View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8901_high_2 (Length: 887)

Name: NF8901_high_2
Description: NF8901
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8901_high_2
NF8901_high_2
[»] chr6 (86 HSPs)
chr6 (426-871)||(29946658-29947081)
chr6 (39-336)||(29946189-29946486)
chr6 (115-329)||(24890203-24890417)
chr6 (121-329)||(29887131-29887339)
chr6 (121-329)||(28926504-28926712)
chr6 (113-329)||(30999895-31000111)
chr6 (112-329)||(25450943-25451160)
chr6 (124-336)||(24730692-24730904)
chr6 (121-329)||(29866483-29866691)
chr6 (121-336)||(29348548-29348763)
chr6 (121-336)||(29929107-29929322)
chr6 (125-336)||(30060112-30060323)
chr6 (121-329)||(29073597-29073805)
chr6 (121-329)||(29078361-29078569)
chr6 (121-329)||(29106170-29106378)
chr6 (121-336)||(29084852-29085067)
chr6 (121-336)||(30127005-30127220)
chr6 (121-329)||(29835049-29835257)
chr6 (121-336)||(29099177-29099392)
chr6 (121-336)||(29366371-29366586)
chr6 (121-336)||(29882269-29882484)
chr6 (125-336)||(29889568-29889779)
chr6 (121-336)||(29909425-29909640)
chr6 (121-327)||(29905473-29905679)
chr6 (121-327)||(30118700-30118906)
chr6 (121-329)||(29357936-29358144)
chr6 (172-336)||(30061945-30062109)
chr6 (121-336)||(29116095-29116310)
chr6 (121-336)||(29876659-29876874)
chr6 (121-321)||(24271912-24272112)
chr6 (121-329)||(29894387-29894595)
chr6 (126-321)||(24263717-24263912)
chr6 (121-329)||(29897911-29898119)
chr6 (332-409)||(29946594-29946671)
chr6 (451-599)||(29894799-29894947)
chr6 (111-234)||(24886569-24886692)
chr6 (461-599)||(25451380-25451518)
chr6 (451-599)||(24271569-24271717)
chr6 (451-599)||(29866895-29867043)
chr6 (250-329)||(29211350-29211429)
chr6 (426-548)||(29078748-29078870)
chr6 (426-548)||(29099564-29099686)
chr6 (451-528)||(29835461-29835538)
chr6 (426-599)||(29882656-29882829)
chr6 (451-528)||(29887543-29887620)
chr6 (426-599)||(29909812-29909985)
chr6 (426-599)||(29914213-29914386)
chr6 (426-525)||(29073984-29074083)
chr6 (426-525)||(29106557-29106656)
chr6 (430-599)||(29903462-29903631)
chr6 (426-599)||(29912193-29912366)
chr6 (111-191)||(21160720-21160800)
chr6 (451-599)||(28926152-28926300)
chr6 (426-525)||(24731076-24731175)
chr6 (449-548)||(29116505-29116604)
chr6 (451-528)||(29085264-29085341)
chr6 (263-336)||(29903222-29903295)
chr6 (123-196)||(30154336-30154409)
chr6 (451-599)||(24263357-24263505)
chr6 (451-599)||(30126660-30126808)
chr6 (128-207)||(29903101-29903180)
chr6 (112-191)||(30149352-30149431)
chr6 (278-336)||(24886515-24886573)
chr6 (448-546)||(29357637-29357735)
chr6 (111-165)||(30053251-30053305)
chr6 (128-197)||(16702235-16702304)
chr6 (111-196)||(24739285-24739370)
chr6 (451-620)||(29929519-29929687)
chr6 (426-503)||(30061696-30061773)
chr6 (140-296)||(15727179-15727335)
chr6 (426-525)||(24889925-24890024)
chr6 (351-406)||(29366189-29366244)
chr6 (451-586)||(29889976-29890111)
chr6 (451-525)||(29211072-29211146)
chr6 (335-404)||(24263522-24263591)
chr6 (121-189)||(15715083-15715151)
chr6 (362-402)||(29357751-29357791)
chr6 (125-196)||(24934505-24934576)
chr6 (448-599)||(29348203-29348354)
chr6 (426-548)||(24886222-24886344)
chr6 (335-404)||(24271734-24271803)
chr6 (462-599)||(29366026-29366163)
chr6 (454-599)||(29898322-29898467)
chr6 (448-525)||(29930311-29930388)
chr6 (112-165)||(29950018-29950071)
chr6 (112-189)||(30577865-30577942)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (121-336)||(15062826-15063041)
chr2 (335-409)||(15062641-15062715)
chr2 (115-188)||(21456433-21456506)
[»] chr3 (6 HSPs)
chr3 (121-330)||(24219191-24219400)
chr3 (125-332)||(11991150-11991357)
chr3 (112-295)||(16350875-16351058)
chr3 (121-293)||(33997774-33997946)
chr3 (123-196)||(24226656-24226729)
chr3 (567-622)||(24208763-24208817)
[»] scaffold0573 (2 HSPs)
scaffold0573 (121-329)||(3971-4179)
scaffold0573 (451-599)||(4383-4531)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (111-336)||(53546-53771)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (112-327)||(4260276-4260491)
chr1 (112-327)||(4263898-4264113)
chr1 (121-330)||(10129971-10130180)
chr1 (113-191)||(19490076-19490154)
chr1 (111-329)||(17251137-17251355)
chr1 (451-525)||(17251559-17251633)
chr1 (124-164)||(15591243-15591283)
chr1 (132-187)||(15612789-15612844)
chr1 (121-196)||(15998809-15998884)
chr1 (113-187)||(41316095-41316169)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (121-336)||(22177-22392)
scaffold0237 (426-599)||(22564-22737)
[»] scaffold0572 (1 HSPs)
scaffold0572 (112-330)||(3058-3276)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (92-330)||(47859-48097)
scaffold0051 (113-293)||(43278-43458)
[»] scaffold0014 (4 HSPs)
scaffold0014 (115-309)||(140126-140320)
scaffold0014 (111-329)||(104695-104913)
scaffold0014 (113-313)||(137200-137400)
scaffold0014 (121-309)||(121457-121636)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (111-298)||(126111-126298)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (111-295)||(3642861-3643045)
[»] scaffold0654 (1 HSPs)
scaffold0654 (111-308)||(1198-1395)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (113-313)||(6022-6222)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (121-309)||(27187-27375)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (126-309)||(8834-9017)
[»] scaffold0652 (1 HSPs)
scaffold0652 (113-197)||(1375-1459)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (121-197)||(31394-31470)
[»] scaffold1840 (1 HSPs)
scaffold1840 (112-187)||(1234-1309)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (125-310)||(43845-44030)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (121-189)||(13904694-13904762)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (1-36)||(4669959-4669994)
chr4 (125-166)||(44262713-44262754)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 86)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 426 - 871
Target Start/End: Original strand, 29946658 - 29947081
Alignment:
Q  426 caaaggctacagtcttgatgcatatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 525  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29946658 caaaggctgcagtcttgatgcatatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 29946757  T
Q  526 aaataatatagctgcattccagacacggcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaaatgataagacatggaaacttcgtaat 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29946758 aaataatatagctgcattccagacactgcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaaatgataagacatggaaacttcgtaat 29946857  T
Q  626 gagtatccagtcatattttataaatggttagacttccaccaacattgcaccaataannnnnnngaactcgaactcattacatcagtcttaggactcgtaa 725  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29946858 gagtatccagtcatattttataaatggttagacttccaccaacattgcaccaataatttttttgaactcgaactcattacatcagtcttaggactcgtaa 29946957  T
Q  726 atacgtctagatgtcgaatttgaggatatttggacttcaataactaagtttggactagttagtttcaaatctaaattattaacaatagtgaactggggtg 825  Q
    ||||||||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29946958 atacgtctagatgtcgaa----------------------taactaagtttggactagttagtttcaaatctgaattattaacaatagcgaactggggtg 29947035  T
Q  826 caaaatttctgatactggtaagatctgaactcttacaaagtccaac 871  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29947036 caaaatttctgatactggtaagatctgaactcttacaaagtccaac 29947081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 39 - 336
Target Start/End: Original strand, 29946189 - 29946486
Alignment:
Q  39 atgatgcatttggtttgttgcaactctttattttcggcattatggcccgaaagggagtgactcctgacaccgatagctatattatcatgattaatggatt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29946189 atgatgcatttggtttgttgcaactctttattttcggcattatggcccgaaagggagtgactcctgacaccgatagctatattatcatgattaatggatt 29946288  T
Q  139 ttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaacttacaattcccttgttaat 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29946289 ttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaacttacaattcccttattaat 29946388  T
Q  239 ggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataattacttacaactctat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29946389 ggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataattacttacaactctat 29946486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 115 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24890417 - 24890203
Alignment:
Q  115 ctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtg 214  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||||    
T  24890417 ctatactaccatggttaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtg 24890318  T
Q  215 gtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccaccta 314  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||| | || |||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24890317 gtaacttacagttcccttattgatggtttgtgtaaattggggagaatcttttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcagccaccta 24890218  T
Q  315 atataattacttaca 329  Q
    ||||| |||||||||    
T  24890217 atatagttacttaca 24890203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 29887131 - 29887339
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | | || |  ||||| |||||||||||    
T  29887131 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatgaccgatgaagccatgaatctctttgaagaaatgcattgtagaaaactaattcctgatgtggtaact 29887230  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29887231 tacaattcccttatcaatggtttgtgcaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctgatataa 29887330  T
Q  321 ttacttaca 329  Q
    |||||||||    
T  29887331 ttacttaca 29887339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28926712 - 28926504
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  28926712 tatcttgattaatgggttttgtaagattaaaatgaccgatgcagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcagaaaaattattcctaatgtggtaact 28926613  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||||||||||| |  |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28926612 tacaattcccttatcgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctgatataa 28926513  T
Q  321 ttacttaca 329  Q
    |||||||||    
