View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8899_low_104 (Length: 213)

Name: NF8899_low_104
Description: NF8899
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8899_low_104
NF8899_low_104
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (6-213)||(19773600-19773807)
chr6 (3-213)||(22805779-22805998)
chr6 (5-172)||(15705500-15705668)
chr6 (4-169)||(17743276-17743442)
chr6 (3-134)||(27415994-27416125)
chr6 (1-134)||(23414819-23414952)
chr6 (1-134)||(27556577-27556710)
chr6 (3-168)||(28103953-28104119)
chr6 (1-134)||(18917400-18917533)
chr6 (14-191)||(18913813-18914000)
chr6 (14-191)||(18937071-18937258)
chr6 (6-172)||(17377855-17378022)
chr6 (5-134)||(31477948-31478077)
chr6 (14-191)||(15174163-15174350)
chr6 (6-172)||(15817579-15817744)
chr6 (6-172)||(15875279-15875446)
chr6 (1-134)||(1644547-1644680)
chr6 (1-134)||(16760134-16760267)
chr6 (1-131)||(18955897-18956027)
chr6 (1-112)||(11566723-11566834)
chr6 (1-112)||(19870451-19870562)
chr6 (1-112)||(23394929-23395040)
chr6 (1-131)||(22948950-22949080)
chr6 (4-112)||(8243722-8243830)
chr6 (1-112)||(23989781-23989892)
chr6 (1-131)||(14472113-14472243)
chr6 (1-131)||(22952906-22953036)
chr6 (1-131)||(23871394-23871524)
chr6 (1-131)||(23875350-23875480)
chr6 (1-108)||(22862811-22862918)
chr6 (3-104)||(14979442-14979543)
chr6 (47-172)||(19656111-19656237)
chr6 (4-112)||(12618981-12619087)
chr6 (3-76)||(18696480-18696553)
chr6 (3-73)||(18706301-18706371)
chr6 (98-151)||(23538745-23538798)
chr6 (56-151)||(17105771-17105865)
chr6 (14-72)||(23956148-23956206)
chr6 (47-160)||(22376656-22376772)
chr6 (47-174)||(18259928-18260058)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (3-213)||(125802-126021)
scaffold0011 (156-191)||(125760-125795)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (3-191)||(16796362-16796551)
chr3 (3-172)||(324130-324300)
chr3 (3-213)||(18700362-18700581)
chr3 (3-172)||(43889681-43889851)
chr3 (3-172)||(52989777-52989947)
chr3 (3-172)||(12469796-12469966)
chr3 (3-172)||(14966064-14966234)
chr3 (3-213)||(17691763-17691982)
chr3 (1-134)||(4588907-4589040)
chr3 (1-134)||(12339640-12339773)
chr3 (5-172)||(11914073-11914241)
chr3 (14-191)||(35961596-35961783)
chr3 (1-134)||(5223238-5223371)
chr3 (1-134)||(11300564-11300697)
chr3 (8-213)||(54876450-54876664)
chr3 (3-213)||(21837271-21837490)
chr3 (1-134)||(37439770-37439903)
chr3 (1-134)||(19775607-19775740)
chr3 (1-112)||(4111383-4111494)
chr3 (1-112)||(7109562-7109673)
chr3 (1-112)||(7113497-7113608)
chr3 (1-112)||(11165663-11165774)
chr3 (1-112)||(22321528-22321639)
chr3 (1-112)||(22336583-22336694)
chr3 (1-112)||(27409778-27409889)
chr3 (1-112)||(28949588-28949699)
chr3 (1-112)||(55022731-55022842)
chr3 (1-131)||(15964814-15964944)
chr3 (1-131)||(15968738-15968868)
chr3 (1-131)||(15972662-15972792)
chr3 (1-111)||(30065811-30065921)
chr3 (1-112)||(4107531-4107642)
chr3 (1-112)||(11069932-11070043)
chr3 (14-153)||(22652036-22652174)
chr3 (1-111)||(15617239-15617349)
chr3 (1-134)||(11854575-11854708)
chr3 (86-191)||(16979092-16979207)
chr3 (47-172)||(17046206-17046332)
chr3 (1-112)||(14499189-14499300)
chr3 (11-151)||(14569023-14569163)
chr3 (9-105)||(16643135-16643231)
chr3 (3-77)||(14670914-14670988)
chr3 (1-75)||(15465068-15465142)
chr3 (3-77)||(14682413-14682487)
chr3 (125-191)||(36527737-36527804)
chr3 (14-72)||(41813-41871)
chr3 (47-141)||(13026427-13026521)
chr3 (47-141)||(13030019-13030113)
chr3 (164-213)||(17685744-17685793)
chr3 (125-191)||(3265075-3265142)
chr3 (118-172)||(24513836-24513891)
chr3 (14-72)||(16325249-16325307)
chr3 (97-134)||(15465039-15465076)
chr3 (156-191)||(324049-324084)
chr3 (156-191)||(18700588-18700623)
chr3 (156-189)||(10542484-10542517)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (5-213)||(699-916)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (4-213)||(23069339-23069557)
chr2 (2-213)||(18358787-18359001)
chr2 (3-172)||(24918006-24918176)
chr2 (5-172)||(27472315-27472483)
chr2 (2-172)||(34874266-34874437)
chr2 (3-172)||(23707343-23707513)
chr2 (3-172)||(24670891-24671061)
chr2 (3-172)||(21081791-21081961)
chr2 (3-172)||(22459617-22459787)
chr2 (3-172)||(24681312-24681480)
chr2 (1-134)||(30345125-30345258)
chr2 (1-134)||(31345051-31345184)
chr2 (1-134)||(1283228-1283361)
chr2 (14-191)||(21914779-21914966)
chr2 (1-134)||(41531138-41531271)
chr2 (14-191)||(34492200-34492387)
chr2 (1-112)||(24628613-24628724)
chr2 (1-112)||(27601657-27601768)
chr2 (53-211)||(24316190-24316356)
chr2 (1-112)||(12901646-12901757)
chr2 (1-112)||(27379567-27379678)
chr2 (1-112)||(27383613-27383724)
chr2 (1-111)||(10101779-10101889)
chr2 (1-112)||(24649218-24649329)
chr2 (73-172)||(20320723-20320823)
chr2 (3-77)||(9784673-9784747)
chr2 (29-110)||(39827955-39828036)
chr2 (157-191)||(13101739-13101773)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (3-213)||(119855-120074)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (3-213)||(14258297-14258516)
chr7 (3-213)||(16579605-16579824)
chr7 (3-213)||(16585839-16586058)
chr7 (3-213)||(16460820-16461039)
chr7 (6-213)||(15719842-15720058)
chr7 (3-172)||(8940145-8940315)
chr7 (3-172)||(16998488-16998658)
chr7 (3-172)||(46580730-46580900)
chr7 (3-172)||(32301183-32301353)
chr7 (1-134)||(13918578-13918711)
chr7 (1-134)||(1858884-1859017)
chr7 (3-133)||(2530191-2530320)
chr7 (3-172)||(8468613-8468783)
chr7 (3-172)||(15112839-15113009)
chr7 (1-134)||(25927301-25927434)
chr7 (3-213)||(14273361-14273580)
chr7 (3-172)||(16323947-16324116)
chr7 (14-172)||(32160910-32161068)
chr7 (1-134)||(39722105-39722238)
chr7 (14-160)||(16550712-16550858)
chr7 (1-112)||(32968-33079)
chr7 (1-112)||(12704793-12704904)
chr7 (1-112)||(12714725-12714836)
chr7 (1-112)||(12718529-12718640)
chr7 (1-112)||(16114102-16114213)
chr7 (1-112)||(16117255-16117366)
chr7 (1-112)||(16907335-16907446)
chr7 (1-112)||(18283227-18283338)
chr7 (1-131)||(45170140-45170270)
chr7 (1-112)||(12723440-12723551)
chr7 (54-172)||(14981541-14981660)
chr7 (54-172)||(15411017-15411136)
chr7 (14-172)||(17232814-17232973)
chr7 (1-112)||(18279264-18279375)
chr7 (1-111)||(70899-71009)
chr7 (1-111)||(75008-75118)
chr7 (3-191)||(15116352-15116546)
chr7 (6-160)||(17060482-17060635)
chr7 (29-134)||(15084035-15084140)
chr7 (7-112)||(26292256-26292361)
chr7 (14-139)||(16614825-16614950)
chr7 (47-213)||(1490153-1490328)
chr7 (3-77)||(20487533-20487607)
chr7 (125-191)||(10501483-10501550)
chr7 (125-191)||(14157164-14157231)
chr7 (156-191)||(16461046-16461081)
chr7 (156-191)||(32301102-32301137)
chr7 (164-213)||(16185935-16185984)
chr7 (156-188)||(16579566-16579598)
chr7 (156-188)||(16586065-16586097)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (3-172)||(22107489-22107659)
chr5 (2-172)||(6765724-6765895)
chr5 (3-172)||(33895700-33895870)
chr5 (14-160)||(17010923-17011069)
chr5 (1-134)||(18356131-18356264)
chr5 (1-134)||(20910969-20911102)
chr5 (14-172)||(263042-263201)
chr5 (1-134)||(40723721-40723854)
chr5 (3-134)||(10753203-10753334)
chr5 (1-112)||(20295708-20295819)
chr5 (3-172)||(29447899-29448069)
chr5 (1-112)||(15236969-15237080)
chr5 (1-112)||(19472854-19472965)
chr5 (5-77)||(20910854-20910925)
chr5 (87-134)||(11220587-11220634)
chr5 (87-134)||(11225173-11225220)
chr5 (87-134)||(11228996-11229043)
chr5 (3-77)||(18356308-18356381)
chr5 (87-134)||(11230985-11231032)
chr5 (14-72)||(33473272-33473330)
chr5 (87-132)||(11227008-11227053)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (3-172)||(17048189-17048359)
chr4 (3-171)||(13591981-13592149)
chr4 (4-172)||(14746639-14746808)
chr4 (3-134)||(43256213-43256344)
chr4 (16-191)||(40619694-40619872)
chr4 (14-160)||(15008163-15008309)
chr4 (3-160)||(15497090-15497247)
chr4 (14-160)||(10694955-10695101)
chr4 (14-160)||(10908721-10908867)
chr4 (1-134)||(10712695-10712828)
chr4 (1-134)||(10926465-10926598)
chr4 (14-160)||(15884123-15884269)
chr4 (1-134)||(12487550-12487683)
chr4 (1-131)||(14954301-14954431)
chr4 (1-131)||(27533868-27533998)
chr4 (1-112)||(9556391-9556502)
chr4 (1-111)||(17810134-17810244)
chr4 (1-131)||(25689712-25689842)
chr4 (1-112)||(14757556-14757667)
chr4 (5-173)||(19857416-19857585)
chr4 (1-109)||(4561468-4561576)
chr4 (1-112)||(5757072-5757183)
chr4 (47-172)||(53631355-53631481)
chr4 (29-191)||(14650697-14650863)
chr4 (54-172)||(26013377-26013498)
chr4 (4-112)||(33742241-33742347)
chr4 (3-57)||(10056650-10056704)
chr4 (125-191)||(14184973-14185040)
chr4 (14-72)||(28385529-28385587)
chr4 (47-141)||(15990254-15990348)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (3-213)||(48603299-48603518)
chr1 (4-172)||(48520407-48520576)
chr1 (5-213)||(51326638-51326856)
chr1 (3-172)||(12271450-12271620)
chr1 (3-213)||(27653277-27653496)
chr1 (14-170)||(46198433-46198590)
chr1 (6-134)||(33797456-33797584)
chr1 (14-191)||(29764346-29764533)
chr1 (14-172)||(50000658-50000817)
chr1 (1-134)||(1925263-1925396)
chr1 (1-134)||(20924277-20924410)
chr1 (3-213)||(22130961-22131169)
chr1 (1-134)||(20228943-20229076)
chr1 (1-112)||(21407216-21407327)
chr1 (1-112)||(1010584-1010695)
chr1 (1-112)||(16375593-16375704)
chr1 (1-112)||(52639402-52639513)
chr1 (3-108)||(13881436-13881541)
chr1 (86-172)||(20316532-20316619)
chr1 (3-77)||(41781643-41781718)
chr1 (164-213)||(636090-636139)
chr1 (3-64)||(43543133-43543194)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (3-213)||(2768-2987)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (3-170)||(21064-21232)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (3-172)||(53893-54063)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (4-213)||(17461108-17461326)
chr8 (3-171)||(37515602-37515771)
chr8 (3-172)||(18833458-18833628)
chr8 (5-172)||(19808419-19808587)
chr8 (6-172)||(22238077-22238243)
chr8 (3-172)||(23409691-23409861)
chr8 (14-160)||(26453908-26454054)
chr8 (1-134)||(21410789-21410922)
chr8 (1-134)||(21805281-21805414)
chr8 (1-134)||(21828148-21828281)
chr8 (16-160)||(23478278-23478422)
chr8 (14-160)||(19880026-19880172)
chr8 (14-191)||(19929556-19929736)
chr8 (1-131)||(18862779-18862909)
chr8 (1-112)||(21976804-21976915)
chr8 (1-112)||(22111792-22111903)
chr8 (1-112)||(19278417-19278528)
chr8 (1-112)||(43251674-43251785)
chr8 (1-134)||(14397915-14398040)
chr8 (86-172)||(22352932-22353019)
chr8 (3-105)||(23659371-23659473)
chr8 (47-172)||(5760577-5760703)
chr8 (1-112)||(21972719-21972826)
chr8 (100-172)||(44384821-44384894)
chr8 (3-96)||(16402057-16402150)
chr8 (3-77)||(23914029-23914103)
chr8 (14-72)||(8414418-8414476)
chr8 (14-72)||(11775008-11775066)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (5-172)||(6998-7166)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (3-172)||(169804-169974)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (5-213)||(384-601)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (3-134)||(71236-71367)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (3-172)||(3382-3552)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (3-172)||(85441-85611)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (4-172)||(313-482)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (3-172)||(24652-24820)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (5-160)||(468-623)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (4-213)||(15588-15807)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (3-172)||(1929-2099)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-134)||(20263-20396)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (1-134)||(31058-31191)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (5-172)||(1349-1517)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (14-191)||(5615-5802)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (14-191)||(22477-22664)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (10-153)||(1227-1370)
scaffold0017 (10-153)||(7978-8121)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (3-172)||(7731-7900)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (3-205)||(10139-10350)
scaffold0107 (3-94)||(15469-15560)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-134)||(207636-207769)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (14-191)||(33074-33261)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (62-213)||(13490-13650)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (6-168)||(67161-67324)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (3-172)||(6957-7127)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-134)||(234-367)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (1-134)||(11635-11768)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-134)||(36220-36353)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-134)||(189511-189644)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (14-191)||(10378-10564)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-116)||(39205-39320)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (1-134)||(32794-32927)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (14-172)||(4215-4374)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (14-172)||(4215-4374)
scaffold0306 (3-160)||(14906-15063)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (3-172)||(49-225)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-134)||(14221-14354)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-134)||(80554-80687)
scaffold0029 (1-112)||(61746-61857)
scaffold0029 (1-112)||(65662-65773)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-112)||(58853-58964)
[»] scaffold0741 (2 HSPs)
scaffold0741 (47-172)||(6851-6977)
scaffold0741 (3-62)||(4324-4383)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (14-172)||(70536-70689)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (29-191)||(7544-7710)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (1-112)||(5235-5346)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (1-112)||(12283-12394)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-135)||(36076-36208)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (29-191)||(56842-57008)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-112)||(311-422)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (1-111)||(4009-4119)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (29-177)||(15470-15622)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (97-210)||(20652-20774)
scaffold0018 (3-50)||(20769-20816)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (1-112)||(67436-67546)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (47-172)||(1349-1475)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (56-134)||(6854-6932)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-96)||(80469-80564)
scaffold0037 (75-134)||(80562-80621)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (29-191)||(166429-166595)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (86-172)||(78299-78386)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (1-83)||(17559-17641)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (3-80)||(6214-6291)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (3-71)||(105078-105146)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (125-191)||(10467-10534)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (29-141)||(8934-9048)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (164-213)||(3550-3599)
scaffold0165 (164-213)||(7614-7663)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (125-188)||(8028-8092)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (47-168)||(11567-11692)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (14-72)||(168724-168782)
scaffold0001 (14-72)||(176078-176136)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (143-191)||(126896-126945)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (126-172)||(21847-21894)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (6-64)||(36088-36146)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Original strand, 19773600 - 19773807
Alignment:
Q  6 tatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 105  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773600 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 19773699  T
Q  106 gaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggag 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19773700 gaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgtaggtgttgtctaagttgtaagttatcgttccaaagtattccaaagtattggag 19773799  T
Q  206 tcttaagt 213  Q
    ||||||||    
T  19773800 tcttaagt 19773807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22805998 - 22805779
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22805998 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatattcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgt 22805899  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 193  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  22805898 tgtgaattgctcgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcattccaaagtatccc 22805799  T
Q  194 aaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22805798 aaagtattggagtcttaagt 22805779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 172
Target Start/End: Original strand, 15705500 - 15705668
Alignment:
Q  5 ctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15705500 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtataagttgatgatgcttctcattaatattgttatgttg 15705599  T
Q  105 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15705600 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtttaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 15705668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17743442 - 17743276
Alignment:
Q  4 cctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17743442 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttctcattaatattgttatgtt 17743343  T
Q  104 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg 169  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17743342 gtgaattgcttgtgttgtttctattgctgttgaagattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttg 17743276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 27415994 - 27416125
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27415994 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 27416093  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27416094 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 27416125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23414952 - 23414819
