View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8903_high_13 (Length: 371)

Name: NF8903_high_13
Description: NF8903
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8903_high_13
NF8903_high_13
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (121-369)||(41795823-41796071)
chr4 (124-369)||(6178591-6178836)
chr4 (124-369)||(30723528-30723773)
chr4 (124-369)||(49093447-49093692)
chr4 (124-369)||(49168536-49168781)
chr4 (124-367)||(1305921-1306164)
chr4 (124-369)||(21018379-21018624)
chr4 (124-369)||(31424765-31425010)
chr4 (124-369)||(40355205-40355449)
chr4 (129-369)||(37016396-37016629)
chr4 (122-369)||(51686139-51686380)
chr4 (151-369)||(50196355-50196567)
chr4 (129-369)||(8110176-8110410)
chr4 (124-283)||(44674632-44674791)
chr4 (148-369)||(50020515-50020730)
chr4 (177-369)||(46439045-46439231)
chr4 (159-369)||(10729822-10730026)
chr4 (159-369)||(10943591-10943795)
chr4 (129-369)||(50278179-50278398)
chr4 (142-369)||(14317634-14317855)
chr4 (190-367)||(21535097-21535268)
chr4 (190-369)||(71962-72135)
chr4 (279-369)||(44676926-44677016)
chr4 (276-371)||(11081578-11081673)
chr4 (233-369)||(13624432-13624565)
chr4 (321-365)||(50904383-50904427)
chr4 (139-243)||(50904466-50904570)
chr4 (159-365)||(55278615-55278812)
chr4 (1-35)||(1305813-1305847)
chr4 (1-35)||(6178467-6178501)
chr4 (1-35)||(21018282-21018316)
chr4 (1-35)||(30723420-30723454)
chr4 (1-35)||(31425084-31425118)
chr4 (159-209)||(40886459-40886509)
chr4 (1-35)||(41795703-41795737)
chr4 (1-35)||(49168863-49168897)
chr4 (1-35)||(55793333-55793367)
chr4 (2-35)||(49093767-49093800)
chr4 (177-233)||(11081485-11081541)
chr4 (142-206)||(12892088-12892152)
chr4 (124-228)||(41930852-41930956)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (121-369)||(19037947-19038195)
chr5 (124-369)||(28238520-28238765)
chr5 (124-369)||(30708072-30708317)
chr5 (124-369)||(8450-8695)
chr5 (124-369)||(8577326-8577571)
chr5 (124-369)||(28879623-28879871)
chr5 (130-369)||(38407644-38407883)
chr5 (129-369)||(5199785-5200025)
chr5 (129-340)||(7761597-7761808)
chr5 (124-365)||(38971070-38971305)
chr5 (139-365)||(42937464-42937684)
chr5 (177-369)||(42538818-42539004)
chr5 (142-319)||(511433-511605)
chr5 (132-369)||(8699225-8699458)
chr5 (148-346)||(15939692-15939881)
chr5 (148-365)||(40622822-40623033)
chr5 (124-157)||(27662565-27662598)
chr5 (1-35)||(8345-8379)
chr5 (1-35)||(8577221-8577255)
chr5 (1-35)||(19037827-19037861)
chr5 (1-35)||(27662460-27662494)
chr5 (1-35)||(28238412-28238446)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (124-369)||(48406383-48406628)
chr7 (124-369)||(9368189-9368434)
chr7 (124-369)||(41883565-41883810)
chr7 (124-369)||(15071070-15071315)
chr7 (124-369)||(17460049-17460294)
chr7 (124-369)||(17592920-17593165)
chr7 (124-369)||(35607178-35607423)
chr7 (122-368)||(17837979-17838225)
chr7 (130-369)||(5538344-5538583)
chr7 (124-365)||(10521859-10522100)
chr7 (191-369)||(42504788-42504966)
chr7 (129-369)||(47521769-47522009)
chr7 (124-369)||(13323059-13323303)
chr7 (159-367)||(27450510-27450717)
chr7 (125-353)||(34741762-34741981)
chr7 (148-369)||(37343275-37343490)
chr7 (124-369)||(41734753-41734992)
chr7 (129-367)||(16680486-16680718)
chr7 (129-367)||(17654722-17654954)
chr7 (148-369)||(47670017-47670235)
chr7 (177-367)||(16488400-16488584)
chr7 (148-326)||(19801568-19801740)
chr7 (129-369)||(36980583-36980805)
chr7 (190-346)||(11630152-11630290)
chr7 (142-205)||(9491796-9491859)
chr7 (1-35)||(9368073-9368107)
chr7 (1-35)||(17459933-17459967)
chr7 (1-35)||(17593247-17593281)
chr7 (1-35)||(35607062-35607096)
chr7 (1-35)||(41883892-41883926)
chr7 (1-35)||(48406710-48406744)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (121-369)||(46401730-46401978)
chr3 (124-369)||(34048450-34048695)
chr3 (124-369)||(42900943-42901188)
chr3 (124-369)||(54389150-54389395)
chr3 (124-369)||(2648359-2648604)
chr3 (124-369)||(50477560-50477805)
chr3 (129-369)||(46698103-46698343)
chr3 (124-369)||(2271839-2272084)
chr3 (124-369)||(49141313-49141546)
chr3 (139-369)||(16646520-16646750)
chr3 (129-369)||(47070974-47071215)
chr3 (130-369)||(50213956-50214195)
chr3 (124-369)||(4005197-4005439)
chr3 (139-369)||(9473304-9473531)
chr3 (125-369)||(17562130-17562371)
chr3 (129-369)||(20353566-20353800)
chr3 (149-365)||(49266177-49266393)
chr3 (126-369)||(599892-600133)
chr3 (129-369)||(52388401-52388626)
chr3 (148-369)||(41615286-41615495)
chr3 (142-369)||(44232736-44232957)
chr3 (142-308)||(16861577-16861743)
chr3 (124-365)||(36130514-36130740)
chr3 (124-342)||(11380825-11381037)
chr3 (148-369)||(6928150-6928365)
chr3 (130-367)||(48891544-48891775)
chr3 (142-368)||(42759681-42759889)
chr3 (148-249)||(48565959-48566060)
chr3 (129-365)||(30252886-30253118)
chr3 (142-369)||(42804765-42804989)
chr3 (315-369)||(48565894-48565948)
chr3 (1-35)||(34048785-34048819)
chr3 (1-35)||(42900827-42900861)
chr3 (1-35)||(46402064-46402098)
chr3 (1-35)||(46697984-46698018)
chr3 (1-35)||(49141189-49141223)
chr3 (1-35)||(50477452-50477486)
chr3 (1-35)||(54389485-54389519)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (124-369)||(1055551-1055796)
chr8 (124-369)||(23019074-23019319)
chr8 (124-369)||(26662472-26662717)
chr8 (124-367)||(42482293-42482536)
chr8 (124-369)||(486520-486765)
chr8 (124-369)||(15033552-15033797)
chr8 (133-369)||(22292-22528)
chr8 (124-369)||(34819403-34819642)
chr8 (148-371)||(40075517-40075734)
chr8 (221-369)||(43214409-43214557)
chr8 (129-369)||(34367416-34367642)
chr8 (129-369)||(39831543-39831783)
chr8 (142-367)||(20859040-20859259)
chr8 (148-369)||(35554613-35554828)
chr8 (142-369)||(30761083-30761304)
chr8 (142-365)||(5301130-5301335)
chr8 (130-236)||(41239347-41239453)
chr8 (150-369)||(52107-52320)
chr8 (253-365)||(41243000-41243112)
chr8 (142-367)||(45132766-45132982)
chr8 (238-367)||(5679888-5680014)
chr8 (288-367)||(39604314-39604393)
chr8 (159-317)||(12716106-12716257)
chr8 (1-35)||(22155-22189)
chr8 (1-35)||(1055878-1055912)
chr8 (1-35)||(23018958-23018992)
chr8 (1-35)||(26662799-26662833)
chr8 (1-35)||(42482177-42482211)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (124-369)||(6204174-6204419)
chr6 (124-369)||(11691141-11691386)
chr6 (124-369)||(30826405-30826650)
chr6 (124-369)||(22304255-22304500)
chr6 (124-369)||(27638773-27639018)
chr6 (124-369)||(31771092-31771326)
chr6 (142-369)||(26172942-26173162)
chr6 (148-330)||(3502038-3502228)
chr6 (122-311)||(2405836-2406024)
chr6 (124-319)||(24885426-24885615)
chr6 (148-366)||(32641675-32641890)
chr6 (148-368)||(18001622-18001836)
chr6 (122-369)||(2407261-2407490)
chr6 (129-369)||(32642916-32643153)
chr6 (145-365)||(3384457-3384670)
chr6 (1-35)||(6204509-6204543)
chr6 (1-35)||(11691476-11691510)
chr6 (1-35)||(22304591-22304625)
chr6 (1-35)||(27639086-27639120)
chr6 (1-35)||(30826297-30826331)
chr6 (233-355)||(24085723-24085842)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (124-369)||(30493748-30493993)
chr2 (124-368)||(43981547-43981791)
chr2 (124-369)||(15834281-15834526)
chr2 (124-369)||(5354996-5355241)
chr2 (124-369)||(43536491-43536736)
chr2 (124-369)||(28471553-28471800)
chr2 (121-369)||(17423491-17423727)
chr2 (124-369)||(29398392-29398637)
chr2 (124-369)||(39950519-39950755)
chr2 (124-369)||(10825705-10825950)
chr2 (124-369)||(36653286-36653528)
chr2 (124-213)||(3938326-3938415)
chr2 (129-249)||(6637884-6638004)
chr2 (296-369)||(45431530-45431603)
chr2 (148-365)||(7416811-7417025)
chr2 (129-369)||(40538550-40538787)
chr2 (122-207)||(25514842-25514924)
chr2 (1-35)||(17423813-17423847)
chr2 (1-35)||(5355323-5355357)
chr2 (1-35)||(30493632-30493666)
chr2 (1-35)||(43536375-43536409)
chr2 (1-35)||(43981881-43981915)
chr2 (2-35)||(3938211-3938244)
chr2 (2-35)||(15834600-15834633)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (124-369)||(26878734-26878979)
chr1 (124-369)||(13636787-13637032)
chr1 (129-369)||(3729135-3729375)
chr1 (124-369)||(19159045-19159290)
chr1 (130-369)||(52804892-52805131)
chr1 (129-369)||(21143954-21144194)
chr1 (124-361)||(22527027-22527264)
chr1 (124-369)||(50617679-50617925)
chr1 (129-369)||(47505365-47505605)
chr1 (124-369)||(31780454-31780693)
chr1 (125-369)||(19522075-19522310)
chr1 (124-369)||(94892-95128)
chr1 (148-367)||(23273218-23273431)
chr1 (124-369)||(45828600-45828839)
chr1 (142-369)||(51336929-51337150)
chr1 (148-368)||(11196888-11197102)
chr1 (149-369)||(38119977-38120191)
chr1 (148-367)||(47660899-47661112)
chr1 (124-228)||(8548255-8548353)
chr1 (148-365)||(49854831-49855045)
chr1 (141-365)||(35256216-35256434)
chr1 (124-201)||(470574-470651)
chr1 (245-292)||(470528-470575)
chr1 (304-369)||(16269758-16269823)
chr1 (1-35)||(8548435-8548469)
chr1 (1-35)||(13636678-13636712)
chr1 (1-35)||(19159369-19159403)
chr1 (1-35)||(19928234-19928268)
chr1 (1-35)||(26879061-26879095)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (142-369)||(12375-12599)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 121 - 369
Target Start/End: Original strand, 41795823 - 41796071
Alignment:
Q  121 taatactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtca 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41795823 taatactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtca 41795922  T
Q  221 tggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgtt 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  41795923 tggcctcaaaccactgttgaggggtcatgctcatgacctcctcttggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtc 41796022  T
Q  321 aggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796023 aggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 41796071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 6178591 - 6178836
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6178591 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 6178690  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6178691 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 6178790  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6178791 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 6178836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 30723528 - 30723773
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30723528 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 30723627  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30723628 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 30723727  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30723728 cgagcttctcgcctcataccgctcccactggtctgcaatgatctgc 30723773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 49093692 - 49093447
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49093692 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcagcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 49093593  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  49093592 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 49093493  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49093492 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 49093447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 49168781 - 49168536
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168781 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctatgggctctcctcctggtcaaaatcgacgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 49168682  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  49168681 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgccataggtgtcagg 49168582  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168581 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 49168536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 124 - 367
Target Start/End: Original strand, 1305921 - 1306164
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1305921 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 1306020  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  1306021 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 1306120  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatct 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306121 cgagcttctcgcctcttaccgctgccactgctctgcaatgatct 1306164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 21018379 - 21018624
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21018379 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 21018478  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  21018479 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccattaaccatgtcataggtgtcagg 21018578  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21018579 cgagcttctcgcctcataccgctcccactactctgcaatgatctgc 21018624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31425010 - 31424765
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31425010 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgtgatctgctccctcatatgggtcatgg 31424911  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||     
T  31424910 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcacaggtgtcaga 31424811  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424810 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 31424765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 40355205 - 40355449
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40355205 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctatgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctcc-tcatatgggtcatgg 40355303  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  40355304 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactaaccatgtcataggtgtcagg 40355403  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40355404 cgagcttctcgcctcataccgctcccactggtctgcaatgatctgc 40355449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Original strand, 37016396 - 37016629
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  37016396 ctggtcctggtcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgccttctagtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatattgctcatggcctga 37016495  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37016496 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaac-------gagcgtaggcaacaacaccataaaccatgtcataggtgtcaggcgagc 37016588  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37016589 ttctcgcctcataccgctttcactgctctgcaatgatctgc 37016629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 122 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 51686380 - 51686139
Alignment:
Q  122 aatactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcat 221  Q
    |||||||||||||||| |  || || |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  51686380 aatactactggtcctgctgatgttgttggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcatggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatgggtcat 51686281  T
Q  222 ggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgtta 321  Q
    ||||| ||||||||| ||||||      || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  51686280 ggcctaaaaccactgttgaggg------cttatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggtgtca 51686187  T
Q  322 ggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  51686186 ggcgagcttctcgcctcataccgctcccactgttgtgcaatgatctgc 51686139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 151 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 50196567 - 50196355
Alignment:
Q  151 tgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgc 250  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| | ||||      |    
T  50196567 tgcctcctcctcggcctctggcctcacctcctggtcaagatcggtgcgatctgctccctaagatggctcatggcctgaaaccactgttaaggg------c 50196474  T
Q  251 tcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgcca 350  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50196473 tcatgacctcctcctggcccatctgtgcatcagcgtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctccca 50196374  T
Q  351 ctgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  50196373 ctgctgtgcaatgatctgc 50196355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8110410 - 8110176
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |    
T  8110410 ctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcccctcctggccaatatcggcgcgatctgctccctaacatggctcatggcctga 8110311  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
    ||||||| ||||| |      |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  8110310 aaccactactgagag------ctcatgacctcctcctggcccatctgtgcatcagcataggcaacagcggcacgaaatatgtcataggtgtcaggcgagc 8110217  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8110216 ttctcgcctcataccgctcccactgctgtgcaatgatctgc 8110176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 124 - 283
Target Start/End: Original strand, 44674632 - 44674791
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    ||||| ||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44674632 tactagtggtcatggtcctactgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctagtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatgg 44674731  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcag 283  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  44674732 cctgaaaccactaccgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgagcatcag 44674791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 369