T  28926512 ttacttaca 28926504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 113 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31000111 - 30999895
Alignment:
Q  113 agctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatg 212  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| ||| |||||    
T  31000111 agctatactaccatgattaatggattttgcaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcgtaatg 31000012  T
Q  213 tggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacc 312  Q
    || ||| ||||| || |||| || |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31000011 tgttaatttacagtttccttattgatggtttgtgtaaatcggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacc 30999912  T
Q  313 taatataattacttaca 329  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  30999911 taatatagttatttaca 30999895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 112 - 329
Target Start/End: Original strand, 25450943 - 25451160
Alignment:
Q  112 tagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaat 211  Q
    |||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||    
T  25450943 tagctacactatcatgattagtaaattttgtaagattaaaatggtggatgaagccaggaaactttttgaagaaatgcagtccaaacaaatatttcctgat 25451042  T
Q  212 gtggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccac 311  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25451043 gtggtaacttacagttcccttgttgatggtttgtgcaaatcggagagaattcctaatgctttgaagcttgtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccac 25451142  T
Q  312 ctaatataattacttaca 329  Q
    | |||||| |||||||||    
T  25451143 caaatatatttacttaca 25451160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 124 - 336
Target Start/End: Original strand, 24730692 - 24730904
Alignment:
Q  124 catgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaacttac 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24730692 catgattaatggattatgtaagattaaaatggtggatgaagctgtaaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtggtaacttac 24730791  T
Q  224 aattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataatta 323  Q
    ||||||||| || |||||||| | | || ||||| |||||| | ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24730792 aattcccttattgatggtttgggtaaattggggaaaatctcttgtgtgttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatataataa 24730891  T
Q  324 cttacaactctat 336  Q
    ||||||| |||||    
T  24730892 cttacaattctat 24730904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 29866483 - 29866691
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||    
T  29866483 tatcttgattaatgggctttgtaagattaaaatgacggatgaagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcagaaaaattattcctgatgtggtaact 29866582  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||| | |||  ||||||| ||||||    
T  29866583 tacaattcccttattgatggtttgtgcaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatgatcggggtgtaccacctgatataa 29866682  T
Q  321 ttacttaca 329  Q
    |||||||||    
T  29866683 ttacttaca 29866691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 29348763 - 29348548
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  29348763 tatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccatgaatctctttaaagaaatgcattgcaaaaacattattcctgatgtggtaact 29348664  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||||||||||| || |||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||| ||    
T  29348663 tacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcagggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtgtaccacatgataaaa 29348564  T
Q  321 ttacttacaactctat 336  Q
    |||||||||| |||||    
T  29348563 ttacttacaattctat 29348548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Original strand, 29929107 - 29929322
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29929107 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaacttttcaaagaaatgcatcacaaacaaatttttcctgatgtgataact 29929206  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    || | | ||||| |  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  | |||||||||||     
T  29929207 tatagtgcccttatcgatggattgtgcaaatcagggagaatctcatatgctttgcagcttgtcgatcagatgcatgatagaggtgtagcacctaatatag 29929306  T
Q  321 ttacttacaactctat 336  Q
    |||||||||| |||||    
T  29929307 ttacttacaattctat 29929322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 125 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30060323 - 30060112
Alignment:
Q  125 atgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaacttaca 224  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  30060323 atgattaatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcaaaaacattattcctgatgtggtaacataca 30060224  T
Q  225 attcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataattac 324  Q
    |||||||| || ||||| | || | |||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30060223 attcccttattgatggtatctgtaaatcggggaaaatctcttatgctttaaagctagtcgatgagatgaatgatagaggtcaactacctgatataattac 30060124  T
Q  325 ttacaactctat 336  Q
    |||||| |||||    
T  30060123 ttacaattctat 30060112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 29073597 - 29073805
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||    
T  29073597 tatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccatgaatctctttaaaaaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgact 29073696  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||| ||| ||| || |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  29073697 tacacttctcttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtgtaccacctgatataa 29073796  T
Q  321 ttacttaca 329  Q
    |||||||||    
T  29073797 ttacttaca 29073805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 29078361 - 29078569
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||    
T  29078361 tatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccatgaatctctttaaaaaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgact 29078460  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||| ||| ||| || |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  29078461 tacacttctcttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtgtaccacctgatataa 29078560  T
Q  321 ttacttaca 329  Q
    |||||||||    
T  29078561 ttacttaca 29078569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 29106170 - 29106378
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||    
T  29106170 tatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccatgaatctctttaaaaaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgact 29106269  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||| ||| ||| || |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  29106270 tacacttctcttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtgtaccacctgatataa 29106369  T
Q  321 ttacttaca 329  Q
    |||||||||    
T  29106370 ttacttaca 29106378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Original strand, 29084852 - 29085067
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| || | ||||||| | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||    
T  29084852 tatcttgattaatgggttttgtaagattaaaaaggtcgataaagctatgaatctctttaatgaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgact 29084951  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||||||| ||| || |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||     
T  29084952 tacaattctcttattgatggtttaagcaaatcagggagaatctcatatgctttgcagcttgtcgatcagatgcatgatagaggtgtaccacctaatatac 29085051  T
Q  321 ttacttacaactctat 336  Q
    |||||||||| |||||    
T  29085052 ttacttacaattctat 29085067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30127220 - 30127005
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  30127220 tatcatgattaatgggttttgtaagattaaaagggtgggtgaagccattaatctctttgaagaaatgcaatgcaaaaaaattattcctgatgtggtaact 30127121  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    || | ||||||| || ||||||| || | ||||| || ||||||  |||||||| | || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30127120 tatagttcccttattgatggtttctgtaaatcggagaaaatctctcatgctttgaatctagtcaatgagatgcatgatagaggtcaaccacctgatataa 30127021  T
Q  321 ttacttacaactctat 336  Q
    ||| |||||| |||||    
T  30127020 ttatttacaattctat 30127005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 29835049 - 29835257
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||    
T  29835049 tatcttgattaatgggctttgtaagattaaaatgacggatgaagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcagaaaaattattcctgatgtggtaact 29835148  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||||||||||| || |||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||| | |||  ||||||| ||||||    
T  29835149 tacaattcccttattgatggtttgtgtaaattggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatgatcggggtgtaccacctgatataa 29835248  T
Q  321 ttacttaca 329  Q
    |||||||||    
T  29835249 ttacttaca 29835257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Original strand, 29099177 - 29099392
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||| ||||||    
T  29099177 tatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaagtttgatgaagccatgaatctctttaaagaaatgcatcgcaaaaacattattcctgatgtcgtaact 29099276  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||| ||||||| || |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||     
T  29099277 tacagttcccttattgatggtttaagcaaatcagggagaatctcatatgctttgcagcttgtcgatcagatgcatgatagaggtgtaccacctaatatat 29099376  T
Q  321 ttacttacaactctat 336  Q
     ||||||||| |||||    
T  29099377 gtacttacaattctat 29099392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 29366586 - 29366371
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||    
T  29366586 tatcatgattcacgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagccatgaatctctttaaagaaatgcattgcaataacattattcctgatgtggtaact 29366487  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||||||||||| || |||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||| ||    
T  29366486 tacaattcccttattgatggtttgtgtaaattggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtgtaccacatgataaaa 29366387  T
Q  321 ttacttacaactctat 336  Q
    |||||||||| |||||    