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414952 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 23414853  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414852 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 23414819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27556710 - 27556577
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556710 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 27556611  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556610 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 27556577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 168
Target Start/End: Original strand, 28103953 - 28104119
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  28103953 gcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgt 28104052  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28104053 tgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagtttcaggtgttggtctaagtt 28104119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 18917400 - 18917533
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917400 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 18917499  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917500 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 18917533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18914000 - 18913813
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18914000 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaattgct 18913901  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18913900 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 18913813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18937258 - 18937071
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18937258 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaattgct 18937159  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18937158 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 18937071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 172
Target Start/End: Original strand, 17377855 - 17378022
Alignment:
Q  6 tatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 105  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||    
T  17377855 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtttatgttcttcattaatattgttatgttgt 17377954  T
Q  106 gaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17377955 gaattgcttgtattgtttctgttgttgttgtatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 17378022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 134
Target Start/End: Original strand, 31477948 - 31478077
Alignment:
Q  5 ctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31477948 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttg 31478047  T
Q  105 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31478048 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 31478077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 15174163 - 15174350
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15174163 tgttgttggttatgtgaaataattatatgacttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgagaattact 15174262  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15174263 tgtgctatttatgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 15174350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 172
Target Start/End: Original strand, 15817579 - 15817744
Alignment:
Q  6 tatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 105  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15817579 tatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtagttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 15817678  T
Q  106 gaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15817679 gaattgcttttg-tgtttct-atgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 15817744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15875446 - 15875279
Alignment:
Q  6 tatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 105  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  15875446 tatgttgctgatgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgataattttcattaatattgttatgttgt 15875347  T
Q  106 gaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  15875346 gaattgcttgtgttgtttctgttgctgttacatattgatcaagttgcaagtgttggtctatgttgtaa 15875279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1644680 - 1644547
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  1644680 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttat 1644581  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644580 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 1644547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16760267 - 16760134
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  16760267 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttat 16760168  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16760167 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 16760134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 18955897 - 18956027
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  18955897 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttat 18955996  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 131  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18955997 gttgtgaattgcatgcgctgtttctgttgct 18956027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 11566834 - 11566723
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11566834 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 11566735  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  11566734 gttgtgaattgc 11566723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19870562 - 19870451
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870562 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 19870463  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  19870462 gttgtgaattgc 19870451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23395040 - 23394929
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23395040 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 23394941  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  23394940 gttgtgaattgc 23394929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22949080 - 22948950
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  22949080 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttat 22948981  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948980 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 22948950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 8243830 - 8243722
Alignment:
Q  4 cctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8243830 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 8243731  T
Q  104 gtgaattgc 112  Q
    |||||||||    
T  8243730 gtgaattgc 8243722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23989892 - 23989781
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989892 tcgcctatgttgctgttgttggttaggtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 23989793  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  23989792 gttgtgaattgc 23989781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14472243 - 14472113
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  14472243 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtataatgttgaagttattgatacttcataataatattgttat 14472144  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 131  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14472143 gttgtgaattgcatgtgctgtttctgttgct 14472113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22953036 - 22952906
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  22953036 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttat 22952937  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22952936 gttgagaattgcttgtgctgtttctgttgct 22952906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23871524 - 23871394
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  23871524 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttat 23871425  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23871424 gttgagaattgcttgtgctgtttctgttgct 23871394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23875480 - 23875350
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  23875480 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttat 23875381  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23875380 gttgagaattgcttgtgctgtttctgttgct 23875350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22862918 - 22862811
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22862918 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 22862819  T
Q  101 gttgtgaa 108  Q
    ||||||||    
T  22862818 gttgtgaa 22862811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 104
Target Start/End: Original strand, 14979442 - 14979543
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  14979442 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgattttcattaatattgttatgt 14979541  T
Q  103 tg 104  Q
    ||    
T  14979542 tg 14979543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Original strand, 19656111 - 19656237
Alignment:
Q  47 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 146  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19656111 atgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcatgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatca 19656210  T
Q  147 agttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  19656211 agttgcaagtgttggtcaaagttgtaa 19656237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Original strand, 12618981 - 12619087
Alignment:
Q  4 cctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 103  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12618981 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatgt--cttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgct 12619078  T
Q  104 gtgaattgc 112  Q
    |||||||||    
T  12619079 gtgaattgc 12619087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18696553 - 18696480
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 76  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18696553 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 18696480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 18706371 - 18706301
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagtt 73  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18706371 gcctatgttgctgtttttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtt 18706301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23538798 - 23538745
Alignment:
Q  98 tatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23538798 tatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 23538745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 17105865 - 17105771
Alignment:
Q  56 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 151  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||  ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17105865 atgtatgatgttaaagt-gttgatgtttgtcattattattgatatgttgagaattgcctgtgttgtttctgttgctgttgaacattgatcaagttg 17105771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23956206 - 23956148
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 72  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23956206 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 23956148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 160
Target Start/End: Original strand, 22376656 - 22376772
Alignment:
Q  47 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaat-attgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatattga 143  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||| || ||  |||| || ||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||| || |||||||||||||    
T  22376656 atgtgaaaaatgtatgatgttgaggttgttgttgattaccattgattattgttatgttgtgagttgcttacgtgctgcctctgctgttgttgaatattga 22376755  T
Q  144 tcaagttgcaggtgttg 160  Q
    | |||||||| ||||||    
T  22376756 ttaagttgcaagtgttg 22376772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 174
Target Start/End: Original strand, 18259928 - 18260058
Alignment:
Q  47 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaat-attgttatgttgtgaattgct--tgtgctgtttctgttgctgttgaatattga 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| || |||||||||||||| | ||||  |||| ||| |||| || || |||||||| |    
T  18259928 atgtggaaaatgtatgatgttcaagttgttgttgattatcattgatcattgttatgttgtg-agtgcttatgtgatgtctctgctgttgctgaatattaa 18260026  T
Q  144 tcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagt 174  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  18260027 ttaagttgcaagtgttggtctaagttgcaagt 18260058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 126021 - 125802
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  126021 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgt 125922  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  125921 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattcc 125822  T
Q  194 aaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  125821 aaagtattggagtcttaagt 125802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 125795 - 125760
Alignment:
Q  156 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  125795 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 125760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16796551 - 16796362
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16796551 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 16796452  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16796451 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 16796362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 324300 - 324130
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  324300 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgt 324201  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  324200 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 324130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 18700362 - 18700581
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18700362 gcctatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgggaaatgtatgatgtttaagtttttgatgtttctcattaatattgttatgt 18700461  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 193  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18700462 tgtgaattgctagtgctgtttctgttgctgttgaatatagatcaagttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattcc 18700561  T
Q  194 aaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18700562 aaagtattggagtcttaagt 18700581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 43889681 - 43889851
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  43889681 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtagaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtctctcattaatattgttatgt 43889780  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43889781 tgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 43889851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 52989777 - 52989947
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  52989777 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgt 52989876  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52989877 tgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 52989947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 12469966 - 12469796
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12469966 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtgtgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgt 12469867  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12469866 tgtgaattggttgtgttgtttttgttgctgttgaatatttataaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 12469796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14966234 - 14966064
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  14966234 gcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgt 14966135  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14966134 tgtgaattgtttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 14966064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 17691763 - 17691982
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  | |||||||||||||||    
T  17691763 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttcgttaatattgttatgt 17691862  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 193  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  17691863 gttgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcataatgatcaagttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttcc 17691962  T
Q  194 aaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17691963 aaagtattggagtcttaagt 17691982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 4588907 - 4589040
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588907 tcgcctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 4589006  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4589007 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 4589040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12339773 - 12339640
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339773 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 12339674  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339673 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 12339640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 172
Target Start/End: Original strand, 11914073 - 11914241
Alignment:
Q  5 ctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 104  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11914073 ctatgttgttgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 11914172  T
Q  105 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11914173 tgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 11914241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 35961596 - 35961783
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35961596 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatatttttatgttgagaattgct 35961695  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35961696 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 35961783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5223371 - 5223238
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5223371 tcgcctatgttgctgctgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 5223272  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5223271 gttgtgaattgtttgtgctgtttttgttgctgtt 5223238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 11300564 - 11300697