Target Start/End: Original strand, 50020515 - 50020730
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    |||||||||| |||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| | | |||| ||||||||| |||||||| |||||||        
T  50020515 tggtgcctcctcctcagcctttggcctcgcctcctggtcaagatcggcgcgatttgctccataagatggctcatggcctgaaaccactactgaggg---- 50020610  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctg 347  Q
      | |||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  50020611 --cccatgacctcctcctggcccatctgtgcatcagtgtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggtgtcaggcaagcttctcgcctcataccgctc 50020708  T
Q  348 ccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||| | |||||||||||||    
T  50020709 ccactgttatgcaatgatctgc 50020730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 46439231 - 46439045
Alignment:
Q  177 cctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactac 276  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||||      |||||||||||||||||  |||  | |    
T  46439231 cctcctggtcaagatcgacgcgatctgctccctaacatgggtcatggcctgaaaccactgttcaggg------ctcatgacctcctcctgatctatatgc 46439138  T
Q  277 gcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  46439137 gcatcaacgcaggcaacaacgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcgtaccgcttccactgctctacaatgatctgc 46439045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 369
Target Start/End: Original strand, 10729822 - 10730026
Alignment:
Q  159 cctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacc 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||| ||  ||||||| |||||| ||||| | || | ||||||||| |||||| || ||||||      |||||||||    
T  10729822 cctcggcctctggcctcacctcttggccaatatcggcgtgatctggtccctaacatagctcatggcctgaaaccattgttgaggg------ctcatgacc 10729915  T
Q  259 tcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctg 358  Q
    ||| ||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  10729916 tccgcctggcccatctgcgcatcagcgtaggcaacaacgccgctaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgccttgtaccgctcccactgctctg 10730015  T
Q  359 caatgatctgc 369  Q
    |||||||||||    
T  10730016 caatgatctgc 10730026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 369
Target Start/End: Original strand, 10943591 - 10943795
Alignment:
Q  159 cctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacc 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||| ||  ||||||| |||||| ||||| | || | ||||||||| |||||| || ||||||      |||||||||    
T  10943591 cctcggcctctggcctcacctcttggccaatatcggcgtgatctggtccctaacatagctcatggcctgaaaccattgttgaggg------ctcatgacc 10943684  T
Q  259 tcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctg 358  Q
    ||| ||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  10943685 tccgcctggcccatctgcgcatcagcgtaggcaacaacgccgctaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgccttgtaccgctcccactgctctg 10943784  T
Q  359 caatgatctgc 369  Q
    |||||||||||    
T  10943785 caatgatctgc 10943795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 50278398 - 50278179
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  50278398 ctggtcctggtcttgctgatggtgcctcctcctcggcctctggccccgcctcctggtcaaaatcggctcgatctgctccctcatatggctcatggcctga 50278299  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
    ||||||||  ||||      ||||||||   |||||||||| | ||  ||||            ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  50278298 aaccactgtagagg------gctcatga---cctcctggcccatctgtgcat------------cagcggcactaaccatgtcataggtgtcaggcgagc 50278220  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  50278219 ttctcgcctcataccgctcccactgctgtgcaatgatctgc 50278179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14317855 - 14317634
Alignment:
Q  142 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 241  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||| ||||||| | |||||| || ||||    
T  14317855 tgctgctggtgcctcctcctcgtcctctggcctcgcctcctggccaacatcggcgcgatctgctctctaacatggctcatggcttgaaaccattgttgag 14317756  T
Q  242 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcata 341  Q
    ||      |||||||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||    
T  14317755 gg------ctcatgacctccgcctggcccatctgcgcgtcagcgtaggcaacagcaccgctaacaatgtcataggtatcacgcgagcttctcgcctcgta 14317662  T
Q  342 ccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  14317661 ccgctcacactgctctgcaataatctgc 14317634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 367
Target Start/End: Original strand, 21535097 - 21535268
Alignment:
Q  190 atcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtagg 289  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| || |||||||||      ||||||||||||||||  || |  |  |||||||||||||    
T  21535097 atcgacgcgatctgctccctaacatggctcatggcctgaaatcattgctgaggg------ctcatgacctcctcctaacccatttgtgcatcagcgtagg 21535190  T
Q  290 caacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatct 367  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||    
T  21535191 caacagcggcactaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcctcataccgctctcactgttgtgcaatgatct 21535268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 72135 - 71962
Alignment:
Q  190 atcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtagg 289  Q
    |||||| |||||| ||| || | |||| ||||||||| |||||| |||||||||      |||||||||| ||||||| | | ||  |||||||| ||||    
T  72135 atcggcacgatctactctctaacatggctcatggcctgaaaccattgctgaggg------ctcatgacctactcctgggccatctgtgcatcagcatagg 72042  T
Q  290 caacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  72041 caacaacgccgctaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcctcgtaccgctcccactactctgcaatgatctgc 71962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 279 - 369
Target Start/End: Original strand, 44676926 - 44677016
Alignment:
Q  279 atcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44676926 atcagcgtaggcaacaacaccataaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctcccactgctctgcaatgatctgc 44677016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 276 - 371
Target Start/End: Original strand, 11081578 - 11081673
Alignment:
Q  276 cgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgccc 371  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11081578 cgcatcaacgtaggcaacatcgccactaaccatgtcacaggtatcaggcgagcttctcgcctcgtaccgcccccactgctctgcaatgatctgccc 11081673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 369
Target Start/End: Original strand, 13624432 - 13624565
Alignment:
Q  233 actgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttct 332  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||   | || ||  || ||||||| |  |||||| ||||||||||||| || ||||| | | ||||||||||    
T  13624432 actgctgaggggtcatgctcatcacctcct---gacccaaaaactcatcagcatgcgcaacaacgccactaaccatatcataggtatcatgcgagcttct 13624528  T
Q  333 cgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13624529 cgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgc 13624565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 50904427 - 50904383
Alignment:
Q  321 aggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgat 365  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  50904427 aggcgagcttctcgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgat 50904383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50904570 - 50904466
Alignment:
Q  139 tcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgct 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||  |  ||||||||  |  ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| | |||||||||    
T  50904570 tcctgctgatggtgcctcctcctcggtctttggcgttgcctcctggctaatatcggcgcgatatgctccctaacatggctcatggcctgataccactgct 50904471  T
Q  239 gaggg 243  Q
    |||||    
T  50904470 gaggg 50904466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 365
Target Start/End: Original strand, 55278615 - 55278812
Alignment:
Q  159 cctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacc 258  Q
    |||||||||| || ||| |||| ||||||  ||||| | ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| |||| ||||         |    
T  55278615 cctcggcctccggcctcgcctcttggtcaatatcggtgtgatatgctccctaatatggtgcatggcctcaaaccattgctcagggttcat---------c 55278705  T
Q  259 tcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctg 358  Q
     ||||||| || | || | ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||| |||  || |||||| | ||    
T  55278706 acctcctgacccatctgctcatcagcataggcaacaacaccactaaccatgtcataagtatcaggcgagcctctcgcctcgtactactcccactgttgtg 55278805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 1305813 - 1305847
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1305813 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 1305847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 6178467 - 6178501
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6178467 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 6178501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 21018282 - 21018316
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21018282 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 21018316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 30723420 - 30723454
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30723420 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 30723454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 31425118 - 31425084
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31425118 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 31425084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 40886459 - 40886509
Alignment:
Q  159 cctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccct 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  40886459 cctcggcctctgggctcgcctcctggtcaatatcggtgcaatctgctccct 40886509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 41795703 - 41795737
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41795703 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 41795737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 49168897 - 49168863
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49168897 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 49168863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 55793367 - 55793333
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55793367 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 55793333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 49093800 - 49093767
Alignment:
Q  2 ccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49093800 ccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 49093767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 233
Target Start/End: Original strand, 11081485 - 11081541
Alignment:
Q  177 cctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaacca 233  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  11081485 cctcctggtcaatatcggcgtgatcttctccctaacatgggtcatggcctgaaacca 11081541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12892152 - 12892088
Alignment:
Q  142 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctc 206  Q
    ||||| || |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  12892152 tgctgctgttgccgcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaatatcggcacgatctgctc 12892088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 228
Target Start/End: Original strand, 41930852 - 41930956
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||| ||||||||| |  ||||| ||||||| || ||| | ||||||| ||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | ||||  |||||    
T  41930852 tactcctggtcctgctgatgctgctggtgccgcctccttgacctctggcctcgcctcctggccaatatcagcgcgatctgctccctaacatggcgcatgg 41930951  T
Q  224 cctca 228  Q
    |||||    
T  41930952 cctca 41930956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 121 - 369
Target Start/End: Original strand, 19037947 - 19038195
Alignment:
Q  121 taatactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtca 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19037947 taatactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcacgatctgctccctcatatgggtca 19038046  T
Q  221 tggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgtt 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  19038047 tggcctcaaaccactgttgaggggtcatgctcatgacctcctcttggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtc 19038146  T
Q  321 aggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038147 aggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 19038195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 28238520 - 28238765
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28238520 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctccccggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 28238619  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  28238620 cctcaaaccactgctgagggctcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 28238719  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28238720 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgtaatgatctgc 28238765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30708317 - 30708072
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30708317 tactactggtcctgatcctgcagatagtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 30708218  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30708217 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcataggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 30708118  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30708117 cgagcttctcgcctcataccgctcccactggtctgcaatgatctgc 30708072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 8450 - 8695
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8450 tactactagtcctgatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 8549  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  8550 cctcaaaccactgttgaggggtcatgctcataacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcacaggtgtcagg 8649  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||    
T  8650 cgagcttctcgcctcataccgctcccactgctattgaatgatctgc 8695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 8577326 - 8577571
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8577326 tactaccggtcctgatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctttgggctcgcctcctggtcaaaatcggcacgatttgctccctcatatgggtcatgg 8577425  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  8577426 cctcaaaccactgttgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactaaccatgtcataggtgtcagg 8577525  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8577526 cgagcttctcgcctcataccgctcccactgctgtgcaatgatctgc 8577571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28879871 - 28879623
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctg---atggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtca 220  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28879871 tactactggtcctgatcctgctgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggatca 28879772  T
Q  221 tggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  28879771 tggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggtaacaacgccactaaccatgtcgtaggtgtc 28879672  T
Q  321 aggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    || |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28879671 agacgagtttctcacctcataccgctcccactggtctgcaatgatctgc 28879623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 130 - 369
Target Start/End: Original strand, 38407644 - 38407883
Alignment:
Q  130 tggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaa 229  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  38407644 tggtcctggtcctactgatggtgcctcctcctcggcctatggcctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaa 38407743  T
Q  230 accactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagct 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  38407744 accactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcttggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccacaaaccatgtcataggtgtcaggcgagct 38407843  T
Q  330 tctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  38407844 tctcgcctcataccgctcccactgctgtgcaatgacctgc 38407883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5200025 - 5199785
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||| |    
T  5200025 ctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcttcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaagatggctcatgacctga 5199926  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5199925 aaccactgctgagggctcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtagacaacggcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagc 5199826  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5199825 ttctcgcctcataccgctcccactgctatgcaatgatctgc 5199785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 129 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7761808 - 7761597
