View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8901_low_173 (Length: 228)

Name: NF8901_low_173
Description: NF8901
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8901_low_173
NF8901_low_173
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (20-228)||(16626470-16626678)
chr3 (17-228)||(18530474-18530685)
chr3 (24-228)||(5652473-5652677)
chr3 (25-228)||(4626030-4626233)
chr3 (25-228)||(17993753-17993956)
chr3 (15-222)||(31034076-31034283)
chr3 (15-222)||(32292844-32293051)
chr3 (25-222)||(5713319-5713516)
chr3 (25-222)||(5724229-5724426)
chr3 (25-222)||(5757051-5757248)
chr3 (25-222)||(5767942-5768139)
chr3 (15-216)||(8296070-8296271)
chr3 (15-216)||(15741053-15741254)
chr3 (15-216)||(18051360-18051561)
chr3 (15-216)||(18330767-18330968)
chr3 (15-222)||(22387537-22387744)
chr3 (15-216)||(4796612-4796813)
chr3 (15-216)||(15892665-15892866)
chr3 (15-219)||(6192411-6192615)
chr3 (15-222)||(7073304-7073511)
chr3 (15-222)||(29148714-29148921)
chr3 (15-216)||(8301226-8301427)
chr3 (15-216)||(35880864-35881065)
chr3 (15-219)||(4721726-4721930)
chr3 (15-222)||(4417011-4417218)
chr3 (15-222)||(10396225-10396432)
chr3 (15-222)||(28115913-28116120)
chr3 (15-222)||(11110308-11110515)
chr3 (15-210)||(29664929-29665124)
chr3 (15-222)||(5467077-5467284)
chr3 (15-222)||(8211830-8212037)
chr3 (15-222)||(28021367-28021574)
chr3 (15-222)||(48466019-48466226)
chr3 (15-222)||(4346646-4346853)
chr3 (15-222)||(18277011-18277218)
chr3 (15-222)||(18292312-18292519)
chr3 (15-222)||(18307613-18307820)
chr3 (15-210)||(20576806-20577001)
chr3 (15-222)||(21674785-21674992)
chr3 (15-222)||(22870815-22871022)
chr3 (15-222)||(22885874-22886081)
chr3 (15-222)||(36997036-36997243)
chr3 (15-222)||(51782115-51782322)
chr3 (15-222)||(51797205-51797412)
chr3 (46-222)||(20066135-20066311)
chr3 (46-222)||(32439246-32439422)
chr3 (15-222)||(31964432-31964639)
chr3 (15-222)||(50134030-50134237)
chr3 (15-222)||(5596316-5596523)
chr3 (15-222)||(5609281-5609488)
chr3 (15-222)||(6542421-6542628)
chr3 (15-210)||(17984915-17985110)
chr3 (15-222)||(28339394-28339601)
chr3 (15-222)||(5013804-5014011)
chr3 (15-222)||(18242831-18243038)
chr3 (15-222)||(47023545-47023752)
chr3 (15-222)||(18225283-18225490)
chr3 (15-222)||(24328251-24328458)
chr3 (15-222)||(7996654-7996861)
chr3 (15-222)||(10643162-10643369)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (20-222)||(15284851-15285053)
chr4 (17-228)||(15228010-15228221)
chr4 (25-228)||(24460533-24460736)
chr4 (17-223)||(1900402-1900608)
chr4 (20-228)||(14235448-14235656)
chr4 (50-228)||(15391291-15391469)
chr4 (15-219)||(17014149-17014353)
chr4 (15-216)||(24592232-24592433)
chr4 (15-216)||(14665170-14665371)
chr4 (15-222)||(5006019-5006226)
chr4 (15-222)||(36344433-36344640)
chr4 (15-222)||(6569999-6570206)
chr4 (15-222)||(14763222-14763429)
chr4 (15-222)||(18800531-18800738)
chr4 (15-222)||(31126436-31126643)
chr4 (15-222)||(40105556-40105763)
chr4 (46-222)||(34188909-34189085)
chr4 (15-222)||(33673716-33673923)
chr4 (15-221)||(14098688-14098894)
chr4 (46-222)||(24112808-24112984)
chr4 (15-210)||(21969859-21970054)
chr4 (15-222)||(54833533-54833740)
chr4 (15-222)||(27163235-27163442)
chr4 (15-222)||(30753900-30754107)
chr4 (15-210)||(39850796-39850991)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (20-228)||(19456333-19456541)
chr2 (24-228)||(27118809-27119013)
chr2 (25-228)||(3784775-3784978)
chr2 (17-228)||(21703073-21703284)
chr2 (15-228)||(34303210-34303423)
chr2 (25-228)||(16163720-16163923)
chr2 (25-228)||(34157132-34157334)
chr2 (20-228)||(27393090-27393298)
chr2 (25-216)||(31891245-31891436)
chr2 (15-210)||(9349889-9350084)
chr2 (15-222)||(40233638-40233845)
chr2 (15-219)||(27434351-27434555)
chr2 (15-216)||(23128473-23128674)
chr2 (15-216)||(12655675-12655876)
chr2 (15-216)||(28882347-28882548)
chr2 (15-219)||(20838048-20838252)
chr2 (15-222)||(22925935-22926142)
chr2 (15-210)||(12586949-12587144)
chr2 (15-210)||(13936451-13936646)
chr2 (15-210)||(27777361-27777556)
chr2 (15-210)||(27817119-27817314)
chr2 (15-222)||(37375288-37375495)
chr2 (15-222)||(260660-260867)
chr2 (15-210)||(12716509-12716704)
chr2 (15-210)||(16829245-16829440)
chr2 (15-210)||(16892041-16892236)
chr2 (15-222)||(32049925-32050132)
chr2 (15-222)||(37925620-37925827)
chr2 (15-210)||(39051729-39051924)
chr2 (18-210)||(27803846-27804038)
chr2 (15-222)||(11635093-11635300)
chr2 (15-222)||(11641282-11641489)
chr2 (15-222)||(21677089-21677296)
chr2 (15-222)||(31876408-31876615)
chr2 (15-222)||(34861807-34862014)
chr2 (15-222)||(37685816-37686023)
chr2 (15-222)||(37701081-37701288)
chr2 (50-222)||(34286481-34286653)
chr2 (50-222)||(34291541-34291713)
chr2 (15-221)||(39890202-39890408)
chr2 (134-222)||(34279576-34279664)
chr2 (15-222)||(19416406-19416613)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (15-228)||(2576-2789)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (15-228)||(20340253-20340466)
chr1 (17-228)||(16207951-16208162)
chr1 (17-228)||(20461205-20461416)
chr1 (15-222)||(28151992-28152199)
chr1 (15-222)||(51638348-51638555)
chr1 (15-222)||(10962800-10963007)
chr1 (15-222)||(28585111-28585318)
chr1 (15-222)||(41793226-41793433)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (15-228)||(22456795-22457008)
chr6 (15-222)||(14143146-14143353)
chr6 (15-222)||(26788072-26788279)
chr6 (15-222)||(27196445-27196652)
chr6 (15-222)||(27252588-27252795)
chr6 (25-228)||(28162779-28162982)
chr6 (25-228)||(33374127-33374330)
chr6 (20-228)||(13521939-13522147)
chr6 (25-228)||(8892182-8892384)
chr6 (25-228)||(8903417-8903619)
chr6 (15-228)||(27290231-27290444)
chr6 (15-219)||(22934741-22934945)
chr6 (15-219)||(23857186-23857390)
chr6 (15-219)||(27272441-27272645)
chr6 (20-216)||(20160835-20161031)
chr6 (20-216)||(22171800-22171996)
chr6 (15-222)||(26918508-26918715)
chr6 (122-228)||(22477241-22477347)
chr6 (15-216)||(26989135-26989336)
chr6 (18-222)||(16749982-16750186)
chr6 (15-216)||(13298812-13299013)
chr6 (15-216)||(24304479-24304680)
chr6 (15-216)||(24863851-24864052)
chr6 (29-216)||(27000207-27000394)
chr6 (15-222)||(29549603-29549810)
chr6 (15-216)||(15424178-15424379)
chr6 (14-222)||(27359852-27360060)
chr6 (14-222)||(27450195-27450403)
chr6 (15-222)||(4757892-4758099)
chr6 (15-222)||(4773134-4773341)
chr6 (15-222)||(16674267-16674474)
chr6 (15-222)||(27007855-27008062)
chr6 (15-222)||(29573141-29573348)
chr6 (15-141)||(17092301-17092427)
chr6 (15-222)||(4545636-4545843)
chr6 (15-210)||(30557877-30558072)
chr6 (15-222)||(34463207-34463414)
chr6 (15-222)||(3696209-3696416)
chr6 (15-210)||(4525426-4525621)
chr6 (15-222)||(4723995-4724202)
chr6 (15-210)||(17025417-17025612)
chr6 (15-222)||(28207582-28207789)
chr6 (15-222)||(16943888-16944095)
chr6 (15-222)||(26116271-26116478)
chr6 (15-222)||(29501543-29501750)
chr6 (14-222)||(26777475-26777683)
chr6 (15-222)||(27044515-27044723)
chr6 (15-222)||(27485257-27485464)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (23-223)||(16449810-16450010)
chr7 (17-228)||(16041449-16041660)
chr7 (25-228)||(31088278-31088481)
chr7 (25-228)||(45733586-45733789)
chr7 (15-222)||(26484826-26485033)
chr7 (23-222)||(2108817-2109016)
chr7 (15-222)||(2775491-2775698)
chr7 (15-222)||(39210827-39211034)
chr7 (15-219)||(26682804-26683008)
chr7 (15-219)||(4200682-4200886)
chr7 (13-222)||(5128124-5128333)
chr7 (15-216)||(2154711-2154912)
chr7 (16-216)||(16518221-16518421)
chr7 (15-216)||(10916672-10916873)
chr7 (15-216)||(11424580-11424781)
chr7 (16-216)||(16503185-16503385)
chr7 (15-222)||(26274898-26275105)
chr7 (15-222)||(3445438-3445645)
chr7 (15-222)||(26435389-26435596)
chr7 (15-222)||(4144927-4145134)
chr7 (15-222)||(5147144-5147351)
chr7 (15-222)||(11441704-11441911)
chr7 (15-222)||(24592345-24592552)
chr7 (15-222)||(31564194-31564401)
chr7 (15-222)||(26319673-26319880)
chr7 (15-222)||(26537674-26537881)
chr7 (15-222)||(26669718-26669925)
chr7 (46-222)||(18540931-18541107)
chr7 (15-222)||(9618783-9618990)
chr7 (15-222)||(45387475-45387682)
chr7 (15-222)||(16736264-16736471)
chr7 (15-222)||(16751318-16751525)
chr7 (15-222)||(17523664-17523871)
chr7 (15-222)||(17529344-17529551)
chr7 (46-222)||(5159651-5159827)
chr7 (15-222)||(31125052-31125259)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (17-228)||(22888604-22888815)
chr5 (25-228)||(13184473-13184676)
chr5 (25-228)||(13440319-13440522)
chr5 (17-228)||(25199163-25199374)
chr5 (20-228)||(33877381-33877589)
chr5 (15-222)||(29888897-29889104)
chr5 (25-228)||(11325928-11326131)
chr5 (15-219)||(23892349-23892553)
chr5 (15-216)||(24687972-24688173)
chr5 (15-219)||(33777630-33777834)
chr5 (15-222)||(9548358-9548565)
chr5 (15-219)||(23752265-23752469)
chr5 (15-216)||(22998929-22999130)
chr5 (15-216)||(11549500-11549701)
chr5 (15-216)||(23717803-23718004)
chr5 (15-216)||(24970164-24970365)
chr5 (15-216)||(30934779-30934980)
chr5 (15-222)||(15658575-15658782)
chr5 (15-222)||(28649375-28649582)
chr5 (15-222)||(37671298-37671505)
chr5 (15-222)||(9317591-9317798)
chr5 (15-222)||(12132295-12132502)
chr5 (15-222)||(13324644-13324851)
chr5 (15-222)||(30152158-30152365)
chr5 (15-222)||(31431580-31431787)
chr5 (15-222)||(31826222-31826429)
chr5 (14-222)||(32599286-32599494)
chr5 (15-222)||(18375227-18375434)
chr5 (23-222)||(18500553-18500752)
chr5 (15-210)||(24681592-24681787)
chr5 (15-210)||(24724119-24724314)
chr5 (15-210)||(33516508-33516703)
chr5 (15-222)||(37358458-37358665)
chr5 (15-210)||(40473364-40473559)
chr5 (15-222)||(43078392-43078599)
chr5 (15-222)||(8665290-8665497)
chr5 (15-222)||(15758672-15758879)
chr5 (15-222)||(26480532-26480739)
chr5 (15-222)||(29966881-29967088)
chr5 (15-222)||(30029555-30029762)
chr5 (46-222)||(33292665-33292841)
chr5 (15-222)||(2511191-2511398)
chr5 (15-222)||(3789681-3789888)
chr5 (15-222)||(6874445-6874652)
chr5 (15-222)||(30168609-30168816)
chr5 (15-222)||(37755120-37755327)
chr5 (15-222)||(37770802-37771009)
chr5 (46-222)||(41674849-41675025)
chr5 (15-222)||(5638050-5638257)
chr5 (15-222)||(34616658-34616865)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (17-228)||(1838-2048)
scaffold0415 (23-222)||(6143-6344)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (17-228)||(20513-20723)
scaffold0124 (15-210)||(30595-30790)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (24-228)||(19658926-19659129)
chr8 (24-228)||(33244790-33244994)
chr8 (25-228)||(44563226-44563427)
chr8 (50-228)||(22080790-22080968)
chr8 (15-228)||(9354747-9354961)
chr8 (15-222)||(18710717-18710924)
chr8 (15-219)||(16283583-16283787)
chr8 (15-216)||(19688235-19688436)
chr8 (15-216)||(27608782-27608983)
chr8 (15-216)||(16277691-16277892)
chr8 (15-216)||(14557761-14557962)
chr8 (15-191)||(189256-189432)
chr8 (15-216)||(2137136-2137337)
chr8 (15-222)||(12092601-12092808)
chr8 (15-222)||(3329384-3329591)
chr8 (15-222)||(19674572-19674779)
chr8 (15-210)||(29829465-29829660)
chr8 (15-222)||(31354655-31354862)
chr8 (15-222)||(31489627-31489834)
chr8 (15-222)||(19208237-19208444)
chr8 (15-222)||(19286593-19286800)
chr8 (15-222)||(28361832-28362039)
chr8 (15-222)||(33258854-33259061)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (70-228)||(1-159)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (50-228)||(21686-21864)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (15-207)||(536-728)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (15-216)||(46903-47104)
scaffold0089 (15-216)||(39987-40188)
scaffold0089 (15-216)||(29900-30101)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (15-216)||(47-248)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (16-216)||(27429-27629)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (15-222)||(9697-9904)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (15-222)||(7157-7364)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (15-222)||(26119-26326)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (15-222)||(14848-15055)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (15-222)||(8984-9191)
scaffold0159 (15-222)||(20146-20353)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (15-222)||(8080-8287)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (59-114)||(46764-46819)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 16626470 - 16626678
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  16626470 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 16626569  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626570 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 16626669  T
Q  220 agaatggaa 228  Q
    |||| ||||    
T  16626670 agaacggaa 16626678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18530685 - 18530474
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  18530685 acattaagtctgggagctccctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaagg 18530586  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530585 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 18530486  T
Q  217 gtcagaatggaa 228  Q
    ||||||| ||||    
T  18530485 gtcagaacggaa 18530474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5652677 - 5652473
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  5652677 gtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattt 5652578  T
Q  124 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5652577 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 5652478  T
Q  224 tggaa 228  Q
     ||||    
T  5652477 cggaa 5652473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4626233 - 4626030
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  4626233 tctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 4626134  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4626133 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 4626034  T
Q  225 ggaa 228  Q
    ||||    
T  4626033 ggaa 4626030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 17993753 - 17993956
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  17993753 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 17993852  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  17993853 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaac 17993952  T
Q  225 ggaa 228  Q
    ||||    
T  17993953 ggaa 17993956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 31034076 - 31034283
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31034076 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 31034175  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31034176 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 31034275  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    ||||||||    
T  31034276 aggtcaga 31034283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32293051 - 32292844
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32293051 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 32292952  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32292951 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 32292852  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    ||||||||    
T  32292851 aggtcaga 32292844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5713516 - 5713319
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5713516 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5713417  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  5713416 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 5713319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5724426 - 5724229
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5724426 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5724327  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  5724326 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 5724229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 222
Target Start/End: Original strand, 5757051 - 5757248
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5757051 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5757150  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  5757151 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 5757248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 222
Target Start/End: Original strand, 5767942 - 5768139
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5767942 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5768041  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  5768042 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 5768139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8296271 - 8296070
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  8296271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 8296172  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  8296171 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 8296072  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  8296071 ag 8296070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 15741053 - 15741254
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15741053 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15741152  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  15741153 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttg 15741252  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  15741253 ag 15741254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18051561 - 18051360
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18051561 ggacatcaagtctaggagctttctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 18051462  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  18051461 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttg 18051362  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  18051361 ag 18051360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18330968 - 18330767