T  29366386 ttacttacaattctat 29366371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Original strand, 29882269 - 29882484
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29882269 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaacttttcaaagaaatgcatcacaaacaaatttttcctgatgtgataact 29882368  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    || | | ||||| |  |||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||    
T  29882369 tatagtgcccttatcgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctttggaacttgtcgatgagatgcatgatcgagggcaacaacctgatataa 29882468  T
Q  321 ttacttacaactctat 336  Q
    |||| ||||| |||||    
T  29882469 ttacctacaattctat 29882484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 125 - 336
Target Start/End: Original strand, 29889568 - 29889779
Alignment:
Q  125 atgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaacttaca 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  29889568 atgattaatgggttttgtaagattaaaaaagtcgatgaagccatgaatctctttaaagaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgacttaca 29889667  T
Q  225 attcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataattac 324  Q
    |||| ||| || |||||||  ||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||    
T  29889668 attctcttattgatggtttaagcaaatcagggataatctcatatgttttgcagcttgtcgatcagatgcatgatagaggtgtaccacctaatatagtcac 29889767  T
Q  325 ttacaactctat 336  Q
    |||||| |||||    
T  29889768 ttacaattctat 29889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Original strand, 29909425 - 29909640
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29909425 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaacttttcaaagaaatgcatcacaaacaaatttttcctgatgtgataact 29909524  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    || | | ||||| |  |||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||    
T  29909525 tatagtgcccttatcgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctttggaacttgtcgatgagatgcatgatcgagggcaacaacctgatataa 29909624  T
Q  321 ttacttacaactctat 336  Q
    |||| ||||| |||||    
T  29909625 ttacctacaattctat 29909640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 327
Target Start/End: Original strand, 29905473 - 29905679
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || |  ||||| |||||||||||    
T  29905473 tatcttgattaatgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccataaatctctttgaagaaatgcattgtagaaaattaattcctgatgtggtaact 29905572  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||||||||||| |  |||||||||| | ||| || | |||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29905573 tacaattcccttatcgatggtttgtgtaaatctggaaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatgatagaggtcagccacctgatataa 29905672  T
Q  321 ttactta 327  Q
    |||||||    
T  29905673 ttactta 29905679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30118906 - 30118700
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || |  ||||| |||||||||||    
T  30118906 tatcttgattaatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagccataaatctctttgaagaaatgcattgtagaaaattaattcctgatgtggtaact 30118807  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||||||||||| |  |||||||||| | ||| || | |||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  30118806 tacaattcccttatcgatggtttgtgtaaatctggaaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatgatagaggtcagccacctgatataa 30118707  T
Q  321 ttactta 327  Q
    |||||||    
T  30118706 ttactta 30118700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29358144 - 29357936
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    ||  |  |||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29358144 tatcttgattaatgggttttgtaagattaaaatgatggatgaagccatggaactactcaaagaaatgcatcacaaacaaattattcctaacgtggtaact 29358045  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||| ||||||| || ||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29358044 tacagttcccttattgatggtttatgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtggatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatag 29357945  T
Q  321 ttacttaca 329  Q
    |||||||||    
T  29357944 ttacttaca 29357936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 172 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30062109 - 30061945
Alignment:
Q  172 tctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgct 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||| || | |||||||| |||||| ||||||    
T  30062109 tctctttgaagaaatgcattgcaaaaacattattcccgatgtggtagcttacaattcccttattgatggtttttgtaaatcggggaaaatctcttatgct 30062010  T
Q  272 ttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataattacttacaactctat 336  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30062009 ttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatataattacttacaattctat 30061945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Original strand, 29116095 - 29116310
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||| ||||||    
T  29116095 tatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaagtttgatgaagccatgaatctctttaaagaaatgcatcgcaaaaacattattcctgatgtcgtaact 29116194  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||| ||||||| || |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||     
T  29116195 tacagttcccttattgatggtttaagcaaatcagggagaatctcatatgctttgcagcttgtcgatcagatgcatgatagaggtgtaccacctactatac 29116294  T
Q  321 ttacttacaactctat 336  Q
     ||||||||| |||||    
T  29116295 gtacttacaattctat 29116310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Original strand, 29876659 - 29876874
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | ||||||  ||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||  | || ||    
T  29876659 tatcatgattaatggattttgtaaggttaaaatgatggatgaagcaatgaatctcttccaagaaatgcattgtaaagaaataattcctgatacgatagct 29876758  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    || | ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||  || | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29876759 tatagttcccttattgatggtttttgcaaatcggggagaattccacaggctttggagcttgttgatgagatgcatgatagaggccaaccacctaatataa 29876858  T
Q  321 ttacttacaactctat 336  Q
    |||||||||| |||||    
T  29876859 ttacttacaattctat 29876874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24272112 - 24271912
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24272112 tatcatgattaatagattttgtaagattaaaatggtggatcaagccatgaaacttttcaaagaaatgcatcacaaacaaatttttcctaatgtgataact 24272013  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    || | ||||||| || |||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||    
T  24272012 tatagttcccttattgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctttggaacttaacgatgagatgcatgatcgagggcaacaacctgatataa 24271913  T
Q  321 t 321  Q
    |    
T  24271912 t 24271912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 29894387 - 29894595
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || | ||||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  29894387 tatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctctttaaagaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaact 29894486  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||||||||||| || |||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||| | |||  ||||||| ||||||    
T  29894487 tacaattcccttattgatggtttgtgtaaattggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatgatcggggtgtaccacctgatataa 29894586  T
Q  321 ttacttaca 329  Q
    |||||||||    
T  29894587 ttacttaca 29894595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 126 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24263912 - 24263717
Alignment:
Q  126 tgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaacttacaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24263912 tgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatcaagccatgaaacttttcaaagaaatgcatcacaaacaaatttttcctaatgtgataacttataa 24263813  T
Q  226 ttcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataat 321  Q
    ||||||| || |||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||   ||||||||| |||| |||| |||| |||||||    
T  24263812 ttcccttattgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctttggaacttatcgatttgatgcatgatcgagggcaacaacctgatataat 24263717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 29897911 - 29898119
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | | |  |  ||||| |||||||||||    
T  29897911 tatcttgattaatgggttttgtaagagtaaaatgaccgatgaagccatgaatctctttgaagaaatgcattgtagaaagctaattcctgatgtggtaact 29898010  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||| | || ||||| | |||| || || ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29898011 tacaattctcttatcgatggtttgtgtaaattggggaaattctcttacgcgttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 29898110  T
Q  321 ttacttaca 329  Q
    |||| ||||    
T  29898111 ttacgtaca 29898119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 332 - 409
Target Start/End: Original strand, 29946594 - 29946671
Alignment:
Q  332 tctatggattatgtaaagttggaaggctaaaggatgcacggaaggtttttgaataccttttggtcaaaggctacagtc 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29946594 tctatggattatgtaaagttggaaggctaaaggatgcacggaaggtttttgaatatcttttggtcaaaggctgcagtc 29946671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 451 - 599
Target Start/End: Original strand, 29894799 - 29894947
Alignment:
Q  451 acatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaataatatagctgcattccagaca 550  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||||      
T  29894799 acatataccgttatgatccatgggttttgtaacaagggcttgtttgatgaagcattgactttgttgtcaaaaatgaaagacaatagttgcattccagatg 29894898  T
Q  551 cggcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
    | | |||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  29894899 ctgtaacttatgaaataatcatccgttccctgtttgataaagatgaaaa 29894947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24886692 - 24886569
Alignment:
Q  111 atagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaa 210  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||| | ||||| |    