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  7761808 ctggttctggtcctgctgatagtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggtgcgatctgctccttcatatggctcatggcctga 7761709  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7761708 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcaccataaaccatgtcataggtgtcaggcgagc 7761609  T
Q  329 ttctcgcctcat 340  Q
    ||||||||||||    
T  7761608 ttctcgcctcat 7761597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 124 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38971305 - 38971070
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||| ||||||||| |  ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  38971305 tactcctggtcctgctgatgctgctcgtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctcttggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatgggtcatgg 38971206  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||| ||||||||| ||||||      |||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||     
T  38971205 cctgaaaccactgttgaggg------ctcatggcctcctcctgacctatctgcgcatcagcgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgtcaga 38971112  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgat 365  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38971111 cgagcttctcgcttcatatcgctcccactgctctgcaatgat 38971070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 139 - 365
Target Start/End: Original strand, 42937464 - 42937684
Alignment:
Q  139 tcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgct 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |  |  |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| | ||||||| |    
T  42937464 tcctgctgatggtgcctcctcctcagcctctggcctcgcctccttgctaatatcggcgcaatctgctccctaacatggctcatggcctgataccactgtt 42937563  T
Q  239 gaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctc 338  Q
    ||||| ||||||      ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  42937564 gagggctcatgc------cctcctcctggcctatctgtgcattagcgtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcctc 42937657  T
Q  339 ataccgctgccactgctctgcaatgat 365  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||    
T  42937658 gtaccgctcccactgctctgcaatgat 42937684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 177 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 42539004 - 42538818
Alignment:
Q  177 cctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactac 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||||||      ||||||||||||||||| ||||  | |    
T  42539004 cctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccttaacatgggtcatggcctgaaaccactgttgaggg------ctcatgacctcctcctgacctatttgc 42538911  T
Q  277 gcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  42538910 gcatcagcgtaggcaacagcgacactaaccatgtcatttgtgtcaggagagcttctcgcctcgtaccgcttccactgctctacaatgatctgc 42538818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 319
Target Start/End: Original strand, 511433 - 511605
Alignment:
Q  142 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgct-ga 240  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||| ||| ||| |||||||||||  ||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  511433 tgctgctggtgccacctcctcggcctttggcctcgcctcctggtcaagatcggtgcgatctactccctaacatgagtcatggcctgaaaccactgcttga 511532  T
Q  241 ggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgt 319  Q
     ||      |||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  511533 agg------ctcatgacctcctcctggcctatctgcgcattagtgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgt 511605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 369
Target Start/End: Original strand, 8699225 - 8699458
Alignment:
Q  132 gtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaac 231  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |  |  ||||||||| ||| ||| | ||    || |||| || ||    
T  8699225 gtcctaatcctactgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcttggtaatgactggcgcgatccgctgcctaacatcatgcaaggccgcatac 8699324  T
Q  232 cactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttc 331  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||   | || ||  || ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  8699325 aactgctgaggggtcatgctcatcacctcct---gacccaaa-actcatcagcatcggcaacagcgccgctaaccatgtcataggtatcaggcgagcttc 8699420  T
Q  332 tcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  8699421 tcgcctcgtaccgctcccactgctatgcagtgatctgc 8699458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15939881 - 15939692
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||  ||| |||| |||| |||    
T  15939881 tggtgccgcctcctcggcctctggcctcgcctcctgaccaatatcggcgcgatctgctccctaacatggcgcatggcctcagtccattgctcagggctca 15939782  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgct 346  Q
    |         | ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| |||||||    
T  15939781 t---------cacctcctgacccaactactcatcaacataggcaacaacgcctctaaccatgtcataggtatcatgcgagcttctcgcctcgtaccgct 15939692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 365
Target Start/End: Original strand, 40622822 - 40623033
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||  |||| |||||||||||| || | |||| ||||||||| |||||| || |||||         
T  40622822 tggtgcctcctcctcggcctctggccttgcctcctggccaatatcgccgcgatctgctctctaacatggctcatggcctgaaaccattgttgagg----- 40622916  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctg 347  Q
     |||||||||||||  ||| || | || | |||| || ||||||||| | |  ||||||||||| || || | | |||||||||||||||| |||||||     
T  40622917 -gctcatgacctccgtctgacccatctgcacatctgcataggcaacaacactgctaaccatgtcatatgtatcaagcgagcttctcgcctcgtaccgctc 40623015  T
Q  348 ccactgctctgcaatgat 365  Q
     ||||||||| |||||||    
T  40623016 tcactgctcttcaatgat 40623033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 157
Target Start/End: Original strand, 27662565 - 27662598
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctcc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27662565 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctcc 27662598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 8345 - 8379
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8345 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 8379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 8577221 - 8577255
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8577221 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 8577255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 19037827 - 19037861
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19037827 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 19037861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 27662460 - 27662494
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27662460 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 27662494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 28238412 - 28238446
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28238412 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 28238446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 48406628 - 48406383
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406628 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 48406529  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  48406528 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 48406429  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406428 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 48406383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 9368189 - 9368434
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368189 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 9368288  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  9368289 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 9368388  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368389 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 9368434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41883810 - 41883565
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883810 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 41883711  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  41883710 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 41883611  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883610 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 41883565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 15071070 - 15071315
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15071070 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcttatgggtcatgg 15071169  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  15071170 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagctccactaaccatgtcataggtgtcagg 15071269  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15071270 cgagcttctcgcctcataccgctcccactgctctgcaatgatctgc 15071315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 17460049 - 17460294
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460049 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtaaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 17460148  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  17460149 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgctcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 17460248  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460249 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 17460294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17593165 - 17592920
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17593165 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtaaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 17593066  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  17593065 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgctcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 17592966  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592965 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 17592920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 35607178 - 35607423
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35607178 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 35607277  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  35607278 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 35607377  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35607378 cgagcttctcgcctcataccgctgtcactgctctgcaatgatctgc 35607423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 122 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17838225 - 17837979
Alignment:
Q  122 aatactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcat 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17838225 aatactactggtcttgatcctgctgatggtgccccctcctcggcctttgggctcgccttctggtcaaaatcagcgcgatctgctccctcatatggctcat 17838126  T
Q  222 ggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgtta 321  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  17838125 ggcctgaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaagtgcgcatcagcgtagacaacagcgccactaaccatgtcataggtgtca 17838026  T
Q  322 ggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctg 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17838025 ggcgagcttctcgcctcataccgctcccactgctctgcaatgatctg 17837979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 130 - 369
Target Start/End: Original strand, 5538344 - 5538583
Alignment:
Q  130 tggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaa 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5538344 tggtcctggtcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctgaa 5538443  T
Q  230 accactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagct 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5538444 accactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacaccacaaaccatgtcataggtgtcaggcgagct 5538543  T
Q  330 tctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5538544 tctcgcctcataccgctcccactgctctgcaatgatctgc 5538583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 124 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10522100 - 10521859
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10522100 tactactggtcctgatcctgttgatggtgcctcctcctcggcctatgggcttgcctcctggtcaaaattggcgcgatctggtccctcatatggctcatgg 10522001  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  10522000 cctcaaaccacttctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaaccgcgcatcagcgtaggcaacaacgctactaaccatgtcataggtgtcagg 10521901  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgat 365  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10521900 cgagcttctcacctcataccgctcccactgctctgcaatgat 10521859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 191 - 369
Target Start/End: Original strand, 42504788 - 42504966
Alignment:
Q  191 tcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggc 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42504788 tcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaattgcgcatcagcgtaggc 42504887  T
Q  291 aacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42504888 aacaacgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctcccactggtctgcaatgatctgc 42504966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Original strand, 47521769 - 47522009
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |    
T  47521769 ctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagacaggcgcgatctgctccctaagatggctcatggcctaa 47521868  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47521869 aaccactgttgaggggtcatgctcgtgacctcctcctggcctaactgctcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagc 47521968  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47521969 ttctcgcctcataccgctcccactgctgtgcaatgatctgc 47522009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13323303 - 13323059
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||| ||||| |  |||||||||| |||||| ||||   ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13323303 tactactggtcctggtcctggtcctggtgcctcctcctcggtctctatcctcgcctcctggtcataattggcgcgatctgctccctcatatggctcatgg 13323204  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| | |    
T  13323203 cctgaaaccactactgaggggtcatgctcatgacctcctcctggtc-aactgcgcatcagcgtaggtaacagcgccaaaaaccatgtcataggtgtcaag 13323105  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  13323104 tgagcttctcgcctcataccgctcccactgttgtgcaatgatctgc 13323059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Original strand, 27450510 - 27450717
Alignment:
Q  159 cctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacc 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450510 cctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagataggcgcgatctgctccctaagatgactcatggcctgaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacc 27450609  T
Q  259 tcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctg 358  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  27450610 tcctcctggcctaactgctcataagcttaggcaacaacg-cactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctcccactgttgtg 27450708  T
Q  359 caatgatct 367  Q
    |||||||||    
T  27450709 caatgatct 27450717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 125 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 34741981 - 34741762
Alignment:
Q  125 actactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggc 224  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34741981 actactggtcatggtcctgctaatggtgcctccttctcggcccctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggc 34741882  T
Q  225 ctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggc 324  Q
    || |||||||||||||||      ||||||||   |||||||||| | ||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || |    
T  34741881 ctgaaaccactgctgagg------gctcatga---cctcctggcccatctgtgcatcaacgtaggcaacaacgacactaaccatgtcataggtgtcagac 34741791  T
Q  325 gagcttctcgcctcataccgctgccactg 353  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  34741790 gagcttctcgcctcataccactcccactg 34741762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 148 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37343490 - 37343275
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| ||| |||||| ||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||||        
T  37343490 tggtgcctcctcatcggcttctggcctcgcctcctagtcaagatcggcgcgatctgcttcctaacatgggtcatggtctgaaaccactgttgaggg---- 37343395  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctg 347  Q
      ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||     
T  37343394 --ctcatgacctcctcctgacctatctgcgcatcagcgtaggcaacaacgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgccttgtaccgctc 37343297  T
Q  348 ccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  37343296 tcactgctctgcaatgatctgc 37343275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41734992 - 41734753
