View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8903_high_16 (Length: 359)

Name: NF8903_high_16
Description: NF8903
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8903_high_16
NF8903_high_16
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (3-331)||(1907306-1907633)
chr4 (3-296)||(15275490-15275781)
chr4 (25-298)||(15379124-15379395)
chr4 (3-331)||(15234901-15235227)
chr4 (18-329)||(24119725-24120036)
chr4 (16-234)||(17020434-17020651)
chr4 (16-234)||(15398993-15399208)
chr4 (16-234)||(14672350-14672565)
chr4 (16-236)||(24585008-24585226)
chr4 (18-234)||(36323091-36323308)
chr4 (18-234)||(36337300-36337517)
chr4 (16-214)||(24813934-24814131)
chr4 (134-331)||(24585359-24585554)
chr4 (18-214)||(54840646-54840841)
chr4 (142-329)||(5701612-5701800)
chr4 (11-177)||(15235234-15235399)
chr4 (16-328)||(21976788-21977098)
chr4 (186-329)||(40098672-40098815)
chr4 (16-214)||(14752327-14752523)
chr4 (134-329)||(17020102-17020298)
chr4 (16-214)||(30761021-30761217)
chr4 (16-214)||(33666613-33666809)
chr4 (3-248)||(15379041-15379289)
chr4 (18-328)||(31119384-31119691)
chr4 (18-236)||(5701765-5701983)
chr4 (195-329)||(14105627-14105760)
chr4 (134-329)||(39857698-39857894)
chr4 (18-214)||(6577099-6577293)
chr4 (186-329)||(54840474-54840615)
chr4 (25-214)||(18793463-18793648)
chr4 (16-214)||(20331304-20331500)
chr4 (186-327)||(20331531-20331672)
chr4 (186-329)||(30760848-30760990)
chr4 (186-329)||(33666840-33666982)
chr4 (186-329)||(36323377-36323519)
chr4 (186-329)||(36337586-36337728)
chr4 (16-214)||(14105800-14105996)
chr4 (134-329)||(18793626-18793825)
chr4 (18-214)||(39857872-39858066)
chr4 (89-234)||(34181779-34181924)
chr4 (186-329)||(14752554-14752698)
chr4 (186-329)||(34181997-34182143)
chr4 (186-327)||(5012968-5013108)
chr4 (18-214)||(5013139-5013334)
chr4 (18-214)||(40098447-40098641)
chr4 (134-329)||(6576920-6577121)
chr4 (17-187)||(34181886-34182056)
chr4 (186-329)||(14672074-14672218)
chr4 (16-187)||(14672160-14672329)
chr4 (16-329)||(24814171-24814483)
chr4 (18-112)||(18793394-18793489)
chr4 (88-187)||(15399300-15399398)
chr4 (16-56)||(14672586-14672626)
chr4 (192-235)||(21977356-21977399)
chr4 (192-235)||(31119141-31119184)
chr4 (192-235)||(39858265-39858308)
chr4 (137-187)||(5701696-5701746)
chr4 (137-187)||(14105710-14105760)
chr4 (137-187)||(30760931-30760981)
chr4 (137-187)||(33666849-33666899)
chr4 (137-187)||(36323386-36323436)
chr4 (137-187)||(36337595-36337645)
chr4 (137-187)||(54840556-54840606)
chr4 (16-56)||(15398932-15398972)
chr4 (16-56)||(24584947-24584987)
[»] chr3 (184 HSPs)
chr3 (16-331)||(16617399-16617714)
chr3 (20-331)||(19701430-19701741)
chr3 (16-331)||(22041443-22041758)
chr3 (3-248)||(35222030-35222275)
chr3 (16-242)||(16423546-16423771)
chr3 (16-234)||(4691265-4691480)
chr3 (3-203)||(15368444-15368644)
chr3 (3-329)||(5589314-5589638)
chr3 (3-236)||(17969600-17969830)
chr3 (18-327)||(47030437-47030746)
chr3 (16-234)||(15733812-15734029)
chr3 (16-234)||(8282218-8282433)
chr3 (16-234)||(4789386-4789601)
chr3 (16-234)||(5659481-5659697)
chr3 (16-234)||(15885453-15885669)
chr3 (10-234)||(29141442-29141665)
chr3 (16-234)||(9527135-9527352)
chr3 (16-234)||(18058615-18058832)
chr3 (16-234)||(35888091-35888306)
chr3 (18-234)||(18337908-18338122)
chr3 (16-234)||(4424145-4424364)
chr3 (16-234)||(4631248-4631467)
chr3 (16-234)||(16403284-16403503)
chr3 (16-234)||(20073502-20073721)
chr3 (16-234)||(48473399-48473618)
chr3 (18-234)||(4728971-4729185)
chr3 (18-234)||(6209240-6209454)
chr3 (133-331)||(35221893-35222087)
chr3 (16-331)||(5659147-5659460)
chr3 (3-214)||(4630971-4631179)
chr3 (3-214)||(20073225-20073433)
chr3 (3-214)||(31029104-31029312)
chr3 (3-214)||(48473122-48473330)
chr3 (16-234)||(22380159-22380377)
chr3 (18-234)||(5589028-5589245)
chr3 (16-331)||(18058281-18058594)
chr3 (142-329)||(5602347-5602535)
chr3 (16-214)||(10403302-10403498)
chr3 (3-212)||(22380444-22380650)
chr3 (16-222)||(17977742-17977950)
chr3 (17-331)||(15734051-15734363)
chr3 (134-327)||(5718036-5718230)
chr3 (134-327)||(5728946-5729140)
chr3 (134-327)||(5763228-5763422)
chr3 (18-238)||(6535539-6535759)
chr3 (18-214)||(20569711-20569905)
chr3 (18-214)||(28108817-28109011)
chr3 (18-242)||(32446431-32446655)
chr3 (16-214)||(28028484-28028680)
chr3 (16-331)||(29141686-29142001)
chr3 (3-248)||(16617326-16617574)
chr3 (3-248)||(22041583-22041831)
chr3 (134-329)||(28108989-28109186)
chr3 (16-214)||(5718208-5718404)
chr3 (16-214)||(5729118-5729314)
chr3 (16-214)||(5763054-5763250)
chr3 (16-214)||(8218854-8219050)
chr3 (134-329)||(11103411-11103607)
chr3 (134-329)||(16599649-16599845)
chr3 (16-214)||(18285230-18285426)
chr3 (16-214)||(18300530-18300726)
chr3 (134-328)||(5473994-5474188)
chr3 (16-233)||(5474205-5474422)
chr3 (186-327)||(7080267-7080408)
chr3 (86-234)||(17969384-17969532)
chr3 (134-328)||(17977978-17978173)
chr3 (18-234)||(18249965-18250181)
chr3 (18-214)||(51789232-51789426)
chr3 (134-329)||(4423932-4424129)
chr3 (16-214)||(11103237-11103433)
chr3 (195-329)||(31957546-31957679)
chr3 (18-214)||(5020928-5021122)
chr3 (18-214)||(7080439-7080634)
chr3 (63-214)||(21681931-21682079)
chr3 (18-214)||(32297844-32298038)
chr3 (186-329)||(4339780-4339922)
chr3 (186-329)||(20569936-20570079)
chr3 (186-329)||(22380683-22380825)
chr3 (18-236)||(5602164-5602382)
chr3 (3-156)||(16403572-16403723)
chr3 (18-236)||(31957309-31957527)
chr3 (162-298)||(15368305-15368442)
chr3 (134-329)||(20073049-20073247)
chr3 (134-329)||(48472946-48473144)
chr3 (18-214)||(24335385-24335579)
chr3 (134-329)||(17969904-17970103)
chr3 (134-329)||(21681756-21681953)
chr3 (186-329)||(51789059-51789201)
chr3 (134-329)||(18249754-18249949)
chr3 (189-327)||(29658108-29658245)
chr3 (134-329)||(32297668-32297866)
chr3 (16-331)||(4728639-4728950)
chr3 (16-331)||(6208908-6209219)
chr3 (18-214)||(16599823-16600017)
chr3 (183-329)||(8282562-8282705)
chr3 (134-327)||(10650110-10650300)
chr3 (186-329)||(16423222-16423363)
chr3 (16-187)||(22863833-22864002)
chr3 (182-328)||(22863940-22864086)
chr3 (16-187)||(22878892-22879061)
chr3 (182-328)||(22878999-22879145)
chr3 (134-329)||(31029290-31029489)
chr3 (18-236)||(28346353-28346571)
chr3 (16-176)||(29657994-29658152)
chr3 (195-329)||(35887775-35887906)
chr3 (186-329)||(18232228-18232370)
chr3 (142-329)||(28346207-28346388)
chr3 (133-234)||(16423495-16423597)
chr3 (186-329)||(18285457-18285602)
chr3 (134-329)||(5020748-5020950)
chr3 (86-233)||(4339564-4339710)
chr3 (186-329)||(18300757-18300903)
chr3 (186-329)||(4630795-4630940)
chr3 (186-329)||(4690690-4690839)
chr3 (134-305)||(6535771-6535942)
chr3 (169-329)||(18337639-18337795)
chr3 (169-329)||(32446166-32446328)
chr3 (267-331)||(4789814-4789878)
chr3 (267-331)||(15885900-15885964)
chr3 (16-187)||(15885690-15885859)
chr3 (17-187)||(9527004-9527173)
chr3 (186-329)||(28028300-28028453)
chr3 (94-214)||(10650278-10650395)
chr3 (11-115)||(19701767-19701870)
chr3 (196-329)||(24335212-24335344)
chr3 (70-214)||(4690930-4691073)
chr3 (134-329)||(8218661-8218876)
chr3 (16-187)||(8282454-8282623)
chr3 (16-107)||(31028995-31029087)
chr3 (222-329)||(16403907-16404015)
chr3 (134-266)||(10403191-10403324)
chr3 (99-233)||(18232440-18232575)
chr3 (133-214)||(4424107-4424188)
chr3 (70-187)||(4690780-4690896)
chr3 (125-190)||(35221972-35222037)
chr3 (16-76)||(18338124-18338183)
chr3 (137-190)||(22380692-22380745)
chr3 (186-234)||(4690968-4691016)
chr3 (16-76)||(4729187-4729246)
chr3 (16-76)||(6209456-6209515)
chr3 (16-112)||(15885332-15885427)
chr3 (198-265)||(9526984-9527051)
chr3 (191-242)||(15368463-15368514)
chr3 (137-187)||(4339789-4339839)
chr3 (121-187)||(4424017-4424083)
chr3 (142-236)||(5474145-5474237)
chr3 (133-212)||(22380334-22380415)
chr3 (137-187)||(31957546-31957596)
chr3 (137-187)||(51789142-51789192)
chr3 (133-214)||(4339669-4339749)
chr3 (133-214)||(18232401-18232481)
chr3 (133-214)||(18249927-18250007)
chr3 (133-214)||(32446401-32446481)
chr3 (16-96)||(4690811-4690890)
chr3 (16-96)||(4690988-4691067)
chr3 (17-117)||(29141627-29141726)
chr3 (192-235)||(4424683-4424726)
chr3 (192-235)||(5601930-5601973)
chr3 (192-235)||(16600216-16600259)
chr3 (192-235)||(17977255-17977298)
chr3 (192-235)||(24335839-24335882)
chr3 (182-237)||(28108922-28108976)
chr3 (192-235)||(28346762-28346805)
chr3 (192-235)||(31957075-31957118)
chr3 (192-235)||(51789625-51789668)
chr3 (137-187)||(5602401-5602451)
chr3 (137-187)||(7080349-7080399)
chr3 (133-187)||(15368359-15368413)
chr3 (23-97)||(16423334-16423407)
chr3 (137-187)||(28028394-28028444)
chr3 (192-234)||(32446855-32446897)
chr3 (133-214)||(17977919-17978000)
chr3 (137-190)||(35887853-35887906)
chr3 (16-56)||(4729267-4729307)
chr3 (16-56)||(4789325-4789365)
chr3 (185-237)||(5659536-5659587)
chr3 (16-56)||(5659718-5659758)
chr3 (16-56)||(6209536-6209576)
chr3 (192-236)||(6535297-6535341)
chr3 (195-235)||(17969077-17969117)
chr3 (16-56)||(22380098-22380138)
chr3 (182-234)||(22380563-22380614)
chr3 (134-190)||(32446250-32446305)
chr3 (16-56)||(35888327-35888367)
[»] chr7 (100 HSPs)
chr7 (3-332)||(16442744-16443072)
chr7 (18-331)||(26508464-26508775)
chr7 (16-327)||(16744331-16744640)
chr7 (18-327)||(4138055-4138365)
chr7 (3-219)||(10848745-10848961)
chr7 (16-327)||(5140087-5140398)
chr7 (16-234)||(5165751-5165966)
chr7 (16-234)||(2161954-2162171)
chr7 (16-235)||(26507215-26507433)
chr7 (16-235)||(39204483-39204701)
chr7 (3-190)||(16048463-16048650)
chr7 (3-214)||(26507801-26508009)
chr7 (3-214)||(39205069-39205277)
chr7 (3-214)||(45738530-45738738)
chr7 (16-234)||(2780511-2780730)
chr7 (18-236)||(31083199-31083418)
chr7 (21-234)||(45738807-45739021)
chr7 (3-214)||(26442605-26442813)
chr7 (3-214)||(39205904-39206112)
chr7 (16-234)||(5155450-5155666)
chr7 (16-319)||(31130977-31131279)
chr7 (16-234)||(10909225-10909441)
chr7 (16-331)||(2161620-2161933)
chr7 (20-234)||(11417444-11417657)
chr7 (16-234)||(16511019-16511235)
chr7 (18-327)||(4206448-4206758)
chr7 (18-187)||(11448043-11448211)
chr7 (125-329)||(24585395-24585600)
chr7 (18-214)||(22149112-22149306)
chr7 (18-214)||(31557099-31557293)
chr7 (18-234)||(39205617-39205834)
chr7 (134-329)||(26312733-26312928)
chr7 (125-327)||(39206081-39206284)
chr7 (21-233)||(26520090-26520302)
chr7 (183-329)||(11447960-11448105)
chr7 (134-329)||(26442315-26442510)
chr7 (134-329)||(26662782-26662977)
chr7 (134-329)||(26677974-26678169)
chr7 (135-329)||(26596727-26596921)
chr7 (186-329)||(31557324-31557469)
chr7 (186-329)||(2780294-2780438)
chr7 (18-214)||(26312561-26312755)
chr7 (16-214)||(26267659-26267855)
chr7 (134-329)||(26519878-26520073)
chr7 (16-214)||(26596900-26597096)
chr7 (183-331)||(16048382-16048528)
chr7 (21-214)||(24585235-24585426)
chr7 (195-329)||(5155134-5155265)
chr7 (195-329)||(5165435-5165566)
chr7 (186-329)||(22148939-22149081)
chr7 (182-329)||(45394288-45394435)
chr7 (134-329)||(45738351-45738552)
chr7 (186-329)||(10909867-10910014)
chr7 (134-328)||(31083492-31083687)
chr7 (63-214)||(26662656-26662804)
chr7 (63-214)||(26677848-26677996)
chr7 (186-329)||(11417726-11417867)
chr7 (267-329)||(16511451-16511513)
chr7 (20-112)||(31131303-31131396)
chr7 (183-248)||(10848774-10848839)
chr7 (133-234)||(31083373-31083476)
chr7 (134-235)||(39205255-39205357)
chr7 (18-187)||(45394373-45394541)
chr7 (17-187)||(2780379-2780549)
chr7 (70-187)||(10909810-10909926)
chr7 (137-214)||(26442488-26442565)
chr7 (16-187)||(16511256-16511425)
chr7 (195-242)||(26267895-26267942)
chr7 (134-234)||(26442526-26442627)
chr7 (133-214)||(11417614-11417695)
chr7 (137-214)||(26508049-26508126)
chr7 (137-214)||(31083437-31083514)
chr7 (134-234)||(26507987-26508088)
chr7 (137-187)||(26267895-26267945)
chr7 (133-214)||(26520051-26520131)
chr7 (16-96)||(2780410-2780489)
chr7 (16-96)||(10909816-10909895)
chr7 (16-112)||(26507691-26507789)
chr7 (11-214)||(26508161-26508360)
chr7 (16-112)||(39204959-39205057)
chr7 (121-177)||(39205301-39205357)
chr7 (192-235)||(4137814-4137857)
chr7 (16-111)||(10909462-10909556)
chr7 (16-111)||(10909639-10909733)
chr7 (192-235)||(26662430-26662473)
chr7 (192-235)||(26677622-26677665)
chr7 (192-235)||(45394801-45394844)
chr7 (62-124)||(16442683-16442744)
chr7 (137-187)||(31557333-31557383)
chr7 (137-190)||(5155212-5155265)
chr7 (86-115)||(5155689-5155718)
chr7 (137-190)||(5165513-5165566)
chr7 (86-115)||(5165989-5166018)
chr7 (137-190)||(11417735-11417787)
chr7 (16-56)||(2162192-2162232)
chr7 (16-56)||(10909164-10909204)
chr7 (16-56)||(11417379-11417419)
chr7 (16-56)||(16510958-16510998)
chr7 (195-235)||(26267361-26267401)
chr7 (195-235)||(26312322-26312362)
[»] chr5 (140 HSPs)
chr5 (20-331)||(23898954-23899263)
chr5 (16-331)||(22895485-22895801)
chr5 (3-248)||(25207507-25207751)
chr5 (3-248)||(25271663-25271907)
chr5 (16-329)||(41681762-41682077)
chr5 (16-234)||(22991735-22991951)
chr5 (18-329)||(33882185-33882498)
chr5 (16-234)||(13178936-13179153)
chr5 (16-234)||(24609579-24609794)
chr5 (125-331)||(25207367-25207572)
chr5 (125-331)||(25271523-25271728)
chr5 (16-234)||(33299935-33300152)
chr5 (16-234)||(23727631-23727846)
chr5 (16-234)||(24977177-24977393)
chr5 (20-234)||(30941965-30942176)
chr5 (3-214)||(13179221-13179429)
chr5 (16-234)||(11556684-11556901)
chr5 (16-234)||(23633302-23633518)
chr5 (16-236)||(13435373-13435594)
chr5 (16-233)||(24731242-24731459)
chr5 (16-328)||(33523464-33523774)
chr5 (134-327)||(40466492-40466686)
chr5 (186-329)||(32589214-32589357)
chr5 (16-214)||(37745060-37745256)
chr5 (17-329)||(11556414-11556722)
chr5 (21-214)||(15751576-15751767)
chr5 (16-212)||(13317536-13317733)
chr5 (18-214)||(18368238-18368435)
chr5 (16-212)||(28952508-28952702)
chr5 (134-329)||(3796612-3796809)
chr5 (186-329)||(18493707-18493850)
chr5 (186-329)||(28952735-28952877)
chr5 (142-329)||(8658388-8658575)
chr5 (134-329)||(12139241-12139436)
chr5 (16-214)||(18493480-18493676)
chr5 (25-214)||(31438689-31438875)
chr5 (134-329)||(37762053-37762248)
chr5 (18-236)||(40466320-40466535)
chr5 (134-328)||(37664391-37664585)
chr5 (18-214)||(32588989-32589183)
chr5 (134-329)||(24731028-24731225)
chr5 (186-329)||(26487453-26487595)
chr5 (134-329)||(2518124-2518319)
chr5 (18-236)||(8658205-8658423)
chr5 (134-329)||(9324543-9324738)
chr5 (16-214)||(11330826-11331022)
chr5 (134-329)||(30175547-30175742)
chr5 (16-214)||(34623751-34623947)
chr5 (63-214)||(2518297-2518448)
chr5 (18-214)||(9324716-9324910)
chr5 (18-214)||(12139414-12139608)
chr5 (186-325)||(28656330-28656470)
chr5 (16-331)||(33299594-33299914)
chr5 (186-329)||(5644820-5644962)
chr5 (23-214)||(30036678-30036867)
chr5 (186-329)||(34623578-34623720)
chr5 (16-187)||(43085412-43085581)
chr5 (18-236)||(5644972-5645190)
chr5 (134-329)||(6881372-6881568)
chr5 (16-214)||(28656501-28656697)
chr5 (16-214)||(30175720-30175916)
chr5 (86-234)||(18121150-18121298)
chr5 (134-328)||(31438517-31438711)
chr5 (51-234)||(3796825-3797007)
chr5 (63-214)||(6881546-6881694)
chr5 (18-214)||(9543440-9543634)
chr5 (186-329)||(18121371-18121515)
chr5 (18-214)||(26487626-26487820)
chr5 (134-329)||(11330651-11330848)
chr5 (25-214)||(37351384-37351570)
chr5 (125-329)||(18368404-18368612)
chr5 (186-329)||(30036505-30036647)
chr5 (134-327)||(37351548-37351744)
chr5 (186-328)||(37745287-37745430)
chr5 (186-329)||(9543665-9543810)
chr5 (25-214)||(37664227-37664413)
chr5 (25-214)||(37762226-37762412)
chr5 (169-329)||(23633030-23633189)
chr5 (133-329)||(13435549-13435751)
chr5 (183-329)||(24976904-24977048)
chr5 (182-329)||(43085326-43085474)
chr5 (18-147)||(31438814-31438944)
chr5 (18-123)||(37351315-37351421)
chr5 (195-329)||(13317775-13317908)
chr5 (17-187)||(18121260-18121430)
chr5 (200-329)||(31819375-31819503)
chr5 (134-331)||(33784540-33784738)
chr5 (186-331)||(23727295-23727441)
chr5 (185-329)||(24609305-24609448)
chr5 (18-123)||(37664158-37664264)
chr5 (16-117)||(31819248-31819350)
chr5 (195-329)||(30941690-30941824)
chr5 (267-329)||(13179836-13179898)
chr5 (93-214)||(30159272-30159390)
chr5 (16-123)||(37762375-37762483)
chr5 (253-329)||(15651766-15651843)
chr5 (196-329)||(15751808-15751940)
chr5 (196-329)||(30159099-30159231)
chr5 (16-187)||(24976987-24977156)
chr5 (16-117)||(33784813-33784912)
chr5 (16-187)||(30941775-30941944)
chr5 (169-331)||(22992064-22992224)
chr5 (137-214)||(13179469-13179546)
chr5 (134-234)||(13179407-13179508)
chr5 (88-187)||(24609389-24609487)
chr5 (133-236)||(3796766-3796867)
chr5 (137-187)||(5644903-5644953)
chr5 (137-187)||(8658442-8658492)
chr5 (11-97)||(22895781-22895866)
chr5 (137-187)||(26487536-26487586)
chr5 (137-190)||(23727380-23727432)
chr5 (11-112)||(23899292-23899392)
chr5 (133-214)||(24731203-24731283)
chr5 (11-112)||(25207763-25207863)
chr5 (11-112)||(25271919-25272019)
chr5 (16-56)||(24609815-24609855)
chr5 (17-117)||(33299874-33299973)
chr5 (192-236)||(37744759-37744803)
chr5 (192-235)||(5645381-5645424)
chr5 (192-235)||(13317234-13317277)
chr5 (192-235)||(30037071-30037114)
chr5 (120-187)||(37745279-37745346)
chr5 (137-187)||(9543674-9543724)
chr5 (137-187)||(18493716-18493766)
chr5 (137-187)||(28656411-28656461)
chr5 (137-187)||(28952744-28952794)
chr5 (86-115)||(23727869-23727898)
chr5 (194-235)||(30176183-30176224)
chr5 (134-187)||(32589220-32589273)
chr5 (195-235)||(6881939-6881979)
chr5 (195-235)||(9325109-9325149)
chr5 (16-56)||(11556922-11556962)
chr5 (195-235)||(12139807-12139847)
chr5 (189-229)||(22895767-22895807)
chr5 (16-56)||(23633539-23633579)
chr5 (16-56)||(24977414-24977454)
chr5 (195-235)||(26488019-26488059)
chr5 (189-237)||(28952622-28952669)
chr5 (16-56)||(30942201-30942241)
chr5 (16-56)||(33784933-33784973)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (3-327)||(16200886-16201210)
chr1 (3-330)||(20467860-20468191)
chr1 (16-331)||(20333287-20333600)
chr1 (16-234)||(21890032-21890247)
chr1 (16-234)||(14691554-14691769)
chr1 (16-234)||(14694236-14694451)
chr1 (16-234)||(14696920-14697135)
chr1 (16-234)||(14699601-14699816)
chr1 (16-234)||(14702292-14702507)
chr1 (16-234)||(28157117-28157336)
chr1 (3-187)||(28156867-28157048)
chr1 (134-327)||(3648232-3648426)
chr1 (18-233)||(10969932-10970147)
chr1 (16-214)||(28592391-28592585)
chr1 (187-329)||(51645298-51645440)
chr1 (18-214)||(3648404-3648598)
chr1 (18-214)||(10952342-10952536)
chr1 (19-187)||(51645382-51645552)
chr1 (16-187)||(41786263-41786432)
chr1 (134-329)||(10969720-10969915)
chr1 (16-187)||(28592243-28592410)
chr1 (16-329)||(14691790-14692098)
chr1 (16-329)||(14694472-14694780)
chr1 (16-329)||(14697156-14697464)
chr1 (16-329)||(14699837-14700145)
chr1 (134-329)||(10952169-10952364)
chr1 (11-235)||(20332986-20333207)
chr1 (18-214)||(28592566-28592760)
chr1 (182-329)||(41786370-41786516)
chr1 (182-329)||(28156781-28156929)
chr1 (16-235)||(20332755-20332971)
chr1 (182-329)||(28592157-28592305)
chr1 (222-329)||(21890825-21890931)
chr1 (16-214)||(20332226-20332424)
chr1 (16-214)||(21890208-21890405)
chr1 (16-187)||(21890679-21890848)
chr1 (16-214)||(20331876-20332070)
chr1 (137-214)||(21890562-21890639)
chr1 (11-242)||(20333222-20333453)
chr1 (186-234)||(21890553-21890601)
chr1 (16-56)||(20468198-20468238)
chr1 (186-234)||(21890319-21890367)
chr1 (62-124)||(20468191-20468252)
chr1 (133-214)||(10969893-10969973)
chr1 (181-234)||(16200705-16200758)
chr1 (16-117)||(20331816-20331916)
chr1 (134-214)||(20332107-20332186)
[»] chr2 (124 HSPs)
chr2 (16-331)||(21696047-21696360)
chr2 (3-298)||(19449261-19449557)
chr2 (3-298)||(27397432-27397722)
chr2 (16-234)||(12662816-12663031)
chr2 (16-234)||(28889635-28889851)
chr2 (16-234)||(3790144-3790361)
chr2 (16-329)||(27123572-27123886)
chr2 (3-236)||(31867127-31867359)
chr2 (3-214)||(3789867-3790075)
chr2 (16-230)||(23118181-23118393)
chr2 (16-234)||(39897591-39897810)
chr2 (3-214)||(34266948-34267156)
chr2 (3-214)||(39897314-39897522)
chr2 (38-234)||(27427162-27427358)
chr2 (3-187)||(3789600-3789781)
chr2 (16-328)||(16822197-16822507)
chr2 (16-328)||(16898973-16899283)
chr2 (18-214)||(11627988-11628182)
chr2 (20-328)||(32056825-32057131)
chr2 (134-327)||(9343018-9343212)
chr2 (134-327)||(16168495-16168689)
chr2 (134-327)||(27783240-27783434)
chr2 (134-327)||(27810720-27810914)
chr2 (18-233)||(12709365-12709580)
chr2 (16-214)||(16168667-16168863)
chr2 (18-214)||(27810892-27811086)
chr2 (18-214)||(34868875-34869069)
chr2 (16-214)||(253452-253648)
chr2 (142-329)||(21670156-21670343)
chr2 (134-329)||(34298221-34298417)
chr2 (195-329)||(37678935-37679068)
chr2 (195-329)||(37694200-37694333)
chr2 (134-331)||(37932447-37932642)
chr2 (134-329)||(39897141-39897336)
chr2 (16-214)||(40240771-40240967)
chr2 (86-234)||(31866911-31867059)
chr2 (186-331)||(34267949-34268094)
chr2 (186-327)||(39044965-39045106)
chr2 (18-214)||(9342846-9343040)
chr2 (18-214)||(27783469-27783663)
chr2 (186-329)||(34161913-34162057)
chr2 (18-214)||(39044740-39044934)
chr2 (134-327)||(40240599-40240793)
chr2 (16-203)||(37944665-37944850)
chr2 (195-329)||(253688-253822)
chr2 (18-236)||(21669973-21670191)
chr2 (18-236)||(22920944-22921162)
chr2 (195-329)||(22921181-22921314)
chr2 (134-329)||(37384727-37384923)
chr2 (16-214)||(37384901-37385097)
chr2 (186-327)||(12593890-12594031)
chr2 (18-234)||(20845245-20845458)
chr2 (16-214)||(34266723-34266920)
chr2 (186-329)||(12709650-12709794)
chr2 (18-214)||(37678701-37678895)
chr2 (18-214)||(37693966-37694160)
chr2 (182-329)||(3789516-3789662)
chr2 (186-329)||(31883343-31883485)
chr2 (186-331)||(28889303-28889446)
chr2 (18-203)||(12594073-12594256)
chr2 (18-203)||(19409287-19409470)
chr2 (21-214)||(31883516-31883710)
chr2 (196-329)||(37944902-37945035)
chr2 (186-329)||(34868707-34868849)
chr2 (134-327)||(11628160-11628353)
chr2 (16-112)||(34162249-34162346)
chr2 (195-329)||(19409521-19409654)
chr2 (134-329)||(23117847-23118041)
chr2 (267-329)||(12662542-12662604)
chr2 (267-329)||(27427580-27427642)
chr2 (221-329)||(31867874-31867983)
chr2 (200-327)||(13929651-13929779)
chr2 (183-329)||(20844966-20845116)
chr2 (93-234)||(34298433-34298573)
chr2 (93-238)||(37932711-37932855)
chr2 (88-187)||(12662625-12662723)
chr2 (87-190)||(34267908-34268011)
chr2 (16-214)||(31867318-31867515)
chr2 (134-234)||(34267368-34267469)
chr2 (137-214)||(31867555-31867632)
chr2 (137-214)||(34267196-34267273)
chr2 (137-214)||(34267313-34267390)
chr2 (137-214)||(34267430-34267507)
chr2 (137-214)||(34267547-34267624)
chr2 (88-176)||(20845066-20845153)
chr2 (186-234)||(34267538-34267586)
chr2 (134-238)||(37932654-37932756)
chr2 (88-187)||(27427450-27427548)
chr2 (134-234)||(31867493-31867594)
chr2 (134-234)||(34267134-34267235)
chr2 (134-234)||(34267251-34267352)
chr2 (137-187)||(21670210-21670260)
chr2 (137-187)||(22921181-22921231)
chr2 (137-187)||(31883426-31883476)
chr2 (134-236)||(37932599-37932699)
chr2 (94-214)||(13929489-13929606)
chr2 (11-56)||(21695982-21696027)
chr2 (137-190)||(28889384-28889437)
chr2 (52-234)||(31867294-31867477)
chr2 (133-214)||(34162088-34162168)
chr2 (133-214)||(34298395-34298475)
chr2 (182-237)||(11628093-11628147)
chr2 (192-235)||(21669739-21669782)
chr2 (186-249)||(34267772-34267835)
chr2 (192-235)||(34298726-34298769)
chr2 (192-235)||(40241224-40241267)
chr2 (137-187)||(253688-253738)
chr2 (137-187)||(12593972-12594022)
chr2 (133-203)||(12709539-12709608)
chr2 (137-187)||(12709659-12709709)
chr2 (193-235)||(27124144-27124186)
chr2 (137-187)||(34161998-34162048)
chr2 (137-187)||(37678935-37678985)
chr2 (137-187)||(37694200-37694250)
chr2 (121-187)||(39044958-39045024)
chr2 (137-214)||(34267781-34267858)
chr2 (19-96)||(34267901-34267977)
chr2 (142-187)||(37944906-37944951)
chr2 (16-56)||(12663052-12663092)
chr2 (16-56)||(20845481-20845521)
chr2 (16-112)||(27427319-27427414)
chr2 (134-214)||(27783412-27783491)
chr2 (16-56)||(34266662-34266702)
chr2 (186-234)||(34267655-34267703)
[»] chr8 (104 HSPs)
chr8 (3-298)||(22073755-22074048)
chr8 (16-234)||(2129881-2130097)
chr8 (16-234)||(16261265-16261480)
chr8 (16-234)||(15774959-15775176)
chr8 (22-234)||(19909844-19910052)
chr8 (16-234)||(18798036-18798251)
chr8 (16-237)||(19653819-19654039)
chr8 (18-234)||(22140188-22140400)
chr8 (16-234)||(19695445-19695656)
chr8 (25-242)||(33249859-33250075)
chr8 (3-214)||(9361856-9362064)
chr8 (137-331)||(19654291-19654488)
chr8 (16-234)||(14570539-14570755)
chr8 (16-234)||(29836616-29836835)
chr8 (16-234)||(9362133-9362352)
chr8 (16-234)||(21340310-21340526)
chr8 (16-214)||(27601587-27601784)
chr8 (16-212)||(19653399-19653596)
chr8 (16-329)||(14570207-14570518)
chr8 (78-234)||(22388537-22388692)
chr8 (134-327)||(19201389-19201583)
chr8 (16-214)||(31482649-31482845)
chr8 (16-329)||(2130118-2130428)
chr8 (18-214)||(18716709-18716903)
chr8 (134-327)||(28354958-28355152)
chr8 (16-214)||(19681707-19681903)
chr8 (186-329)||(12085728-12085873)
chr8 (21-214)||(28354788-28354980)
chr8 (142-328)||(31361608-31361794)
chr8 (186-329)||(29836400-29836544)
chr8 (186-329)||(19681534-19681676)
chr8 (134-329)||(44568059-44568254)
chr8 (134-329)||(9361680-9361878)
chr8 (134-329)||(18716533-18716731)
chr8 (18-214)||(12085503-12085697)
chr8 (18-233)||(33266017-33266235)
chr8 (134-329)||(31482823-31483016)
chr8 (133-234)||(33249809-33249910)
chr8 (183-328)||(16260991-16261136)
chr8 (221-329)||(21341223-21341330)
chr8 (16-331)||(15774624-15774938)
chr8 (186-329)||(22388881-22389028)
chr8 (216-329)||(27601961-27602073)
chr8 (16-118)||(19653579-19653680)
chr8 (190-329)||(33249415-33249557)
chr8 (183-327)||(19910181-19910325)
chr8 (267-331)||(22139964-22140028)
chr8 (195-329)||(19695168-19695304)
chr8 (16-187)||(19695255-19695424)
chr8 (16-187)||(19910073-19910242)
chr8 (25-214)||(19653888-19654074)
chr8 (186-329)||(33265797-33265947)
chr8 (267-329)||(18797761-18797823)
chr8 (70-214)||(21341015-21341158)
chr8 (16-187)||(16261075-16261244)
chr8 (87-214)||(19654124-19654251)
chr8 (120-190)||(19654332-19654402)
chr8 (62-187)||(33249503-33249625)
chr8 (17-214)||(33249651-33249847)
chr8 (70-214)||(21340779-21340922)
chr8 (16-104)||(33250057-33250144)
chr8 (18-214)||(44568232-44568428)
chr8 (16-86)||(19653700-19653769)
chr8 (186-248)||(19653930-19653992)
chr8 (134-238)||(19201275-19201377)
chr8 (94-236)||(31361759-31361900)
chr8 (186-248)||(19654282-19654344)
chr8 (186-234)||(19654165-19654213)
chr8 (186-234)||(21341072-21341120)
chr8 (128-212)||(19653750-19653836)
chr8 (16-234)||(21340547-21340764)
chr8 (137-187)||(31361690-31361740)
chr8 (133-214)||(33265978-33266058)
chr8 (186-234)||(19653510-19653558)
chr8 (16-96)||(19654114-19654193)
chr8 (16-56)||(19695677-19695717)
chr8 (16-56)||(21340249-21340289)
chr8 (198-234)||(21340848-21340884)
chr8 (16-96)||(21341021-21341100)
chr8 (186-234)||(33249689-33249737)
chr8 (16-56)||(33250165-33250205)
chr8 (187-242)||(15775009-15775063)
chr8 (133-236)||(19201331-19201432)
chr8 (142-189)||(27601946-27601992)
chr8 (192-235)||(28354605-28354648)
chr8 (192-235)||(31362116-31362159)
chr8 (192-235)||(31482346-31482389)
chr8 (137-187)||(12085737-12085787)
chr8 (137-187)||(19681617-19681667)
chr8 (137-187)||(29836485-29836535)
chr8 (137-187)||(33265888-33265938)
chr8 (137-190)||(21341198-21341250)
chr8 (185-242)||(22140238-22140294)
chr8 (16-56)||(2129820-2129860)
chr8 (16-56)||(14570776-14570816)
chr8 (16-56)||(16261501-16261541)
chr8 (16-56)||(18798272-18798312)
chr8 (195-235)||(19200979-19201019)
chr8 (186-234)||(19653750-19653798)
chr8 (16-56)||(19909777-19909817)
chr8 (16-96)||(21340785-21340864)
chr8 (16-56)||(22140423-22140463)
chr8 (17-57)||(22388714-22388754)
chr8 (16-56)||(27601526-27601566)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (25-248)||(28497-28720)
scaffold0109 (125-298)||(28391-28562)
scaffold0109 (3-248)||(28555-28803)
[»] chr6 (121 HSPs)
chr6 (18-329)||(13517030-13517343)
chr6 (16-234)||(16757204-16757421)
chr6 (16-329)||(4764802-4765116)
chr6 (16-234)||(22926979-22927195)
chr6 (16-234)||(24871033-24871250)
chr6 (16-234)||(15405132-15405347)
chr6 (16-234)||(15416919-15417134)
chr6 (16-234)||(13291543-13291761)
chr6 (16-234)||(26928138-26928355)
chr6 (16-234)||(27032403-27032620)
chr6 (20-234)||(24298367-24298579)
chr6 (16-234)||(14137884-14138103)
chr6 (16-234)||(27354501-27354720)
chr6 (18-234)||(27026524-27026738)
chr6 (16-328)||(4779962-4780273)
chr6 (3-214)||(8898439-8898647)
chr6 (3-214)||(28167720-28167928)
chr6 (3-214)||(33369191-33369399)
chr6 (16-234)||(8898151-8898370)
chr6 (16-234)||(27015109-27015328)
chr6 (16-234)||(33368902-33369122)
chr6 (16-322)||(4755519-4755824)
chr6 (16-329)||(4532344-4532656)
chr6 (3-214)||(14138172-14138380)
chr6 (16-190)||(27283259-27283430)
chr6 (11-234)||(27210282-27210504)
chr6 (11-234)||(27238724-27238946)
chr6 (16-333)||(13291782-13292097)
chr6 (3-187)||(27014859-27015040)
chr6 (182-331)||(27283364-27283512)
chr6 (16-234)||(28167997-28168216)
chr6 (134-331)||(15405483-15405681)
chr6 (134-331)||(15417270-15417468)
chr6 (18-214)||(28214694-28214889)
chr6 (16-331)||(27209948-27210261)
chr6 (16-331)||(27238967-27239280)
chr6 (134-329)||(27032072-27032268)
chr6 (16-234)||(27201459-27201677)
chr6 (16-234)||(27247556-27247774)
chr6 (16-328)||(30550818-30551128)
chr6 (18-214)||(4538537-4538732)
chr6 (16-325)||(22200999-22201301)
chr6 (134-331)||(27026191-27026388)
chr6 (134-327)||(34457496-34457690)
chr6 (18-216)||(26109180-26109376)
chr6 (16-214)||(29556782-29556978)
chr6 (16-233)||(29580296-29580513)
chr6 (18-214)||(26793037-26793234)
chr6 (18-214)||(16681384-16681578)
chr6 (134-329)||(26109352-26109550)
chr6 (16-200)||(26665415-26665597)
chr6 (16-200)||(26771386-26771568)
chr6 (186-329)||(29508471-29508615)
chr6 (18-214)||(29508646-29508840)
chr6 (134-328)||(27201248-27201443)
chr6 (134-328)||(27247790-27247985)
chr6 (16-325)||(20131569-20131871)
chr6 (18-214)||(34457324-34457518)
chr6 (16-325)||(24298600-24298904)
chr6 (3-156)||(27354789-27354940)
chr6 (18-187)||(16936902-16937069)
chr6 (186-329)||(16681209-16681353)
chr6 (186-328)||(26792867-26793006)
chr6 (195-331)||(22927867-22928005)
chr6 (186-328)||(26665642-26665785)
chr6 (186-328)||(26771613-26771756)
chr6 (134-329)||(28167544-28167742)
chr6 (18-214)||(27064743-27064937)
chr6 (134-329)||(29580084-29580279)
chr6 (134-329)||(14138358-14138560)
chr6 (16-125)||(16757434-16757542)
chr6 (186-327)||(4538763-4538906)
chr6 (186-325)||(8898678-8898820)
chr6 (182-329)||(27014774-27014921)
chr6 (186-329)||(29556606-29556751)
chr6 (134-329)||(33369377-33369579)
chr6 (23-203)||(22927460-22927639)
chr6 (186-327)||(28214520-28214663)
chr6 (134-329)||(16756872-16757067)
chr6 (200-329)||(27492189-27492317)
chr6 (182-329)||(16937007-16937155)
chr6 (186-331)||(26927801-26927949)
chr6 (25-234)||(22927048-22927255)
chr6 (267-329)||(24870759-24870821)
chr6 (254-331)||(27622546-27622624)
chr6 (16-176)||(24870854-24871012)
chr6 (222-329)||(27355124-27355232)
chr6 (16-248)||(22200939-22201172)
chr6 (267-329)||(27064541-27064603)
chr6 (134-265)||(27064633-27064765)
chr6 (16-234)||(20131712-20131931)
chr6 (192-325)||(20175612-20175737)
chr6 (192-325)||(22160254-22160379)
chr6 (133-214)||(22927212-22927293)
chr6 (137-214)||(22927690-22927767)
chr6 (90-187)||(22927820-22927917)
chr6 (133-214)||(29580257-29580337)
chr6 (186-234)||(22927681-22927729)
chr6 (62-117)||(22927378-22927433)
chr6 (195-234)||(22927573-22927612)
chr6 (137-187)||(8898687-8898737)
chr6 (182-235)||(20175992-20176045)
chr6 (182-235)||(22159946-22159999)
chr6 (133-214)||(27201421-27201501)
chr6 (133-214)||(27247732-27247812)
chr6 (16-56)||(15405075-15405115)
chr6 (16-56)||(15416862-15416902)
chr6 (137-187)||(4538772-4538822)
chr6 (137-187)||(16681294-16681344)
chr6 (137-187)||(28214604-28214654)
chr6 (137-187)||(29508556-29508606)
chr6 (137-187)||(29556692-29556742)
chr6 (16-97)||(23759013-23759093)
chr6 (17-117)||(16757143-16757242)
chr6 (16-56)||(26928376-26928416)
chr6 (20-76)||(26992397-26992452)
chr6 (20-76)||(27026740-27026795)
chr6 (16-56)||(27026820-27026860)
chr6 (16-56)||(27032641-27032681)
chr6 (16-56)||(27210520-27210560)
chr6 (16-56)||(27238668-27238708)
[»] scaffold0240 (4 HSPs)
scaffold0240 (16-234)||(23663-23878)
scaffold0240 (267-329)||(24093-24155)
scaffold0240 (88-187)||(23970-24068)
scaffold0240 (16-56)||(23602-23642)
[»] scaffold0322 (4 HSPs)
scaffold0322 (2-187)||(13213-13398)
scaffold0322 (16-214)||(2848-3044)
scaffold0322 (134-327)||(2676-2870)
scaffold0322 (191-331)||(13124-13267)
[»] scaffold0336 (3 HSPs)
scaffold0336 (16-234)||(17106-17325)
scaffold0336 (3-214)||(16829-17037)
scaffold0336 (134-329)||(16650-16851)
[»] scaffold0547 (3 HSPs)
scaffold0547 (16-234)||(8304-8521)
scaffold0547 (195-329)||(8706-8842)
scaffold0547 (137-190)||(8706-8759)
[»] scaffold0089 (6 HSPs)
scaffold0089 (16-234)||(7151-7367)
scaffold0089 (16-118)||(14581-14681)
scaffold0089 (185-331)||(6875-7020)
scaffold0089 (16-187)||(6961-7130)
scaffold0089 (16-56)||(7388-7428)
scaffold0089 (16-56)||(14520-14560)
[»] scaffold0489 (4 HSPs)
scaffold0489 (16-234)||(4852-5072)
scaffold0489 (25-214)||(2044-2230)
scaffold0489 (16-117)||(1973-2075)
scaffold0489 (134-232)||(2208-2307)
[»] scaffold0143 (5 HSPs)
scaffold0143 (16-234)||(34683-34897)
scaffold0143 (134-328)||(10995-11190)
scaffold0143 (18-214)||(11168-11362)
scaffold0143 (16-329)||(34347-34662)
scaffold0143 (16-56)||(34918-34958)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (51-234)||(39322-39507)
scaffold0099 (254-318)||(39714-39779)
[»] scaffold0477 (3 HSPs)
scaffold0477 (18-214)||(12786-12981)
scaffold0477 (186-327)||(13012-13155)
scaffold0477 (137-187)||(13021-13071)
[»] scaffold0241 (3 HSPs)
scaffold0241 (125-296)||(25556-25725)
scaffold0241 (150-248)||(25523-25621)
scaffold0241 (207-248)||(25522-25563)
[»] scaffold0038 (3 HSPs)
scaffold0038 (18-214)||(15192-15387)
scaffold0038 (186-327)||(15018-15161)
scaffold0038 (137-187)||(15102-15152)
[»] scaffold0237 (3 HSPs)
scaffold0237 (18-236)||(7753-7971)
scaffold0237 (142-329)||(7936-8123)
scaffold0237 (137-187)||(7990-8040)
[»] scaffold0792 (3 HSPs)
scaffold0792 (18-214)||(3426-3620)
scaffold0792 (186-329)||(3651-3797)
scaffold0792 (137-187)||(3660-3710)
[»] scaffold0159 (7 HSPs)
scaffold0159 (195-329)||(23645-23778)
scaffold0159 (195-329)||(2225-2358)
scaffold0159 (18-236)||(1988-2206)
scaffold0159 (63-236)||(23454-23626)
scaffold0159 (137-187)||(2225-2275)
scaffold0159 (137-187)||(23645-23695)
scaffold0159 (192-235)||(1746-1789)
[»] scaffold0418 (3 HSPs)
scaffold0418 (134-329)||(13090-13288)
scaffold0418 (93-234)||(13304-13444)
scaffold0418 (142-214)||(13266-13337)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (200-329)||(1117-1245)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1907633 - 1907306
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1907633 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaa 1907534  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1907533 ctggttactccaccggagacataaacaaacaaacaggtgcaagctgctcttggatttgaactagccacttgaccggacagaaacaaatagacaggtacaa 1907434  T
Q  203 gttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   | |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1907433 gttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagttt-tttgacaaaatatagattcaaattgacttgacgtcg 1907335  T
Q  303 attcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1907334 atttgatttgaaaggtagaaattgaccaa 1907306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 296
Target Start/End: Original strand, 15275490 - 15275781
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  15275490 tggaaaagtagacaggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggacgtgaa 15275589  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15275590 ctggttactccaccagagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggagttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaggtacaa 15275689  T
Q  203 gttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttg 296  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15275690 gctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagtt--tttgacaaaatataaattgaaattgacttg 15275781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Original strand, 15379124 - 15379395
Alignment:
Q  25 ttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacat 124  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15379124 ttgttcttggatgcgaactggtcactcgaccgaaaacaacggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacat 15379223  T
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactag 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15379224 aaacaaacagacaggtgcaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactag 15379323  T
Q  225 ccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 298  Q
    |||||||||| || |||| || |||   |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15379324 ccacttgaccaaacagaaacacattcattggggattagtt--tttgacaaaatataaattgaaattgacttgac 15379395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15235227 - 15234901
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  15235227 tggaaaagtagacaggtacgagttattcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgcgagctcgtttttggatgcgaa 15235128  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  15235127 ctggttactccaccggaaacataaacaaataaacaggtgcaagctgctcttggatttgaactagccacttgaccgaacagaaatagatagacaggtacaa 15235028  T
Q  203 gttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcg 302  Q
    | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||   |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15235027 gctgttcttggacttgaacaaaccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattagtt--tttgacaaaatgtagattgaaactgacttgacgtcg 15234930  T
Q  303 attcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  15234929 atttgatttgaaaggcagagattgaccaa 15234901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24120036 - 24119725
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24120036 gtacgagttgttcttacggattcgaactggtgacccgactgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactagttactccac 24119937  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
     ||  ||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| || ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  24119936 tgg--acagaaacatatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgagcgaacggaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 24119840  T
Q  216 ttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttgg-tggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24119839 ttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgttgatttgatttgaa 24119740  T
Q  315 aggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||||||||    
T  24119739 aggtagaaattgacc 24119725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17020651 - 17020434
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17020651 aggtgcgagttgttcttgaattcgaactggtcactcgactgaaagcaaagacaaatagacaagtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 17020552  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17020551 cggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggac 17020453  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17020452 ttgaactagccacttgacc 17020434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 15398993 - 15399208
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15398993 aggtacgagttgttcttg-attcgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 15399090  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15399091 cggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccactcgagcgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggac 15399189  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15399190 ttgaactagccacttgacc 15399208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14672565 - 14672350
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14672565 aggtacgagttattcttg-attcgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 14672468  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | || || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||    
T  14672467 cggagacaaagaccaatagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacgggtacaagcggttcttggac 14672369  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14672368 ttgaactagccacttgacc 14672350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 236
Target Start/End: Original strand, 24585008 - 24585226
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24585008 aggtacgagttgttcttg-attcgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaacttgttactccac 24585105  T
Q  116 cggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  24585106 cggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 24585204  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccga 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24585205 cttgaactagccacttgaccga 24585226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 36323091 - 36323308
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36323091 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactagttactccac 36323189  T
Q  116 cggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  36323190 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 36323288  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36323289 cttgaactagccacttgacc 36323308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 36337300 - 36337517
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36337300 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactagttactccac 36337398  T
Q  116 cggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  36337399 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 36337497  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36337498 cttgaactagccacttgacc 36337517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 24813934 - 24814131
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813934 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgattgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 24814032  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  24814033 cggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga 24814131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Original strand, 24585359 - 24585554
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgac 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || |  |||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||| |||| || | ||||||||    
T  24585359 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggtacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgac 24585456  T
Q  234 cgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24585457 cgaatagaaacaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaaatgaccaa 24585554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 54840841 - 54840646
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54840841 gtacgagttgttcttacggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 54840742  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  54840741 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 54840646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5701800 - 5701612
Alignment:
Q  142 caagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaata 239  Q
    ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5701800 caagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaaca 5701702  T
Q  240 gaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5701701 gaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 5701612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15235399 - 15235234
Alignment:
Q  11 cagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttac 110  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15235399 cagacaggtgcgagttgttcttggatt-gaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatacgaactggttac 15235301  T
Q  111 tccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccg 177  Q
    ||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||    
T  15235300 tcccccggagacaaaggcaaacagacaggtgcaagctgctcttggattcgaactagccactcgaccg 15235234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21977098 - 21976788
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21977098 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 21977000  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga----actgaaacaaatagacaggtacaagttgttc 209  Q
    ||   ||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||    | ||||  || || || ||||||||| ||||    
T  21976999 ac---cgacagaaacagatagccaggtacaagctgctcttgga-ttgagctaggcactcgaccgataacattgaa--aagtaaacgggtacaagtcgttc 21976906  T
Q  210 ttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgat 309  Q
    |||||   |||||||  |||||||| || |||| || |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  21976905 ttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttg-ttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaa 21976807  T
Q  310 ttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  21976806 ttgaaagataaaaattgac 21976788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 40098672 - 40098815
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40098672 caaattgataggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 40098771  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40098772 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 40098815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 14752327 - 14752523
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14752327 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 14752425  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  14752426 accg--gacaaaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 14752522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 17020298 - 17020102
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17020298 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 17020200  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||| |||| ||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17020199 accgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgacc 17020102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30761217 - 30761021
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30761217 aggtacgagttgttcttagggattcgaactagttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 30761119  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| || || ||||||    
T  30761118 accg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacgagctgctcttgg 30761022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 33666613 - 33666809
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33666613 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactagttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 33666711  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| || || ||||||    
T  33666712 accg--gacagaaacagataggcaggtgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacgagctgctcttgg 33666808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Original strand, 15379041 - 15379289
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15379041 tggaaaagcagacaggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaaacaacggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaa 15379140  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagc-tgctcttggacttgatctagccacttgaccg--aactgaaacaaatagacaggta 199  Q
    ||||| |||| ||||   |||    |||| |||||||||| ||| || |||||||   || || |  |||  ||||   ||  ||||||| ||||||||     
T  15379141 ctggtcactcgaccgaaaacaacggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacataaacaaacagacaggtg 15379240  T
Q  200 caagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaat 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15379241 caagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 15379289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 328
Target Start/End: Original strand, 31119384 - 31119691
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||   | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31119384 gtacgagttgttcttacggattcgaactggtgactcgactgaaaacat--gtaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 31119481  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga----actgaaacaaatagacaggtacaagttgttctt 211  Q
    ||   ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||    | |||||  | || || ||||||||| ||||||    
T  31119482 cg---acagaaacagatagccaggtacaagctgctcttgga-ttgagctaggcactcgaccgataacattgaaa--agtaaacgggtacaagtcgttctt 31119575  T
Q  212 ggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgattt 311  Q
    |||   |||||||  |||||||| || |||| || |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  31119576 ggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaatt 31119674  T
Q  312 gaaaggtagaaattgac 328  Q
    |||||||| ||||||||    
T  31119675 gaaaggtaaaaattgac 31119691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5701983 - 5701765
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5701983 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 5701885  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| || |||||||| | |||||||| || |||||||    
T  5701884 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagagacaaataggcgggtacaagctgctcttgga 5701786  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccga 236  Q
     |||| || | |||||||||||    
T  5701785 -ttgagctgggcacttgaccga 5701765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14105760 - 14105627
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgact 294  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14105760 aggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgact 14105662  T
Q  295 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14105661 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 14105627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 39857894 - 39857698
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39857894 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 39857796  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  39857795 accaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 39857698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6577293 - 6577099
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6577293 gtacgagttgttcttacggattcgaactggtgactcgactgaaaacac-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaattggttactccac 6577195  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  6577194 cggagac--aaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 6577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 54840615 - 54840474
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  54840615 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttt--ttgacaaaatatagattg 54840518  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54840517 agattgacttgacgtcaattcgatttgaaaggtagaaattgacc 54840474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 214
Target Start/End: Original strand, 18793463 - 18793648
Alignment:
Q  25 ttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacat 124  Q
    |||||||||||| |||||| || || |||| |||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  18793463 ttgttcttggatgcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacag 18793559  T
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  18793560 aaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 18793648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 20331304 - 20331500
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20331304 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 20331402  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||| | || ||| |||||||| || ||||||    
T  20331403 accg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctaggcacttgaccaaacggaaatatattgacgggtacaagctgctcttgg 20331499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 327
Target Start/End: Original strand, 20331531 - 20331672
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20331531 caaattgataggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttaaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattg 20331630  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20331631 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 20331672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 30760990 - 30760848
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  30760990 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattg 30760892  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30760891 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 30760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 33666840 - 33666982
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  33666840 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattg 33666938  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33666939 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 33666982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 36323377 - 36323519
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   | |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36323377 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattagttt-tttgacaaaatatagattg 36323475  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36323476 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 36323519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 36337586 - 36337728
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   | |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36337586 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattagttt-tttgacaaaatatagattg 36337684  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36337685 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 36337728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14105996 - 14105800
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttg--gattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14105996 aggtacgagttgttcttacagattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 14105898  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||| | | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||| || || ||||||    
T  14105897 accg--gacagaaagagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatactgacaggtacgagctgctcttgg 14105801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Original strand, 18793626 - 18793825
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18793626 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 18793724  T
Q  232 accgaa-tagaagcaaatttggtggggattggtttgtt--tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    ||| || ||||| || |||   ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18793725 accaaaatagaaacatattcactggggattggttttttcctgacaaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgac 18793824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39858066 - 39857872
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39858066 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtgactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttgaatgcgaactggttactccac 39857968  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  || | ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  39857967 cg--gagagaaacatatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcgcttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 39857872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 234
Target Start/End: Original strand, 34181779 - 34181924
Alignment:
Q  89 ttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||| ||||||||||||| || | || |||||||||||| ||||| ||||||    
T  34181779 ttcttagatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttaga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaaca 34181877  T
Q  188 aatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34181878 gatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 34181924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 14752554 - 14752698
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagatt 284  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14752554 caaattgataggtacaagctgttcttgaacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatagatt 14752653  T
Q  285 gaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    || |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  14752654 gagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 14752698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 34181997 - 34182143
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt---gacaaaatataga 282  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||   ||||||||||||| |||   |||||| ||||||    
T  34181997 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaggttcactggggattggttttttttttgacaaagtataga 34182096  T
Q  283 ttgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34182097 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 34182143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5013108 - 5012968
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||  ||   | |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5013108 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacctgaccaaacagaaacatgttcactagggattggtttgtt-gaccaaatatagattg 5013010  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5013009 aaattgacttgacgtcgatttgatttaaaaggtagaaattga 5012968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5013334 - 5013139
