View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8902A_low_184 (Length: 263)

Name: NF8902A_low_184
Description: NF8902A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8902A_low_184
NF8902A_low_184
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (1-262)||(16626470-16626731)
chr3 (3-262)||(18530421-18530680)
chr3 (5-262)||(5652420-5652677)
chr3 (6-262)||(4625977-4626233)
chr3 (6-262)||(17993753-17994009)
chr3 (1-262)||(31034081-31034342)
chr3 (1-262)||(32292785-32293046)
chr3 (6-254)||(5713268-5713516)
chr3 (6-254)||(5724178-5724426)
chr3 (6-254)||(5757051-5757299)
chr3 (6-254)||(5767942-5768190)
chr3 (1-254)||(18051303-18051556)
chr3 (1-254)||(18330710-18330963)
chr3 (1-254)||(22387542-22387795)
chr3 (1-254)||(4796617-4796870)
chr3 (1-254)||(8296013-8296266)
chr3 (1-254)||(15741058-15741311)
chr3 (1-254)||(15892670-15892923)
chr3 (1-254)||(8301231-8301484)
chr3 (1-254)||(29148719-29148972)
chr3 (1-254)||(6192357-6192610)
chr3 (1-260)||(10396168-10396427)
chr3 (4-254)||(4721672-4721922)
chr3 (1-260)||(11110313-11110572)
chr3 (1-254)||(4416960-4417213)
chr3 (1-254)||(28115918-28116171)
chr3 (1-254)||(35880807-35881060)
chr3 (1-248)||(7073259-7073506)
chr3 (1-254)||(5467026-5467279)
chr3 (1-260)||(48465962-48466221)
chr3 (1-260)||(4346651-4346910)
chr3 (1-260)||(29664934-29665193)
chr3 (1-254)||(18277016-18277269)
chr3 (1-254)||(18292317-18292570)
chr3 (1-254)||(18307618-18307871)
chr3 (1-254)||(28021316-28021569)
chr3 (1-254)||(36997041-36997294)
chr3 (1-254)||(51782064-51782317)
chr3 (1-245)||(8211788-8212032)
chr3 (1-260)||(6542426-6542685)
chr3 (1-248)||(21674740-21674987)
chr3 (1-254)||(31964437-31964690)
chr3 (1-254)||(50134035-50134288)
chr3 (1-260)||(20576811-20577070)
chr3 (1-254)||(51797153-51797407)
chr3 (1-254)||(5596321-5596574)
chr3 (1-254)||(5609286-5609539)
chr3 (1-254)||(17984920-17985173)
chr3 (1-254)||(28339343-28339596)
chr3 (27-260)||(32439189-32439422)
chr3 (1-245)||(22870820-22871064)
chr3 (1-245)||(22885879-22886123)
chr3 (1-254)||(18242780-18243033)
chr3 (27-260)||(20066078-20066311)
chr3 (1-254)||(5013753-5014006)
chr3 (1-254)||(47023494-47023747)
chr3 (1-254)||(18225232-18225485)
chr3 (1-254)||(24328200-24328453)
chr3 (1-254)||(7996603-7996856)
chr3 (1-254)||(10643111-10643364)
chr3 (130-260)||(4893245-4893375)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-262)||(15284851-15285112)
chr4 (1-262)||(15227957-15228218)
chr4 (6-262)||(24460533-24460789)
chr4 (4-262)||(1900344-1900602)
chr4 (1-262)||(14235448-14235709)
chr4 (31-262)||(15391291-15391522)
chr4 (1-254)||(17014095-17014348)
chr4 (1-254)||(24592237-24592490)
chr4 (1-254)||(14665113-14665366)
chr4 (1-260)||(36344438-36344697)
chr4 (1-254)||(5005968-5006221)
chr4 (1-254)||(6569948-6570201)
chr4 (1-254)||(14763227-14763480)
chr4 (1-248)||(18800536-18800783)
chr4 (1-248)||(40105561-40105808)
chr4 (1-254)||(14098636-14098889)
chr4 (1-254)||(31126441-31126694)
chr4 (27-260)||(34188909-34189142)
chr4 (1-260)||(33673721-33673980)
chr4 (27-260)||(24112751-24112984)
chr4 (1-254)||(30753849-30754102)
chr4 (1-254)||(27163240-27163493)
chr4 (1-254)||(54833482-54833735)
chr4 (1-260)||(39850727-39850986)
chr4 (1-242)||(21969808-21970049)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-262)||(19456333-19456594)
chr2 (4-262)||(21703079-21703337)
chr2 (5-262)||(27118756-27119013)
chr2 (6-262)||(3784722-3784978)
chr2 (1-262)||(34303215-34303476)
chr2 (6-262)||(16163667-16163923)
chr2 (6-262)||(34157079-34157334)
chr2 (1-262)||(27393037-27393298)
chr2 (6-262)||(31891245-31891501)
chr2 (1-260)||(40233581-40233840)
chr2 (1-254)||(27434356-27434609)
chr2 (1-254)||(23128478-23128731)
chr2 (1-254)||(28882290-28882543)
chr2 (9-260)||(9349902-9350153)
chr2 (1-254)||(12655618-12655871)
chr2 (1-254)||(22925940-22926193)
chr2 (1-254)||(20837994-20838247)
chr2 (1-260)||(12586880-12587139)
chr2 (1-260)||(37375231-37375490)
chr2 (1-254)||(16829250-16829503)
chr2 (1-254)||(16891978-16892231)
chr2 (1-254)||(21677094-21677347)
chr2 (1-260)||(13936456-13936715)
chr2 (1-254)||(11635098-11635351)
chr2 (1-254)||(11641287-11641540)
chr2 (1-260)||(260665-260924)
chr2 (1-260)||(27777292-27777551)
chr2 (1-260)||(27817050-27817309)
chr2 (31-254)||(34286430-34286653)
chr2 (31-254)||(34291490-34291713)
chr2 (4-254)||(34861756-34862006)
chr2 (1-254)||(31876357-31876610)
chr2 (1-254)||(37685821-37686074)
chr2 (1-254)||(37701086-37701339)
chr2 (1-260)||(12716514-12716773)
chr2 (1-260)||(27803777-27804036)
chr2 (1-260)||(39051734-39051993)
chr2 (1-254)||(37925569-37925822)
chr2 (1-254)||(39890150-39890403)
chr2 (1-254)||(32049874-32050127)
chr2 (115-254)||(34279525-34279664)
chr2 (1-254)||(19416411-19416664)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-262)||(2581-2842)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (1-262)||(22456800-22457061)
chr6 (6-262)||(33374127-33374383)
chr6 (1-262)||(13521939-13522200)
chr6 (6-262)||(8892182-8892437)
chr6 (6-262)||(8903417-8903672)
chr6 (6-262)||(28162726-28162982)
chr6 (1-262)||(14143151-14143412)
chr6 (1-262)||(26788013-26788274)
chr6 (1-262)||(27196386-27196647)
chr6 (1-262)||(27252593-27252854)
chr6 (1-262)||(27290236-27290497)
chr6 (103-262)||(22477241-22477400)
chr6 (1-262)||(20160770-20161031)
chr6 (1-262)||(22171800-22172061)
chr6 (1-254)||(22934746-22934999)
chr6 (1-254)||(23857191-23857444)
chr6 (1-254)||(26918457-26918710)
chr6 (1-254)||(27272446-27272699)
chr6 (1-254)||(16749931-16750184)
chr6 (1-254)||(26989078-26989331)
chr6 (1-254)||(13298817-13299070)
chr6 (1-254)||(24304484-24304737)
chr6 (1-254)||(24863794-24864047)
chr6 (10-254)||(27000150-27000394)
chr6 (1-254)||(15424183-15424436)
chr6 (1-254)||(29549552-29549805)
chr6 (1-260)||(4773077-4773336)
chr6 (1-260)||(16674210-16674469)
chr6 (1-260)||(27007798-27008057)
chr6 (1-254)||(4757841-4758094)
chr6 (1-254)||(27359858-27360111)
chr6 (1-254)||(27450201-27450454)
chr6 (1-254)||(30557882-30558135)
chr6 (1-257)||(4525360-4525616)
chr6 (1-260)||(29573084-29573343)
chr6 (1-254)||(4545641-4545894)
chr6 (1-248)||(3696164-3696411)
chr6 (1-260)||(34463212-34463471)
chr6 (1-254)||(29501492-29501745)
chr6 (1-248)||(4724000-4724247)
chr6 (1-248)||(26116276-26116523)
chr6 (1-248)||(28207537-28207784)
chr6 (1-254)||(16943893-16944146)
chr6 (1-254)||(26777481-26777734)
chr6 (1-260)||(17025348-17025607)
chr6 (1-254)||(27044464-27044718)
chr6 (1-122)||(17092306-17092427)
chr6 (1-254)||(27485206-27485459)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-262)||(20340258-20340519)
chr1 (1-262)||(20461152-20461413)
chr1 (1-262)||(16207954-16208215)
chr1 (1-262)||(28151933-28152194)
chr1 (1-254)||(10962749-10963002)
chr1 (1-254)||(41793231-41793484)
chr1 (1-245)||(51638306-51638550)
chr1 (1-254)||(28585060-28585313)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (4-262)||(16041396-16041654)
chr7 (4-262)||(16449810-16450068)
chr7 (6-262)||(31088278-31088534)
chr7 (6-262)||(45733533-45733789)
chr7 (1-262)||(26484767-26485028)
chr7 (4-262)||(2108817-2109075)
chr7 (1-262)||(2775432-2775693)
chr7 (1-262)||(39210832-39211093)
chr7 (1-200)||(26682809-26683008)
chr7 (1-200)||(4200682-4200881)
chr7 (1-254)||(5128073-5128326)
chr7 (1-254)||(2154654-2154907)
chr7 (1-262)||(11424585-11424846)
chr7 (1-254)||(16518225-16518478)
chr7 (1-254)||(10916677-10916930)
chr7 (1-254)||(16503189-16503442)
chr7 (1-254)||(3445387-3445640)
chr7 (1-254)||(26274903-26275156)
chr7 (1-254)||(11441653-11441906)
chr7 (1-254)||(26435338-26435591)
chr7 (1-254)||(4144932-4145185)
chr7 (1-254)||(5147149-5147402)
chr7 (1-254)||(24592350-24592603)
chr7 (1-254)||(31564199-31564452)
chr7 (27-262)||(18540872-18541107)
chr7 (1-248)||(26537679-26537926)
chr7 (1-254)||(26319678-26319931)
chr7 (1-254)||(9618732-9618985)
chr7 (1-254)||(26669723-26669976)
chr7 (1-254)||(45387424-45387677)
chr7 (1-254)||(16736269-16736522)
chr7 (1-254)||(16751323-16751576)
chr7 (1-254)||(17523613-17523866)
chr7 (1-254)||(17529349-17529602)
chr7 (1-254)||(31125001-31125254)
chr7 (27-260)||(5159594-5159827)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (4-262)||(22888551-22888809)
chr5 (1-262)||(25199110-25199371)
chr5 (6-262)||(13184473-13184729)
chr5 (6-262)||(13440319-13440575)
chr5 (1-262)||(29888902-29889163)
chr5 (1-262)||(33877328-33877589)
chr5 (1-262)||(23892287-23892548)
chr5 (6-262)||(11325875-11326131)
chr5 (1-254)||(24687977-24688230)
chr5 (1-254)||(33777576-33777829)
chr5 (1-254)||(23752270-23752523)
chr5 (1-254)||(9548363-9548616)
chr5 (1-254)||(22998934-22999187)
chr5 (1-254)||(30934722-30934975)
chr5 (1-254)||(11549443-11549696)
chr5 (1-254)||(23717808-23718061)
chr5 (1-254)||(24970107-24970360)
chr5 (1-254)||(15658580-15658833)
chr5 (1-260)||(37671303-37671562)
chr5 (1-248)||(28649330-28649577)
chr5 (1-254)||(31826227-31826480)
chr5 (4-248)||(18500553-18500797)
chr5 (1-248)||(31431535-31431782)
chr5 (1-254)||(8665295-8665548)
chr5 (1-254)||(9317540-9317793)
chr5 (1-254)||(12132244-12132497)
chr5 (1-254)||(15758677-15758930)
chr5 (1-254)||(30152107-30152360)
chr5 (1-254)||(33516445-33516698)
chr5 (1-254)||(37358463-37358716)
chr5 (1-260)||(32599292-32599551)
chr5 (1-254)||(2511140-2511393)
chr5 (1-254)||(6874394-6874647)
chr5 (1-254)||(18375232-18375485)
chr5 (1-254)||(26480481-26480734)
chr5 (1-260)||(13324649-13324908)
chr5 (1-248)||(43078347-43078594)
chr5 (1-254)||(29966886-29967139)
chr5 (1-254)||(30029504-30029757)
chr5 (1-260)||(3789624-3789883)
chr5 (1-260)||(24681523-24681782)
chr5 (1-260)||(24724050-24724309)
chr5 (1-248)||(30168564-30168811)
chr5 (1-248)||(37770807-37771054)
chr5 (1-260)||(40473369-40473628)
chr5 (27-254)||(41674798-41675025)
chr5 (27-260)||(33292608-33292841)
chr5 (1-248)||(37755075-37755322)
chr5 (1-254)||(5637999-5638252)
chr5 (1-254)||(34616607-34616860)
chr5 (1-254)||(28959606-28959859)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (4-262)||(1844-2101)
scaffold0415 (4-248)||(6098-6344)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (4-262)||(20460-20717)
scaffold0124 (1-254)||(30532-30785)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (5-258)||(19658926-19659178)
chr8 (5-258)||(33244741-33244994)
chr8 (6-262)||(44563173-44563427)
chr8 (31-262)||(22080790-22081021)
chr8 (1-262)||(9354694-9354956)
chr8 (2-254)||(16283529-16283781)
chr8 (1-254)||(18710666-18710919)
chr8 (1-254)||(19688178-19688431)
chr8 (1-254)||(27608787-27609040)
chr8 (1-254)||(16277634-16277887)
chr8 (1-254)||(2137141-2137394)
chr8 (1-254)||(14557704-14557957)
chr8 (1-251)||(29829405-29829655)
chr8 (1-254)||(12092606-12092859)
chr8 (1-254)||(31354604-31354857)
chr8 (1-254)||(31489632-31489885)
chr8 (1-260)||(3329389-3329648)
chr8 (1-254)||(19208242-19208495)
chr8 (1-254)||(19674521-19674774)
chr8 (1-172)||(189256-189427)
chr8 (1-254)||(28361837-28362090)
chr8 (1-254)||(19286542-19286795)
chr8 (1-254)||(33258803-33259056)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (51-262)||(1-212)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (31-260)||(21635-21864)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-188)||(541-728)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-254)||(46908-47161)
scaffold0089 (1-254)||(39992-40245)
scaffold0089 (1-254)||(29843-30096)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-254)||(27372-27625)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-254)||(52-305)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-248)||(9652-9899)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-254)||(7162-7415)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-254)||(8989-9242)
scaffold0159 (1-254)||(20095-20348)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-254)||(14853-15106)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-248)||(8035-8282)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-254)||(26124-26378)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (40-95)||(46764-46819)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 16626470 - 16626731
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  16626470 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 16626569  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16626570 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 16626669  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626670 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 16626731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18530680 - 18530421
Alignment:
Q  3 aagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaat 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||    
T  18530680 aagtctgggagctccctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaaggtcaat 18530581  T
Q  103 tttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcag 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18530580 tttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcag 18530481  T
Q  203 aatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530480 aacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 18530421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5652677 - 5652420
Alignment:
Q  5 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  5652677 gtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattt 5652578  T
Q  105 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaa 204  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  5652577 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 5652478  T
Q  205 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
     ||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5652477 cggaacttgggaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 5652420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4626233 - 4625977
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  4626233 tctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 4626134  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  4626133 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 4626034  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4626033 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 4625977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 17993753 - 17994009
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  17993753 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 17993852  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||     
T  17993853 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaac 17993952  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993953 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 17994009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 31034081 - 31034342
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  31034081 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 31034180  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31034181 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 31034280  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31034281 agaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgcc 31034342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32293046 - 32292785
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  32293046 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 32292947  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  32292946 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 32292847  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32292846 agaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgcc 32292785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5713516 - 5713268
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5713516 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5713417  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| |||||      
T  5713416 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5713317  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  5713316 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 5713268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5724426 - 5724178
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5724426 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5724327  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| |||||      
T  5724326 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5724227  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  5724226 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 5724178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 5757051 - 5757299
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5757051 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5757150  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| |||||      
T  5757151 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5757250  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  5757251 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 5757299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Original strand, 5767942 - 5768190
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  ||     
T  5767942 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttc 5768041  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| |||||      
T  5768042 ccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacc 5768141  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  5768142 tgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 5768190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18051556 - 18051303
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  18051556 tcaagtctaggagctttctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 18051457  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| ||| ||||||||| ||||| ||    
T  18051456 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttgagatc 18051357  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18051356 ggacctgaacctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 18051303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18330963 - 18330710
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  18330963 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 18330864  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  18330863 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 18330764  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18330763 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 18330710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 22387542 - 22387795
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  22387542 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 22387641  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  22387642 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 22387741  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22387742 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 22387795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 4796617 - 4796870
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  4796617 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 4796716  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  4796717 gctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 4796816  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4796817 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 4796870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8296266 - 8296013
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  8296266 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 8296167  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  8296166 actttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 8296067  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  8296066 ggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggttgt 8296013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 15741058 - 15741311
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  15741058 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 15741157  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  15741158 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 15741257  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15741258 ggacctgaaccttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 15741311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 15892670 - 15892923
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  15892670 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 15892769  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  15892770 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatc 15892869  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15892870 ggacctgaacctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 15892923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 8301231 - 8301484
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  8301231 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 8301330  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  8301331 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatc 8301430  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8301431 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 8301484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 29148719 - 29148972