T  24886692 atagctacactatcttgattaatggattttgcaaggttaaaatgatagatgaagccataaatctctatgaagaaatgcattgtagaaaaaatattcctga 24886593  T
Q  211 tgtggtaacttacaattcccttgt 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  24886592 tgtggtaacttacagttcccttgt 24886569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 461 - 599
Target Start/End: Original strand, 25451380 - 25451518
Alignment:
Q  461 ttatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaataatatagctgcattccagacacggcaactta 560  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||| |  | || |||||||||||||| | ||||||    
T  25451380 ttatgatccatggattttgtagaaagggcttgtttgatgaagctttgacattgctgtcaaatatgaaagacaacagttgcattccagacaccgtaactta 25451479  T
Q  561 tggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
    |  ||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||    
T  25451480 taaaacaattatcagttctcttcttgataaaggtgaaaa 25451518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 451 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 24271717 - 24271569
Alignment:
Q  451 acatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaataatatagctgcattccagaca 550  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || ||| |||||||||||||| |  || | ||||||||| |      
T  24271717 acatataccgttatgatccatgggttttgtaacaagggcttgtttgatgaagcaatgactttgttgtcaaaaatgaaagacaattgttgcattccaaatg 24271618  T
Q  551 cggcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
    | | |||||||| || ||| |||| |||| |||||||||| | ||||||    
T  24271617 ctgtaacttatgaaataatcatccgttctctgtttgataacgatgaaaa 24271569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 451 - 599
Target Start/End: Original strand, 29866895 - 29867043
Alignment:
Q  451 acatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaataatatagctgcattccagaca 550  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||| |  |||| ||| ||||| |      
T  29866895 acatataccgttatgatccatgggttttgtaacaagggcttgtttgatgaagcattggctttgttgtcaaaaatgaaagacaatagttgctttccaaatg 29866994  T
Q  551 cggcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
    |   |||||||| || ||| |||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  29866995 ccttaacttatgaaataatcatccgttctctgtttgataaagatgaaaa 29867043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29211429 - 29211350
Alignment:
Q  250 atcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataattacttaca 329  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29211429 atcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtggatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagttacttaca 29211350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 426 - 548
Target Start/End: Original strand, 29078748 - 29078870
Alignment:
Q  426 caaaggctacagtcttgatgcatatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 525  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  29078748 caaaggctacaatcttgatgtctatgcatataccgttatgatccaagggttttgtgtcaagggcttgtttaatgaagcgttggccttgctgtcaaaaatg 29078847  T
Q  526 aaataatatagctgcattccaga 548  Q
     || |  || |||||||||||||    
T  29078848 gaagacaatggctgcattccaga 29078870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 426 - 548
Target Start/End: Original strand, 29099564 - 29099686
Alignment:
Q  426 caaaggctacagtcttgatgcatatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 525  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  29099564 caaaggctacaatcttgatgtctatgcatataccattatgatccaagggttttgtgtcgagggcttgtttaatgaagcgttggccttgctgtcaaaaatg 29099663  T
Q  526 aaataatatagctgcattccaga 548  Q
     || |  || |||||||||||||    
T  29099664 gaagacaatggctgcattccaga 29099686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 451 - 528
Target Start/End: Original strand, 29835461 - 29835538
Alignment:
Q  451 acatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaa 528  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  29835461 acatataccgttatgatccatgggttttgtaacaagggcttgtttgatgaagcattggctttgttgtcaaaaatgaaa 29835538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 426 - 599
Target Start/End: Original strand, 29882656 - 29882829
Alignment:
Q  426 caaaggctacagtcttgatgcatatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 525  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  29882656 caaaggctacaatcttgatgtctatgcatataccgttatgatccaagggttttgtgacaagggcttgtttgacgaagcgttggccttgctgtcaaaaatg 29882755  T
Q  526 aaataatatagctgcattccagacacggcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
     || |  || | |||||||||||  |   |||||||| || |||||||| |||| |||| || |||| ||||||    
T  29882756 gaagagaatggatgcattccagatgctaaaacttatgaaataattatcctttctctgttcgaaaaagatgaaaa 29882829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 451 - 528
Target Start/End: Original strand, 29887543 - 29887620
Alignment:
Q  451 acatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaa 528  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  29887543 acatataccgttatgatccatgggttttgtaacaagggcttgtttgatgaagcattggctttgttgtcaaaaatgaaa 29887620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 426 - 599
Target Start/End: Original strand, 29909812 - 29909985
Alignment:
Q  426 caaaggctacagtcttgatgcatatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 525  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  29909812 caaaggctacaatcttgatgtctatgcatataccgttatgatccaagggttttgtgacaagggcttgtttgacgaagcgttggccttgctgtcaaaaatg 29909911  T
Q  526 aaataatatagctgcattccagacacggcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
     || |  || | |||||||||||  |   |||||||| || |||||||| |||| |||| || |||| ||||||    
T  29909912 gaagagaatggatgcattccagatgctaaaacttatgaaataattatcctttctctgttcgaaaaagatgaaaa 29909985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 426 - 599
Target Start/End: Original strand, 29914213 - 29914386
Alignment:
Q  426 caaaggctacagtcttgatgcatatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 525  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  29914213 caaaggctacaatcttgatgtctatgcatataccgttatgatccaagggttttgtgacaaggacttgtttgatgaagcgttggccttgctgtcaaaaatg 29914312  T
Q  526 aaataatatagctgcattccagacacggcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
     || |  || | |||||||||||  |   |||||||| || |||||||| |||| |||| || |||| ||||||    
T  29914313 gaagagaatggatgcattccagatgctaaaacttatgaaataattatcctttctctgttcgaaaaagatgaaaa 29914386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 426 - 525
Target Start/End: Original strand, 29073984 - 29074083
Alignment:
Q  426 caaaggctacagtcttgatgcatatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 525  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  29073984 caaaggctacaatcttgatgtctatgcatataccgttatgatccaagggttttgtgtcaagggcttgtttaatgaagcgttggccttgctgtcaaaaatg 29074083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 426 - 525
Target Start/End: Original strand, 29106557 - 29106656
Alignment:
Q  426 caaaggctacagtcttgatgcatatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 525  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  29106557 caaaggctacaatcttgatgtctatgcatataccgttatgatccaagggttttgtgtcaagggcttgtttaatgaagcgttggccttgctgtcaaaaatg 29106656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 430 - 599
Target Start/End: Original strand, 29903462 - 29903631
Alignment:
Q  430 ggctacagtcttgatgcatatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaat 529  Q
    ||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||| ||     
T  29903462 ggctacaatcttgatgtctatgcatataccgttatgatccaagggttttgtgacaagggcttgtttgatgaagtgttggccttgctgtcaaaaatggaag 29903561  T
Q  530 aatatagctgcattccagacacggcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
    |  || | |||||||||||  |   |||||||| || |||||||| |||| |||| || |||| ||||||    
T  29903562 agaatggatgcattccagatgctaaaacttatgaaataattatcctttctctgttcgaaaaagatgaaaa 29903631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 426 - 599
Target Start/End: Original strand, 29912193 - 29912366
Alignment:
Q  426 caaaggctacagtcttgatgcatatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 525  Q
    |||||||||||  |||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  29912193 caaaggctacaaccttgatgtctatgcatataccgttatgatccaagggttttgtgacaagggcttgtttgacgaagcgttggccttgctgtcaaaaatg 29912292  T
Q  526 aaataatatagctgcattccagacacggcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
     || |  || | |||||||||||  |   |||||||| || |||||||| |||| |||| || |||| ||||||    
T  29912293 gaagagaatggatgcattccagatgctaaaacttatgaaataattatcctttctctgttcgaaaaagatgaaaa 29912366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21160800 - 21160720
Alignment:
Q  111 atagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcatt 191  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  21160800 atagctatactgtcatgattaatggactatgtaagaataaaatggtggatgaagccgttaatctctttaaagaaatgcatt 21160720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 451 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 28926300 - 28926152
Alignment:
Q  451 acatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaataatatagctgcattccagaca 550  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |  || ||||||||||| || || || | ||||||||| ||     
T  28926300 acatataccgttatgatccatgtgttttgtaacaacggcatgtttggtgaagcattggctatgttgtcaaaaatggaagaaaatggttgcattccaaacg 28926201  T
Q  551 cggcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
    | |  ||||||| || ||| |||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  28926200 ccgttacttatgaaataatcatccgttctctgtttgataaagatgaaaa 28926152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 525
Target Start/End: Original strand, 24731076 - 24731175
Alignment:
Q  426 caaaggctacagtcttgatgcatatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 525  Q
    ||||||||| | ||| ||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||    
T  24731076 caaaggctataatctagatgtctatacatataccgttatgatccaagggttttgtgtcaagggcttgtttgatgcagcgttggccttgctgtcaaaaatg 24731175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 548
Target Start/End: Original strand, 29116505 - 29116604
Alignment:
