View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8901_high_13 (Length: 461)

Name: NF8901_high_13
Description: NF8901
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8901_high_13
NF8901_high_13
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (191-454)||(18531029-18531292)
chr5 (197-454)||(22053801-22054058)
chr5 (230-454)||(23507003-23507227)
chr5 (200-454)||(27182518-27182772)
chr5 (225-454)||(34939316-34939544)
chr5 (259-443)||(29188302-29188486)
chr5 (260-426)||(27009907-27010074)
chr5 (260-426)||(43443414-43443581)
chr5 (261-426)||(4200005-4200171)
chr5 (230-360)||(20623101-20623231)
chr5 (230-360)||(21233529-21233659)
chr5 (260-426)||(18778011-18778178)
chr5 (230-325)||(37052911-37053006)
chr5 (231-325)||(25900408-25900502)
chr5 (243-426)||(19499965-19500149)
chr5 (243-426)||(22366483-22366667)
chr5 (243-426)||(25426694-25426878)
chr5 (230-325)||(16536364-16536459)
chr5 (243-426)||(12440-12624)
chr5 (243-426)||(21073597-21073781)
chr5 (244-448)||(32950737-32950943)
chr5 (95-154)||(18530935-18530994)
chr5 (370-455)||(23493955-23494040)
chr5 (364-452)||(7728459-7728547)
chr5 (99-154)||(22053704-22053759)
chr5 (246-455)||(5450844-5451054)
chr5 (279-448)||(11212107-11212277)
chr5 (372-455)||(21222736-21222819)
chr5 (372-447)||(35791235-35791310)
chr5 (245-455)||(23981516-23981727)
chr5 (245-328)||(21310709-21310793)
chr5 (263-455)||(22885678-22885871)
chr5 (364-455)||(432499-432590)
chr5 (245-455)||(19862245-19862456)
chr5 (245-327)||(29918129-29918212)
chr5 (370-455)||(21617052-21617137)
chr5 (371-455)||(16835426-16835510)
chr5 (100-154)||(108680-108734)
chr5 (362-452)||(1168322-1168412)
chr5 (353-443)||(21650743-21650833)
chr5 (362-447)||(20712120-20712205)
chr5 (359-424)||(21906784-21906849)
chr5 (370-455)||(37983400-37983485)
chr5 (364-424)||(3673929-3673989)
chr5 (110-154)||(17909849-17909893)
chr5 (245-328)||(21297175-21297259)
chr5 (372-420)||(28902262-28902310)
chr5 (372-420)||(28938657-28938705)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (191-454)||(15675051-15675314)
chr4 (191-424)||(10104212-10104445)
chr4 (256-454)||(31115667-31115865)
chr4 (200-454)||(13246468-13246722)
chr4 (200-454)||(54118215-54118469)
chr4 (230-391)||(121990-122151)
chr4 (260-426)||(10644285-10644452)
chr4 (230-454)||(26680239-26680462)
chr4 (245-424)||(40885570-40885749)
chr4 (230-426)||(13048222-13048419)
chr4 (191-301)||(33240891-33241001)
chr4 (230-325)||(10488729-10488824)
chr4 (230-325)||(16327927-16328022)
chr4 (243-426)||(47357720-47357904)
chr4 (244-448)||(17145664-17145869)
chr4 (244-435)||(7850056-7850248)
chr4 (95-154)||(15674956-15675015)
chr4 (95-154)||(33241037-33241096)
chr4 (191-263)||(31132543-31132615)
chr4 (279-448)||(8374552-8374722)
chr4 (95-154)||(10104117-10104176)
chr4 (364-455)||(15044864-15044955)
chr4 (95-154)||(31132651-31132710)
chr4 (263-455)||(18238175-18238368)
chr4 (370-452)||(13809636-13809718)
chr4 (362-448)||(18248262-18248348)
chr4 (394-454)||(111433-111493)
chr4 (244-455)||(15013282-15013493)
chr4 (372-455)||(15109477-15109560)
chr4 (364-455)||(52265628-52265719)
chr4 (364-454)||(41166066-41166156)
chr4 (362-443)||(12837318-12837399)
chr4 (362-443)||(30232614-30232695)
chr4 (267-455)||(38764745-38764934)
chr4 (246-328)||(15109350-15109433)
chr4 (362-452)||(21959581-21959671)
chr4 (370-455)||(18276470-18276555)
chr4 (384-452)||(27961010-27961078)
chr4 (95-154)||(13246763-13246822)
chr4 (364-455)||(13590194-13590285)
chr4 (246-328)||(15044991-15045074)
chr4 (364-455)||(41256489-41256580)
chr4 (364-455)||(41916846-41916937)
chr4 (100-154)||(15135859-15135913)
chr4 (100-154)||(15272163-15272217)
chr4 (362-452)||(16732208-16732298)
chr4 (370-455)||(7185970-7186055)
chr4 (263-334)||(7964730-7964802)
chr4 (110-154)||(18248551-18248595)
chr4 (245-328)||(18276597-18276681)
chr4 (404-452)||(37957185-37957233)
chr4 (245-328)||(47535065-47535149)
[»] scaffold0025 (6 HSPs)
scaffold0025 (191-454)||(8887-9150)
scaffold0025 (201-454)||(148759-149012)
scaffold0025 (95-154)||(9186-9245)
scaffold0025 (362-443)||(146649-146730)
scaffold0025 (246-328)||(53509-53592)
scaffold0025 (95-154)||(146932-146991)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (191-454)||(24341351-24341614)
chr2 (200-454)||(36982412-36982666)
chr2 (230-442)||(462788-463000)
chr2 (225-454)||(25265386-25265615)
chr2 (200-454)||(8891280-8891534)
chr2 (200-454)||(43642928-43643182)
chr2 (244-454)||(19794719-19794929)
chr2 (230-454)||(20627314-20627538)
chr2 (279-454)||(7507894-7508069)
chr2 (230-426)||(17396654-17396850)
chr2 (230-360)||(19689402-19689532)
chr2 (230-360)||(23820203-23820333)
chr2 (230-325)||(14906441-14906536)
chr2 (243-426)||(19886663-19886847)
chr2 (230-325)||(20015178-20015273)
chr2 (95-154)||(24341256-24341315)
chr2 (263-455)||(9636781-9636974)
chr2 (364-455)||(68028-68119)
chr2 (245-455)||(19669109-19669320)
chr2 (362-448)||(21141939-21142025)
chr2 (362-452)||(24571409-24571500)
chr2 (252-455)||(24884722-24884926)
chr2 (364-455)||(43645929-43646020)
chr2 (100-154)||(21273901-21273955)
chr2 (370-455)||(23821731-23821816)
chr2 (370-455)||(23830810-23830895)
chr2 (364-455)||(25305481-25305573)
chr2 (246-328)||(68155-68238)
chr2 (406-455)||(3403-3452)
chr2 (263-327)||(19660044-19660109)
chr2 (364-445)||(36890805-36890886)
chr2 (245-328)||(19666691-19666775)
chr2 (364-452)||(31146301-31146388)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (200-454)||(19244-19498)
scaffold0195 (230-454)||(21328-21552)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (230-454)||(51158019-51158243)
chr3 (230-454)||(15859025-15859249)
chr3 (230-454)||(2049848-2050072)
chr3 (233-454)||(13838932-13839153)
chr3 (230-454)||(12030148-12030372)
chr3 (238-454)||(15936636-15936852)
chr3 (230-443)||(14842562-14842775)
chr3 (238-454)||(15938478-15938694)
chr3 (230-454)||(17912484-17912706)
chr3 (259-454)||(15614872-15615067)
chr3 (260-426)||(16821205-16821372)
chr3 (243-426)||(55316285-55316469)
chr3 (230-426)||(13975723-13975919)
chr3 (230-426)||(45860871-45861067)
chr3 (243-426)||(41270141-41270325)
chr3 (230-325)||(2449239-2449334)
chr3 (230-426)||(13954891-13955087)
chr3 (244-454)||(16744130-16744339)
chr3 (244-448)||(11986181-11986386)
chr3 (377-454)||(47984688-47984765)
chr3 (377-454)||(48003262-48003339)
chr3 (377-454)||(47993975-47994052)
chr3 (377-454)||(48012548-48012625)
chr3 (200-294)||(19231979-19232073)
chr3 (266-453)||(14814786-14814974)
chr3 (233-420)||(54651529-54651717)
chr3 (372-445)||(16880169-16880242)
chr3 (362-443)||(17100701-17100782)
chr3 (362-443)||(17101386-17101467)
chr3 (364-452)||(11329081-11329169)
chr3 (372-448)||(12264929-12265005)
chr3 (245-299)||(14080701-14080756)
chr3 (380-455)||(15876104-15876179)
chr3 (362-455)||(11061123-11061217)
chr3 (370-452)||(14059339-14059421)
chr3 (362-448)||(44229029-44229115)
chr3 (364-452)||(12488846-12488934)
chr3 (370-445)||(12560362-12560437)
chr3 (362-452)||(14295477-14295568)
chr3 (362-452)||(14301104-14301195)
chr3 (377-452)||(17139547-17139622)
chr3 (364-455)||(39656562-39656653)
chr3 (377-447)||(14528145-14528215)
chr3 (200-443)||(19260796-19261038)
chr3 (263-329)||(3576456-3576523)
chr3 (408-455)||(9590918-9590965)
chr3 (95-154)||(12030020-12030079)
chr3 (404-455)||(38811168-38811219)
chr3 (246-328)||(47784767-47784850)
chr3 (245-327)||(4145814-4145896)
chr3 (362-424)||(12349657-12349719)
chr3 (353-443)||(16261501-16261591)
chr3 (353-443)||(38167962-38168052)
chr3 (353-443)||(53771089-53771179)
chr3 (100-154)||(53771391-53771445)
chr3 (362-424)||(54424079-54424141)
chr3 (370-455)||(12953000-12953085)
chr3 (370-455)||(47784873-47784958)
chr3 (95-151)||(5240576-5240632)
chr3 (245-328)||(17191704-17191788)
chr3 (245-328)||(17204844-17204928)
chr3 (110-154)||(19947052-19947096)
chr3 (265-328)||(34560062-34560126)
chr3 (383-455)||(50313223-50313295)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (225-454)||(47481027-47481256)
chr7 (200-454)||(11580709-11580964)
chr7 (238-455)||(16211803-16212020)
chr7 (238-454)||(18253844-18254060)
chr7 (225-454)||(13321052-13321283)
chr7 (200-454)||(3060004-3060256)
chr7 (201-454)||(36052705-36052955)
chr7 (200-454)||(13036985-13037239)
chr7 (259-454)||(16478980-16479175)
chr7 (230-454)||(7293055-7293278)
chr7 (230-426)||(25292339-25292535)
chr7 (269-447)||(296006-296185)
chr7 (260-426)||(13572742-13572909)
chr7 (261-426)||(13911044-13911211)
chr7 (261-426)||(2437523-2437689)
chr7 (230-360)||(11516359-11516489)
chr7 (230-360)||(15441565-15441695)
chr7 (230-360)||(30262130-30262260)
chr7 (243-426)||(10989476-10989659)
chr7 (95-154)||(36024479-36024538)
chr7 (191-261)||(36024372-36024442)
chr7 (95-154)||(15709495-15709554)
chr7 (362-455)||(13274823-13274917)
chr7 (372-455)||(13377565-13377648)
chr7 (95-154)||(25124476-25124535)
chr7 (245-455)||(9838915-9839126)
chr7 (370-455)||(9611343-9611428)
chr7 (243-328)||(48622672-48622757)
chr7 (245-328)||(16914928-16915012)
chr7 (95-154)||(11580608-11580667)
chr7 (362-456)||(13863047-13863142)
chr7 (95-154)||(36052997-36053056)
chr7 (364-455)||(46474037-46474128)
chr7 (362-452)||(49047791-49047882)
chr7 (100-154)||(2190037-2190091)
chr7 (353-443)||(3049631-3049721)
chr7 (191-241)||(15709409-15709459)
chr7 (362-443)||(3895073-3895154)
chr7 (285-455)||(13448868-13449038)
chr7 (362-442)||(16570123-16570204)
chr7 (362-442)||(16595458-16595539)
chr7 (370-455)||(16915054-16915139)
chr7 (370-455)||(48356680-48356765)
chr7 (263-455)||(4484763-4484956)
chr7 (245-328)||(9611471-9611555)
chr7 (267-455)||(20583576-20583765)
chr7 (364-455)||(9723927-9724018)
chr7 (246-328)||(13377692-13377775)
chr7 (95-154)||(16212097-16212156)
chr7 (364-455)||(17224058-17224149)
chr7 (364-455)||(17947712-17947803)
chr7 (364-455)||(31501209-31501300)
chr7 (362-452)||(11287456-11287546)
chr7 (362-452)||(12759026-12759116)
chr7 (100-154)||(42056140-42056194)
chr7 (263-328)||(48356807-48356873)
chr7 (364-453)||(16919597-16919686)
chr7 (364-445)||(26070384-26070465)
chr7 (364-445)||(26094171-26094252)
chr7 (263-327)||(28722274-28722339)
chr7 (407-455)||(14272049-14272097)
chr7 (95-151)||(17817307-17817363)
chr7 (95-151)||(19049638-19049694)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (200-454)||(23153485-23153739)
chr6 (230-454)||(35009440-35009664)
chr6 (225-454)||(1657744-1657972)
chr6 (225-454)||(15862511-15862738)
chr6 (230-454)||(14626119-14626343)
chr6 (259-454)||(1650123-1650318)
chr6 (230-424)||(29665941-29666136)
chr6 (353-454)||(27740876-27740977)
chr6 (243-426)||(25175629-25175813)
chr6 (243-426)||(27653985-27654169)
chr6 (243-426)||(16825754-16825940)
chr6 (225-314)||(27751603-27751692)
chr6 (364-455)||(18381803-18381894)
chr6 (364-452)||(18398977-18399065)
chr6 (364-455)||(22361885-22361976)
chr6 (364-446)||(25367357-25367439)
chr6 (370-455)||(25651273-25651358)
chr6 (245-455)||(29605486-29605696)
chr6 (245-328)||(16887792-16887876)
chr6 (245-328)||(18629608-18629692)
chr6 (263-327)||(17083216-17083280)
chr6 (359-443)||(18777194-18777278)
chr6 (263-455)||(34966903-34967096)
chr6 (364-455)||(29160423-29160514)
chr6 (245-299)||(35136013-35136068)
chr6 (353-443)||(23994971-23995061)
chr6 (100-154)||(23995273-23995327)
chr6 (244-328)||(17557017-17557101)
chr6 (364-424)||(31628335-31628395)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (243-454)||(3000-3212)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (200-454)||(5033-5286)
[»] scaffold0266 (4 HSPs)
scaffold0266 (232-445)||(3585-3798)
scaffold0266 (200-454)||(1162-1414)
scaffold0266 (95-154)||(1456-1515)
scaffold0266 (95-154)||(3455-3514)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (225-454)||(41686-41915)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (230-454)||(34461-34686)
scaffold0075 (364-452)||(4980-5068)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (230-454)||(20931383-20931607)
chr1 (200-454)||(20445717-20445971)
chr1 (200-454)||(20893597-20893851)
chr1 (200-454)||(37844421-37844676)
chr1 (200-454)||(20531482-20531736)
chr1 (238-454)||(41394260-41394476)
chr1 (231-454)||(20913075-20913291)
chr1 (259-454)||(2116292-2116488)
chr1 (259-428)||(45051487-45051656)
chr1 (279-443)||(22227858-22228022)
chr1 (279-443)||(22232555-22232719)
chr1 (243-426)||(18601120-18601304)
chr1 (243-426)||(5072390-5072574)
chr1 (230-360)||(51452624-51452754)
chr1 (245-455)||(22143361-22143572)
chr1 (370-455)||(17608964-17609049)
chr1 (362-443)||(27329873-27329954)
chr1 (370-455)||(37233986-37234071)
chr1 (95-154)||(20446013-20446072)
chr1 (95-154)||(20913361-20913420)
chr1 (245-455)||(21195050-21195261)
chr1 (372-424)||(16645979-16646031)
chr1 (364-455)||(20177211-20177302)
chr1 (95-154)||(20531777-20531836)
chr1 (95-154)||(20931676-20931735)
chr1 (362-424)||(35522437-35522499)
chr1 (404-450)||(38033834-38033880)
chr1 (359-452)||(51627778-51627872)
chr1 (398-455)||(41229093-41229150)
chr1 (372-420)||(16656709-16656757)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (200-454)||(26387-26640)
scaffold0162 (225-454)||(8176-8402)
scaffold0162 (394-455)||(7175-7236)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (201-454)||(36885-37138)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (201-454)||(43373440-43373693)
chr8 (238-454)||(16193725-16193941)
chr8 (230-454)||(16404976-16405197)
chr8 (259-454)||(6774276-6774471)
chr8 (225-454)||(17345608-17345836)
chr8 (259-454)||(24549020-24549215)
chr8 (230-454)||(24928792-24929016)
chr8 (230-454)||(22907215-22907438)
chr8 (243-426)||(30120788-30120972)
chr8 (260-426)||(21844591-21844758)
chr8 (260-426)||(21851984-21852151)
chr8 (230-360)||(5238219-5238349)
chr8 (230-360)||(24661249-24661379)
chr8 (230-360)||(43685678-43685808)
chr8 (243-426)||(16674394-16674578)
chr8 (304-426)||(222754-222877)
chr8 (304-426)||(736377-736500)
chr8 (304-426)||(860272-860395)
chr8 (364-455)||(23837234-23837325)
chr8 (245-455)||(26011530-26011741)
chr8 (372-447)||(16195275-16195350)
chr8 (364-455)||(29306453-29306544)
chr8 (377-455)||(5854650-5854728)
chr8 (370-447)||(39446892-39446969)
chr8 (305-455)||(45558998-45559148)
chr8 (263-455)||(15933334-15933527)
chr8 (263-455)||(18261489-18261682)
chr8 (95-154)||(24385599-24385658)
chr8 (95-154)||(43373339-43373398)
chr8 (364-450)||(22735958-22736044)
chr8 (370-452)||(38533688-38533770)
chr8 (252-299)||(23226083-23226131)
chr8 (246-328)||(17285367-17285450)
chr8 (364-423)||(20654025-20654084)
chr8 (364-455)||(21198272-21198363)
chr8 (408-455)||(23226240-23226287)
chr8 (353-423)||(20561740-20561810)
chr8 (353-423)||(20647938-20648008)
chr8 (260-325)||(16195399-16195464)
chr8 (245-286)||(23158367-23158408)
chr8 (370-455)||(27233193-27233278)
chr8 (245-328)||(21198152-21198236)
chr8 (245-328)||(25296321-25296405)
chr8 (245-328)||(25758341-25758425)
chr8 (364-452)||(41246697-41246785)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (225-454)||(13544-13773)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (238-454)||(8916-9132)
scaffold0498 (95-154)||(9209-9268)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (230-454)||(41767-41991)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (230-454)||(48636-48860)
scaffold0023 (262-426)||(36159-36324)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (232-454)||(48225-48447)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (230-454)||(123165-123389)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (230-454)||(171943-172167)
scaffold0001 (230-454)||(177646-177870)
scaffold0001 (95-154)||(172236-172295)
scaffold0001 (95-154)||(177939-177998)
scaffold0001 (364-424)||(60873-60933)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (230-443)||(957-1169)
scaffold0175 (353-443)||(14997-15087)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (238-454)||(107785-108001)
scaffold0026 (260-426)||(64542-64714)
scaffold0026 (244-295)||(89863-89915)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (230-454)||(128170-128393)
scaffold0008 (262-426)||(31696-31862)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (230-437)||(6065-6271)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (200-454)||(247413-247667)
scaffold0012 (364-441)||(34286-34363)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (230-454)||(535-759)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (230-443)||(12164-12375)
scaffold0302 (95-131)||(12467-12503)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (260-454)||(9368-9562)
scaffold0215 (260-454)||(16266-16460)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (254-454)||(272063-272263)
scaffold0009 (370-455)||(69493-69578)
scaffold0009 (95-154)||(272356-272415)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (279-445)||(5254-5420)
scaffold0022 (364-452)||(109629-109717)
scaffold0022 (370-452)||(103048-103130)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (230-424)||(51183-51377)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (200-424)||(89425-89649)
scaffold0028 (95-154)||(89325-89384)
scaffold0028 (95-154)||(107655-107714)
scaffold0028 (245-455)||(79575-79786)
scaffold0028 (200-280)||(107755-107835)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (279-443)||(3771-3936)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (233-426)||(5594-5788)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (261-391)||(13345-13475)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (264-426)||(43063-43226)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (261-443)||(21136-21318)
scaffold0139 (260-426)||(14080-14246)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (260-426)||(101-268)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (230-454)||(37067-37290)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (244-448)||(56114-56319)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (279-447)||(45075-45244)
scaffold0066 (279-448)||(54460-54630)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (230-325)||(26962-27057)
scaffold0141 (233-325)||(22707-22799)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (230-325)||(1583-1678)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (243-376)||(1306-1439)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (225-424)||(3257-3457)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (245-451)||(22422-22629)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (394-454)||(9420-9480)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (245-455)||(76847-77058)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (362-455)||(4599-4693)
scaffold0447 (362-455)||(9213-9307)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (245-328)||(8173-8257)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (103-154)||(10211-10262)
scaffold0467 (233-325)||(10335-10427)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (353-455)||(33698-33800)
[»] scaffold0700 (2 HSPs)
scaffold0700 (370-455)||(2561-2646)
scaffold0700 (245-328)||(2688-2772)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (370-447)||(33854-33931)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (362-455)||(46201-46294)
scaffold0034 (362-455)||(40694-40787)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (370-455)||(197379-197464)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (263-455)||(7693-7886)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (364-452)||(109582-109670)
scaffold0035 (359-452)||(118078-118171)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (245-328)||(104623-104707)
scaffold0032 (245-328)||(93773-93857)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (362-452)||(8999-9090)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (362-455)||(7207-7302)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (372-455)||(5976-6059)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (364-455)||(2436-2527)
scaffold0243 (246-328)||(2317-2400)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (364-455)||(35514-35605)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (362-448)||(7582-7668)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (245-455)||(30000-30211)
scaffold0165 (378-455)||(22035-22112)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (245-298)||(70307-70361)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (362-443)||(24846-24927)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (370-455)||(31056-31141)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (364-452)||(348-436)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (245-328)||(1348-1432)
scaffold0409 (245-328)||(9603-9687)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (245-328)||(22429-22513)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (364-452)||(85371-85459)
scaffold0014 (353-444)||(159346-159438)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (408-455)||(2491-2538)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (281-328)||(3578-3625)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (95-154)||(193344-193403)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (362-424)||(211-273)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (366-452)||(698-784)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (353-443)||(1095-1185)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (263-328)||(6824-6890)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (246-299)||(10854-10908)
[»] scaffold0251 (3 HSPs)
scaffold0251 (100-154)||(13237-13291)
scaffold0251 (353-443)||(13503-13593)
scaffold0251 (353-443)||(21477-21567)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (362-424)||(10004-10066)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (362-452)||(132368-132458)
scaffold0021 (362-443)||(88323-88404)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (245-286)||(1546-1587)
scaffold0456 (245-286)||(8691-8732)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (370-455)||(37594-37679)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (386-443)||(48563-48620)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (370-447)||(70657-70734)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (279-328)||(54039-54088)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (364-424)||(1384-1444)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (110-154)||(18052-18096)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (245-328)||(43798-43882)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 191 - 454
Target Start/End: Original strand, 18531029 - 18531292
Alignment:
Q  191 ttttacaatttttcaaatgtgatatgaattttttataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattga 290  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531029 ttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattga 18531128  T
Q  291 tgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgt 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531129 tgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgt 18531228  T
Q  391 ttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531229 tgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 18531292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 197 - 454
Target Start/End: Original strand, 22053801 - 22054058
Alignment:
Q  197 aatttttcaaatgtgatatgaattttttataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataa 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  22053801 aatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatag 22053900  T
Q  297 ttgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaatt 396  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22053901 ttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaatt 22054000  T
Q  397 gagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22054001 gagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 22054058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 23507227 - 23507003
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  23507227 tggataattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 23507128  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |     
T  23507127 tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggt 23507028  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  23507027 tgttaattgatgttgtggttgatga 23507003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Original strand, 27182518 - 27182772
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27182518 ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataat-ggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataatt 27182616  T
Q  299 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattga 398  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| || | | ||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27182617 gtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattga 27182716  T
Q  399 gatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27182717 gttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 27182772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 225 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 34939544 - 34939316
Alignment:
Q  225 ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgt 324  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34939544 ataaatggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgt 34939445  T
Q  325 tcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  34939444 tcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagtcattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgtt 34939346  T
Q  425 attgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34939345 attgctgttaattgatgttgttgttgatga 34939316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 259 - 443
Target Start/End: Original strand, 29188302 - 29188486
Alignment:
Q  259 actgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattg 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||| |    
T  29188302 actgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatgg 29188401  T
Q  359 tgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  29188402 tgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgtt 29188486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 27010074 - 27009907
Alignment:
Q  260 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgt 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || || |||| |||||    
T  27010074 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 27009975  T
Q  360 gttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
      ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  27009974 actcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttat 27009907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 426
Target Start/End: Original strand, 43443414 - 43443581
Alignment:
Q  260 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgt 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |  || || |||| |||||    
T  43443414 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgt 43443513  T
Q  360 gttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  43443514 gctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttat 43443581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 426
Target Start/End: Original strand, 4200005 - 4200171
Alignment:
Q  261 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |  || || |||| ||| ||    
T  4200005 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 4200104  T
Q  361 ttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     | ||||||||||||| |  || ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4200105 ctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttat 4200171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20623231 - 20623101
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  20623231 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa 20623132  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||| |||| |  || || |||||||||||    