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11300564 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttat 11300663  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11300664 gttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 11300697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 213
Target Start/End: Original strand, 54876450 - 54876664
Alignment:
Q  8 tgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||| |    
T  54876450 tgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttccttaatattgttatgttgtaa 54876549  T
Q  108 attgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tctaagt--------tgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagt 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||        ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |    
T  54876550 attgcttgtactgtttctgttgctgttgcataatgatcaagttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaaat 54876649  T
Q  199 attggagtcttaagt 213  Q
    |||| ||||||||||    
T  54876650 attgaagtcttaagt 54876664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21837490 - 21837271
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||||    
T  21837490 gcctatgttgttgatgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttatgttgttgatgcttttcatgaatattattatgt 21837391  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 193  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||| | ||||    
T  21837390 tgtgaatgacttgtactgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgttgatgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaaatgttcc 21837291  T
Q  194 aaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21837290 aaagtattggagtcttaagt 21837271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 37439770 - 37439903
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37439770 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttat 37439869  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37439870 gttgtgaattgcttgtgctgtttatgttgctgtt 37439903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19775740 - 19775607
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  19775740 tcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgctat 19775641  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19775640 gttgtgaattgtttgtgctgtttctgttgctgtt 19775607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 4111383 - 4111494
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4111383 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 4111482  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  4111483 gttgtgaattgc 4111494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 7109673 - 7109562
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7109673 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 7109574  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  7109573 gttgtgaattgc 7109562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 7113608 - 7113497
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113608 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 7113509  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  7113508 gttgtgaattgc 7113497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 11165663 - 11165774
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11165663 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 11165762  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  11165763 gttgtgaattgc 11165774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22321639 - 22321528
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321639 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 22321540  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  22321539 gttgtgaattgc 22321528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22336694 - 22336583
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336694 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 22336595  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  22336594 gttgtgaattgc 22336583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 27409778 - 27409889
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27409778 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 27409877  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  27409878 gttgtgaattgc 27409889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28949699 - 28949588
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949699 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 28949600  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  28949599 gttgtgaattgc 28949588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 55022842 - 55022731
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55022842 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 55022743  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  55022742 gttgtgaattgc 55022731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15964944 - 15964814
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |    
T  15964944 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgtttt 15964845  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15964844 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 15964814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15968868 - 15968738
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |    
T  15968868 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgtttt 15968769  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15968768 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 15968738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15972792 - 15972662
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |    
T  15972792 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgtttt 15972693  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15972692 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 15972662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 30065921 - 30065811
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30065921 tcgcctatgctgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 30065822  T
Q  101 gttgtgaattg 111  Q
    |||||||||||    
T  30065821 gttgtgaattg 30065811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 4107531 - 4107642
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4107531 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtttcacattaatattgttat 4107630  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  4107631 gttgtgaattgc 4107642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 11070043 - 11069932
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11070043 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 11069944  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  11069943 gttgtgaattgc 11069932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22652174 - 22652036
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22652174 tgttgttggttatgtgaaataattatatgcattatgtggaaa-tgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatactgttatgttgtgaattgct 22652076  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 153  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22652075 tgtgttgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgca 22652036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 15617349 - 15617239
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617349 tcgcctatgctgctgctgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 15617250  T
Q  101 gttgtgaattg 111  Q
    |||||||||||    
T  15617249 gttgtgaattg 15617239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11854708 - 11854575
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  11854708 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtttatatgtcttatgaggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctccgtattaatattgttat 11854609  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11854608 gttgtgaattgcttgagctgtttatgttgctgtt 11854575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16979207 - 16979092
Alignment:
Q  86 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagtt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||    
T  16979207 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagtt 16979108  T
Q  176 gtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||||| ||||||||    
T  16979107 gtcgttccaaagtatt 16979092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17046332 - 17046206
Alignment:
Q  47 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 146  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046332 atgtggaatatatatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgattgtactgtttctgttgctgttgaatattgatca 17046233  T
Q  147 agttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17046232 agttgcaggtgttggtctaagttgtaa 17046206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14499300 - 14499189
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||| |||| |||||||| | |||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14499300 tcgccaatgtggctgttgtgggttatgtaaaatattaatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagtggttgatgcttcacattaatattgttat 14499201  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  14499200 gttgtgaattgc 14499189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 151
Target Start/End: Original strand, 14569023 - 14569163
Alignment:
Q  11 tgctgttgttgattatgggaaa-tatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaat 109  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||    
T  14569023 tgctgttgttggttatggtaaaatatgtatataccttatgtggaaaatgtatgatgttaaaga-gttgatgtttgtcattattattcatatgttgtgaat 14569121  T
Q  110 tgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 151  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569122 tacttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 14569163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16643231 - 16643135
Alignment:
Q  9 gttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 105  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||    
T  16643231 gttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcagtaatattgttatgttgt 16643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 14670988 - 14670914
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 77  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14670988 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 14670914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15465142 - 15465068
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgt 75  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15465142 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttatgttgt 15465068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 14682487 - 14682413
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 77  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  14682487 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaattgacgatgtttaagttgttg 14682413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36527804 - 36527737
Alignment:
Q  125 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  36527804 tgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 36527737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 41871 - 41813
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 72  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41871 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 41813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 13026427 - 13026521
Alignment:
Q  47 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatatt 141  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| | || ||  | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  13026427 atgtggaatatgtatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttattatgtgaattgcttgtgctgtttctgctgttgttgattatt 13026521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 13030019 - 13030113
Alignment:
Q  47 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatatt 141  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| | || ||  | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  13030019 atgtggaatatgtatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttattatgtgaattgcttgtgctgtttctgctgttgttgattatt 13030113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 213
Target Start/End: Original strand, 17685744 - 17685793
Alignment:
Q  164 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17685744 aagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagt 17685793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Original strand, 3265075 - 3265142
Alignment:
Q  125 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3265075 tgttgttgttgcatattgatcaattcgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 3265142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24513891 - 24513836
Alignment:
Q  118 ctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24513891 ctgttgctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtggtaa 24513836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 72
Target Start/End: Original strand, 16325249 - 16325307
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 72  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16325249 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttacgtggaaaatgtatgatgtttaagt 16325307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15465076 - 15465039
Alignment:
Q  97 ttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15465076 ttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 15465039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 324084 - 324049
Alignment:
Q  156 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  324084 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 324049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 191
Target Start/End: Original strand, 18700588 - 18700623
Alignment:
Q  156 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18700588 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 18700623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 189
Target Start/End: Original strand, 10542484 - 10542517
Alignment:
Q  156 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagta 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10542484 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagta 10542517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 916 - 699
Alignment:
Q  5 ctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  916 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 817  T
Q  105 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  816 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattccaa 717  T
Q  196 agtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||    
T  716 agtattggagtcttaagt 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 23069339 - 23069557
Alignment:
Q  4 cctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23069339 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgtt 23069438  T
Q  104 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcca 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23069439 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagctgtcgttccaaagtattcca 23069538  T
Q  195 aagtattggagtcttaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23069539 aagtattggagtcttaagt 23069557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 18358787 - 18359001
Alignment:
Q  2 cgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  18358787 cgcctatgttgctgttgttggttttgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattattatg 18358886  T
Q  102 ttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt-aagttgtcgttctaaagt-attccaaagt 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||  |||| ||||    
T  18358887 ttgtgaatttcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcagatgttggtctaagttgtaaagttgtctttccaaagtgtttccgaagt 18358986  T
Q  199 attggagtcttaagt 213  Q
    |||||||||||||||    
T  18358987 attggagtcttaagt 18359001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24918176 - 24918006
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  24918176 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgt 24918077  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24918076 tgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 24918006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27472483 - 27472315
Alignment:
Q  5 ctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  27472483 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttg 27472384  T
Q  105 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27472383 tgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 27472315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 172
Target Start/End: Original strand, 34874266 - 34874437
Alignment:
Q  2 cgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatg 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  34874266 cgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatg 34874365  T
Q  102 ttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34874366 ttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 34874437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 23707343 - 23707513
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23707343 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcattatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgt 23707442  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23707443 tgtgaattgcttgtactatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 23707513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24671061 - 24670891
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  24671061 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgggttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgt 24670962  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24670961 tgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgtatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 24670891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 21081791 - 21081961
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  21081791 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttattgatgctcttcattaatattgttatgt 21081890  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21081891 tgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 21081961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 22459617 - 22459787