Q  449 atacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaataatatagctgcattccaga 548  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||| || |  || |||||||||||||    
T  29116505 atacatataccattatgatccaagggttttgtgtcgagggcttgtttaatgaagcgttggccttgctgtcaaaaatggaagacaatggctgcattccaga 29116604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 528
Target Start/End: Original strand, 29085264 - 29085341
Alignment:
Q  451 acatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaa 528  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  29085264 acatataacgttatgatccatgggttttgtaagaagggcttgtttgatgaagcattgtctttgttgtcaaaaatgaaa 29085341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 336
Target Start/End: Original strand, 29903222 - 29903295
Alignment:
Q  263 tcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataattacttacaactctat 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  29903222 tcatatgctttggaacttgtcgatgagatgcatgatcgagggcaacaacctgatataattacctacaattctat 29903295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 196
Target Start/End: Original strand, 30154336 - 30154409
Alignment:
Q  123 tcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaa 196  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||||| ||||    
T  30154336 tcatgattaatggattatgtaaggttaaaatggtggatgaagctgtgattctctttaaagaaatgcattccaaa 30154409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 24263505 - 24263357
Alignment:
Q  451 acatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaataatatagctgcattccagaca 550  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||||||||| | |||||||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||     
T  24263505 acatatactgttatgattcaagggttttgtagccatggcttgtttgatgaagcattgtctttgttgtcaaaaatgaaagacaatagttgcattccagacg 24263406  T
Q  551 cggcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
    |    ||||||| || ||| |||  |||| |||||||||||| ||||||    
T  24263405 ccattacttatgaaataatcatctgttctctgtttgataaagatgaaaa 24263357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 451 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 30126808 - 30126660
Alignment:
Q  451 acatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaataatatagctgcattccagaca 550  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||  | ||| ||| | |||||||| |  |||| ||||||||| ||     
T  30126808 acatataccgatatgatccatgggttgtgtaacatgggcttgtttgatgaagcattggctttgttgttagaaatgaaagacaatagttgcattccaaacg 30126709  T
Q  551 cggcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
      | |||||||| || ||| |||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  30126708 ttgtaacttatgaaataatcatccgttctctgtttgataaagatgaaaa 30126660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 207
Target Start/End: Original strand, 29903101 - 29903180
Alignment:
Q  128 attaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcc 207  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29903101 attaacgggttttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaacttttcagagaaatgcatcgcaaacaaatttttcc 29903180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Original strand, 30149352 - 30149431
Alignment:
Q  112 tagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcatt 191  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||    
T  30149352 tagctacaatatcatgattaacggattatgtaagaataaaatggtggatgaagccgtaaatcttttcaaagaaatgcatt 30149431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24886573 - 24886515
Alignment:
Q  278 cttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataattacttacaactctat 336  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24886573 cttgtcgatataatgcatgatagaggtcagccacctgatataattacttacaattctat 24886515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 29357735 - 29357637
Alignment:
Q  448 tatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaataatatagctgcattcca 546  Q
    |||||||||||  |||||||||| || ||||||  |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||| || |  || |||||||||||    
T  29357735 tatacatatactgttatgatccaaggcttttgtgacaagggcttgtttgatgaagcgttgaccttgctatcaaaaatggaagacaatggctgcattcca 29357637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 165
Target Start/End: Original strand, 30053251 - 30053305
Alignment:
Q  111 atagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagc 165  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30053251 atagctacattgtcatgattaatggattatgtaagaataaaatggtggatgaagc 30053305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16702304 - 16702235
Alignment:
Q  128 attaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaac 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||   |||||||||||||||||    
T  16702304 attaatggattatgtaagattaaaatggttgatgaagccttgaatctcttcacagaaatgcattgcaaac 16702235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24739370 - 24739285
Alignment:
Q  111 atagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaa 196  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| | | |||| |  |||||||||||| ||||    
T  24739370 atagctatagtgtcatgattaatggactatgtaagactaaaatggtggatgaagccgttaatctcctcaaagaaatgcattccaaa 24739285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 451 - 620
Target Start/End: Original strand, 29929519 - 29929687
Alignment:
Q  451 acatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaataatatagctgcattccagaca 550  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||| | |||| ||||  | ||||||||||||||| || || || | ||||||||||||     
T  29929519 acatataccgttatgattcaagggttttgtagccatggcttgttggatgaatcattggctttgctgtcaaaaatggaagaaaatggttgcattccagacg 29929618  T
Q  551 cggcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaaatgataagacatggaaacttc 620  Q
    | |  ||||||| || ||| |||  |||| | |||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||    
T  29929619 ccgttacttatgaaataatcatctgttctctatttgataaagat-aaaaatgataaggcagagaaacttc 29929687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 426 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 30061773 - 30061696
Alignment:
Q  426 caaaggctacagtcttgatgcatatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagc 503  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  30061773 caaaggctacaatcttgatgtgtatgcatatgccgttatgatccatgggttttgtaacaatggtttgtttgatgaagc 30061696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15727335 - 15727179
Alignment:
Q  140 tgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaacttacaattcccttgttaatg 239  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| | ||||||| | |||||  ||||  |||| ||  ||||||||||||||| ||  || |||    
T  15727335 tgtaagattaaaatgatcgatgaagccttgagtctctttaatgaaatgcgtagcaaaggaattactcctgataaggtaacttacaattctctcattgatg 15727236  T
Q  240 gtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatg 296  Q
    ||||||||| | |  |||||||| | | ||||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  15727235 gtttgtgcaaagcaaggagaatcccctgtgcttgggagtttgttgatgagatgcatg 15727179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 426 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 24890024 - 24889925
Alignment:
Q  426 caaaggctacagtcttgatgcatatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 525  Q
    ||||||||| | ||| ||||  ||| |||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||||    
T  24890024 caaaggctataatctagatgtctatgcatatactgttatgatccaagggttttgtgacaagggcttctttgataaagcattggccttgctgtcaaaaatg 24889925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 351 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29366244 - 29366189
Alignment:
Q  351 tggaaggctaaaggatgcacggaaggtttttgaataccttttggtcaaaggctaca 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  29366244 tggaaggctagaggatgcacggatagtttttgaagatcttttggtcaaaggctaca 29366189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 451 - 586
Target Start/End: Original strand, 29889976 - 29890111
Alignment:
Q  451 acatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaataatatagctgcattccagaca 550  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||  | ||||||||||||||| || || || | |||||| || ||     
T  29889976 acatataccgttatgattcaagggttttgtagccatggcttgtttgatgaatcattggctttgctgtcaaaaatggaagaaaatggttgcatttcaaacg 29890075  T
Q  551 cggcaacttatggaacaattatccattctttgtttg 586  Q
    | | |||||||| || ||| |||| |||| ||||||    
T  29890076 ccgtaacttatgaaataatcatccgttctctgtttg 29890111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 29211146 - 29211072
Alignment:
Q  451 acatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 525  Q
    ||||||| | ||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  29211146 acatatatcgttatgttctatgggttttgtaagaagggcttgtttgatgaagcatcggccttgctgtcaaaaatg 29211072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 24263591 - 24263522
Alignment:
Q  335 atggattatgtaaagttggaaggctaaaggatgcacggaaggtttttgaataccttttggtcaaaggcta 404  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||    
T  24263591 atggattgtgtaaaggtggaagactagaggatgcacggaatatttttgaggatcttttggtcaaaggcta 24263522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15715151 - 15715083
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgca 189  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||  ||||||||||    
T  15715151 tatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttgaatctcttcaaagaaatgca 15715083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 362 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 29357791 - 29357751
Alignment:
Q  362 aggatgcacggaaggtttttgaataccttttggtcaaaggc 402  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29357791 aggatgcacggaaggtttttgaagatcttttggtcaaaggc 29357751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 196
Target Start/End: Original strand, 24934505 - 24934576
Alignment:
Q  125 atgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaa 196  Q
    |||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||| ||||    
T  24934505 atgattaatggactatgcaagactaaaatggtggatgaagccgttaatctcttcaaagaaatgcattccaaa 24934576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 29348354 - 29348203
Alignment:
Q  448 tatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaataatatagctgcattccag 547  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||  ||| | ||||||||   |||||||  ||||||||||||||||| || |  || |||||||||||     
T  29348354 tatacatataccgttatgattcaagggttttgtgacaacgacttgtttgacaaagcattggccttgctgtcaaaaatggaagacaatggctgcattccaa 29348255  T
Q  548 acacggcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
    |  |   |||||||| || |||||||| |||| |||| || |||| ||||||    
T  29348254 atgctaaaacttatgaaataattatcctttctctgttcgaaaaagatgaaaa 29348203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 426 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 24886344 - 24886222
Alignment:
Q  426 caaaggctacagtcttgatgcatatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 525  Q
    ||||||||| | ||| ||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||   ||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  24886344 caaaggctataatctagatgtctatacatatactgttatgatccaagggttttgtgacaagggtttgtttaaggaagcgttggccttgctgtccaaaatg 24886245  T
Q  526 aaataatatagctgcattccaga 548  Q
     || |  || |||||||||||||    
T  24886244 gaagacaatggctgcattccaga 24886222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 24271803 - 24271734
Alignment:
Q  335 atggattatgtaaagttggaaggctaaaggatgcacggaaggtttttgaataccttttggtcaaaggcta 404  Q
    ||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||    
T  24271803 atggattgtgcaaaggtggaagactagaggatgcacggaatatttttgaggatcttttggtcaaaggcta 24271734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 462 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 29366163 - 29366026
Alignment:
Q  462 tatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaataatatagctgcattccagacacggcaacttat 561  Q
    |||||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||    ||| ||||||||||| || || || | ||||||||| || | |  ||||||    
T  29366163 tatgattcaagggttttgtagccatggcttgtttgatgaatcattggatttgttgtcaaaaatggaagaaaatggttgcattccaaacgccgttacttat 29366064  T
Q  562 ggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
    | || ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  29366063 gaaataatcatctgttctttgtttgataaagatgaaaa 29366026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 454 - 599
Target Start/End: Original strand, 29898322 - 29898467
Alignment:
Q  454 tataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaataatatagctgcattccagacacgg 553  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||  | |||||| |||||||| || || || | ||||||||| || |      
T  29898322 tataccgttatgattcaagggttttgtagctatggcttgtttgatgaatcattggctttgctgccaaaaatggaagaaaatggttgcattccaaacgcca 29898421  T
Q  554 caacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
      ||||||| || ||| |||  |||| |||||||||||| ||||||    
T  29898422 ttacttatgaaataatcatctgttctctgtttgataaagatgaaaa 29898467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 448 - 525
Target Start/End: Original strand, 29930311 - 29930388
Alignment:
Q  448 tatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 525  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||    ||||| || |||||||| |||||||||    
T  29930311 tatacatataccgttatgatccaagggttttgtgacatgggcttgttcaacgaagcgttgaccttgctatcaaaaatg 29930388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29950071 - 29950018
Alignment:
Q  112 tagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagc 165  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  29950071 tagctacaatatcatgattaacggattatgtaagaataaaatggtgaatgaagc 29950018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30577942 - 30577865
Alignment:
Q  112 tagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgca 189  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||||||    
T  30577942 tagctacaatataatgattaatggattaagtaaggctaaaatggtggatgaagctgtgattctctttaaagaaatgca 30577865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 152; Significance: 5e-80; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15063041 - 15062826
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15063041 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtagatgaagccatgaagctctttgaagaaatgcattgtaaacaaatttttccaaatgtggtaact 15062942  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15062941 tacaattcccttgttgatggtttgtgtaaatctggaagaacctcgtgtgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccatctaatataa 15062842  T
Q  321 ttacttacaactctat 336  Q
    |||||||||| |||||    
T  15062841 ttacttacaattctat 15062826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 335 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 15062715 - 15062641
Alignment:
Q  335 atggattatgtaaagttggaaggctaaaggatgcacggaaggtttttgaataccttttggtcaaaggctacagtc 409  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15062715 atggattgtgtaaagttggaagactagacgatgcacaaaaggtttttgaagatcttttggtcaaaggctacagtc 15062641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 188
Target Start/End: Original strand, 21456433 - 21456506
Alignment:
Q  115 ctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgc 188  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  21456433 ctatactatgatgattaaaggattatgtaagataaaaagggtggatgaagcattgaatctctttgaagaaatgc 21456506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 6)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24219400 - 24219191
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||     
T  24219400 tatcatgattagtggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaactctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcccgatgtggtgacg 24219301  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24219300 tacaattcccttattgatggtttgtgcaaatcgggaagaatctcatatgctttgaaacttatcggagagatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 24219201  T
Q  321 ttacttacaa 330  Q
    ||||||||||    
T  24219200 ttacttacaa 24219191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 125 - 332
Target Start/End: Original strand, 11991150 - 11991357
Alignment:
Q  125 atgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaacttaca 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | || ||||| | ||||  ||||  |||| ||  ||||||||| |    
T  11991150 atgattaatggattttgtaagattaaaatggttgatgaagccttgagtctctttaatgatatgcagttcaaaggaattgctcctgataaggtaacttata 11991249  T
Q  225 attcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataattac 324  Q
    |||| ||  || |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||| | ||    
T  11991250 attctctcattgatggtttgtgcaaatcagggagaatctcctatgcttgggagcttgttgatgaaatgcatgataatggtcaaccagccaatatattcac 11991349  T
Q  325 ttacaact 332  Q
    ||||||||    
T  11991350 ttacaact 11991357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 295
Target Start/End: Original strand, 16350875 - 16351058
Alignment:
Q  112 tagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaat 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||| | ||||||  ||||| |  ||||  |||| ||    
T  16350875 tagctataatatcatgattaatggattctgtaagattaaaatggtcgacgaagccttatgtctctttcatgaaatgtgttgcagaggaattgctcctcat 16350974  T
Q  212 gtggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcat 295  Q
      ||||||||||||||| ||  || |||||||||||| | | ||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  16350975 aaggtaacttacaattctctcattgatggtttgtgcaaagcagggagaatcccctatgcttgggagcttgttgatgagatgcat 16351058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 293
Target Start/End: Original strand, 33997774 - 33997946
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| | |||  |||| |||||||||||    
T  33997774 tatcattattaatggattgtgcaagaaaaaaagggtggatgaagccatgaatctctttaaagagatgcattggaaaaagattaatcctgatgtggtaact 33997873  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgc 293  Q
    ||||||  |||| || |||||||||||| ||  |||| |||||||  | ||||||||||||| ||||| ||||    
T  33997874 tacaatatccttattgatggtttgtgcaaattagggaaaatctcaacttctttggagcttgttgatgagatgc 33997946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 196
Target Start/End: Original strand, 24226656 - 24226729
Alignment:
Q  123 tcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaa 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  || ||| ||  |||||||||||| ||||    
T  24226656 tcatgattaatggattatgtaagaataaaatggtggatgaagccgcaaatcttttcaaagaaatgcattccaaa 24226729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 24208817 - 24208763
Alignment:
Q  567 aattatccattctttgtttgataaaggtgaaaaatgataagacatggaaacttcgt 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||    
T  24208817 aattatccattctttgtttgataaaggtg-aatatgataaggcaaagaaacttcgt 24208763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0573 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0573
Description:

Target: scaffold0573; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 3971 - 4179
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  3971 tatcttgattaatgggttttgtaagattaaaatgaccgatgcagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcagaaaaattattcctaatgtggtaact 4070  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    |||||||||||| |  |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4071 tacaattcccttatcgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctgatataa 4170  T
Q  321 ttacttaca 329  Q
    |||||||||    
T  4171 ttacttaca 4179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0573; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 451 - 599
Target Start/End: Original strand, 4383 - 4531
Alignment:
Q  451 acatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatgaaataatatagctgcattccagaca 550  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  |  || ||||||||||| || || || | ||||||||| ||     
T  4383 acatataccgttatgatccatgtgttttgtaacaacggcatgtttggtgaagcattggctatgttgtcaaaaatggaagaaaatggttgcattccaaacg 4482  T
Q  551 cggcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
    | |  ||||||| || ||| |||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  4483 ccgttacttatgaaataatcatccgttctctgtttgataaagatgaaaa 4531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 111 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 53771 - 53546