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  29148719 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 29148818  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  29148819 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 29148918  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  29148919 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 29148972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6192610 - 6192357
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  6192610 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 6192511  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  6192510 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtc 6192411  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6192410 ggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 6192357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10396427 - 10396168
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||| |    
T  10396427 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaggtca 10396328  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  10396327 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 10396228  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10396227 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtg 10396168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4721922 - 4721672
Alignment:
Q  4 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 103  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| || |  |    
T  4721922 agtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaaagtcagct 4721823  T
Q  104 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcaga 203  Q
    ||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| |||||||| ||    
T  4721822 ttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcgga 4721723  T
Q  204 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
       |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4721722 cctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 4721672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 11110313 - 11110572
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  11110313 tcaagtcttggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 11110412  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  11110413 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 11110512  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  11110513 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtg 11110572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4417213 - 4416960
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  4417213 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 4417114  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||  |||| |||||||| ||||| ||    
T  4417113 gctttccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatc 4417014  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  4417013 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgt 4416960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 28115918 - 28116171
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  28115918 tcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaatgtca 28116017  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  28116018 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 28116117  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||    
T  28116118 agacctgaaccttggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtctagttgt 28116171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 35881060 - 35880807
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  35881060 tcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 35880961  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  35880960 gctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 35880861  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  35880860 ggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggttgt 35880807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7073506 - 7073259
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||    
T  7073506 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtta 7073407  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  7073406 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 7073307  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||    
T  7073306 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtct 7073259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5467279 - 5467026
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  5467279 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 5467180  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
     ||| ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  5467179 gtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 5467080  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  5467079 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 5467026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 48466221 - 48465962
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  48466221 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 48466122  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  48466121 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 48466022  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  48466021 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtg 48465962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 4346651 - 4346910
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  4346651 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 4346750  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  4346751 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 4346850  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  4346851 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtg 4346910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 29664934 - 29665193
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  29664934 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 29665033  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| || || ||    
T  29665034 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatc 29665133  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  29665134 agagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 29665193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 18277016 - 18277269
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  18277016 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 18277115  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  18277116 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 18277215  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  18277216 agacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 18277269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 18292317 - 18292570
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  18292317 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 18292416  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  18292417 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 18292516  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  18292517 agacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 18292570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 18307618 - 18307871
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  18307618 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 18307717  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  18307718 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 18307817  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  18307818 agacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 18307871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28021569 - 28021316
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  28021569 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaaagtca 28021470  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||| ||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  28021469 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 28021370  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  28021369 agacctgaaccttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 28021316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 36997041 - 36997294
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  ||||  || |||||||| || |    
T  36997041 tcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaaagtca 36997140  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  36997141 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 36997240  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  36997241 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 36997294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 51782317 - 51782064
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  51782317 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 51782218  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  51782217 gctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 51782118  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  51782117 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 51782064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8212032 - 8211788
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  8212032 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 8211933  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  8211932 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 8211833  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctg 245  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  8211832 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctg 8211788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 6542426 - 6542685
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |    
T  6542426 tcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtca 6542525  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  6542526 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 6542625  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  6542626 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtg 6542685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21674987 - 21674740
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||    || |||||||| || |    
T  21674987 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaaagtca 21674888  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  21674887 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 21674788  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21674787 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 21674740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 31964437 - 31964690
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  31964437 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 31964536  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  31964537 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 31964636  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  31964637 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 31964690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 50134035 - 50134288
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  50134035 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 50134134  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  50134135 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 50134234  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  50134235 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 50134288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 20576811 - 20577070
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  20576811 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 20576910  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| || || ||    
T  20576911 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatc 20577010  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  20577011 agagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 20577070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 51797407 - 51797153
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  51797407 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 51797308  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  51797307 gctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 51797208  T
Q  201 agaatggaacc-tgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  51797207 agacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 51797153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 5596321 - 5596574
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  5596321 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 5596420  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  5596421 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 5596520  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  5596521 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 5596574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 5609286 - 5609539
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  5609286 tcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 5609385  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  5609386 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 5609485  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  5609486 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 5609539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 17984920 - 17985173
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  17984920 tcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 17985019  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |  |||||| |||| || ||||| || || ||    
T  17985020 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatc 17985119  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  17985120 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 17985173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28339596 - 28339343
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  28339596 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 28339497  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  28339496 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 28339397  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  28339396 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 28339343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32439422 - 32439189
Alignment:
Q  27 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 126  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  32439422 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 32439323  T
Q  127 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 226  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  32439322 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 32439223  T
Q  227 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
      ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  32439222 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 32439189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 22870820 - 22871064
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  22870820 tcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 22870919  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  22870920 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 22871019  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctg 245  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  22871020 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctg 22871064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 22885879 - 22886123
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  22885879 tcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 22885978  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  22885979 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 22886078  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctg 245  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  22886079 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctg 22886123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18243033 - 18242780
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  18243033 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 18242934  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  18242933 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 18242834  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  18242833 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 18242780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20066311 - 20066078
Alignment:
Q  27 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 126  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  20066311 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 20066212  T
Q  127 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 226  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || ||      
T  20066211 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggc 20066112  T
Q  227 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
      ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  20066111 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 20066078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5014006 - 5013753
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  5014006 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 5013907  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||| ||    
T  5013906 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatc 5013807  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  5013806 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 5013753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 47023747 - 47023494
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  47023747 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 47023648  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||| ||    
T  47023647 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatc 47023548  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  47023547 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 47023494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18225485 - 18225232
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  18225485 tcaagcctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 18225386  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  18225385 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 18225286  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  18225285 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 18225232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24328453 - 24328200
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  24328453 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 24328354  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||| ||    
T  24328353 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatc 24328254  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24328253 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 24328200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7996856 - 7996603
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  7996856 tcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 7996757  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||| ||    
T  7996756 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatc 7996657  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  7996656 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 7996603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10643364 - 10643111
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  10643364 tcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 10643265  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||| ||    
T  10643264 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatc 10643165  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  10643164 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 10643111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4893375 - 4893245
Alignment:
Q  130 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 229  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |  |    
T  4893375 atgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccg 4893276  T
Q  230 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  4893275 gtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtg 4893245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 15284851 - 15285112
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  15284851 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 15284950  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15284951 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 15285050  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285051 agaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 15285112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15228218 - 15227957