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22459617 gcctatgttgctgttgtcggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtataatgttgaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgt 22459716  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22459717 tgtgaattgcttgtactgtttcggttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 22459787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24681480 - 24681312
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  24681480 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcgtcattagtattgttatgt 24681381  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24681380 tgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttg--tattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 24681312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 30345125 - 30345258
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30345125 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttat 30345224  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30345225 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 30345258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31345184 - 31345051
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31345184 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttaatgcttcacactaatattgttat 31345085  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31345084 gttgtgaattacttgtgctgtttctgttgctgtt 31345051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1283361 - 1283228
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1283361 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttat 1283262  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1283261 gttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 1283228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21914966 - 21914779
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21914966 tgttgtaggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttatttaatattgttatgttgagaattgct 21914867  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21914866 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 21914779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 41531138 - 41531271
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  41531138 tcgcctatgttactgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttat 41531237  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41531238 gttgtgaattgcttgtgctgtttatgttgctgtt 41531271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 34492200 - 34492387
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  34492200 tgttgttggttatgtgaaataattatataccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgctttttattaatattgttatgttgagaattgct 34492299  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt----------gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||          ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34492300 tctgatgtttctgttgttgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagtcgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 34492387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 24628613 - 24628724
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24628613 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 24628712  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  24628713 gttgtgaattgc 24628724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 27601768 - 27601657
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601768 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 27601669  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  27601668 gttgtgaattgc 27601657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 211
Target Start/End: Original strand, 24316190 - 24316356
Alignment:
Q  53 aaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgc 152  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24316190 aaaatgtatgatgtttaagttgt-gatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgc 24316288  T
Q  153 aggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaa 211  Q
    ||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24316289 aggtgttggtctaagttacaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaa 24316356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 12901646 - 12901757
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901646 tcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 12901745  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  12901746 gttgtgaattgc 12901757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 27379567 - 27379678
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379567 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 27379666  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    |||| |||||||    
T  27379667 gttgcgaattgc 27379678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 27383613 - 27383724
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383613 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 27383712  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    |||| |||||||    
T  27383713 gttgcgaattgc 27383724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 10101779 - 10101889
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10101779 tcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtttcacattaatattgttat 10101878  T
Q  101 gttgtgaattg 111  Q
    |||||||||||    
T  10101879 gttgtgaattg 10101889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 24649329 - 24649218
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24649329 tcgcctaggttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgcttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 24649230  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  24649229 gttgtgaattgc 24649218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 172
Target Start/End: Original strand, 20320723 - 20320823
Alignment:
Q  73 tgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgta 171  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20320723 tgttgatgcttttcattaatattgtcatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgaatactgatcaagttgcaggtgttggtctaaattgta 20320822  T
Q  172 a 172  Q
    |    
T  20320823 a 20320823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 9784747 - 9784673
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 77  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9784747 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaaattgttg 9784673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 110
Target Start/End: Original strand, 39827955 - 39828036
Alignment:
Q  29 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaatt 110  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||  |||| |||| |||||| ||||||||    
T  39827955 gaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttaattcttatcattgatatggttatgctgtgaatt 39828036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 191
Target Start/End: Original strand, 13101739 - 13101773
Alignment:
Q  157 gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13101739 gttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 13101773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 120074 - 119855
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  120074 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattattatgt 119975  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtg-ttgtcta--------agttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  119974 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtatagttgtaagttgtcgttccaaagtattcc 119875  T
Q  194 aaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  119874 aaagtattggagtcttaagt 119855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14258516 - 14258297
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14258516 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttgagttgttgatgcttctcattaatattgttatgt 14258417  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 193  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14258416 tgtgaattgcttgtaatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcattccaaagtattcc 14258317  T
Q  194 aaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14258316 aaagtattggagtcttaagt 14258297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16579824 - 16579605
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16579824 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgt 16579725  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16579724 tgtgaattgcttgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattcc 16579625  T
Q  194 aaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16579624 aaagtattggagtcttaagt 16579605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 16585839 - 16586058
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16585839 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgt 16585938  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16585939 tgtgaattgcttgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattcc 16586038  T
Q  194 aaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16586039 aaagtattggagtcttaagt 16586058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 16460820 - 16461039
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16460820 gcctatgttgttgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcatcaatattgttatgt 16460919  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtg-ttgtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 193  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16460920 tgtgaattgcttttgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattcc 16461019  T
Q  194 aaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16461020 aaagtattggagtcttaagt 16461039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15720058 - 15719842
Alignment:
Q  6 tatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 105  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15720058 tatgtttctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgt 15719959  T
Q  106 gaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaa 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  15719958 gaattgcttgtactgtttctgttgctgatgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaa 15719859  T
Q  197 gtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||| |||||    
T  15719858 gtattggagtcctaagt 15719842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8940315 - 8940145
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  8940315 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgt 8940216  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8940215 tgtgaattgcttgtactgtttatgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 8940145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16998658 - 16998488
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16998658 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgttgaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgt 16998559  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16998558 tgtgaattgcttgtaatgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 16998488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 46580730 - 46580900
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||     
T  46580730 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgc 46580829  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46580830 tgtgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 46580900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 32301353 - 32301183
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  32301353 gcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatacttttcattaatattgttatgt 32301254  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt-gttgtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  32301253 tgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtggtggtctaagttgtaa 32301183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 13918578 - 13918711
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918578 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatatggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 13918677  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918678 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 13918711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 1858884 - 1859017
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1858884 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatat 1858983  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1858984 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 1859017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Original strand, 2530191 - 2530320
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2530191 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatt-atatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 2530289  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgt 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2530290 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgt 2530320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8468783 - 8468613
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8468783 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgt 8468684  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8468683 tgtgaattgcttgtattgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgtaa 8468613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15113009 - 15112839
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15113009 gcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtagaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgt 15112910  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15112909 tgtgaatttcttgtactgtttctgttgctgttgcacattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 15112839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 25927301 - 25927434
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25927301 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 25927400  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25927401 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgatgtt 25927434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14273580 - 14273361
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  14273580 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttcattaatattgttatgt 14273481  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtg-ttgtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 193  Q
    || ||||   |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  14273480 tgcgaatattttgtactatttctgttgctattgcatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttcc 14273381  T
Q  194 aaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14273380 aaagtattggagtcttaagt 14273361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16324116 - 16323947
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  16324116 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtt-atatgccttttgtggaaaatgcatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgt 16324018  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16324017 tgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcgggtgttggtctaagttgtaa 16323947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Original strand, 32160910 - 32161068
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32160910 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaat-tgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 32161008  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32161009 tgtgctgtttctgttgctgttgcatattgattaagttacaggtgttggtctaagttgtaa 32161068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 39722238 - 39722105
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  39722238 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttat 39722139  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39722138 gttgtgaattgcttgtgctgtttatgttgctgtt 39722105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 16550712 - 16550858
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16550712 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttttgaattgct 16550811  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 160  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16550812 tgtgttgtttctattgatgttgaataatgatcaagttgcagatgttg 16550858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 33079 - 32968
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33079 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 32980  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  32979 gttgtgaattgc 32968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 12704793 - 12704904
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12704793 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 12704892  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  12704893 gttgtgaattgc 12704904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12714836 - 12714725
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714836 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 12714737  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  12714736 gttgtgaattgc 12714725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12718640 - 12718529
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718640 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 12718541  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  12718540 gttgtgaattgc 12718529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16114213 - 16114102
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16114213 tcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 16114114  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  16114113 gttgtgaattgc 16114102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16117366 - 16117255
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16117366 tcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 16117267  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  16117266 gttgtgaattgc 16117255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 16907335 - 16907446
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907335 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 16907434  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  16907435 gttgtgaattgc 16907446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18283338 - 18283227
