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Alignment Overview

Query: NF8901_low_184 (Length: 219)

Name: NF8901_low_184
Description: NF8901
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8901_low_184
NF8901_low_184
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (14-219)||(31891545-31891750)
chr2 (13-219)||(27118506-27118712)
chr2 (22-219)||(19456638-19456835)
chr2 (13-219)||(34156829-34157035)
chr2 (13-219)||(34303520-34303726)
chr2 (13-219)||(3784472-3784678)
chr2 (13-219)||(16163417-16163623)
chr2 (22-219)||(21703381-21703578)
chr2 (37-185)||(27434698-27434846)
chr2 (18-166)||(27392813-27392961)
chr2 (37-165)||(23128840-23128968)
chr2 (37-165)||(12655381-12655509)
chr2 (37-165)||(28882053-28882181)
chr2 (39-165)||(20837759-20837885)
chr2 (19-188)||(13936795-13936964)
chr2 (19-185)||(11635443-11635609)
chr2 (19-185)||(11641632-11641798)
chr2 (19-185)||(34279270-34279436)
chr2 (64-185)||(21677436-21677557)
chr2 (64-185)||(32049664-32049785)
chr2 (64-195)||(261009-261140)
chr2 (67-185)||(34286223-34286341)
chr2 (67-185)||(34291283-34291401)
chr2 (19-195)||(40233320-40233496)
chr2 (64-195)||(9350238-9350369)
chr2 (64-195)||(27803558-27803689)
chr2 (64-194)||(12586667-12586797)
chr2 (19-185)||(37925314-37925480)
chr2 (64-195)||(27777073-27777204)
chr2 (37-128)||(37375000-37375091)
chr2 (61-191)||(39052076-39052206)
chr2 (64-185)||(27816840-27816961)
chr2 (37-185)||(16829592-16829740)
chr2 (37-185)||(16891741-16891889)
chr2 (19-125)||(12716919-12717025)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (13-219)||(44562923-44563129)
chr8 (13-219)||(9354444-9354650)
chr8 (13-219)||(19659226-19659432)
chr8 (37-219)||(16283292-16283477)
chr8 (18-219)||(22081065-22081263)
chr8 (19-165)||(19687923-19688069)
chr8 (37-165)||(16277397-16277525)
chr8 (37-165)||(2137503-2137631)
chr8 (37-219)||(14557470-14557652)
chr8 (64-165)||(27609149-27609250)
chr8 (19-191)||(18710411-18710583)
chr8 (19-185)||(19674263-19674429)
chr8 (19-215)||(19286290-19286486)
chr8 (19-125)||(31490034-31490140)
chr8 (64-185)||(19518367-19518488)
chr8 (19-195)||(3329733-3329909)
chr8 (64-128)||(31354394-31354458)
chr8 (175-219)||(33244649-33244693)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (14-219)||(28162477-28162682)
chr6 (13-219)||(13522244-13522450)
chr6 (13-219)||(33374427-33374633)
chr6 (13-219)||(8892481-8892687)
chr6 (13-219)||(8903716-8903922)
chr6 (22-219)||(22477444-22477644)
chr6 (61-219)||(20160568-20160726)
chr6 (61-219)||(22172105-22172263)
chr6 (37-219)||(22935051-22935233)
chr6 (37-219)||(23857496-23857678)
chr6 (37-185)||(26999913-27000061)
chr6 (37-165)||(13299179-13299307)
chr6 (37-165)||(15424545-15424673)
chr6 (37-185)||(24863557-24863705)
chr6 (38-185)||(16749695-16749842)
chr6 (19-185)||(26918202-26918368)
chr6 (37-165)||(26988841-26988969)
chr6 (19-165)||(24304846-24304992)
chr6 (19-215)||(29549300-29549496)
chr6 (64-195)||(3695930-3696061)
chr6 (163-219)||(27290541-27290597)
chr6 (64-195)||(34463559-34463690)
chr6 (61-195)||(16673991-16674125)
chr6 (22-195)||(27629907-27630080)
chr6 (18-185)||(30558224-30558391)
chr6 (64-194)||(26777826-26777956)
chr6 (19-128)||(4525111-4525220)
chr6 (151-219)||(22457105-22457176)
chr6 (19-128)||(29501228-29501337)
chr6 (175-219)||(14143456-14143500)
chr6 (175-219)||(26787925-26787969)
chr6 (64-128)||(27044257-27044321)
chr6 (175-219)||(27196298-27196342)
chr6 (175-219)||(27252898-27252942)
chr6 (19-195)||(27484939-27485115)
chr6 (64-195)||(27007579-27007710)
chr6 (19-194)||(28207264-28207439)
chr6 (19-185)||(4545992-4546158)
chr6 (19-185)||(4724351-4724517)
chr6 (64-185)||(17025129-17025250)
chr6 (19-191)||(4757583-4757755)
chr6 (19-195)||(27360208-27360384)
chr6 (19-195)||(27450551-27450727)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (13-219)||(2886-3092)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (13-219)||(20340563-20340769)
chr1 (22-166)||(20460935-20461079)
chr1 (22-219)||(16208259-16208453)
chr1 (64-185)||(41793573-41793694)
chr1 (175-219)||(28151845-28151889)
chr1 (181-219)||(20461070-20461108)
chr1 (19-185)||(28584805-28584971)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (22-219)||(15227716-15227913)
chr4 (22-219)||(15285156-15285353)
chr4 (13-219)||(24460833-24461039)
chr4 (22-219)||(1900103-1900300)
chr4 (22-219)||(14235753-14235953)
chr4 (18-219)||(15391566-15391764)
chr4 (19-219)||(24592542-24592742)
chr4 (37-165)||(17013858-17013986)
chr4 (19-165)||(14664858-14665004)
chr4 (18-185)||(5005709-5005876)
chr4 (18-185)||(27163582-27163749)
chr4 (64-145)||(6569738-6569819)
chr4 (64-185)||(21969586-21969707)
chr4 (19-128)||(34189279-34189388)
chr4 (20-128)||(24112506-24112614)
chr4 (19-195)||(30753582-30753758)
chr4 (37-215)||(36344747-36344925)
chr4 (19-215)||(54833230-54833426)
chr4 (37-128)||(14763626-14763717)
chr4 (61-195)||(33674065-33674199)
chr4 (19-120)||(19373101-19373202)
chr4 (19-191)||(18800881-18801053)
chr4 (19-185)||(14098381-14098547)
chr4 (19-185)||(31126783-31126949)
chr4 (61-195)||(39850505-39850639)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (22-219)||(16626775-16626972)
chr3 (13-219)||(17994053-17994259)
chr3 (13-219)||(4625727-4625933)
chr3 (13-219)||(5652170-5652376)
chr3 (22-219)||(18530186-18530377)
chr3 (13-125)||(5713007-5713119)
chr3 (13-125)||(5723917-5724029)
chr3 (13-125)||(5757448-5757560)
chr3 (13-125)||(5768339-5768451)
chr3 (19-219)||(15892975-15893178)
chr3 (19-219)||(8301536-8301736)
chr3 (37-185)||(4796959-4797107)
chr3 (37-165)||(18051066-18051194)
chr3 (19-165)||(35880552-35880698)
chr3 (37-140)||(15741433-15741536)
chr3 (37-219)||(8295779-8295961)
chr3 (19-219)||(7072998-7073201)
chr3 (19-145)||(4721417-4721543)
chr3 (19-165)||(6192102-6192248)
chr3 (19-185)||(28116263-28116429)
chr3 (64-185)||(7996393-7996514)
chr3 (64-185)||(10642901-10643022)
chr3 (64-185)||(47023284-47023405)
chr3 (37-185)||(29149061-29149209)
chr3 (64-194)||(11110658-11110788)
chr3 (19-165)||(18330460-18330601)
chr3 (19-128)||(4892999-4893108)
chr3 (19-128)||(8211527-8211636)
chr3 (19-128)||(22387938-22388047)
chr3 (20-128)||(32438944-32439052)
chr3 (37-128)||(20065850-20065941)
chr3 (64-195)||(36997385-36997516)
chr3 (61-195)||(29665281-29665415)
chr3 (37-128)||(18277415-18277506)
chr3 (37-128)||(18292716-18292807)
chr3 (37-128)||(18308017-18308108)
chr3 (64-195)||(20577158-20577289)
chr3 (19-134)||(21674479-21674594)
chr3 (67-128)||(10395970-10396031)
chr3 (19-195)||(48465701-48465877)
chr3 (18-185)||(17985262-17985429)
chr3 (19-194)||(22871171-22871346)
chr3 (19-194)||(22886230-22886405)
chr3 (61-195)||(51781839-51781973)
chr3 (61-195)||(51796928-51797062)
chr3 (19-128)||(5466771-5466880)
chr3 (19-128)||(5596729-5596838)
chr3 (19-195)||(6542770-6542946)
chr3 (175-219)||(32292697-32292741)
chr3 (19-185)||(18224977-18225143)
chr3 (64-128)||(4347047-4347111)
chr3 (19-195)||(18242513-18242689)
chr3 (64-128)||(28021109-28021173)
chr3 (175-219)||(31034386-31034430)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (13-219)||(31088578-31088784)
chr7 (13-219)||(45733283-45733489)
chr7 (22-219)||(16450112-16450309)
chr7 (22-219)||(16041155-16041352)
chr7 (37-185)||(16503531-16503679)
chr7 (37-185)||(16518567-16518715)
chr7 (19-219)||(5127818-5128021)
chr7 (64-219)||(10916982-10917137)
chr7 (37-145)||(2154417-2154525)
chr7 (61-219)||(5147454-5147615)
chr7 (64-165)||(11424947-11425048)
chr7 (64-195)||(11441431-11441562)
chr7 (19-185)||(45387169-45387335)
chr7 (19-128)||(5159348-5159457)
chr7 (64-185)||(16736611-16736732)
chr7 (64-185)||(16751665-16751786)
chr7 (64-185)||(17523403-17523524)
chr7 (64-185)||(17529691-17529812)
chr7 (61-145)||(26435125-26435209)
chr7 (19-191)||(26538018-26538190)
chr7 (19-195)||(26485885-26486061)
chr7 (61-195)||(3445162-3445296)
chr7 (19-128)||(4145331-4145440)
chr7 (175-219)||(2109119-2109163)
chr7 (175-219)||(26484679-26484723)
chr7 (19-185)||(26320020-26320186)
chr7 (175-219)||(18540784-18540828)
chr7 (19-195)||(31124737-31124913)
chr7 (175-219)||(39211137-39211181)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (13-219)||(13184773-13184979)
chr5 (13-219)||(13440619-13440825)
chr5 (13-219)||(33877078-33877284)
chr5 (13-219)||(11325625-11325831)
chr5 (22-219)||(22888310-22888507)
chr5 (37-219)||(25198884-25199066)
chr5 (37-219)||(23892058-23892243)
chr5 (37-219)||(24969876-24970055)
chr5 (19-185)||(33777321-33777487)
chr5 (37-165)||(24688339-24688467)
chr5 (37-219)||(30934488-30934670)
chr5 (37-165)||(11549206-11549334)
chr5 (37-165)||(23718170-23718298)
chr5 (37-165)||(23752632-23752760)
chr5 (37-165)||(22999296-22999424)
chr5 (64-165)||(9548725-9548826)
chr5 (19-195)||(31431262-31431438)
chr5 (19-191)||(43078083-43078255)
chr5 (64-195)||(18500900-18501031)
chr5 (64-185)||(8665637-8665758)
chr5 (64-185)||(15658922-15659043)
chr5 (19-128)||(33292362-33292471)
chr5 (65-185)||(41674589-41674709)
chr5 (18-185)||(30168302-30168469)
chr5 (19-195)||(3789360-3789536)
chr5 (19-191)||(24681271-24681443)
chr5 (19-191)||(24723798-24723970)
chr5 (163-219)||(29889207-29889263)
chr5 (18-185)||(18375574-18375741)
chr5 (18-185)||(33516189-33516356)
chr5 (64-185)||(28649105-28649226)
chr5 (19-195)||(37358807-37358983)
chr5 (19-194)||(37671645-37671820)
chr5 (19-185)||(12131989-12132155)
chr5 (64-185)||(6874181-6874302)
chr5 (19-195)||(13324996-13325172)
chr5 (19-195)||(31826571-31826747)
chr5 (64-128)||(32599688-32599752)
chr5 (19-195)||(37771151-37771327)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (22-166)||(20240-20384)
scaffold0124 (37-165)||(30296-30424)
scaffold0124 (178-219)||(20375-20416)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (18-219)||(21391-21589)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (37-219)||(29606-29791)
scaffold0089 (37-185)||(40334-40482)
scaffold0089 (64-165)||(47270-47371)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (19-185)||(395-561)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (37-165)||(27135-27263)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (163-219)||(256-312)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (18-185)||(15195-15362)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (64-125)||(5859-5921)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (19-128)||(8057-8166)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (19-194)||(7762-7937)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (19-185)||(7504-7670)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31891750 - 31891545
Alignment:
Q  14 tggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31891750 tggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatc 31891651  T
Q  114 gggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcct 213  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31891650 gggacaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcct 31891551  T
Q  214 ccgata 219  Q
    | ||||    
T  31891550 ctgata 31891545  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 27118506 - 27118712
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27118506 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgcatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 27118605  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27118606 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctaccttccc 27118705  T
Q  213 tccgata 219  Q
    |||||||    
T  27118706 tccgata 27118712  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19456835 - 19456638
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19456835 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgcaatactttcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaac 19456736  T
Q  122 ctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19456735 ctcaggtgcccgttaatgccatcgtttagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgata 19456638  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 34156829 - 34157035
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34156829 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 34156928  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  34156929 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 34157028  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  34157029 tctgata 34157035  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34303726 - 34303520