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18330968 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18330869  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  18330868 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 18330769  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  18330768 ag 18330767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 22387537 - 22387744
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  22387537 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22387636  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  22387637 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 22387736  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  22387737 agatcaga 22387744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 4796612 - 4796813
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  4796612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4796711  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  4796712 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4796811  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  4796812 ag 4796813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 15892665 - 15892866
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15892665 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 15892764  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  15892765 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 15892864  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  15892865 ag 15892866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6192615 - 6192411
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  6192615 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 6192516  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  6192515 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 6192416  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  6192415 aggtc 6192411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7073511 - 7073304
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  7073511 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7073412  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  7073411 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 7073312  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  7073311 agatcaga 7073304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 29148714 - 29148921
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  29148714 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29148813  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  29148814 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29148913  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  29148914 agatcaga 29148921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 8301226 - 8301427
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  8301226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 8301325  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  8301326 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 8301425  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  8301426 ag 8301427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35881065 - 35880864
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  35881065 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 35880966  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||    
T  35880965 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 35880866  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  35880865 ag 35880864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4721930 - 4721726
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| |||    
T  4721930 ggacatcgagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaa 4721831  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  4721830 agtcagctttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 4721731  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  4721730 aggtc 4721726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4417218 - 4417011
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  4417218 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 4417119  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  4417118 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 4417019  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  4417018 agatcaga 4417011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10396432 - 10396225
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  10396432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10396333  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
    ||| |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  10396332 ggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 10396233  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  10396232 agatcaga 10396225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 28115913 - 28116120
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  28115913 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28116012  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  28116013 tgtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28116112  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  28116113 agatcaga 28116120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 11110308 - 11110515
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11110308 ggacatcaagtcttggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11110407  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  11110408 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 11110507  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  11110508 agatcaga 11110515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 29664929 - 29665124
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  29664929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29665028  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  29665029 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcaca 29665124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5467284 - 5467077
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  5467284 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5467185  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || | ||| ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5467184 agtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5467085  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  5467084 agatcaga 5467077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8212037 - 8211830
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  8212037 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 8211938  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  8211937 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 8211838  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  8211837 agatcaga 8211830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28021574 - 28021367
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  28021574 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaa 28021475  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  28021474 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28021375  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  28021374 agatcaga 28021367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 48466226 - 48466019
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  48466226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 48466127  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  48466126 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 48466027  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  48466026 agatcaga 48466019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 4346646 - 4346853
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  || ||||||||    
T  4346646 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4346745  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  4346746 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 4346845  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  4346846 agatcaga 4346853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 18277011 - 18277218
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18277011 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18277110  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18277111 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18277210  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  18277211 agatcaga 18277218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 18292312 - 18292519
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18292312 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18292411  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18292412 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18292511  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  18292512 agatcaga 18292519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 18307613 - 18307820
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18307613 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18307712  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  18307713 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 18307812  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  18307813 agatcaga 18307820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 20576806 - 20577001
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  20576806 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20576905  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  20576906 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 20577001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21674992 - 21674785
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||    || ||||||||    
T  21674992 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaa 21674893  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  21674892 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 21674793  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  21674792 agatcaga 21674785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 22870815 - 22871022
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  22870815 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22870914  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22870915 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22871014  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  22871015 agatcaga 22871022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 22885874 - 22886081
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  22885874 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 22885973  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22885974 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22886073  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  22886074 agatcaga 22886081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 36997036 - 36997243
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  ||||  || ||||||||    
T  36997036 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaa 36997135  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  36997136 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 36997235  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  36997236 agatcaga 36997243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 51782322 - 51782115
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  51782322 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51782223  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  51782222 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51782123  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  51782122 agatcaga 51782115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 51797412 - 51797205
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  51797412 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51797313  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  51797312 agtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 51797213  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  51797212 agatcaga 51797205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20066311 - 20066135
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  20066311 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 20066212  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  20066211 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcaga 20066135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32439422 - 32439246
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  32439422 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 32439323  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  32439322 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcaga 32439246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 31964432 - 31964639
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  31964432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31964531  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  31964532 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31964631  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  31964632 agatcaga 31964639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 50134030 - 50134237
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  50134030 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 50134129  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  50134130 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 50134229  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  50134230 agatcaga 50134237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 5596316 - 5596523
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  5596316 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 5596415  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5596416 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5596515  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  5596516 agatcaga 5596523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 5609281 - 5609488
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  5609281 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5609380  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5609381 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5609480  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  5609481 agatcaga 5609488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 6542421 - 6542628
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  6542421 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 6542520  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  6542521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 6542620  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  6542621 agatcaga 6542628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 17984915 - 17985110
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  17984915 ggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17985014  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |  ||||||||||| || |||||    
T  17985015 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 17985110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28339601 - 28339394
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  28339601 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28339502  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  28339501 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 28339402  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  28339401 agatcaga 28339394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5014011 - 5013804
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  5014011 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 5013912  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  5013911 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 5013812  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  5013811 agatcaga 5013804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18243038 - 18242831
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  18243038 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 18242939  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18242938 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18242839  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  18242838 agatcaga 18242831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 47023752 - 47023545
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  47023752 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 47023653  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  47023652 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 47023553  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  47023552 agatcaga 47023545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18225490 - 18225283
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18225490 ggacatcaagcctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18225391  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18225390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18225291  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  18225290 agatcaga 18225283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24328458 - 24328251
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  24328458 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 24328359  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  24328358 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 24328259  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  24328258 agatcaga 24328251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7996861 - 7996654