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactag-tcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcca 114  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| | | | || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5013334 gtacgagttgttcttaaggattcgaattgggttactcgactgaaaacaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggaagcgaactggttactcca 5013236  T
Q  115 ccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||  | || ||| | | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||| || |||||||    
T  5013235 ccg--ggcagaaatagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgataggtacaagctgctcttgga 5013139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 40098447 - 40098641
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40098447 gtacgagttgttcttacggattcgaactggttacccgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgctcttggatgcgaactagttactccac 40098545  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  || | ||||  | |||||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||| ||||| || |||||||    
T  40098546 cg--gagagaaacggatagacaggtacaagctgctcttaga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggcacaagctgctcttgga 40098641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6577121 - 6576920
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6577121 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 6577023  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattgg-----tttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattg 326  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||     ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  6577022 accaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttttgaccaaatatggattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattg 6576923  T
Q  327 acc 329  Q
    |||    
T  6576922 acc 6576920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Original strand, 34181886 - 34182056
Alignment:
Q  17 ggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc 116  Q
    ||||| || |||||||||| | ||||||| |||  |||| ||| || || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  34181886 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaaatcatagacaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggtaactcgacc 34181985  T
Q  117 ggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |   |||||| ||||  || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  34181986 gataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 34182056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14672218 - 14672074
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt--gacaaaatatagat 283  Q
    |||||||  |||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||| ||| |||  |||||| |||||||    
T  14672218 caaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttttttttttgacaaagtatagat 14672120  T
Q  284 tgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14672119 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 14672074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14672329 - 14672160
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||  |  || || || |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  14672329 aggtacgagctgttcttggatttgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtgcaag-ttgttcttggattcgaactggtaactcgac 14672231  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||   |||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  14672230 cgataacataagcaaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 14672160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 329
Target Start/End: Original strand, 24814171 - 24814483
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaa-tagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcca 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  || ||| || || |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||  |    
T  24814171 aggtacgagtagttcttggattcgaactggttactcgaccgataacattggaaaagtaaacgggtgcaag-tcgttcttggatgtgaactggtaacttga 24814269  T
Q  115 ccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || |||||||  |||| |||| || |||||    
T  24814270 ccaa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaataggtaggttcaagctgctcttg 24814366  T
Q  213 gacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgattt 311  Q
    || |||| |||||||||||||| |  |||| || | |   ||||  || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||    
T  24814367 ga-ttgagctagccacttgaccaagcagaaacagaatcactgggatttagttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaatt 24814465  T
Q  312 gaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24814466 gaaaggtagaaattgacc 24814483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 112
Target Start/End: Original strand, 18793394 - 18793489
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactc 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18793394 gtacgagttgttcttacggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatggacaggtgcgagtttgttcttggatgcgaactggttactc 18793489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 187
Target Start/End: Original strand, 15399300 - 15399398
Alignment:
Q  88 gttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| |||||  ||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  15399300 gttcttggaggcaaactggtaactcgaccggaaacataaacaaataggtaggttcaaactgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 15399398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 14672626 - 14672586
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14672626 aggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 14672586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21977399 - 21977356
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21977399 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 21977356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Original strand, 31119141 - 31119184
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31119141 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 31119184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39858308 - 39858265
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39858308 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 39858265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5701746 - 5701696
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  5701746 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 5701696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14105760 - 14105710
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  14105760 aggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 14105710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30760981 - 30760931
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  30760981 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 30760931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 33666849 - 33666899
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  33666849 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 33666899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 36323386 - 36323436
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  36323386 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 36323436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 36337595 - 36337645
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  36337595 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 36337645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 54840606 - 54840556
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  54840606 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 54840556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 15398932 - 15398972
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15398932 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 15398972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 24584947 - 24584987
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24584947 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 24584987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 184)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Original strand, 16617399 - 16617714
Alignment:
Q  16 aggtacgag-ttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcca 114  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| || || | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16617399 aggtacgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccagaaacaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcca 16617498  T
Q  115 ccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16617499 ccggagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttgga 16617598  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16617599 cttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattagttt-tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaa 16617697  T
Q  315 aggtagaaattgaccaa 331  Q
    |||||||||||||||||    
T  16617698 aggtagaaattgaccaa 16617714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19701741 - 19701430
Alignment:
Q  20 acgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19701741 acgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccaaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 19701642  T
Q  120 gacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19701641 gacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggatttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttga 19701542  T
Q  220 actagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggta 319  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19701541 actagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggaatagtttttatgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggta 19701442  T
Q  320 gaaattgaccaa 331  Q
    ||||||||||||    
T  19701441 gaaattgaccaa 19701430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22041758 - 22041443
Alignment:
Q  16 aggtacgag-ttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcca 114  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| || || | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22041758 aggtacgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccagaaacaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcca 22041659  T
Q  115 ccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  22041658 ccagagacataaacaaaaagacaggtgcaagctgctcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaagaacaagctgttcttgga 22041559  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22041558 cttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattagttt-tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaa 22041460  T
Q  315 aggtagaaattgaccaa 331  Q
    |||||||||||||||||    
T  22041459 aggtagaaattgaccaa 22041443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35222275 - 35222030
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35222275 tggaaaagtagacaggtacgagttgtcctcggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaa 35222176  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35222175 ctggttactccactggagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggatttgaactagccacttgaccgaacagaaacagatagacaggtacaa 35222076  T
Q  203 gttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaat 248  Q
    | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  35222075 gctgttcttggtcttgaactaaccacttgaccgaacagaaacaaat 35222030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16423771 - 16423546
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16423771 aggtgcgagttgttctcggattcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 16423672  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16423671 cggagacaaagacaaatagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgactgaacagaaactgatagacaggtacaagttgttcttggac 16423573  T
Q  216 ttgaactagccacttgaccgaatagaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16423572 ttgaactagccacttgaccgaacagaa 16423546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4691480 - 4691265
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4691480 aggtacgagttgttcttg-attcgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 4691383  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4691382 cggagacaaagacaaatagacaggtgcaagctgctcttgga-tggagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggac 4691284  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4691283 ttgaactagccacttgacc 4691265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15368644 - 15368444
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15368644 tggaaaagtagacaggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggacgcgaa 15368545  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  15368544 ctggttactccaccagagacataaaaatacagacaggtgcaagctgctcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacacatagataggtacaa 15368445  T
Q  203 g 203  Q
    |    
T  15368444 g 15368444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 329
Target Start/End: Original strand, 5589314 - 5589638
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  5589314 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacagatgtgagcttgttcttggatgcgaa 5589413  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccg--aactgaaacaaatagacaggtac 200  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| |||||  |||  || ||||| || |||| |    
T  5589414 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtgc 5589510  T
Q  201 aagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgt 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5589511 aagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcattggggattagtttg-ttgaaaaaatatagattgagattgacttgacgt 5589609  T
Q  301 cgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  5589610 cgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 5589638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Original strand, 17969600 - 17969830
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17969600 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 17969699  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||    
T  17969700 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttggac-tgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaa 17969796  T
Q  203 gttgttcttggacttgaactagccacttgaccga 236  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17969797 gctgttcttggacttgaactagccacttgaccga 17969830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 47030746 - 47030437
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47030746 gtacgagttgttcttacggattcgaactggttacccgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 47030648  T
Q  116 cggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
     || |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||| || |||||||    
T  47030647 tggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtataagctgctcttgga 47030549  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaa 314  Q
     |||| |||| |||||||| |||  ||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  47030548 -ttgagctagtcacttgactgaacggaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaa 47030450  T
Q  315 aggtagaaattga 327  Q
    |||||||||||||    
T  47030449 aggtagaaattga 47030437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 15733812 - 15734029
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15733812 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 15733910  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  15733911 cggagacaaagacaaaatagacaggtgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 15734009  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15734010 cttgaactagccacttgacc 15734029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 8282218 - 8282433
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8282218 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactagttactccac 8282315  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  8282316 cggagacaaagacaaatagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaacgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 8282414  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8282415 ttgaactagccacttgacc 8282433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 4789386 - 4789601
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4789386 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 4789483  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    | | |||| | || || ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4789484 cagagacaaagaccaatagataggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggac 4789582  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4789583 ttgaactagccacttgacc 4789601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5659697 - 5659481
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  5659697 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgtgaactagttactctac 5659599  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| | || | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  5659598 cggagtcaaagacaaatagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacataaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 5659500  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5659499 ttgaactagccacttgacc 5659481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 15885453 - 15885669
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15885453 aggtacgagttgttcttg-atcggaactggccactcgaccgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 15885551  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  15885552 cggagacaaaggcaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 15885650  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15885651 ttgaactagccacttgacc 15885669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 29141442 - 29141665
Alignment:
Q  10 gcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggtta 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29141442 gcagacaggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttcgatgcgaactggtta 29141540  T
Q  110 ctccaccggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgtt 208  Q
    ||||||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||||||||    
T  29141541 ctccaccggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagatgggtacaagttgtt 29141639  T
Q  209 cttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29141640 cttggacttgaactagccacttgacc 29141665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9527352 - 9527135
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9527352 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaacagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 9527254  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  9527253 cggagacaaagacaaaatagacaggtgcaagctgctcttgg-tttgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 9527155  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  9527154 cttgaactagtcacttgacc 9527135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18058832 - 18058615
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18058832 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcgctcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaattggttactccac 18058734  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  18058733 cggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 18058635  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18058634 cttgaactagccacttgacc 18058615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35888306 - 35888091
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35888306 aggtacgagttgttcttg-attcgaactagccactcgattgaaagcaa-ggtaaatagacgggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccgc 35888209  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  35888208 cggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 35888110  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35888109 ttgaactagccacttgacc 35888091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18338122 - 18337908
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18338122 gtacgagttgttcttg-attcgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 18338025  T
Q  118 gcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggact 216  Q
      |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18338024 aagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggact 18337926  T
Q  217 tgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18337925 tgaactagccacttgacc 18337908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4424364 - 4424145
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424364 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 4424266  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  4424265 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 4424167  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4424166 gacttgaactagccacttgacc 4424145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4631467 - 4631248
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4631467 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 4631369  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  4631368 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 4631270  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4631269 gacttgaactagccacttgacc 4631248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 16403284 - 16403503
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16403284 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 16403382  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  16403383 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 16403481  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16403482 gacttgaactagccacttgacc 16403503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20073721 - 20073502
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20073721 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 20073623  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  20073622 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 20073524  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20073523 gacttgaactagccacttgacc 20073502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48473618 - 48473399
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48473618 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 48473520  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  48473519 accggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 48473421  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48473420 gacttgaactagccacttgacc 48473399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4729185 - 4728971
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 117  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4729185 gtacgagttgttcttg-atttgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgtgaactggttactccaccg 4729088  T
Q  118 gcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggact 216  Q
    | |||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4729087 gagacaaagacaaaatagacaggtgcaagctgctcttgga-tcgagctaaccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggact 4728989  T
Q  217 tgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4728988 tgaactagccacttgacc 4728971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6209454 - 6209240
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 117  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6209454 gtacgagttgttcttg-atttgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 6209357  T
Q  118 gcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggact 216  Q
    | |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6209356 gagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctaaccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggact 6209258  T
Q  217 tgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6209257 tgaactagccacttgacc 6209240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 133 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35222087 - 35221893
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttga 232  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35222087 agacaggtacaagctgttcttggtcttgaactaaccacttgaccgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactaaccacttga 35221988  T
Q  233 ccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||| |||| ||||||   ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  35221987 ccgaacagaaacaaattcactggagattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgat----tttgaaaggtagaaattgaccaa 35221893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5659460 - 5659147
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  5659460 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtgcaag-ttgttcttggatgcgaactggtaacttgac 5659362  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  5659361 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgg 5659265  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5659264 acttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 5659165  T
Q  314 aaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5659164 aaggtagaaattgaccaa 5659147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4631179 - 4630971
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4631179 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 4631080  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    || ||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  4631079 ctagttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 4630983  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  4630982 gctgctcttgga 4630971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20073433 - 20073225
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20073433 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 20073334  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  20073333 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaagtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 20073237  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  20073236 gctgctcttgga 20073225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 31029104 - 31029312
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31029104 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataagcaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 31029203  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  31029204 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 31029300  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  31029301 gctgctcttgga 31029312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48473330 - 48473122
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  48473330 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggcttcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 48473231  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  48473230 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 48473134  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  48473133 gctgctcttgga 48473122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 22380159 - 22380377
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtc-acccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcca 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||  |||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22380159 aggtacgagttgttcttg-attcgaactagtttactcgattgaaagcaa-ggtaaatagacgggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcca 22380256  T
Q  115 ccggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagcc-acttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    |||| |||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22380257 ccggagacaaagacaaaatagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgagctagcttacttgaccgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttg 22380355  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22380356 gacttgaactagccacttgacc 22380377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 5589028 - 5589245
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5589028 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttaccccac 5589126  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||     
T  5589127 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggg 5589225  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5589226 cttgaactagccacttgacc 5589245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18058594 - 18058281
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  18058594 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 18058496  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  18058495 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgg 18058399  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18058398 acttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcaatttgatttga 18058299  T
Q  314 aaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18058298 aaggtagaaattgaccaa 18058281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 329
Target Start/End: Original strand, 5602347 - 5602535
Alignment:
Q  142 caagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaata 239  Q
    ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  5602347 caagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgagctagccacttgaccaaaca 5602445  T
Q  240 gaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5602446 gaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 5602535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10403498 - 10403302
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10403498 aggtacgagttgttcttatggattcgaactagtgactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 10403400  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  10403399 accg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 10403303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 22380444 - 22380650
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22380444 tggaaaagtagacaggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 22380543  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | |||||| || || ||||||||    
T  22380544 ctggttactccaccg--gacggaaacatatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaatcggaaacatattgataggtacaa 22380640  T
Q  203 gttgttcttg 212  Q
    | || |||||    
T  22380641 gctgctcttg 22380650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 17977742 - 17977950
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17977742 aggtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgtgaactggttactcc 17977840  T
Q  114 accggcgacataaac--aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttctt 211  Q
    ||||| |||| | ||  ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  17977841 accggagacaaataccaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttctt 17977939  T
Q  212 ggacttgaact 222  Q
    |||||||||||    
T  17977940 ggacttgaact 17977950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 331
Target Start/End: Original strand, 15734051 - 15734363
Alignment:
Q  17 ggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  |||    
T  15734051 ggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgacc 15734149  T
Q  117 ggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
        ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || |||||||  |||| |||| | ||||||||    
T  15734150 aa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaataggtaggttcaagctattcttgga 15734246  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15734247 cttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaa 15734346  T
Q  315 aggtagaaattgaccaa 331  Q
    |||||||||||||||||    
T  15734347 aggtagaaattgaccaa 15734363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5718230 - 5718036
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5718230 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 5718132  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5718131 accaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 5718036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5729140 - 5728946
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5729140 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 5729042  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5729041 accaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 5728946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Original strand, 5763228 - 5763422
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5763228 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 5763326  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5763327 accaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 5763422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 6535539 - 6535759
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6535539 gtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 6535637  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||||    
T  6535638 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttgga 6535736  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccgaat 238  Q
     |||| |||| |||||||| ||||    
T  6535737 -ttgagctagtcacttgactgaat 6535759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 20569711 - 20569905
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20569711 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtgactcgactgaaaacaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 20569809  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||||    
T  20569810 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacgggtacaagctgttcttgga 20569905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 28108817 - 28109011
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || ||  ||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28108817 gtacgagttgttcttaaggattcgaactggttacttgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 28108915  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  28108916 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 28109011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32446655 - 32446431
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32446655 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 32446557  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||| || |||||||    
T  32446556 cggagacaaacacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaatagaaacagatagacgggtacaagctgctcttgga 32446458  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccgaatagaa 242  Q
     | || |||||||||||| |||||||||    
T  32446457 -tcgagctagccacttgagcgaatagaa 32446431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28028680 - 28028484
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28028680 aggtacgagttgttcttatggattcgaactggtgactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 28028582  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||| || ||||||    
T  28028581 accg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattaacaggtacaagctgctcttgg 28028485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Original strand, 29141686 - 29142001
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  29141686 aggtacgagctgttcttggattcgaactggttactcaaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 29141784  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || |||||||  ||||||||| |||||||||    
T  29141785 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaataggtaggtacaagctgttcttgg 29141881  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattgg--tttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgattt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  29141882 acttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgattt 29141981  T
Q  312 gaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29141982 gaaaggtagaaattgaccaa 29142001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Original strand, 16617326 - 16617574
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16617326 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcacccgaccaaaaataaaggcaaatagacaggtacgagcttgttcttggatgcgaa 16617425  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagc-tgctcttggacttgatctagccacttgaccg--aactgaaacaaatagacaggta 199  Q
    |||||||||||||| |  ||| |  |||| |||||||||| ||| || |||||||   || || |  |||  ||||   ||  ||||||| ||||||||     
T  16617426 ctggttactccaccagaaacaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacataaacaaacagacaggtg 16617525  T
Q  200 caagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaat 248  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16617526 caagctgctcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 16617574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22041831 - 22041583
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22041831 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcacccgaccaaaaataaaggcaaatagacaggtacgagcttgttcttggatgcgaa 22041732  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagc-tgctcttggacttgatctagccacttgacc-ga-actgaaacaaatagacaggta 199  Q
    |||||||||||||| |  ||| |  |||| |||||||||| ||| || |||||||   || || |  |||  ||| || ||  ||||||| ||||||||     
T  22041731 ctggttactccaccagaaacaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccagagacataaacaaaaagacaggtg 22041632  T
Q  200 caagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaat 248  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22041631 caagctgctcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 22041583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Original strand, 28108989 - 28109186
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28108989 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 28109087  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  28109088 accaaacagaaacatattcactgggggttggtttgttttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgacc 28109186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5718404 - 5718208
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5718404 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 5718306  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  5718305 accggagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 5718209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5729314 - 5729118
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5729314 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 5729216  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  5729215 accggagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 5729119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 5763054 - 5763250
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5763054 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 5763152  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  5763153 accggagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 5763249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8219050 - 8218854
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8219050 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaacagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 8218952  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |||   |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  8218951 acc--agacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 8218855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Original strand, 11103411 - 11103607
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11103411 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 11103509  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  11103510 accaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 11103607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16599845 - 16599649
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16599845 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 16599747  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  16599746 accaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 16599649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 18285230 - 18285426
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18285230 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 18285328  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  18285329 accg--gacaaaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagttagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 18285425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 18300530 - 18300726
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18300530 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 18300628  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  18300629 accg--gacaaaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagttagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 18300725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5474188 - 5473994
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5474188 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 5474090  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    |||||| | || || |||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5474089 accgaacataaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgac 5473994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5474422 - 5474205
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5474422 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 5474324  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||||| || |||||    
T  5474323 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagagacagataggcgggtacaagctgctcttg 5474225  T
Q  213 gacttgaactagccacttgac 233  Q
    || |||| |||| ||||||||    
T  5474224 ga-ttgagctagtcacttgac 5474205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7080408 - 7080267
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7080408 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatatagattg 7080309  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  7080308 aaattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattga 7080267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 234
Target Start/End: Original strand, 17969384 - 17969532
Alignment:
Q  86 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaa 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||    
T  17969384 ttgttcttggattcgaactggttactccaccggagacaacgacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgagcgaacagaa 17969482  T
Q  185 acaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17969483 acagatagacgggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 17969532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 17977978 - 17978173
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17977978 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaatcgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 17978076  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  17978077 accaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgac 17978173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18250181 - 18249965
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18250181 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtgactcgactgaaaacat-gtaaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 18250083  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||||    
T  18250082 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttgga 18249984  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
     |||| |||| |||||||||    
T  18249983 -ttgagctagtcacttgacc 18249965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 51789426 - 51789232
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51789426 gtacgagttgttcttaaggattcaaactagttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 51789328  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| || || |||||||    
T  51789327 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacgagctgctcttgga 51789232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4424129 - 4423932
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4424129 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 4424031  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgt-ttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| ||  ||| || |||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424030 accaaacggaaacatattcactggggattggtttttattgacaaaatatagattgagattgacttaacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 4423932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 11103237 - 11103433
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11103237 aggtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 11103335  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  11103336 accggagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-tcgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 11103432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 31957546 - 31957679
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgact 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31957546 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgact 31957644  T
Q  295 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  31957645 tgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 31957679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5021122 - 5020928
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5021122 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtgactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 5021024  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  || | ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||||  | |||||||||||| || |||||||    
T  5021023 cg--gagagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatgttgacaggtacaagctgctcttgga 5020928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7080634 - 7080439
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| | |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7080634 gtacgagttgttcttacggattcgaactggtgactcgactggaaagtaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 7080535  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||| ||| || |||||||    
T  7080534 cg--gacagaaacagatagacagatacaagctgctcttgga-ttgagctagccactcgaccgaacagaaacatgttgacaggtataagctgctcttgga 7080439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21682079 - 21681931
Alignment:
Q  63 aaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgat 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  21682079 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgag 21681983  T
Q  163 ctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  21681982 ctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 21681931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32298038 - 32297844
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32298038 gtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 32297940  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  32297939 cggagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 32297844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 4339780 - 4339922
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||   | ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4339780 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactagggattggtttgtta-acaaaatatagattg 4339878  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4339879 aggttgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 4339922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 20569936 - 20570079
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20569936 caaattgataggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 20570035  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  20570036 agattgacttaacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 20570079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 22380683 - 22380825
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    |||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  22380683 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacagggggttagttt-tttgacaaagtatagattg 22380781  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22380782 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 22380825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Original strand, 5602164 - 5602382
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5602164 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttattcttggatgcgaactggttactccac 5602262  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||||| || |||||||    
T  5602263 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagagacagataggcgggtacaagctgctcttgga 5602361  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccga 236  Q
     |||| || | |||||||||||    
T  5602362 -ttgagctgggcacttgaccga 5602382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 16403572 - 16403723
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16403572 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 16403671  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttgga 156  Q
    || | |||||||| |  |||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  16403672 ctaggtactccactg--gacagaaacatatagacaggtacaagctgctcttgga 16403723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Original strand, 31957309 - 31957527
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31957309 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttattcttggatgcgaactggttactccac 31957407  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||||| || |||||||    
T  31957408 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagagacagataggcgggtacaagctgctcttgga 31957506  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccga 236  Q
     |||| || | |||||||||||    
T  31957507 -ttgagctgggcacttgaccga 31957527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 162 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15368442 - 15368305
Alignment:
Q  162 tctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggatt- 260  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| || |||   ||||||||     
T  15368442 tctagccacttgaccgaacagaaacacatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactaaccacttgaccaaacagaaacacattcactggggatta 15368343  T
Q  261 ggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 298  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15368342 gttttttttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 15368305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20073247 - 20073049
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20073247 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 20073149  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  20073148 accaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 20073049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 48473144 - 48472946
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48473144 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 48473046  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  48473045 accaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 48472946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24335579 - 24335385
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24335579 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtgactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggagcgagcttgttcttggatgcgaactggttactctac 24335481  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  || | ||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  24335480 cg--gagagaaacagatagacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatagacaggtacaagctgctcttgga 24335385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Original strand, 17969904 - 17970103
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17969904 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 17970002  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt---gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  17970003 accaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaagtagaaattgac 17970102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 21681953 - 21681756
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21681953 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 21681855  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttg-tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| || |||||||| |||||||||||    
T  21681854 accaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacattgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 21681756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 51789201 - 51789059
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  51789201 caaattgataggtacaagctgctcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattg 51789103  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51789102 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 51789059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18249949 - 18249754
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18249949 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 18249851  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18249850 accaaacagaaacatattcaccggggattggttt-tttgacaaaatatagattgagattgacctgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 18249754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 327
Target Start/End: Original strand, 29658108 - 29658245
Alignment:
Q  189 atagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaa 288  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| ||||||||| ||  |||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  29658108 atagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaagcatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgaga 29658206  T
Q  289 ttgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29658207 ttgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 29658245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 32297866 - 32297668
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32297866 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 32297768  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||| |||| || |||   ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  32297767 atcgaacagaaacatattcactggggattgttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 32297668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4728950 - 4728639
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  4728950 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 4728852  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| || | || | |||| ||||||  ||  || ||||  || ||||||||| |||||||||    
T  4728851 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttaagctgggcactcgaccgataacataagcaaaatgataggtacaagctgttcttgg 4728755  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||| |||||||| |||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4728754 acttgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaacata--ggttgaaattgacttggcgtcgatttgatttga 4728657  T
Q  314 aaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4728656 aaggtagaaattgaccaa 4728639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6209219 - 6208908
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  6209219 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 6209121  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||  || ||||||||| |||||||||    
T  6209120 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaaatgataggtacaagctgttcttgg 6209024  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||    ||||||| |||| |||||||| |||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6209023 acttgaactagtcacttgaccgaacaaaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaacata--ggttgaaattgacttggcgtcgatttgatttga 6208926  T
Q  314 aaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6208925 aaggtagaaattgaccaa 6208908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16600017 - 16599823
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16600017 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtgactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttgaatgcgaactagttactccac 16599919  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  || | ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  16599918 cg--gagagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcgcttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 16599823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Original strand, 8282562 - 8282705
Alignment:
Q  183 aaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatataga 282  Q
    ||||||||||  |||| |||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  8282562 aaacaaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagattcagtggggattgtttt--ttgacaaaatataga 8282658  T
Q  283 ttgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8282659 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 8282705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10650300 - 10650110
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10650300 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 10650202  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
     || || |||| || |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10650201 gccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattga----gatttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 10650110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16423363 - 16423222