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||| ||||||||| |  ||||| |||||||||| ||| | ||| ||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  41734992 tactcctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctccttgacctatgaactcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgttccctaacatgggtcatgg 41734893  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||| ||||||||||||| ||      ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||     
T  41734892 cctgaaaccactgctgaagg------ctcatgacctcctcctgacctatatgcgcatcagcgtaggcaacaacgacactaaccatgtcataggtgtcaga 41734799  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41734798 cgagcttctcacctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgc 41734753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 129 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16680718 - 16680486
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| |    
T  16680718 ctggtcctgctaatgctgctggtgcctcctcctcggcctctgacctcgcctcctgatcaagatcggcgcgatctactccctaagatggctcatggcctga 16680619  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
    |||||||| ||||||      |||||||||||||||||||  |  |  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  16680618 aaccactgttgaggg------ctcatgacctcctcctggctcatttgtgcatcagcgtagacaacagcggcactaaccatgtcataggtgtcagacgagc 16680525  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatct 367  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  16680524 ttctcgcctcataccgcttccactgttgtgcaatgatct 16680486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 129 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17654954 - 17654722
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| |    
T  17654954 ctggtcctgctaatgctgctggtgcctcctcctcggcctctgacctcgcctcctgatcaagatcggcgcgatctactccctaagatggctcatggcctga 17654855  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
    |||||||| ||||||      |||||||||||||||||||  |  |  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  17654854 aaccactgttgaggg------ctcatgacctcctcctggctcatttgtgcatcagcgtagacaacagcggcactaaccatgtcataggtgtcagacgagc 17654761  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatct 367  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  17654760 ttctcgcctcataccgcttccactgttgtgcaatgatct 17654722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 369
Target Start/End: Original strand, 47670017 - 47670235
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||| |  |||||||||||||| | ||| | ||    || |||| || || |||||||||||||||    
T  47670017 tggtgcctcctcctcggcctctggcatcgcctcctggtaattatcggcgcgatctggtgcctaacatcatgcaaggccgcatacaactgctgaggggtca 47670116  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctg 347  Q
    ||||||| |||||||   | || ||  || |||| || | ||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||     
T  47670117 tgctcatcacctcct---gacccaaaaactcatcggcatgggcaacatcgccgctaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcctcgtaccgctc 47670213  T
Q  348 ccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47670214 ccactgctctgcaatgatctgc 47670235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16488584 - 16488400
Alignment:
Q  177 cctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactac 276  Q
    |||||| ||||  ||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||||||      |||||||||||||| || || | ||      
T  16488584 cctcctagtcaagatcagcgtgatcggctccctaacatggctcatggcctgaaaccactgttgaggg------ctcatgacctcctcttgacccatctgt 16488491  T
Q  277 gcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatct 367  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16488490 gcatcagcgtaggcaacaacgacactaaccatgtcatagctatcaggcgagcttctcgcatcgtaccgctcccactgctgtgcaatgatct 16488400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19801740 - 19801568
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||||||  |||| ||| ||||||||||| | |||| ||||| ||| |||||||| |||||||        
T  19801740 tggtgcctcctcctcggcctctggccttgccccctggtcaagatcgacgcaatctgctccctaagatggttcatgacctgaaaccactactgaggg---- 19801645  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcga 326  Q
      |||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19801644 --ctcatgacctcctcctggaccatctgtgcatcagcgtaggcaacagtgacactaaccatgtcataggtgtcaggcga 19801568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36980805 - 36980583
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| |  ||||| | |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||| || | |||| ||||||||| |    
T  36980805 ctggtcctgctgatgctgttcgtgcctcctcctcggcctctggtctcgcctcctggccaatatcggcgcgatcttctctctaacatggctcatggcctaa 36980706  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
    ||||| || ||||||      |||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||            || ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  36980705 aaccattgttgaggg------ctcatgacctcctcctggcccatctgtgcattagcg------------ccgctaaccatgtcataggtatcaggcgagc 36980624  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36980623 ttctcgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgc 36980583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 346
Target Start/End: Original strand, 11630152 - 11630290
Alignment:
Q  190 atcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtagg 289  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| ||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||        
T  11630152 atcggcgcgatctgctccctaacatgggtcctgacctgaaaccactgctgaggg------ctcatgacctccttctggcctaactgtgcatcagcgg--- 11630242  T
Q  290 caacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgct 346  Q
             ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11630243 ---------cactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttttcgcctcataccgct 11630290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 205
Target Start/End: Original strand, 9491796 - 9491859
Alignment:
Q  142 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgct 205  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  9491796 tgctggtggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcctcctggtaatgatcggcgcgatctgct 9491859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 9368073 - 9368107
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9368073 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 9368107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 17459933 - 17459967
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17459933 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 17459967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 17593281 - 17593247
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17593281 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 17593247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 35607062 - 35607096
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35607062 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 35607096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 41883926 - 41883892
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41883926 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 41883892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 48406744 - 48406710
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48406744 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 48406710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 121 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 46401978 - 46401730
Alignment:
Q  121 taatactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtca 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401978 taatactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggttctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtca 46401879  T
Q  221 tggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgtt 320  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  46401878 tggcctcaaaccactgttgagggatcatgctcatgacctcctcttggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtc 46401779  T
Q  321 aggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401778 aggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 46401730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34048695 - 34048450
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34048695 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 34048596  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  34048595 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 34048496  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34048495 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 34048450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 42900943 - 42901188
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42900943 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 42901042  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  42901043 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 42901142  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42901143 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 42901188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 54389395 - 54389150
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54389395 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 54389296  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  54389295 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcataggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 54389196  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54389195 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 54389150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 2648359 - 2648604
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2648359 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 2648458  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2648459 cctcaaaccactgctaaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 2648558  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  2648559 cgagcttctcgcctcataccgctcccattggtctgcaatgatctgc 2648604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 50477560 - 50477805
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50477560 tactactggtcatgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcagcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 50477659  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  50477660 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 50477759  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50477760 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 50477805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Original strand, 46698103 - 46698343
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698103 ctggtcttgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 46698202  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  46698203 taccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtatgcaatagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagc 46698302  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698303 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 46698343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 2271839 - 2272084
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  2271839 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctcgcctcctagtcaaaattggcgtgatctgcttcctcatatggctcatgg 2271938  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2271939 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcataggcaacagcgccactaatcatgtcataggtgttagg 2272038  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2272039 cgagcttctcgcctcataccgctcccactggtctgcaatgatctgc 2272084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 49141313 - 49141546
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141313 tactactagtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 49141412  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||            ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  49141413 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcat------------cagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 49141500  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141501 cgagcttcccgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 49141546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 139 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16646750 - 16646520
Alignment:
Q  139 tcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgct 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  16646750 tcctgctgatggtgcctcctcctcgacctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcacgatctgctccctcatatggctcatggcctgaaaccactgtt 16646651  T
Q  239 gaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctc 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| | |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16646650 gaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaattgcgcatcagtgtaggaaacaacaccataaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctc 16646551  T
Q  339 ataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16646550 ataccgctcccactgctctgcaatgatctgc 16646520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Original strand, 47070974 - 47071215
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  47070974 ctggtcccggtcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcatcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctga 47071073  T
Q  229 aa-ccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgag 327  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||  || |||||| ||| ||| |||||||    
T  47071074 aaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgcaggcaacaacaccataaaacatgtcatagatgtcaggcgag 47071173  T
Q  328 cttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47071174 tttctcgcctcataccgctcccactgctctgcaatgatctgc 47071215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 130 - 369
Target Start/End: Original strand, 50213956 - 50214195
Alignment:
Q  130 tggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaa 229  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||    
T  50213956 tggtcctggtcctgttgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctagtcaaaatcggcgcgatctgctctcttatatggctcatggcctgaa 50214055  T
Q  230 accactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagct 329  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||| |||    
T  50214056 accacagctgatgggtaatgcttatgaccttctcctggcctaactgcgcatcaacgtaggcaacaacgccacaatccatgtcataggtgttaggcgggct 50214155  T
Q  330 tctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  50214156 tctcgcctcataccgctcccactgctgtgcaatgatctgc 50214195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 4005197 - 4005439
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4005197 tactactggtcctggtcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctggccttgcctcttggtcaagatcggcacgatctgctccctcatatgggtcatgg 4005296  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || | ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||    
T  4005297 cctgaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcat---gggccaactgtgcatcagcgtaggcaacaacgccgctaaccatgtcgtaggcgtcagg 4005393  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||    
T  4005394 cgagcttctcgcctcgtaccgctcccaccggtctacaatgatctgc 4005439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9473531 - 9473304
Alignment:
Q  139 tcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgct 238  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9473531 tcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctgacctcgcctcctagtcaagatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctgaaactactgct 9473432  T
Q  239 gaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctc 338  Q
     |||||||||||||||||| ||||    ||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9473431 aaggggtcatgctcatgacatccta---gcccaactgtgcatcagcgtaggcaacagcaccgctaaccatatcgtaggtgtcaggcgagcttctcgcctc 9473335  T
Q  339 ataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9473334 ataccgctctcactgctctgcaatgatctgc 9473304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 125 - 369
Target Start/End: Original strand, 17562130 - 17562371
Alignment:
Q  125 actactggtcctgatcctgctgatg---gtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcat 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||        |||||||||||  || ||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  17562130 actactggtcctggtcctgctgatgctggtgcctcctcctcggcctcg-------cctcctggtcaagataggcgcgatctgctccctaagatggctcat 17562222  T
Q  222 ggcctcaaaccactgctgagggg-tcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgtt 320  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  17562223 ggcctgaaaccattgctgagggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactaaccatgtcataggtgtc 17562322  T
Q  321 aggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17562323 aagcgagcttctcgcctcataccgctcccactgctttgcaatgatctgc 17562371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20353800 - 20353566