T  20623131 tatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 20623101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 360
Target Start/End: Original strand, 21233529 - 21233659
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  21233529 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa 21233628  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||| |||| |  || || |||||||||||    
T  21233629 tatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 21233659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 260 - 426
Target Start/End: Original strand, 18778011 - 18778178
Alignment:
Q  260 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgt 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |  || || |||| |||||    
T  18778011 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 18778110  T
Q  360 gttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    | | ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  18778111 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 18778178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37053006 - 37052911
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 325  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  37053006 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 37052911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 325
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900502
Alignment:
Q  231 ggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 325  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtt 25900502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19500149 - 19499965
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |     
T  19500149 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 19500050  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     || || |||| |||||| | || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  19500049 taagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 19499965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Original strand, 22366483 - 22366667
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |     
T  22366483 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 22366582  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     || || |||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||| | ||||||| |||||||||    
T  22366583 taagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttat 22366667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 25426878 - 25426694
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |     
T  25426878 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 25426779  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     || || |||| |||||| | || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  25426778 taagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 25426694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16536459 - 16536364
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 325  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16536459 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 16536364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 12624 - 12440
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |     
T  12624 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtga 12525  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     || || |||| |||||| | || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  12524 taagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 12440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Original strand, 21073597 - 21073781
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |     
T  21073597 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 21073696  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     || || |||| |||||| | || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  21073697 taagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 21073781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 32950943 - 32950737
Alignment:
Q  244 taaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc--aattatgtaaaaaag 341  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||| || || || |||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||   || |||||| ||| |    
T  32950943 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtatgtataaagg 32950844  T
Q  342 tgaaa-ttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgat 440  Q
    | ||| || ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  32950843 tcaaagttatgaaa-ttgtgctcaaatggtgaattttactatgttgttgttgaaaagagatgtgattcatgttccattgatgttgatgctattaactgat 32950745  T
Q  441 gttgttgt 448  Q
    ||||||||    
T  32950744 gttgttgt 32950737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Original strand, 18530935 - 18530994
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530935 ttggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 18530994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 23494040 - 23493955
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  23494040 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgat 23493955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 7728547 - 7728459
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||    
T  7728547 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 7728459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 154
Target Start/End: Original strand, 22053704 - 22053759
Alignment:
Q  99 agtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22053704 agtgagcttaggagctaaagtgaagtctaagttgaggttaatcataatctaaggta 22053759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 455
Target Start/End: Original strand, 5450844 - 5451054
Alignment:
Q  246 aattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat-tatgtaaaaaagtg 343  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||  ||||  | ||||||    
T  5450844 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg--agaaagtg 5450941  T
Q  344 aaat-tgtgaaaattgtgttcaa-ttggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 441  Q
    | || |||  || || || |||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||||| ||| || ||| |||||    
T  5450942 atatatgttgaa-ttatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataaaattcatgttcaactgatgttgttgttgctaagtgatg 5451040  T
Q  442 ttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| |||||||    
T  5451041 ttgttgatgatgat 5451054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 448
Target Start/End: Original strand, 11212107 - 11212277
Alignment:
Q  279 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc--aattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt 376  Q
    |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||   || | |||| ||| || || || ||||| || |  |||| | ||||||||    
T  11212107 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtgtgtataaatgttaagttatgaaa-ttatactcaagtagtgaattt 11212205  T
Q  377 tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 448  Q
    |  || ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  11212206 taatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgt 11212277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 455
Target Start/End: Original strand, 21222736 - 21222819
Alignment:
Q  372 aattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  21222736 aattgtgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattaatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 21222819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 447
Target Start/End: Original strand, 35791235 - 35791310
Alignment:
Q  372 aattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttg 447  Q
    ||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  35791235 aattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttg 35791310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 455
Target Start/End: Original strand, 23981516 - 23981727
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc-aattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |   ||||||||||| || ||||||| || |||||| ||| ||    
T  23981516 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatgt 23981615  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 441  Q
     || || ||  |||| || |||| ||| |||||| || || ||||||||| ||||  |||  ||  ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||     
T  23981616 taacttatg--aattatgctcaaatggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 23981713  T
Q  442 ttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||||||||    
T  23981714 ttgttgttgatgat 23981727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310793
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 21310793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 22885871 - 22885678
Alignment:
Q  263 tgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| || | ||||||  |||||||    
T  22885871 tgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgttatattgtg--aattgtg 22885774  T
Q  361 ttc-aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
     || ||||  |||||| || || ||||||||| ||||  | |  || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  22885773 ctcaaattattgaattgtgttatgttgttgttgaattatgttgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 22885678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 432590 - 432499
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| | ||| |||||||||  |||| | || ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  432590 aattgatgaattatactatgttgttgttggattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 432499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 19862456 - 19862245
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc-aattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||| || ||||  | |||||    
T  19862456 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg--agaaagt 19862359  T
Q  343 gaaat-tgtgaaaattgtgttc-aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgat 440  Q
    || || |||   |||| || || ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||||| ||| || ||| ||||    
T  19862358 gatatatgt-tgaattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgat 19862260  T
Q  441 gttgttgttgatgat 455  Q
     || |||||||||||    
T  19862259 attattgttgatgat 19862245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918129
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 327  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 29918129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 21617137 - 21617052
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| | ||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||| ||||    
T  21617137 tgaattgttctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgttgat 21617052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 455
Target Start/End: Original strand, 16835426 - 16835510
Alignment:
Q  371 gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||| |||  |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  16835426 gaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattaatgttgttgttgttaagagatgttgttgttgatgat 16835510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 154
Target Start/End: Original strand, 108680 - 108734
Alignment:
Q  100 gtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  108680 gtgagcttaggaggtaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 108734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 452
Target Start/End: Original strand, 1168322 - 1168412
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||    
T  1168322 tcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 1168412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21650833 - 21650743
Alignment:
Q  353 aaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  21650833 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgtt 21650743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 20712205 - 20712120
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttg 447  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||| |||| | | |||| |||||||||||| ||| |||||| | |||||||||    
T  20712205 tcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttg 20712120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 21906849 - 21906784
Alignment:
Q  359 tgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  21906849 tgttcaattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 21906784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 37983485 - 37983400
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |||||  ||  || ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  37983485 tgaattgtgctatgttattgttgaattgtaatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgat 37983400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 364 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 3673989 - 3673929
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  3673989 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 3673929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17909893 - 17909849
Alignment:
Q  110 gagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  17909893 gagttaaagtgaagcctaagtttggattaatcataacctaaggta 17909849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Original strand, 21297175 - 21297259
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| | ||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  21297175 aaattcgtcctctaactatgatgatatgtttgaacgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 21297259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 28902310 - 28902262
Alignment:
Q  372 aattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattga 420  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28902310 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattga 28902262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 28938705 - 28938657
Alignment:
Q  372 aattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattga 420  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28938705 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattga 28938657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 191 - 454
Target Start/End: Original strand, 15675051 - 15675314
Alignment:
Q  191 ttttacaatttttcaaatgtgatatgaattttttataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattga 290  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15675051 ttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattga 15675150  T
Q  291 tgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgt 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15675151 tgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgt 15675250  T
Q  391 ttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15675251 tgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatga 15675314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 191 - 424
Target Start/End: Original strand, 10104212 - 10104445
Alignment:
Q  191 ttttacaatttttcaaatgtgatatgaattttttataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattga 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10104212 ttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattga 10104311  T
Q  291 tgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgt 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10104312 tgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgt 10104411  T
Q  391 ttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10104412 tgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 256 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115667
Alignment:
Q  256 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  356 ttgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatga 31115667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 13246722 - 13246468
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13246722 ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataat-ggataattgttgttaaattcgtgctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataatt 13246624  T
Q  299 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattga 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13246623 gtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattga 13246524  T
Q  399 gatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13246523 gttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 13246468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Original strand, 54118215 - 54118469
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54118215 ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataat-ggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 54118313  T
Q  299 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattga 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||  |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  54118314 gtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattta 54118413  T
Q  399 gatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  54118414 gttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatga 54118469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 230 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 122151 - 121990
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  122151 tggataattgttgctaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 122052  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 391  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122051 tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 121990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 260 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 10644452 - 10644285
Alignment:
Q  260 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgt 359  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || || || |||  |||||    
T  10644452 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 10644353  T
Q  360 gttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    | | ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10644352 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttat 10644285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 26680462 - 26680239
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  26680462 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa 26680363  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    |||||||||| |  || || |||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||     
T  26680362 tatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 26680264  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || |||| |||||||| ||||||||    
T  26680263 tgctaatagatgttgtagttgatga 26680239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 424
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885749
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc-aattatgtaaaaaagtg 343  Q
    |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||     
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  344 aaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    || || || ||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40885670 aagttatg-aaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 230 - 426
Target Start/End: Original strand, 13048222 - 13048419
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  13048222 tggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaa 13048321  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    |||||||||| |  || || |||| |||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  13048322 tatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttat 13048419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 191 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33241001 - 33240891
Alignment:
Q  191 ttttacaatttttcaaatgtgatatgaattttttataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattga 290  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33241001 ttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattga 33240902  T
Q  291 tgataattgta 301  Q
    |||| ||||||    
T  33240901 tgatgattgta 33240891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10488824 - 10488729
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 325  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10488824 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 10488729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Original strand, 16327927 - 16328022
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 325  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16327927 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 16328022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 47357904 - 47357720
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |     
T  47357904 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 47357805  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     || || |||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  47357804 taagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 47357720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 448
Target Start/End: Original strand, 17145664 - 17145869
Alignment:
Q  244 taaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc--aattatgtaaaaaag 341  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| ||| ||  | | |||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||   || |||||| ||| |    
T  17145664 taaattcgtgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 17145763  T
Q  342 tgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 441  Q
    | || |||||||| || |  |||||| |||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||    
T  17145764 ttaagttgtgaaa-ttatactcaattagtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatg 17145862  T
Q  442 ttgttgt 448  Q
    |||||||    
T  17145863 ttgttgt 17145869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 244 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7850248 - 7850056
Alignment:
Q  244 taaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtg 343  Q
    ||||||| ||||||||  | |||| |||||||| ||| ||| |||||||| || |||  ||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||| |||    
T  7850248 taaattcgtgctccaatggagatgttatgtttgaatgaatgtattgatgaaaactgtgtgattgttggtggaattgtatgtccaattatgtgaaaatgtg 7850149  T
Q  344 aaattgtgaaaattgtgttcaattggtg-aattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaa 435  Q
    || || ||||||||||| |||| || || |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |  ||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  7850148 aagttatgaaaattgtgctcaagtgatgaaattttgctaagtgattgttgaattgagatatgaattgtgtttcattgatgttgttgttgttaa 7850056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Original strand, 15674956 - 15675015
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15674956 ttggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 15675015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33241096 - 33241037
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33241096 ttggagtgagcttaggagttaaagcgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 33241037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31132615 - 31132543
Alignment:
Q  191 ttttacaatttttcaaatgtgatatgaattttttataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgt 263  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  31132615 ttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgt 31132543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8374722 - 8374552
Alignment:
Q  279 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaat-tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt 376  Q
    |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||  |||||| ||| || || || ||||| || |  |||||| ||||||||    
T  8374722 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa-ttatactcaattagtgaattt 8374624  T
Q  377 tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 448  Q
    |  || ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  8374623 taatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgt 8374552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Original strand, 10104117 - 10104176
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10104117 ttggagtgagcttaggagctaaagtaaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 10104176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 15044955 - 15044864
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  15044955 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgat 15044864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31132710 - 31132651
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31132710 ttggagtgagcttaggagctaaagtggagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 31132651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 455
Target Start/End: Original strand, 18238175 - 18238368
Alignment:
Q  263 tgatgatatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |  | ||||||||  |||||    
T  18238175 tgatgatatgtttgaatacatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa--ttgtg 18238272  T
Q  361 ttc-aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
     || ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  18238273 ctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 18238368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 452
Target Start/End: Original strand, 13809636 - 13809718
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||    
T  13809636 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgat 13809718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18248348 - 18248262
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 448  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  18248348 tcaattagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgt 18248262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 394 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111433
Alignment:
Q  394 attgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 111433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 455
Target Start/End: Original strand, 15013282 - 15013493
Alignment:
Q  244 taaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaaag 341  Q
    ||||||| ||||| || | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |    
T  15013282 taaattcgtgctctaattatgatgatatgtt-gaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatg 15013380  T
Q  342 tgaaattgtgaaaattgtgttcaa-ttggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgat 440  Q
      | ||||||||  || || |||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  || ||||||| ||||||| || ||| ||||||  |||    
T  15013381 acatattgtgaa--ttatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatattgttgttgttaagagat 15013478  T
Q  441 gttgttgttgatgat 455  Q
     ||||||||||||||    
T  15013479 attgttgttgatgat 15013493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 455
Target Start/End: Original strand, 15109477 - 15109560
Alignment:
Q  372 aattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| |||||||    
T  15109477 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgat 15109560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Original strand, 52265628 - 52265719
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||| ||||||||||    
T  52265628 aattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgat 52265719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 454
Target Start/End: Original strand, 41166066 - 41166156
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |  | || |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  41166066 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatga 41166156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 12837318 - 12837399