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  7996861 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 7996762  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  7996761 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 7996662  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  7996661 agatcaga 7996654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10643369 - 10643162
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  10643369 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 10643270  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  10643269 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 10643170  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  10643169 agatcaga 10643162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 222
Target Start/End: Original strand, 15284851 - 15285053
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  15284851 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 15284950  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15284951 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 15285050  T
Q  220 aga 222  Q
    |||    
T  15285051 aga 15285053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15228221 - 15228010
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  15228221 acatcaagtctgggagctatctcatataccccaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaagg 15228122  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228121 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 15228022  T
Q  217 gtcagaatggaa 228  Q
    ||||||| ||||    
T  15228021 gtcagaacggaa 15228010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 24460533 - 24460736
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  24460533 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 24460632  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24460633 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 24460732  T
Q  225 ggaa 228  Q
    ||||    
T  24460733 ggaa 24460736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1900608 - 1900402
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||| |    
T  1900608 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaag 1900509  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900508 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 1900409  T
Q  217 gtcagaa 223  Q
    |||||||    
T  1900408 gtcagaa 1900402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 14235448 - 14235656
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  14235448 tcaagactgggagcttcttcataggtctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagtta 14235547  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    | ||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14235548 actttccctggtctatgagcttctttacaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 14235647  T
Q  220 agaatggaa 228  Q
      |||||||    
T  14235648 gaaatggaa 14235656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 15391291 - 15391469
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||| |||||||    
T  15391291 atcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttacaa 15391390  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15391391 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaa 15391469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17014353 - 17014149
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  17014353 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 17014254  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  17014253 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 17014154  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  17014153 aggtc 17014149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 24592232 - 24592433
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24592232 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24592331  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  24592332 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24592431  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  24592432 ag 24592433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14665371 - 14665170
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  14665371 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaa 14665272  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  14665271 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14665172  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  14665171 ag 14665170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5006226 - 5006019
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  5006226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5006127  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5006126 agtcaacttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5006027  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  5006026 agatcaga 5006019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 36344433 - 36344640
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  36344433 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 36344532  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  36344533 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 36344632  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  36344633 agatcaga 36344640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6570206 - 6569999
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  6570206 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 6570107  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  6570106 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttg 6570007  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  6570006 agatcaga 6569999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 14763222 - 14763429
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  14763222 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14763321  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  14763322 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14763421  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  14763422 agatcaga 14763429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 18800531 - 18800738
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  18800531 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 18800630  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  18800631 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 18800730  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  18800731 agatcaga 18800738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 31126436 - 31126643
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  31126436 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31126535  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31126536 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31126635  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  31126636 agatcaga 31126643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 40105556 - 40105763
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  40105556 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 40105655  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  40105656 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 40105755  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  40105756 agatcaga 40105763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Original strand, 34188909 - 34189085
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  34188909 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 34189008  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  34189009 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcaga 34189085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 33673716 - 33673923
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  33673716 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 33673815  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  33673816 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 33673915  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  33673916 agatcaga 33673923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14098894 - 14098688
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  14098894 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 14098795  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  14098794 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 14098695  T
Q  215 aggtcag 221  Q
    || ||||    
T  14098694 agatcag 14098688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24112984 - 24112808
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  24112984 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 24112885  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  24112884 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcaga 24112808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21970054 - 21969859
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | |  |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  21970054 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacatttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 21969955  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  21969954 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 21969859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 54833740 - 54833533
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  54833740 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 54833641  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  54833640 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 54833541  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  54833540 agatcaga 54833533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 27163235 - 27163442
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  27163235 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27163334  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  27163335 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 27163434  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  27163435 agatcaga 27163442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30754107 - 30753900
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  30754107 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 30754008  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  30754007 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30753908  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  30753907 agatcaga 30753900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39850991 - 39850796
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  39850991 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39850892  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  39850891 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcaca 39850796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 19456333 - 19456541
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  19456333 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 19456432  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456433 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 19456532  T
Q  220 agaatggaa 228  Q
    |||| ||||    
T  19456533 agaacggaa 19456541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27119013 - 27118809
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  27119013 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 27118914  T
Q  124 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27118913 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 27118814  T
Q  224 tggaa 228  Q
     ||||    
T  27118813 cggaa 27118809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3784978 - 3784775
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  3784978 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 3784879  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3784878 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 3784779  T
Q  225 ggaa 228  Q
    ||||    
T  3784778 ggaa 3784775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 21703073 - 21703284
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  21703073 acatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 21703172  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703173 ttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 21703272  T
Q  217 gtcagaatggaa 228  Q
    ||||||| ||||    
T  21703273 gtcagaacggaa 21703284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Original strand, 34303210 - 34303423
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  34303210 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 34303309  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34303310 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttg 34303409  T
Q  215 aggtcagaatggaa 228  Q
    ||||| ||| ||||    
T  34303410 aggtccgaacggaa 34303423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16163923 - 16163720
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  16163923 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 16163824  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16163823 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 16163724  T
Q  225 ggaa 228  Q
    ||||    
T  16163723 ggaa 16163720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34157334 - 34157132
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  34157334 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 34157235  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  34157234 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 34157136  T
Q  225 ggaa 228  Q
    ||||    
T  34157135 ggaa 34157132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27393298 - 27393090
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  27393298 tcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagtta 27393199  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    | ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27393198 actttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtc 27393099  T
Q  220 agaatggaa 228  Q
    |||||||||    
T  27393098 agaatggaa 27393090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Original strand, 31891245 - 31891436
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||    
T  31891245 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaatttt 31891344  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  31891345 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 31891436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 9349889 - 9350084
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9349889 ggacgtcaagaccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 9349988  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  9349989 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 9350084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40233845 - 40233638
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  40233845 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40233746  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40233745 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 40233646  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    ||||||||    
T  40233645 aggtcaga 40233638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 27434351 - 27434555
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  27434351 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 27434450  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  27434451 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 27434550  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  27434551 aggtc 27434555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 23128473 - 23128674
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  23128473 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 23128572  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  23128573 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23128672  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  23128673 ag 23128674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12655876 - 12655675
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  12655876 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 12655777  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  12655776 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 12655677  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  12655676 ag 12655675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28882548 - 28882347
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  28882548 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28882449  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  28882448 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 28882349  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  28882348 ag 28882347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20838252 - 20838048
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  20838252 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 20838153  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||     
T  20838152 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacattta 20838053  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  20838052 aggtc 20838048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 22925935 - 22926142