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| || |||   |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16423363 caaattgataggtacaagctgttcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattagttt-tttgacaaaatatagattg 16423266  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16423265 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 16423222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 22863833 - 22864002
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22863833 aggtacgagtcgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaattggttactcc 22863931  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||||  | || ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  22863932 accg--ggcagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 22864002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 182 - 328
Target Start/End: Original strand, 22863940 - 22864086
Alignment:
Q  182 gaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatata 280  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22863940 gaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatata 22864038  T
Q  281 gattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22864039 gattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgac 22864086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 22878892 - 22879061
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22878892 aggtacgagtcgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaattggttactcc 22878990  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||||  | || ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  22878991 accg--ggcagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 22879061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 182 - 328
Target Start/End: Original strand, 22878999 - 22879145
Alignment:
Q  182 gaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatata 280  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22878999 gaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatata 22879097  T
Q  281 gattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22879098 gattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgac 22879145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Original strand, 31029290 - 31029489
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31029290 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgtccttggacttgaactagccacttg 31029388  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt---gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  31029389 accaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgac 31029488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28346571 - 28346353
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28346571 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttattcttggatgcgaactggttactccac 28346473  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || |||  |||||| ||||||||| |||||| | || |||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||||| || |||||||    
T  28346472 cggagacaaatacaaaatggacaggcgcaagctgcccttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagagacagataggcgggtacaagctgctcttgga 28346374  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccga 236  Q
     |||| || | |||||||||||    
T  28346373 -ttgagctgggcacttgaccga 28346353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Original strand, 29657994 - 29658152
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29657994 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 29658092  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgacc 176  Q
    ||||  | || ||| | | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  29658093 accg--ggcagaaatagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgacc 29658152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 35887906 - 35887775
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgact 294  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||    ||||||| ||   ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  35887906 aggtacaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagt---tttgacaaaatgtagattgagattgact 35887810  T
Q  295 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35887809 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 35887775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18232370 - 18232228
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | || |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18232370 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacgggaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattg 18232272  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  18232271 aggttgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgacc 18232228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28346388 - 28346207
Alignment:
Q  142 caagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaata 239  Q
    ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||  ||  || ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28346388 caagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaaca 28346290  T
Q  240 gaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
     |  || |      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28346289 tattcaca------ggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 28346207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16423597 - 16423495
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttc-ttggacttgaactagccacttg 231  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16423597 agacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacagatagacaggtacaaactgttctttggacttgaactagccacttg 16423498  T
Q  232 acc 234  Q
    |||    
T  16423497 acc 16423495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 18285457 - 18285602
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt--gacaaaatatagat 283  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||| ||| |||  ||||| ||||||||    
T  18285457 caaattgataggtacaagctgttcttgaacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgttttttttttgacaagatatagat 18285556  T
Q  284 tgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  18285557 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 18285602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5020950 - 5020748
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5020950 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 5020852  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgt------ttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt 325  Q
    ||| || |||| || |||    |||||||||||| |      ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  5020851 accaaacagaaacatattcacaggggattggtttttatttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgccgatttaaattgaaaggtagaaatt 5020752  T
Q  326 gacc 329  Q
    ||||    
T  5020751 gacc 5020748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Original strand, 4339564 - 4339710
Alignment:
Q  86 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||  |||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||    
T  4339564 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatggacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaa 4339662  T
Q  185 acaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgac 233  Q
    ||| |||||| |||||||| || ||||||| |||| |||| ||||||||    
T  4339663 acagatagacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgac 4339710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 18300757 - 18300903
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt---gacaaaatataga 282  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||| ||| |||   ||||| |||||||    
T  18300757 caaattgataggtacaagctgttcttgaacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgtttttttttttgacaagatataga 18300856  T
Q  283 ttgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  18300857 ttgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 18300903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4630940 - 4630795
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattgg--tttgtttgacaaaatatagat 283  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || |||   ||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  4630940 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaatcagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagat 4630841  T
Q  284 tgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| ||||||||||| | |||| || |||||||| |||||||||||    
T  4630840 tgagattgacttgacattgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 4630795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4690839 - 4690690
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt------gacaaaatat 279  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||   | ||||||| ||| |||      ||||||||||    
T  4690839 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaacatattcactagggattgttttttttttttttgacaaaatat 4690740  T
Q  280 agattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4690739 agattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtggaaattgacc 4690690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 305
Target Start/End: Original strand, 6535771 - 6535942
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6535771 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctaggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 6535869  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatt 305  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||||||||  ||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6535870 accaaacagaaacatattcactggggattggttt-attggcacaatatagattgaggttgacttgacgtcgatt 6535942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18337795 - 18337639
Alignment:
Q  169 acttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtt 268  Q
    |||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||| |||| || | |||| |||| || |||| ||||||    ||||||| ||||       
T  18337795 acttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccaaacagaaacaaattcacaggggattagttt--- 18337700  T
Q  269 tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18337699 tgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 18337639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 32446328 - 32446166
Alignment:
Q  169 acttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattgg---ttt 265  Q
    |||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||| |||| || | |||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |   |||    
T  32446328 acttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttt 32446230  T
Q  266 gtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32446229 ttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaatcgacc 32446166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 267 - 331
Target Start/End: Original strand, 4789814 - 4789878
Alignment:
Q  267 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4789814 tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaa 4789878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 267 - 331
Target Start/End: Original strand, 15885900 - 15885964
Alignment:
Q  267 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15885900 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaa 15885964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 15885690 - 15885859
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||  |  || || || ||| |||| | ||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  15885690 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgaaaacattgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggaggcgaactggtaactcgac 15885788  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  15885789 cggaaacataaacaaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 15885859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9527173 - 9527004
Alignment:
Q  17 ggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc 116  Q
    ||||| || |||||||||| | |||||||||||  |||| ||| || || || |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  9527173 ggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccaaaatcatagacacatagacaggtgcgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgacc 9527075  T
Q  117 ggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |   |||||| ||||| || || | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  9527074 gataacataagcaaactgatagatacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 9527004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28028453 - 28028300
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattgg----------tttgtttgacaaa 275  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||          ||| |||||||||    
T  28028453 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgggttttttttttttttttgacaaa 28028354  T
Q  276 atatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  28028353 atatagattgagatcgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 28028300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10650395 - 10650278
Alignment:
Q  94 ggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaataga 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || ||    
T  10650395 ggattcgaactggttactccaccgg--acagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattga 10650299  T
Q  194 caggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  10650298 caggtacaagctgctcttgga 10650278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 19701870 - 19701767
Alignment:
Q  11 cagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttac 110  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |  || || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19701870 cagacaggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccaaaatcgtagacacatagacaggtgcgag-ttgttcttggatgcgaactggttac 19701772  T
Q  111 tccac 115  Q
    |||||    
T  19701771 tccac 19701767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24335344 - 24335212
Alignment:
Q  196 ggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgactt 295  Q
    ||||||||| |||||||||   |||||||  |||||||| || |||| || |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  24335344 ggtacaagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcaatggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgactt 24335246  T
Q  296 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||| |||| || |||||||| |||||||||||    
T  24335245 gacgttgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 24335212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4691073 - 4690930
Alignment:
Q  70 atagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagcca 169  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||||| ||||  || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4691073 atagacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagcca 4690975  T
Q  170 cttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||||||| ||| |||||| || || ||||||||| || |||||||    
T  4690974 cttgaccaaacagaaacatattgataggtacaagctgctcttgga 4690930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8218876 - 8218661
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8218876 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 8218778  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttg-------------------acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttg 312  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||||||||                   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  8218777 accaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgttttttttttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattg 8218678  T
Q  313 aaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8218677 aaaggcagaaattgacc 8218661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 8282454 - 8282623
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  ||  | || ||| |||| | ||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  8282454 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagcaaacgggtacaag-tcgttcttggaggcgaactggtaactcgac 8282552  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||  || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8282553 cggaaacgtaaacaaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaaca 8282623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 31028995 - 31029087
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggt 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31028995 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggattcgaactggt 31029087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 329
Target Start/End: Original strand, 16403907 - 16404015
Alignment:
Q  222 tagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtag 320  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |||   |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |     
T  16403907 tagccacttgaccaagtagaaacagattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcaa 16404006  T
Q  321 aaattgacc 329  Q
    |||||||||    
T  16404007 aaattgacc 16404015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10403324 - 10403191
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10403324 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacaaaagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 10403226  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttg 266  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||||    
T  10403225 accaaacagaaacatattcactggggattggtttg 10403191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18232575 - 18232440
Alignment:
Q  99 cgaactggttactccaccggcgacataaacaaaca---gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagaca 195  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||| |   |||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| || ||| ||||||     
T  18232575 cgaactggttactccaccggagacaaatacaaaaaatggacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagagacagatagacg 18232477  T
Q  196 ggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgac 233  Q
    |||||||| || ||||||| |||| |||| ||||||||    
T  18232476 ggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgac 18232440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4424188 - 4424107
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  4424188 agacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 4424107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4690896 - 4690780
Alignment:
Q  70 atagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagcca 169  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||||| ||||  || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4690896 atagacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagcca 4690798  T
Q  170 cttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||||||| ||| ||||||    
T  4690797 cttgaccaaacggaaaca 4690780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35222037 - 35221972
Alignment:
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaat 190  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35222037 aaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactaaccacttgaccgaacagaaacaaat 35221972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18338183 - 18338124
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagaca 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18338183 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcacccgactgaaagcaaaggcaaatagaca 18338124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Original strand, 22380692 - 22380745
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaat 190  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22380692 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 22380745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4691016 - 4690968
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4691016 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 4690968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 4729246 - 4729187
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagaca 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  4729246 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagaca 4729187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 6209515 - 6209456
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagaca 76  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  6209515 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagaca 6209456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 112
Target Start/End: Original strand, 15885332 - 15885427
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactc 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || ||| ||| | | |||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15885332 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgggaataaaagcagacaaacaggtgcgag-ttgttcttggattcgaactggtcactc 15885427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9527051 - 9526984
Alignment:
Q  198 tacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggttt 265  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||||||||    
T  9527051 tacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttt 9526984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15368514 - 15368463
Alignment:
Q  191 agacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaa 242  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15368514 agacaggtgcaagctgctcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaa 15368463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 4339789 - 4339839
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  4339789 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 4339839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4424083 - 4424017
Alignment:
Q  121 acataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  4424083 acataagcaaattgacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaaca 4424017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5474237 - 5474145
Alignment:
Q  142 caagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccga 236  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||||| || ||||||| |||| || | |||||||||||    
T  5474237 caagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgactgaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccga 5474145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Original strand, 22380334 - 22380415
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactga--aacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || | |  |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  22380334 agacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaaatcataaacacatagacaggtacgagctgttcttg 22380415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 31957546 - 31957596
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  31957546 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 31957596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 51789192 - 51789142
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  51789192 aggtacaagctgctcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 51789142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Original strand, 4339669 - 4339749
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  4339669 agacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgactgaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 4339749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18232481 - 18232401
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  18232481 agacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgactgaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 18232401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18250007 - 18249927
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  18250007 agacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 18249927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32446481 - 32446401
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  32446481 agacgggtacaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaatagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 32446401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 4690890 - 4690811
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttgga 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| |||| | |||||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  4690890 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagc-tgttcttgga 4690811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 4691067 - 4690988
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttgga 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| |||| | |||||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  4691067 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagc-tgttcttgga 4690988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Original strand, 29141627 - 29141726
Alignment:
Q  17 ggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc 116  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||| || || || |||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29141627 ggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccaaaatcatagacacatagacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggttactcaacc 29141725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4424726 - 4424683
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4424726 gacaggtacaagctgttcttggactcaaactagccacttgaccg 4424683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Original strand, 5601930 - 5601973
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5601930 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 5601973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16600259 - 16600216
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16600259 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 16600216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Original strand, 17977255 - 17977298
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17977255 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 17977298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24335882 - 24335839
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24335882 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 24335839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 182 - 237
Target Start/End: Original strand, 28108922 - 28108976
Alignment:
Q  182 gaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaa 237  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28108922 gaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaa 28108976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28346805 - 28346762
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28346805 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 28346762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Original strand, 31957075 - 31957118
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31957075 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 31957118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51789668 - 51789625
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  51789668 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 51789625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 5602401 - 5602451
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  5602401 aggtacaagctgttcttggacttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 5602451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7080399 - 7080349
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  7080399 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 7080349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15368413 - 15368359
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  15368413 agacaggtacaagctgttcttggacttgaactaaccacttgaccaaacagaaaca 15368359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16423407 - 16423334
Alignment:
Q  23 agttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggat 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| | |||||| || |||| ||||| |||||||||||    
T  16423407 agttgttcttggatttgaactagtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagc-tgttcttggat 16423334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28028444 - 28028394
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  28028444 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 28028394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32446897 - 32446855
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32446897 gacaggtacaagctgttcttggatttaaactagccacttgacc 32446855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Original strand, 17977919 - 17978000
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||| || |  |||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  17977919 agacgggtacaagctgttcttggacttgaactggtaacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 17978000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35887906 - 35887853
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaat 190  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35887906 aggtacaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaat 35887853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 4729307 - 4729267
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4729307 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 4729267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 4789325 - 4789365
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4789325 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 4789365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5659587 - 5659536
Alignment:
Q  185 acaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaa 237  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5659587 acaaatagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaa 5659536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 5659758 - 5659718
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5659758 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 5659718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 6209576 - 6209536
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6209576 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 6209536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 236
Target Start/End: Original strand, 6535297 - 6535341
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccga 236  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  6535297 gacaggtacaagctgttcttggattcaaactagccacttgaccga 6535341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Original strand, 17969077 - 17969117
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17969077 aggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 17969117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 22380098 - 22380138
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22380098 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 22380138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 234
Target Start/End: Original strand, 22380563 - 22380614
Alignment:
Q  182 gaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22380563 gaaacatatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgacc 22380614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32446305 - 32446250
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaat 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||| |||||||||    
T  32446305 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccgaacagaaacaaat 32446250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 35888367 - 35888327
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  35888367 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 35888327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 100)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 332
Target Start/End: Original strand, 16442744 - 16443072
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16442744 tggaaaagtagacaggtatgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaa 16442843  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16442844 ctggttactccactggagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggatttgaactagccacttgaccgaacagaaacagatagacaggtacaa 16442943  T
Q  203 gttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcg 302  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16442944 gctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaatggggattagttt-tttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcg 16443042  T
Q  303 attcgatttgaaaggtagaaattgaccaac 332  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16443043 atttgatttgaaaggtagaaattaaccaac 16443072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 331
Target Start/End: Original strand, 26508464 - 26508775
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508464 gtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 26508563  T
Q  118 gcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggactt 217  Q
    |  | | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26508564 g--atagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacagatagacaggtgcaagctgttcttggactt 26508661  T
Q  218 gaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaagg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26508662 gaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 26508761  T
Q  318 tagaaattgaccaa 331  Q
    ||||||||||||||    
T  26508762 tagaaattgaccaa 26508775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 327
Target Start/End: Original strand, 16744331 - 16744640
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744331 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacatgtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 16744429  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |||||  |||  |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  16744430 accgg--acaggaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgg 16744526  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    | ||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16744527 atttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 16744626  T
Q  314 aaggtagaaattga 327  Q
    ||||||||||||||    
T  16744627 aaggtagaaattga 16744640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 327
Target Start/End: Original strand, 4138055 - 4138365
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4138055 gtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgctcttggatgcgaactggttactccac 4138153  T
Q  116 cggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  4138154 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 4138252  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaa 314  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| || |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4138253 cttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaa 4138352  T
Q  315 aggtagaaattga 327  Q
    |||||||||||||    
T  4138353 aggtagaaattga 4138365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10848961 - 10848745
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10848961 tggaaaagtagacaggtatgagttgtccttggattcgaactggtcactcgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 10848862  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10848861 ctggttactccaccggagacataaacaaacagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaggtacaa 10848762  T
Q  203 gttgttcttggacttga 219  Q
    | |||||||||||||||    
T  10848761 gctgttcttggacttga 10848745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 327
Target Start/End: Original strand, 5140087 - 5140398
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5140087 aggtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 5140185  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttctt 211  Q
    ||||| ||||  |||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||    
T  5140186 accggagaca--aacaaataggtaggtacaagctgctcttgga-ttgagctaggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttctt 5140282  T
Q  212 ggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgattt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  5140283 ggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgatttgacgtcgatttgattt 5140382  T
Q  312 gaaaggtagaaattga 327  Q
    ||||||||||||||||    
T  5140383 gaaaggtagaaattga 5140398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5165966 - 5165751
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5165966 aggtacgagctgttcttg-atttgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 5165869  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  5165868 cggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 5165770  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5165769 ttgaactagccacttgacc 5165751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2162171 - 2161954
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2162171 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 2162073  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  2162072 cggggacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagatgggtacaagctgttcttgga 2161974  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2161973 cttgaactagccacttgacc 2161954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Original strand, 26507215 - 26507433
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507215 aggtacgagttgttcttggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 26507313  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||  |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||    
T  26507314 cggagacaaatacaaaatagacagacgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacggatagacgggtacaagctgttcttgga 26507412  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26507413 cttgaactagccacttgaccg 26507433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Original strand, 39204483 - 39204701
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39204483 aggtacgagttgttcttggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 39204581  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||  |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||    
T  39204582 cggagacaaatacaaaatagacagacgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacggatagacgggtacaagctgttcttgga 39204680  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39204681 cttgaactagccacttgaccg 39204701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16048650 - 16048463
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  16048650 tggaaaagtagaaaggtacgagttgttcttggattcgaactggtcagtcgaccgaaaccaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcgtggattcgaa 16048551  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaat 190  Q
    || ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16048550 ctagttactccactagagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggattcgaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 16048463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 26507801 - 26508009
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26507801 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 26507900  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  26507901 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 26507997  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  26507998 gctgctcttgga 26508009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 39205069 - 39205277
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39205069 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 39205168  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  39205169 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 39205265  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  39205266 gctgctcttgga 39205277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45738738 - 45738530
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45738738 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 45738639  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  45738638 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 45738542  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  45738541 gctgctcttgga 45738530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2780730 - 2780511
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2780730 aggtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgggcttgttcttggatgcgaactggttactcc 2780632  T
Q  114 accggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  2780631 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 2780533  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2780532 gacttgaactagccacttgacc 2780511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Original strand, 31083199 - 31083418
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31083199 gtacgagttgttcttaaggattcgaactggtcactcgactgaaagcaa-ggcaaacagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 31083297  T
Q  116 cggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | |||||  ||||||| ||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  31083298 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgcccttgga-tcgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 31083396  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccga 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  31083397 cttgaactagccactcgaccga 31083418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45739021 - 45738807
Alignment:
Q  21 cgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg 118  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45739021 cgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg 45738923  T
Q  119 cgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggactt 217  Q
     |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45738922 agacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggactt 45738824  T
Q  218 gaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||    
T  45738823 gaactagccacttgacc 45738807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26442813 - 26442605
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  26442813 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacagatgtgagcttgttcttggatgcgaa 26442714  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  26442713 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 26442617  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  26442616 gctgctcttgga 26442605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 39205904 - 39206112
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39205904 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 39206003  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||    
T  39206004 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatactgacaggtacaa 39206100  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  39206101 gctgctcttgga 39206112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5155666 - 5155450
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| || | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5155666 aggtacgagctgttcttg-atttgaactagtcactcgactgacagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 5155569  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||  ||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  5155568 cggagacaaagacgaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacaaaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 5155470  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5155469 cttgaactagccacttgacc 5155450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 31131279 - 31130977
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31131279 aggtacgagttgttcttatggattcgaactagttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 31131181  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga----actgaaacaaatagacaggtacaagttgttc 209  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    | ||||  || || || | | ||||| ||||    
T  31131180 accg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccgataacattgaa--aagtaaacggatgcaagtcgttc 31131086  T
Q  210 ttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgat 309  Q
    |||||   |||||||  ||||||||||| |||| || |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  31131085 ttggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttg-ttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttggt 31130987  T
Q  310 ttgaaaggta 319  Q
    ||||||||||    
T  31130986 ttgaaaggta 31130977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 10909225 - 10909441
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| | ||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  10909225 aggtacgagttgttcttg-atcggaactggccactcgactgaaagcaaaggcgaatagacaggtgtgagcttgttcttggatacgaactggttactcgat 10909323  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  10909324 cggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 10909422  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10909423 ttgaactagccacttgacc 10909441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2161933 - 2161620
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  2161933 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 2161835  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  2161834 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgg 2161738  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2161737 acttgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattggtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 2161638  T
Q  314 aaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2161637 aaggtagaaattgaccaa 2161620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 11417444 - 11417657
Alignment:
Q  20 acgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggc 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11417444 acgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaggcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 11417542  T
Q  120 gacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttg 218  Q
    |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||  | | || ||||| |||||| | ||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11417543 gacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttcta-tcgagctagctacttgagcaaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttg 11417641  T
Q  219 aactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  11417642 aactagccacttgacc 11417657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 16511019 - 16511235
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| | ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16511019 aggtacgagttgttcttg-atcggaactggccactcgattgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttattggatgcgaactggtcactccac 16511117  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| | ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  16511118 cggagacaaagacaaataaacaggcgtaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 16511216  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
     ||||||||||||||||||    
T  16511217 atgaactagccacttgacc 16511235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4206758 - 4206448
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4206758 gtacgagttgttcttacggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 4206660  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga----actgaaacaaatagacaggtacaagttgttctt 211  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||    | ||||  || || || ||| ||||| ||||||    
T  4206659 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacattgaa--aagtaaacgggtgcaagtcgttctt 4206565  T
Q  212 ggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttg-tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatt 310  Q
    |||   |||||||  ||||||||||| |||| || |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |    
T  4206564 ggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgtat 4206465  T
Q  311 tgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||||||| |||||||||    
T  4206464 tgaaaggcagaaattga 4206448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11448211 - 11448043
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11448211 gtacgagttgttcttagggattcgaactagttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 11448113  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  11448112 cg--gacaaaaacagatagacaggtacaagctgctcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 11448043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 329
Target Start/End: Original strand, 24585395 - 24585600
Alignment:
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaact 222  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || || || || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24585395 aaacatactgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcagattgataggtacaagctgttcttggacttgaact 24585493  T
Q  223 agccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaa 322  Q
    |||||||||||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24585494 agccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaa 24585593  T
Q  323 attgacc 329  Q
    |||||||    
T  24585594 attgacc 24585600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22149306 - 22149112
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22149306 gtacgagttgttcttacggattcgaactggtgactcgactgaaaacaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 22149208  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  22149207 cg--gaccgaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 22149112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 31557099 - 31557293
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31557099 gtacgagttgttcttacggattcgaactagttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 31557197  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| || || |||||||    
T  31557198 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgaccaaacggaaacatatcgacaggtacgagctgctcttgga 31557293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 39205617 - 39205834
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||  |  |||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39205617 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtgactcgactgaaaacat-gtaaaattggcaggtacgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 39205715  T
Q  116 cggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | |||||  ||||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  39205716 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgcttttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 39205814  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39205815 cttgaactagccacttgacc 39205834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Original strand, 26312733 - 26312928
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26312733 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 26312831  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||| |||| || |||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26312832 accgaacagaaacatattcactggggattggtttg-ttgacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 26312928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 125 - 327
Target Start/End: Original strand, 39206081 - 39206284
Alignment:
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaa--ctgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaact 222  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| |||||||  |  || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39206081 aaacatactgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgaaaacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaact 39206179  T
Q  223 agccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaa 322  Q
    |||||||||||| || |||| || |||   ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39206180 agccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttagtttgcttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaa 39206279  T
Q  323 attga 327  Q
    |||||    
T  39206280 attga 39206284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26520302 - 26520090
Alignment:
Q  21 cgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg 118  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26520302 cgagttgttcttacggattcgaactggtgactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg 26520204  T
Q  119 cgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggactt 217  Q
     |||| | || ||| ||||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || ||||||| ||    
T  26520203 agacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgcttttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttgga-tt 26520106  T
Q  218 gaactagccacttgac 233  Q
    || |||| ||||||||    
T  26520105 gagctagtcacttgac 26520090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11448105 - 11447960
Alignment:
Q  183 aaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatataga 282  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  11448105 aaacagatagacaggtacaagctgctcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtaga 11448007  T
Q  283 ttgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11448006 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 11447960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26442510 - 26442315
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26442510 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 26442412  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26442411 accaaacagaaacatattcactggggattggttt-tttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 26442315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Original strand, 26662782 - 26662977
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26662782 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 26662880  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26662881 accaaacagaaacatattcactggggattagtttgttgg-caaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 26662977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Original strand, 26677974 - 26678169
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26677974 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 26678072  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26678073 accaaacagaaacatattcactggggattagtttgttgg-caaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 26678169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26596921 - 26596727
Alignment:
Q  135 acaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttga 232  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26596921 acaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttga 26596823  T
Q  233 ccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    || || |||| || |||   |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26596822 ccaaacagaaacatattcactggggattagttt-tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 26596727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 31557324 - 31557469
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggttt-gtt-tgacaaaatatagat 283  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31557324 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttgttctgacaaaatatagat 31557423  T
Q  284 tgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31557424 tgagattgacttgacgtcgattcgaattgaaaggtagaaattgacc 31557469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 2780438 - 2780294
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagatt 284  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2780438 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagatt 2780339  T
Q  285 gaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    || |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  2780338 gagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 2780294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 26312561 - 26312755
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26312561 gtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 26312659  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  26312660 cggagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 26312755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 26267659 - 26267855
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26267659 aggtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactagttactcc 26267757  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  || | ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  26267758 accg--gagagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 26267854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26520073 - 26519878
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26520073 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 26519975  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26519974 accaaacagaaacatattcactggggattggtttg-ttgacaaaatatagattgagattgacctgacatcgatttgatttgaaaggtagaaactgacc 26519878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26597096 - 26596900