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34303726 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 34303627  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34303626 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgtcgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 34303527  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  34303526 tctgata 34303520  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 3784472 - 3784678
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3784472 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 3784571  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  3784572 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcc 3784671  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  3784672 tctgata 3784678  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 16163417 - 16163623
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16163417 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccat 16163516  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16163517 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 16163616  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  16163617 tctgata 16163623  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21703578 - 21703381
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaac 121  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21703578 aatgctgcctagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 21703479  T
Q  122 ctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21703478 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgata 21703381  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27434846 - 27434698
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  27434846 cctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 27434747  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    |||| |||| ||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  27434746 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 27434698  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 27392813 - 27392961
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggt 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  ||  |||||    
T  27392813 catcgatgctgctcagctacctccaccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccgggt 27392912  T
Q  118 caacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagc 166  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27392913 caacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagc 27392961  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23128968 - 23128840
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  23128968 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 23128869  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  23128868 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 23128840  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Original strand, 12655381 - 12655509
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  12655381 cctccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 12655480  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  12655481 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 12655509  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Original strand, 28882053 - 28882181
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  28882053 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 28882152  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  28882153 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 28882181  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 165
Target Start/End: Original strand, 20837759 - 20837885
Alignment:
Q  39 tccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaat 138  Q
    |||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  20837759 tccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 20837858  T
Q  139 gccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    || || | ||| || ||| ||||||||    
T  20837859 gcaatcgctcaacagatgaaacaacag 20837885  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13936964 - 13936795
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||    
T  13936964 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtc 13936865  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagca 188  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| |||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  13936864 aacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaacagca 13936795  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11635609 - 11635443
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11635609 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 11635510  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  11635509 aacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 11635443  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11641798 - 11641632
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11641798 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 11641699  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  11641698 aacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 11641632  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 34279270 - 34279436
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||    
T  34279270 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtc 34279369  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||||||| || ||| | ||||| |||| ||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  34279370 aacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 34279436  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21677557 - 21677436
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  21677557 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaac 21677458  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  21677457 agatgccggttcaacaacaaca 21677436  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 32049664 - 32049785
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  32049664 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 32049763  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  32049764 agatgccggttcaacaacaaca 32049785  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 261140 - 261009
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  261140 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 261041  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    ||   || | |||||||||||| || ||||||    
T  261040 agttgccagttcaacaacaacaacaacaacaa 261009  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 185
Target Start/End: Original strand, 34286223 - 34286341
Alignment:
Q  67 cagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagc 166  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||  ||| ||| || ||| ||||||||     
T  34286223 cagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaacaacaga 34286322  T
Q  167 caccggctcaacaacaaca 185  Q
      |||| ||||||||||||    
T  34286323 tgccggttcaacaacaaca 34286341  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 185
Target Start/End: Original strand, 34291283 - 34291401
Alignment:
Q  67 cagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagc 166  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||  ||| ||| || ||| ||||||||     
T  34291283 cagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaacaacaga 34291382  T
Q  167 caccggctcaacaacaaca 185  Q
      |||| ||||||||||||    
T  34291383 tgccggttcaacaacaaca 34291401  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 40233320 - 40233496
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||| ||||||    
T  40233320 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtc 40233419  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  40233420 aacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 40233496  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9350369 - 9350238
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||| | ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  9350369 tctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgctaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 9350270  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    |||  |||| |||||||||||| || ||||||    
T  9350269 agctgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 9350238  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Original strand, 27803558 - 27803689
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  27803558 tctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 27803657  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    ||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  27803658 agttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 27803689  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 194
Target Start/End: Original strand, 12586667 - 12586797
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  12586667 tctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 12586766  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaacagcagcaaca 194  Q
    ||   |||| |||||||||||| || |||||    
T  12586767 agttgccggttcaacaacaacaacaacaaca 12586797  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 37925314 - 37925480
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  37925314 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtc 37925413  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  37925414 aacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 37925480  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Original strand, 27777073 - 27777204
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||||| | ||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  27777073 tctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccaggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 27777172  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    ||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  27777173 agttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 27777204  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 37375000 - 37375091
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggt 128  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  37375000 cctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccgccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 37375091  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39052206 - 39052076
Alignment:
Q  61 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaac 160  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||| | || || ||||  || || ||| |||    
T  39052206 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaacgcaattgcccaacagatgaaac 39052107  T
Q  161 aacagccaccggctcaacaacaacagcagca 191  Q
    |||||   |||| |||||||||||| |||||    
T  39052106 aacagttgccggttcaacaacaacaacagca 39052076  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 27816840 - 27816961
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||||| | ||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  27816840 tctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccaggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 27816939  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  27816940 agttgccggttcaacaacaaca 27816961  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16829740 - 16829592
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| || ||| | |    
T  16829740 cctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtca 16829641  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    |||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  16829640 atgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 16829592  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 16891741 - 16891889
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| || ||| | |    
T  16891741 cctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtca 16891840  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    |||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  16891841 atgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 16891889  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12717025 - 12716919
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  12717025 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 12716926  T
Q  119 aacctca 125  Q
    | |||||    
T  12716925 agcctca 12716919  T