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  22925935 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 22926034  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  22926035 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 22926134  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  22926135 agatcaga 22926142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12587144 - 12586949
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  12587144 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12587045  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  12587044 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 12586949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 13936451 - 13936646
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  13936451 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 13936550  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || |||||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  13936551 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 13936646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27777556 - 27777361
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  27777556 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27777457  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  27777456 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 27777361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27817314 - 27817119
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  27817314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 27817215  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  27817214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 27817119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37375495 - 37375288
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  37375495 ggacatcaagtctaggagcttccccacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 37375396  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  37375395 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 37375296  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  37375295 agatcaga 37375288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 260660 - 260867
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||    
T  260660 ggacatcaagtctaggaacttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaa 260759  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  260760 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 260859  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  260860 agatcaga 260867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 12716509 - 12716704
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  12716509 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 12716608  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  12716609 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 12716704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 16829245 - 16829440
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  16829245 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16829344  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || |||||    
T  16829345 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 16829440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16892236 - 16892041
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  16892236 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16892137  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || |||||    
T  16892136 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 16892041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32050132 - 32049925
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  32050132 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 32050033  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  32050032 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 32049933  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  32049932 agatcaga 32049925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37925827 - 37925620
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  37925827 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37925728  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||    
T  37925727 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttg 37925628  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  37925627 agatcaga 37925620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 39051729 - 39051924
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  39051729 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 39051828  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| ||||||||    
T  39051829 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcaca 39051924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27804038 - 27803846
Alignment:
Q  18 catcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggt 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| ||    
T  27804038 catcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagt 27803939  T
Q  118 taattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| ||||||||    
T  27803938 cagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcaca 27803846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 11635093 - 11635300
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||    
T  11635093 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaa 11635192  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  11635193 agtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 11635292  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  11635293 agatcaga 11635300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 11641282 - 11641489
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||    
T  11641282 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaa 11641381  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  11641382 agtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 11641481  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  11641482 agatcaga 11641489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 21677089 - 21677296
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  21677089 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 21677188  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  21677189 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 21677288  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  21677289 agatcaga 21677296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31876615 - 31876408
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  31876615 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31876516  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31876515 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31876416  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  31876415 agatcaga 31876408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34862014 - 34861807
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  34862014 ggacatctagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 34861915  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  34861914 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 34861815  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  34861814 agatcaga 34861807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 37685816 - 37686023
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  37685816 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37685915  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  37685916 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37686015  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  37686016 agatcaga 37686023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 37701081 - 37701288
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  37701081 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 37701180  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  37701181 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 37701280  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  37701281 agatcaga 37701288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34286653 - 34286481
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || |    
T  34286653 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34286554  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  34286553 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 34286481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34291713 - 34291541
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || |    
T  34291713 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34291614  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  34291613 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 34291541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39890408 - 39890202
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  39890408 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 39890309  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||| ||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  39890308 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 39890209  T
Q  215 aggtcag 221  Q
    || ||||    
T  39890208 agatcag 39890202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34279664 - 34279576
Alignment:
Q  134 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  34279664 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 34279576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 19416406 - 19416613
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  19416406 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 19416505  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  19416506 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 19416605  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  19416606 agatcaga 19416613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Original strand, 2576 - 2789
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2576 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 2675  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2676 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 2775  T
Q  215 aggtcagaatggaa 228  Q
    ||||||||| ||||    
T  2776 aggtcagaacggaa 2789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Original strand, 20340253 - 20340466
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20340253 ggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaa 20340352  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340353 agttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 20340452  T
Q  215 aggtcagaatggaa 228  Q
    ||||||||| ||||    
T  20340453 aggtcagaacggaa 20340466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 16207951 - 16208162
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  16207951 acatcaagtctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16208050  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208051 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 16208150  T
Q  217 gtcagaatggaa 228  Q
    ||||||| ||||    
T  16208151 gtcagaacggaa 16208162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20461416 - 20461205
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||    
T  20461416 acatcaagtctgcgagcttgctcatatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaagg 20461317  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20461316 tcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgag 20461217  T
Q  217 gtcagaatggaa 228  Q
    ||||||| ||||    
T  20461216 gtcagaacggaa 20461205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28152199 - 28151992
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28152199 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 28152100  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28152099 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 28152000  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    ||||||||    
T  28151999 aggtcaga 28151992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 51638555 - 51638348
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  51638555 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 51638456  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  51638455 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 51638356  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  51638355 agatcaga 51638348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10963007 - 10962800
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  10963007 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 10962908  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  10962907 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttg 10962808  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  10962807 agatcaga 10962800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28585318 - 28585111
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  28585318 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 28585219  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || || || |||    
T  28585218 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttg 28585119  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  28585118 agatcaga 28585111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 41793226 - 41793433
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  41793226 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 41793325  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  41793326 agtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 41793425  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  41793426 agatcaga 41793433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Original strand, 22456795 - 22457008
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22456795 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaa 22456894  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456895 agttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 22456994  T
Q  215 aggtcagaatggaa 228  Q
    |||| |||| ||||    
T  22456995 aggtaagaacggaa 22457008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 14143146 - 14143353
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14143146 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 14143245  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14143246 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 14143345  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    ||||||||    
T  14143346 aggtcaga 14143353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26788279 - 26788072
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26788279 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26788180  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26788179 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26788080  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    ||||||||    
T  26788079 aggtcaga 26788072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27196652 - 27196445
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27196652 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27196553  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27196552 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27196453  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    ||||||||    
T  27196452 aggtcaga 27196445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 27252588 - 27252795
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27252588 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 27252687  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27252688 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 27252787  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    ||||||||    
T  27252788 aggtcaga 27252795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28162982 - 28162779
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  28162982 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 28162883  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28162882 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 28162783  T
Q  225 ggaa 228  Q
    ||||    
T  28162782 ggaa 28162779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 33374127 - 33374330
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||    
T  33374127 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaatttt 33374226  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33374227 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 33374326  T
Q  225 ggaa 228  Q
    ||||    
T  33374327 ggaa 33374330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 13521939 - 13522147
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  13521939 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 13522038  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522039 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 13522138  T
Q  220 agaatggaa 228  Q
     ||| ||||    
T  13522139 cgaacggaa 13522147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 8892182 - 8892384
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8892182 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 8892281  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8892282 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 8892380  T
Q  225 ggaa 228  Q
    ||||    
T  8892381 ggaa 8892384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 8903417 - 8903619
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8903417 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 8903516  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8903517 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 8903615  T