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  15228218 tcaagtctgggagctatctcatataccccaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaaggtta 15228119  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15228118 actttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 15228019  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15228018 agaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgcc 15227957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 24460533 - 24460789
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  24460533 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 24460632  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  24460633 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 24460732  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24460733 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 24460789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1900602 - 1900344
Alignment:
Q  4 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||| ||||| |    
T  1900602 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaagttaact 1900503  T
Q  104 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcaga 203  Q
    ||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1900502 ttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 1900403  T
Q  204 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    | | |||||| || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1900402 acgaaacctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgcc 1900344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 14235448 - 14235709
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  14235448 tcaagactgggagcttcttcataggtctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagtta 14235547  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14235548 actttccctggtctatgagcttctttacaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 14235647  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
      ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14235648 gaaatggaacctgggaggcaaagggttaggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgcc 14235709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 262
Target Start/End: Original strand, 15391291 - 15391522
Alignment:
Q  31 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||| |||||||    
T  15391291 atcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttacaa 15391390  T
Q  131 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15391391 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttagg 15391490  T
Q  231 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15391491 tggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgcc 15391522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17014348 - 17014095
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  17014348 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 17014249  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  17014248 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtc 17014149  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17014148 ggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 17014095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 24592237 - 24592490
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  24592237 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 24592336  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  24592337 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 24592436  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24592437 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 24592490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14665366 - 14665113
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  14665366 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaaagtca 14665267  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  14665266 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 14665167  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14665166 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 14665113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 36344438 - 36344697
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  36344438 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 36344537  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  36344538 gctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 36344637  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  36344638 agacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtg 36344697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5006221 - 5005968
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  5006221 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 5006122  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  5006121 acttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 5006022  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  5006021 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgt 5005968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6570201 - 6569948
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  6570201 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 6570102  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  6570101 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 6570002  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  6570001 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 6569948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 14763227 - 14763480
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  14763227 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 14763326  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  14763327 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 14763426  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  14763427 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 14763480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 18800536 - 18800783
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  18800536 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 18800635  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  18800636 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatc 18800735  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18800736 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 18800783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 40105561 - 40105808
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  40105561 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 40105660  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  40105661 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 40105760  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  40105761 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 40105808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14098889 - 14098636
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  14098889 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 14098790  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  14098789 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 14098690  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    ||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  14098689 agtcctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 14098636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 31126441 - 31126694
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  31126441 tcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 31126540  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  31126541 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 31126640  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  31126641 agacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 31126694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 260
Target Start/End: Original strand, 34188909 - 34189142
Alignment:
Q  27 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 126  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  34188909 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 34189008  T
Q  127 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 226  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  34189009 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 34189108  T
Q  227 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
      ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  34189109 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 34189142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 33673721 - 33673980
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  33673721 tcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 33673820  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  33673821 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 33673920  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  33673921 agacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 33673980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24112984 - 24112751
Alignment:
Q  27 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 126  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  24112984 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 24112885  T
Q  127 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 226  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  24112884 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 24112785  T
Q  227 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
      ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  24112784 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 24112751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30754102 - 30753849
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  30754102 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 30754003  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  30754002 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 30753903  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  30753902 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 30753849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 27163240 - 27163493
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  27163240 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 27163339  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||| ||    
T  27163340 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatc 27163439  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27163440 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 27163493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 54833735 - 54833482
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  54833735 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 54833636  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  54833635 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 54833536  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||    
T  54833535 agacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgt 54833482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39850986 - 39850727
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  39850986 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 39850887  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| || || ||    
T  39850886 gctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatc 39850787  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  39850786 agagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 39850727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21970049 - 21969808
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| ||| |||||||| | |  |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  21970049 tcaagtctaggaacttcctcacacatttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 21969950  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| || || ||    
T  21969949 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatc 21969850  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgcc 242  Q
    |||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||    
T  21969849 agagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgcc 21969808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 19456333 - 19456594
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  19456333 tcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtca 19456432  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19456433 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 19456532  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456533 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 19456594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 262
Target Start/End: Original strand, 21703079 - 21703337
Alignment:
Q  4 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |    
T  21703079 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaact 21703178  T
Q  104 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcaga 203  Q
    |||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21703179 ttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 21703278  T
Q  204 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21703279 acggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgcc 21703337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27119013 - 27118756
Alignment:
Q  5 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  27119013 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 27118914  T
Q  105 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaa 204  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  27118913 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 27118814  T
Q  205 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
     ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118813 cggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 27118756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3784978 - 3784722
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  3784978 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 3784879  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  3784878 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 3784779  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784778 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 3784722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 34303215 - 34303476
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  34303215 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtca 34303314  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34303315 attttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 34303414  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
     ||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303415 cgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 34303476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16163923 - 16163667
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  16163923 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 16163824  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  16163823 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 16163724  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163723 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 16163667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34157334 - 34157079
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  34157334 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 34157235  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  34157234 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 34157136  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157135 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 34157079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27393298 - 27393037
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  27393298 tcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagtta 27393199  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27393198 actttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtc 27393099  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27393098 agaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgcc 27393037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 31891245 - 31891501
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||    
T  31891245 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaatttt 31891344  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| || ||      
T  31891345 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacc 31891444  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891445 tgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 31891501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40233840 - 40233581
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  40233840 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 40233741  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  40233740 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 40233641  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  40233640 agaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtg 40233581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 27434356 - 27434609
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  27434356 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 27434455  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27434456 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtc 27434555  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27434556 ggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 27434609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 23128478 - 23128731
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  23128478 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 23128577  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  23128578 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 23128677  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23128678 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 23128731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28882543 - 28882290
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  28882543 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 28882444  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  28882443 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 28882344  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28882343 ggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 28882290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Original strand, 9349902 - 9350153
Alignment:
Q  9 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttcct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  || |||    
T  9349902 gggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccct 9350001  T
Q  109 tggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatgga 208  Q
    || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| || || |||||  |||    
T  9350002 tgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcgga 9350101  T
Q  209 acctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  9350102 accttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtg 9350153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12655871 - 12655618
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  12655871 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 12655772  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  12655771 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 12655672  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12655671 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 12655618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 22925940 - 22926193
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  22925940 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 22926039  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  22926040 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 22926139  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22926140 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 22926193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20838247 - 20837994
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  20838247 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 20838148  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| || |||||    
T  20838147 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttaaggtc 20838048  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  20838047 ggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 20837994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12587139 - 12586880
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  12587139 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 12587040  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| || || ||    