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  12837318 tcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgttaagtgatgtt 12837399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 30232614 - 30232695
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  30232614 tcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgtt 30232695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 38764934 - 38764745
Alignment:
Q  267 gatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttca 364  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || | ||||||||  ||||| |||    
T  38764934 gatatgtttgaatgaatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgttatattgtgaa--ttgtgctca 38764837  T
Q  365 a-ttggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    | ||| |||||| ||| | ||||||||| ||||  |||  || ||||||| |||||||||| ||| ||||||   || ||||||||||||||    
T  38764836 aattgttgaattatgcgatgttgttgttcaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgat 38764745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 328
Target Start/End: Original strand, 15109350 - 15109433
Alignment:
Q  246 aattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  15109350 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 15109433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 452
Target Start/End: Original strand, 21959581 - 21959671
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||| |||| | | ||||||||| ||||    
T  21959581 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 21959671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 18276555 - 18276470
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| |||||  |||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  || |||| ||||||||||||||    
T  18276555 tgaattgtgctatattgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgcaaagtgatattgttgttgatgat 18276470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 384 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 27961078 - 27961010
Alignment:
Q  384 ttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  27961078 ttgttgttgaattgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgat 27961010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13246822 - 13246763
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  13246822 ttggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 13246763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Original strand, 13590194 - 13590285
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| |||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| || |||||||||||    
T  13590194 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattattgttgatgat 13590285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15045074 - 15044991
Alignment:
Q  246 aattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    ||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  15045074 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 15044991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Original strand, 41256489 - 41256580
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  ||  |||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  41256489 aattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaaccatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 41256580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Original strand, 41916846 - 41916937
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  || ||||||| || ||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  41916846 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaactgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 41916937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 154
Target Start/End: Original strand, 15135859 - 15135913
Alignment:
Q  100 gtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  15135859 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 15135913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 154
Target Start/End: Original strand, 15272163 - 15272217
Alignment:
Q  100 gtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  15272163 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 15272217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16732298 - 16732208
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||||||||  ||| || ||| | ||||||||| ||||    
T  16732298 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 16732208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Original strand, 7185970 - 7186055
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||| || |||  ||| || |||||||||||    
T  7185970 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattattgttgatgat 7186055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 334
Target Start/End: Original strand, 7964730 - 7964802
Alignment:
Q  263 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgt 334  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7964730 tgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaagtatgt 7964802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18248595 - 18248551
Alignment:
Q  110 gagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||    
T  18248595 gagttaaagtgaagcttaagttaagattaatcatcatctaaggta 18248551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18276681 - 18276597
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |   |||||||||||||| |||||||||    
T  18276681 aaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 18276597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 404 - 452
Target Start/End: Original strand, 37957185 - 37957233
Alignment:
Q  404 gattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  37957185 gattcatgttcaattgatgtggttgctgctaagtgatgttgttattgat 37957233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Original strand, 47535065 - 47535149
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| || ||||||    
T  47535065 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcaagttcaa 47535149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 6)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 191 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 9150 - 8887
Alignment:
Q  191 ttttacaatttttcaaatgtgatatgaattttttataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattga 290  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9150 ttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattga 9051  T
Q  291 tgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgt 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9050 tgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgt 8951  T
Q  391 ttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8950 tgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgttgatga 8887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 201 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 149012 - 148759
Alignment:
Q  201 tttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 299  Q
    ||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149012 tttcaaatgttgtatgaatttttgcataattg-ataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 148914  T
Q  300 taagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgag 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  148913 taagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgag 148814  T
Q  400 atatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  148813 atttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatga 148759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9245 - 9186
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9245 ttggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 9186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 146730 - 146649
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  146730 tcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgtt 146649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 53592 - 53509
Alignment:
Q  246 aattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  53592 aattcatgctctaataatgatgatatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 53509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 146991 - 146932
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  146991 ttggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 146932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 191 - 454
Target Start/End: Original strand, 24341351 - 24341614
Alignment:
Q  191 ttttacaatttttcaaatgtgatatgaattttttataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattga 290  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24341351 ttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattga 24341450  T
Q  291 tgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgt 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24341451 tgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgt 24341550  T
Q  391 ttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  24341551 tgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgttgatga 24341614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Original strand, 36982412 - 36982666
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36982412 ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataat-ggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataatt 36982510  T
Q  299 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattga 398  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36982511 gtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaattga 36982610  T
Q  399 gatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36982611 gttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatga 36982666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 230 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 463000 - 462788
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  463000 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 462901  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  462900 tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggc 462801  T
Q  430 tgttaattgatgt 442  Q
    |||||||||||||    
T  462800 tgttaattgatgt 462788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 225 - 454
Target Start/End: Original strand, 25265386 - 25265615
Alignment:
Q  225 ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgt 324  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25265386 ataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgt 25265485  T
Q  325 tcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||  ||  |||||||||||||||||    
T  25265486 tcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgtt 25265585  T
Q  425 attgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25265586 gttgttgttaattgatgttgttgtttatga 25265615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 8891534 - 8891280
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8891534 ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataat-ggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 8891436  T
Q  299 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattga 398  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| || | | ||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  8891435 gtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattga 8891336  T
Q  399 gatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8891335 gttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatga 8891280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Original strand, 43642928 - 43643182
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaattttttataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 299  Q
    |||||||||||  |||||||||||    | ||||||| |||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43642928 ttttcaaatgttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 43643027  T
Q  300 taagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgag 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| || | | ||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| || | |||||    
T  43643028 tatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttttcttagttgttattaatttgag 43643127  T
Q  400 atatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43643128 atatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatga 43643182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 244 - 454
Target Start/End: Original strand, 19794719 - 19794929
Alignment:
Q  244 taaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtg 343  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||| |      
T  19794719 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgat 19794818  T
Q  344 aaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19794819 aagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgtt 19794918  T
Q  444 gttgttgatga 454  Q
     | ||||||||    
T  19794919 atagttgatga 19794929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Original strand, 20627314 - 20627538
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  20627314 tggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaa 20627413  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||||||||| |||| |     
T  20627414 tatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggt 20627513  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||    
T  20627514 tgttaattggtgttgtggttgatga 20627538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 279 - 454
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508069
Alignment:
Q  279 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    || || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaatttgg 7507993  T
Q  379 ctaagttgttgtttaattgagatatgattcatg-ttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7507994 ctaagttgttg-ttaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatga 7508069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 230 - 426
Target Start/End: Original strand, 17396654 - 17396850
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  17396654 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaa 17396752  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    || ||||||| |  || || |||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  17396753 taagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttat 17396850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 360
Target Start/End: Original strand, 19689402 - 19689532
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  19689402 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa 19689501  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||| |||| |  || || |||||||||||    
T  19689502 tatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 19689532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23820333 - 23820203
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  23820333 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa 23820234  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||| |||| |  || || |||||||||||    
T  23820233 tatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 23820203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Original strand, 14906441 - 14906536
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 325  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14906441 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 14906536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Original strand, 19886663 - 19886847
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |     
T  19886663 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtga 19886762  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     || || |||| |||||| | || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  19886763 taagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 19886847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20015273 - 20015178
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 325  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  20015273 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtt 20015178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Original strand, 24341256 - 24341315
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24341256 ttggagtgagcttaggagctaaaatgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 24341315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 9636974 - 9636781
Alignment:
Q  263 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |  | ||||||||  || ||    
T  9636974 tgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa--ttatg 9636877  T
Q  361 ttc-aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
     || ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  9636876 ctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 9636781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 68119 - 68028
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||| ||||    
T  68119 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgat 68028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 455
Target Start/End: Original strand, 19669109 - 19669320
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc-aattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||| || |||||  ||  ||    
T  19669109 aaatccatgctctaactatggtgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaaattgcatgttctaagtatgtgtaagtgt 19669208  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 441  Q
     || |||||  |||  || | |||||| |||||| || || ||||||||| ||||  ||| |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  19669209 taacttgtg--aatcatgcttaattggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatg 19669306  T
Q  442 ttgttgttgatgat 455  Q
    || |||||||||||    
T  19669307 ttattgttgatgat 19669320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21142025 - 21141939
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 448  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| | ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21142025 tcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccattaaggttattgctattaactgatgttgttgt 21141939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 452
Target Start/End: Original strand, 24571409 - 24571500
Alignment:
Q  362 tcaattggt-gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||| | || |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  24571409 tcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgat 24571500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 24884926 - 24884722
Alignment:
Q  252 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat-tatgtaaaaaagtgaaattg 349  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||  |  | ||||    
T  24884926 tgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatggaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgatatattg 24884827  T
Q  350 tgaaaattgtgttc-aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 448  Q
    |||   || || || || || |||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||| || |||| ||| |||||||    
T  24884826 tgag--ttatgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaatagatattgttgt 24884729  T
Q  449 tgatgat 455  Q
    |||||||    
T  24884728 tgatgat 24884722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 43646020 - 43645929
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| || || | || || |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||    
T  43646020 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaactgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgtcgatgat 43645929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 154
Target Start/End: Original strand, 21273901 - 21273955
Alignment:
Q  100 gtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  21273901 gtgagcttatgagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 21273955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Original strand, 23821731 - 23821816
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  23821731 tgaattgtgctatgttattgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 23821816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Original strand, 23830810 - 23830895
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  23830810 tgaattgtgctatgttattgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 23830895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 25305573 - 25305481
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttg-ttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| | || || |||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  25305573 aattgttgaattatgctatgttgattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgtggctaagtgatgttgttgttgatgat 25305481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 68238 - 68155
Alignment:
Q  246 aattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    ||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  68238 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 68155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 455
Target Start/End: Original strand, 3403 - 3452
Alignment:
Q  406 ttcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  3403 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgat 3452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19660109 - 19660044
Alignment:
Q  263 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 327  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  19660109 tgatgatatgttcgtatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttca 19660044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 445
Target Start/End: Original strand, 36890805 - 36890886
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgt 445  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| ||||||| |||| ||| || ||| |||||||||    
T  36890805 aattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgctaagtgatgttgt 36890886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19666775 - 19666691
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   || |||||||| || |||||||||    
T  19666775 aaattcatgctctaactataatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgtttttggtgaatttgcatgttcaa 19666691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 364 - 452
Target Start/End: Original strand, 31146301 - 31146388
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||||| |||||  ||| ||||| |||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||    
T  31146301 aattgttgaattatgctatgt-gttgttgaattgtaataagattcctgttcaattgatgttactgttgctaagtgatgttgttgatgat 31146388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 19498 - 19244
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498 ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataat-ggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 19400  T
Q  299 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19399 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattga 19300  T
Q  399 gatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19299 gttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 19244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 21552 - 21328
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21552 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 21453  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21452 tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgc 21353  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21352 tgttaattgatgttgttgttgatga 21328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Original strand, 51158019 - 51158243
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  51158019 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 51158118  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  51158119 tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggc 51158218  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  51158219 tgttaattgatgttgtggttgatga 51158243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Original strand, 15859025 - 15859249
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  15859025 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 15859124  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    |||| | ||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15859125 tatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggc 15859224  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  15859225 tgttaattgatgttgtggttgatga 15859249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 2050072 - 2049848
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2050072 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 2049973  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    |||||||| | |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||| ||| |     
T  2049972 tatgtaaacatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggt 2049873  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  2049872 tgttaattgatgttgtggttgatga 2049848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 233 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 13839153 - 13838932
Alignment:
Q  233 ataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattat 332  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  13839153 ataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaatag 13839054  T
Q  333 gtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgt 432  Q
    | | ||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13839053 gaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgt 13838954  T
Q  433 taattgatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  13838953 taattgatgttgtggttgatga 13838932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Original strand, 12030148 - 12030372
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12030148 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 12030247  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    |||||||||  |  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| || |||||| ||||||||||||| ||| |     
T  12030248 tatgtaaaagtgataagttgtgaaagttgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggt 12030347  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||| | ||||||||    
T  12030348 tgttaattgatgttatggttgatga 12030372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 238 - 454
Target Start/End: Original strand, 15936636 - 15936852
Alignment:
Q  238 tgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 337  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15936636 tgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaa 15936735  T
Q  338 aaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaatt 437  Q
    || |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15936736 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatt 15936835  T
Q  438 gatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||||  |||||||    
T  15936836 gatgttgtgattgatga 15936852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 230 - 443
Target Start/End: Original strand, 14842562 - 14842775
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  14842562 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaa 14842661  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    | |||||||| |  || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |     
T  14842662 tgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgga 14842761  T
Q  430 tgttaattgatgtt 443  Q
    ||||||||||||||    
T  14842762 tgttaattgatgtt 14842775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 238 - 454
Target Start/End: Original strand, 15938478 - 15938694
Alignment:
Q  238 tgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 337  Q
    |||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15938478 tgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaa 15938577  T
Q  338 aaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaatt 437  Q
