagac 24914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 24878 - 24746
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24878 ttcaccatcaaagcaaacatatgcaacgtctttctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatcct 24779  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  |||| |||||| || |||| ||| ||||    
T  24778 tcaacaactctaaccatcttctctacctcatgt 24746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 41 - 633
Target Start/End: Original strand, 27201 - 27793
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||||||||   | ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  27201 tgaatgtaaatcttctccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggaataaaatgcgctgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcat 27300  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  27301 catgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgctatcccacttccactctggcacatctaacagtgtcaacaaccctgcagg 27400  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  27401 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaag 27500  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||  ||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27501 tcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttccaaaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatgcaaa 27600  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |||  ||  ||||| | |||||  | |  ||| ||||| |||||||| | |||       
T  27601 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaacattgaagtcatcattttcagtttgattactagcaaccattaaatccacaaacttgacatcaat 27700  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagact 633  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27701 tttctgcgcttctctgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgcacactctgaggtgacaactcacaaacaagact 27793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 27843 - 27930
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  27843 gacatgtgaaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttca 27930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 1601 - 1008
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||  ||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||| |    
T  1601 tgaatataaatctccgccaactaagctaccggaaaactaatattgatcggaataaaatgtgcctacttcgtcaacctatcgacagcaacccaaatggcat 1502  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  1501 catgccctctcggagtattcggtaaactcgtcataaaatccatggaaatgctatcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcagg 1402  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||||||     
T  1401 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaag 1302  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||  | ||||| || || |||||  ||||||| || || | ||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1301 tcatgatacatctttgtagctcctagatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaacattttcaactcatcattgtcaggaatgcaaa 1202  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || ||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||  | |  ||| |||||||||||||| | |||  |    
T  1201 ttcttcctctgaacctcaacactccttgatcatcaaccttgaaatcactatcttcagt-ccattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcggc 1103  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || ||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||    
T  1102 ttgctgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtttcaactcacaaacaagactca 1008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 41 - 617
Target Start/End: Original strand, 3468 - 4044
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  3468 tgaatataaatctccgccaactgagctatcggataactaatattgatcggaataaagtgcgcggactttgtcaacctatcgacaaccacccaaatggcat 3567  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  3568 cacgccctctgggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctacagg 3667  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||||||     
T  3668 cttctgatgctcaaccttagtcttctgacaagtcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaag 3767  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  3768 tcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcttccagaataaactttttcaactcatcattatctggaatgcaaa 3867  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| | |  |||||||||||||||||| | |||| |    
T  3868 ttctccctctgaacctcaacacaccctgaacatcaaccttgaagtcactctcttcagtttcattaccagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccac 3967  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgaca 617  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||| |  |||| ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  3968 ttgctgcgcttctcggatactattcaagaaatcgctattaatcttcaacatacccaattgtacactctgaggtgaca 4044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 440
Target Start/End: Original strand, 7050 - 7448
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |  || ||| |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  7050 gaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtc 7149  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| || |  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |  || ||  || || ||     
T  7150 attccctttaggagtattagacaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaacgataccatcataccagcaggt 7249  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||| || | ||||||  |||||||||||||||   |||| | ||    
T  7250 ttttgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaattgtgcaacgtcacgtttcaattcggaccaccaaaacaacctctttagat 7349  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    |||| ||||| || ||||| ||| | ||||| |||||  ||||  | ||  |||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  7350 catgatacatcttcgtagctcccagatgaatactcaagttacttctatggatctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaa 7448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 651 - 739
Target Start/End: Original strand, 7691 - 7779
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcag 739  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  |||||||| |||| |||||    
T  7691 gacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcataatctttcag 7779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 41 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 23005 - 22519
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  23005 tgaatataaatctccggcaactgagctaccggataactaagattgatcggaataaattgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcat 22906  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |     
T  22905 catgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaacccagcagt 22806  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  22805 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaa 22706  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||| | |||||||| ||||| | |||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||    
T  22705 tcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctagttttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaa 22606  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaa 527  Q
      || |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  | |  ||||||||||||||    
T  22605 tccttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattactagcaaccatcaaatcaacaa 22519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 41 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 14826 - 14340
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  14826 tgaatataaatctccggcaactgagctaccggataactaagattgatcggaataaattgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcat 14727  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |     
T  14726 catgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagt 14627  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| || |||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  14626 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatagacaaacttagtaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaa 14527  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||| | |||||||| ||||| | |||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||    
T  14526 tcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctagttttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaa 14427  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaa 527  Q
      || |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  | |  ||||||||||||||    
T  14426 tccttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattactagcaaccatcaaatcaacaa 14340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 14286 - 14200
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14286 gacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattgtctttact-ggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 14200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 22465 - 22379
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22465 gacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattgtctttact-ggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 22379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Original strand, 260965 - 261580
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||| || || || |||| |||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||  ||    
T  260965 catgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaattgagctatcggataactgatgttgataggaataaagtgtgccgactttgtcaacctatc 261064  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    ||| || ||||| || |  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  261065 gaccacaacccatatagaatcatgtcctctcagagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaac 261164  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  261165 ggcgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaacgtcacgtttcaaaccggacc 261264  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  || || | ||| |||||  |||| ||    
T  261265 accaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgaccttcttctaaaattaactttttcaattc 261364  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||  || |||||||||||||| ||||| ||  |||  ||  || ||||||| | | ||||||||    
T  261365 ttcattgtcaagaacacaaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtctttattttctttgccattaccagcaatcatcaaa 261464  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||| | ||| | |||| ||| ||  ||||||||||||||   |||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |    
T  261465 tcaaccagcttgacatccacttgctttgcttctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaactgtatactctgagtcgacaact 261564  T
Q  621 cacagacaagactcat 636  Q
    |||| || ||||||||    
T  261565 cacataccagactcat 261580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 278405 - 278026
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||  | |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  278405 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactat 278306  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || |||||||| | |  || ||   | || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||| | ||| ||||| ||    
T  278305 cccatttccattctggcacatctaatgataccatcatatcagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacatgaatacacaaattg 278206  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||| | |||||| || |||||||| || |  ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||    
T  278205 tgccacatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaacctacttctatgactc 278106  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    || ||||||||||  ||| ||| ||| ||||  ||||||||||||| ||  |||| ||||| || |||||| || |||||    
T  278105 tcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcggcctcggaatctcaacacaccatggtcatc 278026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 277829 - 277730
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  277829 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 277730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 10470 - 11064
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |    
T  10470 tgaatgtaaatctcctccaactgagctaccggaaaactaatattgattggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatgacat 10569  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  10570 catgccctctcggactattcggtaaactcgtcacaaaatccatgaaaatgctatcccacttccactctggcatatctaacggtgtcaacaaccctgcagg 10669  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||||     
T  10670 cttctgatgctcaaccttagacttctaacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacctagaccaccaaaacagtttcttcaag 10769  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |  |||||  ||||||| || || |||||||||||  |||| || ||||| ||| |||| ||||    
T  10770 tcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaggctacttctgtgactttcttctagaatcaactttttcaaatcatcattatcaagaatgcaaa 10869  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
      || |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||| ||||| |  | |  ||| |||||||||||||| | ||   |    
T  10870 tccttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccattttcagtttcattgctagcaaccattaaatcaacaaactttacataaac 10969  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||| || ||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  10970 tttatgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaactgcacactctgaggcgacaactcacaaacaagactca 11064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 11112 - 11199
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11112 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 11199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 4)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 11086 - 10492
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| |||| |||||   |||||| || ||||| || || |    
T  11086 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcgaaataaagtgcgccaactttgtcaatttgtcgaccacaacccatatcgcat 10987  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  10986 catgccctctcggagtgttaggtagactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 10887  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    | ||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || || ||||| || || |  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  10886 cctctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacatgcatacacgaaatgagcgacgtcacgcttcaaactggaccaccaaaacaacttcttcaaa 10787  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  ||||  | ||||  | |||||| ||||    
T  10786 tcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaaccatcatcattaggaatgcaaa 10687  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||  |||| |    
T  10686 ttctccctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccaataaccatcaaatcaacaaacttctcatccac 10587  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || |||||||||||||| || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| || | | ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10586 ttattgcgcttctcggatactatttaagaaatcactattaatcttcagcatccccaattgaacaatctgaggtgtcaattcacagacaaggctca 10492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 21300 - 20706
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||| |||| |||||   |||||| || ||||| || || |    
T  21300 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcgaaataaagtgcgccaactttgtcaatttgtcgaccacaacccatatcgcat 21201  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21200 catgccctctcggagtgttaggtagactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 21101  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    | ||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || || ||||| || || |  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  21100 cctctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacatgcatacacgaaatgagcgacgtcacgcttcaaactggaccaccaaaacaacttcttcaaa 21001  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  ||||  | ||||  | |||||| ||||    
T  21000 tcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcaaaccatcatcattaggaatgcaaa 20901  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||  |||| |    
T  20900 ttctccctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgtcattaccaataaccatcaaatcaacaaacttctcatccac 20801  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || |||||||||||||| || ||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| || | | ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20800 ttattgcgcttctcggatactatttaagaaatcactattaatcttcagcatccccaattgaacaatctgaggtgtcaattcacagacaaggctca 20706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 648 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 10447 - 10327
Alignment:
Q  648 gcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaacttta 747  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | ||  |    
T  10447 gcggacatatgcagcgttttcctactcaaggcatctgtaaccacattggctttaccaggatggtaattcaacccaaaatcataatccttcaacagctcca 10348  T
Q  748 accacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  10347 accatctcctctgcctcatgt 10327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 648 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 20661 - 20541
Alignment:
Q  648 gcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaacttta 747  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | ||  |    
T  20661 gcggacatatgcagcgttttcctactcaaggcatctgtaaccacattggctttaccaggatggtaattcaacccaaaatcataatccttcaacagctcca 20562  T
Q  748 accacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  20561 accatctcctctgcctcatgt 20541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 48836 - 48241
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || ||||| || |  |    
T  48836 tgaatataaatctcagccaactgagctaccagataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaat 48737  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  48736 catgccctctcggagtgtttggtaaacttgtcactaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcagg 48637  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaa-caggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaa 339  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||  |     ||  | |   |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  48636 cttctgatgttcaactttagatttctgacaacttttttcaaactttttcaaactgagctacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaa 48537  T
Q  340 atcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaa 439  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  48536 atcgtggtacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttatgactttcctctaaaatcaactttttcaattcttcattgtcaggaatacaa 48437  T
Q  440 actctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcct 539  Q
    | |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | | ||||||||||||| | ||| | ||||     
T  48436 attctacctctgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttaaagtcactatcctctgtttcattaccagcaatcatcaaatcaaccagcttgacatcca 48337  T
Q  540 ctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||  || || |||||||||||   |||||| | ||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  48336 cttgttgtgcctctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcctaactgtatactctgaggcgacaactcacataccagactca 48241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 205; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 12434 - 11839
Alignment:
Q  21 catgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtc 120  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| || |||  |||||| || | |||||||||||||| |||    
T  12434 catgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataattgatgttgataccaatgaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtc 12335  T
Q  121 gacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaac 220  Q
    ||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  12334 gaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaaatcgtcacgaaatccatagaaatgctatcccatttccactctggtacatccaac 12235  T
Q  221 ggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc 320  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||| |||    
T  12234 gg-gtcaacaaccctgcaggcttctaatgctcaaccttagacttctggcaagtcaagcatgcatacacaaaatgagcgacatcacaattcaaaccgaacc 12136  T
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||  |||| ||    
T  12135 accaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcatctaaaattaactttttcaattc 12036  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | | ||||||||    
T  12035 ttcattgtcaggaatacaaattctacctctgaatctcaatactccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtgccattaccagcaatcatcaaa 11936  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgaca 617  Q
    ||||| | ||| | |||| |||  |  ||||||||||||||   |||||| | ||||| ||| |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||    
T  11935 tcaaccagcttgacatccacttgatatgcttctcggatactacccaagaaatcactattaatcttcagcatgcccaaccgtatgctctgaggcgaca 11839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 663 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 11761 - 11691
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || || || |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11761 gtcttcctgctcaatgcatcagcaactacgttagctttactaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 11691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 41 - 631
Target Start/End: Original strand, 28734 - 29324
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||| |    
T  28734 tgaatgtaaatctccaccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatagacaacaacccaaatggcat 28833  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  28834 catgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaacagtgttaacaaccctgcagg 28933  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||||||     
T  28934 cttctaattctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactaagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaag 29033  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || || |||||  |||| || || || | |||||||||  ||||||| ||| | ||||||||  |||    
T  29034 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtggctttcttccaaaatcaactttttcaactcatcactatcaggaatgaaaa 29133  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||  | |  ||| ||||| ||| |||| | |||  |    
T  29134 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttcattactagtaaccattaaatccacacacttgacatcaac 29233  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaaga 631  Q
    || ||| ||||||| |||| | |||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29234 ttgctgtgcttctctgatattattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacaaacaaga 29324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 449
Target Start/End: Original strand, 29622 - 30030
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  || ||| |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  29622 gaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctttcaacaatcacccaaattgcgtc 29721  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac-aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    || |||| | ||||| |   | |||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    || ||  || |  ||    
T  29722 attccctttaggagtatcatgcaaactcgtcacaaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagacaccatcataccagtagg 29821  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
     |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | ||| |||||||  |||||||| | |||||| || ||| || ||||||   |||| | |    
T  29822 tttctgatggtcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactctgcaacatcgcgtttcaatccagacgacaaaaacaacctctttaga 29921  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||  ||||||||||    
T  29922 tcgtggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtttggaatacaaa 30021  T
Q  441 ctctacctc 449  Q
      |||||||    
T  30022 tcctacctc 30030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 29376 - 29463
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  29376 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 29463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 560 - 1154
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||||| || ||||| || |  |    
T  560 tgaatgtaaatctctgccaactgagctactggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgatttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaat 659  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  660 catgccctcttggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccatttccactccggtacatccaacggcgtcaacaatcctgcagg 759  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  760 cctctgatgctcaaccttatacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaaa 859  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| || || | |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  860 tcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttctaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaaa 959  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| ||||| |||| || |||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||  | |  ||| ||||| |||||||| | |||  |    
T  960 ttctgcctctaaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatcactattctcagcttgattactagtaaccataaaatccacaaacttgacatcaac 1059  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  || ||||  || |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  1060 ttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcaatatacccaactgcacactttgaggtgacaattcacaaacgagactca 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 636 - 733
Target Start/End: Original strand, 1187 - 1284
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1187 ttcaccatcatggccgacatgtgcaatgtctttctactcaacgcatctgcaactacattagctttacccggatggtaattcaagccaaaatcataatc 1284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 41 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 51492 - 51027
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  51492 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggaataaagtgtgacgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcat 51393  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51392 catgccttctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgctgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcagg 51293  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||| | ||||||||    
T  51292 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatctcttcaaa 51193  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||  | ||||| || ||  ||||  ||||||| || || | |||||||||  |||| || ||| | |||||||| ||||    
T  51192 tcatgatacatctttgtagctcctagatgaatacttaagttacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatcactatcaggaatgcaaa 51093  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattac 506  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  51092 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatctccagtttcattac 51027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 50862 - 50775
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  50862 gacatgtgcaacgttttcctgctcaaagcatctacaaccacattagctttacccggatggtaattcaacccaaaatcataatccttca 50775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 548 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 50997 - 50910
Alignment:
Q  548 gcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||||  ||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50997 gcttctctaatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatagccaactgtacactctgaggtgacaactcacagacaagactca 50910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 41 - 393
Target Start/End: Original strand, 40415 - 40767
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  40415 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcat 40514  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40515 catgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcagg 40614  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| | ||||||||||    
T  40615 cttttgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaaaaatttcttcaaa 40714  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgact 393  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  40715 tcatggtacatctttgtagctctcggatgaatacttaagctactcttgtgact 40767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 447 - 635