T  12587039 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatc 12586940  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  12586939 agagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 12586880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37375490 - 37375231
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  37375490 tcaagtctaggagcttccccacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 37375391  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  37375390 gctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 37375291  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  37375290 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtg 37375231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 16829250 - 16829503
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  16829250 tcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 16829349  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| || || ||    
T  16829350 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatc 16829449  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  16829450 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 16829503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16892231 - 16891978
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  16892231 tcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 16892132  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| || || ||    
T  16892131 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatc 16892032  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  16892031 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 16891978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 21677094 - 21677347
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  21677094 tcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 21677193  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  21677194 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 21677293  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21677294 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgt 21677347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 13936456 - 13936715
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  13936456 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 13936555  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || |||||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| || || ||    
T  13936556 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatc 13936655  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  13936656 agagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 13936715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 11635098 - 11635351
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  11635098 tcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 11635197  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  |||||  |||| |||||||| ||||| ||    
T  11635198 gcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatc 11635297  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  11635298 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 11635351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 11641287 - 11641540
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  11641287 tcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 11641386  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |  |||||  |||| |||||||| ||||| ||    
T  11641387 gcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatc 11641486  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  11641487 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 11641540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 260665 - 260924
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| ||| |||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  260665 tcaagtctaggaacttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 260764  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  260765 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 260864  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  260865 agacctgaaccttggaggcaacagatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtg 260924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27777551 - 27777292
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  27777551 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 27777452  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| || || ||    
T  27777451 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatc 27777352  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  27777351 agagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 27777292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27817309 - 27817050
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  27817309 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 27817210  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| || || ||    
T  27817209 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatc 27817110  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  27817109 agagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 27817050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34286653 - 34286430
Alignment:
Q  31 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 130  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || |    
T  34286653 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34286554  T
Q  131 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 230  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  34286553 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 34286454  T
Q  231 tggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||    
T  34286453 tgggggcttaccctgtctagttgt 34286430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34291713 - 34291490
Alignment:
Q  31 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 130  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| || || |    
T  34291713 atcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 34291614  T
Q  131 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 230  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  34291613 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 34291514  T
Q  231 tggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||    
T  34291513 tgggggcttaccctgtctagttgt 34291490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34862006 - 34861756
Alignment:
Q  4 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 103  Q
    ||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |    
T  34862006 agtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 34861907  T
Q  104 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcaga 203  Q
    | ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||| |||||    
T  34861906 tcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 34861807  T
Q  204 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
       |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  34861806 cctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 34861756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31876610 - 31876357
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  31876610 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 31876511  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  31876510 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 31876411  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  31876410 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 31876357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 37685821 - 37686074
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  37685821 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 37685920  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||| ||    
T  37685921 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatc 37686020  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  37686021 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 37686074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 37701086 - 37701339
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  37701086 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 37701185  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||| ||    
T  37701186 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatc 37701285  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  37701286 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 37701339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 12716514 - 12716773
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  12716514 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 12716613  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| || || ||    
T  12716614 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatc 12716713  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  12716714 agagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 12716773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27804036 - 27803777
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  27804036 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 27803937  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  |||||| |||| |||||||| || || ||    
T  27803936 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatc 27803837  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  27803836 agagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 27803777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 39051734 - 39051993
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  39051734 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 39051833  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  |||||| |||| |||||||| || || ||    
T  39051834 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatc 39051933  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  39051934 agagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 39051993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37925822 - 37925569
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  37925822 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 37925723  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| ||||||| || || ||||| ||    
T  37925722 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttgagatc 37925623  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  37925622 agacctgaaccttggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgt 37925569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39890403 - 39890150
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  39890403 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 39890304  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || || || ||||||| ||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  39890303 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 39890204  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    ||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  39890203 agccctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 39890150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32050127 - 32049874
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  32050127 tcaagtctaggaacttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 32050028  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||| ||    
T  32050027 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatc 32049928  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||| |  ||||| || || |||||||| |||||    
T  32049927 agacctgaaccttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctagttgt 32049874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34279664 - 34279525
Alignment:
Q  115 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 214  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |    
T  34279664 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttg 34279565  T
Q  215 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  34279564 gaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 34279525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 19416411 - 19416664
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  19416411 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 19416510  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||| ||    
T  19416511 gcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatc 19416610  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19416611 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 19416664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 2581 - 2842
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  2581 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagtta 2680  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2681 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 2780  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2781 agaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgcc 2842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 22456800 - 22457061
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  22456800 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaaagtta 22456899  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  22456900 actttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggta 22456999  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22457000 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 22457061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 33374127 - 33374383
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||    
T  33374127 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaatttt 33374226  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  33374227 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 33374326  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374327 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 33374383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 13521939 - 13522200
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  13521939 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 13522038  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13522039 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 13522138  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
     ||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522139 cgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 13522200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 8892182 - 8892437
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8892182 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 8892281  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  8892282 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 8892380  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892381 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 8892437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 8903417 - 8903672
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8903417 tctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 8903516  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  8903517 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 8903615  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8903616 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 8903672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28162982 - 28162726
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  28162982 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 28162883  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  28162882 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 28162783  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||| |||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162782 ggaacttgggaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 28162726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 14143151 - 14143412
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  14143151 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 14143250  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14143251 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 14143350  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  14143351 agaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgcc 14143412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26788274 - 26788013
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  26788274 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 26788175  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26788174 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 26788075  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  26788074 agaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgcc 26788013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27196647 - 27196386
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  27196647 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 27196548  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27196547 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 27196448  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  27196447 agaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgcc 27196386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 27252593 - 27252854
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  27252593 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 27252692  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27252693 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 27252792  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  27252793 agaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgcc 27252854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 27290236 - 27290497
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  27290236 tcaagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 27290335  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27290336 actttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 27290435  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27290436 agaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgcc 27290497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 103 - 262
Target Start/End: Original strand, 22477241 - 22477400
Alignment:
Q  103 tttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcag 202  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22477241 tttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggttag 22477340  T
Q  203 aatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477341 aacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 22477400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20161031 - 20160770
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |    
T  20161031 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 20160932  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  20160931 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 20160832  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
     |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  20160831 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgcc 20160770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 22171800 - 22172061
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |    
T  22171800 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtca 22171899  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  22171900 gcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatc 22171999  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
     |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  22172000 ggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgcc 22172061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 22934746 - 22934999
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||    
T  22934746 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtta 22934845  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22934846 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtc 22934945  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22934946 ggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 22934999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 23857191 - 23857444
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||    
T  23857191 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtta 23857290  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23857291 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtc 23857390  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23857391 ggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 23857444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26918710 - 26918457
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  26918710 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 26918611  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  26918610 gctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 26918511  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26918510 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 26918457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 27272446 - 27272699