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18283338 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 18283239  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  18283238 gttgtgaattgc 18283227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 45170140 - 45170270
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  45170140 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttat 45170239  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 131  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45170240 gttgtgaattgtttgtactgtttctgttgct 45170270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12723551 - 12723440
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723551 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagctgttgatgcttcacattaatattgttat 12723452  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  12723451 gttgtgaattgc 12723440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 172
Target Start/End: Original strand, 14981541 - 14981660
Alignment:
Q  54 aaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14981541 aaatgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgca 14981640  T
Q  154 ggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  14981641 ggtgttggtctaagttgtaa 14981660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 172
Target Start/End: Original strand, 15411017 - 15411136
Alignment:
Q  54 aaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15411017 aaatgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgtatattgatcaagttgca 15411116  T
Q  154 ggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  15411117 ggtgttggtctaagttgtaa 15411136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17232973 - 17232814
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  17232973 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttataaattgct 17232874  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17232873 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgtaa 17232814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18279375 - 18279264
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18279375 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 18279276  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||| ||||||||    
T  18279275 gttttgaattgc 18279264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 70899 - 71009
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  70899 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgtcgatgcttcacattaatattgttat 70998  T
Q  101 gttgtgaattg 111  Q
    |||||||||||    
T  70999 gttgtgaattg 71009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 75008 - 75118
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  75008 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgtcgatgcttcacattaatattgttat 75107  T
Q  101 gttgtgaattg 111  Q
    |||||||||||    
T  75108 gttgtgaattg 75118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15116546 - 15116352
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |    
T  15116546 gcctatgttgctgttgtttgttatgtgaaatgtgcatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttacgttgttgatgtttttcattaatattgttattt 15116447  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct-----aagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||     ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15116446 tgtgaatttcttgtattgtttctgttgctgttgcacattgatcaagttgcaagtgttggtctttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 15116352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 17060482 - 17060635
Alignment:
Q  6 tatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 105  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | | ||||    
T  17060482 tatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatgttggtct-ttgt 17060580  T
Q  106 gaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 160  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  17060581 gaattgcttgtactgtttctattgctgttgaatattgatcaaattacaagtgttg 17060635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15084140 - 15084035
Alignment:
Q  29 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgtt 128  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15084140 gaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgtt 15084041  T
Q  129 gctgtt 134  Q
    ||||||    
T  15084040 gctgtt 15084035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 26292361 - 26292256
Alignment:
Q  7 atgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtg 106  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292361 atgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtg 26292262  T
Q  107 aattgc 112  Q
    ||||||    
T  26292261 aattgc 26292256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16614950 - 16614825
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16614950 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttttgaattgct 16614851  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaata 139  Q
    |||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  16614850 tgtgttgtttctattgatgttaaata 16614825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Original strand, 1490153 - 1490328
Alignment:
Q  47 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 146  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||||| | || ||  | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1490153 atgtggaatatatatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtactttttctgttgttgttgaatattgatca 1490252  T
Q  147 agttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1490253 agttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagt 1490328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20487607 - 20487533
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 77  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20487607 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 20487533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Original strand, 10501483 - 10501550
Alignment:
Q  125 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10501483 tgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctgagttgtaagttgtctttccaaagtatt 10501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Original strand, 14157164 - 14157231
Alignment:
Q  125 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  14157164 tgttgctgttgcatattgatcaagttccaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttgcaaagtatt 14157231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 191
Target Start/End: Original strand, 16461046 - 16461081
Alignment:
Q  156 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16461046 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 16461081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32301137 - 32301102
Alignment:
Q  156 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32301137 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 32301102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16185984 - 16185935
Alignment:
Q  164 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 213  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16185984 aagttgtaagttatctttccaaagtgttccaaagtattggagtcctaagt 16185935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16579598 - 16579566
Alignment:
Q  156 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16579598 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 16579566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 188
Target Start/End: Original strand, 16586065 - 16586097
Alignment:
Q  156 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16586065 tgttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagt 16586097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 22107489 - 22107659
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22107489 gcctatgttgctgttgttggttatgtcaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgt 22107588  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22107589 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 22107659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 6765895 - 6765724
Alignment:
Q  2 cgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  6765895 cgcctatgttgctgttgttggttgtgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaatattgttatg 6765796  T
Q  102 ttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  6765795 ttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcatgtgttggtctaagttgtaa 6765724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 33895700 - 33895870
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33895700 gcctatgttgctgttgtgggttttgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgt 33895799  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33895800 tgtgaactgcttgtgctgtttatgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtattggtctaagttgtaa 33895870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17011069 - 17010923
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17011069 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 17010970  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 160  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17010969 tgtgctgcttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 17010923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18356264 - 18356131
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18356264 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttgagttgttgatgcttcacattaatattgttat 18356165  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18356164 gttgtgaattgtttgtgatgtttctgttgctgtt 18356131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 20910969 - 20911102
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20910969 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 20911068  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20911069 gttgtgaattgtttgtgttgtttctgttgctgtt 20911102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 263201 - 263042
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  263201 tgttgttggttatgtgaaataattatgtgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 263102  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgt-tgtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  263101 tgtgctgtttctgttgttgttgcatatagatcaagttgcaggtataggtctaagttgtaa 263042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 40723721 - 40723854
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  40723721 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataatagtattgttat 40723820  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40723821 gttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 40723854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10753334 - 10753203
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  10753334 gcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgctatgt 10753235  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10753234 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgttgtt 10753203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20295819 - 20295708
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295819 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 20295720  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  20295719 gttgtgaattgc 20295708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 29448069 - 29447899
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttg-ttgatgcttcacattaatattgttatg 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  29448069 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaa-tgtataatgtttaaattgattgatgcttttcattaatattgttatg 29447971  T
Q  102 ttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29447970 ttgtgaattgcttgtgttgctcctgttgatgttgagtattgattaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 29447899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 15236969 - 15237080
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236969 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 15237068  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  15237069 gttgtgaattgc 15237080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 19472854 - 19472965
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19472854 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 19472953  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  19472954 gttgtgaattgc 19472965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 77
Target Start/End: Original strand, 20910854 - 20910925
Alignment:
Q  5 ctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 77  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20910854 ctatgttgctgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttat-tggaaaatgtatgatgtataagttgttg 20910925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11220634 - 11220587
Alignment:
Q  87 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11220634 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11220587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11225220 - 11225173
Alignment:
Q  87 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11225220 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11225173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11229043 - 11228996
Alignment:
Q  87 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11229043 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11228996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18356381 - 18356308
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 77  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18356381 gcctatgttgctgttgttggttatctgaaatatttatatgctttat-tggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 18356308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11231032 - 11230985
Alignment:
Q  87 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11231032 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 11230985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 72
Target Start/End: Original strand, 33473272 - 33473330
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 72  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33473272 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 33473330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11227053 - 11227008
Alignment:
Q  87 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctg 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  11227053 attaatattgttatgttgtgaatttcatgtgctgtatctgttgctg 11227008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 17048189 - 17048359
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17048189 gcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 17048288  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17048289 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgttgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 17048359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 171
Target Start/End: Original strand, 13591981 - 13592149
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13591981 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaa-tgtatgatgtttaagttgatgatgcttttcattaatattgatatgt 13592079  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgta 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13592080 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgaaggtgttggtctaagttgta 13592149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Original strand, 14746639 - 14746808
Alignment:
Q  4 cctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  14746639 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgtt 14746738  T
Q  104 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14746739 gtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 14746808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 43256213 - 43256344
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43256213 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatatgt 43256312  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43256313 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 43256344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40619872 - 40619694
Alignment:
Q  16 ttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttg 115  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40619872 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtaagatgtttaggttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgtgaattgcttg 40619773  T
Q  116 tgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttg--taagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  40619772 tgctgtttctgttactgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtcgttccaaagtatt 40619694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15008309 - 15008163
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15008309 tgttgttggttatgtgaaataattatatatcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgct 15008210  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15008209 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 15008163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 15497090 - 15497247
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15497090 gcctatgttgatgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgt 15497189  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 160  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15497190 tgagaattgattgtgatgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttg 15497247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 10694955 - 10695101
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| |||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10694955 tgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10695054  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10695055 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 10695101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 10908721 - 10908867
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| |||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908721 tgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10908820  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10908821 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 10908867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10712828 - 10712695
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  10712828 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttgt 10712729  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10712728 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 10712695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10926598 - 10926465