Target Start/End: Original strand, 40781 - 40969
Alignment:
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||    | |  |||||||||||||||||| |||||| |||  ||    
T  40781 ctctgaatctcaacacaccctgataatcaaccttgaagtcaccatcttcagtttcattgttagtaaccatcaaatcaacaaacttgatatccacttgatg 40880  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40881 tgcttctcggatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacagacaagactca 40969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 651 - 736
Target Start/End: Original strand, 41017 - 41102
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||  || ||||||||| |||||||    
T  41017 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatgataatcaaaaccaaaatcataatcctt 41102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 546 - 1140
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||  |||||||   |||||||||| |    
T  546 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggaataaagtgtgtcgacttcgtcaacctatcgacaaaatcccaaatggcat 645  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  646 catgccctctcagagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactttggcaaatctaacggtgtcaacaaccctgcagg 745  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||| |||||||||     
T  746 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacgaactgagcaacatcacgtttcaacccaaaccaccaaaacaatttcttcaag 845  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || || |||||  |||| || ||  | | |||||||||  |||| || |  || |||||||||||||    
T  846 tcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtggctttctaccaaaatcaactttttcaaatcattgttatcaggaatacaaa 945  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| | |||  |    
T  946 ttcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttcattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcaac 1045  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  || ||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||| |||| ||| ||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  1046 ttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcaacatacccaattgtacactctaaggcgacaactcacaaacaagactca 1140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 651 - 736
Target Start/End: Original strand, 1188 - 1273
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1188 gacatgtgtaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatcctt 1273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 41 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 863 - 270
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |    
T  863 tgaatgtagatctccgctaactgagctactggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaat 764  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  763 catgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgttatcccatttccactctggtacttccaacggtgtcaacaaacctgcagg 664  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    | ||||||| |||||||| |||||| || |  ||||||| ||||| |||||| |||| |||||  | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||     
T  663 cctctgatgttcaaccttagacttccgataagtcaaacacgcatacacaaaccgagcgacatccttcttcaaaccagaccactaaaacagcttcttcaag 564  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctc-aagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaa 439  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| || || || |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  563 tcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagttgctcttatgactttcttctaaaaatcaacttcttcaattcttcattgtcaggaatacaa 464  T
Q  440 actctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcct 539  Q
    | ||| ||||| |||| || |||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |  | |||||  | |  ||| ||||| |||||||| | |||      
T  463 attctgcctctaaatctcaacacaccttgttcatcaaccttgaaatcactattctccgcttgattactagtaaccattaaatccacaaacttaacatcaa 364  T
Q  540 ctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagact 633  Q
    |||  || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  || |||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| || |||||    
T  363 cttgttgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgcacactctgagatgacaattcacacacgagact 270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 232 - 103
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || || || ||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| || |    
T  232 accatcaaggccgacatgtgcaatgtcttcctactcaacgcatctgcaactactttagctttatctggatggtatttcaagccaaaatcataatctttta 133  T
Q  739 gtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
     |||||  | ||| ||||||||||| ||||    
T  132 ataactcaagccatctcctctgcctcatgt 103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 40 - 635
Target Start/End: Original strand, 1584 - 2179
Alignment:
Q  40 gtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcg 139  Q
    ||||||||||||||| || ||||| | ||| ||| ||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||    
T  1584 gtgaatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgttaatcagaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagcg 1683  T
Q  140 tcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgg 239  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| || |    
T  1684 tcatgtcctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgtatatactatcccatttccattctagcacatctaacggtgtcaacaacccagcag 1783  T
Q  240 gcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaa 339  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  ||||| | |||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  1784 gtttctgatgctcaacttttgacttctgacaaatcaaacatgaatacacaaactgtgtcacatcacgtttcaacctagaccaccaaaacagcttcttcaa 1883  T
Q  340 atcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaa 439  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||| || ||||||| |||| | | ||| ||||||||| ||||||||    
T  1884 atcatgatacatctttatagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcgagaatcatcttctttatctcatcattgtcaagaatacaa 1983  T
Q  440 actctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcct 539  Q
    | ||| ||||  |||| || ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| ||   | |||  ||||| |||||||| | ||||     
T  1984 attctgcctcgaaatcgcaacactccctgatcatcaactttaaagtcactatcctcagtctgatttccaccaatcaataaatctacaaactttagatccg 2083  T
Q  540 ctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     |||||| ||||||   ||||||||||| || | ||||| ||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2084 ttttctgtgcttctttaatactgttcaaaaattcactattaatcttcaacattcccaacttgacactctgaggtgacaattcacaaacaaaactca 2179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 182; Significance: 5e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 123 - 635
Target Start/End: Original strand, 18107 - 18620
Alignment:
Q  123 caactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacgg 222  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||||||    
T  18107 caacaacccaaatggcatcatgctctcacggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgatgtcccacttccactctggcacatctaacgg 18206  T
Q  223 tgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacca- 321  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||     
T  18207 agtcaacaaccctgaaggcttctgatgctcaaccttaaacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacatttcaacccaaaccat 18306  T
Q  322 ccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcg 421  Q
    | |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||| ||| || || |||||||||||  |||||||     
T  18307 caaaaacaatttcttcaaatgatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgttactttcttccagaatcaactttttcaactca 18406  T
Q  422 tcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaat 521  Q
    ||| | ||| |||| |||| ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||  | |  ||| ||||    
T  18407 tcactatcatgaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttgattactagcaaccattaaat 18506  T
Q  522 caacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattc 621  Q
    |||||||||| | |||  ||| ||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||  |||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||    
T  18507 caacaaacttgacatcaacttgctgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaaccttcagcatacccaactgtacactttgaagtgacaactc 18606  T
Q  622 acagacaagactca 635  Q
    ||||||||||||||    
T  18607 acagacaagactca 18620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 654 - 736
Target Start/End: Original strand, 18671 - 18753
Alignment:
Q  654 atgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||  | || ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  18671 atgtgaaatgtcttcctgctcaaagcatctacaacgacattagctttacccggatggtaattaaaaccaaaatcataatcctt 18753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 25776 - 25679
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || || || ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  25776 accatcaaagcagacatatgcaatgtctttctactcaaagcatcaacaacaacgttagccttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 25679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 4)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Original strand, 19532 - 20120
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||  || || || |||||||| || |||||||    
T  19532 taaatctccgccaactgagctaccggaaaacttatattgatcggaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccaccacaacccaaatagcatcatgcc 19631  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19632 ctctcggagtattgggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccacttccattctggcacatctaaaggtgtcaacaaccctgcaggcttctg 19731  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||     
T  19732 atgttcgaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattaagcaacatcccccttcaaaccggaccaccaaaacaactttttcaaatcatga 19831  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |    
T  19832 tacatcttcgtagctcccgaatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcatctcatcattgtcaggaatgcaaattctgc 19931  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||   |  ||| ||||| |||||||| | |||  | |  ||    
T  19932 ctctgaacctcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcttcagcttgattaccattaaccattaaatccacaaacttgacatcaacctgttg 20031  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     ||||||| |||||| |||||||| | |||||  ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  20032 cgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcagcatacccaactgcacactctggggtgacaattcgcaaaccagactca 20120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 635
Target Start/End: Original strand, 23694 - 24282
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||  || || || |||||||| || |||||||    
T  23694 taaatctccgccaactgagctaccggaaaacttatattgatcggaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccaccacaacccaaatagcatcatgcc 23793  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23794 ctctcggagtattgggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccacttccattctggcacatctaaaggtgtcaacaaccctgcaggcttctg 23893  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||     
T  23894 atgttcgaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattaagcaacatcccccttcaaaccggaccaccaaaacaactttttcaaatcatga 23993  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |    
T  23994 tacatcttcgtagctcccgaatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaattaactttttcatctcatcattgtcaggaatgcaaattctgc 24093  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||   ||  ||| ||||| |||||||| | |||  | |  ||    
T  24094 ctctgaacctcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcttcagattgattacaataaaacattaaatccacaaacttgacatcaacctgttg 24193  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     ||||||| |||||| |||||||| | |||||  ||||||| ||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  24194 cgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttcaacatacccaactgcacactctggggtgacaattcgcaaacaagactca 24282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 20168 - 20285
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| |  || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||  | || |||||    
T  20168 gacatgtgtaacgtcttcctgctcaaagcatctgtaactacattggctttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatccttcaacagctctaacc 20267  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  20268 atctcctctgcctcatgt 20285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 24330 - 24447
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| |  || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||  | || |||||    
T  24330 gacatgtgtaacgtcttcctgctcaaagcatctgtaactacattggctttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatccttcaacagctctaacc 24429  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  24430 atctcctctgcctcatgt 24447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 180; Significance: 9e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 212 - 635
Target Start/End: Original strand, 3024 - 3447
Alignment:
Q  212 acatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttca 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  3024 acatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttca 3123  T
Q  312 aaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaactt 411  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||  || || ||||||| |||    
T  3124 acccagaccaccaaaacaatttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgacattcttccagaatcatctt 3223  T
Q  412 cctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaa 511  Q
      ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||||  | |    
T  3224 tttcaactcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaacacaccctcaccatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttgattactagca 3323  T
Q  512 gtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgag 611  Q
      ||| ||||||||||||||   |||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||| || ||||| ||    
T  3324 accattaaatcaacaaacttggcatcaacttgctgtgcttctctgatactgttcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactatacactcttag 3423  T
Q  612 gtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  3424 gtgacaactcacagacaagactca 3447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 286
Target Start/End: Original strand, 2471 - 2716
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  2471 tgaatgtaaatctctgccaactgagctaccggataactattattgatcggaataaagtgtgttgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcat 2570  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2571 cgtgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttctactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcagg 2670  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataa 286  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  2671 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataa 2716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 651 - 763
Target Start/End: Original strand, 3495 - 3607
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||  | ||    
T  3495 gacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaatttaaaccaaaatcataatcctttagcaactcaagcc 3594  T
Q  751 acctcctctgcct 763  Q
    | |||||||||||    
T  3595 atctcctctgcct 3607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 5)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 219
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || || || |||||| || |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  778 tgaatataaatctcagccaattgagctaccagaaaactaatattgatcggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcat 679  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  678 catgccctctcggagtattcagtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgctatcccactttcactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcagg 579  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||| | ||||||      
T  578 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcatgtttcaacccagaccaccaaaacaatctcttcagg 479  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||  ||||| |||||||| ||    ||||| || || |||||  ||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||| | |||||||| ||||    
T  478 tcataatacatctttgtagctcctaaatgaatacttaagctacttctgtgactttcttcgaaaatcaactttttcaactcatcactatcaggaatgcaaa 379  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||||| ||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||  | |  ||| ||||| ||| |||| | |||  |    
T  378 ttcttcctctgaacctcaacacaccctaatcgtcaaccttgaagtcacgatcttcagtttcattactagtaaccattaaatccacacacttgacatcaac 279  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactg 600  Q
     ||||| |||||||  ||||| |||||||| | ||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  278 attctgggcttctctaatactattcaagaaatcactattaatctttagcatacccaactg 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 320 - 635
Target Start/End: Original strand, 28173 - 28488
Alignment:
Q  320 caccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaact 419  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  ||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||| |    
T  28173 caccaaaacagcttcttgaaatcatgatacattttcgtagatcccagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaat 28272  T
Q  420 cgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaa 519  Q
    | ||||| | || |||||||| ||| |||| ||| | || ||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||| ||||||| | |  ||||||    
T  28273 catcattattagaaatacaaattcttcctccgaacctcaacacaccctgaaaatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaa 28372  T
Q  520 atcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaat 619  Q
    |||||||| ||| | |||| |||  || |||||||||||||| |||||||| | | | | ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28373 atcaacaagcttgacatccacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcattgttaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaat 28472  T
Q  620 tcacagacaagactca 635  Q
    ||||| ||||||||||    
T  28473 tcacaaacaagactca 28488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 320 - 635
Target Start/End: Original strand, 34426 - 34741
Alignment:
Q  320 caccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaact 419  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  ||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||| |    
T  34426 caccaaaacagcttcttgaaatcatgatacattttcgtagatcccagatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaat 34525  T
Q  420 cgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaa 519  Q
    | ||||| | || |||||||| ||| |||| ||| | || ||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||| ||||||| | |  ||||||    
T  34526 catcattattagaaatacaaattcttcctccgaacctcaacacaccctgaaaatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaa 34625  T
Q  520 atcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaat 619  Q
    |||||||| ||| | |||| |||  || |||||||||||||| |||||||| | | | | ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34626 atcaacaagcttgacatccacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcattgttaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaat 34725  T
Q  620 tcacagacaagactca 635  Q
    ||||| ||||||||||    
T  34726 tcacaaacaagactca 34741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 663 - 768
Target Start/End: Original strand, 28548 - 28653
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaaccacctcctctgcc 762  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | || |||||| ||||||||||    
T  28548 gtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcc 28647  T
Q  763 tgatgt 768  Q
    | ||||    
T  28648 tcatgt 28653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 663 - 768
Target Start/End: Original strand, 34801 - 34906
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaaccacctcctctgcc 762  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | || |||||| ||||||||||    
T  34801 gtcttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacagctctaaccatctcctctgcc 34900  T
Q  763 tgatgt 768  Q
    | ||||    
T  34901 tcatgt 34906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 162 - 635
Target Start/End: Original strand, 12996 - 13471
Alignment:
Q  162 gtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttgga 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  12996 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttaga 13095  T
Q  262 cttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacc-accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagc 360  Q
    |||| ||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  13096 cttcagacaagtcaaacatgcatacacaaattgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaaccaaaacagcttctttaaatcatgatacattttcgtagc 13195  T
Q  361 -ccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacag 459  Q
      ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| | ||| ||| |  | || || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| | ||     
T  13196 ttcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaattaaccttttgaaatcatcattatcaggaatacaaattcttcctctgaacctcaa 13295  T
Q  460 cacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggata 559  Q
    ||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||| | |  ||| |||||||||||||||| |||  ||   || ||||||||||||    
T  13296 cacaccctgatcatccaccttaaactcactatcctcagtgccattaccagcaaccattaaatcaacaaacttcacatctactagttgtgcttctcggata 13395  T
Q  560 ctgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || |||||||| | ||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13396 ctattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgtacactctaaggtgtcaactcacagacaagactca 13471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 158
Target Start/End: Original strand, 11571 - 11682
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||| |||||| || ||||| || || |||||||    
T  11571 taaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgcc 11670  T
Q  147 ctctcggagtgt 158  Q
    |||| |||||||    
T  11671 ctctaggagtgt 11682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 13519 - 13636
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||  | || |||||    
T  13519 gacatgtgcaacgtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattagctttacctggatgataattcaagccaaaatcataatctttcaacagctctaacc 13618  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | || |||||||| ||||    
T  13619 atcttctctgcctcatgt 13636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 172; Significance: 5e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 168 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 20943 - 20476
Alignment:
Q  168 tcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctg 267  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20943 tcgttacaaaatccatagaaatgctgtcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctg 20844  T
Q  268 acagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccggg 367  Q
    |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| || |||||||||||| | || || |||||||| |||||     
T  20843 acaagtcaaacacgcatagacaaactgagcaacatcacgcttcaacccagaccaccaaaaaagcttcttcaaatcaagatagatctttgtagctcccgga 20744  T
Q  368 tgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccct 467  Q
    ||||| || || |||||||||||||| |  || | |||||||||  |||| || ||||  |||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||| |    
T  20743 tgaatacttaagctactcttgtgacttttttctaaaatcaactttttcaaatcatcatcatcaggaatgcaaattcttcctctgaatctcaacacaccat 20644  T
Q  468 gatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaa 567  Q
    |||||||||| || || |||||||||| |||| || |||| | |  ||||||||| |||||||| | |||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||    
T  20643 gatcatcaaccttaaagtcactatcctgagtgccactaccagcaaccatcaaatcgacaaacttgacatccacttgctgtgcttcccggatactattcaa 20544  T
Q  568 gaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||| | ||| | ||  |||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20543 gaaatcactgttaaacttcagcatccctaactgtacactctgaggtgtcaattcgcagacaagactca 20476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 16563 - 16466
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  16563 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagccttcccaggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 16466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 27265 - 27168
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   ||||||||| |||||    
T  27265 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcaacaacaacattagccttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaagtcctt 27168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 170; Significance: 8e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 206 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 1150 - 722
Alignment:
Q  206 tccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctc 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  1150 tccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaagcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcac 1051  T
Q  306 ttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaat 405  Q
     |||||| || |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || |||||    
T  1050 gtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacatttttgtagctcccgggtgaatactctagctactcttgtgactttcttctagaat 951  T
Q  406 caacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcatta 505  Q
    ||||||   |||||| ||| | |||||||| |||| ||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||    
T  950 caacttttccaactcatcactatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaactttgaagtcaatatcttccgtttcatta 851  T
Q  506 cctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatac 605  Q
       | |  |||||||||||||||||| | |||| |||  || |||||||||||||| |||||||| | || || ||| |||| ||| |||||||||| |     
T  850 ttagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcac-attaatcttcatcatccccaactgtacag 752  T
Q  606 tctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  751 tctgaggtgtcaactcacagacaagactca 722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2482 - 2336
Alignment:
Q  65 gctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggta 164  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  2482 gctaccggataattgatattaattggaataaagtgtgccgacttcgttaacctatcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttaggta 2383  T
Q  165 aactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggt 211  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  2382 aactcgtcacaaaatccatagaaatgccgtcccacttccactccggt 2336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 674 - 558
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||  | || || ||    
T  674 gacatatgcaacgtcttcctacttatggcatctgcaaccacatttgctttacccg-atggtaattcaaaccaaaatcataatctttcaacagctctagcc 576  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  575 atctcctctgcctcatgt 558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 170; Significance: 8e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 635
Target Start/End: Original strand, 47801 - 48375
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  47801 tgaatataaatctcccccaactgagctaccggataactaatattgatcggaataaagtgtgccgacttagtcaacctatcgacaacaacccaaatggcat 47900  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  47901 cagggcctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaacggggtcaacaaccctgtagg 48000  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||               
T  48001 cttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtctaacatgcataaacaaattgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaaca----------- 48089  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
             |||| |||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48090 ---------atttctgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcttccagaatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaa 48180  T