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||||| |    
T  27272446 tcaagtctaggagctacctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaaggtca 27272545  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27272546 gcttcccttgatcgatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgaggtc 27272645  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27272646 ggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggttgt 27272699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16750184 - 16749931
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  16750184 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 16750085  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  16750084 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 16749985  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  16749984 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 16749931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26989331 - 26989078
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  26989331 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 26989232  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  26989231 gctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 26989132  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26989131 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 26989078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 13298817 - 13299070
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  13298817 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 13298916  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  13298917 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 13299016  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13299017 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 13299070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 24304484 - 24304737
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  24304484 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 24304583  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  24304584 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 24304683  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24304684 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 24304737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24864047 - 24863794
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  24864047 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 24863948  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  24863947 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 24863848  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24863847 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 24863794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 27000150
Alignment:
Q  10 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttcctt 109  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 27000295  T
Q  110 ggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 209  Q
    | |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| || ||   |||    
T  27000294 gatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaa 27000195  T
Q  210 cctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27000194 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 27000150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 15424183 - 15424436
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |  ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  15424183 tcaagtctaggagcttcctcacatactttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtca 15424282  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  15424283 gctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 15424382  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  15424383 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 15424436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29549805 - 29549552
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||  |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  29549805 tcaagtccaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 29549706  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  29549705 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 29549606  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29549605 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 29549552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4773336 - 4773077
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  4773336 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 4773237  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | ||||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  4773236 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 4773137  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  4773136 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtg 4773077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16674469 - 16674210
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  16674469 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 16674370  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  16674369 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 16674270  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  16674269 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtg 16674210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27008057 - 27007798
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  27008057 tcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 27007958  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| ||||  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  27007957 gctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 27007858  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  27007857 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtg 27007798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4758094 - 4757841
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  4758094 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 4757995  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  4757994 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 4757895  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  4757894 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 4757841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 27359858 - 27360111
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  27359858 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 27359957  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  27359958 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 27360057  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27360058 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 27360111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 27450201 - 27450454
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  27450201 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 27450300  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  27450301 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 27450400  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27450401 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 27450454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 30557882 - 30558135
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  30557882 tcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 30557981  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| || || ||    
T  30557982 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatc 30558081  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  30558082 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 30558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4525616 - 4525360
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |    
T  4525616 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtca 4525517  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||| | ||    
T  4525516 gctttccctgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgggatc 4525417  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgca 257  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4525416 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgca 4525360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29573343 - 29573084
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  29573343 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 29573244  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  29573243 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 29573144  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  29573143 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtg 29573084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 4545641 - 4545894
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |    
T  4545641 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtca 4545740  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | ||||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  4545741 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 4545840  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  4545841 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 4545894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3696411 - 3696164
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  3696411 tcaagtctaggagcttcatcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 3696312  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  3696311 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatc 3696212  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3696211 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 3696164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 34463212 - 34463471
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  34463212 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 34463311  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  34463312 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 34463411  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  34463412 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtg 34463471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29501745 - 29501492
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  29501745 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 29501646  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  29501645 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 29501546  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  29501545 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 29501492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 4724000 - 4724247
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || |    
T  4724000 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaaagtca 4724099  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  4724100 gctttccctgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 4724199  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  4724200 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtct 4724247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 26116276 - 26116523
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  26116276 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 26116375  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  26116376 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 26116475  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26116476 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 26116523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28207784 - 28207537
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  28207784 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 28207685  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  28207684 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 28207585  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  28207584 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtct 28207537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 16943893 - 16944146
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  16943893 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 16943992  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  16943993 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 16944092  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16944093 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 16944146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 26777481 - 26777734
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||  ||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  26777481 tcaagtctaggattttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 26777580  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  26777581 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 26777680  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  26777681 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 26777734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17025607 - 17025348
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  17025607 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 17025508  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  |||||| |||| |||||||| || || ||    
T  17025507 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatc 17025408  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  17025407 agagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 17025348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27044718 - 27044464
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  27044718 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 27044619  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagc-atccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggt 199  Q
      || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || | | || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  27044618 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagat 27044519  T
Q  200 cagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    ||||   |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  27044518 cagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 27044464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 17092306 - 17092427
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||   || |||||||| || |    
T  17092306 tcaagtttggtagcttcctcacatacctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaaagtca 17092405  T
Q  101 attttccttggtttatgagctt 122  Q
    | ||||| ||||  ||||||||    
T  17092406 actttccctggtcaatgagctt 17092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27485459 - 27485206
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  27485459 tcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 27485360  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  27485359 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 27485260  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  27485259 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 27485206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 20340258 - 20340519
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  20340258 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagtta 20340357  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20340358 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 20340457  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20340458 agaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgcc 20340519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20461413 - 20461152
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| |    
T  20461413 tcaagtctgcgagcttgctcatatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaaggtca 20461314  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20461313 attttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgaggtc 20461214  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461213 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 20461152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 16207954 - 16208215
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  16207954 tcaagtctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 16208053  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16208054 actttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 16208153  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16208154 agaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgcc 16208215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28152194 - 28151933
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  28152194 tcaagtccgggagcttcctcatatatctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 28152095  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28152094 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 28151995  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||  ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28151994 agaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgcc 28151933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10963002 - 10962749
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  10963002 tcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 10962903  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  10962902 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 10962803  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  10962802 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 10962749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 41793231 - 41793484
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  41793231 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 41793330  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  41793331 gcttcccttgatcgacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 41793430  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  41793431 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgt 41793484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 51638550 - 51638306
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  51638550 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 51638451  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  51638450 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 51638351  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctg 245  Q
    |||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||    
T  51638350 agacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctg 51638306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28585313 - 28585060
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  28585313 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 28585214  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  |||||| |||| || || || ||||| ||    
T  28585213 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatc 28585114  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  28585113 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 28585060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16041654 - 16041396
Alignment:
Q  4 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |    
T  16041654 agtctgggagcttcctcgtatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaact 16041555  T
Q  104 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcaga 203  Q
    |||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16041554 ttccctgatcaatgagctttttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttaggtcaga 16041455  T
Q  204 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041454 acggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 16041396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 262
Target Start/End: Original strand, 16449810 - 16450068
Alignment:
Q  4 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |    
T  16449810 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaact 16449909  T
Q  104 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcaga 203  Q
    |||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16449910 ttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 16450009  T
Q  204 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    | | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16450010 acgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 16450068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 31088278 - 31088534
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  31088278 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 31088377  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  31088378 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 31088477  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088478 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 31088534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 45733789 - 45733533