Q  225 ggaa 228  Q
    ||||    
T  8903616 ggaa 8903619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Original strand, 27290231 - 27290444
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  27290231 ggacatcaagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaa 27290330  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290331 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 27290430  T
Q  215 aggtcagaatggaa 228  Q
    ||||||||| ||||    
T  27290431 aggtcagaacggaa 27290444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 22934741 - 22934945
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  22934741 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 22934840  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22934841 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 22934940  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  22934941 aggtc 22934945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 23857186 - 23857390
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  23857186 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 23857285  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  23857286 agttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 23857385  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  23857386 aggtc 23857390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 27272441 - 27272645
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||    
T  27272441 ggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaa 27272540  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
    ||| |  || ||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27272541 ggtcagcttcccttgatcgatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 27272640  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  27272641 aggtc 27272645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20161031 - 20160835
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |    
T  20161031 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 20160932  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
      || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  20160931 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgag 20160835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Original strand, 22171800 - 22171996
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |    
T  22171800 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 22171899  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
      || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  22171900 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgag 22171996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26918715 - 26918508
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26918715 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26918616  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  26918615 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26918516  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  26918515 agatcaga 26918508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Original strand, 22477241 - 22477347
Alignment:
Q  122 tttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcag 221  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22477241 tttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggttag 22477340  T
Q  222 aatggaa 228  Q
    || ||||    
T  22477341 aacggaa 22477347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26989336 - 26989135
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  26989336 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26989237  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  26989236 agtcagctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 26989137  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  26989136 ag 26989135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16750186 - 16749982
Alignment:
Q  18 catcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggt 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||    
T  16750186 catcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagt 16750087  T
Q  118 taattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagg 217  Q
     |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||     
T  16750086 cagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaga 16749987  T
Q  218 tcaga 222  Q
    |||||    
T  16749986 tcaga 16749982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 13298812 - 13299013
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  13298812 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 13298911  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  13298912 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 13299011  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  13299012 ag 13299013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 24304479 - 24304680
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24304479 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24304578  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  24304579 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 24304678  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  24304679 ag 24304680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24864052 - 24863851
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24864052 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24863953  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  24863952 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 24863853  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  24863852 ag 24863851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 27000207
Alignment:
Q  29 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttcctt 128  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 27000295  T
Q  129 ggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    | |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  27000294 gatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 27000207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29549810 - 29549603
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  29549810 ggacatcaagtccaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29549711  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  29549710 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 29549611  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  29549610 agatcaga 29549603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 15424178 - 15424379
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  15424178 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatactttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 15424277  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  15424278 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 15424377  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  15424378 ag 15424379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Original strand, 27359852 - 27360060
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||    
T  27359852 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27359951  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  27359952 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27360051  T
Q  214 gaggtcaga 222  Q
    ||| |||||    
T  27360052 gagatcaga 27360060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Original strand, 27450195 - 27450403
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||    
T  27450195 tggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaa 27450294  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  27450295 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 27450394  T
Q  214 gaggtcaga 222  Q
    ||| |||||    
T  27450395 gagatcaga 27450403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4758099 - 4757892
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  4758099 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4758000  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4757999 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4757900  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  4757899 agatcaga 4757892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4773341 - 4773134
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  4773341 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 4773242  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  4773241 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4773142  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  4773141 agatcaga 4773134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16674474 - 16674267
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  16674474 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 16674375  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  16674374 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 16674275  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  16674274 agatcaga 16674267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27008062 - 27007855
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  27008062 ggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27007963  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| ||||  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  27007962 agtcagctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 27007863  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  27007862 agatcaga 27007855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29573348 - 29573141
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  29573348 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 29573249  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  29573248 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 29573149  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  29573148 agatcaga 29573141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Original strand, 17092301 - 17092427
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||   || ||||||||    
T  17092301 ggacatcaagtttggtagcttcctcacatacctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaa 17092400  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagctt 141  Q
     || || ||||| ||||  ||||||||    
T  17092401 agtcaactttccctggtcaatgagctt 17092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 4545636 - 4545843
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  4545636 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4545735  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  4545736 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 4545835  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  4545836 agatcaga 4545843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 30557877 - 30558072
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  30557877 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30557976  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || |||||    
T  30557977 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 30558072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 34463207 - 34463414
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  34463207 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34463306  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  34463307 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 34463406  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  34463407 agatcaga 34463414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3696416 - 3696209
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  3696416 ggacatcaagtctaggagcttcatcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 3696317  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  3696316 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 3696217  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  3696216 agatcaga 3696209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4525621 - 4525426
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  4525621 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 4525522  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || |||||    
T  4525521 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 4525426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 4723995 - 4724202
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  4723995 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaa 4724094  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  4724095 agtcagctttccctgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 4724194  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  4724195 agatcaga 4724202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17025612 - 17025417
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  17025612 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 17025513  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| ||||||||    
T  17025512 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcaca 17025417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28207789 - 28207582
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  28207789 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 28207690  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  28207689 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28207590  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  28207589 agatcaga 28207582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 16943888 - 16944095
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  16943888 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16943987  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  16943988 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 16944087  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  16944088 agatcaga 16944095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 26116271 - 26116478
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  26116271 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 26116370  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  26116371 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26116470  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  26116471 agatcaga 26116478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29501750 - 29501543
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  29501750 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 29501651  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  29501650 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29501551  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  29501550 agatcaga 29501543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Original strand, 26777475 - 26777683
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  26777475 tggacatcaagtctaggattttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaa 26777574  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  26777575 aagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacattt 26777674  T
Q  214 gaggtcaga 222  Q
    ||| |||||    
T  26777675 gagatcaga 26777683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27044723 - 27044515
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  27044723 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 27044624  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgt-agcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| | | || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  27044623 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacattt 27044524  T
Q  214 gaggtcaga 222  Q
    ||| |||||    
T  27044523 gagatcaga 27044515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27485464 - 27485257
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  27485464 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 27485365  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  27485364 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 27485265  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  27485264 agatcaga 27485257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 223
Target Start/End: Original strand, 16449810 - 16450010
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |    
T  16449810 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaact 16449909  T
Q  123 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    |||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449910 ttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 16450009  T
Q  223 a 223  Q
    |    
T  16450010 a 16450010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16041660 - 16041449
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  16041660 acatcgagtctgggagcttcctcgtatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 16041561  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| ||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16041560 ttaactttccctgatcaatgagctttttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttag 16041461  T
Q  217 gtcagaatggaa 228  Q
    ||||||| ||||    
T  16041460 gtcagaacggaa 16041449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 31088278 - 31088481
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  31088278 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 31088377  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31088378 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 31088477  T
Q  225 ggaa 228  Q
    ||||    
T  31088478 ggaa 31088481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45733789 - 45733586