    || |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15938578 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatt 15938677  T
Q  438 gatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||||  |||||||    
T  15938678 gatgttgtgattgatga 15938694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Original strand, 17912484 - 17912706
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  17912484 tggataattgttgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaa 17912582  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    |||||||||| |  || || |||||||||||   ||||| |||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  17912583 tatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaa-tttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgt 17912681  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17912682 tgttaattgatgttgttgttgatga 17912706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 259 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 15615067 - 15614872
Alignment:
Q  259 actgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattg 358  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||| || |    
T  15615067 actgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatgg 15614968  T
Q  359 tgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15614967 tgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 15614872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 260 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 16821372 - 16821205
Alignment:
Q  260 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgt 359  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  | |||  |||||    
T  16821372 ctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgt 16821273  T
Q  360 gttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    | | ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16821272 gctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttat 16821205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 55316469 - 55316285
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |     
T  55316469 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 55316370  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     || || |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  55316369 taagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttat 55316285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 230 - 426
Target Start/End: Original strand, 13975723 - 13975919
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  13975723 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaa 13975821  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    || ||||||| |  || || |||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  13975822 taagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttat 13975919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 230 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 45861067 - 45860871
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  45861067 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaa 45860969  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    || ||||||| |  || || |||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||  || | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  45860968 taagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttat 45860871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 41270325 - 41270141
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| |     
T  41270325 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatga 41270226  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     || || |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  41270225 taagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttat 41270141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Original strand, 2449239 - 2449334
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 325  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2449239 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 2449334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 426
Target Start/End: Original strand, 13954891 - 13955087
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  13954891 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaa 13954989  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    || ||||||| |   | || |||| |||||| ||||||| ||||||| | |||||||||  || | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  13954990 taagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttat 13955087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 244 - 454
Target Start/End: Original strand, 16744130 - 16744339
Alignment:
Q  244 taaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtg 343  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| || || |||||||||| |      
T  16744130 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaa 16744229  T
Q  344 aaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    || || |||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||| | ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||  |||||    
T  16744230 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgtt 16744328  T
Q  444 gttgttgatga 454  Q
    || ||||||||    
T  16744329 gtagttgatga 16744339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 244 - 448
Target Start/End: Original strand, 11986181 - 11986386
Alignment:
Q  244 taaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc--aattatgtaaaaaag 341  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||| || || ||||||| || |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||   || ||||||  || |    
T  11986181 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtatgtattaatg 11986280  T
Q  342 tgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 441  Q
    | || || ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||  || || |||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  11986281 tcaagttatgaaa-ttgtgctcaaatagtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgttgatgctattaactgatg 11986379  T
Q  442 ttgttgt 448  Q
    |||||||    
T  11986380 ttgttgt 11986386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 377 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 47984765 - 47984688
Alignment:
Q  377 tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47984765 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatga 47984688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 377 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 48003339 - 48003262
Alignment:
Q  377 tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48003339 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatga 48003262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 377 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 47994052 - 47993975
Alignment:
Q  377 tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  47994052 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatga 47993975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 377 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 48012625 - 48012548
Alignment:
Q  377 tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  48012625 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatga 48012548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19232073 - 19231979
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 294  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19232073 ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataat-ggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgatgat 19231979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 453
Target Start/End: Original strand, 14814786 - 14814974
Alignment:
Q  266 tgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttc 363  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |  | ||||||  ||||||| ||    
T  14814786 tgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattgtgctc 14814883  T
Q  364 -aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatg 453  Q
     ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||    
T  14814884 aaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatg 14814974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 54651717 - 54651529
Alignment:
Q  233 ataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt--caatt 330  Q
    |||| |||| |||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||   || |    
T  54651717 ataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagt 54651618  T
Q  331 atgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattga 420  Q
    ||||| ||| || || || || ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| | |||||||||| |||||    
T  54651617 atgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 54651529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 16880242 - 16880169
Alignment:
Q  372 aattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgt 445  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  16880242 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttattgttgctaagtgatgttgt 16880169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17100782 - 17100701
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17100782 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgtt 17100701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17101467 - 17101386
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17101467 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgtt 17101386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 452
Target Start/End: Original strand, 11329081 - 11329169
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||    
T  11329081 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 11329169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 448
Target Start/End: Original strand, 12264929 - 12265005
Alignment:
Q  372 aattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 448  Q
    ||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  12264929 aattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgt 12265005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080701
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattg 299  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 14080701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 15876179 - 15876104
Alignment:
Q  380 taagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||  |||||||    
T  15876179 taagttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttggtaagtgatgttgttaatgatgat 15876104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 455
Target Start/End: Original strand, 11061123 - 11061217
Alignment:
Q  362 tcaattggt-gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  11061123 tcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatagtcatgttcaattgatgttgttggtgctaagtgatattgttgttgatgat 11061217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 452
Target Start/End: Original strand, 14059339 - 14059421
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||    
T  14059339 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttattgttgctatgtgatgttgttgatgat 14059421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 44229115 - 44229029
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 448  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| | ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  44229115 tcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccattaaggttattgctattaactgatgttgttgt 44229029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 452
Target Start/End: Original strand, 12488846 - 12488934
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||    
T  12488846 aattgatgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 12488934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 370 - 445
Target Start/End: Original strand, 12560362 - 12560437
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgt 445  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| || ||| |||||||||    
T  12560362 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgt 12560437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 14295568 - 14295477
Alignment:
Q  362 tcaattggt-gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||| ||||    
T  14295568 tcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgat 14295477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 14301195 - 14301104
Alignment:
Q  362 tcaattggt-gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||| ||||    
T  14301195 tcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgat 14301104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 17139622 - 17139547
Alignment:
Q  377 tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||    
T  17139622 tgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 17139547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 39656653 - 39656562
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||  ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  39656653 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagattcatgttcaattgatgtggttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 39656562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 447
Target Start/End: Original strand, 14528145 - 14528215
Alignment:
Q  377 tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttg 447  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  14528145 tgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttg 14528215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 443
Target Start/End: Original strand, 19260796 - 19261038
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaattttttataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg-ataatt 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||  ||| ||||| | ||| ||||||    
T  19260796 ttttcaaatgttgtatgaatttttttta--tggataattgttgctaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataatt 19260893  T
Q  299 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaat-tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattg 397  Q
    | |   ||||| ||  ||||||||||||||  |||| ||||| | | |  |||  ||| | || |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||    
T  19260894 gaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatg-aaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattg 19260992  T
Q  398 agatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
     |||| | |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  19260993 tgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaaatgatgtt 19261038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 329
Target Start/End: Original strand, 3576456 - 3576523
Alignment:
Q  263 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  3576456 tgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaat 3576523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 408 - 455
Target Start/End: Original strand, 9590918 - 9590965
Alignment:
Q  408 catgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  9590918 catgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgat 9590965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Original strand, 12030020 - 12030079
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  12030020 ttggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 12030079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 455
Target Start/End: Original strand, 38811168 - 38811219
Alignment:
Q  404 gattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  38811168 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgat 38811219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 328
Target Start/End: Original strand, 47784767 - 47784850
Alignment:
Q  246 aattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  47784767 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 47784850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 327
Target Start/End: Original strand, 4145814 - 4145896
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 327  Q
    |||||| | |||||| | || ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||    
T  4145814 aaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttca 4145896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 424
Target Start/End: Original strand, 12349657 - 12349719
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  12349657 tcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 12349719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16261591 - 16261501
Alignment:
Q  353 aaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||   ||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  16261591 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgtt 16261501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 38168052 - 38167962
Alignment:
Q  353 aaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||  ||| | |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  38168052 aaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgtt 38167962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 53771179 - 53771089
Alignment:
Q  353 aaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||   ||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  53771179 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgtt 53771089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 53771445 - 53771391
Alignment:
Q  100 gtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  53771445 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 53771391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 54424141 - 54424079
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  54424141 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 54424079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 12953085 - 12953000
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  |||| ||||| |||||||||| ||| || |||  ||| ||||||||||||||    
T  12953085 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagatttatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgat 12953000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Original strand, 47784873 - 47784958
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||   || ||  |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  47784873 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtagtaagaaacatgttcagttgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgttaatgat 47784958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 151
Target Start/End: Original strand, 5240576 - 5240632
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaag 151  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||    
T  5240576 ttggagtgagcttacgagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatctaag 5240632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17191788 - 17191704
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | |   |||||||||||||| |||||||||    
T  17191788 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 17191704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17204928 - 17204844
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | |   |||||||||||||| |||||||||    
T  17204928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 17204844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19947096 - 19947052
Alignment:
Q  110 gagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  19947096 gagttaaagtgaagcctaagtttggattaatcataacctaaggta 19947052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34560126 - 34560062
Alignment:
Q  265 atgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  34560126 atgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 34560062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 383 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 50313295 - 50313223
Alignment:
Q  383 gttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  50313295 gttgttgttgaattgtgatgggaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 50313223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 225 - 454
Target Start/End: Original strand, 47481027 - 47481256
Alignment:
Q  225 ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgt 324  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47481027 ataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgt 47481126  T
Q  325 tcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    |||| |||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  47481127 tcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgtt 47481226  T
Q  425 attgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  47481227 atcgctcttaattgatgtttttgttgatga 47481256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Original strand, 11580709 - 11580964
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt--ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataat 297  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||| | || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11580709 ttttcaaatgttgtatgaattttttgcataat-ggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataat 11580807  T
Q  298 tgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattg 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  11580808 tgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattg 11580907  T
Q  398 agatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11580908 agttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 11580964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 238 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 16212020 - 16211803
Alignment:
Q  238 tgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 337  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16212020 tgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaa 16211921  T
Q  338 aaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaatt 437  Q
    || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||    
T  16211920 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaatt 16211821  T
Q  438 gatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||||| |||||||||    
T  16211820 gatgttgtggttgatgat 16211803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 238 - 454
Target Start/End: Original strand, 18253844 - 18254060
Alignment:
Q  238 tgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 337  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18253844 tgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaa 18253943  T
Q  338 aaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaatt 437  Q
    || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18253944 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatt 18254043  T
Q  438 gatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||||  |||||||    
T  18254044 gatgttgtgattgatga 18254060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 225 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 13321283 - 13321052
Alignment:
Q  225 ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgt 324  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13321283 ataagtggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgt 13321184  T
Q  325 t--caattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttg-ttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgat 421  Q
    |   || |||||| ||| || || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321183 ttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgat 13321085  T
Q  422 gttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13321084 gttattgttgttaattgatgttgttgttgatga 13321052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 3060256 - 3060004
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaattttttataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3060256 ttttcaaatgttatatgaattttgctta--tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattg 3060159  T
Q  300 taagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgag 399  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  3060158 taatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaattttgttaagttgttgttagattgag 3060059  T
Q  400 atatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
     |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3060058 ttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatga 3060004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 201 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 36052955 - 36052705
Alignment:
Q  201 tttcaaatgtgatatgaattttt-tataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  36052955 tttcaaatgttgtatgaatttttgtataat-ggataattgttgctaaatttatactccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataatta 36052857  T
Q  300 taagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgag 399  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| | |||||    
T  36052856 tatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagt---tgttaatttgag 36052760  T
Q  400 atatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  36052759 atttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgatga 36052705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Original strand, 13036985 - 13037239
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13036985 ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataat-ggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 13037083  T
Q  299 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattga 398  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||||| || | | ||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13037084 gtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattga 13037183  T
Q  399 gatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||   | |||||||||||||| ||||||||    
T  13037184 gttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgatga 13037239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 259 - 454
Target Start/End: Original strand, 16478980 - 16479175
Alignment:
Q  259 actgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattg 358  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  16478980 actgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattg 16479079  T
Q  359 tgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| || || | ||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16479080 tgctcaattggtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatga 16479175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7293278 - 7293055
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  7293278 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa 7293179  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    ||||| |||| |  || || |||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||     
T  7293178 tatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 7293080  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || |||| |||||||| ||||||||    
T  7293079 tgctaatagatgttgtagttgatga 7293055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 230 - 426
Target Start/End: Original strand, 25292339 - 25292535
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  25292339 tggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaa 25292438  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    |||||||||| |  ||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  25292439 tatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaattctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttat 25292535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 269 - 447
Target Start/End: Original strand, 296006 - 296185
Alignment:
Q  269 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattg 368  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| || | |||||| | | ||| ||    
T  296006 tatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaattatatccaaatg 296105  T