Q  441 ctctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
     ||| |||||||| | || |||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||||  | |  ||| |||||||||||||| | |||  |    
T  48181 ttcttcctctgaacctcaacacaccttcatcatcaaccttgaaatcaccatcttcagtttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcaac 48280  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     |  || ||||||| ||||||  ||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  48281 ctgatgtgcttctctgatactactcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgataactcacagacaagactca 48375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 651 - 736
Target Start/End: Original strand, 48423 - 48508
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  48423 gacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatcctt 48508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 357 - 635
Target Start/End: Original strand, 27926 - 28204
Alignment:
Q  357 tagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatca 456  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27926 tagcccccgggtgaatactcaatctactcttgtgactctcttcaagaatcaacttcctcaattcatcgttgtcaggaatacaaactcttcctctgaatct 28025  T
Q  457 cagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcgg 556  Q
    ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||| |||| |||| | ||||||||||||||| || |||| |||  | |||||||||||||||    
T  28026 cagtacaccctaatcatcaatcttgaaatcactgttctcagcgtcactaccagtagtcatcaaatcaaccaatttcaaatctaccttctgagcttctcgg 28125  T
Q  557 atactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28126 atattgtccaagaaattactatcaattttcagcatccccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 28204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 28237 - 28369
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28237 ttcaccattaaagcagacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcaacaaccacattggccttaccatgatggtaattcaagccaaaatcataatcct 28336  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||| || |||||||| ||||    
T  28337 tcaacagctctaaccatcttctctgcctcatgt 28369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 165; Significance: 8e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 47 - 399
Target Start/End: Original strand, 547 - 899
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||  |||||| || ||||| || |  |||||||    
T  547 taaatctccgccaactgagctaccagataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccacaacccatatagtatcatgcc 646  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  647 ctctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgttatcccacttccacttcggcacatccaacggtgacaacaaccctgcaggcttctg 746  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  747 atgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaatagcttcttcaaatcatga 846  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctc 399  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  847 tacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctc 899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 164; Significance: 3e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 103 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 24638 - 24244
Alignment:
Q  103 cgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttc 202  Q
    |||||||||||| |  || ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  24638 cgacttcgtcaatctatctacaaccacccaaatggtatcatgccctcttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatgga-atactatcccatttc 24540  T
Q  203 cactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacat 302  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  24539 cacttcggcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgttcaactttagatttctgacaaatcaaacaagcatatacaaactgtgcaacat 24440  T
Q  303 ctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaag 402  Q
    | | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || || |     
T  24439 cacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcattatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcttctaa 24340  T
Q  403 aatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  24339 aatcaactttttcaactcatcattatcaggaatacaaattctgcctcggaatctcaacacaccttgatcatcaaccttgaagtcaccatcttcagt 24244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 94 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 637 - 108
Alignment:
Q  94 gaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatacta 193  Q
    |||||| || |||||||||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||    
T  637 gaaatgcgctgacttcgtcaacctatcgacaacaaccctaatggtgtcatgccctctcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggaaatgcta 538  T
Q  194 tcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaact 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  537 tcccacttccactcaggtacatctaacggtgtcaacaacc-tgcatgcttctgatgttcaaccttagacttctgacaaatcaaacatgcatatacaaact 439  T
Q  294 gagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgact 393  Q
    | ||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||  | |||||    
T  438 gtgcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaataatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctatgact 339  T
Q  394 ctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcc 493  Q
     || || | |||||||||  ||||||| ||| | ||| |||| |||  ||| |||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||     
T  338 ttcttctaaaatcaactttttcaactcatcactatcaagaatgcaagttcttcctctgaacctcaacacaccttgatcatcaaccttgaaatcaccctct 239  T
Q  494 tcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattc 593  Q
    ||||| | |||||  | |  ||| ||||| |||||| | | |||   ||| || ||||||| |||| |||||||||| | |||||  || |||| ||| |    
T  238 tcagtttgattactagcaaccattaaatccacaaacatgacatcaattttatgtgcttctctgatattgttcaagaaatcactattgatcttcaacatac 139  T
Q  594 ccaactgtatactctgaggtgacaattcaca 624  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  138 ccaactgcacactctgaggtgacaactcaca 108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 162; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18166 - 17841
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  18166 tgaatataaatctccgccaactgagctactggataactaatattgatcggaataaagtgtgccgactttgtcaacttgtcgacaacaacccaaatggcat 18067  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18066 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacgaaatccatggaaatgctgtcccactttcactctgccacatctaacggtgtcaacaatcctgcagg 17967  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||   ||||||||    
T  17966 cttctgatgctcaaccttagacttctaacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgttttaacccagaccaccaaaacaacatcttcaaa 17867  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgg 366  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||    
T  17866 tcatgatacatttttgtagctcccgg 17841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 83 - 627
Target Start/End: Original strand, 15596 - 16140
Alignment:
Q  83 ttaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatcca 182  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  15596 ttaatcggaataaaatgagccgacttcatcaatccatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctcgtagtattcggaaaactcgtcacaaaatcca 15695  T
Q  183 tagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggc 282  Q
    | || || |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||      
T  15696 tggatatgctatcccatttccactatggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgctgaacttttgacttctgacaaatcaaacagta 15795  T
Q  283 ataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaaccta 382  Q
    ||| |||||||| || || |||| |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  15796 atacacaaactgtgccacgtctcgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttagtagctcccggatgaatactcaagcta 15895  T
Q  383 ctcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttga 482  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| || | |||||||||||||| | || |||  |||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  15896 cttctgtgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcgtcgtcaggaatacaaattatatctcgaaatctcaacacaccctgatcatcgactttga 15995  T
Q  483 aatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaat 582  Q
    | |||||||| || || | ||||| || |  || ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||  | ||||| || |  || | |||||||||    
T  15996 agtcactatcttccgtctgattacttgcaaccaacaagtccacaaacttaacatcctctttctgcgcttcatgaatactctttagaaattcactatcaat 16095  T
Q  583 tttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
     ||||||||||||| || || ||||||||||||||| || |||||    
T  16096 cttcagcattcccagctttacactctgaggtgacaactcgcagac 16140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 113082 - 112660
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    |||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||| ||    
T  113082 aactaatattaattggaaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcac 112983  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||| | |  || || ||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  112982 aaaatccatggatatgctatcccatttcca-tctggcacatctaaagataccatcatcccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatt 112884  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  112883 aaacaagaatacacaaattgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatac 112784  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||  |||||||    
T  112783 tcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcctcatcgtctggaatacaaattctacctcggaatctcaacacacctcgatcatc 112684  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     | ||| ||||||| ||| |||||    
T  112683 gattttaaaatcaccatcttcagt 112660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 16196 - 16283
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  16196 gacatatgcaaagtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaacccaaaatcataatctttca 16283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 42 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 40387 - 39794
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| |||||||| || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||  ||    
T  40387 gaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcggaataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggtatc 40288  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||  |     
T  40287 atgtccccttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaagt 40188  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  40187 ttctgatgttcaactttagatttctgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagt 40088  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| || || |||||||| ||||| ||||| || || |||||  ||||| | || || | |||||||||  |||| || ||||| | |||||||||||     
T  40087 catgataaatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgaatatcttctaaaatcaactttttcaattcatcattataaggaatacaaat 39988  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctct 541  Q
    ||| ||||  |||| || ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||  | |  || ||| || |||||||| |||||  ||    
T  39987 tcttcctcgaaatctcaacacgccttgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaatatcaact 39888  T
Q  542 ttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    || || ||||||  ||||||||||||||| | | | |  || |||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  39887 ttttgtgcttctttgatactgttcaagaactcattgttgatcttcaacatacccaacttcatactctgaggcgacaactcacaaactagactca 39794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28396 - 28093
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| |||||||| || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||  ||    
T  28396 gaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcggaataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggtatc 28297  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||  |     
T  28296 atgtccccttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaagt 28197  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  28196 ttctgatgttcaactttagatttctgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagt 28097  T
Q  342 catg 345  Q
    ||||    
T  28096 catg 28093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 4)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6866 - 6507
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||| || || |||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||| |    
T  6866 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaacattgatcagaataaagtgcgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccaaatggcat 6767  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaa-tccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  6766 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaaatccatggaaatgctgtcccacttccactccggcacatctaatggtgtcaacaaccttgcag 6667  T
Q  240 gcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaa 339  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||  | ||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  6666 gcttctggtgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcattgaaaaattgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaa 6567  T
Q  340 atcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctc 399  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||    
T  6566 atcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcctc 6507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 41 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 11297 - 10938
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||| || || |||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||| |    
T  11297 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaacattgatcagaataaagtgcgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccaaatggcat 11198  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaa-tccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  11197 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaaatccatggaaatgctgtcccacttccactccggcacatctaatggtgtcaacaaccttgcag 11098  T
Q  240 gcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaa 339  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||  | ||| ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  11097 gcttctggtgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcattgaaaaattgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaa 10998  T
Q  340 atcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctc 399  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||    
T  10997 atcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcctc 10938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 514 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 6486 - 6365
Alignment:
Q  514 catcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggt 613  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||  || |||||||||||||| |||||||| | ||||| | | |||| ||| |||||||| | ||||||||||    
T  6486 catcaaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattattcttcaacatacccaactggacactctgaggt 6387  T
Q  614 gacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  6386 gacaactcacagacaagactca 6365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 514 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 10917 - 10796
Alignment:
Q  514 catcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggt 613  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||  || |||||||||||||| |||||||| | ||||| | | |||| ||| |||||||| | ||||||||||    
T  10917 catcaaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattattcttcaacatacccaactggacactctgaggt 10818  T
Q  614 gacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  10817 gacaactcacagacaagactca 10796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 155; Significance: 7e-82; HSPs: 9)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 50142 - 49549
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| |||||||| || ||||| || |||||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |  ||||| || ||||| || |  ||    
T  50142 gaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatc 50043  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||| ||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  50042 atgtcctctcggagtattatgtaaacttgtcacaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggc 49943  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  49942 ttctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccaggccaccaaaacagctttttcaaat 49843  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    | || ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || | ||||||| |  ||| ||| || || |||||||| ||||     
T  49842 cgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgtgactttcttccaaaatcaaccttttcatctcatcgttatcaggaatgcaaat 49743  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattac-ctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctc 540  Q
    ||| | ||||||   || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  | || | || ||||| |||||||| | |||  |    
T  49742 tctgcatctgaacttcaacacaccttgttcatcaactttgaaatcactatcctcagcttcattactattaact-attaaatccacaaacttgacatcaac 49644  T
Q  541 tttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     |  || ||||||| |||||| |||||||| | |||||  ||||||  ||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  49643 ctgttgcgcttctctgatactattcaagaattcactattgattttctacatacccaactgcacactctggggtgacaattcgcaaacaagactca 49549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 498
Target Start/End: Original strand, 43833 - 44288
Alignment:
Q  43 aatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtca 142  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||  || ||||  |||||||| || ||     
T  43833 aatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcatcg 43932  T
Q  143 tgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggct 242  Q
    | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || |    
T  43933 ttccctctgggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtt 44032  T
Q  243 tctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatc 342  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  44033 tctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatc 44132  T
Q  343 atggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaact 442  Q
     || ||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| | |||||||| |    
T  44133 gtgatacatcttcgtagctcccgagtgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctgtaatacaaatt 44232  T
Q  443 ctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||  ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  44233 ctctctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 44288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 487
Target Start/End: Original strand, 9205 - 9597
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  9205 aaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgatatactat 9304  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || ||||||||||| || || ||||||||||| |  | ||||| ||| ||||||||    
T  9305 cccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccggcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactagacaggaatacacaaactg 9404  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||| ||||||||    
T  9405 tgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcctgtgactc 9504  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatca 487  Q
    || |||||||||| |||| | | ||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||||    
T  9505 tcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaccacaccttgatcatcgattttcaaatca 9597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 487
Target Start/End: Original strand, 15667 - 16059
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15667 aaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctataggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgatatactat 15766  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    | || ||||| |  || |||||||| |||  || ||  || || || ||||||||||| || || ||||||||||| |  |  |||| ||| ||||||||    
T  15767 cacatttccattttggcacatctaaaggtaccatcattccggcaggtttctgatgctcgactttcgacttctgacaaactagtcaggaatacacaaactg 15866  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||| ||||||||    
T  15867 tgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctactcctgtgactc 15966  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatca 487  Q
    || |||||||||| |||| | | ||| | |||||| |||||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||||    
T  15967 tcttcaagaatcatcttcttaatctctttattgtctggaatacaaattcttcctcggaatctcaccacaccttgatcatcgattttaaaatca 16059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 320 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 966 - 788
Alignment:
Q  320 caccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaact 419  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||| | | ||    
T  966 caccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctacttttgtgactctcttccagaatcatcttctttatct 867  T
Q  420 cgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| |||  ||||||||| ||||||||  || | ||  ||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  866 cttcatcgtctagaatacaaattctacctcgaaacctcaatacaccatgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 49501 - 49384
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | ||| || ||||| ||||||||| ||||||||| || || |||||    
T  49501 gacatgtgtaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattggctttacccgaatgatagttcaacccaaaatcataatccttcaatagctctaacc 49402  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  49401 atctcctctgcctcatgt 49384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 106160 - 106106
Alignment:
Q  83 ttaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatgg 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||    
T  106160 ttaataggaatgaaatgtgctgacttcgtcaaccgatcaacaatcacccaaatgg 106106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 724
Target Start/End: Original strand, 44458 - 44543
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaa 724  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  44458 accatcatagcggacatatgcaatgtcttccgactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatggtaattcaaaccaaa 44543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 105572 - 105502
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatg 709  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  105572 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagccttcccgggatg 105502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 627
Target Start/End: Original strand, 4709 - 5294
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||| || || ||||| |  || ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  4709 gaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaatcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtc 4808  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| |  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||  | |||| ||| ||||||| ||| ||||| ||     
T  4809 attccctttatgagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctagaacatataaaggtgtcatcaaacctgcaggt 4908  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||| ||||    
T  4909 ttctgatgctcaacttttgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacatttcaacccagaccaccaaaacaacttctttaaat 5008  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||     
T  5009 catgatacatcttcgtagctcccggatgattactcaagctacttttatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaat 5108  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctct 541  Q
    ||| ||||  || | || ||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||| | ||||| || |  || ||| || |||||||| | |||   |    
T  5109 tctgcctcgaaaacgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcagtctgattacttgcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaatt 5208  T
Q  542 ttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  5209 ttctgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattctcagcttcacactctgaggtgacaattcacagac 5294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 407 - 635
Target Start/End: Original strand, 1 - 229
Alignment:
Q  407 aacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattac 506  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||    
T  1 aacttcttcaaatcatcattgtcaggaatacaaactcttcctctgaacctcagcacaccctgatcatcaaccataaagtcactatcctcagtgtcattac 100  T
Q  507 ctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatact 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  101 ctgaagtcatcaaatcaacaaacttcaaatccactttctgagcttctcggatactgttcaagaaatcacaataaatcttcagcatccccaactgtatact 200  T
Q  607 ctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  201 ctgaggtgacagttcacagacaagactca 229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 657 - 768
Target Start/End: Original strand, 287 - 398
Alignment:
Q  657 tgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaaccacctcc 756  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  287 tgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcataatccttcagtaactctaaccacctcc 386  T
Q  757 tctgcctgatgt 768  Q
    ||||||| ||||    
T  387 tctgcctcatgt 398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 152; Significance: 4e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6665 - 6334
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |    
T  6665 tgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcgggataaaatgcgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggtat 6566  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6565 catgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggagatgctgtcccacttccactctggaaaatctaacggtgtcaacaatcctgcagg 6466  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    ||||| ||| |||| ||| |||||||||||  ||||||| || || | ||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  6465 cttctcatgttcaatcttagacttctgacaagtcaaacatgcctatagaaattgtgcaacatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaag 6366  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaat 372  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  6365 tcatgatacatctttgtagctcccggatgaat 6334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 6078 - 5989
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctacc--acattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  6078 gacatgtgcaacgtcttcctactcaaagcatctgcaaccgtacattagctttaccggggtgataattcaaaccaaaatcatagtccttca 5989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 6205 - 6126
Alignment:
Q  556 gatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||||||||||| | |||||  || |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  6205 gatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaactgcacactctgaggtgacaactcacaaactagactca 6126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 152; Significance: 4e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 219045 - 218466
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||| || || ||||| |  || ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  219045 gaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaatcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtc 218946  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| ||||  || ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||     
T  218945 attccctttaggagtattcgacaagctcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtatatctaatggtgtcatcaaccctgcaggt 218846  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  218845 ttctgatgctcaacttttgacttctgacaaatcaaacaggaattcacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaat 218746  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||     
T  218745 catgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcattatcaggaatacaaat 218646  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctct 541  Q