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  10926598 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttgt 10926499  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10926498 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 10926465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 15884123 - 15884269
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15884123 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgagaattgct 15884222  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 160  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15884223 tgtgttgtttctgttgatgttgaatattgatcaagttgcagatgttg 15884269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12487683 - 12487550
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12487683 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttat 12487584  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12487583 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 12487550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 14954301 - 14954431
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  14954301 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttat 14954400  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954401 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 14954431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27533998 - 27533868
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  27533998 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttat 27533899  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 131  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27533898 gttgtgaattgcatgtgctgtttctgttgct 27533868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9556502 - 9556391
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556502 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 9556403  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  9556402 gttgtgaattgc 9556391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 17810244 - 17810134
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17810244 tcgcctatgttgttgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 17810145  T
Q  101 gttgtgaattg 111  Q
    |||||||||||    
T  17810144 gttgtgaattg 17810134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25689842 - 25689712
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  25689842 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttat 25689743  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689742 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 25689712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 14757556 - 14757667
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14757556 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 14757655  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  14757656 gttgtgaattgc 14757667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19857585 - 19857416
Alignment:
Q  5 ctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  19857585 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcataagccttatgtggagaatatatgatatttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttg 19857486  T
Q  105 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaag 173  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  19857485 tgaattacttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaggatgcaggtgttggtttaagttgtaag 19857416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 4561468 - 4561576
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4561468 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaataatgttat 4561567  T
Q  101 gttgtgaat 109  Q
    |||||||||    
T  4561568 gttgtgaat 4561576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 5757072 - 5757183
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5757072 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttggtgcttcacattaatattgttat 5757171  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    |||||| |||||    
T  5757172 gttgtggattgc 5757183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Original strand, 53631355 - 53631481
Alignment:
Q  47 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 146  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53631355 atgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 53631454  T
Q  147 agttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  53631455 agttgcaagtgttggtctaagttgtaa 53631481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14650863 - 14650697
Alignment:
Q  29 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgttt-ct 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| ||    
T  14650863 gaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgctatttcct 14650764  T
Q  126 gttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14650763 gttgttgttgaatattagtcaagctgcaagtgttggtctaagttgtaacttgtcgttccaaagtatt 14650697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26013498 - 26013377
Alignment:
Q  54 aaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct--gttgaatattgatcaagttg 151  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  26013498 aaatgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgggttgcatattgatcaagttg 26013399  T
Q  152 caggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||| |||| || ||||||||||    
T  26013398 cagatgttggtttaagttgtaa 26013377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 33742347 - 33742241
Alignment:
Q  4 cctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33742347 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatgt--cttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgct 33742250  T
Q  104 gtgaattgc 112  Q
    |||||||||    
T  33742249 gtgaattgc 33742241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 10056704 - 10056650
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaat 57  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10056704 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaat 10056650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14185040 - 14184973
Alignment:
Q  125 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  14185040 tgttgctgttgtatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaagttatctttccaaagtatt 14184973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 28385587 - 28385529
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 72  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28385587 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 28385529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15990348 - 15990254
Alignment:
Q  47 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatatt 141  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| | || ||  | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  15990348 atgtggaatatgtatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttataatgtgaattgcttgtgttgtttctgctgttgttgattatt 15990254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48603518 - 48603299
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48603518 gcctatgttgctgttgttggctatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatga 48603419  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtc--------taagttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 193  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  48603418 tggaaattgcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgttaagttgtaagttgtcgttccaaagtattca 48603319  T
Q  194 aaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48603318 aaagtattggagtcttaagt 48603299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 48520576 - 48520407
Alignment:
Q  4 cctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 103  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  48520576 cctatgttgctgctgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgatatgtt 48520477  T
Q  104 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  48520476 gtgaattgcttgtgctgtttctattgccgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaaattgtaa 48520407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 51326856 - 51326638
Alignment:
Q  5 ctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  51326856 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttg 51326757  T
Q  105 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagt-attcca 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |        ||||||||||||||| ||| |||||  |||||    
T  51326756 tgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtataagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgtttcca 51326657  T
Q  195 aagtattggagtcttaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||    
T  51326656 aagtattggagtcttaagt 51326638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 12271620 - 12271450
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||     
T  12271620 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaattttgttatgc 12271521  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12271520 tgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 12271450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 27653277 - 27653496
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27653277 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtagaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgt 27653376  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 193  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| || |    
T  27653377 tgtgaattgtttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagatgcagatgttggtctaagttataaagttgtaagttgtctttccaaagtgtttc 27653476  T
Q  194 aaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27653477 aaagtattggagtcttaagt 27653496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 46198433 - 46198590
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198433 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgaggcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 46198532  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt 170  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46198533 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt 46198590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33797584 - 33797456
Alignment:
Q  6 tatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 105  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33797584 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttcacattaatattgttatgttgt 33797485  T
Q  106 gaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33797484 gaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 33797456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 29764346 - 29764533
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  29764346 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgttttcaattaatattgttatgttgtgaattgct 29764445  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29764446 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 29764533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 50000817 - 50000658
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50000817 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgtgaattgct 50000718  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  50000717 tgtgctatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtggtaa 50000658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 1925263 - 1925396
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1925263 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttat 1925362  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1925363 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 1925396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 20924277 - 20924410
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20924277 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttat 20924376  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20924377 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 20924410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 22130961 - 22131169
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatg-tttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatg 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            | |||    
T  22130961 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttttaagttgttgatgcttc------------tcatg 22131048  T
Q  102 ttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22131049 ttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttctcgttccaaagtattc 22131148  T
Q  193 caaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  22131149 caaagtactggagtcttaagt 22131169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 20228943 - 20229076
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  20228943 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttat 20229042  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20229043 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 20229076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21407327 - 21407216
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21407327 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 21407228  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  21407227 gttgtgaattgc 21407216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 1010695 - 1010584
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010695 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 1010596  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  1010595 gttgtgaattgc 1010584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 16375593 - 16375704
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16375593 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 16375692  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  16375693 gttgtgaattgc 16375704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 52639513 - 52639402
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52639513 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtggaagatgtttgatgtctaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 52639414  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  52639413 gttgtgaattgc 52639402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 108
Target Start/End: Original strand, 13881436 - 13881541
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  13881436 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgt 13881535  T
Q  103 tgtgaa 108  Q
    ||||||    
T  13881536 tgtgaa 13881541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 20316619 - 20316532
Alignment:
Q  86 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  20316619 cattgatattgacatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagtttcaggtgttggtctaaattgtaa 20316532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 41781643 - 41781718
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtgg-aaaatgtatgatgtttaagttgttg 77  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41781643 gcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaaatgtacgatgtttaagttgttg 41781718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 213
Target Start/End: Original strand, 636090 - 636139
Alignment:
Q  164 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  636090 aagttgtaagttgtctttctaaagtattccaaagtattggattcttaagt 636139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 43543194 - 43543133
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgat 64  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  43543194 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgat 43543133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 2768 - 2987
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  2768 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgt 2867  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  2868 tgtgaattgcttgtactgtttctgttgctcttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttcc 2967  T
Q  194 aaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  2968 aaagtattggattcttaagt 2987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21232 - 21064
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21232 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcagtaatattgttatgt 21133  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgt 170  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21132 tgtgaattgcttgtgctatttttgttgctgttgaatattaatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt 21064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 127; Significance: 9e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 53893 - 54063
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  53893 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgt 53992  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53993 tgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 54063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 17461108 - 17461326
Alignment:
Q  4 cctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 103  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  17461108 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtaagatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgtt 17461207  T
Q  104 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtg-ttgtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcca 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  17461208 gtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttcca 17461307  T
Q  195 aagtattggagtcttaagt 213  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17461308 aagtattggagtcttaagt 17461326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 37515771 - 37515602
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  37515771 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatgtgccttatgtggaaaaagtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgt 37515672  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgta 171  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37515671 tgtgaattgcttgtgatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgta 37515602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18833628 - 18833458
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  18833628 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttttttatgcttctcattaatattgatatgt 18833529  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  18833528 tgtgaattgcttgtgctgtttatgttgttgttgaatattgatcaagttgtaggagttggtctaagttgtaa 18833458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 172