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  45733789 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 45733690  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  45733689 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 45733590  T
Q  225 ggaa 228  Q
    ||||    
T  45733589 ggaa 45733586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26485033 - 26484826
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26485033 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 26484934  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26484933 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26484834  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    ||||||||    
T  26484833 aggtcaga 26484826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Original strand, 2108817 - 2109016
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |    
T  2108817 agtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaact 2108916  T
Q  123 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2108917 ttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 2109016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2775698 - 2775491
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2775698 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 2775599  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2775598 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 2775499  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    ||||||||    
T  2775498 aggtcaga 2775491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 39210827 - 39211034
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39210827 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 39210926  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  39210927 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttg 39211026  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    ||||||||    
T  39211027 aggtcaga 39211034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 26682804 - 26683008
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  26682804 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaa 26682903  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26682904 ggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 26683003  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  26683004 aggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4200886 - 4200682
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4200886 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaa 4200787  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4200786 agtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 4200687  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  4200686 aggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5128333 - 5128124
Alignment:
Q  13 atggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctca 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  5128333 atggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctca 5128234  T
Q  113 aaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacact 212  Q
    || || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  5128233 aaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatt 5128134  T
Q  213 tgaggtcaga 222  Q
    |||| |||||    
T  5128133 tgagatcaga 5128124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2154912 - 2154711
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  2154912 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 2154813  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||    
T  2154812 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttg 2154713  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  2154712 ag 2154711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 16518221 - 16518421
Alignment:
Q  16 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaag 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  16518221 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16518320  T
Q  116 gttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttga 215  Q
    || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  16518321 gtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16518420  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  16518421 g 16518421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 10916672 - 10916873
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  10916672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 10916771  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  10916772 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 10916871  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  10916872 ag 10916873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 11424580 - 11424781
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11424580 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11424679  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  11424680 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11424779  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  11424780 ag 11424781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 16503185 - 16503385
Alignment:
Q  16 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaag 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  16503185 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaa 16503284  T
Q  116 gttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttga 215  Q
    || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  16503285 gtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttga 16503384  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  16503385 g 16503385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 26274898 - 26275105
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26274898 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26274997  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26274998 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26275097  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  26275098 agatcaga 26275105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3445645 - 3445438
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  3445645 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 3445546  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  3445545 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3445446  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  3445445 agatcaga 3445438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26435596 - 26435389
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26435596 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26435497  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  26435496 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 26435397  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  26435396 agatcaga 26435389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 4144927 - 4145134
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  4144927 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 4145026  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  4145027 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 4145126  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  4145127 agatcaga 4145134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 5147144 - 5147351
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  5147144 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 5147243  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  5147244 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 5147343  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  5147344 agatcaga 5147351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11441911 - 11441704
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11441911 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11441812  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  11441811 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 11441712  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  11441711 agatcaga 11441704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 24592345 - 24592552
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  24592345 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 24592444  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  24592445 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 24592544  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  24592545 agatcaga 24592552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 31564194 - 31564401
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  31564194 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31564293  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  31564294 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 31564393  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  31564394 agatcaga 31564401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 26319673 - 26319880
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26319673 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26319772  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26319773 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26319872  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  26319873 agatcaga 26319880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 26537674 - 26537881
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  26537674 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 26537773  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  26537774 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 26537873  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  26537874 agatcaga 26537881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 26669718 - 26669925
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26669718 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26669817  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  26669818 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 26669917  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  26669918 agatcaga 26669925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18541107 - 18540931
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  18541107 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 18541008  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  18541007 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcaga 18540931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9618990 - 9618783
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  9618990 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9618891  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  9618890 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 9618791  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  9618790 agatcaga 9618783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 45387682 - 45387475
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  45387682 ggacatcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 45387583  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  45387582 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 45387483  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  45387482 agatcaga 45387475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 16736264 - 16736471
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  16736264 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16736363  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  16736364 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16736463  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  16736464 agatcaga 16736471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 16751318 - 16751525
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  16751318 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 16751417  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  16751418 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 16751517  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  16751518 agatcaga 16751525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17523871 - 17523664
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  17523871 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17523772  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  17523771 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17523672  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  17523671 agatcaga 17523664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 17529344 - 17529551
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  17529344 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 17529443  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  17529444 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 17529543  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  17529544 agatcaga 17529551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5159827 - 5159651
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    |||||| || ||||| ||||| | ||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  5159827 ctcaattatattcacggcagcatcatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 5159728  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || | ||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  5159727 acgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcaga 5159651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31125259 - 31125052
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  31125259 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31125160  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31125159 agtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31125060  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  31125059 agatcaga 31125052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22888815 - 22888604
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  22888815 acatcgagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 22888716  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888715 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 22888616  T
Q  217 gtcagaatggaa 228  Q
    ||||||| ||||    
T  22888615 gtcagaacggaa 22888604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 13184473 - 13184676
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  13184473 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 13184572  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13184573 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 13184672  T
Q  225 ggaa 228  Q
    ||||    
T  13184673 ggaa 13184676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 13440319 - 13440522
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  13440319 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 13440418  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13440419 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 13440518  T
Q  225 ggaa 228  Q
    ||||    
T  13440519 ggaa 13440522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25199374 - 25199163
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  25199374 acatcaagtctgggggctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 25199275  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199274 ttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 25199175  T
Q  217 gtcagaatggaa 228  Q
     |||||| ||||    
T  25199174 atcagaacggaa 25199163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33877589 - 33877381
Alignment:
Q  20 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  33877589 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 33877490  T
Q  120 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 219  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877489 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 33877390  T
Q  220 agaatggaa 228  Q
     ||| ||||    
T  33877389 cgaacggaa 33877381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 29888897 - 29889104
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29888897 ggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 29888996  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || |||||||| |  |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29888997 agtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatg 29889096  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    ||||||||    
T  29889097 aggtcaga 29889104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11326131 - 11325928
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||    
T  11326131 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaacttt 11326032  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  11326031 ccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaac 11325932  T
Q  225 ggaa 228  Q
    ||||    
T  11325931 ggaa 11325928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23892553 - 23892349
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23892553 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaa 23892454  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||||| |||||||| |  |||||||| || || |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23892453 agttaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttg 23892354  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  23892353 aggtc 23892349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 24687972 - 24688173
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24687972 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 24688071  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24688072 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttg 24688171  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  24688172 ag 24688173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33777834 - 33777630