    ||| |||| ||||| || ||  ||||||||||  | ||| |||||| | || ||||| | |||||  | |  || ||| || |||||||| | |||   |    
T  218645 tctgcctcggaatctcaacaatccctgatcattgattttaaaatcattgtcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaatt 218546  T
Q  542 ttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattc 621  Q
    ||||| ||||||  |||| |||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  218545 ttctgcgcttctttgatattgttcaagaattcactatcaatctttagcattcccaacttcacactctgaggtgacaattc 218466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 474
Target Start/End: Original strand, 229721 - 230153
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  || ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  229721 gaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaatcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtc 229820  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| |    || ||  || || ||     
T  229821 attccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcacaattccactctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggt 229920  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| | |||||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||| || |||||||||| ||  || |||||||    
T  229921 ttctgatgctcaattttcgacttctgacaaaccaaacaagaatacacaaattgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaaaccaactttttcaaat 230020  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| || |||||||||| |||| ||| ||| |||| ||| |||||| |||     
T  230021 catgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactttcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaatataaat 230120  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||||||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  230121 tctacctcggaatctcaacacaccttgatcatc 230153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 150; Significance: 7e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 378
Target Start/End: Original strand, 6861 - 7198
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||  |    
T  6861 tgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatggaat 6960  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||   ||||| ||    
T  6961 catgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaactttcctgcagg 7060  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaa 340  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||| |||||  | |||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  7061 cctctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatatacaaaccgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaag 7160  T
Q  341 tcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaa 378  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  7161 tcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaa 7198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 662 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 10865 - 10794
Alignment:
Q  662 ggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    ||||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10865 ggtcttcctgcttaacgcatccgcaaccacattggctttaccaagatggtaattcaaaccaaaatcataatc 10794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 150; Significance: 7e-79; HSPs: 5)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 59 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 95613 - 95048
Alignment:
Q  59 aactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgt 158  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |  || || |||||||| || |    
T  95613 aactgagctactgggtaacttatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaatcgtgtcctctcggggtat 95514  T
Q  159 tcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaacctt 258  Q
    | |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  95513 tgggtaaacttgtcacgaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgttcaacttt 95414  T
Q  259 ggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgta 358  Q
     |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||| |||||  | |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  95413 agacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaaccgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacattttcgta 95314  T
Q  359 gcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcaca 458  Q
    || ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| || || | ||| |||||| | || || |||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| ||    
T  95313 gctcccggatgaatactcaaattgctcttatgactttcttctaaaattaacttctttaattcttcattgtcgggaacacaaattctacctctaaatctca 95214  T
Q  459 gcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggat 558  Q
      ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||  | |||||    |  ||| ||||| |||||||| || ||  |||  || ||||||| |||    
T  95213 atacaccttgctcatcaactttgaaatcaccatcttcagcttgattactatcaaccattaaatccacaaacttgatgtcaacttgttgtgcttctctgat 95114  T
Q  559 actgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcaca 624  Q
     || |||||||| | |||||  || |||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  95113 gctattcaagaaatcactattgatcttcagcatacccaactgtacactttgcgatgacaattcaca 95048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 635
Target Start/End: Original strand, 113237 - 113830
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |  ||||| || ||||| || |  ||    
T  113237 gaatataaatctctgccaactgcgccaccgtaaaactgatatttattggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgactacaacccatattgaatc 113336  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  113337 atgtcctctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggc 113436  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |||||||  ||||||||||| || |||||||| |    
T  113437 ttctgatgttcaactttagacttctggcaagttaaacatgcatacacaaactaagcaacatcacgcttcaaactagaccaccaaaatagcttcttcaagt 113536  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    | || ||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||| |||||||||| || || | ||||| | |  ||| ||| || |||||| |||||||||     
T  113537 cgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctattcttgtgactttcttccaaaatcagccttttcatctcatcgttgtcaagaatacaaat 113636  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctct 541  Q
    ||| |||| ||||| || |||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||    |  ||| ||||| |||| ||| | |||  |     
T  113637 tctgcctccgaatctcaacacaccgtgttcatcaaccttgcaatcactatcttcagtttgattactattaaccattaaatccacaagcttgacatcaacc 113736  T
Q  542 ttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |  || ||||||| |||||| |||||||| | | |||  ||||||| ||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  113737 tgttgcgcttctctgatactattcaagaattcattattgattttcaacatgcccaactgcacactctggggtgacaattcacaaacaaggctca 113830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 109437 - 108983
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| |    
T  109437 atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgt 109338  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||   || || ||| ||||| ||    
T  109337 tccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaattccatcgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggcaccatcatcccagcgggttt 109238  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||    
T  109237 ctgatgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatca 109138  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| |||||| ||| ||    
T  109137 tgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatataaattc 109038  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  109037 ttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 108983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Original strand, 113863 - 113995
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||  || |||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||    
T  113863 ttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttcctactcaaagcatctgcaactacattggcgttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatcct 113962  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    ||| || || |||||| ||||||||||| ||||    
T  113963 tcaatagctctaaccatctcctctgcctcatgt 113995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 651 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 108798 - 108713
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  108798 gacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatcctt 108713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 145; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 44 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10434 - 9986
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||  |||| || ||||| ||||||||||| |  || || || |||||  |||| ||||    
T  10434 atgtaaatctctgccaattgtgccaccggaaaactaatattaattagaataaagtgtgctgacttcgtcaatctatcaaccaccacccatgtggcatcat 10335  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
    |||||||||  || || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  10334 gccctctcgaggtatttggtaaacttgttacaaagtccatggatatgctatcccatttccattctggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaggctt 10235  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  10234 ctgatgttcaactttagatttctgacaagtcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagtca 10135  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| ||| |||| ||| | ||||| || || |||||  ||||||| || || | |||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||| ||    
T  10134 tgatacatctttttagctccctgatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaatcaactttttcaactcatcattatcagaaatacaaattc 10035  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatc 492  Q
    | |||| ||||| || ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  10034 ttcctcggaatctcaacacacccagatcatcaaccttgaagtcactatc 9986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 129 - 620
Target Start/End: Original strand, 17446 - 17937
Alignment:
Q  129 cccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaa 228  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||     
T  17446 cccaaatagcgtcattccctttcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggaacatctaaaggtgtcat 17545  T
Q  229 caaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaac 328  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  17546 caaccctgcaggtttctgatgctcaacttttgacttttgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcatttcaacctagaccaccaaaac 17645  T
Q  329 agtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgt 428  Q
    |  ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||    
T  17646 aacttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatacttaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgt 17745  T
Q  429 caggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaa 528  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| || ||| ||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| | |||||  | |  || ||| || |||||    
T  17746 caggaatacaaattctgcctcagaatctcaacactccctgatcatcgattttaaaatcattatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaa 17845  T
Q  529 cttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||| | |||   |||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| | ||  | ||| |||||||||||||    
T  17846 cttaacatcaattttctgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcaatctttagcattcctagcttcacactatgaggtgacaatt 17937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 627
Target Start/End: Original strand, 4549 - 5134
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||| || |||||||| | |||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |  ||||  |||||||| |||||    
T  4549 gaatgtaaatttccgctaactgagatacaagaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctataaacaatcacccaaatcgcgtc 4648  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||| | | |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||   ||     
T  4649 attccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctattctatttccactctggtacatataaaggtgtcatcaaccctataggt 4748  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  || ||||| | |||||| || ||| |||||||||  ||||||||||    
T  4749 ttctgatgctccacttttgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactatgccacatcacgtttcaacccagacgaccaaaacaacttcttcaaat 4848  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||     
T  4849 catgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaat 4948  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctct 541  Q
    |||  ||| ||||| || ||| || |||||||| | ||| || |||||||| ||||| | |||||  | |  || ||| || |||||||| | |||  ||    
T  4949 tctggctcggaatctcaacactccttgatcatcgattttaaagtcactatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaact 5048  T
Q  542 ttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||  || | ||||||||| |||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||| |||||    
T  5049 ttctgcgcttctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcatcattcccagcttcacactctgaggtgacaattcgcagac 5134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 627
Target Start/End: Original strand, 11679 - 12264
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||| || |||||||| | |||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |  ||||  |||||||| |||||    
T  11679 gaatgtaaatttccgctaactgagatacaagaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctataaacaatcacccaaatcgcgtc 11778  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||| | | |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||   ||     
T  11779 attccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctattctatttccactctggtacatataaaggtgtcatcaaccctataggt 11878  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  || ||||| | |||||| || ||| |||||||||  ||||||||||    
T  11879 ttctgatgctccacttttgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactatgccacatcacgtttcaacccagacgaccaaaacaacttcttcaaat 11978  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||     
T  11979 catgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaat 12078  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctct 541  Q
    |||  ||| ||||| || ||| || |||||||| | ||| || |||||||| ||||| | |||||  | |  || ||| || |||||||| | |||  ||    
T  12079 tctggctcggaatctcaacactccttgatcatcgattttaaagtcactatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctacaaacttaacatcaact 12178  T
Q  542 ttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||  || | ||||||||| |||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||| |||||    
T  12179 ttctgcgcttctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcatcattcccagcttcacactctgaggtgacaattcgcagac 12264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 137; Significance: 4e-71; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 283 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 89832 - 89480
Alignment:
Q  283 ataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaaccta 382  Q
    |||||| ||| || ||||||| | |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  | |||    
T  89832 ataaacgaacagatcaacatcacatttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactttagcta 89733  T
Q  383 ctcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttga 482  Q
    ||||||||||| || || | |||||||||  |||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||    
T  89732 ctcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttga 89633  T
Q  483 aatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaat 582  Q
    | |||||||| ||||| |||||||  | |  |||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||    
T  89632 agtcactatcttcagtttcattactagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaat 89533  T
Q  583 tttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     |||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  89532 cttcaacatacccaactgtacactctgaggtgataactcacagacaagactca 89480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 283 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 90510 - 90158
Alignment:
Q  283 ataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaaccta 382  Q
    |||||| ||| || ||||||| | |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  | |||    
T  90510 ataaacgaacagatcaacatcacatttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactttagcta 90411  T
Q  383 ctcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttga 482  Q
    ||||||||||| || || | |||||||||  |||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||    
T  90410 ctcttgtgactttcttctaaaatcaactttttcaaatcatcattgtcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttga 90311  T
Q  483 aatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaat 582  Q
    | |||||||| ||||| |||||||  | |  |||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||    
T  90310 agtcactatcttcagtttcattactagcaaccatcaaatcaacaaacttgacatccacttgctgtgcttctcggatactattcaagaaatcactattaat 90211  T
Q  583 tttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     |||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  90210 cttcaacatacccaactgtacactctgaggtgataactcacagacaagactca 90158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 233
Target Start/End: Original strand, 114866 - 115054
Alignment:
Q  45 tgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatg 144  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| | ||| || || ||||| || || |||||    
T  114866 tgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctgtcaaccacaacccatatagcatcatg 114965  T
Q  145 ccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaacc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  114966 ccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctattccacttccactccagcacatccaacggtgtcaacaacc 115054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 390795 - 390492
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||| ||| | |||||||| ||    
T  390795 aactgatattaatcggaataaaatgagtcaacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatcgcgtcatcccctttaggagtattcagcaaactcgtcac 390696  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | |||||| | |  || ||  |  || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  390695 aaaatccatggatatactatcccatttccactctggcatatctaaagataccatcattctagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatc 390596  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||| || ||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  390595 aaacaagaatacacaaactgtgctacatcacgtttcaatccagaccaccaaaataactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatac 390496  T
Q  375 tcaa 378  Q
    ||||    
T  390495 tcaa 390492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 89432 - 89345
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  89432 gacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 89345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 90110 - 90023
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  90110 gacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 90023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 136; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 83 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 116492 - 116077
Alignment:
Q  83 ttaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatcca 182  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  116492 ttaatatgaatgaaatgagtcgacttcgtcaatctctccacaatcacccaaatagcgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatcca 116393  T
Q  183 tagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggc 282  Q
    | || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||| |||||  || || |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |     
T  116392 tggatatactatcccatttccactctggcacttctaaaggtgtcatcaacctagcaggtttctgatgctcaacttttgacttctgagaaatcaaacatga 116293  T
Q  283 ataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaaccta 382  Q
    ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  116292 atacacaaactgcgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagcta 116193  T
Q  383 ctcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttga 482  Q
    ||  |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||| || ||| ||||||||||| || || |    
T  116192 cttctgtgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcattgtcaggaatacaaattctgcctcgaaatcgcaacactccctgatcatcgaccttaa 116093  T
Q  483 aatcactatcctcagt 498  Q
    | |||||||| |||||    
T  116092 agtcactatcttcagt 116077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 574 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 116001 - 115948
Alignment:
Q  574 actatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  116001 actatcaatcatcagcattcctaacttcacactctgaggtgacaattcacagac 115948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 135; Significance: 6e-70; HSPs: 7)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1147 - 897
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || || |||||||    
T  1147 taaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaatatagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgcc 1048  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1047 ctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaattaggtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctg 948  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagc 297  Q
    ||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  947 atgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaaatgagc 897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 334 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 887 - 587
Alignment:
Q  334 cttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcagga 433  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  887 cttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaactc-tcattatcagga 789  T
Q  434 atacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttca 533  Q
    ||||||| ||| |||||||| | ||  ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||| | ||| |    
T  788 atacaaattcttcctctgaacctcaatacaccttgatcatcaaccttaaagtcactatcctcagtgccattaccagcaaccatcaaatcaaccagcttga 689  T
Q  534 tatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagact 633  Q
     |||| |||  || ||||| |||||||| |||||||| | ||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  688 catccacttgttgtgcttcccggatactattcaagaaatcactgttaatcttcagcatccccaactgtacactctgaggtgtcaattcacagacaaggct 589  T
Q  634 ca 635  Q
    ||    
T  588 ca 587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 450
Target Start/End: Original strand, 6701 - 7106
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  || ||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  ||||| || |||||    
T  6701 gaatgtaaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccatatcgcgtc 6800  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |    || ||  || || ||     
T  6801 attccctttaggagtattaggcaaactcgttacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggt 6900  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||||    ||| | ||    
T  6901 ttctgatactcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagtatacacaaactgtgcaacatcgcgtttcaatccagaccaccaaaaca---actttagat 6997  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    | |||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||     
T  6998 cgtggtacatcttcgtagctcctggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaat 7097  T
Q  442 tctacctct 450  Q
     ||||||||    
T  7098 cctacctct 7106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 474
Target Start/End: Original strand, 12846 - 13168
Alignment:
Q  152 ggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgct 251  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |    || ||  || || || ||||||||||    
T  12846 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgct 12945  T
Q  252 caaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacat 351  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| |||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||| | |||||| |||||    
T  12946 caaccttcgacttctgacaaattaaacaagaatacacgaactgtgcaacatctcgtttcagtccagacaaccaaaacaacttctttagatcatgatacat 13045  T
Q  352 ttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctg 451  Q
     || ||||| || |||||||| |||||  ||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||  |||||||      
T  13046 cttcgtagctccagggtgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcattgtctggaatacaaatcctacctcga 13145  T
Q  452 aatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| || |||||| ||||||||    
T  13146 aatctcaacacaccttgatcatc 13168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 554 - 422
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  554 ttcaccatcatagcagacatgtgcaacgttttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatcct 455  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || ||| || ||||||||||| ||||    
T  454 tcaacagctctaagcatctcctctgcctcatgt 422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 631 - 739
Target Start/End: Original strand, 7319 - 7427
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  |||||||| |    
T  7319 actcatttaccatcatagcggacatatgcaaagtcttcctactcaaagcgtctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcata 7418  T
Q  731 atccttcag 739  Q
     ||||||||    
T  7419 gtccttcag 7427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 700
Target Start/End: Original strand, 23483 - 23544
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggcctt 700  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  23483 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagcctt 23544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 25347 - 25029
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||  || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  25347 gaatgtaaatctctgccaactgagatacaagaaaactgatgttaattggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagcgtc 25248  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | ||     
T  25247 atgccctcttggagtattcggcaaactcgtgacaaaatccatggatacactatcccatttccactacggcacatctaacggtgtcaacaacccaacaggt 25148  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  25147 ttctgatgctcaacttttgacttctgacaaatcaaacatgaatacacaaattgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaat 25048  T
Q  342 catggtacatttttgtagc 360  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  25047 catgatacatctttgtagc 25029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 24955 - 24879
Alignment:
Q  422 tcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||  |||| || ||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  24955 tcattgttaggaatacaaattctgcctcgaaatcgcaacactccctgattatcaacttttaagtcactatcctcagt 24879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 17572 - 17020
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||  ||||||||  |||||| |||| | ||||| |||   |||||||| ||    
T  17572 aactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatatcgtcattcccttttggagtattcaacaaactcgtcac 17473  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||| ||| || |||||||  || |||||||| || |||||||| | |  || ||||||  | || || ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  17472 aaaattcatggatatactattgcatttccactctggcacatctaaagatagcatcaacccaacaggtttttgatgctcaacttttgacttctgacaaatc 17373  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  17372 aaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatac 17273  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    ||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||  ||| ||||||||| ||| |||| ||||| || |||  ||||||||||    
T  17272 tcaagttacttttgtgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcttcaagaatacaaattctgcctcagaatcgcaacacctcctgatcatc 17173  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagtta 574  Q
    ||| ||||| ||| |||| ||||| | |||||  | |  || ||| || |||||||| | |||  |||| || ||||||   ||| |||||||||| | |    