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |    
T  20353800 ctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgtctcctggtcatgatcggcgcgatctgctccccaagatgggtcatggcctga 20353701  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
    |||||||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20353700 aaccactgatgaggg------ctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaagcaacaacgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagc 20353607  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20353606 ttctcgtctcataccgctcccactgctgtgcaatgatctgc 20353566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Original strand, 49266177 - 49266393
Alignment:
Q  149 ggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcat 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  |  ||||| ||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  49266177 ggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagacaggcgcaatctgctccctaagatggctgatggcctgaaaccactgctaaggggtcat 49266276  T
Q  249 gctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgc 348  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||| |||||||| |    
T  49266277 gctcatgacctcctcatggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacatcgccactaaccatgtcataagtgtcagacgagcttctcgcctaataccgctcc 49266376  T
Q  349 cactgctctgcaatgat 365  Q
    ||||||| |||||||||    
T  49266377 cactgctatgcaatgat 49266393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 126 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 600133 - 599892
Alignment:
Q  126 ctactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctct-------cctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggt 218  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  600133 ctactggtcctggtcctactgatggtggctcctcctcggcctctggcctctagcctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggct 600034  T
Q  219 catggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtg 318  Q
    |||||||| |||||||||||| |||      ||||||||||| |   || | ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  600033 catggcctgaaaccactgctggggg------ctcatgacctctt---gggccaactgtgcatcagtgtaggcaacagcggcactaaccatgtcgtaggtg 599943  T
Q  319 ttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  599942 tcaggcgagcttctcgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgc 599892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Original strand, 52388401 - 52388626
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52388401 ctggtcctggtcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagattggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctga 52388500  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||| ||||  ||||            || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52388501 aaccactgctaaggggtcatgttcatga---cctcctggcccaactgtgcat------------caacgccgctaaccatgtcgtaggtgtcaggcgagc 52388585  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  52388586 ttctcgcctcgtaccgctcccacttgtctgcaatgatctgc 52388626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 148 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41615495 - 41615286
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  41615495 tggtgcctcctcctcggcctctggcctcacctcctggtcaagatcggcgcaatctgctccctaagatggctcatggcctgaaaccactgttgagggctca 41615396  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctg 347  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||            ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  41615395 tgcacatgacctcctcctggcctaactgcgcat------------cagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctt 41615308  T
Q  348 ccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||| | |||||||||||||    
T  41615307 ccactgttgtgcaatgatctgc 41615286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 44232957 - 44232736
Alignment:
Q  142 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 241  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||| ||||    
T  44232957 tgctgctggtgcctcctcctcgacctatgggctcgcctcctggtcaagatcggcgcgttctgctccctaagatggcttatggcctgaaaccactgttgag 44232858  T
Q  242 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcata 341  Q
    ||      ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  44232857 gg------ctcatgacctcctcctggcctaattgcacatcagcgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcacctcata 44232764  T
Q  342 ccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  44232763 ccgctcccactgatgtgcaatgatctgc 44232736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 308
Target Start/End: Original strand, 16861577 - 16861743
Alignment:
Q  142 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 241  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||| |||| |||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16861577 tgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctgttcaagatcagcgcaatctgctctctaagatggctcatggcctgaaaccactgctgag 16861676  T
Q  242 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16861677 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgtgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccat 16861743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 124 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36130740 - 36130514
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | || ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36130740 tactactggtcctggtcgtgctgatggtgcctcctcctcggcctctggccttgcatcttggtcaagatcggcgcgatctgctccctcatatgcgtcatgg 36130641  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||  ||||            ||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  36130640 actgaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacc---tcctggcccaactgtgcat------------cagcgccgctaaccatgtcgtaggtgtcaga 36130556  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgat 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||    
T  36130555 cgagcttctcgcctcttaccgctccaactggtctgcaatgat 36130514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 124 - 342
Target Start/End: Original strand, 11380825 - 11381037
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||| ||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||| ||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||     
T  11380825 tactcctggtcctgttgatgctgctggtgcctcctcctcggcctttggcctcgcttcctagtcaagatcgccgcgatctgctccctaacatgggtcatga 11380924  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  11380925 cctgaaaccactgctgagga------ctcatgacctcctcctgtcctatctgcgcatcagcgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgttagg 11381018  T
Q  324 cgagcttctcgcctcatac 342  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  11381019 cgagcttcacgcctcatac 11381037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6928365 - 6928150
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| | | | |||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  6928365 tggtgcatcctccttggcatctggcctcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacacgagtcatggcctgaaaccactgctgagggatca 6928266  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctg 347  Q
    ||      || |||||||| |||| || ||||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| |||| |||||||     
T  6928265 tg------acatcctcctgacctatctgcgcatcagcgtaggcaactacgacactaaccatgccataggtgtcaggcgaacttctcacctcgtaccgctc 6928172  T
Q  348 ccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  6928171 ccaccgctctgcaatgatctgc 6928150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48891775 - 48891544
Alignment:
Q  130 tggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaa 229  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||| ||  ||| |||  ||  |||| |||||||||||| || | |||| ||||||||| ||    
T  48891775 tggtcctgatgatgctgctggtgcctcctcctcagcctctggccttgccttctgaccaatatcgacgcgatctgctctctaacatggctcatggcctgaa 48891676  T
Q  230 accactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagct 329  Q
    |||| |||||||||      ||||||||||||| |||||  | ||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  48891675 accattgctgaggg------ctcatgacctccttctggctcatctgtgcatcagcgtaggcaacaacgccgctaaccatgtcataggtatcaggcgagct 48891582  T
Q  330 tctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatct 367  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  48891581 tctcgcctcgtaccgctcccactgctcagcaatgatct 48891544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 42759889 - 42759681
Alignment:
Q  142 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 241  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42759889 tgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcttggtcaagatcggcgcgatgtgctcccttacatgggtcatggcctgaaaccactgctgag 42759790  T
Q  242 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcata 341  Q
    |      | |||||||||||||||| |||| || |||||            ||||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||     
T  42759789 g------gttcatgacctcctcctgacctatctgcgcat------------cagcggcactaaccatgtcatgggtgtcagacgagcttctcgcctcatg 42759708  T
Q  342 ccgctgccactgctctgcaatgatctg 368  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  42759707 ccgctcccactactgtgcaatgatctg 42759681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48566060 - 48565959
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  48566060 tggtgcctcctcctcggcctctggcctaccctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatgggtcatggcctgcaaccactgctgagggctca 48565961  T
Q  248 tg 249  Q
    ||    
T  48565960 tg 48565959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 365
Target Start/End: Original strand, 30252886 - 30253118
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| |  |||||||||||||||| ||| | ||    || |||| ||    
T  30252886 ctggtcctggtcctgctg---gtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctccaggtaatgatcggcgcgatctgctgcctaacatcatgcaaggcccca 30252982  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaacta--cgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcga 326  Q
     || |||||||||||||||||||||| |||||||   | || ||  |  | ||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  30252983 tacaactgctgaggggtcatgctcatcacctcct---gacccaaaaaaactcattagcatgggcaacagcgccgctaaccatgtcataggtatcaggcga 30253079  T
Q  327 gcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgat 365  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  30253080 gcttctagcctcgtaccgctcccactgctctacaatgat 30253118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Original strand, 42804765 - 42804989
Alignment:
Q  142 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 241  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |  || |||||||||| || ||| | ||    || |||| || || | |||||||    
T  42804765 tgctgttggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtaatgattggcgcgatctactgcctaacataatgcaaggccacatacaattgctgag 42804864  T
Q  242 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcata 341  Q
    |||||||||||||   | ||||||| || ||  || |||| || | ||||| ||||||| ||||||| || ||||| | | |||||||||| ||||| ||    
T  42804865 gggtcatgctcat---cccctcctgacccaaaaactcatcggcatgggcaatagcgccagtaaccatatcataggtatcatgcgagcttcttgcctcgta 42804961  T
Q  342 ccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  42804962 ccgctcccactgctctacaatgatctgc 42804989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 48565948 - 48565894
Alignment:
Q  315 ggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  48565948 ggtgtcaggcgagcttctcgcctcgtactgctcccactgctctgcaatgatctgc 48565894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 34048819 - 34048785
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34048819 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 34048785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 42900827 - 42900861
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42900827 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 42900861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 46402098 - 46402064
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46402098 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 46402064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 46697984 - 46698018
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46697984 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 46698018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 49141189 - 49141223
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49141189 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 49141223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 50477452 - 50477486
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50477452 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 50477486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 54389519 - 54389485
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54389519 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 54389485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1055796 - 1055551
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055796 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 1055697  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  1055696 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 1055597  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055596 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 1055551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 23019074 - 23019319
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019074 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 23019173  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  23019174 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 23019273  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019274 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 23019319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26662717 - 26662472
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662717 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 26662618  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26662617 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 26662518  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662517 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 26662472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 124 - 367
Target Start/End: Original strand, 42482293 - 42482536
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42482293 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 42482392  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  42482393 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcataactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 42482492  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatct 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42482493 cgagcttatcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatct 42482536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 486520 - 486765
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  486520 tactactggtcctgatcctaataatggagcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 486619  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  486620 cctcataccactgctgtggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 486719  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  486720 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 486765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 15033552 - 15033797
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15033552 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 15033651  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15033652 cctcaaaccactactgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaattgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 15033751  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  15033752 cgagcttctcgcctcatactgctcccactgatctgcaatgatctgc 15033797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 133 - 369
Target Start/End: Original strand, 22292 - 22528
Alignment:
Q  133 tcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaacc 232  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22292 tcctgatcttgatgatggtgcctcctcctcggcctttgggctctcctccaggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcatacc 22391  T
Q  233 actgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttct 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  22392 actgctgaggggtcatgctcatgacctcctccccgcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcctct 22491  T
Q  333 cgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22492 cgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 22528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 34819403 - 34819642
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||| ||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  34819403 tactcctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatgggttatgg 34819502  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||    