Q  369 gtgaattttgctaagttgttgttt-aattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttg 447  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  296106 gtgaattttgctaaattgatgtttgaattgtgttgtgattcatgttcaattgatgttgttgctattaattgatgttgttg 296185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 260 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 13572909 - 13572742
Alignment:
Q  260 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgt 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || || |||| |||||    
T  13572909 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 13572810  T
Q  360 gttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  13572809 gctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttat 13572742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 426
Target Start/End: Original strand, 13911044 - 13911211
Alignment:
Q  261 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |  || || |||| ||| ||    
T  13911044 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatg 13911143  T
Q  361 ttcaattggtgaattt-tgct-aagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     ||||||||||||||| | || ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13911144 ctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttat 13911211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2437689 - 2437523
Alignment:
Q  261 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |  || || |||| ||||||    
T  2437689 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 2437590  T
Q  361 ttcaattggtgaa-ttttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  2437589 ttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttat 2437523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11516489 - 11516359
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  11516489 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa 11516390  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||| |||| |  || || |||||||||||    
T  11516389 tatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 11516359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 360
Target Start/End: Original strand, 15441565 - 15441695
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  15441565 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa 15441664  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||| |||| |  || || |||||||||||    
T  15441665 tatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 15441695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 360
Target Start/End: Original strand, 30262130 - 30262260
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  30262130 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa 30262229  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||| |||| |  || || |||||||||||    
T  30262230 tatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 30262260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 10989659 - 10989476
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |     
T  10989659 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 10989560  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     || || |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  10989559 taagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 10989476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36024538 - 36024479
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36024538 ttggagtgagcttatgagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 36024479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 36024442 - 36024372
Alignment:
Q  191 ttttacaatttttcaaatgtgatatgaattttttataattggataactgtttctaaattcatgctccaact 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36024442 ttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgtttctaaattcgtgctccaact 36024372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15709554 - 15709495
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15709554 ttggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 15709495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 13274917 - 13274823
Alignment:
Q  362 tcaattggt-gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  13274917 tcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgat 13274823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 13377648 - 13377565
Alignment:
Q  372 aattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| |||||||    
T  13377648 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgat 13377565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25124535 - 25124476
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  25124535 ttggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagtttagattaatcattatctaaggta 25124476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 9839126 - 9838915
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat-tatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||  ||    
T  9839126 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgt 9839027  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttc-aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 441  Q
     | ||  ||||  || || || || || |||||| ||||| ||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||     
T  9839026 tatatgttgaa--ttatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 9838929  T
Q  442 ttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||||||||    
T  9838928 ttgttgttgatgat 9838915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 9611428 - 9611343
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  9611428 tgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 9611343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 328
Target Start/End: Original strand, 48622672 - 48622757
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  48622672 ctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaa 48622757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Original strand, 16914928 - 16915012
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  16914928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 16915012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Original strand, 11580608 - 11580667
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  11580608 ttggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttaatctaaggta 11580667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 456
Target Start/End: Original strand, 13863047 - 13863142
Alignment:
Q  362 tcaattggt-gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgatg 456  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||| || ||| |||| |||||||| ||||||    
T  13863047 tcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgttgttgttgttgctaagtgatattgttgttaatgatg 13863142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36053056 - 36052997
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  36053056 ttggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 36052997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 46474128 - 46474037
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| |||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  46474128 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 46474037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 452
Target Start/End: Original strand, 49047791 - 49047882
Alignment:
Q  362 tcaattggt-gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||    
T  49047791 tcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgat 49047882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 154
Target Start/End: Original strand, 2190037 - 2190091
Alignment:
Q  100 gtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  2190037 gtgagcttaggagttaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 2190091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3049721 - 3049631
Alignment:
Q  353 aaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  3049721 aaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgtt 3049631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15709459 - 15709409
Alignment:
Q  191 ttttacaatttttcaaatgtgatatgaattttttataattggataactgtt 241  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15709459 ttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgtt 15709409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3895154 - 3895073
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  3895154 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgtt 3895073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 285 - 455
Target Start/End: Original strand, 13448868 - 13449038
Alignment:
Q  285 aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttc-aattggtgaattttgctaa 382  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |  | ||||||||  ||||| || || || |||||| |||||     
T  13448868 aattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa--ttgtgctctaaatgttgaattgtgctat 13448965  T
Q  383 gttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  13448966 gttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 13449038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 442
Target Start/End: Original strand, 16570123 - 16570204
Alignment:
Q  362 tcaattggt-gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgt 442  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||    
T  16570123 tcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgt 16570204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16595539 - 16595458
Alignment:
Q  362 tcaattggt-gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgt 442  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||    
T  16595539 tcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgt 16595458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Original strand, 16915054 - 16915139
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| | || ||||||||||||||    
T  16915054 tgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtcatattgttgttgatgat 16915139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 48356765 - 48356680
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| || || ||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  48356765 tgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 48356680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 4484956 - 4484763
Alignment:
Q  263 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat-tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |   ||||||| |||||| |||||||| | ||||| |||| |  | ||||||||  || ||    
T  4484956 tgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggagaaattgcatgttcattgtatgtgaaaatgatatattgtgaa--ttatg 4484859  T
Q  361 ttcaa-ttggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
     |||| ||| |||||| |||||  |||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  4484858 ctcaaattgttgaattgtgctatattgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 4484763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9611555 - 9611471
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  9611555 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 9611471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 455
Target Start/End: Original strand, 20583576 - 20583765
Alignment:
Q  267 gatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttca 364  Q
    |||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||| |  | ||||||||  || || |||    
T  20583576 gatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttgatgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa--ttatgctca 20583673  T
Q  365 a-ttggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    | ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||  |||  || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  20583674 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagggatattgttgttgatgat 20583765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Original strand, 9723927 - 9724018
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| |||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| || |||||||||||    
T  9723927 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattattgttgatgat 9724018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13377775 - 13377692
Alignment:
Q  246 aattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    ||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  13377775 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 13377692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16212156 - 16212097
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  16212156 ttggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatctaaggta 16212097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Original strand, 17224058 - 17224149
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||   || || |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||  |||||||    
T  17224058 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgatgat 17224149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Original strand, 17947712 - 17947803
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| |||  || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  17947712 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 17947803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 31501300 - 31501209
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||| ||| |||||   ||| ||||||||||||||    
T  31501300 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttatgagatattgttgttgatgat 31501209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 11287546 - 11287456
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| ||| |||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||    
T  11287546 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 11287456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 12759116 - 12759026
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||  |||| | |||||| ||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||| ||||    
T  12759116 tcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttggtgat 12759026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 154
Target Start/End: Original strand, 42056140 - 42056194
Alignment:
Q  100 gtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  42056140 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 42056194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 48356873 - 48356807
Alignment:
Q  263 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  48356873 tgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 48356807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16919686 - 16919597
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatg 453  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| || || |||| |||||||||| ||| || ||| | || ||||||||||||    
T  16919686 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcgtgtttaattgatgttgttgttgctaagtaatattgttgttgatg 16919597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 445
Target Start/End: Original strand, 26070384 - 26070465
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgt 445  Q
    |||||||||||| || || ||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||    
T  26070384 aattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 26070465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 445
Target Start/End: Original strand, 26094171 - 26094252
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgt 445  Q
    |||||||||||| || || ||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||    
T  26094171 aattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 26094252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28722339 - 28722274
Alignment:
Q  263 tgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  28722339 tgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 28722274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 407 - 455
Target Start/End: Original strand, 14272049 - 14272097
Alignment:
Q  407 tcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  14272049 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgat 14272097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 151
Target Start/End: Original strand, 17817307 - 17817363
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaag 151  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||    
T  17817307 ttggagtgagcttacgagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatctaag 17817363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19049694 - 19049638
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaag 151  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||    
T  19049694 ttggagtgagcttacgagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatctaag 19049638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 23153739 - 23153485
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153739 ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataat-ggataattgtttctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 23153641  T
Q  299 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattga 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23153640 gtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattga 23153541  T
Q  399 gatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23153540 gttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgatga 23153485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Original strand, 35009440 - 35009664
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35009440 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat 35009539  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||  ||  ||||||||||||||||| |||     
T  35009540 tatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgt 35009639  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  35009640 tgttaattgatgttgttgttgatga 35009664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 225 - 454
Target Start/End: Original strand, 1657744 - 1657972
Alignment:
Q  225 ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgt 324  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1657744 ataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgt 1657843  T
Q  325 tcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  1657844 tcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgtt 1657942  T
Q  425 attgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1657943 attgttgttaattgatgttgttgttgatga 1657972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 225 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 15862738 - 15862511
Alignment:
Q  225 ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgt 324  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15862738 ataaatggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgt 15862639  T
Q  325 tcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  15862638 tcaattatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgtt 15862541  T
Q  425 attgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15862540 attgctgataattgatgttgttgttgatga 15862511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Original strand, 14626119 - 14626343
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| | || |||||||| |||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  14626119 tggataattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 14626218  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    |||||||||| |  || || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| || |||||||||||||| |     
T  14626219 tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtgcaattggtgaattatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggt 14626318  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  14626319 tgttaattgatgttgtagttgatga 14626343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 259 - 454
Target Start/End: Original strand, 1650123 - 1650318
Alignment:
Q  259 actgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattg 358  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  || ||||||||||||    
T  1650123 actgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaattg 1650222  T
Q  359 tgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1650223 tgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatga 1650318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 230 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 29666136 - 29665941
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc--a 327  Q
    ||||||| ||||  ||||||| ||||| | |||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   |    
T  29666136 tggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaa 29666037  T
Q  328 attatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    | |||| | ||| || || || ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29666036 agtatgcataaatgtcaagttatgaaa-ttgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 353 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 27740977 - 27740876
Alignment:
Q  353 aaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||    
T  27740977 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggat 27740878  T
Q  453 ga 454  Q
    ||    
T  27740877 ga 27740876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 25175813 - 25175629
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   ||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |     
T  25175813 ctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 25175714  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     || || |||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  25175713 taagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 25175629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Original strand, 27653985 - 27654169
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |     
T  27653985 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 27654084  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     || || |||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||| | |||||||||    
T  27654085 taagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttat 27654169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Original strand, 16825754 - 16825940
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaa--gattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaa 340  Q
    |||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||     
T  16825754 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16825853  T
Q  341 gtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    |  || || |||| |||||| | |||||||| |||| | |||| |||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  16825854 gataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 16825940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27751692 - 27751603
Alignment:
Q  225 ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtga 314  Q
    |||| ||||||| |||  |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27751692 ataaatggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Original strand, 18381803 - 18381894
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  18381803 aattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgat 18381894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 18399065 - 18398977
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||    
T  18399065 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 18398977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Original strand, 22361885 - 22361976
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  22361885 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 22361976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 446
Target Start/End: Original strand, 25367357 - 25367439
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgtt 446  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  25367357 aattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtt 25367439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 25651358 - 25651273
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  25651358 tgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 25651273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605486
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaaagtg 343  Q
    |||||| ||||| || | || ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaa--tg 29605599  T
Q  344 aaattgtgaaaattgtgttc-aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgt 442  Q
    ||||  ||  ||||||| || || || |||||| ||||| ||||||||| ||||  ||| ||| ||||| | |||||||||| ||| || |||   || |    
T  29605598 aaatattgtgaattgtgctcaaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgtgaatcatgcttaattgatgttgttgttgctaagaaatat 29605499  T
Q  443 tgttgttgatgat 455  Q
    |||||||||||||    
T  29605498 tgttgttgatgat 29605486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Original strand, 16887792 - 16887876
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||    
T  16887792 aaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaactgttgttggtgaatttgcatgttcaa 16887876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Original strand, 18629608 - 18629692
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  18629608 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 18629692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 327
Target Start/End: Original strand, 17083216 - 17083280
Alignment:
Q  263 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 327  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||  |||||||    
T  17083216 tgatgatatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttca 17083280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18777278 - 18777194
Alignment:
Q  359 tgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||  ||||| ||| |||||| |||||||    
T  18777278 tgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgttgttgttaagtgatgtt 18777194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 34967096 - 34966903
Alignment:
Q  263 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| |   ||||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||||  | ||||||||  ||||     
T  34967096 tgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttcgtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaaagatatattgtgaa--ttgta 34966999  T
Q  361 ttc-aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
     || ||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| |||  || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  34966998 ctctaattgttgaattatgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 34966903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Original strand, 29160423 - 29160514
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| |||  || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  29160423 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgcgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 29160514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 299
Target Start/End: Original strand, 35136013 - 35136068
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattg 299  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35136013 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 35136068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 23995061 - 23994971
Alignment:
Q  353 aaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||   ||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  23995061 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgtt 23994971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23995327 - 23995273
Alignment:
Q  100 gtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  23995327 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 23995273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 328
Target Start/End: Original strand, 17557017 - 17557101