Alignment:
Q  111 atagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaa 210  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||   ||||||||||  |||||| ||| ||||| |    
T  53771 atagctacaatatcatgattaatggattttgtaagattaaaaaggtggataaagccatgaaactcttcatagaaatgcatcacaaacatattattcctga 53672  T
Q  211 tgtggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaacca 310  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  53671 tgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatatcttatgctttccagctagtcaatgagatgcatgatagaggtcaacca 53572  T
Q  311 cctaatataattacttacaactctat 336  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  53571 cctaatataattacttacaattctat 53546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 108; Significance: 9e-54; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 112 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4260491 - 4260276
Alignment:
Q  112 tagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaat 211  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| |     
T  4260491 tagctacaatatcatgattaatgaattttgtaaaatgaaaatggtggatgaagccatcaaactctttgaagaaatgcctctcaaacaaatatttcctgac 4260392  T
Q  212 gtggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccac 311  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4260391 gtggtaacttaccatacccttattgatggtttgtgcaaatccgggagattatcatatgctatggaacttgttgatgaaatggatgatagaggtgaaccac 4260292  T
Q  312 ctaatataattactta 327  Q
    ||||||||||||||||    
T  4260291 ctaatataattactta 4260276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 112 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4264113 - 4263898
Alignment:
Q  112 tagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaat 211  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| |     
T  4264113 tagctacaatatcatgattaatgaattttgtaaaatgaaaatggtggatgaagccatcaaactctttgaagaaatgcctctcaaacaaatatttcctgac 4264014  T
Q  212 gtggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccac 311  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4264013 gtggtaacttaccatacccttattgatggtttgtgcaaatccgggagattatcatatgctatggaacttgttgatgaaatggatgatagaggtgaaccac 4263914  T
Q  312 ctaatataattactta 327  Q
    ||||||||||||||||    
T  4263913 ctaatataattactta 4263898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 330
Target Start/End: Original strand, 10129971 - 10130180
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||  ||||||||||  ||| |||| |  ||||| ||  | |||||    
T  10129971 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagctattgatctcttcaaagaaatgcaaggcagacaactcgttcctgatacgataact 10130070  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    || | ||||||| || |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| |||||   ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  10130071 tatagttcccttattgatggcttgtgcaaatcagggagaatctcagatgcttgggaacttgtaagtgagatgtctgatagaggtcaacaacctaatataa 10130170  T
Q  321 ttacttacaa 330  Q
    ||||||||||    
T  10130171 ttacttacaa 10130180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Original strand, 19490076 - 19490154
Alignment:
Q  113 agctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcatt 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19490076 agctatactatcatgattaatggattatgtaagatgaaaatgttggatgaagcggtaagtctctttgaagaaatgcatt 19490154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 329
Target Start/End: Original strand, 17251137 - 17251355
Alignment:
Q  111 atagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaa 210  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||| | ||| || |||||| |||||||||| ||   |||||||||||  |||| |  | || |  |  ||||| |    
T  17251137 atagctatagtgtcatgattagtggattatctaaaatgaaaatgttggatgaagctatggatctctttgaagggatgcgtaacgaaaatgtgattcctga 17251236  T
Q  211 tgtggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcata-tgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaacc 309  Q
    ||| ||| |||| | ||| ||| || |||||||||||| ||| || ||||||  ||| ||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17251237 tgtagtagcttatagttctcttattgatggtttgtgcaaatcaggtagaatca-atagtgctttgaagtatgttgatgagatgcatgatagaggtcaacc 17251335  T
Q  310 acctaatataattacttaca 329  Q
    ||||||| |||| |||||||    
T  17251336 acctaatgtaataacttaca 17251355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 525
Target Start/End: Original strand, 17251559 - 17251633
Alignment:
Q  451 acatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 525  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| ||||||   || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17251559 acatatagtattatgatcaatgggctttgtaaagagagcttgtttgatgaagcattgaccttgctgtcaaaaatg 17251633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 164
Target Start/End: Original strand, 15591243 - 15591283
Alignment:
Q  124 catgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaag 164  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15591243 catgattaatggattatgtaagattaaaatagtggatgaag 15591283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 187
Target Start/End: Original strand, 15612789 - 15612844
Alignment:
Q  132 atggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatg 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  15612789 atggattatgtaagattaaaatggtatatgaaaccatgaatctctttgaagaaatg 15612844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15998884 - 15998809
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaa 196  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||  | | | | |||||||||||||| ||| ||||    
T  15998884 tatcatgattaatgaattatgtaagattaaaatagtggatgaaatcgtgaatgtctttgaagaaatgtattccaaa 15998809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 187
Target Start/End: Original strand, 41316095 - 41316169
Alignment:
Q  113 agctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatg 187  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | | ||||||| | ||||||    
T  41316095 agctataatatcatgattaacggattctgtaagattaaaatagtcaatgaagccttgattctctttaaggaaatg 41316169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Original strand, 22177 - 22392
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22177 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaacttttcaaagaaatgcatcacaaacaaatttttcctgatgtgataact 22276  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacctaatataa 320  Q
    || | ||||||| |  |||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| |||| |||| ||||||    
T  22277 tatagttcccttatcgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctttggaacttgtcgatgagatgcattatcgagggcaacaacctgatataa 22376  T
Q  321 ttacttacaactctat 336  Q
    |||||||||| |||||    
T  22377 ttacttacaattctat 22392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 426 - 599
Target Start/End: Original strand, 22564 - 22737
Alignment:
Q  426 caaaggctacagtcttgatgcatatacatataccattatgatccatgggttttgtagcaagggcttgtttggtgaagcattcaccttgctgtcaaaaatg 525  Q
    |||||||||||  |||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  22564 caaaggctacaaccttgatgtctatgcatataccgttatgatccaagggttttgtgacaagggcttgtttgacgaagcgttggccttgctgtcaaaaatg 22663  T
Q  526 aaataatatagctgcattccagacacggcaacttatggaacaattatccattctttgtttgataaaggtgaaaa 599  Q
     || |  || | |||||||||||  |   |||||||| || |||||||| |||| |||| || |||| ||||||    
T  22664 gaagagaatggatgcattccagatgctaaaacttatgaaataattatcctttctctgttcgaaaaagatgaaaa 22737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0572 (Bit Score: 83; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0572
Description:

Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 112 - 330
Target Start/End: Original strand, 3058 - 3276
Alignment:
Q  112 tagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaat 211  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||| | ||||||| ||||| |  ||||  |||| ||    
T  3058 tagctatagtatcgtgattaatggattctgtaagattaaaatggtcgacaaagccttgagtctcttttatgaaatgcgttgcagaagaattgctcctgat 3157  T
Q  212 gtggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccac 311  Q
      ||||||||||||||| ||  || |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||     
T  3158 acggtaacttacaattctctaattgatggtttgtgcaaatctgggagaatctcctatgcttgggagcttgttgatgagatgcgtgatagtggtcaaccag 3257  T
Q  312 ctaatataattacttacaa 330  Q
    || ||||||| ||||||||    
T  3258 ctgatataatcacttacaa 3276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 48097 - 47859
Alignment:
Q  92 ggagtgactcctgacaccgatagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcatt 191  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| | ||||||||||    
T  48097 ggagtggctcctgatgctgatagctatagtatcatgattaatggattctgtaagattaaaatggtcgacgaagccttgagtctcttttatgaaatgcatt 47998  T
Q  192 gcaaacaaatttttcctaatgtggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaat 291  Q
    ||| |  | ||  |||||||  | ||||||||| ||| ||  || |||||||||||| | | |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  47997 gcagaagatttgctcctaatacgataacttacagttcgctcattgatggtttgtgcaaagctgggagattctcttgtgcttgggagcttgttgatgagat 47898  T
Q  292 gcatgatagaggtcaaccacctaatataattacttacaa 330  Q
    ||||||||  || |||||||| |||||| | ||||||||    
T  47897 gcatgataatggccaaccacccaatatattcacttacaa 47859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 43458 - 43278
Alignment:
Q  113 agctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatg 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||  |  ||||| ||| |||     
T  43458 agctataatatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtcaatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgccgaggaatttctcccaata 43359  T
Q  213 tggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgc 293  Q
      |||||||||| ||| ||  || |||||||||||| ||  || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  43358 cagtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaattaggtagaatctcctatgcttgggagcttgttgatgagatgc 43278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 309
Target Start/End: Original strand, 140126 - 140320
Alignment:
Q  115 ctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtg 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| | ||| |  ||||  |||||||  |    