T  34819503 cctgaaaccactgctgaggg------ctcatgacctcctcctgacctatctgcgtatcagcgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgtcagg 34819596  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34819597 cgagcttctcgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgc 34819642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 148 - 371
Target Start/End: Original strand, 40075517 - 40075734
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||        
T  40075517 tggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcatggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatgggtcatggcctgaaaccactgctgaggg---- 40075612  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctg 347  Q
      |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  40075613 --ctcatgacctcctcctggcctatctgcgcattagcgtaggcaacagtagcactaaccatgtcataggtgttaggcgagcttctcgcctcgtaccgctc 40075710  T
Q  348 ccactgctctgcaatgatctgccc 371  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  40075711 tcactgctctgcaatgatctgccc 40075734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 221 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 43214557 - 43214409
Alignment:
Q  221 tggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgtt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  43214557 tggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtatc 43214458  T
Q  321 aggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  43214457 aggcgagcttctcgcctcataccgctcccactggtctgcaatgatctgc 43214409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Original strand, 34367416 - 34367642
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  34367416 ctggtcctggtcctgctgatgctgcctcctcctcggcccctggcctcgcctcctggtcaaaatcagcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctga 34367515  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              || ||| | |||  ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  34367516 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaact--------------gcgacaacaccataaaccatgtcataggtttcaggcgagc 34367601  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34367602 ttctcgcctcataccgctctcactgctctgcaatgatctgc 34367642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Original strand, 39831543 - 39831783
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| |  ||||| || ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  | |||| | |||||||      
T  39831543 ctggtcctgctgatgctgctgttgcatcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagataggcgcgatctgctcccaaagatggcttatggcctgg 39831642  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||   ||||||    
T  39831643 aaccactgctgaggggtcatgctcatggcctcctcctggcctaactgctcatcagcataggcaacaacgccactaaccatgtcataggagtccagcgagc 39831742  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  39831743 ttctcgcctcataccgctcccactcctgtgcaatgatctgc 39831783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20859259 - 20859040
Alignment:
Q  142 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 241  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20859259 tgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcttggtcaagatcggcgcgatttgctccctaagatggctcatggcctgaaaccactgctgag 20859160  T
Q  242 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcata 341  Q
    ||      |||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20859159 gg------ctcatgacctcctcctggcccatctgtgcatcagtgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgtcagtcgagcttctcgcctcata 20859066  T
Q  342 ccgctgccactgctctgcaatgatct 367  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20859065 ccgctcccactgctgtgcaatgatct 20859040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 148 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35554828 - 35554613
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||        
T  35554828 tggtgcctcctcctcggcctctgtcctcgcctcctggtcaaaatcggcacgatctgctccctaacatgggtcatggcctgaaaccattgctgaggg---- 35554733  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctg 347  Q
      ||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||     
T  35554732 --ctcatgaactcctcctgacctatttgcgcatcagcgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttcttgcctcgtaccgctc 35554635  T
Q  348 ccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  35554634 tcactgctctgcaatgatctgc 35554613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Original strand, 30761083 - 30761304
Alignment:
Q  142 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 241  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  30761083 tgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggccaatatcggcgcgatctgctccctaacatggctcatggcctgaaaccactgttgag 30761182  T
Q  242 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcata 341  Q
    ||      |||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  30761183 gg------ctcatgacctcctcctggcacatctgtgcatcagcgtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcacctcata 30761276  T
Q  342 ccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  30761277 ccgcttccactgctgtgtaatgatctgc 30761304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 365
Target Start/End: Original strand, 5301130 - 5301335
Alignment:
Q  142 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 241  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5301130 tgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctagtcaagatcggcgcgatctactccctaacatggatcatggcctgaaaccactgctgag 5301229  T
Q  242 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcata 341  Q
    |      |||||||||||||||||||||||||| |||||            ||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5301230 g------gctcatgacctcctcctggcctaactgcgcat------------cagtggcactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcata 5301311  T
Q  342 ccgctgccactgctctgcaatgat 365  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  5301312 ccgctcccactgctgtgcaatgat 5301335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 236
Target Start/End: Original strand, 41239347 - 41239453
Alignment:
Q  130 tggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaa 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  41239347 tggtcctggtcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcacgatctgctccctcatatggctcatggcctgaa 41239446  T
Q  230 accactg 236  Q
    |||||||    
T  41239447 accactg 41239453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 150 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 52320 - 52107
Alignment:
Q  150 gtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatg 249  Q
    ||||| || ||||||| | ||| ||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||  | | |||| ||||||||| |||||| |||||||||          
T  52320 gtgccccctcctcggcatgtggcctcgcctcctggccaatatcggcgtgatctgctctttaacatggctcatggcctgaaaccattgctgaggg------ 52227  T
Q  250 ctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgcc 349  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||  ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  52226 ctcatgacctcctccaggcccatctgtgcatcagagtaggcaacaacgccgctaaccatgtcatagatatcaggtgagcttctcgcctcgtaccgctccc 52127  T
Q  350 actgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52126 actgctctgcaatgatctgc 52107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 253 - 365
Target Start/End: Original strand, 41243000 - 41243112
Alignment:
Q  253 atgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccact 352  Q
    ||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41243000 atgacctcctcctggcccatctgtgcatcagggtaggcaacagcggcactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcgtaccgctcccact 41243099  T
Q  353 gctctgcaatgat 365  Q
    |||||||| ||||    
T  41243100 gctctgcagtgat 41243112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 45132982 - 45132766
Alignment:
Q  142 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 241  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| || | ||||  ||||||||||  ||| |||| ||    
T  45132982 tgctgctggtgccgcctcctcggcctctggcctctcctcctggccaatatcggcgtgatctgctctcttacatggcgcatggcctcagtccattgctcag 45132883  T
Q  242 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcata 341  Q
    || ||||         | ||| ||| || |||| | ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||| ||    
T  45132882 ggctcat---------cacctgctgacccaactgctcatcagcataggcaataacgccgctaaccatgtcataggcatcaggcgagcttctcgcctcgta 45132792  T
Q  342 ccgctgccactgctctgcaatgatct 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45132791 ccgcttccactgctctgcaatgatct 45132766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5680014 - 5679888
Alignment:
Q  238 tgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcct 337  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   | || || ||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  5680014 tgaggggtcatgctcatcacctcct---gacccaaatactcatcagcatgggcaacagcgccagtgaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcct 5679918  T
Q  338 cataccgctgccactgctctgcaatgatct 367  Q
    | ||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  5679917 cgtaccgctcccaatgctgtgcaatgatct 5679888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39604393 - 39604314
Alignment:
Q  288 ggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatct 367  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39604393 ggcaacagcaccataaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctcacactgctctgcaatgatct 39604314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 317
Target Start/End: Original strand, 12716106 - 12716257
Alignment:
Q  159 cctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacc 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  |||  |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | |||||| || ||||        |||||||||    
T  12716106 cctcggcctctggcctcgcctccta-tcaatatcggcgcgatctgctccctaacatggctcatggcttgaaaccattgttgagaa------ctcatgacc 12716198  T
Q  259 tcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggt 317  Q
    |||||||| || | || ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  12716199 tcctcctgacccatctgcgcatcagcataggcaatagcggcactaaccatgtcataggt 12716257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 22155 - 22189
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22155 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 22189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 1055912 - 1055878
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1055912 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 1055878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 23018958 - 23018992
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23018958 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 23018992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 26662833 - 26662799
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26662833 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 26662799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 42482177 - 42482211
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42482177 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 42482211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6204419 - 6204174
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6204419 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 6204320  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6204319 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 6204220  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6204219 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 6204174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 11691386 - 11691141
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11691386 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 11691287  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  11691286 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 11691187  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11691186 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 11691141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 30826405 - 30826650
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826405 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 30826504  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30826505 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 30826604  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826605 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 30826650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22304500 - 22304255
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304500 tactactgggcctgatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 22304401  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22304400 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 22304301  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22304300 cgagcttctcgcctcataccgctcccactggtctgcaatgatctgc 22304255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27639018 - 27638773
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27639018 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 27638919  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  27638918 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactgaccatgtcataggtgtcagg 27638819  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638818 cgaacttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 27638773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31771326 - 31771092
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  31771326 tactattgttcctggtcctgctgatgttgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcgtgatctgctccctaatatggctcatgg 31771227  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||           |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |    
T  31771226 cctgaaaccactgctgaggggtcatg-----------ctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccacaaaccatgtcataggtgtcaag 31771138  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  31771137 cgagtttctcacctcatactgctcccactgctgtgcaatgatctgc 31771092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26173162 - 26172942
Alignment:
Q  142 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 241  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||| | ||| |||| || |||  |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26173162 tgctgctggtgccttctcctcggcctctagcctcgcctcatgatcaagatcggcgcgatctgctcc-taagatggctcatggcctaaaaccactgctgag 26173064  T
Q  242 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcata 341  Q
    ||      |||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26173063 gg------ctcatgaccttctcctggccaatctgtgcatcagcgtaggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgtcaggtgagcttctcgcctcata 26172970  T
Q  342 ccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26172969 ccgctcccactgctgtgcaatgatctgc 26172942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3502228 - 3502038
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccac--------tgctg 239  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||| |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||        |||||    
T  3502228 tggtgcttcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagataggcgtgatctgctccctaagatggctcatggcctgaaaccacgaaaccactgctg 3502129  T
Q  240 aggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagctt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  3502128 aggggtcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcatcagtgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtggcaggcgagctt 3502038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 311
Target Start/End: Original strand, 2405836 - 2406024
Alignment:
Q  122 aatactactggtcctgatcctgctgatg------gtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatg 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||      |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||| | | |||    
T  2405836 aatactactggtcctggtcctgctgatgttgctggtgcctcctcctcggcctctagcctcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccgtaacatg 2405935  T
Q  216 ggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtc 311  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  2405936 ggtcatggcctgaaaccactactgagg------gctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcaacgttgg-aacagcggcactaaccatgtc 2406024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 319
Target Start/End: Original strand, 24885426 - 24885615
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||| ||||||||| |  ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||    
T  24885426 tactcctggtcctgctgatgctgctggtgcctccttctcggcctctggcctcgcctcctgctcaagatcggtgcgatccgctccctaacatgggtcatgg 24885525  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgt 319  Q
    ||| |||| ||||||||||      |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24885526 cctgaaacaactgctgagg------gctcatgacctcctcctgacctatctgcgcatcatcgtaggcaacagcgacactaaccatgtcataggtgt 24885615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 366