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  33777834 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33777735  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  33777734 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 33777635  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  33777634 aggtc 33777630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 9548358 - 9548565
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  9548358 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 9548457  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  9548458 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 9548557  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  9548558 agatcaga 9548565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 23752265 - 23752469
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  23752265 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23752364  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  23752365 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 23752464  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  23752465 aggtc 23752469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 22998929 - 22999130
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  22998929 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 22999028  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  22999029 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttg 22999128  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  22999129 ag 22999130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11549701 - 11549500
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  11549701 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 11549602  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  11549601 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 11549502  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  11549501 ag 11549500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 23717803 - 23718004
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  23717803 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 23717902  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  23717903 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 23718002  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  23718003 ag 23718004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24970365 - 24970164
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |  ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  24970365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacgtactttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 24970266  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     ||    |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  24970265 agtccgctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 24970166  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  24970165 ag 24970164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30934980 - 30934779
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  30934980 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30934881  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  30934880 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 30934781  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  30934780 ag 30934779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 15658575 - 15658782
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15658575 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 15658674  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  15658675 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttg 15658774  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  15658775 agatcaga 15658782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28649582 - 28649375
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  28649582 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28649483  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  28649482 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 28649383  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  28649382 agatcaga 28649375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 37671298 - 37671505
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  37671298 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37671397  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  37671398 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37671497  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  37671498 agatcaga 37671505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9317798 - 9317591
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  9317798 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9317699  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  9317698 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 9317599  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  9317598 agatcaga 9317591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12132502 - 12132295
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  12132502 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 12132403  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  12132402 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 12132303  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  12132302 agatcaga 12132295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 13324644 - 13324851
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  13324644 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 13324743  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  13324744 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 13324843  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  13324844 agatcaga 13324851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30152365 - 30152158
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  30152365 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30152266  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  30152265 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 30152166  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  30152165 agatcaga 30152158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31431787 - 31431580
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  31431787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 31431688  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31431687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31431588  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  31431587 agatcaga 31431580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 31826222 - 31826429
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  31826222 ggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 31826321  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  31826322 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 31826421  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  31826422 agatcaga 31826429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Original strand, 32599286 - 32599494
Alignment:
Q  14 tggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaa 113  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  32599286 tggacatcaagtctaggggcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaa 32599385  T
Q  114 aggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    | || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  32599386 aagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacattt 32599485  T
Q  214 gaggtcaga 222  Q
    ||| |||||    
T  32599486 gagatcaga 32599494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 18375227 - 18375434
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18375227 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18375326  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  18375327 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 18375426  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  18375427 agatcaga 18375434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Original strand, 18500553 - 18500752
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |    
T  18500553 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 18500652  T
Q  123 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    |||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18500653 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 18500752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24681787 - 24681592
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  24681787 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24681688  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  24681687 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 24681592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24724314 - 24724119
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  24724314 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 24724215  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  24724214 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 24724119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33516703 - 33516508
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  33516703 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 33516604  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || |||||    
T  33516603 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 33516508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 37358458 - 37358665
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  37358458 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaa 37358557  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  37358558 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37358657  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  37358658 agatcaga 37358665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 40473364 - 40473559
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  40473364 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 40473463  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  40473464 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 40473559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43078599 - 43078392
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  43078599 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 43078500  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  43078499 agtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 43078400  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  43078399 agatcaga 43078392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 8665290 - 8665497
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  8665290 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 8665389  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  8665390 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 8665489  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  8665490 agatcaga 8665497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 15758672 - 15758879
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  15758672 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 15758771  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  15758772 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 15758871  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  15758872 agatcaga 15758879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26480739 - 26480532
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26480739 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26480640  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  26480639 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 26480540  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  26480539 agatcaga 26480532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 29966881 - 29967088
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  29966881 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 29966980  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  29966981 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 29967080  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  29967081 agatcaga 29967088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30029762 - 30029555
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  30029762 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 30029663  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  30029662 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 30029563  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  30029562 agatcaga 30029555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33292841 - 33292665
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  33292841 ctcaatcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 33292742  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  33292741 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcaga 33292665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2511398 - 2511191
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  2511398 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 2511299  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  2511298 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 2511199  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  2511198 agatcaga 2511191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3789888 - 3789681
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  3789888 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 3789789  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  3789788 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 3789689  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  3789688 agatcaga 3789681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6874652 - 6874445
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  6874652 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 6874553  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  || ||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  6874552 agtcagcttcccttgatcgataagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 6874453  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  6874452 agatcaga 6874445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30168816 - 30168609
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||    
T  30168816 ggacatcaagtctaggagtttcttcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaa 30168717  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  30168716 agtgagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 30168617  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  30168616 agatcaga 30168609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37755327 - 37755120
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  37755327 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 37755228  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  37755227 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 37755128  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  37755127 agatcaga 37755120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 37770802 - 37771009
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  37770802 ggacatcaagtctagaagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 37770901  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || |  || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  37770902 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 37771001  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  37771002 agatcaga 37771009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41675025 - 41674849
Alignment:
Q  46 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||| ||     
T  41675025 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttg 41674926  T
Q  146 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 222  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  41674925 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 41674849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5638257 - 5638050
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || || |||||    
T  5638257 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaa 5638158  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  5638157 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 5638058  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  5638057 agatcaga 5638050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34616865 - 34616658
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  34616865 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 34616766  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  34616765 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 34616666  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  34616665 agatcaga 34616658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 1838 - 2048
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  1838 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 1937  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1938 ttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 2036  T
Q  217 gtcagaatggaa 228  Q
    ||||||| ||||    
T  2037 gtcagaacggaa 2048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6344 - 6143
Alignment:
Q  23 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |    