T  17172 aaccttgaagtcattatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaactttttgcgcttctttaatattgttcaagaattca 17073  T
Q  575 ctatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  17072 ttatcaatcttcagcattcctaacttcacactctgaggtgacacttcacagac 17020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 128; Significance: 9e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 260 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 2740 - 2365
Alignment:
Q  260 gacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtag 359  Q
    |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||    
T  2740 gacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccggaccacgaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtag 2641  T
Q  360 cccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacag 459  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || | |||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||     
T  2640 ctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttccaaaatcaactttttcaacccatcattgtcagggatacaaattctgcctctgaacctcaa 2541  T
Q  460 cacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggata 559  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| | |   |||| |||||| ||||| | |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  2540 cacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtgccattaccagcaacaatcagatcaaccaacttgacatccacttgctgtgcttctcggata 2441  T
Q  560 ctgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  ||||||| | ||| | |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  2440 ctactcaagaattcactgttaattttcaacatacccaactgcacactctgaggtgtcaattcacaaaccagactca 2365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 636 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 2332 - 2200
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| | ||||||| ||||||    
T  2332 ttcaccatcaacgccgacatatgcaatgccttcctgctcaacgcatctgcaaccacattggctttacccggatgatagttcaaactaaaatcataatcct 2233  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctgcctgatgt 768  Q
    |||  | || |||||| ||||||||||| ||||    
T  2232 tcaacagctctaaccatctcctctgcctcatgt 2200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 330
Target Start/End: Original strand, 10195 - 10283
Alignment:
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacag 330  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||| || ||||||||||||||    
T  10195 ttctgaggctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaaatgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacag 10283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 173 - 635
Target Start/End: Original strand, 4585 - 5047
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaga 272  Q
    ||||||||||| || || |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||      
T  4585 acaaaatccatggatatgctataccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttttgacaag 4684  T
Q  273 tcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaat 372  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||   ||| ||| |||| ||||| |||||    
T  4685 tcaaacacgcataaaaaaactgagcaatatcacgtttcaaccaagaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgaatcatctttttagctcccggatgaat 4784  T
Q  373 gctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatca 472  Q
     || || |||||  |||| || || || | |||||||||  |||| || ||||| | |||||| |||| ||| |||||||| | || |||||||||||||    
T  4785 acttaagctacttctgtggctttcttctaaaatcaactttatcaaatcatcattattaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatca 4884  T
Q  473 tcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagt 572  Q
    ||||| ||||| ||||  || || || | |||||  | |  ||| |||||||||||||| | |||  |||  || ||||||| |||||| |||||||| |    
T  4885 tcaaccttgaagtcaccctcttcggtttgattactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctctgatactattcaagaaat 4984  T
Q  573 tactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     ||||| ||| |||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4985 cactattaatcttcagcatactcaactgtacactttgaggtgacaactcacaaacaagactca 5047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 654 - 738
Target Start/End: Original strand, 5098 - 5182
Alignment:
Q  654 atgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  5098 atgtgcaacgtcttcttgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccggatggtaatttaaaccaaaatcataatccttca 5182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14705 - 14251
Alignment:
Q  44 atgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcat 143  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||  |||||||| |||||||    
T  14705 atgtaaatctctgccaactgagatacaggaaaactgatgttaatcggaatgaaatgagccgacttcgttaatctatctacaatcacccaaatagcgtcat 14606  T
Q  144 gccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggctt 243  Q
     |||  ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||  | || ||    
T  14605 tcccattcggagtattcggcaaactcgtcacaaattccatggatatactatctcatttccactctggcacatctaaaggtgtcatcaacccaacaggttt 14506  T
Q  244 ctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatca 343  Q
    ||||| |||||| || ||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||| |  |||||   |||||| || |||||||||||||  ||||||||||||    
T  14505 ctgatactcaacttttgacttctaacaaatcaaacatgaatacacaaactgtgtcacatcatgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatca 14406  T
Q  344 tggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactc 443  Q
    || ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||    
T  14405 tgatacatcttcgtagctccctgatgaatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatagtcaggaatacaaattc 14306  T
Q  444 tacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | ||||  || | || ||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  14305 tgcctcgaaaccgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcactatcttcagt 14251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 474
Target Start/End: Original strand, 9681 - 10080
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || |  || |||| |||||||||  | |||| |||| ||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  9681 aactgatattaatcggaatgaaatgagctgatttcgttaatctatcaacaattacccaaatcacatcattccctttcgtagtattcggaaaactcgtcac 9780  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  9781 aaaatccatggatatactatcctatttccactctggcacatctaacggtgtcatcaaccctgcaggtttttgatgctcaacctttgacttctgacaaatc 9880  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||| | ||| |||||||  || ||||| | |||||  || |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||    
T  9881 aaacaagaatacacaaactatgccacatcacgtttcagtccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcctggatgaatgc 9980  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||| || |||||| || |||||    
T  9981 tcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcatgaatacaaattcttcctcagaatctcaacacaccttggtcatc 10080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 123; Significance: 9e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 321 - 635
Target Start/End: Original strand, 11690 - 12004
Alignment:
Q  321 accaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactc 420  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| || || |  ||||||||  |||| ||    
T  11690 accaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcctggatgaatacttaagctactcttatgactttcttctaagatcaactttttcaattc 11789  T
Q  421 gtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaa 520  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| | |  ||| |||    
T  11790 ttcattgtcaggaatacaaattctacctatgaatctcaatacaccctgatcatcaaccttgaagtcactatcctctgtttcattaccagcaaccattaaa 11889  T
Q  521 tcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaatt 620  Q
    ||||||||||| | |||| |||  || |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11890 tcaacaaactttacatccacttgttgcgcttctcggatactattcaagaaatcactattaattctcaacatccccaactgtatactctgaggtgacaatt 11989  T
Q  621 cacagacaagactca 635  Q
    |||| ||||| ||||    
T  11990 cacaaacaaggctca 12004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 285
Target Start/End: Original strand, 11446 - 11690
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||| || | ||| || |  |    
T  11446 tgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgtaccgactttgtcaacctatcgaccacaaaccatatagaat 11545  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcggg 240  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  11546 caaaccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgttatcccatttccactccgatacatccaacggtgtcaacaaccctgcagg 11645  T
Q  241 cttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcata 285  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| |||||    
T  11646 cttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcata 11690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 651 - 718
Target Start/End: Original strand, 12052 - 12119
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaa 718  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12052 gacatatgtaaggtcttcctactcaacgcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaa 12119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 42 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 32381 - 31925
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||| || || ||||| |  || ||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  || ||||  |||||||| | |||    
T  32381 gaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtc 32282  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| | |  || ||  || || ||     
T  32281 attccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaaagataccatcattccagcaggt 32182  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| ||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  || |||| ||    
T  32181 ttctgatgctcaactttcgacttctcacaaattaaataggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcacat 32082  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||  ||||  | |||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||     
T  32081 catgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaat 31982  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    |||||||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  31981 tctacctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagt 31925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 663 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 12502 - 12397
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaaccacctcctctgcc 762  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |  | |||||| ||||||||||    
T  12502 gtcttcctactcaaggcatctgcaaccacattggctttaccaggatggtaattcaaaccaaaatcatagtccttcaacagttctaaccatctcctctgcc 12403  T
Q  763 tgatgt 768  Q
    | ||||    
T  12402 tcatgt 12397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 584 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12613 - 12562
Alignment:
Q  584 ttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12613 ttcagcatccccaactgaatactctgaggtgtcaattcacagacaagactca 12562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11792 - 11369
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    |  ||||  |||| ||| | ||||| |||| | ||||| ||||| |||||||| ||    
T  11792 aactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatcaccccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcac 11693  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| | |    
T  11692 aaaatccatggatattctatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgctcaacttttgacttttgacaaagc 11593  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| ||||| || || ||||  |||||||| |  |||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||| || || |    
T  11592 aaacaggaatacacaaattgtgccacattacttttcaacctagaccaccaaaacaacctcttcaaataatgatacatctttctagctcccggatggatac 11493  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  |||||||||| | |||| ||| |||| ||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||| || ||||||||    
T  11492 tcaagctacttctgtgactctctttaagagtcatcttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctacctcagaatctcaacactccttgatcatc 11393  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     |||||||| |||||||| |||||    
T  11392 gactttgaagtcactatcttcagt 11369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 17984 - 17561
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    |  ||||  |||| ||| | ||||| |||| | ||||| ||||| |||||||| ||    
T  17984 aactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatcaccccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcac 17885  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| | |    
T  17884 aaaatccatggatattctatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgctcaacttttgacttttgacaaagc 17785  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||||| ||| ||||| || || ||||  |||||||| |  |||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||| || || |    
T  17784 aaacaggaatacacaaattgtgccacattacttttcaacctagaccaccaaaacaacctcttcaaataatgatacatctttctagctcccggatggatac 17685  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  |||||||||| | |||| ||| |||| ||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||| || ||||||||    
T  17684 tcaagctacttctgtgactctctttaagagtcatcttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctacctcagaatctcaacactccttgatcatc 17585  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     |||||||| |||||||| |||||    
T  17584 gactttgaagtcactatcttcagt 17561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 115; Significance: 5e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 317 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 2838 - 2520
Alignment:
Q  317 gaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctca 416  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| | |||||| ||  |||    
T  2838 gaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacatttttgtagctcccggatgaatacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatcaaatttttca 2739  T
Q  417 actcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcat 516  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| |||  ||| ||| | || |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| | |  |||    
T  2738 actcatcattatcaggaatgcaaattctttctccgaacctcaacacaccctcatcatcaaccttgaagtcactatcttcagtttcattaccagcaaccat 2639  T
Q  517 caaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgac 616  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||| |||||||||||||| |||||||| |||| || ||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||     
T  2638 caaatcaacaaacttgacatccagttgctgtgcttctcggatactattcaagaaattacaattaatcttcaacatacccaactgtacactctaaggtgag 2539  T
Q  617 aattcacagacaagactca 635  Q
    || ||||||||||||||||    
T  2538 aactcacagacaagactca 2520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 651 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 2472 - 2360
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||| || ||    
T  2472 gacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagcttcacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacaactctagcc 2373  T
Q  751 acctcctctgcct 763  Q
    | || ||||||||    
T  2372 atcttctctgcct 2360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 498
Target Start/End: Original strand, 3851 - 4274
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||| |  || ||||  ||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||    
T  3851 aactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttgtgcaatctatctacaatcacctaaatcgcgtcattccctttcggagtgttcgaaaaactcgtcac 3950  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| || |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  3951 aaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtcatcagccctgcaggtttctgatgctcaacttttgacttctgacaaatc 4050  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||| | ||||| ||| || || ||||| | |||||| || |||||||||||||  ||||||||||| || ||||| || ||||  |||   ||||| |    
T  4051 aaacatgaataaataaattgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcgtgatacatcttggtagatcccaaatgaatac 4150  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | |||||||| || | ||||| |||| | | ||| |||| |||| ||||||||| ||  ||||  |||| ||||||||| || |||||    
T  4151 tcaagctacttctatgactctcttccaaaatcatcttcttaatctcatcatcgtcatgaatacaaattcggcctcgaaatctcagcacaccttggtcatc 4250  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    |||| | || ||||||||||||||    
T  4251 aactctaaagtcactatcctcagt 4274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 7519 - 6934
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    ||||||||||||| || ||||| |  || ||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||  |||||||| |||||    
T  7519 gaatgtaaatctccgccaactgagacacgggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagtcgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaatagcgtc 7420  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||||||  | ||     
T  7419 attccctttgggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcaacccaacaggt 7320  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| | |||||| | ||| |||||||  || ||||| | |||||| |  |||||||||||||  ||||| | ||    
T  7319 ttctgatgctccacttttgacttctgacaaaccaaacatgaatatacaaactatgccacatcacgtttcaaccgagaccaccaaaacatcttctttagat 7220  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||| |||  || |||| || |||||||||||     
T  7219 catgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcatcttcttcatttcatcatcgtaaggaatacaaat 7120  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctct 541  Q
    ||||||||  || | || ||| ||||||||||| || || || ||| |||| ||||| | || ||  | |  || ||| || |||||||| | |||  ||    
T  7119 tctacctcaaaaacgcaacactccctgatcatcgaccttaaagtcattatcttcagtctgatcactagcaaccaacaagtccacaaacttaacatcaact 7020  T
Q  542 ttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    ||||| ||||||   |||||||||||||| | |||| |||| |||| |||||| ||||  | ||||| |||||||| ||| |||||    
T  7019 ttctgcgcttctttaatactgttcaagaattcactaacaatcttcatcattcctaacttcacactctaaggtgacacttcgcagac 6934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 663 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 6866 - 6801
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatca 728  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  6866 gtcttcctacttaatgcatctgcaaccacattagctttacctggatgataattcaacccaaaatca 6801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 47 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 39443 - 39014
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||| ||||||| || |  ||| ||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| ||    
T  39443 taaatctctactaactgggcaataggaaaactgatattaattggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattcc 39344  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||| || ||||| |||||    
T  39343 ctctaggagtattcagcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaggataccatcaaaccagcgggtttctg 39244  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||| || || ||||| | |||||| || |||||||| || | |||||||| ||||||     
T  39243 atgttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaattgtgccacatcgcgtttcaatccagaccaccataaaattttcttcagatcatga 39144  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  | ||| |||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| |||||||||||||| || |     
T  39143 tacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgagtctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaaattcgat 39044  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaa 476  Q
    ||| ||||| || |||||| || |||||||    
T  39043 ctcggaatctcaacacaccatggtcatcaa 39014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Original strand, 66088 - 66521
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| ||||  ||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || || | ||||||||| || ||   ||    
T  66088 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactattattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgctcc 66187  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    || | ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |  || |||||||| | |  || ||  || ||  | || ||    
T  66188 ctttaggagtattcggcaagctcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattatggcacatctaaagataccatcataccagcaagtttttg 66287  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||  || |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||     
T  66288 atgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggagtacacaaactgtgccacatcacgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtga 66387  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    |||||||| ||||| ||| | || || ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| |||  ||| ||||||||| ||||  | ||    
T  66388 tacattttcgtagctcccagatggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctacatcgtcaggaatgcaaatccgac 66487  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaacttt 480  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  66488 ctcggaatctcaacacaccgtgatcatcaacttt 66521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 744
Target Start/End: Original strand, 66712 - 66817
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  66712 accatcaaagcggacatatgcaatgtcttcttgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatggtaattcaaaccaaagtcataatctttca 66811  T
Q  739 gtaact 744  Q
    | ||||    
T  66812 gcaact 66817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 487
Target Start/End: Original strand, 8049 - 8489
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| ||||| |||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | ||    
T  8049 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttcc 8148  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  8149 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccggcaggtttctg 8248  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||| || || ||||||||||| |  | ||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  8249 atgctcgactttcgacttctgacaaactagacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 8348  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| |||||||||| ||| |    
T  8349 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctgtgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctggaatacaaattcttc 8448  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatca 487  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||||    
T  8449 ctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatca 8489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 739
Target Start/End: Original strand, 8673 - 8773
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  8673 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 8772  T
Q  739 g 739  Q
    |    
T  8773 g 8773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 498
Target Start/End: Original strand, 7670 - 8073
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  7670 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggatatactat 7769  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  7770 cccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggcttctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactg 7869  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  7870 tgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgataaatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactc 7969  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcct 494  Q
    || |||||||||| |||| | | ||| ||||||||  | ||||||| ||| |||| ||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| || |    
T  7970 tcttcaagaatcatcttcttaatctcttcattgtctaggatacaaattcttcctcggaatctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtctt 8069  T
Q  495 cagt 498  Q
    ||||    
T  8070 cagt 8073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 8246 - 8345
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  8246 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 8345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8715 - 8283
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |  || ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||  ||| |||| |||||    
T  8715 gaatataaatctctaccaactgagaaacaggaaaactgatattaatcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcaccaaaatcgcgtc 8616  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |  || ||  || || ||     
T  8615 attccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggtacatctaaagataccatcattcccgcaggt 8516  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||  || |||||||    
T  8515 ttctgatgctcaactttcgacttctaacaaatcaaacatgaatacacgaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcaaat 8416  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| |  ||||| ||||| || || || || | |||  | ||| |||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| |||| |||||||||     
T  8415 catgatacatctgcgtagctcccggatggatacttaagccacttctatgattctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcatgaatacaaat 8316  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||||||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  8315 tctacctcggaatctcaacacaccttgatcatc 8283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 303
Target Start/End: Original strand, 12172 - 12433
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||||||  | ||||| | ||| ||| ||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  12172 gaatgtaaatctccaccaactgaggtacaggaaaactgatattactcgaaatgaaatgagccgacttcgtcaatccatctacaatcacccaaatcgcgtc 12271  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  12272 attccctttcgaagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaacggtgtcatcaaccctgcaggt 12371  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatc 303  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||||    
T  12372 ttctgatgttcaacctttgacttttgacaaatcaaacaggaatacaccaactgtgccacatc 12433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 33196 - 32763
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || ||  || |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || || | ||||||||| || |||| ||    
T  33196 taaatctctgccaactgggcaacaagaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattcc 33097  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |  || ||  || ||||| |||||    
T  33096 ctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaagataccatcataccagcgggtttctg 32997  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||     
T  32996 atgctcaatctttgacctctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtga 32897  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||||||||||||||  ||| ||| |||  ||| ||||||||| ||||  | ||    
T  32896 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcctcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgac 32797  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaacttt 480  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||| || |||||    
T  32796 ctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgacttt 32763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Original strand, 9279 - 9712
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || || | ||||||||| || |||| ||    
T  9279 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattcc 9378  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  || || |||||||| | |  || |   || ||||| |||||    
T  9379 ctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccgttctggcacatctaaagataccatcttaccagcgggtttctg 9478  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||     
T  9479 atgctcaatctttgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtga 9578  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| |||  ||| ||||||||| ||||  | ||    
T  9579 tacatcttcgtagcacccagatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctacatcgtcaggaatgcaaatccgac 9678  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaacttt 480  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||| || |||||    