Target Start/End: Original strand, 19808419 - 19808587
Alignment:
Q  5 ctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 104  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  19808419 ctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatatttttatgttg 19808518  T
Q  105 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19808519 tgaattgcttgtaatggttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 19808587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 172
Target Start/End: Original strand, 22238077 - 22238243
Alignment:
Q  6 tatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 105  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  22238077 tatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaa-tgtatgatgtttaagttgttgatcctcttcattaatattgttatgttgt 22238175  T
Q  106 gaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22238176 gaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 22238243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23409861 - 23409691
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  23409861 gcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatatttaagttgttgatgttcttcattaatattgttatgt 23409762  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23409761 tgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaa 23409691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26454054 - 26453908
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26454054 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 26453955  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 160  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26453954 tgtgttgtttctgttgcagttgaatattgatcaagttgcagatgttg 26453908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21410922 - 21410789
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21410922 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttat 21410823  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21410822 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 21410789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21805414 - 21805281
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21805414 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttat 21805315  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21805314 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 21805281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 21828148 - 21828281
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  21828148 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttat 21828247  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828248 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 21828281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23478422 - 23478278
Alignment:
Q  16 ttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttg 115  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478422 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtttatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttg 23478323  T
Q  116 tgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 160  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23478322 tgctgtttcttttgatgttgaatattgatcaagttggagatgttg 23478278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19880172 - 19880026
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19880172 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgagaattgct 19880073  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 160  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19880072 tgtgttgtttctgttgatgttgaatattgaccaagttgcagatgttg 19880026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 19929556 - 19929736
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgg-gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19929556 tgttgttgattattgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattaatattgttatgctgtgaattgc 19929655  T
Q  113 ttgtgctg-tttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  19929656 ttgtgctgttttatgttgctgttgaatattaattaagttgcaagtgttggtccaagttgtaagttgttgttccaaaatatt 19929736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 18862779 - 18862909
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  18862779 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttat 18862878  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18862879 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgct 18862909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 21976804 - 21976915
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21976804 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 21976903  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  21976904 gttgtgaattgc 21976915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 22111903 - 22111792
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111903 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 22111804  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  22111803 gttgtgaattgc 22111792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 19278417 - 19278528
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19278417 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 19278516  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||| ||||||||    
T  19278517 gttctgaattgc 19278528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 43251785 - 43251674
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251785 tcgcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 43251686  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  43251685 gttgtgaattgc 43251674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 14397915 - 14398040
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14397915 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgc--------gaagatgtatgatgtttaagttgttgttgcttcacattaatattgttat 14398006  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14398007 gttgtgaattgtttgtgctgtttctgttgctgtt 14398040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 86 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22353019 - 22352932
Alignment:
Q  86 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22353019 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 22352932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23659473 - 23659371
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  23659473 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttcattaatattgttatgt 23659374  T
Q  103 tgt 105  Q
    |||    
T  23659373 tgt 23659371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 5760703 - 5760577
Alignment:
Q  47 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 146  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5760703 atgtggaatatgtatgatgttgaagttgtagttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtgttgtttctgttgttgttgaatattgatca 5760604  T
Q  147 agttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5760603 agttgcaagtgttggtctaagttgtaa 5760577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 21972719 - 21972826
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    || ||||||||||| |||||||||||    
T  21972719 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa----ttaatgcttcacataaatattgttat 21972814  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  21972815 gttgtgaattgc 21972826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 172
Target Start/End: Original strand, 44384821 - 44384894
Alignment:
Q  100 tgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44384821 tgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 44384894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Original strand, 16402057 - 16402150
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattg 96  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  16402057 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatactcttcattaatattg 16402150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 23914103 - 23914029
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttg 77  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23914103 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttg 23914029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 72
Target Start/End: Original strand, 8414418 - 8414476
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 72  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8414418 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 8414476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 11775066 - 11775008
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 72  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11775066 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 11775008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 125; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 172
Target Start/End: Original strand, 6998 - 7166
Alignment:
Q  5 ctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6998 ctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatgtatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttg 7097  T
Q  105 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7098 tgaattgtttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 7166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 169804 - 169974
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  169804 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgt 169903  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  169904 tgtgaattgcttgtactgtttctgttactgttacatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 169974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 601 - 384
Alignment:
Q  5 ctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 104  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  601 ctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttg 502  T
Q  105 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaa 195  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  501 tgaattgtttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagctgtaaagttgtaagttgtctttcaaaagtgttccaa 402  T
Q  196 agtattggagtcttaagt 213  Q
    | ||||||||||||||||    
T  401 actattggagtcttaagt 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 71367 - 71236
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71367 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 71268  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71267 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 71236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 3382 - 3552
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  3382 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgaattatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgt 3481  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3482 tgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcagatgttggtctaagttgtaa 3552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 85611 - 85441
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  85611 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcagatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgt 85512  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  85511 tgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgtaa 85441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 114; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 482 - 313
Alignment:
Q  4 cctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgtt 103  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||     
T  482 cctatgttgttgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttacgtc 383  T
Q  104 gtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  382 gtgaatttcttgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 114; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 24652 - 24820
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24652 gcctatgttgatgttgatggttatgtgaaatatttatatgccttatctggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttt-cattaatattgttatgt 24750  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttgtctaagttgtaa 172  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24751 tctgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttgtttaagttgtaa 24820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 623 - 468
Alignment:
Q  5 ctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 104  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  623 ctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttg 524  T
Q  105 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  523 tgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttg 468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15807 - 15588
Alignment:
Q  4 cctatgttgctgttgttgattatgggaaatat-ttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  15807 cctatgttgctgttgttggttatgtgaaaaatattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgt 15708  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtc--------taagttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 193  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||         ||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  15707 tgtgaattgcttgtattgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaagtgttggtcgaatttgtaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttcc 15608  T
Q  194 aaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15607 aaagtattggagtcttaagt 15588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 1929 - 2099
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  1929 gcctttgttgctgttattggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaatattgttatgt 2028  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2029 tgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttacaggtgttggtctaagttgtaa 2099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 20263 - 20396
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20263 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 20362  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20363 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 20396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31191 - 31058
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31191 tcgcctatgttgctgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 31092  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31091 gttttgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 31058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 172
Target Start/End: Original strand, 1349 - 1517
Alignment:
Q  5 ctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 104  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  1349 ctatgttgttgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttg 1448  T
Q  105 tgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1449 tgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 1517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5802 - 5615
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5802 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatagttatgttgtgaattgct 5703  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5702 tgtgatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 5615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 22477 - 22664
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22477 tgttgttgattatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 22576  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22577 tgtgctgtttttgttgctgttgaatatttatcaagttgcagatgtttgtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 22664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 1227 - 1370
Alignment:
Q  10 ttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaat 109  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  1227 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaat 1326  T
Q  110 tgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 153  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1327 tgcttgtgttgtttctgttgctgttcaatattgatcaagttgca 1370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 7978 - 8121
Alignment:
Q  10 ttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaat 109  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  7978 ttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaat 8077  T
Q  110 tgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgca 153  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8078 tgcttgtgttgtttctgttgctgttcaatattgatcaagttgca 8121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 7900 - 7731
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  7900 gcctatgttgttgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgaagtt-aagtggttgatgcttctcattaatattgacatgt 7802  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg-tctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7801 tgtgaattgtttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttgctctaaattgtaa 7731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 10139 - 10350
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||| ||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  10139 gcctatgtttctgctattggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaattttgttattt 10238  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattcc 193  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  10239 tgtgaattgcttgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgcaaagttgtaagttgtctttccaaagtgttcc 10338  T
Q  194 aaagtattggag 205  Q
    ||||||||||||    
T  10339 aaagtattggag 10350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 15469 - 15560
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatat 94  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15469 gcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcgcattaatat 15560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 207636 - 207769
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  207636 tcgcctatgttgatgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 207735  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  207736 cttgtgaattgcttgtgctgtttttgttgctgtt 207769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33261 - 33074
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33261 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgcttttaattaatattgttatgttgagaattgct 33162  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33161 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 33074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 213