T  6344 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 6245  T
Q  123 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttc-aaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatg-gaaatcacacttgaggtca 220  Q
    |||| || |  |||||||| || || || |||||| ||||| || || || || ||||||||||| |  |||||||||||  |||||||| ||||| |||    
T  6244 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatca 6145  T
Q  221 ga 222  Q
    ||    
T  6144 ga 6143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20723 - 20513
Alignment:
Q  17 acatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaagg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  20723 acatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaag 20624  T
Q  117 ttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 216  Q
    |||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623 ttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 20525  T
Q  217 gtcagaatggaa 228  Q
    ||||||| ||||    
T  20524 gtcagaacggaa 20513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30790 - 30595
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  30790 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 30691  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || |||||    
T  30690 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 30595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Original strand, 19658926 - 19659129
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  19658926 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 19659025  T
Q  124 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19659026 tccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 19659124  T
Q  224 tggaa 228  Q
     ||||    
T  19659125 cggaa 19659129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33244994 - 33244790
Alignment:
Q  24 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  33244994 gtctgagagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 33244895  T
Q  124 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 223  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33244894 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 33244795  T
Q  224 tggaa 228  Q
     ||||    
T  33244794 cggaa 33244790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44563427 - 44563226
Alignment:
Q  25 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || || |||    
T  44563427 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaacttt 44563329  T
Q  125 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaat 224  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44563328 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 44563230  T
Q  225 ggaa 228  Q
    ||||    
T  44563229 ggaa 44563226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 22080790 - 22080968
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  22080790 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 22080889  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22080890 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaa 22080968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9354961 - 9354747
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  9354961 ggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 9354862  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagctttttt-acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactt 213  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9354861 ggtcaattttccttggtctatgagttttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacactt 9354762  T
Q  214 gaggtcagaatggaa 228  Q
    |||||| ||| ||||    
T  9354761 gaggtccgaacggaa 9354747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18710924 - 18710717
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  18710924 ggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 18710825  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18710824 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttg 18710725  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  18710724 agatcaga 18710717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16283787 - 16283583
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  16283787 ggacaacaagtctaggagcttcctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 16283688  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  16283687 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttg 16283588  T
Q  215 aggtc 219  Q
    |||||    
T  16283587 aggtc 16283583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19688436 - 19688235
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  19688436 ggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 19688337  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  19688336 agtcaactttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttg 19688237  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  19688236 ag 19688235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 27608782 - 27608983
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  27608782 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 27608881  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  27608882 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 27608981  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  27608982 ag 27608983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16277892 - 16277691
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  16277892 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 16277793  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  16277792 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 16277693  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  16277692 ag 16277691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14557962 - 14557761
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  14557962 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaa 14557863  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  14557862 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 14557763  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  14557762 ag 14557761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 189432 - 189256
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  189432 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 189333  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagag 191  Q
     || |  |||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  189332 agtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 2137136 - 2137337
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| || | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||    
T  2137136 ggacatcaagtctaggagctttctcacatgcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaa 2137235  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  2137236 agtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttg 2137335  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  2137336 ag 2137337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 12092601 - 12092808
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  12092601 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 12092700  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  12092701 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 12092800  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  12092801 agatcaga 12092808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 3329384 - 3329591
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  3329384 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaa 3329483  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  3329484 agtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttg 3329583  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  3329584 agatcaga 3329591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19674779 - 19674572
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  19674779 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 19674680  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||    
T  19674679 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttg 19674580  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  19674579 agatcaga 19674572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29829660 - 29829465
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  29829660 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 29829561  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 210  Q
     || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  29829560 agtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 29829465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31354862 - 31354655
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  31354862 ggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 31354763  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  31354762 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 31354663  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  31354662 agatcaga 31354655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 31489627 - 31489834
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  31489627 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 31489726  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||    
T  31489727 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttg 31489826  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  31489827 agatcaga 31489834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 19208237 - 19208444
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  19208237 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 19208336  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  19208337 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 19208436  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  19208437 agatcaga 19208444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19286800 - 19286593
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||    
T  19286800 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaa 19286701  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  19286700 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 19286601  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  19286600 agatcaga 19286593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 28361832 - 28362039
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  28361832 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 28361931  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  28361932 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 28362031  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  28362032 agatcaga 28362039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33259061 - 33258854
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  33259061 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 33258962  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||    
T  33258961 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 33258862  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  33258861 agatcaga 33258854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 228
Target Start/End: Original strand, 1 - 159
Alignment:
Q  70 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcat 100  T
Q  170 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  101 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaa 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21864 - 21686
Alignment:
Q  50 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  21864 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 21765  T
Q  150 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 228  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21764 tctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaa 21686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 536 - 728
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||| ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||    
T  536 ggacgtcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaa 635  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatc 207  Q
     ||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  636 agttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 46903 - 47104
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  46903 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 47002  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  47003 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttg 47102  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  47103 ag 47104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 39987 - 40188
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  39987 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 40086  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||  || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  40087 agtcagctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttg 40186  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  40187 ag 40188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30101 - 29900
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  30101 ggacatcaagtctaagagcttcctcacatacttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 30002  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  30001 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttg 29902  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  29901 ag 29900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Original strand, 47 - 248
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  47 ggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaa 146  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||    
T  147 agtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttg 246  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  247 ag 248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27629 - 27429
Alignment:
Q  16 gacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaag 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  27629 gacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaa 27530  T
Q  116 gttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttga 215  Q
    || |  |||||||| |  || ||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  27529 gtcagctttccttgatcaataagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttga 27430  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  27429 g 27429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9904 - 9697
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  9904 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9805  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  9804 agtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttg 9705  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  9704 agatcaga 9697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 7157 - 7364
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  7157 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 7256  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  7257 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 7356  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  7357 agatcaga 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 26119 - 26326
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  26119 ggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 26218  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  26219 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttg 26318  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  26319 agatcaga 26326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 14848 - 15055
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  14848 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 14947  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  14948 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 15047  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  15048 agatcaga 15055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Original strand, 8984 - 9191
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  8984 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 9083  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  9084 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 9183  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  9184 agatcaga 9191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20353 - 20146
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  20353 ggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaa 20254  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  20253 agtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttg 20154  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  20153 agatcaga 20146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8287 - 8080
Alignment:
Q  15 ggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||    
T  8287 ggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaa 8188  T
Q  115 ggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttg 214  Q
     || |  || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| |||    
T  8187 agtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttg 8088  T
Q  215 aggtcaga 222  Q
    || |||||    
T  8087 agatcaga 8080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 114
Target Start/End: Original strand, 46764 - 46819
Alignment:
Q  59 acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 114  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  46764 acagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 46819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University