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Target: chr8 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 44562923 - 44563129
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44562923 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 44563022  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44563023 cgggacaacctcaggtacccgttaatgccgccgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcc 44563122  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  44563123 tctgata 44563129  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 9354444 - 9354650
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9354444 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 9354543  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9354544 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 9354643  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  9354644 tctgata 9354650  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19659432 - 19659226
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19659432 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 19659333  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| ||||||| || || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19659332 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacaacctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 19659233  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  19659232 tctgata 19659226  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Original strand, 16283292 - 16283477
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16283292 cctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcattagtatcctttgccaccaggtcaacctcaggtacccatta 16283391  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggct---caacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||| |||| ||| || ||| ||||||||   |||| |   ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16283392 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctaccttccctccgata 16283477  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22081263 - 22081065
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||   || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |   |  |||||    
T  22081263 catcaatgctgctcagctacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggt 22081164  T
Q  118 caacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccga 217  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| | ||||||||   ||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22081163 caacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcagcaacagccgttggct---caacagcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccga 22081067  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Original strand, 19687923 - 19688069
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  19687923 atcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattcccagcatcctttctttccgccattctatcaccagtaccctctgccaccgggtc 19688022  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||| ||| || ||| ||||||||    
T  19688023 aacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacag 19688069  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Original strand, 16277397 - 16277525
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  16277397 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 16277496  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  16277497 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 16277525  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2137631 - 2137503
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  2137631 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgtcattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 2137532  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  2137531 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 2137503  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Original strand, 14557470 - 14557652
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||    
T  14557470 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgtta 14557569  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||   || | ||||||||||||  | || ||| |||||||||| || |||||||||    
T  14557570 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgata 14557652  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27609250 - 27609149
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || | ||| || ||| ||||||    
T  27609250 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 27609151  T
Q  164 ag 165  Q
    ||    
T  27609150 ag 27609149  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 18710411 - 18710583
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  18710411 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 18710510  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagca 191  Q
    |||||||||| ||| | |||||  ||| ||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||| ||||||||    
T  18710511 aacctcaggttcccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacagcagcagca 18710583  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 19674263 - 19674429
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||    
T  19674263 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtc 19674362  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  19674363 aacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 19674429  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 19286290 - 19286486
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  19286290 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttaccaccgggcc 19286389  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctcc 215  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||| ||| ||  |  |||| || || || | |||||| || ||||||||| | |||||||| || ||||||||    
T  19286390 aacctcaggttcctgtcaatgccattgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcc 19286486  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31490140 - 31490034
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  31490140 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtc 31490041  T
Q  119 aacctca 125  Q
    |||||||    
T  31490040 aacctca 31490034  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19518488 - 19518367
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  19518488 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 19518389  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  19518388 agttgccggttcaacaacaaca 19518367  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3329909 - 3329733
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  3329909 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 3329810  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  3329809 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 3329733  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 128
Target Start/End: Original strand, 31354394 - 31354458
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggt 128  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  31354394 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 31354458  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 219
Target Start/End: Original strand, 33244649 - 33244693
Alignment:
Q  175 caacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  33244649 caacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgata 33244693  T