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || ||  ||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26597096 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttacttgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 26596998  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||| || ||||||    
T  26596997 accg--gacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattaacaggtacaagctgctcttgg 26596901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16048528 - 16048382
Alignment:
Q  183 aaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatataga 282  Q
    ||||||| |||||||| |||| || ||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  16048528 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggattcgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattaggtt--ttgacaaaatataga 16048431  T
Q  283 ttgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16048430 ttgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaa 16048382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 24585235 - 24585426
Alignment:
Q  21 cgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg 118  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24585235 cgagttgttcttatggattcgaactggtcacccgactgaaaacat-ggtaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg 24585333  T
Q  119 cgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
     |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||  |||||| |  |||||||||||| || |||||||    
T  24585334 agac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaatggaaacatactgacaggtacaagctgctcttgga 24585426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5155265 - 5155134
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgact 294  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||    ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5155265 aggtacaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagt---tttgacaaaatatagattgaaattgact 5155169  T
Q  295 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5155168 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 5155134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5165566 - 5165435
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgact 294  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||    ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5165566 aggtacaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagt---tttgacaaaatatagattgaaattgact 5165470  T
Q  295 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5165469 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 5165435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22149081 - 22148939
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22149081 caaattgataggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttt-tttgacaaaatatagattg 22148983  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  22148982 agattgacttgacatcgatttgaattgaaaggcagaaatcgacc 22148939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 182 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 45394435 - 45394288
Alignment:
Q  182 gaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatata 280  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| || |||   ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  45394435 gaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaagtata 45394337  T
Q  281 gattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45394336 gattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaagatagaaattgacc 45394288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 45738552 - 45738351
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45738552 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 45738454  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgt-----ttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattg 326  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||| |     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  45738453 accaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattg 45738354  T
Q  327 acc 329  Q
    |||    
T  45738353 acc 45738351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 10909867 - 10910014
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt----gacaaaatatag 281  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||   ||||||||| ||| |||    ||||||||||||    
T  10909867 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattgttttttttttttgacaaaatatag 10909966  T
Q  282 attgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10909967 attgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 10910014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 31083492 - 31083687
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31083492 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacctgaactagccacttg 31083590  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    ||| || |||| || |||   ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  31083591 accaaacagaaacatattcactggaggttggtttggttgacaaaatatagattgagattgatttgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgac 31083687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 214
Target Start/End: Original strand, 26662656 - 26662804
Alignment:
Q  63 aaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgat 162  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  26662656 aaggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcaaactggttactccaccg--gagagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgag 26662752  T
Q  163 ctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  26662753 ctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 26662804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 214
Target Start/End: Original strand, 26677848 - 26677996
Alignment:
Q  63 aaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgat 162  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  26677848 aaggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcaaactggttactccaccg--gagagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgag 26677944  T
Q  163 ctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  26677945 ctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 26677996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 11417726 - 11417867
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    |||||||  |||| |||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  11417726 caaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacataaacaaattcacaggggattagttt-tttgacaaaatataggttg 11417823  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11417824 aaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 11417867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 267 - 329
Target Start/End: Original strand, 16511451 - 16511513
Alignment:
Q  267 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16511451 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 16511513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 31131396 - 31131303
Alignment:
Q  20 acgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactc 112  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31131396 acgagttgttcttaaggattcgaactggtgactcgactgaaaacaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggtgactc 31131303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10848839 - 10848774
Alignment:
Q  183 aaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaat 248  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10848839 aaacaaacagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 10848774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 31083373 - 31083476
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccactt 230  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31083373 agacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttctcggacttgaactagccactt 31083472  T
Q  231 gacc 234  Q
    ||||    
T  31083473 gacc 31083476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Original strand, 39205255 - 39205357
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39205255 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 39205353  T
Q  232 accg 235  Q
    ||||    
T  39205354 accg 39205357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45394541 - 45394373
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttctt--ggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||  |  |||| | ||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  45394541 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtgactcgactgaaaacat-gtaaaattggcaggtacaag-ttgttcttaaggattcgaactggttactcc 45394444  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||||  ||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  45394443 accgg--acagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaaca 45394373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2780549 - 2780379
Alignment:
Q  17 ggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaa-caaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||| || |||||||||| | ||||||| |||  |||| |||| || ||||| |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  2780549 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacccaaaatcataggcacatagacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtcactcgac 2780451  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||   | |||| ||||  || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  2780450 cgataatataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 2780379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 187
Target Start/End: Original strand, 10909810 - 10909926
Alignment:
Q  70 atagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagcca 169  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||||| ||||  || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10909810 atagacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagcca 10909908  T
Q  170 cttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||||||| ||| ||||||    
T  10909909 cttgaccaaacggaaaca 10909926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26442565 - 26442488
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  26442565 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 26442488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 16511256 - 16511425
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | ||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  16511256 aggtacgagctgttcttggattcgagctggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggaggcgaactggtaactcgac 16511354  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
     ||  ||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  16511355 tggaaacataaacaaataggtaggttcaaactgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 16511425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 242
Target Start/End: Original strand, 26267895 - 26267942
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaa 242  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26267895 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaa 26267942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26442627 - 26442526
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26442627 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 26442529  T
Q  232 acc 234  Q
    |||    
T  26442528 acc 26442526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Original strand, 11417614 - 11417695
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||| || |||||||    
T  11417614 agacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaaccgaaacatattgacaagtacaagctgctcttgga 11417695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 26508049 - 26508126
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  26508049 aggtacaagctgttcttgggcttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 26508126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 31083437 - 31083514
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  31083437 aggtacaagctgttctcggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 31083514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 26507987 - 26508088
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26507987 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgggcttgaactagccacttg 26508085  T
Q  232 acc 234  Q
    |||    
T  26508086 acc 26508088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 26267895 - 26267945
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26267895 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 26267945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26520131 - 26520051
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  26520131 agacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgactgaacggaaacatatcgacaggtacaagctgctcttgga 26520051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 2780489 - 2780410
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttgga 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | | |||||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  2780489 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtcactcgaccgataatataagcaaattgataggtacaagc-tgttcttgga 2780410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Original strand, 10909816 - 10909895
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttgga 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| |||| | |||||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  10909816 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagc-tgttcttgga 10909895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 112
Target Start/End: Original strand, 26507691 - 26507789
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaa-caaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactc 112  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| |||| || || || |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  26507691 aggtacgagttgttcttatggattcgaactagtgactcgacccaaaatcatagacacatagacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactc 26507789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 26508161 - 26508360
Alignment:
Q  11 cagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttac 110  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||  ||||| || || ||||||| ||||  |  || || || |||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  26508161 cagacaggtgcgagtagttcttggatctgaactggttactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtgcaag-tcgttcttggatgcgaactggtaac 26508259  T
Q  111 tccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttct 210  Q
    |  ||||   ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || |  |||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||    
T  26508260 ttgaccga--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggtacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctct 26508356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 112
Target Start/End: Original strand, 39204959 - 39205057
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaa-caaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactc 112  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| |||| || || || |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  39204959 aggtacgagttgttcttatggattcgaactagtgactcgacccaaaatcatagacacatagacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactc 39205057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 177
Target Start/End: Original strand, 39205301 - 39205357
Alignment:
Q  121 acataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccg 177  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39205301 acataagcaaattgacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccg 39205357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Original strand, 4137814 - 4137857
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4137814 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 4137857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 10909462 - 10909556
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttact 111  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||  |  || || || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10909462 aggtacgagctgttcttggatttgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtgcaag-tcgttcttggatgcgaactggttact 10909556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 10909639 - 10909733
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttact 111  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||  |  || || || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10909639 aggtacgagctgttcttggatttgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtgcaag-tcgttcttggatgcgaactggttact 10909733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Original strand, 26662430 - 26662473
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26662430 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 26662473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Original strand, 26677622 - 26677665
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26677622 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 26677665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45394844 - 45394801
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45394844 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 45394801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 124
Target Start/End: Original strand, 16442683 - 16442744
Alignment:
Q  62 aaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacat 124  Q
    ||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  16442683 aaaggcagacagacaggtgcgag-ttgttcttggatgcgaactggtcactcgaccggggacat 16442744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 31557333 - 31557383
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  31557333 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 31557383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5155265 - 5155212
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaat 190  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5155265 aggtacaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaat 5155212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5155718 - 5155689
Alignment:
Q  86 ttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5155718 ttgttcttggatgcgaactggttactccac 5155689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5165566 - 5165513
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaat 190  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5165566 aggtacaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaat 5165513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5166018 - 5165989
Alignment:
Q  86 ttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5166018 ttgttcttggatgcgaactggttactccac 5165989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Original strand, 11417735 - 11417787
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaat 190  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11417735 aggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacataaacaaat 11417787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 2162232 - 2162192
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2162232 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 2162192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 10909164 - 10909204
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10909164 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 10909204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 11417379 - 11417419
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11417379 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 11417419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 16510958 - 16510998
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16510958 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 16510998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Original strand, 26267361 - 26267401
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26267361 aggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 26267401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Original strand, 26312322 - 26312362
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26312322 aggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 26312362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 140)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 20 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23899263 - 23898954
Alignment:
Q  20 acgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23899263 acgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 23899164  T
Q  120 gacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttga 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23899163 gacaaaaacaaacagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggacttga 23899065  T
Q  220 actagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggta 319  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23899064 actagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttt-tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggta 23898966  T
Q  320 gaaattgaccaa 331  Q
    ||||||||||||    
T  23898965 gaaattgaccaa 23898954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22895801 - 22895485
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22895801 aggtacgagctgttcttggatttgaactagccactcaaccgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 22895702  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22895701 tggagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggatttgaactagccacttgaccgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggac 22895602  T
Q  216 ttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggatt-ggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||   |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22895601 ttgaactagccacttgaccgaacagaaacagattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaa 22895502  T
Q  315 aggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||||| |||||||||    
T  22895501 aggtagagattgaccaa 22895485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25207751 - 25207507
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25207751 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgactgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgctcttggatgcgaa 25207652  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25207651 ctggttactccaccggagaca-aaacaaacagacaggtgcaagctgttcttgaatttgaactagccacttgactgaacagaaacaaatagacaggtacaa 25207553  T
Q  203 gttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaat 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25207552 gctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaatagaaacaaat 25207507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25271907 - 25271663
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25271907 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgactgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgctcttggatgcgaa 25271808  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25271807 ctggttactccaccggagaca-aaacaaacagacaggtgcaagctgttcttgaatttgaactagccacttgactgaacagaaacaaatagacaggtacaa 25271709  T
Q  203 gttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaat 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25271708 gctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaatagaaacaaat 25271663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41682077 - 41681762
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||  | |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41682077 aggtacgagttgttcttatggattcgaactggttgctcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 41681979  T
Q  114 accggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  41681978 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 41681880  T
Q  213 gacttgaactagccacttgaccgaatagaagc-aaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgattt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  41681879 gacttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaatt 41681780  T
Q  312 gaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||| ||| |||||||    
T  41681779 gaaaggcagacattgacc 41681762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 22991735 - 22991951
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22991735 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 22991833  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | || || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  22991834 cggagacaaagaccaatagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 22991932  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22991933 ttgaactagccacttgacc 22991951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33882498 - 33882185
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33882498 gtacgagttgttcttaaggattcgaactagttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggacgcgaactggttactccac 33882400  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |||  ||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  33882399 cgg--acagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgacaacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgg 33882303  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgt--ttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgattt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||   ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33882302 acttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgattt 33882203  T
Q  312 gaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33882202 gaaaggtagaaattgacc 33882185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 13178936 - 13179153
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13178936 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 13179034  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13179035 cggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagttgttcttgga 13179133  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13179134 cttgaactagccacttgacc 13179153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24609794 - 24609579
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24609794 aggtacgagttattcttg-attcgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 24609697  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| || | | || || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  24609696 cggagataaagaccaatagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 24609598  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24609597 ttgaactagccacttgacc 24609579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 125 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25207572 - 25207367
Alignment:
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactag 224  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  25207572 aaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaatagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaaccag 25207473  T
Q  225 ccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaat 324  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||   | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25207472 ccacttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagttt-tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaat 25207374  T
Q  325 tgaccaa 331  Q
    |||||||    
T  25207373 tgaccaa 25207367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 125 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25271728 - 25271523
Alignment:
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactag 224  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  25271728 aaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaatagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaaccag 25271629  T
Q  225 ccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaat 324  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||   | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25271628 ccacttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagttt-tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaat 25271530  T
Q  325 tgaccaa 331  Q
    |||||||    
T  25271529 tgaccaa 25271523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33300152 - 33299935
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33300152 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 33300054  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33300053 cggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgttcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagttgttcttgga 33299955  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33299954 cttgaactagccacttgacc 33299935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23727846 - 23727631
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23727846 aggtacgagctgttcttg-atttgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 23727749  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  23727748 cggagacaaagacaaatagacaagcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 23727650  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23727649 ttgaactagccacttgacc 23727631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24977393 - 24977177
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| | ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24977393 aggtacgagttgttcttg-atcggaactggccactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 24977295  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24977294 cggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccactcgagcgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggac 24977196  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24977195 ttgaactagccacttgacc 24977177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30942176 - 30941965
Alignment:
Q  20 acgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggc 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30942176 acgagttgttcttg-attcgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaataaacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 30942079  T
Q  120 gacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttga 219  Q
    |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  30942078 gacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggatttga 30941980  T
Q  220 actagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||    
T  30941979 actagccacttgacc 30941965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 13179221 - 13179429
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13179221 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 13179320  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  13179321 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 13179417  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  13179418 gctgctcttgga 13179429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11556901 - 11556684
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11556901 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcggctgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcctc 11556803  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||    
T  11556802 cggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcaaacagaaacggatagacgggtacaagctgttcttgga 11556704  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11556703 cttgaactagccacttgacc 11556684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23633518 - 23633302
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||| ||||||||||||| ||  ||||| | ||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23633518 aggtgcgagttgttcttg-atcggaactggccactcgactgaaagcaaaggcagatagacaggtgcgaggttgttcttggatgcgaactggttactccac 23633420  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  23633419 cggagacaaagacaaatagacaggcgccagctgctcttgga-ttgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 23633321  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23633320 ttgaactagccacttgacc 23633302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 236
Target Start/End: Original strand, 13435373 - 13435594
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435373 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 13435471  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| | ||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  13435472 accggggacaaatacaaaataaacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 13435570  T
Q  213 gacttgaactagccacttgaccga 236  Q
    |||||||||||| |||| ||||||    
T  13435571 gacttgaactaggcactcgaccga 13435594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24731459 - 24731242
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24731459 aggtacgagttgttcttagggattcgaactagttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 24731361  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||    
T  24731360 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttg 24731262  T
Q  213 gacttgaactagccacttgac 233  Q
    || |||| |||| ||||||||    
T  24731261 ga-ttgagctagtcacttgac 24731242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 33523774 - 33523464
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33523774 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 33523676  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga----actgaaacaaatagacaggtacaagttgttc 209  Q
    ||   ||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||    | ||||  || || || ||||||||| ||||    
T  33523675 ac---cgacagaaacagatagccaggtacaagctgctcttgga-ttgagctaggcactcgaccgataacattgaa--aagtaaacgggtacaagtcgttc 33523582  T
Q  210 ttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgat 309  Q
    |||||   |||||||  |||||||| || |||| || |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  33523581 ttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttg-ttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaa 33523483  T
Q  310 ttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  33523482 ttgaaaggtaaaaattgac 33523464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Original strand, 40466492 - 40466686
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40466492 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 40466590  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40466591 accaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 40466686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 32589214 - 32589357
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32589214 caaattgacaggtacaagccgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattg 32589313  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32589314 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 32589357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 37745060 - 37745256
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37745060 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 37745158  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| || || ||||||    
T  37745159 accg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacgagctgctcttgg 37745255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11556722 - 11556414
Alignment:
Q  17 ggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc 116  Q
    ||||| || |||||||||| | ||||||| |||  |||| ||| || || || |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  11556722 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaaatcatagacatatagacaggtgcgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgacc 11556624  T
Q  117 ggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |   ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  11556623 ga--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgga 11556527  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaa 314  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    ||||||| |||| ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11556526 cttgaactagccacctgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaata--ggttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaa 11556429  T
Q  315 aggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||||||||    
T  11556428 aggtagaaattgacc 11556414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 15751576 - 15751767
Alignment:
Q  21 cgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg 118  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15751576 cgagttgttcttacggattcgaactggtgactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg- 15751673  T
Q  119 cgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
     |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  15751674 -gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatagacaggtacaagctgctcttgga 15751767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 13317536 - 13317733
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317536 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 13317634  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||    
T  13317635 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttg 13317733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 18368238 - 18368435
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18368238 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 18368336  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  18368337 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccgcttgagcgaacggaaacaaattgacaggtacaagctgctcttgga 18368435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 28952508 - 28952702
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28952508 aggtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 28952606  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||  |||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||| || |||||    
T  28952607 accg--gacagaaacggatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacggaaacgtattgacaggtacaagctgctcttg 28952702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3796809 - 3796612
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3796809 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcctggacttgaactagccacttg 3796711  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtt-tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3796710 accaaacagaaacatattcactggggattggtttattctgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 3796612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 18493707 - 18493850
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18493707 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattg 18493806  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18493807 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggcagaaattgacc 18493850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 28952735 - 28952877
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28952735 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattg 28952833  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28952834 aaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagatagaaattgacc 28952877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 329
Target Start/End: Original strand, 8658388 - 8658575
Alignment:
Q  142 caagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaata 239  Q
    ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8658388 caagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaaca 8658486  T
Q  240 gaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8658487 gaaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 8658575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 12139436 - 12139241
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12139436 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 12139338  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||| |||| || |||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12139337 accgaacagaaacatattcactggggattggtttg-ttgacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 12139241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 18493480 - 18493676
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18493480 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggtgactcgactgaaaacaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 18493578  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || ||  |||||||| || ||||||    
T  18493579 accg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgatgggtacaagctgctcttgg 18493675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31438875 - 31438689
Alignment:
Q  25 ttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacat 124  Q
    |||||||||||| |||||| || || | |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  31438875 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacag 31438778  T
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  31438777 aaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 31438689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37762248 - 37762053
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||| |||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37762248 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgatcgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 37762150  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||| |||| || |||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  37762149 accgaacagaaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 37762053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Original strand, 40466320 - 40466535
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40466320 gtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 40466418  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||  || | ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||     
T  40466419 cg--gagagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga- 40466514  T
Q  216 ttgaactagccacttgaccga 236  Q
    |||| || | |||||||||||    
T  40466515 ttgagctgggcacttgaccga 40466535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 37664391 - 37664585
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||| |||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37664391 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgatcgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 37664489  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37664490 accaaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgaattgaaaggtagagattgac 37664585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 32588989 - 32589183
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32588989 gtacgagttgttcttacggattcgaactggtgactcgactgaaaacaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 32589087  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || ||||||||| || || |||||||    
T  32589088 cg--gacagaaacagatagacagatacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacgagctgctcttgga 32589183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24731225 - 24731028
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24731225 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 24731127  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24731126 accaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattaagattgacttaacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 24731028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26487595 - 26487453
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26487595 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttg-ttgacaaaatataaattg 26487497  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26487496 agattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 26487453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 2518319 - 2518124
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2518319 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 2518221  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2518220 accaaacagaaacatattcactggggattagtttgcttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttga-ttgaaaggtagaaattgacc 2518124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Original strand, 8658205 - 8658423
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8658205 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 8658303  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||||| || |||||||    
T  8658304 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagagacagataggcgggtacaagctgctcttgga 8658402  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccga 236  Q
     |||| || | |||||||||||    
T  8658403 -ttgagctgggcacttgaccga 8658423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 9324738 - 9324543
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9324738 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 9324640  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||| |||| || |||   ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  9324639 accgaacagaaacatattcactggagattggtttgtt-gacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 9324543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11331022 - 11330826
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11331022 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 11330924  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  11330923 accggagac--aaacatatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcatttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 11330827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 30175742 - 30175547
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  30175742 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttg 30175644  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30175643 accaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 30175547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34623947 - 34623751
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34623947 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 34623849  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||| || ||||||    
T  34623848 accg--gacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattaacaggtacaagctgctcttgg 34623752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2518448 - 2518297
Alignment:
Q  63 aaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttga 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2518448 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttctcggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttga 2518350  T
Q  162 tctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
     |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  2518349 gctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 2518297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9324910 - 9324716
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9324910 gtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 9324812  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  9324811 cggagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 9324716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12139608 - 12139414
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12139608 gtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 12139510  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  12139509 cggagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 12139414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28656470 - 28656330
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagatt 284  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28656470 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagatt 28656371  T
Q  285 gaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt 325  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28656370 gagattgacttgacgtcgatttggtttgaaaggtagaaatt 28656330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33299914 - 33299594
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  33299914 aggtacgagctgttcttggattcgaactggttactcaaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 33299816  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || |||||||  ||||||||| |||||||||    
T  33299815 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaataggtaggtacaagctgttcttgg 33299719  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-------gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||| |||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  33299718 acttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattt 33299619  T
Q  307 gatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33299618 gatttgaaaggtagaaattgaccaa 33299594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5644962 - 5644820
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||    ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5644962 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgct-gacaaaatatagattg 5644864  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5644863 agattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 5644820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30036867 - 30036678
Alignment:
Q  23 agttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcg 120  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  30036867 agttgttcttacggattcgaactggtgactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--g 30036771  T
Q  121 acataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
     || ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||| || |||||||    
T  30036770 gcagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgataggtacaagctgctcttgga 30036678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34623720 - 34623578
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  34623720 caaattgataggtacaagctgttcctggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagttt-tttgacaaaatatagattg 34623622  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34623621 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 34623578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43085581 - 43085412
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43085581 aggtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 43085483  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  43085482 accg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaaca 43085412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5645190 - 5644972
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5645190 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 5645092  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| |||| || |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||||| || |||||||    
T  5645091 cggagacaaatacaaaatagaccggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagagacagataggcgggtacaagctgctcttgga 5644993  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccga 236  Q
     |||| || | |||||||||||    
T  5644992 -ttgagctgggcacttgaccga 5644972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6881568 - 6881372
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6881568 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttctcggactcgaactagccacttg 6881470  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6881469 accaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 6881372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28656697 - 28656501
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || ||||  ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28656697 aggtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactaaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 28656599  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||  || |||||||| || ||||||    
T  28656598 accg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattcacgggtacaagctgctcttgg 28656502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30175916 - 30175720
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30175916 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactagttactcc 30175818  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  || | ||||  | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  30175817 accg--gagagaaacggatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 30175721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 234
Target Start/End: Original strand, 18121150 - 18121298
Alignment:
Q  86 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaa 184  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | | |||||  ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||    
T  18121150 ttgttcttagatgcgaactggttactccaccggagataaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaa 18121248  T
Q  185 acaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18121249 acagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 18121298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31438711 - 31438517
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31438711 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 31438613  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  31438612 accaaacagaaacatattcactggggattggtttg-ttgacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgac 31438517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3797007 - 3796825
Alignment:
Q  51 cgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgc 149  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||  |||||| |||||||||    
T  3797007 cgactgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatggacaggcgcaagctgc 3796908  T
Q  150 tcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  3796907 tcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccatttgacc 3796825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6881694 - 6881546
Alignment:
Q  63 aaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgat 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  6881694 aaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacaggaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgag 6881598  T
Q  163 ctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  6881597 ctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 6881546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 9543440 - 9543634
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9543440 gtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaggcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 9543538  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||  ||||| | ||||||||  |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  9543539 cg--gaccgaaacagatagacaggtataagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 9543634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 18121371 - 18121515
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagatt 284  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||   ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  18121371 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaggttcactggggattggttttttttgacaaagtatagatt 18121470  T
Q  285 gaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18121471 gagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 18121515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26487820 - 26487626
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26487820 gtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 26487722  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||| || |||||||    
T  26487721 cggagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccaaacggaaacatattgacagatacaagctgctcttgga 26487626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11330848 - 11330651
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11330848 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 11330750  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  11330749 accaaacagaaacatattcactggggattagtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttaacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 11330651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 214
Target Start/End: Original strand, 37351384 - 37351570
Alignment:
Q  25 ttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacat 124  Q
    |||||||||||| |||||| || || | |||| | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  37351384 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacag 37351481  T
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| |||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  37351482 aaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 37351570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 329
Target Start/End: Original strand, 18368404 - 18368612
Alignment:
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaact 222  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18368404 aaacaaattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaact 18368502  T
Q  223 agccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt---gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggta 319  Q
    ||||||||| || || |||| || |||   ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  18368503 agccacttgtccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggca 18368602  T
Q  320 gaaattgacc 329  Q
    ||||||||||    
T  18368603 gaaattgacc 18368612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 30036647 - 30036505