T  9679 ctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgacttt 9712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 744
Target Start/End: Original strand, 9903 - 10008
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||    
T  9903 accatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaagcatcggcaaccacattagctttacctggatgataattcaaaccgaagtcataatctttca 10002  T
Q  739 gtaact 744  Q
    | ||||    
T  10003 gcaact 10008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 32572 - 32467
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  32572 accatcaaagtggacatatgcaacgtctttctgctcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 32473  T
Q  739 gtaact 744  Q
    | ||||    
T  32472 gcaact 32467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 6)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 596
Target Start/End: Original strand, 19285 - 19834
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| ||    
T  19285 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaatcggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattcc 19384  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || || |||||    
T  19385 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatctcatttccactctggcacatctaaggataccatcataccagcaggtttctg 19484  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| |  ||||  | |||||| |  |||||||| || | |||||||| ||||||     
T  19485 atgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgtcacattgcgtttcaatctagaccaccagaatattttcttcagatcatga 19584  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || |||||  |||||||||| || |  |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| |||||||||||||| || ||    
T  19585 tacatcttcgtagctgccgggtgaatacttaggctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaaattcgac 19684  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||| ||||| || |||||| || ||||| || || || |||| ||| ||||| | |||||  | |  |  ||| || |||||||| | |||  |||||||    
T  19685 ctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccgacaagtctacaaacttaacatcaactttctg 19784  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattccca 596  Q
     ||||||  |||||| ||||  || | ||||||||| |||||||||||||    
T  19785 tgcttctttgatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattccca 19834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 596
Target Start/End: Original strand, 34709 - 35258
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| ||    
T  34709 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaatcggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattcc 34808  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || || |||||    
T  34809 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatctcatttccactctggcacatctaaggataccatcataccagcaggtttctg 34908  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| |  ||||  | |||||| |  |||||||| || | |||||||| ||||||     
T  34909 atgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgtcacattgcgtttcaatctagaccaccagaatattttcttcagatcatga 35008  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || |||||  |||||||||| || |  |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||  ||||||||||||| || ||    
T  35009 tacatcttcgtagctgccgggtgaatacttaggctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcgac 35108  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctg 546  Q
    ||| ||||| || |||||| || ||||| || || || |||| ||| ||||| | |||||  | |  |  ||| || |||||||| | |||  |||||||    
T  35109 ctcggaatctcaacacaccatggtcatcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactagcaaccgacaagtctacaaacttaacatcaactttctg 35208  T
Q  547 agcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattccca 596  Q
     ||||||  |||||| ||||  || | ||||||||| |||||||||||||    
T  35209 tgcttctttgatactcttcagaaattcactatcaatcttcagcattccca 35258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 498
Target Start/End: Original strand, 50234 - 50566
Alignment:
Q  166 actcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttc 265  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    || ||  || || || |||||||||||||| || ||||||    
T  50234 actcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttc 50333  T
Q  266 tgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccg 365  Q
    || || |||||||| | |||  ||||||| || ||||| | |||||| || ||||| ||||| |  ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||    
T  50334 tggcaaatcaaacaagaatacgcaaactgtgccacatcacgtttcaatccagaccagcaaaataacttctttagatcatggtacatcttcgtagctcccg 50433  T
Q  366 ggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacacc 465  Q
    | ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||  || | ||  |||||    
T  50434 gatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcttctggaatacaaattctacctcgaaacctcaatacacc 50533  T
Q  466 ctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     |||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  50534 ttgatcatcaattttaaaatcactgtcttcagt 50566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 709
Target Start/End: Original strand, 50739 - 50809
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatg 709  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||    
T  50739 accatcatagcggacatgtgcaaagtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatg 50809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 739
Target Start/End: Original strand, 19909 - 20009
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  19909 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctacaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 20008  T
Q  739 g 739  Q
    |    
T  20009 g 20009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 739
Target Start/End: Original strand, 35333 - 35433
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  35333 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctacaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 35432  T
Q  739 g 739  Q
    |    
T  35433 g 35433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 440
Target Start/End: Original strand, 6727 - 7125
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |  || ||| |||| |||||||| ||||  ||||  |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  6727 gaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaataagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtc 6826  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |  || ||  || || ||     
T  6827 attccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactcaggcacatctaacgataccatcataccagcaggt 6926  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||  || || | ||    
T  6927 ttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaagcaagaatacacaaactgtgcaacgtcgcatttcaatccggaccaccaaaacaacttttttagat 7026  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | || ||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  7027 catgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaa 7125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 739
Target Start/End: Original strand, 7368 - 7456
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcag 739  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  |||||||| ||||||||||    
T  7368 gacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcataatccttcag 7456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 3608 - 3538
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatg 709  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||    
T  3608 accatcatagcggacatatgcaaagtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatg 3538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 127 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5134 - 4855
Alignment:
Q  127 tacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtc 226  Q
    ||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||    
T  5134 tacccaaatcgcatcatgtcctctttgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat-gatatactatcccacttccactctggaatatctaaaggtgtc 5036  T
Q  227 aacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaa 326  Q
    |||||||| |  |  || ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||    
T  5035 aacaacccagaagttttgtgatgttcaaccttcgacttctgacaaattaaacatgcatacacaaattgtgcaacatctcgctttaacccggaccaccaaa 4936  T
Q  327 acagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 407  Q
    | |  ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||  ||||||| || || |||||||    
T  4935 ataacttcttcaaatcgtgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttctgtgactttcttccagaatca 4855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 498
Target Start/End: Original strand, 374 - 830
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  || |||  ||||||||||||  |||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  374 gaatataaatctctgccaactgagaaacaggaagactgatattaatcagaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtc 473  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| || || |||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    || ||  || |||||     
T  474 attccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaattcatgggtatactatcccatttccactctggcacatctaaagacaccatcataccagcgggt 573  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||||||   |||||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  574 ttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaattgtgcaacatcgtgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaat 673  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||  ||||  ||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| || | ||| |||||| |||     
T  674 catgatacatcttcgtagctcccggatgaataatcaagttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcgtcgtctggaatagaaat 773  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     |||||||  || | || |||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  774 cctacctcgaaacctcaacacagcttgatcatcgattttaaaatcactatcctcagt 830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 688
Target Start/End: Original strand, 1003 - 1052
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctac 688  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1003 accatcatagcggacatatgcaaggtcttcctacttaaagcatctgctac 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 130 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 3997 - 3637
Alignment:
Q  130 ccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaac 229  Q
    |||||| | ||||| |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| | |  || |    
T  3997 ccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggaacatctaaagataccatc 3898  T
Q  230 aaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaaca 329  Q
    | |||  | || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || ||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  3897 atcccaacaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaattaaacaggaatacacaaattgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaaaaca 3798  T
Q  330 gtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtc 429  Q
      ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| |||  ||| ||| |||  |||    
T  3797 acttcttcagatcatgatacattttcgtagctcccagatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatctttttcatctcatcaccgtc 3698  T
Q  430 aggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcacta 490  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || | |||| ||| |||| | ||| |||||||||    
T  3697 aggaatacaaattctacctcggaatctcaacgcaccttgagcatcgattttaaaatcacta 3637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 28905 - 28544
Alignment:
Q  137 gcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctg 236  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || |    
T  28905 gcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccag 28806  T
Q  237 cgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttctt 336  Q
    |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||  | ||| || | || |  |||||    
T  28805 cgggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaatacagacaactataaaatcttctt 28706  T
Q  337 caaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaata 436  Q
       |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| |||||||  ||| || |||||||    
T  28705 tggatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcaactctacatcgtaaggaata 28606  T
Q  437 caaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||||  | ||||| ||| | || |||||| || ||||| ||||| || |||| ||| |||||    
T  28605 caaatccgacctcggaaactcaacacaccatggtcatcgactttaaagtcaccatcttcagt 28544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 378
Target Start/End: Original strand, 59513 - 59769
Alignment:
Q  122 acaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacg 221  Q
    |||| ||||||||| || ||||| ||| | ||||| || || ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | | |||||| |    
T  59513 acaattacccaaatcgcatcatgtccttttggagtatttggcaaaatcgtcacaaaatccatggatatactatcccacttccactctcgaatatctaaag 59612  T
Q  222 gtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggacca 321  Q
    ||||||||||||| |  || ||||| || ||| | ||  |||||||||| || ||||| |||||  |||| || || |||| ||  ||||| ||||||||    
T  59613 gtgtcaacaacccagtaggtttctggtgttcatcttttaacttctgacaaattaaacacgcatacccaaattgtgccacatgtcgcttcaacccggacca 59712  T
Q  322 ccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaa 378  Q
    |||||| |  ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  59713 ccaaaataacttcttaaaatcttgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaa 59769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 498
Target Start/End: Original strand, 130985 - 131241
Alignment:
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||  ||||| || | |||||| || |||||||||||||  ||||| | ||    
T  130985 ttctgatgcttaaccatcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactttgcaacgtcgcgtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagat 131084  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||  | ||  | || ||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||     
T  131085 catgatacctcttcgtagctcccggatgaatactcaagttgcttctatggctctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaat 131184  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     | |||||  || | ||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  131185 ccgacctcgaaacctcagtacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 131241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 88; Significance: 7e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 380 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 2144 - 1889
Alignment:
Q  380 ctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactt 479  Q
    |||||||||||||| | ||| | |||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| | || |||||||||||||| ||| |    
T  2144 ctactcttgtgacttttctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatacaaattcttcctcggaacctcaacacaccctgatcattaacct 2045  T
Q  480 tgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatc 579  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||| | |||  |||  || ||||||| |||| |||||||||| | |||||     
T  2044 tgaagtcactatcttcagtttcattactagcaatcatcaaatcaacaaacttgacatcaacttgttgtgcttctctgatattgttcaagaaatcactatt 1945  T
Q  580 aattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1944 aatcttcagcatccccaactttacactctgaggtgtcaactcacagacaagactca 1889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 651 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 1841 - 1729
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||  | ||    
T  1841 gacatgtgcaacgtcttcctactcaaggcatctgcaaccacatttgctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttcaacaactcaagcc 1742  T
Q  751 acctcctctgcct 763  Q
    | |||||||||||    
T  1741 atctcctctgcct 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 88; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 190 - 453
Target Start/End: Original strand, 34014 - 34277
Alignment:
Q  190 actatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaaca 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||| |    
T  34014 actatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggattctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcataaaaa 34113  T
Q  290 aactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgt 389  Q
    || ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  34114 aattgagcaacatcacgcttcaaaccagaccaccaaaaaagctttttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctgctcttgt 34213  T
Q  390 gactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaa 453  Q
    |||| || || | ||||||| |  | | ||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  34214 gactttcttccaaaatcaacctttttatctcatcgttgtcaggaatgcaaattctgcctctgaa 34277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4028 - 3595
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || || | ||||||||| || |||| ||    
T  4028 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattcc 3929  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  || || |||||||| | |  || |   || ||||| |||||    
T  3928 ctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccgttctggcacatctaaagataccatcttaccagcgggtttctg 3829  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||     
T  3828 atgctcaatctttgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtga 3729  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| |||  ||| ||||||||| ||||  | ||    
T  3728 tacatcttcgtagcacccagatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctacatcgtcaggaatgcaaatccgac 3629  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaacttt 480  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||| || |||||    
T  3628 ctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgacttt 3595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 3404 - 3299
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||    
T  3404 accatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaagcatcggcaaccacattagctttacctggatgataattcaaaccgaagtcataatctttca 3305  T
Q  739 gtaact 744  Q
    | ||||    
T  3304 gcaact 3299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 19630 - 19198
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |  || ||| |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||     
T  19630 gaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtt 19531  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| || |  | |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |  |||||   | || ||     
T  19530 attccctttaggagtatttgtcatactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggaacatctaacgataccaacatatcagcaggt 19431  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||| || | |||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  19430 ttctgatgctcaatcttcgacttctggcaaatcaaacaagcatacacaaaccgtgcaacgtcgcgtttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagat 19331  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | || ||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||     
T  19330 catgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaat 19231  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
     | |||||  || | ||||||||| ||||||||    
T  19230 ccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatc 19198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14574 - 14407
Alignment:
Q  307 tttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatc 406  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | || ||||| |||||||||    
T  14574 tttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaagaatc 14475  T
Q  407 aacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |  ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  | |||||  || | ||||||||| ||||||||    
T  14474 attttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaatccgacctcgaaacctcagcacaccttgatcatc 14407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 651 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 14198 - 14110
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcag 739  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  |||||||| ||||||||||    
T  14198 gacatatgcatggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcataatccttcag 14110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 380 - 635
Target Start/End: Original strand, 17 - 272
Alignment:
Q  380 ctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactt 479  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||| || ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| |    
T  17 ctactcttgtgactttcctctaaaatcaactttttcaaatcatcattatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaacct 116  T
Q  480 tgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatc 579  Q
    | || |||||||||||| |  ||||||| | |   ||||||||||||||||| | |||  ||| ||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||     
T  117 taaagtcactatcctcaataacattaccagcaacaatcaaatcaacaaacttaacatctacttgctgtgcttctcggatactattcaggaaatcactatt 216  T
Q  580 aattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    |||||||| ||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  217 aattttcaacatcccaaactgaacactctgaggtgtcaactcacagacaagactca 272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Original strand, 320 - 437
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||  | || |||||    
T  320 gacatatgcaacgtcttcctgctcaacgcatctgctaccacattggctttacctggatggtaattcaaacaaaaatcataatccttcaacagctctaacc 419  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  420 atctcctctgcctcatgt 437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 498
Target Start/End: Original strand, 6745 - 7148
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||| | |||||  |||  |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  6745 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctataggagtaatcgacaaactcgtcacaaaatccatggatatactat 6844  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  6845 cccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaaccttcgacttatgacaaatcaaacaagaatacacaaactg 6944  T
Q  295 agcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactc 394  Q
     ||||| || | |||||| || ||||||||||| |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||    
T  6945 tgcaacgtcgcgtttcaatccagaccaccaaaatatcttctttagatcatgatacatcttcatagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactc 7044  T
Q  395 tcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcct 494  Q
    || ||||||||||  ||| ||| ||| ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||  | ||||| ||||| ||||||| ||| |    
T  7045 tcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattcgacctcggaatctcaacacaccaaggtcatcgactttaaaatcaccatctt 7144  T
Q  495 cagt 498  Q
    ||||    
T  7145 cagt 7148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 83; Significance: 7e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 173 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 18709 - 18258
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaga 272  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || |||||  ||| |||||| ||||||| |||| |||| || |||||||||||||| || |||||  |||| |    
T  18709 acaaaatccatggatatgctatcccattttcactctagtatatctaaaggtgtcatcaacgctgcaggtttctgatgctcaacttttgactttggacaaa 18610  T
Q  273 tcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccg-gaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaa 371  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || ||||| |     |||||  |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||||    
T  18609 tcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgca----aaaccaagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccaggtgaa 18514  T
Q  372 tgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatc 471  Q
    | ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| |||||||||||||| |||   ||  || | || ||| ||||||||    
T  18513 tactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaattctgaatcgaaaacgcaacactccctgatc 18414  T
Q  472 atcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaag 571  Q
    ||| | ||| ||||||| ||| ||||| | |||||  |||  || ||| || |||||||| | |||   |||||| |||| |  |||||| ||||||||     
T  18413 atcgattttaaaatcacaatcttcagtctgattactagaaaccaacaagtccacaaacttaacatcaattttctgcgcttttgtgatactattcaagaat 18314  T
Q  572 ttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    | ||||||||| || |||||||||| ||  | |||||||||||||||||| |||||    
T  18313 tcactatcaatctttagcattcccagcttcacactctgaggtgacaattcgcagac 18258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 18214 - 18115
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||| | ||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18214 accatcatagcggacatatgcaacgtcttcctacttaaggcatctgcaacaacattagctttacctgaatgataattcaacccaaaatcacaatccttca 18115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18833 - 18732
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||| || || ||||| | |||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  18833 gaatgtaaatttccgccaactgagatacaagaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtc 18734  T
Q  142 at 143  Q
    ||    
T  18733 at 18732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 83; Significance: 7e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 63654 - 63252
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| || |  ||||| |||||| ||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| ||    
T  63654 taaatctctgccaactgagcaacaggaaaactgatattaatcggtagaaaatgagccgacgtcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattcc 63555  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || || ||||     
T  63554 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgcatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctt 63455  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||| | | |||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||| || |  ||||| | ||| ||     
T  63454 atgttcaatcttcgacttctgacaaacctaacaggaatacacaaactgcgccacatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttctttagatcgtga 63355  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||||||||| |||| || ||    
T  63354 tacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcgtcaggaattcaaattcgac 63255  T
Q  447 ctc 449  Q
    |||    
T  63254 ctc 63252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 633 - 738
Target Start/End: Original strand, 108931 - 109036
Alignment:
Q  633 tcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaat 732  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  108931 tcatttaccatcatagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatctacaaccacattagctttacccggatgttaattcaaaccaaaatcataat 109030  T
Q  733 ccttca 738  Q
    ||||||    
T  109031 ccttca 109036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 593 - 635
Target Start/End: Original strand, 108859 - 108901
Alignment:
Q  593 cccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  108859 cccaactgtacgctctgaggtgacaactcacagacaagactca 108901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 412
Target Start/End: Original strand, 1097 - 1462
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| ||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||  || ||||  |||||||| | |||   ||    
T  1097 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaattgtgtcgctcc 1196  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
     ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || || ||| ||||| |||||    
T  1197 atctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcatcccagcgggtttctg 1296  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||| | || || ||||||||||| |  ||||||| ||| | |||||  || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||||||     
T  1297 atgcccgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacataaactatgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatga 1396  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttc 412  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||||| ||||    