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Target: chr6 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 28162477 - 28162682
Alignment:
Q  14 tggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28162477 tggacatcaatgctgctcagctacctccatcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatc 28162576  T
Q  114 gggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcct 213  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28162577 gggacaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcct 28162676  T
Q  214 ccgata 219  Q
    | ||||    
T  28162677 ctgata 28162682  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13522450 - 13522244
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13522450 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 13522351  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13522350 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 13522251  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  13522250 tctgata 13522244  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33374633 - 33374427
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33374633 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 33374534  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33374533 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 33374434  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  33374433 tctgata 33374427  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8892687 - 8892481
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  8892687 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtattctttgccat 8892588  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8892587 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 8892488  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  8892487 tctgata 8892481  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8903922 - 8903716
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8903922 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatctcttctttccaccattctatcatcagtattctttgccat 8903823  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8903822 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 8903723  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  8903722 tctgata 8903716  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22477644 - 22477444
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22477644 aatgctgcccaattacctctgtcgtacccgtatgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattctatcattagtatcctttgccatcgggtcaac 22477545  T
Q  122 ctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaaca---acagcagcaacaaactagacctacctttcctccgat 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  22477544 ctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacaaatgcaacaacagtcaccggttcaacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgat 22477445  T
Q  219 a 219  Q
    |    
T  22477444 a 22477444  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 219
Target Start/End: Original strand, 20160568 - 20160726
Alignment:
Q  61 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaac 160  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   | |    
T  20160568 tactctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagc 20160667  T
Q  161 aacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20160668 aacagccaccagctcaacaacaacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgata 20160726  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22172263 - 22172105
Alignment:
Q  61 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaac 160  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   | |    
T  22172263 tactctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagc 22172164  T
Q  161 aacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22172163 aacagccaccagctcaacaacaacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgata 22172105  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22935233 - 22935051
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  22935233 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtca 22935134  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||| |||| ||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||  | || ||| |||||||||| || |||||||||    
T  22935133 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgata 22935051  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23857678 - 23857496
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  23857678 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtca 23857579  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||| |||| ||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||  | || ||| |||||||||| || |||||||||    
T  23857578 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgata 23857496  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 26999913 - 27000061
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  26999913 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 27000012  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    |||| |||| ||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  27000013 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 27000061  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13299307 - 13299179
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  13299307 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 13299208  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  13299207 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 13299179  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15424673 - 15424545
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  15424673 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 15424574  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  15424573 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 15424545  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 24863557 - 24863705
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| || |||||| |||    
T  24863557 cctccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctaccaccgagtcaaccccaagtacccgtta 24863656  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    |||| |||| ||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  24863657 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 24863705  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 185
Target Start/End: Original strand, 16749695 - 16749842
Alignment:
Q  38 ctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaa 137  Q
    ||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  16749695 ctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 16749794  T
Q  138 tgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||| || | ||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  16749795 tgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 16749842  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 26918202 - 26918368
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  26918202 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 26918301  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||||||| |||||| | ||||| |||| ||| || | | ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  26918302 aacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagacgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 26918368  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Original strand, 26988841 - 26988969
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  26988841 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 26988940  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  26988941 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 26988969  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24304992 - 24304846
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24304992 atcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 24304893  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  24304892 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 24304846  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 29549300 - 29549496
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  29549300 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 29549399  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctcc 215  Q
    |||||||||| ||  | |||||||| | ||| ||  || |||| || || || | ||||||||| ||||||||| |  ||||||| || ||||||||    
T  29549400 aacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacaacagcagcagcaatacgctagaccaacttttcctcc 29549496  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Original strand, 3695930 - 3696061
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  3695930 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 3696029  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    ||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  3696030 agttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 3696061  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27290597 - 27290541
Alignment:
Q  163 cagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  27290597 cagccaccggctcaacaacgacagcagcaataagctagacctacctttcctctgata 27290541  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34463690 - 34463559
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  34463690 tctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 34463591  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    ||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  34463590 agttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 34463559  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 195
Target Start/End: Original strand, 16673991 - 16674125
Alignment:
Q  61 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaac 160  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| |||    
T  16673991 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 16674090  T
Q  161 aacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    |||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  16674091 aacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 16674125  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27630080 - 27629907
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaac 121  Q
    |||| |||||||||||||||  | ||||| | | | | ||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||| ||||||| || | ||    
T  27630080 aatgttgctcagctacctccaccatacccctgtacaccatattctcagcatccattcttcccaccgttttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 27629981  T
Q  122 ctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| || || | |  |||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  27629980 ctcaggtacccgtgaatgctattgtgcaacagaagccacaacaaccaccagttcagcaacaacaacagcaacaa 27629907  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30558391 - 30558224
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggt 117  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||     
T  30558391 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggc 30558292  T
Q  118 caacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    || ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  30558291 cagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 30558224  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26777956 - 26777826
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  26777956 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 26777857  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaacagcagcaaca 194  Q
    ||   |||| |||||||||||| || |||||    
T  26777856 agttgccggttcaacaacaacaacaacaaca 26777826  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 4525111 - 4525220
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| | || |    
T  4525111 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggcc 4525210  T
Q  119 aacctcaggt 128  Q
    ||||||||||    
T  4525211 aacctcaggt 4525220  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22457176 - 22457105
Alignment:
Q  151 caaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaac---agcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22457176 caaatgcaacaacagtcaccggttcaacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgata 22457105  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 29501228 - 29501337
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||||||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| | || |    
T  29501228 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggcc 29501327  T
Q  119 aacctcaggt 128  Q
    ||||||||||    
T  29501328 aacctcaggt 29501337  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14143500 - 14143456
Alignment:
Q  175 caacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14143500 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgata 14143456  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 219
Target Start/End: Original strand, 26787925 - 26787969
Alignment:
Q  175 caacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26787925 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgata 26787969  T

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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 128
Target Start/End: Original strand, 27044257 - 27044321
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggt 128  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  27044257 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 27044321  T

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Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 219
Target Start/End: Original strand, 27196298 - 27196342
Alignment:
Q  175 caacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27196298 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgata 27196342  T

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Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27252942 - 27252898
Alignment:
Q  175 caacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27252942 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgata 27252898  T

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Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 27484939 - 27485115
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||| |    
T  27484939 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggcc 27485038  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  ||||| ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  27485039 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccagcagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 27485115  T

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Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Original strand, 27007579 - 27007710
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  27007579 tctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 27007678  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    ||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  27007679 agttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 27007710  T

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Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 28207264 - 28207439
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  28207264 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 28207363  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaaca 194  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || |||||    
T  28207364 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaaca 28207439  T

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Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4546158 - 4545992
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  4546158 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 4546059  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  4546058 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 4545992  T

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Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4724517 - 4724351
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  4724517 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 4724418  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  4724417 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 4724351  T

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Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 17025129 - 17025250
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  17025129 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 17025228  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  17025229 agttgccggttcaacaacaaca 17025250  T

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Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 4757583 - 4757755
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  4757583 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 4757682  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagca 191  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| |||||    
T  4757683 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacagca 4757755  T

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Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27360384 - 27360208
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  27360384 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 27360285  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  27360284 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 27360208  T

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Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27450727 - 27450551
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  27450727 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 27450628  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  27450627 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 27450551  T

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Target: scaffold0260 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3092 - 2886
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3092 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 2993  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  2992 cgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcc 2893  T
Q  213 tccgata 219  Q
    |||||||    
T  2892 tccgata 2886  T