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30036647 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccaaatagaaacatattcactggggattggtttg-ttgacaaaatatagattg 30036549  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |  |||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||    
T  30036548 aggttgacttgacatcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 30036505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Original strand, 37351548 - 37351744
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37351548 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 37351646  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattgg--tttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37351647 accaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattga 37351744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 328
Target Start/End: Original strand, 37745287 - 37745430
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttg-tttgacaaaatatagatt 284  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  37745287 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgctttgacagaatagagatt 37745386  T
Q  285 gaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    || |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  37745387 gagattgacttgacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgac 37745430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 9543665 - 9543810
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgt--ttgacaaaatatagat 283  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  9543665 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagat 9543764  T
Q  284 tgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  9543765 tgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 9543810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 214
Target Start/End: Original strand, 37664227 - 37664413
Alignment:
Q  25 ttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacat 124  Q
    |||||||||||| |||||| || || | |||| | ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  37664227 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaaggcaaataaacaggtatgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacag 37664324  T
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| |||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  37664325 aaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 37664413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37762412 - 37762226
Alignment:
Q  25 ttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacat 124  Q
    |||||||||| | |||||| || || | |||| | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  37762412 ttgttcttggctgcgaactggttactccaccggagacaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg--gacag 37762315  T
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| |||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  37762314 aaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 37762226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 169 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23633189 - 23633030
Alignment:
Q  169 acttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtt 268  Q
    |||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||| | || || | ||||||| |||| |||| ||||||    ||||||| |||| ||    
T  23633189 acttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-tcgagctgggcacttgagcgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttt 23633091  T
Q  269 tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23633090 tgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 23633030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 133 - 329
Target Start/End: Original strand, 13435549 - 13435751
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccactt 230  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||  ||  || ||||  || ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  13435549 agacgggtacaagctgttcttggacttgaactaggcactcgaccgataacataagcaaaatgataggtacaagctggtcttggacgtgaactagccactt 13435648  T
Q  231 gaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtt----tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattg 326  Q
    |||| || |  | || |||   ||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13435649 gaccaaacatgaacatattcactggggattggtttgttcttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattg 13435748  T
Q  327 acc 329  Q
    |||    
T  13435749 acc 13435751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24977048 - 24976904
Alignment:
Q  183 aaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatataga 282  Q
    ||||||||||  |||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24977048 aaacaaataggtaggttcaagatgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgtttt-tttgacaaaatataga 24976951  T
Q  283 ttgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24976950 ttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 24976904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43085474 - 43085326
Alignment:
Q  182 gaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtt--tgacaaaatat 279  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| || |||   ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  43085474 gaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggttttttcctgacaaaatat 43085376  T
Q  280 agattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43085375 agattgagattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 43085326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31438944 - 31438814
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31438944 gtacgagttgttcttacggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 31438846  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagct 147  Q
    ||| |||| |  |||| |||||||||| ||||    
T  31438845 cggagacaaaggcaaatagacaggtgcgagct 31438814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 123
Target Start/End: Original strand, 37351315 - 37351421
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37351315 gtacgagttgttcttaaggattcgaactggtgactcgactgaaaacaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 37351413  T
Q  116 cggcgaca 123  Q
    ||| ||||    
T  37351414 cggagaca 37351421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 13317775 - 13317908
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgact 294  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |  | || |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  13317775 aggtacaagctgttcttggacgtgaactagccacttgaccaaacatgaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgact 13317873  T
Q  295 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  13317874 tgacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgacc 13317908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 187
Target Start/End: Original strand, 18121260 - 18121430
Alignment:
Q  17 ggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc 116  Q
    ||||| || |||||||||| | ||||||| |||  |||| ||| || || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  18121260 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaaatcatagacaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggtaactcgacc 18121359  T
Q  117 ggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |   |||||| ||||  || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  18121360 gataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 18121430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 329
Target Start/End: Original strand, 31819375 - 31819503
Alignment:
Q  200 caagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacg 299  Q
    ||||| |||||||||   |||||||  ||||||||||| |||| || |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31819375 caagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacctgacg 31819473  T
Q  300 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31819474 tcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 31819503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33784738 - 33784540
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || |||||||  | || |||| || ||||||| |||| |||||||||||    
T  33784738 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaataggtatgttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttg 33784641  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacca 330  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33784640 accaaacagaaacagattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacca 33784541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23727441 - 23727295
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattgg--tttgtttgacaaaatatagat 283  Q
    |||||||  |||| |||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |  ||| ||||||||| |||||||    
T  23727441 caaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttttgacaaagtatagat 23727343  T
Q  284 tgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23727342 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaa 23727295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24609448 - 24609305
Alignment:
Q  185 acaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagatt 284  Q
    ||||||||  |||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||    
T  24609448 acaaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttttttttgaaaaagtatagatt 24609350  T
Q  285 gaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24609349 gagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 24609305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 123
Target Start/End: Original strand, 37664158 - 37664264
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37664158 gtacgagttgttcttacggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 37664256  T
Q  116 cggcgaca 123  Q
    ||| ||||    
T  37664257 cggagaca 37664264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 117
Target Start/End: Original strand, 31819248 - 31819350
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31819248 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcg 31819346  T
Q  114 accg 117  Q
    ||||    
T  31819347 accg 31819350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 30941824 - 30941690
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggt-ttgtttgacaaaatatagattgaaattgac 293  Q
    |||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30941824 aggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattattgttttttgacaaaatatagattgagattgac 30941726  T
Q  294 ttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30941725 ttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 30941690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 267 - 329
Target Start/End: Original strand, 13179836 - 13179898
Alignment:
Q  267 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13179836 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 13179898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30159390 - 30159272
Alignment:
Q  93 tggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatag 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||||    
T  30159390 tggattcgaactggttactccaccgg--acagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatatag 30159294  T
Q  193 acaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||||||||||| || |||||||    
T  30159293 acaggtacaagctgctcttgga 30159272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 37762483 - 37762375
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37762483 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggctgcgaactggttactcc 37762385  T
Q  114 accggcgaca 123  Q
    ||||| ||||    
T  37762384 accggagaca 37762375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 329
Target Start/End: Original strand, 15651766 - 15651843
Alignment:
Q  253 tggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15651766 tggggattggttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 15651843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 329
Target Start/End: Original strand, 15751808 - 15751940
Alignment:
Q  196 ggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgactt 295  Q
    ||||||||| |||||||||   |||||||  |||||||| || |||| || |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  15751808 ggtacaagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgactt 15751906  T
Q  296 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  15751907 gacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 15751940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 30159231 - 30159099
Alignment:
Q  196 ggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgactt 295  Q
    ||||||||| |||||||||   |||||||  |||||||| || |||| || |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  30159231 ggtacaagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgactt 30159133  T
Q  296 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  30159132 gacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 30159099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24977156 - 24976987
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  24977156 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaattaaacgggtacaag-ttgttcttggaggcgaactggtaactcgac 24977058  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  24977057 cggaaacataaacaaataggtaggttcaagatgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 24976987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 33784912 - 33784813
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| ||    
T  33784912 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgaccggaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatttgaactggtaactcgac 33784815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30941944 - 30941775
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | || |||||| |||||||||| |||| ||    
T  30941944 aggtacgagctgttcttggatttgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-tcgtccttggaggcgaactggtaactcgac 30941846  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  30941845 cggaaacataaacaaacaggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 30941775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 22992064 - 22992224
Alignment:
Q  169 acttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtt 268  Q
    |||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||| |||| || | |||| |||| || |||| ||||||    ||||||| |||| ||    
T  22992064 acttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccaaacagaaacaaattcacaggggattagtttttt 22992162  T
Q  269 t-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    | ||||| |||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22992163 ttgacaacata--ggttgaaattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaa 22992224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 13179469 - 13179546
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  13179469 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 13179546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 13179407 - 13179508
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13179407 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 13179505  T
Q  232 acc 234  Q
    |||    
T  13179506 acc 13179508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24609487 - 24609389
Alignment:
Q  88 gttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  24609487 gttcttggaggcgaactggtaactcgaccggaaacatagacaaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 24609389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3796867 - 3796766
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttga 232  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||| |||| || | |||||||    
T  3796867 agacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccatttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttga 3796770  T
Q  233 ccga 236  Q
    ||||    
T  3796769 ccga 3796766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5644953 - 5644903
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  5644953 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 5644903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 8658442 - 8658492
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8658442 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 8658492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 22895866 - 22895781
Alignment:
Q  11 cagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggat 97  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || || || |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  22895866 cagacaggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccaaaatcatagacacatagacaggtacgagc-tgttcttggat 22895781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26487586 - 26487536
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26487586 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 26487536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23727432 - 23727380
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaat 190  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23727432 aggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacaaat 23727380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23899392 - 23899292
Alignment:
Q  11 cagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttac 110  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| || |  || |||||||||| | || ||||||||||||  |||||||||||    
T  23899392 cagacaggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgactaaaatcataaacacatagacaggtacgag-ttgttcttggatttgaactggttac 23899294  T
Q  111 tc 112  Q
    ||    
T  23899293 tc 23899292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24731283 - 24731203
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  24731283 agacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgactgaacggaaacatatcgacaggtacaagctgctcttgga 24731203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 25207863 - 25207763
Alignment:
Q  11 cagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttac 110  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| || || || |||||||||| | ||| ||||||| |||  |||||||||||    
T  25207863 cagacaggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgactaaaatcatagacacatagacaggtacgagc-tgttcttagatttgaactggttac 25207765  T
Q  111 tc 112  Q
    ||    
T  25207764 tc 25207763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 25272019 - 25271919
Alignment:
Q  11 cagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttac 110  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| || || || |||||||||| | ||| ||||||| |||  |||||||||||    
T  25272019 cagacaggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgactaaaatcatagacacatagacaggtacgagc-tgttcttagatttgaactggttac 25271921  T
Q  111 tc 112  Q
    ||    
T  25271920 tc 25271919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 24609855 - 24609815
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24609855 aggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 24609815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 33299973 - 33299874
Alignment:
Q  17 ggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc 116  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||| || || || |||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  33299973 ggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccaaaatcatagacacatagacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggttactcaacc 33299875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 236
Target Start/End: Original strand, 37744759 - 37744803
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccga 236  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37744759 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccga 37744803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5645424 - 5645381
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5645424 gacaggtacaagctgttcttggactcaaactagccacttgaccg 5645381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Original strand, 13317234 - 13317277
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13317234 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 13317277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30037114 - 30037071
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30037114 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 30037071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 187
Target Start/End: Original strand, 37745279 - 37745346
Alignment:
Q  120 gacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  37745279 gacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 37745346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 9543674 - 9543724
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  9543674 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 9543724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 18493716 - 18493766
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  18493716 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 18493766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28656461 - 28656411
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  28656461 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 28656411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 28952744 - 28952794
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  28952744 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 28952794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 23727898 - 23727869
Alignment:
Q  86 ttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23727898 ttgttcttggatgcgaactggttactccac 23727869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30176224 - 30176183
Alignment:
Q  194 caggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30176224 caggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 30176183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 187
Target Start/End: Original strand, 32589220 - 32589273
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  32589220 gacaggtacaagccgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 32589273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6881979 - 6881939
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6881979 aggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 6881939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9325149 - 9325109
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9325149 aggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 9325109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 11556962 - 11556922
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11556962 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 11556922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12139847 - 12139807
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  12139847 aggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 12139807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22895807 - 22895767
Alignment:
Q  189 atagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccact 229  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  22895807 atagacaggtacgagctgttcttggatttgaactagccact 22895767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 23633579 - 23633539
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23633579 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 23633539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 24977454 - 24977414
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24977454 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 24977414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26488059 - 26488019
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26488059 aggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 26488019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 237
Target Start/End: Original strand, 28952622 - 28952669
Alignment:
Q  189 atagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaa 237  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28952622 atagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaa 28952669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 30942241 - 30942201
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30942241 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 30942201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 33784973 - 33784933
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33784973 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 33784933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 16200886 - 16201210
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16200886 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggttactcgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaa 16200985  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16200986 ctggttactccaccggagaca-aaacaaacagacaggtgcaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaggtacaa 16201084  T
Q  203 gttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggatt-ggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtc 301  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16201085 gctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagttttttttgacaaaatatagattgaagttgactggacgtc 16201184  T
Q  302 gattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  16201185 gatttgatttgaaaggtagaaattga 16201210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20468191 - 20467860
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20468191 tggaaaagtagataggtacgagttgttctgggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaa 20468092  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20468091 ctggttactccaccggggacataaacaaatagacaggtgcaagctgctcttggatttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaggtacaa 20467992  T
Q  203 gttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt----gacaaaatatagattgaaattgacttgac 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||| |||| |||     |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20467991 gctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagttttttttttgtacaaaatatagattgaaactgacttgac 20467892  T
Q  299 gtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacca 330  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20467891 gtggatttgatttgaaaggtagaaattgacca 20467860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Original strand, 20333287 - 20333600
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| | || || ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20333287 aggtgcgagttgttcttggatgcgaattggtaactcgaccgaaagcaaaggcaaatagacatgtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 20333386  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    |||  |||  |||| | |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20333387 cggaaaca--aacagatagacaggtacaagctgttcttggatttgaactagccacttaaccgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggac 20333484  T
Q  216 ttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaa 315  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||   |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||    
T  20333485 ttgaactagccactagaccgaacagaaacaaattcattggggattagtttttttgacaaaatgtagattgagattgacttgaagtcgatttggtttgaaa 20333584  T
Q  316 ggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||||||||||||||    
T  20333585 ggtagaaattgaccaa 20333600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 21890032 - 21890247
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890032 aggtacgagttgttcttg-attcgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 21890129  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21890130 cggagacaaagacaaatagacaggtgcaagctgctcttgga-tggagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggac 21890228  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21890229 ttgaactagccacttgacc 21890247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 14691554 - 14691769
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14691554 aggtacgagctgttcttg-atttgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 14691651  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  14691652 cggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 14691750  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14691751 ttgaactagccacttgacc 14691769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 14694236 - 14694451
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14694236 aggtacgagctgttcttg-atttgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 14694333  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  14694334 cggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 14694432  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14694433 ttgaactagccacttgacc 14694451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 14696920 - 14697135
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14696920 aggtacgagctgttcttg-atttgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 14697017  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  14697018 cggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 14697116  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14697117 ttgaactagccacttgacc 14697135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 14699601 - 14699816
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14699601 aggtacgagctgttcttg-atttgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 14699698  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  14699699 cggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 14699797  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14699798 ttgaactagccacttgacc 14699816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 14702292 - 14702507
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14702292 aggtacgagctgttcttg-atttgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 14702389  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  14702390 cggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacatatagacgggtacaagctgttcttggac 14702488  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14702489 ttgaactagccacttgacc 14702507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28157336 - 28157117
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28157336 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 28157238  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  28157237 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 28157139  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28157138 gacttgaactagccacttgacc 28157117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28157048 - 28156867
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28157048 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 28156949  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  28156948 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaaca 28156867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3648426 - 3648232
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3648426 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 3648328  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| || |||| || |||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3648327 accaaacagaaacatattcactgaggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 3648232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10970147 - 10969932
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || | || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10970147 gtacgagttgttcttacggattcgaactggttactccactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 10970049  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||||    
T  10970048 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttgga 10969950  T
Q  215 cttgaactagccacttgac 233  Q
     |||| |||| ||||||||    
T  10969949 -ttgagctagtcacttgac 10969932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28592585 - 28592391
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||| || || ||||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28592585 aggtacaagctgctcttggatt-gagctggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 28592487  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  28592486 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 28592391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 51645440 - 51645298
Alignment:
Q  187 aaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattga 286  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51645440 aaatagacaggcgcaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattga 51645341  T
Q  287 aattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  51645340 gattgacttgacatcgatttgatttgaaaggcagaaattgacc 51645298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3648598 - 3648404
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3648598 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtgactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 3648500  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  3648499 cggagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 3648404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10952536 - 10952342
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10952536 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 10952438  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  10952437 cggagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 10952342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 51645552 - 51645382
Alignment:
Q  19 tacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc 116  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51645552 tacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgctcttggatgcgaactggttactccacc 51645454  T
Q  117 ggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    || |||| | || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  51645453 ggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 51645382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 41786263 - 41786432
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41786263 aggtacgagttgttcttacggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggacgcgaactggttactcc 41786361  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  41786362 accg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaaca 41786432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 10969915 - 10969720
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10969915 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 10969817  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||  | |||| || |||   |||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10969816 accagacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 10969720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28592410 - 28592243
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||| || || ||||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28592410 aggtacaagctgctcttggatt-gagctggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 28592312  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  28592311 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaaca 28592243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 329
Target Start/End: Original strand, 14691790 - 14692098
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  14691790 aggtacgagctgttctgggattcgaactggtaactcgaccgataacatcgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 14691888  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  14691889 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgg 14691985  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14691986 acttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatc---ttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 14692082  T
Q  314 aaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||| ||||||||    
T  14692083 aaggtaggaattgacc 14692098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 329
Target Start/End: Original strand, 14694472 - 14694780
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  14694472 aggtacgagctgttctgggattcgaactggtaactcgaccgataacatcgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 14694570  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  14694571 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgg 14694667  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14694668 acttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatc---ttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 14694764  T
Q  314 aaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||| ||||||||    
T  14694765 aaggtaggaattgacc 14694780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 329
Target Start/End: Original strand, 14697156 - 14697464
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  14697156 aggtacgagctgttctgggattcgaactggtaactcgaccgataacatcgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 14697254  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  14697255 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgg 14697351  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14697352 acttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatc---ttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 14697448  T
Q  314 aaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||| ||||||||    
T  14697449 aaggtaggaattgacc 14697464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 329
Target Start/End: Original strand, 14699837 - 14700145
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  14699837 aggtacgagctgttctgggattcgaactggtaactcgaccgataacatcgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 14699935  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  14699936 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgg 14700032  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14700033 acttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatc---ttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttga 14700129  T
Q  314 aaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||| ||||||||    
T  14700130 aaggtaggaattgacc 14700145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 10952364 - 10952169
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10952364 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 10952266  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||  | |||| || |||   |||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  10952265 accagacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaagttgacc 10952169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 20332986 - 20333207
Alignment:
Q  11 cagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttac 110  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||||||| ||    
T  20332986 cagacaggtgcgagttgttcttggattcgaactggtaactcgaccgaaagcaaaggcaaatagacaggtacgagc-tgttcttggattcaaactggtaac 20333084  T
Q  111 tccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttct 210  Q
    || ||||   |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||| |||||| || |||||| ||||| || |||    
T  20333085 tcgaccgataacataagcaaattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccaaacagaaacatattgacaggaacaagctgctct 20333183  T
Q  211 tggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||| |||| || | ||||||||||    
T  20333184 tgga-ttgagctgggcacttgaccg 20333207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28592760 - 28592566
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28592760 gtacgagttgttcttacggattcgaactggtgactcgactgaaagcaa-ggcaaatagataggtgcgagcttgttcttggatgtgaactggttactccac 28592662  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||  ||||| | ||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  28592661 cggagac--aaacagatagataggtacaagccgctcttgga-ttgagctaggcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 28592566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 182 - 329
Target Start/End: Original strand, 41786370 - 41786516
Alignment:
Q  182 gaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatag 281  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| || |||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41786370 gaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcaccggggattggtttgtttgacaaaatatag 41786468  T
Q  282 attgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  41786469 attgagattggcttgacgtcgatttgatttgaaaggcggaaattgacc 41786516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 182 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28156929 - 28156781
Alignment:
Q  182 gaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt--gacaaaatat 279  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| || |||   ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  28156929 gaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgactggggattggtttttttttgacaaaatat 28156831  T
Q  280 agattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  28156830 agattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 28156781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Original strand, 20332755 - 20332971
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||| || || || |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  20332755 aggtacgagttgttcttggatctgaactggtcactcgaccaaaatcatagtcacatagacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgac 20332853  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||   |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||  ||||| || |||||||||||| || |||||||     
T  20332854 cgataacataagcaaattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccaaacataaacatattgacaggtacaagctgctcttgga- 20332951  T
Q  216 ttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||| || | ||||||||||    
T  20332952 ttgagctgggcacttgaccg 20332971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 182 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28592305 - 28592157
Alignment:
Q  182 gaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgt--ttgacaaaatat 279  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| || |||   ||||||||||||| |  ||||| ||||||    
T  28592305 gaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatat 28592207  T
Q  280 agattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28592206 agattgagattgacttaacattgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 28592157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 222 - 329
Target Start/End: Original strand, 21890825 - 21890931
Alignment:
Q  222 tagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtaga 321  Q
    ||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21890825 tagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgtttt-tttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtaga 21890923  T
Q  322 aattgacc 329  Q
    ||||||||    
T  21890924 aattgacc 21890931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 20332226 - 20332424
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| || || || |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  20332226 aggtacgagttgttcttggatccgaactggtcactcgaccaaaatcatagtcacatagacaggtacgagc-tgttcttggattcgaactggtaactcgac 20332324  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgacc--gaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||    ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||||||||  | |   | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20332325 cgatagcataagcaaattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctggtcacttgaccggggataaagacaaatagacaggtacgagttgttcttgg 20332423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 21890208 - 21890405
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||| || |||||||||| | ||||||| |||  |||| ||| || || || |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  21890208 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaaatcatagacacatagacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgac 21890306  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||   |||||| ||||  || |||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||| || |||||||    
T  21890307 cgataacataagcaaattgataggtacaagctgtttttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattgataggtacaagctgctcttgga 21890405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 21890679 - 21890848
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  21890679 aggtacgagctgttcttagattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtgcaagct-gttcttggattcgaactggtaactcgac 21890777  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||   ||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  21890778 cgataacataaacaaataggtaggttgaagctgctcttgga-ttgagttagccacttgaccaaacagaaaca 21890848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 20331876 - 20332070
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  20331876 aggtacgagctgttattggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtgcaag-ttgttcttggattcgaactggttacttgac 20331974  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |    |||||| ||||  || |||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||  ||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  20331975 c--aaacataagcaaattgataggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccaaacaaaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 20332070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 21890562 - 21890639
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||| || |||||||    
T  21890562 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaacatattgataggtacaagctgctcttgga 21890639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 20333222 - 20333453
Alignment:
Q  11 cagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttac 110  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||| ||  || |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||| ||    
T  20333222 cagacaggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccggggacatagaaaagtagataggtgcgag-ttgttcttggatgcgaattggtaac 20333320  T
Q  111 tccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagc-tgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttc 209  Q
    || ||||    || |  |||| ||||| |||| ||| || |||||||   || || |  |||  |||| |   ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20333321 tcgaccgaaagcaaaggcaaatagacatgtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggaaacaaacagatagacaggtacaagctgttc 20333420  T
Q  210 ttggacttgaactagccacttgaccgaatagaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20333421 ttggatttgaactagccacttaaccgaacagaa 20333453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 21890553 - 21890601
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890553 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 21890601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 20468238 - 20468198
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20468238 aggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 20468198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 21890319 - 21890367
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21890319 caaattgataggtacaagctgtttttggacttgaactagccacttgacc 21890367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 20468252 - 20468191
Alignment:
Q  62 aaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacat 124  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  20468252 aaaggcaaatagacaggtacgag-ttgttcttggattcgaactggtcactcgaccggggacat 20468191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10969973 - 10969893
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||  || |||||||||||| || |||||||    
T  10969973 agacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgactgaacggaaacctatcgacaggtacaagctgctcttgga 10969893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 234
Target Start/End: Original strand, 16200705 - 16200758
Alignment:
Q  181 tgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16200705 tgaagcaaattgacgggtacaagctgttcttggacttgaactgggcacttgacc 16200758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 117
Target Start/End: Original strand, 20331816 - 20331916
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||| ||| || || || |||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||| |||| ||    
T  20331816 aggtacgagttgttcttggatctaaactggtcactcgaccaaaatcatagacacatagacaggtacgagc-tgttattggattcgaactggtaactcgac 20331914  T
Q  116 cg 117  Q
    ||    
T  20331915 cg 20331916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Original strand, 20332107 - 20332186
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  20332107 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagttgggcacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 20332186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 124)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Original strand, 21696047 - 21696360
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21696047 aggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcaaccgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggattcaaactggttactccac 21696146  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21696147 tggagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggattcaaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggac 21696246  T
Q  216 ttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaa 315  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||| | |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21696247 ttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaattcgctggggattagct--tttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaa 21696344  T
Q  316 ggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||||||||||||||    
T  21696345 ggtagaaattgaccaa 21696360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 298
Target Start/End: Original strand, 19449261 - 19449557
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgag-ttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcga 101  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19449261 tggaaaagtagacaggtacgagcttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaaacaaaagcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggacgcga 19449360  T
Q  102 actggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtaca 201  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19449361 actggttactccaccagagacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaggtaca 19449460  T
Q  202 agttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 298  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| || |||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19449461 agctgttcttggacttgaactaggcacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 19449557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27397722 - 27397432
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||   |||    
T  27397722 tggaaaagtagacaggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcgagct-gctcttggacttgaa 27397624  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    || |  |||  ||||   ||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27397623 ctagccacttgaccga--acagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaggtacaa 27397526  T
Q  203 gttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27397525 gctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggaatagtt--tttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 27397432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12663031 - 12662816
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12663031 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 12662934  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12662933 cggagacaaagacaaatacacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggac 12662835  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12662834 ttgaactagccacttgacc 12662816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28889851 - 28889635
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || || |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28889851 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggttactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 28889753  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  28889752 cggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgaactagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 28889654  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28889653 ttgaactagccacttgacc 28889635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3790361 - 3790144
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3790361 aggtacgagttgttcttg-attcaaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 3790263  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||  ||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3790262 cggaaacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagttgttcttgga 3790164  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3790163 cttgaactagccacttgacc 3790144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27123886 - 27123572
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27123886 aggtacgagttgttcttagggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagctggttcttggatgcgaactggttactcc 27123788  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttctt 211  Q
    |||||  ||| ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||    
T  27123787 accgg--acagaaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttctt 27123691  T
Q  212 ggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| || |||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  27123690 ggacttgaactagccacttgactaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaat 27123591  T
Q  311 tgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  27123590 tgaaaggcagaaattgacc 27123572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Original strand, 31867127 - 31867359
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31867127 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 31867226  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccg--aactgaaacaaatagacaggtac 200  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||  || ||||| || ||||||    
T  31867227 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgataacataagcaaattgataggtac 31867323  T
Q  201 aagttgttcttggacttgaactagccacttgaccga 236  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  31867324 aagctgttcttggacttgaactgggcactcgaccga 31867359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3790075 - 3789867
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3790075 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 3789976  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  3789975 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 3789879  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  3789878 gctgctcttgga 3789867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23118393 - 23118181
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23118393 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagctcgttcttggatgcgaactggttactccac 23118296  T
Q  116 cggcgacata-aacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | | |||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  23118295 cggagacaaagaccaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 23118197  T
Q  215 cttgaactagccactt 230  Q
    ||||||||||||||||    
T  23118196 cttgaactagccactt 23118181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39897810 - 39897591
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39897810 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 39897712  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  39897711 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 39897613  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  39897612 gtcttgaactagccacttgacc 39897591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 34266948 - 34267156
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34266948 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggaaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 34267047  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  34267048 ctggttactccaccg--gacagaaacatatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 34267144  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  34267145 gctgctcttgga 34267156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39897522 - 39897314
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39897522 tggaaaagtagataggtacgagttgttctcggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 39897423  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  39897422 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 39897326  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  39897325 gctgctcttgga 39897314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 234
Target Start/End: Original strand, 27427162 - 27427358
Alignment:
Q  38 cgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaac-aaacagac 136  Q
    |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| |||     
T  27427162 cgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaaatagaa 27427261  T
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27427262 aggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacaaaaacagatagacaggtacaagctgctcttggatttgaactagccacttgacc 27427358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3789781 - 3789600