Alignment:
Q  244 taaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    ||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  17557017 taaattcgtgctctaattatgatgatatgtttg-atgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 17557101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 364 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 31628395 - 31628335
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  31628395 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 31628335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 243 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 3212 - 3000
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3212 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgt 3113  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatg-ttcaattgatgttattgctgttaattgatg 441  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3112 gaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatg 3013  T
Q  442 ttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||    
T  3012 ttgttgttgatga 3000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Original strand, 5033 - 5286
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaattttttataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 299  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5033 ttttcaaatgttgtatgaatttttcataat-ggataattgttgctaaattcgtactccaactgtgacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattg 5131  T
Q  300 taagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgag 399  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||    
T  5132 taagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgag 5231  T
Q  400 atatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  5232 ttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatga 5286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 232 - 445
Target Start/End: Original strand, 3585 - 3798
Alignment:
Q  232 gataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaatta 331  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3585 gataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaata 3684  T
Q  332 tgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctg 431  Q
    |||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  3685 tgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatg 3784  T
Q  432 ttaattgatgttgt 445  Q
    ||||||||||||||    
T  3785 ttaattgatgttgt 3798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 1414 - 1162
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaattttttataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 299  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||  ||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1414 ttttcaaatgttgtatgaatttttctta--tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattg 1317  T
Q  300 taagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgag 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1316 tatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgag 1217  T
Q  400 atatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  1216 atttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatga 1162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1515 - 1456
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  1515 ttggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgtgattaatctttatctaaggta 1456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Original strand, 3455 - 3514
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  3455 ttggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 3514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 225 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 41915 - 41686
Alignment:
Q  225 ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgt 324  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41915 ataaatggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgt 41816  T
Q  325 tcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||  ||  |||||||||||||||||    
T  41815 tcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgtt 41716  T
Q  425 attgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  41715 gttgttgttaaatgatgttgttgttgatga 41686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Original strand, 34461 - 34686
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34461 tggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat 34560  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatg-ttcaattgatgttattg 428  Q
    | ||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34561 tgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattg 34660  T
Q  429 ctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
     ||||| |||||||||||||||||||    
T  34661 ttgttatttgatgttgttgttgatga 34686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 364 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 5068 - 4980
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||    
T  5068 aattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 4980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20931607 - 20931383
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20931607 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcata 20931508  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    |||||||||| |  || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |     
T  20931507 tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggt 20931408  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  20931407 tgttaattgatgttgtggttgatga 20931383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20445971 - 20445717
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20445971 ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataat-ggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 20445873  T
Q  299 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattga 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||| |  || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20445872 gtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgt 20445773  T
Q  399 gatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20445772 gttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatga 20445717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Original strand, 20893597 - 20893851
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20893597 ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataat-ggataattgttgctaaattcttgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 20893695  T
Q  299 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattga 398  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| || | | ||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20893696 gtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattga 20893795  T
Q  399 gatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
      |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20893796 tttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatga 20893851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Original strand, 37844421 - 37844676
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37844421 ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataat-ggataattgttgctaaattcatgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 37844519  T
Q  299 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaag-tgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattg 397  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||| | | |||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  37844520 gtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtgaaaattgtgctcaattaatgaattttgctaagttgttgttagattg 37844619  T
Q  398 agatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  37844620 agttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 37844676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20531736 - 20531482
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531736 ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataat-ggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 20531638  T
Q  299 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattga 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | | ||| |  || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20531637 gtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgt 20531538  T
Q  399 gatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20531537 gttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatga 20531482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 238 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 41394476 - 41394260
Alignment:
Q  238 tgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 337  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41394476 tgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaa 41394377  T
Q  338 aaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaatt 437  Q
    || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||| ||    
T  41394376 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttattt 41394277  T
Q  438 gatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||||    
T  41394276 gatgttgttgttgatga 41394260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 231 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20913291 - 20913075
Alignment:
Q  231 ggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaatt 330  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  20913291 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatat 20913192  T
Q  331 atgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgct 430  Q
    ||||||||| |  || || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||      |||||| ||||||||||||||||| | |    
T  20913191 atgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttg-ttaatt------tgattcttgttcaattgatgttatggtt 20913099  T
Q  431 gttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||| |||| ||||||||    
T  20913098 gttaattgatcttgtggttgatga 20913075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 259 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 2116488 - 2116292
Alignment:
Q  259 actgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattg 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||| |    
T  2116488 actgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatgg 2116389  T
Q  359 tgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgaga-tatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | |||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  2116388 tgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 2116292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 259 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 45051656 - 45051487
Alignment:
Q  259 actgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattg 358  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  45051656 actgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattg 45051557  T
Q  359 tgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattg 428  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  45051556 tgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattg 45051487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 279 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227858
Alignment:
Q  279 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  || || |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22227923  T
Q  379 ctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  22227922 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgtt 22227858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 279 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232555
Alignment:
Q  279 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  || || |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22232620  T
Q  379 ctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  22232619 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgtt 22232555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Original strand, 18601120 - 18601304
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |     
T  18601120 ctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 18601219  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     || || |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  18601220 taagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttat 18601304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Original strand, 5072390 - 5072574
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |     
T  5072390 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 5072489  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     || || |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  5072490 taagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttat 5072574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 51452754 - 51452624
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  51452754 tggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa 51452655  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||| |||| |  || || |||||||||||    
T  51452654 tatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 51452624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 455
Target Start/End: Original strand, 22143361 - 22143572
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat-tatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||  |||||| ||| ||    
T  22143361 aaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaaatttgtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatgt 22143460  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggt-gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 441  Q
     || || ||||  || || |||| |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||  |||  ||  |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||     
T  22143461 taacttatgaa--ttatgctcaaatggttgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgctcaattgatgttgttgctgctaagtgata 22143558  T
Q  442 ttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||||||||    
T  22143559 ttgttgttgatgat 22143572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 17609049 - 17608964
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  17609049 tgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgat 17608964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 27329873 - 27329954
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  27329873 tcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgtt 27329954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Original strand, 37233986 - 37234071
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  37233986 tgaattatgctatgttgtggttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 37234071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20446072 - 20446013
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  20446072 ttggagtgagcttaggagttaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 20446013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20913420 - 20913361
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  20913420 ttggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 20913361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 21195261 - 21195050
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||| ||||| || | || ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||| |     
T  21195261 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatga 21195162  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaa-ttggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 441  Q
     | ||||||||  || || |||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||     
T  21195161 tatattgtgaa--ttatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattaatgttgttgttgttaagagata 21195064  T
Q  442 ttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||||||||    
T  21195063 ttgttgttgatgat 21195050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 372 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 16646031 - 16645979
Alignment:
Q  372 aattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16646031 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgtt 16645979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 20177302 - 20177211
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||  | ||| |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  20177302 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaaaagtcaagttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgat 20177211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20531836 - 20531777
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  20531836 ttggagtgagcttaggagataaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 20531777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20931735 - 20931676
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  20931735 ttggagtgagcttagcagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 20931676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 424
Target Start/End: Original strand, 35522437 - 35522499
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  35522437 tcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 35522499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 404 - 450
Target Start/End: Original strand, 38033834 - 38033880
Alignment:
Q  404 gattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttg 450  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||    
T  38033834 gattcatgttcaattgatgtgattgctgctaagtgatgttgctgttg 38033880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 452
Target Start/End: Original strand, 51627778 - 51627872
Alignment:
Q  359 tgttcaattggt-gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||||||||| ||||| || || | ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||| ||||    
T  51627778 tgttcaattggttgaattatgatatggtgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgat 51627872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 455
Target Start/End: Original strand, 41229093 - 41229150
Alignment:
Q  398 agatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||||    
T  41229093 agataagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttaatgat 41229150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 16656757 - 16656709
Alignment:
Q  372 aattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattga 420  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16656757 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattga 16656709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Original strand, 26387 - 26640
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaattttttataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 299  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26387 ttttcaaatgttgtatgaatttttcataat-gtataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattg 26485  T
Q  300 taagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgag 399  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  26486 taagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgttctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagaatgag 26585  T
Q  400 atatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  26586 ttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatga 26640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 225 - 454
Target Start/End: Original strand, 8176 - 8402
Alignment:
Q  225 ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgt 324  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  8176 ataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggt 8275  T
Q  325 tcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||  |||  ||  |||||||||||||||||    
T  8276 tcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcta---tgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgtt 8372  T
Q  425 attgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8373 gttgttgttaattgatgttgttgtttatga 8402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 394 - 455
Target Start/End: Original strand, 7175 - 7236
Alignment:
Q  394 attgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  7175 attgtgataagaatcatgttcaattgatgttgttgctgctaagtgatattgttgttgatgat 7236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 201 - 454
Target Start/End: Original strand, 36885 - 37138
Alignment:
Q  201 tttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 299  Q
    ||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36885 tttcaaatgttgtatgaatttttgcataat-ggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 36983  T
Q  300 taagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgag 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  36984 taagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgag 37083  T
Q  400 atatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  37084 ttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 37138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 201 - 454
Target Start/End: Original strand, 43373440 - 43373693
Alignment:
Q  201 tttcaaatgtgatatgaattttt-tataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |  | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  43373440 tttcaaatgttgtatgaatttttgtataat-ggataattaatgctaaattcgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataatta 43373538  T
Q  300 taagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgag 399  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  43373539 tatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgag 43373638  T
Q  400 atatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  43373639 atttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatga 43373693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 238 - 454
Target Start/End: Original strand, 16193725 - 16193941
Alignment:
Q  238 tgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 337  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16193725 tgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaa 16193824  T
Q  338 aaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaatt 437  Q
    || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16193825 aatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaatt 16193924  T
Q  438 gatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||| ||||||||    
T  16193925 gatgttgtggttgatga 16193941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Original strand, 16404976 - 16405197
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  16404976 tggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 16405075  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    || | | ||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16405076 taggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgt 16405172  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||| | ||||||||    
T  16405173 tgttaattgatgttttagttgatga 16405197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 259 - 454
Target Start/End: Original strand, 6774276 - 6774471
Alignment:
Q  259 actgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattg 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  6774276 actgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattg 6774375  T
Q  359 tgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6774376 tgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatga 6774471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 225 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 17345836 - 17345608
Alignment:
Q  225 ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgt 324  Q
    |||| ||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17345836 ataaatggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgt 17345737  T
Q  325 tcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||| |||||| ||||| ||    
T  17345736 tcaattatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatatt 17345638  T
Q  425 attgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17345637 attgttgttaattgatgttgttgttgatga 17345608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 259 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24549215 - 24549020
Alignment:
Q  259 actgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattg 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||| |    
T  24549215 actgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatgg 24549116  T
Q  359 tgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  24549115 tgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 24549020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Original strand, 24928792 - 24929016
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  24928792 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 24928891  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    || | | ||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||||  || ||||||||||| ||||| |     
T  24928892 taggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggt 24928991  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||||||||||||  |||||||    
T  24928992 tgttaattgatgttgtgattgatga 24929016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Original strand, 22907215 - 22907438
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  22907215 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa 22907314  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    ||||| |||| |  || || |||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||     
T  22907315 tatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 22907413  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || |||| |||||||| ||||||||    
T  22907414 tgctaatagatgttgtagttgatga 22907438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 30120972 - 30120788
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |     
T  30120972 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 30120873  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     || || |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30120872 taagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttat 30120788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 260 - 426
Target Start/End: Original strand, 21844591 - 21844758
Alignment:
Q  260 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgt 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || || |||| |||||    
T  21844591 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 21844690  T
Q  360 gttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||  ||||||| |||||||||    
T  21844691 gctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttat 21844758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 260 - 426
Target Start/End: Original strand, 21851984 - 21852151
Alignment:
Q  260 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgt 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |  || || |||| |||||    
T  21851984 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 21852083  T
Q  360 gttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  21852084 gctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttat 21852151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5238349 - 5238219
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  5238349 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa 5238250  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||| |||| |  || || |||||||||||    
T  5238249 tatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 5238219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 360
Target Start/End: Original strand, 24661249 - 24661379
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  24661249 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa 24661348  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||| |||| |  || || |||||||||||    