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Target: chr1 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20340769 - 20340563
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20340769 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 20340670  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  20340669 cgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcc 20340570  T
Q  213 tccgata 219  Q
    |||||||    
T  20340569 tccgata 20340563  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 166
Target Start/End: Original strand, 20460935 - 20461079
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20460935 aatgctgcccagttacctccgccgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcaatatcctctaccatcgggtcaac 20461034  T
Q  122 ctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagc 166  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20461035 ctcaggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagc 20461079  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16208453 - 16208259
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| | |||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |    
T  16208453 aatgctgcccagttacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccaccatcgggtcagc 16208354  T
Q  122 ctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16208353 ctcaggtacccattaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaa---catcaacaagctagacctacctttcctccgata 16208259  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41793694 - 41793573
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||| ||  || ||| ||||||    
T  41793694 tctcaacatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctccacagatgaaacaac 41793595  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  41793594 agatgccggttcaacaacaaca 41793573  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 219
Target Start/End: Original strand, 28151845 - 28151889
Alignment:
Q  175 caacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28151845 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgata 28151889  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 219
Target Start/End: Original strand, 20461070 - 20461108
Alignment:
Q  181 caacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20461070 caacaacagcaacaagctagacctacctttcctccgata 20461108  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 28584805 - 28584971
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| |||||||||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||| |    
T  28584805 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccgtatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggcc 28584904  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  28584905 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 28584971  T

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Target: chr4 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Original strand, 15227716 - 15227913
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15227716 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaac 15227815  T
Q  122 ctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15227816 ctcaggtacccgttaatgctgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgata 15227913  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15285353 - 15285156
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15285353 aatgctgcccagttacctccattgtacccatatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaac 15285254  T
Q  122 ctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15285253 ctcaggtgcccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccaactcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgata 15285156  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24461039 - 24460833
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24461039 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccat 24460940  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24460939 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 24460840  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  24460839 tctgata 24460833  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Original strand, 1900103 - 1900300
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1900103 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 1900202  T
Q  122 ctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1900203 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgata 1900300  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14235953 - 14235753
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  14235953 aatgctgctcagttacctctgccgtaccagtatatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcatcagtaccctctaccatcgggtcacc 14235854  T
Q  122 ctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagca---acaaactagacctacctttcctccgat 218  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| |||    
T  14235853 cataggtacccgttaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgccggctcagcaacaacagcagcaacaacaagctagacctacctttcctctgat 14235754  T
Q  219 a 219  Q
    |    
T  14235753 a 14235753  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15391764 - 15391566
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggt 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| | |||   || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |   |  |||||    
T  15391764 catcaatgttgctcagctacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggt 15391665  T
Q  118 caacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccga 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| | ||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15391664 caacctcaggtacccatcaatgccattgctcagcaaatgcagcaacagccgctggct---caacaacagcagcaacaaaccagacctacctttcctccga 15391568  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24592742 - 24592542
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24592742 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 24592643  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgat 218  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || | ||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||  | || ||| |||||||||| || ||||||||    
T  24592642 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgat 24592543  T
Q  219 a 219  Q
    |    
T  24592542 a 24592542  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Original strand, 17013858 - 17013986
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    ||||| || ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  17013858 cctccttcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 17013957  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    |||| |||| ||| || ||| ||||||||    
T  17013958 atgcaattgctcaacagatgaaacaacag 17013986  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Original strand, 14664858 - 14665004
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14664858 atcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcaccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 14664957  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  14664958 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 14665004  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 5005709 - 5005876
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggt 117  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5005709 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggt 5005808  T
Q  118 caacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  5005809 caacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 5005876  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27163749 - 27163582
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggt 117  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27163749 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggt 27163650  T
Q  118 caacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    |||||||| || ||| | ||||| |||| ||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  27163649 caacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 27163582  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 6569738 - 6569819
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattg 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  6569738 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattg 6569819  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 21969586 - 21969707
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  21969586 tctcagcatcctttcttcccgccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 21969685  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  21969686 agttgccggttcaacaacaaca 21969707  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34189388 - 34189279
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  34189388 atcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 34189289  T
Q  119 aacctcaggt 128  Q
    ||||||||||    
T  34189288 aacctcaggt 34189279  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 128
Target Start/End: Original strand, 24112506 - 24112614
Alignment:
Q  20 tcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtca 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| ||    
T  24112506 tcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcca 24112605  T
Q  120 acctcaggt 128  Q
    |||||||||    
T  24112606 acctcaggt 24112614  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 30753582 - 30753758
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  30753582 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccgccgggtc 30753681  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  30753682 aacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 30753758  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36344925 - 36344747
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||  | |    
T  36344925 cctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcctaccgttttatcatcagtatcctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtca 36344826  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctcc 215  Q
    ||||||| | ||| ||  || |||| || || || | |||||| || ||||||||| | |||||||| || ||||||||    
T  36344825 atgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcc 36344747  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 54833230 - 54833426
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  54833230 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttaccaccgggcc 54833329  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctcc 215  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||| ||| ||  |  |||| || || || | |||||| || ||||||||| | |||||||| || ||||||||    
T  54833330 aacctcaggttcctgtcaatgccattgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcc 54833426  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14763717 - 14763626
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggt 128  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  14763717 cctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 14763626  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33674199 - 33674065
Alignment:
Q  61 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaac 160  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| |||    
T  33674199 tactctcagcatccgttcttcccaccattttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 33674100  T
Q  161 aacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    |||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  33674099 aacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 33674065  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Original strand, 19373101 - 19373202
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  19373101 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtc 19373200  T
Q  119 aa 120  Q
    ||    
T  19373201 aa 19373202  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18801053 - 18800881
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  18801053 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 18800954  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagca 191  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| |||||    
T  18800953 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacagca 18800881  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 14098381 - 14098547
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  14098381 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 14098480  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  14098481 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 14098547  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31126949 - 31126783
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  31126949 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 31126850  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  31126849 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 31126783  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 195
Target Start/End: Original strand, 39850505 - 39850639
Alignment:
Q  61 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaac 160  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||  ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| |||    
T  39850505 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 39850604  T
Q  161 aacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    |||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  39850605 aacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 39850639  T