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  45733789 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 45733690  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  45733689 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 45733590  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733589 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 45733533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26485028 - 26484767
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  26485028 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 26484929  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26484928 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 26484829  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26484828 agaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgcc 26484767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 262
Target Start/End: Original strand, 2108817 - 2109075
Alignment:
Q  4 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |    
T  2108817 agtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaact 2108916  T
Q  104 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcaga 203  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2108917 ttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 2109016  T
Q  204 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
      ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2109017 ccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgcc 2109075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 2775693 - 2775432
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  2775693 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 2775594  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2775593 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 2775494  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2775493 agaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgcc 2775432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 39210832 - 39211093
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  39210832 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 39210931  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  39210932 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 39211031  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  39211032 agaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgcc 39211093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 26682809 - 26683008
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  26682809 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtca 26682908  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26682909 attttccttggtctatgagtttttttaaaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4200881 - 4200682
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  4200881 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 4200782  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4200781 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5128326 - 5128073
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  5128326 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 5128227  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  5128226 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 5128127  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5128126 agacctgaaccttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggttgt 5128073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2154907 - 2154654
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  2154907 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 2154808  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  2154807 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 2154708  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2154707 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 2154654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 11424585 - 11424846
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  11424585 tcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 11424684  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  11424685 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 11424784  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11424785 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgcc 11424846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 16518225 - 16518478
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  16518225 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 16518324  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  16518325 actttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatc 16518424  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16518425 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 16518478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 10916677 - 10916930
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  10916677 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 10916776  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  10916777 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 10916876  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10916877 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 10916930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 16503189 - 16503442
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  16503189 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 16503288  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  16503289 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatc 16503388  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16503389 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 16503442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3445640 - 3445387
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  3445640 tcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 3445541  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  3445540 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 3445441  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  3445440 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 3445387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 26274903 - 26275156
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  26274903 tcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 26275002  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  26275003 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 26275102  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  26275103 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 26275156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11441906 - 11441653
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  11441906 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 11441807  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  11441806 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 11441707  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  11441706 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 11441653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26435591 - 26435338
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  26435591 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 26435492  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  26435491 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 26435392  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  26435391 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 26435338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 4144932 - 4145185
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  4144932 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 4145031  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  4145032 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 4145131  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  4145132 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 4145185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 5147149 - 5147402
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  5147149 tcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 5147248  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  5147249 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 5147348  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  5147349 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 5147402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 24592350 - 24592603
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  24592350 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 24592449  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  24592450 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 24592549  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24592550 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 24592603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 31564199 - 31564452
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  31564199 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 31564298  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | ||||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  31564299 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 31564398  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  31564399 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 31564452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18541107 - 18540872
Alignment:
Q  27 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 126  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  18541107 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 18541008  T
Q  127 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 226  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  18541007 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 18540908  T
Q  227 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
      ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18540907 ccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgcc 18540872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 26537679 - 26537926
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  26537679 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 26537778  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  26537779 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatc 26537878  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26537879 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 26537926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 26319678 - 26319931
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  26319678 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 26319777  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  26319778 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 26319877  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  26319878 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 26319931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9618985 - 9618732
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  9618985 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 9618886  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  9618885 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 9618786  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  9618785 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 9618732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 26669723 - 26669976
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  26669723 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 26669822  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||| ||    
T  26669823 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatc 26669922  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  26669923 agacctgaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 26669976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 45387677 - 45387424
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||| || |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  45387677 tcaagcctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 45387578  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||| ||    
T  45387577 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatc 45387478  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  45387477 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 45387424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 16736269 - 16736522
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  16736269 tcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 16736368  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||  |||| |||||||| ||||| ||    
T  16736369 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatc 16736468  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  16736469 agacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 16736522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 16751323 - 16751576
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  16751323 tcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 16751422  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||  |||| |||||||| ||||| ||    
T  16751423 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatc 16751522  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  16751523 agacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 16751576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17523866 - 17523613
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  17523866 tcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 17523767  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||  |||| |||||||| ||||| ||    
T  17523766 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatc 17523667  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  17523666 agacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 17523613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 17529349 - 17529602
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  17529349 tcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 17529448  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||  |||| |||||||| ||||| ||    
T  17529449 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatc 17529548  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  17529549 agacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 17529602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31125254 - 31125001
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  31125254 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 31125155  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  31125154 gcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 31125055  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  31125054 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 31125001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5159827 - 5159594
Alignment:
Q  27 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 126  Q
    |||||| || ||||| ||||| | ||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  5159827 ctcaattatattcacggcagcatcatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 5159728  T
Q  127 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 226  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || | ||||||||| || | ||| ||| ||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  5159727 acgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 5159628  T
Q  227 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
      ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  5159627 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 5159594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22888809 - 22888551
Alignment:
Q  4 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |    
T  22888809 agtctaggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaact 22888710  T
Q  104 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcaga 203  Q
    ||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22888709 ttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 22888610  T
Q  204 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888609 acggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 22888551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25199371 - 25199110
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  25199371 tcaagtctgggggctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 25199272  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | |||||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  25199271 actttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagatc 25199172  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199171 agaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 25199110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 13184473 - 13184729
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  13184473 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 13184572  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  13184573 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 13184672  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184673 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 13184729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 13440319 - 13440575
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  13440319 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaatttt 13440418  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  13440419 ccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 13440518  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440519 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 13440575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 29888902 - 29889163
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |    
T  29888902 tcaagtctgggagcttcctcatacacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtca 29889001  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | |||||||| |  |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  29889002 actttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatgaggtc 29889101  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29889102 agaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgcc 29889163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33877589 - 33877328
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  33877589 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtca 33877490  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33877489 actttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 33877390  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
     ||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877389 cgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 33877328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23892548 - 23892287
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23892548 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtta 23892449  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | |||||||| |  |||||||| || || |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23892448 actttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 23892349  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
     ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892348 ggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 23892287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11326131 - 11325875
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||    
T  11326131 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaacttt 11326032  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||     
T  11326031 ccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaac 11325932  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11325931 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 11325875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 24687977 - 24688230
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  24687977 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 24688076  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  24688077 gctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgagatc 24688176  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24688177 ggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 24688230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33777829 - 33777576
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  33777829 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 33777730  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  33777729 gctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtc 33777630  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33777629 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 33777576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 23752270 - 23752523
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  23752270 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 23752369  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  23752370 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtc 23752469  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23752470 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 23752523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 9548363 - 9548616