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||    
T  3789781 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggacgcgaa 3789682  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  3789681 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaaca 3789600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 328
Target Start/End: Original strand, 16822197 - 16822507
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16822197 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 16822295  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga----actgaaacaaatagacaggtacaagttgttc 209  Q
    ||   ||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||    | ||||  || || || ||||||||| ||||    
T  16822296 ac---cgacagaaacagatagccaggtacaagctgctcttgga-ttgagctaggcactcgaccgataacattgaa--aagtaaacgggtacaagtcgttc 16822389  T
Q  210 ttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgat 309  Q
    |||||   |||||||  |||||||| || |||| || |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  16822390 ttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttg-ttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaa 16822488  T
Q  310 ttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  16822489 ttgaaaggtaaaaattgac 16822507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16899283 - 16898973
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16899283 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 16899185  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga----actgaaacaaatagacaggtacaagttgttc 209  Q
    ||   ||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||    | ||||  || || || ||||||||| ||||    
T  16899184 ac---cgacagaaacagatagccaggtacaagctgctcttgga-ttgagctaggcactcgaccgataacattgaa--aagtaaacgggtacaagtcgttc 16899091  T
Q  210 ttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgat 309  Q
    |||||   |||||||  |||||||| || |||| || |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  16899090 ttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttg-ttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaa 16898992  T
Q  310 ttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  16898991 ttgaaaggtaaaaattgac 16898973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 11627988 - 11628182
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11627988 gtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 11628086  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  11628087 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 11628182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 32057131 - 32056825
Alignment:
Q  20 acgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 117  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  32057131 acgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac-- 32057035  T
Q  118 gcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga----actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
     ||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||    | ||||  || || || ||||||||| ||||||||    
T  32057034 -cgacagaaacagatagccaggtacaagctgctcttgga-ttgagctaggcactcgaccgataacattgaa--aagtaaacgggtacaagtcgttcttgg 32056939  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    |   |||||||  |||||||| || |||| || |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  32056938 atgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttg-ttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattga 32056840  T
Q  314 aaggtagaaattgac 328  Q
    |||||| ||||||||    
T  32056839 aaggtaaaaattgac 32056825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Original strand, 9343018 - 9343212
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9343018 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 9343116  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9343117 accaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 9343212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16168689 - 16168495
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16168689 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 16168591  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16168590 accaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 16168495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27783434 - 27783240
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27783434 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 27783336  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27783335 accaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 27783240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27810914 - 27810720
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27810914 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 27810816  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27810815 accaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 27810720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 12709365 - 12709580
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12709365 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtgactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 12709463  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||||    
T  12709464 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttgga 12709562  T
Q  215 cttgaactagccacttgac 233  Q
     |||| |||| ||||||||    
T  12709563 -ttgagctagtcacttgac 12709580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16168863 - 16168667
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16168863 aggtacgagttgttcttatggattcgaactggtgactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 16168765  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  16168764 accg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 16168668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27811086 - 27810892
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27811086 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtgactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 27810988  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  27810987 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 27810892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34869069 - 34868875
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34869069 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtgactcgactgaaaacaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 34868971  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || ||| |||||||| || |||||||    
T  34868970 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacgggtacaagctgctcttgga 34868875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 253452 - 253648
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253452 aggtacgagttgttcttatggattcgaacttgttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 253550  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  253551 accggagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 253647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 329
Target Start/End: Original strand, 21670156 - 21670343
Alignment:
Q  142 caagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaata 239  Q
    ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21670156 caagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaaca 21670254  T
Q  240 gaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21670255 gaaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 21670343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34298417 - 34298221
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  34298417 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccactag 34298319  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| ||||||| || |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  34298318 accaaatagaaacatattcactggggattggtttgcttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 34298221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 37678935 - 37679068
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgact 294  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37678935 aggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgact 37679033  T
Q  295 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37679034 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 37679068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 37694200 - 37694333
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgact 294  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37694200 aggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgact 37694298  T
Q  295 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37694299 tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 37694333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37932642 - 37932447
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37932642 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 37932544  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  37932543 accaaacagaaacatattcactggggattggttt---tgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccaa 37932447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 39897336 - 39897141
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39897336 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 39897238  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||| |||| || |||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39897237 accgaacagaaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 39897141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40240967 - 40240771
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40240967 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 40240869  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  40240868 accggagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 40240772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 234
Target Start/End: Original strand, 31866911 - 31867059
Alignment:
Q  86 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaa 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||    
T  31866911 ttgttcttggattcgaactggttactccaccggagacaacgacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgagcgaacagaa 31867009  T
Q  185 acaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31867010 acagatagacgggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 31867059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 331
Target Start/End: Original strand, 34267949 - 34268094
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  34267949 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaattcacagggtattagtttttttgacaaaatatagattg 34268048  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34268049 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaa 34268094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 327
Target Start/End: Original strand, 39044965 - 39045106
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39044965 caaattgacaggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttcgacaaaatatagattg 39045064  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39045065 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 39045106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 9342846 - 9343040
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9342846 gtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 9342944  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  || | ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  9342945 cg--gagagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 9343040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27783663 - 27783469
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27783663 gtacgagttgttcttacggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 27783565  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  27783564 cggagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 27783469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34162057 - 34161913
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagatt 284  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34162057 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagatt 34161958  T
Q  285 gaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161957 gagattgacttaacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 34161913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 39044740 - 39044934
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || ||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39044740 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtgacttgactgaaaacaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 39044838  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  39044839 cg--gacagaaacagatagacagatacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaaggtgctcttgga 39044934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 40240793 - 40240599
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40240793 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 40240695  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| || |||| || |||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40240694 accaaacagaaacatattcactagggattagtttgtttgacaaaatatagattgagcttgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 40240599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 37944665 - 37944850
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37944665 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 37944763  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaag 203  Q
    ||||| |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  37944764 accggagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaag 37944850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 253688 - 253822
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgact 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  253688 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgact 253787  T
Q  295 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  253788 tgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 253822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Original strand, 21669973 - 21670191
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21669973 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 21670071  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||||| || |||||||    
T  21670072 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagagacagataggcgggtacaagctgctcttgga 21670170  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccga 236  Q
     |||| || | |||||||||||    
T  21670171 -ttgagctgggcacttgaccga 21670191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Original strand, 22920944 - 22921162
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22920944 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttattcttggatgcgaactggttactccac 22921042  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| || |||||||| | |||||||| || |||||||    
T  22921043 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagagacaaataggcgggtacaagctgctcttgga 22921141  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccga 236  Q
     |||| || | |||||||||||    
T  22921142 -ttgagctgggcacttgaccga 22921162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 22921181 - 22921314
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgact 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22921181 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgact 22921279  T
Q  295 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22921280 tgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 22921314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37384923 - 37384727
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37384923 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgatgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 37384825  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37384824 accaaacagaaacatattcactggggattgatttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 37384727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37385097 - 37384901
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  37385097 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactagttactct 37384999  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  37384998 accg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagccagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 37384902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12594031 - 12593890
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12594031 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttagtttgtttgacaaaatatagattg 12593932  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12593931 agtttgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 12593890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20845458 - 20845245
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 117  Q
    |||||||||||||| | || |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  || ||||||||| |||||    
T  20845458 gtacgagttgttctcg-atccgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagct-gctcttggatt-gagctggttacttcaccg 20845362  T
Q  118 gcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggact 216  Q
    | | || | |||||  ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20845361 gagtcaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttgaact 20845263  T
Q  217 tgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20845262 tgaactagccacttgacc 20845245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 34266723 - 34266920
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34266723 aggtacgagttgttcttg-attcgaactagtcactcgactgaaggcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 34266820  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaa--ctgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||| ||||||||||| |||| | || | |||||||||||| ||  |  | ||| |||||||||||| || |||||||||    
T  34266821 cggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcctgga-tcgagccagccacttgaccaaaatcatagacacatagacaggtacgagctgttcttgg 34266919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 12709650 - 12709794
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagatt 284  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12709650 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgaggattggtttgttttgacaaaatatagatt 12709749  T
Q  285 gaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12709750 gagattgacttaacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 12709794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 37678701 - 37678895
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37678701 gtacgagttgttcttacggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 37678799  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||| | | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||| || || |||||||    
T  37678800 cg--gacagaaagagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatactgacaggtacgagctgctcttgga 37678895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 37693966 - 37694160
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37693966 gtacgagttgttcttacggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 37694064  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||| | | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||| || || |||||||    
T  37694065 cg--gacagaaagagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatactgacaggtacgagctgctcttgga 37694160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 182 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3789662 - 3789516
Alignment:
Q  182 gaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatag 281  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| || |||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789662 gaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcaccggggattggtttgtttgacaaaatatag 3789564  T
Q  282 attgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3789563 attgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 3789516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31883485 - 31883343
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31883485 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattg 31883387  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  31883386 agattgatttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 31883343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28889446 - 28889303
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    |||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  28889446 caaattgataggtacaagctgtttttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattgtttt--ttgacaaaatatagattg 28889349  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28889348 aaactgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaactgaccaa 28889303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12594256 - 12594073
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12594256 gtacgagttgttcttacggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 12594158  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaag 203  Q
    ||  |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  12594157 cgaagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaag 12594073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Original strand, 19409287 - 19409470
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19409287 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtgactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 19409385  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaag 203  Q
    ||  || | ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||||  | ||||||||||||    
T  19409386 cg--gagagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatgttgacaggtacaag 19409470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31883710 - 31883516
Alignment:
Q  21 cgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg 118  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| || |  |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883710 cgagttgttcttatggattcgaactggttaatcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg 31883612  T
Q  119 cgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
     |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| || |||||||| | |||||||| || |||||||    
T  31883611 agacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagagacaaataggcgggtacaagctgctcttgga 31883516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 196 - 329
Target Start/End: Original strand, 37944902 - 37945035
Alignment:
Q  196 ggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgactt 295  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  37944902 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgactc 37945001  T
Q  296 gacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  37945002 gacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 37945035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34868849 - 34868707
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||| ||||||| | |||||  |||||||    
T  34868849 caaattgataggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttgg-caaaaagtagattg 34868751  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34868750 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 34868707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Original strand, 11628160 - 11628353
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11628160 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 11628258  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| || |||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  11628259 accaaacagaaacatattcactgggggttggtttg-ttgacaaaatataaactgagattgacttgacgtcgatttgtattgaaaggcagaaattga 11628353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 34162346 - 34162249
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactc 112  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34162346 aggtacgagttgttcttagggattcgaactagtgactcgactgaaaacaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactc 34162249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 19409521 - 19409654
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgact 294  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  19409521 aggtacaagctgttcttggacctgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgact 19409619  T
Q  295 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||| |||| || |||||||| |||||||||||    
T  19409620 tgacgttgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 19409654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23118041 - 23117847
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || |||||||  |||| ||||  | ||||||| |||| |||||  ||||    
T  23118041 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaataggtaggttcaagccgctcttgga-ttgagctagctgcttg 23117944  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||| |||| ||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23117943 accgaacagaaacaaattcacaggggattagttt-tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 23117847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 267 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 12662604 - 12662542
Alignment:
Q  267 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12662604 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 12662542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 267 - 329
Target Start/End: Original strand, 27427580 - 27427642
Alignment:
Q  267 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27427580 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 27427642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 329
Target Start/End: Original strand, 31867874 - 31867983
Alignment:
Q  221 ctagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggta 319  Q
    |||||||||||||| | ||||| || |||   |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31867874 ctagccacttgaccaagtagaaacagattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggaa 31867973  T
Q  320 gaaattgacc 329  Q
    ||||||||||    
T  31867974 gaaattgacc 31867983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 327
Target Start/End: Original strand, 13929651 - 13929779
Alignment:
Q  200 caagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgac 298  Q
    ||||| |||||||||   |||||||  ||||||||||| |||| || |||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13929651 caagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgac 13929750  T
Q  299 gtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  13929751 gtcgatttgtattgaaaggcagaaattga 13929779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20845116 - 20844966
Alignment:
Q  183 aaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-----gacaaaat 277  Q
    ||||||||||  |||| |||  || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || |||   ||||||||| ||| |||     ||||||||    
T  20845116 aaacaaataggtaggttcaaactgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaatagaaacagattcactggggattgtttttttttttttgacaaaat 20845018  T
Q  278 atagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20845017 atagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgacc 20844966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34298573 - 34298433
Alignment:
Q  93 tggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaata 191  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||| |||||| |||    
T  34298573 tggattcgaactggttactccaccggaaacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcaaacagaaacagata 34298475  T
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||| |||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||    
T  34298474 gacgggtacaagctgctcttgga-ttcagctagccacttgacc 34298433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37932855 - 37932711
Alignment:
Q  93 tggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaata 191  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||  |||||| ||     
T  37932855 tggattcgaactggtaactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgactgaatggaaacatatt 37932757  T
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaat 238  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||||| ||||    
T  37932756 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgactgaat 37932711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12662723 - 12662625
Alignment:
Q  88 gttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  12662723 gttcttggaggcgaactggtaactcgaccggaaacataaacaaacaggtaggttcaagctgctcttgg-gttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 12662625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 190
Target Start/End: Original strand, 34267908 - 34268011
Alignment:
Q  87 tgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaac 186  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||||| ||||  || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  34267908 tgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaac 34268007  T
Q  187 aaat 190  Q
    ||||    
T  34268008 aaat 34268011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 31867318 - 31867515
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||| || |||||||||| | ||||| | ||| ||||||| |||| | |||||| || |||| ||||||  ||||||||   |||||||  |||| ||    
T  31867318 aggtacaagctgttcttggacttgaactgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagcta-ttcttggacttgaactgggcactcgac 31867416  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||   |||||| ||||  || |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  31867417 cgataacataagcaaattgataggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 31867515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 34267368 - 34267469
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34267368 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 34267466  T
Q  232 acc 234  Q
    |||    
T  34267467 acc 34267469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 31867555 - 31867632
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  31867555 aggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 31867632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 34267196 - 34267273
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  34267196 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccactcgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 34267273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 34267313 - 34267390
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  34267313 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccactcgaccaaacagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 34267390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 34267430 - 34267507
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||| || |||||||    
T  34267430 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattgataggtacaagctgctcttgga 34267507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 34267547 - 34267624
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||| || |||||||    
T  34267547 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattgataggtacaagctgctcttgga 34267624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20845153 - 20845066
Alignment:
Q  88 gttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgacc 176  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20845153 gttcttggaggcgaactggtaactcgaccggaaacataaacaaataggtaggttcaaactgctcttgga-ttgagctagccacttgacc 20845066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 34267538 - 34267586
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34267538 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 34267586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37932756 - 37932654
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgac 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||  |||||| || |||||||||||| || ||||||| |||| |||| ||||||||    
T  37932756 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgactgaatggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgac 37932659  T
Q  234 cgaat 238  Q
     ||||    
T  37932658 tgaat 37932654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 187
Target Start/End: Original strand, 27427450 - 27427548
Alignment:
Q  88 gttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||||  ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  27427450 gttcttggaggcgaactggtaacttgaccggaaacatacacaaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 27427548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 31867493 - 31867594
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  31867493 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctattcttggacttgaactagccacttg 31867591  T
Q  232 acc 234  Q
    |||    
T  31867592 acc 31867594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 34267134 - 34267235
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  34267134 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccactcg 34267232  T
Q  232 acc 234  Q
    |||    
T  34267233 acc 34267235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Original strand, 34267251 - 34267352
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  34267251 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccactcg 34267349  T
Q  232 acc 234  Q
    |||    
T  34267350 acc 34267352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 21670210 - 21670260
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21670210 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 21670260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 22921181 - 22921231
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22921181 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 22921231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31883476 - 31883426
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  31883476 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 31883426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37932699 - 37932599
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgac 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||  |||||| || |||||||||||| || ||||||| |||| || | ||||||||    
T  37932699 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgactgaatggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgac 37932602  T
Q  234 cga 236  Q
    |||    
T  37932601 cga 37932599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 214
Target Start/End: Original strand, 13929489 - 13929606
Alignment:
Q  94 ggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaataga 193  Q
    |||| |||||||||||||| || ||  ||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| | | || || ||    
T  13929489 ggattcgaactggttactcgactgg--acagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagttagccacttgaccaaacgggagcatattga 13929585  T
Q  194 caggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  13929586 caggtacaagctgctcttgga 13929606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 56
Target Start/End: Original strand, 21695982 - 21696027
Alignment:
Q  11 cagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21695982 cagacaggtgcgagttgttcttggattcgaactagtcactcgaccg 21696027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28889437 - 28889384
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaat 190  Q
    |||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28889437 aggtacaagctgtttttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 28889384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 234
Target Start/End: Original strand, 31867294 - 31867477
Alignment:
Q  52 gaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctc 151  Q
    |||||| |||| | |||||| || |||| |||||| |||||||||   |||||||  |||| ||||   |||||| ||||  || |||| ||||||  ||    
T  31867294 gaccgataacataagcaaattgataggtacaagct-gttcttggacttgaactgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctattc 31867392  T
Q  152 ttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31867393 ttggacttgaactgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgacc 31867477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34162168 - 34162088
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||| || |||||||    
T  34162168 agacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattaacaggtacaagctgctcttgga 34162088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34298475 - 34298395
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  34298475 agacgggtacaagctgctcttgga-ttcagctagccacttgaccaaacggaaacacattgacaggtacaagctgctcttgga 34298395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 182 - 237
Target Start/End: Original strand, 11628093 - 11628147
Alignment:
Q  182 gaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaa 237  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11628093 gaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaa 11628147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Original strand, 21669739 - 21669782
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21669739 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 21669782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 249
Target Start/End: Original strand, 34267772 - 34267835
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatt 249  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||||    
T  34267772 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactgggcacttgaccaaacagaaacaaatt 34267835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34298769 - 34298726
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34298769 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 34298726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40241267 - 40241224
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40241267 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 40241224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 253688 - 253738
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  253688 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 253738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12594022 - 12593972
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  12594022 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 12593972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 203
Target Start/End: Original strand, 12709539 - 12709608
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaag 203  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||    
T  12709539 agacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgactgaacggaaacatatcgacaggtacaag 12709608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 12709659 - 12709709
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  12709659 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 12709709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27124186 - 27124144
Alignment:
Q  193 acaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27124186 acaggtacaaactgttcttggatttgaactagccacttgaccg 27124144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34162048 - 34161998
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  34162048 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 34161998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 37678935 - 37678985
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  37678935 aggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 37678985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 37694200 - 37694250
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  37694200 aggtacaagctattcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 37694250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 187
Target Start/End: Original strand, 39044958 - 39045024
Alignment:
Q  121 acataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  39044958 acataagcaaattgacaggtacaagctgttcttggccttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 39045024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 34267781 - 34267858
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| || |||||||    
T  34267781 aggtacaagctgttcttggacttgaactgggcacttgaccaaacagaaacaaattgatgggtacaagctgctcttgga 34267858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 34267901 - 34267977
Alignment:
Q  19 tacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttgga 96  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| |||| | |||||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  34267901 tacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagc-tgttcttgga 34267977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 187
Target Start/End: Original strand, 37944906 - 37944951
Alignment:
Q  142 caagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  37944906 caagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 37944951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 12663092 - 12663052
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12663092 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 12663052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 20845521 - 20845481
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20845521 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 20845481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 112
Target Start/End: Original strand, 27427319 - 27427414
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactc 112  Q
    |||||| || || ||||||||| ||||||| |||  |||| ||| ||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||    
T  27427319 aggtacaagctgctcttggatttgaactagccacttgaccaaaatcaaagacacatagacaggtgcgagc-tgttcttggatttgaactggtaactc 27427414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27783491 - 27783412
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| |||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  27783491 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 27783412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 34266662 - 34266702
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34266662 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 34266702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 34267655 - 34267703
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34267655 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactgggcacttgacc 34267703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 104)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 298
Target Start/End: Original strand, 22073755 - 22074048
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22073755 tggaaaagcagacaggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaaacaacggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaa 22073854  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22073855 ctggttactccaccggagacataaacaaacagacaggtgcaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaggtacaa 22073954  T
Q  203 gttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22073955 ggtgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacacattcattggggattagtt--tttggcaaaatataaattgaaattgacttgac 22074048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 2129881 - 2130097
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2129881 aggtacgagttgttcttg-attcgaactagttactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 2129979  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  2129980 cggagacaaagacaaatagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 2130078  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2130079 ttgaactagccacttgacc 2130097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16261480 - 16261265
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261480 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 16261382  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16261381 cggagacaaagacaaatagacaggtgcaagctactcttgga-ttgagctagccacttgaccgaac-gaaacagatagacaggtacaagctgttcttggac 16261284  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16261283 ttgaactagccacttgacc 16261265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15775176 - 15774959
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcca- 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15775176 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 15775078  T
Q  115 ccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15775077 ccggagacaagacaaaatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttgga 15774979  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15774978 cttgaactagccacttgacc 15774959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 19909844 - 19910052
Alignment:
Q  22 gagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcga 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19909844 gagttgttcttg-attcgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggaga 19909941  T
Q  122 cataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaac 221  Q
    || | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19909942 caaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacaaatagacgggtacaagctgttcttggacttgaac 19910040  T
Q  222 tagccacttgacc 234  Q
    || ||||||||||    
T  19910041 ta-ccacttgacc 19910052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18798251 - 18798036
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18798251 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttcgatgcgaactggttactccac 18798154  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    | | |||| | || || ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18798153 cagagacaaagaccaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggac 18798055  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18798054 ttgaactagccacttgacc 18798036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 237
Target Start/End: Original strand, 19653819 - 19654039
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19653819 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggaaaataggcaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcgac 19653917  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||   |||||| ||||  || |||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19653918 cgataacataagcaaattgataggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccggacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggac 19654017  T
Q  216 ttgaactagccacttgaccgaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19654018 ttgaactagccacttgaccgaa 19654039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22140400 - 22140188
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||    
T  22140400 gtacgagttgttcttg-attcgaactggtaactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcaagct-gctcttggatt-gagctggttactccaccg 22140304  T
Q  118 gcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggactt 217  Q
    | |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22140303 gagacaaagacaaatagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggactt 22140205  T
Q  218 gaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||    
T  22140204 gaactagccacttgacc 22140188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19695656 - 19695445
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19695656 aggtacgagttattcttg-attcgaactagccactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 19695559  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||  |||| | || || ||||||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19695558 cgaagacaaagaccaatagacaggtgcaagctgctcttg-----gagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggac 19695464  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19695463 ttgaactagccacttgacc 19695445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33250075 - 33249859
Alignment:
Q  25 ttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacat 124  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  33250075 ttgttcttggatgtgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaa 33249977  T
Q  125 aaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaacta 223  Q
    | |||||  ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  33249976 agacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaacta 33249878  T
Q  224 gccacttgaccgaatagaa 242  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  33249877 gccacttgaccgaacagaa 33249859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9362064 - 9361856
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9362064 tggaaaagtagacaggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 9361965  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  9361964 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 9361868  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  9361867 gctgctcttgga 9361856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 137 - 331
Target Start/End: Original strand, 19654291 - 19654488
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccga 236  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19654291 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccggacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccga 19654390  T
Q  237 atagaagcaaatttggtggggattgg---tttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    | |||| ||||||    ||||||| |   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19654391 acagaaacaaattcacaggggattagttttttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcggtttgatttgaaaggtagaaattgaccaa 19654488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14570755 - 14570539
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| | | ||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14570755 aggtacgagttgttcttg-atcggaattggccactcgactgaaagcaaaggcagatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaattggttactccac 14570657  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  14570656 cggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 14570558  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14570557 ttgaactagccacttgacc 14570539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29836835 - 29836616
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29836835 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 29836737  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  29836736 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 29836638  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29836637 gacttgaactagccacttgacc 29836616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9362352 - 9362133
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9362352 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacacgtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 9362254  T
Q  114 accggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  9362253 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 9362155  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9362154 gacttgaactagccacttgacc 9362133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 21340310 - 21340526
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21340310 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggattcgaactggtaactccac 21340407  T
Q  116 cggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  21340408 cggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcaaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 21340506  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21340507 cttgaactagccacttgacc 21340526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 27601587 - 27601784
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601587 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 27601685  T
Q  116 cggcgacata-aacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | | |||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  27601686 cggagacaaagaccaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 27601784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 19653399 - 19653596
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19653399 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 19653497  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaa--ctgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||| || | |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |  | ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19653498 cggagataaaggcaaatagacaggtgcaagctgctcttggatttgaactagccacttgaccaaaatcatagacacatagacaggtacgagttgttcttg 19653596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14570518 - 14570207
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  14570518 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 14570420  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  14570419 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgg 14570323  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14570322 acttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 14570223  T
Q  314 aaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||||||||    
T  14570222 aaggtagaaattgacc 14570207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 78 - 234
Target Start/End: Original strand, 22388537 - 22388692
Alignment:
Q  78 gtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccg 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22388537 gtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccg 22388635  T
Q  178 aactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22388636 aacagaaacatatagattggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 22388692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Original strand, 19201389 - 19201583
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19201389 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgtccttggacttgaactagccacttg 19201487  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    |||||| |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19201488 accgaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 19201583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 31482649 - 31482845
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31482649 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 31482747  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  31482748 accg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 31482844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 329
Target Start/End: Original strand, 2130118 - 2130428
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  2130118 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 2130216  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  2130217 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgg 2130313  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2130314 acttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttt-tttgacaaagtataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 2130412  T
Q  314 aaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||||||||    
T  2130413 aaggtagaaattgacc 2130428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18716903 - 18716709
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18716903 gtacgagttgttcttacggattcgaactggtgactcgactgaaaacaa-ggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 18716805  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  18716804 cg--gaccgaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 18716709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Original strand, 28354958 - 28355152
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28354958 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 28355056  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28355057 accaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 28355152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19681903 - 19681707
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19681903 aggtacgagttgttcttagggattcgaactagttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 19681805  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| || || ||||||    
T  19681804 accg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacgagctgctcttgg 19681708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 12085728 - 12085873
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggttt-gtt-tgacaaaatatagat 283  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12085728 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttgttctgacaaaatatagat 12085827  T
Q  284 tgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12085828 tgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 12085873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 28354788 - 28354980
Alignment:
Q  21 cgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg 118  Q
    ||||||||||||  || |||||||| |||||||||| |||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28354788 cgagttgttcttatggtttcgaactggtcacccgactgaaaaacatggtaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgg 28354887  T
Q  119 cgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
     |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  28354888 agac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 28354980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31361794 - 31361608
Alignment:
Q  142 caagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaata 239  Q
    ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31361794 caagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaaca 31361696  T
Q  240 gaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    ||| || |||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31361695 gaaacatattcacaggggatcggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgac 31361608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29836544 - 29836400
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagatt 284  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29836544 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaagtatagatt 29836445  T
Q  285 gaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29836444 gagattgacttaacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 29836400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19681676 - 19681534
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  19681676 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattg 19681578  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19681577 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 19681534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 44568254 - 44568059
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44568254 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 44568156  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  44568155 accaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-cataatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 44568059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 9361878 - 9361680
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9361878 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 9361780  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  9361779 accaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 9361680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18716731 - 18716533
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18716731 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 18716633  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  18716632 accaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 18716533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 12085503 - 12085697
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12085503 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatggacaggtgcgagattgttcttggatgcgaactggttactccac 12085601  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  12085602 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgatcaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 12085697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33266235 - 33266017
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttctt--ggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  33266235 gtacgagttgttcttacggattcgaactggtgacccgactgaaaacat-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttaaggattcgaactggttactcc 33266137  T
Q  114 accggcgacataaacaaaca--gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttctt 211  Q
    ||||| |||| | ||||| |  |||||| |||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || ||||    
T  33266136 accggagacaaatacaaaaatggacaggcgcaagctgctcttggg-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgctctt 33266038  T
Q  212 ggacttgaactagccacttgac 233  Q
    ||| |||| |||| ||||||||    
T  33266037 gga-ttgagctagtcacttgac 33266017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Original strand, 31482823 - 31483016
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31482823 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgatagatacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 31482921  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  31482922 accaaacagaaacatattcactggggatgggttt---tgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 31483016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33249910 - 33249809
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttga 232  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33249910 agacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttga 33249811  T
Q  233 cc 234  Q
    ||    
T  33249810 cc 33249809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16261136 - 16260991
Alignment:
Q  183 aaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatag 281  Q
    ||||||||||  |||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16261136 aaacaaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcattggggattggttttttttgacaaaatatag 16261038  T
Q  282 attgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16261037 attgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgac 16260991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 329
Target Start/End: Original strand, 21341223 - 21341330
Alignment:
Q  221 ctagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtag 320  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21341223 ctagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttt-tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtag 21341321  T
Q  321 aaattgacc 329  Q
    |||||||||    
T  21341322 aaattgacc 21341330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15774938 - 15774624
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  15774938 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 15774840  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| || ||| ||    
T  15774839 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgctctagg 15774743  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgattt 311  Q
    | |||| |||||||||||||| |  |||| || |||   ||||  || |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15774742 a-ttgagctagccacttgaccaagcagaaacagattcactgggatttagtttttttttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcaattcgattt 15774644  T
Q  312 gaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15774643 gaaaggtagaaattgaccaa 15774624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 22388881 - 22389028
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt----gacaaaatatag 281  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||| || |||   ||||||||| ||| |||    ||||||||||||    
T  22388881 caaattgataggtacaagctgttcttggatttgaactagtcacttgaccaaacggaaacatattcactggggattgttttttttttttgacaaaatatag 22388980  T
Q  282 attgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22388981 attgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 22389028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 216 - 329
Target Start/End: Original strand, 27601961 - 27602073
Alignment:
Q  216 ttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaa 315  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||| |    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27601961 ttgagctagccacttgaccgaacagaaacaaaatcacaggggattagttt-tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 27602059  T
Q  316 ggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||||||    
T  27602060 ggtagaaattgacc 27602073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 118
Target Start/End: Original strand, 19653579 - 19653680
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||| ||    
T  19653579 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttgaattcgaactggtcactcgac 19653677  T
Q  116 cgg 118  Q
    |||    
T  19653678 cgg 19653680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33249557 - 33249415
Alignment:
Q  190 tagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt----gacaaaatatagattg 285  Q
    ||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| ||  ||   ||||||||||||| |||    ||||||||||||||||    
T  33249557 tagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaacaggttcactggggattggtttttttttttgacaaaatatagattg 33249459  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33249458 agattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 33249415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 327
Target Start/End: Original strand, 19910181 - 19910325
Alignment:
Q  183 aaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggt-ttgtttgacaaaatatag 281  Q
    ||||||||||  |||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||  | || |||||||||||||||    
T  19910181 aaacaaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattattgttttttgacaaaatatag 19910279  T
Q  282 attgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19910280 attgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 19910325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 267 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22140028 - 22139964
Alignment:
Q  267 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22140028 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaa 22139964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19695304 - 19695168
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggt---ttgtttgacaaaatatagattgaaattg 291  Q
    |||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||| |   || |||||||||||||||||||| ||||    
T  19695304 aggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttgttttttttgacaaaatatagattgagattg 19695206  T
Q  292 acttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19695205 acttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 19695168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19695424 - 19695255
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || |||||||| | |||||||||  ||||||||| |||| ||    
T  19695424 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtgcaag-tcgttcttggagacgaactggtaactcgac 19695326  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  19695325 cggaaacataaacaaacaggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 19695255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 19910073 - 19910242
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||  |  || || || |||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  19910073 aggtacgagctgttcttggatttgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtgcaag-tcgttcttggatgcgaactggtaactcgac 19910171  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  19910172 cggaaacataaacaaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 19910242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 214
Target Start/End: Original strand, 19653888 - 19654074
Alignment:
Q  25 ttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacat 124  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||| |||| | |||||| || |||| |||| |||||||||||   ||||| |  |||  |||||  |||     
T  19653888 ttgttcttggatgcgaactggttactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaag-ttgttcttggacttgaactagccacttgaccgg--acag 19653984  T
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||| || |||||||    
T  19653985 aaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacggaaacatattgataggtacaagctgctcttgga 19654074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33265947 - 33265797
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgt-------ttgacaaaata 278  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||| ||| |       |||||||||||    
T  33265947 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgttttttattttttttgacaaaata 33265848  T
Q  279 tagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||    
T  33265847 tagattgagattgacttgacgccgatttaaattgaaaagtagaaattgacc 33265797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 267 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18797823 - 18797761
Alignment:
Q  267 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18797823 tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcaatttgatttgaaaggtagaaattgacc 18797761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 214
Target Start/End: Original strand, 21341015 - 21341158
Alignment:
Q  70 atagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagcca 169  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||||| ||||  || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21341015 atagacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagcca 21341113  T
Q  170 cttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||||||| ||| |||||| || || ||||||||| || |||||||    
T  21341114 cttgaccaaacagaaacatattgataggtacaagctgctcttgga 21341158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16261244 - 16261075
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| || || ||||||| ||||  |  || || || |||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  16261244 aggtacgagctattcttggatttgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtgcaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 16261146  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  16261145 cggaaacataaacaaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 16261075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 214
Target Start/End: Original strand, 19654124 - 19654251
Alignment:
Q  87 tgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaac 186  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||||| ||||  || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  19654124 tgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaac 19654223  T
Q  187 aaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    | || || ||||||||| || |||||||    
T  19654224 atattgataggtacaagctgctcttgga 19654251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 190
Target Start/End: Original strand, 19654332 - 19654402
Alignment:
Q  120 gacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaat 190  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19654332 gacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 19654402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33249625 - 33249503
Alignment:
Q  62 aaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttga 161  Q
    ||||||| | |||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| |||||  ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33249625 aaaggcagacagacaggtgcgag-ttgttcttggat-cgaactggtcactcgaccgggaacatagaaaagtagacaggtgcaagctgctcttgga-ttga 33249529  T
Q  162 tctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||    
T  33249528 gctagccacttgaccaaacagaaaca 33249503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33249847 - 33249651
Alignment:
Q  17 ggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc 116  Q
    ||||| || |||||||||| | ||||||| |||  |||| ||| || || || |||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||| |||| |||    
T  33249847 ggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaaatcatagacacatagacaggtacgagct-gttcttagattcgaactggtaactcgacc 33249749  T
Q  117 ggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |   |||||| ||||  || |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| || || ||||||||| || |||||||    
T  33249748 gataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccactcgaccaaacggaaacatattgataggtacaagctgctcttgga 33249651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 214
Target Start/End: Original strand, 21340779 - 21340922
Alignment:
Q  70 atagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagcca 169  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||||| ||||  || || | ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21340779 atagacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgatagatacaagctgttcttggacttgaactagcca 21340877  T
Q  170 cttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||||||| ||| |||||| || || ||||||||| || |||||||    
T  21340878 cttgaccaaacagaaacatattgataggtacaagctgctcttgga 21340922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 33250144 - 33250057
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaact 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||| || | || ||||||||||||| |||||    
T  33250144 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaagtacgagtttgttcttggatgtgaact 33250057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44568428 - 44568232
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||    || |||||||||| ||    
T  44568428 gtacgagttgttcttacggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaattgacaggtgcgagct-gctcttgggcttgagctggttactcgac 44568331  T
Q  116 cggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
     || |||||| | ||   |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  44568330 tggggacatagaaaaggtagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 44568232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 86
Target Start/End: Original strand, 19653700 - 19653769
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagct 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19653700 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagct 19653769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 248
Target Start/End: Original strand, 19653930 - 19653992
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaat 248  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  19653930 caaattgataggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccggacagaaacaaat 19653992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 19201275 - 19201377
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgac 233  Q
    |||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || ||||||| |||| |||| ||||||||    
T  19201275 gacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgac 19201372  T
Q  234 cgaat 238  Q
     ||||    
T  19201373 tgaat 19201377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31361900 - 31361759
Alignment:
Q  94 ggatgcgaactggttactccaccggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatag 192  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| || ||| ||||    
T  31361900 ggattcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagagacagatag 31361802  T
Q  193 acaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccga 236  Q
     | || ||||| || ||||||| |||| || | |||||||||||    
T  31361801 gcgggcacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccga 31361759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 248
Target Start/End: Original strand, 19654282 - 19654344
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaat 248  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  19654282 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccggacagaaacaaat 19654344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 19654165 - 19654213
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19654165 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 19654213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 21341072 - 21341120
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21341072 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 21341120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Original strand, 19653750 - 19653836
Alignment:
Q  128 caaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaa--ctgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |  | ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19653750 caaatagacaggtgcgagctgctcttggatttgaactagccacttgaccaaaatcatagacacatagacaggtacgagttgttcttg 19653836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 21340547 - 21340764
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||  ||    
T  21340547 aggtacgagctgctcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaagct-gttcttggatgtgaactggtaacttgac 21340645  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttctt-g 212  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||||| |    
T  21340646 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttctttg 21340742  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21340743 gacttgaactagccacttgacc 21340764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31361740 - 31361690
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  31361740 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 31361690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33266058 - 33265978
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  33266058 agacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgactgaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 33265978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 19653510 - 19653558
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19653510 caaatagacaggtgcaagctgctcttggatttgaactagccacttgacc 19653558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Original strand, 19654114 - 19654193
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttgga 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| |||| | |||||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  19654114 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagc-tgttcttgga 19654193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 19695717 - 19695677
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19695717 aggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 19695677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 21340249 - 21340289
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21340249 aggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 21340289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 234
Target Start/End: Original strand, 21340848 - 21340884
Alignment:
Q  198 tacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21340848 tacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 21340884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Original strand, 21341021 - 21341100
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttgga 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| |||| | |||||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  21341021 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagc-tgttcttgga 21341100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33249737 - 33249689
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33249737 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccactcgacc 33249689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 33250205 - 33250165
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33250205 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcacccgaccg 33250165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15775063 - 15775009
Alignment:
Q  187 aaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaa 242  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15775063 aaatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaa 15775009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 236
Target Start/End: Original strand, 19201331 - 19201432
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttga 232  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||  |||||| || |||||||||||| || ||||||| |||| || | |||||||    
T  19201331 agacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgactgaatggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttga 19201428  T
Q  233 ccga 236  Q
    ||||    
T  19201429 ccga 19201432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 189
Target Start/End: Original strand, 27601946 - 27601992
Alignment:
Q  142 caagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaa 189  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27601946 caagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacaaa 27601992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Original strand, 28354605 - 28354648
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28354605 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 28354648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31362159 - 31362116
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31362159 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 31362116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Original strand, 31482346 - 31482389
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31482346 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 31482389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 12085737 - 12085787
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  12085737 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 12085787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19681667 - 19681617
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  19681667 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 19681617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29836535 - 29836485
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  29836535 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 29836485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33265938 - 33265888
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  33265938 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 33265888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Original strand, 21341198 - 21341250
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaat 190  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21341198 aggttcaagctgctcttgga-ttgcgctagccacttgaccgaacagaaacaaat 21341250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22140294 - 22140238
Alignment:
Q  185 acaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaa 242  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22140294 acaaatagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaa 22140238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 2129820 - 2129860
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2129820 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 2129860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 14570816 - 14570776
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14570816 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 14570776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 16261541 - 16261501
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16261541 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 16261501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 18798312 - 18798272
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18798312 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 18798272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Original strand, 19200979 - 19201019
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19200979 aggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 19201019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 19653750 - 19653798
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||| | || || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19653750 caaatagacaggtgcgagctgctcttggatttgaactagccacttgacc 19653798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 19909777 - 19909817
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19909777 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 19909817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Original strand, 21340785 - 21340864
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttgga 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| |||| | |||||| || || | ||||| ||||||||||    
T  21340785 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacataagcaaattgatagatacaagc-tgttcttgga 21340864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 22140463 - 22140423
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22140463 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 22140423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Original strand, 22388714 - 22388754
Alignment:
Q  17 ggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccga 57  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22388714 ggtacgagctgttcttggattcgaactagtaactcgaccga 22388754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 27601526 - 27601566
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27601526 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 27601566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28720 - 28497
Alignment:
Q  25 ttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacat 124  Q
    |||||||||||| |||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28720 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccgaaaacaaaggcaaatagacaagtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacat 28621  T
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactag 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28620 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaagtacaagctgttcttggacttgaactag 28521  T
Q  225 ccacttgaccgaatagaagcaaat 248  Q
    ||||||||||||| |||| |||||    
T  28520 ccacttgaccgaacagaaacaaat 28497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 125 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28562 - 28391
Alignment:
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactag 224  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28562 aaacaaatagacaagtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactag 28463  T
Q  225 ccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 298  Q
    |||||||||| || |||| || |||   |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28462 ccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagtt--tttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 28391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28803 - 28555
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28803 tggaaaagcaaacaggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaaacaacggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaa 28704  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagc-tgctcttggacttgatctagccacttgaccg--aactgaaacaaatagacaggta 199  Q
    |||||||||||||||   ||| |  |||| ||||| |||| ||| || |||||||   || || |  |||  ||||   ||  ||||||| ||||||||     
T  28703 ctggttactccaccgaaaacaaaggcaaatagacaagtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacataaacaaacagacaggtg 28604  T
Q  200 caagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaat 248  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28603 caagctgctcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 28555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 121)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 329
Target Start/End: Original strand, 13517030 - 13517343
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13517030 gtacgagttgttcttaaggattcgaactagttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggacgcgaactggttactccac 13517128  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |||  ||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  13517129 cgg--acagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgacaacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgg 13517225  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgt--ttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgattt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||   ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13517226 acttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgattt 13517325  T
Q  312 gaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13517326 gaaaggtagaaattgacc 13517343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16757421 - 16757204
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16757421 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 16757323  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||| ||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16757322 cggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagtcacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagttgttcttgga 16757224  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16757223 cttgaactagccacttgacc 16757204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4765116 - 4764802
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4765116 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 4765018  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| |||||||  ||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||    
T  4765017 accggagacaaatacaaaatagacaggcccaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttg 4764919  T
Q  213 gacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttg-tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgattt 311  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||  ||| || |||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  4764918 ga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttaacgtcgattcgaatt 4764820  T
Q  312 gaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||| |||||||||||    
T  4764819 gaaaggcagaaattgacc 4764802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 22926979 - 22927195
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22926979 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacgggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 22927077  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| |  |||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  22927078 cggagacaaaggcaaatagacaggtgcaagccgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 22927176  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22927177 ttgaactagccacttgacc 22927195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24871250 - 24871033
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24871250 aggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgactgaaagcat-gacaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 24871152  T
Q  116 cggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||  | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  24871151 cggagaccaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 24871053  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24871052 cttgaactagccacttgacc 24871033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 15405132 - 15405347
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15405132 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 15405229  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| | || | ||||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  15405230 cggagtcaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 15405328  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15405329 ttgaactagccacttgacc 15405347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 15416919 - 15417134
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15416919 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 15417016  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| | || | ||||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  15417017 cggagtcaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggac 15417115  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15417116 ttgaactagccacttgacc 15417134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 13291543 - 13291761
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13291543 aggtgcgagttgttcttggatgcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 13291642  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  13291643 cggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcaagctagccacttgagcgaacagaaacagatagatgggtacaagctgttcttgga 13291741  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13291742 cttgaactagccacttgacc 13291761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26928355 - 26928138
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26928355 aggtacgagttgttcttggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 26928257  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  26928256 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacctgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 26928158  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26928157 cttgaactagccacttgacc 26928138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27032620 - 27032403
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27032620 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatacgaactggttactccac 27032522  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||||    
T  27032521 cggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatggacgggtacaagctgttcttgga 27032423  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27032422 cttgaactagccacttgacc 27032403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 24298367 - 24298579
Alignment:
Q  20 acgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggc 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24298367 acgagttgttcttg-attcgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccgga 24298464  T
Q  120 gacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttg 218  Q
    |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24298465 gacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatggacgggtacaagctgttcttggacttg 24298563  T
Q  219 aactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  24298564 aactagccacttgacc 24298579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 14137884 - 14138103
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14137884 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 14137982  T
Q  114 accggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | |||||  ||||||| ||||||||||||| || | || |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14137983 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttaga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacaaatagacgggtacaagctgttcttg 14138081  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14138082 gacttgaactagccacttgacc 14138103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 27354501 - 27354720
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27354501 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 27354599  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  27354600 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 27354698  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27354699 gacttgaactagccacttgacc 27354720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27026738 - 27026524
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27026738 gtacgagttgttcttg-attcgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttattcttggatgcgaactggttactccaccg 27026641  T
Q  118 gcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggact 216  Q
    | |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27026640 gagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttggact 27026542  T
Q  217 tgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||| |||||||||    
T  27026541 tgaactagtcacttgacc 27026524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4780273 - 4779962
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4780273 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaaacat-gtaaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 4780175  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||| || |||||    
T  4780174 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagagacagatagacgggtacaagctgctcttg 4780076  T
Q  213 gacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttg 312  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||  ||| || |||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | || |||    
T  4780075 ga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattcaccggggattggtttg-ttgacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgacttgaattg 4779978  T
Q  313 aaaggtagaaattgac 328  Q
    ||||||||||||||||    
T  4779977 aaaggtagaaattgac 4779962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 8898439 - 8898647
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8898439 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 8898538  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  8898539 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 8898635  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  8898636 gctgctcttgga 8898647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28167928 - 28167720
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28167928 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 28167829  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  28167828 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 28167732  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  28167731 gctgctcttgga 28167720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 33369191 - 33369399
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33369191 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 33369290  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  33369291 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 33369387  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  33369388 gctgctcttgga 33369399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 8898151 - 8898370
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||  |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8898151 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgaatgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 8898249  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  8898250 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 8898348  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8898349 gacttgaactagccacttgacc 8898370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27015328 - 27015109
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015328 aggtacgagctgttcttagggattcgaactagttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 27015230  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  27015229 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaatggaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 27015131  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27015130 gacttgaactagccacttgacc 27015109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 33368902 - 33369122
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33368902 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 33369000  T
Q  114 accggcgac--ataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttctt 211  Q
    ||||| |||  ||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  33369001 accggagacaaatacaaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagttagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttctt 33369099  T
Q  212 ggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33369100 ggacttgaactagccacttgacc 33369122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 322
Target Start/End: Original strand, 4755519 - 4755824
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4755519 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaaacat-gtaaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 4755617  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||| || |||||    
T  4755618 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagagacagatagacgggtacaagctgctcttg 4755716  T
Q  213 gacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttg 312  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||  ||| || |||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | || |||    
T  4755717 ga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattcaccggggattggtttg-ttgacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgacttgaattg 4755814  T
Q  313 aaaggtagaa 322  Q
    ||||||||||    
T  4755815 aaaggtagaa 4755824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4532656 - 4532344
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4532656 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgaccgaaagcaa-ggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 4532558  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga----actgaaacaaatagacaggtacaagttgttc 209  Q
    ||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||    | ||||  || || || ||| ||||| ||||    
T  4532557 accg--gacagaaacaaatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacattgaa--aagtaaacgggtgcaagtcgttc 4532463  T
Q  210 ttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgat 309  Q
    |||||   |||||||  ||||||||||| | || || |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  4532462 ttggatgcgaactagtaacttgaccgaacaaaaacatattcactggggattggtttg-ttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaa 4532364  T
Q  310 ttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4532363 ttgaaaggtagaaattgacc 4532344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 14138172 - 14138380
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14138172 tggaaaagtagataggtacgagttcttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaagacaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 14138271  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  14138272 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaa 14138368  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  14138369 gctgctcttgga 14138380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 27283259 - 27283430
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283259 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 27283357  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaat 190  Q
    ||  |||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  27283358 cg--gacagaaacaaatagacagatacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaat 27283430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27210504 - 27210282
Alignment:
Q  11 cagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttac 110  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||     
T  27210504 cagacaggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgaccgaaatcaa-ggcaaatagacacgcgcgagcttgttcttggatgcgaactggttag 27210407  T
Q  111 tccaccggcgacataaa--caaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgtt 208  Q
    |||||||| |||| | |   ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||| ||||    
T  27210406 tccaccggggacaaagatcaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcaaacagaaacagatagacgggtacaagctgtt 27210308  T
Q  209 cttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27210307 cttggacttgaactagccacttgacc 27210282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 27238724 - 27238946
Alignment:
Q  11 cagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttac 110  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||     
T  27238724 cagacaggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgaccgaaatcaa-ggcaaatagacacgcgcgagcttgttcttggatgcgaactggttag 27238821  T
Q  111 tccaccggcgacataaa--caaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgtt 208  Q
    |||||||| |||| | |   ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||| ||||    
T  27238822 tccaccggggacaaagatcaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcaaacagaaacagatagacgggtacaagctgtt 27238920  T
Q  209 cttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27238921 cttggacttgaactagccacttgacc 27238946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 333
Target Start/End: Original strand, 13291782 - 13292097
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  13291782 aggtacgagccgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 13291880  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  13291881 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgg 13291977  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13291978 acttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttga 13292077  T
Q  314 aaggtagaaattgaccaaca 333  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13292078 aaggtagaaattgaccaaca 13292097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27015040 - 27014859
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27015040 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 27014941  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  27014940 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 27014859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 182 - 331
Target Start/End: Original strand, 27283364 - 27283512
Alignment:
Q  182 gaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatag 281  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27283364 gaaacaaatagacagatacaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattagttt-tttgacaaaatatag 27283462  T
Q  282 attgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27283463 attgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaa 27283512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28168216 - 28167997
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28168216 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcatgttcttggatgcgaactggttactcc 28168118  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||  |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| ||||   |||||| |||||||| ||||||||    
T  28168117 accggggacaaatacaaaatagacagacgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaatggatagacgggtacaagctgttcttg 28168019  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28168018 gacttgaactagccacttgacc 28167997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Original strand, 15405483 - 15405681
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15405483 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 15405581  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    |||||| |||| ||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15405582 accgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaa 15405681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Original strand, 15417270 - 15417468
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15417270 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 15417368  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    |||||| |||| ||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15417369 accgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaa 15417468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28214889 - 28214694
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28214889 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 28214790  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| || || |||||||    
T  28214789 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacgagctgctcttgga 28214694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27210261 - 27209948
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||  ||    
T  27210261 aggtacgagctgttcttggattcgaactgataactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-ttgttcttggacgcgaactggtaacttgac 27210163  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||| ||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  27210162 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgactgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgg 27210066  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||   |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27210065 acttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcaatttga 27209966  T
Q  314 aaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27209965 aaggtagaaattgaccaa 27209948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 331
Target Start/End: Original strand, 27238967 - 27239280
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||  ||    
T  27238967 aggtacgagctgttcttggattcgaactgataactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-ttgttcttggacgcgaactggtaacttgac 27239065  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||| ||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  27239066 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgactgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgg 27239162  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||   |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27239163 acttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcaatttga 27239262  T
Q  314 aaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27239263 aaggtagaaattgaccaa 27239280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27032268 - 27032072
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27032268 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgagctagccacttg 27032170  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||| |||| ||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27032169 accgaacagaaacaaattcagaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 27032072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27201677 - 27201459
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27201677 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 27201579  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||    
T  27201578 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttg 27201480  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    || |||| |||| |||||||||    
T  27201479 ga-ttgagctagtcacttgacc 27201459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 27247556 - 27247774
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27247556 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 27247654  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||    
T  27247655 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttg 27247753  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    || |||| |||| |||||||||    
T  27247754 ga-ttgagctagtcacttgacc 27247774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 328
Target Start/End: Original strand, 30550818 - 30551128
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30550818 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaaaagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 30550916  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga----actgaaacaaatagacaggtacaagttgttc 209  Q
    ||   ||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||    | ||||  || || || ||||||||| ||||    
T  30550917 ac---cgacagaaacagatagccaggtacaagctgctcttgga-ttgagctaggcactcgaccgataacattgaa--aagtaaacgggtacaagtcgttc 30551010  T
Q  210 ttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgat 309  Q
    |||||   |||||||  |||||||| || |||| || |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  30551011 ttggatgcgaactagtaacttgaccaaacagaaacacattcactggggattggtttg-ttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaa 30551109  T
Q  310 ttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  30551110 ttgaaagataaaaattgac 30551128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 4538537 - 4538732
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4538537 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 4538636  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||| | | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| || || |||||||    
T  4538637 cg--gacagaaatagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacgagctgctcttgga 4538732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 325
Target Start/End: Original strand, 22200999 - 22201301
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||  || || || || ||| | || ||||||||| ||  ||||||||||||| ||    
T  22200999 aggtacgagctgttcttggattcgaactagtaactcgatcgataacattggaaagtaaacgggtacgag-ttgttcttgaatttgaactggttactcgac 22201097  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||   ||| ||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22201098 cgataacagaaataaattgacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggac 22201197  T
Q  216 ttgaactagccacttgaccgaatagaagca-aatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || | ||   |||||||       ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||    
T  22201198 ttgaactagccacttgactaaacagaaacatagttcactggggat-------tttaacaaaatacagattgatattgacttgacattgatttgatttgaa 22201290  T
Q  315 aggtagaaatt 325  Q
    |||||||||||    
T  22201291 aggtagaaatt 22201301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27026388 - 27026191
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27026388 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 27026290  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    |||||| |||| ||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27026289 accgaacagaaacaaattcacaggggattagttt-tttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaa 27026191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Original strand, 34457496 - 34457690
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34457496 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctggacactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 34457594  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34457595 accaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 34457690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 26109180 - 26109376
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26109180 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcat-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 26109278  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||    
T  26109279 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttggac 26109375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29556978 - 29556782
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29556978 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 29556880  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  29556879 accg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 29556783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29580513 - 29580296
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29580513 aggtacgagttgttcttagggattcgaactagttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttctaggatgcgaactggttactcc 29580415  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||  |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| || |||||    