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Target: chr3 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16626972 - 16626775
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16626972 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcacaatactctcagcatcccttctttccaccgttctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaac 16626873  T
Q  122 ctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16626872 ctccggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgata 16626775  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17994259 - 17994053
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17994259 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 17994160  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17994159 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 17994060  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  17994059 tctgata 17994053  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 4625727 - 4625933
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4625727 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtatcctttgccat 4625826  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4625827 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgtcgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 4625926  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  4625927 tctgata 4625933  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 5652170 - 5652376
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  5652170 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcgtttgcaat 5652269  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5652270 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 5652369  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  5652370 tctgata 5652376  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Original strand, 18530186 - 18530377
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18530186 aatgctgcccagttacctccatcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaac 18530285  T
Q  122 ctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||| || ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18530286 ctcaagtgcccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagct------caacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgata 18530377  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 5713007 - 5713119
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  5713007 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccac 5713106  T
Q  113 cgggtcaacctca 125  Q
    |||||||||||||    
T  5713107 cgggtcaacctca 5713119  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 5723917 - 5724029
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  5723917 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccac 5724016  T
Q  113 cgggtcaacctca 125  Q
    |||||||||||||    
T  5724017 cgggtcaacctca 5724029  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5757560 - 5757448
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  5757560 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccac 5757461  T
Q  113 cgggtcaacctca 125  Q
    |||||||||||||    
T  5757460 cgggtcaacctca 5757448  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5768451 - 5768339
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  5768451 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccac 5768352  T
Q  113 cgggtcaacctca 125  Q
    |||||||||||||    
T  5768351 cgggtcaacctca 5768339  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15893178 - 15892975
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  15893178 atcaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgcccttctatcatcagtaccctttgccaccgggtc 15893079  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaac---aacagcagcaacaaactagacctacctttcctcc 215  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||| ||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||   |||| || |||||| |||||||||| || |||||    
T  15893078 aacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctcc 15892979  T
Q  216 gata 219  Q
    ||||    
T  15892978 gata 15892975  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8301736 - 8301536
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  8301736 atcaatgctgcccaaatgcctccgtcgtactcatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtc 8301637  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgat 218  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||| ||| || ||| ||||||||   || | ||||||||||||  | || ||| |||||||||| || ||||||||    
T  8301636 aacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgat 8301537  T
Q  219 a 219  Q
    |    
T  8301536 a 8301536  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4797107 - 4796959
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  4797107 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 4797008  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    |||| |||| ||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  4797007 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 4796959  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Original strand, 18051066 - 18051194
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  18051066 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 18051165  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  18051166 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 18051194  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Original strand, 35880552 - 35880698
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35880552 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 35880651  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  35880652 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 35880698  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15741536 - 15741433
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  15741536 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 15741437  T
Q  137 atgc 140  Q
    ||||    
T  15741436 atgc 15741433  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Original strand, 8295779 - 8295961
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||  |||    
T  8295779 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtacctgtta 8295878  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||   ||   ||||||||||||  | || ||| |||||||||| || |||||||||    
T  8295879 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccaattcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgata 8295961  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Original strand, 7072998 - 7073201
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||    
T  7072998 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtc 7073097  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagc---agcaacaaactagacctacctttcctcc 215  Q
    ||||||| || ||| | ||||| |||| ||| || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| |   | || ||| |||||||||| ||||||||    
T  7073098 aacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcc 7073197  T
Q  216 gata 219  Q
    ||||    
T  7073198 gata 7073201  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Original strand, 4721417 - 4721543
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4721417 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcttttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 4721516  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattg 145  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||    
T  4721517 aacctcaagtacccgtcaatgcaattg 4721543  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Original strand, 6192102 - 6192248
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  6192102 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttcttttcgccattttatcattagtaccctctgccaccgggtc 6192201  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    ||||||| |||||| | ||||| |||| ||| || ||| ||||||||    
T  6192202 aacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacag 6192248  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28116429 - 28116263
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28116429 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 28116330  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  28116329 aacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 28116263  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 7996393 - 7996514
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  7996393 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 7996492  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  7996493 agatgccggttcaacaacaaca 7996514  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 10642901 - 10643022
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  10642901 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 10643000  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  10643001 agatgccggttcaacaacaaca 10643022  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 47023284 - 47023405
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  47023284 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaggtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 47023383  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  47023384 agatgccggttcaacaacaaca 47023405  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29149209 - 29149061
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||    
T  29149209 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtta 29149110  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  29149109 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 29149061  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11110788 - 11110658
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  11110788 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 11110689  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaacagcagcaaca 194  Q
    ||   |||| |||||||||||| || |||||    
T  11110688 agttgccggttcaacaacaacaacaacaaca 11110658  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Original strand, 18330460 - 18330601
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||     ||||||||| ||||||    
T  18330460 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccaccattttatcatc-----cctctgccaccgggtc 18330554  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  18330555 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 18330601  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 4892999 - 4893108
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  4892999 atcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 4893098  T
Q  119 aacctcaggt 128  Q
    ||||||||||    
T  4893099 aacctcaggt 4893108  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 8211527 - 8211636
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  8211527 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 8211626  T
Q  119 aacctcaggt 128  Q
    ||||||||||    
T  8211627 aacctcaggt 8211636  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22388047 - 22387938
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  22388047 atcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccatactctcagcatccgttcttcccatcgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 22387948  T
Q  119 aacctcaggt 128  Q
    ||||||||||    
T  22387947 aacctcaggt 22387938  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 128
Target Start/End: Original strand, 32438944 - 32439052
Alignment:
Q  20 tcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtca 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| ||    
T  32438944 tcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcca 32439043  T
Q  120 acctcaggt 128  Q
    |||||||||    
T  32439044 acctcaggt 32439052  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 20065850 - 20065941
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggt 128  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  20065850 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 20065941  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36997516 - 36997385
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  36997516 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccacccggccaacctcaggtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 36997417  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    ||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  36997416 agttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 36997385  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29665415 - 29665281
Alignment:
Q  61 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaac 160  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| |||    
T  29665415 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 29665316  T
Q  161 aacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    |||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  29665315 aacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 29665281  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18277506 - 18277415
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggt 128  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  18277506 cctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 18277415  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18292807 - 18292716
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggt 128  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  18292807 cctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 18292716  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18308108 - 18308017
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggt 128  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  18308108 cctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 18308017  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20577289 - 20577158
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  20577289 tctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 20577190  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    ||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  20577189 agttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 20577158  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Original strand, 21674479 - 21674594
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |||||| ||||||    
T  21674479 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatccgttctttccgccattttaccatcagtaccccctgccaccgggtc 21674578  T
Q  119 aacctcaggtacccat 134  Q
    ||||||| || |||||    
T  21674579 aacctcaagtgcccat 21674594  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 128
Target Start/End: Original strand, 10395970 - 10396031
Alignment:
Q  67 cagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggt 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  10395970 cagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 10396031  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 48465701 - 48465877
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || | |||| ||||||    
T  48465701 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccccgccaccgggtc 48465800  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  48465801 aacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 48465877  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17985429 - 17985262
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggt 117  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||     
T  17985429 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggc 17985330  T
Q  118 caacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    || ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  17985329 cagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 17985262  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22871346 - 22871171
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| | || |    
T  22871346 atcaatgcagctcagatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccaggcc 22871247  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaaca 194  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22871246 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacagcaaca 22871171  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22886405 - 22886230
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| | || |    
T  22886405 atcaatgcagctcagatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccaggcc 22886306  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaaca 194  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22886305 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacagcaaca 22886230  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 195
Target Start/End: Original strand, 51781839 - 51781973
Alignment:
Q  61 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaac 160  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||  ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| |||    
T  51781839 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 51781938  T
Q  161 aacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    |||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  51781939 aacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 51781973  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 195
Target Start/End: Original strand, 51796928 - 51797062
Alignment:
Q  61 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaac 160  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||  ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| |||    
T  51796928 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 51797027  T
Q  161 aacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    |||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  51797028 aacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 51797062  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 5466771 - 5466880
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| | || |    
T  5466771 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccattttatcatcagtaccctttgccacccggcc 5466870  T
Q  119 aacctcaggt 128  Q
    ||||||||||    
T  5466871 aacctcaggt 5466880  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5596838 - 5596729
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||||||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| | || |    
T  5596838 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggcc 5596739  T
Q  119 aacctcaggt 128  Q
    ||||||||||    
T  5596738 aacctcaggt 5596729  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6542946 - 6542770
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  6542946 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 6542847  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  6542846 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 6542770  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 219
Target Start/End: Original strand, 32292697 - 32292741
Alignment:
Q  175 caacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32292697 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgata 32292741  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 18224977 - 18225143
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||| |    
T  18224977 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggcc 18225076  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  18225077 agcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 18225143  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4347111 - 4347047
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggt 128  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||    
T  4347111 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggt 4347047  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 18242513 - 18242689
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||  || ||||  |||| |    
T  18242513 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtactctttgccgccgggcc 18242612  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  ||||| ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  18242613 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccagcagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 18242689  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 128
Target Start/End: Original strand, 28021109 - 28021173
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggt 128  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||    
T  28021109 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggt 28021173  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31034430 - 31034386
Alignment:
Q  175 caacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  31034430 caacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgata 31034386  T