Target Start/End: Original strand, 32641675 - 32641890
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||| | ||    || |||| || || |||||||||||||||    
T  32641675 tggtgcctcctcctcggtctctggcctcgcctcctggtaatgatcggcgcgatctgctgcctaacatcatgcaaggccgcatacaactgctgaggggtca 32641774  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctg 347  Q
    ||||||| |||||||   | || ||  || ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||     
T  32641775 tgctcatcacctcct---gacccaaaaactcatcagcatgggcaacaacgccgctaaccatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcctcgtaccgctc 32641871  T
Q  348 ccactgctctgcaatgatc 366  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32641872 ccactgctctgcaatgatc 32641890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 368
Target Start/End: Original strand, 18001622 - 18001836
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    |||||||||| |||||||||||   ||| |||||||| ||  || |||||||||||||| || | |||| ||||||||| |||||| || ||||||        
T  18001622 tggtgcctcctcctcggcctctaacctcgcctcctggccaatattggcgcgatctgctctctaacatggctcatggcctgaaaccattgatgaggg---- 18001717  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctg 347  Q
      ||||||||||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| | | |||||||||||||||  |||||||     
T  18001718 --ctcatgacctcttcctggcccatctgtgcatcagcgtaggcaacatcgccgttaaccatgtcataggtatcaagcgagcttctcgccttgtaccgctc 18001815  T
Q  348 ccactgctctgcaatgatctg 368  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  18001816 ccactgctctacaatgatctg 18001836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 122 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2407490 - 2407261
Alignment:
Q  122 aatactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcat 221  Q
    |||||||||||||||| |  ||||| | |||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||  |||| |||||||||||| || | |||||||||    
T  2407490 aatactactggtcctgctgatgctgctagtgcctcctcctcggactctggcctcgcctcctggtcaagatcgacgcgatctgctctctaacatgggtcat 2407391  T
Q  222 ggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgtta 321  Q
    || || ||||||| | |||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||            || || || |||||||||| |||||||      
T  2407390 ggtctgaaaccaccggtgagg------gctcatgacctcctcctggcctaactgcgcat------------caacggcattaaccatgtcataggtgtgc 2407309  T
Q  322 ggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2407308 ggcgagcttctcgcttcataccgctcccactgctgtgcaatgatctgc 2407261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 32643153 - 32642916
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| |||| |||||| | ||| |||| |||| |  |||||||||||||||| ||| | ||    || |||| ||    
T  32643153 ctggtcctgctggtgctgctggtgcctcctcctcagcctctagcctcgcctcatggtaatgatcggcgcgatctgctgcctaacatcatgcaaggccaca 32643054  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
     || ||||| |||||||||||||||| |||||||   | || ||  || ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||    
T  32643053 tacaactgccgaggggtcatgctcatcacctcct---gacccaaaaactcatcagcatgggcaacaacgccactaaccatgtcataggtatcaggggagc 32642957  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32642956 ttctcgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgc 32642916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3384670 - 3384457
Alignment:
Q  145 tgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgagggg 244  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||||| ||| ||||   ||||  ||||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||| |||||||| |||||||     
T  3384670 tgatggtacctcatcctaggcctctggcctcgcctctaagtcaagatcggggcgatttgctccctaacatggctcatggcctgaaaccactactgaggg- 3384572  T
Q  245 tcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccg 344  Q
         ||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||    
T  3384571 -----ctcatgacctcctcctgacctatttgtgcatcagcg-aggcaacaacaacactaaccatgtcataggtgtcaggccagcttctcgcctcgtatcg 3384478  T
Q  345 ctgccactgctctgcaatgat 365  Q
    || ||||| ||||| ||||||    
T  3384477 ctcccactactctgaaatgat 3384457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 6204543 - 6204509
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6204543 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 6204509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 11691510 - 11691476
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11691510 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 11691476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 22304625 - 22304591
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22304625 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 22304591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 27639120 - 27639086
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27639120 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 27639086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 30826297 - 30826331
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30826297 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 30826331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 355
Target Start/End: Original strand, 24085723 - 24085842
Alignment:
Q  233 actgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttct 332  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||   | || ||  || ||||||| | ||||| | ||||| ||||||| || ||||| | |||| |||||||    
T  24085723 actgctgaggtgtcatgctcatcacctcct---gacccaaaaactcatcagcatgggcaataacgccagtaaccatatcataggtatcaggcaagcttct 24085819  T
Q  333 cgcctcataccgctgccactgct 355  Q
    |||||  ||||||| ||||||||    
T  24085820 cgccttgtaccgctcccactgct 24085842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 30493748 - 30493993
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30493748 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 30493847  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30493848 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 30493947  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30493948 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 30493993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 124 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 43981791 - 43981547
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43981791 tactactggtcctgatcctgatgatggtgtctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 43981692  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  43981691 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 43981592  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctg 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43981591 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctg 43981547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15834526 - 15834281
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15834526 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggttatgg 15834427  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15834426 cctcaaacgactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 15834327  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15834326 cgagtttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 15834281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5355241 - 5354996
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5355241 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcatcctcggcctctaggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctcccttatatgggtcatgg 5355142  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5355141 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 5355042  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5355041 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 5354996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 43536491 - 43536736
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43536491 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcagcctctggactctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 43536590  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  43536591 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcatggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactaaccatgtcataggtgtcagg 43536690  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43536691 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 43536736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28471800 - 28471553
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcc--tggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcat 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28471800 tactactggtcctaatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctcgcctccctttgtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcat 28471701  T
Q  222 ggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgtta 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  28471700 ggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcaacgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtca 28471601  T
Q  322 ggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28471600 ggcgagcttctcgcctcataccgctcccactgctctgcaatgatctgc 28471553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 121 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17423727 - 17423491
Alignment:
Q  121 taatactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtca 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423727 taatactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtca 17423628  T
Q  221 tggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||            ||||||||||||||||||| |||||||     
T  17423627 tggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcttggcctaactgcgcat------------cagcgccactaaccatgtcataggtgtc 17423540  T
Q  321 aggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423539 aggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 17423491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 29398392 - 29398637
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29398392 tactactgatcctggtcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcacctcctggtcaaaatcggcatgatatgctccctcatatggctcatgg 29398491  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||    
T  29398492 cctgaaaccactgttgaggggtcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccgtaaaccatgtcataggtgtcagg 29398591  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29398592 cgagcttctcgcctcataccgctcccaccgctctgcaatgatctgc 29398637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39950755 - 39950519
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39950755 tactactggtcctgatcctgctg---gtgcctcctcctcggcctctgggttcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatggctcatgg 39950659  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||     
T  39950658 cctgaaatcactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccactaaccatgtcataggtgtcaga 39950559  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||      | ||||||||||||||||||||||    
T  39950558 cgagcttctcgcctca------tcccactgctctgcaatgatctgc 39950519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 10825705 - 10825950
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10825705 tactactggtcctggtcctgctgacgatgcctcctcctcggcctctggtctcgcctcctggtcaaaatcaacgcgatctgctccctcatatggctcatgg 10825804  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||| |||    
T  10825805 cctgaaaccactgctgaggggtcatgcccatgaactcctcttggcctaactgcgcatcaacgtaggcaacaacaccataaaccatgtcataggtgtcagg 10825904  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10825905 tgagcttctcgcctcataccgcttccactgctctgcaatgatctgc 10825950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 36653286 - 36653528
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||  | |||| ||||||    
T  36653286 tactactggtcctggtcctgctg---gtgcctcctcctcggcctctagcctcgcctcctggtcaagatcagcgagatctgctcccaaagatggctcatgg 36653382  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  36653383 cctgaaaccactgctgaggggtcatgatcatgttctcctcttggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 36653482  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  36653483 cgagcttctcgtctcctaccgctcccactgttgtgcaatgatctgc 36653528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 124 - 213
Target Start/End: Original strand, 3938326 - 3938415
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcata 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3938326 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcata 3938415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 249
Target Start/End: Original strand, 6637884 - 6638004
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |    
T  6637884 ctggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggtctcccctcctggtcaatatcggcgcgatctgctccctaacatggctcatggcctga 6637983  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatg 249  Q
    |||||||| |||||| |||||    
T  6637984 aaccactgttgagggctcatg 6638004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 296 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45431603 - 45431530
Alignment:
Q  296 cgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  45431603 cgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcataccgctaccaatgatctgcaatgatctgc 45431530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7417025 - 7416811
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | |  ||||||||||| |||| ||| | ||    || |||| || || |||||||||||||||    
T  7417025 tggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctgataatgatcggcgcgatttgctgcctaacatcatgcaaggccgcatacaactgctgaggggtca 7416926  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctg 347  Q
    ||||||| |||||||   | |  ||  |  ||||||| | ||||||| ||||| |||| || || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||     
T  7416925 tgctcatcacctcct---gacacaaaaagtcatcagcatgggcaacatcgccagtaactatatcataggtatcaggcgagcttctcgcctcgtaccgctc 7416829  T
Q  348 ccactgctctgcaatgat 365  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  7416828 ccactactctgcaatgat 7416811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 40538787 - 40538550
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| |  ||||| |||||||||| ||| | ||    ||  ||| ||    
T  40538787 ctggtcctgcttatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctactggtaatgatcggtgcgatctgctgcctaacatcatgcaaagccgca 40538688  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
     || ||||||||||||||||||||||   | ||||||  || ||  || ||||||| | ||||||| |||| |||||  |||| || || | | |||||     
T  40538687 tacaactgctgaggggtcatgctcat---cacctcctaacccaaaaactcatcagcatgggcaacaacgccgctaacattgtcataagtataaagcgagt 40538591  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  40538590 ttctcgcctcgtatcgctcccactgctctgcattgatctgc 40538550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Original strand, 25514842 - 25514924
Alignment:
Q  122 aatactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctcc 207  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  25514842 aatactactactcctggtcctgctgatgctgcctcc---tcggcctctggcctcgcctcctggccaatatcggcgcgatctgctcc 25514924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 17423847 - 17423813
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423847 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 17423813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 5355357 - 5355323
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5355357 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 5355323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 30493632 - 30493666
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30493632 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 30493666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 43536375 - 43536409
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43536375 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 43536409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 43981915 - 43981881
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43981915 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 43981881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 35
Target Start/End: Original strand, 3938211 - 3938244
Alignment:
Q  2 ccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3938211 ccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 3938244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 15834633 - 15834600
Alignment:
Q  2 ccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15834633 ccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 15834600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26878979 - 26878734
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26878979 tactactggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 26878880  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26878879 cctcataccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 26878780  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26878779 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 26878734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 13636787 - 13637032