T  24661349 tatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 24661379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 43685808 - 43685678
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  43685808 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa 43685709  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||| |||| |  || || |||||||||||    
T  43685708 tatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtg 43685678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 426
Target Start/End: Original strand, 16674394 - 16674578
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |     
T  16674394 ctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 16674493  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
     || || |||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  16674494 taagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttat 16674578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 426
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222877
Alignment:
Q  304 attgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagata 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |  || || |||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  403 tgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    |||||| ||||||| |||||||||    
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttat 222877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 426
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736500
Alignment:
Q  304 attgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagata 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |  || || |||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  403 tgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    |||||| ||||||| |||||||||    
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttat 736500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 426
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860395
Alignment:
Q  304 attgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagata 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |  || || |||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  403 tgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    |||||| ||||||| |||||||||    
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttat 860395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 23837325 - 23837234
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | || || |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  23837325 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgat 23837234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 26011741 - 26011530
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat-tatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||    
T  26011741 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtgaaagtgt 26011642  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttc-aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 441  Q
     | ||  ||||  || || || || || |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||| || ||| ||||     
T  26011641 tatatgttgaa--ttatgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgttgttgctaagtgata 26011544  T
Q  442 ttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||||||||    
T  26011543 ttgttgttgatgat 26011530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 16195350 - 16195275
Alignment:
Q  372 aattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttg 447  Q
    ||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16195350 aattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttg 16195275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 29306544 - 29306453
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  29306544 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 29306453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 377 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 5854728 - 5854650
Alignment:
Q  377 tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  5854728 tgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 5854650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 447
Target Start/End: Original strand, 39446892 - 39446969
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttg 447  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  39446892 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttg 39446969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 455
Target Start/End: Original strand, 45558998 - 45559148
Alignment:
Q  305 ttgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttc-aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagata 402  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |  | ||||||||  ||||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||     
T  45558998 ttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa--ttgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatg 45559095  T
Q  403 tgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
     || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  45559096 agaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagggatattgttgttgatgat 45559148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 15933527 - 15933334
Alignment:
Q  263 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat-tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||  || ||||  ||||  || ||    
T  15933527 tgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttaaatgttgaa--ttatg 15933430  T
Q  361 ttc-aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
     || || || |||||| || || ||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  15933429 ctctaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 15933334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 455
Target Start/End: Original strand, 18261489 - 18261682
Alignment:
Q  263 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||| |||| | ||||| |||| |  | ||||||||  |||||    
T  18261489 tgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatcttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa--ttgtg 18261586  T
Q  361 ttc-aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
     || ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  18261587 ctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 18261682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Original strand, 24385599 - 24385658
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  24385599 ttggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttcatctaaggta 24385658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Original strand, 43373339 - 43373398
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  43373339 ttggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 43373398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 450
Target Start/End: Original strand, 22735958 - 22736044
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttg 450  Q
    ||||| |||||| | ||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||    
T  22735958 aattgatgaattatactatgttgttgttggattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttcttgctaactgatgttgttgttg 22736044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 38533770 - 38533688
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||| ||||    
T  38533770 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaggtgatgttgttgatgat 38533688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 299
Target Start/End: Original strand, 23226083 - 23226131
Alignment:
Q  252 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattg 299  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23226083 tgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 23226131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17285450 - 17285367
Alignment:
Q  246 aattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  17285450 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 17285367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 423
Target Start/End: Original strand, 20654025 - 20654084
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 423  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  20654025 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 20654084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Original strand, 21198272 - 21198363
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||| ||||| | || || |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||| |||| |||||    
T  21198272 aattgttgaattatgttatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgctgttaatgat 21198363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 408 - 455
Target Start/End: Original strand, 23226240 - 23226287
Alignment:
Q  408 catgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  23226240 catgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgat 23226287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 423
Target Start/End: Original strand, 20561740 - 20561810
Alignment:
Q  353 aaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 423  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  20561740 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 20561810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 423
Target Start/End: Original strand, 20647938 - 20648008
Alignment:
Q  353 aaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 423  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  20647938 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 20648008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16195464 - 16195399
Alignment:
Q  260 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 325  Q
    |||||||| ||||||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  16195464 ctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16195399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23158408 - 23158367
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa 286  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  23158408 aaattcatgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 23158367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Original strand, 27233193 - 27233278
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| || || ||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  27233193 tgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 27233278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Original strand, 21198152 - 21198236
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  21198152 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgtagataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 21198236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25296405 - 25296321
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |    ||||||||||||| |||||||||    
T  25296405 aaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcatgttcaa 25296321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25758425 - 25758341
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |    ||||||||||||| |||||||||    
T  25758425 aaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcatgttcaa 25758341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 364 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 41246785 - 41246697
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||||||||| |||   ||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||    
T  41246785 aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgat 41246697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 225 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 13773 - 13544
Alignment:
Q  225 ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgt 324  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13773 ataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgt 13674  T
Q  325 tcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||  ||  |||||||||||||||||    
T  13673 tcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgtt 13574  T
Q  425 attgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13573 gttgttgttaattgatgttgttgttgatga 13544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 238 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 9132 - 8916
Alignment:
Q  238 tgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 337  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9132 tgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 9033  T
Q  338 aaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaatt 437  Q
    || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9032 aatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatt 8933  T
Q  438 gatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||||  |||||||    
T  8932 gatgttgtgattgatga 8916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9268 - 9209
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  9268 ttggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 9209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 41991 - 41767
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||     
T  41991 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaa 41892  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  41891 tatgtaaaaatgataatttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggc 41792  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||    
T  41791 tgttaattgttgttgtagatgatga 41767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 48860 - 48636
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  48860 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 48761  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    || | ||||| |  || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  48760 taggaaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcagttggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggc 48661  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | |||||||||||||| ||||||||    
T  48660 tattaattgatgttgtggttgatga 48636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 36324 - 36159
Alignment:
Q  262 gtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgt 361  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |  || || |||| ||||||     
T  36324 gtgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 36225  T
Q  362 tcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36224 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttat 36159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 232 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 48447 - 48225
Alignment:
Q  232 gataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaatta 331  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  48447 gataattgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatg 48348  T
Q  332 tgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctg 431  Q
    |||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  48347 tgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatg 48248  T
Q  432 ttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||||||||||  |||||||    
T  48247 ttaattgatgttgtgattgatga 48225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Original strand, 123165 - 123389
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  123165 tggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 123264  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    || | | ||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||| |     
T  123265 taggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggt 123364  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  123365 tgttaattgatgttgtggttgatga 123389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 172167 - 171943
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  172167 tggataactgttgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaa 172068  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    || | | ||| |  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  172067 taggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggc 171968  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  171967 tgttaattgatgttgtggttgatga 171943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 177870 - 177646
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  177870 tggataactgttgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaa 177771  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    || | | ||| |  || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  177770 taggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggc 177671  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  177670 tgttaattgatgttgtggttgatga 177646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 172295 - 172236
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  172295 ttggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 172236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 177998 - 177939
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  177998 ttggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 177939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 364 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 60933 - 60873
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  60933 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 60873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 443
Target Start/End: Original strand, 957 - 1169
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  957 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 1056  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    ||||||||||    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |     
T  1057 tatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttg-ttaattgagattttattcttgttcaagtgatgttatgga 1155  T
Q  430 tgttaattgatgtt 443  Q
    |||||||| |||||    
T  1156 tgttaatttatgtt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15087 - 14997
Alignment:
Q  353 aaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||   ||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  15087 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgtt 14997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 238 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 108001 - 107785
Alignment:
Q  238 tgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaa 337  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  108001 tgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaa 107902  T
Q  338 aaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaatt 437  Q
    || |  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  107901 aatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatt 107802  T
Q  438 gatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||||  |||||||    
T  107801 gatgttgtgattgatga 107785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 260 - 426
Target Start/End: Original strand, 64542 - 64714
Alignment:
Q  260 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaatt-----gatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaa 354  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||     |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || || ||||     
T  64542 ctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaat 64641  T
Q  355 attgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  64642 attgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttat 64714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89915
Alignment:
Q  244 taaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgata 295  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgata 89915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Original strand, 128170 - 128393
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  128170 tggataattgttgctaaattcgtgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 128269  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    | ||||||   || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |     
T  128270 tgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggcgaattttgttaggttgttg-ttaattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgga 128368  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||    
T  128369 tgttaatggatgttgtgattgatga 128393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 262 - 426
Target Start/End: Original strand, 31696 - 31862
Alignment:
Q  262 gtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgt 361  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |  || || |||| ||| ||     
T  31696 gtgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgc 31795  T
Q  362 tcaattggtgaattt-tgct-aagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31796 tcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttat 31862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 230 - 437
Target Start/End: Original strand, 6065 - 6271
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  6065 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 6164  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    ||||||||||    || |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |     
T  6165 tatgtaaaaataataagttgtaaaaattgtgctgaattggtgaattttgctaagttgttg-ttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgga 6263  T
Q  430 tgttaatt 437  Q
    ||||||||    
T  6264 tgttaatt 6271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Original strand, 247413 - 247667
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247413 ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataat-ggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 247511  T
Q  299 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattga 398  Q
    ||| |||||  ||||||||| ||||||||| || | | ||| |  || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  247512 gtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttagattga 247611  T
Q  399 gatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  247612 gttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatga 247667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 441
Target Start/End: Original strand, 34286 - 34363
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 441  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  34286 aattgatgaatttggatatgttgttgttgaaatgagatatgattcatgttccattaatgttgttgctattaactgatg 34363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Original strand, 535 - 759
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  535 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 634  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    || | | ||| |   | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| || |||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  635 taggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggc 734  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
T  735 tgctaattgatgttgtggttgatga 759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12375 - 12164
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||     
T  12375 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaa 12276  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    | |||||||| |  || |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||       
T  12275 tgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattttgttaagttgttg--taattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaa 12178  T
Q  430 tgttaattgatgtt 443  Q
    ||||||||||||||    
T  12177 tgttaattgatgtt 12164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12503 - 12467
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagtt 131  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12503 ttggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagtt 12467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 260 - 454
Target Start/End: Original strand, 9368 - 9562
Alignment:
Q  260 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgt 359  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||| ||    
T  9368 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggt 9467  T
Q  360 gttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| || |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  9468 gctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 9562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 260 - 454
Target Start/End: Original strand, 16266 - 16460
Alignment:
Q  260 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgt 359  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||| ||    
T  16266 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggt 16365  T
Q  360 gttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| || |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  16366 gctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 16460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 254 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 272263 - 272063
Alignment:
Q  254 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaa 353  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || | | ||| |  || |||||||    
T  272263 ctccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 272164  T
Q  354 aattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatg 453  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  272163 aattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatg 272064  T
Q  454 a 454  Q
    |    
T  272063 a 272063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 69578 - 69493
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  69578 tgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 69493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 272415 - 272356
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  272415 ttggagtgagctcaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 272356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 279 - 445
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5420
Alignment:
Q  279 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 5353  T
Q  379 ctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgt 445  Q
    || |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  5354 ctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgt 5420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 109717 - 109629
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||    
T  109717 aattgttgaattttgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 109629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 452
Target Start/End: Original strand, 103048 - 103130
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||    
T  103048 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataacattcatgttcaattgatgttattgtttctaagtgatgttgttgatgat 103130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 230 - 424
Target Start/End: Original strand, 51183 - 51377
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51183 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 51282  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    || ||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||| | ||||| |||  || ||||||| ||||||||||    
T  51283 taggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgttatgtggttgatgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgtt 51377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 424
Target Start/End: Original strand, 89425 - 89649
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  89425 ttttcaaatgttctatgaatttttgcataat-ggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataatt 89523  T
Q  299 gtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattga 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | | |||    || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||     