Target Start/End: Original strand, 13490 - 13650
Alignment:
Q  62 gatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-g 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13490 gatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcatgtgttgg 13589  T
Q  161 tct--------aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 213  Q
    |||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13590 tctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtctaaagt 13650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 67324 - 67161
Alignment:
Q  6 tatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgt 105  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  67324 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgaataatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgt 67225  T
Q  106 gaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  67224 gaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatccagttgcaggtgttggtctaagtt 67161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 6957 - 7127
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| |     
T  6957 gcctatgttactgttgttggttatgtgaaatttttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatactgttacga 7056  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7057 tgtgtattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 7127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 367 - 234
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  367 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttat 268  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  267 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 11635 - 11768
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11635 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttat 11734  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11735 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 36220 - 36353
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  36220 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttat 36319  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36320 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 36353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 189511 - 189644
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  189511 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttat 189610  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189611 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 189644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10564 - 10378
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10564 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttta-gtttttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10466  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggt----------gttgtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10465 tgtgctatttctgttgctgttgaatattcatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 10378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 39320 - 39205
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39320 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 39221  T
Q  101 gttgtgaattgcttgt 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  39220 gttgtgaattgcttgt 39205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 32794 - 32927
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32794 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttat 32893  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32894 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 32927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4215
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||  |||||  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4374 tgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 4275  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4274 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaa 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4215
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||||||| ||||  |||||  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4374 tgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 4275  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4274 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaa 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15063 - 14906
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||| || |||   ||| ||||||| ||||     
T  15063 gcctatgttggtgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgggaaaaatgtatgatgttaaagttgtagacgctctccataaatattgatatga 14964  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttg 160  Q
    ||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  14963 tgaaaattgcttgcactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagtcgcacgtgttg 14906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 225 - 49
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  225 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttaggtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgt 126  T
Q  103 tgtgaattgcttgtgctgtttc------tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||| |||| |||||||      ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  125 tgtgaattgtttgtactgtttctgtttctgttgctgttgcatattaagcaagttgcaggtgttggtctaatttgtaa 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 14221 - 14354
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  14221 tcgcctatgttcctgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttat 14320  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14321 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 14354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 80687 - 80554
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  80687 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttat 80588  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  80587 gttgtgaattgattgtgctatttctgttgctgtt 80554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 61746 - 61857
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61746 tcgcctatgttgctgttgttgaatatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 61845  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  61846 gttgtgaattgc 61857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 65662 - 65773
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65662 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 65761  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  65762 gttgtgaattgc 65773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 58853 - 58964
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58853 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 58952  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  58953 gttgtgaattgc 58964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Original strand, 6851 - 6977
Alignment:
Q  47 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6851 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgatgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatca 6950  T
Q  147 agttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6951 agttgcaggtgttggtctaagttgtaa 6977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 62
Target Start/End: Original strand, 4324 - 4383
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatg 62  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  4324 gcctattttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatacgttatgtggaaaatgtatg 4383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Original strand, 70536 - 70689
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 113  Q
    |||| ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  70536 tgttcttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 70635  T
Q  114 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||| ||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  70636 tgtgttgtttctgttgc------atattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 70689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7710 - 7544
Alignment:
Q  29 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgttt-ct 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||    
T  7710 gaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgttgtttcct 7611  T
Q  126 gttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7610 attgctgttgaatattaatcaagttgcaagtgttggtctgagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 7544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 5235 - 5346
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5235 tcgcctatgttgctgatgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 5334  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  5335 gttgtgaattgc 5346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 12394 - 12283
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12394 tcgcctatgttgctattgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 12295  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  12294 gttgtgaattgc 12283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 36076 - 36208
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  36076 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttat 36175  T
Q  101 gttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttg 135  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  36176 gttgtgaattgcatgtgctgtt--tgttgctgttg 36208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 57008 - 56842
Alignment:
Q  29 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgttt-ct 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||| ||    
T  57008 gaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtcgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgtttatgtgttgtttcct 56909  T
Q  126 gttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56908 gttgctgttgaatattaatcaagttgcaagtgttggtctaagttgtaagttgtcgttccaaagtatt 56842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 422 - 311
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  422 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaagatgtttgatgtttaagttattgatgcttcacattaatattgttat 323  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  322 gttgtgaattgc 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 4009 - 4119
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4009 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttaatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 4108  T
Q  101 gttgtgaattg 111  Q
    ||| |||||||    
T  4109 gttatgaattg 4119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15622 - 15470
Alignment:
Q  29 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgttt-ct 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||    
T  15622 gaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgatgtgaattgcttatgtgctgtttcct 15523  T
Q  126 gttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgt 177  Q
      || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15522 aatgttgttgaatattaatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgt 15470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20774 - 20652
Alignment:
Q  97 ttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtct--------aagttgtaagttgtcgttctaaag 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||| ||||    
T  20774 ttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaag 20675  T
Q  188 tattccaaagtattggagtctta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20674 tattccaaagtattggagtctta 20652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 20816 - 20769
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgt 50  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20816 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgt 20769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 67436 - 67546
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67436 tcgcctatgttgttgttgttggttatgt-aaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttat 67534  T
Q  101 gttgtgaattgc 112  Q
    ||||||||||||    
T  67535 gttgtgaattgc 67546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Original strand, 1349 - 1475
Alignment:
Q  47 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 146  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1349 atgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatca 1448  T
Q  147 agttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1449 agttgcaagtgttggtctaagttgtaa 1475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6932 - 6854
Alignment:
Q  56 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6932 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 6854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 80469 - 80564
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattg 96  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80469 tcgcctatgttgctgttgttggttatatgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattg 80564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 134
Target Start/End: Original strand, 80562 - 80621
Alignment:
Q  75 ttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80562 ttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 80621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Original strand, 166429 - 166595
Alignment:
Q  29 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgttt-ct 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| ||    
T  166429 gaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgctatttcct 166528  T
Q  126 gttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  166529 gttgttgttgaatattagtcaagctgcaagtgttggtctaagttgtaacttgtcgttccaaagtatt 166595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 78386 - 78299
Alignment:
Q  86 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  78386 cattaatattgctatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 78299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 17641 - 17559
Alignment:
Q  1 tcgcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctt 83  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17641 tcgcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctt 17559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Original strand, 6214 - 6291
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatg 80  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6214 gcctatgttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatgtggaaaatatacgatgtttaagttgttgatg 6291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 105146 - 105078
Alignment:
Q  3 gcctatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaag 71  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  105146 gcctatgttgttgttgtcggttatgcgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaag 105078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10534 - 10467
Alignment:
Q  125 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10534 tgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 10467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9048 - 8934
Alignment:
Q  29 gaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct--tgtgctgtttctg 126  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||  || |||  |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||  | ||    
T  9048 gaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtgaattcttatcattgatattgttatgttgtgaattacttatgtgctgcctatg 8949  T
Q  127 ttgctgttgaatatt 141  Q
    ||||||||| |||||    
T  8948 ttgctgttgtatatt 8934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3599 - 3550
Alignment:
Q  164 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3599 aagttgtaagttgtcgttccaaagtattcgaaagtattggagtcttaagt 3550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7663 - 7614
Alignment:
Q  164 aagttgtaagttgtcgttctaaagtattccaaagtattggagtcttaagt 213  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7663 aagttgtaagttgtctttccaaagtattctaaagtattggagtcttaagt 7614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8092 - 8028
Alignment:
Q  125 tgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaagttgtcgttctaaagt 188  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8092 tgttgctgttgcatattgataaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagt 8028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 168
Target Start/End: Original strand, 11567 - 11692
Alignment:
Q  47 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaat-attgttatgttgtgaattgctt--gtgctgtttctgttgctgttgaatattga 143  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || ||  |||| || |||| |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  11567 atgtgaaaagtgtatgatgttgaagttgttgttgattatcattgattattgatatgttgtgagttgcttacgtgctgcctctgttgttgttgaatattga 11666  T
Q  144 tcaagttgcaggtgtt-gtctaagtt 168  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||    
T  11667 ttaagttgcaagtgttggtctaagtt 11692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 168782 - 168724
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 72  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  168782 tgttgttgcttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 168724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 176136 - 176078
Alignment:
Q  14 tgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 72  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  176136 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 176078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 126945 - 126896
Alignment:
Q  143 atcaagttgcaggtgttg-tctaagttgtaagttgtcgttctaaagtatt 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  126945 atcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaagttgtctttccaaagtatt 126896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21894 - 21847
Alignment:
Q  126 gttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtt-gtctaagttgtaa 172  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21894 gttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 21847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 64
Target Start/End: Original strand, 36088 - 36146
Alignment:
Q  6 tatgttgctgttgttgattatgggaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgat 64  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  36088 tatgttgctgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgat 36146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University