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  9548363 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 9548462  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  9548463 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatc 9548562  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  9548563 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 9548616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 22998934 - 22999187
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  22998934 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 22999033  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  22999034 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatc 22999133  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22999134 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 22999187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30934975 - 30934722
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  30934975 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 30934876  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  30934875 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 30934776  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30934775 ggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 30934722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11549696 - 11549443
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  11549696 tcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 11549597  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  11549596 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 11549497  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11549496 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 11549443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 23717808 - 23718061
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  23717808 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 23717907  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  23717908 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 23718007  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23718008 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 23718061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24970360 - 24970107
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| |  ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||      
T  24970360 tcaagtctaggagcttcctcacgtactttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcc 24970261  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  24970260 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatc 24970161  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24970160 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 24970107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 15658580 - 15658833
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  15658580 tcaagtctaggagcttcctcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 15658679  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  15658680 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 15658779  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15658780 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 15658833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 37671303 - 37671562
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |    
T  37671303 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtca 37671402  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  37671403 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 37671502  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  37671503 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtg 37671562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28649577 - 28649330
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  28649577 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 28649478  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  28649477 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 28649378  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28649377 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 28649330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 31826227 - 31826480
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  31826227 tcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 31826326  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  31826327 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 31826426  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  31826427 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 31826480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Original strand, 18500553 - 18500797
Alignment:
Q  4 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 103  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |    
T  18500553 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 18500652  T
Q  104 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcaga 203  Q
    |||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| |||||    
T  18500653 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 18500752  T
Q  204 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
       |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18500753 cctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 18500797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31431782 - 31431535
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  31431782 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 31431683  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  31431682 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 31431583  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  31431582 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 31431535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 8665295 - 8665548
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  8665295 tcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 8665394  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  8665395 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 8665494  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8665495 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgt 8665548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9317793 - 9317540
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  9317793 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 9317694  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  9317693 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 9317594  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  9317593 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 9317540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12132497 - 12132244
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  12132497 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 12132398  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  12132397 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 12132298  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  12132297 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 12132244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 15758677 - 15758930
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  15758677 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 15758776  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  15758777 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 15758876  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15758877 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgt 15758930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30152360 - 30152107
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  30152360 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 30152261  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||| ||    
T  30152260 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatc 30152161  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30152160 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 30152107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33516698 - 33516445
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  33516698 tcaagtctcggagcttcttcacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 33516599  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| || || ||    
T  33516598 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatc 33516499  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  33516498 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 33516445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 37358463 - 37358716
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  37358463 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaaagtca 37358562  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  37358563 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 37358662  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  37358663 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 37358716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 32599292 - 32599551
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| || ||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  32599292 tcaagtctaggggcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 32599391  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  32599392 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 32599491  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  32599492 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtg 32599551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2511393 - 2511140
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  2511393 tcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 2511294  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  2511293 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 2511194  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2511193 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgt 2511140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6874647 - 6874394
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  6874647 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 6874548  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  || ||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  6874547 gcttcccttgatcgataagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 6874448  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6874447 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgt 6874394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 18375232 - 18375485
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  18375232 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 18375331  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  18375332 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 18375431  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  18375432 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 18375485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26480734 - 26480481
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  26480734 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 26480635  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  26480634 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 26480535  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  26480534 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 26480481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 13324649 - 13324908
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  13324649 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 13324748  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | ||||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  13324749 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 13324848  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  13324849 agagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 13324908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43078594 - 43078347
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  43078594 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 43078495  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  43078494 gctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 43078395  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  43078394 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtct 43078347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 29966886 - 29967139
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  29966886 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 29966985  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  29966986 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 29967085  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29967086 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 29967139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30029757 - 30029504
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  30029757 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 30029658  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  30029657 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 30029558  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30029557 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 30029504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3789883 - 3789624
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  3789883 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 3789784  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  3789783 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 3789684  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  3789683 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtg 3789624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24681782 - 24681523
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  24681782 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 24681683  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| || || ||    
T  24681682 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatc 24681583  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  24681582 agagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 24681523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24724309 - 24724050
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  24724309 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 24724210  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| || || ||    
T  24724209 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatc 24724110  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  24724109 agagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 24724050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30168811 - 30168564
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  30168811 tcaagtctaggagtttcttcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaaagtga 30168712  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  30168711 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatc 30168612  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30168611 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 30168564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 37770807 - 37771054
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| | |||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |    
T  37770807 tcaagtctagaagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtca 37770906  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || |  || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  37770907 gctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 37771006  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37771007 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 37771054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 40473369 - 40473628
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  40473369 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 40473468  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| || || ||    
T  40473469 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatc 40473568  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  40473569 agagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 40473628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41675025 - 41674798
Alignment:
Q  27 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 126  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||| ||     
T  41675025 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttg 41674926  T
Q  127 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 226  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||| |||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  41674925 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggat 41674826  T
Q  227 taggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  41674825 caggtgggggcttaccctgtctagttgt 41674798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33292841 - 33292608
Alignment:
Q  27 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 126  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  33292841 ctcaatcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 33292742  T
Q  127 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 226  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| ||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  33292741 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 33292642  T
Q  227 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
      ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  33292641 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtg 33292608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37755322 - 37755075
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  37755322 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 37755223  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  37755222 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 37755123  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  37755122 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtct 37755075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5638252 - 5637999
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || || ||||| || |    
T  5638252 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaaagtca 5638153  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  5638152 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 5638053  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  5638052 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 5637999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34616860 - 34616607
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  34616860 tcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 34616761  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  34616760 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 34616661  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  34616660 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 34616607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 28959606 - 28959859
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| ||||  |||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  28959606 tcaagtctaggagtctcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 28959705  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  28959706 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 28959805  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  28959806 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 28959859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 262
Target Start/End: Original strand, 1844 - 2101
Alignment:
Q  4 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  1844 agtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaatt 1943  T
Q  104 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcaga 203  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1944 t-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 2042  T
Q  204 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2043 acggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 2101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6344 - 6098
Alignment:
Q  4 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 103  Q
    ||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |    
T  6344 agtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagct 6245  T
Q  104 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttc-aaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatg-gaaatcacacttgaggtca 201  Q
    |||| || |  |||||||| || || || |||||| ||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| ||||  |||||||| ||||| |||    