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Target: chr7 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31088784 - 31088578
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31088784 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 31088685  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31088684 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 31088585  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  31088584 tctgata 31088578  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 45733283 - 45733489
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45733283 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 45733382  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45733383 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 45733482  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  45733483 tctgata 45733489  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16450309 - 16450112
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16450309 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtacgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattttatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 16450210  T
Q  122 ctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16450209 ctcaggtacccattaatgccgtcgttcagcaagtgcaacaacagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgata 16450112  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Original strand, 16041155 - 16041352
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16041155 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgtcatcgggtcaac 16041254  T
Q  122 ctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16041255 ctcaggtacccgttaattccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgata 16041352  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16503679 - 16503531
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16503679 cctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtta 16503580  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    |||| |||| ||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  16503579 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaaca 16503531  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16518715 - 16518567
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16518715 cctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtta 16518616  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    |||| |||| ||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  16518615 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaaca 16518567  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Original strand, 5127818 - 5128021
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5127818 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtc 5127917  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagc---agcaacaaactagacctacctttcctcc 215  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||| ||| || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| |   | || ||| |||||||||| ||||||||    
T  5127918 aacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcc 5128017  T
Q  216 gata 219  Q
    ||||    
T  5128018 gata 5128021  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10917137 - 10916982
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| || | ||| || ||| ||||||    
T  10917137 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 10917038  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||   || | ||||||||||||  | || ||| |||||||||| || |||||||||    
T  10917037 agttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgata 10916982  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 145
Target Start/End: Original strand, 2154417 - 2154525
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || |||    
T  2154417 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtatccgtta 2154516  T
Q  137 atgccattg 145  Q
    |||| ||||    
T  2154517 atgcaattg 2154525  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5147615 - 5147454
Alignment:
Q  61 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaac 160  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||  || || ||| |||    
T  5147615 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 5147516  T
Q  161 aacagccaccggctcaacaacaacagc---agcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||||   |||  |||||||||||| |   | |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5147515 aacagatgccgattcaacaacaacaacaaaatcaacaagctagacctacttttcctccgata 5147454  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11425048 - 11424947
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || | ||| || ||| ||||||    
T  11425048 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 11424949  T
Q  164 ag 165  Q
    ||    
T  11424948 ag 11424947  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Original strand, 11441431 - 11441562
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  11441431 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 11441530  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    ||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  11441531 agttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 11441562  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 45387169 - 45387335
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45387169 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 45387268  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  45387269 aacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaaca 45387335  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 5159348 - 5159457
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  5159348 atcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 5159447  T
Q  119 aacctcaggt 128  Q
    ||||||||||    
T  5159448 aacctcaggt 5159457  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16736732 - 16736611
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  16736732 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 16736633  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  16736632 agatgccggttcaacaacaaca 16736611  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16751786 - 16751665
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  16751786 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 16751687  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  16751686 agatgccggttcaacaacaaca 16751665  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 17523403 - 17523524
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  17523403 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 17523502  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  17523503 agatgccggttcaacaacaaca 17523524  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17529812 - 17529691
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  17529812 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 17529713  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  17529712 agatgccggttcaacaacaaca 17529691  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Original strand, 26435125 - 26435209
Alignment:
Q  61 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattg 145  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||    
T  26435125 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattg 26435209  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26538190 - 26538018
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||| ||||||    
T  26538190 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtc 26538091  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagca 191  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| |||||    
T  26538090 aacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacagca 26538018  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26486061 - 26485885
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||| ||||||    
T  26486061 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtc 26485962  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   || | |||||||||||| || ||||||    
T  26485961 aacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaacaacaa 26485885  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 195
Target Start/End: Original strand, 3445162 - 3445296
Alignment:
Q  61 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaac 160  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||  ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| |||    
T  3445162 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 3445261  T
Q  161 aacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    |||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  3445262 aacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 3445296  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4145440 - 4145331
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  4145440 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 4145341  T
Q  119 aacctcaggt 128  Q
    ||||||||||    
T  4145340 aacctcaggt 4145331  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2109163 - 2109119
Alignment:
Q  175 caacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2109163 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgata 2109119  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 219
Target Start/End: Original strand, 26484679 - 26484723
Alignment:
Q  175 caacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26484679 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgata 26484723  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26320186 - 26320020
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||| |    
T  26320186 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggcc 26320087  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| |||||||| | |||| ||||||||||||    
T  26320086 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagacgccggttcaacaacaaca 26320020  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 219
Target Start/End: Original strand, 18540784 - 18540828
Alignment:
Q  175 caacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  18540784 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacttttcctctgata 18540828  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 31124737 - 31124913
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||| | |||| |    
T  31124737 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcaaccgggcc 31124836  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  31124837 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 31124913  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39211181 - 39211137
Alignment:
Q  175 caacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39211181 caacaacgaccgcagcaacaagctagacctacctttcctctgata 39211137  T