T  1397 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcatcttc 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 627
Target Start/End: Original strand, 102111 - 102496
Alignment:
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| |  |||||   |||||| || |||||||||||||  || |||| ||    
T  102111 ttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaataggaatacacaaactgtgacacatcatgtttcaacccagaccaccaaaacaactttttcagat 102210  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||     
T  102211 catgatacattttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcctcatcgtcaggaatacaaat 102310  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctct 541  Q
    |||||||| ||||| || |||||| || ||||| | ||| ||||||||||  ||||| |||||||    |  || |||||| |||||||| | |||  ||    
T  102311 tctacctcggaatctcaacacaccttggtcatcgattttaaaatcactattttcagtctcattactatcaaccaacaaatctacaaacttaacatcgact 102410  T
Q  542 ttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    ||||| ||||||   ||||| ||||  || | ||||||||| ||||||||| | | ||  | |||||||| |||||||||||||||    
T  102411 ttctgcgcttctttaatacttttcagaaattcactatcaatcttcagcatttctagcttcacactctgagatgacaattcacagac 102496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 22550 - 22910
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || |  ||||  || ||||||||||| |  || || | ||||||||| ||||| | ||    
T  22550 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaataagcagacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgtccc 22649  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |  |||||||  | |  || ||  || || || |||||    
T  22650 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattcagacacatctagagataccatcataccagcaggtttctg 22749  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||     
T  22750 atgctcaatctttgacttctgacaaactaaacaggaatatacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccaaaaaattttctttaaatcgtga 22849  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 407  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||    
T  22850 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttatatgactctcttcaagaatca 22910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 86110 - 85823
Alignment:
Q  78 tgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaa 177  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||  |  || |||| ||||||||| || | ||| ||| | ||||| |||||  ||||||| |||||    
T  86110 tgatgttaattggaataaaatgggccgacttcatcagtctatccacaattacccaaatcgcattatgtccttttggagtattcggacaactcgtcacaaa 86011  T
Q  178 atccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaa 277  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  86010 atccatggatatattatcccacttccactttggaacatctaaaggtgtcaacaacccagcaggtttctgatgttcaactttcgacttctgacaaattaaa 85911  T
Q  278 caggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgg 366  Q
    || ||||  ||||| || || |||||||  ||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  85910 cacgcatgcacaaattgtgccacatctcgcttcaacccggaccacc-aaataacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccgg 85823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 498
Target Start/End: Original strand, 1387 - 1810
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||| |||||||| ||||| |  || ||||  |||||||| || |||| |||| | ||||| ||||| ||| |||| ||    
T  1387 aactgatactaatcggaagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcatcattccctttaggagtattcggcaaagtcgtcac 1486  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||   |  || ||  || || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  1487 aaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaatataccatcataccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatc 1586  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||| | ||| |||||| | |||||||| |  ||||| || ||||| |||||||   ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  1587 aaacaagaatacacaaaccgtgcaacatcacgcttcaatccagaccatcaaaacaacatcttcaaatcatggtgcatcttcgtagctcccggatgaatac 1686  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||    |||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||| |||  |||||||||  || ||||| |||| || |||||| ||||| ||    
T  1687 tcaaactacttcaatgactctcttcaagaatcatcttcttcatctcatcatcgtctagaatacaaatccttcctctaaatctcaacacaccttgatcgtc 1786  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     | ||| |||||||| || |||||    
T  1787 gattttaaaatcactgtcttcagt 1810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 3409 - 2986
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| || |  ||||| |||||||| ||||| |  || ||||  ||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  3409 aactgatattaatcggtagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcccgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcac 3310  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| | |  || ||  || ||||| |||||| | |||  ||| ||||||||||| | |    
T  3309 aaaatccatggatatactatctcatttccactctggcacatctaaggataccatcataccagcgggtttctgacgttcagtcttcgacttctgacaaacc 3210  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||| | | | |||||||| || ||||| | |||| | || |||||||| || | |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  3209 aaacaagaacacacaaactgtgccacatcgcgtttcgatccagaccaccagaaaattttcttcagatcatgatacattttcgtagctcccgggtgaatac 3110  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatc 474  Q
    |||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| |||  ||| ||||||||||||||  | ||||| ||| | || |||||| || |||||    
T  3109 tcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctacatcgtcaggaatacaaatccgacctcggaacctcaacacaccatggtcatc 3010  T
Q  475 aactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     ||||| || |||| ||| |||||    
T  3009 gactttaaagtcaccatcttcagt 2986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 1571 - 1239
Alignment:
Q  166 actcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttc 265  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||||| || || |||||||| | |  || ||  || || || |||||||||||||| || ||||||    
T  1571 actcgtcacaaaatccatggatatattatcccatttccattctggcacatctaaagataccatcattcccgcaggtttctgatgctcaactttcgacttc 1472  T
Q  266 tgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccg 365  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||| || || ||||||||||  || |||| |||||| || || || ||||| ||||    
T  1471 tgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagatcaccaaaacaactttttcagatcatgatatatcttcgtagctcccg 1372  T
Q  366 ggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacacc 465  Q
    | ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||  ||||  ||| ||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  1371 gatgaatactcaagctactcctatgactctcttcaaatatcattttcttcatctcatcatcgtcaggaatacaaattctacctcggaatctcaacacacc 1272  T
Q  466 ctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
     |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  1271 ttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 1239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 440
Target Start/End: Original strand, 3090 - 3450
Alignment:
Q  80 atattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaat 179  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |  || ||||  |||||||| | ||||| |||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  3090 atattaatcggaagaaaatgagccgaattcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaat 3189  T
Q  180 ccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaaca 279  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    || ||  || || || |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  3190 ccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcaatttctgacaaatcaaaca 3289  T
Q  280 ggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaac 379  Q
     | ||| |||||||| |||||||| | |||||| || |||||||| ||||  ||||| | ||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||     
T  3290 agaatacacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccagaacaacttctttagatcgtggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaag 3389  T
Q  380 ctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
     ||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  3390 ttacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcctcatcgtctggaatacaaa 3450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16011 - 15742
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||||  ||| | ||||| || || |||||||| ||    
T  16011 aactgatattaatcggaataaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttcctttaggagtattaggcaaactcgtcac 15912  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||| || ||||||||||||       |||| ||||| |||    
T  15911 aaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcatcgctgcaggtttctgatgctca-------acttttgacaaatc 15819  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacat 351  Q
    ||||||| ||| |||||||| || |||||   |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  15818 aaacaggaatacacaaactgtgccacatcatgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacat 15742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 651 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 1821 - 1704
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  1821 gacatatgcaatgttttcctgctcaatgcatcagcaaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcgtaatccttcagtaactataacc 1722  T
Q  751 acctcctctgcctgatgt 768  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  1721 atctcctctgcctcatgt 1704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 574 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 1930 - 1869
Alignment:
Q  574 actatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1930 actatcaatcttcagcatccccaactatatactctgaggtgacagttcacagacaagactca 1869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 198
Target Start/End: Original strand, 49449 - 49606
Alignment:
Q  41 tgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgt 140  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||| || ||||| || |  |    
T  49449 tgaatataaatctccgccaactgagctaccggttaactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccacaacccatatagaat 49548  T
Q  141 catgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatccca 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  49549 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgccacaaaatccatagaaatgctatccca 49606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 366
Target Start/End: Original strand, 2145 - 2469
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  || ||| ||||||||||||  ||||  ||||| | |||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  2145 gaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaagcggaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtc 2244  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| |    || ||  || || ||     
T  2245 attccctttaggagtattcgacaaactcgttacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggcacttctaaagacaccatcataccagcaggt 2344  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||||| ||    
T  2345 ttctgatgctcaaccttcgacttttgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgccacatcccgttttaatccagaccaccaaaatagtttcttcagat 2444  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgg 366  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||    
T  2445 catgatacatcttcgtagctcccgg 2469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 7898 - 7503
Alignment:
Q  103 cgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttc 202  Q
    |||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| | |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||    
T  7898 cgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtctttccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatctcatttc 7799  T
Q  203 cactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacat 302  Q
    || |  || |||||||| | |  || ||  || || || |||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |    
T  7798 cattttggcacatctaatgataccatcataccagcaggtttctgatgttcaaccttcgacttctaacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacgt 7699  T
Q  303 ctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaag 402  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | || ||||| |||||    
T  7698 cgcgtttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatggctctcttcaag 7599  T
Q  403 aatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    |||||  ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||  |||||||  || | ||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  7598 aatcattttcttcatctcatcatcgtcgggaatacaaatcctacctcgaaacctcagtacaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 7503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 657 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 7312 - 7230
Alignment:
Q  657 tgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcag 739  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  |||||||| ||||||||||    
T  7312 tgcaaggtcttcctactcaaagcgtctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcataatccttcag 7230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 5)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 197101 - 196650
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || |  |||||||| ||||||||||| |  || ||||  | |||||| ||||||| ||    
T  197101 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgtgctgacttcgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattcc 197002  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||| || | |||||| | |  || ||   | | ||| |||||    
T  197001 ctctaggagtattcggctaactcgtcacaaaatccatggatatattatcccatttcgactctggcatatctaaagataccatcatatcagtgggtttctg 196902  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| | |||||| | ||| |||||||  || ||||||| |||||| || |||||||| || |  ||||| | ||||||     
T  196901 atgctcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagaatacacaaactatgccacatctcgtttcaatccagaccaccataaaatcttctttagatcatga 196802  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | || ||||||||||||||||  ||| ||| |||  ||| ||||||||| ||||  | ||    
T  196801 tacatcttcgtagctcccggttgaatactcaagctacttctatggctctcctcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatacgac 196702  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||| ||||| || |||||  || ||||||||||| || |||| ||| |||||    
T  196701 ctcggaatctcaacacacgatggtcatcaactttaaagtcaccatcttcagt 196650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 480
Target Start/End: Original strand, 56895 - 57133
Alignment:
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||| || || ||||| | ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||    
T  56895 ttctgatgctcaattttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaattgtgccacatcacgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaat 56994  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    | || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| |||  ||| |||||||||  |||     
T  56995 cgtgatacatcttcgtagctcccgggtggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgtaaat 57094  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaacttt 480  Q
     | ||||| ||||| || |||||| ||||| || |||||    
T  57095 ccgacctcggaatctcaacacaccgtgatcgtcgacttt 57133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 19477 - 19239
Alignment:
Q  260 gacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtag 359  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||| || |  ||||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  19477 gacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgctacatcacgtttcaatccagaccaccagaagatcttctttaaaccatgatacatctttgtag 19378  T
Q  360 cccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacag 459  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||  ||||||||||  ||| ||| |||  ||| ||||||||| ||||  | ||||| ||| | ||     
T  19377 ctcccggatgaatactcaagctacttatatgactctattcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccgacctcggaacctcaa 19278  T
Q  460 cacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    | |||| || ||||||||||| || |||| ||| |||||    
T  19277 cgcaccatggtcatcaactttaaagtcaccatcttcagt 19239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 196477 - 196378
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  196477 accatcaaagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcgtccgcgacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 196378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 57324 - 57423
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  57324 accataaaagcggacatatgcaatgtcttcctgctcaaagcatctacaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 57423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 627
Target Start/End: Original strand, 13249 - 13731
Alignment:
Q  145 ccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttc 244  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |  || ||  || || || |||    
T  13249 ccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttc 13348  T
Q  245 tgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcat 344  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| |    
T  13349 tgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacatttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgt 13448  T
Q  345 ggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactct 444  Q
    | ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| |||  ||| ||||||||| ||||  |     
T  13449 gatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctctgcatcgtcaggaatgcaaatccg 13548  T
Q  445 acctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttc 544  Q
    ||||| ||||| || ||| || || ||||| ||||| || ||||  ||  |||| | |||||  | |  || ||| || |||||||| | ||    ||||    
T  13549 acctcggaatctcaacacgccgtggtcatcgactttaaagtcaccgtctccagtctgattactagcatccaacaagtccacaaacttaacattaattttc 13648  T
Q  545 tgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagac 627  Q
    || ||||||  ||||||||||||||| | |||||| || || |||||||| | ||  | |||||||||||||||||| |||||    
T  13649 tgcgcttctttgatactgttcaagaattcactatcgatctttagcattcctagcttcacactctgaggtgacaattcgcagac 13731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 403 - 635
Target Start/End: Original strand, 17 - 249
Alignment:
Q  403 aatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtca 502  Q
    |||||||||  ||||||| || || |||||||| |||| ||| |||||||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||| | |    
T  17 aatcaactttttcaactcatcgttatcaggaatgcaaattcttcctctgaacctcaacaccccctgatcatcaaccttgaaatcaccctcttcagtttga 116  T
Q  503 ttacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgta 602  Q
    ||||  | |  ||| |||||||||||||| | |||  ||| ||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  117 ttactagcaaccattaaatcaacaaacttgacatcaacttgctgtgcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgta 216  T
Q  603 tactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  217 cactctgaggtgacaactcacaaacaaggctca 249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 297 - 384
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  297 gacatatgcaacgtcttcctgctcaaagcatctgcaaccatattagctttacccggatggtaattcaaaccaaaatcataatccttca 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 487
Target Start/End: Original strand, 8080 - 8520
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||||||| | || ||  || |||| |||||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||  || ||||| |||||||| ||||| | ||    
T  8080 taaatctctgctaacagggcaacaagaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcatcaacctatcaacaacaacccaaattgcgtcgttcc 8179  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||  | || |||||||| |||  || ||     ||  | |||||    
T  8180 ctctaggagtattcggaaaacttgtcacaaaatccattgatatactatcccatttccatactggcacatctaaaggtaccatcattttagcatgtttctg 8279  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||| || || ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || |  ||||| ||||| ||     
T  8280 atgctcgactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatttcttttgaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtga 8379  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | |||  ||||||| |||||||||| ||| |    
T  8380 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgactctcttcaagaatcatcttcgtaatctctccattgtctggaatacaaattcttc 8479  T
Q  447 ctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatca 487  Q
    ||  ||||| || |||||| ||| |||| | ||| ||||||    
T  8480 cttggaatctcaacacaccttgaccatcgattttaaaatca 8520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 637 - 738
Target Start/End: Original strand, 8702 - 8803
Alignment:
Q  637 tcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  8702 tcaccatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatcctt 8801  T
Q  737 ca 738  Q
    ||    
T  8802 ca 8803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 492
Target Start/End: Original strand, 16333 - 16782
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |  || ||| |||||||||||||  |||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| || ||    
T  16333 gaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaatcagaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcatc 16432  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||  | ||||| || || |||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| || |||||||| |    || ||  || || ||     
T  16433 attcccattaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatcgatggatatactatcgcatttccactctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggt 16532  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaat 341  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||| || ||||||||||| |  || || | ||    
T  16533 ttctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaaaataacttttttagat 16632  T
Q  342 catggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaac 441  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| |||  ||| ||| ||||| ||||     
T  16633 catgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctc-acatcgtctggaatgcaaat 16731  T
Q  442 tctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatc 492  Q
    ||||||||  || | ||  ||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  16732 tctacctcgaaacctcaagacaccttgatcatcgattttaaaatcactatc 16782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 16973 - 17060
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  |||||||| |||| ||||    
T  16973 gacatatgcaatgtcttcctactcaaagcatctgctacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcataatctttca 17060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 66; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 289 - 4
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||| | ||||| || || |||||||| ||    
T  289 aactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtatttggcaaactcgtcac 190  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |  || ||  || || || ||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  189 aaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaatgataccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatc 90  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagc 360  Q
    ||| | | ||| |||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||||| |  ||||| | |||||| ||||| || |||||    
T  89 aaataagaatacacaaactgtgcaacgtcgcgtttcaatccggaccaccaaaataacttctttagatcatgatacatcttcgtagc 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 26353 - 26116
Alignment:
Q  261 acttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagc 360  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||| || ||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  26353 acttctgacaaatcaaacaagaatatacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaataactttttcaaatcatgatacatcttcgtagc 26254  T
Q  361 ccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagc 460  Q
     ||||| ||||| ||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||  |||| || |    
T  26253 tcccggatgaatactcaagctatttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcatcatcgtctggaatacaaattctacctcgaaatctcaac 26154  T
Q  461 acaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  26153 acaccttgatcatcgattttaaaatcactgtcttcagt 26116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 789 - 886
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   ||||||||| |||||    
T  789 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcaacaacaacattagccttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaattcctt 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39639 - 39354
Alignment:
Q  42 gaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtc 141  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  || ||| |||||||| |||| | ||  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| |||||    
T  39639 gaatgtaaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatactaatcgaaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtc 39540  T
Q  142 atgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggc 241  Q
    || |||| | ||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| |    || ||  || || ||     
T  39539 attccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatctcatttccactctggcacatctaaagacaccatcataccagcaggt 39440  T
Q  242 ttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaa 327  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| |||||| | ||||||||   |||||| || |||||||||||    
T  39439 ttctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaaccgtgcaacatcgtgtttcaatccagaccaccaaaa 39354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 487
Target Start/End: Original strand, 1660 - 2016
Alignment:
Q  131 caaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaaca 230  Q
    ||||| ||||||| |||| | ||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| |    || ||    
T  1660 caaatcgcgtcattccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccacttccactctggcacatctaaagacaccatca 1759  T
Q  231 accctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacag 330  Q
      || |  || || |||| |||||| || ||||||||||| |||||||  | ||| ||||| || || ||||| | |||||| |  || |||||||| |     
T  1760 ttccagtaggtttttgatcctcaactttcgacttctgacaaatcaaaccagaatacacaaattgtgccacatcacgtttcaacctagatcaccaaaataa 1859  T
Q  331 tttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtca 430  Q
     || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| |  ||||||| |||| ||| ||| |||| |||     
T  1860 ctttttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctctttgagaatcatcttcttcatctcctcatcgtct 1959  T
Q  431 ggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatca 487  Q
     ||||||||| |||||||| |||||  | |||||| |||||||| | ||| ||||||    
T  1960 agaatacaaattctacctcggaatctgaacacaccttgatcatcgattttaaaatca 2016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 498
Target Start/End: Original strand, 2029 - 2403
Alignment:
Q  128 acccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtca 227  Q
    |||||||| ||||||| |||| |  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    ||    
T  2029 acccaaatcgcgtcattccctttaagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagacacca 2128  T
Q  228 acaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaa 327  Q
     ||  || || || |||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| ||||| || | |||||| || |||||||||||    
T  2129 tcataccagcaggtttctgacgctcatccttcgacttctgacaaataaaacaagaatacacaaactgtgcaacgtcgcatttcaatccagaccaccaaaa 2228  T
Q  328 cagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctac-tct---tgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtc 423  Q
    ||  ||||| | |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| |||||  ||| |||   | |||||||  ||||||||||  ||| ||| ||||||    
T  2229 caacttctttagatcatgctacatcttcggagctcccggatgaatactcaagttacttctatatatgactctattcaagaatcattttcttcatctcgtc 2328  T