T  29580414 accggagacaaatacaaaatagacagacgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacggatagacaggtacaagctgctcttg 29580316  T
Q  213 gacttgaactagccacttgac 233  Q
    || |||| |||| ||||||||    
T  29580315 ga-ttgagctagtcacttgac 29580296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26793234 - 26793037
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26793234 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 26793136  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||||    
T  26793135 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgctcttgga 26793037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16681578 - 16681384
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16681578 gtacgagttgttcttacggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 16681480  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || ||| |||||||| || |||||||    
T  16681479 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacgggtacaagctgctcttgga 16681384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Original strand, 26109352 - 26109550
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26109352 gacaggtacaagctgctcttggact-gagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 26109450  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggttt-gtt-tgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26109451 accaaacagaaacatattcactggggattggttttgttctgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 26109550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 26665415 - 26665597
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26665415 aggtacgagttgttcttagggattcgaactagttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 26665513  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtac 200  Q
    ||||  | || ||||| | |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||    
T  26665514 accg--ggcagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtac 26665597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 26771386 - 26771568
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26771386 aggtacgagttgttcttagggattcgaactagttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 26771484  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtac 200  Q
    ||||  | || ||||| | |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||    
T  26771485 accg--ggcagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtac 26771568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29508615 - 29508471
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagatt 284  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29508615 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagatt 29508516  T
Q  285 gaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29508515 gagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 29508471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29508840 - 29508646
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29508840 gtacgagttgttcttacggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 29508742  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| || || |||||||    
T  29508741 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacgagctgctcttgga 29508646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27201443 - 27201248
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27201443 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 27201345  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    ||| || |||| || |||    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27201344 accaaacagaaacatattcaccggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgacctgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattgac 27201248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Original strand, 27247790 - 27247985
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27247790 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 27247888  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    ||| || |||| || |||    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27247889 accaaacagaaacatattcaccggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgacctgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattgac 27247985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20131871 - 20131569
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||  || || || || ||| | || ||||||||| ||  ||||||||||||| ||    
T  20131871 aggtacgagctgttcttggattcgaactagtaactcgatcgataacattggaaagtaaacgggtacgag-ttgttcttgaatttgaactggttactcgac 20131773  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||   ||| ||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  20131772 cgataacagaaataaattgacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagagacatattgacaggtacaagctgttcttggac 20131673  T
Q  216 ttgaactagccacttgaccgaatagaagca-aatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaa 314  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| || | ||   |||||||       ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||    
T  20131672 ttgaactagccacttgactaaacagaaacatagttcactggggat-------tttaacaaaatacagattgatattgacttgacattgatttgatttgaa 20131580  T
Q  315 aggtagaaatt 325  Q
    |||||||||||    
T  20131579 aggtagaaatt 20131569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 34457324 - 34457518
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34457324 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtgactcgactgaaaccaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 34457422  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
     || |||  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  34457423 tggagac--aaacagatagataggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 34457518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 325
Target Start/End: Original strand, 24298600 - 24298904
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  24298600 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 24298698  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  24298699 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgg 24298795  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttga 313  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    ||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  24298796 acttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaattcacaggggattagt---tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcggtttgatttga 24298892  T
Q  314 aaggtagaaatt 325  Q
    ||||||||||||    
T  24298893 aaggtagaaatt 24298904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 27354789 - 27354940
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27354789 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 27354888  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttgga 156  Q
    || | |||||||| |  |||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  27354889 ctaggtactccactg--gacagaaacatatagacaggtacaagctgctcttgga 27354940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Original strand, 16936902 - 16937069
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16936902 gtacgagttgttcttacggattcgaactggtgactcgactgaaagcaa-ggcaaatagataggtgcgagcttgttcttggatgtgaactggttactccac 16937000  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  16937001 cg--gacagaaacagatagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaaca 16937069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16681353 - 16681209
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttg-tttgacaaaatatagatt 284  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16681353 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagatt 16681254  T
Q  285 gaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    || ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||    
T  16681253 gagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 16681209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 186 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26793006 - 26792867
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattg 285  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| || |||   |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  26793006 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagtcacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttt---tgacaaaatatagattg 26792910  T
Q  286 aaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26792909 agattgacttgacgtcgattcgaattgaaaggtagaaattgac 26792867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 331
Target Start/End: Original strand, 22927867 - 22928005
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttg--acaaaatatagattgaaattga 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||    
T  22927867 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttacaaaatataggttgaaattga 22927966  T
Q  293 cttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22927967 cttgatgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaa 22928005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 186 - 328
Target Start/End: Original strand, 26665642 - 26665785
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtt-tgacaaaatatagatt 284  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| || |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26665642 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacctgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttctgacaaaatatagatt 26665741  T
Q  285 gaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    || |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  26665742 gagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagttagaaattgac 26665785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 186 - 328
Target Start/End: Original strand, 26771613 - 26771756
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtt-tgacaaaatatagatt 284  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| || |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26771613 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacctgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttctgacaaaatatagatt 26771712  T
Q  285 gaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    || |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  26771713 gagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagttagaaattgac 26771756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28167742 - 28167544
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28167742 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 28167644  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  28167643 accaaacagaaacatattcactagggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 28167544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27064937 - 27064743
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || || | |||||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27064937 gtacgagttgttcttacggattcgaactggtgactcggctgaaaacat-ggcaaatagataggtgcgagcttgtttttggatgtgaactggttactccac 27064839  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  27064838 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 27064743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29580279 - 29580084
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  29580279 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgctcttggacttgagctagccacttg 29580181  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  29580180 accaaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatacagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 29580084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Original strand, 14138358 - 14138560
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14138358 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 14138456  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt------gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt 325  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||| |||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  14138457 accaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaatt 14138556  T
Q  326 gacc 329  Q
    ||||    
T  14138557 gacc 14138560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16757542 - 16757434
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16757542 aggtgcgagttgctcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 16757444  T
Q  116 cggcgacata 125  Q
    ||| ||||||    
T  16757443 cggagacata 16757434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 327
Target Start/End: Original strand, 4538763 - 4538906
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattgg--tttgtttgacaaaatatagat 283  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  4538763 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaatatagat 4538862  T
Q  284 tgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4538863 tgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattga 4538906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 325
Target Start/End: Original strand, 8898678 - 8898820
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattgg---tttgtttgacaaaatataga 282  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||   ||||||||||   ||| |||||||||||||||     
T  8898678 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggttttttatttgacaaaatatagg 8898777  T
Q  283 ttgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt 325  Q
    |||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  8898778 ttgagattgacttgacatcgatttggtttgaaaggtagaaatt 8898820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27014921 - 27014774
Alignment:
Q  182 gaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatata 280  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| || |||    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27014921 gaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattcacgggggattggtttgttttgacaaaatata 27014823  T
Q  281 gattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27014822 gattgagattgacttaacgtcgattcgaattgaaaggcagaaattgacc 27014774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29556751 - 29556606
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattgg--tttgtttgacaaaatatagat 283  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  29556751 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagat 29556652  T
Q  284 tgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||    
T  29556651 tgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 29556606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Original strand, 33369377 - 33369579
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33369377 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgatatgtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 33369475  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt------gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt 325  Q
    ||| || |||| || |||   ||||||||||||| |||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  33369476 accaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaatt 33369575  T
Q  326 gacc 329  Q
    ||||    
T  33369576 gacc 33369579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 203
Target Start/End: Original strand, 22927460 - 22927639
Alignment:
Q  23 agttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgac 122  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||   ||    
T  22927460 agttgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtgcaag-ttgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataac 22927558  T
Q  123 ataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaag 203  Q
    |||| ||||| || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  22927559 ataagcaaactgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaag 22927639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28214663 - 28214520
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattgg--tttgtttgacaaaatatagat 283  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||||   |||||||||| ||| ||||||    
T  28214663 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaacatagat 28214564  T
Q  284 tgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28214563 tgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattga 28214520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16757067 - 16756872
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || |||||||  |||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||    
T  16757067 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttg 16756970  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| |  |||| || |||   |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16756969 accaagcagaaacagattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaacgtagaaattgacc 16756872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27492317 - 27492189
Alignment:
Q  200 caagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacg 299  Q
    ||||| |||||||||   |||||||  ||||||||||| |||| || |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27492317 caagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacg 27492219  T
Q  300 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27492218 tcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 27492189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 182 - 329
Target Start/End: Original strand, 16937007 - 16937155
Alignment:
Q  182 gaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgt--ttgacaaaatat 279  Q
    |||||| |||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||| || |||   ||||||||||||| |  ||||| ||||||    
T  16937007 gaaacagatagacaggtgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatat 16937105  T
Q  280 agattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16937106 agattgagattgacttgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 16937155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 186 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26927949 - 26927801
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt----gacaaaatatag 281  Q
    |||||||  |||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||| |||    ||||||||||||    
T  26927949 caaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattggtttttttttttgacaaaatatag 26927851  T
Q  282 attgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26927850 attgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccaa 26927801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Original strand, 22927048 - 22927255
Alignment:
Q  25 ttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacat 124  Q
    |||||||||||| |||||| || || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| || |  |||  | ||   |||     
T  22927048 ttgttcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaaggcaaatagacaggtgcaagcc-gctcttggat-cgagctagccacttgagcga--acag 22927143  T
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaa--caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaact 222  Q
    ||||| | |||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || | |||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22927144 aaacagatagacgggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaaatcaaagacacatagacaggtacgagctgttcttggacttgaact 22927243  T
Q  223 agccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||    
T  22927244 agccacttgacc 22927255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 267 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24870821 - 24870759
Alignment:
Q  267 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24870821 tttgacaaagtatagattgaaattgacttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 24870759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 331
Target Start/End: Original strand, 27622546 - 27622624
Alignment:
Q  254 ggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  27622546 ggggattggtttgttttgacaaaatatatattgaaagtgacttgacgtcgatttaatttgaaaagtagaaattgaccaa 27622624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24871012 - 24870854
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  ||  | || |||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  24871012 aggtatgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagcaaacgggtgcaag-tcgttcttggatgcgaactggtaactcgac 24870914  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgacc 176  Q
    |||  ||||||||||| |   |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24870913 cggaaacataaacaaataagtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgacc 24870854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 329
Target Start/End: Original strand, 27355124 - 27355232
Alignment:
Q  222 tagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtag 320  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |||   |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |     
T  27355124 tagccacttgaccaagtagaaacagattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcaa 27355223  T
Q  321 aaattgacc 329  Q
    |||||||||    
T  27355224 aaattgacc 27355232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 22200939 - 22201172
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || || || |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| || |||| |     
T  22200939 aggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccaaaatcatagacacatagacaggtacgagc-tgttcttggattcgaactagtaactcgat 22201037  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccg--aactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||   ||||    ||  | || ||| | || || ||||| | |||| || |  ||| |||||  ||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  22201038 cgataacattggaaagtaaacgggtacgagttgttcttgaatttgaactggttactcgaccgataacagaaataaattgacaggtacaagctgttcttgg 22201137  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaat 248  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  22201138 acttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaat 22201172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27064603 - 27064541
Alignment:
Q  267 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  27064603 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaactgaaaggcagaaattgacc 27064541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27064765 - 27064633
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27064765 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 27064667  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggttt 265  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||||||||    
T  27064666 accaaacagaaacatattcactggggattggttt 27064633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20131931 - 20131712
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || || || |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| || |||| |     
T  20131931 aggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccaaaatcatagacacatagacaggtacgagc-tgttcttggattcgaactagtaactcgat 20131833  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccg--aactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||   ||||    ||  | || ||| | || || ||||| | |||| || |  ||| |||||  ||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  20131832 cgataacattggaaagtaaacgggtacgagttgttcttgaatttgaactggttactcgaccgataacagaaataaattgacaggtacaagctgttcttgg 20131733  T
Q  214 acttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20131732 acttgaactagccacttgacc 20131712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20175737 - 20175612
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattg 291  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||  | |||||       ||| |||||||| ||||||||||||    
T  20175737 gacaggtacaagctgttcttgga-ttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaagttcattgggat-------tttaacaaaatacagattgaaattg 20175646  T
Q  292 acttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt 325  Q
    ||||||| | |||  |||||| ||||||||||||    
T  20175645 acttgacattgatctgatttggaaggtagaaatt 20175612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 325
Target Start/End: Original strand, 22160254 - 22160379
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattg 291  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||  | |||||       ||| |||||||| ||||||||||||    
T  22160254 gacaggtacaagctgttcttgga-ttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaagttcattgggat-------tttaacaaaatacagattgaaattg 22160345  T
Q  292 acttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaatt 325  Q
    ||||||| | |||  |||||| ||||||||||||    
T  22160346 acttgacattgatctgatttggaaggtagaaatt 22160379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Original strand, 22927212 - 22927293
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||| || |||||||    
T  22927212 agacaggtacgagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattgataggtacaagctgctcttgga 22927293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Original strand, 22927690 - 22927767
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||| || |||||||    
T  22927690 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacggaaacatattgataggtacaagctgctcttgga 22927767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 187
Target Start/End: Original strand, 22927820 - 22927917
Alignment:
Q  90 tcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||||||| ||||||||| |||| | ||   |||||| ||||| || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  22927820 tcttggattcgaactggtaactcgatcgataacataagcaaactgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 22927917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29580337 - 29580257
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  29580337 agacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgactgaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 29580257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 22927681 - 22927729
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22927681 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 22927729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 117
Target Start/End: Original strand, 22927378 - 22927433
Alignment:
Q  62 aaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccg 117  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22927378 aaaggcagacagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggtaactcgaccg 22927433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Original strand, 22927573 - 22927612
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22927573 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgacc 22927612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 8898687 - 8898737
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8898687 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 8898737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20176045 - 20175992
Alignment:
Q  182 gaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20176045 gaaacaaattgacgggtacaagctgttcttggacttgaactgggcacttgaccg 20175992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 235
Target Start/End: Original strand, 22159946 - 22159999
Alignment:
Q  182 gaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22159946 gaaacaaattgacgggtacaagctgttcttggacttgaactgggcacttgaccg 22159999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27201501 - 27201421
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  27201501 agacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 27201421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Original strand, 27247732 - 27247812
Alignment:
Q  133 agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  27247732 agacgggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 27247812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 15405075 - 15405115
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15405075 aggtgcgagttgttcttggattcgaactagtcactcgaccg 15405115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 15416862 - 15416902
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15416862 aggtgcgagttgttcttggattcgaactagtcactcgaccg 15416902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 4538772 - 4538822
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  4538772 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 4538822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16681344 - 16681294
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  16681344 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 16681294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28214654 - 28214604
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  28214654 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 28214604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29508606 - 29508556
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  29508606 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 29508556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29556742 - 29556692
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  29556742 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 29556692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 23759093 - 23759013
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggat 97  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||| || || || |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  23759093 aggtacgagttgttcttggatctgaactggtcactcgaccaaaatcatagacacatagacaggtacgagc-tgttcttggat 23759013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16757242 - 16757143
Alignment:
Q  17 ggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccacc 116  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||  |||| ||| || || || |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  16757242 ggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccaaaatcatagacacatagacaggtacgagct-gttcttggattcgaactggtaactcgacc 16757144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 26928416 - 26928376
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26928416 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 26928376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 26992452 - 26992397
Alignment:
Q  20 acgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagaca 76  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  26992452 acgaattgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagaca 26992397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 27026795 - 27026740
Alignment:
Q  20 acgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagaca 76  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  27026795 acgaattgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagaca 27026740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 27026860 - 27026820
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27026860 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 27026820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 27032681 - 27032641
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27032681 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 27032641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 27210560 - 27210520
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27210560 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 27210520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 27238668 - 27238708
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27238668 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 27238708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 4)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 23663 - 23878
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23663 aggtacgagttgttcttg-attcgaactagtcactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 23760  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23761 cggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccactcgagcgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttggac 23859  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23860 ttgaactagccacttgacc 23878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 267 - 329
Target Start/End: Original strand, 24093 - 24155
Alignment:
Q  267 tttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24093 tttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgacc 24155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 187
Target Start/End: Original strand, 23970 - 24068
Alignment:
Q  88 gttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| |||||  ||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  23970 gttcttggaggcaaactggtaactcgaccggaaacataaacaaataggtaggttcaaactgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 24068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 23602 - 23642
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23602 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 23642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13398 - 13213
Alignment:
Q  2 gtggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcga 101  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  13398 gtggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaaacaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcga 13299  T
Q  102 actggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13298 actggttactccactggaaatataaacgaacagacaggtgcaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 13213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3044 - 2848
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3044 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 2946  T
Q  114 accggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    ||||  | || ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  2945 accg--ggcagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgg 2849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2870 - 2676
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2870 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 2772  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| || || | || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2771 accaaacaggaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttggtttgaaaggtagaaattga 2676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13267 - 13124
Alignment:
Q  191 agacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt---gacaaaatatagattgaa 287  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||   | |||||| |||| |||   |||||||| || ||||||    
T  13267 agacaggtgcaagctgttcttggatttgaactagccacttgaccgaacagaaacacattcacttgggattagttttttttttgacaaaatgtaaattgaa 13168  T
Q  288 attgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  13167 actgacttgacgtcgatttgatttgaaagataaaaattgaccaa 13124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17325 - 17106
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17325 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 17227  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  17226 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 17128  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17127 gacttgaactagccacttgacc 17106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17037 - 16829
Alignment:
Q  3 tggagaagcagagaggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaa 102  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17037 tggaaaagtagataggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaa 16938  T
Q  103 ctggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaa 202  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  16937 ctggttactccaccg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaacatattgacaggtacaa 16841  T
Q  203 gttgttcttgga 214  Q
    | || |||||||    
T  16840 gctgctcttgga 16829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16851 - 16650
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16851 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 16753  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt-----gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattg 326  Q
    ||| || | || || |||   ||||||||| ||| |||     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  16752 accaaacaaaaacatattcactggggattgtttttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttgaattgaaaggcagaaattg 16653  T
Q  327 acc 329  Q
    |||    
T  16652 acc 16650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 8304 - 8521
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8304 aggtatgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatatgaactggttactccac 8402  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||    
T  8403 cggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacggatagacgggtacaagctgttcttgga 8501  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8502 cttgaactagccacttgacc 8521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 8706 - 8842
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattgg--tttgtttgacaaaatatagattgaaattga 292  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |  ||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  8706 aggtacaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttttgacaaagtataaattgagattga 8805  T
Q  293 cttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8806 attgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacc 8842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Original strand, 8706 - 8759
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaat 190  Q
    |||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8706 aggtacaagctgttcttggactcgaactagtcacttgaccgaacagaaacaaat 8759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 6)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7367 - 7151
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7367 aggtacgagttgttcttg-attcgaactagtcactcgactgaaagcaa-gccaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 7270  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||| | |||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  7269 cggagacaaagacaaaatagacaagcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcaaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttgga 7171  T
Q  215 cttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7170 cttgaactagccacttgacc 7151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 118
Target Start/End: Original strand, 14581 - 14681
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14581 aggtacgagttgttcttg-attcgaactagtcactcgactgaaagcaa-gccaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 14678  T
Q  116 cgg 118  Q
    |||    
T  14679 cgg 14681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7020 - 6875
Alignment:
Q  185 acaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagatt 284  Q
    ||||||||  |||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  7020 acaaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttttttttgacaaagtatagatt 6922  T
Q  285 gaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaa 331  Q
    || ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6921 gagattgacttgacgctgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaa 6875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7130 - 6961
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| | || || ||||||| |||   |  || || || |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  7130 aggtacgagctgttcttggatttgaattggtaactcgaccgataactttgaaaagtaaacgggtgcaag-ttgttcttggaggcgaactggtaactcgac 7032  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||  ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  7031 cggaaacatagacaaataggtaggttcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacagaaaca 6961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 7428 - 7388
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7428 aggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 7388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Original strand, 14520 - 14560
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14520 aggtacgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 14560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0489
Description:

Target: scaffold0489; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 4852 - 5072
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || || ||||   |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4852 aggtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactagaaagcaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 4951  T
Q  114 accggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttg 212  Q
    ||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  4952 accggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagaaacagatagacgggtacaagctgttcttg 5050  T
Q  213 gacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5051 gacttgaactagccacttgacc 5072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 214
Target Start/End: Original strand, 2044 - 2230
Alignment:
Q  25 ttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacat 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  2044 ttgttcttggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccatcg--gacag 2141  T
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  2142 aaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaatggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 2230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 117
Target Start/End: Original strand, 1973 - 2075
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactcc 113  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  1973 aggtacgagttgttcttagggattcgaactagttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggattcgaactggtcactcg 2071  T
Q  114 accg 117  Q
    ||||    
T  2072 accg 2075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 2208 - 2307
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2208 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgatatgtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 2306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 5)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34897 - 34683
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  || |||||||||||||    
T  34897 aggtacgagttgttcttg-attcgaactggtcactcgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagct-gctcttggatt-gagctggttactccac 34801  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggac 215  Q
    ||| | || | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  34800 cggagtcaaagacaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccgaacagaaacagatagacaggtacaagctgttcttgtac 34702  T
Q  216 ttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34701 ttgaactagccacttgacc 34683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 134 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11190 - 10995
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11190 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 11092  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgac 328  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11091 accaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgac 10995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11362 - 11168
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11362 gtacgagttgttcttaaggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 11264  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  11263 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 11168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34662 - 34347
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |  || || || ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||  ||    
T  34662 aggtacgagctgttcttggattcgaactggtaactcgaccgataacattgaaaagtaaacgggtacaag-tcgttcttggatgcgaactggtaacttgac 34564  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgg 213  Q
    |    ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||  ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  34563 caa--acagaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacccgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttgg 34467  T
Q  214 acttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttg----acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgat 309  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||| |||     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34466 acttgaactagccgtttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagttttttttttgtacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgat 34367  T
Q  310 ttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34366 ttgaaaggtagaaattgacc 34347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 34958 - 34918
Alignment:
Q  16 aggtacgagttgttcttggattcgaactagtcacccgaccg 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34958 aggtgcgagttgttcttggattcgaactggtcactcgaccg 34918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 234
Target Start/End: Original strand, 39322 - 39507
Alignment:
Q  51 cgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttctt--ggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctg 148  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  39322 cgactgaaagcaaaggcaaatagacaggtgcgagcttgttctttgggatgcgaactggttactccaccggagacaaagacaaatagacaggcgcaagctg 39421  T
Q  149 ctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaag-ttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    |||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39422 ctcttgga-ttgagctagccactcgagcgaacagaaacagatagacaggtacaagactgttcttggacttgaactagccacttgacc 39507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 318
Target Start/End: Original strand, 39714 - 39779
Alignment:
Q  254 ggggattggtttgtttgacaaaa-tatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggt 318  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39714 ggggattgttttttttgacaaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggt 39779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 12786 - 12981
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12786 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 12885  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| || || |||||||    
T  12886 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacgagctgctcttgga 12981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 327
Target Start/End: Original strand, 13012 - 13155
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattgg--tttgtttgacaaaatatagat 283  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  13012 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaatatagat 13111  T
Q  284 tgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13112 tgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattga 13155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 13021 - 13071
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  13021 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 13071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 125 - 296
Target Start/End: Original strand, 25556 - 25725
Alignment:
Q  125 aaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactag 224  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25556 aaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactag 25655  T
Q  225 ccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttg 296  Q
    |||||||||| || |||| || |||   |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25656 ccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagtt--tttgacaaaatataaattgaaattaacttg 25725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 248
Target Start/End: Original strand, 25523 - 25621
Alignment:
Q  150 tcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaat 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25523 tcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaatagacaggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacaaat 25621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 248
Target Start/End: Original strand, 25522 - 25563
Alignment:
Q  207 ttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  25522 ttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacaaat 25563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15387 - 15192
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15387 gtacgagttgttcttatggattcgaactggtcactcgaccgaaagcaaaggcaaataaacaggtgtgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 15288  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| || || |||||||    
T  15287 cg--gacagaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacgagctgctcttgga 15192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15161 - 15018
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattgg--tttgtttgacaaaatatagat 283  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   |||||||||   |||||||||| ||| ||||||    
T  15161 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaacatagat 15062  T
Q  284 tgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattga 327  Q
    ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15061 tgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattga 15018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15152 - 15102
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  15152 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 15102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Original strand, 7753 - 7971
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7753 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaagcaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 7851  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| || |||||||| | |||||||| || |||||||    
T  7852 cggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagagacaaataggcgggtacaagctgctcttgga 7950  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccga 236  Q
     |||| || | |||||||||||    
T  7951 -ttgagctgggcacttgaccga 7971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 329
Target Start/End: Original strand, 7936 - 8123
Alignment:
Q  142 caagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaata 239  Q
    ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||  ||  || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7936 caagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaaca 8034  T
Q  240 gaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8035 gaaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 8123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 7990 - 8040
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7990 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 8040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 3426 - 3620
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3426 gtacgagttgttcttacggattcgaactggtgactcgactgaaaacaa-ggcaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 3524  T
Q  116 cggcgacataaacaaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||  |||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||| || ||||||||| || || |||||||    
T  3525 cg--gaccgaaacagatagacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctagtcacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacgagctgctcttgga 3620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Original strand, 3651 - 3797
Alignment:
Q  186 caaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtt---tgacaaaatataga 282  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||   ||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  3651 caaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttatttgacaaaatataga 3750  T
Q  283 ttgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  3751 ttgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 3797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 3660 - 3710
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  3660 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccaaacagaaaca 3710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 7)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 23645 - 23778
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgact 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23645 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcaaaggggatcggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgact 23743  T
Q  295 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23744 tgacgtcgattcgatttgaaagatagaaattgacc 23778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 2225 - 2358
Alignment:
Q  195 aggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgact 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||    | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2225 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacagaggatcggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgact 2323  T
Q  295 tgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2324 tgacgtcgattcgatttgaaagatagaaattgacc 2358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 236
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2206
Alignment:
Q  18 gtacgagttgttctt--ggattcgaactagtcacccgaccgaaaacaaaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || || |||| |||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988 gtacgagttgttcttatggattcgaactggttactcgactgaaggcaa-gacaaatagacaggtgcgagcttgttcttggatgcgaactggttactccac 2086  T
Q  116 cggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||| |||| |  | ||| ||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||||| || |||||||    
T  2087 cggagacaaaggcaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcgagctagccacttgagcgaacagagacagataggcgggtacaagctgctcttgga 2185  T
Q  215 cttgaactagccacttgaccga 236  Q
     |||| || | |||||||||||    
T  2186 -ttgagctgggcacttgaccga 2206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Original strand, 23454 - 23626
Alignment:
Q  63 aaggcaaatagacaggtgcaagcttgttcttggatgcgaactggttactccaccggcgacataaac-aaacagacaggtgcaagctgctcttggacttga 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  23454 aaggcaaatagacaggtgcgagcttattcttggatgcgaactggttactccaccggagacaaatacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcga 23552  T
Q  162 tctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccga 236  Q
     |||||||||||| ||||| || ||| |||| | |||||||| || ||||||| |||| || | |||||||||||    
T  23553 gctagccacttgagcgaacagagacagataggcgggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcacttgaccga 23626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 2225 - 2275
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  2225 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 187
Target Start/End: Original strand, 23645 - 23695
Alignment:
Q  137 aggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaaca 187  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  23645 aggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaacagaaaca 23695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Original strand, 1746 - 1789
Alignment:
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgaccg 235  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1746 gacaggtacaagctgttcttggattcgaactagccacttgaccg 1789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13288 - 13090
Alignment:
Q  134 gacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccga--actgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  ||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13288 gacaggtacaagctgctcttgga-ttgagctgggcactcgaccgataacataagcaaattgataggtacaagctgttcttggacttgaactagccacttg 13190  T
Q  232 accgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    ||| || |||| || |||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  13189 accaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgacc 13090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13444 - 13304
Alignment:
Q  93 tggatgcgaactggttactccaccggcgacataaacaaac-agacaggtgcaagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaata 191  Q
    ||||| ||||||||| |||| || || |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  13444 tggattcgaactggtgactcgactggagacaaagacaaaatagacaggcgcaagctgctcttgga-tcaagctagccacttgagcgaacagaaacagata 13346  T
Q  192 gacaggtacaagttgttcttggacttgaactagccacttgacc 234  Q
    ||  |||||||| || |||| || | || ||||||||||||||    
T  13345 gatgggtacaagctgctctt-gattcgagctagccacttgacc 13304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13337 - 13266
Alignment:
Q  142 caagctgctcttggacttgatctagccacttgaccgaactgaaacaaatagacaggtacaagttgttcttgga 214  Q
    ||||||||||||| | | || |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  13337 caagctgctcttg-attcgagctagccacttgaccaaacggaaacatattgacaggtacaagctgctcttgga 13266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 329
Target Start/End: Original strand, 1117 - 1245
Alignment:
Q  200 caagttgttcttggacttgaactagccacttgaccgaatagaagcaaatttggtggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacg 299  Q
    ||||| |||||||||   |||||||  ||||||||||| |||| || |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1117 caagtcgttcttggatgcgaactagtaacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacg 1215  T
Q  300 tcgattcgatttgaaaggtagaaattgacc 329  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1216 tcgatttgaattgaaaggtagaaattgacc 1245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University