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Target: chr5 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13184979 - 13184773
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13184979 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 13184880  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13184879 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 13184780  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  13184779 tctgata 13184773  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13440825 - 13440619
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13440825 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 13440726  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13440725 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 13440626  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  13440625 tctgata 13440619  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 33877078 - 33877284
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33877078 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 33877177  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33877178 cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 33877277  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  33877278 tctgata 33877284  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 11325625 - 11325831
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11325625 atggacatcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat 11325724  T
Q  113 cgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcc 212  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11325725 tgggacaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcc 11325824  T
Q  213 tccgata 219  Q
    || ||||    
T  11325825 tctgata 11325831  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Original strand, 22888310 - 22888507
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22888310 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 22888409  T
Q  122 ctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22888410 ctcaggtaaccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgata 22888507  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Original strand, 25198884 - 25199066
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  25198884 cctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtactcgtta 25198983  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    | ||| | |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25198984 acgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttttctccgata 25199066  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Original strand, 23892058 - 23892243
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  23892058 cctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaacattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtca 23892157  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggct---caacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23892158 atgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgata 23892243  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Original strand, 24969876 - 24970055
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24969876 cctccgtcgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtta 24969975  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||| |||| ||| || ||| |||||||||  |||| ||||||||||   || |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  24969976 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaa---catcaacaagctagacctactttccctccgata 24970055  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 33777321 - 33777487
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  33777321 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 33777420  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || | ||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  33777421 aacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 33777487  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24688467 - 24688339
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  24688467 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 24688368  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    || | |||| ||| || ||| ||||||||    
T  24688367 atacaattgctcaacagatgaaacaacag 24688339  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Original strand, 30934488 - 30934670
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  30934488 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 30934587  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||   || | ||||||||||||  | || ||| |||||||||| || |||||||||    
T  30934588 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgata 30934670  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Original strand, 11549206 - 11549334
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  11549206 cctccgtcatacccatatgtgccgtattcacagcatcctttctttccaccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 11549305  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  11549306 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 11549334  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23718298 - 23718170
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  23718298 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 23718199  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  23718198 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 23718170  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23752760 - 23752632
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  23752760 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 23752661  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  23752660 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 23752632  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22999424 - 22999296
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||    
T  22999424 cctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtacccgtta 22999325  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  22999324 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 22999296  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9548826 - 9548725
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  9548826 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 9548727  T
Q  164 ag 165  Q
    ||    
T  9548726 ag 9548725  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 31431262 - 31431438
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31431262 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 31431361  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  31431362 aacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 31431438  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 43078083 - 43078255
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||||||||| ||   ||  || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43078083 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 43078182  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagca 191  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| |||||    
T  43078183 aacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacagca 43078255  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18501031 - 18500900
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  18501031 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 18500932  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    ||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  18500931 agttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 18500900  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8665758 - 8665637
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  8665758 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaac 8665659  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  8665658 agatgccggttcaacaacaaca 8665637  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15659043 - 15658922
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    |||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  15659043 tctcagcatcctttctttccgccgttttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 15658944  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  15658943 agttgccggttcaacaacaaca 15658922  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 33292362 - 33292471
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  33292362 atcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 33292461  T
Q  119 aacctcaggt 128  Q
    ||||||||||    
T  33292462 aacctcaggt 33292471  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Original strand, 41674589 - 41674709
Alignment:
Q  65 ctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaaca 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||||| ||||  || || ||| |||||||    
T  41674589 ctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtccacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaaca 41674688  T
Q  165 gccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    |   |||| ||||||||||||    
T  41674689 gttgccggttcaacaacaaca 41674709  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 30168302 - 30168469
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggt 117  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  30168302 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggt 30168401  T
Q  118 caacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    |||||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  30168402 caacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 30168469  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 3789360 - 3789536
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  3789360 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 3789459  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    | |||||||| ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  3789460 agcctcaggtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 3789536  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 24681271 - 24681443
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  24681271 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 24681370  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagca 191  Q
    | ||||| || ||| | || || ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  24681371 agcctcaagtgcccgtcaacgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacagcagca 24681443  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 24723798 - 24723970
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  24723798 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 24723897  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagca 191  Q
    | ||||| || ||| | || || ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  24723898 agcctcaagtgcccgtcaacgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacagcagca 24723970  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29889263 - 29889207
Alignment:
Q  163 cagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29889263 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgata 29889207  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18375741 - 18375574
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggt 117  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||     
T  18375741 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggc 18375642  T
Q  118 caacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    || ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  18375641 cagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 18375574  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 33516189 - 33516356
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggt 117  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||     
T  33516189 catcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggc 33516288  T
Q  118 caacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    || ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  33516289 cagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 33516356  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 28649105 - 28649226
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  28649105 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 28649204  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  28649205 agtttccggttcaacaacaaca 28649226  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37358983 - 37358807
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  37358983 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 37358884  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  37358883 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 37358807  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37671820 - 37671645
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  37671820 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 37671721  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaaca 194  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || |||||    
T  37671720 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaaca 37671645  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 12131989 - 12132155
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||| |    
T  12131989 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggcc 12132088  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| |||||||| | |||| ||||||||||||    
T  12132089 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagacgccggttcaacaacaaca 12132155  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 6874181 - 6874302
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||    
T  6874181 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 6874280  T
Q  164 agccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||   |||| ||||||||||||    
T  6874281 agttgccggttcaacaacaaca 6874302  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13325172 - 13324996
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  13325172 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 13325073  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  13325072 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 13324996  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31826747 - 31826571
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||| |    
T  31826747 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggcc 31826648  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  31826647 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 31826571  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32599752 - 32599688
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggt 128  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||    
T  32599752 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggt 32599688  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37771327 - 37771151
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| || |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||  |||| |    
T  37771327 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtatccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggcc 37771228  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaa 195  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || ||||||    
T  37771227 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaacaa 37771151  T

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Target: scaffold0124 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 166
Target Start/End: Original strand, 20240 - 20384
Alignment:
Q  22 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaac 121  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20240 aatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccatcattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 20339  T
Q  122 ctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagc 166  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  20340 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagc 20384  T

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Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Original strand, 30296 - 30424
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  30296 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 30395  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  30396 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 30424  T

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Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 219
Target Start/End: Original strand, 20375 - 20416
Alignment:
Q  178 caacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20375 caacaacagcagcaacaagctagacctacctttcccccgata 20416  T

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Target: scaffold0109 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 21391 - 21589
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggt 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  ||  |||||    
T  21391 catcaatgcttctcagctacctccgccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccaccgccgggt 21490  T
Q  118 caacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccga 217  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21491 caacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagctgctggct---taacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccga 21587  T

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Target: scaffold0089 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Original strand, 29606 - 29791
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  29606 cctccatcgtacccgtatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 29705  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggct---caacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||   |||| |   ||||||||||| || |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  29706 atgcaatagctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgata 29791  T

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Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40482 - 40334
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  40482 cctccgccgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttctgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtaa 40383  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    |||| |||| ||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  40382 atgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 40334  T

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Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 47371 - 47270
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaac 163  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || | ||| || ||| ||||||    
T  47371 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 47272  T
Q  164 ag 165  Q
    ||    
T  47271 ag 47270  T

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Target: scaffold0029 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 561 - 395
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  561 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtc 462  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||| ||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  461 aacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 395  T

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Target: scaffold0143 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Original strand, 27135 - 27263
Alignment:
Q  37 cctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctcaggtacccatta 136  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  27135 cctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctaccaccgggtcaacctcaagtacccgtta 27234  T
Q  137 atgccattgttcagcaaatgtaacaacag 165  Q
    |||| || | ||| || ||| ||||||||    
T  27235 atgcaatcgctcaacagatgaaacaacag 27263  T

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Target: scaffold0558 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 312 - 256
Alignment:
Q  163 cagccaccggctcaacaacaacagcagcaacaaactagacctacctttcctccgata 219  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  312 cagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgata 256  T

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Target: scaffold0237 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15362 - 15195
Alignment:
Q  18 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggt 117  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||     
T  15362 catcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggc 15263  T
Q  118 caacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaaca 185  Q
    || ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  15262 cagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaaca 15195  T

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Target: scaffold0415 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Original strand, 5859 - 5921
Alignment:
Q  64 tctcagcatcctttctttccaccattct-atcatcagtatcctctgccatcgggtcaacctca 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5859 tctcagcatcctttcttcccaccgtttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctca 5921  T

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Target: scaffold0336 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 8057 - 8166
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| | || |    
T  8057 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggcc 8156  T
Q  119 aacctcaggt 128  Q
    ||||||||||    
T  8157 aacctcaggt 8166  T

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Target: scaffold0038 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 7762 - 7937
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
    |||||||| |||||  | |||||||| ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  7762 atcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggcc 7861  T
Q  119 aacctcaggtacccattaatgccattgttcagcaaatgtaacaacagccaccggctcaacaacaacagcagcaaca 194  Q
    | ||||| || ||| | ||||| ||||  || || ||| ||||||||   |||| |||||||||||| || |||||    
T  7862 agcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaaca 7937  T

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Target: scaffold0350 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7670 - 7504
Alignment:
Q  19 atcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgctatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctgccatcgggtc 118  Q
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