T  89524 gtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgt 89623  T
Q  399 gatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||    
T  89624 gataagtttcatgaacaattgatgtt 89649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Original strand, 89325 - 89384
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  89325 ttggagtgagcttaggagttaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 89384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Original strand, 107655 - 107714
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  107655 ttggagtgagcttaggagttaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 107714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 79786 - 79575
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc-aattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||||| ||||||| || |||||  ||  ||    
T  79786 aaattcgtgcactaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttggtggtgaaattgcatgttctaagtatgtgtaagtgt 79687  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 441  Q
     || |||||  |||| || | |||||| |||||| || || ||||||||| ||||  ||| |||  ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||     
T  79686 taacttgtg--aattatgcttaattggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 79589  T
Q  442 ttgttgttgatgat 455  Q
    || |||||||||||    
T  79588 ttattgttgatgat 79575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 280
Target Start/End: Original strand, 107755 - 107835
Alignment:
Q  200 ttttcaaatgtgatatgaatttttt-ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatg 280  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  107755 ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataat-ggataatttttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 279 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3771
Alignment:
Q  279 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaa-gtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaatttt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || || ||||||||| |||||||||||||||    
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  378 gctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgtt 3771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 5788 - 5594
Alignment:
Q  233 ataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattat 332  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  5788 ataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatat 5689  T
Q  333 gtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    ||||||| |  || |  |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  5688 gtaaaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttat 5594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 391
Target Start/End: Original strand, 13345 - 13475
Alignment:
Q  261 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||| |||    
T  13345 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtg 13444  T
Q  361 ttcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 391  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13445 ctcaattggtgaattttgctaagttattgtt 13475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 264 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 43063
Alignment:
Q  264 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttc 363  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || || |||| |||||| |     
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgcta 43127  T
Q  364 aattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  43126 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttat 43063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 261 - 443
Target Start/End: Original strand, 21136 - 21318
Alignment:
Q  261 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  || || |||| |||| |    
T  21136 tgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgag 21235  T
Q  361 ttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||||||    
T  21236 ctcaattggtgaattttcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgtt 21318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 260 - 426
Target Start/End: Original strand, 14080 - 14246
Alignment:
Q  260 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgt 359  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |  || || |||| |||||    
T  14080 ctgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgt 14179  T
Q  360 gttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  14180 gctcaattggtgaattttcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttat 14246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 260 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 101
Alignment:
Q  260 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgt 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || || || | |||||    
T  268 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgt 169  T
Q  360 gttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 426  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  168 gctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttat 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 230 - 454
Target Start/End: Original strand, 37067 - 37290
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat 329  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |     
T  37067 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaa 37166  T
Q  330 tatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgc 429  Q
    ||||| |||| |  || || |||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||     
T  37167 tatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 37265  T
Q  430 tgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    || |||| |||||||| ||||||||    
T  37266 tgctaatagatgttgtagttgatga 37290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 244 - 448
Target Start/End: Original strand, 56114 - 56319
Alignment:
Q  244 taaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg--ttcaattatgtaaaaaag 341  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||| || || ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||  || || |||||| ||| |    
T  56114 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatgtataaatg 56213  T
Q  342 tgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 441  Q
    | || || || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || || |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  56214 tcaagttatg-aaattgtgctcaaatggtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgttgatgctattaattgatg 56312  T
Q  442 ttgttgt 448  Q
    |||||||    
T  56313 ttgttgt 56319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 279 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45075
Alignment:
Q  279 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc--aattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   || |||||| ||| || || || ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttgaaa-ttgtactcaattggtgaattt 45146  T
Q  377 tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttg 447  Q
    || || ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  45145 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttg 45075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 279 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54460
Alignment:
Q  279 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc--aattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||   || |||||| ||| || || || ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  377 tgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 448  Q
    || || ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgt 54460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27057 - 26962
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 325  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27057 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 26962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 233 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22799 - 22707
Alignment:
Q  233 ataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 325  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22799 ataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 22707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 325
Target Start/End: Original strand, 1583 - 1678
Alignment:
Q  230 tggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 325  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1583 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 1678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 376
Target Start/End: Original strand, 1306 - 1439
Alignment:
Q  243 ctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |     
T  1306 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatga 1405  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt 376  Q
     || || |||| |||||| |||||||||||||||    
T  1406 taagttatgaatattgtgctcaattggtgaattt 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 3457 - 3257
Alignment:
Q  225 ataattggataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgt 324  Q
    |||| ||||||| || | |||||||| ||||| | |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3457 ataaatggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatat 3358  T
Q  325 t--caattatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatg 422  Q
    |   || |||||| |||  | || || || |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |   || || |||||  |||||||||||||    
T  3357 ttcaaagtatgtataaatatcaagttatg-aaattgtactcaaatggtgaattttgctaagttgttgttgagaggatatgtgattattgttcaattgatg 3259  T
Q  423 tt 424  Q
    ||    
T  3258 tt 3257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 451
Target Start/End: Original strand, 22422 - 22629
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaat-tatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |   ||||||||||| || |||||||||  |||||| ||| |     
T  22422 aaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataatttaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaaatatgtataaatgc 22521  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttcaa-ttggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 441  Q
     || || ||||  || || |||| ||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||     
T  22522 taacttatgaa--ttatgctcaaattattgaattgtgctatgttgttgttgaattgagatgtgaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaattgata 22619  T
Q  442 ttgttgttga 451  Q
    ||||||||||    
T  22620 ttgttgttga 22629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 394 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9420
Alignment:
Q  394 attgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 454  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 9420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 455
Target Start/End: Original strand, 76847 - 77058
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttc-aattatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||| || ||||  | |||||    
T  76847 aaattcatgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg--agaaagt 76944  T
Q  343 gaaat-tgtgaaaattgtgttc-aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgat 440  Q
    || || |||   |||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||    
T  76945 gatatatgt-tgaattatgttcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 77043  T
Q  441 gttgttgttgatgat 455  Q
     ||||| ||||||||    
T  77044 attgttattgatgat 77058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 4693 - 4599
Alignment:
Q  362 tcaattggt-gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  4693 tcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 4599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 9307 - 9213
Alignment:
Q  362 tcaattggt-gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  9307 tcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 9213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8173
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaa 8173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 154
Target Start/End: Original strand, 10211 - 10262
Alignment:
Q  103 agcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10211 agcttatgagctaaagtgaagcctaagttggggttaatcatcatctaaggta 10262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 325
Target Start/End: Original strand, 10335 - 10427
Alignment:
Q  233 ataactgtttctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 325  Q
    |||| |||| |||||||| |||||   |||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  10335 ataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 353 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 33800 - 33698
Alignment:
Q  353 aaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||  |||| | |||||| |||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||    
T  33800 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 33701  T
Q  453 gat 455  Q
    |||    
T  33700 gat 33698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 2646 - 2561
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  2646 tgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 2561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2772 - 2688
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  2772 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaa 2688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 447
Target Start/End: Original strand, 33854 - 33931
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttg 447  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  33854 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttg 33931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 46294 - 46201
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||| |||||| ||| |  ||| |||| ||||||||||||||    
T  46294 tcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtttctaagtgatattgttgttgatgat 46201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 40787 - 40694
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  |||| |||| | |||||| ||||| |||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  40787 tcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 40694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Original strand, 197379 - 197464
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| | ||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  197379 tgaattgtcctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 197464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 455
Target Start/End: Original strand, 7693 - 7886
Alignment:
Q  263 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaaagtgaaattgtgaaaattgtg 360  Q
    ||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |  | ||||||||  |||||    
T  7693 tgatgatatgtttgactacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaa--ttgtg 7790  T
Q  361 ttc-aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
     || ||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| |||  || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  7791 ctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 7886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 452
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109670
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||    
T  109582 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 109670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 452
Target Start/End: Original strand, 118078 - 118171
Alignment:
Q  359 tgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| ||| |||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||    
T  118078 tgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 118171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Original strand, 104623 - 104707
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgca-tgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |   ||||||||||| || || ||||||    
T  104623 aaattcatgctctaactatgatgatatgtttgtatgcattaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcaggttcaa 104707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Original strand, 93773 - 93857
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| | | ||||| | |||||| |||||||||    
T  93773 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaagtttttgataattgaatggttgttagagaaatttcatgttcaa 93857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 452
Target Start/End: Original strand, 8999 - 9090
Alignment:
Q  362 tcaattggt-gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||    
T  8999 tcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 9090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 7302 - 7207
Alignment:
Q  362 tcaattggt-gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaatt-gatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| |||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  7302 tcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 7207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 6059 - 5976
Alignment:
Q  372 aattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||| ||||| || |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  6059 aattatgctatgtggttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 5976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Original strand, 2436 - 2527
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||  |||| || |||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||| |||||||    
T  2436 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgttgttcctaagtgatgttgttgatgatgat 2527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 328
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2400
Alignment:
Q  246 aattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    ||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  2317 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 2400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 35605 - 35514
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||| ||| || ||||| ||||||||| || || | || || |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  35605 aattgttgatttatgctatgttgttgttgaaatgtggtaagagtcatgttcaattgatgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgat 35514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 448
Target Start/End: Original strand, 7582 - 7668
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 448  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| | ||||||| | |||| ||||||||||||    
T  7582 tcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccattaaggttattgttattaactgatgttgttgt 7668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 30211 - 30000
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca-attatgtaaaaaagt 342  Q
    |||||| |||||  ||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |   |||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||| |     
T  30211 aaattcgtgctcttactatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 30112  T
Q  343 gaaattgtgaaaattgtgttc-aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 441  Q
     | ||||||||  || || || ||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  |||     
T  30111 tatattgtgaa--ttttgctctaattgttgaattgtgctatgtttttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagcgata 30014  T
Q  442 ttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||||||||    
T  30013 ttgttgttgatgat 30000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 22112 - 22035
Alignment:
Q  378 gctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  22112 gctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 22035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70361
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataatt 298  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataatt 70361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 24846 - 24927
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  24846 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgtt 24927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 31141 - 31056
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||  |||||||||||||    
T  31141 tgaattgtgctatgttcttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatactgttgttgatgat 31056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 436 - 348
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||| | || || |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  436 aattgttgaattatgctatgttattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtttttgttgat 348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Original strand, 1348 - 1432
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcat-gaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||| ||||    
T  1348 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaa 1432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Original strand, 9603 - 9687
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcat-gaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||| ||||    
T  9603 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaa 9687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Original strand, 22429 - 22513
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||    
T  22429 aaattcgtgctctaactaggataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaa 22513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 85459 - 85371
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||    
T  85459 aattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 85371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 353 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 159438 - 159346
Alignment:
Q  353 aaattgtgttcaattggt-gaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttg 444  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||    
T  159438 aaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttg 159346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 408 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 2538 - 2491
Alignment:
Q  408 catgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  2538 catgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgat 2491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3625 - 3578
Alignment:
Q  281 catgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3625 catgaattgatgattatggtatgattgtgggtgaaattacatgttcaa 3578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Original strand, 193344 - 193403
Alignment:
Q  95 ttggagtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||    
T  193344 ttggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttcatttaaggta 193403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 273 - 211
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  273 tcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 366 - 452
Target Start/End: Original strand, 698 - 784
Alignment:
Q  366 ttggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||    
T  698 ttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgat 784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 443
Target Start/End: Original strand, 1095 - 1185
Alignment:
Q  353 aaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||   ||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  1095 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgtt 1185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6890 - 6824
Alignment:
Q  263 tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  6890 tgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10908 - 10854
Alignment:
Q  246 aattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattg 299  Q
    ||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10908 aattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 10854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 154
Target Start/End: Original strand, 13237 - 13291
Alignment:
Q  100 gtgagcttatgagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  13237 gtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggta 13291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 443
Target Start/End: Original strand, 13503 - 13593
Alignment:
Q  353 aaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||   ||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  13503 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgtt 13593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 443
Target Start/End: Original strand, 21477 - 21567
Alignment:
Q  353 aaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||   ||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  21477 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgtt 21567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 10066 - 10004
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  10066 tcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 10004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 452
Target Start/End: Original strand, 132368 - 132458
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgat 452  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||| | ||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||    
T  132368 tcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgat 132458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 88404 - 88323
Alignment:
Q  362 tcaattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| | |||||| ||||| ||||||  || |||||| |||||||    
T  88404 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgctgttgttaagtgatgtt 88323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 286
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa 286  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 286
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa 286  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 37679 - 37594
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgat 455  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||   || ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  37679 tgaattgtgctatgttattgttgaattgagacgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgat 37594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48563
Alignment:
Q  386 gttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 443  Q
    |||||| | ||||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgtt 48563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 70734 - 70657
Alignment:
Q  370 tgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttg 447  Q
    |||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||  |||||||||||    
T  70734 tgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctgatatatgatgttgttg 70657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 54088 - 54039
Alignment:
Q  279 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  54088 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaa 54039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 364 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 1444 - 1384
Alignment:
Q  364 aattggtgaattttgctaagttgttgtttaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 424  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  1444 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 1384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18096 - 18052
Alignment:
Q  110 gagttaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggta 154  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  18096 gagttaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggta 18052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Original strand, 43798 - 43882
Alignment:
Q  245 aaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 328  Q
    ||||| |||||| || | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  43798 aaattaatgctctaattatgatgctatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 43882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University