T  140126 ctatagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggttgatgaagccttgagtctctttgatgaaatgcgtcgcagaggaattgctcctaatacg 140225  T
Q  215 gtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaacc 309  Q
    |||||||||||||| ||  || ||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||  ||||||| |||  ||||||||    
T  140226 gtaacttacaattctctcattgatggtttatgcaaatcagggagaatcccctatgcttgggagcttgttgatacaatgcataataatggtcaacc 140320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 104913 - 104695
Alignment:
Q  111 atagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaa 210  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||| | ||||||| ||| | |  ||||  ||||||    
T  104913 atagctatagcatcatgattaatggattctgtaagattaaaatgatcgacgaagccttgagtctcttttatgaaatgcgttgtagaggaattgctcctaa 104814  T
Q  211 tgtggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaacca 310  Q
    |  ||||||||||| ||| ||  || |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||    
T  104813 tacggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatctgggagattctcttgtgcttgggagcttgtggatgagatgcatgttaatggtcaacca 104714  T
Q  311 cctaatataattacttaca 329  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  104713 cctaacatatttacttaca 104695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 313
Target Start/End: Original strand, 137200 - 137400
Alignment:
Q  113 agctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatg 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||| | ||||||| |||  ||  ||||| ||| |||     
T  137200 agctataatatcatgattaatggattctgtaagattaaaatggtcaatgaagctttgagtctctttaatgaaatgcgttgtcaaagaatttctcccaata 137299  T
Q  213 tggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacc 312  Q
     ||||||||||||||| ||  || |||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||    
T  137300 cggtaacttacaattctctcattgatggtttgtgcaaatcaggtagaatctcccatgcttggaagcttgtcgatgagatgcatgttaatggtcaaccacc 137399  T
Q  313 t 313  Q
    |    
T  137400 t 137400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 121636 - 121457
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||| |||||||||||||  |||         |||||  |||||||    
T  121636 tatcattattaatggtttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttgaatttctttaaagaaatgcattgtgaac---------ctaatacggtaact 121546  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaacc 309  Q
    |||| ||| ||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||  |||| | ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  121545 tacagttctcttattgatgctttgtgcaaatcagggagaatctctcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgatagaggtcaacc 121457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 126298 - 126111
Alignment:
Q  111 atagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaa 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||| | ||||||||| | ||||||| ||||| |  ||||  ||||||    
T  126298 atagctatagtatcatgattaatggattatgtaaggttaaaatggtcgacgaagccttgagtctcttttatgaaatgcgttgcagaggaattgctcctaa 126199  T
Q  211 tgtggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgat 298  Q
    |  ||||||||||| ||| ||  || |||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
T  126198 tacggtaacttacagttcgctcattgatggtttgtgcaaatctgggagatactcttatgcttgggaccttgttgatgagatgcatgat 126111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 295
Target Start/End: Original strand, 3642861 - 3643045
Alignment:
Q  111 atagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaa 210  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||||||  ||||  |||| |    
T  3642861 atagctataatataatgattaatggattgggtaagattaaaatggtcgatgaagccttaagtctctttaaggaaatgtgttgcaaaggaattgctcctga 3642960  T
Q  211 tgtggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcat 295  Q
    |  ||||||||||||||| ||  || |||||||||||| ||  || ||||| || ||||||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  3642961 tacggtaacttacaattctctcattgatggtttgtgcaaattaggaagaatatcctatgcttggcagcttgttgatgagatgcat 3643045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0654 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0654
Description:

Target: scaffold0654; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1395 - 1198
Alignment:
Q  111 atagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaa 210  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | ||||||  ||||| |  ||||  |||| |    
T  1395 atagctataatattattattaatggattctgtaagattaaaatggtcgatgaagccttaaatctctttaatgaaatgtgttgcagaggaattgctcctga 1296  T
Q  211 tgtggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaac 308  Q
    |  ||||||||||||||| ||  || |||||||||||| | | |||| ||| ||  |||| | ||||||| | ||| | |||||||||||||||||||    
T  1295 taaggtaacttacaattctctcattgatggtttgtgcaaagcagggaaaatttctcatgcatgggagcttcttgattagatgcatgatagaggtcaac 1198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 313
Target Start/End: Original strand, 6022 - 6222
Alignment:
Q  113 agctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatg 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||  |  ||||| ||| |||     
T  6022 agctataatatcatgattaatgggttctgtaagattaaaatgatcaatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgccgaggaatttctcccaata 6121  T
Q  213 tggtaacttacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacc 312  Q
      |||||||||| ||| ||  || |||||||||| | ||  || |||||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  6122 cagtaacttacagttctctcattgatggtttgtgtaaattaggtagaatctcctatgcttgggagtttgttgatgagatgcgtgataatggtcaaccacc 6221  T
Q  313 t 313  Q
    |    
T  6222 t 6222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 309
Target Start/End: Original strand, 27187 - 27375
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 220  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||  ||||  |||  ||  |||||||    
T  27187 tatcattattaagagattatgtaagattaaaatggtcgatgaagccttgagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattactcccgataaggtaact 27286  T
Q  221 tacaattcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaacc 309  Q
    |||| ||| ||  || |||||||||||| ||| | |||||||||  |||| | ||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  27287 tacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatctctcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgctagaggtcaacc 27375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 309
Target Start/End: Original strand, 8834 - 9017
Alignment:
Q  126 tgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaacttacaa 225  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| || | |||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||||| | ||| | ||||||  |||||||||||     
T  8834 tgattaatgggttgtgtaagaataaattgatcgatgaagccatggatttctttaaagaaatgcaaagcaaaaagattatccctaatacggtaacttacag 8933  T
Q  226 ttcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaacc 309  Q
    ||| ||| || |||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||| |||| |  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8934 ttctcttattgatggtttgtgcaaatcagggagaatttctcatgcttgggagttgcttgatgagatgcatgatagaggtcaacc 9017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0652 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0652
Description:

Target: scaffold0652; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1459 - 1375
Alignment:
Q  113 agctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaac 197  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||   |||||||||||||||||    
T  1459 agctacattatcattattaatggtttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttgaatctcttcacagaaatgcattgcaaac 1375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31470 - 31394
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaac 197  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | | ||||||   |||||||||||||||||    
T  31470 tatcattattaatggattatgtaagattaaaattgttgatgaagccttgaatctcttcacagaaatgcattgcaaac 31394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1840 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1840
Description:

Target: scaffold1840; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 187
Target Start/End: Original strand, 1234 - 1309
Alignment:
Q  112 tagctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatg 187  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||| | ||||||    
T  1234 tagctatagtatcgtgattaatggattctgtaagattaaaatggtcgacaaagccttgagtctcttttatgaaatg 1309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44030 - 43845
Alignment:
Q  125 atgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaacttaca 224  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  | | ||||||  |||||||||||| |||| | ||  |||||||    ||||| ||||    
T  44030 atgattaacggattttgcaagaataaaatggtggatgaagcagttaatctcttcaaagaaatgcattccaaaaatatggttcctaacactgtaacataca 43931  T
Q  225 attcccttgttaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaacca 310  Q
    ||||| |  || ||||  | |||| ||  |||||||| ||  |||||| |||  || | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  43930 attccttaattgatggactttgcaaattagggagaatgtctgatgcttgggattttatagatgagatgcatgatagaggtcaacca 43845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13904762 - 13904694
Alignment:
Q  121 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataagtctctttgaagaaatgca 189  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||  ||||||||||    
T  13904762 tatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttgaatctcttcaaagaaatgca 13904694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 4669994 - 4669959
Alignment:
Q  1 tgcattggggatgctacaaccatgcgatgaaagaat 36  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4669994 tgcattggggatgctacaaccatgtgatgaaagaat 4669959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44262754 - 44262713
Alignment:
Q  125 atgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagcc 166  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  44262754 atgattaatggattgtgtaagaaaaaaatggtggatgaagcc 44262713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University