T  6244 ttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatca 6145  T
Q  202 gaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6144 gacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 6098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20717 - 20460
Alignment:
Q  4 agtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatt 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  20717 agtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaatt 20618  T
Q  104 ttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcaga 203  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20617 t-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 20519  T
Q  204 atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20518 acggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 20460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30785 - 30532
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  30785 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 30686  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| || ||||| || || ||    
T  30685 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatc 30586  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  30585 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 30532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 258
Target Start/End: Original strand, 19658926 - 19659178
Alignment:
Q  5 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  19658926 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 19659025  T
Q  105 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaa 204  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  19659026 tccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 19659124  T
Q  205 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcag 258  Q
     ||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659125 cggaacttgggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcag 19659178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33244994 - 33244741
Alignment:
Q  5 gtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattt 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  33244994 gtctgagagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattt 33244895  T
Q  105 tccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaa 204  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  33244894 tccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaa 33244795  T
Q  205 tggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcag 258  Q
     ||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33244794 cggaacttaggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcag 33244741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 44563427 - 44563173
Alignment:
Q  6 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaatttt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || || |||    
T  44563427 tctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaacttt 44563329  T
Q  106 ccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaat 205  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  44563328 ccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaac 44563230  T
Q  206 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563229 ggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 44563173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 262
Target Start/End: Original strand, 22080790 - 22081021
Alignment:
Q  31 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  22080790 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 22080889  T
Q  131 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22080890 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttagg 22080989  T
Q  231 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22080990 tggaggctttccctgcctggttgtgcagtgcc 22081021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9354956 - 9354694
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||||| |    
T  9354956 tcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaggtca 9354857  T
Q  101 attttccttggtttatgagctttttt-acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggt 199  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9354856 attttccttggtctatgagttttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggt 9354757  T
Q  200 cagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 262  Q
    | ||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9354756 ccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcc 9354694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16283781 - 16283529
Alignment:
Q  2 caagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaa 101  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |     
T  16283781 caagtctaggagcttcctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcag 16283682  T
Q  102 ttttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtca 201  Q
     |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||     
T  16283681 ctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttgaggtcg 16283582  T
Q  202 gaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16283581 gacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 16283529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18710919 - 18710666
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  18710919 tcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 18710820  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  18710819 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttgagatc 18710720  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| |||||    
T  18710719 agacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtctagttgt 18710666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19688431 - 19688178
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  19688431 tcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 19688332  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
    | |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  19688331 actttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 19688232  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19688231 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 19688178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 27608787 - 27609040
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  27608787 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 27608886  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  27608887 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 27608986  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27608987 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 27609040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16277887 - 16277634
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  16277887 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 16277788  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  16277787 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 16277688  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16277687 ggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 16277634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 2137141 - 2137394
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| ||||||| |||| || | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||| || |    
T  2137141 tcaagtctaggagctttctcacatgcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaaagtca 2137240  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  2137241 gctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 2137340  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2137341 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 2137394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14557957 - 14557704
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  14557957 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtca 14557858  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  14557857 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 14557758  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  14557757 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgt 14557704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29829655 - 29829405
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  29829655 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 29829556  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| || || ||    
T  29829555 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatc 29829456  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggt 251  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  29829455 agagcggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggt 29829405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 12092606 - 12092859
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  12092606 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 12092705  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | ||||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  12092706 gctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 12092805  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  12092806 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 12092859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31354857 - 31354604
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  31354857 tcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 31354758  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  31354757 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 31354658  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31354657 agacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgt 31354604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 31489632 - 31489885
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  31489632 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 31489731  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| ||||| || ||||| ||    
T  31489732 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatc 31489831  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  31489832 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 31489885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 3329389 - 3329648
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |    
T  3329389 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtca 3329488  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | ||||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  3329489 gcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 3329588  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  3329589 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtg 3329648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 19208242 - 19208495
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  19208242 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 19208341  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  19208342 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 19208441  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  19208442 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgt 19208495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19674774 - 19674521
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  19674774 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 19674675  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  || ||||||||||| |  |||||  |||| |||||||| ||||| ||    
T  19674674 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatc 19674575  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  19674574 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgt 19674521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 189427 - 189256
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  189427 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 189328  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagag 172  Q
      |||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  189327 gctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 28361837 - 28362090
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  28361837 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 28361936  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  28361937 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 28362036  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  28362037 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 28362090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19286795 - 19286542
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |    
T  19286795 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 19286696  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  19286695 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 19286596  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||    
T  19286595 agacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgt 19286542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33259056 - 33258803
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||| | || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  33259056 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 33258957  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  33258956 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 33258857  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  33258856 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 33258803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 51 - 262
Target Start/End: Original strand, 1 - 212
Alignment:
Q  51 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcat 100  T
Q  151 ccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  101 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctgg 200  T
Q  251 ttgtgcagtgcc 262  Q
    ||| ||||||||    
T  201 ttgagcagtgcc 212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21864 - 21635
Alignment:
Q  31 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  21864 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 21765  T
Q  131 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 230  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  21764 tctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttagg 21665  T
Q  231 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21664 tggaggcttgccctgcctggttgtgcagtg 21635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 541 - 728
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||    
T  541 tcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaaagtta 640  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatc 188  Q
    | ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  641 actttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 46908 - 47161
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  46908 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 47007  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  47008 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 47107  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  47108 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 47161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 39992 - 40245
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  39992 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 40091  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||  || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  40092 gctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatc 40191  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40192 ggacctgaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 40245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30096 - 29843
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  30096 tcaagtctaagagcttcctcacatacttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtca 29997  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||| | ||||||||||| ||||| ||    
T  29996 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttgagatc 29897  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29896 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 29843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27625 - 27372
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  27625 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 27526  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  || ||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  27525 gctttccttgatcaataagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 27426  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27425 ggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 27372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 52 - 305
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |    
T  52 tcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtca 151  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||  || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  152 gctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttgagatc 251  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
     ||   |||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  252 ggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgt 305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9899 - 9652
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  9899 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 9800  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  |||||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  9799 gcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatc 9700  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9699 agatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtct 9652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 7162 - 7415
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  7162 tcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 7261  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  7262 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 7361  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  7362 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 7415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 8989 - 9242
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  8989 tcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 9088  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||| ||    
T  9089 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatc 9188  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  9189 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 9242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20348 - 20095
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  20348 tcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 20249  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||||| ||    
T  20248 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatc 20149  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  20148 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 20095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 14853 - 15106
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  14853 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 14952  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  14953 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 15052  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15053 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 15106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8282 - 8035
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |    
T  8282 tcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtca 8183  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  8182 gcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 8083  T
Q  201 agaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 248  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  8082 agacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtct 8035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 26124 - 26378
Alignment:
Q  1 tcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggtta 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |    
T  26124 tcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtca 26223  T
Q  101 attttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcacctcgatggaaatcacacttgaggtc 200  Q
      || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  26224 gcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatc 26323  T
Q  201 agaatggaacc-tgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 254  Q
    |||   ||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  26324 agacctgaacctttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 26378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 95
Target Start/End: Original strand, 46764 - 46819
Alignment:
Q  40 acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaa 95  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  46764 acagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaa 46819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University