Q  424 attgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    || ||| |||| |||||  |||||||  || | || |||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  2329 atcgtctggaagacaaatcctacctcgaaacctcaacacaccttgatcatcgattttaaaatcactatcttcagt 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 739
Target Start/End: Original strand, 2588 - 2676
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcag 739  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  ||||||||||||| |||||    
T  2588 gacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcaaaatcattcag 2676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 651 - 739
Target Start/End: Original strand, 85 - 173
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcag 739  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||  ||||  |||||||| | ||||||||    
T  85 gacatatgcaaggtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacccggatgatagctcaactcaaaatcatagtccttcag 173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 8473 - 8833
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || |  ||| |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || || | | ||||||| || || | ||    
T  8473 taaatctctgccaactgggcaataggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattgcccaaattgcatcgttcc 8572  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| | |  || ||  || || || |||||    
T  8573 ctctctgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctg 8672  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |  || |||| ||| |||||||  || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||||| |      
T  8673 atgctcaatctttgacttctgacaaactaagcaggaatacacaaactttgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatcgtca 8772  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatca 407  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||    
T  8773 tacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatca 8833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 596
Target Start/End: Original strand, 3003 - 3426
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaga 272  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || || |||||||| |||| | | ||||||||||| |    
T  3003 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcgtcgacttctgacaaa 3102  T
Q  273 tcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaat 372  Q
     |||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||| || |||||||| || |  ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  3103 ccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccaggtgaat 3202  T
Q  373 gctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatca 472  Q
     ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||  ||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||| || |||    
T  3203 actcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaattaaacctcggaatctcaacacaccatggtca 3302  T
Q  473 tcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagt 572  Q
    || || || || |||| ||| ||||| | |||||  | |  || ||| || |||||||| | |||  ||||||| |||||   |||| | ||||  || |    
T  3303 tcgaccttaaagtcaccatcttcagtctgattactggcaaccaacaagtctacaaacttgacatcaactttctgtgcttccttgatagttttcagaaatt 3402  T
Q  573 tactatcaattttcagcattccca 596  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  3403 tactatcaatcttcagcattccca 3426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 446 - 28
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| ||||||||| |||| |  || || |  |||||||| ||||||| |     
T  446 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcatcaatctatcaactatcacccaaatcgcgtcattct 347  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  |  || || || ||    
T  346 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaactccatggatatactgtcccatttccactctggcacatctaaggataccatcatactagcaggtttgtg 247  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||| ||| || |||||||| |  ||||||| ||| | ||| || || | ||| | ||||||||| |||||| | || | |||||||| ||||||     
T  246 atgttcaatcttcgatttctgacaaactaaacaggaatacaaaaattgtgccatatcgcgtttcaaaccagaccactagaaaattttcttcagatcatga 147  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctac 446  Q
     |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||||||| |||||||| |  ||| ||| ||| |||| |||||||||||||| || ||    
T  146 aacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaattattttcttcatctcttcatcgtcaggaatacaaattcgac 47  T
Q  447 ctctgaatcacagcacacc 465  Q
    ||| ||||| || ||||||    
T  46 ctcggaatctcaacacacc 28  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 405
Target Start/End: Original strand, 25657 - 26015
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||| ||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| | ||||| ||    
T  25657 taaatctttgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattcc 25756  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||   |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||| |  || ||  |  || || |||||    
T  25757 ctccatgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaacgataccatcatacaagcaggtttctg 25856  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||| ||| ||| |||||||| || ||||||| |||||| || |||||||| || |   |||||| ||||||     
T  25857 atgttcaatcttcgacttgtgacaaactaaataggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaatccagaccaccagaaaatcatcttcagatcatga 25956  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaat 405  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||    
T  25957 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaat 26015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 26281 - 26380
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  26281 accatcatagcggacatatgcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 26380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 80117 - 79724
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| ||||||||| |||| |  |   |||  |||||||| ||||||| ||    
T  80117 taaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcatcaatctattatcaataacccaaattgcgtcattcc 80018  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||| || || |||||||||| |  || ||  || || || |||||    
T  80017 ctctaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccgtggatatactatcccatttccattctggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttctg 79918  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgg 346  Q
    ||| || | ||| ||||| ||||| |  |||||   ||| |||||||| || ||||||| |||||| || |||||||| || |  ||||| | ||||||     
T  79917 atgttcgatcttcgacttatgacaaaataaacacaaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttagatcatga 79818  T
Q  347 tacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaa 440  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  79817 tacatcttcgtagctcccggttgaatactcaagctacttctatgactctcttcaagaatcattttcttcatctcttcatcatcaggaatacaaa 79724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 548 - 635
Target Start/End: Original strand, 15296 - 15383
Alignment:
Q  548 gcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15296 gcttctctgatactattcaagaaatcactattaatcttcagcatacccaactgtacactctgaggtgacaactcacagacaagactca 15383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 738
Target Start/End: Original strand, 15431 - 15518
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15431 gacatatgcaacctcttcctgctcaaagcatctgcaaccacattagctttacccagatggtaattcaacccaaaatcataatccttca 15518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 651 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 8848 - 8763
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  8848 gacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagccttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 8763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 116
Alignment:
Q  278 caggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctca 377  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  326 caggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactca 227  T
Q  378 acctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaac 477  Q
    | |||||  | |||||||| |||||||||| |||| | | ||| || ||||| |||||||||| ||| |||| ||||| || ||| || | |||||| |     
T  226 agctacttctatgactctcttcaagaatcatcttcttaatctcttcgttgtctggaatacaaattctccctcggaatctcaacacgccttcatcatcgat 127  T
Q  478 tttgaaatcac 488  Q
    ||| |||||||    
T  126 tttaaaatcac 116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 312
Target Start/End: Original strand, 24209 - 24446
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||| | | ||| ||||  |||||| | ||    
T  24209 aactgatattaatcggtaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctatagaagtattcgacaaactcatcac 24308  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |  || ||  || || || |||||||| |||| | | ||||||||||| | |    
T  24309 aaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcatcgacttctgacaaacc 24408  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaa 312  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||||    
T  24409 aaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaa 24446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 24774 - 24873
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  24774 accatcaaagcggacatatgtagagtcttcctacttaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 24873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 636 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 6687 - 6563
Alignment:
Q  636 ttcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcct 735  Q
    ||||||||||  || |||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||    
T  6687 ttcaccatcatggccgacatgtgtaacgtcttcctactcaaagcatccgcaactacattggctttacccggatgatagttcaacccaaaatcataatcct 6588  T
Q  736 tcagtaactttaaccacctcctctg 760  Q
    ||| || ||  ||||| ||||||||    
T  6587 tcaatagctccaaccatctcctctg 6563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 423 - 326
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   ||||||||| |||||    
T  423 accatcaaagcggacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagccttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaagtcctt 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 381 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 6974 - 6857
Alignment:
Q  381 tactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaacttt 480  Q
    ||||||||||||| || || | ||||| | |  ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | || |||||| || |||||||| ||    
T  6974 tactcttgtgactttcttctaaaatcagccttttcatctcatcattgtcaggaacacaaattctgcctctgaacctcaacacaccgtgttcatcaacctt 6875  T
Q  481 gaaatcactatcctcagt 498  Q
    |||||||||||| |||||    
T  6874 gaaatcactatcttcagt 6857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 921 - 880
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtaca 214  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  921 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggtaca 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 294
Target Start/End: Original strand, 15043 - 15290
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||  || || ||| |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || || | || |||||| || || | ||    
T  15043 taaatctctgccaactaggcaacaggaaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattagccaaattgcatcgttcc 15142  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |  || |   || || || |||||    
T  15143 ctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggtacatctaaagataccatcctaccagcaggtttctg 15242  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  15243 atgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactg 15290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 294
Target Start/End: Original strand, 1303 - 1550
Alignment:
Q  47 taaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgcc 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  || ||||  |||||||| | ||| | ||    
T  1303 taaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaatcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcgttcc 1402  T
Q  147 ctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctg 246  Q
    |||| | ||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  || ||  || || || |||||    
T  1403 ctctagaagtatttggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccattctggcacatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctg 1502  T
Q  247 atgctcaaccttggacttctgacagatcaaacaggcataaacaaactg 294  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  1503 atgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactg 1550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 287 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 4736 - 4407
Alignment:
Q  287 acaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactct 386  Q
    |||||||| || ||||| | |||||| || ||||||||||| |  ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||      
T  4736 acaaactgtgccacatcgcgtttcaatccagaccaccaaaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttc 4637  T
Q  387 tgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcaggaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatc 486  Q
    | |||| ||| ||||||||||   || ||| ||| |||| ||||||||| |||| || ||||| ||||| || |||||| || |||||||| || || ||    
T  4636 tatgaccctcttcaagaatcattatcttcatctcttcatcgtcaggaatgcaaattcgacctcggaatctcaacacaccatggtcatcaaccttaaagtc 4537  T
Q  487 actatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatatcctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttc 586  Q
    || ||| ||||| | |||||  | |  || ||| || | |||||| | |||  ||||||| ||||||  |||||| || |  || | ||||||||| |||    
T  4536 accatcttcagtctgattactagcaaccaacaagtctaaaaacttgacatcaactttctgtgcttctttgatactctttagaaattcactatcaatcttc 4437  T
Q  587 agcattcccaactgtatactctgaggtgac 616  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  4436 agcattcccagcttcacactctgaggtgac 4407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 639 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 4352 - 4252
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  4352 accatcaaagcggacatattcaatgtcttcctactcaaggcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatccttca 4253  T
Q  739 g 739  Q
    |    
T  4252 g 4252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4674 - 4550
Alignment:
Q  95 aaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagatactat 194  Q
    ||||| || ||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  4674 aaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaagctcgtcacaaaatccatggatatactat 4575  T
Q  195 cccacttccactccggtacatctaa 219  Q
    |||| |||||||| || ||||||||    
T  4574 cccatttccactctggcacatctaa 4550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 3505 - 3307
Alignment:
Q  437 caaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatat 536  Q
    |||| ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||||| | |||||  | |  ||||||||| |||||||| | ||    
T  3505 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgatgtcaacatcttcagtttgattactagcaaccatcaaatccacaaacttgacat 3406  T
Q  537 cctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  |||||| |||||   ||||||||||||||| | |||||  || |||| ||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3405 ccattttctgcgcttccttgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaattgcacactctgaggtgacaactcacaaacaagactca 3307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 631 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 3279 - 3182
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatca 728  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3279 actctttcactatcaaagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatccgcgactacattagttttaccaagatggtaattcaaaccaaaatca 3182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 30518 - 30320
Alignment:
Q  437 caaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagtgtcattacctgaagtcatcaaatcaacaaacttcatat 536  Q
    |||| ||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||||| | |||||  | |  ||||||||| |||||||| | ||    
T  30518 caaattcttcctctgaacctcaacacaccctgatcatcaaccttgatgtcaacatcttcagtttgattactagcaaccatcaaatccacaaacttgacat 30419  T
Q  537 cctctttctgagcttctcggatactgttcaagaagttactatcaattttcagcattcccaactgtatactctgaggtgacaattcacagacaagactca 635  Q
    ||  |||||| |||||   ||||||||||||||| | |||||  || |||| ||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30418 ccattttctgcgcttccttgatactgttcaagaaatcactattgatcttcaacatacccaattgcacactctgaggtgacaactcacaaacaagactca 30320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 631 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 30292 - 30195
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatca 728  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30292 actctttcactatcaaagcagacatgtgcaacgtcttcctgctcaaagcatccgcgactacattagttttaccaagatggtaattcaaaccaaaatca 30195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 429
Target Start/End: Original strand, 5932 - 6286
Alignment:
Q  75 aactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||| |   | | ||  |||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||| ||    
T  5932 aactgatattaatcggaagaaaatgaaccgacttcgtcaatctacccataatcacccaaattgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcac 6031  T
Q  175 aaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacagatc 274  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||  | |||| ||| | |  || |   || || || ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||    
T  6032 aaaatccatgggtatactatcccatttccactctagcacatataaagataccatcctaccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctaacaagtc 6131  T
Q  275 aaacaggcataaacaaactgagcaacatctcttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgc 374  Q
    ||||| | ||| ||||| || |||||||| | |||||| |  |||||| ||||||  ||||| | ||| |||||||| ||  |||| ||| | || || |    
T  6132 aaacaagaatacacaaattgtgcaacatcgcgtttcaatctagaccactaaaacaacttctttagatcgtggtacatcttcatagctcccagatggatac 6231  T
Q  375 tcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtc 429  Q
    |||| |||||  | ||||| || ||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||    
T  6232 tcaagctacttctatgactttcttcaagaatcattttcttcatctcatcattgtc 6286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 332 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 10354 - 10188
Alignment:
Q  332 ttcttcaaatcatggtacatttttgtagcccccgggtgaatgctcaacctactcttgtgactctcctcaagaatcaacttcctcaactcgtcattgtcag 431  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||  ||| |||  || || | |||||    
T  10354 ttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgtatactcaagctacttctgtgactctcttcaagaatcattttcttcatgtcatcgtcgtcag 10255  T
Q  432 gaatacaaactctacctctgaatcacagcacaccctgatcatcaactttgaaatcactatcctcagt 498  Q
    ||||||||| ||| | || ||||| || ||| |||||||| || || || || |||||||| |||||    
T  10254 gaatacaaattctgcttcggaatcgcaacactccctgatcgtcgaccttaaagtcactatcttcagt 10188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 631 - 736
Target Start/End: Original strand, 6473 - 6578
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||   |||||||||    
T  6473 actcattaaccatcaaagcagacatatgcaaagactttctactcaaagcatcagcaacaacattagccttcccaggatgataactcaactgaaaatcaaa 6572  T
Q  731 atcctt 736  Q
    ||||||    
T  6573 atcctt 6578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 651 - 763
Target Start/End: Original strand, 8491 - 8603
Alignment:
Q  651 gacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaacc 750  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   ||||||||||||||| ||  ||| |||||    
T  8491 gacatatgcaaagtcttcatactcaaagcatcagcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatccttaaggtactctaacc 8590  T
Q  751 acctcctctgcct 763  Q
    | |||||||||||    
T  8591 aactcctctgcct 8603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 29570 - 29471
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  29570 accatcatagcggacatatgcaacgtcttcctactcaaagcatctgcaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 29471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 631 - 736
Target Start/End: Original strand, 25261 - 25366
Alignment:
Q  631 actcattcaccatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaa 730  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||    
T  25261 actcattaaccatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcaacaacgacattagccttcccaagatgataactcaactgaaaatcaaa 25360  T
Q  731 atcctt 736  Q
    ||||||    
T  25361 atcctt 25366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 15738 - 15835
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  15738 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcaacaacgacattagccttcccaagatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 15835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 32412 - 32333
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaa 718  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||    
T  32412 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagccttcccgggatgataactcaa 32333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 207
Target Start/End: Original strand, 24772 - 24806
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactc 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24772 acaaaatcgatagagatactatcccacttccactc 24806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 738
Target Start/End: Original strand, 39686 - 39785
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttca 738  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  39686 accatcaaagcggacatatgcaatgtcttactgctcaaagcatcaacaacaacattagctttacctggatgataattcaaaccaaagtcataatctttca 39785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 733
Target Start/End: Original strand, 1 - 47
Alignment:
Q  687 accacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1 accacattggccttactaggatggtaattcaaaccaaaatcataatc 47  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 299
Target Start/End: Original strand, 24689 - 24815
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaga 272  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||| |  || ||| || |  || |||||||| |||| ||| ||||||||||| |    
T  24689 acaaagtccatagagatattatcccacttccactctggtacaaacaacgattgcatcaaacccgacggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaa 24788  T
Q  273 tcaaacaggcataaacaaactgagcaa 299  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||    
T  24789 ccaaacaagcatacacaaactcagcaa 24815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 133488 - 133391
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  |||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  133488 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagccttcccgagatgttaactcaactgaaaatcaaaatcctt 133391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 209
Target Start/End: Original strand, 232370 - 232400
Alignment:
Q  179 tccatagagatactatcccacttccactccg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  232370 tccatagagatactatcccacttccactccg 232400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 25133 - 25230
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||  | || || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  25133 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattcactttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 25230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 2874 - 2777
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  2874 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 2777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 135
Target Start/End: Original strand, 9708 - 9757
Alignment:
Q  86 ataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaat 135  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9708 ataggaataaaatgtgcctacttcgtcaaccgatcgacaattacccaaat 9757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 769 - 866
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   ||||||||| |||||    
T  769 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatcagcaacaacattagccttcccgggatgataactcaactgaaaatcaaagtcctt 866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 24701 - 24798
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  24701 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 24798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 736
Target Start/End: Original strand, 14215 - 14312
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatcctt 736  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  14215 accatcaaagcagacatatgcaaagtctttctactcaaagcatccgcaacaacattagcctttccgggatgataactcaactgaaaatcaaaatcctt 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 1894 - 1794
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatccttcagtaactttaaccacctcctctgcc 762  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| || ||||| ||| | ||   ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||    
T  1894 gtcttcctactcaaagcatcagcaacaatattagccttcccgggatgataacttaactgaaaatcaaaatccttaagttacttcaaccaccttctttgcc 1795  T
Q  763 t 763  Q
    |    
T  1794 t 1794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 137
Target Start/End: Original strand, 3261 - 3315
Alignment:
Q  83 ttaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatgg 137  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||    
T  3261 ttaataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcaacaatcacccaaatgg 3315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 205
Target Start/End: Original strand, 10103 - 10135
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccac 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10103 acaaaatccatagagatactatcccacttccac 10135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 733
Target Start/End: Original strand, 10601 - 10695
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| || ||| ||||   ||||||||||||    
T  10601 accatcaaagcagacatatgcaaagtcttcctactcaaagcatcggcaacaacattagccttcctagggtgataactcaactgaaaatcaaaatc 10695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 551 - 517
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  551 acaaaatccatagagatactatcccactttcactc 517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14324 - 14270
Alignment:
Q  83 ttaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatgg 137  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||    
T  14324 ttaataggaacaaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcaacaatcacccaaatgg 14270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 207
Target Start/End: Original strand, 458 - 492
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccactc 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  458 acaaaatccatagaaatactatcccacttccactc 492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 663 - 733
Target Start/End: Original strand, 96495 - 96565
Alignment:
Q  663 gtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggccttaccaggatggtaattcaagccaaaatcaaaatc 733  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  96495 gtcttcctgctcaatgcatcagcgactacattagcttttcccggatggtaattcaacccaaaatcataatc 96565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 206
Target Start/End: Original strand, 8074 - 8107
Alignment:
Q  173 acaaaatccatagagatactatcccacttccact 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8074 acaaaatctatagagatactatcccacttccact 8107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 700
Target Start/End: Original strand, 8572 - 8633
Alignment:
Q  639 accatcaatgcggacatgtgcaaggtcttcctactcaaagcatcagctaccacattggcctt 700  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||    
T  8572 accatcaaagcagacatatgcaaagtcttcctactcaaagcatcggcaacaacattagcctt 8633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 135
Target Start/End: Original strand, 44260 - 44309
Alignment:
Q  86 ataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaat 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  44260 ataggaataaaatgtgccgacttcgtcaaccgttcaacaatcacccaaat 44309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University