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13636787 tactactgggcctgatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaatcggcgtgatctgctccctcatatgggtcatgg 13636886  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13636887 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 13636986  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13636987 cgagcttctcgcctcataccgctcccactggtctgcaatgatctgc 13637032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Original strand, 3729135 - 3729375
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3729135 ctggtcctgatcctgatgatggtgcctcctcctcggcctctgggctctcctcctggtcaaaattggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 3729234  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3729235 taccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagc 3729334  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3729335 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 3729375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19159290 - 19159045
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19159290 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctcctcctgggcctctgggctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 19159191  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  19159190 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcaccactaaccatgtcataggtgtcagg 19159091  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19159090 cgagcttctcgcctcataccgctcccactgctctgcaatgatctgc 19159045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 130 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 52805131 - 52804892
Alignment:
Q  130 tggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaa 229  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  52805131 tggtcttggtcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaattggcgcggtctgctccctcatatggctcgtggcctgaa 52805032  T
Q  230 accactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagct 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  52805031 accactactgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccacaaaccatgtcataggtgtcaggcgagct 52804932  T
Q  330 tctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52804931 tctcgcctcataccgctcccactgctctgcaatgatctgc 52804892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21144194 - 21143954
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  21144194 ctggtcctggtcctgttgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcagcgcgatctgctccctcatatggctcatggcctga 21144095  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| |||    
T  21144094 aaccactactgaggggtcgtgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacaacgccacaaaccatgtcataggtgtcaggcaagc 21143995  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21143994 ttctcgcctcataccgctcccactgctgtgcaatgatctgc 21143954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 124 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22527264 - 22527027
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||| | | |||| ||||||    
T  22527264 tactactggtcctgctgatgctgctggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagataggcgcgatctgctccttaagatggctcatgg 22527165  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22527164 cctcaaacgactgctgaggggtcatgctcatgacctccttctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcagg 22527065  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22527064 cgagcttctcgcctcataccgttcccactgctctgcaa 22527027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 50617679 - 50617925
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50617679 tactattggtcctggtcctgctgatgatgcatcctcctcggcctctagcctcgcctcctggtcaaaatcggtgcgatctgctccctcatatggctcatgg 50617778  T
Q  224 cctcaaaccactgctgagggg-tcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttag 322  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  50617779 cctgaaaccacagctgagggggtcatgctcatgacctcctcctgacctaactgcgcagcagcgtaggcaacagcgccacaaaccatgtcataggtgtcag 50617878  T
Q  323 gcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  50617879 gcgagcttctcgcctcataccgctcccactgttgtgcaatgatctgc 50617925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 129 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 47505605 - 47505365
Alignment:
Q  129 ctggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctca 228  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||  || |||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |    
T  47505605 ctggtcctgctgatgctgttggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcatggtcaagataggcgtgatctgctctctaatatggctcatggcctga 47505506  T
Q  229 aaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagc 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47505505 aaccactgttgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcataggtgtcaggcgagc 47505406  T
Q  329 ttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  47505405 ttctcgcctcataccgctcccactgttgtgcaatgatctgc 47505365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 31780454 - 31780693
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  31780454 tactactggtcctggtcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctaggctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatctgttccctcatatggctcatgg 31780553  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||      ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||| |||    
T  31780554 cctaaaaccactgccgaggggtcatgct------ctcctcctggcctaactgcacatcagcgtaggcaacaacaccataaaccatgtcataggtgtcagg 31780647  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31780648 cgagcttctcgcctcataccgctcccactgctctacaatgatctgc 31780693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 125 - 369
Target Start/End: Original strand, 19522075 - 19522310
Alignment:
Q  125 actactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggc 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19522075 actactggttctgatcctgctgatggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcttggtcaaaatcggcgcgatctgctccctcatatgactcatggc 19522174  T
Q  225 ctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggc 324  Q
    || ||||||||| |||||| |||||         ||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19522175 ctgaaaccactgttgagggctcatg---------tcctcctggcccatctgtgcatcagcataggcaacaacggcactaaccatgtcataggtgtcaggc 19522265  T
Q  325 gagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  19522266 gagcttctcgcctcataccgctctcactgctgtgcaatgatctgc 19522310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 94892 - 95128
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatg---gtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtca 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| | |||| |||    
T  94892 tactactggtcctggtcctgctgatgctggtgcctcctcctcggcctctagcctcgcctcctggtcaagataggcgcgatctgctccctaagatggctca 94991  T
Q  221 tggcctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgtt 320  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||            ||||||||||||||||||| |||||||     
T  94992 tggcctgaaaccactgttgaggggtcatgctcatgacctcctcctagcctaactgcgcat------------cagcgccactaaccatgtcataggtgtc 95079  T
Q  321 aggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  95080 aggcgagcttctcgcctcataccgctcccactactctgcaatgatctgc 95128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Original strand, 23273218 - 23273431
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||  || | ||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||||||        
T  23273218 tggtgccacctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaagattgacgcgatctgctccataacatgggtcatggcctgaaaccactgttgaggg---- 23273313  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctg 347  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  23273314 --ctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggctacaacggcactaaccatgtcataggtgtctggcgagcttctcgcctcataccgctc 23273411  T
Q  348 ccactgctctgcaatgatct 367  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  23273412 ccactgctgtgcaatgatct 23273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45828839 - 45828600
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    |||| ||||||||| |  ||||| |||||||| | ||| ||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  45828839 tactcctggtcctgctgatgctgctggtgccttctccttggcctctagcctcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatgggtcatgg 45828740  T
Q  224 cctcaaaccactgctgaggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttagg 323  Q
    ||| ||||||||| ||||||      |||||||||||  | || |||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||    
T  45828739 cctgaaaccactgttgaggg------ctcatgacctcaccttgacctatctgcgcatcagcgtaggcaacatcggcactaaccatgtcataggtgtcagg 45828646  T
Q  324 cgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45828645 cgagcttctcgcctcgtaccgctcccactgctctgcaatgatctgc 45828600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 51337150 - 51336929
Alignment:
Q  142 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 241  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| |||||| || ||||    
T  51337150 tgctgctggtgcctcctcctcagcctctggcctcgcctcctggccaatatcggcgcgatctgctctctaacatggctcatggcctgaaaccattgatgag 51337051  T
Q  242 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcata 341  Q
    ||      |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||    
T  51337050 gg------ctcatgacctcctcctggccaatctatgcatcagcgtaggcaacagcgccgctaaccatgtcataggtatcatgcgagcttctcgcctcgta 51336957  T
Q  342 ccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51336956 ccgctcccactgctctgcaatgatctgc 51336929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11197102 - 11196888
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||   | |||| ||||||||| ||||||||| ||||||        
T  11197102 tggtgcctcctcttcggcctctggcctcgcctcctagtcaagatcggcgcgatctgctcctcaacatggatcatggcctgaaaccactgttgaggg---- 11197007  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctg 347  Q
      ||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||     
T  11197006 --ctcatgacctcctcctgacctaactgcacattagcgtaggcaacagcggcactaactatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgccttgtaccgctc 11196909  T
Q  348 ccactgctctgcaatgatctg 368  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  11196908 ccacggctctgcaatgatctg 11196888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 149 - 369
Target Start/End: Original strand, 38119977 - 38120191
Alignment:
Q  149 ggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtcat 248  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||  |||||| ||||||| ||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||||         
T  38119977 ggtgcctcctcctcggcctttggcctagcctcctggtcaagatcggcacgatctggtccctaacatgggtcatcgtctgaaaccactgctgaggg----- 38120071  T
Q  249 gctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgc 348  Q
     |||||||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  38120072 -ctcatgacctcctcttgacctatctgcgcatcagtgtaggcaacaacgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttctcgcctcgtaccactcc 38120170  T
Q  349 cactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  38120171 cactgctctacaatgatctgc 38120191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47661112 - 47660899
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    |||||||||| | ||| ||  ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||        
T  47661112 tggtgcctcctcatcgacccatggcctcgcctcctggtcaagatcggcgcgatctgctccctaacatgggtcatggcctgaaaccgctgttgaggg---- 47661017  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctg 347  Q
      ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||     
T  47661016 --ctcatgacctcctcctgacctatatgcgcatcagcataggcaacaacgacactaaccatgtcataggtgtcaggcgagcttcttgcctcgtaccgctc 47660919  T
Q  348 ccactgctctgcaatgatct 367  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  47660918 ccattgctctgcaatgatct 47660899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8548353 - 8548255
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 223  Q
    ||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8548353 tactactggtcctgatcctg------gtgcctcctcctcggcctttgggctctcctcctggtcaaaatcgacgcgatctgctccctcatatgggtcatgg 8548260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 365
Target Start/End: Original strand, 49854831 - 49855045
Alignment:
Q  148 tggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgaggggtca 247  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |  |||||| ||||||||| ||| | ||    || ||||  | || |||||||||||||||    
T  49854831 tggtgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcttggtaatgatcggcacgatctgctgcctaacatcatgcaaggccgtatacaactgctgaggggtca 49854930  T
Q  248 tgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctg 347  Q
    ||||||| |||||||   | || ||  || ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||     
T  49854931 tgctcatcacctcct---gacccaaaaactcatcagcatgggcaacatcgccactaaccatgtcataggtatcaggggagcttctcgcctcgtaccgctc 49855027  T
Q  348 ccactgctctgcaatgat 365  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49855028 ccactgctctgcaatgat 49855045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 365
Target Start/End: Original strand, 35256216 - 35256434
Alignment:
Q  141 ctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctga 240  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||  ||||||||||||||||| || | || | ||||||| | |||||| || |||    
T  35256216 ctgctgttggtgtctcctcctcggcctctggcctcgcctccttgccaatatcggcgcgatctgctctctaacatagctcatggcttgaaaccattgttga 35256315  T
Q  241 ggggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcat 340  Q
    |||      |||||||||||||||||||| |  |  ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||  |    
T  35256316 ggg------ctcatgacctcctcctggccaatatgtgcatcaatgtaggcaacagcgctgctaaccatgtcataggtatcatgcgagcttctcgccttgt 35256409  T
Q  341 accgctgccactgctctgcaatgat 365  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  35256410 accactcccactgctctgcaatgat 35256434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 470651 - 470574
Alignment:
Q  124 tactactggtcctgatcctgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatc 201  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  470651 tactattggtcctggtcctgctgatgctgcctcctcctcggcctctggcctcgcctcctggtcaaaatcggcgcgatc 470574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 470575 - 470528
Alignment:
Q  245 tcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  470575 tcatgctcatgacctcctcctggcctaactgcgcatcagcgtaggcaa 470528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 369
Target Start/End: Original strand, 16269758 - 16269823
Alignment:
Q  304 accatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcataccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  16269758 accatgtcataggtatcaggcgagcttctcgcctcttaccgctcccactactgtgcaatgatctgc 16269823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 8548469 - 8548435
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8548469 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 8548435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 13636678 - 13636712
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13636678 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 13636712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 19159403 - 19159369
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19159403 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 19159369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 19928268 - 19928234
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19928268 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 19928234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 26879095 - 26879061
Alignment:
Q  1 cccatgaaattaaaaataatgtgatcaaagtagaa 35  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26879095 cccatgaaattaaaaataatgtcatcaaagtagaa 26879061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12599 - 12375
Alignment:
Q  142 tgctgatggtgcctccgcctcggcctctgggctctcctcctggtcagaatcggcgcgatctgctccctcatatgggtcatggcctcaaaccactgctgag 241  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||| |  ||||||||||||||||  || | ||    || || | || || |||||||||    
T  12599 tgctgctggtgcctcctcctcggcctctgccctcgcctcttggtaatgatcggcgcgatctgctgtctaacatcatgcaaggacgcatacaactgctgag 12500  T
Q  242 gggtcatgctcatgacctcctcctggcctaactacgcatcagcgtaggcaacagcgccactaaccatgtcgtaggtgttaggcgagcttctcgcctcata 341  Q
    ||||||||||||| ||||| |   |||| ||  || ||||||| | |||||||  || | ||||| |||| ||||| | |||| |||||||| |||| ||    
T  12499 gggtcatgctcatcacctcgtg--ggcccaaaaactcatcagcatgggcaacattgc-agtaaccctgtcataggtatcaggccagcttctcacctcgta 12403  T
Q  342 ccgctgccactgctctgcaatgatctgc 369  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12402 ccgctcccactgctctgcaatgatctgc 12375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University